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/tags/v5.0-agropyraie-20130830/initialiserBdd.sh
New file
0,0 → 1,91
#!/bin/bash
##############################################################################################################
# But : Script permettant d'initialiser en une seule commande l'ensemble de la base de données eFlore.
# Auteur : Jean-Pascal Milcent <jpm@tela-botanica.org> (translate bat file to shell script)
# Exemple : /opt/lampp/bin/php -d memory_limit=3500M ./cli.php bdtxa -a supprimerTous
# License : GPL v3
# Création : 07 decembre 2011
# Version: 0.1
# 2011-12-07 - Création
# $Id$
##############################################################################################################
# Constante
APPDIR_ABSOLU=`pwd`;
#
CHEMIN_PHP="/opt/lampp/bin"
CHEMIN_TBF_CLI="$APPDIR_ABSOLU/scripts"
MEMORY_LIMIT="3500M"
echo -e "\033[31m`tput blink`ATTENTION :`tput sgr0` Nécessite la création préalable de la base de données \033[31mtb_eflore\033[00m"
echo "Nettoyage et chargement en cours...";
# BASEFLORE : doit être placé apèrs BDTFX (dépendance !)
echo "BASEVEG :";
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php baseveg -a supprimerTous
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php baseveg -a chargerTous
echo "BDNT :";
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php bdnt -a supprimerTous
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php bdnt -a chargerTous
echo "BDTFX :";
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php bdtfx -a supprimerTous
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php bdtfx -a chargerTous
echo "BASEFLOR :";
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php baseflor -a supprimerTous
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php baseflor -a chargerTous
echo "BDTXA :";
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php bdtxa -a supprimerTous
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php bdtxa -a chargerTous
echo "BIBLIO_BOTA :";
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php biblio_bota -a supprimerTous
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php biblio_bota -a chargerTous
# echo "BONNIER :";
# Pas encore utilisé !
echo "CHORODEP :";
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php chorodep -a supprimerTous
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php chorodep -a chargerTous
echo "COSTE :";
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php coste -a supprimerTous
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php coste -a chargerTous
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php coste -a chargerTxt
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php coste -a chargerIndex
echo "EFLORE :";
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php eflore -a supprimerTous
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php eflore -a chargerTous
# echo "FOURNIER :";
# Pas encore utilisé !
echo "INSEE-D :";
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php insee_d -a supprimerTous
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php insee_d -a chargerTous
echo "ISO-3166-1 :";
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php iso_3166_1 -a supprimerTous
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php iso_3166_1 -a chargerTous
echo "ISO-639-1 :";
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php iso_639_1 -a supprimerTous
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php iso_639_1 -a chargerTous
echo "NVJFL :";
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php nvjfl -a supprimerTous
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php nvjfl -a chargerTous
echo "NVPS :";
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php nvps -a supprimerTous
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php nvps -a chargerTous
echo "NVA :";
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php nva -a supprimerTous
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php nva -a chargerTous
echo "PHOTOFLORA :";
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php photoflora -a supprimerTous
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php photoflora -a chargerTous
# echo "PROMETHEUS :";
# Ontologie botanique.
# Pas encore utilisé !
echo "SPTB :";
# Statut de protection Tela Botanica
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php sptb -a supprimerTous
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php sptb -a chargerTous
echo "CEL :";
echo -e "\033[31m`tput blink`ATTENTION :`tput sgr0` Nécessite la création préalable de la base de données \033[31mtb_cel\033[00m"
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php cel -a supprimerTous
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php cel -a chargerTous
echo "TAPIRLINK :";
echo -e "\033[31m`tput blink`ATTENTION :`tput sgr0` Nécessite la création préalable de la base de données \033[31mtb_hit_indexation\033[00m"
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php tapirlink -a supprimerTous
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php tapirlink -a chargerTous
 
 
Property changes:
Added: svn:eol-style
+native
\ No newline at end of property
Added: svn:executable
+*
\ No newline at end of property
/tags/v5.0-agropyraie-20130830/livraison.sh
New file
0,0 → 1,21
#!/bin/bash
##############################################################################################################
# But : Script permettant d'initialiser en une seule commande l'ensemble de la base de données eFlore.
# Auteur : Jean-Pascal Milcent <jpm@tela-botanica.org> (translate bat file to shell script)
# License : GPL v3
# Création : 07 decembre 2011
# Version: 0.1
# 2011-12-07 - Création
# $Id$
##############################################################################################################
 
# ATTENTION NE PAS UTILISER !!!
 
# compresser les services en excluant les fichiers svn et les fichiers de config et framework
#tar cvzf services.tar.gz services/ --exclude=".svn" --exclude="*.ini" --exclude="framework.php" --exclude="*.sh"
# envoyer sur tela
#scp services.tar.gz root@tela-botanica.org:/home/telabotap/www/eflore-test/.
 
# se connecter sur tela botanica en ssh et effectuer le déploiement
#ssh root@tela-botanica.org "cd /home/telabotap/www/eflore-test/; cd services; tar cvzf ../backup/services.tar.gz .; cd ../; rm -Rf services; tar xvzf services.tar.gz; cd services; cp ../configurations/services/* . -R; chown #telabotap:users /home/telabotap/www/eflore-test/services -R; chmod 755 /home/telabotap/www/eflore-test/services -R; exit";
#echo "Done !"
Property changes:
Added: svn:eol-style
+native
\ No newline at end of property
Added: svn:executable
+*
\ No newline at end of property
/tags/v5.0-agropyraie-20130830/chargerDonnees.sh
New file
0,0 → 1,50
#!/bin/bash
##############################################################################################################
# But : téléchargement automatique en local des données des projets depuis le serveur de Tela Botanica par ftp
# Auteur : Jean-Pascal Milcent <jpm@tela-botanica.org> (translate bat file to shell script)
# License : GPL v3
# Création : 07 decembre 2011
# Version: 0.1
# 2011-12-07 - Création
# $Id$
##############################################################################################################
# Constante
NBREPARAM=$#
APPDIR_ABSOLU=`pwd`;
DOSSIER_LOCAL="$APPDIR_ABSOLU/donnees/"
DOSSIER_DISTANT="/www/eflore/donnees/"
# Aide
E_OPTERR=65
if [ "$1" = '--help' ]
then # Le script a besoin d'au moins un argument sur la ligne de commande
echo "Usage $0 -[parameters -u, -p ]"
echo "Paramétres : "
echo " -h: indiquer l'hote ftp"
echo " -u: indiquer le nom de l'utilisateur ftp"
echo " -p: indiquer le mot de passe de l'utilisateur ftp"
exit $E_OPTERR
fi
 
# Récupération des paramètres et des options de la ligne de commande
TEMP=`getopt -o u:p:h: -l help: -- "$@"`
if [ $? != 0 ] ; then echo "Terminating..." >&2 ; exit 1 ; fi
eval set -- "$TEMP"
while [ ! -z "$1" ] ; do
#echo $1" # "$2
case "$1" in
-h) HOST=$2;;
-u) FTP_USER=$2;;
-p) FTP_PASSWD=$2;;
--) shift ; break ;;
*) echo "Internal error!" ; exit 1 ;;
esac
shift 2
done
 
# Transfert sur le serveur par FTP
if [ $NBREPARAM -eq 0 ]; then
echo "Pas de transfert sur le serveur. Utiliser --help pour voir les options de transfert."
else
echo "Téléchargement en cours :";
lftp ftp://$FTP_USER:$FTP_PASSWD@$HOST -e "set ftp:passive off; mirror -e --no-symlinks -x '.*cel\/images\/.*' -x '.*osm\/.*' -x '.*plantscan\/.*' -x '.*coste\/cles\/.*' -x '.*coste\/descriptions\/.*' -x '.*coste\/images\/.*' -x '.*coste\/ressources\/.*' $DOSSIER_DISTANT $DOSSIER_LOCAL ; quit"
fi;
Property changes:
Added: svn:eol-style
+native
\ No newline at end of property
Added: svn:executable
+*
\ No newline at end of property
/tags/v5.0-agropyraie-20130830/services/tests/0.1/bibliobota/PublicationsTest.php
New file
0,0 → 1,33
<?php
require_once dirname(__FILE__).'/../ServiceEflorePhpUnit.php';
 
class PublicationsTest extends ServiceEflorePhpUnit {
public function __construct() {
$this->projet = 'bibliobota';
$this->service = 'publications';
}
public function testObtenirPublicationSansMasqueTaxon() {
$ressources = array();
$parametres = array();
$retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$this->assertEquals('', $retour['entete']['masque'], 'Valeur entete > ""');
$this->assertSame(29689, $retour['entete']['total'], 'Valeur entete > total = 29689');
$this->assertArrayHasKey(463, $retour['resultats'], "Absence du résultat 463 attendu");
$this->assertArrayHasKey('href.suivant', $retour['entete'], "Absence de lien href suivant attendu");
}
public function testObtenirPublication() {
$ressources = array();
$parametres = array('masque.taxon' => 'Acer monspessulanum');
$retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$this->assertEquals('masque.taxon=Acer monspessulanum', $retour['entete']['masque'], 'Valeur entete > masque.taxon=Acer monspessulanum');
$this->assertSame(4, $retour['entete']['total'], 'Valeur entete > total = 4');
$this->assertArrayHasKey(21991, $retour['resultats'], "Absence du résultat 21991 attendu");
$this->assertArrayNotHasKey('href.suivant', $retour['entete'], "Le lien href suivant est présent alors qu'il ne devrait pas");
}
}
?>
/tags/v5.0-agropyraie-20130830/services/tests/0.1/wikipedia/WikipediaTexteTest.php
New file
0,0 → 1,59
<?php
require_once dirname(__FILE__).'/../ServiceEflorePhpUnit.php';
 
class WikipediaTest extends ServiceEflorePhpUnit {
public function __construct() {
$this->projet = 'wikipedia';
$this->service = 'textes';
}
public function testPageComplete() {
$ressources = array('Viola_alba');
$parametres = array('txt.format'=> 'htm');
$url = ServiceEflorePhpUnit::creerUrl($this->service, $ressources, $parametres);
$retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
 
$this->assertEquals("Violette blanche", $retour['titre'], "Le titre n'est pas celui attendu. Voir : $url");
$this->assertArrayHasKey('id', $retour, "Le json ne contient pas d'attribut : id. Voir : $url");
$this->assertArrayHasKey('titre', $retour, "Le json ne contient pas d'attribut : titre. Voir : $url");
$this->assertArrayHasKey('texte', $retour, "Le json ne contient pas d'attribut : texte. Voir : $url");
$this->assertContains("<a href=\"http://fr.wikipedia.org/wiki/Fichier:Viola_alba", $retour['texte'], "Le titre n'est pas celui attendu. Voir : $url");
 
$this->assertArrayHasKey('mime', $retour, "Le json ne contient pas d'attribut : mime. Voir : $url");
$this->assertArrayHasKey('href', $retour, "Le json ne contient pas d'attribut : href. Voir : $url");
}
public function testDescription() {
$ressources = array('Viola_alba');
$parametres = array('txt.format'=> 'htm',
'txt.section.titre' => 'Description');
$url = ServiceEflorePhpUnit::creerUrl($this->service, $ressources, $parametres);
$retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$this->assertArrayHasKey('id', $retour, "Le json ne contient pas d'attribut : id. Voir : $url");
$this->assertArrayHasKey('titre', $retour, "Le json ne contient pas d'attribut : titre. Voir : $url");
$this->assertEquals("Violette blanche", $retour['titre'], "Le titre n'est pas celui attendu. Voir : $url");
$this->assertArrayHasKey('texte', $retour, "Le json ne contient pas d'attribut : texte. Voir : $url");
$this->assertEquals("<p>C'est une espèce ", substr($retour['texte'], 0, 21), "Le texte n'est pas celui attendu. Voir : $url");
}
public function testCaracteristiques() {
$ressources = array('Viola_alba');
$parametres = array('txt.format'=> 'htm',
'txt.section.titre' => 'Caractéristiques');
$url = ServiceEflorePhpUnit::creerUrl($this->service, $ressources, $parametres);
$retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$this->assertEquals("Violette blanche", $retour['titre'], "Le titre n'est pas celui attendu. Voir : $url");
$this->assertArrayHasKey('texte', $retour, "Le json ne contient pas d'attribut : texte. Voir : $url");
$debut_chara = '<ul>
<li>organes repr';
$this->assertEquals($debut_chara, trim(substr($retour['texte'], 0, 21)), "Le texte n'est pas celui attendu. Voir : $url");
}
}
 
?>
/tags/v5.0-agropyraie-20130830/services/tests/0.1/bdtfx/BdtfxNomsTest.php
New file
0,0 → 1,289
<?php
require_once dirname(__FILE__).'/../ServiceEflorePhpUnit.php';
 
class BdtfxNomsTest extends ServiceEflorePhpUnit {
 
public function __construct() {
$this->projet = 'bdtfx';
$this->service = 'noms';
}
 
public function testVersionPrecise() {
$ressources = array();
$parametres = array('version.projet' => '1.01');
$url = ServiceEflorePhpUnit::creerUrl($this->service, $ressources, $parametres);
$retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
 
$this->assertArrayHasKey('entete', $retour, "Le json ne contient pas d'attribut : entete. Voir : $url");
$this->assertArrayHasKey('resultat', $retour, "Le json ne contient pas d'attribut : resultat. Voir : $url");
}
 
public function testNomsIdVersionMultiple() {
$ressources = array('71711');
$parametres = array('version.projet' => '*');
$url = ServiceEflorePhpUnit::creerUrl($this->service, $ressources, $parametres);
 
$retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$this->assertArrayHasKey('bdtfx_v1_01', $retour, "Le json ne contient pas d'attribut : bdtfx_v1_01.\nVoir : $url");
$this->assertArrayHasKey('bdtfx_v1_02', $retour, "Le json ne contient pas d'attribut : bdtfx_v1_02.\nVoir : $url");
$this->assertEquals('71711', $retour['bdtfx_v1_01']['id'], "'bdtfx_v1_01' doit contenir un attribut 'id' avec la valeur '71711'");
$this->assertEquals('71711', $retour['bdtfx_v1_02']['id'], "'bdtfx_v1_02' doit contenir un attribut 'id' avec la valeur '71711'");
}
 
public function testNomsVersionMultiple() {
$ressources = array();
$parametres = array('version.projet' => '*');
$url = ServiceEflorePhpUnit::creerUrl($this->service, $ressources, $parametres);
 
$retour = ServiceEflorePhpUnit::consulterBrut($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
 
$attendu = "L'affichage de plusieurs versions ne fonctionne que pour les ressources de type /ressources/#id";
$message = "L'url :\n'$url'\n doit retourner un résultat de la forme :\n $attendu";
$this->assertEquals($attendu, $retour, $message);
}
 
public function testVersionInexistante() {
$ressources = array();
$parametres = array('version.projet' => '99.00');
$url = ServiceEflorePhpUnit::creerUrl($this->service, $ressources, $parametres);
 
$retour = ServiceEflorePhpUnit::consulterBrut($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
 
$attendu = 'La requête SQL formée comporte une erreur!';
$message = "L'url :\n'$url'\n doit retourner un résultat de la forme :\n $attendu";
$this->assertEquals($attendu, $retour, $message);
}
 
public function testRechercheStricte() {
$ressources = array();
$parametres = array(
'version.projet' => '1.01',
'recherche' => 'stricte',
'masque' => 'Acer');
$url = ServiceEflorePhpUnit::creerUrl($this->service, $ressources, $parametres);
 
$retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$this->assertArrayHasKey('entete', $retour, "Le json ne contient pas d'attribut : entete. Voir : $url");
$this->assertArrayHasKey('resultat', $retour, "Le json ne contient pas d'attribut : resultat. Voir : $url");
$this->assertEquals('1', $retour['entete']['total'], "L'attribut 'total' de l'entête devrait valoir 1. Voir : $url");
$this->assertEquals(1, count($retour['resultat']), "Le résultat devrait contenir une seule donnée. Voir : $url");
}
 
public function testResultatChamps() {
$ressources = array();
$parametres = array(
'version.projet' => '1.01',
'recherche' => 'stricte',
'masque.nn' => '182');
$url = ServiceEflorePhpUnit::creerUrl($this->service, $ressources, $parametres);
 
$retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
 
$this->assertArrayHasKey('resultat', $retour, "Le json ne contient pas d'attribut : resultat. Voir : $url");
$this->assertEquals(1, count($retour['resultat']), "Le résultat devrait contenir une seule donnée. Voir : $url");
$this->assertArrayNotHasKey('id', $retour['resultat']['182'], "Le tableau du résultat 182 ne doit pas contenir un champ 'id'. Voir : $url");
$this->assertArrayHasKey('retenu', $retour['resultat']['182'], "Le tableau du résultat 182 doit contenir un champ 'id'. Voir : $url");
$this->assertEquals('true', $retour['resultat']['182']['retenu'], "Le tableau du résultat 182 doit contenir un champ 'retenu' avec pour valeur 'true'. Voir : $url");
$this->assertArrayHasKey('nom_sci', $retour['resultat']['182'], "Le tableau du résultat 182 doit contenir un champ 'nom_sci'. Voir : $url");
$this->assertEquals('Acer monspessulanum', $retour['resultat']['182']['nom_sci'], "Le tableau du résultat 182 doit contenir un champ 'nom_sci' avec pour valeur 'Acer monspessulanum'. Voir : $url");
}
 
public function testMasqueSg() {
$ressources = array();
$parametres = array(
'version.projet' => '1.01',
'recherche' => 'stricte',
'masque.sg' => 'Asteraceae');
$url = ServiceEflorePhpUnit::creerUrl($this->service, $ressources, $parametres);
 
$retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$this->assertArrayHasKey('entete', $retour, "Le json ne contient pas d'attribut : entete. Voir : $url");
$this->assertEquals('nom_supra_generique=Asteraceae', $retour['entete']['masque'], "L'attribut 'masque' de l'entête devrait valoir 'nom_supra_generique=Asteraceae'. Voir : $url");
$this->assertArrayHasKey('resultat', $retour, "Le json ne contient pas d'attribut : resultat. Voir : $url");
$this->assertEquals('1', $retour['entete']['total'], "L'attribut 'total' de l'entête devrait valoir 1. Voir : $url");
$this->assertEquals(1, count($retour['resultat']), "Le résultat devrait contenir une seule donnée. Voir : $url");
}
 
public function testMasqueGenSpSspAuAn() {
$ressources = array();
$parametres = array(
'version.projet' => '1.01',
'recherche' => 'stricte',
'masque.gen' => 'Allium',
'masque.sp' => 'carinatum',
'masque.ssp' => 'consimile',
'masque.au' => 'Gren.',
'masque.an' => '1855');
$url = ServiceEflorePhpUnit::creerUrl($this->service, $ressources, $parametres);
 
$retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
 
$this->assertArrayHasKey('entete', $retour, "Le json ne contient pas d'attribut : entete. Voir : $url");
 
$masque = 'genre=Allium&epithete_sp=carinatum&epithete_infra_sp=consimile&auteur=Gren.&annee=1855';
$message = "L'attribut 'masque' de l'entête devrait valoir '$masque'. Voir : $url";
$this->assertEquals($masque, $retour['entete']['masque'], $message);
 
$this->assertArrayHasKey('resultat', $retour, "Le json ne contient pas d'attribut : resultat. Voir : $url");
$this->assertEquals('1', $retour['entete']['total'], "L'attribut 'total' de l'entête devrait valoir 1. Voir : $url");
$this->assertEquals(1, count($retour['resultat']), "Le résultat devrait contenir une seule donnée. Voir : $url");
}
 
public function testMasqueNn() {
$ressources = array();
$parametres = array(
'version.projet' => '1.01',
'recherche' => 'stricte',
'masque.nn' => '182');
$url = ServiceEflorePhpUnit::creerUrl($this->service, $ressources, $parametres);
 
$retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$this->assertArrayHasKey('entete', $retour, "Le json ne contient pas d'attribut : entete. Voir : $url");
$masque = 'num_nom=182';
$message = "L'attribut 'masque' de l'entête devrait valoir '$masque'. Voir : $url";
$this->assertEquals($masque, $retour['entete']['masque'], $message);
$this->assertEquals('1', $retour['entete']['total'], "L'attribut 'total' de l'entête devrait valoir 1. Voir : $url");
 
$this->assertArrayHasKey('resultat', $retour, "Le json ne contient pas d'attribut : resultat. Voir : $url");
$this->assertEquals(1, count($retour['resultat']), "Le résultat devrait contenir une seule donnée. Voir : $url");
$this->assertArrayNotHasKey('id', $retour['resultat']['182'], "Le tableau du résultat 182 doit contenir un champ 'id'. Voir : $url");
}
 
public function testMasqueRg() {
$ressources = array();
$parametres = array(
'version.projet' => '1.01',
'recherche' => 'stricte',
'masque.rg' => '180');
$url = ServiceEflorePhpUnit::creerUrl($this->service, $ressources, $parametres);
 
$retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$this->assertArrayHasKey('entete', $retour, "Le json ne contient pas d'attribut : entete. Voir : $url");
$masque = 'rang=180';
$message = "L'attribut 'masque' de l'entête devrait valoir '$masque'. Voir : $url";
$this->assertEquals($masque, $retour['entete']['masque'], $message);
$this->assertEquals('210', $retour['entete']['total'], "L'attribut 'total' de l'entête devrait valoir 210. Voir : $url");
}
 
public function testNsStructureTxt() {
$ressources = array();
$parametres = array(
'version.projet' => '1.01',
'recherche' => 'stricte',
'masque.nn' => '182',
'ns.format' => 'txt',
'ns.structure' => 'au,an,bib,ad');
$url = ServiceEflorePhpUnit::creerUrl($this->service, $ressources, $parametres);
 
$retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$this->assertArrayHasKey('entete', $retour, "Le json ne contient pas d'attribut : entete. Voir : $url");
$masque = 'num_nom=182';
$message = "L'attribut 'masque' de l'entête devrait valoir '$masque'. Voir : $url";
$this->assertEquals($masque, $retour['entete']['masque'], $message);
$this->assertEquals('1', $retour['entete']['total'], "L'attribut 'total' de l'entête devrait valoir 1. Voir : $url");
 
$this->assertArrayHasKey('resultat', $retour, "Le json ne contient pas d'attribut : resultat. Voir : $url");
$this->assertEquals('Acer monspessulanum L. [1753, Sp. Pl., éd. 1 : 1056]', $retour['resultat']['182']['nom_sci_complet'], "Le tableau du résultat 182 doit contenir un champ 'nom_sci' avec pour valeur 'Acer monspessulanum'. Voir : $url");
}
 
public function testNsStructureHtml() {
$ressources = array();
$parametres = array(
'version.projet' => '1.01',
'recherche' => 'stricte',
'masque.nn' => '182',
'ns.format' => 'htm',
'ns.structure' => 'au,an,bib,ad');
$url = ServiceEflorePhpUnit::creerUrl($this->service, $ressources, $parametres);
 
$retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$this->assertArrayHasKey('entete', $retour, "Le json ne contient pas d'attribut : entete. Voir : $url");
$masque = 'num_nom=182';
$message = "L'attribut 'masque' de l'entête devrait valoir '$masque'. Voir : $url";
$this->assertEquals($masque, $retour['entete']['masque'], $message);
$this->assertEquals('1', $retour['entete']['total'], "L'attribut 'total' de l'entête devrait valoir 1. Voir : $url");
 
$this->assertArrayHasKey('resultat', $retour, "Le json ne contient pas d'attribut : resultat.\nVoir : $url");
$attendu = '<span class="sci"><span class="gen">Acer</span> <span class="sp">monspessulanum</span></span> <span class="auteur">L.</span> [<span class="annee">1753</span>, <span class="biblio">Sp. Pl., éd. 1 : 1056</span>]';
$message = "Le tableau du résultat 182 doit contenir un champ 'nom_sci' avec pour valeur '$attendu'. Voir : $url";
$this->assertEquals($attendu, $retour['resultat']['182']['nom_sci_complet'], $message);
}
 
public function testListeNomsAvecParametreRetourChamps() {
$ressources = array();
$parametres = array('version.projet' => '1.01',
'masque' => 'acer',
'retour.champs' => 'auteur,nom_retenu.*');
 
$retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$this->assertArrayHasKey('auteur', $retour['resultat']['83587']);
$this->assertArrayHasKey('nom_retenu.id', $retour['resultat']['83587']);
$this->assertArrayHasKey('nom_retenu.href', $retour['resultat']['83587']);
$this->assertArrayNotHasKey('nom_retenu', $retour['resultat']['83587']);
}
 
public function testNomsIdAvecParametreRetourChamps() {
$ressources = array(1);
$parametres = array('version.projet' => '1.01',
'retour.champs' => 'nom_retenu.*');
 
$retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$this->assertArrayHasKey('nom_retenu.id', $retour);
$this->assertArrayHasKey('nom_retenu.href', $retour);
$this->assertArrayNotHasKey('nom_retenu', $retour);
$this->assertArrayNotHasKey('auteur', $retour);
}
 
public function testListeNomAvecParametreNsStructureAuAnBibAd() {
$ressources = array();
$parametres = array('version.projet' => '1.01',
'masque.nn' => '39607',
'ns.structure' => 'au,an,bib,ad');
 
$retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$this->assertArrayHasKey('resultat', $retour);
$this->assertArrayHasKey('39607', $retour['resultat']);
$this->assertArrayHasKey('nom_sci', $retour['resultat']['39607']);
$nomSciTxt = 'Lolium annuum Gilib. [1792, Exercit. Phytol., 2 : 520] [nom. invalid.]';
$this->assertEquals($nomSciTxt, $retour['resultat']['39607']['nom_sci_complet']);
}
 
public function testListeNomAvecParametreNsStructureAuAnBibAdEtNsFormatHtm() {
$ressources = array();
$parametres = array('version.projet' => '1.01',
'masque.nn' => '39607',
'ns.structure' => 'au,an,bib,ad',
'ns.format' => 'htm');
 
$retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$this->assertArrayHasKey('entete', $retour);
$this->assertArrayHasKey('masque', $retour['entete']);
$this->assertEquals('num_nom=39607', $retour['entete']['masque']);
 
$this->assertArrayHasKey('resultat', $retour);
$this->assertArrayHasKey('39607', $retour['resultat']);
$this->assertArrayHasKey('nom_sci', $retour['resultat']['39607']);
$nomSciHtml = "<span class=\"sci\"><span class=\"gen\">Lolium</span> <span class=\"sp\">annuum</span></span> <span class=\"auteur\">Gilib.</span> [<span class=\"annee\">1792</span>, <span class=\"biblio\">Exercit. Phytol., 2 : 520</span>] [<span class=\"adendum\">nom. invalid.</span>]";
$this->assertEquals($nomSciHtml, $retour['resultat']['39607']['nom_sci_complet']);
}
public function testListeNomAvecParametreRetourChamps() {
$ressources = array();
$parametres = array('version.projet' => '1.01',
'masque.nn' => '39607',
'retour.champs' => 'rang,auteur');
$retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$this->assertArrayHasKey('entete', $retour);
$this->assertArrayHasKey('masque', $retour['entete']);
$this->assertEquals('num_nom=39607', $retour['entete']['masque']);
$this->assertArrayHasKey('resultat', $retour);
$this->assertArrayHasKey('39607', $retour['resultat']);
$this->assertArrayHasKey('rang.libelle', $retour['resultat']['39607']);
$this->assertEquals('Espèce', $retour['resultat']['39607']['rang.libelle']);
$this->assertArrayHasKey('auteur', $retour['resultat']['39607']);
$this->assertEquals('Gilib.', $retour['resultat']['39607']['auteur']);
}
}
?>
/tags/v5.0-agropyraie-20130830/services/tests/0.1/bdtfx/BdtfxTaxonsTest.php
New file
0,0 → 1,127
<?php
require_once dirname(__FILE__).'/../ServiceEflorePhpUnit.php';
 
class BdtfxTaxonsTest extends ServiceEflorePhpUnit {
 
public function __construct() {
$this->projet = 'bdtfx';
$this->service = 'taxons';
}
 
public function testVersionPrecise() {
$ressources = array();
$parametres = array('version.projet' => '1.01');
$url = ServiceEflorePhpUnit::creerUrl($this->service, $ressources, $parametres);
$retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
 
$this->assertArrayHasKey('entete', $retour, "Le json ne contient pas d'attribut : entete. Voir : $url");
$this->assertArrayHasKey('resultat', $retour, "Le json ne contient pas d'attribut : resultat. Voir : $url");
}
 
public function testNomsIdVersionMultiple() {
$ressources = array('182');
$parametres = array('version.projet' => '*');
$url = ServiceEflorePhpUnit::creerUrl($this->service, $ressources, $parametres);
 
$retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
/* NI (anymore ?)
$this->assertArrayHasKey('bdtfx_v1_01', $retour, "Le json ne contient pas d'attribut : bdtfx_v1_01.\nVoir : $url");
$this->assertArrayHasKey('bdtfx_v1_02', $retour, "Le json ne contient pas d'attribut : bdtfx_v1_02.\nVoir : $url");
$this->assertEquals('182', $retour['bdtfx_v1_01']['id'], "'bdtfx_v1_01' doit contenir un attribut 'id' avec la valeur '182'");
$this->assertEquals('182', $retour['bdtfx_v1_02']['id'], "'bdtfx_v1_02' doit contenir un attribut 'id' avec la valeur '182'");
*/
$this->assertEquals('182', $retour['id'], "doit contenir un attribut 'id' avec la valeur '182'");
}
 
public function testNomsVersionMultiple() {
$ressources = array();
$parametres = array('version.projet' => '*');
$url = ServiceEflorePhpUnit::creerUrl($this->service, $ressources, $parametres);
 
$retour = ServiceEflorePhpUnit::consulterBrut($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
 
$attendu = "L'affichage de plusieurs versions ne fonctionne que pour les ressources de type /ressources/#id";
$message = "L'url :\n'$url'\n doit retourner un résultat de la forme :\n $attendu";
$this->assertEquals($attendu, $retour, $message);
}
 
public function testVersionInexistante() {
$ressources = array();
$parametres = array('version.projet' => '99.00');
$url = ServiceEflorePhpUnit::creerUrl($this->service, $ressources, $parametres);
 
$retour = ServiceEflorePhpUnit::consulterBrut($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
 
$attendu = 'La requête SQL formée comporte une erreur!';
$message = "L'url :\n'$url'\n doit retourner un résultat de la forme :\n $attendu";
$this->assertEquals($attendu, $retour, $message);
}
 
public function testRechercheStricte() {
$ressources = array();
$parametres = array(
'version.projet' => '1.01',
'recherche' => 'stricte',
'masque' => 'Acer');
$url = ServiceEflorePhpUnit::creerUrl($this->service, $ressources, $parametres);
 
$retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$this->assertArrayHasKey('entete', $retour, "Le json ne contient pas d'attribut : entete. Voir : $url");
$this->assertArrayHasKey('resultat', $retour, "Le json ne contient pas d'attribut : resultat. Voir : $url");
$this->assertEquals('1', $retour['entete']['total'], "L'attribut 'total' de l'entête devrait valoir 1. Voir : $url");
$this->assertEquals(1, count($retour['resultat']), "Le résultat devrait contenir une seule donnée. Voir : $url");
}
 
public function testRechercheEtendue() {
$ressources = array();
$parametres = array(
'version.projet' => '1.01',
'recherche' => 'etendue',
'masque' => 'Acer');
$url = ServiceEflorePhpUnit::creerUrl($this->service, $ressources, $parametres);
 
$retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$this->assertArrayHasKey('entete', $retour, "Le json ne contient pas d'attribut : entete. Voir : $url");
$this->assertArrayHasKey('resultat', $retour, "Le json ne contient pas d'attribut : resultat. Voir : $url");
$this->assertEquals('50', $retour['entete']['total'], "L'attribut total de l'entête devrait valoir 50. Voir : $url");
$this->assertEquals(50, count($retour['resultat']), "Le résultat devrait contenir 50 données. Voir : $url");
}
 
public function testRechercheFloue() {
$ressources = array();
$parametres = array(
'version.projet' => '1.01',
'recherche' => 'floue',
'masque' => 'Acer');
$url = ServiceEflorePhpUnit::creerUrl($this->service, $ressources, $parametres);
 
$retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$this->assertArrayHasKey('entete', $retour, "Le json ne contient pas d'attribut : entete. Voir : $url");
$this->assertArrayHasKey('resultat', $retour, "Le json ne contient pas d'attribut : resultat. Voir : $url");
$this->assertEquals('3', $retour['entete']['total'], "L'attribut total de l'entête devrait valoir 3. Voir : $url");
$this->assertEquals(3, count($retour['resultat']), "Le résultat devrait contenir 3 données. Voir : $url");
}
public function testTaxonsInf() {
$ressources = array('13609', 'relations', 'inferieurs');
$parametres = array();
$url = ServiceEflorePhpUnit::creerUrl($this->service, $ressources, $parametres);
$retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$this->assertArrayHasKey('13609', $retour, "Le json ne contient pas le num tax en indice. Voir : $url");
$this->assertEquals('2', count($retour['13609']), "Le json ne contient pas le nom de taxons inf attendu. Voir : $url");
$this->assertEquals("Carex cuprina var. cuprina", $retour['13609']['13610']['nom_sci'], "Le json ne contient pas les 1er taxon inf attendu. Voir : $url");
}
public function testTaxonsSup() {
$ressources = array('13609', 'relations', 'superieurs');
$parametres = array();
$url = ServiceEflorePhpUnit::creerUrl($this->service, $ressources, $parametres);
$retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$this->assertArrayHasKey('13609', $retour, "Le json ne contient pas le num tax en indice. Voir : $url");
$this->assertEquals('14', count($retour['13609']), "Le json ne contient pas le nom de taxons inf attendu. Voir : $url");
$this->assertEquals("Chlorobiontes", $retour['13609']['101140']['nom_sci'], "Le json ne contient pas les 1er taxon inf attendu. Voir : $url");
}
}
?>
/tags/v5.0-agropyraie-20130830/services/tests/0.1/iso-639-1/Iso6391LanguesTest.php
New file
0,0 → 1,22
<?php
require_once dirname(__FILE__).'/../ServiceEflorePhpUnit.php';
 
class Iso6391LanguesTest extends ServiceEflorePhpUnit {
 
public function __construct() {
$this->projet = 'iso-639-1';
$this->service = 'langues';
}
 
public function testValeurChampPrecis() {
$ressources = array('fr', 'nom');
$parametres = array();
$url = ServiceEflorePhpUnit::creerUrl($this->service, $ressources, $parametres);
$retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$this->assertArrayHasKey('id', $retour, "Le json ne contient pas d'attribut : id. Voir : $url");
$this->assertEquals('fr', $retour['id'], "L'attribut 'id' devrait avoir la valeur 'fr'. Voir : $url");
$this->assertArrayHasKey('nom.fr', $retour, "Le json ne contient pas d'attribut : nom.fr. Voir : $url");
$this->assertEquals('Français', $retour['nom.fr'], "L'attribut 'nom.fr' devrait avoir la valeur 'Français'. Voir : $url");
}
}
?>
/tags/v5.0-agropyraie-20130830/services/tests/0.1/ServiceEflorePhpUnit.php
New file
0,0 → 1,160
<?php
// declare(encoding='UTF-8');
/**
* Classe contenant des méthodes :
* - d'intialisation des tests,
* - refactorisant le code des tests,
* - facilitant les tests.
*
* @category php 5.3
* @package Tests/Services
* @author Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org>
* @copyright Copyright (c) 2011, Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
* @license http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-fr.txt Licence CECILL
* @license http://www.gnu.org/licenses/gpl.html Licence GNU-GPL
* @version $Id$
*/
abstract class ServiceEflorePhpUnit extends PHPUnit_Framework_TestCase {
 
/** Définir la valeur de cet attribut dans le constructeur de la classe de test.*/
protected $projet = '';
/** Définir la valeur de cet attribut dans le constructeur de la classe de test.*/
protected $service = '';
 
//+------------------------------------------------------------------------------------------------------+
// Intialisation
 
public static function setUpBeforeClass() {
error_reporting(E_ALL);
 
self::chargerFramework();
 
// Enregistrement en première position des autoload de la méthode gérant les classes des services
spl_autoload_register(array(get_class(), 'chargerClasseAuto'));
}
 
public static function chargerClasseAuto($classe) {
if (class_exists($classe)) {
return null;
}
$cheminBase = realpath(__DIR__.'/../../modules/0.1').'/';
$cheminsTests = __DIR__.'/';
$chemins = array($cheminBase, $cheminsTests);
foreach ($chemins as $chemin) {
$chemin = $chemin.$classe.'.php';
if (file_exists($chemin)) {
require_once $chemin;
}
}
}
 
private static function chargerFramework() {
$cheminRacine = realpath(dirname(__FILE__).'/../..').'/';
$framework = $cheminRacine.'framework.php';
if (!file_exists($framework)) {
$e = "Veuillez paramétrer l'emplacement et la version du Framework dans le fichier $framework";
trigger_error($e, E_USER_ERROR);
} else {
// Inclusion du Framework
require_once $framework;
 
// Ajout d'information concernant cette application
Framework::setCheminAppli($cheminRacine);// Obligatoire
}
}
 
//+------------------------------------------------------------------------------------------------------+
// Refactorisation
public function consulterJson($service, $projet, $ressources, $parametres = NULL) {
$retourJson = self::consulterBrut($service, $projet, $ressources, $parametres);
$retour = json_decode($retourJson, true);
$url = self::creerUrl($service, $ressources, $parametres);
$this->assertEquals(JSON_ERROR_NONE, json_last_error(), "Le json contient des erreurs qui bloquent le décodage. Voir : $url\n".print_r($retourJson, true));
return $retour;
}
 
static function consulterBrut($service, $projet, $ressources, $parametres = NULL) {
array_unshift($ressources, $projet, $service);
$projets = new Projets();
$retourJson = $projets->consulter($ressources, $parametres);
return $retourJson;
}
 
static function creerUrl($service, $ressources, $parametres = NULL) {
// TODO ? $version
$ressourcesUrl = array();
foreach ($ressources as $ressource) {
$ressourcesUrl[] = $ressource;
}
$ressourcesUrl = count($ressourcesUrl) > 0 ? '/'.implode('/', $ressourcesUrl) : '';
 
$parametresUrl = '';
if ($parametres) {
foreach ($parametres as $cle => $valeur) {
$parametresUrl[] = $cle.'='.rawurlencode($valeur);
}
$parametresUrl = '?'.implode('&', $parametresUrl);
}
 
return Config::get('url_service') . '/' . $service . $ressourcesUrl . $parametresUrl;
}
 
//+------------------------------------------------------------------------------------------------------+
// Méthodes facilitant les tests
 
/**
* Récupère un bouchon de classe abstraite.
* Comment l'utiliser :
* $classeAstraite = $this->getClasseAbstraite('MaClasse', array('param1', 'param2'));
* $foo = $classeAstraite->methodeConcretePublique();
*
* @param String $classeNom Le nom de la classe
* @param Array $parametres Les paramètres à passer au constructeur.
* @return Object Le bouchon de la classe abstraite
*/
public function getClasseAbstraite($classeNom, Array $parametres) {
$efloreScript = $this->getMockForAbstractClass($classeNom, $parametres);
return $efloreScript;
}
 
/**
* Récupère une méthode privée d'une classe pour tester/documenter.
* Comment l'utiliser :
* MyClass->foo():
* $cls = new MyClass();
* $foo = self::getPrivateMethode($cls, 'foo');
* $foo->invoke($cls, $...);
*
* @param object $objet Une instance de votre classe
* @param string $methode Le nom de la méthode private
* @return ReflectionMethod La méthode demandée
*/
public static function getMethodePrivee($objet, $nomMethode) {
$classe = new ReflectionClass($objet);
$methode = $classe->getMethod($nomMethode);
$methode->setAccessible(true);
return $methode;
}
 
/**
* Récupère une méthode protégée d'une classe pour tester/documenter.
* Comment l'utiliser :
* MyClass->foo():
* $cls = new MyClass();
* $foo = self::getProtectedMethode($cls, 'foo');
* $foo->invoke($cls, $...);
* @param object $objet Une instance de votre classe
* @param string $methode Le nom de la méthode protected
* @return ReflectionMethod La méthode demandée
*/
public static function getMethodeProtegee($objet, $nomMethode) {
return self::getMethodePrivee($objet, $nomMethode);
}
}
 
/*
sed -i 's/$this->consulterBrut(/ServiceEflorePhpUnit::consulterBrut($this->service, $this->projet, /' $(grep -rl consulterBrut)
sed -i 's/$this->consulterJson(/$this->consulterJson($this->service, $this->projet, /' $(grep -rl consulterJson)
sed -i 's/$this->creerUrl(/ServiceEflorePhpUnit::creerUrl($this->service, /' $(grep -rl creerUrl)
*/
?>
/tags/v5.0-agropyraie-20130830/services/tests/0.1/baseveg/SyntaxonsTest.php
New file
0,0 → 1,312
<?php
 
require_once dirname(__FILE__).'/../ServiceEflorePhpUnit.php';
 
class SyntaxonsTest extends ServiceEflorePhpUnit {
public function __construct() {
$this->projet = 'baseveg';
$this->service = 'syntaxons';
}
//++ ------------------------------------Test des ressources -----------------------------++
//la ressource demandée est t elle connue ?
public function testRessourceInconnue() {
$ressourcesList = array(
array('inconnue'),
array('code:07-2.0.1.0.1-08'),
array('relations'),
array('cle:bgwsd'),
array('cle:5','relations'),
array('cle:5','relations','synonymie'),
array('cle:5','relations','niveaux-sup'),
array('catminat:catminat'),
array('catminat:45'),
array('catminat:07-2.0.1.0.1-08','inconnu'),
array('catminat:07-2.0.1.0.1-08','inconnu','synonymie'),
array('catminat:07-2.0.1.0.1-08','relations','inconnu')
);
$parametres = array();
foreach ($ressourcesList as $ressources) {
$retour = ServiceEflorePhpUnit::consulterBrut($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$messageAttendu = "Erreur dans l'url de votre requête : </br> La ressource demandée n'existe pas.";
$this->assertEquals($messageAttendu, $retour, "Il faut indiquer si une ressource est eronnée.");
}
}
//++ ------------------------------------Test des parametres -----------------------------++
public function testParametreinconnu() {
$ressourcesList = array(
array('catminat:07-2.0.1.0.1-08'),
array('cle:10'),
array('catminat:07-2.0.1.0.1-08','relations','niveaux-sup'),
array(),
array('catminat:07-2.0.1.0.1-07','relations','synonymie'),
array('catminat:07-2.0.1.0.1-07','relations')
);
$parametres = array('paramatre' => 'ORD');
foreach ($ressourcesList as $ressources) {
$retour = ServiceEflorePhpUnit::consulterBrut($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$messageAttendu = "Erreur dans les parametres de votre requête :".
" </br> Le paramètre \" paramatre \" n'existe pas.";
$this->assertEquals($messageAttendu, $retour,
"Il faut indiquer si le masque est erronné.");
}
}
public function testMasqueNiveauErronne() {
$ressourcesList = array(
array(),
array('catminat:07-2.0.1.0.1-08','relations','niveaux-sup'),
);
$parametres = array('masque.niveau' => 'syn');
foreach ($ressourcesList as $ressources) {
$retour = ServiceEflorePhpUnit::consulterBrut($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$messageAttendu = "Erreur : valeur inconnue pour masque.niveau. valeurs possibles : ALL|ORD|CLA|SUBCLA|SUBORD|SUBALL|ASS|SUBASS|BC|DC|GRPT";
$this->assertEquals($messageAttendu, $retour,
"Il faut indiquer si le masque est erronné.");
}
}
public function testParametresNavigationNonAutorisesSyntaxonsCode() {
$ressourcesList = array(
array('catminat:07-2.0.1.0.1-08'),
array('cle:6'),
array('catminat:07-2.0.1.0.1-08','relations'),
);
$parametres = array('navigation.depart' => '0');
foreach ($ressourcesList as $ressources) {
$retour = ServiceEflorePhpUnit::consulterBrut($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$messageAttendu = $messageAttendu = "Erreur dans les parametres de votre requête :".
" </br> Le paramètre \" navigation.depart \" n'existe pas.";
$this->assertEquals($messageAttendu, $retour,
"Il faut indiquer que le parametre navigation.depart est interdit pour ce sous-service.");
}
$parametres = array('navigation.limite' => '10');
foreach ($ressourcesList as $ressources) {
$retour = ServiceEflorePhpUnit::consulterBrut($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$messageAttendu = $messageAttendu = "Erreur dans les parametres de votre requête :".
" </br> Le paramètre \" navigation.limite \" n'existe pas.";
$this->assertEquals($messageAttendu, $retour,
"Il faut indiquer que le parametre navigation.limite est interdit pour ce sous-service.");
}
}
public function testParametresMasqueCatminatNonAutorise() {
$ressourcesList = array(
array('catminat:07-2.0.1.0.1-08'),
array('cle:6'),
array('catminat:07-2.0.1.0.1-08','relations'),
array('catminat:07-2.0.1.0.1-08','relations','synonymie')
);
$parametres = array('masque.catminat' => '07-2.0.1.0.1-08');
foreach ($ressourcesList as $ressources) {
$retour = ServiceEflorePhpUnit::consulterBrut($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$messageAttendu = $messageAttendu = "Erreur dans les parametres de votre requête :".
" </br> Le paramètre \" masque.catminat \" n'existe pas.";
$this->assertEquals($messageAttendu, $retour,
"Il faut indiquer que le parametre masque.catminat est interdit pour ce sous-service.");
}
}
public function testParametresMasqueFixeNonAutorise() {
$ressourcesList = array(
array('catminat:07-2.0.1.0.1-08'),
array('cle:6'),
array('catminat:07-2.0.1.0.1-08','relations'),
);
$parametres = array('masque.fixe' => '2338');
foreach ($ressourcesList as $ressources) {
$retour = ServiceEflorePhpUnit::consulterBrut($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$messageAttendu = $messageAttendu = "Erreur dans les parametres de votre requête :".
" </br> Le paramètre \" masque.fixe \" n'existe pas.";
$this->assertEquals($messageAttendu, $retour,
"Il faut indiquer que le parametre masque.fixe est interdit pour ce sous-service.");
}
}
public function testParametresMasqueNiveauNonAutorise() {
$ressourcesList = array(
array('catminat:07-2.0.1.0.1-08'),
array('cle:6'),
array('catminat:07-2.0.1.0.1-08','relations'),
array('catminat:07-2.0.1.0.1-08','relations','synonymie')
);
$parametres = array('masque.niveau' => 'ord');
foreach ($ressourcesList as $ressources) {
$retour = ServiceEflorePhpUnit::consulterBrut($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$messageAttendu = $messageAttendu = "Erreur dans les parametres de votre requête :".
" </br> Le paramètre \" masque.niveau \" n'existe pas.";
$this->assertEquals($messageAttendu, $retour,
"Il faut indiquer que le parametre masque.niveau est interdit pour ce sous-service.");
}
}
public function testParametresMasqueRetenuNonAutorise() {
$ressourcesList = array(
array('catminat:07-2.0.1.0.1-08'),
array('cle:6'),
array('catminat:07-2.0.1.0.1-08','relations'),
array('catminat:07-2.0.1.0.1-08','relations','synonymie')
);
$parametres = array('masque.retenu' => 'true');
foreach ($ressourcesList as $ressources) {
$retour = ServiceEflorePhpUnit::consulterBrut($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$messageAttendu = "Erreur dans les parametres de votre requête :".
" </br> Le paramètre \" masque.retenu \" n'existe pas.";
$this->assertEquals($messageAttendu, $retour,
"Il faut indiquer que le parametre masque.catminat est interdit pour ce sous-service.");
}
}
//++ ------------------------------------Test du retour Json -----------------------------++
public function testJsonBienFormeListes() {
$ressourcesList = array(
array('catminat:07-2.0.1.0.1-08','relations','niveaux-sup'),
array(),
array('catminat:07-2.0.1.0.1-07','relations','synonymie'),
array('catminat:07-2.0.1.0.1-07','relations')
);
$parametres = array();
foreach ($ressourcesList as $ressources) {
$url = ServiceEflorePhpUnit::creerUrl($this->service, $ressources, $parametres);
$retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$this->assertArrayHasKey('entete', $retour, "Le json ne contient pas d'attribut : entete. Voir : $url");
$this->assertArrayHasKey('resultat', $retour, "Le json ne contient pas d'attribut : resultat. Voir : $url");
}
}
public function testPasDeResultat() {
$ressourcesList = array(
array('catminat:18-5.2.1.6.0-8'),
array('catminat:18-5.2.1.6.0-8','relations')
);
$parametres = array();
foreach ($ressourcesList as $ressources) {
$url = ServiceEflorePhpUnit::creerUrl($this->service, $ressources, $parametres);
$retour = ServiceEflorePhpUnit::consulterBrut($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$messageAttendu = "Les données recherchées sont introuvables.";
$this->assertEquals($messageAttendu, $retour,"Il faut indiquer si les données recherchées sont introuvables");
}
$ressourcesList = array(
array('catminat:18-5.2.1.6.0-8','relations','synonymie'),
array('catminat:18-5.2.1.6.0-8','relations','niveaux-sup'),
);
$parametres = array();
foreach ($ressourcesList as $ressources) {
$url = ServiceEflorePhpUnit::creerUrl($this->service, $ressources, $parametres);
$retour = ServiceEflorePhpUnit::consulterBrut($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$messageAttendu = "\"Les donn\u00e9es recherch\u00e9es sont introuvables\"";
$this->assertEquals($messageAttendu, $retour,"Il faut indiquer si les données recherchées sont introuvables");
}
}
public function testChampsNiveau() {
$ressources = array();
$parametres = array('masque.retenu' => 'true');
$url = ServiceEflorePhpUnit::creerUrl($this->service, $ressources, $parametres);
$retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
foreach ($retour['resultat'] as $cle => $valeurs) {
$this->assertArrayHasKey('niveau.code', $valeurs, "Le json ne contient pas d'attribut : niveau.code . Voir : $url");
$this->assertNotEmpty($valeurs['niveau.code']);
$this->assertArrayHasKey('niveau.libelle', $valeurs, "Le json ne contient pas d'attribut : niveau.libelle . Voir : $url");
$this->assertNotEmpty($valeurs['niveau.libelle']);
$this->assertArrayHasKey('niveau.href', $valeurs, "Le json ne contient pas d'attribut : niveau.href . Voir : $url");
$this->assertNotEmpty($valeurs['niveau.href']);
}
$parametres = array('masque.retenu' => 'false');
$url = ServiceEflorePhpUnit::creerUrl($this->service, $ressources, $parametres);
$retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
foreach ($retour['resultat'] as $cle => $valeurs) {
$this->assertArrayHasKey('niveau.code', $valeurs, "Le json ne contient pas d'attribut : niveau.code . Voir : $url");
$this->assertNotEmpty($valeurs['niveau.code']);
$this->assertArrayHasKey('niveau.libelle', $valeurs, "Le json ne contient pas d'attribut : niveau.libelle . Voir : $url");
$this->assertNotEmpty($valeurs['niveau.libelle']);
$this->assertArrayHasKey('niveau.detail', $valeurs, "Le json ne contient pas d'attribut : niveau.detail . Voir : $url");
$this->assertNotEmpty($valeurs['niveau.detail']);
}
}
public function testMasqueNiveau() {
$ressourcesList = array(
array(),
array('catminat:07-2.0.1.0.1-08','relations','niveaux-sup'),
);
$parametres = array('masque.niveau' => 'ORD');
foreach ($ressourcesList as $ressources) {
$url = ServiceEflorePhpUnit::creerUrl($this->service, $ressources, $parametres);
$retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
foreach ($retour['resultat'] as $cle => $valeurs) {
$this->assertEquals( $valeurs['niveau.code'], 'ORD','le masque.niveau ne fonctionne pas.');
}
}
}
public function testMasqueRetenu() {
$ressourcesList = array();
$parametres = array('masque.retenu' => 'true');
foreach ($ressourcesList as $ressources) {
$url = ServiceEflorePhpUnit::creerUrl($this->service, $ressources, $parametres);
$retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
foreach ($retour['resultat'] as $cle => $valeurs) {
$this->assertStringStartsNotWith('syn',$valeurs['niveau.code'],'le masque.retenu ne fonctionne pas pour true.');
}
}
$parametres = array('masque.retenu' => 'false');
foreach ($ressourcesList as $ressources) {
$url = ServiceEflorePhpUnit::creerUrl($this->service, $ressources, $parametres);
$retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
foreach ($retour['resultat'] as $cle => $valeurs) {
$this->assertStringStartsWith('syn',$valeurs['niveau.code'],'le masque.retenu ne fonctionne pas pour false.');
}
}
}
public function testMasqueCatminat() {
$ressourcesList = array(
array(),
array('catminat:07-2.0.1.0.1-08','relations','niveaux-sup'),
);
$parametres = array('masque.catminat' => '07-2.');
foreach ($ressourcesList as $ressources) {
$url = ServiceEflorePhpUnit::creerUrl($this->service, $ressources, $parametres);
$retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
foreach ($retour['resultat'] as $cle => $valeurs) {
$this->assertEquals( $valeurs['code_catminat'], '07/2.','le masque.niveau ne fonctionne pas.');
}
}
}
public function testMasqueFixe() {
$ressourcesList = array(
array(),
array('catminat:07-2.0.1.0.1-08','relations','niveaux-sup'),
);
$parametres = array('masque.fixe' => '2322');
foreach ($ressourcesList as $ressources) {
$url = ServiceEflorePhpUnit::creerUrl($this->service, $ressources, $parametres);
$retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
foreach ($retour['resultat'] as $cle => $valeurs) {
$this->assertEquals( $valeurs['code_fixe_nom'], '2322','le masque.fixe ne fonctionne pas.');
}
}
}
}
?>
/tags/v5.0-agropyraie-20130830/services/tests/0.1/eflore/EfloreCartesTest.php
New file
0,0 → 1,52
<?php
require_once dirname(__FILE__).'/../ServiceEflorePhpUnit.php';
 
class EfloreCartesTest extends ServiceEflorePhpUnit {
 
private $retour = '';
private $map = '';
 
public function __construct() {
$this->projet = 'eflore';
$this->service = 'cartes';
}
 
public function setUp() {
$this->retour = '';
$this->map = '';
}
 
public function testCarteGenerale() {
$ressources = array();//nn = 141; nt = 8522; nom = 'Acer campestre L.'; nom_ss_auteur = 'Acer campestre'
$parametres = array('projet' => 'general', 'masque.nn' => '141', 'masque.nt' => '8522',
'masque.ns' => 'Acer campestre', 'masque.au' => 'L.', 'retour' => 'text/html');
 
$this->retour = ServiceEflorePhpUnit::consulterBrut($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$this->assertNotEmpty($this->retour, $this->retour);
$this->assertContains('<img', $this->retour, 'doit contenir une balise image');
$this->assertContains('nt8522_france_utm_600x564.png', $this->retour, 'l\'adresse doit se terminer par nt8522_france_utm_600x564.png');
$this->assertContains('<map', $this->retour, 'doit contenir une balise map');
$this->assertContains('CEL', $this->retour, 'doit contenir une observation CEL');
$this->assertContains('SOPHY', $this->retour, 'doit contenir une observation SOPHY');
}
 
public function testCarteGeneriqueLegende() {
$ressources = array('legende');
$parametres = array();
 
$this->retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$this->assertNotEmpty($this->retour);
$this->assertGreaterThanOrEqual(4, count($this->retour), 'doit contenir au - les légendes de cel, cen-lr, sophy et plusieurs'.$this->retour);
$this->assertArrayHasKey('code', $this->retour[0], 'contient le code du projet');
$this->assertArrayHasKey('couleur', $this->retour[0], 'contient le code couleur correspondant');
$this->assertArrayHasKey('nom', $this->retour[0], 'contient le nom du projet');
$this->assertArrayHasKey('description', $this->retour[0], 'contient une desctiption du projet');
}
 
private function verifierPresenceMessage($messageAttendu) {
$this->assertEquals($messageAttendu, $this->retour);
}
 
}
?>
/tags/v5.0-agropyraie-20130830/services/tests/0.1/eflore/EfloreOntologiesTest.php
New file
0,0 → 1,50
<?php
require_once dirname(__FILE__).'/../ServiceEflorePhpUnit.php';
 
class EfloreOntologiesTest extends ServiceEflorePhpUnit {
 
public function __construct() {
$this->projet = 'eflore';
$this->service = 'ontologies';
}
 
public function testRecherche() {
$ressources = array();
$parametres = array();
$url = ServiceEflorePhpUnit::creerUrl($this->service, $ressources, $parametres);
$retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$this->assertNotEmpty($retour, 'données absentes');
$this->assertArrayHasKey('total', $retour['entete'], "Le json ne contient pas d'attribut : total. Voir : $url");
// 23 au 20/08/2013
$this->assertGreaterThanOrEqual('23', $retour['entete']['total'], "L'attribut 'total' devrait avoir une valeur >= '23'. Voir : $url");
$this->assertArrayHasKey('10', $retour['resultat'], "Le json ne contient pas d'ontologie n°10. Voir : $url");
$this->assertArrayHasKey('nom', $retour['resultat'][10], "Le json ne contient pas d'attribut : nom. Voir : $url");
$this->assertEquals('legendeCarte', $retour['resultat'][10]['code'], "L'attribut 'code' devrait avoir la valeur 'legendeCarte'. Voir : $url");
$this->assertEquals('Légende carte eFlore observations', $retour['resultat'][10]['nom'], "L'attribut 'nom' devrait avoir la valeur 'Légende carte eFlore observations'. Voir : $url");
}
public function testMasqueCode() {
$ressources = array();
$parametres = array('masque.code' => 's');
$url = ServiceEflorePhpUnit::creerUrl($this->service, $ressources, $parametres);
$retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$this->assertNotEmpty($retour, 'données absentes');
$this->assertArrayHasKey('total', $retour['entete'], "Le json ne contient pas d'attribut : total. Voir : $url");
$this->assertEquals('2', $retour['entete']['total'], "L'attribut 'total' devrait avoir la valeur '2'. Voir : $url");
$this->assertArrayHasKey('nom', $retour['resultat'][2], "Le json ne contient pas d'attribut : nom. Voir : $url");
$this->assertEquals('service', $retour['resultat'][2]['nom'], "L'attribut 'nom' devrait avoir la valeur 'service'. Voir : $url");
}
public function testMasqueNom() {
$ressources = array();
$parametres = array('masque.nom' => 'description');
$url = ServiceEflorePhpUnit::creerUrl($this->service, $ressources, $parametres);
$retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$this->assertNotEmpty($retour, 'données absentes');
$this->assertArrayHasKey('total', $retour['entete'], "Le json ne contient pas d'attribut : total. Voir : $url");
$this->assertEquals('1', $retour['entete']['total'], "L'attribut 'total' devrait avoir la valeur '1'. Voir : $url");
$this->assertArrayHasKey('code', $retour['resultat'][6], "Le json ne contient pas d'attribut : code. Voir : $url");
$this->assertEquals('1', $retour['resultat'][6]['code'], "L'attribut 'code' devrait avoir la valeur '1'. Voir : $url");
}
}
?>
/tags/v5.0-agropyraie-20130830/services/tests/0.1/baseflor/OntologiesBaseflorTest.php
New file
0,0 → 1,44
<?php
 
require_once dirname(__FILE__).'/../ServiceEflorePhpUnit.php';
 
class OntologiesBaseflorTest extends ServiceEflorePhpUnit {
public function __construct() {
$this->projet = 'baseflor';
$this->service = 'ontologies';
}
public function testRecherche() {
$ressources = array();
$parametres = array("navigation.depart" => 20, "navigation.limite" => 100);
$url = ServiceEflorePhpUnit::creerUrl($this->service, $ressources, $parametres);
$retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$this->assertNotEmpty($retour, 'données absentes');
//limite
$this->assertArrayHasKey('limite', $retour['entete'],
"L'en-tête ne contient pas d'attribut : limite");
$this->assertEquals($retour['entete']['limite'], $parametres['navigation.limite'],
"La valeur de limite est incorrecte dans l'en-tête.");
//total
$this->assertArrayHasKey('total', $retour['entete'],
"L'en-tête ne contient pas d'attribut : total ");
$this->assertEquals('156', $retour['entete']['total'],
"L'attribut 'total' devrait avoir la valeur '156. Voir : $url");
//href
$this->assertArrayHasKey('href.suivant', $retour['entete'],
"L'en-tête ne contient pas d'attribut : href.suivant ");
$this->assertArrayHasKey('href.precedent', $retour['entete'],
"L'en-tête ne contient pas d'attribut : href.precedent ");
$parametres_url =
array('navigation.depart' => ($retour['entete']['limite']+$retour['entete']['depart']),
'navigation.limite' => $retour['entete']['limite'] );
$urlsuivant = ServiceEflorePhpUnit::creerUrl($this->service, $ressources, $parametres_url);
$this->assertEquals($urlsuivant, $retour['entete']['href.suivant'],
"L' url $urlsuivant de l'entete est incorrecte.");
}
}
?>
/tags/v5.0-agropyraie-20130830/services/tests/0.1/baseflor/GraphiquesBaseflorTest.php
New file
0,0 → 1,267
<?php
require_once dirname(__FILE__).'/../ServiceEflorePhpUnit.php';
 
class GraphiquesBaseflorTest extends ServiceEflorePhpUnit {
private $svg;
public function __construct() {
$this->projet = 'baseflor';
$this->service = 'graphiques';
}
//++ ------------------------------------Test des ressources -----------------------------++
public function testRessourceTypeGraphiqueInexistante() {
$ressources = array('','bdtfx.nn:73256');
$parametres = array();
$retour = ServiceEflorePhpUnit::consulterBrut($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$messageAttendu = "Erreur dans l'url de votre requête :".
"</br> precisez le graphique -> \"sol\" ou \"climat\".";
$this->assertEquals($messageAttendu, $retour,
"Il faut indiquer l'absence de la ressource 'sol' ou 'climat'.");
}
public function testRessourceReferentielNnInexistante() {
$ressources = array('sol','');
$parametres = array();
$retour = ServiceEflorePhpUnit::consulterBrut($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$messageAttendu =
"Erreur dans l'url de votre requête : précisez le référentiel et le numéro nomenclatural sous la forme {bdnt}.nn:{nn}.";
$this->assertEquals($messageAttendu, $retour,
"Il faut indiquer l'absence de la ressource {bdnt}.nn:{nn}.");
}
 
public function testRessourceReferentielTypeGraphiqueErronee() {
$ressources = array('humdite','bdtfx.nn:73256');
$parametres = array();
$retour = ServiceEflorePhpUnit::consulterBrut($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$messageAttendu = "Erreur dans l'url de votre requête :".
"</br> precisez le graphique -> \"sol\" ou \"climat\".";
$this->assertEquals($messageAttendu, $retour,
"Il faut indiquer si la ressource type de graphique n'est ni sol' ni 'climat'.");
}
public function testRessourceReferentielNnEronne() {
$ressources = array('sol','gnnyh');
$parametres = array();
$retour = ServiceEflorePhpUnit::consulterBrut($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$messageAttendu =
"Erreur dans l'url de votre requête : précisez le référentiel et le numéro nomenclatural sous la forme {bdnt}.nn:{nn}.";
$this->assertEquals($messageAttendu, $retour,
"Il faut indiquer si la ressource {bdnt}.nn:{nn} est erronée.");
}
public function testRessourceReferentielInconnu() {
$ressources = array('climat','btdjv.nn:73256');
$parametres = array();
$retour = ServiceEflorePhpUnit::consulterBrut($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$messageAttendu = "Le référentiel btdjv n'existe pas.";
$this->assertEquals($messageAttendu, $retour,
"Il faut indiquer si le référentiel est inconnu.");
}
public function testRessourceNNInconnu() {
$ressources = array('sol','bdtfx.nn:3');
$parametres = array();
$retour = ServiceEflorePhpUnit::consulterBrut($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$messageAttendu = "Les données recherchées sont introuvables.";
$this->assertEquals($messageAttendu, $retour,
"Il faut indiquer si une requête ne renvoie pas de résultats.");
}
//++ ------------------------------------Test des paramètres -----------------------------++
public function testParametreInconnu() {
$ressources = array('sol','bdtfx.nn:73256');
$parametres = array('paramatre' => 'image/jpeg');
$retour = ServiceEflorePhpUnit::consulterBrut($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$messageAttendu = "Erreur : Le paramètre paramatre est inconnu.";
$this->assertEquals($messageAttendu, $retour,
"Il faut indiquer si un paramètre est inconnu.");
}
public function testParametreRetourInconnu() {
$ressources = array('sol','bdtfx.nn:73256');
$parametres = array('retour' => 'image/jpeg');
$retour = ServiceEflorePhpUnit::consulterBrut($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$messageAttendu =
"Erreur : valeur inconnue. Choisissez le format de retour pour le paramètre retour : image/svg%2Bxml ou image/png.";
$this->assertEquals($messageAttendu, $retour,
"Il faut indiquer si la valeur du paramètre retour est inconnue.");
}
public function testParametreRetourAbsent() {
$ressources = array('sol','bdtfx.nn:73256');
$parametres = array('retour' => '');
$retour = ServiceEflorePhpUnit::consulterBrut($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$messageAttendu =
"Erreur : valeur inconnue. Choisissez le format de retour pour le paramètre retour : image/svg%2Bxml ou image/png.";
$this->assertEquals($messageAttendu, $retour,
"Il faut indiquer si la valeur du paramètre retour est absente.");
}
public function testParametreRetourFormatAbsent() {
$ressources = array('sol','bdtfx.nn:73256');
$parametres = array('retour.format' => '');
$retour = ServiceEflorePhpUnit::consulterBrut($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$messageAttendu = "Erreur : valeur inconnue. Entrez la largeur voulue (en pixels) pour le paramètre retour.format.";
$this->assertEquals($messageAttendu, $retour,
"Il faut indiquer si la valeur du paramètre retour.format est absente.");
}
public function testParametreRetourFormatInconnu() {
$ressources = array('sol','bdtfx.nn:73256');
$parametres = array('retour.format' => 'dhgkg22');
$retour = ServiceEflorePhpUnit::consulterBrut($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$messageAttendu = "Erreur : valeur inconnue. Entrez la largeur voulue (en pixels) pour le paramètre retour.format.";
$this->assertEquals($messageAttendu, $retour,
"Il faut indiquer si la valeur du paramètre retour.format est inconnue.");
}
public function testParametreVersionProjetInconnu() {
$ressources = array('sol','bdtfx.nn:73256');
$parametres = array('version.projet' => 'dhgkg22');
$retour = ServiceEflorePhpUnit::consulterBrut($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$messageAttendu = "Erreur : La version est inconnue.";
$this->assertEquals($messageAttendu, $retour,
"Il faut indiquer si la valeur du paramètre version.projet est inconnue.");
}
public function testParametreVersionProjetAbsent() {
$ressources = array('sol','bdtfx.nn:73256');
$parametres = array('version.projet' => '');
$retour = ServiceEflorePhpUnit::consulterBrut($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$messageAttendu = "Erreur : La version est inconnue.";
$this->assertEquals($messageAttendu, $retour,
"Il faut indiquer si la valeur du paramètre version.projet est absente.");
}
//++------------------------------------------test des fichiers -------------------------++
public function testRetourEstUnSVG(){
$ressourcesListe = array(
array('sol','bdtfx.nn:73256'),
array('climat','bdtfx.nn:73256'),
array('climat','bdtfx.nn:101128'),
array('sol','bdtfx.nn:101128')
);
$parametresListe = array(
array('retour' => 'image/svg+xml'),
array()
);
foreach ($ressourcesListe as $ressources) {
foreach ($parametresListe as $parametres) {
$retour = ServiceEflorePhpUnit::consulterBrut($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$this->chargerXml($retour);
$this->etreSvg($retour);
}
}
}
public function testSVGPresenceValeursEcolo_baseflor(){
$ressourcesListe = array(
array('sol','bdtfx.nn:73256'),
array('climat','bdtfx.nn:73256'),
);
$parametresListe = array();
foreach ($ressourcesListe as $ressources) {
$retour = ServiceEflorePhpUnit::consulterBrut($this->service, $this->projet, $ressources, $parametresListe);
$this->chargerXml($retour);
$this->etreSvg($retour);
$test = false;
$curseurs = $this->svg->getElementsByTagName('circle');
foreach ($curseurs as $curseur){
$classe = $curseur->getAttribute('class');
if ($classe == 'curseur') {
$test = true;
break;
}
}
}
$this->assertTrue($test,"Le graphique renvoyé par $retour est vide de données écologiques.");
}
public function testSVGPresenceValeursEcolo_rangSup(){
$ressourcesListe = array(
array('climat','bdtfx.nn:101128'),
array('sol','bdtfx.nn:101128')
);
$parametresListe = array();
foreach ($ressourcesListe as $ressources) {
$retour = ServiceEflorePhpUnit::consulterBrut($this->service, $this->projet, $ressources, $parametresListe);
$this->chargerXml($retour);
$this->etreSvg($retour);
$test = false;
$cases = $this->svg->getElementsByTagName('rect');
// ne fonctionne pas :
/*$dompath = new DOMXPath($this->svg);
$dompath->registerNamespace("svg", "http://www.w3.org/2000/svg");
$cases = $dompath->query('svg:rect[@fill and not(@id="fond" or @id="cache")]');*/
foreach ($cases as $case){
$classe = $case->getAttribute('class');
if ($classe != 'fond' and $classe != 'cache' and $case->getAttribute('fill') != 'none') {
$test = true;
break;
}
}
}
$this->assertTrue($test,"Le graphique renvoyé par $retour est vide de données écologiques.");
}
public function testExistenceDesSvgDeBase(){
$this->assertFileExists(config::get('chemin')."sol.svg","le svg de base sol.svg n'existe pas.");
$this->assertFileExists(config::get('chemin')."climat.svg","le svg de base climat.svg n'existe pas.");
$this->assertFileExists(config::get('chemin')."sol_min_max.svg","le svg de base sol_min_max.svg n'existe pas.");
$this->assertFileExists(config::get('chemin')."climat_min_max.svg","le svg de base climat_min_max.svg n'existe pas.");
 
}
public function testCreationSvgEtPngDansCache(){
$convertisseur = config::get('convertisseur');
if ($convertisseur == 'rsvg') {
$ressourcesListe = array(
array('sol','bdtfx.nn:73256'),
array('climat','bdtfx.nn:73256'),
array('climat','bdtfx.nn:101128'),
array('sol','bdtfx.nn:101128'));
$parametresListe = array('retour' => 'image/png');
foreach ($ressourcesListe as $ressources) {
ServiceEflorePhpUnit::consulterBrut($this->service, $this->projet, $ressources, $parametresListe);
$fichier = config::get('cache_stockageChemin') . $this->getFichier($ressources);
$this->assertFileExists($fichier.".svg"," {$fichier}.svg n'existe pas.");
$this->assertFileExists($fichier.".png"," {$fichier}.png n'existe pas.");
}
}
}
//++------------------------------------------fonctions utiles-------------------------++
private function chargerXml($retour) {
$this->svg = new DOMDocument();
$chargement = $this->svg->loadXML($retour);
$this->assertTrue($chargement,"le fichier ne s'est pas chargé.");
}
private function etreSvg($retour) {
$racineElement = $this->svg->documentElement;
$this->assertEquals('svg', $racineElement->tagName,"$retour ne renvoie pas un svg." );
}
private function getFichier($ressources) {
$idfichier = str_replace(".","-",$ressources[1]);
$idfichier = str_replace(':','-',$idfichier);
$idfichier .= "-".$ressources[0];
return $idfichier;
}
}
 
?>
/tags/v5.0-agropyraie-20130830/services/tests/0.1/baseflor/InformationsBaseflorTest.php
New file
0,0 → 1,367
<?php
 
require_once dirname(__FILE__).'/../ServiceEflorePhpUnit.php';
 
class InformationsBaseflorTest extends ServiceEflorePhpUnit {
public function __construct() {
$this->projet = 'baseflor';
$this->service = 'informations';
}
//++ ------------------------------------Test des ressources -----------------------------++
public function testRessourceReferentielInconnu() {
$ressources = array('dgoju.nn:73256');
$parametres = array();
$retour = ServiceEflorePhpUnit::consulterBrut($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$messageAttendu =
"Erreur dans l'url de votre requête :".
" </br> Le référentiel \" dgoju \" n'existe pas.";
$this->assertEquals($messageAttendu, $retour,
"Il faut indiquer un référentiel inconnu.");
}
public function testRessourceInconnue() {
$ressources = array('inconnue');
$parametres = array();
$retour = ServiceEflorePhpUnit::consulterBrut($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$messageAttendu =
"Erreur dans l'url de votre requête : </br> La ressource demandée n'existe pas.";
$this->assertEquals($messageAttendu, $retour,
"Il faut indiquer si une ressource est eronnée.");
}
public function testRessourceNNInconnu() {
$ressources = array('bdtfx.nn:3');
$parametres = array();
$retour = ServiceEflorePhpUnit::consulterBrut($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$messageAttendu = "Les données recherchées sont introuvables.";
$this->assertEquals($messageAttendu, $retour,
"Il faut indiquer si une requête ne renvoie pas de résultats.");
}
//++ ------------------------------------Test des paramètres -----------------------------++
public function testParametreInconnu() {
$ressourcesList = array(
array('bdtfx.nn:73256'),
array('bdtfx.nn:101128'));
$parametres = array('paramatre' => 'image/jpeg');
foreach ($ressourcesList as $ressources) {
$retour = ServiceEflorePhpUnit::consulterBrut($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$messageAttendu = "Erreur dans les parametres de votre requête :".
" </br> Le paramètre \" paramatre \" n'existe pas.";
$this->assertEquals($messageAttendu, $retour,
"Il faut indiquer si un paramètre est inconnu.");
}
}
public function testParametreCategorieInconnue() {
$ressourcesList = array(
array('bdtfx.nn:73256'),
array('bdtfx.nn:101128'));
$parametres = array('categorie' => 'inventé');
foreach ($ressourcesList as $ressources) {
$retour = ServiceEflorePhpUnit::consulterBrut($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$messageAttendu = "Valeur de paramètre inconnue pour 'categorie'. Ce paramètre n'est pas autorisé";
$this->assertContains($messageAttendu, $retour,
"Il faut indiquer si la valeur du paramètre categorie est inconnue pour (" . implode(',', $ressources) . ").");
}
}
public function testParametreNavigationDepartSansLimite() {
$ressources = array();
$parametres = array('navigation.depart' => 10);
$retour = ServiceEflorePhpUnit::consulterBrut($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$messageAttendu = "indiquez également la valeur pour le paramètre navigation.limite.";
$this->assertEquals($messageAttendu, $retour,
"Navigation.depart doit être accompagné de navigation.limite ensemble.");
 
}
public function testParametreDepartSuperieurTotalResultats() {
$ressources = array();
$parametres = array('navigation.depart' => 20000, 'navigation.limite' => 10 );
$retour = ServiceEflorePhpUnit::consulterBrut($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$messageAttendu =
"Erreur : la valeur pour le paramètre navigation.départ est supérieure".
" au nombre total de résultats.";
$this->assertEquals($messageAttendu, $retour,
"Il faut indiquer si la valeur de départ est supérieure au nombre de résultats.");
}
public function testParametreNavigationErrone() {
$ressources = array();
$parametresList = array(
array('navigation.depart' => -5, 'navigation.limite' => 10 ),
array('navigation.depart' => 0, 'navigation.limite' => abc ));
$cles = array('navigation.depart','navigation.limite');
$i = 0 ;
foreach ($parametresList as $parametres) {
$retour = ServiceEflorePhpUnit::consulterBrut($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$messageAttendu = "Erreur : valeur erronnée pour le paramètre {$cles[$i]}.";
$this->assertEquals($messageAttendu, $retour,
"il faut indiquer lorsque qu'un des paramètres de navigation a une valeur impossible.");
$i++;
}
}
public function testParametreRetourFormatErrone() {
$ressourcesList = array(
array('bdtfx.nn:73256'),
array('bdtfx.nn:101128'));
$parametres = array('retour.format' => 'pdf');
foreach ($ressourcesList as $ressources) {
$retour = ServiceEflorePhpUnit::consulterBrut($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$messageAttendu = "Valeur de paramètre inconnue pour 'retour.format'. Ce paramètre n'est pas autorisé";
$this->assertContains($messageAttendu, $retour,
"il faut indiquer lorsque que le paramètre retour.format a une valeur impossible.");
}
}
public function testParametreVersionProjetInconnu() {
$ressourcesList = array(
array('bdtfx.nn:73256'),
array('bdtfx.nn:101128'));
$parametres = array('version.projet' => 'dhgkg22');
foreach ($ressourcesList as $ressources){
$retour = ServiceEflorePhpUnit::consulterBrut($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$messageAttendu = "Erreur : La version est inconnue.";
$this->assertEquals($messageAttendu, $retour,
"Il faut indiquer si la valeur du paramètre version.projet est inconnue.");
}
}
//++ ------------------------------------Test du retour json correct -----------------------------++
//++ ---Informations ----++
public function testJsonBienFormeInformations() {
$ressources = array();
$parametres = array('navigation.depart' => 10, 'navigation.limite' => 15);
$url = ServiceEflorePhpUnit::creerUrl($this->service, $ressources, $parametres);
$retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$this->assertArrayHasKey('entete', $retour, "Le json ne contient pas d'attribut : entete. Voir : $url");
$this->assertArrayHasKey('resultats', $retour, "Le json ne contient pas d'attribut : resultat. Voir : $url");
$this->verifierJsonEnteteBienFormeInformations($retour, $parametres);
}
private function verifierJsonEnteteBienFormeInformations($retour, $parametres) {
//depart
$this->assertArrayHasKey('depart', $retour['entete'],
"L'en-tête ne contient pas d'attribut : depart ");
$this->assertEquals($retour['entete']['depart'], $parametres['navigation.depart'],
"La valeur de départ est incorrecte dans l'en-tête.");
//limite
$this->assertArrayHasKey('limite', $retour['entete'],
"L'en-tête ne contient pas d'attribut : limite");
$this->assertEquals($retour['entete']['limite'], $parametres['navigation.limite'],
"La valeur de limite est incorrecte dans l'en-tête.");
//total
$this->assertArrayHasKey('total', $retour['entete'],
"L'en-tête ne contient pas d'attribut : total ");
$this->assertNotEquals('', $retour['entete']['total'],
"La valeur de total est vide dans l'en-tête.");
//href
$this->assertArrayHasKey('href.suivant', $retour['entete'],
"L'en-tête ne contient pas d'attribut : href.suivant ");
$this->assertArrayHasKey('href.precedent', $retour['entete'],
"L'en-tête ne contient pas d'attribut : href.precedent ");
$parametres_url =
array('navigation.depart' => ($retour['entete']['limite']+$retour['entete']['depart']),
'navigation.limite' => $retour['entete']['limite'] );
$urlsuivant = ServiceEflorePhpUnit::creerUrl($this->service, $ressources, $parametres_url);
$this->assertEquals($urlsuivant, $retour['entete']['href.suivant'],
"L' url $urlsuivant de l'entete est incorrecte.");
}
public function testJsonResultatsHrefInformations() {
$ressources = array();
$parametres = array('navigation.depart' => 370, 'navigation.limite' => 5);
$url = ServiceEflorePhpUnit::creerUrl($this->service, $ressources, $parametres);
$retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
foreach ($retour['resultats'] as $id => $valeurs) {
if (!$valeurs['num_nomen']) {
$this->assertArrayNotHasKey('href', $valeurs,
"Il ne doit pas avoir de lien s'il n'y a pas de numéro nomenclatural (=0). Voir $url ");
}
}
}
public function testJsonNombreLimiteDemande() {
$ressources = array();
$parametresList = array('navigation.depart' => 10, 'navigation.limite' => 15 );
$url = ServiceEflorePhpUnit::creerUrl($this->service, $ressources, $parametres);
$retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$this->assertLessThanOrEqual(15, count($retour),
"Le json renvoie un nombre de résultats trop important : entete. Voir : $url");
}
//++ ---Informations.nn ----++
public function testJsonInformationsNN_min() {
$ressourcesList = array(
array('bdtfx.nn:73256'),
array('bdtfx.nn:101128'));
$parametres = array('retour.format' => 'min' );
foreach ($ressourcesList as $ressources) {
$retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$this->assertArrayNotHasKey('type_bio.code',$retour,
"Le champs 'type_bio.code' ne doit pas être présent si retour.format=min. ");
$this->assertArrayNotHasKey('type_bio.libelle',$retour,
"Le champs 'type_bio.libelle' ne doit pas être présent si retour.format=min.");
$this->assertArrayNotHasKey('type_bio.detail',$retour,
"Le champs 'type_bio.detail' ne doit pas être présent si retour.format=min.");
$champs = array_keys(config::get('champs_ontologiques'));
foreach ($champs as $chps) {
$this->assertArrayNotHasKey($chps.'.libelle', $retour,
"Le champs '{$chps}.libelle' ne doit pas être présent si retour.format=min.");
$this->assertArrayNotHasKey($chps.'.code', $retour,
"Le champs '{$chps}.code' ne doit pas être présent si retour.format=min.");
$this->assertArrayNotHasKey($chps.'.href', $retour,
"Le champs '{$chps}.href' ne doit pas être présent si retour.format=min.");
}
foreach ($champs as $chps) {
$this->assertArrayNotHasKey($chps.'_min.libelle', $retour,
"Le champs '{$chps}_min.libelle' ne doit pas être présent si retour.format=min.");
$this->assertArrayNotHasKey($chps.'_min.code', $retour,
"Le champs '{$chps}_min.code' ne doit pas être présent si retour.format=min.");
$this->assertArrayNotHasKey($chps.'_min.href', $retour,
"Le champs '{$chps}_min.href' ne doit pas être présent si retour.format=min.");
$this->assertArrayNotHasKey($chps.'_max.libelle', $retour,
"Le champs '{$chps}_max.libelle' ne doit pas être présent si retour.format=min.");
$this->assertArrayNotHasKey($chps.'_max.code', $retour,
"Le champs '{$chps}_max.code' ne doit pas être présent si retour.format=min.");
$this->assertArrayNotHasKey($chps.'_max.href', $retour,
"Le champs '{$chps}_max.href' ne doit pas être présent si retour.format=min.");
}
}
}
public function testJsonInformationsNNBasefor_max() {
$ressources = array('bdtfx.nn:73256');
$parametresList = array(
array('retour.format' => 'max', 'categorie' => 'description'),
array('retour.format' => 'max' , 'categorie' => 'ecologie'));
foreach ($parametresList as $parametres) {
$retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
if ($parametres['categorie'] == 'description') {
$this->verifierParametresDescription_max($retour);
} else {
$this->verifierParametresEcologie_max($retour, 'baseflor');
}
}
}
public function testJsonInformationsNNRangSup_max() {
$ressources = array('bdtfx.nn:101128');
$parametres = array('retour.format' => 'max' , 'categorie' => 'ecologie');
$retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
if ($parametres['categorie'] == 'description') {
$this->verifierParametresDescription_max();
} else {
$this->verifierParametresEcologie_max($retour, 'rangSup');
}
}
 
private function verifierParametresDescription_max($retour) {
$this->assertArrayHasKey('type_bio.code',$retour,
"Le champs 'type_bio.code' doit être présent si retour.format=max. ");
$this->assertArrayHasKey('type_bio.libelle',$retour,
"Le champs 'type_bio.libelle' doit être présent si retour.format=max.");
$this->assertArrayHasKey('type_bio.detail',$retour,
"Le champs 'type_bio.detail' doit être présent si retour.format=max.");
}
private function verifierParametresEcologie_max($retour,$type) {
$champs = array_keys(config::get('champs_ontologiques'));
if ($type == 'baseflor') {
foreach ($champs as $chps) {
$this->assertArrayHasKey($chps.'.libelle', $retour,
"Le champs '{$chps}.libelle' doit être présent si retour.format=max.");
$this->assertArrayHasKey($chps.'.code', $retour,
"Le champs '{$chps}.code' doit être présent si retour.format=max.");
$this->assertArrayHasKey($chps.'.href', $retour,
"Le champs '{$chps}.href' doit être présent si retour.format=max.");
}
} elseif ($type == 'rangSup') {
foreach ($champs as $chps) {
$this->assertArrayHasKey($chps.'_min.libelle', $retour,
"Le champs '{$chps}_min.libelle' doit être présent si retour.format=max.");
$this->assertArrayHasKey($chps.'_min.code', $retour,
"Le champs '{$chps}_min.code' doit être présent si retour.format=max.");
$this->assertArrayHasKey($chps.'_min.href', $retour,
"Le champs '{$chps}_min.href' doit être présent si retour.format=max.");
$this->assertArrayHasKey($chps.'_max.libelle', $retour,
"Le champs '{$chps}_max.libelle' doit être présent si retour.format=max.");
$this->assertArrayHasKey($chps.'_max.code', $retour,
"Le champs '{$chps}_max.code' doit être présent si retour.format=max.");
$this->assertArrayHasKey($chps.'_max.href', $retour,
"Le champs '{$chps}_max.href' doit être présent si retour.format=max.");
}
}
}
//++ ------------------------------------Test du champs type biologique -----------------------------++
//TEST sur différents cas typique de 'type_bio.libelle'
public function testJsonTypeBioOntologies() {
$ressourcesList = array(array("bdtfx.nn:73256"),array("bdtfx.nn:70441"),array("bdtfx.nn:62911"),array("bdtfx.nn:72496"),
array("bdtfx.nn:6446"),array("bdtfx.nn:8373"), array("bdafx.nn:35574"), array("bdtfx.nn:62443"),
array("bdtfx.nn:62442"));
$parametres = array();
$resultats_attendus = array ('Grhi-aqua' => 'Géophytes (>= 1m) à rhizome (plantes aquatiques) ' ,
'test-aqua-car' => 'Thérophytes (< 1m) estivaux (plantes aquatiques, carnivores) ',
'grhi' => 'Géophytes (< 1m) à rhizome ',
'hsto(test)' => 'Hémicryptophytes (< 1m) stolonifères , Thérophytes (< 1m) estivaux ',
'Hsto-lia(Grhi-lia)' => 'Hémicryptophytes (>= 1m) stolonifères (lianes) , Géophytes (>= 1m) à rhizome (lianes) ',
'Cfru(b-cad)' => 'Chaméphytes (>= 1m) frutescents , Nanophanérophytes (2 à 4m) (caducifoliées) ',
'test-aqua(heri)' => 'Thérophytes (< 1m) estivaux (plantes aquatiques) , Hémicryptophytes (< 1m) érigé ',
'hbis(hsto,test)-suc' => 'Hémicryptophytes (< 1m) bisannuels (succulentes) , Hémicryptophytes (< 1m) stolonifères, Thérophytes (< 1m) estivaux ',
'hbis(hsto)-suc' => 'Hémicryptophytes (< 1m) bisannuels (succulentes) , Hémicryptophytes (< 1m) stolonifères ');
foreach ($ressourcesList as $ressources) {
$retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$code = $retour['type_bio.code'];
$this->assertEquals($resultats_attendus[$code], $retour['type_bio.libelle'],
"le traitement de l'ontologie pour les types biologiques est erroné pour $ressources[0] . ");
}
}
 
public function testRelationsCatminat() {
$ressources = array('bdtfx.nn:5641', 'relations', 'catminat');
$retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
 
// valeurs standards
$this->assertArrayHasKey('cle',$retour, "Le champ 'cle' doit être présent.");
$this->assertEquals('1693',$retour['cle'], "Le champ 'cle' est erroné.");
 
$this->assertArrayHasKey('num_nomen',$retour, "Le champ 'num_nomen' doit être présent.");
$this->assertEquals('5641',$retour['num_nomen'], "Le champ 'num_nomen' est erroné.");
 
$this->assertArrayHasKey('bdnt',$retour, "Le champ 'bdnt' doit être présent.");
$this->assertEquals('bdtfx',$retour['bdnt'], "Le champ 'bdnt' est erroné.");
 
// valeurs écologiques, test libelle
$this->assertArrayHasKey('ve_texture_sol_min.libelle',$retour, "Le champ 've_texture_sol_min.libelle' doit être présent.");
$this->assertEquals('intermédiaire',$retour['ve_texture_sol_min.libelle'], "Le champ 've_texture_sol_min.libelle' est erroné.");
 
$this->assertArrayHasKey('ve_humidite_atmos_min.code',$retour, "Le champ 've_humidite_atmos_min.code' doit être présent.");
$this->assertEquals('8',$retour['ve_humidite_atmos_min.code'], "Le champ 've_texture_sol_min.libelle' est erroné.");
 
// climat
$this->assertArrayHasKey('graphique_climat',$retour, "Le champ 'graphique_climat' doit être présent.");
$this->assertArrayHasKey('libelle',$retour['graphique_climat'], "Le champ 'graphique_climat > libelle' doit être présent.");
$this->assertArrayHasKey('href',$retour['graphique_climat'], "Le champ 'graphique_climat > href' doit être présent.");
$this->assertEquals('climat',$retour['graphique_climat']['libelle'], "Le champ 'graphique_climat > href' doit être présent.");
}
 
// TODO = ajouter un test pour Informations/id/Relations/catminat?navigation.limite=500&navigation.depart=0
}
?>
/tags/v5.0-agropyraie-20130830/services/tests/0.1/commun/CommunAideTest.php
New file
0,0 → 1,34
<?php
require_once dirname(__FILE__).'/../ServiceEflorePhpUnit.php';
 
class CommunAideTest extends ServiceEflorePhpUnit {
 
public function __construct() {
$this->projet = 'eflore';
$this->service = 'aide';
}
 
public function testAideSurCommun() {
$ressources = array();
$parametres = array();
$url = ServiceEflorePhpUnit::creerUrl($this->service, $ressources, $parametres);
$retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$this->assertNotEmpty($retour['PROJET EFLORE'], 'données absentes');
$this->assertArrayHasKey('service.nom', $retour['PROJET EFLORE']['projet.services'][0], "Le json ne contient pas d'attribut : editeur. Voir : $url");
$this->assertEquals('ontologies', $retour['PROJET EFLORE']['projet.services'][0]['service.nom'], "L'attribut 'editeur' devrait avoir la valeur 'Tela Botanica'. Voir : $url");
}
public function testAideProjets() {
$ressources = array('projets');
$parametres = array();
$url = ServiceEflorePhpUnit::creerUrl($this->service, $ressources, $parametres);
$retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$this->assertNotEmpty($retour, 'données absentes');
$this->assertGreaterThanOrEqual(8, count($retour), $retour);
$this->assertNotEmpty($retour['eflore'], 'données absentes');
$this->assertArrayHasKey('service.nom', $retour['eflore']['projet.services'][0], "Le json ne contient pas d'attribut : editeur. Voir : $url");
$this->assertEquals('ontologies', $retour['eflore']['projet.services'][0]['service.nom'], "L'attribut 'editeur' devrait avoir la valeur 'Tela Botanica'. Voir : $url");
}
}
?>
/tags/v5.0-agropyraie-20130830/services/tests/0.1/commun/CommunMetaDonneesTest.php
New file
0,0 → 1,22
<?php
require_once dirname(__FILE__).'/../ServiceEflorePhpUnit.php';
 
class CommunMetaDonneesTest extends ServiceEflorePhpUnit {
 
public function __construct() {
$this->projet = 'eflore';
$this->service = 'meta-donnees';
}
 
public function testValeurChampPrecis() {
$ressources = array('editeur');
$parametres = array();
$url = ServiceEflorePhpUnit::creerUrl($this->service, $ressources, $parametres);
$retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$this->assertNotEmpty($retour[0], 'données absentes');
$this->assertArrayHasKey('editeur', $retour[0], "Le json ne contient pas d'attribut : editeur. Voir : $url");
$this->assertEquals('Tela Botanica', $retour[0]['editeur'], "L'attribut 'editeur' devrait avoir la valeur 'Tela Botanica'. Voir : $url");
$this->assertArrayNotHasKey('langue', $retour[0], "Le json contient un attribut : langue. Voir : $url");
}
}
?>
/tags/v5.0-agropyraie-20130830/services/tests/0.1/commun/CommunOntologiesTest.php
New file
0,0 → 1,109
<?php
require_once dirname(__FILE__).'/../ServiceEflorePhpUnit.php';
 
class CommunOntologiesTest extends ServiceEflorePhpUnit {
 
public function __construct() {
$this->projet = 'eflore';
$this->service = 'ontologies';
}
 
public function testRecherche() {
$ressources = array();
$parametres = array();
$url = ServiceEflorePhpUnit::creerUrl($this->service, $ressources, $parametres);
$retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$this->assertNotEmpty($retour, 'données absentes');
$this->assertArrayHasKey('total', $retour['entete'], "Le json ne contient pas d'attribut : total. Voir : $url");
// au 20/08/2013, n°23 = Baznat
$this->assertEquals('23', $retour['entete']['total'], "L'attribut 'total' devrait avoir la valeur '23'. Voir : $url");
$this->assertArrayHasKey('nom', $retour['resultat'][1], "Le json ne contient pas d'attribut : nom. Voir : $url");
$this->assertEquals('contactType', $retour['resultat'][1]['nom'], "L'attribut 'nom' devrait avoir la valeur 'contactType'. Voir : $url");
}
public function testMasqueCode() {
$ressources = array();
$parametres = array('masque.code' => 'o');
$url = ServiceEflorePhpUnit::creerUrl($this->service, $ressources, $parametres);
$retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$this->assertNotEmpty($retour, 'données absentes');
$this->assertArrayHasKey('total', $retour['entete'], "Le json ne contient pas d'attribut : total. Voir : $url");
$this->assertEquals('1', $retour['entete']['total'], "L'attribut 'total' devrait avoir la valeur '1'. Voir : $url");
$this->assertArrayHasKey('nom', $retour['resultat'][4], "Le json ne contient pas d'attribut : nom. Voir : $url");
$this->assertEquals('organisations', $retour['resultat'][4]['nom'], "L'attribut 'nom' devrait avoir la valeur 'organisations'. Voir : $url");
}
public function testMasqueDescription() {
$ressources = array();
$parametres = array('masque.description' => '%contact');
$url = ServiceEflorePhpUnit::creerUrl($this->service, $ressources, $parametres);
$retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$this->assertNotEmpty($retour, 'données absentes');
$this->assertArrayHasKey('total', $retour['entete'], "Le json ne contient pas d'attribut : total. Voir : $url");
$this->assertEquals('1', $retour['entete']['total'], "L'attribut 'total' devrait avoir la valeur '1'. Voir : $url");
$this->assertArrayHasKey('nom', $retour['resultat'][1], "Le json ne contient pas d'attribut : nom. Voir : $url");
$this->assertEquals('contactType', $retour['resultat'][1]['nom'], "L'attribut 'nom' devrait avoir la valeur 'contactType'. Voir : $url");
}
 
// simple test ontologies bdnt
// ce qui signifie les ontologies communes aux référentiels (bdtfx, bdtxa, isfan)
public function testBdntSimpleNonExistante() {
$url = '/bdnt' . ServiceEflorePhpUnit::creerUrl('ontologies', [ 'rangTaxo:-1' ] );
$retour = $this->consulterBrut('ontologies', 'bdnt', [ 'rangTaxo:-1' ] );
$this->assertContains($retour, 'Les données recherchées sont introuvables.');
}
 
public function testBdntSimpleExistante() {
$url = '/bdnt' . ServiceEflorePhpUnit::creerUrl('ontologies', [ 'rangTaxo:70' ] );
$retour = $this->consulterJson('ontologies', 'bdnt', [ 'rangTaxo:70' ] );
$this->assertNotEmpty($retour, 'données absentes');
foreach(['id', 'nom', 'code', 'complements', 'classe.id', 'classe', 'classe.href'] as $v) {
$this->assertArrayHasKey($v, $retour, "Le json ne contient pas l'attribut \"$v\". Voir : $url");
}
$this->assertEquals('15', $retour['id'], "L'attribut 'id' devrait avoir la valeur '15'. Voir : $url");
$this->assertEquals('Cladus', $retour['nom'], "L'attribut 'nom' devrait avoir la valeur 'Cladus'. Voir : $url");
}
 
// Les ontologies supportent les requêtes multiples, eg: /bdnt/ontologies/rangTaxo:70,rangTaxo:-1
// Les ontologies sont alors indexées par élément de requête (pour faciliter le travail du client)
// Les résultats inexistants ne sont pas retournés
public function testBdntMultiplesNonExistante() {
$ressource = [ implode(',', [ 'rangTaxo:70', 'rangTaxo:-1' ]) ];
$url = '/bdnt' . ServiceEflorePhpUnit::creerUrl('ontologies', $ressource );
$retour = $this->consulterJson('ontologies', 'bdnt', $ressource );
$this->assertNotEmpty($retour, 'données absentes');
$this->assertEquals(1, count($retour), "Le retour ne devrait contenir que le seul élément valide. Voir : $url");
$this->assertArrayHasKey('rangTaxo:70', $retour, "Le json ne contient pas d'élément rangTaxo:70. Voir : $url");
foreach(['id', 'nom', 'code', 'complements', 'classe.id', 'classe', 'classe.href'] as $v) {
$this->assertArrayHasKey($v, $retour['rangTaxo:70'], "Le json ne contient pas l'attribut \"$v\". Voir : $url");
}
$this->assertEquals('15', $retour['rangTaxo:70']['id'], "L'attribut 'id' devrait avoir la valeur '15'. Voir : $url");
$this->assertEquals('Cladus', $retour['rangTaxo:70']['nom'], "L'attribut 'nom' devrait avoir la valeur 'Cladus'. Voir : $url");
}
 
// Les ontologies supportent les requêtes multiples sur des code différents
// eg: /bdnt/ontologies/rangTaxo:70,zoneGeo:YT
public function testBdntMultiplesExistantes() {
$ressource = [ implode(',', [ 'rangTaxo:70', 'zoneGeo:YT' ]) ];
$url = '/bdnt' . ServiceEflorePhpUnit::creerUrl('ontologies', $ressource );
$retour = $this->consulterJson('ontologies', 'bdnt', $ressource );
$this->assertNotEmpty($retour, 'données absentes');
$this->assertEquals(2, count($retour), "Le retour devrait contenir 2 éléments valides. Voir : $url");
$this->assertArrayHasKey('rangTaxo:70', $retour, "Le json ne contient pas d'élément 'rangTaxo:70'. Voir : $url");
$this->assertArrayHasKey('zoneGeo:YT', $retour, "Le json ne contient pas d'élément 'zoneGeo:YT'. Voir : $url");
 
foreach($retour as $k => $e) {
foreach(['id', 'nom', 'code', 'classe.id', 'classe', 'classe.href'] as $v) {
$this->assertArrayHasKey($v, $e, "Le json ne contient pas l'attribut \"$v\" pour l'élément \"$k\". Voir : $url");
}
}
// n'existe pas pour "zoneGeo", pourquoi ?
$this->assertArrayHasKey('complements', $retour['rangTaxo:70'], "Le json ne contient pas l'attribut \"$v\". Voir : $url");
 
 
$this->assertEquals('15', $retour['rangTaxo:70']['id'], "L'attribut 'id' devrait avoir la valeur '15'. Voir : $url");
$this->assertEquals('Cladus', $retour['rangTaxo:70']['nom'], "L'attribut 'nom' devrait avoir la valeur 'Cladus'. Voir : $url");
$this->assertEquals('180', $retour['zoneGeo:YT']['id'], "L'attribut 'id' devrait avoir la valeur '180'. Voir : $url");
$this->assertEquals('Mayotte', $retour['zoneGeo:YT']['nom'], "L'attribut 'nom' devrait avoir la valeur 'Mayotte'. Voir : $url");
}
}
/tags/v5.0-agropyraie-20130830/services/tests/0.1/nvjfl/NvjflNomsVernaTest.php
New file
0,0 → 1,251
<?php
require_once dirname(__FILE__).'/../ServiceEflorePhpUnit.php';
 
class NvjflNomsVernaTest extends ServiceEflorePhpUnit {
 
public function __construct() {
$this->projet = 'nvjfl';
$this->service = 'noms-vernaculaires';
}
 
public function testVersionPrecise() {
$ressources = array();
$parametres = array('version.projet' => '2007');
$url = ServiceEflorePhpUnit::creerUrl($this->service, $ressources, $parametres);
$retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
 
$this->assertArrayHasKey('entete', $retour, "Le json ne contient pas d'attribut : entete. Voir : $url");
$this->assertArrayHasKey('resultat', $retour, "Le json ne contient pas d'attribut : resultat. Voir : $url");
}
 
public function testVersionInexistante() {
$ressources = array();
$parametres = array('version.projet' => '2011');
$url = ServiceEflorePhpUnit::creerUrl($this->service, $ressources, $parametres);
 
$retour = ServiceEflorePhpUnit::consulterBrut($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
 
$attendu = 'La requête SQL formée comporte une erreur!';
$message = "L'url :\n'$url'\n doit retourner un résultat de la forme :\n $attendu";
$this->assertEquals($attendu, $retour, $message);
}
 
public function testRechercheStricte() {
$ressources = array();
$parametres = array(
'version.projet' => '2007',
'recherche' => 'stricte',
'masque' => 'Abricotier');
$url = ServiceEflorePhpUnit::creerUrl($this->service, $ressources, $parametres);
$url_attendu = ServiceEflorePhpUnit::creerUrl($this->service, array('111'), array('version.projet' => '2007'));
 
$retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$this->assertArrayHasKey('entete', $retour, "Le json ne contient pas d'attribut : entete. Voir : $url");
$this->assertArrayHasKey('resultat', $retour, "Le json ne contient pas d'attribut : resultat. Voir : $url");
$this->assertEquals('1', $retour['entete']['total'], "L'attribut 'total' de l'entête devrait valoir 1. Voir : $url");
$this->assertEquals(1, count($retour['resultat']), "Le résultat devrait contenir une seule donnée. Voir : $url");
$this->assertArrayNotHasKey('id', $retour['resultat']['111'], "Le tableau du résultat 111 ne doit pas contenir un champ 'id'. Voir : $url");
$this->assertArrayHasKey('href', $retour['resultat']['111'], "Le tableau du résultat 111 doit contenir un champ 'href'. Voir : $url");
$this->assertEquals($url_attendu, $retour['resultat']['111']['href'], "Le tableau du résultat 111 doit contenir un champ 'href' avec pour valeur $url_attendu . Voir : $url");
$this->assertArrayHasKey('nom', $retour['resultat']['111'], "Le tableau du résultat 111 doit contenir un champ 'nom'. Voir : $url");
$this->assertEquals('Abricotier', $retour['resultat']['111']['nom'], "Le tableau du résultat 111 doit contenir un champ 'nom' avec pour valeur 'Abricotier'. Voir : $url");
}
 
public function testMasqueNt() {
$ressources = array();
$parametres = array(
'version.projet' => '2007',
'recherche' => 'stricte',
'masque.nt' => '379');
$url = ServiceEflorePhpUnit::creerUrl($this->service, $ressources, $parametres);
$url_attendu = ServiceEflorePhpUnit::creerUrl($this->service, array('502'), array('version.projet' => '2007'));
$retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
 
$this->assertArrayHasKey('resultat', $retour, "Le json ne contient pas d'attribut : resultat. Voir : $url");
$this->assertEquals(2, count($retour['resultat']), "Le résultat devrait contenir une seule donnée. Voir : $url");
$this->assertArrayNotHasKey('id', $retour['resultat']['502'], "Le tableau du résultat 502 ne doit pas contenir un champ 'id'. Voir : $url");
$this->assertArrayHasKey('href', $retour['resultat']['502'], "Le tableau du résultat 502 doit contenir un champ 'href'. Voir : $url");
$this->assertEquals($url_attendu, $retour['resultat']['502']['href'], "Le tableau du résultat 502 doit contenir un champ 'href' avec pour valeur $url_attendu. Voir : $url");
$this->assertArrayHasKey('nom', $retour['resultat']['502'], "Le tableau du résultat 502 doit contenir un champ 'nom'. Voir : $url");
$this->assertEquals('Adénostyle de Briquet', $retour['resultat']['502']['nom'], "Le tableau du résultat 502 doit contenir un champ 'nom' avec pour valeur 'Adénostyle de Briquet'. Voir : $url");
}
 
public function testMasqueLg() {
$ressources = array();
$parametres = array(
'version.projet' => '2007',
'recherche' => 'stricte',
'masque.lg' => 'fra',
'navigation.limite' => '100');
$url = ServiceEflorePhpUnit::creerUrl($this->service, $ressources, $parametres);
 
$retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$this->assertArrayHasKey('entete', $retour, "Le json ne contient pas d'attribut : entete. Voir : $url");
$this->assertEquals('masque.lg=fra', $retour['entete']['masque'], "L'attribut 'masque' de l'entête devrait valoir 'masque.lg=fra'. Voir : $url");
$this->assertArrayHasKey('resultat', $retour, "Le json ne contient pas d'attribut : resultat. Voir : $url");
$this->assertEquals('16411', $retour['entete']['total'], "L'attribut 'total' de l'entête devrait valoir 16411. Voir : $url");
$this->assertEquals(100, count($retour['resultat']), "Le résultat devrait contenir 100 données. Voir : $url");
}
public function testRechercheFloue() {
$ressources = array();
$parametres = array(
'version.projet' => '2007',
'recherche' => 'floue',
'masque' => 'Abrict');
$url = ServiceEflorePhpUnit::creerUrl($this->service, $ressources, $parametres);
$url_attendu_pattern = ServiceEflorePhpUnit::creerUrl($this->service, ['%d'], array('version.projet' => '2007'));
$retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$this->assertArrayHasKey('entete', $retour, "Le json ne contient pas d'attribut : entete. Voir : $url");
$this->assertArrayHasKey('resultat', $retour, "Le json ne contient pas d'attribut : resultat. Voir : $url");
$this->assertEquals('5', $retour['entete']['total'], "L'attribut 'total' de l'entête devrait valoir 1. Voir : $url");
$this->assertEquals(5, count($retour['resultat']), "Le résultat devrait contenir une seule donnée. Voir : $url");
$resultat_attendu = array(
"2611" => array("nom" => "Apricot", "href" => sprintf($url_attendu_pattern, 2611)),
"15868" => array("nom" => "Eyebright", "href" => sprintf($url_attendu_pattern, 15868)),
"4857" => array("nom" => "Berg-Ziest", "href" => sprintf($url_attendu_pattern, 4857)),
"33750" => array("nom" => "Periquet", "href" => sprintf($url_attendu_pattern, 33750)),
"17614" => array("nom" => "Frare cugot", "href"=> sprintf($url_attendu_pattern, 17614)));
$this->assertEquals($resultat_attendu, $retour['resultat'], "Le tableau de résultats est inattendu. Voir : $url");
}
 
public function testRechercheAttributions() {
$ressources = array('attributions');
$parametres = array(
'version.projet' => '2007',
'recherche' => 'stricte',
'masque.nv' => 'Acacia',
'retour.format' => 'min');
$url = ServiceEflorePhpUnit::creerUrl($this->service, $ressources, $parametres);
 
$retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$this->assertArrayHasKey('entete', $retour, "Le json ne contient pas d'attribut : entete. Voir : $url");
$this->assertArrayHasKey('resultat', $retour, "Le json ne contient pas d'attribut : resultat. Voir : $url");
$this->assertEquals('4', $retour['entete']['total'], "L'attribut 'total' de l'entête devrait valoir 4. Voir : $url");
$this->assertEquals(4, count($retour['resultat']), "Le résultat devrait contenir une seule donnée. Voir : $url");
$this->assertArrayHasKey('id', $retour['resultat']['-880871632'], "Le tableau du résultat -880871632 ne doit pas contenir un champ 'id'. Voir : $url");
$this->assertEquals('140', $retour['resultat']['-880871632']['id'], "Le tableau du résultat -880871632 doit contenir un champ 'id' avec pour valeur 140. Voir : $url");
$this->assertArrayNotHasKey('href', $retour['resultat']['-880871632'], "Le tableau du résultat -880871632 doit contenir un champ 'href'. Voir : $url");
$this->assertArrayHasKey('nom_vernaculaire', $retour['resultat']['-880871632'], "Le tableau du résultat -880871632 doit contenir un champ 'nom'. Voir : $url");
$this->assertEquals('Acacia', $retour['resultat']['-880871632']['nom_vernaculaire'], "Le tableau du résultat -880871632 doit contenir un champ 'nom' avec pour valeur 'Acacia'. Voir : $url");
$this->assertArrayHasKey('langue.code', $retour['resultat']['-880871632'], "Le tableau du résultat -880871632 doit contenir un champ 'langue.code'. Voir : $url");
$this->assertEquals('spa', $retour['resultat']['-880871632']['langue.code'], "Le tableau du résultat -880871632 doit contenir un champ 'langue.code' avec pour valeur 'spa'. Voir : $url");
$this->assertArrayHasKey('taxon.code', $retour['resultat']['-880871632'], "Le tableau du résultat -880871632 doit contenir un champ 'taxon.code'. Voir : $url");
$this->assertEquals('bdtfx.nt:30746', $retour['resultat']['-880871632']['taxon.code'], "Le tableau du résultat -880871632 doit contenir un champ 'taxon.code' avec pour valeur 'bdtfx.nt:30746'. Voir : $url");
}
 
public function testerIdAvecOntologies() {
$ressources = array('140');
$parametres = array('version.projet' => '2007');
$url = ServiceEflorePhpUnit::creerUrl($this->service, $ressources, $parametres);
$retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$this->assertArrayNotHasKey('entete', $retour, "Le json contient un attribut : entete. Voir : $url");
$this->assertArrayNotHasKey('resultat', $retour, "Le json contient un attribut : resultat. Voir : $url");
$this->assertArrayHasKey('id', $retour, "Le json doit contenir un attribut : 'id' . Voir : $url");
$this->assertEquals('140', $retour['id'], "Le json doit contenir un attribut 'id' avec pour valeur 140. Voir : $url");
$this->assertArrayHasKey('nom_vernaculaire', $retour, "Le json doit contenir un attribut 'nom'. Voir : $url");
$this->assertEquals('Acacia', $retour['nom_vernaculaire'], "Le json doit contenir un attribut 'nom' avec pour valeur 'Acacia'. Voir : $url");
$this->assertArrayHasKey('attributions', $retour, "Le json doit contenir un attribut 'attributions'. Voir : $url");
$this->assertEquals(2, count($retour['attributions']), "Le résultat devrait contenir deux langues d'attributions. Voir : $url");
$this->assertEquals(1, count($retour['attributions']['fra']), "Le résultat devrait contenir une attribution à un taxon en français. Voir : $url");
$this->assertArrayHasKey('taxon', $retour['attributions']['fra']['-1617415758'], "Le json doit contenir un attribut : 'taxon' . Voir : $url");
$this->assertEquals('Robinia pseudoacacia L.', $retour['attributions']['fra']['-1617415758']['taxon'], "Le json doit contenir un attribut 'taxon' avec pour valeur Robinia pseudoacacia. Voir : $url");
$this->assertArrayHasKey('genre', $retour['attributions']['fra']['-1617415758'], "Le json doit contenir un attribut : 'genre' . Voir : $url");
$this->assertEquals('Masculin singulier', $retour['attributions']['fra']['-1617415758']['genre'], "Le json doit contenir un attribut 'genre' avec pour valeur Masculin singulier. Voir : $url");
$this->assertArrayHasKey('conseil_emploi', $retour['attributions']['fra']['-1617415758'], "Le json doit contenir un attribut : 'conseil_emploi' . Voir : $url");
$this->assertEquals('Recommandé ou typique', $retour['attributions']['fra']['-1617415758']['conseil_emploi'], "Le json doit contenir un attribut 'conseil_emploi' avec pour valeur Recommandé ou typique. Voir : $url");
}
public function testerAttributionsAvecRechercheMasqueEtOntologies() {
$ressources = array('attributions');
$parametres = array(
'retour.format' => 'max',
'navigation.limite' => '50',
'masque.nt' => '8523');
$url = ServiceEflorePhpUnit::creerUrl($this->service, $ressources, $parametres);
$retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$this->assertArrayHasKey('entete', $retour, "Le json ne contient pas d'attribut : entete. Voir : $url");
$this->assertArrayHasKey('resultat', $retour, "Le json contient pas d'attribut : resultat. Voir : $url");
$this->assertEquals('21', $retour['entete']['total'], "Le json ne contient pas le nombre de valeurs attendues. Voir : $url");
$this->assertEquals('Acer monspessulanum L.', $retour['resultat']['2081013327']['taxon'], "Le json ne contient pas le taxon attendu. Voir : $url");
$this->assertEquals('Masculin singulier', $retour['resultat']['2081013327']['genre'], "Le json ne contient pas le genre attendu pour ce taxon. Voir : $url");
$this->assertEquals('Recommandé ou typique', $retour['resultat']['2081013327']['conseil_emploi'], "Le json ne contient pas le conseil emploi attendu pour ce taxon. Voir : $url");
}
public function testerAvecLangueFrMasqueEtRetourOss() {
$ressources = array();
$parametres = array(
'recherche' => 'etendue',
'retour.format' => 'oss',
'navigation.limite' => '50',
'masque.lg' => 'fra',
'masque' => 'Abr');
$url = ServiceEflorePhpUnit::creerUrl($this->service, $ressources, $parametres);
// Raphaël, le 28/08/2013: pourquoi double-requête ? dans le doute: commentée
// $retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$this->assertArrayNotHasKey('entete', $retour, "Le json ne doit pas contenir d'attribut : entete. Voir : $url");
$this->assertEquals('Pas de masque', $retour['0'], "L'attribut 0 du retour devrait valoir 'Pas de masque'. Voir : $url");
$this->assertArrayNotHasKey('resultat', $retour, "Le json ne doit pas contenir d'attribut : resultat. Voir : $url");
$this->assertEquals(50, count($retour[1]), "Le résultat devrait contenir 50 données. Voir : $url");
}
 
// L'utilisation de retour.champs=conseil_emploi sur l'Héliotrope commun induit un requêtage à
// de multiple ontologies. Celles-ci devraient être factorisées sous la forme d'une requête et le
// résultat renvoyé correct.
// nvjfl/noms-vernaculaires/attributions?masque.nt=1382&retour.champs=conseil_emploi
// masque.lg=fra (pour simplement réduire la lourdeur)
public function testAttributionsOntologiesMultiples() {
$parametres = [ 'masque.nt' => 1382, 'retour.champs' => 'conseil_emploi,genre', 'masque.lg' => 'fra' ];
$url = '/nvjfl' . ServiceEflorePhpUnit::creerUrl('noms-vernaculaires', ['attributions'], $parametres);
$retour = $this->consulterJson('noms-vernaculaires', 'nvjfl', ['attributions'], $parametres);
 
// basique:
$this->assertArrayHasKey('entete', $retour, "Le json ne contient pas d'attribut : entete. Voir : $url");
$this->assertArrayHasKey('resultat', $retour, "Le json ne contient pas d'attribut : resultat. Voir : $url");
$this->assertEquals('4', $retour['entete']['total'], "L'attribut 'total' de l'entête devrait valoir 1. Voir : $url");
$this->assertEquals(4, count($retour['resultat']), "Le résultat devrait contenir une seule donnée. Voir : $url");
 
// présence champs standards:
foreach($retour['resultat'] as $k => $e) {
foreach([ 'id', 'nom_vernaculaire', 'taxon', /* 'langue.code', 'taxon.code', 'href', */ 'nom_retenu.code', 'num_taxon' ] as $v) {
$this->assertArrayHasKey($v, $e, "Le json ne contient pas l'attribut \"$v\" pour l'élément \"$k\". Voir : $url");
}
}
 
// présence champs additionnels:
foreach($retour['resultat'] as $k => $e) {
foreach([ 'is_null', 'zone_usage', 'num_genre', 'notes', 'num_statut', 'num_nom_vernaculaire' ] as $v) {
$this->assertArrayHasKey($v, $e, "Le json ne contient pas l'attribut \"$v\" pour l'élément \"$k\". Voir : $url");
}
}
 
// -1311256838
$this->assertArrayHasKey('-1311256838', $retour['resultat'], "Le json ne contient pas l'élément -1311256838. Voir : $url");
$this->assertEquals('Recommandé ou typique', $retour['resultat']['-1311256838']['conseil_emploi'], "L'élément '-1311256838' contient une valeur erronée pour l'attribut 'conseil_emploi'. Voir : $url");
$this->assertEquals('Héliotrope commun', $retour['resultat']['-1311256838']['nom_vernaculaire'], "L'élément '-1311256838' contient une valeur erronée pour l'attribut 'nom_vernaculaire'. Voir : $url");
$this->assertEquals('1', $retour['resultat']['-1311256838']['num_statut'], "L'élément '-1311256838' contient une valeur erronée pour l'attribut 'num_statut'. Voir : $url");
 
$this->assertEquals('Secondaire ou régional', $retour['resultat']['-516239805']['conseil_emploi'], "L'élément '-516239805' contient une valeur erronée pour l'attribut 'conseil_emploi'. Voir : $url");
$this->assertEquals('Girasol', $retour['resultat']['-516239805']['nom_vernaculaire'], "L'élément '-516239805' contient une valeur erronée pour l'attribut 'nom_vernaculaire'. Voir : $url");
$this->assertEquals('2', $retour['resultat']['-516239805']['num_statut'], "L'élément '-516239805' contient une valeur erronée pour l'attribut 'num_statut'. Voir : $url");
 
// TODO: code_langue et num_taxon => langue.code et taxon.code ?
// absence champs "pseudo"-inattendus
foreach($retour['resultat'] as $k => $e) {
foreach([ '_result_ontologies@nvjfl'] as $v) {
$this->assertArrayNotHasKey($v, $e, "Le json contient l'attribut \"$v\" pour l'élément \"$k\". Voir : $url");
}
}
}
}
/tags/v5.0-agropyraie-20130830/services/tests/0.1/nvjfl/NvjflOntologiesTest.php
New file
0,0 → 1,50
<?php
require_once dirname(__FILE__).'/../ServiceEflorePhpUnit.php';
 
class NvjflOntologiesTest extends ServiceEflorePhpUnit {
 
// simple test ontologies nvjfl
// ce qui signifie les ontologies communes aux référentiels (bdtfx, bdtxa, isfan)
public function testOntoNVJFLSimpleNotExist() {
$url = '/nvjfl' . ServiceEflorePhpUnit::creerUrl('ontologies', [ 'numStatut:-1' ] );
$retour = $this->consulterBrut('ontologies', 'nvjfl', [ 'numStatut:-1' ] );
$this->assertContains($retour, 'Les données recherchées sont introuvables.');
}
 
public function testOntoNVJFLSimpleAttrNotExist() {
$url = '/nvjfl' . ServiceEflorePhpUnit::creerUrl('ontologies', [ 'blah:1' ] );
$retour = $this->consulterBrut('ontologies', 'nvjfl', [ 'blah:1' ] );
$this->assertContains($retour, 'Les données recherchées sont introuvables.');
}
 
public function testOntoNVJFLSimple() {
$ressource = [ 'numStatut:1' ];
$url = '/nvjfl' . ServiceEflorePhpUnit::creerUrl('ontologies', $ressource );
$retour = $this->consulterJson('ontologies', 'nvjfl', $ressource );
$this->assertNotEmpty($retour, 'données absentes');
foreach(['id', 'nom', 'code', 'complements', 'classe.id', 'classe', 'classe.href', 'description'] as $v) {
$this->assertArrayHasKey($v, $retour, "Le json ne contient pas l'attribut \"$v\". Voir : $url");
}
}
 
public function testOntoNVJFLMultiples() {
$ressource = [ implode(',', [ 'numStatut:1', 'numStatut:2', 'genreNombre:10', 'numStatut:-1', 'blah:1' ]) ];
$url = '/nvjfl' . ServiceEflorePhpUnit::creerUrl('ontologies', $ressource );
$retour = $this->consulterJson('ontologies', 'nvjfl', $ressource );
$this->assertNotEmpty($retour, 'données absentes');
$this->assertEquals(3, count($retour), "Le retour devrait contenir 3 éléments valides. Voir : $url");
foreach($retour as $k => $e) {
$this->assertArrayHasKey($k, $retour, "Le json ne contient pas d'élément '$k'. Voir : $url");
}
foreach($retour as $k => $e) {
foreach(['id', 'nom', 'code', 'classe.id', 'classe', 'classe.href'] as $v) {
$this->assertArrayHasKey($v, $e, "Le json ne contient pas l'attribut \"$v\" pour l'élément \"$k\". Voir : $url");
}
}
$this->assertEquals('Recommandé ou typique', $retour['numStatut:1']['nom'], "test attribut 'nom' pour numStatut:1. Voir : $url");
$this->assertEquals('Secondaire ou régional', $retour['numStatut:2']['nom'], "test attribut 'nom' pour numStatut:2. Voir : $url");
$this->assertEquals('Féminin singulier', $retour['genreNombre:10']['nom'], "test attribut 'nom' pour genreNombre:10. Voir : $url");
$this->assertEquals('N° Statut', $retour['numStatut:1']['classe'], "test attribut 'classe' pour numStatut:1. Voir : $url");
$this->assertEquals('N° Genre et nombre', $retour['genreNombre:10']['classe'], "test attribut 'nom' pour genreNombre:10. Voir : $url");
}
}
/tags/v5.0-agropyraie-20130830/services/tests/0.1/cel/CelImagesTest.php
New file
0,0 → 1,188
<?php
require_once dirname(__FILE__).'/../ServiceEflorePhpUnit.php';
 
class CelImagesTest extends ServiceEflorePhpUnit {
 
public function __construct() {
$this->projet = 'cel';
$this->service = 'images';
}
 
public function testParametreMasqueNnInexistant() {
$ressources = array();
$parametres = array('retour'=>'image/jpeg', 'retour.format'=>'M');
 
$retour = ServiceEflorePhpUnit::consulterBrut($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$messageAttendu = "Le paramètre masque.nn est obligatoire.";
$this->assertEquals($messageAttendu, $retour,
"Le service doit renvoyer un message pour un masque non renseigné");
}
 
public function testParametreMasqueNnMultiple() {
$ressources = array();
$parametres = array('masque.nn' => 'bdftf:6218,182','retour'=>'image/jpeg');
 
$retour = ServiceEflorePhpUnit::consulterBrut($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$messageAttendu = "Le paramètre masque.nn peut contenir une seule valeur numérique pour l'instant pour le format de retour image/jpeg.";
$this->assertEquals($messageAttendu, $retour,
"Le service doit renvoyer un message car le paramètre masque.nn n'est pas complétement implémenté.");
}
 
public function testParametreRetourFormatInexistant() {
$ressources = array();
$parametres = array('masque.nn' => '62018', 'retour'=>'image/jpeg');
 
$retour = ServiceEflorePhpUnit::consulterBrut($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$image = imagecreatefromstring($retour);
$largeur = imagesx($image);
$hauteur = imagesy($image);
$this->assertLessThanOrEqual(450, $largeur,
"Le service doit renvoyer une image de taille M (largeur < 450px) par défaut (h:$hauteur x l:$largeur)");
$this->assertLessThanOrEqual(450, $hauteur,
"Le service doit renvoyer une image de taille M (hauteur < 600px) par défaut (h:$hauteur x l:$largeur)");
if ($hauteur != 450) {
$this->assertSame(450, $largeur,
"Le service doit renvoyer une image de taille M : largeur == 450px pour une hauteur infèrieure à 600px (h:$hauteur x l:$largeur)");
}
if ($largeur != 450) {
$this->assertSame(450, $hauteur,
"Le service doit renvoyer une image de taille M : hauteur == 600px pour une largeur infèrieure à 450px (h:$hauteur x l:$largeur)");
}
}
 
public function testValeurParametreRetourFormatInexistante() {
$ressources = array();
$parametres = array('masque.nn' => '62018', 'retour'=>'image/jpeg', 'retour.format'=>'X53L');
 
$retour = ServiceEflorePhpUnit::consulterBrut($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$messageAttendu = "Le type de format 'X53L' n'est pas supporté";
$this->assertEquals($messageAttendu, $retour,
"Le service doit renvoyer un message pour un format de retour inexistant");
}
 
public function testValeurParametreRetourInexistante() {
$ressources = array();
$parametres = array('masque.nn' => '6218','retour'=>'image/jpog');
 
$retour = ServiceEflorePhpUnit::consulterBrut($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$messageAttendu = "Le type de retour 'image/jpog' n'est pas supporté";
$this->assertEquals($messageAttendu, $retour,
"Le service doit renvoyer un message d'erreur 400 sur une type de retour incorrect");
}
 
public function testTaxonSansImage() {
$ressources = array();
$parametres = array('masque.nn' => '6218','retour' => 'image/jpeg');
 
$retour = ServiceEflorePhpUnit::consulterBrut($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$messageAttendu = "Aucune image ne correspond au numéro numenclatural bdtfx:'6218'";
$this->assertEquals($messageAttendu, $retour,
"Le service doit renvoyer un message pour un taxon ne possédant pas d'images");
}
 
public function testListeImagesJsonMasqueNnSimple() {
$ressources = array();
$parametres = array('masque.nn' => '182','retour' => 'application/json', 'retour.format' => 'CRX2S');
 
$retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
 
$this->verifierEnteteChampsObligatoires($retour);
$this->assertEquals('nn=182', $retour['entete']['masque'], 'Valeur entete > masque = "nn=182"');
$this->assertSame(0, $retour['entete']['depart'], 'Valeur entete > depart = 0');
$this->assertSame(100, $retour['entete']['limite'], 'Valeur entete > limite = 0');
$this->assertSame(62, $retour['entete']['total'], 'Valeur entete > total = 62');
$this->assertArrayNotHasKey('href.suivant', $retour['entete'], "Absence champ : entete > href.suivant");
$this->assertArrayNotHasKey('href.precedent', $retour['entete'], "Absence champ : entete > href.precedent");
 
$this->verifierResultatsChampsObligatoires($retour);
$this->verifierResultatsValeursGenerique($retour);
$this->assertCount(62, $retour['resultats'], 'Nbre resultats = 62');
foreach ($retour['resultats'] as $id => $resultat) {
$this->assertRegExp("/CRX2S/", $resultat['binaire.href']);
}
}
 
public function testListeImagesJsonMasqueNnMultiple() {
$ressources = array();
$parametres = array('masque.nn' => '62018,182,141','retour' => 'application/json');
 
$retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
 
$this->verifierEnteteChampsObligatoires($retour);
$this->assertEquals('nn=62018,182,141', $retour['entete']['masque'], 'Valeur entete > masque = "nn=62018,182,141"');
$this->assertSame(0, $retour['entete']['depart'], 'Valeur entete > depart = 0');
$this->assertSame(100, $retour['entete']['limite'], 'Valeur entete > limite = 0');
$this->assertSame(134, $retour['entete']['total'], 'Valeur entete > total = 134');
$this->assertArrayHasKey('href.suivant', $retour['entete'], "Présence champ : entete > href.suivant");
$urlHrefSuivantAttendue = 'http://localhost/service:eflore:0.1/cel/images?navigation.depart=100&navigation.limite=100&masque.nn=62018,182,141';
$this->assertEquals($urlHrefSuivantAttendue, $retour['entete']['href.suivant'], "Valeur entete > href.suivant = '$urlHrefSuivantAttendue'");
$this->assertArrayNotHasKey('href.precedent', $retour['entete'], "Abscence champ : entete > href.precedent");
 
$this->verifierResultatsChampsObligatoires($retour);
$this->verifierResultatsValeursGenerique($retour);
$this->assertCount(100, $retour['resultats'], 'Nbre resultats = 134');
$this->assertArrayHasKey('6114', $retour['resultats'], "Présence champ : resultats > 6114");
}
 
public function testListeImagesJsonNavigation() {
$ressources = array();
$parametres = array('masque.nn' => '62018,182,141', 'retour' => 'application/json',
'navigation.depart' => 100, 'navigation.limite' => 100);
 
$retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
 
$this->verifierEnteteChampsObligatoires($retour);
$this->assertEquals('nn=62018,182,141', $retour['entete']['masque'], 'Valeur entete > masque = "nn=62018,182,141"');
$this->assertSame((int)$parametres['navigation.depart'], $retour['entete']['depart'], "Valeur entete > depart = {$parametres['navigation.depart']}");
$this->assertSame((int)$parametres['navigation.limite'], $retour['entete']['limite'], "Valeur entete > limite = {$parametres['navigation.limite']}");
$this->assertSame(134, $retour['entete']['total'], 'Valeur entete > total = 134');
 
$this->assertArrayHasKey('href.precedent', $retour['entete'], "Présence champ : entete > href.precedent");
$urlHrefPrecedentAttendue = 'http://localhost/service:eflore:0.1/cel/images?navigation.depart=0&navigation.limite=100&masque.nn=62018,182,141';
$this->assertEquals($urlHrefPrecedentAttendue, $retour['entete']['href.precedent'], "Valeur entete > href.precedent = '$urlHrefPrecedentAttendue'");
$this->assertArrayNotHasKey('href.suivant', $retour['entete'], "Abscence champ : entete > href.suivant");
 
$this->verifierResultatsChampsObligatoires($retour);
$this->verifierResultatsValeursGenerique($retour);
}
 
private function verifierEnteteChampsObligatoires($retour) {
$this->assertArrayHasKey('entete', $retour, "Présence champ : entete");
$this->assertArrayHasKey('masque', $retour['entete'], "Présence champ : entete > masque");
$this->assertArrayHasKey('depart', $retour['entete'], "Présence champ : entete > depart");
$this->assertArrayHasKey('limite', $retour['entete'], "Présence champ : entete > limite");
$this->assertArrayHasKey('total', $retour['entete'], "Présence champ : entete > total");
}
 
private function verifierResultatsChampsObligatoires($retour) {
$this->assertArrayHasKey('resultats', $retour, "Présence champ : resultats");
foreach ($retour['resultats'] as $id => $resultat) {
$this->assertTrue(is_int($id), "id = nbre entier : $id");
$this->assertArrayHasKey('date', $resultat, "Présence champ : resultats > $id > date");
$this->assertArrayHasKey('mime', $resultat, "Présence champ : resultats > $id > mime");
$this->assertArrayHasKey('binaire.href', $resultat, "Présence champ : resultats > $id > binaire.href");
$this->assertArrayHasKey('determination', $resultat, "Présence champ : resultats > $id > determination");
$this->assertArrayHasKey('determination.nom_sci', $resultat, "Présence champ : resultats > $id > determination.nom_sci");
$this->assertArrayHasKey('determination.nom_sci.code', $resultat, "Présence champ : resultats > $id > determination.nom_sci.code");
$this->assertArrayHasKey('station', $resultat, "Présence champ : resultats > $id > station");
$this->assertArrayHasKey('auteur', $resultat, "Présence champ : resultats > $id > auteur");
}
}
 
private function verifierResultatsValeursGenerique($retour) {
foreach ($retour['resultats'] as $id => $resultat) {
$this->assertRegExp("/$id/", $resultat['binaire.href']);
}
}
 
public function testDateAnterieur1901() {
$ressources = array('41825');
$parametres = array('referentiel'=>'bdtfx');
 
$retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
 
$this->assertArrayHasKey('date', $retour, "Présence champ : date");
$this->assertEquals("1891-00-00 00:00:00", $retour['date'], 'Valeur date <> 1891');
}
}
?>
/tags/v5.0-agropyraie-20130830/services/tests/0.1/chorodep/ChorodepObservationsTest.php
New file
0,0 → 1,48
<?php
require_once dirname(__FILE__).'/../ServiceEflorePhpUnit.php';
 
class ChorodepObservationsTest extends ServiceEflorePhpUnit {
 
public function __construct() {
$this->projet = 'chorodep';
$this->service = 'observations';
}
 
public function testRecherche() {
$ressources = array();
$parametres = array();
$url = ServiceEflorePhpUnit::creerUrl($this->service, $ressources, $parametres);
$retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$this->assertNotEmpty($retour, print_r($retour, true));
$this->assertNotEmpty($retour['entete'], print_r($retour['entete'], true));
$this->assertEquals(20, $retour['entete']['total'], "L'attribut 'total' devrait avoir la valeur '20'. Voir : $url");
$this->assertEquals(20, count($retour['resultat']), "Il devrait y avoir '20' résultats. Voir : $url");
}
 
 
public function testObservation() {
$ressources = array("10:20");
$parametres = array();
$url = ServiceEflorePhpUnit::creerUrl($this->service, $ressources, $parametres);
$retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$this->assertNotEmpty($retour, print_r($retour, true));
$this->assertArrayHasKey('type', $retour, "Le json ne contient pas d'attribut : type. Voir : $url");
$this->assertEquals('chorologie', $retour['type'], "L'attribut 'type' devrait avoir la valeur 'chorologie'. Voir : $url");
}
 
public function testMasqueStation() {
$ressources = array();
$parametres = array('masque.station' => '34', 'retour.format' => 'min');
$url = ServiceEflorePhpUnit::creerUrl($this->service, $ressources, $parametres);
$retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$this->assertNotEmpty($retour, 'pas de resultat'.print_r($retour, true));
$this->assertNotEmpty($retour['entete'], 'pas d\'entete'.print_r($retour['entete'], true));
$this->assertEquals(20, $retour['entete']['total'], "L'attribut 'total' devrait avoir la valeur '20'. Voir : $url");
$this->assertEquals(20, count($retour['resultat']), "L'attribut 'total' devrait avoir la valeur '20'. Voir : $url");
$this->assertNotEmpty($retour['resultat']['197:34'], 'resultat 197:34 absent'.print_r($retour['resultat']['74929:03'], true));
/*$this->assertArrayHasKey('type', $retour['resultat']['74929:03'], "Le json ne contient pas d'attribut : type. Voir : $url");
$this->assertEquals('chorologie', $retour['resultat']['74929:03']['type'], "L'attribut 'type' devrait avoir la valeur 'chorologie'. Voir : $url");*/
// TODO: implémenter "chorodep/observations/10:25?masque.station=34&retour.format=min"
}
}
?>
/tags/v5.0-agropyraie-20130830/services/tests/0.1/chorodep/ChorodepCartesTest.php
New file
0,0 → 1,135
<?php
require_once dirname(__FILE__).'/../ServiceEflorePhpUnit.php';
 
class ChorodepCartesTest extends ServiceEflorePhpUnit {
 
private $retour = '';
private $svg = '';
 
public function __construct() {
$this->projet = 'chorodep';
$this->service = 'cartes';
}
 
public function setUp() {
$this->retour = '';
$this->svg = '';
}
 
public function testCarteGenerique() {
$ressources = array();
$parametres = array('version.projet' => '2012.01');
 
$this->retour = ServiceEflorePhpUnit::consulterBrut($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
 
$this->verifierPresenceMessage("A implémenter : carte proportionnelle ensemble des infos");
}
 
public function testCarteGeneriqueLegende() {
$ressources = array('legende');
$parametres = array('version.projet' => '2012.01');
 
$this->retour = ServiceEflorePhpUnit::consulterBrut($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
 
$this->verifierPresenceMessage("A implémenter : légende carte proportionnelle ensemble des infos");
}
 
public function testErreurRessource1() {
$ressources = array('ressource1Erreur');
$parametres = array('version.projet' => '2012.01');
 
$this->retour = ServiceEflorePhpUnit::consulterBrut($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
 
$this->verifierPresenceMessage("La ressource n°1 '{$ressources[0]} indiquée n'est pas valable.");
}
 
public function testCarteSvgIdentifiants() {
$ressourcesListe = array(
array('3237'),
array('nn:3237'),
array('bdtfx.nn:3237')
);
$parametres = array('version.projet' => '2012.01',
'retour' => 'image/svg+xml');
 
foreach ($ressourcesListe as $ressources) {
$this->retour = ServiceEflorePhpUnit::consulterBrut($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
 
$this->chargerXml();
$this->etreSvg();
$this->verifierDepartementsPresence(array(63, 81));
}
}
 
public function testCarteSvgPlusieursLegendes() {
$ressources = array('bdtfx.nn:71574');
$parametres = array('version.projet' => '2012.01',
'retour' => 'image/svg+xml');
 
$this->retour = ServiceEflorePhpUnit::consulterBrut($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
 
$this->chargerXml();
$this->etreSvg();
$this->verifierDepartementsPresence(array('02', '07', '57', '67', '88', '68', '90', '25', '21', '39', '01', '74', '73', '38', '46', '83'));
$this->verifierDepartementsPresenceAConfirmer(array('62', '71'));
$this->verifierDepartementsDisparu(array('70'));
$this->verifierDepartementsErreur(array('06'));
}
 
private function verifierPresenceMessage($messageAttendu) {
$this->assertEquals($messageAttendu, $this->retour);
}
 
private function chargerXml() {
$this->svg = new DOMDocument();
$chargement = $this->svg->loadXML($this->retour);
$this->assertTrue($chargement);
}
 
private function etreSvg() {
$racineElement = $this->svg->documentElement;
$this->assertEquals('svg', $racineElement->tagName);
}
private function verifierDepartementsPresence($departements) {
$this->verifierReglesCssCouleur('A0FF7D', $departements);
}
 
private function verifierDepartementsPresenceAConfirmer($departements) {
$this->verifierReglesCssCouleur('FFFF32', $departements);
}
 
private function verifierDepartementsDouteux($departements) {
$this->verifierReglesCssCouleur('FFCB30', $departements);
}
 
private function verifierDepartementsDisparu($departements) {
$this->verifierReglesCssCouleur('F88017', $departements);
}
 
private function verifierDepartementsErreur($departements) {
$this->verifierReglesCssCouleur('FF2850', $departements);
}
 
private function verifierDepartementsErreurAConfirmer($departements) {
$this->verifierReglesCssCouleur('9F0016', $departements);
}
 
private function verifierReglesCssCouleur($couleur, $departements) {
sort($departements);
$cssRegles = $this->getListeReglesCss($departements);
$cssAttendu = "$cssRegles{\nfill:#$couleur;\n}";
 
$cssPresent = $this->svg->getElementsByTagName('style')->item(0)->nodeValue;
 
$this->assertContains($cssAttendu, $cssPresent);
}
 
private function getListeReglesCss($departements) {
foreach ($departements as $id => $val) {
$departements[$id] = '.departement'.$val;
}
$cssRegle = implode(', ', $departements);
return $cssRegle;
}
}
?>
/tags/v5.0-agropyraie-20130830/services/tests/0.1/chorodep/ChorodepOntologiesTest.php
New file
0,0 → 1,48
<?php
require_once dirname(__FILE__).'/../ServiceEflorePhpUnit.php';
 
class ChorodepOntologiesTest extends ServiceEflorePhpUnit {
 
public function __construct() {
$this->projet = 'chorodep';
$this->service = 'ontologies';
}
 
public function testRecherche() {
$ressources = array();
$parametres = array();
$url = ServiceEflorePhpUnit::creerUrl($this->service, $ressources, $parametres);
$retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$this->assertNotEmpty($retour, 'données absentes');
$this->assertArrayHasKey('total', $retour['entete'], "Le json ne contient pas d'attribut : total. Voir : $url");
$this->assertEquals('8', $retour['entete']['total'], "L'attribut 'total' devrait avoir la valeur '8'. Voir : $url");
$this->assertArrayHasKey('nom', $retour['resultat'][1], "Le json ne contient pas d'attribut : nom. Voir : $url");
$this->assertEquals('presenceChorologie', $retour['resultat'][1]['nom'], "L'attribut 'nom' devrait avoir la valeur 'presenceChorologie'. Voir : $url");
}
public function testMasqueCode() {
$ressources = array();
$parametres = array('masque.code' => '?');
$url = ServiceEflorePhpUnit::creerUrl($this->service, $ressources, $parametres);
$retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$this->assertNotEmpty($retour, 'données absentes');
$this->assertArrayHasKey('total', $retour['entete'], "Le json ne contient pas d'attribut : total. Voir : $url");
$this->assertEquals('1', $retour['entete']['total'], "L'attribut 'total' devrait avoir la valeur '1'. Voir : $url");
$this->assertArrayHasKey('5', $retour['resultat'], "L'ontologie n°5 ne fait pas partie du résultat. Voir : $url");
$this->assertArrayHasKey('nom', $retour['resultat'][5], "Le json ne contient pas d'attribut : nom. Voir : $url");
$this->assertEquals('douteux', $retour['resultat'][5]['nom'], "L'attribut 'nom' devrait avoir la valeur 'douteux'. Voir : $url");
}
public function testMasqueNom() {
$ressources = array();
$parametres = array('masque.nom' => 'disparu');
$url = ServiceEflorePhpUnit::creerUrl($this->service, $ressources, $parametres);
$retour = $this->consulterJson($this->service, $this->projet, $ressources, $parametres);
$this->assertNotEmpty($retour, 'données absentes');
$this->assertArrayHasKey('total', $retour['entete'], "Le json ne contient pas d'attribut : total. Voir : $url");
$this->assertEquals('1', $retour['entete']['total'], "L'attribut 'total' devrait avoir la valeur '1'. Voir : $url");
$this->assertArrayHasKey('code', $retour['resultat'][6], "Le json ne contient pas d'attribut : code. Voir : $url");
$this->assertEquals('-|-', $retour['resultat'][6]['code'], "L'attribut 'code' devrait avoir la valeur '-|-'. Voir : $url");
}
}
?>
/tags/v5.0-agropyraie-20130830/services/tests/0.2/bdtfx/NomsServiceBdftxTest.php
New file
0,0 → 1,399
<?php
require_once dirname(__FILE__).'/../ServicePhpUnit.php';
 
class NomsServiceBdtfxTest extends ServicePhpUnit {
 
private $retour = '';
private $nomDetailSqueletteUrl = 'http://localhost/service:eflore:0.2/bdtfx/noms/%s';
private $ontologieHrefTpl = 'http://localhost/service:eflore:0.2/bdnt/ontologies/rangTaxo:%s';
private $champsProjet = array(
'presence_Ga' => 'presence_Ga.code',
'presence_Co' => 'presence_Co.code'
);
 
public function __construct() {
$this->projet = 'bdtfx';
$this->service = 'noms';
}
 
public function initialiserService(NomsListe $service) {
$service->setDetailsHrefTpl($this->nomDetailSqueletteUrl);
$service->setOntologieHrefTpl($this->ontologieHrefTpl);
$service->setChampsProjet($this->champsProjet);
}
 
public function testVersionPrecise() {
$ressources = array();
$parametres = array('version.projet' => '1.01', 'recherche' => 'etendue', 'masque' => 'acer');
 
$this->retour = $this->consulter($ressources, $parametres);
 
$this->verifierStructureListe();
$this->verifierMasque('nom_sci=acer%');
$this->verifierTotal(156);
$this->verifierNbreResultats(100);
}
 
public function testNomsVersionMultiple() {
$ressources = array();
$parametres = array('version.projet' => '*', 'recherche' => 'etendue', 'masque' => 'acer');
 
$this->retour = $this->consulterBrut($ressources, $parametres);
 
$this->verifierPresenceMessage("L'affichage de plusieurs versions ne fonctionne que pour les ressources de type /ressources/#id");
}
 
public function testVersionInexistante() {
$ressources = array();
$parametres = array('version.projet' => '99.00');
 
$this->retour = $this->consulterBrut($ressources, $parametres);
 
$this->verifierPresenceMessage("La version '99.00' n'est pas disponible pour le projet 'bdtfx' !");
}
 
public function testAucunResultat() {
$ressources = array();
$parametres = array(
'version.projet' => '1.01',
'recherche' => 'stricte',
'masque' => 'Axer');
 
$this->retour = $this->consulterBrut($ressources, $parametres);
 
$this->verifierPresenceMessage("Aucun résultat ne correspond a votre requête !");
}
 
public function testRechercheStricte() {
$ressources = array();
$parametres = array(
'version.projet' => '1.01',
'recherche' => 'stricte',
'masque' => 'Acer');
 
$this->retour = $this->consulter($ressources, $parametres);
 
$this->verifierStructureListe();
$this->verifierMasque('nom_sci=Acer');
$this->verifierTotal(1);
$this->verifierNbreResultats(1);
}
 
public function testResultatChamps() {
$ressources = array();
$parametres = array(
'version.projet' => '1.01',
'recherche' => 'stricte',
'masque.nn' => '182');
 
$this->retour = $this->consulter($ressources, $parametres);
 
$this->verifierStructureListe();
$this->verifierMasque('num_nom=182');
$this->verifierTotal(1);
$this->verifierNbreResultats(1);
$this->verifierLigneResultatsStructure(182);
$this->verifierResultatsLigneAttributValeur(182, 'retenu', true);
$this->verifierResultatsLigneAttributValeur(182, 'nom_sci', 'Acer monspessulanum');
}
 
public function testMasqueSg() {
$ressources = array();
$parametres = array(
'version.projet' => '1.01',
'recherche' => 'stricte',
'masque.sg' => 'Asteraceae');
 
$this->retour = $this->consulter($ressources, $parametres);
 
$this->verifierStructureListe();
$this->verifierMasque('nom_supra_generique=Asteraceae');
$this->verifierTotal(1);
$this->verifierNbreResultats(1);
}
 
public function testMasqueGenSpSspAuAn() {
$ressources = array();
$parametres = array(
'version.projet' => '1.01',
'recherche' => 'stricte',
'masque.gen' => 'Allium',
'masque.sp' => 'carinatum',
'masque.ssp' => 'consimile',
'masque.au' => 'Gren.',
'masque.an' => '1855');
 
$this->retour = $this->consulter($ressources, $parametres);
 
$this->verifierStructureListe();
$this->verifierMasque('genre=Allium&epithete_sp=carinatum&epithete_infra_sp=consimile&auteur=Gren.&annee=1855');
$this->verifierTotal(1);
$this->verifierNbreResultats(1);
}
 
public function testMasqueNn() {
$ressources = array();
$parametres = array(
'version.projet' => '1.01',
'recherche' => 'stricte',
'masque.nn' => '182');
 
$this->retour = $this->consulter($ressources, $parametres);
 
$this->verifierStructureListe();
$this->verifierMasque('num_nom=182');
$this->verifierTotal(1);
$this->verifierNbreResultats(1);
$this->verifierLigneResultatsStructure(182);
}
 
public function testMasqueRg() {
$ressources = array();
$parametres = array(
'version.projet' => '1.01',
'recherche' => 'stricte',
'masque.rg' => '180');
 
$this->retour = $this->consulter($ressources, $parametres);
 
$this->verifierStructureListe();
$this->verifierMasque('rang=180');
$this->verifierTotal(210);
}
 
// TODO : à implémenter!
/*
public function testNomsIdVersionMultiple() {
$ressources = array('71711');
$parametres = array('version.projet' => '*');
 
$retour = $this->consulter($ressources, $parametres);
$this->assertArrayHasKey('bdtfx_v1_01', $retour, "Le json ne contient pas d'attribut : bdtfx_v1_01.");
$this->assertArrayHasKey('bdtfx_v1_02', $retour, "Le json ne contient pas d'attribut : bdtfx_v1_02.");
$this->assertEquals('71711', $retour['bdtfx_v1_01']['id'], "'bdtfx_v1_01' doit contenir un attribut 'id' avec la valeur '71711'");
$this->assertEquals('71711', $retour['bdtfx_v1_02']['id'], "'bdtfx_v1_02' doit contenir un attribut 'id' avec la valeur '71711'");
}*/
 
// TODO : à implémenter
/*
public function testNsStructureTxt() {
$ressources = array();
$parametres = array(
'version.projet' => '1.01',
'recherche' => 'stricte',
'masque.nn' => '182',
'ns.format' => 'txt',
'ns.structure' => 'au,an,bib,ad');
 
$this->retour = $this->consulter($ressources, $parametres);
 
$this->verifierStructureListe();
$this->verifierMasque('num_nom=182');
$this->verifierTotal(1);
$this->verifierNbreResultats(1);
$this->verifierResultatsLigneAttributValeur(182, 'nom_sci', 'Acer monspessulanum L. [1753, Sp. Pl., éd. 1 : 1056]');
}*/
 
// TODO : à implémenter
/*
public function testNsStructureHtml() {
$ressources = array();
$parametres = array(
'version.projet' => '1.01',
'recherche' => 'stricte',
'masque.nn' => '182',
'ns.format' => 'htm',
'ns.structure' => 'au,an,bib,ad');
 
$this->retour = $this->consulter($ressources, $parametres);
 
$this->verifierStructureListe();
$this->verifierMasque('num_nom=182');
$this->verifierTotal(1);
$this->verifierNbreResultats(1);
$nomSciAttendu = '<span class="sci"><span class="gen">Acer</span> <span class="sp">monspessulanum</span></span> <span class="auteur">L.</span> [<span class="annee">1753</span>, <span class="biblio">Sp. Pl., éd. 1 : 1056</span>]';
$this->verifierResultatsLigneAttributValeur(182, 'nom_sci', $nomSciAttendu);
}*/
 
// TODO : à implémenter
/*
public function testListeNomsAvecParametreRetourChamps() {
$ressources = array();
$parametres = array('version.projet' => '1.01',
'masque' => 'acer',
'retour.champs' => 'auteur,nom_retenu.*');
 
$this->retour = $this->consulter($ressources, $parametres);
 
$this->verifierStructureListe();
$this->presenceAttributDansResultat(83587, 'auteur');
$this->presenceAttributDansResultat(83587, 'nom_retenu.id');
$this->presenceAttributDansResultat(83587, 'nom_retenu.href');
$this->abscenceAttributDansResultat(83587, 'nom_retenu');
}*/
 
// TODO : à implémenter
/*
public function testNomsIdAvecParametreRetourChamps() {
$ressources = array('1');
$parametres = array('version.projet' => '1.01',
'retour.champs' => 'nom_retenu.*');
 
$this->retour = $this->consulter($ressources, $parametres);
 
$this->presenceAttribut('nom_retenu.id');
$this->presenceAttribut('nom_retenu.href');
$this->abscenceAttribut('nom_retenu');
$this->abscenceAttribut('auteur');
}*/
 
// TODO : à implémenter
/*
public function testListeNomAvecParametreNsStructureAuAnBibAd() {
$ressources = array();
$parametres = array('version.projet' => '1.01',
'masque.nn' => '39607',
'ns.structure' => 'au,an,bib,ad');
 
$this->retour = $this->consulter($ressources, $parametres);
 
$this->verifierStructureListe();
$this->presenceAttributDansResultat(39607, 'nom_sci');
 
$nomSciTxt = 'Lolium annuum Gilib. [1792, Exercit. Phytol., 2 : 520] [nom. invalid.]';
$this->verifierResultatsLigneAttributValeur(39607, 'nom_sci', $nomSciTxt);
}*/
 
// TODO : à implémenter
/*
public function testListeNomAvecParametreNsStructureAuAnBibAdEtNsFormatHtm() {
$ressources = array();
$parametres = array('version.projet' => '1.01',
'masque.nn' => '39607',
'ns.structure' => 'au,an,bib,ad',
'ns.format' => 'htm');
 
$this->retour = $this->consulter($ressources, $parametres);
 
$this->verifierStructureListe();
$this->verifierMasque('num_nom=39607');
 
$this->presenceAttributDansResultat(39607, 'nom_sci');
 
$nomSciHtml = "<span class=\"sci\"><span class=\"gen\">Lolium</span> <span class=\"sp\">annuum</span></span> <span class=\"auteur\">Gilib.</span> [<span class=\"annee\">1792</span>, <span class=\"biblio\">Exercit. Phytol., 2 : 520</span>] [<span class=\"adendum\">nom. invalid.</span>]";
$this->verifierResultatsLigneAttributValeur(39607, 'nom_sci', $nomSciHtml);
}*/
 
public function testSansParametres() {
$ressources = array('85');
$parametres = array();
 
$retour = $this->consulter($ressources, $parametres);
 
$this->assertTrue(is_array($retour), 'Retour est un tableau');
$this->assertArrayHasKey('id', $retour, 'Présence champ id');
$this->assertSame(85, $retour['id'], 'Valeur champ id = 85');
$this->assertArrayHasKey('nom_sci', $retour, 'Présence champ nom_sci');
 
$this->assertSame('Abutilon theophrasti', $retour['nom_sci'], 'Valeur champ nom_sci = Abutilon theophrasti');
$this->assertArrayHasKey('nom_retenu.id', $retour, 'Présence champ nom_retenu.id');
$this->assertSame(85, $retour['nom_retenu.id'], 'Valeur champ nom_sci = 85');
$this->assertArrayHasKey('nom_retenu', $retour, 'Présence champ nom_retenu');
$this->assertSame('Abutilon theophrasti', $retour['nom_retenu'], 'Valeur champ nom_retenu = Abutilon theophrasti');
$this->assertArrayHasKey('nom_retenu.href', $retour, 'Présence champ nom_retenu.href');
$urlNomRetenuHrefAttendue = sprintf($this->nomDetailSqueletteUrl, 85);
$this->assertSame($urlNomRetenuHrefAttendue, $retour['nom_retenu.href'], "Valeur champ nom_retenu.href = $urlNomRetenuHrefAttendue");
 
$this->assertArrayHasKey('rang.code', $retour, 'Présence champ rang.code');
$this->assertSame('bdnt.rangTaxo:290', $retour['rang.code'], 'Valeur champ rang.code = bdnt.rangTaxo:290');
$this->assertArrayHasKey('rang', $retour, 'Présence champ rang');
$this->assertSame('Espèce', $retour['rang'], 'Valeur champ rang = Espèce');
 
$this->assertArrayHasKey('rang.href', $retour, 'Présence champ rang.href');
$hrefAttendue =sprintf($this->ontologieHrefTpl, 290);
$this->assertSame($hrefAttendue, $retour['rang.href'], "Valeur champ rang.href = $hrefAttendue");
 
$this->assertArrayHasKey('nom_sci.genre', $retour, 'Présence champ nom_sci.genre');
$this->assertSame('Abutilon', $retour['nom_sci.genre'], "Valeur champ nom_sci.genre = 'Abutilon'");
$this->assertArrayHasKey('nom_sci.sp', $retour, 'Présence champ nom_sci.sp');
$this->assertSame('theophrasti', $retour['nom_sci.sp'], "Valeur champ nom_sci.sp = theophrasti");
 
$this->assertArrayHasKey('auteur', $retour, 'Présence champ auteur');
$this->assertSame('Medik.', $retour['auteur'], "Valeur champ auteur = 'Medik.'");
 
$this->assertArrayHasKey('presence_Ga.code', $retour, 'Présence champ presence_Ga.code'.print_r($retour,true));
$this->assertSame('P', $retour['presence_Ga.code'], "Valeur champ presence_Ga.code = 'P'");
$this->assertArrayHasKey('presence_Co.code', $retour, 'Présence champ "presence_Co.code');
$this->assertSame('P', $retour['presence_Co.code'], "Valeur champ page = P");
}
 
public function testNomSansCorrespondance() {
$ressources = array('98940');
$parametres = array();
 
$this->retour = $this->consulter($ressources, $parametres);
 
$this->abscenceAttribut('nom_retenu.id');
$this->abscenceAttribut('nom_retenu.href');
$this->verifierAttributValeur('nom_retenu', null);
}
 
private function verifierPresenceMessage($messageAttendu) {
$this->assertEquals($messageAttendu, $this->retour);
}
 
private function verifierStructureListe() {
$this->assertArrayHasKey('entete', $this->retour, "Présence attribut : entete");
$this->assertArrayHasKey('masque', $this->retour['entete'], "Présence attribut : entete>masque");
$this->assertArrayHasKey('depart', $this->retour['entete'], "Présence attribut : entete>depart");
$this->assertArrayHasKey('limite', $this->retour['entete'], "Présence attribut : entete>limite");
$this->assertArrayHasKey('total', $this->retour['entete'], "Présence attribut : entete>total");
$this->assertArrayHasKey('resultats', $this->retour, "Présence attribut : resultats");
}
 
private function verifierMasque($masque) {
$this->assertEquals($masque, $this->retour['entete']['masque'], "Attribut 'entete>masque' = '$masque'");
}
 
private function verifierTotal($total) {
$this->assertSame($total, $this->retour['entete']['total'], "Attribut 'entete>total' = $total");
}
 
private function verifierNbreResultats($nbre) {
$this->assertSame($nbre, count($this->retour['resultats']), "Nbre 'resultats' = 1");
}
 
private function verifierLigneResultatsStructure($ligne) {
$this->assertArrayHasKey($ligne, $this->retour['resultats'], "Presence attribut : resultats>$ligne".print_r($this->retour, true));
$this->assertArrayHasKey('nom_sci', $this->retour['resultats'][$ligne], "Presence attribut : resultats>$ligne>nom_sci".print_r($this->retour, true));
$this->assertArrayHasKey('retenu', $this->retour['resultats'][$ligne], "Presence attribut : resultats>$ligne>retenu".print_r($this->retour, true));
$this->assertArrayHasKey('href', $this->retour['resultats'][$ligne], "Presence attribut : resultats>$ligne>href".print_r($this->retour, true));
}
 
private function presenceAttributDansResultat($ligne, $attribut) {
$this->assertArrayHasKey($ligne, $this->retour['resultats'], "Présence ligne : resultats>$ligne");
$this->assertArrayHasKey($attribut, $this->retour['resultats'][$ligne], "Présence attribut : resultats>$ligne>$attribut");
}
 
private function abscenceAttributDansResultat($ligne, $attribut) {
$this->assertArrayNotHasKey($attribut, $this->retour['resultats'][$ligne], "Présence attribut : resultats>$ligne>$attribut");
}
 
private function verifierResultatsLigneAttributValeur($ligne, $attribut, $valeur) {
$this->assertSame($valeur, $this->retour['resultats'][$ligne][$attribut], "Attribut 'resultats>$ligne>$attribut' = $valeur");
}
 
private function presenceAttribut($attribut) {
$this->assertArrayHasKey($attribut, $this->retour);
}
 
private function abscenceAttribut($attribut) {
$this->assertArrayNotHasKey($attribut, $this->retour);
}
 
private function verifierAttributValeur($attribut, $valeur) {
$this->presenceAttribut($attribut);
$this->assertSame($valeur, $this->retour[$attribut]);
}
}
?>
/tags/v5.0-agropyraie-20130830/services/tests/0.2/bdd/tb_eflore.sqlite
Cannot display: file marked as a binary type.
svn:mime-type = application/octet-stream
/tags/v5.0-agropyraie-20130830/services/tests/0.2/bdd/tb_eflore.sqlite
New file
Property changes:
Added: svn:mime-type
+application/octet-stream
\ No newline at end of property
/tags/v5.0-agropyraie-20130830/services/tests/0.2/bdd/mysql2sqlite.sh
New file
0,0 → 1,109
#!/bin/sh
# Converts a mysqldump file into a Sqlite 3 compatible file. It also extracts the MySQL `KEY xxxxx` from the
# CREATE block and create them in separate commands _after_ all the INSERTs.
 
# Awk is choosen because it's fast and portable. You can use gawk, original awk or even the lightning fast mawk.
# The mysqldump file is traversed only once.
 
# Usage: $ ./mysql2sqlite mysqldump-opts db-name | sqlite3 database.sqlite
# Example: $ ./mysql2sqlite --no-data -u root -pMySecretPassWord myDbase | sqlite3 database.sqlite
 
# Thanks to and @artemyk and @gkuenning for their nice tweaks.
 
# AJOUT 2011-12-27 : chemin vers lampp pour le dump mysql, suppression des commentaires, insenssibilité à la casse pour tous les champs
 
# USAGE :
# ./mysql2sqlite.sh --default-character-set=utf8 -u root -p tb_eflore bdnt_meta bdnt_ontologies_v4_30 bdtfx_meta bdtfx_v1_01 \
# bdtfx_v1_02 fournier_meta fournier_v1_00 | \
# sqlite3 /home/jpm/web/eflore/eflore-projets/services/tests/0.2/bdd/tb_eflore.sqlite
 
/opt/lampp/bin/mysqldump --compatible=ansi --skip-extended-insert --compact "$@" | \
 
awk '
 
BEGIN {
FS=",$"
print "PRAGMA synchronous = OFF;"
print "PRAGMA journal_mode = MEMORY;"
print "BEGIN TRANSACTION;"
}
 
# CREATE TRIGGER statements have funny commenting. Remember we are in trigger.
/^\/\*.*CREATE.*TRIGGER/ {
gsub( /^.*TRIGGER/, "CREATE TRIGGER" )
print
inTrigger = 1
next
}
 
# The end of CREATE TRIGGER has a stray comment terminator
/END \*\/;;/ { gsub( /\*\//, "" ); print; inTrigger = 0; next }
 
# The rest of triggers just get passed through
inTrigger != 0 { print; next }
 
# Skip other comments
/^\/\*/ { next }
 
# Print all `INSERT` lines. The single quotes are protected by another single quote.
/INSERT/ {
gsub( /\\\047/, "\047\047" )
gsub(/\\n/, "\n")
gsub(/\\r/, "\r")
gsub(/\\"/, "\"")
gsub(/\\\\/, "\\")
gsub(/\\\032/, "\032")
print
next
}
 
# Print the `CREATE` line as is and capture the table name.
/^CREATE/ {
print
if ( match( $0, /\"[^\"]+/ ) ) tableName = substr( $0, RSTART+1, RLENGTH-1 )
}
 
# Replace `FULLTEXT KEY` or any other `XXXXX KEY` except PRIMARY by `KEY`
/^ [^"]+KEY/ && !/^ PRIMARY KEY/ { gsub( /.+KEY/, " KEY" ) }
 
# Get rid of field lengths in KEY lines
/ KEY/ { gsub(/\([0-9]+\)/, "") }
 
# Print all fields definition lines except the `KEY` lines.
/^ / && !/^( KEY|\);)/ {
gsub( /AUTO_INCREMENT|auto_increment/, "" )
gsub( /(CHARACTER SET|character set) [^ ]+ /, "" )
gsub( /DEFAULT CURRENT_TIMESTAMP ON UPDATE CURRENT_TIMESTAMP|default current_timestamp on update current_timestamp/, "" )
gsub( /(COLLATE|collate) [^ ]+ /, "" )
gsub(/(ENUM|enum)[^)]+\)/, "text ")
gsub(/(SET|set)\([^)]+\)/, "text ")
gsub(/UNSIGNED|unsigned/, "")
# AJOUT : suppression des commentaires
gsub(/(COMMENT|comment) '"'"'.+'"'"',/, ",")
# AJOUT : insenssibilité à la casse pour tous les champs
if (prev) print prev " COLLATE NOCASE,"
prev = $1
}
 
# `KEY` lines are extracted from the `CREATE` block and stored in array for later print
# in a separate `CREATE KEY` command. The index name is prefixed by the table name to
# avoid a sqlite error for duplicate index name.
/^( KEY|\);)/ {
if (prev) print prev
prev=""
if ($0 == ");"){
print
} else {
if ( match( $0, /\"[^"]+/ ) ) indexName = substr( $0, RSTART+1, RLENGTH-1 )
if ( match( $0, /\([^()]+/ ) ) indexKey = substr( $0, RSTART+1, RLENGTH-1 )
key[tableName]=key[tableName] "CREATE INDEX \"" tableName "_" indexName "\" ON \"" tableName "\" (" indexKey ");\n"
}
}
 
# Print all `KEY` creation lines.
END {
for (table in key) printf key[table]
print "END TRANSACTION;"
}
'
exit 0
Property changes:
Added: svn:eol-style
+native
\ No newline at end of property
Added: svn:executable
+*
\ No newline at end of property
/tags/v5.0-agropyraie-20130830/services/tests/0.2/fournier/NomsListeFournierTest.php
New file
0,0 → 1,211
<?php
require_once dirname(__FILE__).'/../ServicePhpUnit.php';
 
class NomsListeFournierTest extends ServicePhpUnit {
 
private $listeUrl = 'http://localhost/service:eflore:0.2/fournier/noms';
private $nomDetailSqueletteUrl = 'http://localhost/service:eflore:0.2/fournier/noms/%s';
private $nbreNom = 168;
 
public function __construct() {
$this->projet = 'fournier';
$this->service = 'noms';
}
 
public function testSansParametres() {
$ressources = array();
$parametres = array();
 
$retour = $this->consulter($ressources, $parametres);
$this->assertArrayHasKey('entete', $retour, 'Présence champ entete');
$this->assertArrayHasKey('masque', $retour['entete'], 'Présence champ entete>masque');
$this->assertEmpty($retour['entete']['masque'], 'Valeur champ entete>masque = vide');
$this->assertArrayHasKey('depart', $retour['entete'], 'Présence champ entete>depart');
$this->assertSame(0, $retour['entete']['depart'], 'Valeur champ entete>depart = 0');
$this->assertArrayHasKey('limite', $retour['entete'], 'Présence champ entete>limite');
$this->assertSame(100, $retour['entete']['limite'], 'Valeur champ entete>limite = 100');
$this->assertArrayHasKey('total', $retour['entete'], 'Présence champ entete>total');
$this->assertNotEquals(0, $retour['entete']['total'], 'Valeur champ entete>total != 0');
$this->assertSame($this->nbreNom, $retour['entete']['total'], 'Valeur champ entete>total = 168');
$this->assertArrayNotHasKey('href.precedent', $retour['entete'], "Abscence champ entete>href.precedent");
$this->assertArrayHasKey('href.suivant', $retour['entete'], "Présence champ entete>href.suivant");
$url = $this->listeUrl.'?navigation.depart=100&navigation.limite=100';
$this->assertEquals($url, $retour['entete']['href.suivant'], "Valeur champ entete>href.suivant = $url");
 
$this->assertArrayHasKey('resultats', $retour, 'Valeur champ resultats');
$this->assertCount(100, $retour['resultats'], 'Nombre de valeurs dans resultats = 100');
$this->assertArrayNotHasKey('1', $retour['resultats'], 'Abscence champ resultats>1 car trie sur nom_sci ASC');
$this->assertArrayHasKey('2', $retour['resultats'], 'Présence champ resultats>2');
$this->assertArrayHasKey('nom_sci', $retour['resultats']['2'], 'Présence champ resultats>2>nom_sci');
$this->assertCount(3, $retour['resultats']['2'], 'Nombre de valeurs dans resultats>2 = 3');
$this->assertEquals('Cryptogames', $retour['resultats']['2']['nom_sci'], 'Test valeur champ resultats>2>nom_sci = Plantae');
$this->assertArrayHasKey('retenu', $retour['resultats']['2'], 'Présence champ resultats>2>retenu');
$this->assertTrue($retour['resultats']['2']['retenu'], 'Valeur champ resultats>2>retenu = true');
$this->assertArrayHasKey('href', $retour['resultats']['2'], 'Présence champ resultats>2>href');
$url = sprintf($this->nomDetailSqueletteUrl, '2');
$this->assertEquals($url, $retour['resultats']['2']['href'], "Valeur champ resultats>2>nom_sci = $url");
}
 
public function testParametreNavigationDepart100() {
$ressources = array();
$parametres = array('navigation.depart' => 100);
 
$retour = $this->consulter($ressources, $parametres);
 
$this->assertArrayHasKey('depart', $retour['entete'], 'Présence champ entete>depart');
$this->assertSame(100, $retour['entete']['depart'], 'Valeur champ entete>depart = 100');
$this->assertArrayHasKey('limite', $retour['entete'], 'Présence champ entete>limite');
$this->assertSame(100, $retour['entete']['limite'], 'Valeur champ entete>limite = 100');
$this->assertSame($this->nbreNom, $retour['entete']['total'], 'Valeur champ entete>total = 168');
$this->assertArrayNotHasKey('href.suivant', $retour['entete'], "Abscence champ entete>href.suivant");
$this->assertArrayHasKey('href.precedent', $retour['entete'], "Présence champ entete>href.precedent");
$url = $this->listeUrl.'?navigation.depart=0&navigation.limite=100';
$this->assertEquals($url, $retour['entete']['href.precedent'], "Valeur champ entete>href.precedent = $url");
}
 
public function testRechercheDefautMasque() {
$ressources = array();
$parametres = array('masque' => 'Lycopodium');
 
$retour = $this->consulter($ressources, $parametres);
 
$this->assertArrayHasKey('masque', $retour['entete'], 'Présence champ entete>masque');
$this->assertEquals('nom_sci=Lycopodium', $retour['entete']['masque'], 'Valeur champ entete>masque = "nom_sci=Lycopodium"');
$this->assertCount(1, $retour['resultats'], 'Nombre de valeurs dans resultats = 1');
$this->assertEquals('Lycopodium', $retour['resultats']['5']['nom_sci'], 'Test valeur champ resultats>5>nom_sci = Lycopodium');
}
 
public function testRechercheStricteMasque() {
$ressources = array();
$parametres = array('masque' => 'Lycopodium', 'recherche' => 'stricte');
 
$retour = $this->consulter($ressources, $parametres);
 
$this->assertArrayHasKey('masque', $retour['entete'], 'Présence champ entete>masque');
$this->assertEquals('nom_sci=Lycopodium', $retour['entete']['masque'], 'Valeur champ entete>masque = "nom_sci=Lycopodium"');
$this->assertCount(1, $retour['resultats'], 'Nombre de valeurs dans resultats = 1');
$this->assertEquals('Lycopodium', $retour['resultats']['5']['nom_sci'], 'Test valeur champ resultats>5>nom_sci = Lycopodium');
}
 
public function testerRechercheEtendueMasque() {
$ressources = array();
$parametres = array('masque' => 'Lycopodium', 'recherche' => 'etendue');
 
$retour = $this->consulter($ressources, $parametres);
 
$this->assertArrayHasKey('masque', $retour['entete'], 'Présence champ entete>masque');
$this->assertEquals('nom_sci=Lycopodium%', $retour['entete']['masque'], 'Valeur champ entete>masque = "nom_sci=Lycopodium%"');
$this->assertCount(11, $retour['resultats'], 'Nombre de valeurs dans resultats = 10');
foreach ($retour['resultats'] as $nom) {
$this->assertContains('Lycopodium', $nom['nom_sci'], 'Test valeur champ resultats>...>nom_sci contient Lycopodium');
}
}
 
public function testerRechercheFloueMasque() {
$ressources = array();
$parametres = array('masque' => 'Licopodium', 'recherche' => 'floue');
 
$retour = $this->consulter($ressources, $parametres);
 
$this->assertArrayHasKey('masque', $retour['entete'], 'Présence champ entete>masque');
$this->assertEquals('nom_sci=Licopodium', $retour['entete']['masque'], 'Valeur champ entete>masque = "nom_sci=Licopodium"');
$this->assertCount(1, $retour['resultats'], 'Nombre de valeurs dans resultats = 1');
$this->assertContains('Lycopodium', $retour['resultats'][5]['nom_sci'], 'Test valeur champ resultats>5>nom_sci contient Lycopodium');
}
 
public function testRechercheDefautMasqueSg() {
$ressources = array();
$parametres = array('masque.sg' => 'Lycopodiaceae');
 
$retour = $this->consulter($ressources, $parametres);
 
$this->assertArrayHasKey('masque', $retour['entete'], 'Présence champ entete>masque');
$this->assertEquals('nom_supra_generique=Lycopodiaceae', $retour['entete']['masque'], 'Valeur champ entete>masque = "nom_sci=Lycopodiaceae"');
$this->assertCount(1, $retour['resultats'], 'Nombre de valeurs dans resultats = 1');
$this->assertEquals('Lycopodiaceae', $retour['resultats']['4']['nom_sci'], 'Test valeur champ resultats>4>nom_sci = Lycopodiaceae');
}
 
public function testRechercheDefautMasqueGen() {
$ressources = array();
$parametres = array('masque.gen' => 'Lycopodium');
 
$retour = $this->consulter($ressources, $parametres);
 
$this->assertArrayHasKey('masque', $retour['entete'], 'Présence champ entete>masque');
$this->assertEquals('genre=Lycopodium', $retour['entete']['masque'], 'Valeur champ entete>masque = "genre=Lycopodium"');
$this->assertCount(11, $retour['resultats'], 'Nombre de valeurs dans resultats = 11');
foreach ($retour['resultats'] as $id => $info) {
$this->assertContains('Lycopodium', $info['nom_sci'], "Test valeur champ resultats>$id>nom_sci contient Lycopodium");
}
}
 
public function testRechercheDefautMasqueSp() {
$ressources = array();
$parametres = array('masque.sp' => 'alpinum');
 
$retour = $this->consulter($ressources, $parametres);
 
$this->assertArrayHasKey('masque', $retour['entete'], 'Présence champ entete>masque');
$this->assertEquals('epithete_sp=alpinum', $retour['entete']['masque'], 'Valeur champ entete>masque = "epithete_sp=alpinum"');
$this->assertCount(2, $retour['resultats'], 'Nombre de valeurs dans resultats = 2');
foreach ($retour['resultats'] as $id => $info) {
$this->assertContains('alpinum', $info['nom_sci'], "Test valeur champ resultats>$id>nom_sci contient alpinum");
}
}
 
public function testRechercheEtendueMasqueSg() {
$ressources = array();
$parametres = array('masque.sg' => 'Lycopodiaceae', 'recherche' => 'etendue');
 
$retour = $this->consulter($ressources, $parametres);
 
$this->assertArrayHasKey('masque', $retour['entete'], 'Présence champ entete>masque');
$this->assertEquals('nom_supra_generique=Lycopodiaceae%', $retour['entete']['masque'], 'Valeur champ entete>masque = "nom_sci=Lycopodiaceae"');
$this->assertCount(1, $retour['resultats'], 'Nombre de valeurs dans resultats = 1');
$this->assertEquals('Lycopodiaceae', $retour['resultats']['4']['nom_sci'], 'Test valeur champ resultats>4>nom_sci = Lycopodiaceae');
}
 
public function testRechercheEtendueMasqueGen() {
$ressources = array();
$parametres = array('masque.gen' => 'Lycopodium', 'recherche' => 'etendue');
 
$retour = $this->consulter($ressources, $parametres);
 
$this->assertArrayHasKey('masque', $retour['entete'], 'Présence champ entete>masque');
$this->assertEquals('genre=Lycopodium%', $retour['entete']['masque'], 'Valeur champ entete>masque = "genre=Lycopodium"');
$this->assertCount(11, $retour['resultats'], 'Nombre de valeurs dans resultats = 11');
foreach ($retour['resultats'] as $id => $info) {
$this->assertContains('Lycopodium', $info['nom_sci'], "Test valeur champ resultats>$id>nom_sci contient Lycopodium");
}
}
 
public function testRechercheEtendueMasqueSp() {
$ressources = array();
$parametres = array('masque.sp' => 'alpinum', 'recherche' => 'etendue');
 
$retour = $this->consulter($ressources, $parametres);
 
$this->assertArrayHasKey('masque', $retour['entete'], 'Présence champ entete>masque');
$this->assertEquals('epithete_sp=alpinum%', $retour['entete']['masque'], 'Valeur champ entete>masque = "epithete_sp=alpinum"');
$this->assertCount(2, $retour['resultats'], 'Nombre de valeurs dans resultats = 2');
foreach ($retour['resultats'] as $id => $info) {
$this->assertContains('alpinum', $info['nom_sci'], "Test valeur champ resultats>$id>nom_sci contient alpinum");
}
}
 
public function testRetourChamps() {
$ressources = array();
$parametres = array('retour.champs' => 'nom_retenu');
 
$retour = $this->consulter($ressources, $parametres);
 
$this->assertArrayHasKey('href.suivant', $retour['entete'], "Présence champ entete>href.suivant");
$url = $this->listeUrl.'?retour.champs=nom_retenu&navigation.depart=100&navigation.limite=100';
$this->assertEquals($url, $retour['entete']['href.suivant'], "Valeur champ entete>href.suivant = $url");
foreach ($retour['resultats'] as $id => $info) {
$this->assertArrayHasKey('nom_retenu', $info, "Présence champ resultats>$id>nom_retenu ");
}
}
 
}
?>
/tags/v5.0-agropyraie-20130830/services/tests/0.2/fournier/NomDetailsFournierTest.php
New file
0,0 → 1,61
<?php
require_once dirname(__FILE__).'/../ServicePhpUnit.php';
 
class NomDetailsFournierTest extends ServicePhpUnit {
 
private $nomDetailSqueletteUrl = 'http://localhost/service:eflore:0.2/fournier/noms/%s';
private $ontologieHrefTpl = 'http://localhost/service:eflore:0.2/bdnt/ontologies/rangTaxo:%s';
private $champsProjet = array(
'nom_scientifique' => 'nom_scientifique',
'auteur_origine' => 'auteur_origine',
'nom_vernaculaire' => 'nom_vernaculaire',
'page' => 'page',
'code_taxon' => 'code_taxon',
'milieu' => 'milieu',
'floraison' => 'floraison',
'type' => 'type',
'sol' => 'sol',
'rarete_region_alt' => 'rarete_region_alt',
'region_bota_monde' => 'region_bota_monde',
'etymologie' => 'etymologie',
'taille' => 'taille',
'formule_hybridite' => 'formule_hybridite',
'culture' => 'culture');
 
public function __construct() {
$this->projet = 'fournier';
$this->service = 'noms';
}
 
public function testSansParametres() {
$ressources = array('85');
$parametres = array();
 
$retour = $this->consulter($ressources, $parametres);
 
$this->assertTrue(is_array($retour), 'Retour est un tableau');
$this->assertArrayHasKey('id', $retour, 'Présence champ id');
$this->assertSame(85, $retour['id'], 'Valeur champ id = 85');
$this->assertArrayHasKey('nom_sci', $retour, 'Présence champ nom_sci');
$this->assertSame('Hymenophyllum peltatum', $retour['nom_sci'], 'Valeur champ nom_sci = Hymenophyllum peltatum');
$this->assertArrayHasKey('nom_retenu.id', $retour, 'Présence champ nom_retenu.id');
$this->assertSame(84, $retour['nom_retenu.id'], 'Valeur champ nom_sci = 84');
$this->assertArrayHasKey('nom_retenu', $retour, 'Présence champ nom_retenu');
$this->assertSame('Hymenophyllum unilaterale', $retour['nom_retenu'], 'Valeur champ nom_retenu = Hymenophyllum unilaterale');
$this->assertArrayHasKey('nom_retenu.href', $retour, 'Présence champ nom_retenu.href');
$urlNomRetenuHrefAttendue = sprintf($this->nomDetailSqueletteUrl, 84);
$this->assertSame($urlNomRetenuHrefAttendue, $retour['nom_retenu.href'], "Valeur champ nom_retenu.href = $urlNomRetenuHrefAttendue");
 
$this->assertArrayHasKey('rang.code', $retour, 'Présence champ rang.code');
$this->assertSame('bdnt.rangTaxo:290', $retour['rang.code'], 'Valeur champ rang.code = bdnt.rangTaxo:290');
$this->assertArrayHasKey('rang', $retour, 'Présence champ rang');
$this->assertSame('Espèce', $retour['rang'], 'Valeur champ rang = Espèce');
 
$this->assertArrayHasKey('rang.href', $retour, 'Présence champ rang.href');
$hrefAttendue =sprintf($this->ontologieHrefTpl, 290);
$this->assertSame($hrefAttendue, $retour['rang.href'], "Valeur champ rang.href = $hrefAttendue");
 
}
 
}
?>
/tags/v5.0-agropyraie-20130830/services/tests/0.2/bibliotheque/ParametresTest.php
New file
0,0 → 1,89
<?php
require_once dirname(__FILE__).'/../ServicePhpUnit.php';
 
class ParametresTest extends ServicePhpUnit {
 
private function initialiser($parametresUrl = array()) {
$bdd = $this->getMock('Bdd');
 
$parametres = new Parametres($parametresUrl, $bdd);
return $parametres;
}
 
public function testerParametreParDefaut() {
$parametres = $this->initialiser();
 
$this->assertEquals('stricte', $parametres->get('recherche'));
$this->assertEquals('txt', $parametres->get('ns.format'));
$this->assertEquals('application/json', $parametres->get('retour'));
$this->assertEquals('max', $parametres->get('retour.format'));
$this->assertEquals('fr', $parametres->get('retour.langue'));
$this->assertEquals('+', $parametres->get('version.projet'));
$this->assertSame(0, $parametres->get('navigation.depart'));
$this->assertSame(100, $parametres->get('navigation.limite'));
}
 
public function testerExisterRetourneBouleen() {
$parametresUrl = array('masque.id' => '12,15,18');
 
$parametres = $this->initialiser($parametresUrl);
 
$this->assertTrue($parametres->exister('masque.id'));
$this->assertFalse($parametres->exister('masque'));
$this->assertTrue($parametres->exister('recherche'));
}
 
public function testerGetRetourneValeur() {
$parametresUrl = array('masque.id' => '12,15,18');
 
$parametres = $this->initialiser($parametresUrl);
 
$this->assertEquals('12,15,18', $parametres->get('masque.id'));
}
 
public function testerGetListeRetourneTableau() {
$parametresUrl = array('masque.id' => '12,15,18');
 
$parametres = $this->initialiser($parametresUrl);
$liste = $parametres->getListe('masque.id');
 
$this->assertTrue(is_array($liste));
$this->assertCount(3, $liste);
$this->assertContains(12, $liste);
$this->assertContains(15, $liste);
$this->assertContains(18, $liste);
}
 
public function testerIterateur() {
$parametresUrl = array('code1' => 'val1', 'code2' => 'val2', 'code3' => 'val3');
 
$parametres = $this->initialiser($parametresUrl);
 
$parametres->rewind();
$code = $parametres->key();
$valeur = $parametres->current();
$this->assertEquals('code1', $code);
$this->assertEquals('val1', $valeur);
 
$parametres->next();
$code = $parametres->key();
$valeur = $parametres->current();
$this->assertEquals('code2', $code);
$this->assertEquals('val2', $valeur);
 
$parametres->next();
$code = $parametres->key();
$valeur = $parametres->current();
$this->assertEquals('code3', $code);
$this->assertEquals('val3', $valeur);
 
$parametres->next();
$this->assertFalse($parametres->valid());
 
$parametres->rewind();
$this->assertTrue($parametres->valid());
$code = $parametres->key();
$this->assertEquals('code1', $code);
}
 
}
/tags/v5.0-agropyraie-20130830/services/tests/0.2/bibliotheque/ProjetTest.php
New file
0,0 → 1,66
<?php
require_once dirname(__FILE__).'/../ServicePhpUnit.php';
 
class ProjetTest extends ServicePhpUnit {
 
private function initialiser($ressourcesUrl = array()) {
$ressources = new Ressources($ressourcesUrl);
$projet = new Projet($ressources);
$projet->setCheminBase(realpath(dirname(__FILE__).'/../../../modules/0.2').'/');
$projet->setCheminConfig(realpath(dirname(__FILE__).'/../../../configurations').'/');
$projet->setCheminBiblio(realpath(dirname(__FILE__).'/../../../bibliotheque').'/');
$paramsVerif = $this->getMock('ParametresVerificateur');
$projet->setParamsVerif($paramsVerif);
$ressourcesVerif = $this->getMock('RessourcesVerificateur');
$projet->setRessourcesVerif($ressourcesVerif);
$versionVerif = $this->getMock('VersionVerificateur');
$projet->setVersionVerif($versionVerif);
return $projet;
}
 
public function testerInitialiserAutoLoad() {
$ressourcesUrl = array('fournier', 'noms', '1');
 
$projet = $this->initialiser($ressourcesUrl);
$projet->initialiser();
 
$nomDetails = $this->getMock('NomDetailsGenerique');
$test = new NomDetailsFournier($nomDetails);
}
 
public function testerInitialiserConfig() {
$ressourcesUrl = array('fournier', 'noms', '1');
 
$projet = $this->initialiser($ressourcesUrl);
$projet->initialiser();
 
$this->assertNotNull(Config::get('nomProjet'));
$this->assertNotNull(Config::get('bddTable'));
$this->assertNotNull(Config::get('bddTableMeta'));
$this->assertNotNull(Config::get('baseServiceUrl'));
$this->assertNotNull(Config::get('baseProjetUrl'));
$this->assertNotNull(Config::get('listeUrl'));
$this->assertNotNull(Config::get('detailsHrefTpl'));
$this->assertNotNull(Config::get('ontologieHrefTpl'));
$this->assertNotNull(Config::get('servicesDispo'));
$this->assertNotNull(Config::get('parametresAPI'));
$this->assertNotNull(Config::get('champsProjet'));
}
 
public function testerVerifierExistanceClasseService() {
$ressourcesUrl = array('fournier', 'ServiceInexistant', '1');
 
$projet = $this->initialiser($ressourcesUrl);
 
try {
$projet->verifier();
} catch(Exception $e) {
$messageAttendu = "La classe du service demandé 'ServiceInexistant' n'existe pas dans le projet 'fournier' !";
$this->assertEquals($messageAttendu, $e->getMessage());
$this->assertEquals(404, $e->getCode());
return null;
}
$this->fail("Aucune exception n'a été soulevée.");
}
}
?>
/tags/v5.0-agropyraie-20130830/services/tests/0.2/bibliotheque/EnteteHttpTest.php
New file
0,0 → 1,14
<?php
require_once dirname(__FILE__).'/../ServicePhpUnit.php';
 
class EnteteHttpTest extends ServicePhpUnit {
 
public function testerEnteteHttpParDefaut() {
$enteteHttp = new EnteteHttp();
 
$this->assertEquals('200', $enteteHttp->code);
$this->assertEquals('utf-8', $enteteHttp->encodage);
$this->assertEquals('application/json', $enteteHttp->mime);
}
}
?>
/tags/v5.0-agropyraie-20130830/services/tests/0.2/bibliotheque/ParametresVerificateurTest.php
New file
0,0 → 1,112
<?php
require_once dirname(__FILE__).'/../ServicePhpUnit.php';
 
class ParametresVerificateurTest extends ServicePhpUnit {
 
private function initialiser($parametresUrl = array(), $parametresAPI = array()) {
$bdd = $this->getMock('Bdd');
$parametres = new Parametres($parametresUrl, $bdd);
$verificateur = new ParametresVerificateur($parametres, $parametresAPI);
return $verificateur;
}
 
public function testerValeursPermises() {
$parametresUrl = array(
'recherche' => 'declencheException',
'ns.format' => 'declencheException',
'retour' => 'declencheException',
'retour.format' => 'declencheException',
'retour.langue' => 'declencheException',
'ns.structure' => 'declencheException',
'version.projet' => 'declencheException');
 
$verificateur = $this->initialiser($parametresUrl);
 
try {
$verificateur->verifierValeurs();
} catch(Exception $e) {
$messageComplet = array("Erreur dans le paramètrage de votre URL :");
$messageTpl = "Le paramètre '%s' ne peut pas prendre la valeur 'declencheException'. Valeurs permises : %s";
$messageComplet[] = $messageAttendu = sprintf($messageTpl, 'recherche', 'stricte|floue|etendue');
$this->assertContains($messageAttendu, $e->getMessage());
$messageComplet[] = $messageAttendu = sprintf($messageTpl, 'ns.format', 'htm|txt');
$this->assertContains($messageAttendu, $e->getMessage());
$messageComplet[] = $messageAttendu = sprintf($messageTpl, 'retour', 'application/json|image/jpeg');
$this->assertContains($messageAttendu, $e->getMessage());
$messageComplet[] = $messageAttendu = sprintf($messageTpl, 'retour.format', 'min|max|oss|perso');
$this->assertContains($messageAttendu, $e->getMessage());
$messageComplet[] = $messageAttendu = sprintf($messageTpl, 'retour.langue', '/^(?:[*]|orig|[a-z]{2})$/');
$this->assertContains($messageAttendu, $e->getMessage());
$messageComplet[] = $messageAttendu = sprintf($messageTpl, 'ns.structure', '|an|au|bib|ad');
$this->assertContains($messageAttendu, $e->getMessage());
$messageComplet[] = $messageAttendu = sprintf($messageTpl, 'version.projet', '/^(?:[0-9]+[.][0-9]+|[*+])$/');
$this->assertContains($messageAttendu, $e->getMessage());
 
$this->assertEquals(implode('<br/>', $messageComplet), $e->getMessage());
return null;
}
$this->fail("Aucune exception n'a été soulevée.");
}
 
public function testerExceptionVerificationConformiteApi() {
$parametresUrl = array('code1' => 'val1');
$parametresAPI = array('paramApi');
 
$verificateur = $this->initialiser($parametresUrl, $parametresAPI);
 
try {
$verificateur->verifierConformiteApi();
} catch(Exception $e) {
$messageAttendu = "Le paramètre 'code1' n'est pas pris en compte par cette version de l'API.";
$this->assertEquals($messageAttendu, $e->getMessage());
return null;
}
$this->fail("Aucune exception n'a été soulevée.");
}
 
public function testerExceptionVerifierValeurSimple() {
$parametresUrl = array('recherche' => 'declencheException');
 
$verificateur = $this->initialiser($parametresUrl);
 
try {
$verificateur->verifierValeurs();
} catch(Exception $e) {
$messageAttendu = "Le paramètre 'recherche' ne peut pas prendre la valeur 'declencheException'. Valeurs permises : ";
$this->assertContains($messageAttendu, $e->getMessage());
return null;
}
$this->fail("Aucune exception n'a été soulevée.");
}
 
public function testerExceptionVerifierValeurRegExp() {
$parametresUrl = array('retour.langue' => '1');
 
$verificateur = $this->initialiser($parametresUrl);
 
try {
$verificateur->verifierValeurs();
} catch(Exception $e) {
$messageAttendu = "Le paramètre 'retour.langue' ne peut pas prendre la valeur '1'. Valeurs permises : ";
$this->assertContains($messageAttendu, $e->getMessage());
return null;
}
$this->fail("Aucune exception n'a été soulevée.");
}
 
public function testerExceptionVerifierValeurMultiple() {
$parametresUrl = array('ns.structure' => 'an,1');
 
$verificateur = $this->initialiser($parametresUrl);
 
try {
$verificateur->verifierValeurs();
} catch(Exception $e) {
$messageAttendu = "Le paramètre 'ns.structure' ne peut pas prendre la valeur '1'. Valeurs permises : ";
$this->assertContains($messageAttendu, $e->getMessage());
return null;
}
$this->fail("Aucune exception n'a été soulevée.");
}
}
?>
/tags/v5.0-agropyraie-20130830/services/tests/0.2/ServicePhpUnit.php
New file
0,0 → 1,168
<?php
// declare(encoding='UTF-8');
/**
* Classe contenant des méthodes :
* - d'intialisation des tests,
* - refactorisant le code des tests,
* - facilitant les tests.
*
* @category php 5.3
* @package Tests/Services
* @author Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org>
* @copyright Copyright (c) 2011, Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
* @license http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-fr.txt Licence CECILL
* @license http://www.gnu.org/licenses/gpl.html Licence GNU-GPL
* @version $Id$
*/
abstract class ServicePhpUnit extends PHPUnit_Framework_TestCase {
 
protected static $cheminBase = '';
protected $projet = '';
protected $service = '';
protected $baseUrl = 'http://localhost/service:eflore:0.1/';
protected $serviceBaseUrl = '';
//+------------------------------------------------------------------------------------------------------+
// Intialisation
 
public static function setUpBeforeClass() {
error_reporting(E_ALL);
$_SERVER['argv'][] = '-contexte';
$_SERVER['argv'][] = $_GET['contexte'] = 'test';
self::chargerFramework();
self::$cheminBase = realpath(__DIR__.'/../../modules/0.2').'/';
// Enregistrement en première position des autoload de la méthode gérant les classes des services
spl_autoload_register(array(get_class($this), 'chargerClasseAuto'));
}
 
public static function chargerClasseAuto($classe) {
if (class_exists($classe)) {
return null;
}
 
$cheminCommun = self::$cheminBase.'commun/';
$cheminBibliotheque = realpath(__DIR__.'/../../bibliotheque').'/';
$cheminBiblioInterfaces = $cheminBibliotheque.'interfaces/';
$cheminBiblioNom = $cheminBibliotheque.'nom/';
$cheminBiblioNomDeco = $cheminBiblioNom.'decorateurs/';
$cheminsTests = __DIR__.'/';
$chemins = array(
self::$cheminBase,
$cheminCommun,
$cheminBibliotheque,
$cheminsTests,
$cheminBiblioInterfaces,
$cheminBiblioNom,
$cheminBiblioNomDeco);
 
foreach ($chemins as $chemin) {
$chemin = $chemin.$classe.'.php';
if (file_exists($chemin)) {
require_once $chemin;
}
}
}
 
private static function chargerFramework() {
$cheminRacine = realpath(dirname(__FILE__).'/../..').'/';
$framework = $cheminRacine.'framework.php';
if (!file_exists($framework)) {
$e = "Veuillez paramétrer l'emplacement et la version du Framework dans le fichier $framework";
trigger_error($e, E_USER_ERROR);
} else {
// Inclusion du Framework
require_once $framework;
 
// Ajout d'information concernant cette application
Framework::setCheminAppli($cheminRacine);// Obligatoire
}
}
 
//+------------------------------------------------------------------------------------------------------+
// Refactorisation
protected function consulter($ressources, $parametres) {
$retourJson = $this->consulterBrut($ressources, $parametres);
$retour = json_decode($retourJson, true);
$this->assertEquals(JSON_ERROR_NONE, json_last_error(), "Le json contient des erreurs qui bloquent le décodage. Voir : $url");
return $retour;
}
 
protected function consulterBrut($ressources, $parametres) {
array_unshift($ressources, $this->service);
array_unshift($ressources, $this->projet);
$projet = new Projets();
$retourJson = $projet->consulter($ressources, $parametres);
return $retourJson;
}
 
protected function creerUrl($ressources, $parametres) {
$version = '';
$ressourcesUrl = array();
foreach ($ressources as $ressource) {
$ressourcesUrl[] = $ressource;
}
$ressourcesUrl = count($ressourcesUrl) > 0 ? '/'.implode('/', $ressourcesUrl) : '';
 
$parametresUrl = '';
if (count($parametres) > 0) {
foreach ($parametres as $cle => $valeur) {
$parametresUrl[] = $cle.'='.rawurlencode($valeur);
}
$parametresUrl = '?'.implode('&', $parametresUrl);
}
$url = $this->baseUrl.$this->projet.'/'.$version.$this->service.$ressourcesUrl.$parametresUrl;
return $url;
}
 
//+------------------------------------------------------------------------------------------------------+
// Méthodes facilitant les tests
 
/**
* Récupère un bouchon de classe abstraite.
* Comment l'utiliser :
* $classeAstraite = $this->getClasseAbstraite('MaClasse', array('param1', 'param2'));
* $foo = $classeAstraite->methodeConcretePublique();
*
* @param String $classeNom Le nom de la classe
* @param Array $parametres Les paramètres à passer au constructeur.
* @return Object Le bouchon de la classe abstraite
*/
public function getClasseAbstraite($classeNom, Array $parametres) {
$efloreScript = $this->getMockForAbstractClass($classeNom, $parametres);
return $efloreScript;
}
 
/**
* Récupère une méthode privée d'une classe pour tester/documenter.
* Comment l'utiliser :
* MyClass->foo():
* $cls = new MyClass();
* $foo = self::getPrivateMethode($cls, 'foo');
* $foo->invoke($cls, $...);
*
* @param object $objet Une instance de votre classe
* @param string $methode Le nom de la méthode private
* @return ReflectionMethod La méthode demandée
*/
public static function getMethodePrivee($objet, $nomMethode) {
$classe = new ReflectionClass($objet);
$methode = $classe->getMethod($nomMethode);
$methode->setAccessible(true);
return $methode;
}
 
/**
* Récupère une méthode protégée d'une classe pour tester/documenter.
* Comment l'utiliser :
* MyClass->foo():
* $cls = new MyClass();
* $foo = self::getProtectedMethode($cls, 'foo');
* $foo->invoke($cls, $...);
* @param object $objet Une instance de votre classe
* @param string $methode Le nom de la méthode protected
* @return ReflectionMethod La méthode demandée
*/
public static function getMethodeProtegee($objet, $nomMethode) {
return self::getMethodePrivee($objet, $nomMethode);
}
}
?>
/tags/v5.0-agropyraie-20130830/services/modules/0.1/isfan/Noms.php
New file
0,0 → 1,599
<?php
// declare(encoding='UTF-8');
/**
* Classe permettant de fournir des informations sur les noms scientifiques.
* Si l'url finit par /noms on retourne une liste de noms latin et leurs identifiants (seulement les 100 premeiers noms par défaut).
* L'url peut contenir des paramètres optionnels passés après le ? : /noms?param1=val1&param2=val2&...
*
* Les paramètres de requête disponibles sont : masque, masque.gen (nom de genre), masque.sp (épithète d'espèce), masque.ssp (épithète infra-spécifique),
* masque.au (auteur du nom), masque.an (année de publication du nom), masque.bib (réf biblio de la publi d'origine du nom), masque.ad (nomen addendum),
* masque.nn (identifiant du nom), recherche, rang, distinct, retour.format, nl.format, nl.structure, navigation.depart et navigation.limite.
* Les différentes requetes :
* - noms | noms/relations/#projet/#id_projet | noms/#id | noms/#id/#champ+#champ
* - noms/#id/relations | noms/#id/relations/synonymie | noms/#id/relations/homonymie | noms/#id/relations/flores
* - noms/stats/rangs | noms/stats/annees | noms/stats/initiales
*
* @package bdtfx
* @author Jennifer Dhé <jennifer.dhe@tela-botanica.org>
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
* @version $Id$
* @copyright 1999-2011 Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
* @see http://www.tela-botanica.org/wikini/eflore/wakka.php?wiki=EfloreApi01Noms
*/
 
class Noms extends CommunNomsTaxons {
 
protected $format_reponse = 'noms'; // Permet de stocker la requete formulée
protected $service = 'noms';
protected $serviceNom = 'noms';
protected $requete_champ = 'num_nom, nom_sci, num_nom_retenu';
protected $requete_condition = null;
protected $requete_group_by = '';
/** Permet de stocker les limite de la requete SQL (par défaut seul les 100 premiers résultats seront retournés).*/
protected $limite_requete = array('depart' => 0, 'limite' => 100);
protected $distinct = null; // Valeur du paramètre de requete distinct (=0|1)
 
public function consulter($ressources, $parametres) {
return parent::consulter($ressources, $parametres);
}
 
//+----------------FONCTION D'ANALYSE DES PARAMETRES---------------------------------------------------------+
 
public function traiterParametresSpecifiques() {
foreach ($this->parametres as $param => $val) {
switch ($param) {
case 'masque' :
$this->ajouterFiltreMasque('nom_sci', $val);
break;
case 'masque.sg' :
$this->ajouterFiltreMasque('nom_supra_generique', $val);
break;
case 'masque.gen' :
$this->ajouterFiltreMasque('genre', $val);
break;
case 'masque.sp' :
$this->ajouterFiltreMasque('epithete_sp', $val);
break;
case 'masque.ssp' :
$this->ajouterFiltreMasque('epithete_infra_sp',$val);
break;
case 'masque.au' :
$this->ajouterFiltreMasque('auteur', $val);
break;
case 'masque.an' :
$this->ajouterFiltreMasque('annee', $val);
break;
case 'masque.bib' :
$this->ajouterFiltreMasque('biblio_origine',$val);
break;
case 'masque.ad' :
$this->ajouterFiltreMasque('nom_addendum', $val);
break;
case 'masque.nn' :
$this->requete_condition []= 'num_nom IN ('.$val.')';
$this->masque['num_nom'] = "num_nom=$val";
break;
case 'masque.nt' :
$this->requete_condition []= 'num_taxonomique IN ('.$val.')';
$this->masque['num_tax'] = "num_taxonomique=$val";
break;
case 'masque.rg' :
$this->ajouterFiltreMasque('rang', $val);
break;
case 'retour.champs' :
$this->verifierParamChamps($param, $val);
break;
case 'distinct' :
$this->ajouterNomDistinct($val);
break;
case 'masque.fam' :
$this->ajouterFiltreMasque('famille', $val);
break;
case 'masque.sto' :
$this->ajouterFiltreMasque('statut_origine', $val);
break;
case 'masque.sti' :
$this->ajouterFiltreMasque('statut_introduction', $val);
break;
case 'masque.stc' :
$this->ajouterFiltreMasque('statut_culture', $val);
break;
case 'masque.and' :
$this->requete_condition []= " annee >= ".$this->getBdd()->proteger($val);
break;
case 'masque.anf' :
$this->requete_condition []= " annee <= ".$this->getBdd()->proteger($val);
break;
case 'masque.prgua' :
$this->ajouterFiltreMasque('presence_Guadeloupe', $val);
break;
case 'masque.prmar' :
$this->ajouterFiltreMasque('presence_Martinique', $val);
break;
case 'masque.prstm' :
$this->ajouterFiltreMasque('presence_Saint_Martin', $val);
break;
case 'masque.prdes' :
$this->ajouterFiltreMasque('presence_La_Desirade', $val);
break;
case 'masque.prstb' :
$this->ajouterFiltreMasque('presence_Saint_Barthelemy', $val);
break;
case 'masque.prmga' :
$this->ajouterFiltreMasque('presence_Marie_Galante', $val);
break;
case 'masque.prsai' :
$this->ajouterFiltreMasque('`presence_Les-Saintes`', $val);
break;
}
}
}
 
public function verifierParamChamps($param, $val) {
$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
$champs_demandes = explode(',', $val);
$champs_verifies = array();
$champs_api = array_flip($this->champs_api);
$champs_supp = array('nom_retenu_complet'=>'num_nom_retenu', 'basionyme_complet'=>'basionyme');
$champs_api = array_merge($champs_api, $champs_supp);
foreach ($champs_demandes as $champ) {
if (array_key_exists($champ, $champs_api)) {
$champs_verifies[] = $champs_api[$champ];
}
}
if (count($champs_verifies) > 0) {
$this->requete_champ .= ', '.implode(',', $champs_verifies);
}
}
 
/** Permet de rajouter à la requete sql le parametre distinct. N'est utilisé qu'avec le format oss */
public function ajouterNomDistinct($distinct) {
if (isset($distinct)) {
if ($distinct == 1 && $this->parametres['retour.format'] == 'oss') {
$this->distinct = ' distinct ';
} elseif ($distinct == 1 && $this->parametres['retour.format'] != 'oss') {
$e = 'Erreur dans votre requête </br> L\'utilisation du paramètre distinct ne se fait que sous
le format oss';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
}
}
}
 
//-----------------FONCTION D'ANALYSE DES RESSOURCES--------------------------------------------------------------------
 
public function traiterRessourcesIdentifiant() {
//on initialise la condition de la requete sql et le format de réponse
$this->requete_condition = array(); //on vide la table dans le cas de plusieurs version
$this->requete_condition[] = 'num_nom = '.$this->getBdd()->proteger($this->ressources[0]);
$this->format_reponse = $this->service.'/id';
if (isset($this->ressources[1]) && !empty($this->ressources[1])) {
if ($this->ressources[1] == 'relations') {
$this->traiterRessourceIdRelations();
} else {
$e = 'Erreur dans votre requête </br> Ressources disponibles : <br/>
<li> noms/#id/relations </li> <li> noms/#id/#champ+#champ </li>
<li> noms/#id/relations/synonymie </li>
<li> noms/#id/relations/homonymie </li>';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
}
} else { // requete de type noms/#id : rajout du nom_sci pour récupérer le format html par la fct mettreAuFormat()
$this->requete_champ = ' *, nom_sci ';
}
}
 
public function traiterRessourceRelations() {
$this->format_reponse .= '/relations';
$projet = $this->ressources[1];
$num_nom = $this->ressources[2];
if (strrpos($num_nom, 'nn.coste') !== false) {
list($p, $nn) = explode('=', $num_nom);
$num_nom = $nn;
}
$champ = "flore_$projet"."_num";
if (isset($this->ressources[3])) {
$type = $this->ressources[3];
if (!in_array($type, array('homonymie', 'synonymie'))) {
$e = "Les types disponibles pour les noms sont homonymie, synonymie";
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
}
}
$this->requete_champ = ' num_nom ';
$this->requete_condition = array();
$this->requete_condition[] = "$champ = ".$this->getBdd()->proteger($num_nom);
}
 
public function traiterRessourceIdRelations() {
$this->format_reponse .= '/relations';
if (isset($this->ressources[2]) && !empty($this->ressources[2])) {
// requete de type noms/#id/relations/#relation
switch ($this->ressources[2]) {
case 'synonymie' :
$this->traiterRessourceIdSynonymie();
break;
case 'homonymie' :
$this->traiterRessourceIdHomonymie();
break;
default :
$e = 'Erreur dans votre requête </br> Ressources disponibles : <br/>
<li> noms/#id/relations </li> <li> noms/#id/relations/synonymie </li>
<li> noms/#id/relations/homonymie </li>';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
break;
}
}
}
 
public function traiterRessourceIdSynonymie() {
// SELECT num_nom, nom_sci, num_nom_retenu, basionyme FROM bdtfx_v2_00 WHERE num_nom = X LIMIT 0,100;
$this->format_reponse .= '/synonymie';
if (strrpos($this->requete_champ, ', basionyme') === false) {
$this->requete_champ .= ', basionyme ';
}
$this->requete_condition[0] = 'num_nom_retenu = '.
'(SELECT num_nom_retenu FROM '.$this->table.' WHERE '.$this->requete_condition[0].')';
}
 
public function traiterRessourceIdHomonymie() {
// SELECT num_nom, nom_sci, num_nom_retenu FROM bdtfx_v2_00 WHERE nom_sci = (SELECT nom_sci FROM bdtfx_v2_00 WHERE num_nom = X);
$this->format_reponse .= '/homonymie';
$this->requete_condition[0] = 'nom_sci = (SELECT nom_sci FROM '.$this->table
.' WHERE '.$this->requete_condition[0].')';
}
 
public function traiterRessourceStatsRangs() {
// SELECT count(*) as nombre, rang FROM bdtfx_v2_00 [WHERE rang = 290] GROUP BY rang ORDER BY rang;
$this->format_reponse .= '/rangs';
$this->requete_champ = 'count(*) as nombre, rang ';
$this->requete_group_by = ' GROUP BY rang ORDER BY rang ';
}
 
public function traiterRessourceStatsAnnees() {
// SELECT count(*) as nombre, annee FROM bdtfx_v2_00 GROUP BY annee ORDER BY annee;
$this->format_reponse .= '/annees';
$this->requete_champ = 'count(*) as nombre, annee ';
$this->requete_condition = null;
$this->requete_group_by = ' GROUP BY annee ORDER BY annee ';
}
 
public function traiterRessourceStatsInitiales() {
// SELECT count(left( nom_sci, 2 )) as nb, rang, left(nom_sci, 2) as lettre GROUP BY rang, left(nom_sci, 2);
$this->format_reponse .= '/initiales';
$this->requete_champ = 'count(left( nom_sci, 2 )) as nb, rang, left(nom_sci, 2) as lettre ';
$this->requete_group_by = ' GROUP BY rang, left(nom_sci, 2)';
}
 
//-----------------------------FONCTIONS DASSEMBLAGE DE LA REQUETE-----------------------------------------------------
 
public function assemblerLaRequete() {
if ( strrpos($this->format_reponse, 'noms/stats/') === false ) {
$this->mettreAuFormat(); //Ds CommunNomsTaxons.php
}
$requete = 'SELECT '.$this->retournerChamps().' '.
"FROM {$this->table} ".
$this->retournerRequeteCondition().' '.
$this->requete_group_by.' '.
$this->retournerOrderBy().' '.
$this->formerRequeteLimite();
return $requete;
}
 
public function retournerChamps() {
$sql = '';
if ($this->distinct) {
$sql .= $this->distinct.' ';
}
if ($this->requete_champ) {
$sql .= $this->requete_champ.' ';
}
 
// Champs "virtuels" pour tier sur l'ensemble des résultats
if (isset($this->parametres['retour.tri'])) {
list($champ, $ordre) = $this->decouperParametreRetourTri();
if ($champ == 'retenu') {
$sql .= ", IF(num_nom = num_nom_retenu, '0', '1') AS nom_retenu_tri ";
}
}
 
return $sql;
}
 
public function decouperParametreRetourTri() {
$tri = array('', '');
if (isset($this->parametres['retour.tri'])) {
if (preg_match('/^(retenu)(?:,(ASC|DESC)|)$/', $this->parametres['retour.tri'], $match))
$tri[0] = $match[1];
$tri[1] = isset($match[2]) ? $match[2] : '';
}
return $tri;
}
 
public function retournerRequeteCondition() {
$condition = '';
if ($this->requete_condition) {
$condition = ' WHERE '.implode(' AND ', $this->requete_condition);
}
return $condition;
}
 
public function retournerOrderBy() {
$orderBy = array();
 
// Tri sur l'ensemble des résultats
if (isset($this->parametres['retour.tri'])) {
list($champ, $ordre) = $this->decouperParametreRetourTri();
if ($champ == 'retenu') {
$orderBy[] = "nom_retenu_tri $ordre";
}
}
// Tri par défaut
if ($this->format_reponse == 'noms') {
$orderBy[] = 'nom_sci ASC';
}
 
$sql = '';
if (count($orderBy) > 0) {
$sql = 'ORDER BY '.implode(', ', $orderBy).' ';
}
return $sql;
}
 
public function formerRequeteLimite() {
if ($this->format_reponse != 'noms' && $this->format_reponse != 'noms/id/relations/synonymie'
&& $this->format_reponse != 'noms/id/relations/homonymie') {
$this->requete_limite = '';
} elseif (($depart = $this->limite_requete['depart']) > ($this->total_resultat = $this->recupererTotalResultat())) {
$this->limite_requete['depart'] =
(($this->total_resultat - $this->limite_requete['limite']) < 0) ? 0 : ($this->total_resultat - $this->limite_requete['limite']);
$this->requete_limite = ' LIMIT '.$this->limite_requete['depart'].', '.$this->limite_requete['limite'];
} else {
$this->requete_limite = ' LIMIT '.$this->limite_requete['depart'].', '.$this->limite_requete['limite'];
}
return $this->requete_limite;
}
 
/** Recupere le nombre total de résultat d'une requete lancée. */
public function recupererTotalResultat() {
$total = null;
$requete = 'SELECT count(*) as nombre FROM '.$this->table.$this->retournerRequeteCondition().$this->requete_group_by;
$res = $this->getBdd()->recuperer($requete);
if ($res) {
$total = $res['nombre'];
} else {
$e = 'Fct recupererTotalResultat() : <br/>Données introuvables dans la base';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE, $e);
}
return $total;
}
 
 
//-------------------FONCTIONS POUR LE FORMATAGE EN JSON----------------------------------------------------------------
 
public function retournerResultatFormate($resultat) {
switch ($this->format_reponse) {
case 'noms/relations' :
$reponse = $this->formaterRelations($resultat[0]);
break;
case 'noms/id' : //ds CommunNomsTaxons
$reponse = $this->formaterId($resultat[0]);
break;
case 'noms/id/relations' :
$reponse = $this->formaterIdRelations($resultat[0]);
break;
case 'noms/id/relations/synonymie' :
$reponse = $this->formaterIdSynonymie($resultat);
break;
case 'noms/id/relations/homonymie' :
$reponse = $this->formaterIdHomonymie($resultat);
break;
case 'noms/stats/annees' : //ds CommunNomsTaxons
$reponse = $this->formaterStatsAnnee($resultat);
break;
case 'noms/stats/rangs' : //ds CommunNomsTaxons
$reponse = $this->formaterStatsRang($resultat);
break;
case 'noms/stats/initiales' : //ds CommunNomsTaxons
$reponse = $this->formaterStatsInitiales($resultat);
break;
case 'noms' :
$reponse = $this->formaterNoms($resultat);
break;
}
return $reponse;
}
 
//+---------------------concerne les resultats pour des requetes de type noms/id-----------------------------+
 
public function formaterRelations($resultat) {
$num_nom = $resultat['num_nom'];
if (isset($this->ressources[3])) {
$url = Config::get('url_service').$this->service."/$num_nom/relations";
} else {
$type = $this->ressources[3];
$url = Config::get('url_service')."/$this->service/$num_nom/relations/$type";
}
$res = $this->consulterHref($url);
return $res;
}
 
public function formaterIdRelations($resultat) {
$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
$this->resultat_req = $resultat;
$retour_id_rel = array ('entete' => array()); //on initialise pr que l'entete apparaisse en premier lors de l'affichage
 
//on recupère le resultat de chaque relation (appel du WS correspondant)
$homonymes = $this->ajouterRelations('homonymie');
if (isset($homonymes)) $retour_id_rel['resultat']['homonymes'] = $homonymes;
$synonymes = $this->ajouterRelations('synonymie');
if (isset($synonymes)) $retour_id_rel['resultat']['synonymes'] = $synonymes;
 
//on renvoit null si il n'existe aucune relations (on efface l'entete en premier lieu)
if (!isset($retour_id_rel['resultat'])) {
$retour_id_rel = null;
} else { //on rajoute l'entete si des relations existent
$this->afficherDonnees('num_nom', $this->ressources[0]);
$retour_id_rel['entete'] = $this->table_retour;
$this->table_retour = array();
}
return $retour_id_rel;
}
 
/**
* Recupere les relations (type de la relation passée en paramètres :[type_relation] = synonymie, homonymie ou
* ) par l'appel du web service [version]/noms/#id/relations/[type_relation]
*/
public function ajouterRelations($relation) {
$version = str_replace(Config::get('bdd_table').'_', '', $this->table);
$res = null;
$parametres_url = '';
if ($this->parametres != array()) $parametres_url = '?'.http_build_query($this->parametres, '', '&');
$url = Config::get('url_service').'/'.$this->service.'/'.
$this->ressources[0].'/relations/'.
$relation.$parametres_url;
 
$relation = $this->consulterHref($url);
 
$res = $relation->resultat;
return $res;
}
 
 
public function formaterIdSynonymie($resultat) {
$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
$retour_id_syn = array();
if ($resultat[0]['num_nom_retenu'] == '') {
$retour_id_syn[] = 'nom_retenu N.D.';
} elseif (count($resultat) != 1) {
//on remplit d'abord l'entete du resultat
$this->table_retour['id'] = $this->ressources[0];
$this->afficherEnteteResultat('/'.$this->service.'/'.$this->ressources[0].'/relations/synonymie');
$retour_id_syn['entete'] = $this->table_retour;
$this->table_retour = array();
foreach ($resultat as $tab) {
//pour chaque basionyme, on recupère le résultat : num_nom, nom_sci, basionyme et num_nom_retenu :
$this->resultat_req = $tab;
$num = $tab['num_nom'];
$this->afficherNomHrefRetenu($tab, $num);
$this->afficherDonnees('basionyme', $tab['basionyme']);
$retour_id_syn['resultat'][$num] = $this->table_retour;
$this->table_retour = array();
}
if (!isset($retour_id_syn['resultat']) && !in_array('nom_retenu N.D.', $retour_id_syn)) {
$retour_id_syn = null; //on initialise le resultat à null
}
}
return $retour_id_syn;
}
 
public function formaterIdHomonymie($resultat) {
$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
if (count($resultat) != 1) {
$this->table_retour['id'] = $this->ressources[0];
$this->afficherEnteteResultat($resultat, '/'.$this->service.'/'.$this->ressources[0].'/relations/homonymie');
$retour_id_hom['entete'] = $this->table_retour;
$this->table_retour = array();
foreach ($resultat as $homonyme) {
$this->resultat_req = $homonyme;
$id = $homonyme['num_nom'];
$this->afficherDonnees('num_nom', $id);
if ($homonyme['num_nom_retenu'] != '') {
$retenu = ($id == $homonyme['num_nom_retenu']) ? 'true' : 'false';
} else {
$retenu = 'absent';
}
$this->table_retour['retenu'] = $retenu;
$retour_id_hom['resultat'][$id] = $this->table_retour;
unset($retour_id_hom['resultat'][$id]['id']);
$this->table_retour = array();
}
} else {
$retour_id_hom = null;
}
return $retour_id_hom;
}
 
public function obtenirSynonymesParNumNomAvecInfosFlore($num_nom, $version='1_02') {
 
$champs_flore = 'flore_bonnier_num, flore_bonnier_rem,'.
'flore_cnrs_num, flore_cnrs_rem '.
'flore_fe_num, flore_fe_rem '.
'flore_coste_num, flore_coste_rem '.
'flore_fh_num, flore_fh_rem '.
'flore_fournier_num, flore_fournier_rem';
 
$requete = 'SELECT num_nom, nom_sci, '.$champs_flore.' '.
'FROM '.$this->table.' '.
'WHERE num_nom_retenu = '.
'('.
'SELECT num_nom_retenu FROM '.$this->table.' WHERE num_nom = "'.$num_nom.'"'.
')';
 
return $this->getBdd()->recupererTous($requete);
}
 
//+---------------------concerne les resultats pour des requetes de type /noms avec ou sans paramètres-------+
 
public function formaterNoms($resultat) {
if ($this->parametres['retour.format'] == 'oss') {
$reponse = $this->formaterEnOss($resultat); //Ds CommunNomsTaxons.php
} else {
$reponse = $this->formaterEnJsonMax($resultat);
}
return $reponse;
}
 
public function formaterEnJsonMax($resultat) {
$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
 
// TODO : améliorer le tri des résultats
// ATTENTION : ce comportement est étrange
$masque = $this->recupererMasquePrincipal();
if (isset($masque) && !isset($this->parametres['retour.tri'])) {
// fonction du pauvre pour palier aux "." remplacés accidentellement par des "_"
$index = str_replace('masque_','masque.',$masque[0]);
//$resultat = $this->trierRechercheFloue($this->parametres[$index], $resultat, $masque[1]);
}
 
$table_retour_json['entete'] = $this->remplirJsonEntete();
$table_retour_json['resultat'] = $this->remplirJsonResultat($resultat);
return $table_retour_json;
}
 
public function remplirJsonResultat($resultat) {
$champs = null;
if (array_key_exists('retour.champs', $this->parametres)) {
$champs = explode(',', $this->parametres['retour.champs']);
}
 
$noms = array();
foreach ($resultat as $tab) {
$this->table_retour = array();
$num = $tab['num_nom'];
$this->afficherNomHrefRetenu($tab, $num); // ajoute le nom_sci, href et si le nom est retenu dans $this->table_retour
$retour = $this->table_retour;
$this->table_retour = array();
if ($champs != null) {
$reponse_id = $this->formaterId($tab);
$this->table_retour = array();
$this->ajouterChampsPersonnalises($champs, $reponse_id);
$retour = array_merge($retour, $this->table_retour);
}
$noms[$num] = $retour;
}
 
return $noms;
}
 
public function remplirJsonEntete() {
$entete = array();
if (isset($this->masque)) {
$this->table_retour['masque'] = implode('&', $this->masque);
}
parent::afficherEnteteResultat('/'.$this->service);
return $this->table_retour;
}
}
?>
/tags/v5.0-agropyraie-20130830/services/modules/0.1/isfan/Taxons.php
New file
0,0 → 1,520
<?php
 
// declare(encoding='UTF-8');// ou ISO-8859-15
/**
* Description :
* Classe Taxons.php permettant de fournir des informations sur les noms scientifiques retenu.
* Si l'url finit par /taxons on retourne une liste de noms latin et leurs identifiants (seulement les 100 premeiers noms par défaut).
* L'url peut contenir des paramètres optionnels passés après le ? : /taxons?param1=val1&param2=val2&...
*
* Les paramètres de requête disponibles sont : masque, recherche, rang, distinct, retour.format, nl.format,
* nl.structure, navigation.depart et navigation.limite.
*
* Encodage en entrée : utf8
* Encodage en sortie : utf8
* @package framework-v3
* @author Jennifer Dhé <jennifer.dhe@tela-botanica.org>
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
* @version 1.0
* @copyright 1999-${year} Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
*/
 
 
class Taxons extends CommunNomsTaxons {
/** Permet de stocker la requete formulée taxons | taxons/#id | taxons/#id/#champ+#champ ...*/
protected $format_reponse = 'taxons';
protected $service = 'taxons';
protected $requete_champ = 'num_nom, nom_sci, num_nom_retenu, num_taxonomique, rang ';
protected $requete_condition = null;
protected $requete_group_by = ' ';
/** Permet de stocker les limite de la requete SQL (par défaut seul les 100 premiers résultats seront retournés).*/
protected $limite_requete = array('depart' => 0, 'limite' => 100);
protected $num_nom_taxon; //Stocke le num_nom du nom retenu du num_nom recherché
protected $presence_num_tax = true;
public function consulter($ressources, $parametres) {
return parent::consulter($ressources, $parametres);
}
public function traiterParametresSpecifiques() {
$this->requete_condition[] = 'num_nom = num_nom_retenu';
foreach ($this->parametres as $param => $val) {
switch ($param) {
case 'masque' :
$this->ajouterFiltreMasque('nom_sci', $val);
break;
case 'masque.nt' :
$this->requete_condition[] = "num_taxonomique IN ($val)";
$this->masque[] = "num_taxonomique=$val";
break;
case 'masque.rg':
$this->requete_condition[] = 'rang = '.$this->getBdd()->proteger($val);
$this->masque[] = "rang=$val";
break;
}
}
}
//------------------------------------------Fonction ressources---------------------------------------------------------------------
public function gererNumTax() {
if (!in_array('num_taxonomique', $this->champs_table)) {
$this->presence_num_tax = false;
$this->requete_champ = str_replace(', num_taxonomique ', '', $this->requete_champ);
} else {
$this->presence_num_tax = true;
}
}
public function traiterRessourcesIdentifiant() {
$this->format_reponse = 'taxons/id';
$this->traiterRessourceNtId();
$this->num_nom_taxon = $this->recupererNumNomTaxon(); //on recupere le taxon correspondant au num_nom recherché
if ($this->entete_http == '') {
$this->requete_condition[0] = 'num_nom = '.$this->getBdd()->proteger($this->num_nom_taxon);
if (isset($this->ressources[1]) && !empty($this->ressources[1])) {
//---------------- requete de type taxons/#id/#champ+#champ--------------------------------------
if ($this->ressources[1] != 'relations') { // SELECT *, nom_sci FROM bftfx_v2_00 WHERE num_nom = X;
$this->requete_champ = ' *, nom_sci ';
$this->format_reponse .= '/champ';
//---------------- requete de type taxons/#id/relations/#relation--------------------------------
} elseif ($this->ressources[1] == 'relations') {
$this->traiterRessourceIdRelations();
} else {
$e = 'Erreur dans votre requête </br> Ressources disponibles : <br/>
<li> #id/relations </li> <li> #id/#champ+#champ </li> <li> #id/relations </li>
<li> #id/relations/inferieurs </li> <li> #id/relations/superieurs </li>';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
}
} else { //--------------- requete de type taxons/#id-----------------------------------------------------
$this->requete_champ = ' *, nom_sci ';
}
}
}
public function traiterRessourceNtId() {
if (strrpos($this->ressources[0], 'nt:') !== false) {
if ($this->presence_num_tax) {
// SELECT num_nom FROM bdtfx_v2_00 WHERE num_nom = num_nom_retenu AND num_taxonomique = X;
$this->requete_condition[0] = ' num_taxonomique = '
.str_replace('nt:', '', $this->ressources[0]).' ';
} else {
$e = 'Erreur dans votre requête : </br> Le numéro taxonomique n\'existe pas dans ce projet';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
}
} else {
// SELECT num_nom FROM bdtfx_v2_00 WHERE num_nom = (SELECT num_nom_retenu FROM bdtfx_v2_00 WHERE num_nom = X);
$this->requete_condition[0] = 'num_nom = '.$this->ressources[0];
}
}
/** Permet de récupérer le num_nom du taxon recherché. Soit le numéro taxonomique est demandé (avec nt: )
* soit un num_nom dont on recherche le num_nom_retenu */
public function recupererNumNomTaxon() {
$identifiant = '';
if ($this->entete_http == '') {
//on récupere l'identifiant du taxon correspondant au num_nom ou num_taxonomique demandé pour pouvoir l'afficher
$req_tax = 'SELECT num_nom_retenu FROM '.$this->table.' WHERE '.$this->requete_condition[0];
$res_tax = $this->getBdd()->recuperer($req_tax);
//on recherche ensuite les identifiants des taxons supérieurs ou inférieurs
if ($res_tax && $res_tax != '') {
$identifiant = $res_tax['num_nom_retenu'];
} else {
$e = 'Le numéro de taxon ou l\'identifiant de nom correspondant au num_nom '
.$this->ressources[0].' n\'existe pas dans la base.';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE, $e);
Debug::printr($req_tax);
}
}
return $identifiant;
}
public function traiterRessourceIdRelations() {
//----------------- requete de type taxons/#id/relations-------------------------------------------
// SELECT *, nom_sci FROM bftfx_v2_00 WHERE num_nom = X;
$this->format_reponse .= '/relations';
if (isset($this->ressources[2]) && !empty($this->ressources[2])) {
//------------- requete de type taxons/#id/relations/#relation--------------------------------
switch ($this->ressources[2]) {
case 'superieurs' :
$rel = 'recupererIdSup';
$this->format_reponse .= '/superieurs';
$this->traiterRessourceIdRelationInfSup($rel);
break;
case 'inferieurs' :
$rel = 'recupererIdInf';
$this->format_reponse .= '/inferieurs';
$this->traiterRessourceIdRelationInfSup($rel);
break;
case 'hierarchie' :
$rel = 'recupererIdHierarchie';
$this->format_reponse .= '/hierarchie';
$this->traiterRessourceIdRelationHierarchie($rel);
break;
default :
$e = 'Erreur dans votre requête </br> Ressources disponibles : <br/>
<li> taxons/#id/relations </li><li> #id/relations/inferieurs </li>
<li> #id/relations/superieurs </li>';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
break;
}
}
}
public function traiterRessourceIdRelationHierarchie($rel) {
//Appel de la fct récupérerIdSup ou recupererIdInf : retourne les num_nom des noms inferieurs ou superieurs
$res_relation = $this->$rel();
//analyse du résultat retourné par la requete de recherche des identifiants correspondant aux taxons inf|sup :
if ($res_relation == '') {
//dans le cas ou la requete comporte des erreurs
$e = 'Fct traiterRessourceIdRelationInfSup : La requête forme comporte une erreur!';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE, $e);
} elseif ($res_relation) {
//dans le cas ou une ou plusieurs relations est retournée, on récupère les identifiants ss la forme (id, id, id)
foreach ($res_relation as $ligne) $res[] = $ligne['num_nom'];
$res = implode(',',$res);
$this->requete_condition[0] = "num_nom IN ($res)";
$this->requete_champ .= ', rang, num_tax_sup ';
} else { //dans le cas ou aucune relation n'existe
$res = array($this->num_nom_taxon => null);
$this->corps_http = json_encode($res);
$this->entete_http = RestServeur::HTTP_CODE_OK;
}
}
public function recupererIdHierarchie() {
$req_relation = 'SELECT num_nom FROM '.$this->table.' '.
' WHERE hierarchie LIKE CONCAT('.
'(SELECT hierarchie FROM '.
$this->table.' '.
'WHERE num_nom = '.$this->getBdd()->proteger($this->num_nom_taxon).')'.
', '.$this->getBdd()->proteger($this->num_nom_taxon.'-%').
')';
$res_relation = $this->getBdd()->recupererTous($req_relation);
return $res_relation;
}
public function traiterRessourceIdRelationInfSup($rel) {
//Appel de la fct récupérerIdSup ou recupererIdInf : retourne les num_nom des noms inferieurs ou superieurs
$res_relation = $this->$rel();
//analyse du résultat retourné par la requete de recherche des identifiants correspondant aux taxons inf|sup :
if ($res_relation == '') { //dans le cas ou la requete comporte des erreurs
$e = 'Fct traiterRessourceIdRelationInfSup : La requête forme comporte une erreur!';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE, $e);
} elseif ($res_relation) {
//dans le cas ou une ou plusieurs relations est retournée, on récupère les identifiants ss la forme (id, id, id)
foreach ($res_relation as $ligne) $res[] = $ligne['num_nom'];
$res = implode(',',$res);
$this->requete_condition[0] = "num_nom IN ($res)";
$this->requete_champ .= ', rang, num_tax_sup ';
} else { //dans le cas ou aucune relation n'existe
$res = array($this->num_nom_taxon => null);
$this->corps_http = json_encode($res);
$this->entete_http = RestServeur::HTTP_CODE_OK;
}
}
public function recupererIdInf() {
//SELECT num_nom FROM bfdtx_v2_00 WHERE num_tax_sup = (SELECT num_nom FROM bdtfx_v2_00 WHERE num_nom = X);
$req_relation = 'SELECT num_nom FROM '.$this->table
.' WHERE num_tax_sup = (SELECT num_nom FROM '
.$this->table
.' WHERE '.implode(' AND ', $this->requete_condition).')';
$res_relation = $this->getBdd()->recupererTous($req_relation);
return $res_relation;
}
public function recupererIdSup() {
//SELECT num_nom FROM bfdtx_v2_00 WHERE num_nom = (SELECT num_tax_sup FROM bdtfx_v2_00 WHERE num_nom = X);
$req_relation = 'SELECT num_tax_sup as num_nom FROM '.$this->table
.' WHERE '.implode(' AND ', $this->requete_condition);
$res_relation = $this->getBdd()->recupererTous($req_relation);
return $res_relation;
}
 
public function traiterRessourceStatsInitiales() {
// SELECT count(nom_sci) as nb, rang, left(nom_sci, 2) as lettre FROM bdtfx_v2_00 GROUP BY rang, left(nom_sci, 2);
$this->format_reponse = 'taxons/stats/initiales';
$this->requete_champ = 'count(nom_sci) as nb, rang, left(nom_sci, 2) as lettre ';
$this->requete_group_by = ' GROUP BY rang, left(nom_sci, 2) ';
}
public function traiterRessourceStatsRangs() {
// SELECT count(*) as nombre, rang FROM bdtfx_v2_00 [WHERE rang = 290] GROUP BY rang ORDER BY rang;
$this->format_reponse = 'taxons/stats/rangs';
$this->requete_champ = 'count(*) as nombre, rang ';
$this->requete_group_by = ' GROUP BY rang ORDER BY rang ';
}
public function traiterRessourceStatsAnnees() {
// SELECT count(*) as nombre, annee FROM bdtfx_v2_00 GROUP BY annee ORDER BY annee;
$this->format_reponse = 'taxons/stats/annees';
$this->requete_champ = 'count(*) as nombre, annee ';
$this->requete_group_by = ' GROUP BY annee ORDER BY annee ';
}
//-----------------------------FONCTIONS DASSEMBLAGE DE LA REQUETE-----------------------------------------------------
public function assemblerLaRequete() {
if ($this->format_reponse != 'taxons/stats/initiales') {
$this->mettreAuFormat(); //on remplace les nom_sci par les nom_sci_html
}
$requete = ' SELECT '.$this->requete_champ.
' FROM '.$this->table
.$this->retournerRequeteCondition()
.$this->requete_group_by
.$this->formerRequeteLimite();
return $requete;
}
public function formerRequeteLimite() {
if ($this->format_reponse != 'taxons' && $this->format_reponse != 'taxons/id/relations/homonymie') {
$this->requete_limite = '';
} elseif (($depart = $this->limite_requete['depart']) > ($this->total_resultat = $this->recupererTotalResultat())) {
$this->limite_requete['depart'] = (($this->total_resultat - $this->limite_requete['limite']) < 0) ? 0 : ($this->total_resultat - $this->limite_requete['limite']);
$this->requete_limite = ' LIMIT '.$this->limite_requete['depart'].', '.$this->limite_requete['limite'];
} else {
$this->requete_limite = ' LIMIT '.$this->limite_requete['depart'].', '.$this->limite_requete['limite'];
}
return $this->requete_limite;
}
public function retournerRequeteCondition() {
$condition = '';
if ($this->requete_condition) {
$condition = ' WHERE '.implode(' AND ', $this->requete_condition);
}
return $condition;
}
public function recupererTotalResultat() {
$requete = 'SELECT count(*) as nombre FROM '.$this->table.$this->retournerRequeteCondition().$this->requete_group_by;
$res = $this->getBdd()->recuperer($requete);
if ($res) {
$total = $res['nombre'];
}
return $total;
}
 
//-------------------------FONCTIONS DE FORMATION DU RESULTAT-----------------------------------------------------------
/** Permet de récupérer le résultat à retourner propre à chaque requete et de l'encoder en json*/
public function retournerResultatFormate($resultat, $version) {
switch ($this->format_reponse) {
case 'taxons/id' ://ds CommunNomsTaxons
$reponse = $this->formaterId($resultat[0]);
break;
case 'taxons/id/champ' ://ds CommunNomsTaxons
$reponse = $this->formaterIdChamp($resultat[0]);
break;
case 'taxons/id/relations' :
$reponse = $this->formaterIdRelations($resultat[0],$version);
break;
case 'taxons/id/relations/superieurs' :
$reponse = $this->formaterIdSuperieur($resultat, $version);
break;
case 'taxons/id/relations/inferieurs' :
$reponse = $this->formaterIdInferieur($resultat);
break;
case 'taxons/id/relations/hierarchie' :
// le formatage de la hiérarchie est identique aux relations inférieures
$reponse = $this->formaterIdInferieur($resultat);
break;
case 'taxons/stats/annees' : //ds CommunNomsTaxons
$reponse = $this->formaterStatsAnnee($resultat);
break;
case 'taxons/stats/rangs' ://ds CommunNomsTaxons
$reponse = $this->formaterStatsRang($resultat);
break;
case 'taxons/stats/initiales' ://ds CommunNomsTaxons
$reponse = $this->formaterStatsInitiales($resultat);
break;
case 'taxons' :
$reponse = $this->formatertaxons($resultat);
break;
}
return $reponse;
}
//----------------------concerne les resultats pour des requetes de type /noms avec ou sans paramètres--------------
public function formaterTaxons($resultat) {
if ($this->parametres['retour.format'] == 'oss') {
$reponse = $this->formaterEnOss($resultat);
} else {
$reponse = $this->formaterEnJsonMax($resultat);
}
return $reponse;
}
public function formaterEnJsonMax($resultat) {
//print_r($resultat);
$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
$masque = $this->recupererMasquePrincipal();
if (isset($masque)) $resultat = $this->trierRechercheFloue($this->parametres[$masque[0]], $resultat, $masque[1]);
if (isset($this->masque)) $this->table_retour['masque'] = implode('&', $this->masque);
$this->afficherEnteteResultat('/'.$this->service);
$table_retour_json['entete'] = $this->table_retour;
$this->table_retour = array();
//on remplit la table $table_retour_json['resultat']
$tab_tax_inf = $this->recupererListeTaxonInf($resultat);
foreach ($resultat as $tab) {
$num = $tab['num_nom'];
if (isset($this->parametres['masque.nt'])) $this->afficherDonnees('num_taxonomique', $tab['num_taxonomique']);
$this->afficherNomHrefRetenu($tab, $num);
$this->afficherTaxonInfNb($num, $tab_tax_inf);
$resultat_json[$num] = $this->table_retour;
$this->table_retour = array(); //on vide le tableau table_retour
}
$table_retour_json['resultat'] = $resultat_json;
return $table_retour_json;
}
//--------------------concerne les resultats pour des requetes de type noms/id----------------------------------------
 
public function formaterIdRelations($resultat, $version) {
$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
$this->resultat_req = $resultat;
$retour_id_rel = array ('entete' => array()); //on initialise pr que l'entete apparaisse en premier
 
$superieurs = $this->ajouterRelations('superieurs'); //, $version);
if (isset($superieurs)) $retour_id_rel['resultat']['superieurs'] = $superieurs;
$inferieurs = $this->ajouterRelations('inferieurs', $version);
if (isset($inferieurs)) $retour_id_rel['resultat']['inferieurs'] = $inferieurs;
if (!isset($retour_id_rel['resultat'])) { //on renvoit un tableau null si il n'existe aucune relations
$retour_id_rel = 'null';
} else { //on rajoute l'entete si des relations existent
$this->afficherDonnees('num_nom', $this->num_nom_taxon); //$this->afficherEnteteResultat($resultat, '/'.$this->service.'/'.$this->ressources[0].'/relations/synonymie');
$retour_id_rel['entete'] = $this->table_retour;
$this->table_retour = array();
}
return $retour_id_rel;
}
public function ajouterRelations($relation, $version) {
$version = str_replace(Config::get('bdd_table').'_', '', $version);
$res = null;
$taxon = $this->num_nom_taxon;
$parametres_url = '';
if ($this->parametres != array()) $parametres_url = '?'.http_build_query($this->parametres, '', '&');
$url = Config::get('url_service').'/'
.$this->service.'/'.$version.'/'
.$this->ressources[0].'/relations/'
.$relation.$parametres_url;
$relation = $this->consulterHref($url);
if (isset($relation->resultat)) {
$res = $relation->resultat;
} elseif (isset($relation->$taxon)) { //pour les relations inf et sup
$res = $relation->$taxon;
}
return $res;
}
public function formaterIdSuperieur($resultat, $version) {
$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
$tab_relation = null; //si il n'existe aucune relation
$taxon_sup_traites = array();
if (($resultat) != '' ) {
//on recupere d'abord les rangs supérieurs
$sup = $resultat[0];
do {
$sup = $this->recupererIdSuperieur($sup['num_tax_sup'], $version);
if(!in_array($sup['num_nom'], $taxon_sup_traites)) {
$taxon_sup_traites[] = $sup['num_nom'];
} else {
$sup = null;
}
if ($sup['rang'] == '0') $sup['rang'] = '10'; //erreur dans la base
if (isset($sup)) $resultat[] = $sup;
} while ($sup != null);
krsort($resultat);
//on les affiche ensuite
foreach ($resultat as $tab) {
$this->resultat_req = $tab;
$num = $tab['num_nom'];
$this->afficherNomHrefRetenu($tab, $num);
$this->afficherDonnees('rang', $tab['rang']);
$tab_inf[$num] = $this->table_retour;
$tab_inf[$num]['num_nom'] = $tab['num_nom'];
$this->table_retour = array();
}
$tab_relation[$this->num_nom_taxon] = $tab_inf;
}
return $tab_relation;
}
public function recupererIdSuperieur($id, $version) {
$req = 'SELECT num_nom, num_nom_retenu, num_tax_sup, rang, nom_sci FROM '
.$version.' WHERE num_nom = '.$this->getBdd()->proteger($id);
$res = $this->getBdd()->recupererTous($req);
if ($res) {
$resultat = $res[0];
} else {
$resultat = null; //on return null si il n'y a pas de taxon superieur
}
return $resultat;
}
public function formaterIdInferieur($resultat) {
// Attention à l'ordre, on doit d'abord récupérer correpondance_champs avant champs_api
$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
$tab_relation = null;
if (($resultat) != array()) {
foreach ($resultat as $tab) {
$this->resultat_req = $tab;
$num = $tab['num_nom'];
$this->afficherNomHrefRetenu($tab, $num);
$this->afficherDonnees('rang', $tab['rang']);
$tab_inf[$num] = $this->table_retour;
$tab_inf[$num]['nom_sci'] = $tab['nom_sci'];
$tab_inf[$num]['num_nom'] = $tab['num_nom'];
$this->table_retour = array();
}
$tab_relation[$this->num_nom_taxon] = $tab_inf;
}
return $tab_relation;
}
public function afficherTaxonInfNb($num, $tab_tax_inf) {
foreach ($tab_tax_inf as $taxNb) {
if ($taxNb['num_tax_sup'] == $num) {
$this->table_retour['taxon_inferieur_nbre'] = $taxNb['nb'];
}
}
if (!isset($this->table_retour['taxon_inferieur_nbre'])) {
$this->table_retour['taxon_inferieur_nbre'] = '0';
}
}
public function recupererListeTaxonInf($resultat) {
// SELECT num_tax_sup, count(*) as nb FROM bdtfx_v2_00 WHERE num_tax_sup IN (id, id, id) AND num_nom = num_nom_retenu GROUP BY num_tax_sup';
foreach ($resultat as $tab) {
$tab_num[] = $tab['num_nom']; //on regroupe ici les id des taxons dont on cherche le nb de taxon inf
}
$req = 'SELECT num_tax_sup, count(*) as nb FROM '.$this->table
.' WHERE num_tax_sup IN ('.implode(',',$tab_num)
.') AND num_nom = num_nom_retenu GROUP BY num_tax_sup';
$res = $this->getBdd()->recupererTous($req);
if ($res) {
$resultat = $res;
} else {
$resultat = array(); //on retourne un tableau vide s'il n'y a pas de taxon inférieurs
}
return $resultat;
}
}
 
?>
/tags/v5.0-agropyraie-20130830/services/modules/0.1/isfan/CommunNomsTaxons.php
New file
0,0 → 1,922
<?php
// declare(encoding='UTF-8');
/**
* Description :
* Classe CommunNomsTaxons.php
* Encodage en entrée : utf8
* Encodage en sortie : utf8
* @package framework-v3
* @author Jennifer Dhé <jennifer.dhe@tela-botanica.org>
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
* @version 1.0
* @copyright 1999-2011 Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
*/
 
 
abstract class CommunNomsTaxons extends Commun {
 
/** Tableau de correspondance entre les noms des champs et les codes de l'ontologie.*/
private $relationsChampsCodesOntologie = null;
protected $table_retour; //Permet de stocker le tableau de résultat (non encodé en json)
protected $resultat_req; // Permet de stocker le résultat de la requete principale.
protected $compo_nom = null; //Stocke sous forme de tableau les composant du nom à ajouter au nom scientifique
protected $table;// Nom de la table dans laquelle on récupèrera les données dans les requetes SQL
protected $total_resultat = null;
/** Stocke le service appelé correspondant. Est utilisé principalement lors de l'affichage du href d'un synonyme
(ex id=12, basionyme num 25 est un synonyme) dans le service taxon */
protected $service_href = null;
protected $erreursParametres = null;
protected $sans_nom_sci = array('gen','sp','ssp','fam','au_ss','bib_ss');
private $bib_traitees = array();
private $ontologie = array();
 
//+------------------------------- PARAMÈTRES ---------------------------------------------------------------+
 
public function traiterParametres() {
$this->definirParametresParDefaut();
$this->verifierParametres();
 
if (isset($this->parametres) && count($this->parametres) > 0) {
foreach ($this->parametres as $param => $val) {
switch ($param) {
case 'ns.structure' :
$this->remplirTableCompositionNom($val);
if (in_array($val,$this->sans_nom_sci)){
$this->requete_champ = implode(', ',$this->compo_nom);
}else {
$this->requete_champ .= ' ,'.implode(', ',$this->compo_nom);
}
break;
case 'navigation.depart' :
$this->limite_requete['depart'] = $val;
break;
case 'navigation.limite' :
$this->limite_requete['limite'] = $val;
break;
}
}
$this->traiterParametresSpecifiques();
}
}
 
protected function definirParametresParDefaut() {
if (empty($this->parametres['recherche'])) {
$this->parametres['recherche'] = 'stricte';
}
if (empty($this->parametres['ns.format'])) {
$this->parametres['ns.format'] = 'txt';
}
if (empty($this->parametres['retour.format'])) {
$this->parametres['retour.format'] = 'max';
}
if (empty($this->parametres['ns.structure']) &&
$this->parametres['retour.format'] != 'oss') {
$this->parametres['ns.structure'] = 'au,an,bib';
}
}
 
 
public function verifierParametres() {
//$this->verifierParametresAPI();
 
$this->verifierParametre('recherche', 'stricte|floue|etendue|complete');
$this->verifierParametre('ns.format', 'htm|txt');
$this->verifierParametre('retour.format', 'min|max|oss|perso');
$this->verifierParametreAvecValeurMultipe('ns.structure', 'an|au|bib|ad|gen|sp|ssp|fam|au_ss|bib_ss');
 
/*if (count($this->erreursParametres) > 0) {
$m = 'Erreur dans votre requête : '.implode('<br/>', $this->erreursParametres);
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $m);
}*/
}
 
public function verifierParametresAPI() {
$parametresApi = $this->recupererTableauConfig('parametresAPI');
while (!is_null($parametre = key($this->parametres))) {
if (!in_array($parametre, $parametresApi)) {
$this->erreursParametres[] = "Le paramètre '$parametre' n'est pas pris en compte par cette version de l'API.";
}
next($this->parametres);
}
}
 
public function verifierParametre($parametre, $valeursPermises) {
if (isset($this->parametres[$parametre]) && !empty($this->parametres[$parametre])) {
$valeur = $this->parametres[$parametre];
$this->verifierValeursPermises($parametre, $valeur, $valeursPermises);
}
}
 
public function verifierParametreAvecValeurMultipe($parametre, $valeursPermises) {
if (isset($this->parametres[$parametre]) && !empty($this->parametres[$parametre])) {
$valeursConcatenees = $this->parametres[$parametre];
$valeurs = explode(',', $valeursConcatenees);
foreach ($valeurs as $valeur) {
$this->verifierValeursPermises($parametre, $valeur, $valeursPermises);
}
}
}
 
private function verifierValeursPermises($parametre, $valeur, $valeursPermises) {
if (!in_array($valeur, explode('|', $valeursPermises))) {
$this->erreursParametres[] = "Le paramètre '$parametre' ne peut pas prendre la valeur '$valeur'. Valeurs permises : $valeursPermises";
}
}
 
public function traiterParametresCommuns() {
 
}
 
public function ajouterFiltreMasque($nom_champ, $valeur) {
$valeur = explode(',',$valeur);
$conditions = array();
if ($nom_champ == 'annee' || $nom_champ == 'rang') {
foreach ($valeur as $val) {
$conditions[] = "$nom_champ = ".$this->getBdd()->proteger($val);
}
} else {
if ($this->parametres['recherche'] == 'etendue') {
foreach ($valeur as $val) {
$val = $this->modifierValeur($val);
$conditions[] = "$nom_champ LIKE ".$this->getBdd()->proteger($val);
}
 
} elseif ($this->parametres['recherche'] == 'floue') {
foreach ($valeur as $val) {
$val = $this->getBdd()->proteger($val);
$conditions[] = "( SOUNDEX($nom_champ) = SOUNDEX($val))".
" OR ( SOUNDEX(REVERSE($nom_champ)) = SOUNDEX(REVERSE($val)))";
}
} else {
foreach ($valeur as $val) {
$conditions[] = "$nom_champ LIKE ".$this->getBdd()->proteger($val);
}
}
}
$this->requete_condition[]= '('.implode(' OR ', $conditions ).')';
$this->masque[$nom_champ] = $nom_champ.'='.implode(',',$valeur);
}
 
private function modifierValeur($valeur) {
$valeur = $this->remplacerCaractereHybrideEtChimere($valeur);
$valeur = $this->preparerChainePourRechercheEtendue($valeur);
return $valeur;
}
 
private function remplacerCaractereHybrideEtChimere($valeur) {
$caracteres = array('×', '%D7', '+', '%2B');
$remplacements = array('x ','x ', '+', '+');
$valeur = str_replace($caracteres, $remplacements, $valeur);
return $valeur;
}
 
private function preparerChainePourRechercheEtendue($valeur) {
$valeur = str_replace(' ', '% ', trim($valeur));
$valeur = $valeur.'%';
return $valeur;
}
 
//+-------------------------------Fonctions d'analyse des ressources-------------------------------------+
 
private function etreRessourceId() {
$ok = false;
if ($this->estUnIdentifiant() && count($this->ressources) == 1) {
$ok = true;
}
return $ok;
}
 
public function traiterRessources() {
if (isset($this->ressources) && count($this->ressources) > 0) {
if ($this->ressources[0] == 'relations') {
$this->traiterRessourceRelations();
} elseif ($this->estUnIdentifiant()) { //l'identifiant peut etre de type /#id ou /nt:#id
$this->traiterRessourcesIdentifiant(); // dans le service noms ou taxons
} elseif ($this->ressources[0] == 'stats') { //ressource = noms/stats
$this->traiterRessourcesStats();
} else {
$e = 'Erreur dans votre requete </br> Ressources disponibles : <br/>
<li> /'.$this->service.'/#id (id : L\'identifiant du nom rechercher)</li>
<li> /'.$this->service.'/nt:#id (id : Numero du taxon recherche)</li>
<li> /'.$this->service.'/stats </li>';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
}
}
}
 
public function traiterRessourcesStats() {
$this->format_reponse = $this->service.'/stats';
 
$e = "Erreur dans votre requête </br> Ressources disponibles : $this->service/stats/[annees|rangs|initiales]";
if (isset($this->ressources[1]) && !empty($this->ressources[1])) {
switch ($this->ressources[1]) {
case 'annees' :
$this->traiterRessourceStatsAnnees();
break;
case 'rangs' :
$this->traiterRessourceStatsRangs();
break;
case 'initiales' :
$this->traiterRessourceStatsInitiales();
break;
default :
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
break;
}
} else {
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
}
}
 
/** Vérifie si la première valeur de la table de ressource est un identifiant :
* un numerique ou un numéro taxonomique sous la forme nt:xx */
public function estUnIdentifiant() {
return (is_numeric($this->ressources[0]) || (strrpos($this->ressources[0],'nt:') !== false
&& is_numeric(str_replace('nt:','',$this->ressources[0]))));
}
 
//+------------------------------------------------------------------------------------------------------+
// Fonction d'analyse des parametres
 
/** Permet de remplir le tableau compo_nom. Il comprendra en fct du paramètre ns.structure les éléments à rajouter
* au nom_sci (annee, auteur, biblio ou addendum). */
public function remplirTableCompositionNom($valeur) {
$structure_nom = explode(',', $valeur);
foreach ($structure_nom as $structure) {
$structure = trim($structure);
$patterns = array('/^an$/', '/^au$/', '/^bib$/', '/^ad$/', '/^sp$/', '/^gen$/', '/^ssp$/','/^fam$/',
'/^au_ss$/','/^bib_ss$/');
$champs = array('annee', 'auteur', 'biblio_origine', 'nom_addendum', 'epithete_sp', 'genre',
'epithete_infra_sp','famille','auteur', 'biblio_origine');
 
// avec str_replace() 'sp' est inclu dans 'ssp', et la conversion pour 'ssp' est mauvaise
$this->compo_nom[$structure] = preg_replace($patterns, $champs, $structure);
}
}
 
public function mettreAuFormat() {
if ($this->parametres['ns.format'] == 'htm') {
if (strrpos($this->requete_champ, 'nom_sci_html as nom_sci') === false) {
$this->requete_champ = str_replace('nom_sci', 'nom_sci_html as nom_sci', $this->requete_champ);
}
}
}
 
//+------------------------------------------------------------------------------------------------------+
// Fonctions de formatage
 
/** Fonction permettant de creer la table dont le nom est passé en paramètre (champs_api, champs_bdtfx,
* correspondance_champs...). Les données de chaque table sont présentes dans le fichier de configuration config.ini
* @param String $table : Peut contenir plusieurs nom de table dont on souhaite récupérer les données : table,table,table. */
public function recupererTableSignification($table) {
$tables = explode(',', $table);
foreach ($tables as $tab) {
if ($tab == 'champs_comp') {
$champ_bdnff_api = array_keys($this->champs_api); //on recupère le nom des champ ds la bdd
$this->champs_comp = array_diff($this->champs_table, $champ_bdnff_api);
} elseif ($tab == 'champs_api') {
foreach ($this->correspondance_champs as $key => $val) {
preg_match('/(hybride[.]parent_0[12](?:[.]notes)?|nom_sci[.][^.]+|[^.]+)(?:[.](id|code))?/', $val, $match);
$val = $match[1];
$this->champs_api[$key] = $val;
}
} else {
$this->$tab = $this->recupererTableauConfig($tab);
}
}
}
 
public function formaterEnOss($resultat) {
$table_nom = array();
$oss = '';
foreach ($resultat as $tab) {
if (isset($tab['nom_sci']) ) {
if (!in_array($tab['nom_sci'], $table_nom)) {
$table_nom[] = $tab['nom_sci'];
$oss[] = $tab['nom_sci'].' '.$this->ajouterCompositionNom($tab);
}
}else {
$res = $this->ajouterCompositionNom($tab);
if($res) {
$oss[] = $res;
}
}
 
}
 
if (isset($this->masque)) $masque = implode('&', $this->masque);
else $masque = 'Pas de masque';
$table_retour_oss = array($masque, $oss);
return $table_retour_oss;
}
 
public function afficherEnteteResultat($url_service) {
$this->table_retour['depart'] = $this->limite_requete['depart'];
$this->table_retour['limite'] = $this->limite_requete['limite'];
$this->table_retour['total'] = $this->total_resultat;
$url = $this->formulerUrl($this->total_resultat, $url_service);
if (isset($url['precedent']) && $url['precedent'] != '') {
$this->table_retour['href.precedent'] = $url['precedent'];
}
if (isset($url['suivant']) && $url['suivant'] != '') {
$this->table_retour['href.suivant'] = $url['suivant'];
}
}
 
public function afficherNomHrefRetenu($tab, $num) {
$this->resultat_req = $tab;
$this->afficherDonnees('num_nom', $num);
if ($this->parametres['retour.format'] == 'min') { // sinon est affiché ds afficherDonnees(num_nom, $val) ci-dessus
$this->table_retour['nom_sci'] = $tab['nom_sci'];
$this->table_retour['nom_sci_complet'] = $tab['nom_sci'].' '.$this->ajouterCompositionNom($tab);
}
if ($tab['num_nom_retenu'] != '') {
$retenu = ($tab['num_nom_retenu'] == $num) ? 'true' : 'false';
} else {
$retenu = 'absent';
}
$this->table_retour['retenu'] = $retenu;
unset($this->table_retour['id']);
}
 
 
//+------------------------------------------------------------------------------------------------------+
// Fonction de formatage pour les services /#id/
 
public function formaterId($resultat) {
$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
$this->resultat_req = $resultat;
 
foreach ($resultat as $cle => $valeur) {
if ($valeur != '') {
$this->afficherDonnees($cle, $valeur);
}
}
if (isset($this->parametres['retour.champs']) && $this->format_reponse == 'noms/id') {
$retour = $this->table_retour;
$this->table_retour = array();
$champs = explode(',', $this->parametres['retour.champs']);
$this->ajouterChampsPersonnalises($champs, $retour);
}
unset($this->table_retour['href']);
return $this->table_retour;
}
 
public function formaterIdChamp($resultat) {
$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
$reponse_id = $this->formaterId($resultat);
$this->table_retour = array();
$champs = explode(' ', $this->ressources[1]);
$this->ajouterChampsPersonnalises($champs, $reponse_id);
return $this->table_retour;
}
 
protected function ajouterChampsPersonnalises($champs, $reponse_id) {
$champs_a_libeller = array('nom_retenu', 'rang', 'basionyme', 'hybride', 'hybride.parent_01',
'hybride.parent_02', 'presence', 'tax_sup', 'statut_origine', 'statut_culture', 'statut_introduction');
if (! is_null($champs) && is_array($champs) && count($champs) > 0) {
foreach ($champs as $champ) {
if ($this->verifierValiditeChamp($champ)) {
if (strrpos($champ, '.*') !== false) {
$this->afficherPointEtoile($champ, $reponse_id);
} elseif (in_array($champ, $champs_a_libeller)) {
$this->table_retour[$champ.'.libelle'] =
(isset($reponse_id[$champ.'.libelle'])) ? $reponse_id[$champ.'.libelle'] : null;
} else {
$champ = $this->trouverChampBddCorrespondant($champ);
$this->table_retour[$champ] = (isset($reponse_id[$champ])) ? $reponse_id[$champ] : null;
}
}
}
}
}
 
public function afficherPointEtoile($champ, $reponse) {
preg_match('/^([^.]+\.)\*$/', $champ, $match);
if ($match[1] == 'nom_sci') {
$this->afficherNomSciPointEpithete($this->resultat_req);
} else {
foreach ($reponse as $chp => $valeur) {
if (strrpos($chp, $match[1]) !== false) {
if ($valeur != '') {
$this->table_retour[$chp] = $valeur;
} else {
$this->table_retour[$chp] = null;
}
}
}
}
}
 
public function decomposerNomChamp($champ) {
$decomposition = false;
if (preg_match('/^(?:([^.]+\.parent_0[12]|[^.]+))(?:\.(.+))?$/', $champ, $match)) {
$radical_champ = $match[1];
$suffixe = (isset($match[2])) ? $match[2] : "";
$decomposition = array($radical_champ, $suffixe);
}
return $decomposition;
}
 
public function verifierValiditeChamp($champ) {
$decomposition = $this->decomposerNomChamp($champ);
$validite_ressource = true;
if ($decomposition) {
list($radical, $suffixe) = $decomposition;
$champs_complementaire = array('nom_retenu_complet', 'basionyme_complet');
// on verifie si le nom du champ existe bien
if (!$this->estChampApi($radical) && !$this->estChampComplementaire($radical)) {
if (!in_array($radical, $champs_complementaire)) {
$validite_ressource = false;
$e = 'Le champ "'.$radical.'" n\'existe pas dans la base. <br/><br/>';
$this->renvoyerErreur( RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
}
} elseif ($this->estUnPoint($champ)) {
$validite_ressource = $this->verifierValiditeSuffixe($suffixe, $radical);
}
}
return $validite_ressource;
}
 
public function estChampApi($radical_champ) {
$champ_api_ok = false;
if (in_array($radical_champ, $this->champs_api) || in_array($radical_champ, $this->correspondance_champs)) {
$champ_api_ok = true;
}
return $champ_api_ok;
}
 
public function estChampComplementaire($radical_champ) {
$champ_complementaire_ok = in_array($radical_champ, $this->champs_comp) ? true : false;
return $champ_complementaire_ok;
}
 
public function verifierValiditeSuffixe($suffixe, $radical_champ) {
$validite_ressource = true;
if ($this->correspondAUnId($radical_champ) || $radical_champ == 'id') {
$this->verificationSuffixesIdentifiant($suffixe, $radical_champ, $validite_ressource);
} elseif ($this->correspondAUnCode($radical_champ)) {
$this->verificationSuffixesCodes($suffixe, $radical_champ, $validite_ressource);
} elseif ($radical_champ == 'nom_sci') {
if ($suffixe != '*') {
$validite_ressource = false;
$m = 'Erreur : Le suffixe demandé n\'existe pas pour le champ "'.$radical_champ.'".<br/>
Les suffixes possibles sont les suivants : <li> * </li>';
$this->renvoyerErreur( RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $m);
}
} else {
$validite_ressource = false;
$m = 'Erreur : Le paramètre "'.$radical_champ.'" ne peut pas présenter de suffixe. <br/><br/>';
$this->renvoyerErreur( RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $m);
}
return $validite_ressource;
}
 
public function verificationSuffixesCodes(&$suffixe, &$radical_champ, &$validite_ressource ) {
if (!in_array($suffixe, array('*', 'code', 'href', 'details'))) {
$validite_ressource = false;
$e = 'Erreur : Le suffixe demandé n\'existe pas pour le champ "'.$radical_champ.'.<br/> Les suffixes '
.'possibles sont les suivants : <li> .* </li><li> .code </li><li> .href </li><li> .details </li>';
$this->renvoyerErreur( RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
}
}
 
public function verificationSuffixesIdentifiant(&$suffixe, &$radical_champ, &$validite_ressource) {
if ((strrpos($radical_champ, 'parent') !== false && !in_array($suffixe, array('*', 'id', 'href', 'details', 'notes')))
|| !in_array($suffixe, array('*', 'id', 'href', 'details')) && strrpos($radical_champ, 'parent') === false) {
$validite_ressource = false;
$e = 'Erreur : Le suffixe demandé n\'existe pas pour le champ "'.$radical_champ.'".<br/> Les suffixes '
.'possibles sont les suivants : <li> .* </li><li> .id </li><li> .href </li><li> .details </li>'
.'<li> .notes (seulement pour les hybride.parent)';
$this->renvoyerErreur( RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
}
}
 
 
//------------------------------fonction de formatage pour les services /stats/-----------------------------------------
 
public function formaterStatsAnnee($resultat) {
foreach ($resultat as $cle_annee) {
$annee = ($cle_annee['annee'] != '') ? $cle_annee['annee'] : 'ND';
$nb = $cle_annee['nombre'];
$retour_stats_annee[$annee] = $nb;
}
return $retour_stats_annee;
}
 
public function formaterStatsRang($resultat) {
foreach ($resultat as $rangs) {
if ($rangs['rang'] != 0) {
$rang = $rangs['rang'];
if ($this->parametres['retour.format'] == 'max') {
$retour_rang[$rang]['rang'] = $this->ajouterSignificationCode('rang',$rang);
}
$nombre = $rangs['nombre'];
$retour_rang[$rang]['nombre'] = $nombre;
}
}
return $retour_rang;
}
 
public function formaterStatsInitiales($resultat) {
$rang = null;
$table_rang = array();
foreach ($resultat as $tuple) {
if ($tuple['rang'] != 0) {
$this->memoriserRang($table_rang, $tuple, $rang);
if ($tuple['lettre'] == 'x ') {
$this->ajouterHybrideChimere('hybride', $rang, $tuple);
} elseif ($tuple['lettre'] == '+ ') {
$this->ajouterHybrideChimere('chimere', $rang, $tuple);
} else {
$l = substr($tuple['lettre'], 0, 1);
if (isset($this->table_retour[$rang][$l])) {
$this->table_retour[$rang][substr($tuple['lettre'], 0, 1)] += floatval($tuple['nb']);
} else {
$this->table_retour[$rang][substr($tuple['lettre'], 0, 1)] = floatval($tuple['nb']);
}
}
}
}
return $this->table_retour;
}
 
public function memoriserRang(&$table_rang, $tuple, &$rang) {
if (is_array($table_rang)) {
if (!in_array($tuple['rang'], $table_rang)) {
$rang = $tuple['rang'];
$table_rang[] = $rang;
if ($this->parametres['retour.format'] == 'max') {
$rang = $this->ajouterSignificationCode('rang', $rang);
}
}
}
}
 
public function ajouterHybrideChimere($groupe, &$rang, &$tuple) {
if (isset($this->table_retour[$rang][str_replace('hybride', 'hyb', $groupe)])) {
$this->table_retour[$rang][$groupe] += floatval($tuple['nb']);
} else {
$this->table_retour[$rang][$groupe] = floatval($tuple['nb']);
}
}
 
//-----------------------------Fonctions d'affichage utiliser dans les fonctions de formatage---------------------------
 
public function afficherDonnees($champApi, $valeur) {
$champBdd = $this->trouverChampBddCorrespondant($champApi);
if ($this->parametres['retour.format'] == 'min') {
if ($champApi == 'nom_sci') {
$valeur = $valeur.' '.$this->ajouterCompositionNom($this->resultat_req);
}
if ($champApi == 'nom_sci_html') {
$valeur = $valeur.' '.$this->ajouterCompositionNom($this->resultat_req, 'htm');
}
$this->table_retour[$champBdd] = $valeur;
} else {
$this->afficherToutesLesInfos($champBdd, $valeur);
}
}
 
public function trouverChampBddCorrespondant($champApi) {
if (array_key_exists($champApi, $this->champs_api)) {
$champBdd = $this->correspondance_champs[$champApi];
} else {
$champBdd = $champApi;
}
return $champBdd;
}
 
public function afficherToutesLesInfos($nom_champ_api, $valeur) {
if ($this->presentePlusieursId($nom_champ_api, $valeur)) {
preg_match('/^([^.]+\.parent_0[12]|[^.]+)(?:\.id)?$/', $nom_champ_api, $match);
$this->afficherInfosPrecises($match[1], 'details', $valeur);
$this->table_retour[$nom_champ_api] = $valeur;
 
} elseif (strrpos($nom_champ_api, 'parent') !== false && strrpos($nom_champ_api, 'notes') !== false) {
$this->table_retour[$nom_champ_api] = $valeur;
 
} elseif (($this->correspondAUnId($nom_champ_api) || $nom_champ_api == 'id' && $valeur != '0')) {
preg_match('/^([^.]+\.parent_0[12]|[^.]+)(?:\.id)?$/', $nom_champ_api, $match);
$this->afficherInfosPrecises($match[1], 'id,signification,href', $valeur);
 
} elseif ($this->correspondAUnCode($nom_champ_api)) {
preg_match('/^([^.]+)(?:\.code)?$/', $nom_champ_api, $match);
$this->afficherInfosPrecises($match[1], 'code,signification,href', $valeur);
 
} elseif ($nom_champ_api == 'nom_sci_html') {
$this->table_retour['nom_sci_html'] = $valeur;
$this->table_retour['nom_sci_html_complet'] = $valeur.' '.$this->ajouterCompositionNom($this->resultat_req, 'htm');
}elseif ($nom_champ_api != 'nom_sci') {
$this->table_retour[$nom_champ_api] = $valeur;
}
}
 
public function presentePlusieursId($ressource, $valeur = null) {
if ($valeur) {
$presente = strrpos($ressource, 'proparte') !== false && strrpos($valeur, ',') !== false;
} else { //pour la vérification du champ, on ignore alors la valeur de la ressource
$presente = strrpos($ressource, 'proparte') !== false;
}
return $presente;
}
 
public function afficherInfosPrecises($champ, $suffixe, $valeur) {
$suffixes = explode(',', $suffixe);
//on initialise au service appelé. Sera potentiellement modifié dans la fonction afficherSignification()
$this->service_href = $this->service;
foreach ($suffixes as $suffixe) {
switch ($suffixe) {
case 'id' :
$this->table_retour[str_replace('id.id', 'id', $champ.'.id')] = $valeur;
break;
case 'details' :
$this->afficherTableDetails($champ, $valeur);
break;
case 'signification' :
$this->afficherSignification($champ, $valeur);
break;
case 'href' :
$url = $this->creerUrl($champ, $valeur);
$this->table_retour[str_replace('id.href', 'href', $champ.'.href')] = $url;
break;
case 'code' :
$this->table_retour[$champ.'.code'] = $this->obtenirCode($champ, $valeur);
break;
case 'notes' :
$this->table_retour[$champ.'.notes'] = $this->resultat_req[str_replace('.', '_', $champ).'_notes'];
break;
default : break;
}
}
}
 
public function afficherTableDetails($nom_champ_api, $valeur) {
$tab_id = explode(',', $valeur);
$tab_res = $this->table_retour;
$this->table_retour = array();
foreach ($tab_id as $id) {
$this->afficherInfosPrecises($nom_champ_api, 'id,signification,href', $id);
$tab_res[$nom_champ_api.'.details'][] = $this->table_retour;
$this->table_retour = array();
}
$this->table_retour = $tab_res;
}
 
private function obtenirCode($champ, $valeur) {
$code = $this->transformerChampEnCode($champ);
return "bdnt.$code:$valeur";
}
 
private function transformerChampEnCode($champ) {
if (is_null($this->relationsChampsCodesOntologie)) {
$this->relationsChampsCodesOntologie = Outils::recupererTableauConfig('ChampsCodesOntologie');
}
 
$code = $champ;
if (array_key_exists($champ, $this->relationsChampsCodesOntologie)) {
$code = $this->relationsChampsCodesOntologie[$champ];
}
return $code;
}
 
public function creerUrl($champ, $valeur) {
if ($this->correspondAUnId($champ) || $champ == 'id') {
$service = $this->service_href;
$url = $this->ajouterHref($service, $valeur);
} else {
$code = $this->transformerChampEnCode($champ);
$url = $this->ajouterHrefAutreProjet('ontologies', "$code:", $valeur, 'bdnt');
}
return $url;
}
 
public function afficherSignification($champ, $valeur) {
if ($champ == 'id' && isset($this->resultat_req['nom_sci']) && $this->resultat_req['num_nom'] == $valeur) {
//si le nom_sci du num_nom que l'on veut afficher est déjà dans la table de résultat :
$this->table_retour['nom_sci'] = $this->resultat_req['nom_sci'];
$this->table_retour['nom_sci_complet'] = $this->resultat_req['nom_sci'].' '.
$this->ajouterCompositionNom($this->resultat_req);
} elseif ($this->correspondAUnId($champ) || $champ == 'id') {
$nom = $this->recupererNomSci($valeur);
if ($nom != array()) {
$this->table_retour[$champ.'.libelle'] = $nom['nom_sci'];
$this->table_retour[$champ.'_html'] = $nom['nom_sci_html'];
$this->table_retour[$champ.'_complet'] = $nom['nom_sci_complet'];
$this->table_retour[$champ.'_html_complet'] = $nom['nom_sci_complet_html'];
$this->service_href = $nom['service'];
}
} elseif ($this->correspondAUnCode($champ)) {
$this->table_retour[$champ.'.libelle'] = $this->ajouterSignificationCode($champ, $valeur);
}
}
 
/** Permet d'afficher les élements nomenclatural du nom_sci lors de l'appel dans le service noms/id/champ du champ^nom_sci.*/
public function afficherNomSciPointEpithete($resultat) {
$tab_nom_sci = array('nom_supra_generique', 'genre', 'epithete_infra_generique', 'epithete_sp',
'type_epithete', 'epithete_infra_sp', 'cultivar_groupe', 'cultivar', 'nom_commercial');
foreach ($tab_nom_sci as $compo_nom) {
if (isset($resultat[$compo_nom]) && !empty($resultat[$compo_nom])) {
$this->table_retour['nom_sci.'.$compo_nom] = $resultat[$compo_nom];
}
}
}
 
public function ajouterSignificationCode($champ, $valeur) {
if($this->termeOntologieEstEnCache($champ, $valeur)) {
$nom_code = $this->obtenirTermeOntologieParCache($champ, $valeur);
} else {
$code = $this->transformerChampEnCode($champ);
if (preg_match('/^([^_-]+)(?:_|-)([^_-]+)$/', $code, $match)) {
$code = $match[1].ucfirst($match[2]);
}
$url = Config::get('url_ontologie').$code.':'.$valeur.'/nom';
$res = $this->consulterHref($url); //dans commun.php
$nom_code = $valeur;
if (is_object($res)) {
$nom_code = $res->nom;
}
$this->mettreEnCacheOntologie($champ, $valeur, $nom_code);
}
return $nom_code;
}
 
public function recupererNomSci($id) {
$nom = array();
if ($id != 0) {
if ($this->compo_nom == null) {
$req = 'SELECT nom_sci, num_nom_retenu, nom_sci_html FROM '.$this->table.' WHERE num_nom = '.$id;
} else { //on ajoute à la requete sql, les champs de ns.structure
//print_r($this->compo_nom);
$req = 'SELECT nom_sci, num_nom_retenu, nom_sci_html, '.implode(', ', $this->compo_nom)
.' FROM '.$this->table
.' WHERE num_nom = '.$id;
}
if ($this->parametres['ns.format'] == 'htm') {
$req = str_replace('nom_sci', 'nom_sci_html as nom_sci', $req);
}
$res = $this->getBdd()->recuperer($req);
if ($res) {
$nom['nom_sci'] = $res['nom_sci'];
$nom['nom_sci_html'] = $res['nom_sci_html'];
$nom['nom_sci_complet'] = $res['nom_sci'].' '.$this->ajouterCompositionNom($res);
$nom['nom_sci_complet_html'] = $res['nom_sci_html'].' '.$this->ajouterCompositionNom($res, 'htm');
$nom['service'] = ($res['num_nom_retenu'] == $id && $this->service == 'taxons') ? 'taxons' : 'noms';
}
}
return $nom;
}
 
/** Permet de retourner une chaine de caractère composée des parametres du nom (ns.structure : annnée, auteur,
* bibilio et addendum). A ajouter au nom scientifique */
public function ajouterCompositionNom($tab_res, $format = '') {
$format = ($format == '') ? $this->parametres['ns.format'] : $format;
 
$nom = '';
if (isset($this->compo_nom)) {
if ($format == 'htm') {
$format = array(
'au' => '<span class="auteur">%s</span>',
'an' => '[<span class="annee">%s</span>]',
'an_bib' => '[<span class="annee">%s</span>, <span class="biblio">%s</span>]',
'bib' => '[<span class="biblio">%s</span>]',
'ad' => '[<span class="adendum">%s</span>]');
} else {
$format = array(
'au' => '%s',
'an' => '[%s]',
'an_bib' => '[%s, %s]',
'bib' => '[%s]',
'ad' => '[%s]',
'gen' => '%s',
'sp' => '%s',
'ssp' => '%s',
'fam' => '%s',
'au_ss' => '%s',
'bib_ss' => '%s');
}
$compo_nom = array();
 
foreach ($this->compo_nom as $key => $champ) {
if (isset($tab_res[$champ]) && !empty($tab_res[$champ])) {
$compo_nom[$key] = $tab_res[$champ];
}
}
$nom_complet = $this->formerNomComplet($compo_nom, $format);
$nom = implode(' ', $nom_complet);
}
return rtrim($nom, ' ');
}
 
 
public function formerNomComplet($compo_nom, $format) {
$nom_complet = array();
extract($compo_nom);
if (isset($au)) $nom_complet[] = sprintf($format['au'], $au);
if (isset($an)) {
if (isset($bib)) {
$nom_complet[] = sprintf($format['an_bib'], $an, $bib);
} else {
$nom_complet[] = sprintf($format['an'], $an);
}
} elseif (isset($bib)) {
$nom_complet[] = sprintf($format['bib'], $bib);
}
if (isset($ad)) $nom_complet[] = sprintf($format['ad'], $ad);
if (isset($gen)) $nom_complet[] = sprintf($format['gen'], $gen);
if (isset($ssp)) $nom_complet[] = sprintf($format['ssp'], $ssp);
if (isset($sp)) $nom_complet[] = sprintf($format['sp'], $sp);
if (isset($fam)) $nom_complet[] = sprintf($format['fam'], $fam);
if (isset($au_ss)) $nom_complet[] = sprintf($format['au_ss'], $au_ss);
if (isset($bib_ss)) {
$bibl = $this->tronquerBiblio($bib_ss);
//simule un 'select distinct' sur les biblio tronquées
if (!isset($this->bib_traitees[$bibl])) {
$nom_complet[] = sprintf($format['bib_ss'],$bibl );
$this->bib_traitees[$bibl] = 1;
}
}
return $nom_complet;
}
 
public function tronquerBiblio($valeur){
$bib = '';
if(strpos($valeur,',') !== false) {
$bib = explode(',',$valeur);
}
if(strpos($bib[0],';') !== false) {
 
$bib[0] = strstr($bib[0],';');
$bib[0] = str_replace('; ','',$bib[0]);
}
return $bib[0];
}
 
 
 
public function correspondAUnCode($key) {
return (strrpos($key, '.code') !== false) || (in_array($key.'.code', $this->correspondance_champs));
}
 
public function correspondAUnId($key) {
return (strrpos($key, '.id') !== false) || (in_array($key.'.id', $this->correspondance_champs));
}
 
public function estUnPoint($key) {
if (strrpos($key, 'hybride.parent') !== false) {
$key = str_replace('hybride.parent', 'hybride_parent', $key);
}
return (strrpos($key, '.') !== false);
}
 
public function recupererMasquePrincipal() {
$masque = null;
$tab_masque = array(
'masque' => 'nom_sci',
'masque_sg' => 'nom_supra_generique',
'masque_gen' => 'genre',
'masque_sp' => 'epithete_sp',
'masque_ssp' => 'epithete_infra_sp',
'masque_au' => 'auteur',
'masque_an' => 'annee',
'masque_bib' => 'biblio_origine',
'masque_ad' => 'addendum',
'masque_rg' => 'rang');
$liste_masque = array();
 
if (isset($this->masque['num_nom'])) {
$liste_masque[] = $this->masque['num_nom'];
}
 
foreach ($tab_masque as $key => $filtre) {
if (isset($this->masque[$filtre])) {
if (!isset($masque) && !in_array($filtre, array('rang', 'annee'))) {
$masque = array($key, $filtre);
}
$liste_masque[] = $this->masque[$filtre];
}
}
$this->masque = $liste_masque;
return $masque;
}
 
private function mettreEnCacheOntologie($categorie, $valeur, $correspondance) {
if(!isset($this->ontologie[$categorie])) {
$this->ontologie[$categorie] = array();
}
if(!isset($this->ontologie[$categorie][$valeur])) {
$this->ontologie[$categorie][$valeur] = array();
}
$this->ontologie[$categorie][$valeur] = $correspondance;
}
 
private function termeOntologieEstEnCache($categorie, $valeur) {
return array_key_exists($categorie, $this->ontologie) && array_key_exists($valeur, $this->ontologie[$categorie]);
}
 
private function obtenirTermeOntologieParCache($categorie, $valeur) {
return $this->ontologie[$categorie][$valeur];
}
}
?>
/tags/v5.0-agropyraie-20130830/services/modules/0.1/bdtxa/cartes/TaxonsCartes.php
New file
0,0 → 1,484
<?php
// declare(encoding='UTF-8');
/**
* Gère le sous-service Taxons de Cartes.
*
* @see http://www.tela-botanica.org/wikini/eflore/wakka.php?wiki=EfloreApi01Cartes
*
* @package eFlore/services
* @author Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org>
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
* @version 1.0
* @copyright 1999-2012 Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
*/
// TODO : Config et Outils sont des classes statiques qui doivent poser des pb pour les tests...
class TaxonsCartes {
 
private $parametres = array();
private $ressources = array();
 
const CODE_REFTAX_DEFAUT = 'bdtxa';
const TYPE_ID_DEFAUT = 'nn';
const CARTE_DEFAUT = 'antilles';
const FORMAT_DEFAUT = '587x550';
const VERSION_DEFAUT = '+';
const MIME_SVG = 'image/svg+xml';
const MIME_PNG = 'image/png';
const PRESENCE_CHOROLOGIE = '15';
 
private $config = array();
private $convertisseur = '';
private $cheminCartesBase = '';
private $formatsSupportes = array(self::MIME_SVG, self::MIME_PNG);
private $reftaxSupportes = array(self::CODE_REFTAX_DEFAUT);
private $UrlNavigation = null;
private $taxonsDemandes = array();
private $imgLargeur = 0;
private $imgHauteur = 0;
private $tableMeta = '';
private $tableOntologie = '';
private $tableChorodep = '';
private $metadonnees = '';
private $ontologies = '';
private $priorites = '';
private $version = '';
private $legende = array();
private $donnees = array();
 
 
public function __construct(Conteneur $conteneur) {
$this->Bdd = $conteneur->getBdd();
$this->tableOntologie = $conteneur->getParametre('bdd_table_ontologies');
$this->config = $conteneur->getParametre('Cartes');
$this->convertisseur = $this->config['convertisseur'];
$this->tableMeta = $conteneur->getParametre('bdd_table_meta');
$this->tableOntologie = $conteneur->getParametre('bdd_table_ontologies');
$this->cheminCartesBase = $this->config['chemin'];
$cacheOptions = array('mise_en_cache' => $this->config['cache_miseEnCache'],
'stockage_chemin' => $this->config['cache_stockageChemin'],
'duree_de_vie' => $this->config['cache_dureeDeVie']);
$this->cache = $conteneur->getCacheSimple($cacheOptions);
}
 
public function consulter($ressources, $parametres) {
$this->parametres = $parametres;
$this->ressources = $ressources;
 
$this->definirValeurParDefautDesParametres();
$this->verifierParametres();
 
$resultat = $this->obtenirResultat();
 
return $resultat;
}
 
private function definirValeurParDefautDesParametres() {
if (isset($this->parametres['retour']) == false) {
$this->parametres['retour'] = self::MIME_SVG;
}
if (isset($this->parametres['retour.format']) == false) {
$this->parametres['retour.format'] = self::FORMAT_DEFAUT;
}
if (isset($this->parametres['version.projet']) == false) {
$this->parametres['version.projet'] = self::VERSION_DEFAUT;
}
}
 
private function verifierParametres() {
$erreurs = array();
 
if (isset($this->parametres['retour']) == false) {
$erreurs[] = "Le paramètre type de retour 'retour' est obligatoire.";
}
if ($this->verifierValeurParametreRetour() == false) {
$erreurs[] = "Le type de retour '{$this->parametres['retour']}' n'est pas supporté.";
}
if (isset($this->parametres['retour.format']) == false) {
$erreurs[] = "Le paramètre de format de retour 'retour.format' est obligatoire.";
}
if ($this->verifierValeurParametreFormat() == false) {
$erreurs[] = "Le type de format '{$this->parametres['retour.format']}' n'est pas supporté.".
"Veuillez indiquer un nombre entier correspondant à la largeur désirée pour la carte.";
}
if ($this->verifierValeurParametreVersionProjet() == false) {
$erreurs[] = "Le format de version.projet '{$this->parametres['version.projet']}' n'est pas supporté.".
"Veuillez indiquer le code '+' (=dernière version) ou une année sur 4 chiffres séparé d'un mois ".
"sur deux chiffres par un point. Ex. : 2012.01";
}
 
if (count($erreurs) > 0) {
$message = implode('<br />', $erreurs);
$code = RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE;
throw new Exception($message, $code);
}
}
 
private function verifierValeurParametreRetour() {
return in_array($this->parametres['retour'], $this->formatsSupportes);
}
 
private function verifierValeurParametreFormat() {
if ($ok = preg_match('/^([0-9]+)$/', $this->parametres['retour.format'], $match)) {
$this->imgLargeur = $match[1];
} else if ($ok = preg_match('/^([0-9]+)x([0-9]+)$/', $this->parametres['retour.format'], $match)) {
$this->imgLargeur = $match[1];
$this->imgHauteur = $match[2];
}
return $ok;
}
private function verifierValeurParametreVersionProjet() {
$ok = (preg_match('/^(?:[+]|[0-9]{4}\.[0-9]{2})$/', $this->parametres['version.projet']) == 0) ? false : true;
return $ok;
}
 
private function obtenirResultat() {
$this->analyserIdentifiants();
$this->verifierIdentifiants();
 
$this->chargerMetadonnees();
$this->definirVersion();
$this->tableChorodep = 'bdtxa_v'.str_replace('.', '_', $this->version);
$this->chargerOntologies();
$this->chargerLegende();
$this->chargerPrioritesLegende();
$this->chargerDonnees();
$svg = $this->genererSVG();
$img = ($this->parametres['retour'] == self::MIME_PNG) ? $this->convertirEnPNG($svg) : $svg;
 
$resultat = new ResultatService();
$resultat->corps = $img;
$resultat->mime = $this->parametres['retour'];
 
return $resultat;
}
 
private function analyserIdentifiants() {
$ids = $this->ressources[0];
if (preg_match('/^[0-9]+$/', $ids)) {
$this->taxonsDemandes[self::CODE_REFTAX_DEFAUT]['nn'][] = $ids;
} else {
// ceci contient potentiellement des formes ref_tax1.nn:1,2;ref_tax2.nt:3,4
$projetsListeEtNumNoms = explode(';', $ids);
if (count($projetsListeEtNumNoms) > 0) {
foreach ($projetsListeEtNumNoms as $projetEtNumNoms) {
$projetEtNumNoms = (strpos($projetEtNumNoms, ':')) ? $projetEtNumNoms : self::CODE_REFTAX_DEFAUT.'.nn:'.$projetEtNumNoms;
list($projetEtType, $numNoms) = explode(':', $projetEtNumNoms);
 
$projetEtType = (strpos($projetEtType, '.')) ? $projetEtType : self::CODE_REFTAX_DEFAUT.'.'.$projetEtType;
list($projet, $type) = explode('.', $projetEtType);
 
$this->taxonsDemandes[$projet][$type] = explode(',', $numNoms);
}
}
}
}
 
private function verifierIdentifiants() {
foreach (array_keys($this->taxonsDemandes) as $reftax) {
$ok = in_array($reftax, $this->reftaxSupportes);
if ($ok == false) {
$message = "Le reférentiel taxonomique '$reftax' n'est pas pris en compte par ce projet.";
$code = RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE;
throw new Exception($message, $code);
}
}
}
 
private function chargerMetadonnees() {
$requete = 'SELECT * '.
"FROM {$this->tableMeta} ".
"ORDER BY date_creation DESC ";
$resultats = $this->Bdd->recupererTous($requete);
 
if (!is_array($resultats) || count($resultats) <= 0) {
$message = "Les méta-données n'ont pu être chargée pour la ressource demandée";
$code = RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE;
throw new Exception($message, $code);
}
 
$this->metadonnees = $resultats;
}
 
private function definirVersion() {
if ($this->parametres['version.projet'] == '+') {
$this->version = $this->metadonnees[0]['version'];
} else {
$this->version = $this->parametres['version.projet'];
}
}
 
private function chargerOntologies() {
$requete = 'SELECT * '.
"FROM {$this->tableOntologie} WHERE classe_id = (SELECT id FROM eflore_ontologies WHERE code ='presenceChorologie')";
$resultats = $this->Bdd->recupererTous($requete);
 
if (!is_array($resultats) || count($resultats) <= 0) {
$message = "Les données de légende n'ont pu être chargées pour la ressource demandée";
$code = RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE;
throw new Exception($message, $code);
}
 
foreach ($resultats as $ontologie) {
$this->ontologies[$ontologie['id']] = $this->extraireComplementsOntologies($ontologie);
}
}
 
 
private function extraireComplementsOntologies($ontologie) {
if ($ontologie['complements'] != '') {
$complements = explode(',', trim($ontologie['complements']));
foreach ($complements as $complement) {
list($cle, $val) = explode('=', trim($complement));
$ontologie[trim($cle)] = trim($val);
}
}
return $ontologie;
}
 
private function chargerLegende() {
foreach ($this->ontologies as $ontologie) {
if ($ontologie['classe_id'] == self::PRESENCE_CHOROLOGIE) {
$this->legende[$ontologie['code']] = $ontologie['legende'];
}
}
}
 
private function chargerPrioritesLegende() {
foreach ($this->ontologies as $ontologie) {
if ($ontologie['classe_id'] == self::PRESENCE_CHOROLOGIE && isset($ontologie['priorite'])) {
$this->priorites[$ontologie['code']] = $ontologie['priorite'];
}
}
}
 
private function chargerDonnees() {
$conditions = $this->getConditions();
$requete = 'SELECT nom_sci, `presence_Guadeloupe`, `presence_Martinique`, `presence_Saint_Martin`, '.
"`presence_La_Desirade`, `presence_Saint_Barthelemy`, `presence_Marie_Galante`, ".
"`presence_Les-Saintes` ".
"FROM {$this->tableChorodep} ".
(isset($conditions) ? 'WHERE '.implode(' AND ', $conditions) : '');
$resultat = $this->Bdd->recupererTous($requete);
$this->donnees = $resultat;
}
 
private function getConditions() {
$conditions = null;
if ($nnListe = $this->getListeNumNom()) {
$conditions[] = "num_nom IN ($nnListe) ";
}
if ($ntListe = $this->getListeNumTax()) {
$conditions[] = "num_tax IN ($ntListe) ";
}
return $conditions;
}
 
private function getListeNumNom() {
$nnListe = null;
$refTax = self::CODE_REFTAX_DEFAUT;
if (isset($this->taxonsDemandes[$refTax])) {
$nnProteges = array();
if (isset($this->taxonsDemandes[$refTax]['nn'])) {
foreach ($this->taxonsDemandes[$refTax]['nn'] as $nn) {
$nnProteges[] = $this->Bdd->proteger($nn);
}
$nnListe = implode(',', $nnProteges);
}
}
return $nnListe;
}
 
private function getListeNumTax() {
$ntListe = null;
$refTax = self::CODE_REFTAX_DEFAUT;
if (isset($this->taxonsDemandes[$refTax])) {
$ntProteges = array();
if (isset($this->taxonsDemandes[$refTax]['nt'])) {
foreach ($this->taxonsDemandes[$refTax]['nt'] as $nt) {
$ntProteges[] = $this->Bdd->proteger($nt);
}
$ntListe = implode(',', $ntProteges);
}
}
return $ntListe;
}
 
private function genererSVG() {
$dom = new DOMDocument('1.0', 'UTF-8');
$dom->validateOnParse = true;
 
$fichierCarteSvg = $this->cheminCartesBase.self::CARTE_DEFAUT.'.svg';
$dom->load($fichierCarteSvg);
 
$racineElement = $dom->documentElement;
$racineElement->setAttribute('width', $this->imgLargeur);
if ($this->imgHauteur != 0) {
$racineElement->setAttribute('height', $this->imgHauteur);
}
 
$css = $this->creerCssCarte();
$styleElement = $dom->getElementsByTagName('style')->item(0);
$css = $styleElement->nodeValue.$css;
$txtCss = $dom->createCDATASection($css);
$styleElement->nodeValue = '';
$styleElement->appendChild($txtCss);
 
$titre = $this->creerTitre();
$titreCdata = $dom->createCDATASection($titre);
$titreElement = $dom->getElementsByTagName('title')->item(0);
$titreElement->nodeValue = '';
$titreElement->appendChild($titreCdata);
 
$taxonTitre = $this->creerTitreTaxon();
$taxonCdata = $dom->createCDATASection($taxonTitre);
$xpath = new DOMXPath($dom);
$taxonTitreEl = $xpath->query("//*[@id='titre-taxon']")->item(0);
$taxonTitreEl->nodeValue = '';
$taxonTitreEl->setAttribute('title', $taxonTitre);
$taxonTitreEl->appendChild($taxonCdata);
 
$svg = $dom->saveXML();
return $svg;
}
 
private function creerCssCarte() {
$css = '';
$this->getZonesPriorites();
$zonesCouleurs = $this->getZonesCouleurs();
foreach ($zonesCouleurs as $couleur => $zonesClasses) {
$classes = implode(', ', $zonesClasses);
$css .= "$classes {"."\n"."fill:$couleur;"."\n"."}"."\n";
}
return $css;
}
 
private function getZonesPriorites() {
$this->zones = array();
$zonesPrioritaires = array();
foreach ($this->donnees as $donnee) {
foreach ($donnee as $zoneId => $codeLegende) {
if (preg_match('/^presence_(.)*$/i', $zoneId)) {
$zoneId = $this->formaterZoneId($zoneId);
if (array_key_exists($codeLegende, $this->priorites)) {
$priorite = $this->priorites[$codeLegende];
if (array_key_exists($zoneId, $zonesPrioritaires) == false) {
$zonesPrioritaires[$zoneId] = 0;
}
if ($priorite > $zonesPrioritaires[$zoneId]) {
$zonesPrioritaires[$zoneId] = $priorite;
$this->zones[$zoneId] = $codeLegende;
}
}
}
}
}
}
private function formaterZoneId($zoneId) {
$zoneId = strtolower(str_replace('presence_', '', $zoneId));
$zoneId = str_replace('-', '_', $zoneId);
return $zoneId;
}
 
private function getZonesCouleurs() {
$zones = array();
ksort($this->zones);
foreach ($this->zones as $zoneId => $codeLegende) {
if (array_key_exists($codeLegende, $this->legende)) {
$couleur = $this->legende[$codeLegende];
$zones[$couleur][] = strtolower('.'.sprintf('%02s', $zoneId));
}
}
return $zones;
}
 
private function creerTitre() {
$titre = "Carte en cours d'élaboration";
if ($this->donnees != array()) {
$titre .= ' pour '.$this->creerTitreTaxon();
}
return $titre;
}
 
private function creerTitreTaxon() {
$titre = '';
$noms = array();
foreach ($this->donnees as $donnee) {
$noms[] = $donnee['nom_sci'];
}
$titre = implode(', ', $noms);
return $titre;
}
 
private function convertirEnPNG($svg) {
$png = null;
if (isset($this->convertisseur)) {
if ($this->convertisseur == 'imagick') {
if (extension_loaded('imagick')) {
$png = $this->convertirEnPNGAvecImageMagick($svg);
} else {
$message = "Impossible de générer l'image sur le serveur. Extenssion ImageMagick abscente.";
$code = RestServeur::HTTP_CODE_ERREUR;
throw new Exception($message, $code);
}
} else if ($this->convertisseur == 'rsvg') {
$png = Commun::convertirEnPNGAvecRsvg($this->getIdFichier(), $this->config['cache_stockageChemin'], $svg);
} else {
$message = "Le convertisseur indiqué '{$this->convertisseur}' ne fait pas parti de la liste ".
"des convertisseurs disponibles : imagick, rsvg.";
$code = RestServeur::HTTP_CODE_ERREUR;
throw new Exception($message, $code);
}
} else {
$message = "Veuillez indiquer le convertisseur de svg à utiliser pour le service.";
$code = RestServeur::HTTP_CODE_ERREUR;
throw new Exception($message, $code);
}
return $png;
}
 
private function convertirEnPNGAvecImageMagick($svg) {
$convertisseur = new Imagick();
$convertisseur->setBackgroundColor(new ImagickPixel('transparent'));
$convertisseur->readImageBlob($svg);
$convertisseur->setImageFormat('png32');
$convertisseur->resizeImage($this->imgLargeur, $this->imgHauteur, imagick::FILTER_LANCZOS, 0, true);
$png = $convertisseur->getImageBlob();
$convertisseur->clear();
$convertisseur->destroy();
return $png;
}
 
private function getIdFichier() {
$id = '';
foreach ($this->taxonsDemandes as $reftax => $ids) {
$id[] = $reftax;
foreach ($ids as $type => $vals) {
$id[] = $type;
$id[] = implode('-', $vals);
}
}
$id = implode('-', $id);
return $id;
}
 
public function getParametreTableau($cle) {
$tableau = array();
$parametre = $this->config[$cle];
if (empty($parametre) === false) {
$tableauPartiel = explode(',', $parametre);
$tableauPartiel = array_map('trim', $tableauPartiel);
foreach ($tableauPartiel as $champ) {
if (strpos($champ, '=') === false) {
$tableau[] = trim($champ);
} else {
list($cle, $val) = explode('=', $champ);
$tableau[trim($cle)] = trim($val);
}
}
}
return $tableau;
}
}
?>
/tags/v5.0-agropyraie-20130830/services/modules/0.1/bdtxa/cartes/LegendeCartes.php
New file
0,0 → 1,123
<?php
// declare(encoding='UTF-8');
/**
* Gère le sous-service Legende de Cartes.
*
* @see http://www.tela-botanica.org/wikini/eflore/wakka.php?wiki=EfloreApi01Cartes
*
* @package eFlore/services
* @author Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org>
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
* @version 1.0
* @copyright 1999-2012 Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
*/
// TODO : Config et Outils sont des classes statiques qui doivent poser des pb pour les tests...
class LegendeCartes {
 
private $parametres = array();
private $ressources = array();
 
const MIME_JSON = 'application/json';
const PRESENCE_CHOROLOGIE = '15';
 
private $formatsSupportes = array(self::MIME_JSON);
private $tableOntologie = '';
private $ontologies = '';
private $legende = array();
 
public function __construct(Conteneur $conteneur) {
$this->Bdd = $conteneur->getBdd();
$this->tableOntologie = $conteneur->getParametre('bdd_table_ontologies');
}
 
public function consulter($ressources, $parametres) {
//$tpsDebut = microtime(true);
$this->parametres = $parametres;
$this->ressources = $ressources;
 
$this->definirValeurParDefautDesParametres();
$this->verifierParametres();
 
$resultat = $this->obtenirResultat();
 
return $resultat;
}
 
private function definirValeurParDefautDesParametres() {
if (isset($this->parametres['retour']) == false) {
$this->parametres['retour'] = self::MIME_JSON;
}
}
 
private function verifierParametres() {
$erreurs = array();
 
if (isset($this->parametres['retour']) == false) {
$erreurs[] = "Le paramètre type de retour 'retour' est obligatoire.";
}
if ($this->verifierValeurParametreRetour() == false) {
$erreurs[] = "Le type de retour '{$this->parametres['retour']}' n'est pas supporté.";
}
 
if (count($erreurs) > 0) {
$message = implode('<br />', $erreurs);
$code = RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE;
throw new Exception($message, $code);
}
}
 
private function verifierValeurParametreRetour() {
return in_array($this->parametres['retour'], $this->formatsSupportes);
}
 
private function obtenirResultat() {
$this->chargerOntologies();
$this->chargerLegende();
 
$resultat = new ResultatService();
$resultat->corps = $this->legende;
$resultat->mime = $this->parametres['retour'];
 
return $resultat;
}
 
private function chargerOntologies() {
$requete = "SELECT * FROM {$this->tableOntologie} ";
$resultats = $this->Bdd->recupererTous($requete);
 
if (!is_array($resultats) || count($resultats) <= 0) {
$message = "Les données d'ontologies n'ont pu être chargées pour la ressource demandée";
$code = RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE;
throw new Exception($message, $code);
}
 
foreach ($resultats as $ontologie) {
$this->ontologies[$ontologie['id']] = $this->extraireComplementsOntologies($ontologie);
}
}
 
private function extraireComplementsOntologies($ontologie) {
if ($ontologie['complements'] != '') {
$complements = explode(',', trim($ontologie['complements']));
foreach ($complements as $complement) {
list($cle, $val) = explode('=', trim($complement));
$ontologie[trim($cle)] = trim($val);
}
}
return $ontologie;
}
 
private function chargerLegende() {
foreach ($this->ontologies as $ontologie) {
if ($ontologie['classe_id'] == self::PRESENCE_CHOROLOGIE) {
$this->legende[] = array(
'code' => $ontologie['code'],
'couleur' => $ontologie['legende'],
'nom' => $ontologie['nom'],
'description' => $ontologie['description']);
}
}
}
}
?>
/tags/v5.0-agropyraie-20130830/services/modules/0.1/bdtxa/Noms.php
New file
0,0 → 1,684
<?php
// declare(encoding='UTF-8');
/**
* Classe permettant de fournir des informations sur les noms scientifiques.
* Si l'url finit par /noms on retourne une liste de noms latin et leurs identifiants (seulement les 100 premeiers noms par défaut).
* L'url peut contenir des paramètres optionnels passés après le ? : /noms?param1=val1&param2=val2&...
*
* Les paramètres de requête disponibles sont : masque, masque.gen (nom de genre), masque.sp (épithète d'espèce), masque.ssp (épithète infra-spécifique),
* masque.au (auteur du nom), masque.an (année de publication du nom), masque.bib (réf biblio de la publi d'origine du nom), masque.ad (nomen addendum),
* masque.nn (identifiant du nom), recherche, rang, distinct, retour.format, nl.format, nl.structure, navigation.depart et navigation.limite.
* Les différentes requetes :
* - noms | noms/relations/#projet/#id_projet | noms/#id | noms/#id/#champ+#champ
* - noms/#id/relations | noms/#id/relations/synonymie | noms/#id/relations/homonymie | noms/#id/relations/flores
* - noms/stats/rangs | noms/stats/annees | noms/stats/initiales
*
* @package bdtfx
* @author Jennifer Dhé <jennifer.dhe@tela-botanica.org>
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
* @version $Id$
* @copyright 1999-2011 Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
* @see http://www.tela-botanica.org/wikini/eflore/wakka.php?wiki=EfloreApi01Noms
*/
 
class Noms extends CommunNomsTaxons {
 
protected $format_reponse = 'noms'; // Permet de stocker la requete formulée
protected $service = 'noms';
protected $serviceNom = 'noms';
protected $requete_champ = 'num_nom, nom_sci, num_nom_retenu';
protected $requete_condition = null;
protected $requete_group_by = '';
/** Permet de stocker les limite de la requete SQL (par défaut seul les 100 premiers résultats seront retournés).*/
protected $limite_requete = array('depart' => 0, 'limite' => 100);
protected $distinct = null; // Valeur du paramètre de requete distinct (=0|1)
 
public function consulter($ressources, $parametres) {
return parent::consulter($ressources, $parametres);
}
 
//+----------------FONCTION D'ANALYSE DES PARAMETRES---------------------------------------------------------+
 
public function traiterParametresSpecifiques() {
foreach ($this->parametres as $param => $val) {
switch ($param) {
case 'masque' :
$this->ajouterFiltreMasque('nom_sci', $val);
break;
case 'masque.sg' :
$this->ajouterFiltreMasque('nom_supra_generique', $val);
break;
case 'masque.gen' :
$this->ajouterFiltreMasque('genre', $val);
break;
case 'masque.sp' :
$this->ajouterFiltreMasque('epithete_sp', $val);
break;
case 'masque.ssp' :
$this->ajouterFiltreMasque('epithete_infra_sp',$val);
break;
case 'masque.au' :
$this->ajouterFiltreMasque('auteur', $val);
break;
case 'masque.an' :
$this->ajouterFiltreMasque('annee', $val);
break;
case 'masque.bib' :
$this->ajouterFiltreMasque('biblio_origine',$val);
break;
case 'masque.ad' :
$this->ajouterFiltreMasque('nom_addendum', $val);
break;
case 'masque.nn' :
$this->requete_condition []= 'num_nom IN ('.$val.')';
$this->masque['num_nom'] = "num_nom=$val";
break;
case 'masque.nt' :
$this->requete_condition []= 'num_tax IN ('.$val.')';
$this->masque['num_tax'] = "num_tax=$val";
break;
case 'masque.rg' :
$this->ajouterFiltreMasque('rang', $val);
break;
case 'retour.champs' :
$this->verifierParamChamps($param, $val);
break;
case 'distinct' :
$this->ajouterNomDistinct($val);
break;
case 'masque.fam' :
$this->ajouterFiltreMasque('famille', $val);
break;
case 'masque.sto' :
$this->ajouterFiltreMasque('statut_origine', $val);
break;
case 'masque.sti' :
$this->ajouterFiltreMasque('statut_introduction', $val);
break;
case 'masque.stc' :
$this->ajouterFiltreMasque('statut_culture', $val);
break;
case 'masque.and' :
$this->requete_condition []= " annee >= ".$this->getBdd()->proteger($val);
break;
case 'masque.anf' :
$this->requete_condition []= " annee <= ".$this->getBdd()->proteger($val);
break;
case 'masque.prgua' :
$this->ajouterFiltreMasque('presence_Guadeloupe', $val);
break;
case 'masque.prmar' :
$this->ajouterFiltreMasque('presence_Martinique', $val);
break;
case 'masque.prstm' :
$this->ajouterFiltreMasque('presence_Saint_Martin', $val);
break;
case 'masque.prdes' :
$this->ajouterFiltreMasque('presence_La_Desirade', $val);
break;
case 'masque.prstb' :
$this->ajouterFiltreMasque('presence_Saint_Barthelemy', $val);
break;
case 'masque.prmga' :
$this->ajouterFiltreMasque('presence_Marie_Galante', $val);
break;
case 'masque.prsai' :
$this->ajouterFiltreMasque('presence_Les-Saintes', $val);
break;
}
}
}
 
public function verifierParamChamps($param, $val) {
$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
$champs_demandes = explode(',', $val);
$champs_verifies = array();
$champs_api = array_flip($this->champs_api);
$champs_supp = array('nom_retenu_complet'=>'num_nom_retenu', 'basionyme_complet'=>'basionyme');
$champs_api = array_merge($champs_api, $champs_supp);
foreach ($champs_demandes as $champ) {
if (array_key_exists($champ, $champs_api)) {
$champs_verifies[] = $champs_api[$champ];
}
}
if (count($champs_verifies) > 0) {
$this->requete_champ .= ', '.implode(',', $champs_verifies);
}
}
 
/** Permet de rajouter à la requete sql le parametre distinct. N'est utilisé qu'avec le format oss */
public function ajouterNomDistinct($distinct) {
if (isset($distinct)) {
if ($distinct == 1 && $this->parametres['retour.format'] == 'oss') {
$this->distinct = ' distinct ';
} elseif ($distinct == 1 && $this->parametres['retour.format'] != 'oss') {
$e = 'Erreur dans votre requête </br> L\'utilisation du paramètre distinct ne se fait que sous
le format oss';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
}
}
}
 
//-----------------FONCTION D'ANALYSE DES RESSOURCES--------------------------------------------------------------------
 
public function traiterRessourcesIdentifiant() {
//on initialise la condition de la requete sql et le format de réponse
$this->requete_condition = array(); //on vide la table dans le cas de plusieurs version
$this->requete_condition[] = 'num_nom = '.$this->getBdd()->proteger($this->ressources[0]);
$this->format_reponse = $this->service.'/id';
if (isset($this->ressources[1]) && !empty($this->ressources[1])) {
if ($this->ressources[1] == 'relations') {
$this->traiterRessourceIdRelations();
} else {
$e = 'Erreur dans votre requête </br> Ressources disponibles : <br/>
<li> noms/#id/relations </li> <li> noms/#id/#champ+#champ </li>
<li> noms/#id/relations/synonymie </li> <li> noms/#id/relations/flores </li>
<li> noms/#id/relations/homonymie </li>';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
}
} else { // requete de type noms/#id : rajout du nom_sci pour récupérer le format html par la fct mettreAuFormat()
$this->requete_champ = ' *, nom_sci ';
}
}
 
public function traiterRessourceRelations() {
$this->format_reponse .= '/relations';
$projet = $this->ressources[1];
$num_nom = $this->ressources[2];
if (strrpos($num_nom, 'nn.coste') !== false) {
list($p, $nn) = explode('=', $num_nom);
$num_nom = $nn;
}
$champ = "flore_$projet"."_num";
if (isset($this->ressources[3])) {
$type = $this->ressources[3];
if (!in_array($type, array('homonymie', 'synonymie', 'flores'))) {
$e = "Les types disponibles pour les noms sont homonymie, synonymie et flores";
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
}
}
$this->requete_champ = ' num_nom ';
$this->requete_condition = array();
$this->requete_condition[] = "$champ = ".$this->getBdd()->proteger($num_nom);
}
 
public function traiterRessourceIdRelations() {
$this->format_reponse .= '/relations';
if (isset($this->ressources[2]) && !empty($this->ressources[2])) {
// requete de type noms/#id/relations/#relation
switch ($this->ressources[2]) {
case 'synonymie' :
$this->traiterRessourceIdSynonymie();
break;
case 'flores' :
$this->traiterRessourceIdFlores();
break;
case 'homonymie' :
$this->traiterRessourceIdHomonymie();
break;
default :
$e = 'Erreur dans votre requête </br> Ressources disponibles : <br/>
<li> noms/#id/relations </li> <li> noms/#id/relations/synonymie </li>
<li> noms/#id/relations/flores </li> <li> noms/#id/relations/homonymie </li>';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
break;
}
}
}
 
public function traiterRessourceIdSynonymie() {
// SELECT num_nom, nom_sci, num_nom_retenu, basionyme FROM bdtfx_v2_00 WHERE num_nom = X LIMIT 0,100;
$this->format_reponse .= '/synonymie';
if (strrpos($this->requete_champ, ', basionyme') === false) {
$this->requete_champ .= ', basionyme ';
}
$this->requete_condition[0] = 'num_nom_retenu = '.
'(SELECT num_nom_retenu FROM '.$this->table.' WHERE '.$this->requete_condition[0].')';
}
 
public function traiterRessourceIdHomonymie() {
// SELECT num_nom, nom_sci, num_nom_retenu FROM bdtfx_v2_00 WHERE nom_sci = (SELECT nom_sci FROM bdtfx_v2_00 WHERE num_nom = X);
$this->format_reponse .= '/homonymie';
$this->requete_condition[0] = 'nom_sci = (SELECT nom_sci FROM '.$this->table
.' WHERE '.$this->requete_condition[0].')';
}
 
public function traiterRessourceIdFlores() {
$champ_flores = '';
foreach ($this->champs_table as $champ) {
if (preg_match('/^flore_.*$/', $champ)) {
$champ_flores .= ', '.$champ;
}
}
$this->format_reponse .= '/flores';
$this->requete_champ = 'num_nom'.$champ_flores;
}
 
public function traiterRessourceStatsRangs() {
// SELECT count(*) as nombre, rang FROM bdtfx_v2_00 [WHERE rang = 290] GROUP BY rang ORDER BY rang;
$this->format_reponse .= '/rangs';
$this->requete_champ = 'count(*) as nombre, rang ';
$this->requete_group_by = ' GROUP BY rang ORDER BY rang ';
}
 
public function traiterRessourceStatsAnnees() {
// SELECT count(*) as nombre, annee FROM bdtfx_v2_00 GROUP BY annee ORDER BY annee;
$this->format_reponse .= '/annees';
$this->requete_champ = 'count(*) as nombre, annee ';
$this->requete_condition = null;
$this->requete_group_by = ' GROUP BY annee ORDER BY annee ';
}
 
public function traiterRessourceStatsInitiales() {
// SELECT count(left( nom_sci, 2 )) as nb, rang, left(nom_sci, 2) as lettre GROUP BY rang, left(nom_sci, 2);
$this->format_reponse .= '/initiales';
$this->requete_champ = 'count(left( nom_sci, 2 )) as nb, rang, left(nom_sci, 2) as lettre ';
$this->requete_group_by = ' GROUP BY rang, left(nom_sci, 2)';
}
 
//-----------------------------FONCTIONS DASSEMBLAGE DE LA REQUETE-----------------------------------------------------
 
public function assemblerLaRequete() {
if ( strrpos($this->format_reponse, 'noms/stats/') === false ) {
$this->mettreAuFormat(); //Ds CommunNomsTaxons.php
}
$requete = 'SELECT '.$this->retournerChamps().' '.
"FROM {$this->table} ".
$this->retournerRequeteCondition().' '.
$this->requete_group_by.' '.
$this->retournerOrderBy().' '.
$this->formerRequeteLimite();
return $requete;
}
 
public function retournerChamps() {
$sql = '';
if ($this->distinct) {
$sql .= $this->distinct.' ';
}
if ($this->requete_champ) {
$sql .= $this->requete_champ.' ';
}
 
// Champs "virtuels" pour tier sur l'ensemble des résultats
if (isset($this->parametres['retour.tri'])) {
list($champ, $ordre) = $this->decouperParametreRetourTri();
if ($champ == 'retenu') {
$sql .= ", IF(num_nom = num_nom_retenu, '0', '1') AS nom_retenu_tri ";
}
}
 
return $sql;
}
 
public function decouperParametreRetourTri() {
$tri = array('', '');
if (isset($this->parametres['retour.tri'])) {
if (preg_match('/^(retenu)(?:,(ASC|DESC)|)$/', $this->parametres['retour.tri'], $match))
$tri[0] = $match[1];
$tri[1] = isset($match[2]) ? $match[2] : '';
}
return $tri;
}
 
public function retournerRequeteCondition() {
$condition = '';
if ($this->requete_condition) {
$condition = ' WHERE '.implode(' AND ', $this->requete_condition);
}
return $condition;
}
 
public function retournerOrderBy() {
$orderBy = array();
 
// Tri sur l'ensemble des résultats
if (isset($this->parametres['retour.tri'])) {
list($champ, $ordre) = $this->decouperParametreRetourTri();
if ($champ == 'retenu') {
$orderBy[] = "nom_retenu_tri $ordre";
}
}
// Tri par défaut
if ($this->format_reponse == 'noms') {
$orderBy[] = 'nom_sci ASC';
}
 
$sql = '';
if (count($orderBy) > 0) {
$sql = 'ORDER BY '.implode(', ', $orderBy).' ';
}
return $sql;
}
 
public function formerRequeteLimite() {
if ($this->format_reponse != 'noms' && $this->format_reponse != 'noms/id/relations/synonymie'
&& $this->format_reponse != 'noms/id/relations/homonymie') {
$this->requete_limite = '';
} elseif (($depart = $this->limite_requete['depart']) > ($this->total_resultat = $this->recupererTotalResultat())) {
$this->limite_requete['depart'] =
(($this->total_resultat - $this->limite_requete['limite']) < 0) ? 0 : ($this->total_resultat - $this->limite_requete['limite']);
$this->requete_limite = ' LIMIT '.$this->limite_requete['depart'].', '.$this->limite_requete['limite'];
} else {
$this->requete_limite = ' LIMIT '.$this->limite_requete['depart'].', '.$this->limite_requete['limite'];
}
return $this->requete_limite;
}
 
/** Recupere le nombre total de résultat d'une requete lancée. */
public function recupererTotalResultat() {
$total = null;
$requete = 'SELECT count(*) as nombre FROM '.$this->table.$this->retournerRequeteCondition().$this->requete_group_by;
$res = $this->getBdd()->recuperer($requete);
if ($res) {
$total = $res['nombre'];
} else {
$e = 'Fct recupererTotalResultat() : <br/>Données introuvables dans la base';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE, $e);
}
return $total;
}
 
 
//-------------------FONCTIONS POUR LE FORMATAGE EN JSON----------------------------------------------------------------
 
public function retournerResultatFormate($resultat) {
switch ($this->format_reponse) {
case 'noms/relations' :
$reponse = $this->formaterRelations($resultat[0]);
break;
case 'noms/id' : //ds CommunNomsTaxons
$reponse = $this->formaterId($resultat[0]);
break;
case 'noms/id/relations' :
$reponse = $this->formaterIdRelations($resultat[0]);
break;
case 'noms/id/relations/synonymie' :
$reponse = $this->formaterIdSynonymie($resultat);
break;
case 'noms/id/relations/homonymie' :
$reponse = $this->formaterIdHomonymie($resultat);
break;
case 'noms/id/relations/flores' : //ds CommunsNomsTaxons
$reponse = $this->formaterIdFlores($resultat[0]);
break;
case 'noms/stats/annees' : //ds CommunNomsTaxons
$reponse = $this->formaterStatsAnnee($resultat);
break;
case 'noms/stats/rangs' : //ds CommunNomsTaxons
$reponse = $this->formaterStatsRang($resultat);
break;
case 'noms/stats/initiales' : //ds CommunNomsTaxons
$reponse = $this->formaterStatsInitiales($resultat);
break;
case 'noms' :
$reponse = $this->formaterNoms($resultat);
break;
}
return $reponse;
}
 
//+---------------------concerne les resultats pour des requetes de type noms/id-----------------------------+
 
public function formaterRelations($resultat) {
$num_nom = $resultat['num_nom'];
if (isset($this->ressources[3])) {
$url = Config::get('url_service').$this->service."/$num_nom/relations";
} else {
$type = $this->ressources[3];
$url = Config::get('url_service')."/$this->service/$num_nom/relations/$type";
}
$res = $this->consulterHref($url);
return $res;
}
 
public function formaterIdRelations($resultat) {
$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
$this->resultat_req = $resultat;
$retour_id_rel = array ('entete' => array()); //on initialise pr que l'entete apparaisse en premier lors de l'affichage
 
//on recupère le resultat de chaque relation (appel du WS correspondant)
$flores = $this->ajouterRelations('flores');
if (isset($flores)) $retour_id_rel['resultat']['flores'] = $flores;
$homonymes = $this->ajouterRelations('homonymie');
if (isset($homonymes)) $retour_id_rel['resultat']['homonymes'] = $homonymes;
$synonymes = $this->ajouterRelations('synonymie');
if (isset($synonymes)) $retour_id_rel['resultat']['synonymes'] = $synonymes;
 
//on renvoit null si il n'existe aucune relations (on efface l'entete en premier lieu)
if (!isset($retour_id_rel['resultat'])) {
$retour_id_rel = null;
} else { //on rajoute l'entete si des relations existent
$this->afficherDonnees('num_nom', $this->ressources[0]);
$retour_id_rel['entete'] = $this->table_retour;
$this->table_retour = array();
}
return $retour_id_rel;
}
 
/**
* Recupere les relations (type de la relation passée en paramètres :[type_relation] = synonymie, homonymie ou
* flores) par l'appel du web service [version]/noms/#id/relations/[type_relation]
*/
public function ajouterRelations($relation) {
$version = str_replace(Config::get('bdd_table').'_', '', $this->table);
$res = null;
$parametres_url = '';
if ($this->parametres != array()) $parametres_url = '?'.http_build_query($this->parametres, '', '&');
$url = Config::get('url_service').'/'.$this->service.'/'.
$this->ressources[0].'/relations/'.
$relation.$parametres_url;
 
$relation = $this->consulterHref($url);
 
$res = $relation->resultat;
return $res;
}
 
 
public function formaterIdSynonymie($resultat) {
$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
$retour_id_syn = array();
if ($resultat[0]['num_nom_retenu'] == '') {
$retour_id_syn[] = 'nom_retenu N.D.';
} elseif (count($resultat) != 1) {
//on remplit d'abord l'entete du resultat
$this->table_retour['id'] = $this->ressources[0];
$this->afficherEnteteResultat('/'.$this->service.'/'.$this->ressources[0].'/relations/synonymie');
$retour_id_syn['entete'] = $this->table_retour;
$this->table_retour = array();
foreach ($resultat as $tab) {
//pour chaque basionyme, on recupère le résultat : num_nom, nom_sci, basionyme et num_nom_retenu :
$this->resultat_req = $tab;
$num = $tab['num_nom'];
$this->afficherNomHrefRetenu($tab, $num);
$this->afficherDonnees('basionyme', $tab['basionyme']);
$retour_id_syn['resultat'][$num] = $this->table_retour;
$this->table_retour = array();
}
if (!isset($retour_id_syn['resultat']) && !in_array('nom_retenu N.D.', $retour_id_syn)) {
$retour_id_syn = null; //on initialise le resultat à null
}
}
return $retour_id_syn;
}
 
public function formaterIdHomonymie($resultat) {
$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
if (count($resultat) != 1) {
$this->table_retour['id'] = $this->ressources[0];
$this->afficherEnteteResultat($resultat, '/'.$this->service.'/'.$this->ressources[0].'/relations/homonymie');
$retour_id_hom['entete'] = $this->table_retour;
$this->table_retour = array();
foreach ($resultat as $homonyme) {
$this->resultat_req = $homonyme;
$id = $homonyme['num_nom'];
$this->afficherDonnees('num_nom', $id);
if ($homonyme['num_nom_retenu'] != '') {
$retenu = ($id == $homonyme['num_nom_retenu']) ? 'true' : 'false';
} else {
$retenu = 'absent';
}
$this->table_retour['retenu'] = $retenu;
$retour_id_hom['resultat'][$id] = $this->table_retour;
unset($retour_id_hom['resultat'][$id]['id']);
$this->table_retour = array();
}
} else {
$retour_id_hom = null;
}
return $retour_id_hom;
}
 
public function obtenirSynonymesParNumNomAvecInfosFlore($num_nom, $version='1_02') {
 
$champs_flore = 'flore_bonnier_num, flore_bonnier_rem,'.
'flore_cnrs_num, flore_cnrs_rem '.
'flore_fe_num, flore_fe_rem '.
'flore_coste_num, flore_coste_rem '.
'flore_fh_num, flore_fh_rem '.
'flore_fournier_num, flore_fournier_rem';
 
$requete = 'SELECT num_nom, nom_sci, '.$champs_flore.' '.
'FROM '.$this->table.' '.
'WHERE num_nom_retenu = '.
'('.
'SELECT num_nom_retenu FROM '.$this->table.' WHERE num_nom = "'.$num_nom.'"'.
')';
 
return $this->getBdd()->recupererTous($requete);
}
 
public function formaterIdFlores($resultat) {
$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp,noms_projets');
$this->resultat_req = $resultat;
$id = array_shift($resultat);
$reponse['entete']['id'] = $id;
$synonymes_flores = $this->obtenirSynonymesParNumNomAvecInfosFlore($this->ressources[0]);
if(is_array($synonymes_flores)) {
foreach ($synonymes_flores as $synonyme) {
$nom_sci = $synonyme['nom_sci'];
$num_nom = $synonyme['num_nom'];
unset($synonyme['nom_sci']);
unset($synonyme['num_nom']);
foreach ($synonyme as $flores => $valeur) {
if ($valeur != '' && $valeur != '0') {
$this->afficherInfosFlore($synonyme, $flores, $valeur, $nom_sci, $num_nom);
}
}
}
}
 
if ($this->table_retour != array()) {
$reponse['resultat'] = $this->table_retour;
$this->table_retour = array();
} else {
$reponse = null;
}
return $reponse;
}
 
public function getNomCompletFlore($flore) {
return Config::get($flore.'_texte');
}
 
public function afficherInfosFlore(&$resultat, $flores, $valeur, $nom_sci, $num_nom) {
$flore = substr($flores,0,strrpos($flores, '_'));
$projet = $this->noms_projets[$flore];
 
//TODO voir si l'on peut factoriser les affectations à la table retour
// et simplifier ce gros pavé
if (strrpos($flores, 'num') !== false) {
if (preg_match('/^([0-9]+)(?:[.]syn[^a-z]*|(.*))?$/', $valeur, $match)) {
$this->table_retour[$num_nom][$flore]['id'] = $match[1];
if ($projet == 'coste') {
$this->table_retour[$num_nom][$flore]['href'] = $this->ajouterHrefAutreProjet('noms', 'nn_coste:', $match[1], $projet);
}
if (isset($match[2]) && $match[2] != '') $this->table_retour[$num_nom][$flore]['cle'] = $match[2];
$this->table_retour[$num_nom][$flore]['nom_flore'] = $this->getNomCompletFlore($flore);
$this->table_retour[$num_nom][$flore]['nom_sci'] = $nom_sci;
}
if (isset($resultat[$flore.'_rem']) && !empty($resultat[$flore.'_rem'])) {
$this->table_retour[$num_nom][$flore]['remarque'] = $resultat[$flore.'_rem'];
$this->table_retour[$num_nom][$flore]['nom_flore'] = $this->getNomCompletFlore($flore);
$this->table_retour[$num_nom][$flore]['nom_sci'] = $nom_sci;
unset($resultat[$flore.'_rem']);
}
} elseif (strrpos($flores,'belge') !== false) {
if (preg_match('/^([0-9]+) (R|S)?$/', $valeur, $match)) {
if (isset($match[2])) $type = ($match[2] == 'R') ? 'taxons' : 'synonyme';
$this->table_retour[$num_nom][$flore]['page'] = $match[1];
$this->table_retour[$num_nom][$flore]['type'] = $type;
$this->table_retour[$num_nom][$flore]['nom_flore'] = $this->getNomCompletFlore($flore);
$this->table_retour[$num_nom][$flore]['nom_sci'] = $nom_sci;
}
}
}
 
//+---------------------concerne les resultats pour des requetes de type /noms avec ou sans paramètres-------+
 
public function formaterNoms($resultat) {
if ($this->parametres['retour.format'] == 'oss') {
$reponse = $this->formaterEnOss($resultat); //Ds CommunNomsTaxons.php
} else {
$reponse = $this->formaterEnJsonMax($resultat);
}
return $reponse;
}
 
public function formaterEnJsonMax($resultat) {
$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
 
// TODO : améliorer le tri des résultats
// ATTENTION : ce comportement est étrange
$masque = $this->recupererMasquePrincipal();
if (isset($masque) && !isset($this->parametres['retour.tri'])) {
// fonction du pauvre pour palier aux "." remplacés accidentellement par des "_"
$index = str_replace('masque_','masque.',$masque[0]);
//$resultat = $this->trierRechercheFloue($this->parametres[$index], $resultat, $masque[1]);
}
 
$table_retour_json['entete'] = $this->remplirJsonEntete();
$table_retour_json['resultat'] = $this->remplirJsonResultat($resultat);
return $table_retour_json;
}
 
public function remplirJsonResultat($resultat) {
$champs = null;
if (array_key_exists('retour.champs', $this->parametres)) {
$champs = explode(',', $this->parametres['retour.champs']);
}
 
$noms = array();
foreach ($resultat as $tab) {
$this->table_retour = array();
$num = $tab['num_nom'];
$this->afficherNomHrefRetenu($tab, $num); // ajoute le nom_sci, href et si le nom est retenu dans $this->table_retour
$retour = $this->table_retour;
$this->table_retour = array();
if ($champs != null) {
$reponse_id = $this->formaterId($tab);
$this->table_retour = array();
$this->ajouterChampsPersonnalises($champs, $reponse_id);
$retour = array_merge($retour, $this->table_retour);
}
$noms[$num] = $retour;
}
 
return $noms;
}
 
public function remplirJsonEntete() {
$entete = array();
if (isset($this->masque)) {
$this->table_retour['masque'] = implode('&', $this->masque);
}
parent::afficherEnteteResultat('/'.$this->service);
return $this->table_retour;
}
}
?>
/tags/v5.0-agropyraie-20130830/services/modules/0.1/bdtxa/Taxons.php
New file
0,0 → 1,520
<?php
 
// declare(encoding='UTF-8');// ou ISO-8859-15
/**
* Description :
* Classe Taxons.php permettant de fournir des informations sur les noms scientifiques retenu.
* Si l'url finit par /taxons on retourne une liste de noms latin et leurs identifiants (seulement les 100 premeiers noms par défaut).
* L'url peut contenir des paramètres optionnels passés après le ? : /taxons?param1=val1&param2=val2&...
*
* Les paramètres de requête disponibles sont : masque, recherche, rang, distinct, retour.format, nl.format,
* nl.structure, navigation.depart et navigation.limite.
*
* Encodage en entrée : utf8
* Encodage en sortie : utf8
* @package framework-v3
* @author Jennifer Dhé <jennifer.dhe@tela-botanica.org>
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
* @version 1.0
* @copyright 1999-${year} Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
*/
 
 
class Taxons extends CommunNomsTaxons {
/** Permet de stocker la requete formulée taxons | taxons/#id | taxons/#id/#champ+#champ ...*/
protected $format_reponse = 'taxons';
protected $service = 'taxons';
protected $requete_champ = 'num_nom, nom_sci, num_nom_retenu, num_tax as num_taxonomique ';
protected $requete_condition = null;
protected $requete_group_by = ' ';
/** Permet de stocker les limite de la requete SQL (par défaut seul les 100 premiers résultats seront retournés).*/
protected $limite_requete = array('depart' => 0, 'limite' => 100);
protected $num_nom_taxon; //Stocke le num_nom du nom retenu du num_nom recherché
protected $presence_num_tax = true;
public function consulter($ressources, $parametres) {
return parent::consulter($ressources, $parametres);
}
public function traiterParametresSpecifiques() {
$this->requete_condition[] = 'num_nom = num_nom_retenu';
foreach ($this->parametres as $param => $val) {
switch ($param) {
case 'masque' :
$this->ajouterFiltreMasque('nom_sci', $val);
break;
case 'masque.nt' :
$this->requete_condition[] = "num_tax IN ($val)";
$this->masque[] = "num_tax=$val";
break;
case 'masque.rg':
$this->requete_condition[] = 'rang = '.$this->getBdd()->proteger($val);
$this->masque[] = "rang=$val";
break;
}
}
}
//------------------------------------------Fonction ressources---------------------------------------------------------------------
public function gererNumTax() {
if (!in_array('num_taxonomique', $this->champs_table)) {
$this->presence_num_tax = false;
$this->requete_champ = str_replace(', num_tax ', '', $this->requete_champ);
} else {
$this->presence_num_tax = true;
}
}
public function traiterRessourcesIdentifiant() {
$this->format_reponse = 'taxons/id';
$this->traiterRessourceNtId();
$this->num_nom_taxon = $this->recupererNumNomTaxon(); //on recupere le taxon correspondant au num_nom recherché
if ($this->entete_http == '') {
$this->requete_condition[0] = 'num_nom = '.$this->getBdd()->proteger($this->num_nom_taxon);
if (isset($this->ressources[1]) && !empty($this->ressources[1])) {
//---------------- requete de type taxons/#id/#champ+#champ--------------------------------------
if ($this->ressources[1] != 'relations') { // SELECT *, nom_sci FROM bftfx_v2_00 WHERE num_nom = X;
$this->requete_champ = ' *, nom_sci ';
$this->format_reponse .= '/champ';
//---------------- requete de type taxons/#id/relations/#relation--------------------------------
} elseif ($this->ressources[1] == 'relations') {
$this->traiterRessourceIdRelations();
} else {
$e = 'Erreur dans votre requête </br> Ressources disponibles : <br/>
<li> #id/relations </li> <li> #id/#champ+#champ </li> <li> #id/relations </li>
<li> #id/relations/inferieurs </li> <li> #id/relations/superieurs </li>';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
}
} else { //--------------- requete de type taxons/#id-----------------------------------------------------
$this->requete_champ = ' *, nom_sci ';
}
}
}
public function traiterRessourceNtId() {
if (strrpos($this->ressources[0], 'nt:') !== false) {
if ($this->presence_num_tax) {
// SELECT num_nom FROM bdtfx_v2_00 WHERE num_nom = num_nom_retenu AND num_taxonomique = X;
$this->requete_condition[0] = ' num_tax = '
.str_replace('nt:', '', $this->ressources[0]).' ';
} else {
$e = 'Erreur dans votre requête : </br> Le numéro taxonomique n\'existe pas dans ce projet';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
}
} else {
// SELECT num_nom FROM bdtfx_v2_00 WHERE num_nom = (SELECT num_nom_retenu FROM bdtfx_v2_00 WHERE num_nom = X);
$this->requete_condition[0] = 'num_nom = '.$this->ressources[0];
}
}
/** Permet de récupérer le num_nom du taxon recherché. Soit le numéro taxonomique est demandé (avec nt: )
* soit un num_nom dont on recherche le num_nom_retenu */
public function recupererNumNomTaxon() {
$identifiant = '';
if ($this->entete_http == '') {
//on récupere l'identifiant du taxon correspondant au num_nom ou num_taxonomique demandé pour pouvoir l'afficher
$req_tax = 'SELECT num_nom_retenu FROM '.$this->table.' WHERE '.$this->requete_condition[0];
$res_tax = $this->getBdd()->recuperer($req_tax);
//on recherche ensuite les identifiants des taxons supérieurs ou inférieurs
if ($res_tax && $res_tax != '') {
$identifiant = $res_tax['num_nom_retenu'];
} else {
$e = 'Le numéro de taxon ou l\'identifiant de nom correspondant au num_nom '
.$this->ressources[0].' n\'existe pas dans la base.';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE, $e);
Debug::printr($req_tax);
}
}
return $identifiant;
}
public function traiterRessourceIdRelations() {
//----------------- requete de type taxons/#id/relations-------------------------------------------
// SELECT *, nom_sci FROM bftfx_v2_00 WHERE num_nom = X;
$this->format_reponse .= '/relations';
if (isset($this->ressources[2]) && !empty($this->ressources[2])) {
//------------- requete de type taxons/#id/relations/#relation--------------------------------
switch ($this->ressources[2]) {
case 'superieurs' :
$rel = 'recupererIdSup';
$this->format_reponse .= '/superieurs';
$this->traiterRessourceIdRelationInfSup($rel);
break;
case 'inferieurs' :
$rel = 'recupererIdInf';
$this->format_reponse .= '/inferieurs';
$this->traiterRessourceIdRelationInfSup($rel);
break;
case 'hierarchie' :
$rel = 'recupererIdHierarchie';
$this->format_reponse .= '/hierarchie';
$this->traiterRessourceIdRelationHierarchie($rel);
break;
default :
$e = 'Erreur dans votre requête </br> Ressources disponibles : <br/>
<li> taxons/#id/relations </li><li> #id/relations/inferieurs </li>
<li> #id/relations/superieurs </li>';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
break;
}
}
}
public function traiterRessourceIdRelationHierarchie($rel) {
//Appel de la fct récupérerIdSup ou recupererIdInf : retourne les num_nom des noms inferieurs ou superieurs
$res_relation = $this->$rel();
//analyse du résultat retourné par la requete de recherche des identifiants correspondant aux taxons inf|sup :
if ($res_relation == '') {
//dans le cas ou la requete comporte des erreurs
$e = 'Fct traiterRessourceIdRelationInfSup : La requête forme comporte une erreur!';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE, $e);
} elseif ($res_relation) {
//dans le cas ou une ou plusieurs relations est retournée, on récupère les identifiants ss la forme (id, id, id)
foreach ($res_relation as $ligne) $res[] = $ligne['num_nom'];
$res = implode(',',$res);
$this->requete_condition[0] = "num_nom IN ($res)";
$this->requete_champ .= ', rang, num_tax_sup ';
} else { //dans le cas ou aucune relation n'existe
$res = array($this->num_nom_taxon => null);
$this->corps_http = json_encode($res);
$this->entete_http = RestServeur::HTTP_CODE_OK;
}
}
public function recupererIdHierarchie() {
$req_relation = 'SELECT num_nom FROM '.$this->table.' '.
' WHERE hierarchie LIKE CONCAT('.
'(SELECT hierarchie FROM '.
$this->table.' '.
'WHERE num_nom = '.$this->getBdd()->proteger($this->num_nom_taxon).')'.
', '.$this->getBdd()->proteger($this->num_nom_taxon.'-%').
')';
$res_relation = $this->getBdd()->recupererTous($req_relation);
return $res_relation;
}
public function traiterRessourceIdRelationInfSup($rel) {
//Appel de la fct récupérerIdSup ou recupererIdInf : retourne les num_nom des noms inferieurs ou superieurs
$res_relation = $this->$rel();
//analyse du résultat retourné par la requete de recherche des identifiants correspondant aux taxons inf|sup :
if ($res_relation == '') { //dans le cas ou la requete comporte des erreurs
$e = 'Fct traiterRessourceIdRelationInfSup : La requête forme comporte une erreur!';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE, $e);
} elseif ($res_relation) {
//dans le cas ou une ou plusieurs relations est retournée, on récupère les identifiants ss la forme (id, id, id)
foreach ($res_relation as $ligne) $res[] = $ligne['num_nom'];
$res = implode(',',$res);
$this->requete_condition[0] = "num_nom IN ($res)";
$this->requete_champ .= ', rang, num_tax_sup ';
} else { //dans le cas ou aucune relation n'existe
$res = array($this->num_nom_taxon => null);
$this->corps_http = json_encode($res);
$this->entete_http = RestServeur::HTTP_CODE_OK;
}
}
public function recupererIdInf() {
//SELECT num_nom FROM bfdtx_v2_00 WHERE num_tax_sup = (SELECT num_nom FROM bdtfx_v2_00 WHERE num_nom = X);
$req_relation = 'SELECT num_nom FROM '.$this->table
.' WHERE num_tax_sup = (SELECT num_nom FROM '
.$this->table
.' WHERE '.implode(' AND ', $this->requete_condition).')';
$res_relation = $this->getBdd()->recupererTous($req_relation);
return $res_relation;
}
public function recupererIdSup() {
//SELECT num_nom FROM bfdtx_v2_00 WHERE num_nom = (SELECT num_tax_sup FROM bdtfx_v2_00 WHERE num_nom = X);
$req_relation = 'SELECT num_tax_sup as num_nom FROM '.$this->table
.' WHERE '.implode(' AND ', $this->requete_condition);
$res_relation = $this->getBdd()->recupererTous($req_relation);
return $res_relation;
}
 
public function traiterRessourceStatsInitiales() {
// SELECT count(nom_sci) as nb, rang, left(nom_sci, 2) as lettre FROM bdtfx_v2_00 GROUP BY rang, left(nom_sci, 2);
$this->format_reponse = 'taxons/stats/initiales';
$this->requete_champ = 'count(nom_sci) as nb, rang, left(nom_sci, 2) as lettre ';
$this->requete_group_by = ' GROUP BY rang, left(nom_sci, 2) ';
}
public function traiterRessourceStatsRangs() {
// SELECT count(*) as nombre, rang FROM bdtfx_v2_00 [WHERE rang = 290] GROUP BY rang ORDER BY rang;
$this->format_reponse = 'taxons/stats/rangs';
$this->requete_champ = 'count(*) as nombre, rang ';
$this->requete_group_by = ' GROUP BY rang ORDER BY rang ';
}
public function traiterRessourceStatsAnnees() {
// SELECT count(*) as nombre, annee FROM bdtfx_v2_00 GROUP BY annee ORDER BY annee;
$this->format_reponse = 'taxons/stats/annees';
$this->requete_champ = 'count(*) as nombre, annee ';
$this->requete_group_by = ' GROUP BY annee ORDER BY annee ';
}
//-----------------------------FONCTIONS DASSEMBLAGE DE LA REQUETE-----------------------------------------------------
public function assemblerLaRequete() {
if ($this->format_reponse != 'taxons/stats/initiales') {
$this->mettreAuFormat(); //on remplace les nom_sci par les nom_sci_html
}
$requete = ' SELECT '.$this->requete_champ.
' FROM '.$this->table
.$this->retournerRequeteCondition()
.$this->requete_group_by
.$this->formerRequeteLimite();
return $requete;
}
public function formerRequeteLimite() {
if ($this->format_reponse != 'taxons' && $this->format_reponse != 'taxons/id/relations/homonymie') {
$this->requete_limite = '';
} elseif (($depart = $this->limite_requete['depart']) > ($this->total_resultat = $this->recupererTotalResultat())) {
$this->limite_requete['depart'] = (($this->total_resultat - $this->limite_requete['limite']) < 0) ? 0 : ($this->total_resultat - $this->limite_requete['limite']);
$this->requete_limite = ' LIMIT '.$this->limite_requete['depart'].', '.$this->limite_requete['limite'];
} else {
$this->requete_limite = ' LIMIT '.$this->limite_requete['depart'].', '.$this->limite_requete['limite'];
}
return $this->requete_limite;
}
public function retournerRequeteCondition() {
$condition = '';
if ($this->requete_condition) {
$condition = ' WHERE '.implode(' AND ', $this->requete_condition);
}
return $condition;
}
public function recupererTotalResultat() {
$requete = 'SELECT count(*) as nombre FROM '.$this->table.$this->retournerRequeteCondition().$this->requete_group_by;
$res = $this->getBdd()->recuperer($requete);
if ($res) {
$total = $res['nombre'];
}
return $total;
}
 
//-------------------------FONCTIONS DE FORMATION DU RESULTAT-----------------------------------------------------------
/** Permet de récupérer le résultat à retourner propre à chaque requete et de l'encoder en json*/
public function retournerResultatFormate($resultat, $version) {
switch ($this->format_reponse) {
case 'taxons/id' ://ds CommunNomsTaxons
$reponse = $this->formaterId($resultat[0]);
break;
case 'taxons/id/champ' ://ds CommunNomsTaxons
$reponse = $this->formaterIdChamp($resultat[0]);
break;
case 'taxons/id/relations' :
$reponse = $this->formaterIdRelations($resultat[0],$version);
break;
case 'taxons/id/relations/superieurs' :
$reponse = $this->formaterIdSuperieur($resultat, $version);
break;
case 'taxons/id/relations/inferieurs' :
$reponse = $this->formaterIdInferieur($resultat);
break;
case 'taxons/id/relations/hierarchie' :
// le formatage de la hiérarchie est identique aux relations inférieures
$reponse = $this->formaterIdInferieur($resultat);
break;
case 'taxons/stats/annees' : //ds CommunNomsTaxons
$reponse = $this->formaterStatsAnnee($resultat);
break;
case 'taxons/stats/rangs' ://ds CommunNomsTaxons
$reponse = $this->formaterStatsRang($resultat);
break;
case 'taxons/stats/initiales' ://ds CommunNomsTaxons
$reponse = $this->formaterStatsInitiales($resultat);
break;
case 'taxons' :
$reponse = $this->formatertaxons($resultat);
break;
}
return $reponse;
}
//----------------------concerne les resultats pour des requetes de type /noms avec ou sans paramètres--------------
public function formaterTaxons($resultat) {
if ($this->parametres['retour.format'] == 'oss') {
$reponse = $this->formaterEnOss($resultat);
} else {
$reponse = $this->formaterEnJsonMax($resultat);
}
return $reponse;
}
public function formaterEnJsonMax($resultat) {
//print_r($resultat);
$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
$masque = $this->recupererMasquePrincipal();
if (isset($masque)) $resultat = $this->trierRechercheFloue($this->parametres[$masque[0]], $resultat, $masque[1]);
if (isset($this->masque)) $this->table_retour['masque'] = implode('&', $this->masque);
$this->afficherEnteteResultat('/'.$this->service);
$table_retour_json['entete'] = $this->table_retour;
$this->table_retour = array();
//on remplit la table $table_retour_json['resultat']
$tab_tax_inf = $this->recupererListeTaxonInf($resultat);
foreach ($resultat as $tab) {
$num = $tab['num_nom'];
if (isset($this->parametres['masque.nt'])) $this->afficherDonnees('num_taxonomique', $tab['num_taxonomique']);
$this->afficherNomHrefRetenu($tab, $num);
$this->afficherTaxonInfNb($num, $tab_tax_inf);
$resultat_json[$num] = $this->table_retour;
$this->table_retour = array(); //on vide le tableau table_retour
}
$table_retour_json['resultat'] = $resultat_json;
return $table_retour_json;
}
//--------------------concerne les resultats pour des requetes de type noms/id----------------------------------------
 
public function formaterIdRelations($resultat, $version) {
$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
$this->resultat_req = $resultat;
$retour_id_rel = array ('entete' => array()); //on initialise pr que l'entete apparaisse en premier
 
$superieurs = $this->ajouterRelations('superieurs'); //, $version);
if (isset($superieurs)) $retour_id_rel['resultat']['superieurs'] = $superieurs;
$inferieurs = $this->ajouterRelations('inferieurs', $version);
if (isset($inferieurs)) $retour_id_rel['resultat']['inferieurs'] = $inferieurs;
if (!isset($retour_id_rel['resultat'])) { //on renvoit un tableau null si il n'existe aucune relations
$retour_id_rel = 'null';
} else { //on rajoute l'entete si des relations existent
$this->afficherDonnees('num_nom', $this->num_nom_taxon); //$this->afficherEnteteResultat($resultat, '/'.$this->service.'/'.$this->ressources[0].'/relations/synonymie');
$retour_id_rel['entete'] = $this->table_retour;
$this->table_retour = array();
}
return $retour_id_rel;
}
public function ajouterRelations($relation, $version) {
$version = str_replace(Config::get('bdd_table').'_', '', $version);
$res = null;
$taxon = $this->num_nom_taxon;
$parametres_url = '';
if ($this->parametres != array()) $parametres_url = '?'.http_build_query($this->parametres, '', '&');
$url = Config::get('url_service').'/'
.$this->service.'/'.$version.'/'
.$this->ressources[0].'/relations/'
.$relation.$parametres_url;
$relation = $this->consulterHref($url);
if (isset($relation->resultat)) {
$res = $relation->resultat;
} elseif (isset($relation->$taxon)) { //pour les relations inf et sup
$res = $relation->$taxon;
}
return $res;
}
public function formaterIdSuperieur($resultat, $version) {
$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
$tab_relation = null; //si il n'existe aucune relation
$taxon_sup_traites = array();
if (($resultat) != '' ) {
//on recupere d'abord les rangs supérieurs
$sup = $resultat[0];
do {
$sup = $this->recupererIdSuperieur($sup['num_tax_sup'], $version);
if(!in_array($sup['num_nom'], $taxon_sup_traites)) {
$taxon_sup_traites[] = $sup['num_nom'];
} else {
$sup = null;
}
if ($sup['rang'] == '0') $sup['rang'] = '10'; //erreur dans la base
if (isset($sup)) $resultat[] = $sup;
} while ($sup != null);
krsort($resultat);
//on les affiche ensuite
foreach ($resultat as $tab) {
$this->resultat_req = $tab;
$num = $tab['num_nom'];
$this->afficherNomHrefRetenu($tab, $num);
$this->afficherDonnees('rang', $tab['rang']);
$tab_inf[$num] = $this->table_retour;
$tab_inf[$num]['num_nom'] = $tab['num_nom'];
$this->table_retour = array();
}
$tab_relation[$this->num_nom_taxon] = $tab_inf;
}
return $tab_relation;
}
public function recupererIdSuperieur($id, $version) {
$req = 'SELECT num_nom, num_nom_retenu, num_tax_sup, rang, nom_sci FROM '
.$version.' WHERE num_nom = '.$this->getBdd()->proteger($id);
$res = $this->getBdd()->recupererTous($req);
if ($res) {
$resultat = $res[0];
} else {
$resultat = null; //on return null si il n'y a pas de taxon superieur
}
return $resultat;
}
public function formaterIdInferieur($resultat) {
// Attention à l'ordre, on doit d'abord récupérer correpondance_champs avant champs_api
$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
$tab_relation = null;
if (($resultat) != array()) {
foreach ($resultat as $tab) {
$this->resultat_req = $tab;
$num = $tab['num_nom'];
$this->afficherNomHrefRetenu($tab, $num);
$this->afficherDonnees('rang', $tab['rang']);
$tab_inf[$num] = $this->table_retour;
$tab_inf[$num]['nom_sci'] = $tab['nom_sci'];
$tab_inf[$num]['num_nom'] = $tab['num_nom'];
$this->table_retour = array();
}
$tab_relation[$this->num_nom_taxon] = $tab_inf;
}
return $tab_relation;
}
public function afficherTaxonInfNb($num, $tab_tax_inf) {
foreach ($tab_tax_inf as $taxNb) {
if ($taxNb['num_tax_sup'] == $num) {
$this->table_retour['taxon_inferieur_nbre'] = $taxNb['nb'];
}
}
if (!isset($this->table_retour['taxon_inferieur_nbre'])) {
$this->table_retour['taxon_inferieur_nbre'] = '0';
}
}
public function recupererListeTaxonInf($resultat) {
// SELECT num_tax_sup, count(*) as nb FROM bdtfx_v2_00 WHERE num_tax_sup IN (id, id, id) AND num_nom = num_nom_retenu GROUP BY num_tax_sup';
foreach ($resultat as $tab) {
$tab_num[] = $tab['num_nom']; //on regroupe ici les id des taxons dont on cherche le nb de taxon inf
}
$req = 'SELECT num_tax_sup, count(*) as nb FROM '.$this->table
.' WHERE num_tax_sup IN ('.implode(',',$tab_num)
.') AND num_nom = num_nom_retenu GROUP BY num_tax_sup';
$res = $this->getBdd()->recupererTous($req);
if ($res) {
$resultat = $res;
} else {
$resultat = array(); //on retourne un tableau vide s'il n'y a pas de taxon inférieurs
}
return $resultat;
}
}
 
?>
/tags/v5.0-agropyraie-20130830/services/modules/0.1/bdtxa/Cartes.php
New file
0,0 → 1,90
<?php
// declare(encoding='UTF-8');
/**
* Classe implémentant l'API d'eFlore Cartes pour le projet bdtxa.
*
* @see http://www.tela-botanica.org/wikini/eflore/wakka.php?wiki=EfloreApi01Cartes
*
* @package eFlore/services
* @author Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org>
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
* @version 1.0
* @copyright 1999-2012 Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
*/
// TODO : Config et Outils sont des classes statiques qui doivent poser des pb pour les tests...
class BdtxaCartes {
 
private $parametres = array();
private $ressources = array();
 
public function consulter($ressources, $parametres) {
$this->parametres = $parametres;
$this->ressources = $ressources;
 
$this->analyserRessources();
$resultat = $this->executerSousService();
 
return $resultat;
}
 
private function analyserRessources() {
$nbreRessources = count($this->ressources);
if ($nbreRessources == 0) {
$message = "A implémenter : carte proportionnelle ensemble des infos";
$code = RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE;
throw new Exception($message, $code);
} else if ($nbreRessources == 1) {
if ($this->etreRessourceIdentifiants(0)) {
$this->sousService = 'Taxons';
} else if ($this->etreRessourceLegende(0)) {
$message = "A implémenter : légende carte proportionnelle ensemble des infos";
$code = RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE;
throw new Exception($message, $code);
} else {
$message = "La ressource n°1 '{$this->ressources[0]} indiquée n'est pas valable.";
$code = RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE;
throw new Exception($message, $code);
}
} else if ($nbreRessources == 2) {
if ($this->etreRessourceIdentifiants(0) && $this->etreRessourceLegende(1)) {
$this->sousService = 'Legende';
}
}
}
 
private function etreRessourceIdentifiants($position) {
$ok = true;
if (isset($this->ressources[$position])) {
$ids = $this->ressources[$position];
$projetPattern = '(?:(?:(?:[A-Za-z0-9]+\.)?(?:nn|nt)?:)?(?:[0-9]+,)*[0-9]+)';
$patternComplet = "/^$projetPattern(?:;$projetPattern)*$/i";
$ok = preg_match($patternComplet, $ids) ? true : false;
}
return $ok;
}
 
private function etreRessourceLegende($position) {
$ok = true;
if (isset($this->ressources[$position])) {
$legende = $this->ressources[$position];
$ok = ($legende == 'legende') ? true : false;
}
return $ok;
}
 
private function executerSousService() {
if (isset($this->sousService)) {
$classe = $this->sousService.'Cartes';
require_once dirname(__FILE__).DS.'cartes'.DS.$classe.'.php';
$sousService = new $classe(new Conteneur());
$resultat = $sousService->consulter($this->ressources, $this->parametres);
} else {
$message = "L'analyse des ressources n'a pu aboutir à déterminer le sous service à executer.";
$code = RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE;
throw new Exception($message, $code);
}
return $resultat;
}
}
?>
/tags/v5.0-agropyraie-20130830/services/modules/0.1/bdtxa/CommunNomsTaxons.php
New file
0,0 → 1,926
<?php
// declare(encoding='UTF-8');
/**
* Description :
* Classe CommunNomsTaxons.php
* Encodage en entrée : utf8
* Encodage en sortie : utf8
* @package framework-v3
* @author Jennifer Dhé <jennifer.dhe@tela-botanica.org>
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
* @version 1.0
* @copyright 1999-2011 Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
*/
 
 
abstract class CommunNomsTaxons extends Commun {
 
/** Tableau de correspondance entre les noms des champs et les codes de l'ontologie.*/
private $relationsChampsCodesOntologie = null;
protected $table_retour; //Permet de stocker le tableau de résultat (non encodé en json)
protected $resultat_req; // Permet de stocker le résultat de la requete principale.
protected $compo_nom = null; //Stocke sous forme de tableau les composant du nom à ajouter au nom scientifique
protected $table;// Nom de la table dans laquelle on récupèrera les données dans les requetes SQL
protected $total_resultat = null;
/** Stocke le service appelé correspondant. Est utilisé principalement lors de l'affichage du href d'un synonyme
(ex id=12, basionyme num 25 est un synonyme) dans le service taxon */
protected $service_href = null;
protected $erreursParametres = null;
protected $sans_nom_sci = array('gen','sp','ssp','fam','au_ss','bib_ss');
private $bib_traitees = array();
private $ontologie = array();
 
//+------------------------------- PARAMÈTRES ---------------------------------------------------------------+
 
public function traiterParametres() {
$this->definirParametresParDefaut();
$this->verifierParametres();
 
if (isset($this->parametres) && count($this->parametres) > 0) {
foreach ($this->parametres as $param => $val) {
switch ($param) {
case 'ns.structure' :
$this->remplirTableCompositionNom($val);
if (in_array($val,$this->sans_nom_sci)){
$this->requete_champ = implode(', ',$this->compo_nom);
}else {
$this->requete_champ .= ' ,'.implode(', ',$this->compo_nom);
}
break;
case 'navigation.depart' :
$this->limite_requete['depart'] = $val;
break;
case 'navigation.limite' :
$this->limite_requete['limite'] = $val;
break;
}
}
$this->traiterParametresSpecifiques();
}
}
 
protected function definirParametresParDefaut() {
if (empty($this->parametres['recherche'])) {
$this->parametres['recherche'] = 'stricte';
}
if (empty($this->parametres['ns.format'])) {
$this->parametres['ns.format'] = 'txt';
}
if (empty($this->parametres['retour.format'])) {
$this->parametres['retour.format'] = 'max';
}
if (empty($this->parametres['ns.structure']) &&
$this->parametres['retour.format'] != 'oss') {
$this->parametres['ns.structure'] = 'au,an,bib';
}
}
 
 
public function verifierParametres() {
//$this->verifierParametresAPI();
 
$this->verifierParametre('recherche', 'stricte|floue|etendue|complete');
$this->verifierParametre('ns.format', 'htm|txt');
$this->verifierParametre('retour.format', 'min|max|oss|perso');
$this->verifierParametreAvecValeurMultipe('ns.structure', 'an|au|bib|ad|gen|sp|ssp|fam|au_ss|bib_ss');
 
/*if (count($this->erreursParametres) > 0) {
$m = 'Erreur dans votre requête : '.implode('<br/>', $this->erreursParametres);
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $m);
}*/
}
 
public function verifierParametresAPI() {
$parametresApi = $this->recupererTableauConfig('parametresAPI');
while (!is_null($parametre = key($this->parametres))) {
if (!in_array($parametre, $parametresApi)) {
$this->erreursParametres[] = "Le paramètre '$parametre' n'est pas pris en compte par cette version de l'API.";
}
next($this->parametres);
}
}
 
public function verifierParametre($parametre, $valeursPermises) {
if (isset($this->parametres[$parametre]) && !empty($this->parametres[$parametre])) {
$valeur = $this->parametres[$parametre];
$this->verifierValeursPermises($parametre, $valeur, $valeursPermises);
}
}
 
public function verifierParametreAvecValeurMultipe($parametre, $valeursPermises) {
if (isset($this->parametres[$parametre]) && !empty($this->parametres[$parametre])) {
$valeursConcatenees = $this->parametres[$parametre];
$valeurs = explode(',', $valeursConcatenees);
foreach ($valeurs as $valeur) {
$this->verifierValeursPermises($parametre, $valeur, $valeursPermises);
}
}
}
 
private function verifierValeursPermises($parametre, $valeur, $valeursPermises) {
if (!in_array($valeur, explode('|', $valeursPermises))) {
$this->erreursParametres[] = "Le paramètre '$parametre' ne peut pas prendre la valeur '$valeur'. Valeurs permises : $valeursPermises";
}
}
 
public function traiterParametresCommuns() {
 
}
 
public function ajouterFiltreMasque($nom_champ, $valeur) {
$valeur = explode(',',$valeur);
$conditions = array();
if ($nom_champ == 'annee' || $nom_champ == 'rang') {
foreach ($valeur as $val) {
$conditions[] = "$nom_champ = ".$this->getBdd()->proteger($val);
}
} else {
if ($this->parametres['recherche'] == 'etendue') {
foreach ($valeur as $val) {
$val = $this->modifierValeur($val);
$conditions[] = "$nom_champ LIKE ".$this->getBdd()->proteger($val);
}
 
} elseif ($this->parametres['recherche'] == 'floue') {
foreach ($valeur as $val) {
$val = $this->getBdd()->proteger($val);
$conditions[] = "( SOUNDEX($nom_champ) = SOUNDEX($val))".
" OR ( SOUNDEX(REVERSE($nom_champ)) = SOUNDEX(REVERSE($val)))";
}
} else {
foreach ($valeur as $val) {
$conditions[] = "$nom_champ LIKE ".$this->getBdd()->proteger($val);
}
}
}
$this->requete_condition[]= '('.implode(' OR ', $conditions ).')';
$this->masque[$nom_champ] = $nom_champ.'='.implode(',',$valeur);
}
 
private function modifierValeur($valeur) {
$valeur = $this->remplacerCaractereHybrideEtChimere($valeur);
$valeur = $this->preparerChainePourRechercheEtendue($valeur);
return $valeur;
}
 
private function remplacerCaractereHybrideEtChimere($valeur) {
$caracteres = array('×', '%D7', '+', '%2B');
$remplacements = array('x ','x ', '+', '+');
$valeur = str_replace($caracteres, $remplacements, $valeur);
return $valeur;
}
 
private function preparerChainePourRechercheEtendue($valeur) {
$valeur = str_replace(' ', '% ', trim($valeur));
$valeur = $valeur.'%';
return $valeur;
}
 
//+-------------------------------Fonctions d'analyse des ressources-------------------------------------+
 
private function etreRessourceId() {
$ok = false;
if ($this->estUnIdentifiant() && count($this->ressources) == 1) {
$ok = true;
}
return $ok;
}
 
public function traiterRessources() {
if (isset($this->ressources) && count($this->ressources) > 0) {
if ($this->ressources[0] == 'relations') {
$this->traiterRessourceRelations();
} elseif ($this->estUnIdentifiant()) { //l'identifiant peut etre de type /#id ou /nt:#id
$this->traiterRessourcesIdentifiant(); // dans le service noms ou taxons
} elseif ($this->ressources[0] == 'stats') { //ressource = noms/stats
$this->traiterRessourcesStats();
} else {
$e = 'Erreur dans votre requete </br> Ressources disponibles : <br/>
<li> /'.$this->service.'/#id (id : L\'identifiant du nom rechercher)</li>
<li> /'.$this->service.'/nt:#id (id : Numero du taxon recherche)</li>
<li> /'.$this->service.'/stats </li>';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
}
}
}
 
public function traiterRessourcesStats() {
$this->format_reponse = $this->service.'/stats';
 
$e = "Erreur dans votre requête </br> Ressources disponibles : $this->service/stats/[annees|rangs|initiales]";
if (isset($this->ressources[1]) && !empty($this->ressources[1])) {
switch ($this->ressources[1]) {
case 'annees' :
$this->traiterRessourceStatsAnnees();
break;
case 'rangs' :
$this->traiterRessourceStatsRangs();
break;
case 'initiales' :
$this->traiterRessourceStatsInitiales();
break;
default :
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
break;
}
} else {
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
}
}
 
/** Vérifie si la première valeur de la table de ressource est un identifiant :
* un numerique ou un numéro taxonomique sous la forme nt:xx */
public function estUnIdentifiant() {
return (is_numeric($this->ressources[0]) || (strrpos($this->ressources[0],'nt:') !== false
&& is_numeric(str_replace('nt:','',$this->ressources[0]))));
}
 
//+------------------------------------------------------------------------------------------------------+
// Fonction d'analyse des parametres
 
/** Permet de remplir le tableau compo_nom. Il comprendra en fct du paramètre ns.structure les éléments à rajouter
* au nom_sci (annee, auteur, biblio ou addendum). */
public function remplirTableCompositionNom($valeur) {
$structure_nom = explode(',', $valeur);
foreach ($structure_nom as $structure) {
$structure = trim($structure);
$patterns = array('/^an$/', '/^au$/', '/^bib$/', '/^ad$/', '/^sp$/', '/^gen$/', '/^ssp$/','/^fam$/',
'/^au_ss$/','/^bib_ss$/');
$champs = array('annee', 'auteur', 'biblio_origine', 'nom_addendum', 'epithete_sp', 'genre',
'epithete_infra_sp','famille','auteur', 'biblio_origine');
 
// avec str_replace() 'sp' est inclu dans 'ssp', et la conversion pour 'ssp' est mauvaise
$this->compo_nom[$structure] = preg_replace($patterns, $champs, $structure);
}
}
 
public function mettreAuFormat() {
if ($this->parametres['ns.format'] == 'htm') {
if (strrpos($this->requete_champ, 'nom_sci_html as nom_sci') === false) {
$this->requete_champ = str_replace('nom_sci', 'nom_sci_html as nom_sci', $this->requete_champ);
}
}
}
 
//+------------------------------------------------------------------------------------------------------+
// Fonctions de formatage
 
/** Fonction permettant de creer la table dont le nom est passé en paramètre (champs_api, champs_bdtfx,
* correspondance_champs...). Les données de chaque table sont présentes dans le fichier de configuration config.ini
* @param String $table : Peut contenir plusieurs nom de table dont on souhaite récupérer les données : table,table,table. */
public function recupererTableSignification($table) {
$tables = explode(',', $table);
foreach ($tables as $tab) {
if ($tab == 'champs_comp') {
$champ_bdnff_api = array_keys($this->champs_api); //on recupère le nom des champ ds la bdd
$this->champs_comp = array_diff($this->champs_table, $champ_bdnff_api);
} elseif ($tab == 'champs_api') {
foreach ($this->correspondance_champs as $key => $val) {
preg_match('/(hybride[.]parent_0[12](?:[.]notes)?|nom_sci[.][^.]+|[^.]+)(?:[.](id|code))?/', $val, $match);
$val = $match[1];
$this->champs_api[$key] = $val;
}
} else {
$this->$tab = $this->recupererTableauConfig($tab);
}
}
}
 
public function formaterEnOss($resultat) {
$table_nom = array();
$oss = '';
foreach ($resultat as $tab) {
if (isset($tab['nom_sci']) ) {
if (!in_array($tab['nom_sci'], $table_nom)) {
$table_nom[] = $tab['nom_sci'];
$oss[] = $tab['nom_sci'].' '.$this->ajouterCompositionNom($tab);
}
}else {
$res = $this->ajouterCompositionNom($tab);
if($res) {
$oss[] = $res;
}
}
 
}
 
if (isset($this->masque)) $masque = implode('&', $this->masque);
else $masque = 'Pas de masque';
$table_retour_oss = array($masque, $oss);
return $table_retour_oss;
}
 
public function afficherEnteteResultat($url_service) {
$this->table_retour['depart'] = $this->limite_requete['depart'];
$this->table_retour['limite'] = $this->limite_requete['limite'];
$this->table_retour['total'] = $this->total_resultat;
$url = $this->formulerUrl($this->total_resultat, $url_service);
if (isset($url['precedent']) && $url['precedent'] != '') {
$this->table_retour['href.precedent'] = $url['precedent'];
}
if (isset($url['suivant']) && $url['suivant'] != '') {
$this->table_retour['href.suivant'] = $url['suivant'];
}
}
 
public function afficherNomHrefRetenu($tab, $num) {
$this->resultat_req = $tab;
$this->afficherDonnees('num_nom', $num);
if ($this->parametres['retour.format'] == 'min') { // sinon est affiché ds afficherDonnees(num_nom, $val) ci-dessus
$this->table_retour['nom_sci'] = $tab['nom_sci'];
$this->table_retour['nom_sci_complet'] = $tab['nom_sci'].' '.$this->ajouterCompositionNom($tab);
}
if ($tab['num_nom_retenu'] != '') {
$retenu = ($tab['num_nom_retenu'] == $num) ? 'true' : 'false';
} else {
$retenu = 'absent';
}
$this->table_retour['retenu'] = $retenu;
unset($this->table_retour['id']);
}
 
 
//+------------------------------------------------------------------------------------------------------+
// Fonction de formatage pour les services /#id/
 
public function formaterId($resultat) {
$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
$this->resultat_req = $resultat;
 
foreach ($resultat as $cle => $valeur) {
if ($valeur != '') {
$this->afficherDonnees($cle, $valeur);
}
}
if (isset($this->parametres['retour.champs']) && $this->format_reponse == 'noms/id') {
$retour = $this->table_retour;
$this->table_retour = array();
$champs = explode(',', $this->parametres['retour.champs']);
$this->ajouterChampsPersonnalises($champs, $retour);
}
unset($this->table_retour['href']);
return $this->table_retour;
}
 
public function formaterIdChamp($resultat) {
$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
$reponse_id = $this->formaterId($resultat);
$this->table_retour = array();
$champs = explode(' ', $this->ressources[1]);
$this->ajouterChampsPersonnalises($champs, $reponse_id);
return $this->table_retour;
}
 
protected function ajouterChampsPersonnalises($champs, $reponse_id) {
$champs_a_libeller = array('nom_retenu', 'rang', 'basionyme', 'hybride', 'hybride.parent_01',
'hybride.parent_02', 'presence', 'tax_sup', 'statut_origine', 'statut_culture', 'statut_introduction');
if (! is_null($champs) && is_array($champs) && count($champs) > 0) {
foreach ($champs as $champ) {
if ($this->verifierValiditeChamp($champ)) {
if (strrpos($champ, '.*') !== false) {
$this->afficherPointEtoile($champ, $reponse_id);
} elseif (in_array($champ, $champs_a_libeller)) {
$this->table_retour[$champ.'.libelle'] =
(isset($reponse_id[$champ.'.libelle'])) ? $reponse_id[$champ.'.libelle'] : null;
} else {
$champ = $this->trouverChampBddCorrespondant($champ);
$this->table_retour[$champ] = (isset($reponse_id[$champ])) ? $reponse_id[$champ] : null;
}
}
}
}
}
 
public function afficherPointEtoile($champ, $reponse) {
preg_match('/^([^.]+\.)\*$/', $champ, $match);
if ($match[1] == 'nom_sci') {
$this->afficherNomSciPointEpithete($this->resultat_req);
} else {
foreach ($reponse as $chp => $valeur) {
if (strrpos($chp, $match[1]) !== false) {
if ($valeur != '') {
$this->table_retour[$chp] = $valeur;
} else {
$this->table_retour[$chp] = null;
}
}
}
}
}
 
public function decomposerNomChamp($champ) {
$decomposition = false;
if (preg_match('/^(?:([^.]+\.parent_0[12]|[^.]+))(?:\.(.+))?$/', $champ, $match)) {
$radical_champ = $match[1];
$suffixe = (isset($match[2])) ? $match[2] : "";
$decomposition = array($radical_champ, $suffixe);
}
return $decomposition;
}
 
public function verifierValiditeChamp($champ) {
$decomposition = $this->decomposerNomChamp($champ);
$validite_ressource = true;
if ($decomposition) {
list($radical, $suffixe) = $decomposition;
$champs_complementaire = array('nom_retenu_complet', 'basionyme_complet');
// on verifie si le nom du champ existe bien
if (!$this->estChampApi($radical) && !$this->estChampComplementaire($radical)) {
if (!in_array($radical, $champs_complementaire)) {
$validite_ressource = false;
$e = 'Le champ "'.$radical.'" n\'existe pas dans la base. <br/><br/>';
$this->renvoyerErreur( RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
}
} elseif ($this->estUnPoint($champ)) {
$validite_ressource = $this->verifierValiditeSuffixe($suffixe, $radical);
}
}
return $validite_ressource;
}
 
public function estChampApi($radical_champ) {
$champ_api_ok = false;
if (in_array($radical_champ, $this->champs_api) || in_array($radical_champ, $this->correspondance_champs)) {
$champ_api_ok = true;
}
return $champ_api_ok;
}
 
public function estChampComplementaire($radical_champ) {
$champ_complementaire_ok = in_array($radical_champ, $this->champs_comp) ? true : false;
return $champ_complementaire_ok;
}
 
public function verifierValiditeSuffixe($suffixe, $radical_champ) {
$validite_ressource = true;
if ($this->correspondAUnId($radical_champ) || $radical_champ == 'id') {
$this->verificationSuffixesIdentifiant($suffixe, $radical_champ, $validite_ressource);
} elseif ($this->correspondAUnCode($radical_champ)) {
$this->verificationSuffixesCodes($suffixe, $radical_champ, $validite_ressource);
} elseif ($radical_champ == 'nom_sci') {
if ($suffixe != '*') {
$validite_ressource = false;
$m = 'Erreur : Le suffixe demandé n\'existe pas pour le champ "'.$radical_champ.'".<br/>
Les suffixes possibles sont les suivants : <li> * </li>';
$this->renvoyerErreur( RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $m);
}
} else {
$validite_ressource = false;
$m = 'Erreur : Le paramètre "'.$radical_champ.'" ne peut pas présenter de suffixe. <br/><br/>';
$this->renvoyerErreur( RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $m);
}
return $validite_ressource;
}
 
public function verificationSuffixesCodes(&$suffixe, &$radical_champ, &$validite_ressource ) {
if (!in_array($suffixe, array('*', 'code', 'href', 'details'))) {
$validite_ressource = false;
$e = 'Erreur : Le suffixe demandé n\'existe pas pour le champ "'.$radical_champ.'.<br/> Les suffixes '
.'possibles sont les suivants : <li> .* </li><li> .code </li><li> .href </li><li> .details </li>';
$this->renvoyerErreur( RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
}
}
 
public function verificationSuffixesIdentifiant(&$suffixe, &$radical_champ, &$validite_ressource) {
if ((strrpos($radical_champ, 'parent') !== false && !in_array($suffixe, array('*', 'id', 'href', 'details', 'notes')))
|| !in_array($suffixe, array('*', 'id', 'href', 'details')) && strrpos($radical_champ, 'parent') === false) {
$validite_ressource = false;
$e = 'Erreur : Le suffixe demandé n\'existe pas pour le champ "'.$radical_champ.'".<br/> Les suffixes '
.'possibles sont les suivants : <li> .* </li><li> .id </li><li> .href </li><li> .details </li>'
.'<li> .notes (seulement pour les hybride.parent)';
$this->renvoyerErreur( RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
}
}
 
 
//------------------------------fonction de formatage pour les services /stats/-----------------------------------------
 
public function formaterStatsAnnee($resultat) {
foreach ($resultat as $cle_annee) {
$annee = ($cle_annee['annee'] != '') ? $cle_annee['annee'] : 'ND';
$nb = $cle_annee['nombre'];
$retour_stats_annee[$annee] = $nb;
}
return $retour_stats_annee;
}
 
public function formaterStatsRang($resultat) {
foreach ($resultat as $rangs) {
if ($rangs['rang'] != 0) {
$rang = $rangs['rang'];
if ($this->parametres['retour.format'] == 'max') {
$retour_rang[$rang]['rang'] = $this->ajouterSignificationCode('rang',$rang);
}
$nombre = $rangs['nombre'];
$retour_rang[$rang]['nombre'] = $nombre;
}
}
return $retour_rang;
}
 
public function formaterStatsInitiales($resultat) {
$rang = null;
$table_rang = array();
foreach ($resultat as $tuple) {
if ($tuple['rang'] != 0) {
$this->memoriserRang($table_rang, $tuple, $rang);
if ($tuple['lettre'] == 'x ') {
$this->ajouterHybrideChimere('hybride', $rang, $tuple);
} elseif ($tuple['lettre'] == '+ ') {
$this->ajouterHybrideChimere('chimere', $rang, $tuple);
} else {
$l = substr($tuple['lettre'], 0, 1);
if (isset($this->table_retour[$rang][$l])) {
$this->table_retour[$rang][substr($tuple['lettre'], 0, 1)] += floatval($tuple['nb']);
} else {
$this->table_retour[$rang][substr($tuple['lettre'], 0, 1)] = floatval($tuple['nb']);
}
}
}
}
return $this->table_retour;
}
 
public function memoriserRang(&$table_rang, $tuple, &$rang) {
if (is_array($table_rang)) {
if (!in_array($tuple['rang'], $table_rang)) {
$rang = $tuple['rang'];
$table_rang[] = $rang;
if ($this->parametres['retour.format'] == 'max') {
$rang = $this->ajouterSignificationCode('rang', $rang);
}
}
}
}
 
public function ajouterHybrideChimere($groupe, &$rang, &$tuple) {
if (isset($this->table_retour[$rang][str_replace('hybride', 'hyb', $groupe)])) {
$this->table_retour[$rang][$groupe] += floatval($tuple['nb']);
} else {
$this->table_retour[$rang][$groupe] = floatval($tuple['nb']);
}
}
 
//-----------------------------Fonctions d'affichage utiliser dans les fonctions de formatage---------------------------
 
public function afficherDonnees($champApi, $valeur) {
$champBdd = $this->trouverChampBddCorrespondant($champApi);
if ($this->parametres['retour.format'] == 'min') {
if ($champApi == 'nom_sci') {
$valeur = $valeur.' '.$this->ajouterCompositionNom($this->resultat_req);
}
if ($champApi == 'nom_sci_html') {
$valeur = $valeur.' '.$this->ajouterCompositionNom($this->resultat_req, 'htm');
}
$this->table_retour[$champBdd] = $valeur;
} else {
$this->afficherToutesLesInfos($champBdd, $valeur);
}
}
 
public function trouverChampBddCorrespondant($champApi) {
if (array_key_exists($champApi, $this->champs_api)) {
$champBdd = $this->correspondance_champs[$champApi];
} else {
$champBdd = $champApi;
}
return $champBdd;
}
 
public function afficherToutesLesInfos($nom_champ_api, $valeur) {
if ($this->presentePlusieursId($nom_champ_api, $valeur)) {
preg_match('/^([^.]+\.parent_0[12]|[^.]+)(?:\.id)?$/', $nom_champ_api, $match);
$this->afficherInfosPrecises($match[1], 'details', $valeur);
$this->table_retour[$nom_champ_api] = $valeur;
 
} elseif (strrpos($nom_champ_api, 'parent') !== false && strrpos($nom_champ_api, 'notes') !== false) {
$this->table_retour[$nom_champ_api] = $valeur;
 
} elseif (($this->correspondAUnId($nom_champ_api) || $nom_champ_api == 'id' && $valeur != '0')) {
preg_match('/^([^.]+\.parent_0[12]|[^.]+)(?:\.id)?$/', $nom_champ_api, $match);
$this->afficherInfosPrecises($match[1], 'id,signification,href', $valeur);
 
} elseif ($this->correspondAUnCode($nom_champ_api)) {
preg_match('/^([^.]+)(?:\.code)?$/', $nom_champ_api, $match);
$this->afficherInfosPrecises($match[1], 'code,signification,href', $valeur);
 
} elseif ($nom_champ_api == 'nom_sci_html') {
$this->table_retour['nom_sci_html'] = $valeur;
$this->table_retour['nom_sci_html_complet'] = $valeur.' '.$this->ajouterCompositionNom($this->resultat_req, 'htm');
}elseif ($nom_champ_api != 'nom_sci') {
$this->table_retour[$nom_champ_api] = $valeur;
}
}
 
public function presentePlusieursId($ressource, $valeur = null) {
if ($valeur) {
$presente = strrpos($ressource, 'proparte') !== false && strrpos($valeur, ',') !== false;
} else { //pour la vérification du champ, on ignore alors la valeur de la ressource
$presente = strrpos($ressource, 'proparte') !== false;
}
return $presente;
}
 
public function afficherInfosPrecises($champ, $suffixe, $valeur) {
$suffixes = explode(',', $suffixe);
//on initialise au service appelé. Sera potentiellement modifié dans la fonction afficherSignification()
$this->service_href = $this->service;
foreach ($suffixes as $suffixe) {
switch ($suffixe) {
case 'id' :
$this->table_retour[str_replace('id.id', 'id', $champ.'.id')] = $valeur;
break;
case 'details' :
$this->afficherTableDetails($champ, $valeur);
break;
case 'signification' :
$this->afficherSignification($champ, $valeur);
break;
case 'href' :
$url = $this->creerUrl($champ, $valeur);
$this->table_retour[str_replace('id.href', 'href', $champ.'.href')] = $url;
break;
case 'code' :
$this->table_retour[$champ.'.code'] = $this->obtenirCode($champ, $valeur);
break;
case 'notes' :
$this->table_retour[$champ.'.notes'] = $this->resultat_req[str_replace('.', '_', $champ).'_notes'];
break;
default : break;
}
}
}
 
public function afficherTableDetails($nom_champ_api, $valeur) {
$tab_id = explode(',', $valeur);
$tab_res = $this->table_retour;
$this->table_retour = array();
foreach ($tab_id as $id) {
$this->afficherInfosPrecises($nom_champ_api, 'id,signification,href', $id);
$tab_res[$nom_champ_api.'.details'][] = $this->table_retour;
$this->table_retour = array();
}
$this->table_retour = $tab_res;
}
 
private function obtenirCode($champ, $valeur) {
$code = $this->transformerChampEnCode($champ);
return "bdnt.$code:$valeur";
}
 
private function transformerChampEnCode($champ) {
if (is_null($this->relationsChampsCodesOntologie)) {
$this->relationsChampsCodesOntologie = Outils::recupererTableauConfig('ChampsCodesOntologie');
}
 
$code = $champ;
if (array_key_exists($champ, $this->relationsChampsCodesOntologie)) {
$code = $this->relationsChampsCodesOntologie[$champ];
}
return $code;
}
 
public function creerUrl($champ, $valeur) {
if ($this->correspondAUnId($champ) || $champ == 'id') {
$service = $this->service_href;
$url = $this->ajouterHref($service, $valeur);
} else {
$code = $this->transformerChampEnCode($champ);
$url = $this->ajouterHrefAutreProjet('ontologies', "$code:", $valeur, 'bdnt');
}
return $url;
}
 
public function afficherSignification($champ, $valeur) {
if ($champ == 'id' && isset($this->resultat_req['nom_sci']) && $this->resultat_req['num_nom'] == $valeur) {
//si le nom_sci du num_nom que l'on veut afficher est déjà dans la table de résultat :
$this->table_retour['nom_sci'] = $this->resultat_req['nom_sci'];
$this->table_retour['nom_sci_complet'] = $this->resultat_req['nom_sci'].' '.
$this->ajouterCompositionNom($this->resultat_req);
} elseif ($this->correspondAUnId($champ) || $champ == 'id') {
$nom = $this->recupererNomSci($valeur);
if ($nom != array()) {
$this->table_retour[$champ.'.libelle'] = $nom['nom_sci'];
$this->table_retour[$champ.'_html'] = $nom['nom_sci_html'];
$this->table_retour[$champ.'_complet'] = $nom['nom_sci_complet'];
$this->table_retour[$champ.'_html_complet'] = $nom['nom_sci_complet_html'];
$this->service_href = $nom['service'];
}
} elseif ($this->correspondAUnCode($champ)) {
$this->table_retour[$champ.'.libelle'] = $this->ajouterSignificationCode($champ, $valeur);
}
}
 
/** Permet d'afficher les élements nomenclatural du nom_sci lors de l'appel dans le service noms/id/champ du champ^nom_sci.*/
public function afficherNomSciPointEpithete($resultat) {
$tab_nom_sci = array('nom_supra_generique', 'genre', 'epithete_infra_generique', 'epithete_sp',
'type_epithete', 'epithete_infra_sp', 'cultivar_groupe', 'cultivar', 'nom_commercial');
foreach ($tab_nom_sci as $compo_nom) {
if (isset($resultat[$compo_nom]) && !empty($resultat[$compo_nom])) {
$this->table_retour['nom_sci.'.$compo_nom] = $resultat[$compo_nom];
}
}
}
 
public function ajouterSignificationCode($champ, $valeur) {
if($this->termeOntologieEstEnCache($champ, $valeur)) {
$nom_code = $this->obtenirTermeOntologieParCache($champ, $valeur);
} else {
$code = $this->transformerChampEnCode($champ);
if (preg_match('/^([^_-]+)(?:_|-)([^_-]+)$/', $code, $match)) {
$code = $match[1].ucfirst($match[2]);
}
$url = Config::get('url_ontologie').$code.':'.$valeur.'/nom';
try {
$res = $this->consulterHref($url); //dans commun.php
$nom_code = $valeur;
if (is_object($res)) {
$nom_code = $res->nom;
}
$this->mettreEnCacheOntologie($champ, $valeur, $nom_code);
} catch (Exception $e) {
$nom_code = '';
}
}
return $nom_code;
}
 
public function recupererNomSci($id) {
$nom = array();
if ($id != 0) {
if ($this->compo_nom == null) {
$req = 'SELECT nom_sci, num_nom_retenu, nom_sci_html FROM '.$this->table.' WHERE num_nom = '.$id;
} else { //on ajoute à la requete sql, les champs de ns.structure
//print_r($this->compo_nom);
$req = 'SELECT nom_sci, num_nom_retenu, nom_sci_html, '.implode(', ', $this->compo_nom)
.' FROM '.$this->table
.' WHERE num_nom = '.$id;
}
if ($this->parametres['ns.format'] == 'htm') {
$req = str_replace('nom_sci', 'nom_sci_html as nom_sci', $req);
}
$res = $this->getBdd()->recuperer($req);
if ($res) {
$nom['nom_sci'] = $res['nom_sci'];
$nom['nom_sci_html'] = $res['nom_sci_html'];
$nom['nom_sci_complet'] = $res['nom_sci'].' '.$this->ajouterCompositionNom($res);
$nom['nom_sci_complet_html'] = $res['nom_sci_html'].' '.$this->ajouterCompositionNom($res, 'htm');
$nom['service'] = ($res['num_nom_retenu'] == $id && $this->service == 'taxons') ? 'taxons' : 'noms';
}
}
return $nom;
}
 
/** Permet de retourner une chaine de caractère composée des parametres du nom (ns.structure : annnée, auteur,
* bibilio et addendum). A ajouter au nom scientifique */
public function ajouterCompositionNom($tab_res, $format = '') {
$format = ($format == '') ? $this->parametres['ns.format'] : $format;
 
$nom = '';
if (isset($this->compo_nom)) {
if ($format == 'htm') {
$format = array(
'au' => '<span class="auteur">%s</span>',
'an' => '[<span class="annee">%s</span>]',
'an_bib' => '[<span class="annee">%s</span>, <span class="biblio">%s</span>]',
'bib' => '[<span class="biblio">%s</span>]',
'ad' => '[<span class="adendum">%s</span>]');
} else {
$format = array(
'au' => '%s',
'an' => '[%s]',
'an_bib' => '[%s, %s]',
'bib' => '[%s]',
'ad' => '[%s]',
'gen' => '%s',
'sp' => '%s',
'ssp' => '%s',
'fam' => '%s',
'au_ss' => '%s',
'bib_ss' => '%s');
}
$compo_nom = array();
 
foreach ($this->compo_nom as $key => $champ) {
if (isset($tab_res[$champ]) && !empty($tab_res[$champ])) {
$compo_nom[$key] = $tab_res[$champ];
}
}
$nom_complet = $this->formerNomComplet($compo_nom, $format);
$nom = implode(' ', $nom_complet);
}
return rtrim($nom, ' ');
}
 
 
public function formerNomComplet($compo_nom, $format) {
$nom_complet = array();
extract($compo_nom);
if (isset($au)) $nom_complet[] = sprintf($format['au'], $au);
if (isset($an)) {
if (isset($bib)) {
$nom_complet[] = sprintf($format['an_bib'], $an, $bib);
} else {
$nom_complet[] = sprintf($format['an'], $an);
}
} elseif (isset($bib)) {
$nom_complet[] = sprintf($format['bib'], $bib);
}
if (isset($ad)) $nom_complet[] = sprintf($format['ad'], $ad);
if (isset($gen)) $nom_complet[] = sprintf($format['gen'], $gen);
if (isset($ssp)) $nom_complet[] = sprintf($format['ssp'], $ssp);
if (isset($sp)) $nom_complet[] = sprintf($format['sp'], $sp);
if (isset($fam)) $nom_complet[] = sprintf($format['fam'], $fam);
if (isset($au_ss)) $nom_complet[] = sprintf($format['au_ss'], $au_ss);
if (isset($bib_ss)) {
$bibl = $this->tronquerBiblio($bib_ss);
//simule un 'select distinct' sur les biblio tronquées
if (!isset($this->bib_traitees[$bibl])) {
$nom_complet[] = sprintf($format['bib_ss'],$bibl );
$this->bib_traitees[$bibl] = 1;
}
}
return $nom_complet;
}
 
public function tronquerBiblio($valeur){
$bib = '';
if(strpos($valeur,',') !== false) {
$bib = explode(',',$valeur);
}
if(strpos($bib[0],';') !== false) {
 
$bib[0] = strstr($bib[0],';');
$bib[0] = str_replace('; ','',$bib[0]);
}
return $bib[0];
}
 
 
 
public function correspondAUnCode($key) {
return (strrpos($key, '.code') !== false) || (in_array($key.'.code', $this->correspondance_champs));
}
 
public function correspondAUnId($key) {
return (strrpos($key, '.id') !== false) || (in_array($key.'.id', $this->correspondance_champs));
}
 
public function estUnPoint($key) {
if (strrpos($key, 'hybride.parent') !== false) {
$key = str_replace('hybride.parent', 'hybride_parent', $key);
}
return (strrpos($key, '.') !== false);
}
 
public function recupererMasquePrincipal() {
$masque = null;
$tab_masque = array(
'masque' => 'nom_sci',
'masque_sg' => 'nom_supra_generique',
'masque_gen' => 'genre',
'masque_sp' => 'epithete_sp',
'masque_ssp' => 'epithete_infra_sp',
'masque_au' => 'auteur',
'masque_an' => 'annee',
'masque_bib' => 'biblio_origine',
'masque_ad' => 'addendum',
'masque_rg' => 'rang');
$liste_masque = array();
 
if (isset($this->masque['num_nom'])) {
$liste_masque[] = $this->masque['num_nom'];
}
 
foreach ($tab_masque as $key => $filtre) {
if (isset($this->masque[$filtre])) {
if (!isset($masque) && !in_array($filtre, array('rang', 'annee'))) {
$masque = array($key, $filtre);
}
$liste_masque[] = $this->masque[$filtre];
}
}
$this->masque = $liste_masque;
return $masque;
}
 
private function mettreEnCacheOntologie($categorie, $valeur, $correspondance) {
if(!isset($this->ontologie[$categorie])) {
$this->ontologie[$categorie] = array();
}
if(!isset($this->ontologie[$categorie][$valeur])) {
$this->ontologie[$categorie][$valeur] = array();
}
$this->ontologie[$categorie][$valeur] = $correspondance;
}
 
private function termeOntologieEstEnCache($categorie, $valeur) {
return array_key_exists($categorie, $this->ontologie) && array_key_exists($valeur, $this->ontologie[$categorie]);
}
 
private function obtenirTermeOntologieParCache($categorie, $valeur) {
return $this->ontologie[$categorie][$valeur];
}
}
?>
/tags/v5.0-agropyraie-20130830/services/modules/0.1/cel/Images.php
New file
0,0 → 1,544
<?php
// declare(encoding='UTF-8');
/**
* Classe implémentant l'API d'eFlore Images pour le projet CEL.
*
* @see http://www.tela-botanica.org/wikini/eflore/wakka.php?wiki=EfloreApi01Images
*
* @package eFlore/services
* @author Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org>
* @author Aurélien PERONNET <aurelien@tela-botanica.org>
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
* @version 1.0
* @copyright 1999-2011 Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
*/
// TODO : Config et Outils sont des classes statiques qui doivent poser des pb pour les tests...
class Images extends Commun {
 
protected $parametres = array();
protected $ressources = array();
private $Bdd;
 
const CODE_REFTAX_DEFAUT = 'bdtfx';
const TPL_URL_IMG = 'http://www.tela-botanica.org/appli:cel-img:%s.jpg';
const TAILLE_IMG_DEFAUT = 'M';
const MIME_JPEG = 'image/jpeg';
const MIME_JSON = 'application/json';
 
private $config = array();
private $cheminImagesBase = '';
private $formats_supportes = array(self::MIME_JPEG, self::MIME_JSON);
private $tris_supportes = array('date');
private $retour_champs = array('determination.nom_sci' => 'nom_sel', 'determination.nom_sci.code' => 'nom_sel_nn',
'station.lieudit' => 'lieudit', 'station', 'milieu');
private $code_ref_tax_demande = null;
private $ref_tax_demande = array();
private $infosImages = array();
private $nbreImages = 0;
private $Utilisateurs = null;
private $UrlNavigation = null;
 
public function __construct(Bdd $bdd = null, Array $config = null, Utilisateurs $utilisateurs = null, Url $url = null) {
$this->config = is_null($config) ? Config::get('Images') : $config;
$this->Bdd = is_null($bdd) ? new Bdd() : $bdd;
$this->Utilisateurs = is_null($utilisateurs) ? new Utilisateurs() : $utilisateurs;
$this->UrlNavigation = is_null($url) ? new Url($this->config['urlService']) : $url;
$this->cheminImagesBase = $this->config['chemin'];
}
 
public function consulter($ressources, $parametres) {
//$tpsDebut = microtime(true);
$this->parametres = $parametres;
$this->ressources = $ressources;
 
$this->definirValeurParDefautDesParametres();
$this->verifierParametres();
 
$resultat = new ResultatService();
if ($this->parametres['retour'] == self::MIME_JPEG) {
if ($this->parametres['retour.tri'] == 'date') { // recherche la plus vieille image du CEL
$id_image_a_renvoyer = $this->obtenirIdPremiereImage();
} else {
$id_image_a_renvoyer = $this->obtenirIdImageAuHasard();
}
$resultat->corps = $this->recupererImageBinaire($id_image_a_renvoyer);
} else if ($this->parametres['retour'] == self::MIME_JSON) {
if (isset($this->ressources[0])) {
$this->chargerInfosImage();
$this->extraireIdentitesAuteurs();
$resultat->corps = $this->formaterInfosImage($this->infosImages[0]);
} else {
$this->chargerListeImages();
$this->chargerNbreImagesTotal();
$resultat->corps = $this->formaterListeImages();
}
}
$resultat->mime = $this->parametres['retour'];
 
return $resultat;
}
//+---------------------------FONCTION D'ANALYSE DES PARAMETRES---------------------------------------------------------+
private function definirValeurParDefautDesParametres() {
if (isset($this->parametres['retour']) == false) {
$this->parametres['retour'] = self::MIME_JSON;
}
if (isset($this->parametres['retour.format']) == false) {
$this->parametres['retour.format'] = 'M';
}
if (isset($this->parametres['navigation.depart']) == false) {
$this->parametres['navigation.depart'] = 0;
}
if (isset($this->parametres['navigation.limite']) == false) {
$this->parametres['navigation.limite'] = 100;
}
if (isset($this->parametres['referentiel']) == false) {
$this->parametres['referentiel'] = self::CODE_REFTAX_DEFAUT;
}
}
 
private function verifierParametres() {
$erreurs = array();
 
if (!isset($this->ressources[0])) {
if (isset($this->parametres['masque.nn']) == false) {
$erreurs[] = "Le paramètre masque.nn est obligatoire.";
} else {
$this->analyserMasqueNn();
if ($this->verifierMasqueNnAutorisePourRetourJPEG() == false) {
$erreurs[] = "Le paramètre masque.nn peut contenir une seule valeur numérique pour l'instant pour le format de retour image/jpeg.";
} else if ($this->verifierValeurParametreMasqueNn() == false) {
$erreurs[] = "Le paramètre masque.nn est mal formé.";
}
}
}
if (isset($this->parametres['retour']) == false) {
$erreurs[] = "Le paramètre type de retour 'retour' est obligatoire.";
}
if ($this->verifierValeurParametreRetour() == false) {
$erreurs[] = "Le type de retour '{$this->parametres['retour']}' n'est pas supporté";
}
if (isset($this->parametres['retour.format']) == false) {
$erreurs[] = "Le paramètre de format de retour 'retour.format' est obligatoire.";
}
if ($this->verifierValeurParametreFormat() == false) {
$erreurs[] = "Le type de format '{$this->parametres['retour.format']}' n'est pas supporté";
}
if (isset($this->parametres['retour.tri'])){
if ($this->verifierValeurParametreTri() == false) {
$erreurs[] = "Le type de tri '{$this->parametres['retour.tri']}' n'est pas supporté";
}
}
 
if (isset($this->parametres['retour.champs'])){
if ($this->verifierValeurParametreRetourChamps() == false) {
$erreurs[] = "Le champs '{$this->parametres['retour.champs']}' n'existe pas";
}
}
 
if ($this->verifierValeurParametreNavigationDepart() == false) {
$erreurs[] = "Le paramètre 'navigation.depart' doit possèder un valeur numérique.";
}
if ($this->verifierValeurParametreNavigationLimite() == false) {
$erreurs[] = "Le paramètre 'navigation.limite' doit possèder un valeur numérique supérieure à 0.";
}
 
if (count($erreurs) > 0) {
$message = implode('<br />', $erreurs);
$code = RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE;
throw new Exception($message, $code);
}
}
 
private function verifierMasqueNnAutorisePourRetourJPEG() {
$ok = true;
$masque = $this->parametres['masque.nn'];
$retour = $this->parametres['retour'];
 
if ($retour == self::MIME_JPEG) {
$ok = is_numeric($masque) ? true : false;
}
return $ok;
}
 
private function verifierValeurParametreMasqueNn() {
$nn = $this->parametres['masque.nn'];
$projetPattern = '(?:(?:[A-Z0-9]+:)?(?:[0-9]+,)*[0-9]+)';
$patternComplet = "/^$projetPattern(?:;$projetPattern)*$/i";
$ok = preg_match($patternComplet, $nn) ? true : false;
return $ok;
}
 
private function verifierValeurParametreRetour() {
return in_array($this->parametres['retour'], $this->formats_supportes);
}
 
private function verifierValeurParametreFormat() {
$formats = Outils::recupererTableauConfig('Images.formats');
$ok = array_key_exists($this->parametres['retour.format'], $formats);
return $ok;
}
 
private function verifierValeurParametreTri() {
return in_array($this->parametres['retour.tri'], $this->tris_supportes);
}
 
private function verifierValeurParametreRetourChamps() {
$ok = false;
$liste_champs = preg_split(',', $this->parametres['retour.champs']);
foreach ($liste_champs as $champs) {
$ok[$champs] = array_key_exists($champs, $this->retour_champs);
}
return $ok;
}
 
private function verifierValeurParametreNavigationDepart() {
$depart = $this->parametres['navigation.depart'];
$ok = is_numeric($depart) ? true : false;
return $ok;
}
 
private function verifierValeurParametreNavigationLimite() {
$limite = $this->parametres['navigation.limite'];
$ok = (is_numeric($limite) && $limite != 0) ? true : false;
return $ok;
}
 
private function analyserMasqueNn() {
$nn = $this->parametres['masque.nn'];
if (preg_match('/^[0-9]+$/', $nn)) {
$this->ref_tax_demande[$this->parametres['referentiel']][] = $nn;
} else {
// ceci contient potentiellement des formes ref_tax1:nn1,nn2;ref_tax2:nn3,nn4
$projetsListeEtNumNoms = explode(';', $nn);
if (count($projetsListeEtNumNoms) > 0) {
foreach ($projetsListeEtNumNoms as $projetEtNumNoms) {
$projetEtNumNoms = (strpos($projetEtNumNoms, ':')) ? $projetEtNumNoms : $this->parametres['referentiel'].':'.$projetEtNumNoms;
list($projet, $numNoms) = explode(':', $projetEtNumNoms);
$this->ref_tax_demande[$projet] = explode(',', $numNoms);
}
}
}
}
 
 
//+---------------------------------------- REQUETES ---------------------------------------------------------------+
private function obtenirIdImageAuHasard() {
$refTax = $this->parametres['referentiel'];
$numNom = $this->Bdd->proteger($this->ref_tax_demande[$refTax][0]);
 
$requete = 'SELECT coi.id_image AS id_image '.
'FROM cel_obs_images AS coi '.
' LEFT JOIN cel_obs AS co '.
'ON (coi.id_observation = co.id_observation) '.
'WHERE ci.transmission = 1 '.
" AND ci.nom_ret_nn IN ($numNom)";
" AND co.nom_referentiel = ".$this->Bdd->proteger($refTax) . ' -- ' . __FILE__ . ':' . __LINE__;
 
$resultat = $this->Bdd->recupererTous($requete);
 
if (!is_array($resultat) || count($resultat) <= 0) {
$message = "Aucune image ne correspond au numéro numenclatural $refTax:$numNom";
$code = RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE;
throw new Exception($message, $code);
}
 
$id_image_hasard = $resultat[array_rand($resultat)]['id_image'];
return $id_image_hasard;
}
 
private function obtenirIdPremiereImage() {
$refTax = $this->parametres['referentiel'];
$numNom = $this->Bdd->proteger($this->ref_tax_demande[$refTax][0]);
$requete = 'SELECT ci.id_image AS id_image '.
'FROM cel_images AS ci'.
' LEFT JOIN cel_obs_images AS coi '.
' ON (coi.id_image = ci.id_image) '.
' LEFT JOIN cel_obs AS co '.
' ON (coi.id_observation = co.id_observation) '.
'WHERE co.transmission = 1 '.
" AND co.nom_ret_nn IN ($numNom) ".
' AND ci.date_prise_de_vue != "0000-00-00" ORDER BY ci.date_prise_de_vue ASC '.
' AND co.nom_referentiel LIKE '.$this->proteger($refTax.'%').' '.
'LIMIT 1' . ' -- ' . __FILE__ . ':' . __LINE__;
 
$resultat = $this->Bdd->recupererTous($requete);
 
if (!is_array($resultat) || count($resultat) <= 0) {
$message = "Aucune image ne correspond au numéro numenclatural $refTax:$numNom";
$code = RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE;
throw new Exception($message, $code);
}
 
$id_image_hasard = $resultat[0]['id_image'];
return $id_image_hasard;
}
 
private function chargerInfosImage() {
$requete = 'SELECT SQL_CALC_FOUND_ROWS '.
' ci.id_image AS id_img, co.date_observation AS date, '.
' co.id_observation AS id_obs, '.
' ci.courriel_utilisateur AS utilisateur_courriel, '.
' nom_sel, nom_sel_nn, '.
' zone_geo, ce_zone_geo, lieudit, station, milieu '.
'FROM cel_images AS ci'.
' LEFT JOIN cel_obs_images AS coi '.
' ON (coi.id_image = ci.id_image) '.
' LEFT JOIN cel_obs AS co '.
' ON (coi.id_observation = co.id_observation) '.
'WHERE ci.id_image = '.$this->ressources[0].
' AND co.id_observation IS NOT NULL' . ' -- ' . __FILE__ . ':' . __LINE__;
 
$this->infosImages = $this->Bdd->recupererTous($requete);
}
 
private function chargerListeImages() {
$refTax = $this->parametres['referentiel'];
$numNomListe = implode(',', $this->ref_tax_demande[$refTax]);
$depart = $this->parametres['navigation.depart'];
$limite = $this->parametres['navigation.limite'];
 
//TODO: modifier la requete lors du passage à la nouvelle base de données pour faire quelque chose
// du numéro nomenclatural + modifier les champs appelés pour le nouveau format
$requete = 'SELECT SQL_CALC_FOUND_ROWS '.
' co.id_observation AS id_obs, co.courriel_utilisateur AS utilisateur_courriel, co.zone_geo, co.ce_zone_geo, '.
' co.nom_sel, co.nom_sel_nn, '.
' ci.id_image AS id_img, co.date_observation AS date '.
(isset($this->parametres['retour.champs']) ? ', '.$this->parametres['retour.champs'] : '').
'FROM cel_images AS ci'.
' LEFT JOIN cel_obs_images AS coi '.
' ON (coi.id_image = ci.id_image) '.
' LEFT JOIN cel_obs AS co '.
' ON (coi.id_observation = co.id_observation) '.
$this->formerRequeteConditions($numNomListe).' '.
'GROUP BY id_img '.
$this->formerRequeteTri().
"LIMIT $depart,$limite " . ' -- ' . __FILE__ . ':' . __LINE__;
 
$this->infosImages = $this->Bdd->recupererTous($requete);
}
 
private function formerRequeteConditions($numNomListe) {
$refTax = $this->parametres['referentiel'];
$where[] = " co.transmission = 1 AND co.nom_ret_nn IN ($numNomListe) ";
$where[] = " co.nom_referentiel LIKE ".$this->Bdd->proteger($refTax."%").' ';
return ' WHERE '.implode(' AND ', $where);
}
 
private function formerRequeteTri() {
$order = '';
if (isset($this->parametres['retour.tri']) && $this->parametres['retour.tri'] == 'date') {
$order = ' ORDER BY co.date_observation ASC ';
}
return $order;
}
 
private function chargerNbreImagesTotal() {
$requete = 'SELECT FOUND_ROWS() AS nbre ';
$resultats = $this->Bdd->recuperer($requete);
$this->nbreImages = (int) $resultats['nbre'];
}
 
//+---------------------------------------CHEMIN ET CONVERSION--------------------------------------------------------+
private function recupererImageBinaire($id_image) {
$image = '';
$chemin = $this->obtenirCheminImage($id_image);
$image = file_get_contents($chemin);
if ($image === false) {
$message = "L'image demandée est introuvable sur le serveur : $chemin";
$code = RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE;
throw new Exception($message, $code);
}
return $image;
}
 
private function obtenirCheminImage($idImage) {
$nom = $this->convertirIdImageVersNomFichier($idImage);
$dossier = $this->convertirIdImageVersChemin($idImage);
return $dossier.'/'.$nom;
}
 
private function convertirIdImageVersNomFichier($idImage) {
$codeImage = $this->construireCodeImage($idImage);
$nom_fichier = $codeImage.'.jpg';
return $nom_fichier;
}
 
private function convertirIdImageVersChemin($idImage) {
$codeImage = $this->construireCodeImage($idImage);
list($dossierNiveau1, $dossierNiveau2, $idFichier, $format) = explode('_', $codeImage);
$chemin_sur_serveur = $this->cheminImagesBase.'/'.$dossierNiveau1.'/'.$dossierNiveau2.'/'.$format;
return $chemin_sur_serveur;
}
 
private function construireCodeImage($idImage) {
$codeImage = sprintf('%09s', $idImage);
$codeImage = wordwrap($codeImage, 3, '_', true);
$format = $this->parametres['retour.format'];
$codeImage .= '_'.$format;
return $codeImage;
}
 
//+------------------------------------FORMATAGE LISTE----------------------------------------------------------------+
private function formaterListeImages() {
$entete = $this->construireEntete();
$resultats = $this->construireResultats();
 
$resultat = array('entete' => $entete, 'resultats' => $resultats);
return $resultat;
}
 
private function construireEntete() {
$entete = array('masque' => '', 'depart' => 0, 'limite' => 100, 'total' => 0);
 
$entete['masque'] = $this->recupererMasque();
$entete['depart'] = (int) $this->parametres['navigation.depart'];
$entete['limite'] = (int) $this->parametres['navigation.limite'];
$entete['total'] = $this->nbreImages;
if ($hrefPrecedent = $this->recupererHrefPrecedent()) {
$entete['href.precedent'] = $hrefPrecedent;
}
if ($hrefSuivant = $this->recupererHrefSuivant()) {
$entete['href.suivant'] = $hrefSuivant;
}
return $entete;
}
 
private function recupererMasque() {
$masqueEntete = '';
if ($masqueNn = $this->parametres['masque.nn']) {
$masqueEntete = "nn=$masqueNn";
}
return $masqueEntete;
}
 
private function recupererHrefPrecedent() {
$departActuel = $this->parametres['navigation.depart'];
$limite = $this->parametres['navigation.limite'];
$departPrecedent = $departActuel - $limite;
$url = null;
if ($departPrecedent >= 0) {
$url = $this->obtenirUrlNavigation($departPrecedent, $limite);
}
return $url;
}
 
private function recupererHrefSuivant() {
$departActuel = $this->parametres['navigation.depart'];
$limite = $this->parametres['navigation.limite'];
$departSuivant = $departActuel + $limite;
$url = null;
if ($departSuivant < $this->nbreImages) {
$url = $this->obtenirUrlNavigation($departSuivant, $limite);
}
return $url;
}
 
private function obtenirUrlNavigation($depart, $limite) {
$parametres = array(
'navigation.depart' => $depart,
'navigation.limite' => $limite);
if (isset($this->parametres['masque.nn'])) {
$parametres['masque.nn'] = $this->parametres['masque.nn'];
}
$this->UrlNavigation->setRequete($parametres);
$url = $this->UrlNavigation->getURL();
return $url;
}
 
private function construireResultats() {
$resultats = array();
$this->extraireIdentitesAuteurs();
foreach ($this->infosImages as $img) {
$info = $this->formaterInfosImage($img);
$id = $img['id_img'];
$info['href'] = $this->config['urlService'].'/'.$id;
if (!isset($resultats[$id])) {
$resultats[$id] = $info;
} else {
throw new Exception("Double : $id");
}
}
return $resultats;
}
 
private function formaterInfosImage($img) {
$info = array();
$info['date'] = $img['date'];
$info['mime'] = self::MIME_JPEG;
$info['auteur.libelle'] = $this->Utilisateurs->getIntitule($img['utilisateur_courriel']);
$info['auteur.id'] = $this->Utilisateurs->getId($img['utilisateur_courriel']);
$info['binaire.href'] = $this->formaterUrlImage($img);
$info['observation.id'] = $img['id_obs'];
if (isset($img['nom_sel'])) {
$info['determination.libelle'] = $this->formaterDetermination($img);
$info['determination.nom_sci'] = $img['nom_sel'];
$info['determination.nom_sci.code'] = $this->formaterNomSciCode($img);
}
$info = array_merge($info, $this->formaterStation($img));
return $info;
}
 
private function extraireIdentitesAuteurs() {
$courriels = array();
foreach ($this->infosImages as $img) {
$courriels[] = $img['utilisateur_courriel'];
}
$this->Utilisateurs->setCourriels($courriels);
$this->Utilisateurs->chargerIdentites();
}
 
private function formaterUrlImage($infos) {
$format = $this->parametres['retour.format'];
$id = sprintf('%09s', $infos['id_img']).$format;
$url = sprintf(self::TPL_URL_IMG, $id);
return $url;
}
 
private function formaterDetermination($infos) {
$auteur = $this->Utilisateurs->getIntitule($infos['utilisateur_courriel']);
return $infos['nom_sel']."[Dét. : $auteur]";
}
 
private function formaterNomSciCode($infos) {
return $this->parametres['referentiel'].'.'.$infos['nom_sel_nn'];
}
 
private function formaterStation($infos) {
$station = array();
if (isset($infos['zone_geo']) && $commune = $this->formaterCommune($infos)) {
$station['station.commune'] = $commune;
}
if (isset($infos['lieudit']) && $this->avoirContenu($infos['lieudit'])) {
$station['station.lieudit'] = $infos['lieudit'];
}
if (isset($infos['station']) && $this->avoirContenu($infos['station'])) {
$station['station.station'] = $infos['station'];
}
 
if (isset($infos['milieu']) && $this->avoirContenu($infos['milieu'])) {
$station['station.milieu'] = $infos['milieu'];
}
if (count($station) >= 1) {
$station['station.libelle'] = implode(' > ', $station);
}
return $station;
}
 
private function formaterCommune($infos) {
$commune = array();
if ($this->avoirContenu($infos['zone_geo'])) {
$commune[] = $infos['zone_geo'];
}
if (isset($infos['ce_zone_geo']) && $this->avoirContenu($infos['ce_zone_geo']) && $infos['ce_zone_geo'] != 'INSEE-C:') {
$commune[] = '('.substr(str_replace('INSEE-C:','',$infos['ce_zone_geo']), 0, 2).')';
}
return implode(' ', $commune);
}
 
private function avoirContenu($info) {
return !($info == null || $info == '' || $info == '000null');
}
}
?>
/tags/v5.0-agropyraie-20130830/services/modules/0.1/chorodep/Observations.php
New file
0,0 → 1,710
<?php
/**
* Description :
* Classe Observations.php permettant de fournir des informations sur les observations.
* Si l'url finit par /observations on retourne une liste d'observations (seulement les 100 premières par défaut) :
* espèce, lieu, date, observateur.
* L'url peut contenir des paramètres optionnels passés après le ? : /observations?param1=val1&param2=val2&...
*
* Les paramètres de requête disponibles sont : masque, masque.type (type d'observation : chorologie),
* masque.date_observation (date d'observation), masque.station (département), masque.determination (nom scientifique de l'espèce)
* masque.observateur (prénom, nom), masque.nn (identifiant du nom), recherche, distinct, retour.format,
* navigation.depart et navigation.limite.
*
* Encodage en entrée : utf8
* Encodage en sortie : utf8
* @package framework-v3
* @author Delphine Cauquil <delphine@tela-botanica.org>
* @author Jennifer Dhé <jennifer.dhe@tela-botanica.org>
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
* @version 1.0
* @copyright 1999-${year} Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
*/
 
class Observations extends Commun {
protected $serviceNom = 'observations';
/** Stockage des paramétres */
protected $table_param = array();
/** Valeur du paramètre de requete recherche :
* - stricte : le masque est passé tel quel à l'opérateur LIKE.
* - etendue : ajout automatique du signe % à la place des espaces et en fin de masque avec utilisation de LIKE.
* - floue : recherche tolérante vis-à-vis d'approximations ou d'erreurs (fautes d'orthographe par exemple) */
protected $recherche = 'stricte';
/** Valeur du paramètre de requete distinct (=0|1)
* Indique que l'on veut les noms distincts (par défaut tous les noms, même semblable, sont renvoyés) */
protected $distinct = null;
protected $retour_format = 'max';
protected $presenceChorologie = '';
/** Variables constituant les parametres de la requete SQL (champ, condition, group by, limit) remplie
* selon ressources et paramètres */
protected $requete_champ = ' id, num_nom, nom_sci ';
protected $requete_condition = array();
/** Une observation est défini par départ qui correspont à un num_nom et dept qui correspond à un departement */
protected $limite_requete = array(
'depart' => 0,
'dept' => 01,
'limite' => 20
);
/**
* Permet de stocker la requete formulée :
* - noms | noms/#id | noms/#id/#champ+#champ
* - noms/#id/relations | noms/#id/relations/synonymie | noms/#id/relations/homonymie | noms/#id/relations/f