/tags/v0.1-20130830/chargerDonnees.sh |
---|
New file |
0,0 → 1,50 |
#!/bin/bash |
############################################################################################################## |
# But : téléchargement automatique en local des données des projets depuis le serveur de Tela Botanica par ftp |
# Auteur : Jean-Pascal Milcent <jpm@tela-botanica.org> (translate bat file to shell script) |
# License : GPL v3 |
# Création : 07 decembre 2011 |
# Version: 0.1 |
# 2011-12-07 - Création |
# $Id$ |
############################################################################################################## |
# Constante |
NBREPARAM=$# |
APPDIR_ABSOLU=`pwd`; |
DOSSIER_LOCAL="$APPDIR_ABSOLU/donnees/" |
DOSSIER_DISTANT="/www/eflore/donnees/" |
# Aide |
E_OPTERR=65 |
if [ "$1" = '--help' ] |
then # Le script a besoin d'au moins un argument sur la ligne de commande |
echo "Usage $0 -[parameters -u, -p ]" |
echo "Paramétres : " |
echo " -h: indiquer l'hote ftp" |
echo " -u: indiquer le nom de l'utilisateur ftp" |
echo " -p: indiquer le mot de passe de l'utilisateur ftp" |
exit $E_OPTERR |
fi |
# Récupération des paramètres et des options de la ligne de commande |
TEMP=`getopt -o u:p:h: -l help: -- "$@"` |
if [ $? != 0 ] ; then echo "Terminating..." >&2 ; exit 1 ; fi |
eval set -- "$TEMP" |
while [ ! -z "$1" ] ; do |
#echo $1" # "$2 |
case "$1" in |
-h) HOST=$2;; |
-u) FTP_USER=$2;; |
-p) FTP_PASSWD=$2;; |
--) shift ; break ;; |
*) echo "Internal error!" ; exit 1 ;; |
esac |
shift 2 |
done |
# Transfert sur le serveur par FTP |
if [ $NBREPARAM -eq 0 ]; then |
echo "Pas de transfert sur le serveur. Utiliser --help pour voir les options de transfert." |
else |
echo "Téléchargement en cours :"; |
lftp ftp://$FTP_USER:$FTP_PASSWD@$HOST -e "set ftp:passive off; mirror -e --no-symlinks -x '.*cel\/images\/.*' -x '.*osm\/.*' -x '.*plantscan\/.*' -x '.*coste\/cles\/.*' -x '.*coste\/descriptions\/.*' -x '.*coste\/images\/.*' -x '.*coste\/ressources\/.*' $DOSSIER_DISTANT $DOSSIER_LOCAL ; quit" |
fi; |
Property changes: |
Added: svn:executable |
+* |
\ No newline at end of property |
Added: svn:eol-style |
+native |
\ No newline at end of property |
/tags/v0.1-20130830/services/modules/0.1/nvps/NomsVernaculaires.php |
---|
New file |
0,0 → 1,652 |
<?php |
/** |
* Description : |
* Classe NomsVernaculaires.php fournit une liste de noms vernaculaires et leur liaison à la bdtfx |
* Le but étant de fournir un ensemble minimal d'information comprenant : |
* un identifiant (numérique ou alphanumérique sous forme de ChatMot si possible), un nom, une langue et |
* une relation avec un taxon de la bdtfx. |
* Si l'url finit par /noms-vernaculaires on retourne une liste de noms (seulement les 100 premières par défaut). |
* L'url peut contenir des paramètres optionnels passés après le ? : /observations?param1=val1¶m2=val2&... |
* |
* Les paramètres de requête disponibles sont : masque, masque.code, masque.nom, masque.region , recherche, |
* distinct, retour.format, navigation.depart et navigation.limite. |
* |
* Encodage en entrée : utf8 |
* Encodage en sortie : utf8 |
* @package framework-v3 |
* @author Delphine Cauquil <delphine@tela-botanica.org> |
* @author Jennifer Dhé <jennifer.dhe@tela-botanica.org> |
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt> |
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt> |
* @version 1.0 |
* @copyright 1999-${year} Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org) |
*/ |
class NomsVernaculaires extends Commun { |
protected $champ_infos = array( |
'taxon' => array('service' => 'taxons', 'ressource' => 'nt:', 'projet' => 'bdtfx', 'nom' => 'nom_sci')); |
protected $service = 'noms-vernaculaires'; |
/** |
* Permet de stocker la requete formulée : /noms-vernaculaires | /noms-vernaculaires/#id | |
* /noms-vernaculaires/#id/champ | /noms-vernaculaires/#id/relations |
* Est remplit au cours de l'analyse des ressources (traiterRessources()), par défaut, a la valeur du service. |
* Est utilisée principalement pr déterminer le format du tableau à retourner. */ |
protected $format_reponse = 'noms-vernaculaires'; |
/** Variables constituant les parametres de la requete SQL (champ, condition, limit) remplie |
* selon ressources et paramètres */ |
protected $requete_champ = array(' * '); |
protected $requete_condition = ''; |
protected $limite_requete = array( |
'depart' => 0, |
'limite' => 100 |
); |
protected $champ_tri = 'code_langue'; |
protected $direction_tri = 'asc'; |
/** |
* Indique les champs supplémentaires à retourner |
* - conseil_emploi = conseil d'emploi du nom vernaculaire |
* - genre = genre et nombre du nom |
* - taxon = nom retenu associé à ce nom |
*/ |
protected $champs_supp = array(); |
/** |
* Precise la contenance plus ou moins précise du tableau à retourner : |
* - min = les données présentes dans la table |
* - max = les données de la table + les informations complémentaires (pour les identifiants et les codes) |
* - oss = la liste des nom_sci (uniquement pour noms et taxons) */ |
protected $retour_format = 'max'; |
/** Valeur du paramètre de requete recherche : |
* - stricte : le masque est passé tel quel à l'opérateur LIKE. |
* - etendue : ajout automatique du signe % à la place des espaces et en fin de masque avec utilisation de LIKE. |
* - floue : recherche tolérante vis-à-vis d'approximations ou d'erreurs (fautes d'orthographe par exemple) */ |
protected $recherche; |
/** Permet de stocker le tableau de résultat (non encodé en json) */ |
protected $table_retour = array(); |
/** Stocke le nombre total de résultats de la requete principale. Est calculée lors de l'assemblage de la requete */ |
protected $total_resultat; |
private $config; |
public function __construct($config) { |
$this->config = is_null($config) ? Config::get('NomsVernaculaires') : $config; |
} |
//+------------------------------------------------------------------------------------------------------+ |
// créer une condition en fonction du paramétre |
public function traiterParametres() { |
if (isset($this->parametres) && !empty($this->parametres)) { |
if (isset($this->parametres['recherche']) && $this->parametres['recherche'] != '') { |
$this->recherche = $this->parametres['recherche']; |
} |
foreach ($this->parametres as $param => $valeur) { |
switch ($param) { |
case 'masque' : |
$this->ajouterFiltreMasque('nom_vernaculaire', $valeur); |
break; |
case 'masque.nt' : |
$this->ajouterFiltreMasque('num_taxon', $valeur); |
break; |
case 'masque.nv' : |
$this->ajouterFiltreMasque('nom_vernaculaire', $valeur); |
break; |
case 'masque.lg' : |
$this->ajouterFiltreMasque('code_langue', $valeur); |
break; |
case 'masque.cce' : |
$this->ajouterFiltreMasque('num_statut', $valeur); |
break; |
case 'retour.format' : |
$this->retour_format = $valeur; |
break; |
case 'navigation.depart' : |
$this->limite_requete['depart'] = $valeur; |
break; |
case 'navigation.limite' : |
$this->limite_requete['limite'] = $valeur; |
break; |
case 'retour.champs' : |
$this->champs_supp = explode(',',$valeur); |
break; |
case 'recherche' : |
break; |
case 'version.projet' : |
break; |
default : |
$p = 'Erreur dans les paramètres de recherche de votre requête : '. |
'</br> Le paramètre " '.$param.' " n\'existe pas.'; |
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $p); |
} |
} |
} |
} |
public function ajouterFiltreMasque($nom_champ, $valeur) { |
if ($nom_champ == 'num_taxon') { // si il s'agit d'un chiffre |
$this->requete_condition[] = $nom_champ.' = '.$this->getBdd()->proteger($valeur); |
} else { |
if ($this->recherche == 'floue') { |
$this->requete_condition[] = '(SOUNDEX('.$nom_champ.') = SOUNDEX(\''.$valeur.'\')' |
.' OR SOUNDEX(REVERSE('.$nom_champ.')) = SOUNDEX(REVERSE(\''.$valeur.'\'))) '; |
} else { |
if ($this->recherche == 'etendue') { |
$valeur = '%'.str_replace(' ','% ', $valeur); |
$valeur .= '%'; |
} |
$this->requete_condition[] = $nom_champ.' LIKE '.$this->getBdd()->proteger($valeur); |
} |
} |
} |
//+------------------------------------------------------------------------------------------------------+ |
// en fonction de la présence des ressources modifie requete_champ et requete_condition |
public function traiterRessources() { |
if (isset($this->ressources) && !empty($this->ressources)) { |
if (isset($this->ressources[0]) && !empty($this->ressources[0])) { |
$this->traiterRessourceId(); // ajoute condition id=#valeur |
if (isset($this->ressources[1]) && !empty($this->ressources[1])) { |
$this->traiterRessourceChamp(); //modifie requete_champ ou requete_condition |
} |
} |
} else { //rajoute distinct pour ne pas avoir plusieurs fois le même nom |
$this->requete_champ = array('distinct(id)', 'nom_vernaculaire '); |
} |
} |
//requete : /noms-vernaculaires/#id (ex : /noms-vernaculaires/7) |
public function traiterRessourceId() { |
if (is_numeric($this->ressources[0])) { |
$this->requete_condition[] = ' id = '.$this->getBdd()->proteger($this->ressources[0]); |
$this->format_reponse .= '/id'; |
} elseif ($this->ressources[0] == 'attributions') { |
$this->format_reponse .= '/attributions'; |
} else { |
$r = 'Erreur dans les ressources de votre requête : </br> La ressource " '.$this->ressources[0]. |
' " n\'existe pas.'; |
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $r); |
} |
} |
public function traiterRessourceChamp() { |
$this->format_reponse .= '/champ'; |
$this->analyserChamp(); |
} |
public function analyserChamp() { |
$this->requete_champ = array(); |
$this->recupererTableConfig('champs_possibles');// s'il y a plusieurs champs correspondant au champ demandé ils sont séparé par des | |
$champs = explode(' ', $this->ressources[1]); |
foreach ($champs as $champ) { |
preg_match('/^([^.]+)(\.([^.]+))?$/', $champ, $match); |
if (isset($this->champs_possibles[$match[1]])) { |
$this->requete_champ[] = str_replace('|', ', ', $this->champs_possibles[$match[1]]); |
} elseif (isset($this->champs_possibles[$match[0]])) { |
$this->requete_champ[] = str_replace('|', ', ', $this->champs_possibles[$match[0]]); |
} else { |
$champs_possibles = implode('</li><li>', array_keys($this->champs_possibles)); |
$c = 'Erreur dans votre requête : </br> Le champ "'.$champ_possibles.'" n\'existe pas. '. |
'Les champs disponibles sont : <li>'.$champs_possibles.'</li> et leurs déclinaisons (ex. ".code").'; |
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $c); |
} |
} |
} |
//+------------------------------------------------------------------------------------------------------+ |
public function assemblerLaRequete() { |
$requete = ' SELECT '.$this->formerRequeteChamp(). |
' FROM '.$this->table |
.$this->formerRequeteCondition() |
.$this->formerRequeteLimite(); |
return $requete; |
} |
public function formerRequeteChamp() { |
if (in_array('*', $this->requete_champ)) { |
$champ = ' * '; |
} else { |
$champ = implode(', ', $this->requete_champ); |
} |
return $champ; |
} |
public function formerRequeteCondition() { |
$condition = ''; |
if ($this->requete_condition != null) { |
$condition = ' WHERE '.implode(' AND ', $this->requete_condition); |
} |
return $condition; |
} |
//ajout d'une limite seulement pour les listes (pas plus de 100 resultats retournés pr les requetes |
// suivantes : /noms-vernaculaires et /noms-vernaculaires/#id/relations) |
public function formerRequeteLimite() { |
if (in_array($this->format_reponse , array($this->service.'/id', $this->service.'/id/champs'))) { |
$this->requete_limite = ''; |
} elseif (($depart = $this->limite_requete['depart']) > ($this->total_resultat = $this->recupererTotalResultat())) { |
$this->limite_requete['depart'] = |
(($this->total_resultat - $this->limite_requete['limite']) < 0) ? 0 : ($this->total_resultat - $this->limite_requete['limite']); |
$this->requete_limite = ' LIMIT '.$this->limite_requete['depart'].', '.$this->limite_requete['limite']; |
} else { |
$this->requete_limite = ' LIMIT '.$this->limite_requete['depart'].', '.$this->limite_requete['limite']; |
} |
return $this->requete_limite; |
} |
//on récupère le nombre total de résultats de la requete (ex : le nombre d'id contenu dans la liste /noms-vernaculaires) |
public function recupererTotalResultat() { |
$distinct = ($this->format_reponse == 'noms-vernaculaires/attributions') ? 'id' : 'distinct(id)'; |
$requete = 'SELECT count('.$distinct.') as nombre FROM ' |
.$this->table |
.$this->formerRequeteCondition(); |
$res = $this->getBdd()->recuperer($requete); |
if ($res) { |
$total = $res['nombre']; |
} else { |
$t = 'Fonction recupererTotalResultat() : <br/>Données introuvables dans la base '.$requete; |
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE, $t); |
} |
return $total; |
} |
//+------------------------------------------------------------------------------------------------------+ |
// determine en fct du service appelé (/noms-vernaculaires | /noms-vernaculaires/#id | /noms-vernaculaires/#id/champ | |
// /noms-vernaculaires/#id/relations) le format du tableau à retourner. |
public function retournerResultatFormate($resultat) { |
$this->recupererTableConfig('correspondance_champs'); |
switch ($this->format_reponse) { |
case 'noms-vernaculaires' : |
$reponse = ($this->retour_format == 'oss') ? $this->formaterEnOss($resultat) : $this->formaterNomsVernaculaires($resultat); break; |
case 'noms-vernaculaires/attributions' : $reponse = $this->formaterNomsVernaculairesAttributions($resultat); break; |
case 'noms-vernaculaires/id' : $reponse = $this->formaterNomsVernaculairesId($resultat); break; |
case 'noms-vernaculaires/id/champ' : $reponse = $this->formaterNomsVernaculairesIdChamp($resultat); break; |
default : break; |
} |
return $reponse; |
} |
public function ajouterJsonEnTeteNV() { |
$table_retour_json['masque'] = $this->recupererMasque(); |
$table_retour_json['depart'] = $this->limite_requete['depart']; |
$table_retour_json['limite'] = $this->limite_requete['limite']; |
$table_retour_json['total'] = $this->total_resultat; |
$url = $this->formulerUrl($this->total_resultat, '/noms-vernaculaires'); |
if (isset($url['precedent']) && $url['precedent'] != '') { |
$table_retour_json['href.precedent'] = $url['precedent']; |
} |
if (isset($url['suivant']) && $url['suivant'] != '') { |
$table_retour_json['href.suivant'] = $url['suivant']; |
} |
return $table_retour_json; |
} |
public function ajouterJsonResultatNV($resultat) { |
foreach ($resultat as $tab) { |
foreach ($tab as $key => $valeur) { |
if ($valeur != '') { |
switch ($key) { |
case 'id' : $num = $valeur; break; |
case 'nom_vernaculaire' : $this->table_retour['nom'] = $valeur; break; |
default : break; |
} |
} |
} |
if ($this->retour_format == 'max') $this->table_retour['href'] = $this->ajouterHref('noms-vernaculaires', $num); |
$resultat_json[$num] = $this->table_retour; |
$this->table_retour = array(); |
} |
return $resultat_json; |
} |
public function formaterNomsVernaculaires($resultat) { |
$table_retour_json['entete'] = $this->ajouterJsonEnTeteNV(); |
$resultat = $this->hierarchiserResultat($resultat); |
$table_retour_json['resultat'] = $this->ajouterJsonResultatNV($resultat); |
return $table_retour_json; |
} |
public function hierarchiserResultat($resultat) { |
//tri recherche floue |
if (isset($this->parametres['masque.nv'])) { |
$resultat = $this->trierRechercheFloue($this->parametres['masque.nv'], $resultat, 'nom_vernaculaire'); |
} |
if (isset($this->parametres['masque'])) { |
$resultat = $this->trierRechercheFloue($this->parametres['masque'], $resultat, 'nom_vernaculaire'); |
} |
return $resultat; |
} |
public function recupererMasque() { |
$tab_masque = array(); |
foreach ($this->parametres as $param=>$valeur) { |
if (strstr($param, 'masque') != false) { |
$tab_masque[] = $param.'='.$valeur; |
} |
} |
$masque = implode('&', $tab_masque); |
return $masque; |
} |
public function formaterEnOss($resultat) { |
$table_nom = array(); |
$oss = ''; |
foreach ($resultat as $tab) { |
if (isset($tab['nom_vernaculaire']) ) { |
if (!in_array($tab['nom_vernaculaire'], $table_nom)) { |
$table_nom[] = $tab['nom_vernaculaire']; |
$oss [] = $tab['nom_vernaculaire']; |
} |
} |
} |
if (isset($this->masque)) $masque = implode('&', $this->masque); |
else $masque = 'Pas de masque'; |
$table_retour_oss = array($masque, $oss); |
return $table_retour_oss; |
} |
public function formaterNomsVernaculairesAttributions($resultat) { |
//on remplie la table $table_retour_json['entete'] |
$table_retour_json['entete']['masque'] = $this->recupererMasque(); |
$table_retour_json['entete']['depart'] = $this->limite_requete['depart']; |
$table_retour_json['entete']['limite'] = $this->limite_requete['limite']; |
$table_retour_json['entete']['total'] = $this->total_resultat; |
$url = $this->formulerUrl($this->total_resultat, '/noms-vernaculaires/attributions'); |
if (isset($url['precedent']) && $url['precedent'] != '') { |
$table_retour_json['entete']['href.precedent'] = $url['precedent']; |
} |
if (isset($url['suivant']) && $url['suivant'] != '') { |
$table_retour_json['entete']['href.suivant'] = $url['suivant']; |
} |
foreach ($resultat as &$tab) { |
$resultat_json[$tab['id']]['id'] = $tab['id']; |
$resultat_json[$tab['id']]['nom_vernaculaire'] = $tab['nom_vernaculaire']; |
$resultat_json[$tab['id']]['code_langue'] = $tab['code_langue']; |
$resultat_json[$tab['id']]['taxon.code'] = 'bdtfx.nt:'.$tab['num_taxon']; |
if ($this->retour_format == 'max') { |
$resultat_json[$tab['id']]['num_taxon'] = $tab['num_taxon']; |
$resultat_json[$tab['id']]['nom_retenu.code'] = $tab['num_taxon']; |
$resultat_json[$tab['id']]['taxon'] = $tab['num_taxon']; |
$this->taxons[] = $tab['num_taxon']; // utilisé pour chercher les noms latins plus bas |
$resultat_json[$tab['id']]['href'] = $this->ajouterHref('noms-vernaculaires', $tab['id']); |
if($this->champs_supp != array()) { |
$resultat_json[$tab['id']] = $this->ajouterChampsOntologieLigneResultat($tab); |
} |
} |
} |
if ($this->retour_format == 'max') { |
// On est obligé de faire un deuxième boucle pour demander tous les taxons présents en une |
// fois et les attribuer aux noms car c'est beaucoup plus rapide |
$noms_sci = $this->recupererNomTaxons(); |
foreach ($resultat_json as $num_nom => &$tab) { |
$tab = $this->ajouterTaxonsAttributionsLigneResultat($tab, $noms_sci); |
if($tab == null) { |
unset($resultat_json[$num_nom]); |
} |
} |
} |
uasort($resultat_json, array($this,'trierLigneTableau')); |
$table_retour_json['resultat'] = $resultat_json; |
return $table_retour_json; |
} |
/** |
* Ajoute les champs d'ontologie supplémentaires si necéssaire |
* en faisant appels aux web services associés |
* @param array $ligne_resultat |
* |
* @return array la ligne modifiée |
*/ |
public function ajouterChampsOntologieLigneResultat($ligne_resultat) { |
$intitule = ''; |
foreach($this->champ_infos as $cle => $champs_supplementaires) { |
if(in_array($cle, $this->champs_supp)) { |
extract($champs_supplementaires); |
$valeur_recherche = ''; |
switch($cle) { |
case 'taxon': |
$valeur_recherche = $ligne_resultat['num_taxon']; |
$intitule = 'taxon.code'; |
break; |
} |
$code_valeur = ''; |
if(trim($valeur_recherche) != '') { |
$url = $this->ajouterHrefAutreProjet($service, $ressource, $valeur_recherche, $projet); |
$code_valeur = $this->chercherSignificationCode($url, $nom); |
} |
$ligne_resultat[$intitule] = $code_valeur; |
} |
} |
return $ligne_resultat; |
} |
/** |
* Fonction qui ajoute les attributions à une ligne de résultats |
* |
* @param array $ligne_tableau_resultat |
* @param array $nom_sci |
*/ |
public function ajouterTaxonsAttributionsLigneResultat(&$ligne_tableau_resultat, &$noms_sci) { |
if (isset($noms_sci[$ligne_tableau_resultat['num_taxon']])) { |
$ligne_tableau_resultat['nom_retenu.code'] = $noms_sci[$ligne_tableau_resultat['num_taxon']]['id']; |
$ligne_tableau_resultat['taxon'] = $noms_sci[$ligne_tableau_resultat['num_taxon']]['nom_sci']; |
} else { |
$ligne_tableau_resultat = null; |
} |
return $ligne_tableau_resultat; |
} |
private function trierLigneTableau($a, $b) { |
$retour = 0; |
if ($a[$this->champ_tri] == $b[$this->champ_tri]) { |
$retour = 0; |
} |
if($this->champ_tri == 'code_langue') { |
if ($a[$this->champ_tri] == 'fra' && $b[$this->champ_tri] != 'fra') { |
$retour = ($this->direction_tri == 'asc') ? -1 : 1; |
} else if ($a[$this->champ_tri] != 'fra' && $b[$this->champ_tri] == 'fra') { |
$retour = ($this->direction_tri == 'asc') ? 1 : -1; |
} else { |
$retour = $this->comparerChaineSelonDirectionTri($a[$this->champ_tri], $b[$this->champ_tri]); |
} |
} else { |
$retour = $this->comparerChaineSelonDirectionTri($a[$this->champ_tri], $b[$this->champ_tri]); |
} |
return $retour; |
} |
private function comparerChaineSelonDirectionTri($a, $b) { |
if($this->direction_tri == 'asc') { |
return ($a < $b) ? -1 : 1; |
} else { |
return ($a > $b) ? -1 : 1; |
} |
} |
// formatage de la reponse /id ss la forme |
// id, nom_vernaculaire, attributions |
// langue |
// num_nom (correspond à un taxon bdtfx) |
public function formaterNomsVernaculairesId($resultat) { |
foreach ($resultat as $taxon) { // pour chaque attribution à un taxon bdtfx |
// on crée les variables qui serviront de clés et on les enléves du tableau |
$num_nom = $taxon['id']; // unique pour un trinôme id, langue, taxon |
$langue = $taxon['code_langue']; |
unset($taxon['code_langue']); |
foreach ($this->correspondance_champs as $key => $correspondance) { // ordonne les infos pour affichage |
if (isset($taxon[$key]) && $taxon[$key] != "") { |
$this->afficherDonnees($correspondance, $taxon[$key], $langue, $num_nom); |
} |
} |
foreach ($taxon as $key => $valeur) { // rajoute les champs non prévus dans l'api |
if (!isset($this->correspondance_champs[$key]) && $valeur != "") { |
$this->afficherDonnees($key, $valeur, $langue, $num_nom); |
} |
} |
} |
if ($this->retour_format == 'max') $this->afficherTaxons(); // va chercher les noms de tous les taxons |
unset($this->table_retour['href']); |
return $this->table_retour; |
} |
public function afficherDonnees($champ, $valeur, $langue = '', $num_nom = '') { |
if ($champ == 'id' || $champ == 'nom_vernaculaire') { |
$this->table_retour[$champ] = $valeur; |
} elseif (preg_match('/^(.*)\.code$/', $champ, $match)) { |
switch ($match[1]) { |
case 'taxon' : if ($this->retour_format == 'max') {$this->taxons[$num_nom] = $valeur;} |
$this->afficherPointCode($match[1], $langue, $num_nom, $valeur); break; |
case 'langue' : //$this->afficherPointCode($match[1], 'iso-639-3', 'langues', $valeur); |
break; |
default : break; |
} |
} elseif ($langue != '') { |
$this->table_retour['attributions'][$langue][$num_nom][$champ] = $valeur; |
} else { |
$this->table_retour[$champ] = $valeur; |
} |
} |
public function afficherPointCode($nomChamp, $langue, $num_nom, $valeur) { |
if (isset($this->champ_infos[$nomChamp])) { |
extract($this->champ_infos[$nomChamp]); |
} |
if ($this->retour_format == 'max') { |
$url = $this->ajouterHrefAutreProjet($service, $ressource, $valeur, $projet); |
if ($service == 'taxons') { |
$code_valeur = ''; |
$this->table_retour['attributions'][$langue][$num_nom]['nom_retenu.code'] = $code_valeur; |
} else { |
$code_valeur = $this->chercherSignificationCode($url, $nom); |
} |
if ($projet != '') $projet .= '.'; |
$this->table_retour['attributions'][$langue][$num_nom][$nomChamp] = $code_valeur; |
$this->table_retour['attributions'][$langue][$num_nom][$nomChamp.'.code'] = $projet.$ressource.$valeur; |
$this->table_retour['attributions'][$langue][$num_nom][$nomChamp.'.href'] = $url; |
} else { |
if ($projet != '') $projet .= '.'; |
$this->table_retour['attributions'][$langue][$num_nom][$nomChamp.'.code'] = $projet.$ressource.$valeur; |
} |
} |
public function chercherSignificationCode($url, $nom) { |
if (isset($this->signification_code[$url])) { |
$valeur = $this->signification_code[$url]; |
} else { |
$res = $this->consulterHref($url); |
$valeur = $res->$nom; |
$this->signification_code[$url] = $valeur; |
} |
return $valeur; |
} |
public function afficherTaxons() { |
$resultat = $this->recupererNomTaxons(); |
foreach ($this->table_retour['attributions'] as $code_langue=>$langue) { |
foreach ($langue as $num_nom=>$taxon) { |
$num_tax = ltrim($taxon['taxon.code'], 'bdtfx.nt:'); |
if (isset($resultat[$num_tax])) { |
$this->table_retour['attributions'][$code_langue][$num_nom]['nom_retenu.code'] = $resultat[$num_tax]['id']; |
$this->table_retour['attributions'][$code_langue][$num_nom]['taxon'] = $resultat[$num_tax]['nom_sci']; |
} |
} |
} |
} |
public function recupererNomTaxons() { |
$taxons = array_unique($this->taxons); |
$url = Config::get('url_service_base').'bdtfx/taxons?navigation.limite=500&ns.structure=au&masque.nt='.implode(',', $taxons); |
$res = $this->consulterHref($url); |
foreach ($res->resultat as $id=>$taxon) { |
$resultat[$taxon->num_taxonomique]['id'] = 'bdtfx.nn:'.$id; |
$resultat[$taxon->num_taxonomique]['nom_sci'] = $taxon->nom_sci_complet; |
} |
return $resultat; |
} |
public function formaterNomsVernaculairesIdChamp($resultat) { |
$this->table_retour['id'] = $this->ressources[0]; |
$champs = explode(' ', $this->ressources[1]); |
if (in_array('attributions', $champs) != false) { |
$this->formaterNomsVernaculairesId($resultat); |
unset($this->table_retour['nom_vernaculaire']); |
} else { |
$champ_attributions = array('num_taxon', 'genre', 'notes'); |
foreach ($resultat as $taxon) { |
foreach ($taxon as $key=>$valeur) { |
if ($key == 'code_langue' && in_array('langue', $champs) != false) { |
$this->table_retour['attributions']['langue'][] = $valeur; |
} elseif (in_array($key, $champ_attributions) != false) { |
$this->afficherPoint($this->correspondance_champs[$key] , $valeur, $taxon['code_langue'], $taxon['id']); |
} elseif (in_array($key, $champs) != false) { |
$this->table_retour[$key] = $valeur; |
} |
} |
} |
} |
return $this->table_retour; |
} |
public function afficherPoint($champ, $valeur, $langue, $num_nom) { |
preg_match('/^(.*)\.code$/', $champ, $match); |
$champ = $match[1]; |
if (isset($this->champ_infos[$champ])) { |
extract($this->champ_infos[$champ]); |
$url = $this->ajouterHrefAutreProjet($service, $ressource, $valeur, $projet); |
$projet .= '.'; |
} |
$champs = explode(' ', $this->ressources[1]); |
if (in_array($champ.'.*', $champs) !== false && isset($projet)) { |
$this->table_retour['attributions'][$langue][$num_nom][$champ.'.code'] = $projet.$ressource.$valeur; |
$this->table_retour['attributions'][$langue][$num_nom][$champ.'.href'] = $url; |
} |
if (in_array($champ.'.code', $champs) !== false && isset($projet)) { |
$this->table_retour['attributions'][$langue][$num_nom][$champ.'.code'] = $projet.$ressource.$valeur; |
} |
if (in_array($champ.'.href', $champs) !== false && isset($projet)) { |
$this->table_retour['attributions'][$langue][$num_nom][$champ.'.href'] = $url; |
} |
if (in_array($champ, $champs) !== false) { |
if (isset($url)) { |
$this->table_retour['attributions'][$langue][$num_nom][$champ] = $this->chercherSignificationCode($url, $nom); |
} else { |
$this->table_retour['attributions'][$langue][$champ] = $valeur; |
} |
} |
} |
public function afficherLangue($nomChamp, $projet, $service, $valeur, $ressource = '', $nom = 'nom') { |
if ($this->retour_format == 'max') { |
$this->table_retour['attributions'][$nomChamp] = $nom; |
$this->table_retour['attributions'][$nomChamp.'.code'] = $projet.$ressource.$valeur; |
$this->table_retour['attributions'][$nomChamp.'.href'] = $url; |
} else { |
$this->table_retour['attributions'][$nomChamp.'.code'] = $projet.$ressource.$valeur; |
} |
} |
} |
?> |
/tags/v0.1-20130830/services/modules/0.1/baseflor/Ontologies.php |
---|
New file |
0,0 → 1,436 |
<?php |
/** |
Classe Ontologies.php fournit des informations sur ensemble structuré des termes et concepts représentant les éléments |
* d'un domaine de connaissances pour le projet baseflor. |
*/ |
class BaseFloreOntologies extends Commun { |
protected $requete_condition = null; |
/** Permet de stocker la requete formulée: /ontologies | /ontologies/#id | /ontologies/#id/champ | /ontologies/#id/relations */ |
protected $format_reponse = 'ontologies'; |
/** Permet de stocker les limite de la requete SQL (par défaut seul les 100 premiers résultats seront retournés). |
* Stocke également les valeurs des paramètres navigation.depart et navigation.limite passés dans la requete*/ |
protected $limite_requete = array( 'depart' => 0, 'limite' => 100); |
/** Stocke le nombre total de résultats de la requete principale. Est calculée lors de l'assemblage de la requete */ |
protected $total_resultat; |
protected $retour_format = 'max'; |
// beaucoup plus flexible dans le cas de requêtes SQL complexes |
protected $mesChamps = ''; |
protected $mesJoinsEtConditions = ''; |
public function consulter($ressources, $parametres) { |
$this->ressources = $ressources; |
$this->parametres = $parametres; |
$this->service = 'ontologies'; |
$this->traiterParametres(); |
$resultats = ''; |
$this->table = 'baseflor_ontologies'; |
$this->recupererNomChamp($this->table); |
$this->traiterRessources(); |
$requete = $this->assemblerLaRequete(); |
$resultat = $this->getBdd()->recupererTous($requete); |
return $this->traiterResultat($resultat, ''); |
} |
public function traiterParametres() { |
if (isset($this->parametres) && !empty($this->parametres)) { |
foreach ($this->parametres as $param => $valeur) { |
switch ($param) { |
case 'masque' : $this->ajouterLeFiltreMasque('masque', $valeur); break; |
case 'masque.code' : $this->ajouterLeFiltreMasque('code', $valeur); break; |
case 'masque.nom' : $this->ajouterLeFiltreMasque('nom', $valeur); break; |
case 'masque.description' : $this->ajouterLeFiltreMasque('description', $valeur); break; |
case 'retour.format' : $this->retour_format = $valeur; break; |
case 'navigation.depart' : $this->limite_requete['depart'] = $valeur; break; |
case 'navigation.limite' : $this->limite_requete['limite'] = $valeur; break; |
default : |
$e = 'Erreur dans les parametres de recherche de votre requête : </br> Le paramètre " ' |
.$param.' " n\'existe pas.'; |
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e); break; |
} |
} |
} |
} |
public function ajouterLeFiltreMasque($nom_champ, $valeur) { |
if ($nom_champ == 'code') { |
$this->requete_condition[] = $nom_champ.' = '.$this->getBdd()->proteger($valeur); |
} else { |
if (isset($this->parametres['recherche']) && $this->parametres['recherche'] == 'floue') { |
if ($nom_champ == 'masque') { |
$this->requete_condition[] = '( code = '.$this->getBdd()->proteger($valeur) |
.' OR ( SOUNDEX(nom) = SOUNDEX(\''.$valeur.'\')' |
.' OR SOUNDEX(REVERSE(nom)) = SOUNDEX(REVERSE(\''.$valeur.'\')) ' |
.') OR ( SOUNDEX(description) = SOUNDEX(\''.$valeur.'\')' |
.' OR SOUNDEX(REVERSE(description)) = SOUNDEX(REVERSE(\''.$valeur.'\')) ))'; |
} else { |
$this->requete_condition[] = '(SOUNDEX('.$nom_champ.') = SOUNDEX(\''.$valeur.'\')' |
.' OR SOUNDEX(REVERSE('.$nom_champ.')) = SOUNDEX(REVERSE(\''.$valeur.'\')))'; |
} |
} else { |
if (isset($this->parametres['recherche']) && $this->parametres['recherche'] == 'etendue') { |
$valeur = str_replace(' ','%', $valeur); |
$valeur .= '%'; |
} |
if ($nom_champ == 'masque') { |
$this->requete_condition[] = '(code = '.$this->getBdd()->proteger($valeur) |
.' OR nom LIKE '.$this->getBdd()->proteger($valeur) |
.' OR description LIKE '.$this->getBdd()->proteger($valeur).')'; |
} else { |
$this->requete_condition[] = $nom_champ.' LIKE '.$this->getBdd()->proteger($valeur); |
} |
} |
} |
} |
public function traiterRessources() { |
if (isset($this->ressources) && !empty($this->ressources)) { |
if (isset($this->ressources[0]) && !empty($this->ressources[0])) { |
//requete = /ontologies/#id |
$this->traiterRessourceId(); |
if (isset($this->ressources[1]) && !empty($this->ressources[1])) { |
//requete = /ontologies/#id/relations |
$this->traiterRessourceRelations(); |
} |
} |
} |
} |
public function traiterRessourceId() { |
$this->requete_condition = array(); |
//requete : /ontologies/#id (ex : /ontologies/7) |
if (is_numeric($this->ressources[0])) { |
$this->requete_condition[] = ' id = '.$this->getBdd()->proteger($this->ressources[0]); |
$this->format_reponse .= '/id'; |
//requete : /ontologies/#classe:#code (ex : /ontologies/rangTaxo:290) |
} elseif (strrpos($this->ressources[0], ':') !== false) { |
// plusieurs couples #classe:#code séparés par des virgules |
if(strrpos($this->ressources[0], ',') !== false) { |
$this->traiterMultipleRessourceId(); |
return; |
} |
// ou un unique couple #classe:#code |
$this->format_reponse .= '/id'; |
preg_match('/^([^:]+):([^:]+)$/', $this->ressources[0], $match); |
$this->requete_condition[] = |
' id = (SELECT id FROM '.$this->table.' WHERE code = BINARY '.$this->getBdd()->proteger($match[2]) |
.' AND classe_id = (SELECT id FROM '.$this->table.' WHERE code = BINARY '.$this->getBdd()->proteger($match[1]).'))'; |
// TODO: optimiser, à voir: traiterMultipleRessourceId() ci-dessous |
// SELECT a.* |
// FROM $this->table a |
// LEFT JOIN $this->table b ON a.id = b.id LEFT JOIN $this->table c ON b.classe_id = c.id |
// WHERE b.code = $this->getBdd()->proteger($match[2]) |
// AND c.code = $this->getBdd()->proteger($match[1]); |
} else { |
$e = 'Erreur dans les paramètres de recherche de votre requête : </br> Le paramètre " ' |
.$this->ressources[0].' " n\'existe pas.'; |
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e); |
} |
} |
// Requète : /ontologies/#classe:#code,[...] (ex : /ontologies/numStatus:2,numStatus:3,genreNombre:10) |
public function traiterMultipleRessourceId() { |
$this->format_reponse .= '/ids'; // noter le "s" |
$this->mesChamps = Array( |
// 'a.*' // pourquoi pas, mais alors des unset() seront nécessaire |
'a.id', |
'a.classe_id AS `classe.id`', |
'a.nom', |
'a.description', |
'a.code', |
'a.complements', |
'c.nom AS classe', // évite très simplement (un très couteux) ajouterClasseCorrespondante() |
'concat(c.code,":", b.code) AS requete'); // permet aux appelants de récupérer la valeur qu'ils recherchent |
$this->mesChamps = implode(', ', $this->mesChamps); |
$this->mesJoinsEtConditions = |
// alias de la table première |
" a " |
. " LEFT JOIN {$this->table} b ON a.id = b.id LEFT JOIN {$this->table} c ON b.classe_id = c.id" |
. " WHERE "; |
$or_stack = false; |
$tab = explode(',', $this->ressources[0]); |
foreach($tab as $couple) { |
preg_match('/^([^:]+):([^:]+)$/', $couple, $match); |
if($or_stack) { |
// une fois qu'un set de condition et présent, |
// les autres sont `OR`-ed. |
$this->mesJoinsEtConditions .= " OR "; |
} |
$this->mesJoinsEtConditions .= |
sprintf("(b.code = %s AND c.code = %s)", |
$this->getBdd()->proteger($match[2]), |
$this->getBdd()->proteger($match[1])); |
$or_stack = true; |
} |
} |
public function traiterRessourceRelations() { |
//requete = /ontologies/#id/relations : |
if ($this->ressources[1] == 'relations') { |
$this->format_reponse .= '/relations'; |
$this->requete_condition = array('classe_id = (SELECT classe_id FROM '.$this->table.' WHERE ' |
.implode(' AND ', $this->requete_condition).')'); |
} |
} |
//+--------------------------FONCTION ASSEMBLAGE DE LA REQUETE-------------------------------------------+ |
public function assemblerLaRequete() { |
$requete = ' SELECT '.$this->formerRequeteChamp(). |
' FROM '.$this->table |
.$this->retournerRequeteCondition() |
.$this->formerRequeteLimite(); //print_r($requete); |
return $requete; |
} |
public function formerRequeteChamp() { |
if($this->mesChamps) return $this->mesChamps; |
$champ[] = 'id'; |
if ($this->format_reponse == 'ontologies') { |
$champ[] = 'nom, code '; |
} |
if (isset($this->parametres['retour_champs']) || $this->format_reponse == 'ontologies/id/champs') { |
$champs_recherches = explode(',', $this->parametres['retour_champs']); |
$champs_possibles = $this->rechercherChampsPossibles(); |
foreach ($champs_recherches as $champ_recherche) { |
if ($this->verifierValiditeChamp($champ_recherche, $champs_possibles)) { |
$champ[] = (preg_match('/classe/', $champ_recherche)) ? 'classe_id' : $champ_recherche; |
} |
} |
} |
if (count($champ) == 1) { |
$champ = array(' * '); |
} |
return implode(', ', $champ); |
} |
public function rechercherChampsPossibles() { |
$this->recupererNomChamp($this->table); |
$champs_possibles = $this->champs_table; |
$champs_possibles[] = 'classe.id'; |
$champs_possibles[] = 'classe'; |
$champs_possibles[] = 'classe.href'; |
return $champs_possibles; |
} |
public function verifierValiditeChamp($champ, $champs_possibles) { |
$validite = false; |
preg_match('/^([^.]+)(:?\.([^.]+))?$/', $champ, $match); |
if (in_array($match[1], $champs_possibles)) { |
$validite = true; |
} else { |
$champs = implode('</li><li>', $champs_possibles); |
$e = 'Erreur dans votre requête : </br> Le champ "'.$champ |
.'" n\'existe pas. Les champs disponibles sont : <li>'.$champs.'</li>'; |
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e); |
} |
return $validite; |
} |
public function retournerRequeteCondition() { |
if($this->mesJoinsEtConditions) return $this->mesJoinsEtConditions; |
$condition = ''; |
if ($this->requete_condition !== null) { |
$condition = ' WHERE '.implode(' AND ', $this->requete_condition); |
} |
return $condition; |
} |
public function formerRequeteLimite() { |
$this->total_resultat = $this->recupererTotalResultat(); |
if (in_array($this->format_reponse , array('textes/id', 'textes/id/relations'))) { |
$this->requete_limite = ''; |
} elseif (($depart = $this->limite_requete['depart']) > ($this->total_resultat)) { |
$this->limite_requete['depart'] = |
(($this->total_resultat - $this->limite_requete['limite']) < 0) ? 0 : ($this->total_resultat - $this->limite_requete['limite']); |
$this->requete_limite = ' LIMIT '.$this->limite_requete['depart'].', '.$this->limite_requete['limite']; |
} else { |
$this->requete_limite = ' LIMIT '.$this->limite_requete['depart'].', '.$this->limite_requete['limite']; |
} |
return $this->requete_limite; |
} |
public function recupererTotalResultat() { |
//on récupère le nombre total de résultats de la requete (ex : le nombre d'id contenu dans la liste /ontologies) |
$requete = 'SELECT count(*) as nombre FROM '.$this->table.' ' |
.$this->retournerRequeteCondition(); |
$res = $this->getBdd()->recuperer($requete . ' -- ' . __FILE__ . ':' . __LINE__); |
if ($res) { |
$total = $res['nombre']; |
} else { |
$e = 'Données introuvables dans la base'; |
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE, $e); |
Debug::printr($requete); |
} |
return $total; |
} |
//+------------------------------------------------------------------------------------------------------+ |
public function retournerResultatFormate($resultat) { |
// determine en fct du service appelé (/ontologies | /ontologies/#id | /ontologies/#id/champ | |
// /ontologies/#id/relations) le format du tableau à retourner. Encode en json |
switch ($this->format_reponse) { |
case 'ontologies' : $reponse = $this->formaterOntologies($resultat); break; |
case 'ontologies/id' : $reponse = $this->formaterOntologiesId($resultat[0]); break; |
case 'ontologies/ids' : $reponse = $this->formaterMultipleOntologiesId($resultat); break; |
case 'ontologies/id/relations' : $reponse = $this->formaterOntologiesIdRelations($resultat); break; |
default : break; |
} |
return $reponse; |
} |
public function formaterOntologies($resultat) { |
$this->ajouterEnteteResultat($resultat); |
$table_retour_json['entete'] = $this->ajouterEnteteResultat($resultat); |
if (isset($this->parametres['masque_code']) || isset($this->parametres['masque'])) { |
$resultat = $this->trierRechercheFloue($this->parametres['masque_code'], $resultat, 'code'); |
} elseif (isset($this->parametres['masque_nom'])) { |
$resultat = $this->trierRechercheFloue($this->parametres['masque_nom'], $resultat, 'nom'); |
} elseif (isset($this->parametres['masque_description'])) { |
$resultat = $this->trierRechercheFloue($this->parametres['masque_description'], $resultat, 'description'); |
} |
//on remplit la table $table_retour_json['resultat'] |
foreach ($resultat as $tab) { |
$num = $tab['id']; |
unset($tab['id']); |
foreach ($tab as $param => $valeur) { |
$resultat_json[$num][$param] = $valeur; |
} |
if ($this->retour_format == 'max') $resultat_json[$num]['href'] = $this->ajouterHref('ontologies', $num); |
} |
$table_retour_json['resultat'] = $resultat_json; |
return $table_retour_json; |
} |
public function ajouterEnteteResultat($resultat) { |
//on remplit la table $table_retour_json['entete'] |
$entete['depart'] = $this->limite_requete['depart']; |
$entete['limite'] = $this->limite_requete['limite']; |
$entete['total'] = $this->total_resultat; |
//formuler les urls |
$url = $this->formulerUrl($this->total_resultat, '/ontologies'); |
if (isset($url['precedent']) && $url['precedent'] != '') { $entete['href.precedent'] = $url['precedent']; } |
if (isset($url['suivant']) && $url['suivant'] != '') { $entete['href.suivant'] = $url['suivant']; } |
return $entete; |
} |
public function __anonyme1($val) { return $val != ''; } |
public function formaterOntologiesId($resultat) { |
$table_retour = array_filter($resultat, array($this, '__anonyme1')); |
$this->calculerClassID($table_retour); |
return $table_retour; |
} |
public function formaterMultipleOntologiesId($resultats) { |
$result = Array(); |
foreach($resultats as $k => $resultat) { |
$id = $resultat['requete']; |
$result[$id] = array_filter($resultat, array($this, '__anonyme1')); |
unset($result[$id]['requete']); |
$this->calculerClassID($result[$id]); |
} |
return $result; |
} |
public function calculerClassID(&$resultat) { |
// commenté: pourquoi restreindre le choix des champs au format "max", |
// ça ne semble pas logique... |
// if ($this->retour_format != 'max') return; |
// question: pourquoi ne pas passer les infos relatives aux ontologies 0 ? |
// et que signifie ce commentaire: "pas de parent" |
if (@$resultat['classe_id'] == '0') return; |
$valeur = isset($resultat['classe_id']) ? $resultat['classe_id'] : $resultat['classe.id']; |
if(! isset($resultat['classe.id'])) { |
$resultat['classe.id'] = $resultat['classe_id']; |
unset($resultat['classe_id']); |
} |
// max-format et pas de champs spécifiques demandés ? |
// Alors on rempli "classe" et "classe.href" |
// Mais ne pas recalculer (surtout la classe) si ce n'est pas nécessaire |
// (c'est le cas si l'on a demandé plusieurs critère [provenons de formaterMultipleOntologiesId()]) |
if (! isset($this->parametres['retour_champs'])) { |
if(! isset($resultat['classe'])) { |
$nom_classe = $this->ajouterClasseCorrespondante($valeur); |
if (isset($nom_classe)) $resultat['classe'] = $nom_classe; |
} |
if(! isset($resultat['classe.href'])) { |
$resultat['classe.href'] = $this->ajouterHref('ontologies', $valeur); |
} |
return; |
} |
// cas où des champs sont demandés |
$champs = explode(',', $this->parametres['retour_champs']); |
if(in_array('classe', $champs) && ! isset($resultat['classe'])) { |
$this->ajouterClasseCorrespondante($valeur); |
} |
if(in_array('classe.id', $champs) && ! isset($resultat['classe.id'])) { |
$resultat['classe.id'] = $valeur; |
} |
if(in_array('classe.href', $champs) && ! isset($resultat['classe.href'])) { |
$resultat['classe.href'] = $this->ajouterHref('ontologies', $valeur); |
} |
if(in_array('classe.*', $champs) && (! isset($resultat['classe.href']) || ! isset($resultat['classe.id']))) { |
$resultat['classe.id'] = $valeur; |
$resultat['classe.href'] = $this->ajouterHref('ontologies', $valeur); |
} |
} |
/** Recherche par interrogation de la base, le nom de la classe à partir de son identifiant (classe.id) */ |
public function ajouterClasseCorrespondante($classe_id) { |
$nom = null; |
if ($classe_id != 0) { |
$nom = ''; |
$req = 'SELECT nom FROM '.$this->table.' WHERE id = '.$this->getBdd()->proteger($classe_id); |
$res = $this->getBdd()->recuperer($req); |
if ($res) { |
$nom = $res['nom']; |
} else { |
$e = "Données introuvables dans la table $this->table"; |
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE, $e); |
Debug::printr($req); |
} |
} |
return $nom; |
} |
public function formaterOntologiesIdRelations($resultat) { |
$retour = null; |
if ($resultat != '') { |
$retour['entete'] = $this->ajouterEnteteResultat($resultat); |
//on remplit la table $table_retour_json['resultat'] |
foreach ($resultat as $tab) { |
$num = $tab['id']; |
$retour['resultat'][$num]['nom'] = $tab['nom']; |
if ($this->retour_format == 'max') { |
$retour['resultat'][$num]['href'] = $this->ajouterHref('ontologies', $num); |
} |
} |
} |
return $retour; |
} |
} |
?> |
/tags/v0.1-20130830/services/modules/0.1/baseflor/GraphiquesBaseflor.php |
---|
New file |
0,0 → 1,121 |
<?php |
/** |
* Classe GraphiquesBaseflor.php transforme les données écologiques de la table baseflor |
* en graphique svg |
* graphiques/#typegraphique/#bdnt.nn:#num_nomen --> renvoie un graphique avec les données connues |
* |
* |
* @package eflore-projets |
* @author Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org> |
* @author Mathilde SALTHUN-LASSALLE <mathilde@tela-botanica.org> |
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt> |
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt> |
* @version 1.0 |
* @copyright 1999-2011 Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org) |
*/ |
class GraphiquesBaseflor extends CommunGraphiques{ |
public function definirTable($version){ |
$this->table = Config::get('bdd_table')."_v".$version; |
} |
//+--------------------------traitement ressources ou paramètres -------------------------------------------+ |
public function traiterReferentieletNum(){ |
if (!empty($this->ressources[1])) { |
if(preg_match('/^(.+)\.nn:([0-9]+)$/', $this->ressources[1], $retour) == 1){ |
switch ($retour[1]) { |
case 'bdtfx' : |
$this->requete_condition[]= "num_nomen = ".$retour[2]." AND bdnt = 'bdtfx' "; |
break; |
case 'bdafx' : |
$this->requete_condition[] = "num_nomen = ".$retour[2]." AND bdnt = 'bdafx' "; |
break; |
case 'bdbfx' : |
$this->requete_condition[] = "num_nomen = ".$retour[2]." AND bdnt = 'bdbfx' "; |
break; |
default : |
$e = "Le référentiel {$retour[1]} n'existe pas."; |
throw new Exception( $e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); |
break; |
} |
}else { |
$e = "Erreur dans l'url de votre requête :". |
" précisez le référentiel et le numéro nomenclatural sous la forme {bdnt}.nn:{nn}."; |
throw new Exception( $e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); |
} |
} else { |
throw new Exception( "Erreur dans l'url de votre requête :". |
" précisez le référentiel et le numéro nomenclatural sous la forme {bdnt}.nn:{nn}.", |
RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); |
} |
} |
public function traiterTypeGraphique(){ |
if (!empty($this->ressources[0])) { |
switch ($this->ressources[0]) { |
case 'climat' : |
$this->requete_champs = ' ve_lumiere , ve_temperature, ve_continentalite, ve_humidite_atmos' ; |
$this->nomGraphique= 'climat'; |
break; |
case 'sol' : |
$this->requete_champs = ' ve_humidite_edaph , ve_reaction_sol, ve_nutriments_sol, ve_salinite,' |
.'ve_texture_sol, ve_mat_org_sol' ; |
$this->nomGraphique = 'sol'; |
break; |
default : |
$e = "Erreur dans l'url de votre requête :". |
"</br> precisez le graphique -> \"sol\" ou \"climat\"."; |
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); |
break; |
} |
}else { |
throw new Exception("Erreur dans l'url de votre requête :". |
"</br> precisez le graphique -> \"sol\" ou \"climat\".", RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); |
} |
} |
//+-------------------------- formatage du résultat -------------------------------------------+ |
/// ++++ svg +++++ /// |
public function changerValeursSVG(){ |
$Dompath = new DOMXPath($this->dom); |
foreach ($this->valeurs_en_pourcentage as $cle => $val){ |
$val = preg_replace('/,/','.', $val); |
$grad_id = array_search($val,$this->graduations_id); |
$element = $Dompath->query("//*[@id='".$grad_id."']")->item(0); |
if($element != null) { |
$pos_x = $element->getAttribute('x1'); |
$curseur = $Dompath->query("//*[@id='".$cle."']")->item(0); |
$curseur->setAttribute('cx', $pos_x); |
$curseur->setAttribute('class', 'curseur'); |
$this->ajouterInfoAuSurvol($curseur); |
$changement = true; |
} |
} |
$this->ajusterFormatSVG(); |
} |
public function ajouterInfoAuSurvol($curseur){ |
$champs = $curseur->getAttribute('id'); |
$valeurTexte = $this->recupererOntologies($this->valeurs_champs[$champs], $champs ); |
$valeurTexte = $this->traiterIntermediaires($valeurTexte->nom, $champs, $champs); |
$curseur->setAttribute('title',$this->valeurs_champs[$champs].": ".$valeurTexte ); |
} |
} |
?> |
/tags/v0.1-20130830/services/modules/0.1/baseflor/InformationsBaseflor.php |
---|
New file |
0,0 → 1,531 |
<?php |
/** |
* Classe InformationsBaseflor.php permet de faire des requetes de baseflor en fonction d'un référentiel |
*( BDTFX, BDAFX, BDBFX ) et d'un numéro nomenclatural ( différent de 0 ). |
* fin d'url possibles : |
* /informations/#bdnt.nn:#num_nomen --> retourne tous les champs pour un BDNT et un num_nomen |
* /informations/#bdnt.nn:#num_nomen?champs=description --> retourne champs description pour un BDNT et un num_nomen |
* /informations/#bdnt.nn:#num_nomen?champs=ecologie --> retourne champs ecologiques pour un BDNT et un num_nomen |
* /informations/#bdnt.nn:#num_nomen/relations/catminat --> donne les num nomen et les bdnt pour tous |
* les taxons qui ont le même code catminat ( code milieu ) que celui entré |
* |
* Encodage en entrée : utf8 |
* Encodage en sortie : utf8 |
* @package eflore-projets |
* @author Mathilde SALTHUN-LASSALLE <mathilde@tela-botanica.org> |
* @author Delphine CAUQUIL <delphine@tela-botanica.org> |
* @author Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org> |
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt> |
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt> |
* @version 1.0 |
* @copyright 1999-2012 Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org) |
*/ |
class InformationsBaseflor extends Commun{ |
protected $table = ""; |
private $format_reponse = 'informations'; |
private $retour_format = 'max'; |
private $champs_ontologiques = array(); |
protected $serviceNom = 'informations'; |
private $Bdd; |
private $requete_condition = ""; |
private $champs_recherches = '*'; |
private $resultat_json; |
private $nb_ressources; |
protected $limite_requete = array( 'depart' => 0, 'limite' => 10); |
public function consulter($ressources, $parametres) { |
$this->ressources = $ressources; |
$this->parametres = $parametres; |
$this->nb_ressources = count($ressources); |
$this->traiterParametres(); |
$this->definirTables(); |
$this->traiterRessources(); |
$resultats = null; |
foreach ($this->table_version as $version) { |
$this->table = $version; |
$requete = $this->assemblerLaRequete(); |
$resultat = $this->Bdd->recupererTous($requete); |
$versionResultat = $this->analyserResultat($resultat); |
if (count($this->table_version) > 1) { |
$resultats[$version] = $versionResultat; |
} else { |
$resultats = $versionResultat; |
} |
} |
return $resultats; |
} |
public function __construct(Conteneur $Conteneur) { |
$this->Bdd = $Conteneur->getBdd(); |
} |
public function analyserResultat($resultat) { |
$versionResultat = null; |
if ($resultat == '') { |
$message = 'La requête SQL formée comporte une erreur!'; |
$code = RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE; |
throw new Exception($message, $code); |
} elseif ($resultat) { |
$versionResultat = $this->retournerResultatFormate($resultat); |
} |
return $versionResultat; |
} |
//+--------------------------traitement ressources ou paramètres -------------------------------------------+ |
public function traiterParametres() { |
if (isset($this->parametres) && !empty($this->parametres)) { |
foreach ($this->parametres as $param => $valeur) { |
switch ($param) { |
case 'categorie' : |
if($this->nb_ressources != 1 ) { |
$e = "Nombre de ressource != 1 pour informations/#id/relations/catminat"; |
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); |
} |
if ($valeur == "description") { |
$this->champs_recherches = "num_nomen, BDNT, chorologie, inflorescence," |
." sexualite, ordre_maturation, " |
."pollinisation, fruit, dissemination, couleur_fleur, macule, floraison, type_bio, " |
."form_vegetale "; |
$this->requete_condition[] = "( chorologie != '' OR inflorescence != '' ". |
"OR sexualite != '' OR ordre_maturation != '' OR pollinisation != '' ". |
"OR fruit != '' OR dissemination != '' OR couleur_fleur != '' OR macule != '' ". |
"OR floraison != '' OR type_bio != '' OR form_vegetale != '' )"; |
} elseif ($valeur == "ecologie") { |
$this->champs_recherches = " num_nomen, BDNT, ve_lumiere , ve_temperature," |
." ve_continentalite, ve_humidite_atmos, ve_humidite_edaph, ve_reaction_sol," |
." ve_nutriments_sol, ve_salinite, ve_texture_sol, ve_mat_org_sol, " |
." vi_lumiere, vi_temperature, vi_continentalite, vi_humidite_edaph," |
." vi_reaction_sol, vi_nutriments_sol, vi_salinite "; |
$this->requete_condition[] = "( ve_lumiere != '' OR ve_temperature != '' ". |
"OR ve_continentalite != '' OR ve_humidite_atmos != '' ". |
"OR ve_humidite_edaph != '' OR ve_reaction_sol != '' ". |
"OR ve_nutriments_sol != '' OR ve_salinite != '' ". |
"OR ve_texture_sol != '' OR ve_mat_org_sol != '' )"; |
} else { |
$e = "Valeur de paramètre inconnue pour 'categorie'. Ce paramètre n'est pas autorisé pour informations/#id/relations/catminat"; |
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); |
} |
break; |
case 'retour.format' : |
if ($valeur == 'min' || $valeur == 'max' && $this->nb_ressources == 1) { |
$this->retour_format = $valeur; |
} else { |
$e = "Valeur de paramètre inconnue pour 'retour.format'. Ce paramètre n'est pas autorisé pour informations/#id/relations/catminat"; |
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); |
} |
break; |
case 'navigation.depart' : |
$this->definirNavigationDepart($valeur); |
break; |
case 'navigation.limite' : |
$this->definirNavigationLimite($valeur); |
break; |
case 'version.projet' : |
$this->traiterVersion($valeur); |
break; |
default : |
$e = 'Erreur dans les parametres de votre requête : </br> Le paramètre " ' |
.$param.' " n\'existe pas.'; |
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); |
break; |
} |
} |
} |
} |
public function traiterRessources() { |
if(preg_match('/^(.+)\.nn:([0-9]+)$/', $this->ressources[0], $retour)){ |
$id = $retour[2]; |
$ref = $retour[1]; |
if ($ref == 'bdtfx' || $ref == 'bdafx' || $ref == 'bdbfx') { |
if($this->nb_ressources == 1) { |
$this->requete_condition[] = "num_nomen = ".$id." AND BDNT = '".strtoupper($ref)."' "; |
} else { |
$this->definirParametresRequeteRelations($ref, $id); |
} |
} else { |
$e = 'Erreur dans l\'url de votre requête : </br> Le référentiel " ' |
.$ref.' " n\'existe pas.'; |
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); |
} |
} else { |
$e = 'Erreur dans l\'url de votre requête : </br> La ressource demandée n\'existe pas.'; |
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); |
} |
} |
function definirParametresRequeteRelations($ref, $id){ |
if ($this->ressources[1] == 'relations'){ |
switch ($this->ressources[2]) { |
case 'catminat' : |
$this->requete_condition[] = "catminat_code = ( SELECT catminat_code from ".$this->table_version[0]." WHERE " |
." num_nomen = ".$id." AND BDNT = '".$ref. "' ) AND num_nomen != ".$id." "; |
$this->champs_recherches = " catminat_code, num_nomen, BDNT, idiotaxon "; |
break; |
default : |
$e = 'Erreur dans l\'url de votre requête : </br> Le type de relation " ' |
.$this->ressources[2].' " n\'existe pas.'; |
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); |
break; |
} |
} else { |
$e = 'Erreur dans l\'url de votre requête : </br> Le type de ressources " ' |
.$this->ressources[1].' " n\'existe pas.'; |
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); |
} |
} |
//+++------------------------------traitement des versions----------------------------------------++ |
public function traiterVersion($valeur) { |
if (preg_match('/^[0-9]+(?:[._][0-9]+)*$/', $valeur) || $valeur == '+') { |
$this->version_projet = $valeur; |
} elseif ($valeur == '*') { |
$this->version_projet = ($this->nb_ressources == 1) ? $valeur : '+' ; |
} else { |
$e = "Erreur : La version est inconnue."; |
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); |
} |
} |
public function definirTables() { |
$table_num_version = $this->recupererVersionDisponible(); |
$prefixe_table = config::get('bdd_table'); |
if ( in_array($this->version_projet,$table_num_version) ) { |
$this->table_version[] = $prefixe_table.'_v'.$this->version_projet; |
} elseif ($this->version_projet == '+') { |
$derniere_version = $table_num_version[count($table_num_version) - 1]; |
$this->table_version[] = $prefixe_table.'_v'.str_replace('.', '_', $derniere_version); |
} elseif ($this->version_projet == '*') { |
foreach ($table_num_version as $num_version) { |
$this->table_version[] = $prefixe_table.'_v'.str_replace('.', '_', $num_version); |
} |
} else { |
$e = "Erreur : La version est inconnue."; |
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); |
} |
} |
//+--------------------------formatages de resultats -------------------------------------------+ |
public function retournerResultatFormate($resultat) { |
$resultat_json = $resultat[0]; |
if ($this->retour_format == 'max'){ |
if ($this->nb_ressources == 1) { |
if ($this->parametres['categorie'] == 'ecologie') { |
$this->formaterResultatsChampsEcologie($resultat_json); |
} elseif ($this->parametres['categorie'] == 'description') { |
$this->formaterResultatsChampsDescription($resultat_json); |
}else { |
$this->formaterResultatsTousChamps($resultat_json); |
} |
} else { |
$this->formaterResultatsRelations($resultat); |
} |
} else { |
$this->resultat_json = $resultat_json; |
} |
return $this->resultat_json; |
} |
public function formaterResultatsRelations($resultat) { |
$this->resultat_json['entete'] = $this->ajouterEnteteResultat(); |
$resultat_json = array(); |
foreach ($resultat as $cle => $res){ |
$resultat_json[$cle] = $res ; |
$resultat_json[$cle]['href'] = $this->ajouterHref('informations',strtolower($res['BDNT']).".nn:".$res['num_nomen']); |
} |
$this->resultat_json['resultat'] = $resultat_json; |
} |
public function ajouterEnteteResultat() { |
$entete['depart'] = $this->limite_requete['depart']; |
$entete['limite'] = $this->limite_requete['limite']; |
$entete['total'] = $this->total_resultat; |
$entete['version'] = $this->version_projet; |
if ($this->limite_requete['limite'] != '*') { |
$url = $this->formulerUrl($this->total_resultat, '/informations/'.$this->ressources[0].'/relations/catminat'); |
if (isset($url['precedent']) && $url['precedent'] != '') { |
$entete['href.precedent'] = $url['precedent']; |
} |
if (isset($url['suivant']) && $url['suivant'] != '') { |
$entete['href.suivant'] = $url['suivant']; |
} |
} |
return $entete; |
} |
public function formaterResultatsTousChamps($resultat) { |
$this->resultat_json = $resultat; |
$this->traiterTypeBio(); |
$graphique_presence = $this->traiterEcologie() ; |
if ($graphique_presence) { |
$graphique = $this->ajouterLiensGraphique($graphique_presence); |
} |
} |
public function formaterResultatsChampsEcologie($resultat) { |
$this->resultat_json = $resultat; |
$graphique_presence = $this->traiterEcologie() ; |
if ($graphique_presence) { |
$graphique = $this->ajouterLiensGraphique($graphique_presence); |
} |
} |
public function formaterResultatsChampsDescription($resultat) { |
$this->resultat_json = $resultat; |
$this->traiterTypeBio(); |
} |
//vérifie la présence de données écologiques pour les graphiques et récupère leur ontologie |
public function traiterEcologie() { |
$donnees_presence = false; |
$this->champs_ontologiques = $this->recupererTableauConfig('champs_ontologiques'); |
foreach ($this->champs_ontologiques as $cle => $valeur){ |
if ($this->resultat_json[$cle] != ""){ |
$donnees_presence[$this->getNomGraphique($valeur)] = true; |
$this->recupererOntologies($this->resultat_json[$cle], $cle); |
unset($this->resultat_json[$cle]); |
} |
} |
return $donnees_presence; |
} |
//donne le nom du graphique correspondant à un champ écologique |
public function getNomGraphique($code_ecolo) { |
$graphique = null; |
if (in_array($code_ecolo, explode(',',Config::get('Paramètres.climat')))) { |
$graphique = 'climat'; |
} elseif (in_array($code_ecolo, explode(',', Config::get('Paramètres.sol')) )) { |
$graphique = 'sol'; |
} |
return $graphique; |
} |
public function traiterTypeBio() { |
if ($this->resultat_json['type_bio'] != ""){ |
$tab_ontologie = $this->recupererOntologiePrTypeBio($this->resultat_json['type_bio']); |
unset($this->resultat_json['type_bio']); |
$this->resultat_json= array_merge($this->resultat_json,$tab_ontologie); |
} |
} |
public function ajouterLiensGraphique($graphique_presence) { |
if ($graphique_presence['climat']) { |
$this->resultat_json['graphique_climat']['libelle'] = 'climat'; |
$this->resultat_json['graphique_climat']['href'] = |
$this->ajouterHref('graphiques/climat', strtolower($this->resultat_json['BDNT']).'.nn:'.$this->resultat_json['num_nomen']); |
} |
if ($graphique_presence['sol']) { |
$this->resultat_json['graphique_sol']['libelle'] = 'sol'; |
$this->resultat_json['graphique_sol']['href'] = |
$this->ajouterHref('graphiques/sol', strtolower($this->resultat_json['BDNT']).'.nn:'.$this->resultat_json['num_nomen']); |
} |
} |
//+--------------------------traitement ontologies -------------------------------------------+ |
public function recupererOntologies($valeur, $champs){ |
$url = Config::get('url_service_base').Config::get('nom_projet'). |
'/ontologies/'.$this->champs_ontologiques[$champs].':'.urlencode(urlencode($valeur)); |
$val = $this->getBdd()->recuperer(sprintf( |
"SELECT a.nom FROM baseflor_ontologies a LEFT JOIN baseflor_ontologies b ON a.id = b.id LEFT JOIN baseflor_ontologies c ON b.classe_id = c.id WHERE". |
" b.code = BINARY '%s' AND c.code = BINARY '%s' LIMIT 0, 100", |
$valeur, |
$this->champs_ontologiques[$champs]), |
Bdd::MODE_OBJET); |
$this->resultat_json[$champs.'.libelle'] = isset($val->nom) ? $val->nom : NULL; // eg: VEMO:0 |
$this->resultat_json[$champs.'.code'] = $valeur; |
$this->resultat_json[$champs.'.href'] = $url; |
} |
//+-------------ontologie pour le champs type biologique (lire le .txt)---+ |
public function recupererOntologiePrTypeBio($type_a_traiter){ |
$resultat_typeBio = ""; |
if ($type_a_traiter != "") { |
$types_prim_sec = $this->separerTypesPrimairesSecondaires($type_a_traiter); |
$types_sstypes = $this->classerPrimSecEnTypesSsTypes($types_prim_sec); |
$resultat_typeBio = $this->formaterJsonTypeBio($types_sstypes, $type_a_traiter ); |
} |
return $resultat_typeBio; |
} |
public function classerPrimSecEnTypesSsTypes($types_prim_sec) { |
$types_sstypes = ''; |
foreach ($types_prim_sec as $cle => $tb) { |
$types_sstypes[$cle]= $this->separerTypes_SousTypes($tb, $cle); |
} |
switch (count($types_sstypes)) { |
case 1 : |
$types_sstypes = $types_sstypes['principal']; |
break; |
case 2 : |
$types_sstypes = array_merge($types_sstypes['principal'],$types_sstypes['secondaire']); |
break; |
} |
return $types_sstypes; |
} |
public function formaterJsonTypeBio( $types_sstypes, $type_a_traiter) { |
$resultat_typeBio['type_bio.code'] = $type_a_traiter; |
foreach ($types_sstypes as $cle => $tb) { |
if (($cle == 'type.principal') || ($cle == 'type.secondaire')) { |
$i = 0; |
foreach ($tb as $types) { |
$url = Config::get('url_service_base').Config::get('nom_projet'). |
'/ontologies/TB:'.urlencode(urlencode($types)); |
$val = $this->consulterHref($url); |
$libelle[$cle][$i]= $val->nom; |
$detail[$cle][$i]['libelle'] = $val->nom; |
$detail[$cle][$i]['code'] = $val->code; |
$detail[$cle][$i]['href'] = $url; |
$i++; |
} |
} |
if ($cle == 'sous_type.principal' || $cle == 'sous_type.secondaire' ) { |
$i = 0; |
foreach ($tb as $sstypes) { |
$url = Config::get('url_service_base').Config::get('nom_projet'). |
'/ontologies/ssTT:'.urlencode(urlencode($sstypes)); |
$val = $this->consulterHref($url); |
$libelle[$cle][$i]=$val->nom; |
$detail[$cle][$i]['libelle'] = $val->nom; |
$detail[$cle][$i]['code'] = $val->code; |
$detail[$cle][$i]['href'] = $url; |
$i++; |
} |
} |
} |
//var_dump($libelle); exit; |
$resultat_typeBio['type_bio.libelle']= $this->formaterTypeBioPrLibelle($libelle); |
$resultat_typeBio['type_bio.detail'] = $detail; |
return $resultat_typeBio; |
} |
public function formaterTypeBioPrLibelle($info) { |
$libelle = implode(', ',$info['type.principal'])." "; |
$libelle .= isset($info['sous_type.principal']) ? " (".implode(', ',$info['sous_type.principal']).") " : ""; |
$libelle .= isset($info['type.secondaire']) ? ", ".implode(', ',$info['type.secondaire'])." " : ""; |
$libelle .= isset($info['sous_type.secondaire']) ? "(".implode(', ',$info['sous_type.secondaire']).") " : ""; |
return $libelle; |
} |
//séparation des principaux et des secondaires |
public function separerTypesPrimairesSecondaires($type) { |
$types = array(); |
if (preg_match("/(.+)\((.+)\)\-{0,1}(.+){0,1}/", $type,$retour)) { |
$types['principal'] = isset($retour[3]) ? $retour[1].'-'. $retour[3] : $retour[1] ; |
$types['secondaire'] = $retour[2]; |
} else { |
$types['principal'] = $type; |
} |
return $types; |
} |
public function separerTypes_SousTypes($type_a_traiter, $typePrimOuSec) { |
$types = array(); |
if (preg_match("/^([a-zA-Zé]+)\-(.+)$|^([a-zA-Zé,]+[^\-])$/", $type_a_traiter, $retour)) { |
//type |
$type = array(); |
$type[0] = (isset($retour[3])) ? $retour[3] : $retour[1] ; |
$type = explode(",", $type[0]); |
for ($i = 0 ; $i < count($type); $i++) { |
$types['type.'.$typePrimOuSec][$i] = $type[$i]; |
} |
//sous types |
$ss_types = array(); |
if (isset($retour[2]) && $retour[2] != '') { |
$ss_types[0] = $retour[2] ; |
$ss_types = explode("-", $ss_types[0]); |
for ($i = 0 ; $i < count($ss_types); $i++) { |
$types['sous_type.'.$typePrimOuSec][$i] = $ss_types[$i]; |
} |
} |
} |
return $types; |
} |
//+--------------------------FONCTIONS D'ASSEMBLAGE DE LA REQUETE-------------------------------------------+ |
public function assemblerLaRequete() { |
$requete = ' SELECT '.$this->champs_recherches.' FROM '.$this->table.' ' |
.$this->retournerRequeteCondition().' '; |
if ($this->nb_ressources != 1 ) { |
$requete .= $this->delimiterResultatsRequete(); |
} |
return $requete; |
} |
public function calculerTotalResultat() { |
$requete = 'SELECT count(*) as nombre FROM '.$this->table.' '.$this->retournerRequeteCondition(); |
$res = $this->getBdd()->recuperer($requete); |
if ($res) { |
$this->total_resultat = $res['nombre']; |
} else { |
$this->total_resultat = 0; |
$e = 'Données introuvables dans la base'; |
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE, $e); |
} |
} |
public function delimiterResultatsRequete() { |
$this->calculerTotalResultat(); |
$requete_limite = ''; |
if ($this->limite_requete['limite'] != '*') { |
if ( ($this->limite_requete['depart'] <= $this->total_resultat)){ |
if (($this->limite_requete['limite'] + $this->limite_requete['depart'] ) |
< $this->total_resultat ){ |
$requete_limite = 'LIMIT '.$this->limite_requete['depart'].', ' |
.$this->limite_requete['limite']; |
} |
} else { |
$e = "Erreur : la valeur pour le paramètre navigation.départ est supérieure". |
" au nombre total de résultats."; |
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE); |
} |
} |
return $requete_limite; |
} |
public function retournerRequeteCondition() { |
$condition = ''; |
if (empty($this->requete_condition) == false) { |
$condition = ' WHERE '.implode(' AND ', $this->requete_condition); |
} |
return $condition; |
} |
} |
?> |
/tags/v0.1-20130830/services/modules/0.1/baseflor/CommunGraphiques.php |
---|
New file |
0,0 → 1,400 |
<?php |
/** |
* Classe CommunGraphiques.php regroupement de fonctions pour les graphiques |
* graphiques/#typegraphique/#bdnt.nn:#num_nomen --> renvoie un graphique avec les données connues |
* |
* |
* @package eflore-projets |
* @author Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org> |
* @author Mathilde SALTHUN-LASSALLE <mathilde@tela-botanica.org> |
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt> |
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt> |
* @version 1.0 |
* @copyright 1999-2011 Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org) |
*/ |
abstract class CommunGraphiques extends Commun{ |
protected $parametres = array(); |
protected $ressources = array(); |
protected $Bdd; |
protected $config; |
protected $cache; |
protected $metadonnees; |
protected $version; |
protected $serviceNom = 'Graphiques'; |
protected $graduations_id = array(); |
protected $champs_ontologiques = array(); |
protected $nomGraphique = array(); |
protected $table = ''; |
protected $requete_condition = ""; |
protected $requete_champs; |
protected $convertisseur; |
protected $cheminGraphBase; |
protected $valeurs_en_pourcentage = array(); |
protected $dom; |
protected $largeurSVG = "500"; |
protected $hauteurSVG; |
protected $valeurs_champs; |
public function consulter($ressources, $parametres) { |
$this->ressources = $ressources; |
$this->parametres = $parametres; |
$this->verifierParametres(); |
$this->initialiserConfiguration(); |
$resultats = ''; |
$this->traiterRessources(); |
$requete = $this->assemblerLaRequete(); |
$resultat = $this->resultat = $this->Bdd->recupererTous($requete); |
$versionResultat = $this->obtenirResultat($resultat); |
return $versionResultat; |
} |
//+--------------------------initialisation de paramètres -------------------------------------------+ |
private function initialiserConfiguration() { |
$conteneur = new Conteneur(); |
$this->Bdd = $conteneur->getBdd(); |
$this->config = $conteneur->getParametre('Graphiques'); |
$this->convertisseur = $this->config['convertisseur']; |
$this->graduations_id = $this->getParametreTableau('graduations_id'); |
$this->champs_ontologiques = $this->getParametreTableau('champs_ontologiques'); |
$this->cheminGraphBase = $this->config['chemin']; |
$cacheOptions = array('mise_en_cache' => $this->config['cache_miseEnCache'], |
'stockage_chemin' => $this->config['cache_stockageChemin'], |
'duree_de_vie' => $this->config['cache_dureeDeVie']); |
$this->cache = $conteneur->getCacheSimple($cacheOptions); |
$this->definirVersion(); |
$this->definirFormat(); |
$this->definirTable($this->version); |
} |
abstract function definirTable($version); |
private function getParametreTableau($cle) { |
$tableau = array(); |
$parametre = Config::get($cle); |
if (empty($parametre) === false) { |
$tableauPartiel = explode(',', $parametre); |
$tableauPartiel = array_map('trim', $tableauPartiel); |
foreach ($tableauPartiel as $champ) { |
if (strpos($champ, '=') !== false && strlen($champ) >= 3) { |
list($cle, $val) = explode('=', $champ); |
$tableau[trim($cle)] = trim($val); |
} else { |
$tableau[] = trim($champ); |
} |
} |
} |
return $tableau; |
} |
//+--------------------------traitement ressources ou paramètres -------------------------------------------+ |
//+---- paramètres ----+ |
private function verifierParametres() { |
if (isset($this->parametres)) { |
$parametres_dispo = array('retour', 'retour.format', 'version.projet'); |
$parametres = array_keys($this->parametres); |
foreach ($parametres as $param) { |
if (!in_array($param, $parametres_dispo)) { |
$erreur = "Erreur : Le paramètre $param est inconnu."; |
$code = RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE; |
throw new Exception($erreur, $code); |
} |
} |
} |
} |
//on n'affiche qu'une version de graphique à la fois ( la dernière ou celle demandée ) |
private function definirVersion() { |
$this->chargerVersions(); |
if (!isset($this->parametres['version.projet']) ) { |
$this->version = $this->metadonnees[0]['version']; |
} elseif ($this->parametres['version.projet'] == '+') { |
$this->version = $this->metadonnees[0]['version']; |
} else { |
if($this->verifierVersion($this->parametres['version.projet'])) { |
$this->version = $this->parametres['version.projet']; |
}else { |
$erreur = "Erreur : La version est inconnue."; |
$code = RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE; |
throw new Exception($erreur, $code); |
} |
} |
} |
private function verifierVersion($version){ |
$retour = false; |
foreach ($this->metadonnees as $vers) { |
if ($vers['version'] == $version ) { |
$retour = true; |
} |
} |
return $retour; |
} |
private function definirFormat() { |
if (isset($this->parametres['retour.format']) ){ |
if (preg_match("/^[0-9]+$/", $this->parametres['retour.format'])){ |
if ($this->parametres['retour.format'] > 0) { |
$this->largeurSVG = $this->parametres['retour.format']; |
} else { |
$erreur = "Erreur : valeur pour retour.format négative ou égale à 0."; |
$code = RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE; |
throw new Exception($erreur, $code); |
} |
}else { |
$erreur = "Erreur : valeur inconnue. Entrez la largeur voulue (en pixels) pour le paramètre retour.format."; |
$code = RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE; |
throw new Exception($erreur, $code); |
} |
} |
if (!isset($this->parametres['retour']) ){ |
$this->parametres['retour'] = 'image/svg+xml'; |
}else { |
if (( $this->parametres['retour'] != 'image/svg+xml')&& ( $this->parametres['retour'] != 'image/png')){ |
$erreur = "Erreur : valeur inconnue. Choisissez le format de retour pour le paramètre retour : image/svg%2Bxml ou image/png."; |
$code = RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE; |
throw new Exception($erreur, $code); |
} |
} |
} |
private function chargerVersions() { |
$requete = "SELECT version ". |
"FROM ".Config::get('bdd_table_meta')." ". |
"ORDER BY date_creation DESC "; |
$resultats = $this->Bdd->recupererTous($requete); |
if (!is_array($resultats) || count($resultats) <= 0) { |
$message = "Les méta-données n'ont pu être chargée pour la ressource demandée"; |
$code = RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE; |
throw new Exception($message, $code); |
} |
$this->metadonnees = $resultats; |
} |
//+----- ressources -----+ |
public function traiterRessources() { |
if(isset($this->ressources)) { |
$this->traiterTypeGraphique(); |
$this->traiterReferentielEtNum(); |
} else { |
$e = 'Erreur dans l\'url de votre requête : </br> ressources insuffisantes.'; |
throw new Exception( $e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); |
} |
} |
abstract function traiterReferentielEtNum(); |
abstract function traiterTypeGraphique(); |
//+--------------------------FONCTIONS D'ASSEMBLAGE DE LA REQUETE-------------------------------------------+ |
public function assemblerLaRequete() { |
$requete = ' SELECT '.$this->requete_champs.' FROM '.$this->table.' '.$this->retournerRequeteCondition(); |
return $requete; |
} |
public function retournerRequeteCondition() { |
$condition = ''; |
if ($this->requete_condition !== "") { |
$condition = ' WHERE '.implode(' AND ', $this->requete_condition); |
} |
return $condition; |
} |
//+-------------------------- formatage du résultat -------------------------------------------+ |
public function obtenirResultat($resultat) { |
if ($resultat == ""){ |
$message = 'La requête SQL formée comporte une erreur!'; |
$code = RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE; |
throw new Exception($message, $code); |
}elseif ($resultat) { |
if ((count($this->ressources)) != 0) { |
//$Atraiter = array_filter($resultat[0],function($var){return ($var != '');}); |
foreach ($resultat[0] as $champs => $valeur) { |
if ($valeur !== '') { |
$Atraiter[$champs] = $valeur; |
} |
} |
if (!empty($Atraiter)) { |
$this->traiterValeursEcologiques($Atraiter); |
$svg = $this->genererSVG(); |
$resultat = new ResultatService(); |
$resultat->corps = ($this->parametres['retour'] == 'image/png') ? $this->convertirEnPNG($svg) : $svg; |
$resultat->mime = $this->parametres['retour']; |
} else { |
$resultat = null; |
} |
} |
} else { |
$resultat = null; |
} |
return $resultat; |
} |
//+----- modification svg -----+ |
public function traiterValeursEcologiques($valeur){ |
$this->valeurs_champs = $valeur; |
foreach($this->valeurs_champs as $cle => $val){ |
if (preg_match("/ve_humidite_edaph/", $cle)) { |
$this->valeurs_en_pourcentage[$cle] = round($val/13,1); |
} elseif (preg_match("/ve_salinite/", $cle)) { |
$this->valeurs_en_pourcentage[$cle] = round(($val+1)/11,1); |
} else { |
$this->valeurs_en_pourcentage[$cle] = round($val/10,1); |
} |
} |
} |
public function donnerHauteur($ancienne_largeur, $ancienne_hauteur) { |
$nouvelle_largeur = $this->largeurSVG; |
$ancienne_largeur = str_replace('px','',$ancienne_largeur); |
$ancienne_hauteur = str_replace('px','',$ancienne_hauteur); |
$rapport = $nouvelle_largeur / $ancienne_largeur ; |
$nouvelle_hauteur = $ancienne_hauteur * $rapport; |
$this->hauteurSVG = $nouvelle_hauteur; |
} |
public function ajusterFormatSVG(){ |
$svg = $this->dom->getElementsByTagName("svg")->item(0); |
$largeur = $svg->getAttribute('width'); |
$hauteur = $svg->getAttribute('height'); |
$this->donnerHauteur($largeur , $hauteur); |
$svg->setAttribute('width',round($this->largeurSVG).'px'); |
$svg->setAttribute('height',round($this->hauteurSVG).'px'); |
} |
public function genererSVG(){ |
$svg = null; |
$this->dom = new DOMDocument('1.0', 'UTF-8'); |
$this->dom->validateOnParse = true; |
$fichierSvg = $this->cheminGraphBase."".$this->nomGraphique.".svg"; |
$this->dom->load($fichierSvg); |
$this->changerValeursSVG(); |
$svg = $this->dom->saveXML(); |
return $svg; |
} |
abstract function changerValeursSVG(); |
public function recupererOntologies($valeur, $champs){ |
$url = $this->ajouterHref('ontologies',$this->champs_ontologiques[$champs].':'.urlencode(urlencode($valeur))); |
try { |
$val = $this->getBdd()->recuperer(sprintf( |
"SELECT a.nom FROM baseflor_ontologies a LEFT JOIN baseflor_ontologies b ON a.id = b.id LEFT JOIN baseflor_ontologies c ON b.classe_id = c.id WHERE". |
" b.code = BINARY '%s' AND c.code = BINARY '%s' LIMIT 0, 100", |
$valeur, |
$this->champs_ontologiques[$champs]), |
Bdd::MODE_OBJET); |
} catch (Exception $e) { |
$val = ""; |
} |
return $val; |
} |
public function traiterIntermediaires($valeurTexte,$champsOntologie, $champsTable){ |
if (preg_match("/(?:I|i)nterm(?:é|e)diaire(?:s)*/", $valeurTexte )) { |
$prec = $this->recupererOntologies(($this->valeurs_champs[$champsTable]-1), $champsOntologie ); |
$suiv = $this->recupererOntologies(($this->valeurs_champs[$champsTable]+1), $champsOntologie ); |
$valeurTexte = "Intermédiaires entre $prec->nom et $suiv->nom "; |
} |
return $valeurTexte; |
} |
/// +---- convertir png ----+ |
public function convertirEnPNG($svg) { |
$png = null; |
if (isset($this->convertisseur)) { |
if ($this->convertisseur == 'imagick') { |
if (extension_loaded('imagick')) { |
$png = $this->convertirEnPNGAvecImageMagick($svg); |
} else { |
$message = "Impossible de générer l'image sur le serveur. Extension ImageMagick absente."; |
$code = RestServeur::HTTP_CODE_ERREUR; |
throw new Exception($message, $code); |
} |
} else if ($this->convertisseur == 'rsvg') { |
$png = $this->convertirGraphiqueEnPNGAvecRsvg($svg); |
} else { |
$message = "Le convertisseur indiqué '{$this->convertisseur}' ne fait pas partie de la liste ". |
"des convertisseurs disponibles : imagick, rsvg."; |
$code = RestServeur::HTTP_CODE_ERREUR; |
throw new Exception($message, $code); |
} |
} else { |
$message = "Veuillez indiquer le convertisseur de svg à utiliser pour le service."; |
$code = RestServeur::HTTP_CODE_ERREUR; |
throw new Exception($message, $code); |
} |
return $png; |
} |
public function convertirEnPNGAvecImageMagick($svg) { |
$convertisseur = new Imagick(); |
$convertisseur->setBackgroundColor(new ImagickPixel('#F8F8F8')); |
$convertisseur->readImageBlob($svg); |
$convertisseur->setImageFormat('png32'); |
$convertisseur->resizeImage($this->largeurSVG,$this->hauteurSVG, imagick::FILTER_LANCZOS, 0, true); |
$png = $convertisseur->getImageBlob(); |
$convertisseur->clear(); |
$convertisseur->destroy(); |
return $png; |
} |
public function convertirGraphiqueEnPNGAvecRsvg($svg) { |
$idFichier = $this->getIdFichier(); |
$fichierPng = $this->config['cache_stockageChemin'].$idFichier.'.png'; |
$fichierSvg = $this->config['cache_stockageChemin'].$idFichier.'.svg'; |
file_put_contents($fichierSvg, $svg); |
$commande = "rsvg-convert $fichierSvg -w ".$this->largeurSVG ." -h ".$this->hauteurSVG ." -o $fichierPng"; |
//echo $commande; exit; |
$rsvg = exec($commande); |
$this->indexerGraphiqueFichierPng($fichierPng); |
$png = file_get_contents($fichierPng); |
return $png; |
} |
public function indexerGraphiqueFichierPng($fichierPng) { |
$img = imagecreatefrompng($fichierPng); |
imagetruecolortopalette($img, false, 32); |
imagepng($img, $fichierPng, 9, PNG_ALL_FILTERS); |
} |
public function getIdFichier(){ |
$idfichier = str_replace(".","-",$this->ressources[1]); |
$idfichier = str_replace(':','-',$idfichier); |
$idfichier .= "-".$this->ressources[0]; |
return $idfichier; |
} |
} |
?> |
/tags/v0.1-20130830/services/modules/0.1/baseflor/Graphiques.php |
---|
New file |
0,0 → 1,42 |
<?php |
/** |
* Classe Graphiques.php détermine le type de graphiques à afficher en fonction des données des tables |
* baseflor et baseflor_rang_sup_ecologie |
* fin d'url possibles : |
* graphiques/#typegraphique/#bdnt.nn:#num_nomen --> renvoie une graphique avec les données connues |
* |
* |
* @package eflore-projets |
* @author Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org> |
* @author Mathilde SALTHUN-LASSALLE <mathilde@tela-botanica.org> |
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt> |
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt> |
* @version 1.0 |
* @copyright 1999-2011 Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org) |
*/ |
class Graphiques extends Commun{ |
private $Graph_tables = array('GraphiquesBaseflor', 'GraphiquesTaxonsSup'); |
public function consulter($ressources, $parametres) { |
$versionResultat = null; |
foreach ($this->Graph_tables as $graph_tab) { |
$Graph = new $graph_tab(); |
$versionResultat = $Graph->consulter($ressources, $parametres); |
if($versionResultat != null) {break;} |
} |
if ($versionResultat == null) { |
$message = 'Les données recherchées sont introuvables.'; |
$code = RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE; |
throw new Exception($message, $code); |
} |
return $versionResultat; |
} |
} |
?> |
/tags/v0.1-20130830/services/modules/0.1/baseflor/Informations.php |
---|
New file |
0,0 → 1,290 |
<?php |
/** |
* Classe Informations.php interroge la table Index |
* et redirige vers une autre classe si besoin |
* d'interroger une autre table (comme baseflor ou baseflor_rang_sup) |
* elle traite également le retour du web service : /informations |
* |
* Encodage en entrée : utf8 |
* Encodage en sortie : utf8 |
* @package eflore-projets |
* @author Mathilde SALTHUN-LASSALLE <mathilde@tela-botanica.org> |
* @author Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org> |
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt> |
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt> |
* @version 1.0 |
* @copyright 1999-2012 Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org) |
* |
* |
*/ |
class Informations extends Commun { |
protected $limite_requete = array( 'depart' => 0, 'limite' => 10); |
private $tables; |
private $champs_recherches = '*'; |
private $requete_jointure = ""; |
private $requete_condition = ""; |
private $total_resultat; |
protected $serviceNom = 'informations'; |
private $masque; |
public function consulter($ressources, $parametres) { |
$this->ressources = $ressources; |
$this->parametres = $parametres; |
$versionResultat = null; |
if (empty($this->ressources)){ |
$this->traiterParametres(); |
} |
$this->definirTables(array ('index' => config::get('bdd_table_index'), |
'baseflor' => config::get('bdd_table'), |
'rangSup' => config::get('bdd_table_rang_sup') |
) |
); |
$this->traiterRessources(); |
$requete = $this->assemblerLaRequete(); |
// exemple: |
// SELECT * FROM baseflor_index_v2012_12_31 WHERE `bdnt.nn` = 'bdtfx.nn:XXXXX'; |
$resultat = $this->Bdd->recupererTous($requete . ' -- ' . __FILE__ . ':' .__LINE__); |
$versionResultat = $this->renvoyerResultat($resultat); |
if ($versionResultat == null) { |
$message = 'Les données recherchées sont introuvables.'; |
$code = RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE; |
throw new Exception($message, $code); |
} |
return $versionResultat; |
} |
public function __construct() { |
$Conteneur = new Conteneur(); |
$this->Bdd = $Conteneur ->getBdd(); |
} |
public function renvoyerResultat($resultat) { |
$res_formate = array(); |
if (empty($this->ressources)) { |
$res_formate = $this->retournerResultatFormate($resultat); |
} else { |
$classe = empty($resultat[0]['baseflor']) ? 'InformationsTaxonsSup' : 'InformationsBaseflor'; |
$info = new $classe(new Conteneur()); |
$res_formate = $info->consulter($this->ressources, $this->parametres); |
} |
return $res_formate; |
} |
//+--------------------------traitement ressources ou paramètres -------------------------------------+ |
public function traiterRessources() { |
if (empty($this->ressources)) { |
$this->requete_jointure = array( |
'LEFT JOIN '. $this->tables['baseflor'].' ON ' |
.$this->tables['baseflor'].".cle =".$this->tables['index'].".baseflor", |
'LEFT JOIN '. $this->tables['rangSup'].' ON ' |
.$this->tables['rangSup'].".cle = ".$this->tables['index'].".RangSup"); |
$this->champs_recherches = " {$this->tables['baseflor']}.num_nomen as 'baseflor.nn', |
{$this->tables['baseflor']}.BDNT as 'baseflor.bdnt', |
{$this->tables['baseflor']}.catminat_code, |
{$this->tables['baseflor']}.num_taxon , |
{$this->tables['baseflor']}.idiotaxon , |
{$this->tables['rangSup']}.num_nomen as 'rangSup.nn', |
{$this->tables['rangSup']}.bdnt as 'rangSup.bdnt', |
{$this->tables['index']}.cle as 'index.cle' "; |
} else { |
if(preg_match('/^(.+)\.nn:([0-9]+)$/', $this->ressources[0], $retour)){ |
$this->champs_recherches = " baseflor, rangSup "; |
$this->requete_condition[] = " `bdnt.nn` = '{$retour[0]}' "; |
} else { |
$e = 'Erreur dans l\'url de votre requête : </br> La ressource demandée n\'existe pas.'; |
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); |
break; |
} |
} |
} |
public function traiterParametres() { |
if (isset($this->parametres) && !empty($this->parametres) ) { |
foreach ($this->parametres as $param => $valeur) { |
switch ($param) { |
case 'navigation.depart' : |
if(!isset($this->parametres['navigation.limite'])) |
throw new Exception("indiquez également la valeur pour le paramètre navigation.limite.", |
RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); |
$this->definirNavigationDepart($valeur); |
break; |
case 'navigation.limite' : |
if(!isset($this->parametres['navigation.depart'])) |
throw new Exception("indiquez également la valeur pour le paramètre navigation.depart.", |
RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); |
$this->definirNavigationLimite($valeur); |
break; |
case 'version.projet' : |
$this->traiterVersion($valeur); |
break; |
case 'masque.cat' : |
$this->masque = 'catminat='.str_replace('-','/',$valeur); |
$this->requete_condition[] = " catminat_code = '".str_replace('-','/',$valeur)."' "; |
break; |
default : |
$e = 'Erreur dans les parametres de votre requête : </br> Le paramètre " ' |
.$param.' " n\'existe pas.'; |
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e); break; |
} |
} |
} |
} |
//+++------------------------------traitement des versions----------------------------------------++ |
public function traiterVersion($valeur) { |
if (preg_match('/^[0-9]+(?:[._][0-9]+)*$/', $valeur) || $valeur == '*' || $valeur == '+') { |
$this->version_projet = $valeur; |
} else { |
$e = "Erreur : La version est inconnue."; |
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); |
} |
if ($this->version_projet == '*' && empty($this->ressources)) { |
$message = "L'affichage de plusieurs versions ne fonctionne que pour les ressources de type /ressources/#id"; |
$code = RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE; |
throw new Exception($message, $code); |
} |
} |
public function definirTables($prefixe_table) { |
$table_num_version = $this->recupererVersionDisponible(); |
foreach ($prefixe_table as $nom => $prefixe ) { |
if ( in_array($this->version_projet,$table_num_version) ) { |
$tables[$nom] = $prefixe.'_v'.$this->version_projet; |
} elseif ($this->version_projet == '+') { |
$derniere_version = $table_num_version[count($table_num_version) - 1]; |
$tables[$nom] = $prefixe.'_v'.str_replace('.', '_', $derniere_version); |
} else { |
$e = "Erreur : La version est inconnue."; |
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); |
} |
} |
$this->tables = $tables; |
} |
//+--------------------------formatages de resultats -------------------------------------------+ |
public function retournerResultatFormate($resultat) { |
$resultat_json = array(); |
$resultat_json['entete'] = $this->ajouterEnteteResultat(); |
$resultat_json['resultats'] = array(); |
foreach ($resultat as $ligne => $tab) { |
$num = $tab['index.cle']; |
$resultat_json['resultats'][$num]['num_nomen'] = |
(empty ($tab['baseflor.nn'])) ? $tab['rangSup.nn'] : $tab['baseflor.nn']; |
$resultat_json['resultats'][$num]['bdnt'] = |
(empty ($tab['baseflor.bdnt'])) ? $tab['rangSup.bdnt'] : $tab['baseflor.bdnt']; |
$resultat_json['resultats'][$num]['catminat_code'] = |
(empty ($tab['catminat_code'])) ? '' : $tab['catminat_code']; |
$resultat_json['resultats'][$num]['idiotaxon'] = |
(empty ($tab['idiotaxon'])) ? '' : $tab['idiotaxon']; |
$resultat_json['resultats'][$num]['num_taxon'] = |
(empty ($tab['num_taxon'])) ? '' : $tab['num_taxon']; |
if ($resultat_json['resultats'][$num]['num_nomen'] != 0) { |
$bdnt = strtolower($resultat_json['resultats'][$num]['bdnt']); |
$nn = $resultat_json['resultats'][$num]['num_nomen']; |
$resultat_json['resultats'][$num]['href'] = |
$this->ajouterHref('informations',$bdnt.".nn:".$nn); |
} |
} |
return $resultat_json; |
} |
public function ajouterEnteteResultat() { |
$entete['depart'] = $this->limite_requete['depart']; |
$entete['limite'] = $this->limite_requete['limite']; |
$entete['total'] = $this->total_resultat; |
if ($this->masque) { |
$entete['masque'] = $this->masque; |
} |
$entete['version'] = $this->version_projet; |
$url = $this->formulerUrl($this->total_resultat, '/informations'); |
if (isset($url['precedent']) && $url['precedent'] != '') { |
$entete['href.precedent'] = $url['precedent']; |
} |
if (isset($url['suivant']) && $url['suivant'] != '') { |
$entete['href.suivant'] = $url['suivant']; |
} |
return $entete; |
} |
//+-------------------------------------assemblage de requête------------------------------------// |
public function assemblerLaRequete() { |
$requete = ' SELECT '.$this->champs_recherches.' FROM '.$this->tables['index'].' ' |
.$this->retournerRequeteJointure().' '.$this->retournerRequeteCondition(). |
' '.$this->delimiterResultatsRequete(); |
return $requete; |
} |
public function retournerRequeteCondition() { |
$condition = ''; |
if ($this->requete_condition !== "") { |
$condition = ' WHERE '.implode(' AND ', $this->requete_condition); |
} |
return $condition; |
} |
public function calculerTotalResultat() { |
$requete = 'SELECT count(*) as nombre FROM '.$this->tables['index'].' ' |
.$this->retournerRequeteJointure().' '.$this->retournerRequeteCondition(); |
$res = $this->getBdd()->recuperer($requete); |
if ($res) { |
$this->total_resultat = $res['nombre']; |
} else { |
$this->total_resultat = 0; |
$e = 'Données introuvables dans la base'; |
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE, $e); |
} |
} |
public function delimiterResultatsRequete() { |
$this->calculerTotalResultat(); |
$requete_limite = ''; |
if (($this->limite_requete['depart'] <= $this->total_resultat) ){ |
if ( $this->limite_requete['depart'] < $this->total_resultat ){ |
$requete_limite = 'LIMIT '.$this->limite_requete['depart'].', ' |
.$this->limite_requete['limite']; |
} |
} else { |
$e = "Erreur : la valeur pour le paramètre navigation.départ est supérieure". |
" au nombre total de résultats."; |
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE); |
} |
return $requete_limite; |
} |
public function retournerRequeteJointure() { |
$jointure = ''; |
if ($this->requete_jointure !== "") { |
$jointure = implode(' ', $this->requete_jointure); |
} |
return $jointure; |
} |
} |
/tags/v0.1-20130830/services/modules/0.1/baseflor/GraphiquesTaxonsSup.php |
---|
New file |
0,0 → 1,146 |
<?php |
/** |
* Classe GraphiquesTaxonsSup.php transforme les données écologiques de la table baseflor_rang_sup_ecologie |
* en graphique svg |
* graphiques/#typegraphique/#bdnt.nn:#num_nomen --> renvoie un graphique avec les données connues |
* |
* |
* @package eflore-projets |
* @author Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org> |
* @author Mathilde SALTHUN-LASSALLE <mathilde@tela-botanica.org> |
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt> |
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt> |
* @version 1.0 |
* @copyright 1999-2011 Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org) |
*/ |
class GraphiquesTaxonsSup extends CommunGraphiques{ |
public function definirTable($version){ |
$this->table = Config::get('bdd_table_rang_sup')."_v".$version; |
} |
//+---- ressources ----+ |
public function traiterReferentieletNum(){ |
if (!empty($this->ressources[1])) { |
if(preg_match('/^(.+)\.nn:([0-9]+)$/', $this->ressources[1], $retour) == 1){ |
switch ($retour[1]) { |
case 'bdtfx' : // pour le moment un seul referentiel disponible |
$this->requete_condition[]= "num_nomen = ".$retour[2]." AND bdnt = 'bdtfx' "; |
break; |
default : |
$e = "Le référentiel {$retour[1]} n'existe pas."; |
throw new Exception( $e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); |
break; |
} |
}else { |
$e = "Erreur dans l'url de votre requête :". |
" précisez le référentiel et le numéro nomenclatural sous la forme {bdnt}.nn:{nn}."; |
throw new Exception( $e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); |
} |
} else { |
throw new Exception( "Erreur dans l'url de votre requête :". |
" précisez le référentiel et le numéro nomenclatural sous la forme {bdnt}.nn:{nn}.", |
RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); |
} |
} |
public function traiterTypeGraphique(){ |
if (!empty($this->ressources[0])) { |
switch ($this->ressources[0]) { |
case 'climat' : |
$this->requete_champs = ' ve_lumiere_min, ve_lumiere_max, ve_temperature_min,'. |
' ve_temperature_max, ve_continentalite_min,'. |
' ve_continentalite_max, ve_humidite_atmos_min,'. |
' ve_humidite_atmos_max' ; |
$this->nomGraphique= 'climat_min_max'; |
break; |
case 'sol' : |
$this->requete_champs = ' ve_humidite_edaph_min , ve_humidite_edaph_max,'. |
' ve_reaction_sol_min, ve_reaction_sol_max, '. |
' ve_nutriments_sol_min, ve_nutriments_sol_max,'. |
' ve_salinite_min, ve_salinite_max,'. |
' ve_texture_sol_min, ve_texture_sol_max,'. |
've_mat_org_sol_min,ve_mat_org_sol_max ' ; |
$this->nomGraphique = 'sol_min_max'; |
break; |
default : |
$e = "Erreur dans l'url de votre requête :". |
"</br> précisez le graphique -> \"sol\" ou \"climat\"."; |
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); |
break; |
} |
}else { |
throw new Exception("Erreur dans l'url de votre requête :". |
"</br> precisez le graphique -> \"sol\" ou \"climat\".", RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); |
} |
} |
//+-------------------------- formatage du résultat -------------------------------------------+ |
public function changerValeursSVG(){ |
$this->ajouterValeursIntermediaires(); |
$Dompath = new DOMXPath($this->dom); |
foreach ($this->valeurs_en_pourcentage as $cle => $val){ |
$val = preg_replace('/,/','.', $val); |
$grad_id = array_search($val,$this->graduations_id); |
$champs = preg_replace('/_min|_max|_[0-9]/','', $cle); |
// dans le cas de mauvaises données, pour ne pas que tout le graphique |
$case = $Dompath->query("//*[@id='".$grad_id."_".$champs."']")->item(0); |
if($case != null) { |
$case->setAttribute('fill','#EA6624'); |
$case->setAttribute('stroke','#EA6624'); |
$this->ajouterInfoAuSurvol($champs,$case); |
} |
$changement = true; |
} |
$this->ajusterFormatSVG(); |
} |
public function ajouterValeursIntermediaires(){ |
$champs_ecolo = array_keys($this->champs_ontologiques); |
foreach ($champs_ecolo as $chps ){ |
$min = !empty($this->valeurs_en_pourcentage[$chps.'_min']) ? $this->valeurs_en_pourcentage[$chps.'_min'] : -1; |
$max = !empty($this->valeurs_en_pourcentage[$chps.'_max']) ? $this->valeurs_en_pourcentage[$chps.'_max'] : -1; |
if ($min < ($max-0.1) ){ |
$i = $min + 0.1; |
$num = 1; |
for ($i ; $i < $max; $i += 0.1) { |
$this->valeurs_en_pourcentage[$chps.'_'.$num] = $i; |
$num++; |
} |
} |
} |
} |
public function ajouterInfoAuSurvol($champs, $case){ |
$min = $this->valeurs_champs[$champs."_min"]; |
$max = $this->valeurs_champs[$champs."_max"]; |
if ($min != $max){ |
$valeurMin = $this->recupererOntologies($min, $champs ); |
$valeurMax = $this->recupererOntologies($max, $champs ); |
$valeurMin = $this->traiterIntermediaires($valeurMin->nom, $champs, $champs.'_min'); |
$valeurMax = $this->traiterIntermediaires($valeurMax->nom, $champs, $champs.'_max'); |
$case->setAttribute('title',"de $min: $valeurMin à $max: $valeurMax " ); |
} else { |
$valeurMin = $this->recupererOntologies($min, $champs ); |
$valeurMin = $this->traiterIntermediaires($valeurMin->nom, $champs, $champs.'_min'); |
$case->setAttribute('title',"$min: $valeurMin" ); |
} |
} |
} |
?> |
/tags/v0.1-20130830/services/modules/0.1/baseflor/InformationsTaxonsSup.php |
---|
New file |
0,0 → 1,268 |
<?php |
/** |
* Classe InformationsTaxonsSup.php permet de faire des requetes pour les rangs superieurs de baseflor |
* du référentiel BDTFX et avec un numéro nomenclatural ( différent de 0 ). |
* fin d'url possibles : |
* |
* /informations/#bdnt.nn:#num_nomen?champs=ecologie --> retourne champs ecologiques pour un BDNT et un num_nomen |
* |
* |
* Encodage en entrée : utf8 |
* Encodage en sortie : utf8 |
* @package eflore-projets |
* @author Mathilde SALTHUN-LASSALLE <mathilde@tela-botanica.org> |
* @author Delphine CAUQUIL <delphine@tela-botanica.org> |
* @author Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org> |
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt> |
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt> |
* @version 1.0 |
* @copyright 1999-2011 Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org) |
*/ |
class InformationsTaxonsSup extends Commun{ |
protected $table = ""; |
private $champs_ontologiques = array(); |
private $format_reponse = 'informations'; |
protected $serviceNom = 'informations'; |
private $retour_format = 'max'; |
private $Bdd; |
private $requete_condition = ""; |
private $champs_recherches = '*'; |
public function consulter($ressources, $parametres) { |
$this->ressources = $ressources; |
$this->parametres = $parametres; |
$this->traiterParametres(); |
$this->definirTables(); |
$this->traiterRessources(); |
$resultats = ''; |
foreach ($this->table_version as $version) { |
$this->table = $version; |
$requete = $this->assemblerLaRequete(); |
$resultat = $this->Bdd->recupererTous($requete); |
$versionResultat = $this->analyserResultat($resultat); |
if (count($this->table_version) > 1) { |
$resultats[$version] = $versionResultat; |
} else { |
$resultats = $versionResultat; |
} |
} |
return $resultats; |
} |
public function analyserResultat($resultat) { |
$versionResultat = null; |
if ($resultat == '') { |
$message = 'La requête SQL formée comporte une erreur!'; |
$code = RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE; |
throw new Exception($message, $code); |
} elseif ($resultat) { |
$versionResultat = $this->retournerResultatFormate($resultat); |
} |
return $versionResultat; |
} |
public function __construct(Conteneur $Conteneur) { |
$this->Bdd = $Conteneur->getBdd(); |
} |
//+--------------------------traitement ressources ou paramètres -------------------------------------------+ |
public function traiterRessources() { |
if(preg_match('/^(.+)\.nn:([0-9]+)$/', $this->ressources[0], $retour)==1){ |
switch ($retour[1]) { |
case 'bdtfx' : |
$this->requete_condition[] = "num_nomen = ".$retour[2]." AND bdnt = 'bdtfx' "; |
break; |
default : |
$e = 'Erreur dans l\'url de votre requête : </br> Le référentiel " ' |
.$retour[1].' " n\'existe pas.'; |
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); |
break; |
} |
} |
} |
//+---- paramètres ----+ |
public function traiterParametres() { |
if (isset($this->parametres) && !empty($this->parametres) ) { |
foreach ($this->parametres as $param => $valeur) { |
switch ($param) { |
case 'categorie' : |
if ($valeur == "ecologie"){ |
$this->champs_recherches = ' num_nomen, bdnt, ve_lumiere_min , ve_lumiere_max,' |
.' ve_temperature_min, ve_temperature_max, ve_continentalite_min,' |
.' ve_continentalite_max, ve_humidite_atmos_min, ve_humidite_atmos_max,' |
.' ve_humidite_edaph_min, ve_humidite_edaph_max, ve_reaction_sol_min,' |
.' ve_reaction_sol_max, ve_nutriments_sol_min, ve_nutriments_sol_max,' |
.' ve_salinite_min, ve_salinite_max, ve_texture_sol_min,ve_texture_sol_max,' |
.' ve_mat_org_sol_min, ve_mat_org_sol_max '; |
} else { |
$e = "Valeur de paramètre inconnue pour 'categorie'. Ce paramètre n'est pas autorisé pour informations/#id"; |
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); |
} |
break; |
case 'retour.format' : |
if ($valeur == 'min' || $valeur == 'max') { |
$this->retour_format = $valeur; |
break; |
} else { |
$e = "Valeur de paramètre inconnue pour 'retour.format'. Ce paramètre n'est pas autorisé pour informations/#id"; |
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); |
} |
case 'version.projet' : |
$this->traiterVersion($valeur); |
break; |
default : |
$e = 'Erreur dans les parametres de votre requête : </br> Le paramètre " ' |
.$param.' " n\'existe pas.'; |
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); break; |
} |
} |
} |
} |
//+++------------------------------traitement des versions----------------------------------------++ |
public function traiterVersion($valeur) { |
if (preg_match('/^[0-9]+(?:[._][0-9]+)*$/', $valeur) || $valeur == '*' || $valeur == '+') { |
$this->version_projet = $valeur; |
} else { |
$e = "Erreur : La version est inconnue."; |
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); |
} |
if ($this->version_projet == '*' && $this->ressources == array()) { |
$message = "L'affichage de plusieurs versions ne fonctionne que pour les ressources de type /ressources/#id"; |
$code = RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE; |
throw new Exception($message, $code); |
} |
} |
public function definirTables() { |
$table_num_version = $this->recupererVersionDisponible(); |
$prefixe_table = config::get('bdd_table_rang_sup'); |
if ( in_array($this->version_projet,$table_num_version) ) { |
$this->table_version[] = $prefixe_table.'_v'.$this->version_projet; |
} elseif ($this->version_projet == '+') { |
$derniere_version = $table_num_version[count($table_num_version) - 1]; |
$this->table_version[] = $prefixe_table.'_v'.str_replace('.', '_', $derniere_version); |
} elseif ($this->version_projet == '*') { |
foreach ($table_num_version as $num_version) { |
$this->table_version[] = $prefixe_table.'_v'.str_replace('.', '_', $num_version); |
} |
} else { |
$e = "Erreur : La version est inconnue."; |
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); |
} |
} |
//+--------------------------formatages de resultats -------------------------------------------+ |
public function retournerResultatFormate($resultat) { |
$this->resultat_json = $resultat[0]; |
if ($this->retour_format == 'max') { |
$graphique_presence = $this->traiterEcologie() ; |
if ($graphique_presence) { |
$this->ajouterLiensGraphique($graphique_presence); |
} |
} |
return $this->resultat_json ; |
} |
public function traiterEcologie() { |
$donnees_presence = false; |
$this->champs_ontologiques = $this->recupererTableauConfig('champs_ontologiques'); |
foreach ($this->champs_ontologiques as $cle => $valeur){ |
/* Les deux tests commentés ci-dessous étaient présents dans eflore-test (uniquement) jusqu'à juin 2013. |
La valeur 0 pose question. |
cf baseflor_v2012_12_31 |
cf services/modules/0.1/baseflor/CommunGraphiques.php traiterValeursEcologiques() */ |
if ($this->resultat_json[$cle.'_min'] != "") { // && $this->resultat_json[$cle.'_min'] != 0) { |
$donnees_presence[$this->getNomGraphique($valeur)] = true; |
$tab_ontologie = $this->recupererOntologies($this->resultat_json[$cle.'_min'], $cle.'_min'); |
unset($this->resultat_json[$cle.'_min']); |
} |
if ($this->resultat_json[$cle.'_max'] != "") { // && $this->resultat_json[$cle.'_max'] != 0) { |
$this->recupererOntologies($this->resultat_json[$cle.'_max'], $cle.'_max'); |
unset($this->resultat_json[$cle.'_max']); |
} |
} |
return $donnees_presence; |
} |
//donne le nom du graphique correspondant à un champ écologique |
public function getNomGraphique($code_ecolo) { |
$graphique = null; |
if (in_array($code_ecolo, explode(',',Config::get('Paramètres.climat')))) { |
$graphique = 'climat'; |
} elseif (in_array($code_ecolo, explode(',', Config::get('Paramètres.sol')) )) { |
$graphique = 'sol'; |
} |
return $graphique; |
} |
public function ajouterLiensGraphique($graphique_presence) { |
if ($graphique_presence['climat']) { |
$this->resultat_json['graphique_climat']['libelle'] = 'climat'; |
$this->resultat_json['graphique_climat']['href'] = $this->ajouterHref('graphiques/climat', |
strtolower($this->resultat_json['bdnt']).'.nn:'.$this->resultat_json['num_nomen']); |
} |
if ($graphique_presence['sol']) { |
$this->resultat_json['graphique_sol']['libelle'] = 'sol'; |
$this->resultat_json['graphique_sol']['href'] = $this->ajouterHref('graphiques/sol', |
strtolower($this->resultat_json['bdnt']).'.nn:'.$this->resultat_json['num_nomen']); |
} |
} |
//+--------------------------traitement ontologies -------------------------------------------+ |
public function recupererOntologies($valeur, $champs){ |
$chps_sans = preg_replace("/_min|_max/", '', $champs); |
$url = Config::get('url_service_base').Config::get('nom_projet'). |
'/ontologies/'.$this->champs_ontologiques[$chps_sans].':'.urlencode(urlencode($valeur)); |
try { |
$val = $this->getBdd()->recuperer(sprintf( |
"SELECT a.nom FROM baseflor_ontologies a LEFT JOIN baseflor_ontologies b ON a.id = b.id LEFT JOIN baseflor_ontologies c ON b.classe_id = c.id WHERE". |
" b.code = BINARY '%s' AND c.code = BINARY '%s' LIMIT 0, 100", |
$valeur, |
$this->champs_ontologiques[$chps_sans]), |
Bdd::MODE_OBJET); |
$this->resultat_json[$champs.'.libelle'] = $val->nom; |
$this->resultat_json[$champs.'.code'] = $valeur; |
$this->resultat_json[$champs.'.href'] = $url; |
} catch (Exception $e) { |
$this->resultat_json[$champs.'.libelle'] = ''; |
$this->resultat_json[$champs.'.code'] = ''; |
$this->resultat_json[$champs.'.href'] = ''; |
} |
} |
//+--------------------------FONCTIONS D'ASSEMBLAGE DE LA REQUETE-------------------------------------------+ |
public function assemblerLaRequete() { |
$requete = ' SELECT '.$this->champs_recherches.' FROM '.$this->table.' ' |
.$this->retournerRequeteCondition(); |
return $requete; |
} |
public function retournerRequeteCondition() { |
$condition = ''; |
if (empty($this->requete_condition) == false) { |
$condition = ' WHERE '.implode(' AND ', $this->requete_condition); |
} |
return $condition; |
} |
} |
?> |