Subversion Repositories eFlore/Projets.eflore-projets

Compare Revisions

No changes between revisions

Ignore whitespace Rev 1118 → Rev 1174

/tags/v5.12-baouque/CHANGELOG
New file
0,0 → 1,145
Changements 2015-03-12 [création de la branche "v5.12-Baouque"]:
* Ajout bdtre
* Debug boucle infinie sur infragen
* Possibilité de demander la présence par département : retourne true / false
* Changement version bdtfx
* Ajout masque coste.nn
* Recherche de présence choro. : meilleure gestion de la synonymie
* Modif relation flores
 
Changements 2014-12-15 [création de la branche "v5.11-bananeraie"]:
* Amélioration service osm zone géo pour les besoins du carnet en ligne
* Référentiel lbf (Lebanon e-flora)
 
Changements 2014-10-27 [création de la branche "v5.10-bambouseraie"]:
* La recherche étendue permet enfin de donner un nom avec auteur dans le masque
* Chorodep : ajout du service noms-plus pour la nouvelle appli de chorologie
Script d'intégration des noms vernaculaires et statuts de protection pour ce service
Bricolages divers
 
Changements 2014-09-29 [création de la branche "v5.9-aulnaie"]:
* Changement de type de champ baseflor et baseveg dans la table cel references
* gestion des numéro bdtfx.nt
* Ajout du service : coord-transfo/point
* Utilisation de composer pour les services
* Début utilisation de ApiDoc pour documenter les web services.
* Bricolage service insee-d pour ingorer les paramètres vides etc.
* Bricolage servicechorodep/observations pour ingorer les paramètres vides, arrêter de faire du caca avec la navigation etc.
* Ajout d'un service Noms à chorodep
* Bricolage de insee_d/ZoneGeo pour permettre de trier et conserver l'ordre (retour d'une liste et non d'un objet)
* Chorodep/noms : si on filtre par zone-geo sur '2A' ou '2B', ça filtre sur '20'
* Chorodep/noms : ne retourne que les noms ayant un nn valide (entier > 0)
* nvjfl : les résultats sont triables, et on peut lui demander de retourner le num_taxon en plus
* nvjfl : group by pour retourner le ombre de résultats demandé, et plusieurs taxons par nom vernaculaire (group_concat, séparés par virgule)
* nvjfl : l'action /#id#/champ+autrechamp marche (il était temps)
* Ajout d'une carte globale donnant le nombre de taxons par département
* Chorodep : ajout du service "infos-espece" qui retourne les mêmes infos que celui de gentiana-services
* ajout d'une nouvelle version de chorodep
* Noms : ajout du paramètre "retour.structure". Si === "liste", retournera une liste et non un objet.
* Mode retour.structure=liste dans bdtxa, isfan, apd
 
Changements 2014-06-02 [création de la branche "v5.8-aspergeraie"]:
* Amélioration puis finalement archivage des scripts générant les contours de communes OSM (remplacé par : https://github.com/telabotanica/osm-boundary-admin )
* Ajout d'un script permettant d'extraire les contours de zones administratives des tables Mysql produite par le script osm-boundary-admin
* Amélioration du services NomCommune et création de ZoneAdmin (pour obtenir la hiérarchie de zones admin de coordonnées géo)
* Mise à jour Baseflor et Baseveg
* Correction d'un nom de fichier mal créé dans le script du CEL
* Simplification de la création de la table cel_references
* Amélioration du service chorodep (ajout exception si fichier svg de base de la carte introuvable).
 
Changements 2014-04-08 [création de la branche "v5.7-arrayanal"]:
* Les urls des images sont désormais un paramètre de config
* changement du formatage des descriptions
* changement de l'interrogation des images
* Première version refactorisée et améliorée du script OSM.
* Amélioration de la vitesse de l'ordonneur de chemin
 
Changements 2014-03-24 [création de la branche "v5.6-arganeraie"]:
* Services : renommage "bdtao" => "apd"
* Scripts : renommage "bdtao" => "apd"
* Apd: version "1_00" => "3_4_0"
* derniere version baseveg
* carte sans contours de département pour moissonnage petit format (png)
* Légère amélioration de la gestion des couleurs pour les petites tailles de png
* Prise en compte de la migration des données eFlore sur Agathis
* Mise à jour des services, scripts et docs du projet OSM.
* Ajout d'une condition dans les requetes sur les ids inférieurs et supérieurs des taxons qui les limite au nom retenu
* Ajout du champ num type s'il n'est pas déjà demandé dans les requetes de synonymie
 
Changements 2014-03-04 [création de la branche "v5.5-arbousiere"]:
* Ajout du web service renvoyant des liens vers les cartes de flore probable isssue de sophy
* nouvelle version de la bdtfx
* debug graphique baseflor valeur vide ne s'affiche plus comme 0
* correction requete vue tapir
* Script d'intégration du référentiel bdtao
* Ajout des scripts eFlore pour bdtao ; utilisation de 'num_basionyme' à la place de 'basionyme'.
 
Changements 2014-02-11 [création de la branche "v5.4-Arboretum"]:
* nouvelle version baseflor
* Les services Noms des trois référentiels (bdtfx, bdtxa, isfan) retournent maintenant en plus du libellé du rang, le code du rang dans "rang.code" lorsqu'on leur demande "champs.retour=rang"
* script de création données ifn et vue tapir
* script transformant les données des tables de tb_moissonnage à une table _tapir et une table meta dans tb_eflore
* ajout du moissonage de l'ifn
* interrogation ifn et baznat par num_nom et plus par nom_sci
 
Changements 2014-01-06 [création de la branche "v5.3-Amandaie"]:
* service presencemuseum
* Protection du graphique Baseflor contre les données NULL
* ajout de version chorodep
* Coste/textes : REDIRECT_QUERY_STRING => QUERY_STRING
* array_unique() sur les courriels de la carte de répartition
 
Changements 20130912 [création de la branche "Acheb"]:
* API change: coste
* référentiels: bdtfx 2.00, ontologies 4.40
* config:
- directives inutiles supprimées pour Coste [r857]
- bdnt: ontologie: 4_40
* coste: réécriture du webservice
 
Changements [[http://svn.tela-botanica.net/websvn/filedetails.php?repname=eFlore%2FProjets.eflore-projets&path=%2Ftrunk%2FChangelog&peg=839 v5.0-agropyraie-20130829]] :
- tenue du Changelog
- config: directives modifiées:
- cache.miseEnCache
- cache.dureeDeVie
- cache.stockageChemin
- ontologies:
- support critères multiples bdnt
- support critères multiples nvjfl
- support critères multiples baseflor
- cache d'appels pour bdtfx/meta-donnees
- SQL hard-codé en place du HTTP dans certains cas
- tests: nombreux ajouts et quelques changements de prototypes
- scripts:
- upgrades pour Cel
- Makefile pour configuration/
- renommage de noms de classes en conflit: Cartes et Ontologies
- améliorations dans l'usage du cache
 
Changements v0.1-20130830-1:
* nvjfl: fix notices
* cache: correction du cache des synonymes (noms à 255 caractères)
* cel/images: déduplication de auteurs au préalable de la requête d'identités
* Note: erreur de tag sur "v0.1-20130830"
 
Changements v0.1-20130829:
* tenue du Changelog
* config: directives modifiées:
- cache.miseEnCache
- cache.dureeDeVie
- cache.stockageChemin
* ontologies:
* support critères multiples bdnt
* support critères multiples nvjfl
* support critères multiples baseflor
* support critères multiples eflore
* cache d'appels pour bdtfx/meta-donnees
* SQL hard-codé en place du HTTP dans certains cas
* tests: nombreux ajouts et quelques changements de prototypes
* scripts:
* upgrades pour Cel
* Makefile pour configuration/
* renommage de noms de classes en conflit: Cartes et Ontologies
* améliorations dans l'usage du cache
 
v0.1-20130600
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/nvjfl/nvjfl.ini
New file
0,0 → 1,23
version = "2007"
dossierTsv = "{ref:dossierDonneesEflore}nvjfl/2007-10-29/"
dossierSql = "{ref:dossierTsv}"
 
[tables]
nvjfl = "nvjfl_v{ref:version}"
nvjflLienBiblio = "nvjfl_lien_biblio_v{ref:version}"
nvjflBiblio = "nvjfl_biblio_v{ref:version}"
ontologies = "nvjfl_ontologies_v{ref:version}"
 
[fichiers]
structureSql = "nvjfl_v{ref:version}.sql"
nvjfl = "{ref:tables.nvjfl}.tsv"
nvjflBiblio = "{ref:tables.nvjflBiblio}.tsv"
nvjflLienBiblio = "{ref:tables.nvjflLienBiblio}.tsv"
ontologies = "{ref:tables.ontologies}.tsv"
 
[chemins]
structureSql = "{ref:dossierSql}{ref:fichiers.structureSql}"
nvjfl = "{ref:dossierTsv}{ref:fichiers.nvjfl}"
nvjflBiblio = "{ref:dossierTsv}{ref:fichiers.nvjflBiblio}"
nvjflLienBiblio = "{ref:dossierTsv}{ref:fichiers.nvjflLienBiblio}"
ontologies = "{ref:dossierTsv}{ref:fichiers.ontologies}"
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/nvjfl/Nvjfl.php
New file
0,0 → 1,180
<?php
/** Exemple lancement:
* /opt/lampp/bin/php -d memory_limit=3500M ~/web/eflore-projets/scripts/cli.php nvjfl
* -a chargerTous
* Options :
* -t : Permet de tester le script sur un jeux réduit de données (indiquer le nombre de lignes).
*/
class Nvjfl extends EfloreScript {
 
private $nomsIndex = array();
private $numeroIndex = 1;
 
protected $parametres_autorises = array(
'-t' => array(false, false, 'Permet de tester le script sur un jeux réduit de données (indiquer le nombre de lignes).'));
 
public function executer() {
// Lancement de l'action demandée
try {
$this->initialiserProjet('nvjfl');
 
$cmd = $this->getParametre('a');
switch ($cmd) {
case 'chargerTous' :
$this->chargerStructureSql();
$this->chargerNvjfl();
$this->chargerBiblio();
$this->chargerBiblioLien();
$this->chargerOntologies();
break;
case 'chargerStructure' :
$this->chargerStructureSql();
break;
case 'chargerNvjfl' :
$this->chargerNvjfl();
break;
case 'chargerBiblio' :
$this->chargerBiblio();
break;
case 'chargerBiblioLien' :
$this->chargerBiblioLien();
break;
case 'chargerOntologies' :
$this->chargerOntologies();
break;
case 'supprimerTous' :
$this->supprimerTous();
break;
default :
throw new Exception("Erreur : la commande '$cmd' n'existe pas!");
}
} catch (Exception $e) {
$this->traiterErreur($e->getMessage());
}
}
 
/**
* Charge le fichier en créant un id pour chaque nom vernaculaire.
*/
private function chargerNvjfl() {
//Debug::printr(Config::get('fichiers'));
$fichierOuvert = $this->ouvrirFichier(Config::get('chemins.nvjfl'));
$donnees = $this->analyserFichier($fichierOuvert);
fclose($fichierOuvert);
foreach ($donnees as $donnee) {
$requete = 'INSERT INTO '.Config::get('tables.nvjfl').' VALUES ('.implode(', ', $donnee).')';
$this->getBdd()->requeter($requete);
 
$this->afficherAvancement("Insertion des noms vernaculaires dans la base de données");
if ($this->stopperLaBoucle($this->getParametre('t'))) {
break;
}
}
echo "\n";
}
 
private function analyserFichier($fichierOuvert) {
$donnees = array();
$entetesCsv = fgets($fichierOuvert);
while ($ligneCsv = fgets($fichierOuvert)) {
$champs = explode("\t", trim($ligneCsv));
if (count($champs) > 0) {
if (isset($champs[2])) {
$nomVernaculaire = $champs[2];
$indexCourrant = $this->getIndexNomVernaculaire($nomVernaculaire);
$champs = array_merge(array($indexCourrant), $champs);
$donnees[] = $this->protegerValeursDesChamps($champs);
}
}
$this->afficherAvancement("Analyse du fichier des noms vernaculaires");
if ($this->stopperLaBoucle()) {
break;
}
}
echo "\n";
return $donnees;
}
 
private function getIndexNomVernaculaire($nomVernaculaire) {
$indexCourrant = null;
if (array_key_exists($nomVernaculaire, $this->nomsIndex) == false) {
$this->nomsIndex[$nomVernaculaire] = $this->numeroIndex++;
}
$indexCourrant = $this->nomsIndex[$nomVernaculaire];
return $indexCourrant;
}
 
private function ouvrirFichier($chemin) {
$fichierOuvert = false;
if ($chemin) {
if (file_exists($chemin) === true) {
$fichierOuvert = fopen($chemin, 'r');
if ($fichierOuvert == false) {
throw new Exception("Le fichier $chemin n'a pas pu être ouvert.");
}
} else {
throw new Exception("Le fichier $chemin est introuvable.");
}
} else {
throw new Exception("Aucun chemin de fichier n'a été fourni.");
}
return $fichierOuvert;
}
 
private function protegerValeursDesChamps($champs) {
$champsProteges = array();
for ($i = 0; $i < 9; $i++) {
$valeur = isset($champs[$i]) ? $champs[$i] : '';
$champsProteges[] = $this->getBdd()->proteger($valeur);
}
return $champsProteges;
}
 
private function chargerBiblio() {
$cheminsNvjflBiblio = Config::get('chemins.nvjflBiblio');
$tableNvjflBiblio = Config::get('tables.nvjflBiblio');
$requete = "LOAD DATA INFILE '$cheminsNvjflBiblio' ".
"REPLACE INTO TABLE $tableNvjflBiblio ".
'CHARACTER SET utf8 '.
'FIELDS '.
" TERMINATED BY '\t' ".
" ENCLOSED BY '' ".
" ESCAPED BY '\\\' ".
'IGNORE 1 LINES';
$this->getBdd()->requeter($requete);
}
 
private function chargerBiblioLien() {
$cheminNvjflLienBiblio = Config::get('chemins.nvjflLienBiblio');
$tableNvjflLienBiblio = Config::get('tables.nvjflLienBiblio');
$requete = "LOAD DATA INFILE '$cheminNvjflLienBiblio' ".
"REPLACE INTO TABLE $tableNvjflLienBiblio ".
'CHARACTER SET utf8 '.
'FIELDS '.
" TERMINATED BY '\t' ".
" ENCLOSED BY '' ".
" ESCAPED BY '\\\' ".
'IGNORE 1 LINES';
$this->getBdd()->requeter($requete);
}
 
private function chargerOntologies() {
$cheminOntologies = Config::get('chemins.ontologies');
$tableOntologies = Config::get('tables.ontologies');
$requete = "LOAD DATA INFILE '$cheminOntologies' ".
"REPLACE INTO TABLE $tableOntologies ".
'CHARACTER SET utf8 '.
'FIELDS '.
" TERMINATED BY '\t' ".
" ENCLOSED BY '' ".
" ESCAPED BY '\\\' ".
'IGNORE 1 LINES';
$this->getBdd()->requeter($requete);
}
 
private function supprimerTous() {
$requete = "DROP TABLE IF EXISTS nvjfl_biblio_v2007, nvjfl_lien_biblio_v2007, nvjfl_meta, nvjfl_ontologies_v2007, nvjfl_v2007";
$this->getBdd()->requeter($requete);
}
}
?>
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/nvjfl
New file
Property changes:
Added: svn:ignore
+nvjfl.ini
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/liste_rouge/liste_rouge.ini
New file
0,0 → 1,17
version="2012"
dossierTsv = "{ref:dossierDonneesEflore}liste_rouge/{ref:version}/"
dossierSql = "{ref:dossierTsv}"
 
[tables]
listeRouge = "liste_rouge_v{ref:version}"
referentielTaxo = "bdtfx_v2_00"
 
[fichiers]
structureSql = "liste_rouge_v{ref:version}.sql"
listeRouge = "liste_rouge_v{ref:version}.tsv"
listeRougeCorresp = "liste_rouge_correspondance_v{ref:version}.sql"
 
[chemins]
structureSql = "{ref:dossierSql}{ref:fichiers.structureSql}"
listeRouge = "{ref:dossierTsv}{ref:fichiers.listeRouge}"
listeRougeCorresp = "{ref:dossierTsv}{ref:fichiers.listeRougeCorresp}"
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/liste_rouge/ListeRouge.php
New file
0,0 → 1,114
<?php
/** Exemple lancement:
* /opt/lampp/bin/php -d memory_limit=3500M cli.php sptb -a chargerTous
*/
class ListeRouge extends EfloreScript {
 
public function executer() {
// Lancement de l'action demandée
try {
$this->initialiserProjet('liste_rouge');
 
$cmd = $this->getParametre('a');
switch ($cmd) {
case 'chargerTous' :
$this->chargerStructureSql();
$this->chargerDonnees();
$this->genererChampNumNomRetenu();
break;
case 'chargerStructureSql' :
$this->chargerStructureSql();
break;
case 'chargerDonnees' :
$this->chargerDonnees();
$this->genererChampNumNomRetenu();
break;
case 'genererChampNumNomRetenu' :
$this->genererChampNumNomRetenu();
break;
case 'ajouterChampNumNomRetenu' :
$this->ajouterChampNumNomRetenu();
break;
case 'supprimerTous' :
$this->supprimerTous();
break;
default :
throw new Exception("Erreur : la commande '$cmd' n'existe pas!");
}
} catch (Exception $e) {
$this->traiterErreur($e->getMessage());
}
}
 
private function chargerDonnees() {
$chemin = Config::get('chemins.listeRouge');
$table = Config::get('tables.listeRouge');
$requete = "LOAD DATA INFILE '$chemin' ".
"REPLACE INTO TABLE $table ".
'CHARACTER SET utf8 '.
'FIELDS '.
" TERMINATED BY '\t' ".
" ENCLOSED BY '' ".
" ESCAPED BY '\\\' ".
'IGNORE 1 LINES';
$this->getBdd()->requeter($requete);
}
private function genererChampNumNomRetenu() {
$this->preparerTablePrChpNumNomRetenu();
$this->genererNumNomRetenu();
$this->recupererNumNomNonTrouve();
}
private function preparerTablePrChpNumNomRetenu() {
$table = Config::get('tables.listeRouge');
$requete = "SHOW COLUMNS FROM $table LIKE 'num_nom_retenu' ";
$resultat = $this->getBdd()->recuperer($requete);
if ($resultat === false) {
$requete = "ALTER TABLE $table ".
' ADD `num_nom_retenu` VARCHAR( 10 ) NOT NULL ,'.
' ADD `nom_sci` VARCHAR( 500 ) NOT NULL ,'.
' ADD INDEX ( `num_nom_retenu` ) ';
$this->getBdd()->requeter($requete);
}
}
private function genererNumNomRetenu() {
$table = Config::get('tables.listeRouge');
$table_referentiel = Config::get('tables.referentielTaxo');
$requete = 'UPDATE '.$table.' s, '.$table_referentiel.' r '.
'SET s.num_nom_retenu = r.num_nom_retenu, s.nom_sci = r.nom_complet '.
'WHERE s.nom_sci_orig = r.nom_complet ';
$this->getBdd()->requeter($requete);
}
private function recupererNumNomNonTrouve() {
$table = Config::get('tables.listeRouge');
$requete = 'SELECT `id`, `nom_sci_orig`'.
' FROM '.$table.
' WHERE `num_nom_retenu` = ""';
$noms = $this->getBdd()->recupererTous($requete);
$debug = "Noms sans correspondance avec bdtfx :\n";
foreach ($noms as $nom) {
$debug .= $nom['id']." ".$nom['nom_sci_orig']."\n";
}
Debug::printr($debug);
}
 
private function ajouterChampNumNomRetenu() {
$chemin = Config::get('chemins.listeRougeCorresp');
$table = Config::get('tables.listeRouge');
$requetes = $this->recupererContenu($chemin);
$this->executerScripSql($requetes);
}
private function supprimerTous() {
$requete = "DROP TABLE IF EXISTS liste_rouge_meta, liste_rouge_v2012";
$this->getBdd()->requeter($requete);
Debug::printr('suppression');
}
}
?>
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/lion1906/Lion1906.php
New file
0,0 → 1,122
<?php
//declare(encoding='UTF-8');
/**
* Classe permettant de :
* - convertir la latitude et longitude en degre, et rajouter l'objet point centroide de la commune.
* - charger la bdd
* Exemple de lancement du script : :
* /opt/lampp/bin/php cli.php lion1906 -a chargerTous
*
* @category php 5.2
* @package eFlore/Scripts
* @author Mohcen BENMOUNAH <mohcen@tela-botanica.org>
* @author Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org>
* @copyright Copyright (c) 2011, Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
* @license http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-fr.txt Licence CECILL
* @license http://www.gnu.org/licenses/gpl.html Licence GNU-GPL
* @version $Id$
*/
class Lion1906 extends EfloreScript {
 
public function executer() {
try {
$this->initialiserProjet('lion1906');
 
// Lancement de l'action demandée
$cmd = $this->getParametre('a');
switch ($cmd) {
case 'chargerTous' :
$this->chargerStructureSql();
$this->chargerMetaDonnees();
$this->chargerLion1906();
$this->preparerTable();
$this->convertirRadianEnDegre();
break;
case 'convertir' :
$this->preparerTable();
$this->convertirRadianEnDegre();
break;
case 'supprimerTous' :
$this->supprimerTous();
break;
default :
throw new Exception("Erreur : la commande '$cmd' n'existe pas!");
}
} catch (Exception $e) {
$this->traiterErreur($e->getMessage());
}
}
 
protected function chargerMetaDonnees() {
$contenuSql = $this->recupererContenu(Config::get('chemins.lion1906Meta'));
$this->executerScripSql($contenuSql);
}
 
private function chargerLion1906() {
$chemin = Config::get('chemins.lion1906');
$table = Config::get('tables.lion1906');
$requete = "LOAD DATA INFILE '$chemin' ".
"REPLACE INTO TABLE $table ".
'CHARACTER SET latin1 '.
'FIELDS '.
" TERMINATED BY ';' ".
" ENCLOSED BY '' ".
" ESCAPED BY '\\\' ".
'IGNORE 1 LINES';
$this->getBdd()->requeter($requete);
}
 
private function convertirRadianEnDegre() {
$table = Config::get('tables.lion1906');
$requete = 'SELECT insee, latitude_radian, longitude_radian '.
"FROM $table ";
$LatLons = $this->getBdd()->recupererTous($requete);
 
foreach ($LatLons as $LatLon) {
$insee = $LatLon['insee'] ;
$latitude_degre = $LatLon['latitude_radian'] * 180 / pi();
$longitude_degre = $LatLon['longitude_radian'] * 180 / pi();
$latitude_degre = str_replace(',', '.', $latitude_degre);
$longitude_degre = str_replace(',', '.', $longitude_degre);
$this->formerPointCentre($latitude_degre, $longitude_degre, $insee);
$this->afficherAvancement('Analyse des communes Lion1906');
}
}
 
private function preparerTable() {
$table = Config::get('tables.lion1906');
$requete = "ALTER TABLE $table ".
'DROP latitude_degre, '.
'DROP longitude_degre, '.
'DROP centroide, '.
'DROP INDEX insee ';
$this->getBdd()->requeter($requete);
 
$requete = "ALTER TABLE $table ".
' ADD latitude_degre double NOT NULL , '.
' ADD longitude_degre double NOT NULL , '.
' ADD centroide point NOT NULL ';
$this->getBdd()->requeter($requete);
 
$requete = "ALTER TABLE $table ".
'ADD INDEX insee (insee, latitude_degre, longitude_degre, centroide) ';
$this->getBdd()->requeter($requete);
}
 
private function formerPointCentre($latitude_degre, $longitude_degre, $insee) {
$centre = "$latitude_degre $longitude_degre" ;
$table = Config::get('tables.lion1906');
$requete = "UPDATE $table ".
"SET latitude_degre = '$latitude_degre', longitude_degre = '$longitude_degre', ".
" centroide = POINTFROMTEXT('POINT($centre)') ".
"WHERE insee = '$insee' ";
$this->getBdd()->requeter($requete);
}
 
private function supprimerTous() {
$requete = "DROP TABLE IF EXISTS lion1906_meta, lion1906_communes_v2008";
$this->getBdd()->requeter($requete);
}
 
}
?>
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/lion1906/lion1906.ini
New file
0,0 → 1,17
version="2008"
dossierTsv = "{ref:dossierDonneesEflore}lion1906/2008-12-17/"
dossierSql = "{ref:dossierTsv}"
 
[tables]
lion1906Meta = "lion1906_meta"
lion1906 = "lion1906_communes_v{ref:version}"
 
[fichiers]
structureSql = "lion1906.sql"
lion1906Meta = "lion1906_meta.sql"
lion1906 = "villes.csv"
 
[chemins]
structureSql = "{ref:dossierSql}{ref:fichiers.structureSql}"
lion1906Meta = "{ref:dossierSql}{ref:fichiers.lion1906Meta}"
lion1906 = "{ref:dossierTsv}{ref:fichiers.lion1906}"
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/moissonnage/Moissonnage.php
New file
0,0 → 1,120
<?php
/** Exemple lancement:
* /opt/lampp/bin/php -d memory_limit=3500M ~/web/eflore-projets/scripts/cli.php moissonnage -a chargerTous -n baznat
* Options :
* -n : nom du projet
*/
 
class Moissonnage extends EfloreScript {
private $projet = "";
protected $parametres_autorises = array(
'-n' => array(true, true, 'Préciser le nom du dataset que vous souhaitez ajouter ex. baznat, naturedugard-flore'));
 
public function executer() {
// Lancement de l'action demandée
try {
$this->initialiserProjet('moissonnage');
 
$cmd = $this->getParametre('a');
$this->projet = $this->getParametre('n');
switch ($cmd) {
case 'chargerTous' :
$this->chargerDonnees();
$this->chargerMetaDonnees();
break;
case 'chargerDonnees' :
$this->chargerDonnees();
break;
case 'chargerMetadonnees' :
$this->chargerMetaDonnees();
break;
case 'supprimerTous' :
$this->supprimerTous();
break;
default :
throw new Exception("Erreur : la commande '$cmd' n'existe pas!");
}
} catch (Exception $e) {
$this->traiterErreur($e->getMessage());
}
}
private function chargerDonnees() {
$requete = "CREATE TABLE tb_eflore.".$this->projet."_tapir2 ".
"AS SELECT concat('urn:lsid:',institutionCode,':',collectionCode,':', catalogNumber) AS guid, ".
"`catalogNumber` AS observation_id, `scientificName` AS nom_scientifique_complet, `referencess` AS num_nom, ".
"`county` AS lieu_station_nom, `locality` AS lieu_commune_code_insee, ".
"`decimalLatitude` AS lieu_station_latitude, `decimalLongitude` AS lieu_station_longitude, `geodeticDatum` , ".
"`eventDate` AS observation_date, `identifiedBy` AS observateur_nom_complet ".
"FROM tb_moissonnage.Occurrence ".
"WHERE dataset_id = (SELECT dataset_id FROM tb_moissonnage.Dataset WHERE name = '$this->projet')";
$this->getBdd()->requeter($requete);
}
private function chercherInfosMetaDonnees() {
$infos = array();
$requeteOccurrence = "SELECT institutionCode, collectionCode FROM tb_moissonnage.Occurrence WHERE dataset_id =
(SELECT id FROM tb_moissonnage.Dataset WHERE name='$this->projet');";
$infos['occurrence'] = $this->getBdd()->recuperer($requeteOccurrence);
$requeteDataset = "SELECT * FROM tb_moissonnage.DataPublisher WHERE id =
(SELECT dataPublisher_id FROM tb_moissonnage.Dataset WHERE name='$this->projet')";
$infos['dataPublisher'] = $this->getBdd()->recuperer($requeteDataset);
return $infos;
}
private function chargerMetaDonnees() {
$this->chargerStructureSqlMetaDonnees();
$infos = $this->chercherInfosMetaDonnees();
$date = date('Y_m_d');
$requete = "INSERT INTO tb_eflore.".$this->projet."_tapir_meta (guid, citation, url_projet, createurs) ".
"VALUES ('urn:lsid:{$infos['occurrence']['institutionCode']}:{$infos['occurrence']['collectionCode']}:{$date}', '".
$this->projet." : {$infos['dataPublisher']['description']} du ".
"<a href=\"{$infos['occurrence']['institutionCode']}\" title=\"{$infos['occurrence']['collectionCode']}\" ".
"onclick=\"window.open(this.href); return false;\">{$this->projet}</a>', ".
"'{$infos['occurrence']['institutionCode']}', ".
"'p.courriel={$infos['dataPublisher']['administrativeContact']}, p.courriel={$infos['dataPublisher']['technicalContact']}')";
$this->getBdd()->requeter($requete);
}
private function chargerStructureSqlMetaDonnees() {
$date = date('Y_m_d');
$requete = "CREATE TABLE IF NOT EXISTS tb_eflore.".$this->projet."_tapir_meta ".
"(`guid` varchar(255) NOT NULL ,
`langue_meta` varchar(2) NOT NULL DEFAULT 'fr',
`code` varchar(20) NOT NULL DEFAULT '{$this->projet}',
`version` varchar(20) NOT NULL DEFAULT '{$date}',
`titre` varchar(255) NOT NULL DEFAULT '{$this->projet}',
`description` text,
`mots_cles` varchar(510) NOT NULL DEFAULT 'flore, observation, {$this->projet}',
`citation` varchar(255) NOT NULL,
`url_tech` varchar(510) DEFAULT NULL,
`url_projet` varchar(510) NOT NULL,
`source` text,
`createurs` text NOT NULL,
`editeur` text,
`contributeurs` text,
`droits` text,
`url_droits` varchar(510) DEFAULT 'http://creativecommons.org/licenses/by-sa/2.0/fr/',
`langue` varchar(255) DEFAULT 'fr',
`date_creation` varchar(30) DEFAULT NULL,
`date_validite` varchar(255) DEFAULT NULL,
`couverture_spatiale` varchar(510) DEFAULT NULL,
`couverture_temporelle` varchar(510) DEFAULT NULL,
`web_services` varchar(255) DEFAULT 'meta-donnees:0.1;ontologies:0.1;cartes:0.1',
PRIMARY KEY (`guid`,`langue_meta`)
) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=utf8;";
$this->getBdd()->requeter($requete);
}
private function supprimerTous() {
$requete = "DROP TABLE IF EXISTS `ifn_arbres_forets`, `ifn_arbres_peupleraie`, `ifn_couverts_foret`,
`ifn_documentation`, `ifn_documentation_flore`, `ifn_ecologie`, `ifn_flore`, `ifn_placettes_foret`,
`ifn_placettes_peupleraie`;
";
$this->getBdd()->requeter($requete);
}
}
?>
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/moissonnage/moissonnage.ini
New file
0,0 → 1,35
code = "ifn"
versions = "2005,2006,2007,2008,2009,2010,2011,2012"
categories = "arbresForet,arbresPeupleraie,couvertsForet,documentation,ecologie,flore,placettesForet,placettesPeupleraie"
dossierTsv = "{ref:dossierDonneesEflore}{ref:code}/"
dossierSql = "{ref:dossierTsv}"
 
[tables]
ifnMeta = "if_meta"
documentationFlore = "ifn_documentation_flore"
arbresForet = "ifn_arbres_foret"
arbresPeupleraie = "ifn_arbres_peupleraie"
couvertsForet = "ifn_couverts_foret"
documentation = "ifn_documentation"
ecologie = "ifn_ecologie"
flore = "ifn_flore"
placettesForet = "ifn_placettes_foret"
placettesPeupleraie = "ifn_placettes_peupleraie"
ifnTest = "ifn"
 
 
[fichiers]
structureSql = "{ref:code}.sql"
arbresForet = "arbres_foret.csv"
arbresPeupleraie = "arbres_peupleraie.csv"
couvertsForet = "couverts_foret.csv"
documentation = "documentation.csv"
ecologie = "ecologie.csv"
flore = "flore.csv"
placettesForet = "placettes_foret.csv"
placettesPeupleraie = "placettes_peupleraie.csv"
documentationFlore = "documentation_flore.csv"
 
[chemins]
structureSql = "{ref:dossierSql}{ref:fichiers.structureSql}"
documentation_flore = "{ref:dossierTsv}{ref:documentation_flore}"
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/robot/Robot.php
New file
0,0 → 1,432
<?php
// Encodage : UTF-8
// +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------+
/**
* Robots
*
* Description : classe permettant d'analyser les pages d'un site web.
* Notes : les noms des pages doivent être dans la bonne casse. http://fr.wikipedia.org/wiki/ambronay ne renvera rien alors que
* http://fr.wikipedia.org/wiki/Ambronay renvera un résultat (Notez le A ou a).
*
//Auteur original :
* @author Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org>
* @copyright Tela-Botanica 1999-2009
* @link http://www.tela-botanica.org/wikini/eflore
* @licence GPL v3 & CeCILL v2
* @version $Id: Robot.class.php 2057 2011-05-13 16:39:06Z Jean-Pascal MILCENT $
*/
// +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------+
class Robot extends ScriptCommande {
/**
* Indique le nom du Robot.
*/
private $robot_nom;
/**
* Indique le fichier de config de la gestion des cookies du Robot.
*/
private $cookie;
/**
* Indique l'url de départ du Robot.
*/
private $page;
/**
* Tableau des URLs à analyse
*/
private $pages = array();
/**
* Chemin vers un fichier contenant les noms des pages à analyser (un nom de page par ligne).
*/
private $page_fichier;
/**
* Contient soit False soit le chemin vers le dossier où mettre les pages en cache.
*/
private $cache = false;
/**
* Contient le squelette de l'url à utiliser pour récupérer les pages web.
*/
private $url_tpl = '';
/**
* Contient false ou l'encodage des pages d'un site web si celui-ci n'est pas en UTF-8.
*/
private $encodage = false;
/**
* Contient la chaine de caractères indiquant où commencer une recherche d'informations dans la page web.
*/
private $chaine_debut = '';
/**
* Contient la chaine de caractères indiquant où terminer une recherche d'informations dans la page web.
*/
private $chaine_fin = '';
/**
* Tableau des expressions régulières récupérant des données lors de l'analyse
*/
private $regexps = array();
/**
* Indique le dossier ou fichier où le Robot doit sotcker les informations collectées.
*/
private $sortie;
 
public $parametres = array( '-pgf' => array(false, '', 'Fichier contenant les pages que le Robot doit analyser'),
'-s' => array(false, '', 'Fichier où stocker les données récupérées par le Robot'),
'-pg' => array(false, '', 'Nom de la page que le Robot doit analyser'));
 
 
public function executer() {
$this->page = $this->getParam('pg');
$this->page_fichier = $this->getParam('pgf');
$this->cookie = dirname(__FILE__).DS.'configuration'.DS.'cookieconf.txt';
$this->sortie = $this->getParam('s');
 
// Construction du tableau contenant les noms des pages à analyser
if (empty($this->page_fichier)) {
$this->pages[] = $this->page;
} else {
$this->pages = $this->convertirFichierEnTableau($this->page_fichier);
}
 
// Création du chemin du cache si le fichier ini du projet l'indique
if ($this->getIni('cache_chemin')) {
$this->cache = $this->getIni('cache_chemin');
}
 
// Lancement du Robot demandé
$cmd = $this->getParam('a');
switch ($cmd) {
case 'wp' :
$this->lancerRobotWikipedia();
break;
case 'wp-pays' :
$this->lancerRobotWikipediaPays();
break;
case 'wp-liste-communes' :
$this->lancerRobotWikipediaListeCommunes();
break;
case 'ipni' :
$this->lancerRobotIpni();
break;
case 'cassini' :
$this->lancerRobotCassini();
break;
case 'utm' :
$this->lancerRobotUtmConverter();
break;
default :
$this->traiterErreur('Erreur : la commande "%s" n\'existe pas!', array($cmd));
}
}
 
/**
* Robot analysant les pages de Wikipedia correspondant à des communes.
* Exemples d'utilisation :
* /opt/lampp/bin/php script.php robot -p wp_commune -a wp -pgf ~/importation/robots/eFloreBotWp_INSEE_C.txt -s ~/importation/robots/wp_communes.tsv
* /opt/lampp/bin/php script.php robot -p wp_commune -a wp -pg Montpellier -s ~/importation/robots/wp_communes.tsv
* /opt/lampp/bin/php script.php robot -p wp_commune -a wp -pg Montpellier
*
* @return unknown_type
*/
private function lancerRobotWikipedia() {
// Valeur spécifique de ce Robot
$this->robot_nom = 'eFloreBotWp';
$this->url_tpl = 'http://fr.wikipedia.org/wiki/%s';
$this->regexp_ligne = '/<!-- bodytext -->(.*)<!-- \/bodytext -->/umsi';
$this->regexps = array( 'CodeInsee' => 'Code commune<\/a><\/th>(?:\n|\r\n)<td>(\d+)<\/td>',
'Nom' => 'class="entete map" style="[^"]+">(.*)<',
'Latitutde' => '<span class="geo-dec geo" title=".*"><span class="latitude">(.*)<\/span>',
'Longitude' => '<span class="geo-dec geo" title=".*">.*<\/span>, <span class="longitude">(.*)<\/span>',
'Superficie' => 'Superficie<\/a>(?:<\/b><\/td>|<\/th>)(?:\n|\r\n)<td>((?:[0-9]| |&#160;)+(?:,[0-9]+)?) km<sup>2<\/sup>',
'AltitudeMin' => 'Altitudes<\/a><\/th>(?:\n|\r\n)<td>mini. (-?[0-9]+) m — maxi. [ 0-9]+ m<\/td>',
'AltitudeMax' => 'Altitudes<\/a><\/th>(?:\n|\r\n)<td>mini. -?[0-9]+ m — maxi. ([ 0-9]+) m<\/td>',
'Population' => 'Population<\/a><\/th>(?:\n|\r\n)<td>(.*) hab.',
'PopulationAnnee' => 'Population<\/a><\/th>(?:\n|\r\n)<td>.* hab. <small>\(<a href="\/wiki\/[0-9]+"(?: title="[0-9]+")?>([0-9]+)<\/a>',
'CodePostal' => 'Code postal<\/a><\/th>(?:\n|\r\n)<td>([0-9]{5}).*<\/td>',
'PageWikipedia' => '(?:Ce document provient|Récupérée) de « <a href="http:\/\/fr.wikipedia.org\/wiki\/(.*)">'
);
// Préparation des noms des pages
foreach ($this->pages as $id => $nom) {
$this->pages[$id] = str_replace(' ', '_', $nom);
}
$this->analyserUrls();
}
 
/**
* Robot analysant les pages de Wikipedia correspondant à des pays.
* Exemples d'utilisation :
* /opt/lampp/bin/php script.php robot -p wp_commune -a wp-pays -pgf ~/importation/robots/eFloreBotWp_pays.txt -s ~/importation/robots/wp-pays.tsv
*
* @return unknown_type
*/
private function lancerRobotWikipediaPays() {
// Valeur spécifique de ce Robot
$this->robot_nom = 'eFloreBotWp';
$this->url_tpl = 'http://fr.wikipedia.org/wiki/%s';
$this->regexp_ligne = '/<!-- bodytext -->(.*)<!-- \/bodytext -->/umsi';
$this->regexps = array( 'Nom' => '<table class="infobox_v2" cellspacing="[^"]+" style="[^"]+">(?:\n|\r\n)<caption style="[^"]+"><b>(.*)<\/b>',
'Latitutde' => '<span class="geo-dec geo" title=".*"><span class="latitude">(.*)<\/span>',
'Longitude' => '<span class="geo-dec geo" title=".*">.*<\/span>, <span class="longitude">(.*)<\/span>',
'Superficie' => 'Superficie<\/a><\/b><\/td>(?:\n|\r\n)<td>((?:[0-9]|\s*|&#160;)+(?:,[0-9]+)?)(?:&#160;|\s*)km<sup>2<\/sup>',
'Population' => 'Population<\/a><\/b>(?:&#160;|\s)*<small>\([0-9]+\)<\/small><\/td>(?:\n|\r\n)<td>(.*)(?:&#160;|\s*)hab.',
'PopulationAnnee' => 'Population<\/a><\/b>(?:&#160;|\s)*<small>\(([0-9]+)\)',
'Capitale' => 'Capitale<\/a><\/b><\/td>(?:\n|\r\n)<td>(?:<a href="\/wiki\/[^"]+" title="[^"]+">|)(.+)<',
'PageWikipedia' => '(?:Ce document provient|Récupérée) de « <a href="http:\/\/fr.wikipedia.org\/wiki\/(.*)">'
);
// Préparation des noms des pages
foreach ($this->pages as $id => $nom) {
$this->pages[$id] = str_replace(' ', '_', $nom);
}
$this->analyserUrls();
}
 
/**
* Robot analysant une page de wikipedia à la recherche de plusieurs données par page.
* Exemples d'utilisation :
* /opt/lampp/bin/php script.php robot -p wp_commune -a wp -pgf ~/importation/robots/eFloreBotWp_INSEE_C.txt -s ~/importation/robots/wp_communes.tsv
* /opt/lampp/bin/php script.php robot -p wp_commune -a wp -pg Montpellier -s ~/importation/robots/wp_communes.tsv
* /opt/lampp/bin/php script.php robot -p wp_commune -a wp -pg Montpellier
*
* @return unknown_type
*/
private function lancerRobotWikipediaListeCommunes() {
// Valeur spécifique de ce Robot
$this->robot_nom = 'eFloreBotWpListe';
$this->url_tpl = 'http://fr.wikipedia.org/wiki/%s';
$this->regexp_ligne = '/<tr>(.*)?<\/tr>/Uumsi';
$this->mode = 'MULTI';
$this->regexps = array( 'PageWikipedia' => '^<td align="left"><a href="\/wiki\/([^"]+)"',
'CodeInsee' => '^<td>.+<\/td>(?:\n|\r\n)<td>(\d+)<\/td>',
'CodePostal' => '^(?:<td>.+<\/td>(?:\n|\r\n)){2}<td>(\d+)<\/td>',
'Superficie' => '^(?:<td>.+<\/td>(?:\n|\r\n)){4}<td><span.+span>((?:[0-9]| |&#160;)+(?:,[0-9]+)?)<\/td>',
'Population' => '^(?:<td>.+<\/td>(?:\n|\r\n)){5}<td><span.+span>((?:[0-9]| |&#160;)+)<\/td>'
);
// Préparation des noms des pages
foreach ($this->pages as $id => $nom) {
$this->pages[$id] = str_replace(' ', '_', $nom);
}
$this->analyserUrls();
}
 
/**
* Robot analysant les pages du site de l'IPNI.
* Exemples d'utilisation :
* /opt/lampp/bin/php script.php robot -p ipni_auteur -a wp -pgf ~/importation/robots/eFloreBotIpni_auteur.txt -s ~/importation/robots/ipni_auteurs.tsv
* /opt/lampp/bin/php script.php robot -p ipni_auteur -a wp -pg Z -s ~/importation/robots/ipni_auteurs.tsv
* /opt/lampp/bin/php script.php robot -p ipni_auteur -a wp -pg Z
*
* @return unknown_type
*/
private function lancerRobotIpni() {
// Valeur spécifique de ce Robot
$this->robot_nom = 'eFloreBotIpni';
$this->url_tpl = 'http://ipni.org/ipni/advAuthorSearch.do?output_format=delimited&find_surname=%s*';
$this->regexp_ligne = '/^(.*)$/umi';
$this->regexps = array( 'Id' => '^([^%]+)%' ,
'Version' => '^(?:[^%]*%){1,}([^%]*)%' ,
'DefaultAuthorName' => '^(?:[^%]*%){2,}([^%]*)%' ,
'DefaultAuthorForename' => '^(?:[^%]*%){3,}([^%]*)%' ,
'DefaultAuthorSurname' => '^(?:[^%]*%){4,}([^%]*)%' ,
'StandardForm' => '^(?:[^%]*%){5,}([^%]*)%' ,
'NameNotes' => '^(?:[^%]*%){6,}([^%]*)%' ,
'NameSource' => '^(?:[^%]*%){7,}([^%]*)%' ,
'Dates' => '^(?:[^%]*%){8,}([^%]*)%' ,
'DateTypeCode' => '^(?:[^%]*%){9,}([^%]*)%' ,
'DateTypeString' => '^(?:[^%]*%){10,}([^%]*)%' ,
'AlternativeAbbreviations' => '^(?:[^%]*%){11,}([^%]*)%' ,
'AlternativeNames' => '^(?:[^%]*%){12,}([^%]*)%' ,
'TaxonGroups' => '^(?:[^%]*%){13,}([^%]*)%' ,
'ExampleOfNamePublished' => '^(?:[^%]*%){14,}([^%]*)$' );
$this->analyserUrls();
}
 
/**
* Robot analysant les pages du site de Cassini.
* Exemples d'utilisation :
* /opt/lampp/bin/php script.php robot -p cassini -a cassini -pgf ~/importation/robots/eFloreBotCassini.txt -s ~/importation/robots/cassini.tsv
* /opt/lampp/bin/php script.php robot -p cassini -a cassini -pg 1 -s ~/importation/robots/cassini.tsv
* /opt/lampp/bin/php script.php robot -p cassini -a cassini -pg 1
*
* @return unknown_type
*/
private function lancerRobotCassini() {
// Valeur spécifique de ce Robot
$this->robot_nom = 'eFloreBotCassini';
$this->url_tpl = 'http://cassini.ehess.fr/cassini/fr/html/fiche.php?select_resultat=%s';
$this->encodage = 'ISO-8859-1';
$this->regexp_ligne = '/\s*var\s+chaine1\s+\t=\s+"(.*?)";/umsi';
$this->regexps = array( 'NomCommune' => '^([^\\\\]+)\\\\n' ,
'Superficie' => '\\\\nsuperficie;([^\\\\]+)\\\\n',
'AltitudeMin' => '\\\\naltitude;([^;]+);',
'AltitudeMax' => '\\\\naltitude;[^;]+;([^\\\\]+)\\\\n',
'LambertIIEtenduX' => '\\\\ncoordonnées;Lambert II étendu\\\\n;x;([^\\\\]+)\\\\n',
'LambertIIEtenduY' => '\\\\ncoordonnées;Lambert II étendu\\\\n;x;[^\\\\]+\\\\n;y;([^\\\\]+)\\\\n',
'Latitude' => '\\\\n;Latitude;(.+)?\\\\ncode',
'Longitude' => '\\\\n;Longitude;(.+?)\\\\n;Latitude',
'CodeInsee' => '\\\\ncode insee;([^\\\\]+)\\\\nstatut',
'Statut' => '\\\\nstatut\(s\);([^\\\\]+)\\\\n\\\\n');
$this->analyserUrls();
}
 
/**
* Robot analysant les pages du site de Cassini.
* Exemples d'utilisation :
* /opt/lampp/bin/php script.php robot -p cassini -a cassini -pgf ~/importation/robots/eFloreBotCassini.txt -s ~/importation/robots/cassini.tsv
* /opt/lampp/bin/php script.php robot -p cassini -a cassini -pg 1 -s ~/importation/robots/cassini.tsv
* /opt/lampp/bin/php script.php robot -p cassini -a cassini -pg 1
*
* @return unknown_type
*/
private function lancerRobotUtmConverter() {
// Valeur spécifique de ce Robot
$this->robot_nom = 'eFloreBotUtmConverter';
$this->url_tpl = 'http://www.rcn.montana.edu/resources/tools/coordinates.aspx?nav=11&c=DD&md=83&mdt=NAD83/WGS84&lat=%s&lath=N&lon=%s&lonh=E';
$this->encodage = 'ISO-8859-1';
$this->regexp_ligne = '/Universal Transverse Mercator \(UTM\):<\/td>(.*?)<\/table><\/td>/umsi';
$this->regexps = array( 'UTM_Zone' => 'Zone: ([0-9]+)<' ,
'UTM_Est_x' => 'Easting: ([0-9]+)<',
'UTM_Nord_y' => 'Northing: ([0-9]+)<');
$this->analyserUrls();
}
 
private function analyserUrls() {
// Lancement de l'analyse
$heure_debut = date('c',time());
 
echo "Analyse de l'URL # : ";
$pagesNum = 0;// Pages
$lignesNum = 0;// Lignes
$sortie = '';
foreach ($this->pages as $paramsPage) {
$xhtml_page = $this->getHtml($this->url_tpl, $paramsPage);
$xhtml_lignes = $this->extraireChaine($this->regexp_ligne, $xhtml_page);
 
// Pour chaque chaine début/fin trouvées au sein de la page, nous recherchons les regexps des données.
if (count($xhtml_lignes) > 1 && $this->mode != 'MULTI') {
$this->traiterAttention("Plusieurs lignes correspondent à votre expression régulière de limitation du contenu :\n %s", array($this->regexp_ligne));
} else if ($xhtml_lignes) {
print_r($xhtml_lignes );
foreach ($xhtml_lignes as $xhtml) {
$champsNum = 1;// Champs
$ligne = '';
foreach ($this->regexps as $chp => $regexp) {
// Si nous traitons la première ligne nous ajoutons les noms des champs en début de fichier de sortie
if ($lignesNum == 0) {
$sortie .= $chp.(($champsNum == count($this->regexps)) ? "\n" : "\t");
$champsNum++;
}
// Ajout de la valeur trouvée grâce à l'expression régulière à la ligne de sortie
if (preg_match('/'.$regexp.'/Umsi', $xhtml, $match)) {
$ligne .= $this->nettoyer($match[1])."\t";
} else {
$ligne .= "\t";
}
}
$lignesNum++;
$ligne = trim($ligne);
$sortie .= $ligne."\n";
 
// Affichage en console...
if (empty($this->sortie)) {
echo "\t".$ligne."\n";
}
}
 
} else {
$this->traiterAttention("Impossible de trouver les chaines début et fin dans la page «%s» avec la regexp :\n%s", array($this->getNomPage($paramsPage), $this->regexp_ligne));
}
// Affichage en console...
echo str_repeat(chr(8), ( strlen( $pagesNum ) + 1 ))."\t".$pagesNum++;
}
echo "\n";
$heure_fin = date('c',time());
 
// Ajout de métadonnées
$metadonnees = "Début d'importation : $heure_debut\nFin d'importation : $heure_fin\n";
$metadonnees .= "Source des données : ".$this->url_tpl."\n";
$sortie = $metadonnees.$sortie;
 
// Écriture du fichier de sortie ou retour dans la console
if (!empty($this->sortie)) {
file_put_contents($this->sortie, $sortie);
}
}
 
private function nettoyer($txt) {
$txt = trim($txt);
$txt = preg_replace('/(?:&nbsp;|&#160;)/', ' ', $txt);
return $txt;
}
 
private function getHtml($url_tpl, $paramsPage) {
// Lancement en ligne de commande pour tester :
//curl -v --url "http://fr.wikipedia.org/wiki/Montpellier" --config /home/jpm/web/eflore_bp/consultation/scripts/modules/robot/configuration/cookieconf.txt
if ($this->cache && file_exists($fichier_cache = $this->cache.$this->getNomPage($paramsPage))) {
$html = file_get_contents($fichier_cache);
} else {
$url = vsprintf($url_tpl, $paramsPage);
$this->traiterAttention(" Url : ".$url);
// Initialisation CURL
$curl = curl_init();
curl_setopt($curl, CURLOPT_COOKIEFILE, $this->cookie);
curl_setopt($curl, CURLOPT_URL, $url);
curl_setopt($curl, CURLOPT_RETURNTRANSFER, TRUE);
curl_setopt($curl, CURLOPT_USERAGENT, 'Mozilla/5.0 (X11; Linux x86_64; rv:2.0.1) Gecko/20100101 Firefox/4.0.1');
 
$html = curl_exec($curl);
 
// Mise en cache
if ($this->cache) {
file_put_contents($fichier_cache, $html);
}
}
 
// Nettoyage des entités html
$html = $this->encoderUtf8($html, 'HTML-ENTITIES');
// Nettoyage de l'encodage des urls
$html = urldecode($html);
 
// Convertion en UTF-8 si nécessaire
if ($this->encodage) {
$html = $this->encoderUtf8($html, $this->encodage);
}
 
return $html;
}
 
/**
* Méthode récupérant seulement une partie du texte passé en paramétre.
*
* @param $debut chaine de caractère indiquant le début du texte à prendre en compte.
* @param $fin chaine de caractère indiquant la fin du texte à prendre en compte.
* @param $txt le texte duquel extraire une partie bornée par $debut et $fin.
* @return le texte extrait.
*/
private function extraireChaine($regexp, $txt) {
if (preg_match_all($regexp, $txt, $match)) {
return $match[1];
} else {
return false;
}
}
/**
* Charge les lignes d'un fichier dans un tableau et le retourne.
* Supprime les caractères blancs et les nouvelles lignes.
*
* @param $fichier
* @return unknown_type
*/
private function convertirFichierEnTableau($fichier) {
$tableau = array();
$handle = fopen($fichier,'r');
if ($handle) {
while ($ligne = fgets($handle)) {
$tableau[] = explode("\t", trim($ligne));
}
fclose($handle);
}
return $tableau;
}
 
private function getNomPage($paramsPage) {
return str_replace(' ', '_', implode('_', $paramsPage)).'.html';
}
 
}
?>
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/robot/configuration/cookieconf.txt
New file
0,0 → 1,4
-b ../../../../../../../importation/robots/cookie.txt
-c ../../../../../../../importation/robots/cookie.txt
 
--max-time 50
Property changes:
Added: svn:eol-style
+native
\ No newline at end of property
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/robot/configuration/ipni_auteur.ini
New file
0,0 → 1,3
; Encodage : UTF-8
; Source des données : http://ipni.org/
cache_chemin = "php:'/home/'.$_ENV['USER'].'/importation/robots/ipni.org/'"
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/robot/configuration/cassini.ini
New file
0,0 → 1,3
; Encodage : UTF-8
; Source des données : http://cassini.ehess.fr/
cache_chemin = "php:'/home/'.$_ENV['USER'].'/importation/robots/cassini.ehess.fr/'"
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/robot/configuration/wp_commune.ini
New file
0,0 → 1,4
; Encodage : UTF-8
; Source des données : http://fr.wikipedia.org/wiki/
; Version des noms de commune utilisé pour intéroger Wikipedia: Code géographique de l'INSEE version 2008-01-01
cache_chemin = "php:'/home/'.$_ENV['USER'].'/importation/robots/fr.wikipedia.org/'"
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/robot/configuration/utm_converter.ini
New file
0,0 → 1,3
; Encodage : UTF-8
; Source des données : http://www.rcn.montana.edu/resources/tools/coordinates.aspx
cache_chemin = "php:'/home/'.$_ENV['USER'].'/importation/robots/rcn.montana.edu/'"
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/nvps/Nvps.php
New file
0,0 → 1,124
<?php
/** Exemple lancement:
* /opt/lampp/bin/php -d memory_limit=3500M ~/web/eflore-projets/scripts/cli.php nvps
* -a chargerTous
* Options :
* -t : Permet de tester le script sur un jeux réduit de données (indiquer le nombre de lignes).
*/
class Nvps extends EfloreScript {
 
private $nomsIndex = array();
private $numeroIndex = 1;
 
protected $parametres_autorises = array(
'-t' => array(false, false, 'Permet de tester le script sur un jeux réduit de données (indiquer le nombre de lignes).'));
 
public function executer() {
// Lancement de l'action demandée
try {
$this->initialiserProjet('nvps');
 
$cmd = $this->getParametre('a');
switch ($cmd) {
case 'chargerTous' :
$this->chargerStructureSql();
$this->chargerNvps();
break;
case 'chargerStructure' :
$this->chargerStructureSql();
break;
case 'chargerNvps' :
$this->chargerNvps();
break;
case 'supprimerTous' :
$this->supprimerTous();
break;
default :
throw new Exception("Erreur : la commande '$cmd' n'existe pas!");
}
} catch (Exception $e) {
$this->traiterErreur($e->getMessage());
}
}
 
/**
* Charge le fichier en créant un id pour chaque nom vernaculaire.
*/
private function chargerNvps() {
//Debug::printr(Config::get('fichiers'));
$fichierOuvert = $this->ouvrirFichier(Config::get('chemins.nvps'));
$donnees = $this->analyserFichier($fichierOuvert);
fclose($fichierOuvert);
foreach ($donnees as $donnee) {
$table = Config::get('tables.nvps');
$fields = implode(', ', array_keys($donnee));
$values = implode(', ', $donnee);
 
$requete = "INSERT INTO $table ($fields) VALUES ($values) ";
$this->getBdd()->requeter($requete);
 
$this->afficherAvancement("Insertion des noms vernaculaires dans la base de données");
if ($this->stopperLaBoucle($this->getParametre('t'))) {
break;
}
}
echo "\n";
}
 
private function ouvrirFichier($chemin) {
$fichierOuvert = false;
if ($chemin) {
if (file_exists($chemin) === true) {
$fichierOuvert = fopen($chemin, 'r');
if ($fichierOuvert == false) {
throw new Exception("Le fichier $chemin n'a pas pu être ouvert.");
}
} else {
throw new Exception("Le fichier $chemin est introuvable.");
}
} else {
throw new Exception("Aucun chemin de fichier n'a été fourni.");
}
return $fichierOuvert;
}
 
private function analyserFichier($fichierOuvert) {
$entetesCsv = explode("\t", trim(fgets($fichierOuvert)));
 
$donnees = array();
while ($ligneCsv = fgets($fichierOuvert)) {
$champs = explode("\t", trim($ligneCsv));
if (count($champs) > 0) {
$infos = array();
foreach ($entetesCsv as $ordre => $champNom) {
$valeur = isset($champs[$ordre]) ? $champs[$ordre] : '';
$infos[$champNom] = $valeur;
}
$infos['id'] = $this->getIndexNomVernaculaire($infos['nom_vernaculaire']);
$donnees[] = $this->getBdd()->protegerTableau($infos);
}
$this->afficherAvancement("Analyse du fichier des noms vernaculaires");
if ($this->stopperLaBoucle()) {
break;
}
}
echo "\n";
 
return $donnees;
}
 
private function getIndexNomVernaculaire($nomVernaculaire) {
$indexCourrant = null;
if (array_key_exists($nomVernaculaire, $this->nomsIndex) == false) {
$this->nomsIndex[$nomVernaculaire] = $this->numeroIndex++;
}
$indexCourrant = $this->nomsIndex[$nomVernaculaire];
return $indexCourrant;
}
 
private function supprimerTous() {
$requete = "DROP TABLE IF EXISTS nvps_meta, nvps_v2007, nvps_v2012";
$this->getBdd()->requeter($requete);
}
}
?>
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/nvps/nvps.ini
New file
0,0 → 1,14
version = "2012"
dossierTsv = "{ref:dossierDonneesEflore}nvps/2012/"
dossierSql = "{ref:dossierTsv}"
 
[tables]
nvps = "nvps_v{ref:version}"
 
[fichiers]
structureSql = "nvps_v{ref:version}.sql"
nvps = "{ref:tables.nvps}.tsv"
 
[chemins]
structureSql = "{ref:dossierSql}{ref:fichiers.structureSql}"
nvps = "{ref:dossierTsv}{ref:fichiers.nvps}"
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/iso_3166_1/Iso31661.php
New file
0,0 → 1,82
<?php
/** Exemple lancement:
* /opt/lampp/bin/php -d memory_limit=3500M ~/web/eflore-projets/scripts/cli.php iso6391
* -a chargerTous
* Options :
* -t : Permet de tester le script sur un jeux réduit de données (indiquer le nombre de lignes).
*/
class Iso31661 extends EfloreScript {
 
public function executer() {
// Lancement de l'action demandée
try {
$this->initialiserProjet('iso-3166-1');
 
$cmd = $this->getParametre('a');
switch ($cmd) {
case 'chargerTous' :
$this->chargerStructureSql();
$this->chargerIso31661();
$this->chargerOntologies();
break;
case 'chargerStructureSql' :
$this->chargerStructureSql();
break;
case 'chargerIso31661' :
$this->chargerIso31661();
break;
case 'chargerOntologies' :
$this->chargerOntologies();
break;
case 'test' :
$this->tester();
break;
case 'supprimerTous' :
$this->supprimerTous();
break;
default :
$this->traiterErreur('Erreur : la commande "%s" n\'existe pas!', array($cmd));
}
} catch (Exception $e) {
$this->traiterErreur($e->getMessage());
}
}
 
private function tester() {
echo Config::get('test');
}
 
private function chargerIso31661() {
$chemin = Config::get('chemins.iso31661');
$table = Config::get('tables.iso31661');
$requete = "LOAD DATA INFILE '$chemin' ".
"REPLACE INTO TABLE $table ".
'CHARACTER SET utf8 '.
'FIELDS '.
" TERMINATED BY '\t' ".
" ENCLOSED BY '\"' ".
" ESCAPED BY '\\\' ".
'IGNORE 1 LINES';
$this->getBdd()->requeter($requete);
}
 
private function chargerOntologies() {
$chemin = Config::get('chemins.ontologies');
$table = Config::get('tables.ontologies');
$requete = "LOAD DATA INFILE '$chemin' ".
"REPLACE INTO TABLE $table ".
'CHARACTER SET utf8 '.
'FIELDS '.
" TERMINATED BY '\t' ".
" ENCLOSED BY '\"' ".
" ESCAPED BY '\\\' ".
'IGNORE 1 LINES';
$this->getBdd()->requeter($requete);
}
 
private function supprimerTous() {
$requete = "DROP TABLE IF EXISTS iso_3166_1_meta, iso_3166_1_ontologies_v2006, iso_3166_1_v2006";
$this->getBdd()->requeter($requete);
}
}
?>
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/iso_3166_1/iso-3166-1.ini
New file
0,0 → 1,18
version="2006"
dossierTsv = "{ref:dossierDonneesEflore}iso-3166-1/{ref:version}/"
dossierSql = "{ref:dossierTsv}"
 
 
[tables]
iso31661 = "iso_3166_1_v{ref:version}"
ontologies = "iso_3166_1_ontologies_v{ref:version}"
 
[fichiers]
structureSql = "iso-3166-1_v{ref:version}.sql"
iso31661 = "iso-3166-1_v{ref:version}.tsv"
ontologies = "iso-3166-1_ontologies_v{ref:version}.tsv"
 
[chemins]
structureSql = "{ref:dossierSql}{ref:fichiers.structureSql}"
iso31661 = "{ref:dossierTsv}{ref:fichiers.iso31661}"
ontologies = "{ref:dossierTsv}{ref:fichiers.ontologies}"
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/iso_3166_1
New file
Property changes:
Added: svn:ignore
+iso-3166-1.ini
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/bonnier/Bonnier.php
New file
0,0 → 1,508
<?php
// Encodage : UTF-8
// +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------+
/* Importation des fichiers excel de Bonnier pour créer une version HTML pour PDA.
* Utilisation au préalable des utillitaire de traitement de fichier mdb sous Unix (voir ci après)
*
* Pré-requis :
* 1. Installer le paquet pour Perl nommé ParseExcel : urpmi perl-spreadsheet-parseexcel
* 2. Télécharger les fichiers Excel de Bonnier : http://www.tela-botanica.org/projets/74/documents/16211
* 3. Créer un dossier où vous dézipperez l'archive des fichiers Excel
* 4. Copier dans ce dossier les fichier xls2sql.pl et generer_sql.sh que vous trouverez dans le dossier shell de ce module
* 5. Donner les droits d'execution au fichier generer_sql.sh et lancer le : ./generer_sql.sh
* 6. Vous devez obtenir un fichier SQL par fichier Excel.
*
* Pour lancer ce script fichier par fichier :
* 1. Ouvrir une console et se positionner dans le dossier "scripts"
* 2. Pour charger le 1er fichier Excel, taper la commande : /opt/lampp/bin/php script.php bonnier -p bonnier -a charger -table renonculacees
* 3. Pour generer le html issu du chargement precedent :
* /opt/lampp/bin/php script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/001-Renonculacees" -table renonculacees
*
* // Auteur original :
* @author David DELON <david@clapas.net>
* @copyright David DELON 2009
* @link http://www.tela-botanica.org/wikini/eflore
* @licence GPL v3 & CeCILL v2
* @version $Id$
*/
// +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------+
class Bonnier extends ScriptCommandeEflore {
 
/**
* Paramêtres disponible pour la ligne de commande
* le tableau se construit de la forme suivnate :
* - clé = nom du paramêtre '-foo'
* - value = contient un nouveau tableau composé de cette façaon :
* - booléen: true si le paramêtre est obligatoire
* - booléen ou var : true si le paramêtre nécessite un valeur à sa suite ou la valeur par défaut
* - string: description du contenu du paramêtre
* Les paramêtres optionels devraient être déclaré à la fin du tableau.
* Le dernier parametre du tableau peut avoir la valeur '...',
* il contiendra alors l'ensemble des paramêtres suivant trouvés sur la ligne de commande.
* @var array
*/
public $parametres = array( '-table' => array(true, true, "Nom de la table où seront stockées les données d'une famille"),
'-dossier' => array(true, true, "Dossier où sont générés les fichiers html pour la table"));
public function executer() {
 
error_reporting(E_ALL & ~E_DEPRECATED );
$table = $this->getParam('table');
$dossier = $this->getParam('dossier');
@mkdir($this->getIni('chemin_fichier_sortie').$dossier);
$cmd = $this->getParam('a');
switch ($cmd) {
// chargement des fichiers sql issus de la transformation xls dans la base de donnee, une table par fichir sql, 2 tables par
// familles : texte (navigation / clef) et plantes : description des plantes.
case 'charger' :
$this->creerTableBonnier($this->version, $table);
$this->chargerDonnees($table);
break;
case 'html' :
// tranformation sql vers html : pour la famille considerée : parcours de l'ensemble de ses clef et generation html pour
// les feuilles.
$this->realiserHtml($dossier, $table);
break;
default :
trigger_error('Erreur : la commande "'.$cmd.'" n\'existe pas!'."\n", E_USER_ERROR);
}
}
 
private function realiserHtml($dossier, $table) {
// Parcours de l'ensemble des données ? ou famille par famille ?
// on charge plante et texte dans des tableaux
$this->type_donnee = $table.'_texte';
$requete = 'SELECT * '.
'FROM '.$this->projet_nom.'_v'.$this->version.'_'.$this->sous_version.'_'.$this->type_donnee.' '.
'ORDER BY uid';
$lignesTexte = $this->retournerDonneesRequete($requete);
// Analyse des données
echo "Analyse des données : ".$this->type_donnee."\n";
foreach ($lignesTexte as $ligneTexte) {
if (!isset($aso_lignes[$ligneTexte['identifiant']])) {
$aso_lignes[$ligneTexte['identifiant']] = $ligneTexte;
} else {
echo "identifiant en double : ".$ligneTexte['identifiant']."\n";
}
}
 
$this->type_donnee = $table.'_plante';
$requete = 'SELECT * '.
'FROM '.$this->projet_nom.'_v'.$this->version.'_'.$this->sous_version.'_'.$this->type_donnee.' '.
'ORDER BY uid';
$lignesPlante = $this->retournerDonneesRequete($requete);
foreach ($lignesPlante as $lignePlante) {
if (!isset($aso_lignes[$lignePlante['identifiant']])) {
$aso_lignes[$lignePlante['identifiant']] = $lignePlante;
} else {
echo "identifiant en double : ".$lignePlante['identifiant']."\n";
}
}
//print_r($aso_lignes_texte[$lignesTexte[0]['identifiant']] ['titre']);
// $ariane : tableau des identifiants parcourus dans la branche
// $niveau : niveau dans l'arbre
$ariane = array();
$niveau = 0;
// Parcours de l'arbre des clefs depuis la racine
$this->genererHtmlTexte($lignesTexte[1]['identifiant'], $aso_lignes, $ariane, $niveau, $dossier);
}
// Generation des elements de navigation (clef)
private function genererHtmlTexte($identifiant, $lignesTexteIdentifiant, $ariane, $niveau, $dossier) {
 
$ariane[] = $identifiant;
$niveau++;
if (isset ($lignesTexteIdentifiant[$identifiant])) { // Si des identifiants sont en doubles
$ligneIdentifiant = $lignesTexteIdentifiant[$identifiant];
}
else {
// initialiser valeur par defaut indiquant une erreur
}
 
$f_html = fopen($this->getIni('chemin_fichier_sortie').$dossier.'/'.$identifiant.'.html', 'wb');
$html =
'<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD XHTML 1.0 Strict//EN" "http://www.w3.org/TR/xhtml1/DTD/xhtml1-strict.dtd">'."\n".
'<html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml" xml:lang="fr">'."\n".
'<head>'."\n".
'<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8" />'."\n".
'<title>Flore BONNIER sur PDA</title>'."\n".
'<link rel="stylesheet" type="text/css" href="../../style/style640.css" media="screen" />'."\n".
'</head>'."\n";
$html .= '<body>'."\n";
$html .= '<div class="titre">'."\n";
$html .= '<p id="titre">';
if (isset($ligneIdentifiant)) {
$html .= $ligneIdentifiant['titre'];
}
$html .= '</p>'."\n";
$html .= '</div>'."\n";
// print "identifiant : ".$ligneIdentifiant['identifiant']."\n";
// Destinations
// Branche niveau inferieur
$html.='<div class="fenetreMenu">'."\n";
for ($i = 1; $i < 6; $i++) {
if (isset($ligneIdentifiant['texte_'.$i]) && $ligneIdentifiant['texte_'.$i] != "") {
$html .= '<div class="menu'.($i-1).'">'."\n";
$html .= '<a href="'.$ligneIdentifiant['destination_'.$i].'.html">';
$html .= $ligneIdentifiant['texte_'.$i];
$html .= '</a>'."\n";
$html .= '</div>'."\n";
}
}
 
$html .= '</div>'."\n";
$html .= '<div class="espace" style="top:518px;">'."\n";
$html .= '</div>'."\n";
$html .= '<div class="navigation">'."\n";
$html .= '<p id="navigation">'."\n";
// Navigation
for ($i = 0; $i < $niveau; $i++) {
if (($ariane[$i]) && $ariane[$i] != '') {
$html .= '<a href="'.$ariane[$i].'.html">';
if (isset ($lignesTexteIdentifiant[$ariane[$i]])) { // Si des identifiants sont en doubles
$html .= $lignesTexteIdentifiant[$ariane[$i]]['titre'];
}
$html .= '</a>'."\n";
}
}
$html .= '</p>'."\n";
$html .= '</div>'."\n";
 
$html .= '<div class="retour">'."\n";
$html .= '<p id="retour">'."\n";
// Retour niveau superieur
if (isset($ariane[$niveau - 2]) && $ariane[$niveau - 2] != '') {
$html .= '<a href="'.$ariane[$niveau - 2].'.html">';
$html .= $lignesTexteIdentifiant[$ariane[$niveau - 2]]['titre'];
$html .= '</a>'."\n";
}
$html .= '</p>'."\n";
$html .= '</div>'."\n";
$html .= '<div class="glossaire">'."\n";
$html .= '<p id="glossaire">'."\n";
$html .= '<a href="../000-general/glossaire0_640.html">'."\n";
$html .= 'Glossaire'."\n";
$html .= '</a>'."\n";
$html .= '</p></div><div class="text">'."\n";
$html .= '<p id="Text">'."\n";
$html .= '<a href="../000-general/accueil1_640.html">'."\n";
$html .= ' Top'."\n";
$html .= '</a>'."\n";
$html .= ' </p>'."\n";
$html .= '</div>'."\n";
 
$html .= '</body>'."\n";
$html .= '</html>'."\n";
fwrite($f_html, $html);
fclose($f_html);
// Ecriture des feuilles (description plantes)
for ($i = 1; $i < 6; $i++) {
if (isset($ligneIdentifiant['destination_'.$i]) && $ligneIdentifiant['destination_'.$i] != '') {
if (substr($ligneIdentifiant['destination_'.$i], 0, 1) == 'p') {
$this->genererHtmlPlante($ligneIdentifiant['destination_'.$i], $lignesTexteIdentifiant, $ariane, $niveau, $dossier);
} else {
$this->genererHtmlTexte($ligneIdentifiant['destination_'.$i], $lignesTexteIdentifiant, $ariane, $niveau, $dossier);
}
}
}
}
// Plante
private function genererHtmlPlante($identifiant, $lignesTexteIdentifiant, $ariane, $niveau, $dossier) {
$ariane[] = $identifiant;
$niveau++;
if (isset ($lignesTexteIdentifiant[$identifiant])) { // Au cas ou des identifiants sont en doubles
$ligneIdentifiant = $lignesTexteIdentifiant[$identifiant];
}
$nom_latin = '';
if (isset($ariane[($niveau - 2)]) && isset($lignesTexteIdentifiant[$ariane[($niveau - 2)]]['texte_1'])) {
$nom_latin = trim(strrchr($lignesTexteIdentifiant[$ariane[($niveau - 2)]]['texte_1'], ':'), ' :');
}
 
$f_html = fopen($this->getIni('chemin_fichier_sortie').$dossier.'/'.$identifiant.'.html', 'wb');
$html=
'<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD XHTML 1.0 Strict//EN" "http://www.w3.org/TR/xhtml1/DTD/xhtml1-strict.dtd">'."\n".
'<html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml" xml:lang="fr">'."\n".
'<head>'."\n".
'<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8" />'."\n".
'<title>Flore BONNIER sur PDA</title>'."\n".
'<link rel="stylesheet" type="text/css" href="../../style/style_plante.css" media="screen" />'."\n".
'</head>'."\n";
$html .= '<body>'."\n";
$html .= '<div class="titre">'."\n";
$html .= '<p id="titre">';
$html .= $nom_latin;
$html .= '</p>'."\n";
$html .= '</div>'."\n";
$html .= '<div class="famille">'."\n";
$html .= '<p id="famille1">Famille : </p>'."\n";
$html .= '<p id="famille2">';
$html .= $lignesTexteIdentifiant[$ariane[0]]['titre'];
$html .= '</p>'."\n";
$html .= '</div>'."\n";
$html .= '<div class="genre">'."\n";
$html .= '<p id="genre1">Genre : </p>'."\n";
$html .= '<p id="genre2">';
if (isset($ligneIdentifiant)) {
$html .= $ligneIdentifiant['genre'];
}
$html .= '</p>'."\n";
$html .= '</div>'."\n";
$html .= '<div class="nom_latin">'."\n";
$html .= '<p id="nom_latin1">Nom Latin : </p>'."\n";
$html .= '<p id="nom_latin2">';
$html .= $nom_latin;
$html .= '</p>'."\n";
$html .= '</div>'."\n";
$html .= '<div class="nom_francais">'."\n";
$html .= '<p id="nom_francais1">Nom Francais : </p>'."\n";
$html .= '<p id="nom_francais2">';
if (isset($ligneIdentifiant)) {
$html .= $ligneIdentifiant['nom_francais'];
}
$html .= '</p>'."\n";
$html .= '</div>'."\n";
$html .= '<div class="nom_commun">'."\n";
$html .= '<p id="nom_commun1">Nom Vulgaire : </p>'."\n";
$html .= '<p id="nom_commun2">';
if (isset($ligneIdentifiant)) {
$html .= $ligneIdentifiant['nom_vulgaire'];
}
$html .= '</p>'."\n";
$html .= '</div>'."\n";
$html .= '<div class="caracteres">'."\n";
$html .= '<p id="caracteres1">Caractéristiques spécifiques : </p>'."\n";
$html .= '<p id="caracteres2">';
if (isset($ligneIdentifiant)) {
$html .= $ligneIdentifiant['description'];
}
$html .= '</p>'."\n";
$html .= '</div>'."\n";
$html .= '<div class="habitat">'."\n";
$html .= '<p id="habitat1">Habitat / taille / floraison : </p>'."\n";
$html .= '<p id="habitat2">';
if (isset($ligneIdentifiant)) {
$html .= $ligneIdentifiant['habitat'];
}
$html .= '</p>'."\n";
$html .= '</div>'."\n";
$html .= '<div class="aire">'."\n";
$html .= '<p id="aire1">Aire g&eacute;ographique : </p>'."\n";
$html .= '<p id="aire2">';
if (isset($ligneIdentifiant)) {
$html .= $ligneIdentifiant['geographie'];
}
$html .= '</p>'."\n";
$html .= '</div>'."\n";
$html .= '<div class="identifiant">'."\n";
$html .= '<p id="identifiant">';
$html .= 'Bonnier : '.$identifiant;
$html .= '</p>'."\n";
$html .= '</div>'."\n";
$html .= '<div class="planche">'."\n";
$html .= '<p id="planche">';
$html .= '</p>'."\n";
$html .= '</div>'."\n";
$html .= '<div class="retour">'."\n";
$html .= '<p id="retour">'."\n";
if (($ariane[$niveau - 2]) && $ariane[$niveau - 2] != '') {
$html .= '<a href="'.$ariane[$niveau - 2].'.html">';
$html .= $lignesTexteIdentifiant[$ariane[$niveau - 2]]['titre'];
$html .= '</a>'."\n";
}
$html .= '</p>'."\n";
$html .= '</div>'."\n";
$html .= '<div class="glossaire">'."\n";
$html .= '<p id="glossaire">'."\n";
$html .= '<a href="../000-general/glossaire0_640.html">'."\n";
$html .= 'Glossaire'."\n";
$html .= '</a>'."\n";
$html .= '</p></div><div class="text">'."\n";
$html .= '<p id="Text">'."\n";
$html .= '<a href="../000-general/accueil1_640.html">'."\n";
$html .= ' Top'."\n";
$html .= '</a>'."\n";
$html .= ' </p>'."\n";
$html .= '</div>'."\n";
 
$html .= '</body>'."\n";
$html .= '</html>'."\n";
fwrite($f_html, $html);
fclose($f_html);
}
 
 
private function creerTableBonnier($version, $table) {
//+------------------------------------------------------------------------------------------------------------+
// texte
$this->type_donnee = $table.'_texte';
$requete = 'DROP TABLE IF EXISTS '.$this->projet_nom.'_v'.$this->version.'_'.$this->sous_version.'_'.$this->type_donnee;
$this->traiterRequete($requete);
$requete = 'CREATE TABLE '.$this->projet_nom.'_v'.$this->version.'_'.$this->sous_version.'_'.$this->type_donnee.' ('.
'uid int(11) not null auto_increment,'.
'identifiant varchar(25),'.
'titre varchar(100),'.
'texte_1 varchar(255),'.
'texte_2 varchar(255),'.
'texte_3 varchar(255),'.
'texte_4 varchar(255),'.
'texte_5 varchar(255),'.
'texte_6 varchar(255),'.
'destination_1 varchar(25),'.
'destination_2 varchar(25),'.
'destination_3 varchar(25),'.
'destination_4 varchar(25),'.
'destination_5 varchar(25),'.
'destination_6 varchar(25),'.
'planche_croquis varchar(25),'.
'PRIMARY KEY (uid)'.
') DEFAULT CHARSET=utf8 COLLATE=utf8_unicode_ci; ' ;
$this->traiterRequete($requete);
//+------------------------------------------------------------------------------------------------------------+
//plante
$this->type_donnee = $table.'_plante';
$requete = 'DROP TABLE IF EXISTS '.$this->projet_nom.'_v'.$this->version.'_'.$this->sous_version.'_'.$this->type_donnee;
$this->traiterRequete($requete);
$requete = 'CREATE TABLE '.$this->projet_nom.'_v'.$this->version.'_'.$this->sous_version.'_'.$this->type_donnee.' ('.
'uid int(11) not null auto_increment,'.
'identifiant varchar(25),'.
'genre varchar(100),'.
'nom_francais varchar(100),'.
'nom_vulgaire varchar(100),'.
'description varchar(512),'.
'habitat varchar(255),'.
'geographie varchar(255),'.
'planche_croquis varchar(25),'.
'PRIMARY KEY (uid)'.
') DEFAULT CHARSET=utf8 COLLATE=utf8_unicode_ci; ' ;
$this->traiterRequete($requete);
}
 
protected function chargerDonnees($table) {
print "Chargements des données ...";
print "\n";
$this->type_donnee = $table.'_texte';
$this->chargerDonneesSql($table);
$this->type_donnee = $table.'_plante';
$this->chargerDonneesSql($table);
return;
}
protected function chargerDonneesSql($table) {
echo $this->type_donnee."\n";
$fichier_sql = $this->chemin_fichier_tab.$this->projet_nom.'_v'.$this->version.'_'.$this->sous_version.'_'.$this->type_donnee.'.sql';
print $fichier_sql."\n";
if (file_exists($fichier_sql)) {
// Des champs textes sont multilignes, d'ou la boucle sur INSERT, marqueur de fin de la requete precedente.
if ($lines = file($fichier_sql)) {
$i = 0;
$ligne_courante = $lines[$i];
if (($i + 1) >= count($lines)) {
$ligne_suivante = 'FIN';
} else {
$ligne_suivante = $lines[$i+1];
}
while ($i < count($lines)) {
$line_in = $ligne_courante;
while (($i < count($lines)) && (substr($ligne_suivante, 0, 6) != 'INSERT') && ($ligne_suivante != 'FIN')) {
$line_in .= $ligne_suivante;
$i++;
$ligne_courante = $lines[$i];
if (($i + 1) >= count($lines)) {
$ligne_suivante = 'FIN';
} else {
$ligne_suivante = $lines[$i + 1];
}
}
$requete = $line_in;
if (substr($requete, 0, 6) == 'INSERT') {
$requete = preg_replace('/ VALUES\(/',' VALUES(0,', $requete);
$this->traiterRequete(utf8_encode($requete));
}
$i++;
if (($i + 1) >= count($lines)) {
$ligne_suivante = 'FIN';
} else {
$ligne_courante = $lines[$i];
$ligne_suivante = $lines[$i + 1];
}
if ($i == (int) $this->getParam('t')) {
break;
}
}
}
} else {
echo 'Fichier sql introuvable'."\n";
}
}
}
?>
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/bonnier/shell/generer_sql.sh
New file
0,0 → 1,298
perl xls2sql.pl file="001-Renonculacées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_renonculacees_plante" > bonnier_v0_00_renonculacees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="001-Renonculacées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_renonculacees_texte" > bonnier_v0_00_renonculacees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="002-Berbéridées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_berberidees_plante" > bonnier_v0_00_berberidees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="002-Berbéridées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_berberidees_texte" > bonnier_v0_00_berberidees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="003-Nymphéacées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_nympheacees_plante" > bonnier_v0_00_nympheacees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="003-Nymphéacées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_nympheacees_texte" > bonnier_v0_00_nympheacees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="004-Papavéracées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_papaveracees_plante" > bonnier_v0_00_papaveracees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="004-Papavéracées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_papaveracees_texte" > bonnier_v0_00_papaveracees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="005-Fumariacées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_fumariacees_plante" > bonnier_v0_00_fumariacees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="005-Fumariacées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_fumariacees_texte" > bonnier_v0_00_fumariacees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="006-Crucifères-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_cruciferes_plante" > bonnier_v0_00_cruciferes_plante.sql
perl xls2sql.pl file="006-Crucifères-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_cruciferes_texte" > bonnier_v0_00_cruciferes_texte.sql
perl xls2sql.pl file="007-Capparidées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_capparidees_plante" > bonnier_v0_00_capparidees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="007-Capparidées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_capparidees_texte" > bonnier_v0_00_capparidees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="008-Cistinées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_cistinees_plante" > bonnier_v0_00_cistinees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="008-Cistinées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_cistinees_texte" > bonnier_v0_00_cistinees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="009-Violariées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_violariees_plante" > bonnier_v0_00_violariees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="009-Violariées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_violariees_texte" > bonnier_v0_00_violariees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="010-Résédacées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_résedacees_plante" > bonnier_v0_00_résedacees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="010-Résédacées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_résedacees_texte" > bonnier_v0_00_résedacees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="011-Droséracées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_droseracees_plante" > bonnier_v0_00_droseracees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="011-Droséracées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_droseracees_texte" > bonnier_v0_00_droseracees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="012-Polygalées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_polygalees_plante" > bonnier_v0_00_polygalees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="012-Polygalées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_polygalees_texte" > bonnier_v0_00_polygalees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="013-Frankéniacées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_frankeniacees_plante" > bonnier_v0_00_frankeniacees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="013-Frankéniacées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_frankeniacees_texte" > bonnier_v0_00_frankeniacees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="014-Caryophyllées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_caryophyllees_plante" > bonnier_v0_00_caryophyllees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="014-Caryophyllées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_caryophyllees_texte" > bonnier_v0_00_caryophyllees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="015-Elatinées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_elatinees_plante" > bonnier_v0_00_elatinees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="015-Elatinées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_elatinees_texte" > bonnier_v0_00_elatinees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="016-Linées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_linees_plante" > bonnier_v0_00_linees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="016-Linées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_linees_texte" > bonnier_v0_00_linees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="017-Tiliacées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_tiliacees_plante" > bonnier_v0_00_tiliacees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="017-Tiliacées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_tiliacees_texte" > bonnier_v0_00_tiliacees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="018-Malvacées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_malvacees_plante" > bonnier_v0_00_malvacees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="018-Malvacées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_malvacees_texte" > bonnier_v0_00_malvacees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="019-Géraniées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_geraniees_plante" > bonnier_v0_00_geraniees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="019-Géraniées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_geraniees_texte" > bonnier_v0_00_geraniees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="020-Hypéricinées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_hypericinees_plante" > bonnier_v0_00_hypericinees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="020-Hypéricinées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_hypericinees_texte" > bonnier_v0_00_hypericinees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="021-Acérinées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_acerinees_plante" > bonnier_v0_00_acerinees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="021-Acérinées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_acerinees_texte" > bonnier_v0_00_acerinees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="022-Ampélidées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_ampelidees_plante" > bonnier_v0_00_ampelidees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="022-Ampélidées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_ampelidees_texte" > bonnier_v0_00_ampelidees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="023-Hippocastanées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_hippocastanees_plante" > bonnier_v0_00_hippocastanees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="023-Hippocastanées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_hippocastanees_texte" > bonnier_v0_00_hippocastanees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="024-Méliacées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_meliacees_plante" > bonnier_v0_00_meliacees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="024-Méliacées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_meliacees_texte" > bonnier_v0_00_meliacees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="025-Balsaminées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_balsaminees_plante" > bonnier_v0_00_balsaminees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="025-Balsaminées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_balsaminees_texte" > bonnier_v0_00_balsaminees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="026-Oxalidées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_oxalidees_plante" > bonnier_v0_00_oxalidees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="026-Oxalidées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_oxalidees_texte" > bonnier_v0_00_oxalidees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="027-Zygophyllées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_zygophyllees_plante" > bonnier_v0_00_zygophyllees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="027-Zygophyllées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_zygophyllees_texte" > bonnier_v0_00_zygophyllees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="028-Hespéridées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_hesperidees_plante" > bonnier_v0_00_hesperidees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="028-Hespéridées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_hesperidees_texte" > bonnier_v0_00_hesperidees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="029-Rutacées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_rutacees_plante" > bonnier_v0_00_rutacees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="029-Rutacées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_rutacees_texte" > bonnier_v0_00_rutacees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="030-Coriariées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_coriariees_plante" > bonnier_v0_00_coriariees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="030-Coriariées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_coriariees_texte" > bonnier_v0_00_coriariees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="031-Celastrinées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_celastrinees_plante" > bonnier_v0_00_celastrinees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="031-Celastrinées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_celastrinees_texte" > bonnier_v0_00_celastrinees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="032-Staphyléacées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_staphyleacees_plante" > bonnier_v0_00_staphyleacees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="032-Staphyléacées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_staphyleacees_texte" > bonnier_v0_00_staphyleacees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="033-Ilicinées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_ilicinees_plante" > bonnier_v0_00_ilicinees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="033-Ilicinées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_ilicinees_texte" > bonnier_v0_00_ilicinees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="034-Rhamnées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_rhamnees_plante" > bonnier_v0_00_rhamnees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="034-Rhamnées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_rhamnees_texte" > bonnier_v0_00_rhamnees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="035-Térébinthacées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_térebinthacees_plante" > bonnier_v0_00_térebinthacees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="035-Térébinthacées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_térebinthacees_texte" > bonnier_v0_00_térebinthacees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="036-Papilionacées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_papilionacees_plante" > bonnier_v0_00_papilionacees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="036-Papilionacées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_papilionacees_texte" > bonnier_v0_00_papilionacees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="037-Césalpiniées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_cesalpiniees_plante" > bonnier_v0_00_cesalpiniees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="037-Césalpiniées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_cesalpiniees_texte" > bonnier_v0_00_cesalpiniees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="038-Rosacées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_rosacees_plante" > bonnier_v0_00_rosacees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="038-Rosacées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_rosacees_texte" > bonnier_v0_00_rosacees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="039-Granatées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_granatees_plante" > bonnier_v0_00_granatees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="039-Granatées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_granatees_texte" > bonnier_v0_00_granatees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="040-Onagrariées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_onagrariees_plante" > bonnier_v0_00_onagrariees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="040-Onagrariées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_onagrariees_texte" > bonnier_v0_00_onagrariees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="041-Myriophyllées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_myriophyllees_plante" > bonnier_v0_00_myriophyllees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="041-Myriophyllées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_myriophyllees_texte" > bonnier_v0_00_myriophyllees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="042-Hippuridées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_hippuridees_plante" > bonnier_v0_00_hippuridees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="042-Hippuridées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_hippuridees_texte" > bonnier_v0_00_hippuridees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="043-Callitrichinées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_callitrichinees_plante" > bonnier_v0_00_callitrichinees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="043-Callitrichinées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_callitrichinees_texte" > bonnier_v0_00_callitrichinees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="044-Ceratophyllées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_ceratophyllees_plante" > bonnier_v0_00_ceratophyllees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="044-Ceratophyllées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_ceratophyllees_texte" > bonnier_v0_00_ceratophyllees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="045-Lythrariées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_lythrariees_plante" > bonnier_v0_00_lythrariees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="045-Lythrariées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_lythrariees_texte" > bonnier_v0_00_lythrariees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="046-Philadelphées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_philadelphees_plante" > bonnier_v0_00_philadelphees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="046-Philadelphées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_philadelphees_texte" > bonnier_v0_00_philadelphees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="047-Tamariscinées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_tamariscinees_plante" > bonnier_v0_00_tamariscinees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="047-Tamariscinées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_tamariscinees_texte" > bonnier_v0_00_tamariscinees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="048-Myrtacées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_myrtacees_plante" > bonnier_v0_00_myrtacees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="048-Myrtacées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_myrtacees_texte" > bonnier_v0_00_myrtacees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="049-Cucurbitacées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_cucurbitacees_plante" > bonnier_v0_00_cucurbitacees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="049-Cucurbitacées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_cucurbitacees_texte" > bonnier_v0_00_cucurbitacees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="050-Portulacées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_portulacees_plante" > bonnier_v0_00_portulacees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="050-Portulacées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_portulacees_texte" > bonnier_v0_00_portulacees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="051-Paronychiées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_paronychiees_plante" > bonnier_v0_00_paronychiees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="051-Paronychiées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_paronychiees_texte" > bonnier_v0_00_paronychiees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="052-Crassulacées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_crassulacees_plante" > bonnier_v0_00_crassulacees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="052-Crassulacées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_crassulacees_texte" > bonnier_v0_00_crassulacees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="053-Cactées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_cactees_plante" > bonnier_v0_00_cactees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="053-Cactées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_cactees_texte" > bonnier_v0_00_cactees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="054-Ficoïdées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_ficoïdees_plante" > bonnier_v0_00_ficoïdees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="054-Ficoïdées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_ficoïdees_texte" > bonnier_v0_00_ficoïdees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="055-Grossulariées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_grossulariees_plante" > bonnier_v0_00_grossulariees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="055-Grossulariées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_grossulariees_texte" > bonnier_v0_00_grossulariees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="056-Saxifragées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_saxifragees_plante" > bonnier_v0_00_saxifragees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="056-Saxifragées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_saxifragees_texte" > bonnier_v0_00_saxifragees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="057-Ombelliféres-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_ombelliferes_plante" > bonnier_v0_00_ombelliferes_plante.sql
perl xls2sql.pl file="057-Ombelliféres-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_ombelliferes_texte" > bonnier_v0_00_ombelliferes_texte.sql
perl xls2sql.pl file="058-Araliacées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_araliacees_plante" > bonnier_v0_00_araliacees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="058-Araliacées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_araliacees_texte" > bonnier_v0_00_araliacees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="059-Cornées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_cornees_plante" > bonnier_v0_00_cornees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="059-Cornées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_cornees_texte" > bonnier_v0_00_cornees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="060-Loranthacées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_loranthacees_plante" > bonnier_v0_00_loranthacees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="060-Loranthacées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_loranthacees_texte" > bonnier_v0_00_loranthacees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="061-Caprifoliacées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_caprifoliacees_plante" > bonnier_v0_00_caprifoliacees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="061-Caprifoliacées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_caprifoliacees_texte" > bonnier_v0_00_caprifoliacees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="062-Rubiacées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_rubiacees_plante" > bonnier_v0_00_rubiacees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="062-Rubiacées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_rubiacees_texte" > bonnier_v0_00_rubiacees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="063-Valérianées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_valerianees_plante" > bonnier_v0_00_valerianees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="063-Valérianées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_valerianees_texte" > bonnier_v0_00_valerianees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="064-Dipsacées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_dipsacees_plante" > bonnier_v0_00_dipsacees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="064-Dipsacées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_dipsacees_texte" > bonnier_v0_00_dipsacees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="065-Composées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_composees_plante" > bonnier_v0_00_composees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="065-Composées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_composees_texte" > bonnier_v0_00_composees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="066-Ambrosiacées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_ambrosiacees_plante" > bonnier_v0_00_ambrosiacees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="066-Ambrosiacées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_ambrosiacees_texte" > bonnier_v0_00_ambrosiacees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="067-Lobéliacées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_lobeliacees_plante" > bonnier_v0_00_lobeliacees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="067-Lobéliacées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_lobeliacees_texte" > bonnier_v0_00_lobeliacees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="068-Campanulacées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_campanulacees_plante" > bonnier_v0_00_campanulacees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="068-Campanulacées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_campanulacees_texte" > bonnier_v0_00_campanulacees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="069-Vacciniées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_vacciniees_plante" > bonnier_v0_00_vacciniees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="069-Vacciniées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_vacciniees_texte" > bonnier_v0_00_vacciniees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="070-Ericinées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_ericinees_plante" > bonnier_v0_00_ericinees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="070-Ericinées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_ericinees_texte" > bonnier_v0_00_ericinees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="071-Pyrolacées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_pyrolacees_plante" > bonnier_v0_00_pyrolacees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="071-Pyrolacées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_pyrolacees_texte" > bonnier_v0_00_pyrolacees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="072-Monotropées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_monotropees_plante" > bonnier_v0_00_monotropees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="072-Monotropées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_monotropees_texte" > bonnier_v0_00_monotropees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="073-Lentibulariées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_lentibulariees_plante" > bonnier_v0_00_lentibulariees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="073-Lentibulariées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_lentibulariees_texte" > bonnier_v0_00_lentibulariees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="074-Primulacées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_primulacees_plante" > bonnier_v0_00_primulacees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="074-Primulacées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_primulacees_texte" > bonnier_v0_00_primulacees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="075-Ebénacées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_ebenacees_plante" > bonnier_v0_00_ebenacees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="075-Ebénacées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_ebenacees_texte" > bonnier_v0_00_ebenacees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="076-Styracées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_styracees_plante" > bonnier_v0_00_styracees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="076-Styracées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_styracees_texte" > bonnier_v0_00_styracees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="077-Oléinées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_oleinees_plante" > bonnier_v0_00_oleinees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="077-Oléinées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_oleinees_texte" > bonnier_v0_00_oleinees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="078-Jasminées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_jasminees_plante" > bonnier_v0_00_jasminees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="078-Jasminées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_jasminees_texte" > bonnier_v0_00_jasminees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="079-Apocynées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_apocynees_plante" > bonnier_v0_00_apocynees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="079-Apocynées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_apocynees_texte" > bonnier_v0_00_apocynees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="080-Asclépiadées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_asclepiadees_plante" > bonnier_v0_00_asclepiadees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="080-Asclépiadées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_asclepiadees_texte" > bonnier_v0_00_asclepiadees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="081-Gentianées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_gentianees_plante" > bonnier_v0_00_gentianees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="081-Gentianées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_gentianees_texte" > bonnier_v0_00_gentianees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="082-Polémoniacées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_polemoniacees_plante" > bonnier_v0_00_polemoniacees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="082-Polémoniacées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_polemoniacees_texte" > bonnier_v0_00_polemoniacees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="083-Convolvulacées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_convolvulacees_plante" > bonnier_v0_00_convolvulacees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="083-Convolvulacées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_convolvulacees_texte" > bonnier_v0_00_convolvulacees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="084-Cuscutacées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_cuscutacees_plante" > bonnier_v0_00_cuscutacees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="084-Cuscutacées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_cuscutacees_texte" > bonnier_v0_00_cuscutacees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="085-Ramondiacées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_ramondiacees_plante" > bonnier_v0_00_ramondiacees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="085-Ramondiacées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_ramondiacees_texte" > bonnier_v0_00_ramondiacees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="086-Borraginées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_borraginees_plante" > bonnier_v0_00_borraginees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="086-Borraginées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_borraginees_texte" > bonnier_v0_00_borraginees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="087-Solanées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_solanees_plante" > bonnier_v0_00_solanees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="087-Solanées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_solanees_texte" > bonnier_v0_00_solanees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="088-Verbascées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_verbascees_plante" > bonnier_v0_00_verbascees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="088-Verbascées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_verbascees_texte" > bonnier_v0_00_verbascees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="089-Scrofularinées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_scrofularinees_plante" > bonnier_v0_00_scrofularinees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="089-Scrofularinées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_scrofularinees_texte" > bonnier_v0_00_scrofularinees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="090-Orobanchées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_orobanchees_plante" > bonnier_v0_00_orobanchees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="090-Orobanchées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_orobanchees_texte" > bonnier_v0_00_orobanchees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="091-Labiées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_labiees_plante" > bonnier_v0_00_labiees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="091-Labiées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_labiees_texte" > bonnier_v0_00_labiees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="092-Acanthacées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_acanthacees_plante" > bonnier_v0_00_acanthacees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="092-Acanthacées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_acanthacees_texte" > bonnier_v0_00_acanthacees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="093-Verbénacées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_verbenacees_plante" > bonnier_v0_00_verbenacees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="093-Verbénacées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_verbenacees_texte" > bonnier_v0_00_verbenacees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="094-Plantaginées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_plantaginees_plante" > bonnier_v0_00_plantaginees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="094-Plantaginées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_plantaginees_texte" > bonnier_v0_00_plantaginees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="095-Plombaginées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_plombaginees_plante" > bonnier_v0_00_plombaginees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="095-Plombaginées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_plombaginees_texte" > bonnier_v0_00_plombaginees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="096-Globulariées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_globulariees_plante" > bonnier_v0_00_globulariees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="096-Globulariées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_globulariees_texte" > bonnier_v0_00_globulariees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="097-Phytolaccées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_phytolaccees_plante" > bonnier_v0_00_phytolaccees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="097-Phytolaccées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_phytolaccees_texte" > bonnier_v0_00_phytolaccees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="098-Amarantacées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_amarantacees_plante" > bonnier_v0_00_amarantacees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="098-Amarantacées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_amarantacees_texte" > bonnier_v0_00_amarantacees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="099-Salsolacées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_salsolacees_plante" > bonnier_v0_00_salsolacees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="099-Salsolacées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_salsolacees_texte" > bonnier_v0_00_salsolacees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="100-Polygonées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_polygonees_plante" > bonnier_v0_00_polygonees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="100-Polygonées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_polygonees_texte" > bonnier_v0_00_polygonees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="101-Daphnoidées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_daphnoidees_plante" > bonnier_v0_00_daphnoidees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="101-Daphnoidées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_daphnoidees_texte" > bonnier_v0_00_daphnoidees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="102-Laurinées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_laurinees_plante" > bonnier_v0_00_laurinees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="102-Laurinées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_laurinees_texte" > bonnier_v0_00_laurinees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="103-Santalacées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_santalacees_plante" > bonnier_v0_00_santalacees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="103-Santalacées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_santalacees_texte" > bonnier_v0_00_santalacees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="104-Eléagnées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_eleagnees_plante" > bonnier_v0_00_eleagnees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="104-Eléagnées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_eleagnees_texte" > bonnier_v0_00_eleagnees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="105-Cytinées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_cytinees_plante" > bonnier_v0_00_cytinees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="105-Cytinées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_cytinees_texte" > bonnier_v0_00_cytinees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="106-Aristolochiées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_aristolochiees_plante" > bonnier_v0_00_aristolochiees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="106-Aristolochiées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_aristolochiees_texte" > bonnier_v0_00_aristolochiees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="107-Empétrées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_empetrees_plante" > bonnier_v0_00_empetrees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="107-Empétrées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_empetrees_texte" > bonnier_v0_00_empetrees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="108-Euphorbiacées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_euphorbiacees_plante" > bonnier_v0_00_euphorbiacees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="108-Euphorbiacées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_euphorbiacees_texte" > bonnier_v0_00_euphorbiacees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="109-Morées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_morees_plante" > bonnier_v0_00_morees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="109-Morées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_morees_texte" > bonnier_v0_00_morees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="110-Ficacées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_ficacees_plante" > bonnier_v0_00_ficacees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="110-Ficacées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_ficacees_texte" > bonnier_v0_00_ficacees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="111-Celtidées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_celtidees_plante" > bonnier_v0_00_celtidees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="111-Celtidées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_celtidees_texte" > bonnier_v0_00_celtidees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="112-Ulmacées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_ulmacees_plante" > bonnier_v0_00_ulmacees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="112-Ulmacées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_ulmacees_texte" > bonnier_v0_00_ulmacees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="113-Urticées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_urticees_plante" > bonnier_v0_00_urticees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="113-Urticées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_urticees_texte" > bonnier_v0_00_urticees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="114-Cannabinées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_cannabinees_plante" > bonnier_v0_00_cannabinees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="114-Cannabinées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_cannabinees_texte" > bonnier_v0_00_cannabinees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="115-Juglandées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_juglandees_plante" > bonnier_v0_00_juglandees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="115-Juglandées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_juglandees_texte" > bonnier_v0_00_juglandees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="116-Cupulifères-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_cupuliferes_plante" > bonnier_v0_00_cupuliferes_plante.sql
perl xls2sql.pl file="116-Cupulifères-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_cupuliferes_texte" > bonnier_v0_00_cupuliferes_texte.sql
perl xls2sql.pl file="117-Salicinées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_salicinees_plante" > bonnier_v0_00_salicinees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="117-Salicinées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_salicinees_texte" > bonnier_v0_00_salicinees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="118-Platanées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_platanees_plante" > bonnier_v0_00_platanees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="118-Platanées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_platanees_texte" > bonnier_v0_00_platanees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="119-Bétulinèes-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_betulinees_plante" > bonnier_v0_00_betulinees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="119-Bétulinèes-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_betulinees_texte" > bonnier_v0_00_betulinees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="120-Myricèes-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_myricees_plante" > bonnier_v0_00_myricees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="120-Myricèes-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_myricees_texte" > bonnier_v0_00_myricees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="121-Alismacées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_alismacees_plante" > bonnier_v0_00_alismacees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="121-Alismacées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_alismacees_texte" > bonnier_v0_00_alismacees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="122-Butomées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_butomees_plante" > bonnier_v0_00_butomees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="122-Butomées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_butomees_texte" > bonnier_v0_00_butomees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="123-Colchicacées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_colchicacees_plante" > bonnier_v0_00_colchicacees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="123-Colchicacées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_colchicacees_texte" > bonnier_v0_00_colchicacees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="124-Liliacées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_liliacees_plante" > bonnier_v0_00_liliacees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="124-Liliacées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_liliacees_texte" > bonnier_v0_00_liliacees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="125-Dioscorées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_dioscorees_plante" > bonnier_v0_00_dioscorees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="125-Dioscorées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_dioscorees_texte" > bonnier_v0_00_dioscorees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="126-Iridées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_iridees_plante" > bonnier_v0_00_iridees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="126-Iridées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_iridees_texte" > bonnier_v0_00_iridees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="127-Amaryllidées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_amaryllidees_plante" > bonnier_v0_00_amaryllidees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="127-Amaryllidées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_amaryllidees_texte" > bonnier_v0_00_amaryllidees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="128-Orchidées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_orchidees_plante" > bonnier_v0_00_orchidees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="128-Orchidées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_orchidees_texte" > bonnier_v0_00_orchidees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="129-Hydrocharidées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_hydrocharidees_plante" > bonnier_v0_00_hydrocharidees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="129-Hydrocharidées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_hydrocharidees_texte" > bonnier_v0_00_hydrocharidees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="130-Joncaginées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_joncaginees_plante" > bonnier_v0_00_joncaginees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="130-Joncaginées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_joncaginees_texte" > bonnier_v0_00_joncaginees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="131-Potamées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_potamees_plante" > bonnier_v0_00_potamees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="131-Potamées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_potamees_texte" > bonnier_v0_00_potamees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="132-Naiadees-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_naiadees_plante" > bonnier_v0_00_naiadees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="132-Naiadees-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_naiadees_texte" > bonnier_v0_00_naiadees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="133-Zosteracées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_zosteracees_plante" > bonnier_v0_00_zosteracees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="133-Zosteracées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_zosteracees_texte" > bonnier_v0_00_zosteracees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="134-Lemnacées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_lemnacees_plante" > bonnier_v0_00_lemnacees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="134-Lemnacées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_lemnacees_texte" > bonnier_v0_00_lemnacees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="135-Aroidées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_aroidees_plante" > bonnier_v0_00_aroidees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="135-Aroidées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_aroidees_texte" > bonnier_v0_00_aroidees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="136-Typhacées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_typhacees_plante" > bonnier_v0_00_typhacees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="136-Typhacées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_typhacees_texte" > bonnier_v0_00_typhacees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="137-Joncées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_joncees_plante" > bonnier_v0_00_joncees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="137-Joncées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_joncees_texte" > bonnier_v0_00_joncees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="138-Cyperacées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_cyperacees_plante" > bonnier_v0_00_cyperacees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="138-Cyperacées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_cyperacees_texte" > bonnier_v0_00_cyperacees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="139-Graminées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_graminees_plante" > bonnier_v0_00_graminees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="139-Graminées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_graminees_texte" > bonnier_v0_00_graminees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="140-Abietinées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_abietinees_plante" > bonnier_v0_00_abietinees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="140-Abietinées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_abietinees_texte" > bonnier_v0_00_abietinees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="141-Cupressinées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_cupressinees_plante" > bonnier_v0_00_cupressinees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="141-Cupressinées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_cupressinees_texte" > bonnier_v0_00_cupressinees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="142-Taxinées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_taxinees_plante" > bonnier_v0_00_taxinees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="142-Taxinées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_taxinees_texte" > bonnier_v0_00_taxinees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="143-Gnetacées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_gnetacees_plante" > bonnier_v0_00_gnetacees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="143-Gnetacées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_gnetacees_texte" > bonnier_v0_00_gnetacees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="144-Fougères-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_fougeres_plante" > bonnier_v0_00_fougeres_plante.sql
perl xls2sql.pl file="144-Fougères-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_fougeres_texte" > bonnier_v0_00_fougeres_texte.sql
perl xls2sql.pl file="145-Ophioglossées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_ophioglossees_plante" > bonnier_v0_00_ophioglossees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="145-Ophioglossées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_ophioglossees_texte" > bonnier_v0_00_ophioglossees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="146-Marsiliacées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_marsiliacees_plante" > bonnier_v0_00_marsiliacees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="146-Marsiliacées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_marsiliacees_texte" > bonnier_v0_00_marsiliacees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="147-Equisétacées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_equisetacees_plante" > bonnier_v0_00_equisetacees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="147-Equisétacées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_equisetacees_texte" > bonnier_v0_00_equisetacees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="148-Isoétées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_isoetees_plante" > bonnier_v0_00_isoetees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="148-Isoétées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_isoetees_texte" > bonnier_v0_00_isoetees_texte.sql
perl xls2sql.pl file="149-Lycopodiacées-Plante.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_lycopodiacees_plante" > bonnier_v0_00_lycopodiacees_plante.sql
perl xls2sql.pl file="149-Lycopodiacées-Texte.xls" skip=0 table="bonnier_v0_00_lycopodiacees_texte" > bonnier_v0_00_lycopodiacees_texte.sql
Property changes:
Added: svn:eol-style
+native
\ No newline at end of property
Added: svn:executable
+*
\ No newline at end of property
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/bonnier/shell/xls2sql.pl
New file
0,0 → 1,205
#!/usr/bin/perl
 
# $Date: 2005/10/19 10:14:00 $
 
# Excel to SQL statements translator.
# Needs the Spreadsheet::ParseExcel module from CPAN
#
# Example usage:
#
# xls2sql.pl help
# xls2sql.pl file=6960_TS_Bressanone_Brixen.xls \
# coldefs="year INTEGER,MEAN1 DOUBLE PRECISION,MEAN2 DOUBLE PRECISION,MEAN3 DOUBLE PRECISION"
#
# Released under GPLv2.0
# by Daniel Calvelo Aros (dca@users.sf.net)
#
# few modifications by MN (why not reading 'Learning Perl' O'Reilly book)
 
#use strict;
use English;
use Spreadsheet::ParseExcel;
# gparser-like options:
# option label => [ref to var to hold opt value, "description", default value or undef for no default]
%gopts = ( file => [\$file, "Name of input excel spreadsheet file", undef],
skip => [\$skip, "Number of rows to skip at the beginning of sheet", 0],
table => [\$tablename,"Name of output table", "mytable"],
rows => [\$nrows, "Number of rows to extract", undef],
sheet => [\$sheetn, "Sheet number to convert from the workbook, counting from 1", 1],
coldefs=> [\$coldefs, "Column definitions as in SQL", "auto"],
nodata => [\$nodata, "No data character(s) used in the Excel table", ""],
help => [\$help, "Help, of course", undef],
debug => [\$DEBUG, "Debugging flag, for developers only", 0]);
#function defined below:
&parse_opts();
 
#-- Open and look for obvious errors
my $wkbk =
Spreadsheet::ParseExcel::Workbook->Parse($file);
if( !defined $wkbk->{Worksheet}) {die "Error:couldn't parse file $file\n"}
my($iR, $iC, $sheet, $ncols, $roffset, $rsize);
$sheet = @{$wkbk->{Worksheet}}[--$sheetn]; #-- Numbering starts at 1 for the user
$ncols = $sheet->{MaxCol} or die "Error:the specified sheet $sheetn does not contain data\n";
$ncols -= $sheet->{MinCol} if defined $sheet->{MinCol} ;
$roffset = $sheet->{MinRow}-1;
$rsize = $sheet->{MaxRow} - $sheet->{MinRow};
die "Error:the specified worksheet seems to contain only one line\n" if $rsize == 0;
$roffset += $skip;
$lastrow = ( defined $nrows
? $nrows + $roffset -1
: $sheet->{MaxRow} );
die "Invalid skip option: the sheet only has $rsize rows" if $roffset >= $rsize - 1;
my (@types, @sqltypes, @firstrow, @titlerow);
 
if($coldefs ne "auto"){
#-- We have user-defined column definitions
#-- Check them
$coldefs =~ s/^\s*//;
$coldefs =~ s/\s*$//;
@defs = split ",", $coldefs;
foreach $i (0..$#defs){
($colname, $typedef) = split /\s+/,$defs[$i],2;
die "Column specification $i: can't parse SQL type definition '$typedef' (should be INTEGER, DOUBLE PRECISION, CHAR).\n" if $typedef !~ /INTEGER|DOUBLE PRECISION|CHAR/i;
die "Column name '$colname' for column $i contains spurious characters (no spaces permitted in list).\n" if $colname !~ /[a-zA-Z][a-zA-Z_0-9]*/;
push @sqltypes, $typedef;
push @titles, $colname;
}
}else{
#-- Inspect file for types:
#-- First estimate initial types from the first row of data
@firstrow = @{$sheet->{Cells}[$roffset+1]};
@types = map { $_->{Type}} @firstrow;
%cvt = (Text=>'CHAR',Numeric=>'INTEGER',Date=>'DOUBLE');
@sqltypes = map { $cvt{$_} } @types;
@lens = map { 0 } @types;
print STDERR "\nTypes:", join ";", @types if $DEBUG;
print STDERR "\nInitial sqltypes:", join ";", @sqltypes if $DEBUG;
#-- Then adjust widths and numeric type from the data
for(my $iR = $roffset ; $iR <= $lastrow ; $iR++) {
for(my $iC = $sheet->{MinCol} ;$iC <= $sheet->{MaxCol} ; $iC++) {
$cell = $sheet->{Cells}[$iR][$iC];
next if !defined $cell;
$cellvalue = $cell->Value;
if($types[$iC] eq 'Text'){
$thislength = length( $cellvalue );
$lens[$iC] = $thislength if $thislength > $lens[$iC];
}else{
if( $cellvalue =~ /[\.,]/ ){
$sqltypes[$iC] = 'DOUBLE PRECISION';
}
if( $cellvalue =~ /[a-df-z]/ ){
$sqltypes[$iC] = 'CHAR'; $lens[$iC] = length( $cellvalue);
}
}
}
}
foreach $i (0..$#sqltypes){
if( $sqltypes[$i] eq 'CHAR' ){
$sqltypes[$i] .= "($lens[$i])";
}
}
print STDERR "\nAdjusted sqltypes:", join ";", @sqltypes if $DEBUG;
 
#-- Generate field names from the title row
@titlerow = @{$sheet->{Cells}[$roffset]};
print STDERR "\nTitlerow:", join ";", map { defined $_ ? $_->Value : "" } @titlerow if $DEBUG;
$varname = "V000";
@titles = map {
/^[^a-zA-Z]/ ? $varname++ : $_
} map {
if( defined $_ && length > 0 ) {$_=$_->Value;y/a-z/A-Z/;s/[^a-zA-Z_0-9]/_/g}
else { $_=$varname++ }
$_;
} @titlerow;
map { $istitle{$_}++ } @titles;
foreach $i (reverse 0..$#titles){
if( $istitle{$titles[$i]} > 1){
$titles[$i] .= --$istitle{$titles[$i]};
}
}
while( $#titles < $ncols ){ #Missing titles, according to the size of the sheet
push @titles, $varname++;
push @sqltypes, "CHAR(32)";
}
print STDERR "\nTitles:" ,join ";", @titles if $DEBUG;
print STDERR "\n" if $DEBUG;
}
 
#-- Write out
print "CREATE TABLE $tablename (";
print join ",", map {"$titles[$_] $sqltypes[$_]"} (0..$#titles);
print ");\n";
if($coldefs eq "auto"){
$lastcol = $sheet->{MaxCol};
}else{
$lastcol = $#sqltypes + $sheet->{MinCol};
foreach $i (reverse 0..$#sqltypes){
$sqltypes[$i + $sheet->{MinCol}] = $sqltypes[$i];
}
}
for(my $iR = $roffset+1 ; $iR <= $lastrow ; $iR++) {
print "INSERT INTO $tablename VALUES(";
print join ",", map {
my $c = $sheet->{Cells}[$iR][$_];
# defined $c ? '"'.&cast($c->Value,$sqltypes[$_]).'"' : NULL
defined $c ? ''.&cast($c->Value,$sqltypes[$_]).'' : NULL
} ($sheet->{MinCol}..$lastcol);
print ");\n"
}
 
sub cast($$){
my ($value, $sqltype) = @_;
if( length($value)>0 ){
if ($value eq $nodata){
$value = "NULL"; # no data coded with char
}else{
if( $sqltype =~ /CHAR\s*\((\d+)\)/i ){
$value =~ s/[\n\r]/ /gm;
$value =~ s/"/\\"/g;
$value =~ s/'/\\'/g;
# $value = substr( $value, 0, $1 );
$value = '\''.substr( $value, 0, $1 ).'\'';
}elsif( $sqltype =~ /DOUBLE PRECISION/i ){
$value += 0;
}elsif( $sqltype =~ /INTEGER/i ){
$value = int $value;
}else{
die "Unknown SQL type '$sqltype'; can't typecast '$value' to that type.\n";
}
}
}else{
$value = "NULL"; # no data
}
}
 
sub parse_opts(){
for $o (sort keys %gopts){
if( defined $gopts{$o}[2] ){
${$gopts{$o}[0]} = $gopts{$o}[2];
}
for $arg (@ARGV){
$arg =~ /^\Q$o\E(?:\s*=\s*(.+)$)?/;
if( length($1)>0 ){
${$gopts{$o}[0]} = $1;
}elsif( $& ){
${$gopts{$o}[0]} = 1;
}
}
}
if($help){
select STDERR;
print "\n$PROGRAM_NAME : extract sheets from an excel workbook and\n";
print "produce SQL statements that create the database\n";
print "\nArguments (use grass style, i.e. arg=value):\n";
foreach (keys %gopts){ $longest = $longest < length() ? length() : $longest }
foreach $arg (grep {!/help/} keys %gopts){
print " $arg".(" "x($longest+2-length $arg));
print $gopts{$arg}[1];
print " (default: ".$gopts{$arg}[2].")" if defined $gopts{$arg}[2];
print "\n";
}
select STDOUT;
die "\n";
}
}
 
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/bonnier/shell/charger_sql.sh
New file
0,0 → 1,149
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/001-Renonculacees" -table renonculacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/002-Berberidees" -table berberidees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/003-Nympheacees" -table nympheacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/004-Papaveracees" -table papaveracees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/005-Fumariacees" -table fumariacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/006-Cruciferes" -table cruciferes
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/007-Capparidees" -table capparidees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/008-Cistinees" -table cistinees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/009-Violariees" -table violariees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/010-Resedacees" -table resedacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/011-Droseracees" -table droseracees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/012-Polygalees" -table polygalees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/013-Frankeniacees" -table frankeniacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/014-Caryophyllees" -table caryophyllees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/015-Elatinees" -table elatinees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/016-Linees" -table linees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/017-Tiliacees" -table tiliacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/018-Malvacees" -table malvacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/019-Geraniees" -table geraniees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/020-Hypericinees" -table hypericinees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/021-Acerinees" -table acerinees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/022-Ampelidees" -table ampelidees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/023-Hippocastanees" -table hippocastanees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/024-Meliacees" -table meliacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/025-Balsaminees" -table balsaminees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/026-tablexalidees" -table oxalidees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/027-Zygophyllees" -table zygophyllees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/028-Hesperidees" -table hesperidees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/029-Rutacees" -table rutacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/030-Coriariees" -table coriariees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/031-Celastrinees" -table celastrinees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/032-Staphyleacees" -table staphyleacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/033-Ilicinees" -table ilicinees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/034-Rhamnees" -table rhamnees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/035-Terebinthacees" -table terebinthacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/036-Papilionacees" -table papilionacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/037-Cesalpiniees" -table cesalpiniees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/038-Rosacees" -table rosacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/039-Granatees" -table granatees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/040-tablenagrariees" -table onagrariees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/041-Myriophyllees" -table myriophyllees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/042-Hippuridees" -table hippuridees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/043-Callitrichinees" -table callitrichinees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/044-Ceratophyllees" -table ceratophyllees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/045-Lythrariees" -table lythrariees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/046-Philadelphees" -table philadelphees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/047-Tamariscinees" -table tamariscinees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/048-Myrtacees" -table myrtacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/049-Cucurbitacees" -table cucurbitacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/050-Portulacees" -table portulacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/051-Paronychiees" -table paronychiees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/052-Crassulacees" -table crassulacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/053-Cactees" -table cactees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/054-Ficoïdees" -table ficoïdees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/055-Grossulariees" -table grossulariees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/056-Saxifragees" -table saxifragees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/057-tablembelliferes" -table ombelliferes
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/058-Araliacees" -table araliacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/059-Cornees" -table cornees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/060-Loranthacees" -table loranthacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/061-Caprifoliacees" -table caprifoliacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/062-Rubiacees" -table rubiacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/063-Valerianees" -table valerianees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/064-Dipsacees" -table dipsacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/065-Composees" -table composees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/066-Ambrosiacees" -table ambrosiacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/067-Lobeliacees" -table lobeliacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/068-Campanulacees" -table campanulacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/069-Vacciniees" -table vacciniees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/070-Ericinees" -table ericinees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/071-Pyrolacees" -table pyrolacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/072-Monotropees" -table monotropees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/073-Lentibulariees" -table lentibulariees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/074-Primulacees" -table primulacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/075-Ebenacees" -table ebenacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/076-Styracees" -table styracees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/077-tableleinees" -table oleinees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/078-Jasminees" -table jasminees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/079-Apocynees" -table apocynees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/080-Asclepiadees" -table asclepiadees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/081-Gentianees" -table gentianees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/082-Polemoniacees" -table polemoniacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/083-Convolvulacees" -table convolvulacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/084-Cuscutacees" -table cuscutacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/085-Ramondiacees" -table ramondiacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/086-Borraginees" -table borraginees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/087-Solanees" -table solanees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/088-Verbascees" -table verbascees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/089-Scrofularinees" -table scrofularinees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/090-tablerobanchees" -table orobanchees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/091-Labiees" -table labiees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/092-Acanthacees" -table acanthacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/093-Verbenacees" -table verbenacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/094-Plantaginees" -table plantaginees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/095-Plombaginees" -table plombaginees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/096-Globulariees" -table globulariees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/097-Phytolaccees" -table phytolaccees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/098-Amarantacees" -table amarantacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/099-Salsolacees" -table salsolacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/100-Polygonees" -table polygonees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/101-Daphnoidees" -table daphnoidees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/102-Laurinees" -table laurinees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/103-Santalacees" -table santalacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/104-Eleagnees" -table eleagnees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/105-Cytinees" -table cytinees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/106-Aristolochiees" -table aristolochiees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/107-Empetrees" -table empetrees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/108-Euphorbiacees" -table euphorbiacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/109-Morees" -table morees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/110-Ficacees" -table ficacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/111-Celtidees" -table celtidees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/112-Ulmacees" -table ulmacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/113-Urticees" -table urticees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/114-Cannabinees" -table cannabinees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/115-Juglandees" -table juglandees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/116-Cupuliferes" -table cupuliferes
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/117-Salicinees" -table salicinees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/118-Platanees" -table platanees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/119-Betulinees" -table betulinees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/120-Myricees" -table myricees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/121-Alismacees" -table alismacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/122-Butomees" -table butomees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/123-Colchicacees" -table colchicacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/124-Liliacees" -table liliacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/125-Dioscorees" -table dioscorees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/126-Iridees" -table iridees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/127-Amaryllidees" -table amaryllidees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/128-tablerchidees" -table orchidees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/129-Hydrocharidees" -table hydrocharidees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/130-Joncaginees" -table joncaginees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/131-Potamees" -table potamees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/132-Naiadees" -table naiadees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/133-Zosteracees" -table zosteracees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/134-Lemnacees" -table lemnacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/135-Aroidees" -table aroidees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/136-Typhacees" -table typhacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/137-Joncees" -table joncees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/138-Cyperacees" -table cyperacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/139-Graminees" -table graminees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/140-Abietinees" -table abietinees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/141-Cupressinees" -table cupressinees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/142-Taxinees" -table taxinees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/143-Gnetacees" -table gnetacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/144-Fougeres" -table fougeres
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/145-tablephioglossees" -table ophioglossees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/146-Marsiliacees" -table marsiliacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/147-Equisetacees" -table equisetacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/148-Isoetees" -table isoetees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a charger -dossier "menus/149-Lycopodiacees" -table lycopodiacees
Property changes:
Added: svn:eol-style
+native
\ No newline at end of property
Added: svn:executable
+*
\ No newline at end of property
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/bonnier/shell/generer_html.sh
New file
0,0 → 1,149
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/001-Renonculacees" -table renonculacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/002-Berberidees" -table berberidees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/003-Nympheacees" -table nympheacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/004-Papaveracees" -table papaveracees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/005-Fumariacees" -table fumariacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/006-Cruciferes" -table cruciferes
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/007-Capparidees" -table capparidees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/008-Cistinees" -table cistinees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/009-Violariees" -table violariees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/010-Resedacees" -table resedacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/011-Droseracees" -table droseracees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/012-Polygalees" -table polygalees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/013-Frankeniacees" -table frankeniacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/014-Caryophyllees" -table caryophyllees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/015-Elatinees" -table elatinees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/016-Linees" -table linees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/017-Tiliacees" -table tiliacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/018-Malvacees" -table malvacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/019-Geraniees" -table geraniees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/020-Hypericinees" -table hypericinees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/021-Acerinees" -table acerinees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/022-Ampelidees" -table ampelidees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/023-Hippocastanees" -table hippocastanees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/024-Meliacees" -table meliacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/025-Balsaminees" -table balsaminees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/026-tablexalidees" -table oxalidees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/027-Zygophyllees" -table zygophyllees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/028-Hesperidees" -table hesperidees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/029-Rutacees" -table rutacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/030-Coriariees" -table coriariees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/031-Celastrinees" -table celastrinees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/032-Staphyleacees" -table staphyleacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/033-dossierlicinees" -table ilicinees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/034-Rhamnees" -table rhamnees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/035-Terebinthacees" -table terebinthacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/036-Papilionacees" -table papilionacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/037-Cesalpiniees" -table cesalpiniees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/038-Rosacees" -table rosacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/039-Granatees" -table granatees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/040-tablenagrariees" -table onagrariees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/041-Myriophyllees" -table myriophyllees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/042-Hippuridees" -table hippuridees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/043-Callitrichinees" -table callitrichinees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/044-Ceratophyllees" -table ceratophyllees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/045-Lythrariees" -table lythrariees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/046-Philadelphees" -table philadelphees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/047-Tamariscinees" -table tamariscinees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/048-Myrtacees" -table myrtacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/049-Cucurbitacees" -table cucurbitacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/050-Portulacees" -table portulacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/051-Paronychiees" -table paronychiees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/052-Crassulacees" -table crassulacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/053-Cactees" -table cactees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/054-Ficoïdees" -table ficoïdees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/055-Grossulariees" -table grossulariees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/056-Saxifragees" -table saxifragees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/057-tablembelliferes" -table ombelliferes
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/058-Araliacees" -table araliacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/059-Cornees" -table cornees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/060-Loranthacees" -table loranthacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/061-Caprifoliacees" -table caprifoliacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/062-Rubiacees" -table rubiacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/063-Valerianees" -table valerianees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/064-Dipsacees" -table dipsacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/065-Composees" -table composees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/066-Ambrosiacees" -table ambrosiacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/067-Lobeliacees" -table lobeliacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/068-Campanulacees" -table campanulacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/069-Vacciniees" -table vacciniees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/070-Ericinees" -table ericinees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/071-Pyrolacees" -table pyrolacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/072-Monotropees" -table monotropees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/073-Lentibulariees" -table lentibulariees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/074-Primulacees" -table primulacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/075-Ebenacees" -table ebenacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/076-Styracees" -table styracees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/077-tableleinees" -table oleinees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/078-Jasminees" -table jasminees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/079-Apocynees" -table apocynees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/080-Asclepiadees" -table asclepiadees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/081-Gentianees" -table gentianees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/082-Polemoniacees" -table polemoniacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/083-Convolvulacees" -table convolvulacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/084-Cuscutacees" -table cuscutacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/085-Ramondiacees" -table ramondiacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/086-Borraginees" -table borraginees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/087-Solanees" -table solanees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/088-Verbascees" -table verbascees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/089-Scrofularinees" -table scrofularinees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/090-tablerobanchees" -table orobanchees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/091-Labiees" -table labiees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/092-Acanthacees" -table acanthacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/093-Verbenacees" -table verbenacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/094-Plantaginees" -table plantaginees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/095-Plombaginees" -table plombaginees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/096-Globulariees" -table globulariees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/097-Phytolaccees" -table phytolaccees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/098-Amarantacees" -table amarantacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/099-Salsolacees" -table salsolacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/100-Polygonees" -table polygonees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/101-Daphnoidees" -table daphnoidees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/102-Laurinees" -table laurinees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/103-Santalacees" -table santalacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/104-Eleagnees" -table eleagnees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/105-Cytinees" -table cytinees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/106-Aristolochiees" -table aristolochiees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/107-Empetrees" -table empetrees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/108-Euphorbiacees" -table euphorbiacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/109-Morees" -table morees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/110-Ficacees" -table ficacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/111-Celtidees" -table celtidees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/112-Ulmacees" -table ulmacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/113-Urticees" -table urticees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/114-Cannabinees" -table cannabinees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/115-Juglandees" -table juglandees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/116-Cupuliferes" -table cupuliferes
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/117-Salicinees" -table salicinees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/118-Platanees" -table platanees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/119-Betulinees" -table betulinees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/120-Myricees" -table myricees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/121-Alismacees" -table alismacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/122-Butomees" -table butomees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/123-Colchicacees" -table colchicacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/124-Liliacees" -table liliacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/125-Dioscorees" -table dioscorees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/126-dossierridees" -table iridees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/127-Amaryllidees" -table amaryllidees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/128-tablerchidees" -table orchidees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/129-Hydrocharidees" -table hydrocharidees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/130-Joncaginees" -table joncaginees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/131-Potamees" -table potamees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/132-Naiadees" -table naiadees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/133-Zosteracees" -table zosteracees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/134-Lemnacees" -table lemnacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/135-Aroidees" -table aroidees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/136-Typhacees" -table typhacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/137-Joncees" -table joncees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/138-Cyperacees" -table cyperacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/139-Graminees" -table graminees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/140-Abietinees" -table abietinees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/141-Cupressinees" -table cupressinees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/142-Taxinees" -table taxinees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/143-Gnetacees" -table gnetacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/144-Fougeres" -table fougeres
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/145-tablephioglossees" -table ophioglossees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/146-Marsiliacees" -table marsiliacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/147-Equisetacees" -table equisetacees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/148-dossiersoetees" -table isoetees
/opt/lampp/bin/php ../../../script.php bonnier -p bonnier -a html -dossier "menus/149-Lycopodiacees" -table lycopodiacees
Property changes:
Added: svn:eol-style
+native
\ No newline at end of property
Added: svn:executable
+*
\ No newline at end of property
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/bonnier/bonnier.ini
New file
0,0 → 1,20
; Encodage : UTF-8
; Exemple de fichier de configuration d'un projet
; Les commentaires commencent par ';', comme dans php.ini
 
; Indique le nom du projet
projet_nom = bonnier
; Indique le nombre sur un chiffre de la version du projet
version = 0
; Indique le nombre sur deux chiffres de la sous version du projet
sous_version = 00
; Indique la date de début de cette version du projet
date_debut = "2009-12-11 00:00:00"
; Indique la date de fin de cette version du projet
date_fin = NULL
; Indique le chemin où les fichier html vont être générés
chemin_fichier_sortie = "php:'/home/'.'david'.'/Bureau/bonnierhtml/'"
; Indique le chemin où trouver le fichier du projet contenant les données à charger puis standardiser
chemin_fichier_tab = "php:'/home/'.'david'.'/Bureau/bonnierhtml/'"
; Indique le chemin où stocker le fichier de log
log_chemin = "php:'/home/'.'david'.'/Bureau/bonnierhtml/'"
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/baseflor/log
New file
Property changes:
Added: svn:ignore
+test
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/baseflor/Baseflor.php
New file
0,0 → 1,313
<?php
/** Exemple lancement:
* /opt/lampp/bin/php -d memory_limit=3500M ~/web/eflore-projets/scripts/cli.php baseflor -a chargerTous
*/
class Baseflor extends EfloreScript {
 
private $table = null;
 
 
public function executer() {
try {
$this->initialiserProjet('baseflor');
$cmd = $this->getParametre('a');
switch ($cmd) {
case 'chargerStructureSql' :
$this->chargerStructureSql();
break;
case 'chargerMetadonnees':
$this->chargerMetadonnees();
break;
case 'chargerOntologies' :
$this->chargerOntologies();
break;
case 'verifierFichier' :
$this->verifierFichier();
break;
case 'chargerDonnees' :
$this->chargerDonnees();
break;
case 'genererChamps' :
$this->genererChamps();
break;
case 'chargerTous':
$this->chargerStructureSql();
$this->chargerMetadonnees();
$this->chargerOntologies();
$this->chargerDonnees();
$this->genererChamps();
$this->insererDonneesBaseflorRangSupEcolo();
$this->insererDonneesIndex();
break;
case 'insererDonneesRangSup' :
$this->insererDonneesBaseflorRangSupEcolo();
break;
case 'supprimerTous' :
$this->supprimerTous();
break;
case 'voirRangSup' :
$this->voirRangSup();
break;
case 'voirRangSupEcologie' :
$this->voirRangSupEcologie();
break;
case 'insererDonneesIndex' :
$this->insererDonneesIndex();
break;
default :
throw new Exception("Erreur : la commande '$cmd' n'existe pas!");
}
} catch (Exception $e) {
$this->traiterErreur($e->getMessage());
}
}
 
 
//-- traitement de la table baseflorRangSupInsertion --//
 
private function getClasseBaseflorRangSupInsertion() {
$conteneur = new Conteneur();
require_once dirname(__FILE__)."/BaseflorRangSupInsertion.php";
$rangSupInsert = new BaseflorRangSupInsertion($conteneur, $this->getBdd());
return $rangSupInsert;
}
 
private function insererDonneesBaseflorRangSupEcolo(){
$rangSupInsert = $this->getClasseBaseflorRangSupInsertion();
$rangSupInsert->insererDonnees();
}
 
private function voirRangSup(){
$rangSupInsert = $this->getClasseBaseflorRangSupInsertion();
$rangSupInsert->testAscendantsDeBaseflor();
}
 
private function voirRangSupEcologie(){
$rangSupInsert = $this->getClasseBaseflorRangSupInsertion();
$rangSupInsert->testEcologieAscendantsDeBaseflor();
}
 
 
//-- traitement de la table baseflorIndex --//
 
private function getClasseBaseflorIndex() {
$conteneur = new Conteneur();
require_once dirname(__FILE__)."/BaseflorIndex.php";
$Index = new BaseflorIndex($conteneur, $this->getBdd());
return $Index;
}
 
private function insererDonneesIndex(){
$Index= $this->getClasseBaseflorIndex();
$Index->insererDonnees();
}
 
 
//-- traitement de la table generer champs --//
 
private function genererChamps(){
$this->initialiserGenerationChamps();
$this->ajouterChamps();
$this->analyserChampsExistant();
}
 
private function initialiserGenerationChamps() {
$this->table = Config::get('tables.donnees');
}
 
private function ajouterChamps() {
$this->preparerTablePrChpsBDNT();
$this->preparerTablePrChpsNumTaxon();
$this->preparerTablePrChpsNumNomen();
}
 
private function preparerTablePrChpsBDNT() {
$requete = "SHOW COLUMNS FROM {$this->table} LIKE 'BDNT' ";
$resultat = $this->getBdd()->recuperer($requete);
if ($resultat === false) {
$requete = "ALTER TABLE {$this->table} ".
'ADD BDNT VARCHAR( 6 ) '.
'CHARACTER SET utf8 COLLATE utf8_general_ci '.
'NOT NULL AFTER catminat_code ';
$this->getBdd()->requeter($requete);
}
}
 
private function preparerTablePrChpsNumTaxon() {
$requete = "SHOW COLUMNS FROM {$this->table} LIKE 'num_taxon' ";
$resultat = $this->getBdd()->recuperer($requete);
if ($resultat === false) {
$requete = "ALTER TABLE {$this->table} ".
'ADD num_taxon INT( 10 ) NOT NULL '.
'AFTER catminat_code';
$this->getBdd()->requeter($requete);
}
}
 
private function preparerTablePrChpsNumNomen() {
$requete = "SHOW COLUMNS FROM {$this->table} LIKE 'num_nomen' ";
$resultat = $this->getBdd()->recuperer($requete);
if ($resultat === false) {
$requete = "ALTER TABLE {$this->table} ".
'ADD num_nomen INT( 10 ) NOT NULL '.
'AFTER catminat_code';
$this->getBdd()->requeter($requete);
}
}
 
private function analyserChampsExistant() {
$resultats = $this->recupererTuplesNumsOriginels();
foreach ($resultats as $chps) {
$cle = $chps['cle'];
$nno = $chps['num_nomen_originel'];
$nto = $chps['num_taxon_originel'];
 
$valeurs = array();
$valeurs["BDNT"] = $this->genererChpsBDNT($nno, $nto);
$valeurs["num_taxon"] = $this->genererChpsNumTaxon($nto);
$valeurs["num_nomen"] = $this->genererChpsNumNomen($nno);
 
$this->remplirChamps($cle, $valeurs);
 
$this->afficherAvancement("Insertion des valeurs dans la base en cours");
}
echo "\n";
}
 
private function recupererTuplesNumsOriginels(){
$requete = "SELECT cle, num_taxon_originel, num_nomen_originel FROM {$this->table} ";
$resultat = $this->getBdd()->recupererTous($requete);
return $resultat;
}
 
private function genererChpsBDNT($nno, $nto) {
$bdnt = '';
if (preg_match("/^([AB])[0-9]+$/", $nno, $retour) || preg_match("/^([AB])[0-9]+$/", $nto, $retour)){
if ($retour[1]=='A') {
$bdnt = "BDAFX";
} else {
$bdnt = "BDBFX";
}
} elseif (($nno == 'nc') && ($nto == 'nc')) {
$bdnt = "nc";
} else {
$bdnt = "BDTFX";
}
return $bdnt;
}
 
private function genererChpsNumTaxon($nto){
$num_taxon = '';
if (preg_match("/^[AB]([0-9]+)$/", $nto, $retour)) {
$num_taxon = intval($retour[1]);
} elseif($nto == 'nc') {
$num_taxon = 0;
} else {
$num_taxon = intval($nto);
}
return $num_taxon;
}
 
private function genererChpsNumNomen($nno) {
$num_nomen = '';
if (preg_match("/^[AB]([0-9]+)$/", $nno, $retour)) {
$num_nomen = intval($retour[1]);
} elseif ($nno == 'nc') {
$num_nomen = 0;
} else {
$num_nomen = intval($nno);
}
return $num_nomen;
}
 
private function remplirChamps($cle, $valeurs) {
foreach ($valeurs as $nomChamp => $valeurChamp) {
$valeurChamp = $this->getBdd()->proteger($valeurChamp);
$requete = "UPDATE {$this->table} SET $nomChamp = $valeurChamp WHERE cle = $cle ";
$resultat = $this->getBdd()->requeter($requete);
if ($resultat === false) {
throw new Exception("Erreur d'insertion pour le tuple clé = $cle");
}
}
}
 
//+------------------------------------------------------------------------------------------------------+
// chargements, suppression, exécution
 
protected function chargerMetadonnees() {
$contenuSql = $this->recupererContenu(Config::get('chemins.metadonnees'));
$this->executerScriptSql($contenuSql);
}
 
private function chargerOntologies() {
$chemin = Config::get('chemins.ontologies');
$table = Config::get('tables.ontologies');
$requete = "LOAD DATA INFILE '$chemin' ".
"REPLACE INTO TABLE $table ".
'CHARACTER SET utf8 '.
'FIELDS '.
" TERMINATED BY '\t' ".
" ENCLOSED BY '' ".
" ESCAPED BY '\\\' "
;
$this->getBdd()->requeter($requete);
}
 
protected function chargerStructureSql() {
$contenuSql = $this->recupererContenu(Config::get('chemins.structureSql'));
$this->executerScriptSql($contenuSql);
}
 
protected function executerScriptSql($sql) {
$requetes = Outils::extraireRequetes($sql);
foreach ($requetes as $requete) {
$this->getBdd()->requeter($requete);
}
}
 
private function chargerDonnees() {
$nb_err = $this->verifierFichier();
if ($nb_err > 0) {
$e = "Je ne peux pas charger les données car le fichier comporte des erreurs.".
"Voir le fichier baseflor_verif.txt\n";
throw new Exception($e);
}
 
$table = Config::get('tables.donnees');
$requete = "LOAD DATA INFILE '".Config::get('chemins.donnees')."' ".
"REPLACE INTO TABLE $table ".
'CHARACTER SET utf8 '.
'FIELDS '.
" TERMINATED BY '\t' ".
" ENCLOSED BY '' ".
" ESCAPED BY '\\\'";
$this->getBdd()->requeter($requete);
}
 
private function supprimerTous() {
// TODO : rajouter une boucle utilisant un parametre de config stockant toutes les versions pour supprimer les tables
$requete = "DROP TABLE IF EXISTS baseflor_meta, baseflor_ontologies, ".
" baseflor_v2012_03_19, ".
" baseflor_v2012_05_08, baseflor_rang_sup_ecologie_v2012_05_08, baseflor_index_v2012_05_08, ".
" baseflor_v2012_12_31, baseflor_rang_sup_ecologie_v2012_12_31, baseflor_index_v2012_12_31, ".
" baseflor_v2013_07_04, baseflor_rang_sup_ecologie_v2013_07_04, baseflor_index_v2013_07_04";
$this->getBdd()->requeter($requete);
}
 
//++------------------------------------verifierFichier------------------------------------------++//
 
private function getClasseBaseflorVerif() {
$conteneur = new Conteneur();
require_once dirname(__FILE__)."/BaseflorVerif.php";
$verif = new BaseflorVerif($conteneur,'baseflor');
return $verif;
}
 
private function verifierFichier() {
$verif = $this->getClasseBaseflorVerif();
$nb_erreurs = $verif->verifierFichier(Config::get('chemins.donnees'));
return $nb_erreurs;
}
 
}
?>
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/baseflor/BaseflorIndex.php
New file
0,0 → 1,83
<?php
/**
*
* @author Mathilde SALTHUN-LASSALLE <mathilde@tela-botanica.org>
*
*
*/
class BaseflorIndex {
private $conteneur;
private $efloreCommun;
private $message;
private $dossierBase;
private $valeurs_insertion = array();
private $Bdd;
public function __construct(Conteneur $conteneur, Bdd $Bdd) {
$this->conteneur = $conteneur;
$this->Bdd = $Bdd;
$this->efloreCommun = $conteneur->getEfloreCommun();
$this->message = $conteneur->getMessages();
$this->dossierBase = dirname(__FILE__).'/';
}
public function insererDonnees(){
$this->efloreCommun->chargerFichierSql('chemins.index_sql');
$this->recupererDonneesBaseflor();
$this->recupererDonneesRangSup();
$this->insererDonneesIndex();
}
private function recupererDonneesBaseflor() {
$table = Config::get('tables.donnees');
$requete = "SELECT cle, num_nomen, BDNT FROM $table WHERE num_nomen != 0 ".
" AND num_nomen != 0 ".
" AND !(ve_lumiere = '' and ve_mat_org_sol = '' and ve_temperature = '' and ve_continentalite = '' ".
" and ve_humidite_atmos = '' and ve_humidite_edaph = '' and ve_nutriments_sol = '' and ve_salinite = ''".
" and ve_texture_sol = '' and ve_reaction_sol = '')";
$resultat = $this->Bdd->recupererTous($requete);
$this->valeurs_insertion['baseflor'] = $resultat;
$this->valeurs_insertion['rangSup'] = $resultat;
}
private function recupererDonneesRangSup() {
$table = Config::get('tables.rang_sup');
$requete = "SELECT cle, num_nomen, bdnt FROM $table ;";
$resultat = $this->Bdd->recupererTous($requete);
$this->valeurs_insertion['rangSup']= $resultat;
 
}
 
private function insererDonneesIndex() {
$table = Config::get('tables.index');
$requete_truncate = 'TRUNCATE TABLE '.$table;
$this->Bdd->requeter($requete_truncate);
$i = 0;
foreach ($this->valeurs_insertion as $tab => $res){
if ($tab == 'baseflor') {
foreach ($res as $valeurs ) {
if ($valeurs['num_nomen'] != 0) {
$requete = "INSERT INTO $table VALUES({$i},{$valeurs['cle']},null,'".strtolower($valeurs['BDNT']).".nn:{$valeurs['num_nomen']}')";
$this->Bdd->requeter($requete);
$i++;
$this->message->afficherAvancement('Insertion des valeurs issues de baseflor en cours');
}
}
} else {
foreach ($res as $valeurs ) {
if ($valeurs['num_nomen'] != 0) {
$requete = "INSERT INTO $table VALUES({$i},null,{$valeurs['cle']},'{$valeurs['bdnt']}.nn:{$valeurs['num_nomen']}')";
$this->Bdd->requeter($requete);
$i++;
$this->message->afficherAvancement('Insertion des valeurs issues des rangs supérieurs en cours');
}
}
}
}
}
}
?>
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/baseflor/baseflor.ini
New file
0,0 → 1,52
version="2014_04_25"
dossierTsv = "{ref:dossierDonneesEflore}baseflor/2014-04-25/"
dossierSql = "{ref:dossierTsv}"
dossierRangSup = "{ref:dossierDonneesEflore}baseflor/2014-04-25/rang_sup/"
dossierIndex = "{ref:dossierDonneesEflore}baseflor/2014-04-25/index/"
 
[tables]
donnees = "baseflor_v{ref:version}"
ontologies = "baseflor_ontologies"
metadonnees = "baseflor_meta"
rang_sup = "baseflor_rang_sup_ecologie_v{ref:version}"
taxons = "bdtfx_v2_00";
index = "baseflor_index_v{ref:version}";
 
 
 
[fichiers]
structureSql = "baseflor.sql"
metadonnees = "insertion_baseflor_meta.sql"
donnees = "baseflor_v{ref:version}.tsv"
donnees_verif = "baseflor_verif.txt"
ontologies = "baseflor_ontologies.tsv"
rang_sup_sql = "baseflor_rang_sup_ecologie.sql"
index_sql = "baseflor_index.sql"
 
[chemins]
structureSql = "{ref:dossierSql}{ref:fichiers.structureSql}"
donnees = "{ref:dossierTsv}{ref:fichiers.donnees}"
donnees_verif = "{ref:dossierTsv}{ref:fichiers.donnees_verif}"
ontologies ="{ref:dossierTsv}{ref:fichiers.ontologies}"
metadonnees = "{ref:dossierSql}{ref:fichiers.metadonnees}"
rang_sup_sql = "{ref:dossierRangSup}{ref:fichiers.rang_sup_sql}"
index_sql = "{ref:dossierIndex}{ref:fichiers.index_sql}"
 
[services]
url_base="http://localhost/"
url_service_base="{ref:url_base}service:eflore:0.1/"
 
[Parametres]
typesBio = "A,a,B,b,C,c,Cfru,cfru,Csuf,csuf,Ccou,ccou,H,h,Heri,heri,Hsto,hsto,Hces,hces,Hros,hros,Hrub,hrub,Hbis,hbis,G,g,Gbul,gbul,Gtub,gtub,Grhi,grhi,T,t,Tver,tver,Test,test"
sousTypesBio = "aqua,lia,épi,hpar,par,suc,semp,cad,car"
signesSeuls = "?, x, x~, x=, xb, xB, -"
signesNonSeuls = "~, =, b, B"
intervalles = "1-9 = 23;24;25;26;28;29;31;32;33;34;35;37;38,
1-12 = 27;36,
0-9 = 30;39"
motifs = "/(^[0-9]*\/)|(inconnu)/ = 1,
/(^[AB]?[0-9]+$)|(^nc$)/ = 2;3,
/[^0-9]+/ = 4;5;6;7;8;9;10;11;12;13;16;19;20;21;22;40;41;42;43;44;45;46;47;48;49;50;51;52;53;54;55,
/^([1-9]|1[0-2])(\-([1-9]|1[0-2]))*$/ = 14"
champsEcologiques = "ve_lumiere,ve_temperature,ve_continentalite,ve_humidite_atmos,ve_humidite_edaph,ve_reaction_sol,ve_nutriments_sol,ve_salinite,ve_texture_sol,ve_mat_org_sol"
 
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/baseflor/BaseflorRangSupInsertion.php
New file
0,0 → 1,272
<?php
/**
*
*
* @author Mathilde SALTHUN-LASSALLE <mathilde@tela-botanica.org>
*
*
*/
class BaseflorRangSupInsertion {
private $table = null;
private $donnees_initiales = array();
private $valeurs_insertion;
private $infos_taxon = array();
private $conteneur;
private $efloreCommun;
private $message;
private $outils;
private $nn_courant;
private $nn_superieur;
private $champs_ecologiques = array();
private $Bdd;
public function __construct(Conteneur $conteneur, Bdd $bdd) {
$this->conteneur = $conteneur;
$this->Bdd = $bdd;
$this->efloreCommun = $conteneur->getEfloreCommun();
$this->message = $conteneur->getMessages();
$this->outils = $conteneur->getOutils();
$this->dossierBase = dirname(__FILE__).'/';
}
public function insererDonnees(){
echo "Chargement de la structure en cours \n" ;
$this->efloreCommun->chargerFichierSql('chemins.rang_sup_sql');
echo "Récupération des données de baseflor en cours \n";
$this->recupererDonneesInitiales();
echo "Calcul des valeurs pour les rangs supérieurs en cours \n";
$this->consulterInfosTaxons();
$this->recupererValeursInsertion();
$this->insererDonneesRangSup();
}
private function insererDonneesRangSup() {
$table = Config::get('tables.rang_sup');
$requete_truncate = 'TRUNCATE TABLE '.$table;
$this->Bdd->requeter($requete_truncate);
$i = 0;
foreach ($this->valeurs_insertion as $nn => $valeurs){
$requete = "INSERT INTO $table VALUES({$i},$nn, 'bdtfx', '{$valeurs['ve_lumiere']['min']}', ".
"'{$valeurs['ve_lumiere']['max']}','{$valeurs['ve_temperature']['min']}',".
"'{$valeurs['ve_temperature']['max']}','{$valeurs['ve_continentalite']['min']}',".
"'{$valeurs['ve_continentalite']['max']}','{$valeurs['ve_humidite_atmos']['min']}',".
"'{$valeurs['ve_humidite_atmos']['max']}','{$valeurs['ve_humidite_edaph']['min']}',".
"'{$valeurs['ve_humidite_edaph']['max']}','{$valeurs['ve_reaction_sol']['min']}',".
"'{$valeurs['ve_reaction_sol']['max']}','{$valeurs['ve_nutriments_sol']['min']}',".
"'{$valeurs['ve_nutriments_sol']['max']}','{$valeurs['ve_salinite']['min']}',".
"'{$valeurs['ve_salinite']['max']}','{$valeurs['ve_texture_sol']['min']}',".
"'{$valeurs['ve_texture_sol']['max']}','{$valeurs['ve_mat_org_sol']['min']}',".
"'{$valeurs['ve_mat_org_sol']['max']}');";
$this->Bdd->requeter($requete);
$i++;
$this->message->afficherAvancement('Insertion des valeurs pour les rangs supérieurs en cours');
}
}
 
 
// dans cette solution je parcours les donnees de baseflor
// je teste une donnée (si min max) pour récuperer les valeurs pour chaque rang superieur
// jusqu'à famille (180) puis je passe à la suivante jusqu'à avoir parcouru tout baseflor
private function recupererValeursInsertion(){
$this->champs_ecologiques = $this->outils->recupererTableauConfig(Config::get('Parametres.champsEcologiques'));
$this->valeurs_insertion = array();
if (empty($this->donnees_initiales)) {
throw new Exception("Erreur : pas de données à traiter.");
} else {
foreach ($this->donnees_initiales as $nn => $ecologie) {
$this->nn_courant = $nn;
$this->nn_superieur = isset($this->infos_taxon[$this->nn_courant]) ? $this->infos_taxon[$this->nn_courant]['nn_sup'] : null;
$rang = isset($this->infos_taxon[$this->nn_superieur]) ? $this->infos_taxon[$this->nn_superieur]['rang'] : 179 ;
while ($rang >= 180){
if (!isset($donnees_initiales[$this->nn_superieur])) {
foreach ($this->champs_ecologiques as $nom) {
$this->testerSiMinMax($nom, $ecologie[$nom]);
}
}
$this->nn_superieur = isset($this->infos_taxon[$this->nn_superieur]) ? $this->infos_taxon[$this->nn_superieur]['nn_sup'] : null;
$rang = !empty($this->nn_superieur) ? $this->infos_taxon[$this->nn_superieur]['rang'] : 179 ;
}
}
}
}
// ici je parcours toutes les données de baseflor et je teste et récupère les valeurs pour le rang superieur
//direct puis je récupère les données obtenues et je recommence jusqu'à que tous les rangs obtenus soient des familles
private function recupererValeursInsertion2(){
$this->champs_ecologiques = $this->outils->recupererTableauConfig(Config::get('Parametres.champsEcologiques'));
$this->valeurs_insertion = array();
if (empty($this->donnees_initiales)) {
throw new Exception("Erreur : pas de données à traiter.");
} else {
$donnees_traitees = $this->donnees_initiales;
$donnees_deja_traitees = array();
$condition_fin = true;
$tab_num_nom = array_keys($donnees_traitees);
while (!empty($donnees_traitees)) {
reset($donnees_traitees);
$this->nn_courant = array_shift($tab_num_nom);
$data = array_shift($donnees_traitees);
if (isset($this->infos_taxon[$this->nn_courant])) {
$this->nn_superieur = $this->infos_taxon[$this->nn_courant]['nn_sup'];
if (!isset($donnees_deja_traitees[$this->nn_courant])) {
if ($this->infos_taxon[$this->nn_superieur]['rang'] >= 180){
$condition_fin = false;
foreach ($this->champs_ecologiques as $nom) {
$this->testerSiMinMax($nom, $data[$nom]);
}
}
}
$donnees_deja_traitees[$this->nn_courant] = 1;
}
if ($condition_fin == false && empty($donnees_traitees)) {
$donnees_traitees = $this->valeurs_insertion;
$tab_num_nom = array_keys($donnees_traitees);
$condition_fin = true;
}
}
}
}
// je stocke des valeurs à insérer sous la forme : $insertion [{nn_tax_sup}][{nom_de_chps}][{max ou min}] = {valeur}
private function testerSiMinMax($nom, $valeur) {
$nn = $this->nn_superieur;
if ( !isset($this->valeurs_insertion[$nn][$nom]['min'])
|| empty($valeur['min'])
|| empty($this->valeurs_insertion[$nn][$nom]['min'])
|| $this->valeurs_insertion[$nn][$nom]['min'] > $valeur['min'] ){
$this->valeurs_insertion[$nn][$nom]['min'] = $valeur['min'];
}
if ( !isset($this->valeurs_insertion[$nn][$nom]['max'])
|| empty($this->valeurs_insertion[$nn][$nom]['max'])
|| empty($valeur['max'])
|| $this->valeurs_insertion[$nn][$nom]['max'] < $valeur['max'] ) {
$this->valeurs_insertion[$nn][$nom]['max'] = $valeur['max'];
}
}
// je stocke les infos taxons sous la forme : $info_taxon[{num_nomem}][{num_nomen_sup ou rang}] = {valeur}
private function consulterInfosTaxons() {
$table = Config::get('tables.taxons');
$requete = 'SELECT A.num_nom AS nn, B.num_tax_sup AS nn_sup, A.rang '.
"FROM $table A JOIN $table B ON (A.num_nom_retenu = B.num_nom) ".
'WHERE B.num_nom = B.num_nom_retenu ';
$resultat = $this->Bdd->recupererTous($requete);
foreach ($resultat as $res) {
$this->infos_taxon[$res['nn']] = array('nn_sup' => $res['nn_sup'], 'rang' => $res['rang'] );
}
}
// je stocke les valeurs initiales sous la forme : $initiales[{nn_nomem}][{champs ecologique}][{'min' ou 'max'}]
private function recupererDonneesInitiales() {
$table = Config::get('tables.donnees');
$requete = "SELECT num_nomen, ve_lumiere, ve_temperature, ve_continentalite, ve_humidite_atmos, ".
"ve_humidite_edaph, ve_reaction_sol, ve_nutriments_sol, ve_salinite, ve_texture_sol, ve_mat_org_sol ".
"FROM $table WHERE BDNT = 'BDTFX' ".
" AND num_nomen != 0 ".
" AND !(ve_lumiere = '' and ve_mat_org_sol = '' and ve_temperature = '' and ve_continentalite = '' ".
" and ve_humidite_atmos = '' and ve_humidite_edaph = '' and ve_nutriments_sol = '' and ve_salinite = ''".
" and ve_texture_sol = '' and ve_reaction_sol = '')";
$resultat = $this->Bdd->recupererTous($requete);
foreach ($resultat as $res) {
$this->donnees_initiales[$res['num_nomen']] = array(
've_lumiere' => array('min' => $res['ve_lumiere'], 'max' => $res['ve_lumiere']),
've_temperature' => array('min' => $res['ve_temperature'], 'max' => $res['ve_temperature']),
've_continentalite' => array('min' => $res['ve_continentalite'], 'max' => $res['ve_continentalite']),
've_humidite_atmos' => array('min' => $res['ve_humidite_atmos'], 'max' => $res['ve_humidite_atmos']),
've_humidite_edaph' => array('min' => $res['ve_humidite_edaph'], 'max' => $res['ve_humidite_edaph']),
've_reaction_sol' => array('min' => $res['ve_reaction_sol'], 'max' => $res['ve_reaction_sol']),
've_nutriments_sol' => array('min' => $res['ve_nutriments_sol'], 'max' => $res['ve_nutriments_sol']),
've_salinite' => array('min' => $res['ve_salinite'], 'max' => $res['ve_salinite']),
've_texture_sol' => array('min' => $res['ve_texture_sol'], 'max' => $res['ve_texture_sol']),
've_mat_org_sol' => array('min' => $res['ve_mat_org_sol'], 'max' => $res['ve_mat_org_sol']));
}
}
// +++ Fonctions de vérification des donnée obtenues ++++//
public function testAscendantsDeBaseflor(){
$this->recupererDonneesInitiales();
$this->consulterInfosTaxons();
$fichier = dirname(__FILE__).'/log/verifTaxonsSup.log';
$liste = array();
foreach ($this->donnees_initiales as $nn => $data) {
$nn_sup = isset($this->infos_taxon[$nn]) ? $this->infos_taxon[$nn]['nn_sup'] : '' ;
if (!empty($nn_sup) && !isset($donnees_initiales[$nn_sup])){
$rang = isset($this->infos_taxon[$nn_sup]) ? $this->infos_taxon[$nn_sup]['rang'] : 179 ;
while ($rang >= 180) {
if (!empty($nn_sup)) {
if (isset($liste["$nn_sup($rang)"])){
$liste["$nn_sup($rang)"] .= ", $nn";
}else {
$liste["$nn_sup($rang)"] = "$nn";
}
$nn_sup = isset($this->infos_taxon[$nn_sup]) ? $this->infos_taxon[$nn_sup]['nn_sup'] : '' ;
$rang = isset($this->infos_taxon[$nn_sup]) ? $this->infos_taxon[$nn_sup]['rang'] : 179 ;
}else {
break;
}
}
}
}
$log = "un ascendant (pas forcement l'ascendant directement au dessus) : les descendants contenus dans baseflor \n";
foreach ($liste as $cle => $inferieur){
$log .= "$cle : $inferieur \n";
}
file_put_contents($fichier, $log);
}
public function testEcologieAscendantsDeBaseflor(){
$this->recupererDonneesInitiales();
$this->consulterInfosTaxons();
$fichier = dirname(__FILE__).'/log/verifTaxonsSupEcolo.log';
$liste = array();
foreach ($this->donnees_initiales as $nn => $data) {
$nn_sup = isset($this->infos_taxon[$nn]) ? $this->infos_taxon[$nn]['nn_sup'] : '' ;
if (!empty($nn_sup) && !isset($donnees_initiales[$nn_sup])){
$rang = isset($this->infos_taxon[$nn_sup]) ? $this->infos_taxon[$nn_sup]['rang'] : 179 ;
while ($rang >= 180) {
if (!empty($nn_sup)) {
$ecolo = array_values($data);
list($l,$t,$c,$ha,$he,$r,$n,$s,$tx,$mo) = $ecolo;
if (isset($liste["$nn_sup($rang)"])){
$liste["$nn_sup($rang)"] .= ",[{$l['min']}, {$t['min']}, {$c['min']},"
."{$ha['min']}, {$he['min']}, {$r['min']}, {$n['min']}, {$s['min']},"
."{$tx['min']}, {$mo['min']}]";
}else {
$liste["$nn_sup($rang)"] = "[{$l['min']}, {$t['min']}, {$c['min']},"
."{$ha['min']}, {$he['min']}, {$r['min']}, {$n['min']}, {$s['min']},"
."{$tx['min']}, {$mo['min']}]";
}
$nn_sup = isset($this->infos_taxon[$nn_sup]) ? $this->infos_taxon[$nn_sup]['nn_sup'] : '' ;
$rang = isset($this->infos_taxon[$nn_sup]) ? $this->infos_taxon[$nn_sup]['rang'] : 179 ;
}else {
break;
}
}
}
}
$log = "nn ascendant (pas forcement l'ascendant directement au dessus) :"
." valeurs descendants contenus dans baseflor \n"
."Pour le calcul des valeurs min et max de gauche, les valeurs de droite sont utilisées. \n";
foreach ($liste as $cle => $inferieurs){
$log .= "$cle : $inferieurs \n";
}
file_put_contents($fichier, $log);
}
 
}
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/baseflor/BaseflorVerif.php
New file
0,0 → 1,149
<?php
 
class BaseflorVerif extends VerificateurDonnees {
 
private $type_bio = array();
private $ss_type_bio = array();
private $signes_seuls = array();// basés sur valeurs trouvées (--> pas de légende !)
private $signes_nn_seuls = array();// basés sur valeurs trouvées (--> pas de légende !)
private $intervalles = array();
private $motifs = array();
 
//obligatoire
public function definirTraitementsColonnes() {
$this->initialiserParametresVerif() ;
if (( $this->colonne_num > 0 && $this->colonne_num < 15 )
|| $this->colonne_num == 16
|| ($this->colonne_num > 18 && $this->colonne_num < 23)
|| $this->colonne_num > 39) {
$this->verifierColonne();
} elseif ($this->colonne_num == 15) {
$this->verifierTypeBio();
} elseif ($this->colonne_num >= 23 && $this->colonne_num <= 32) {
$this->verifierIntervalles($this->colonne_valeur);
} elseif ($this->colonne_num >= 33 && $this->colonne_num < 41) {
$this->verifierValeursIndic();
}
}
private function initialiserParametresVerif() {
$this->type_bio = $this->getParametreTableau('Parametres.typesBio');
$this->ss_type_bio = $this->getParametreTableau('Parametres.sousTypesBio');
$this->signes_seuls = $this->getParametreTableau('Parametres.signesSeuls');
$this->signes_nn_seuls = $this->getParametreTableau('Parametres.signesNonSeuls');
$this->intervalles = $this->inverserTableau($this->getParametreTableau('Parametres.intervalles'));
$this->motifs = $this->inverserTableau($this->getParametreTableau('Parametres.motifs'));
}
//++---------------------------------traitements des colonnes baseflor------------------------------------++
private function verifierColonne(){
$motif = $this->motifs[$this->colonne_num];
if (preg_match($motif, $this->colonne_valeur) == 0 && $this->verifierSiVide() == false){
$this->erreurs_ligne[$this->colonne_num] = $this->colonne_valeur;
}
}
 
private function verifierSiVide(){
$vide = ($this->colonne_valeur == '') ? true : false;
return $vide;
}
 
private function verifierTypeBio(){
if (preg_match("/(.+)\((.+)\)$/", $this->colonne_valeur, $retour) == 1) {
$this->verifierTypeEtSsType($retour[1]);
$this->verifierTypeEtSsType($retour[2]);
} else {
$this->verifierTypeEtSsType($this->colonne_valeur);
}
}
 
private function verifierTypeEtSsType($chaine_a_verif){
if (preg_match("/^([a-zA-Zé]+)\-(.+)$|^([a-zA-Zé]+[^\-])$/", $chaine_a_verif, $retour) == 1) {
$type = (isset($retour[3])) ? $retour[3] : $retour[1];
$this->verifierType($type);
 
$sousType = $retour[2];
$this->verifierSousType($sousType);
}
}
 
private function verifierType($type) {
if (in_array($type, $this->type_bio) == false) {
$this->erreurs_ligne[$this->colonne_num] = $this->colonne_valeur;
}
}
 
private function verifierSousType($sousType) {
if ($sousType != ''){
$ss_type = explode('-', $sousType);
foreach ($ss_type as $sst) {
if (in_array($sst, $this->ss_type_bio) == false) {
$this->erreurs_ligne[$this->colonne_num] = $this->colonne_valeur;
}
}
}
}
 
private function verifierIntervalles($valeur){
if ($valeur != '') {
list($min, $max) = explode('-', $this->intervalles[$this->colonne_num]);
if ($valeur < $min || $valeur > $max){
$this->erreurs_ligne[$this->colonne_num] = $this->colonne_valeur;
}
}
}
 
private function verifierValeursIndic(){
if (preg_match("/^([^0-9])*([0-9]+)([^0-9])*$/", $this->colonne_valeur, $retour) == 1){
$this->verifierIntervalles($retour[2]);
if (isset($retour[3]) && in_array($retour[3], $this->signes_nn_seuls) == false){
$this->erreurs_ligne[$this->colonne_num] = $this->colonne_valeur;
}
if ($retour[1] != '-' && $retour[1] != ''){
$this->erreurs_ligne[$this->colonne_num] = $this->colonne_valeur;
}
} elseif (in_array( $this->colonne_valeur, $this->signes_seuls) == false && $this->verifierSiVide() == false) {
$this->erreurs_ligne[$this->colonne_num] = $this->colonne_valeur;
}
}
/*--------------------------------------------OUtils-------------------------------------------*/
private function getParametreTableau($cle) {
$tableau = array();
$parametre = Config::get($cle);
if (empty($parametre) === false) {
$tableauPartiel = explode(',', $parametre);
$tableauPartiel = array_map('trim', $tableauPartiel);
foreach ($tableauPartiel as $champ) {
if (strpos($champ, '=') !== false && strlen($champ) >= 3) {
list($cle, $val) = explode('=', $champ);
$tableau[trim($cle)] = trim($val);
} else {
$tableau[] = trim($champ);
}
}
}
return $tableau;
}
 
private function inverserTableau($tableau) {
$inverse = array();
foreach ($tableau as $cle => $valeurs) {
$valeurs = explode(';', $valeurs);
foreach ($valeurs as $valeur) {
$inverse[$valeur] = $cle;
}
}
return $inverse;
}
}
 
?>
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/osm/config.ini
New file
0,0 → 1,12
; Base de données contenant les infos provenant d'OSM
bdd_osm_nom = "tb_osm"
 
; Ajouter les nouvelles version à la suite dans versions et versionsDonnees.
version = "2.0"
dossierSql = "{ref:dossierDonneesEflore}osm/"
 
[fichiers]
structureSql = "osm_v{ref:version}.sql"
 
[chemins]
structureSql = "{ref:dossierSql}{ref:version}/{ref:fichiers.structureSql}"
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/osm/Osm.php
New file
0,0 → 1,65
<?php
//declare(encoding='UTF-8');
/**
* Exemple de lancement du script : :
* 1. Création de la base de données :
* /opt/lampp/bin/php cli.php osm -a communes -m manuel -v 3
*
* @category php 5.4
* @package DEL
* @subpackage Scripts
* @author Aurélien PERONNET <aurelien@tela-botanica.org>
* @copyright Copyright (c) 2012, Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
* @license CeCILL v2 http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-fr.txt
* @license GNU-GPL http://www.gnu.org/licenses/gpl.html
*/
class Osm extends EfloreScript {
 
const PROJET_NOM = 'osm';
 
protected $parametres_autorises = array(
'-m' => array(false, 'auto', 'Mode «auto» ou «manuel». En manuel, les compteurs dans les boucles sont affichés.'));
 
public function executer() {
try {
$this->initialiserProjet(self::PROJET_NOM);
 
// Lancement de l'action demandée
$cmd = $this->getParametre('a');
switch ($cmd) {
case 'chargerStructureSql' :
$this->chargerStructureSql();
break;
case 'cm' :
case 'cmCreer' :
case 'cmSupprimer' :
$script = $this->chargerClasse('FranceCommunes');
$script->executer();
break;
case 'za' :
case 'zaCreer' :
case 'zaCorriger' :
case 'zaMajIdZG' :
case 'zaSupprimer' :
$script = $this->chargerClasse('ZonesAdmin');
$script->executer();
break;
default :
throw new Exception("Erreur : la commande '$cmd' n'existe pas!");
}
} catch (Exception $e) {
$this->traiterErreur($e->getMessage());
}
print "\n";// Pour ramener à la ligne en fin de script
}
 
protected function initialiserProjet($projetNom) {
$this->projetNom = $projetNom;
}
 
private function chargerClasse($classe) {
require_once $classe.'.php';
$conteneur = new Conteneur($this->parametres);
return new $classe($conteneur);
}
}
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/osm/archives/OrdonneurDeChemins.php
New file
0,0 → 1,226
<?php
/**
* Traitement de l'ordre :
*
* Fonction qui rajoute l'ordre et le sens de chaque way d'une relation dans la table `osm_relation_a_chemins`
*
* Exemple de lancement du script :
* /opt/lampp/bin/php -d memory_limit=8000M cli.php osm -a ordre -m manuel
*
*/
class OrdonneurDeChemins {
private $conteneur;
private $bdd;
private $messages;
private $mode;
 
private $premierNoeudPolygon = null;
private $infosRel = array();
private $infosNoeuds = array();
private $idRelation = null;
private $idChemin = null;
private $idNoeud = null;
private $ordre = 0;
 
public function __construct($conteneur) {
$this->conteneur = $conteneur;
$this->bdd = $this->conteneur->getBdd();
$this->messages = $this->conteneur->getMessages();
$this->mode = $this->conteneur->getParametre('m');
}
 
public function executer() {
$relations = $this->getToutesRelationsAChemins();
if ($this->mode == 'manuel') {
$this->messages->traiterInfo("Nombre de relations : %s", array(count($relations)));
}
foreach ($relations as $relation) {
// Traitement de la relation courante
$this->idRelation = $relation['id_relation'];
 
$this->chargerDonneesRelationActuelle();
 
$numPolygon = 1;
while(count($this->chemins) > 0) {
reset($this->chemins);
$idChemin = key($this->chemins);
echo "--------------POLY : $numPolygon : $idChemin\n";
$this->ordonnerCheminsRelation($numPolygon, $idChemin);
$this->mettreAJourRelationAChemin();
$numPolygon++;
}
 
// Affichage de l'avancement
if ($this->mode == 'manuel') {
$this->messages->afficherAvancement("Ordone les chemins de la relation : ", 1);
}
}
}
 
private function getToutesRelationsAChemins() {
$requete = 'SELECT DISTINCT id_relation '.
'FROM osm_relation_a_chemins '.
'WHERE id_relation = 403823 '.
' -- '.__FILE__.' : '.__LINE__;
$relations = $this->bdd->recupererTous($requete);
return $relations;
}
 
private function chargerDonneesRelationActuelle() {
$requete = 'SELECT cn.id_chemin, cn.id_noeud, cn.ordre '.
'FROM osm_relation_a_chemins AS rc '.
' INNER JOIN osm_chemin_a_noeuds AS cn ON (rc.id_chemin = cn.id_chemin) '.
"WHERE rc.id_relation = {$this->idRelation} ".
"ORDER BY rc.ordre ASC, cn.ordre ASC ".
' -- '.__FILE__.' : '.__LINE__;
$infos = $this->bdd->recupererTous($requete);
$noeuds = array();
foreach ($infos as $info) {
$noeuds[$info['id_noeud']][$info['id_chemin']] = $info['ordre'];
if (! isset($this->chemins[$info['id_chemin']]) ) {
$this->chemins[$info['id_chemin']]['max'] == info['ordre'];
if ($info['ordre'] == 1) {
$this->chemins[$info['id_chemin']][0] == $info['id_noeud'];
}
} else {
 
}
if (count($noeuds[$info['id_noeud']]) == 2) {
list($premierChemin, $dernierChemin) = array_keys($noeuds[$info['id_noeud']]);
$this->chemins[$premierChemin][] = $info['id_noeud'];
$this->chemins[$dernierChemin][] = $info['id_noeud'];
$this->noeuds[$info['id_noeud']][$premierChemin] = $dernierChemin;
$this->noeuds[$info['id_noeud']][$dernierChemin] = $premierChemin;
}
}
//print_r($this->chemins);exit();
}
 
private function ordonnerCheminsRelation($numPolygon, $idChemin, $idCheminPrecedent = null, $ordre = 1) {
$this->infosRel[$idChemin] = array($ordre, $numPolygon);
 
list($premierNoeud, $dernierNoeud) = $this->chemins[$idChemin];
 
if ($idCheminPrecedent == null) {// Premier chemin à tester
$this->premierNoeudPolygon = $premierNoeud;
$noeudSuivant = ($dernierNoeud == $premierNoeud) ? $premierNoeud : $dernierNoeud;
echo "Chemin $idChemin :: premierNoeud: $premierNoeud, dernierNoeud: $dernierNoeud \n";
} else {
list($premierNoeudPrec, $dernierNoeudPrec) = $this->chemins[$idCheminPrecedent];
unset($this->chemins[$idCheminPrecedent]);
$noeudSuivant = ($dernierNoeudPrec == $dernierNoeud || $premierNoeudPrec == $dernierNoeud) ? $premierNoeud : $dernierNoeud;
echo "Chemin $idChemin :: premierNoeudPrec: $premierNoeudPrec, dernierNoeudPrec: $dernierNoeudPrec, premierNoeud: $premierNoeud, dernierNoeud: $dernierNoeud \n";
}
 
if ($this->premierNoeudPolygon != $noeudSuivant) {
if (isset($this->noeuds[$noeudSuivant][$idChemin])) {
$idCheminSuivant = $this->noeuds[$noeudSuivant][$idChemin];
if (! isset($this->infosRel[$idCheminSuivant])) {
$this->ordonnerCheminsRelation($numPolygon, $idCheminSuivant, $idChemin, ++$ordre);
} else {
$this->messages->traiterAvertissement("Chemins %s déjà pris en comtpe", array($idCheminSuivant));
}
} else {
$this->messages->traiterAvertissement("Relation %s a un polygone incomplet", array($this->idRelation));
}
} else {
unset($this->chemins[$idChemin]);
}
return null;
}
 
private function mettreAJourRelationAChemin() {
if (count($this->infosRel) > 0) {
foreach ($this->infosRel as $idC => $donnees) {
list($ordre, $numPolygon) = $this->bdd->proteger($donnees);
$requete = 'UPDATE osm_relation_a_chemins '.
"SET sens = $ordre, num_poly = $numPolygon ".
"WHERE id_relation = {$this->idRelation} ".
"AND id_chemin = $idC ".
' -- '.__FILE__.' : '.__LINE__;
$this->bdd->requeter($requete);
}
$this->infosRel = array();
}
}
 
private function creerSet($donnees) {
$values = array();
foreach ($donnees as $infos) {
$infosP = $this->bdd->proteger($infos);
$values[] = implode(',', $infosP);
}
$valuesClause = '('.implode('),(', $values).')';
return $valuesClause;
}
 
private function getIdPremierChemin() {
$idChemin = null;
if (count($this->infosRel) > 0) {
reset($this->infosRel);
$idChemin = key($this->infosRel);
}
return $idChemin;
}
 
private function mettreAJourChemin($sens, $ligne, $fichier = __FILE__) {
$ordre = $this->ordre++;
$requete = 'UPDATE osm_relation_a_chemins '.
"SET ordre = '$ordre', sens = '$sens' ".
"WHERE id_relation = {$this->idRelation} ".
"AND id_chemin = {$this->idChemin} ".
" -- $fichier : $ligne";
$retour = $this->bdd->requeter($requete);
return $retour;
}
 
private function getIdDernierNoeud() {
$idNoeud = false;
if (count($this->infosRel[$this->idChemin]) > 0) {
end($this->infosRel[$this->idChemin]);
$idNoeud = current($this->infosRel[$this->idChemin]);
}
return $idNoeud;
}
 
private function ordonnerChemins() {
foreach ($this->infosRel as $chemin) {
// Selection du chemin qui possède le dernier noeud du précédent chemin et écarter l'actuel
$idCheminSuivant = $this->getIdCheminSuivant();
if ($idCheminSuivant) {
$this->idChemin = $idCheminSuivant;
$idPremierNoeud = $this->getIdPremierNoeud();
$idDernierNoeud = $this->getIdDernierNoeud();
$sens = $this->getSens($idPremierNoeud);
$this->mettreAJourChemin($sens, __LINE__);
$this->idNoeud = ($sens == 'directe') ? $idDernierNoeud : $idPremierNoeud;
}
}
}
 
private function getIdCheminSuivant() {
$idCheminSuivant = false;
if (isset($this->infosNoeuds[$this->idNoeud])) {
$idCheminSuivant = next($this->infosNoeuds[$this->idNoeud]);
//echo $this->idChemin.'-'.$idCheminSuivant."\n".print_r($this->infosNoeuds[$this->idNoeud]); exit();
} else {
$msg = "Impossible de trouver le chemin suivant pour la relation : %s, le chemin %s et le noeud %s";
$this->messages->traiterAvertissement($msg, array($this->idRelation, $this->idChemin, $this->idNoeud));
}
return $idCheminSuivant;
}
 
private function getSens($idPremierNoeud) {
$sens = ( strcmp($idPremierNoeud, $this->idNoeud ) == 0 ) ? 'directe' : 'indirecte';
return $sens;
}
 
private function getIdPremierNoeud() {
$idNoeud = false;
if (count($this->infosRel[$this->idChemin]) > 0) {
reset($this->infosRel[$this->idChemin]);
$idNoeud = current($this->infosRel[$this->idChemin]);
}
return $idNoeud;
}
}
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/osm/archives/config.ini
New file
0,0 → 1,9
; Ajouter les nouvelles version à la suite dans versions et versionsDonnees.
version = "1.0"
dossierSql = "{ref:dossierDonneesEflore}osm/"
 
[fichiers]
structureSql = "osm_v{ref:version}.sql"
 
[chemins]
structureSql = "{ref:dossierSql}{ref:version}/{ref:fichiers.structureSql}"
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/osm/archives/MiseAJour.php
New file
0,0 → 1,417
<?php
/**
* Permet de mettre à jour les contours à partir d'un fichier de diff.
*
* Exemple de lancement du script :
* /opt/lampp/bin/php -d memory_limit=3500M cli.php osm -a maj -f fichier_osm_change -e fichier_osm_nouveau
*/
class MiseAJour {
private $conteneur;
private $bdd;
private $messages;
private $mode;
 
private $communes = array();
private $relations_communes = array();
private $relation_a_chemins = array();
private $chemin_a_noeuds = array();
private $noeuds = array();
private $pas = 10000;
private $pas_commune = 1000;
private $elementType = '';
 
public function __construct($conteneur) {
$this->conteneur = $conteneur;
$this->bdd = $this->conteneur->getBdd();
$this->messages = $this->conteneur->getMessages();
$this->mode = $this->conteneur->getParametre('m');
}
 
/**
* Fonction qui parcourt tous les ways les noeuds de chaque relation en prenant en considération l'ordre et
* le sens de chaque ways concaténés ensemble (séparés par des virgules). Update du champ polygone de chaque
* relation dans la table `osm_relations`
*/
public function executer() {
// Lancement de l'action demandée
$cmd = $this->conteneur->getParametre('a');
switch ($cmd) {
case 'maj' :
$this->mettreAjour();
break;
default :
$msgTpl = "Erreur : la commande '%s' n'est pas prise en compte par la classe %s !";
$msg = sprintf($msgTpl, $cmd, get_class($this));
throw new Exception($msg);
}
print "\n";// Pour ramener à la ligne en fin de script
}
 
/**
* Fonction permettant de traiter et d'analyser le fichier de différence et de mettre à jour la base de données
* en tenant compte des trois cas:Suppression, Création ,modification
*/
private function mettreAjour() {
$lecteur = $this->getLecteurXml();
while ($lecteur->read()) {
if ($lecteur->nodeType == XMLREADER::ELEMENT) {
$this->elementType = $lecteur->localName;
$this->analyserElementXml($lecteur->localName, $lecteur->expand());
}
 
if ($this->mode == 'manuel') {
$this->messages->afficherAvancement("Analyse de la ligne du fichier de diff OSM : ", 1);
}
}
}
 
private function getLecteurXml() {
$fichierOsm = $this->conteneur->getParametre('f');
$lecteur = new XMLReader();
$ouvertureXmlOk = $lecteur->open($fichierOsm);
if ($ouvertureXmlOk === false) {
$msgTpl = "Impossible d'ouvrir le fichier osm : %s";
$msg = sprintf($msgTpl, $this->conteneur->getParametre('f'));
new Exception($msg);
}
return $lecteur;
}
 
private function analyserElementXml($noeudDom) {
$relations = $noeudDom->getElementsByTagName('relation');
if ($relations->length > 0) {
foreach ($relations as $relation) {
$this->analyserRelation($relation);
$this->traiterRelations();
}
}
 
$ways = $creations->getElementsByTagName('way');
if ($ways->length > 0) {
foreach ($ways as $way) {
$this->analyserWay($way);
$this->traiterCheminANoeuds();
}
}
 
$noeuds = $creations->getElementsByTagName('node');
if ($noeuds->length > 0) {
foreach ($noeuds as $noeud) {
$this->analyserNode($noeud);
$this->traiterNoeuds();
}
}
 
$this->traiterElementsOrphelins();
}
 
private function traiterRelations() {
if (count($this->relation_a_chemins) > $this->pas) {
switch ($this->elementType) {
case 'create' :
$this->insererRelationAChemins();
break;
case 'modify' :
$this->modifierRelationAChemins();
break;
case 'delete' :
$this->supprimerRelationAChemins();
break;
}
}
if (count($this->relations_communes) > $this->pas_commune) {
switch ($this->elementType) {
case 'create' :
$this->insererRelationsCommunes();
break;
case 'modify' :
$this->modifierRelationsCommunes();
break;
case 'delete' :
$this->supprimerRelationsCommunes();
break;
}
}
}
 
private function traiterChemins() {
if (count($this->chemin_a_noeuds) > $this->pas) {
switch ($this->elementType) {
case 'create' :
$this->insererCheminANoeuds();
break;
case 'modify' :
$this->modifierCheminANoeuds();
break;
case 'delete' :
$this->supprimerCheminANoeuds();
break;
}
}
}
 
private function traiterNoeuds() {
if (count($this->noeuds) > $this->pas) {
switch ($this->elementType) {
case 'create' :
$this->insererNoeuds();
break;
case 'modify' :
$this->modifierNoeuds();
break;
case 'delete' :
$this->supprimerNoeuds();
break;
}
}
}
 
private function traiterElementsOrphelins() {
switch ($this->elementType) {
case 'create' :
$this->insererRelationsCommunes();
$this->insererRelationAChemins();
$this->insererCheminANoeuds();
$this->insererNoeuds();
break;
case 'modify' :
$this->modifierRelationsCommunes();
$this->modifierRelationAChemins();
$this->modifierCheminANoeuds();
$this->modifierNoeuds();
break;
case 'delete' :
$this->supprimerRelationsCommunes();
$this->supprimerRelationAChemins();
$this->supprimerCheminANoeuds();
$this->supprimerNoeuds();
break;
}
}
 
/**
* Récupère l'id commune, nom commune et le code INSEE et remplie la table `osm_relations`
*/
private function analyserRelation($relation) {
$relation_id = $relation->getAttribute('id');
$chemins = $relation->getElementsByTagName('member');
foreach ($chemins as $chemin) {
if ($chemin->getAttribute('type') == 'way') { //écarter le noeud centrale
$chemin_id = $chemin->getAttribute('ref');
$role = $chemin->getAttribute('role');//role: null, inner, outer, exclave et enclave.
$this->relation_a_chemins[] = array($relation_id, $chemin_id, $role);
}
}
 
$tags = $relation->getElementsByTagName('tag');
if ($tags->length > 0) {
$this->analyserTags($relation_id, $tags);
}
}
 
private function analyserTags($relation_id, $tags) {
$commune_nom = null;
$commune_insee = null;
foreach ($tags as $tag) {
$tag_cle = $tag->getAttribute('k');
$tag_val = $tag->getAttribute('v');
switch ($tag_cle) {
case 'name' :
$commune_nom = $tag_val;
break;
case 'ref:INSEE' :
$commune_insee = $tag_val;
break;
}
if (!is_null($commune_nom) && !is_null($commune_insee)) {
$this->relations_communes[] = array($relation_id, $commune_nom, $commune_insee);
if (!isset($this->communes[$commune_insee])) {
$this->communes[$commune_insee] = $relation_id;
} else {
$e = "La relation #%s contient déjà le tag ref:INSEE avec la valeur %s.".
"Veuillez corriger la carte OSM.";
$this->traiterErreur($e, array($this->communes[$commune_insee], $commune_insee, $relation_id));
}
break;
}
}
}
 
/**
* Récupère l'id_way et tous les id_node de chaque way et remplie la table `osm_chemin_a_noeuds`
*/
private function analyserWay($way) {
$chemin_id = $way->getAttribute('id');
$noeuds = $way->getElementsByTagName('nd');
$ordre = 0;
foreach ($noeuds as $noeud) {
$noeud_id = $noeud->getAttribute('ref');
$this->chemin_a_noeuds[] = array($chemin_id, $noeud_id, ++$ordre);
}
}
 
/**
* Fonction qui récupère tous les l'id_node et les valeurs(Lat/Lon) correspondantes et remplie la table `osm_noeuds`
*/
private function analyserNode($node) {
$this->noeuds[] = array(
$node->getAttribute('id'),
$node->getAttribute('lat'),
$node->getAttribute('lon')
);
}
 
//Insertion des relations
private function insererRelationsCommunes() {
$requete = 'INSERT INTO osm_relations (id_relation, nom, code_insee) '.
'VALUES '.$this->creerValuesMultiple($this->relations_communes).
' -- '.__FILE__.' : '.__LINE__;
$this->bdd->requeter($requete);
$this->relations_communes = array();
}
 
//Insertion des relations à chemins
private function insererRelationAChemins() {
$requete = 'INSERT INTO osm_relation_a_chemins (id_relation, id_chemin, role) '.
'VALUES '.$this->creerValuesMultiple($this->relation_a_chemins).
' -- '.__FILE__.' : '.__LINE__;
$this->bdd->requeter($requete);
$this->relation_a_chemins = array();
}
 
//Insertion des chemins à noeuds
private function insererCheminANoeuds() {
$requete = 'INSERT INTO osm_chemin_a_noeuds (id_chemin, id_noeud, ordre) '.
'VALUES '.$this->creerValuesMultiple($this->chemin_a_noeuds).
' -- '.__FILE__.' : '.__LINE__;
$this->bdd->requeter($requete);
$this->chemin_a_noeuds = array();
}
 
//Insertion des noeuds
private function insererNoeuds() {
$requete = 'INSERT INTO osm_noeuds (id_noeud, lat, `long`) '.
'VALUES '.$this->creerValuesMultiple($this->noeuds).
' -- '.__FILE__.' : '.__LINE__;
$this->bdd->requeter($requete);
$this->noeuds = array();
}
 
//Update des relations
private function modifierRelationsCommunes() {
foreach ($this->relations_communes as $donnee) {
$infosP = $this->bdd->proteger($donnee);
$requete = 'UPDATE osm_relations '.
"SET id_relation = $infosP[0], nom = $infosP[1], code_insee = $infosP[2] ".
"WHERE id_relation = $infosP[0] ".
' -- '.__FILE__.' : '.__LINE__;
$this->bdd->requeter($requete);
}
$this->relations_communes = array();
}
 
/*
*Update des relations à chemins en supprimant l'ancienne relation et tous ses chemins
*de la table osm_relation_a_chemins et insérer la nouvelle
*/
private function modifierRelationAChemins() {
$this->supprimerRelationAChemins();
foreach ($this->relation_a_chemins as $donnee) {
$infosP = $this->bdd->proteger($donnee);
$requete = 'INSERT INTO osm_relation_a_chemins (id_relation, id_chemin, role) '.
"VALUES ($infosP[0], $infosP[1], $infosP[2]) ".
' -- '.__FILE__.' : '.__LINE__;
$this->bdd->requeter($requete);
}
$this->relation_a_chemins = array();
}
 
/*
*Update des chemins à noeuds en supprimant l'ancien chemin et tous ses noeuds
*de la table osm_chemins_a_noeuds et insérer le nouveau
*/
private function modifierCheminANoeuds() {
$this->supprimerCheminANoeuds();
foreach ($this->chemin_a_noeuds as $donnee) {
$infosP = $this->bdd->proteger($donnee);
$requete = 'INSERT INTO osm_chemin_a_noeuds (id_chemin, id_noeud, ordre) '.
"VALUES ($infosP[0], $infosP[1], $infosP[2]) ".
' -- '.__FILE__.' : '.__LINE__;
$this->bdd->requeter($requete);
}
$this->chemin_a_noeuds = array();
}
 
//Update des noeuds
private function modifierNoeuds() {
foreach ($this->noeuds as $donnee) {
$infosP = $this->bdd->proteger($donnee);
$requete = 'UPDATE osm_noeuds '.
"SET id_noeud = $infosP[0], lat = $infosP[1], `long` = $infosP[2] ".
"WHERE id_noeud = $infosP[0] ".
' -- '.__FILE__.' : '.__LINE__;
$this->bdd->requeter($requete);
}
$this->noeuds = array();
}
 
//Suppressions des relations
private function supprimerRelationsCommunes() {
$idsIn = $this->getIds($this->relations_communes);
$this->relations_communes = array();
$requete = 'DELETE FROM osm_relations '.
"WHERE id_relation IN ($idsIn) ".
' -- '.__FILE__.' : '.__LINE__;
$this->bdd->requeter($requete);
}
 
//Suppressions des relations à chemins
private function supprimerRelationAChemins() {
$idsIn = $this->getIds($this->relation_a_chemins);
$this->relation_a_chemins = array();
$requete = 'DELETE FROM osm_relation_a_chemins '.
"WHERE id_relation IN ($idsIn) ".
' -- '.__FILE__.' : '.__LINE__;
$this->bdd->requeter($requete);
}
 
//Suppressions des chemins à noeuds
private function supprimerCheminANoeuds() {
$idsIn = $this->getIds($this->chemin_a_noeuds);
$this->chemin_a_noeuds = array();
$requete = 'DELETE FROM osm_chemin_a_noeuds '.
"WHERE id_chemin IN ($idsIn) ".
' -- '.__FILE__.' : '.__LINE__;
$this->bdd->requeter($requete);
}
 
//Suppressions des chemins à noeuds
private function supprimerNoeuds() {
$idsIn = $this->getIds($this->noeuds);
$this->noeuds = array();
$requete = 'DELETE FROM osm_noeuds '.
"WHERE id_noeud IN ($idsIn) ".
' -- '.__FILE__.' : '.__LINE__;
$this->bdd->requeter($requete);
}
 
private function getIds(&$tableau) {
$ids = array();
foreach ($tableau as $info) {
$ids[] = $this->bdd->proteger($info[0]);
}
$idsSansDoublon = array_unique($ids);
$idsIn = implode(',', $idsSansDoublon);
return $idsIn;
}
 
private function creerValuesMultiple($donnees) {
$values = array();
foreach ($donnees as $infos) {
$infosP = $this->bdd->proteger($infos);
$values[] = implode(',', $infosP);
}
$valuesClause = '('.implode('),(', $values).')';
return $valuesClause;
}
}
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/osm/archives/Osm.php
New file
0,0 → 1,104
<?php
//declare(encoding='UTF-8');
/**
* Exemple de lancement du script : :
* 1. Création de la base de données :
* /opt/lampp/bin/php cli.php osm -a chargerStructureSql -m manuel -v 3
*
* 2. Analyse du fichir OSM :
* /opt/lampp/bin/php cli.php osm -a analyser -f "../donnees/osm/fr_communes_new.osm" -m manuel -v 3
*
* 3. Traitement de l'ordre :
* /opt/lampp/bin/php cli.php osm -a ordre -m manuel -v 3
*
* 4. Remplissage des polygones :
* /opt/lampp/bin/php cli.php osm -a polygone -m manuel -v 3
*
* Définition des centroïdes pour les polygones déjà complets:
* /opt/lampp/bin/php cli.php osm -a centre -m manuel -v 3
*
* 5. Remise de l'ordre à zéro :
* /opt/lampp/bin/php cli.php osm -a zero -m manuel -v 3
*
* 6. Traitement de l'ordre des polygones incomplets :
* /opt/lampp/bin/php cli.php osm -a ordonnerPolygoneInc -m manuel -v 3
*
* 7. Remplissage des polygones incomplets :
* /opt/lampp/bin/php cli.php osm -a remplirPolygoneInc -m manuel -v 3
*
* 8. Renommage des polygones incomplets :
* /opt/lampp/bin/php cli.php osm -a renommer -m manuel -v 3
*
* 9. Définition des centroïdes :
* /opt/lampp/bin/php cli.php osm -a centre -m manuel -v 3
*
* @category php 5.4
* @package DEL
* @subpackage Scripts
* @author Aurélien PERONNET <aurelien@tela-botanica.org>
* @copyright Copyright (c) 2012, Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
* @license CeCILL v2 http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-fr.txt
* @license GNU-GPL http://www.gnu.org/licenses/gpl.html
*/
// TODO : Améliorer la gestion de l'ordre des chemins pour éviter de prendre en compte des chemins inexistants
class Osm extends EfloreScript {
 
const PROJET_NOM = 'osm';
 
protected $parametres_autorises = array(
'-f' => array(true, null, 'Chemin du fichier osm à analyser'),
'-m' => array(false, 'auto', 'Mode «auto» ou «manuel». En manuel, les compteurs dans les boucles sont affichés.'));
 
public function executer() {
try {
$this->initialiserProjet(self::PROJET_NOM);
 
// Lancement de l'action demandée
$cmd = $this->getParametre('a');
switch ($cmd) {
case 'chargerStructureSql' :
$this->chargerStructureSql();
break;
case 'analyser' :
$script = $this->chargerClasse('ParseurOsm');
$script->executer();
break;
case 'ordre' :
$script = $this->chargerClasse('OrdonneurDeChemins');
$script->executer();
break;
case 'polygone' :
case 'centre' :
case 'zero' :
$script = $this->chargerClasse('PolygoneCreateur');
$script->executer();
break;
case 'ordonnerPolygoneInc' :
case 'remplirPolygoneInc' :
case 'renommer' :
$script = $this->chargerClasse('PolygoneReparateur');
$script->executer();
break;
case 'maj' :
$script = $this->chargerClasse('MiseAJour');
$script->executer();
break;
default :
throw new Exception("Erreur : la commande '$cmd' n'existe pas!");
}
} catch (Exception $e) {
$this->traiterErreur($e->getMessage());
}
print "\n";// Pour ramener à la ligne en fin de script
}
 
protected function initialiserProjet($projetNom) {
$this->projetNom = $projetNom;
}
 
private function chargerClasse($classe) {
require_once $classe.'.php';
$conteneur = new Conteneur($this->parametres);
return new $classe($conteneur);
}
}
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/osm/archives/ParseurOsm.php
New file
0,0 → 1,245
<?php
/**
* Exemple de lancement du script :
*
* Analyse du fichir OSM :
* /opt/lampp/bin/php cli.php osm -a analyser -f "../donnees/osm/france_communes_new.osm" -m manuel
*
*/
class ParseurOsm {
 
private $conteneur;
private $bdd;
private $messages;
private $mode;
 
private $communes = array();
private $relations_communes = array();
private $relation_a_chemins = array();
private $chemin_a_noeuds = array();
private $noeuds = array();
private $pas = 10000;
private $pas_commune = 1000;
 
public function __construct($conteneur) {
$this->conteneur = $conteneur;
$this->bdd = $this->conteneur->getBdd();
$this->messages = $this->conteneur->getMessages();
$this->mode = $this->conteneur->getParametre('m');
}
 
public function executer() {
// Lancement de l'action demandée
$cmd = $this->conteneur->getParametre('a');
switch ($cmd) {
case 'analyser' :
$this->lireFichierOsm();
break;
case 'polygone' :
$this->remplirPolygone();
break;
case 'zero' :
$this->remettreOrdreAZero();
break;
default :
$this->messages->traiterErreur('Erreur : la commande "%s" n\'existe pas!', array($cmd));
}
}
 
/**
* Lit le fichier OSM et lance l'analyse des noeuds xml en fonction de leur type.
*/
private function lireFichierOsm() {
$lecteur = $this->getLecteurXml();
while ($lecteur->read()) {
if ($lecteur->nodeType == XMLREADER::ELEMENT) {
$this->analyserElementXml($lecteur->localName, $lecteur->expand());
}
if ($this->mode == 'manuel') {
$this->messages->afficherAvancement("Analyse de la ligne du fichier OSM : ", 1);
}
}
$this->insererElementsOrphelins();
}
 
private function analyserElementXml($elementNom, $noeudDom) {
switch ($elementNom) {
case 'relation' :
$this->analyserRelation($noeudDom);
break;
case 'way' :
$this->analyserWay($noeudDom);
break;
case 'node' :
$this->analyserNode($noeudDom);
break;
}
}
 
private function insererElementsOrphelins() {
$this->insererRelationsCommunes();
$this->insererRelationAChemins();
$this->insererCheminANoeuds();
$this->insererNoeuds();
}
 
private function getLecteurXml() {
$fichierOsm = $this->conteneur->getParametre('f');
$lecteur = new XMLReader();
$ouvertureXmlOk = $lecteur->open($fichierOsm);
if ($ouvertureXmlOk === false) {
$msgTpl = "Impossible d'ouvrir le fichier osm : %s";
$msg = sprintf($msgTpl, $this->conteneur->getParametre('f'));
new Exception($msg);
}
return $lecteur;
}
 
/**
* Récupère l'id commune, nom commune et le code INSEE et remplie la table `CommuneOSM`
*/
private function analyserRelation($relation) {
$idRelation = $relation->getAttribute('id');
 
$chemins = $relation->getElementsByTagName('member');
$this->analyserChemins($idRelation, $chemins);
if (count($this->relation_a_chemins) > $this->pas) {
$this->insererRelationAChemins();
}
 
$tags = $relation->getElementsByTagName('tag');
$this->analyserTags($idRelation, $tags);
if (count($this->relations_communes) > $this->pas_commune) {
$this->insererRelationsCommunes();
}
}
 
private function analyserChemins($relation_id, $chemins) {
$ordreChemin = 1;
foreach ($chemins as $chemin) {
if ($chemin->getAttribute('type') == 'way') { //écarter le noeud centrale
$chemin_id = $chemin->getAttribute('ref');
$role = $chemin->getAttribute('role');//role: null, inner, outer, exclave et enclave.
$this->relation_a_chemins[] = array($relation_id, $chemin_id, $role, $ordreChemin++);
}
}
}
 
private function analyserTags($relation_id, $tags) {
$commune_nom = null;
$commune_insee = null;
foreach ($tags as $tag) {
$tag_cle = $tag->getAttribute('k');
$tag_val = $tag->getAttribute('v');
 
switch ($tag_cle) {
case 'name' :
$commune_nom = $tag_val;
break;
case 'ref:INSEE' :
$commune_insee = $tag_val;
break;
}
 
if (!is_null($commune_nom) && !is_null($commune_insee)) {
 
if (!isset($this->relations_communes[$relation_id])) {
$this->relations_communes[$relation_id] = array($relation_id, $commune_nom, $commune_insee);
} else {
$e = "La relation #%s possédant le tag ref:INSEE «%s» est déjà prise en compte.";
$this->messages->traiterErreur($e, array($relation_id, $commune_insee));
}
 
if (!isset($this->communes[$commune_insee])) {
$this->communes[$commune_insee] = $relation_id;
} else {
$e = "La relation #%s contient déjà le tag ref:INSEE avec la valeur %s.".
"Veuillez corriger la carte OSM.";
$this->messages->traiterErreur($e, array($this->communes[$commune_insee], $commune_insee, $relation_id));
}
break;// Stoppe le foreach car nous avons les infos nécessaires
}
}
}
 
/**
* Récupère l'id_way et tous les id_node de chaque way et remplie la table `osm_chemin_a_noeuds`
*/
private function analyserWay($way) {
$chemin_id = $way->getAttribute('id');
$ordre = 1;
$noeuds = $way->getElementsByTagName('nd');
foreach ($noeuds as $noeud) {
$noeud_id = $noeud->getAttribute('ref');
$this->chemin_a_noeuds[] = array($chemin_id, $noeud_id, $ordre++);
}
 
if (count($this->chemin_a_noeuds) > $this->pas) {
$this->insererCheminANoeuds();
}
}
 
/**
* Fonction qui récupère tous les l'id_node et les valeurs(Lat/Lon) correspondantes et remplie la table `osm_noeuds`
*/
private function analyserNode($node) {
$noeud_id = $node->getAttribute('id');
$lat = $node->getAttribute('lat');
$lon = $node->getAttribute('lon');
$this->noeuds[] = array($noeud_id, $lat, $lon);
 
if (count($this->noeuds) > $this->pas) {
$this->insererNoeuds();
}
}
 
private function insererRelationsCommunes() {
if (count($this->relations_communes) > 0) {
$requete = 'INSERT INTO osm_relations (id_relation, nom, code_insee) '.
'VALUES '.$this->creerValuesMultiple($this->relations_communes).
' -- '.__FILE__.' : '.__LINE__;
$this->bdd->requeter($requete);
}
$this->relations_communes = array();
}
 
private function insererRelationAChemins() {
if (count($this->relation_a_chemins) > 0) {
$requete = 'INSERT INTO osm_relation_a_chemins (id_relation, id_chemin, role, ordre) '.
'VALUES '.$this->creerValuesMultiple($this->relation_a_chemins).
' -- '.__FILE__.' : '.__LINE__;
$this->bdd->requeter($requete);
}
$this->relation_a_chemins = array();
}
 
private function insererCheminANoeuds() {
if (count($this->chemin_a_noeuds) > 0) {
$requete = 'INSERT INTO osm_chemin_a_noeuds (id_chemin, id_noeud, ordre) '.
'VALUES '.$this->creerValuesMultiple($this->chemin_a_noeuds).
' -- '.__FILE__.' : '.__LINE__;
$this->bdd->requeter($requete);
}
$this->chemin_a_noeuds = array();
}
 
private function insererNoeuds() {
if (count($this->noeuds) > 0) {
$requete = 'INSERT INTO osm_noeuds (id_noeud, lat, `long`) '.
'VALUES '.$this->creerValuesMultiple($this->noeuds).
' -- '.__FILE__.' : '.__LINE__;
$this->bdd->requeter($requete);
}
$this->noeuds = array();
}
 
private function creerValuesMultiple($donnees) {
$values = array();
foreach ($donnees as $infos) {
$infosP = $this->bdd->proteger($infos);
$values[] = implode(',', $infosP);
}
$valuesClause = '('.implode('),(', $values).')';
return $valuesClause;
}
}
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/osm/archives/shell/config.defaut.cfg
New file
0,0 → 1,26
# Binaires
CHEMIN_JAVA="/usr/local/jre/bin/java"
CHEMIN_PHP="/usr/local/php/5.5/bin/php"
CHEMIN_SCRIPT="/home/apitela/www/scripts/eflore"
 
# Dossiers, fichiers & urls
# Pour tester : http://download.geofabrik.de/europe/france/languedoc-roussillon-latest.osm.pbf
URL_FICHIER_OSM="http://download.geofabrik.de/europe/france-latest.osm.pbf"
DOSSIER_OSM="/home/jpm/web/eflore/eflore-projets/donnees/osm"
FICHIER_OSM="fr.osm.pbf"
FICHIER_ZG_NEW="fr_communes_new.osm"
FICHIER_ZG_OLD="fr_communes_old.osm"
FICHIER_ZG_DIFF="fr_communes_diff.osm"
 
# Osmosis
CHEMIN_OSMOSIS="/usr/local/sbin/osmosis-0.43.1/bin"
OSMOSIS_DOSSIER_TMP="$DOSSIER_OSM/tmp"
 
# Logs
VERBOSITE=3
DATE=`date +"%F"`
CHEMIN_LOG="$DOSSIER_OSM/logs"
FICHIER_LOG="$CHEMIN_LOG/analyse_${DATE}.log"
 
# Paramètres PHP
MEMORY_LIMIT_PHP="8000M"
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/osm/archives/shell/carto-osm-service.sh
New file
0,0 → 1,41
#!/bin/sh
#/etc/rc.d/init.d/
#
# Jean-Pascal MILCENT & Mohcen BENMOUNAH [19 juillet 2011]
# Service de lancement des scripts d'integration des donnees OSM pour le service de Geocadage Inverse
#
case "$1" in
 
start)
 
echo "Demarrage de carto-osm-cron :"
nohup /usr/local/sbin/carto-osm-cron 1>/dev/null 2>/dev/null &
 
;;
 
stop)
 
echo "Arret de carto-osm-cron"
PID=`ps -eaf | grep carto-osm-cron | grep -v grep | tr -s ' ' | cut -d' ' -f2 | head -n1`
kill -9 ${PID}
 
;;
 
status)
 
echo -n "Voici les PID du processus carto-osm-cron :"
PID=`ps -eaf | grep carto-osm-cron | grep -v grep | tr -s ' ' | cut -d' ' -f2 | head -n1`
echo ${PID}
 
;;
 
 
*)
 
echo "Usage: {start|stop|status}"
 
exit 1
 
;;
 
esac
Property changes:
Added: svn:executable
+*
\ No newline at end of property
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/osm/archives/shell/carto-osm-cron.sh
New file
0,0 → 1,30
#!/bin/bash
#
# Mohcen BENMOUNAH & Jean-Pascal MILCENT [19 juillet 2011]
# /etc/init.d/carto-osm : demarage/arrete/etat du cron de l'integration des donnees OSM pour le Geocodage Inverse (carto-osm)
# Lancement toutes les semaines le samedi matin après 3h00
 
while true
do
JOUR=$(date "+%u")
# Si nous sommes samedi (=6)
if [ $JOUR -eq 6 ] ; then
HEURE=$(date "+%H")
# Si nous sommes à 3 heures du matin
if [ $HEURE -eq 3 ] ; then
logger "carto-osm-maj : lancement script"
sudo -u telabotap /usr/local/sbin/carto-osm-maj
logger "carto-osm-maj : arret script"
# Nous retenterons de vérifier jour et heure dans 6 jours
sleep 6d
else
# Tentative toutes les heures
logger "carto-osm-maj : tentative heure $HEURE"
sleep 1h
fi
else
# Tentative tous les jours
logger "carto-osm-maj : tentative jour $JOUR"
sleep 1d
fi
done
Property changes:
Added: svn:executable
+*
\ No newline at end of property
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/osm/archives/shell/carto-osm-maj.sh
New file
0,0 → 1,91
#!/bin/bash
#
# Script de lancement de l'integration des donnees OSM pour le geocodage inverse
# Mohcen BENMOUNAH & Jean-Pascal MILCENT [19 juillet 2011]
#
ageEnSeconde(){ expr `date +%s` - `stat -c %Y $1`; };
 
if [ -f config.cfg ] ; then
source config.cfg
echo $DATE;
else
echo "Veuillez paramétrer le script en renommant le fichier 'config.defaut.cfg' en 'config.cfg'."
exit;
fi
 
echo "Export de l'emplacement du binaire Java dans la variable d'environnement JAVACMD";
export JAVACMD="$CHEMIN_JAVA"
 
echo "Export de l'emplacement du dossier tmp pour Osmosis"
export JAVACMD_OPTIONS="-Djava.io.tmpdir=$OSMOSIS_DOSSIER_TMP -Xmx4G"
 
if [ ! -f "$DOSSIER_OSM/$FICHIER_OSM" ] || [ `ageEnSeconde "$DOSSIER_OSM/$FICHIER_OSM"` -gt 86000 ] ; then
echo "Téléchargement du nouveau fichier PBF ...";
wget $URL_FICHIER_OSM -O "$DOSSIER_OSM/$FICHIER_OSM"
else
echo "Fichier $FICHIER_OSM existant à moins d'un jour.";
fi
 
if [ ! -f "$DOSSIER_OSM/$FICHIER_ZG_NEW" ] || [ `ageEnSeconde "$DOSSIER_OSM/$FICHIER_ZG_NEW"` -gt 86000 ] ; then
echo "Filtrage du fichier en cours ...";
$CHEMIN_OSMOSIS \
-v \
--read-pbf-fast "$DOSSIER_OSM/$FICHIER_OSM" workers=6 \
--tf accept-relations admin_level=8 \
--tf accept-relations type=boundary \
--tf accept-relations ref:INSEE=* \
--used-way \
--used-node \
--wx "$DOSSIER_OSM/$FICHIER_ZG_NEW"
fi
 
HEURE_DEBUT=`date +"%F %X"`;
echo "Début éxecution scripts php : $HEURE_DEBUT";
 
if [ ! -f "$DOSSIER_OSM/$FICHIER_ZG_OLD" ] ; then
echo "Création des tables osm en cours ...";
$CHEMIN_PHP -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT_PHP $CHEMIN_SCRIPT/cli.php osm -a chargerStructureSql -v $VERBOSITE > $FICHIER_LOG
 
echo "Analyse du fichier osm en cours ...";
$CHEMIN_PHP -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT_PHP $CHEMIN_SCRIPT/cli.php osm -a analyser -v $VERBOSITE -f "$DOSSIER_OSM/$FICHIER_ZG_NEW" >> $FICHIER_LOG
else
echo "Suppression du fichier DIFF existant en cours ...";
rm -f "$DOSSIER_OSM/$FICHIER_ZG_DIFF"
 
echo "Déduction de la différence en cours ...";
$CHEMIN_OSMOSIS\
--read-xml file="$DOSSIER_OSM/$FICHIER_ZG_NEW" \
--read-xml file="$DOSSIER_OSM/$FICHIER_ZG_OLD" \
--derive-change \
--write-xml-change file="$DOSSIER_OSM/$FICHIER_ZG_DIFF"
 
echo "Début de la mise à jour de base ...";
$CHEMIN_PHP -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT_PHP $CHEMIN_SCRIPT/cli.php mise_a_jour -a MAJ -f "$DOSSIER_OSM/$FICHIER_ZG_DIFF" > $FICHIER_LOG
fi
 
echo "Renommage du fichier NEW en OLD en cours ...";
mv "$DOSSIER_OSM/$FICHIER_ZG_NEW" "$DOSSIER_OSM/$FICHIER_ZG_OLD" >> $FICHIER_LOG
 
echo "Traitement de l'ordre en cours ...";
$CHEMIN_PHP -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT_PHP $CHEMIN_SCRIPT/cli.php osm -a ordre -v $VERBOSITE >> $FICHIER_LOG
 
echo "Remplissage des polygones en cours ...";
$CHEMIN_PHP -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT_PHP $CHEMIN_SCRIPT/cli.php osm -a polygone -v $VERBOSITE >> $FICHIER_LOG
 
echo "Remise de l'ordre à zéro en cours ...";
$CHEMIN_PHP -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT_PHP $CHEMIN_SCRIPT/cli.php osm -a zero -v $VERBOSITE >> $FICHIER_LOG
 
echo "Traitement de l'ordre des polygones incomplets en cours ...";
$CHEMIN_PHP -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT_PHP $CHEMIN_SCRIPT/cli.php osm -a ordonnerPolygoneInc -v $VERBOSITE >> $FICHIER_LOG
 
echo "Remplissage des polygones incomplets en cours ...";
$CHEMIN_PHP -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT_PHP $CHEMIN_SCRIPT/cli.php osm -a remplirPolygoneInc -v $VERBOSITE >> $FICHIER_LOG
 
echo "Renommage des polygones incomplets en cours ...";
$CHEMIN_PHP -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT_PHP $CHEMIN_SCRIPT/cli.php osm -a renommer -v $VERBOSITE >> $FICHIER_LOG
 
echo "Definition des centroïdes en cours ...";
$CHEMIN_PHP -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT_PHP $CHEMIN_SCRIPT/cli.php osm -a centre -v $VERBOSITE >> $FICHIER_LOG
 
HEURE_FIN=`date +"%F %X"`;
echo "Fin éxecution scripts php : $HEURE_FIN";
Property changes:
Added: svn:executable
+*
\ No newline at end of property
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/osm/archives/shell
New file
Property changes:
Added: svn:ignore
+config.cfg
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/osm/archives/PolygoneCreateur.php
New file
0,0 → 1,143
<?php
/**
* Traitement de l'ordre :
*
* Fonction qui rajoute l'ordre et le sens de chaque way d'une relation dans la table `osm_relation_a_chemins`
*
* Exemple de lancement du script :
* /opt/lampp/bin/php -d memory_limit=8000M cli.php osm -a ordre -m manuel
*
*/
class PolygoneCreateur {
private $conteneur;
private $bdd;
private $messages;
private $mode;
 
public function __construct($conteneur) {
$this->conteneur = $conteneur;
$this->bdd = $this->conteneur->getBdd();
$this->messages = $this->conteneur->getMessages();
$this->mode = $this->conteneur->getParametre('m');
}
 
/**
* Fonction qui parcourt tous les ways les noeuds de chaque relation en prenant en considération l'ordre et
* le sens de chaque ways concaténés ensemble (séparés par des virgules). Update du champ polygone de chaque
* relation dans la table `osm_relations`
*/
public function executer() {
// Lancement de l'action demandée
$cmd = $this->conteneur->getParametre('a');
switch ($cmd) {
case 'polygone' :
$this->genererPolygones();
break;
case 'centre' :
$this->mettreAJourCentroide();
break;
case 'zero' :
$this->remettreOrdreAZero();
break;
default :
$msgTpl = "Erreur : la commande '%s' n'est pas prise en compte par la classe %s !";
$msg = sprintf($msgTpl, $cmd, get_class($this));
throw new Exception($msg);
}
print "\n";// Pour ramener à la ligne en fin de script
}
 
private function genererPolygones() {
$relations = $this->getRelations();
foreach ($relations as $relation) {
$chemins = $this->getChemins($relation['id_relation']);
$noeuds = array();
foreach ($chemins as $chemin) {
$noeuds = array_merge($noeuds, $this->getNoeuds($chemin['id_chemin'], $chemin['sens']));
}
$this->creerPolygone($relation, $noeuds);
 
if ($this->mode == 'manuel') {
$this->messages->afficherAvancement("Création du polygone pour la relation : ", 1);
}
}
}
 
private function getRelations() {
$requete = 'SELECT id_relation, nom, code_insee '.
'FROM osm_relations '.
' -- '.__FILE__.' : '.__LINE__;
$relations = $this->bdd->recupererTous($requete);
return $relations;
}
 
private function getChemins($idRelation) {
$requete = 'SELECT id_chemin, sens '.
'FROM osm_relation_a_chemins '.
"WHERE id_relation = $idRelation ".
'ORDER BY ordre '.
' -- '.__FILE__.' : '.__LINE__;
$chemins = $this->bdd->recupererTous($requete);
return $chemins;
}
 
private function getNoeuds($idChemin, $sens) {
$tri = ($sens == 'directe') ? 'ASC' : 'DESC';
$requete = 'SELECT NLL.id_noeud, NLL.lat, NLL.`long` '.
'FROM osm_chemin_a_noeuds AS WN '.
' INNER JOIN osm_noeuds AS NLL ON (WN.id_noeud = NLL.id_noeud) '.
"WHERE WN.id_chemin = $idChemin ".
"ORDER BY WN.ordre $tri ".
' -- '.__FILE__.' : '.__LINE__;
$noeuds = $this->bdd->recupererTous($requete);
$latLng = array();
foreach ($noeuds as $noeud) {
$latLng[] = $noeud['lat'].' '.$noeud['long'];
}
return $latLng;
}
 
private function creerPolygone($relation, $noeuds) {
$polygone = implode(', ', $noeuds);
$idRelation = $relation['id_relation'];
$nomCommuneP = $this->bdd->proteger($relation['nom']);
$InseeP = $this->bdd->proteger($relation['code_insee']);
$note = ($noeuds[0] == $noeuds[count($noeuds) - 1]) ? 'Polygone complet' : 'Polygone incomplet';
 
$requete = 'REPLACE INTO osm_communes (id_relation, nom, code_insee, polygone, notes ) '.
"VALUES ($idRelation, $nomCommuneP, $InseeP, ".
"POLYFROMTEXT('MULTIPOLYGON ((($polygone)))'), '$note') ".
' -- '.__FILE__.' : '.__LINE__;
unset($polygone);
 
$this->bdd->requeter($requete);
}
 
/**
* Pour chaque commune, renseigne le champe "centre" avec un point centroïde du polygone (si non null).
*/
private function mettreAJourCentroide() {
$requete = 'UPDATE osm_communes '.
'SET centre = CENTROID(polygone) '.
"WHERE polygone IS NOT NULL ".
' -- '.__FILE__.' : '.__LINE__;
$retour = $this->bdd->requeter($requete);
$this->messages->traiterInfo("Nombre de centroïde mis à jour : ".$retour->rowCount());
}
 
/**
* Pour chaque commune, remet à zéro l'ordre des chemins si le polygone est incomplet.
*/
private function remettreOrdreAZero() {
$sousRequeteRelations = 'SELECT DISTINCT id_relation '.
'FROM osm_communes '.
"WHERE notes = 'Polygone incomplet' ";
 
$requete = 'UPDATE osm_relation_a_chemins '.
'SET ordre = NULL '.
"WHERE id_relation IN ($sousRequeteRelations) ".
' -- '.__FILE__.' : '.__LINE__;
$retour = $this->bdd->requeter($requete);
$this->messages->traiterInfo("Nombre de chemins remis à zéro : ".$retour->rowCount());
}
}
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/osm/archives/PolygoneReparateur.php
New file
0,0 → 1,300
<?php
/**
* Réparation des polygones incomplets :
*
* Exemple de lancement du script :
* /opt/lampp/bin/php -d memory_limit=8000M cli.php osm -a ordonnerPolygoneInc -m manuel -v 3
*
* /opt/lampp/bin/php -d memory_limit=8000M cli.php osm -a remplirPolygoneInc -m manuel -v 3
*
* /opt/lampp/bin/php -d memory_limit=8000M cli.php osm -a renommer -m manuel -v 3
*
*/
class PolygoneReparateur {
private $conteneur;
private $bdd;
private $messages;
private $mode;
 
public function __construct($conteneur) {
$this->conteneur = $conteneur;
$this->bdd = $this->conteneur->getBdd();
$this->messages = $this->conteneur->getMessages();
$this->mode = $this->conteneur->getParametre('m');
}
 
/**
* Fonction qui parcourt tous les ways les noeuds de chaque relation en prenant en considération l'ordre et
* le sens de chaque ways concaténés ensemble (séparés par des virgules). Update du champ polygone de chaque
* relation dans la table `osm_relations`
*/
public function executer() {
// Lancement de l'action demandée
$cmd = $this->conteneur->getParametre('a');
switch ($cmd) {
case 'ordonnerPolygoneInc' :
$this->ordonnerRelationsAuPolygoneIncomplet();
break;
case 'remplirPolygoneInc' :
$this->remplirRelationsAuPolygoneIncomplet();
break;
case 'renommer' :
$this->renommerEnPolygoneIncomplet();
break;
default :
$msgTpl = "Erreur : la commande '%s' n'est pas prise en compte par la classe %s !";
$msg = sprintf($msgTpl, $cmd, get_class($this));
throw new Exception($msg);
}
print "\n";// Pour ramener à la ligne en fin de script
}
 
/**
* Fonction qui récupère les relations des polygones incomplets et appelle pour chaque relation la fonction
* ordonnerPolygoneIncomplet($ordre,$tour,$idRelation,$nombrePolygone)
*/
private function ordonnerRelationsAuPolygoneIncomplet() {
$relations = $this->getRelationsAuPolygoneIncomplet();
foreach ($relations as $relation) {
$idRelation = $relation['id_relation'];
$this->ordonnerCheminsMultiPolygone($idRelation);
 
if ($this->mode == 'manuel') {
$this->messages->afficherAvancement("Réparation du polygone incomplet : ", 1);
}
}
}
 
/**
* Fonction récursive qui exécute la même tâche que la fonction ordonnerWays() pour chaque polygone d'un
* multipolygone et remplie le champ NbPoly dans la table `osm_relation_a_chemins` qui correspond au nombre de polygone fermé
* dans le multipolygone
*/
private function ordonnerCheminsMultiPolygone($idRelation, $numPolygone = 1, $ordre = 1, $tour = 1) {
$chemins = $this->getChemins($idRelation);
$nbreCheminsTotal = count($chemins);
 
// premier élément du tableau
$idPremierChemin = $chemins[0]['id_chemin'];
$idChemin = $idPremierChemin;
 
$this->mettreAJourChemin($idRelation, $idPremierChemin, $ordre, 'directe', $numPolygone);
//selection dernier noeud
$nodes = $this->getNoeuds($idPremierChemin);
$nombreNodes = count($nodes);
$premierNoeud = $nodes[0]['id_noeud'];
$dernierNoeud = $nodes[$nombreNodes - 1]['id_noeud'];
$noeudActuel = $dernierNoeud;
 
//Condition pour laquelle la boucle while continue à tourner; tant que le premier noeud du polygone n'est
//égale au dernier et tant qu'il reste des ways à gérer
while (($premierNoeud != $noeudActuel) && (($ordre % 1000) < $nbreCheminsTotal)) {
//select le way qui possède le dernier noeud du précédent way et écarter l'actuel
$ordre++;
 
$chemins = $this->getCheminsAOrdonner($idRelation, $idChemin, $noeudActuel);
if (isset($chemins[0])) {
$idChemin = $chemins[0]['id_chemin'];
$nodes = $this->getNoeuds($idChemin);
$nombreNodes = count($nodes);
if (strcmp($nodes[0]['id_noeud'], $noeudActuel ) == 0) {
$sens = 'directe';
$noeudActuel = $nodes[$nombreNodes-1]['id_noeud'];
} else {
$sens = 'indirecte';
$noeudActuel = $nodes[0]['id_noeud'];
}
$this->mettreAJourChemin($idRelation, $idChemin, $ordre, $sens, $numPolygone);
}
}
$ordre = 1000 * $tour; //différencier chaque polygone: pour chaque polygone on a un multiple de mille
if ($this->getNombreChemins($idRelation) != 0) {
//appelle de la méthode récursivement
$this->ordonnerCheminsMultiPolygone($idRelation, ++$numPolygone, $ordre, ++$tour);
}
}
 
private function getRelationsAuPolygoneIncomplet() {
$requete = 'SELECT id_relation '.
'FROM osm_communes '.
"WHERE notes = 'Polygone incomplet' ".
' -- '.__FILE__.' : '.__LINE__;
$relations = $this->bdd->recupererTous($requete);
return $relations;
}
 
private function getChemins($idRelation) {
$requete = 'SELECT id_chemin '.
'FROM osm_relation_a_chemins '.
"WHERE id_relation = $idRelation ".
"AND ordre IS NULL ".
' -- '.__FILE__.' : '.__LINE__;
$chemins = $this->bdd->recupererTous($requete);
return $chemins;
}
/**
* Select des ways qui n'ont pas été ordonnés: on obtient à chaque itération les ways qui restent à ordonner
*/
private function getCheminsAOrdonner($idRelation, $idChemin, $idNoeud) {
$requete = 'SELECT cn.id_chemin '.
'FROM osm_relation_a_chemins AS rc '.
' INNER JOIN osm_chemin_a_noeuds AS cn ON (rc.id_chemin = cn.id_chemin) '.
"WHERE cn.id_noeud = $idNoeud ".
"AND cn.id_chemin != $idChemin ".
"AND rc.id_relation = $idRelation ".
"AND rc.ordre IS NULL ".
' -- '.__FILE__.' : '.__LINE__;
$chemins = $this->bdd->recupererTous($requete);
return $chemins;
}
 
private function getNoeuds($idChemin) {
$requete = 'SELECT id_noeud '.
'FROM osm_chemin_a_noeuds '.
"WHERE id_chemin = $idChemin ".
'ORDER BY ordre '.
' -- '.__FILE__.' : '.__LINE__;
$noeuds = $this->bdd->recupererTous($requete);
return $noeuds;
}
 
private function getNombreChemins($idRelation) {
$requete = 'SELECT COUNT(id_chemin) AS nbre '.
'FROM osm_relation_a_chemins '.
"WHERE id_relation = $idRelation ".
'AND ordre = 0 '.
' -- '.__FILE__.' : '.__LINE__;
$infos = $this->bdd->recuperer($requete);
return $infos['nbre'];
}
 
private function mettreAJourChemin($idRelation, $idChemin, $ordre, $sens, $nbrePoly) {
$requete = 'UPDATE osm_relation_a_chemins '.
"SET ordre = '$ordre', sens = '$sens', num_poly = $nbrePoly ".
"WHERE id_relation = $idRelation ".
"AND id_chemin = $idChemin ".
' -- '.__FILE__.' : '.__LINE__;
$this->bdd->requeter($requete);
}
 
/**
* Fonction qui récupère les relations des polygones incomplets et appelle pour chaque relation la fonction
* remplirPolygoneIncomplet($idRelation);
*/
private function remplirRelationsAuPolygoneIncomplet() {
$relations = $this->getRelationsAuPolygoneIncomplet();
foreach ($relations as $relation) {
$this->remplirPolygoneIncomplet($relation['id_relation']);
if ($this->mode == 'manuel') {
$this->messages->afficherAvancement("Création du polygone incomplet : ", 1);
}
}
}
 
/**
* Fonction qui exécute la même tâche que la fonction remplirPolygone() pour chaque polygone d'un multipolygone
* et renvoie un tableau MultiPolygone[] où chaque case contient un polygone fermé. Puis met à jour le polygone
* de la commune.
*/
private function remplirPolygoneIncomplet($idRelation) {
// Tableau multipolygone qui contient tous les polygones d'un multipolygone
$multiPolygone = array();
// Tableau roles qui contient les différents roles des chemins de la relation
$roles = array();
// Sélectionner le nombre de polygones qui existe dans un multipolygone
$nbPoly = $this->getNombrePoly($idRelation);
//boucle for qui parcourt chaque polygone du multipolygone
for ($numPoly = 1; $numPoly <= $nbPoly; $numPoly++) {
$polygone = array();
$chemins = $this->getCheminsParPolygone($idRelation, $numPoly);
foreach ($chemins as $chemin) {
$role = $chemin['role'];
$roles[$role] = (isset($roles[$role])) ? $roles[$role]++ : 1;
$noeuds = $this->getNoeudsPourCheminEtSens($chemin['id_chemin'], $chemin['sens']);
$polygone = array_merge($polygone, $noeuds);
}
$multiPolygone[] = implode(', ', $polygone);
}
$this->mettreAJourMultiPolygone($multiPolygone, $roles, $idRelation, $nbPoly);
}
 
private function getNombrePoly($idRelation) {
$requete = 'SELECT MAX(num_poly) AS num_poly '.
'FROM osm_relation_a_chemins '.
"WHERE id_relation = $idRelation ".
' -- '.__FILE__.' : '.__LINE__;
$resultat = $this->bdd->recuperer($requete);
return $resultat['num_poly'];
}
 
private function getCheminsParPolygone($idRelation, $numPoly) {
$requete = 'SELECT id_chemin, sens, role '.
'FROM osm_relation_a_chemins '.
"WHERE id_relation = $idRelation ".
"AND num_poly = $numPoly ".
'ORDER BY ordre '.
' -- '.__FILE__.' : '.__LINE__;
$chemins = $this->bdd->recupererTous($requete);
return $chemins;
}
 
private function getNoeudsPourCheminEtSens($idChemin, $sens) {
$tri = ($sens == 'directe') ? 'ASC' : 'DESC';
$requete = 'SELECT NLL.id_noeud, NLL.lat, NLL.`long` '.
'FROM osm_chemin_a_noeuds AS WN '.
' INNER JOIN osm_noeuds AS NLL ON (WN.id_noeud = NLL.id_noeud) '.
"WHERE WN.id_chemin = $idChemin ".
"ORDER BY WN.ordre $tri ".
' -- '.__FILE__.' : '.__LINE__;
$noeuds = $this->bdd->recupererTous($requete);
$latLng = array();
foreach ($noeuds as $noeud) {
$latLng[] = $noeud['lat'].' '.$noeud['long'];
}
return $latLng;
}
 
/**
* Remplie le champ polygone à partir du tableau MultiPolygone
*/
private function mettreAJourMultiPolygone($multiPolygone, $roles, $idRelation, $nbPoly) {
// Présence d'une enclave contenue dans cette entité administrative mais qui appartient à une autre entité administrative
if ((isset($roles['inner']) || isset($roles['enclave']))) {
if ($nbPoly == 2) {
$multiPoly = implode('),(', $multiPolygone);
} else {
$multiPoly = null;
$msgTpl = "La relation '%s' possède plus de 2 polygones de type enclaves.";
$this->messages->traiterErreur($msgTpl, array($idRelation));
}
} else {
// Tous les autres cas
$multiPoly = implode(')),((', $multiPolygone);
}
if (isset($multiPoly)) {
$this->mettreAJourCommune($idRelation, $multiPoly);
}
}
 
private function mettreAJourCommune($idRelation, $multiPoly) {
$requete = 'UPDATE osm_communes '.
"SET polygone = MPOLYFROMTEXT('MULTIPOLYGON((($multiPoly)))'), ".
"notes = 'Polygone complet' ".
"WHERE id_relation = $idRelation ".
' -- '.__FILE__.' : '.__LINE__;
$this->bdd->requeter($requete);
}
 
/**
* Renomme la note des polygones vides d'un polygone complet en polygone incomplet
*/
private function renommerEnPolygoneIncomplet() {
$requete = 'UPDATE osm_communes '.
"SET notes = 'Polygone incomplet' ".
"WHERE ASTEXT(polygone) IS NULL ".
' -- '.__FILE__.' : '.__LINE__;
 
$retour = $this->bdd->requeter($requete);
$this->messages->traiterInfo("Nombre de polygones définis à incomplet : ".$retour->rowCount());
}
}
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/osm/FranceCommunes.php
New file
0,0 → 1,61
<?php
/**
* Création de la table osm_communes.
* /opt/lampp/bin/php cli.php osm -a communes -m manuel
*
*/
class FranceCommunes {
 
private $conteneur;
private $bdd;
private $messages;
private $mode;
 
private $bddOsmNom;
 
public function __construct($conteneur) {
$this->conteneur = $conteneur;
$this->bdd = $this->conteneur->getBdd();
$this->bddOsmNom = $this->conteneur->getParametre('bdd_osm_nom');
$this->messages = $this->conteneur->getMessages();
$this->mode = $this->conteneur->getParametre('m');
}
 
public function executer() {
// Lancement de l'action demandée
$cmd = $this->conteneur->getParametre('a');
switch ($cmd) {
case 'cm' :
$this->supprimerTableOsmCommunes();
$this->conteneur->getEfloreCommun()->chargerStructureSql();
$this->creerTableOsmCommunes();
break;
case 'cmCreer' :
$this->creerTableOsmCommunes();
break;
case 'cmSupprimer' :
$this->supprimerTableOsmCommunes();
break;
default :
$this->messages->traiterErreur('Erreur : la commande "%s" n\'existe pas!', array($cmd));
}
 
}
 
private function supprimerTableOsmCommunes() {
$requete = 'DROP TABLE IF EXISTS osm_communes '.
' -- '.__FILE__.' : '.__LINE__;
$this->bdd->requeter($requete);
}
 
private function creerTableOsmCommunes() {
$requete = 'INSERT INTO osm_communes '.
"SELECT osm_id, osm_version, osm_timestamp, name, ref_insee, shape, shape_centroid, wikipedia ".
"FROM {$this->bddOsmNom}.multipolygons_ref ".
"WHERE admin_level = 8 ".
"AND (ref_insee IS NOT NULL OR ref_insee != '') ".
"AND CHAR_LENGTH(ref_insee) = 5 ".
' -- '.__FILE__.' : '.__LINE__;
$this->bdd->requeter($requete);
}
}
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/osm/ZonesAdmin.php
New file
0,0 → 1,119
<?php
/**
* Création de la table osm_communes.
* /opt/lampp/bin/php cli.php osm -a communes -m manuel
*
*/
class ZonesAdmin {
 
private $conteneur;
private $bdd;
private $messages;
private $mode;
 
private $bddOsmNom;
 
public function __construct($conteneur) {
$this->conteneur = $conteneur;
$this->bdd = $this->conteneur->getBdd();
$this->bddOsmNom = $this->conteneur->getParametre('bdd_osm_nom');
$this->messages = $this->conteneur->getMessages();
$this->mode = $this->conteneur->getParametre('m');
}
 
public function executer() {
// Lancement de l'action demandée
$cmd = $this->conteneur->getParametre('a');
switch ($cmd) {
case 'za' :
$this->supprimerTableOsmZonesAdmin();
$this->conteneur->getEfloreCommun()->chargerStructureSql();
$this->creerTableOsmZonesAdmin();
$this->corrigerTableOsmZonesAdmin();
$this->mettreAJourIdZoneGeo();
break;
case 'zaCreer' :
$this->creerTableOsmZonesAdmin();
break;
case 'zaCorriger' :
$this->corrigerTableOsmZonesAdmin();
break;
case 'zaMajIdZG' :
$this->mettreAJourIdZoneGeo();
break;
case 'zaSupprimer' :
$this->supprimerTableOsmZonesAdmin();
break;
default :
$this->messages->traiterErreur('Erreur : la commande "%s" n\'existe pas!', array($cmd));
}
 
}
 
private function supprimerTableOsmZonesAdmin() {
$requete = 'DROP TABLE IF EXISTS osm_zones_admin '.
' -- '.__FILE__.' : '.__LINE__;
$this->bdd->requeter($requete);
}
 
private function creerTableOsmZonesAdmin() {
$requete = 'INSERT INTO osm_zones_admin '.
"SELECT if(ref_insee != '' AND admin_level = 8, CONCAT('INSEE-C:',ref_insee), ".
"if(ref_insee != '' AND admin_level = 6, CONCAT('INSEE-D:',ref_insee), ".
"if(ref_insee != '' AND admin_level = 4, CONCAT('INSEE-R:',ref_insee), ".
"if(iso3166_2 != '', CONCAT('ISO-3166-2:',iso3166_2), ".
"if(iso3166_1 != '', CONCAT('ISO-3166-1:',iso3166_1), ".
"CONCAT('OSM-ID:',osm_id)))))), ".
'osm_id, osm_version, osm_timestamp, '.
"if(name_fr != '', name_fr, name), ".
'shape, shape_centroid, Y(shape_centroid), X(shape_centroid), zone, '.
'admin_level, iso3166_1, iso3166_2, ref_insee, ref_nuts, '.
'name, name_fr, name_en, name_es, wikipedia '.
"FROM {$this->bddOsmNom}.multipolygons_ref ".
' -- '.__FILE__.' : '.__LINE__;
$this->bdd->requeter($requete);
}
 
private function corrigerTableOsmZonesAdmin() {
$requete = 'SELECT osm_id, other_tags '.
"FROM {$this->bddOsmNom}.multipolygons_ref ".
"WHERE iso3166_2 IS NULL AND other_tags LIKE '%\"iso3166-2\"%' ".
' -- '.__FILE__.' : '.__LINE__;
$resultat = $this->bdd->recupererTous($requete);
if ($resultat) {
foreach ($resultat as $infos) {
$tags = $this->getTags($infos['other_tags']);
$iso_3166_2 = $this->bdd->proteger($tags['iso3166-2']);
$osm_id = $this->bdd->proteger($infos['osm_id']);
 
$requete = 'UPDATE osm_zones_admin '.
"SET code_iso_3166_2 = $iso_3166_2 ".
"WHERE osm_id = $osm_id ".
' -- '.__FILE__.' : '.__LINE__;
$this->bdd->requeter($requete);
}
}
}
 
private function getTags($tagsInfos) {
$tags = array();
$clesValeurs = explode(',', $tagsInfos);
foreach ($clesValeurs as $cleValeur) {
list($cle, $val) = explode('=>', $cleValeur);
$tags[trim($cle, '"')] = trim($val, '"');
}
return $tags;
}
 
private function mettreAJourIdZoneGeo() {
$requete = 'UPDATE osm_zones_admin '.
"SET id_zone_geo = if(code_insee != '' AND niveau = 8, CONCAT('INSEE-C:',code_insee), ".
"if(code_insee != '' AND niveau = 6, CONCAT('INSEE-D:',code_insee), ".
"if(code_insee != '' AND niveau = 4, CONCAT('INSEE-R:',code_insee), ".
"if(code_iso_3166_2 != '', CONCAT('ISO-3166-2:',code_iso_3166_2), ".
"if(code_iso_3166_1 != '', CONCAT('ISO-3166-1:',code_iso_3166_1), ".
"CONCAT('OSM-ID:',osm_id)))))) ".
' -- '.__FILE__.' : '.__LINE__;
$this->bdd->requeter($requete);
}
}
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/osm
New file
Property changes:
Added: svn:mergeinfo
Merged /branches/v5.2-alpage/scripts/modules/osm:r976,978
Merged /branches/v5.7-arrayanal/scripts/modules/osm:r1050,1052
Merged /branches/v5.1-acheb/scripts/modules/osm:r927
Merged /branches/v5.7-arrayanal:r1066-1070
Added: svn:ignore
+.config.ini.swp
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/chorodep/Chorodep.php
New file
0,0 → 1,765
<?php
// /opt/lampp/bin/php cli.php chorodep -a chargerVersions
class Chorodep extends EfloreScript {
protected $nbre_dep = 0;
private $type_donnee = '';
protected $aso_num_nomenc = array();
protected $nbre_ligne = 0;
protected $nbre_plte_presente = 0;
protected $nbre_plte_a_confirmer = 0;
protected $nbre_plte_douteux = 0;
protected $nbre_plte_erreur = 0;
protected $nbre_plte_disparue = 0;
protected $nbre_plte_erreur_a_confirmer = 0;
protected $nc_autres_valeur_champ = 0;
protected $nc_nbre_plte_presente = 0;
protected $nc_nbre_plte_a_confirmer = 0;
protected $nc_nbre_plte_douteux = 0;
protected $nc_nbre_plte_disparue = 0;
protected $nc_nbre_plte_erreur = 0;
protected $nc_nbre_plte_erreur_a_confirmer = 0;
 
protected $aso_totaux_dep = array();
private $fichier_verif = './chorodep_verif.html';
 
public function executer() {
try {
$this->initialiserProjet('chorodep');
 
// Lancement de l'action demandée
$cmd = $this->getParametre('a');
switch ($cmd) {
 
case 'chargerTous' :
$this->chargerStructureSql();
$this->chargerVersions();
$this->chargerChorodepContributeurs();
$this->chargerChorodepSources();
$this->chargerChorodepOntologies();
break;
case 'chargerStructureSql' :
$this->chargerStructureSql();
break;
case 'chargerVersions' :
$this->chargerVersions();
break;
case 'chargerChorodep' :
$this->chargerChorodepContributeurs();
$this->chargerChorodepSources();
$this->chargerChorodepOntologies();
break;
case 'verifierDonnees' :
$this->initialiserTraitement();
$this->verifierDonnees();
break;
case 'supprimerTous' :
$this->supprimerTous();
break;
// noms vernaculaires et statuts de protection
case 'NVSP' :
$this->nettoyageNVSP();
$this->chargerStructureNVSP();
$this->rabouterNomsVernaculaires();
$this->rabouterStatutsProtection();
break;
case 'nettoyageNVSP' :
$this->nettoyageNVSP();
break;
case 'chargerStructureNVSP' :
$this->chargerStructureNVSP();
break;
case 'nomsVernaculaires' :
$this->rabouterNomsVernaculaires();
break;
case 'statutsProtection' :
$this->rabouterStatutsProtection();
break;
default :
throw new Exception("Erreur : la commande '$cmd' n'existe pas!");
}
} catch (Exception $e) {
$this->traiterErreur($e->getMessage());
}
}
 
private function chargerChorodepContributeurs() {
$chemin = Config::get('chemins.chorodepContributeurs');
$table = Config::get('tables.chorodepContributeurs');
$requete = "LOAD DATA INFILE '$chemin' ".
"REPLACE INTO TABLE $table ".
'CHARACTER SET utf8 '.
'FIELDS '.
" TERMINATED BY '\t' ".
" ENCLOSED BY '' ".
" ESCAPED BY '\\\' ".
'IGNORE 2 LINES';
$this->getBdd()->requeter($requete);
}
 
private function chargerChorodepSources() {
$chemin = Config::get('chemins.chorodepSources');
$table = Config::get('tables.chorodepSources');
$requete = "LOAD DATA INFILE '$chemin' ".
"REPLACE INTO TABLE $table ".
'CHARACTER SET utf8 '.
'FIELDS '.
" TERMINATED BY '\t' ".
" ENCLOSED BY '' ".
" ESCAPED BY '\\\' ".
'IGNORE 2 LINES';
$this->getBdd()->requeter($requete);
}
 
private function chargerChorodepOntologies() {
$chemin = Config::get('chemins.chorodepOntologies');
$table = Config::get('tables.chorodepOntologies');
$requete = "LOAD DATA INFILE '$chemin' ".
"REPLACE INTO TABLE $table ".
'CHARACTER SET utf8 '.
'FIELDS '.
" TERMINATED BY '\t' ".
" ENCLOSED BY '' ".
" ESCAPED BY '\\\' ".
'IGNORE 1 LINES';
$this->getBdd()->requeter($requete);
}
 
private function chargerVersions() {
$versions = explode(',', Config::get('versions'));
$versionsDonnees = explode(',', Config::get('versionsDonnees'));
foreach ($versions as $id => $version) {
$versionDonnees = $versionsDonnees[$id];
$this->chargerStructureSqlVersion($versionDonnees);
$this->chargerDonneesVersion($versionDonnees, $version);
}
}
 
private function chargerStructureSqlVersion($versionDonnees) {
$fichierSqlTpl = Config::get('chemins.structureSqlVersionTpl');
$fichierSql = sprintf($fichierSqlTpl, $versionDonnees, $versionDonnees);
$contenuSql = $this->recupererContenu($fichierSql);
$this->executerScripSql($contenuSql);
}
 
private function chargerDonneesVersion($versionDonnees, $version) {
$fichierTsvTpl = Config::get('chemins.chorodepTpl');
$fichierTsv = sprintf($fichierTsvTpl, $versionDonnees, $versionDonnees);
$tableTpl = Config::get('tables.chorodepTpl');
$table = sprintf($tableTpl, $version);
$champs = Config::get('chorodepChamps'.$version);
$requete = "LOAD DATA INFILE '$fichierTsv' ".
"REPLACE INTO TABLE $table ".
'CHARACTER SET utf8 '.
'FIELDS '.
" TERMINATED BY '\t' ".
" ENCLOSED BY '' ".
" ESCAPED BY '\\\' ".
"($champs) ";
$this->getBdd()->requeter($requete);
}
 
private function initialiserTraitement() {
//------------------------------------------------------------------------------------------------------------//
// Récupération des informations à vérifier
$table = $this->getNomTableDerniereVersion();
$requete = 'SELECT * '.
"FROM $table ";
$taxons = $this->getBdd()->recupererTous($requete);
$tax_col = $taxons[1];
$col = array_keys($tax_col);
$this->initialiserTableaux($col);
//------------------------------------------------------------------------------------------------------------//
// Analyse des données
echo 'Traitement de la ligne n° :';
$i = 0;
$j = 0;
$aso_departements_analyses = array();
$this->nbre_ligne_avec_guillemet = 0;
foreach ($taxons as $aso_champs) {
$nom = $aso_champs['nom_sci'];
$num_taxo = $aso_champs['num_tax'];
$num_nomenc = $aso_champs['num_nom'];
if ($num_nomenc == 'nc') {
$this->nc_nbre_nom++;
} else if ($num_nomenc != 'nc') {
$this->nbre_nom++;
// Vérification de la nom duplication des numéros nomenclaturaux
if ( !array_key_exists($num_nomenc, (array) $this->aso_num_nomenc) ) {
$this->aso_num_nomenc[$num_nomenc]['compteur'] = 1;
$this->aso_num_nomenc[$num_nomenc]['ligne'] = ($this->nbre_ligne+1);
} else {
$this->aso_num_nomenc[$num_nomenc]['compteur']++;
$this->aso_num_nomenc[$num_nomenc]['ligne'] .= ' - '.($this->nbre_ligne+1);
}
}
foreach ($aso_champs as $cle => $val ) {# Pour chaque département du taxon, on regarde la valeur
$this->nbre_ligne_avec_guillemet += preg_match('/"/', $val);
if ( preg_match('/^\d{2}$/', $cle) ) {# Nous vérifions que le nom du champs comprend bien le numéro du département entre ()
$nd = $cle;# Numéro du département
// Nous comptons le nombre de département en base de données
if (!isset($aso_departements_analyses[$nd])) {
$this->nbre_dep_analyse++;
$aso_departements_analyses[$nd] = $nd;
}
if ( $num_nomenc != 'nc' && isset($val) && $val != '') {# Si le taxon n'est pas abscent du département
if ($val == '1') {# Présent
// Calcul du nombre de plante ayant un statut "Présent"
$this->nbre_plte_presente++;
// Stockage par département du nombre de plante ayant un statut "Présent"
$this->aso_totaux_dep[$nd]['plte_presente']++;
// Stockage des informations
$this->tab_choro_dep[$j] = array(ZgFrDepartements::getIdChaine($nd), $num_taxo, $num_nomenc, 3, $this->id_donnee_choro++);
} else if ($val == '1?') {# Présence à confirmer
// Calcul du nombre de plante ayant un statut "Présence à confirmer"
$this->nbre_plte_a_confirmer++;
// Stockage par département du nombre de plante ayant un statut "Présence à confirmer"
$this->aso_totaux_dep[$nd]['plte_a_confirmer']++;
// Stockage des informations
$this->tab_choro_dep[$j] = array(ZgFrDepartements::getIdChaine($nd), $num_taxo, $num_nomenc, 4, $this->id_donnee_choro++);
} else if (preg_match('/^\s*(?:\?)\s*$/', $val)) {# Douteux
// Calcul du nombre de plante ayant un statut "Disparu ou douteux"
$this->nbre_plte_douteux++;
// Stockage par département du nombre de plante ayant un statut "Douteux"
$this->aso_totaux_dep[$nd]['plte_douteux']++;
// Stockage des informations
$this->tab_choro_dep[$j] = array(ZgFrDepartements::getIdChaine($nd), $num_taxo, $num_nomenc, 5, $this->id_donnee_choro++);
if (preg_match('/(?: \?|\? | \? )/', $val)) {# Douteux
// Ajout de la valeur dans une variable car elle n'est pas tout à fait conforme à "?".
$this->autres_valeur_champ .= '<'.$val.'> '.'(Ligne n°: '.($this->nbre_ligne+2).
' - N° nomenclatural: '.$num_nomenc.' - N° département: '.$nd.')<br />';
}
} elseif (preg_match('/^\s*(?:#)\s*$/', $val)) {# Erreur
# Calcul du nombre de plante ayant un statut "Erreur"
$this->nbre_plte_erreur++;
# Stockage par département du nombre de plante ayant un statut "Erreur"
$this->aso_totaux_dep[$nd]['plte_erreur']++;
# Stockage des informations
$this->tab_choro_dep[$j] = array(ZgFrDepartements::getIdChaine($nd), $num_taxo, $num_nomenc, 6, $this->id_donnee_choro++);
if (preg_match('/(?: #|# | # )/', $val)) {# Erreur avec espace
# Ajout de la valeur dans une variable car elle n'est pas tout à fait conforme à "#".
$autres_valeur_champ .= '<'.$val.'> '.'(Ligne n°: '.($this->nbre_ligne+2).
' - N° nomenclatural: '.$num_nomenc.' - N° département: '.$nd.')<br />';
}
} elseif (preg_match('/^\s*(?:-\|-)\s*$/', $val)) {# Disparu
# Calcul du nombre de plante ayant un statut "Disparu"
$this->nbre_plte_disparue++;
# Stockage par département du nombre de plante ayant un statut "Disparu"
$this->aso_totaux_dep[$nd]['plte_disparue']++;
# Stockage des informations
$this->tab_choro_dep[$j] = array(ZgFrDepartements::getIdChaine($nd), $num_taxo, $num_nomenc, 6, $this->id_donnee_choro++);
if (preg_match('/(?: -\|-|-\|- | -\|- )/', $val)) {# Disparu avec espace
# Ajout de la valeur dans une variable car elle n'est pas tout à fait conforme à "-|-".
$autres_valeur_champ .= '<'.$val.'> '.'(Ligne n°: '.($this->nbre_ligne+2).
' - N° nomenclatural: '.$num_nomenc.' - N° département: '.$nd.')<br />';
}
} elseif (preg_match('/^\s*(?:#\?)\s*$/', $val)) {# Erreur à confirmer
# Calcul du nombre de plante ayant un statut "Erreur à confirmer"
$this->nbre_plte_erreur_a_confirmer++;
# Stockage par département du nombre de plante ayant un statut "Erreur à confirmer"
$this->aso_totaux_dep[$nd]['plte_erreur_a_confirmer']++;
# Stockage des informations
$this->tab_choro_dep[$j] = array(ZgFrDepartements::getIdChaine($nd), $num_taxo, $num_nomenc, 6, $this->id_donnee_choro++);
if (preg_match('/^(?:\s+#\?|#\?\s+|\s+#\?\s+)$/', $val)) {# Erreur à confirmer avec espace
# Ajout de la valeur dans une variable car elle n'est pas tout à fait conforme à "#?".
$autres_valeur_champ .= '<'.$val.'> '.'(Ligne n°: '.($this->nbre_ligne+2).
' - N° nomenclatural: '.$num_nomenc.' - N° département: '.$nd.')<br />';
}
} else {
// Ajout de la valeur dans une variable car elle n'est pas conforme.
$this->autres_valeur_champ .= '<'.$val.'> '.'(Ligne n°: '.($this->nbre_ligne+2).
' - N° nomenclatural: '.$num_nomenc.' - N° département: '.$nd.')<br />';
}
$j++;
} else if (isset($val) && $val != '') {
if ($val == '1') {# Présent
// Calcul du nombre de plante 'nc' ayant un statut "Présent"
$this->nc_nbre_plte_presente++;
// Stockage par département du nombre de plante 'nc' ayant un statut "Présent"
$this->aso_totaux_dep[$nd]['nc_plte_presente']++;
} elseif ($val == '1?') {# Présence à confirmer
// Calcul du nombre de plante 'nc' ayant un statut "Présence à confirmer"
$this->nc_nbre_plte_a_confirmer++;
// Stockage par département du nombre de plante 'nc' ayant un statut "Présence à confirmer"
$this->aso_totaux_dep[$nd]['nc_plte_a_confirmer']++;
} elseif (preg_match('/^(?:\?| \?|\? | \?)$/', $val)) {# Douteux
// Calcul du nombre de plante 'nc' ayant un statut "Douteux"
$this->nc_nbre_plte_douteux++;
// Stockage par département du nombre de plante 'nc' ayant un statut "Douteux"
$this->aso_totaux_dep[$nd]['nc_plte_douteux']++;
if (preg_match('/(?: \?|\? | \? )/', $val)) {# Douteux
// Ajout de la valeur dans une variable car elle n'est pas tout à fait conforme à "?".
$this->nc_autres_valeur_champ .= '<'.$val.'> '.'(Ligne n°: '.($this->nbre_ligne+2).
' - N° nomenclatural: '.$num_nomenc.' - N° département: '.$nd.')<br />';
}
} elseif (preg_match('/^(?:#| #|# | # )$/', $val)) {# Erreur
# Calcul du nombre de plante 'nc' ayant un statut "Erreur"
$this->nc_nbre_plte_erreur++;
# Stockage par département du nombre de plante 'nc' ayant un statut "Erreur"
$this->aso_totaux_dep[$nd]['nc_plte_erreur']++;
if (preg_match('/(?: #|# | # )/', $val)) {# Erreur avec espace
# Ajout de la valeur dans une variable car elle n'est pas tout à fait conforme à "#".
$nc_autres_valeur_champ .= '<'.$val.'> '.'(Ligne n°: '.($this->nbre_ligne+2).
' - N° nomenclatural: '.$num_nomenc.' - N° département: '.$nd.')<br />';
}
} elseif (preg_match('/^\s*(?:-\|-)\s*$/', $val)) {# Disparu
# Calcul du nombre de plante 'nc' ayant un statut "Disparu"
$this->nc_nbre_plte_disparue++;
# Stockage par département du nombre de plante 'nc' ayant un statut "Disparu"
$this->aso_totaux_dep[$nd]['nc_plte_disparue']++;
if (preg_match('/(?: -\|-|-\|- | -\|- )/', $val)) {# Disparu avec espace
# Ajout de la valeur dans une variable car elle n'est pas tout à fait conforme à "-|-".
$nc_autres_valeur_champ .= '<'.$val.'> '.'(Ligne n°: '.($this->nbre_ligne+2).
' - N° nomenclatural: '.$num_nomenc.' - N° département: '.$nd.')<br />';
}
} elseif (preg_match('/^\s*(?:#\?)\s*$/', $val)) {# Erreur à confirmer
# Calcul du nombre de plante 'nc' ayant un statut "Erreur à confirmer"
$this->nc_nbre_plte_erreur_a_confirmer++;
# Stockage par département du nombre de plante 'nc' ayant un statut "Erreur à confirmer"
$this->aso_totaux_dep[$nd]['nc_plte_erreur_a_confirmer']++;
if (preg_match('/^(?:\s+#\?|#\?\s+|\s+#\?\s+)$/', $val)) {# Erreur à confirmer avec espace
# Ajout de la valeur dans une variable car elle n'est pas tout à fait conforme à "#?".
$nc_autres_valeur_champ .= '<'.$val.'> '.'(Ligne n°: '.($this->nbre_ligne+2).
' - N° nomenclatural: '.$num_nomenc.' - N° département: '.$nd.')<br />';
}
} else {
// Ajout de la valeur dans une variable car elle n'est pas conforme.
$this->nc_autres_valeur_champ .= '<'.$val.'> '.'(Ligne n°: '.($this->nbre_ligne+2).
' - N° nomenclatural: '.$num_nomenc.' - N° département: '.$nd.')<br />';
}
}
// Affichage dans la console du numéro de l'enregistrement analysé.
//echo str_repeat(chr(8), ( strlen( $i ) + 1 ))."\t".$i++;
}
}// fin du foreach
// Affichage dans la console du numéro de l'enregistrement analysé.
echo str_repeat(chr(8), ( strlen( $this->nbre_ligne ) + 1 ))."\t".$this->nbre_ligne++;
}
echo "\n";
}
 
private function initialiserTableaux($dep) {
foreach ($dep as $code_dep) {
if ( preg_match('/^\d{2}$/', $code_dep) ) {
$this->aso_totaux_dep[$code_dep]['plte_presente'] = 0;
$this->aso_totaux_dep[$code_dep]['plte_a_confirmer'] = 0;
$this->aso_totaux_dep[$code_dep]['plte_douteux'] = 0;
$this->aso_totaux_dep[$code_dep]['plte_erreur'] = 0;
$this->aso_totaux_dep[$code_dep]['plte_disparue'] = 0;
$this->aso_totaux_dep[$code_dep]['plte_erreur_a_confirmer'] = 0;
$this->aso_totaux_dep[$code_dep]['autres_valeur_champ'] = 0;
$this->aso_totaux_dep[$code_dep]['nc_plte_presente'] = 0;
$this->aso_totaux_dep[$code_dep]['nc_plte_a_confirmer'] = 0;
$this->aso_totaux_dep[$code_dep]['nc_plte_douteux'] = 0;
$this->aso_totaux_dep[$code_dep]['nc_plte_erreur'] = 0;
$this->aso_totaux_dep[$code_dep]['nc_plte_disparue'] = 0;
$this->aso_totaux_dep[$code_dep]['nc_plte_erreur_a_confirmer'] = 0;
$this->aso_totaux_dep[$code_dep]['nc_autres_valeur_champ'] = 0;
}
}
}
 
private function verifierDonnees() {
// Ouverture du fichier contenant les résultats (sortie)
if (!$handle = fopen($this->fichier_verif, 'w')) {
echo "Impossible d'ouvrir le fichier ($this->fichier_verif)";
exit;
}
 
// Création de la page
$page = '<html>'."\n";
$page .= '<head>'."\n";
$page .= '<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8" />'."\n";
$page .= '<title>RESULTAT DE LA VERIFICATION DU FICHIER TABULE DE LA CHOROLOGIE</title>'."\n";
$page .= '</head>'."\n";
$page .= '<body>'."\n";
$page .= '<h1>RESULTAT DE LA VERIFICATION DU FICHIER TABULE DE LA CHOROLOGIE</h1>'."\n";
$page .= '<hr/>'."\n";
$page .= '<p>'.
'Adresse fichier analysé : '.'<br />'."\n".
'</p>'."\n";
$page .= '<hr/>'."\n";
$page .= '<h2>RESULTATS PROGRAMME DE VERIFICATION</h2>'."\n";
$page .= '<p>'.
'Nom du programme générant ce fichier : '.__FILE__.'<br />'."\n".
'Nombre de lignes analysées : '.$this->nbre_ligne.'<br />'."\n".
'Nbre de départements analysés : '.$this->nbre_dep_analyse.'<br />'."\n".
'Date d\'exécution du programme : '.date('d.m.Y').'<br />'."\n".
'</p>'."\n";
$page .= '<hr/>'."\n";
$page .= '<h2>RESULTATS ANALYSE CHOROLOGIE</h2>'."\n";
$page .= '<p>'.
'Nombre de nom "nc" : '.$this->nc_nbre_nom.'<br />'."\n".
'Nombre de nom : '.$this->nbre_nom.'<br />'."\n".
'Valeurs autres que 1, 1?, ?, #, #? et -|- : '.$this->autres_valeur_champ.'<br />'."\n".
'Valeurs autres que 1, 1?, ?, #, #? et -|- pour les plantes nc : <br />'."\n".$this->nc_autres_valeur_champ.'</br>'."\n".
'</p>'."\n";
$page .= '<hr/>'."\n";
$page .= '<h2>RESULTATS ANALYSE des CHAMPS</h2>'."\n";
$page .= '<p>'.
'Nombre de guillemets antislashés: '.$this->nbre_ligne_avec_guillemet.'<br />'."\n".
'</p>'."\n";
$page .= '<hr/>'."\n";
$page .= '<h2>TABLEAUX</h2>'."\n";
 
// Tableau des numéros nomenclaturaux dupliqués
$table = '<table><thead><tr><th colspan="3">Tableau des numéros nomenclaturaux dupliqués </th></tr>';
$table .= '<tr><th>Numéro nomenclatural</th><th>Nbre d\'itération</th><th>Lignes</th></tr></thead>';
$afficher_tab_num_duplique = 0;
ksort($this->aso_num_nomenc);
$table .= '<tbody style="text-align: center;">';
foreach ($this->aso_num_nomenc as $cle_nomenc => $val ) {
$ligne = '<tr><td>'.$cle_nomenc.'</td><td>'.$val['compteur'].'</td><td>'.$val['ligne'].'</td></tr>';
if ($val['compteur'] > 1) {
$table .= $ligne;
$afficher_tab_num_duplique = 1;
}
}
if ( $afficher_tab_num_duplique == 1 ) {
$page .= $table.'</tbody></table>';
}
 
// Tableau des résultats par départements
$table = '<table><thead><tr><th colspan="14">Tableau des résulats par départements</th></tr>';
$table .= '<tr><th>Département</th><th>Nbre pltes présentes</th><th>Nbre pltes à confirmer</th>'.
'<th>Nbre pltes douteuses</th><th>Nbre pltes disparues</th><th>Nbre pltes erreur</th><th>Nbre pltes erreur à confirmer</th>'.
'<th>Total</th><th>Nbre pltes nc présentes</th><th>Nbre pltes nc à confirmer</th>'.
'<th>Nbre nc pltes douteuses</th><th>Nbre nc pltes disparues</th><th>Nbre nc pltes erreur</th><th>Nbre nc pltes erreur à confirmer</th></tr></thead>';
$table .= '<tbody style="text-align: center;">';
ksort($this->aso_totaux_dep);
foreach ($this->aso_totaux_dep as $cle_dep => $val ) {
$plt_total = $val{'plte_presente'} + $val{'plte_a_confirmer'} + $val{'plte_douteux'} + $val{'plte_disparue'} + $val{'plte_erreur'} + $val{'plte_erreur_a_confirmer'};
$table .= '<tr><td>'.ZgFrDepartements::getNom($cle_dep).' ('.ZgFrDepartements::getIdChaine($cle_dep).') </td>'.
'<td>'.$val{'plte_presente'}.'</td><td>'.$val{'plte_a_confirmer'}.'</td><td>'.$val{'plte_douteux'}.'</td>'.
'<td>'.$val{'plte_disparue'}.'</td><td>'.$val{'plte_erreur'}.'</td><td>'.$val{'plte_erreur_a_confirmer'}.'</td><td>'.$plt_total.'</td>'.
'<td>'.$val{'nc_plte_presente'}.'</td><td>'.$val{'nc_plte_a_confirmer'}.'</td><td>'.$val{'nc_plte_douteux'}.'</td>'.
'<td>'.$val{'nc_plte_disparue'}.'</td><td>'.$val{'nc_plte_erreur'}.'</td><td>'.$val{'nc_plte_erreur_a_confirmer'}.'</td></tr>';
}
 
$table .= '<tr><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td>'.
'<td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td></tr>';
$plt_total = $this->nbre_plte_presente + $this->nbre_plte_a_confirmer + $this->nbre_plte_douteux + $this->nbre_plte_disparue + $this->nbre_plte_erreur + $this->nbre_plte_erreur_a_confirmer;
$table .= '<tr><td>Totaux : '.$this->nbre_dep_analyse.' départements</td><td>'.$this->nbre_plte_presente.'</td>'.
'<td>'.$this->nbre_plte_a_confirmer.'</td><td>'.$this->nbre_plte_douteux.'</td><td>'.$this->nbre_plte_disparue.'</td>'.
'<td>'.$this->nbre_plte_erreur.'</td><td>'.$this->nbre_plte_erreur_a_confirmer.'</td><td>'.$plt_total.'</td>'.
'<td>'.$this->nc_nbre_plte_presente.'</td>'.'<td>'.$this->nc_nbre_plte_a_confirmer.'</td>'.
'<td>'.$this->nc_nbre_plte_douteux.'</td><td>'.$this->nc_nbre_plte_disparue.'</td><td>'.$this->nc_nbre_plte_erreur.'</td><td>'.$this->nc_nbre_plte_erreur_a_confirmer.'</td></tr>';
 
$table .= '<tr><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td>'.
'<td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td></tr>';
$total_nbre_plte = ($this->nbre_plte_presente + $this->nbre_plte_a_confirmer + $this->nbre_plte_douteux + $this->nbre_plte_disparue + $this->nbre_plte_erreur + $this->nbre_plte_erreur_a_confirmer);
$total_nbre_plte_nc = ($this->nc_nbre_plte_presente + $this->nc_nbre_plte_a_confirmer + $this->nc_nbre_plte_douteux + $this->nc_nbre_plte_disparue + $this->nc_nbre_plte_erreur + $this->nc_nbre_plte_erreur_a_confirmer);
$table .= '<tr><td>Totaux plante / plante nc</td><td colspan="7">'.$total_nbre_plte.'</td>'.
'<td colspan="6">'.$total_nbre_plte_nc.'</td></tr>';
 
$table .= '<tr><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td>'.
'<td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td></tr>';
$plt_total = $this->nbre_plte_presente + $this->nc_nbre_plte_presente + $this->nc_nbre_plte_a_confirmer + $this->nbre_plte_a_confirmer;
$table .= '<tr><td>Total plantes présentes et à confirmer</td><td colspan="13">'.$plt_total.'</td></tr>';
 
$table .= '<tr><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td>'.
'<td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td></tr>';
$plt_total = $this->nbre_plte_presente + $this->nc_nbre_plte_presente;
$table .= '<tr><td>Total plantes présentes</td><td colspan="13">'.$plt_total.'</td></tr>';
 
$table .= '<tr><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td>'.
'<td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td></tr>';
$plt_total = $total_nbre_plte + $total_nbre_plte_nc;
$table .= '<tr><td>Total données chorologiques</td><td colspan="13">'.$plt_total.'</td></tr>';
 
$table .= '</tbody></table>';
$page .= $table;
 
$page .= '<hr/>'."\n";
$page .= '<h2>NOTES</h2>'."\n";
$page .= '<p>'.
'1.- Chaque champ précédé par "ATTENTION" doit être vide.'."\n".
'S\'il ne l\'est pas, il y a une erreur'."\n".
'</p>'."\n";
$page .= '</body>'."\n";
$page .= '</html>'."\n";
// Fermeture de la poignée sur le fichier de sortie
if (fwrite($handle, $page) === FALSE) {
echo "Impossible d'écrire dans le fichier ($this->fichier_verif)";
exit;
}
echo 'Ecriture du fichier de vérification de la chorologie réalisée!'."\n";
fclose($handle);
}
 
private function supprimerTous() {
$tablesChorodep = implode(',', $this->getNomsTablesChorodep());
$tableContributeurs = Config::get('tables.chorodepContributeurs');
$tableSources = Config::get('tables.chorodepSources');
$tableOntologies = Config::get('tables.chorodepOntologies');
$requete = "DROP TABLE IF EXISTS chorodep_meta, $tablesChorodep, $tableContributeurs, $tableSources, $tableOntologies ";
$this->getBdd()->requeter($requete);
}
 
private function getNomsTablesChorodep() {
$versions = explode(',', Config::get('versions'));
$tableTpl = Config::get('tables.chorodepTpl');
$tablesChorodep = array();
foreach ($versions as $version) {
$tablesChorodep[] = sprintf($tableTpl, $version);
}
return $tablesChorodep;
}
 
private function getNomTableDerniereVersion() {
$version = $this->getDerniereVersion();
$table = sprintf(Config::get('tables.chorodepTpl'), $version);
return $table;
}
 
private function getDerniereVersion() {
$version = array_pop(explode(',', Config::get('versions')));
return $version;
}
 
// ----------
// intégration des noms vernaculaires et statuts de protection (NVSP) dans
// une table dédiée, pour permettre le service intégratif de l'applciation "chorologie"
// (basé sur les scripts de "gentiana-services")
// ----------
 
/**
* Dézingue tout le bousin
* @TODO chaque méthode devrait s'autonettoyer au début afin d'être répétable
* sans avoir à tout reprendre depuis le début (principe du dump)
*/
protected function nettoyageNVSP() {
echo "---- suppression des tables\n";
$tableStatutsProtection = Config::get('tables.statuts_protection');
$tableNomsVernaculaires = Config::get('tables.noms_vernaculaires');
$req = "DROP TABLE IF EXISTS `" . $tableStatutsProtection . "`";
$this->getBdd()->requeter($req);
$req = "DROP TABLE IF EXISTS `" . $tableNomsVernaculaires . "`;";
$this->getBdd()->requeter($req);
}
 
/**
* Crée les tables vides
*/
protected function chargerStructureNVSP() {
echo "---- création des tables\n";
$contenuSql = $this->recupererContenu(Config::get('chemins.structureNVSP'));
$this->executerScripSql($contenuSql);
}
 
/**
* Va chercher les noms vernaculaires pour chaque espèce, et les rajoute
* dans la table dédiée
*/
protected function rabouterNomsVernaculaires() {
$tableNomsVernaculaires = Config::get('tables.noms_vernaculaires');
restore_error_handler();
restore_exception_handler();
ini_set("display_errors", true);
error_reporting(E_ALL);
$squeletteUrlNvjfl = Config::get("url_nvjfl");
echo "---- récupération des noms vernaculaires depuis eFlore\n";
$depart = 0;
$nbInsertions = 0;
$yenaencore = true;
$tailleTranche = 1000;
while ($yenaencore) {
$url = sprintf($squeletteUrlNvjfl, $depart, $tailleTranche);
$noms = $this->chargerDonnees($url);
// Si quelqu'un parvient à dédoublonner les $valeurs, on enlève le IGNORE
$req = "INSERT IGNORE INTO " . $tableNomsVernaculaires . " VALUES ";
$valeurs = array();
// insertion des données
foreach ($noms['resultat'] as $res) {
$numTaxons = explode(',', $res['num_taxon']);
$nvP = $this->getBdd()->proteger($res['nom']);
foreach ($numTaxons as $numTaxon) {
$valeurs[] = "(" . $numTaxon . ", " . $nvP . ")";
}
}
$req .= implode(",", $valeurs);
$this->getBdd()->executer($req);
// prochain tour
$nbInsertions += count($valeurs); // Faux car INSERT IGNORE - dédoublonner ou compter les insertions réelles
$depart += $tailleTranche;
$total = $noms['entete']['total'];
$yenaencore = $depart <= $total;
echo "insérés: " . min($depart, $total) . " noms, " . $nbInsertions . " attributions\n";
}
}
 
/**
* Va chercher les statuts de protection pour chaque espèce et les rajoute
* à la table; importe un fichier dump SQL des lois
*/
protected function rabouterStatutsProtection() {
$tableChorologie = $this->getNomTableDerniereVersion();
$tableStatutsProtection = Config::get('tables.statuts_protection');
echo "---- récupération des statuts de protection depuis eFlore\n";
$req = "SELECT distinct num_nom FROM " . $tableChorologie;
$resultat = $this->getBdd()->recupererTous($req);
// pour chaque taxon mentionné (inefficace mais évite d'implémenter un
// mode liste sur le service eflore/sptb
$squeletteUrlSptb = Config::get("url_sptb");
foreach ($resultat as $res) {
$nn = $res['num_nom'];
//echo "NN: $nn\n";
if ($nn != 0) {
$url = sprintf($squeletteUrlSptb, $nn);
//echo "URL: $url\n";
$statuts = $this->chargerDonnees($url);
//echo "STATUTS: " . print_r($statuts, true) . "\n";
if (count($statuts) > 0) {
$json = array();
foreach ($statuts as $statut) {
$nouveauStatut = array();
$nouveauStatut['zone'] = $statut['code_zone_application'];
$nouveauStatut['lien'] = $statut['hyperlien_legifrance'];
$json[] = $nouveauStatut;
}
// Si au moins un statut
if (count($json) > 0) {
$json = json_encode($json);
//echo "JSON: " . print_r($json, true) . "\n";
// Insertion d'un bout de JSON
$jsonP = $this->getBdd()->proteger($json);
$nnP = $this->getBdd()->proteger($nn);
$reqIns = "INSERT INTO " . $tableStatutsProtection
. " values($nnP, $jsonP)";
//echo "ReqIns: $reqIns\n";
$this->getBdd()->executer($reqIns);
}
}
}
}
}
}
 
class ZgFrDepartements {
static private $departements =
array(
"01" => array("Ain", "01", 1),
"02" => array("Aisne", "02", 2),
"03" => array("Allier", "03", 3),
"04" => array("Alpes-de-Haute-Provence", "04", 4),
"05" => array("Hautes-Alpes", "05", 5),
"06" => array("Alpes-Maritimes", "06", 6),
"07" => array("Ardèche", "07", 7),
"08" => array("Ardennes", "08", 8),
"09" => array("Ariège", "09", 9),
"10" => array("Aube", "10", 10),
"11" => array("Aude", "11", 11),
"12" => array("Aveyron", "12", 12),
"13" => array("Bouches-du-Rhône", "13", 13),
"14" => array("Calvados", "14", 14),
"15" => array("Cantal", "15", 15),
"16" => array("Charente", "16", 16),
"17" => array("Charente-Maritime", "17", 17),
"18" => array("Cher", "18", 18),
"19" => array("Corrèze", "19", 19),
"20" => array("Corse", "20", 20),
"2A" => array("Haute-Corse", "2A", 20),
"2B" => array("Corse-du-Sud", "2B", 20),
"21" => array("Côte-d'Or", "21", 21),
"22" => array("Côtes-d'Armor", "22", 22),
"23" => array("Creuse", "23", 23),
"24" => array("Dordogne", "24", 24),
"25" => array("Doubs","25", 25),
"26" => array("Drôme", "26", 26),
"27" => array("Eure", "27", 27),
"28" => array("Eure-et-Loir", "28", 28),
"29" => array("Finistère", "29", 29),
"30" => array("Gard", "30", 30),
"31" => array("Haute-Garonne", "31", 31),
"32" => array("Gers", "32", 32),
"33" => array("Gironde", "33", 33),
"34" => array("Hérault", "34", 34),
"35" => array("Ille-et-Vilaine", "35", 35),
"36" => array("Indre", "36", 36),
"37" => array("Indre-et-Loire", "37", 37),
"38" => array("Isère", "38", 38),
"39" => array("Jura", "39", 39),
"40" => array("Landes", "40", 40),
"41" => array("Loir-et-Cher", "41", 41),
"42" => array("Loire", "42", 42),
"43" => array("Haute-Loire", "43", 43),
"44" => array("Loire-Atlantique", "44", 44),
"45" => array("Loiret", "45", 45),
"46" => array("Lot", "46", 46),
"47" => array("Lot-et-Garonne", "47", 47),
"48" => array("Lozére ", "48", 48),
"49" => array("Maine-et-Loire", "49", 49),
"50" => array("Manche", "50", 50),
"51" => array("Marne", "51", 51),
"52" => array("Haute-Marne", "52", 52),
"53" => array("Mayenne", "53", 53),
"54" => array("Meurthe-et-Moselle", "54", 54),
"55" => array("Meuse", "55", 55),
"56" => array("Morbihan", "56", 56),
"57" => array("Moselle", "57", 57),
"58" => array("Nièvre", "58", 58),
"59" => array("Nord", "59", 59),
"60" => array("Oise", "60", 60),
"61" => array("Orne", "61", 61),
"62" => array("Pas-de-Calais", "62", 62),
"63" => array("Puy-de-Dôme", "63", 63),
"64" => array("Pyrénées-Atlantiques", "64", 64),
"65" => array("Hautes-Pyrénées", "65", 65),
"66" => array("Pyrénées-Orientales", "66", 66),
"67" => array("Bas-Rhin", "67", 67),
"68" => array("Haut-Rhin", "68", 68),
"69" => array("Rhône", "69", 69),
"70" => array("Haute-Saône", "70", 70),
"71" => array("Saône-et-Loire", "71", 71),
"72" => array("Sarthe", "72", 72),
"73" => array("Savoie", "73", 73),
"74" => array("Haute-Savoie", "74", 74),
"75" => array("Paris", "75", 75),
"76" => array("Seine-Maritime", "76", 76),
"77" => array("Seine-et-Marne", "77", 77),
"78" => array("Yvelines", "78", 78),
"79" => array("Deux-Sèvres", "79", 79),
"80" => array("Somme", "80", 80),
"81" => array("Tarn", "81", 81),
"82" => array("Tarn-et-Garonne", "82", 82),
"83" => array("Var", "83", 83),
"84" => array("Vaucluse", "84", 84),
"85" => array("Vendée", "85", 85),
"86" => array("Vienne", "86", 86),
"87" => array("Haute-Vienne", "87", 87),
"88" => array("Vosges", "88", 88),
"89" => array("Yonne", "89", 89),
"90" => array("Territoire-de-Belfort", "90", 90),
"91" => array("Essonne", "91", 91),
"92" => array("Hauts-de-Seine", "92", 92),
"93" => array("Seine-Saint-Denis", "93", 93),
"94" => array("Val-de-Marne", "94", 94),
"95" => array("Val-d'Oise", "95", 95),
"96" => array("aaa", "96", 96),
"971" => array("Guadeloupe", "971", 971),
"972" => array("Martinique", "972", 972),
"973" => array("Guyane", "973", 973),
"974" => array("Réunion", "974", 974),
"99" => array("Etranger", "99", 99),
);
 
static public function get() {
return self::$departements;
}
 
static public function getNom($n) {
return self::$departements[$n][0];
}
 
static public function getIdChaine($n) {
return self::$departements[$n][1];
}
 
static public function getIdNumerique($n) {
return (int)self::$departements[$n][2];
}
 
static public function getIdEflore($n) {
return (int)self::$departements[$n][3];
}
}
?>
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/chorodep/chorodep.ini
New file
0,0 → 1,54
; Ajouter les nouvelles version à la suite dans versions et versionsDonnees.
versions = "2011_04,2012_01,2013_07,2013_08,2013_11"
versionsDonnees="2011-04-05,2012-01-01,2013-07-22,2013-08-05,2013-11-13,2014-08-15"
dossierTsv = "{ref:dossierDonneesEflore}chorodep/{ref:versionDonnees}/"
dossierTsvTpl = "{ref:dossierDonneesEflore}chorodep/%s/"
dossierSql = "{ref:dossierDonneesEflore}chorodep/"
chorodepChamps2011_04 = "rang, catminat, num_tax, num_nom, nom_sci, `01`, `02`, `03`, `04`, `06`, `07`, `08`, `09`, `10`, `11`, `12`, `67`, `13`, `14`, `15`, `16`, `17`, `18`, `19`, `20`, `21`, `22`, `23`, `79`, `24`, `25`, `26`, `91`, `27`, `28`, `29`, `30`, `32`, `33`, `31`, `43`, `52`, `05`, `70`, `74`, `65`, `87`, `68`, `92`, `34`, `35`, `36`, `37`, `38`, `39`, `40`, `42`, `44`, `45`, `41`, `46`, `47`, `48`, `49`, `50`, `51`, `53`, `54`, `55`, `56`, `57`, `58`, `59`, `60`, `61`, `75`, `62`, `63`, `66`, `64`, `69`, `71`, `72`, `73`, `77`, `76`, `93`, `80`, `81`, `82`, `90`, `94`, `95`, `83`, `84`, `85`, `86`, `88`, `89`, `78`, freq_abs, freq_rel, rare_nat";
chorodepChamps2012_01 = "rang, catminat, num_tax, num_nom, nom_sci, `01`, `02`, `03`, `04`, `06`, `07`, `08`, `09`, `10`, `11`, `12`, `67`, `13`, `14`, `15`, `16`, `17`, `18`, `19`, `20`, `21`, `22`, `23`, `79`, `24`, `25`, `26`, `91`, `27`, `28`, `29`, `30`, `32`, `33`, `31`, `43`, `52`, `05`, `70`, `74`, `65`, `87`, `68`, `92`, `34`, `35`, `36`, `37`, `38`, `39`, `40`, `42`, `44`, `45`, `41`, `46`, `47`, `48`, `49`, `50`, `51`, `53`, `54`, `55`, `56`, `57`, `58`, `59`, `60`, `61`, `75`, `62`, `63`, `66`, `64`, `69`, `71`, `72`, `73`, `77`, `76`, `93`, `80`, `81`, `82`, `90`, `94`, `95`, `83`, `84`, `85`, `86`, `88`, `89`, `78`, freq_abs, freq_rel, rare_nat";
chorodepChamps2013_07 = "rang, catminat,syntaxons, num_tax, num_nom, nom_sci, `01`, `02`, `03`, `04`, `06`, `07`, `08`, `09`, `10`, `11`, `12`, `67`, `13`, `14`, `15`, `16`, `17`, `18`, `19`, `20`, `21`, `22`, `23`, `79`, `24`, `25`, `26`, `91`, `27`, `28`, `29`, `30`, `32`, `33`, `31`, `43`, `52`, `05`, `70`, `74`, `65`, `87`, `68`, `92`, `34`, `35`, `36`, `37`, `38`, `39`, `40`, `42`, `44`, `45`, `41`, `46`, `47`, `48`, `49`, `50`, `51`, `53`, `54`, `55`, `56`, `57`, `58`, `59`, `60`, `61`, `75`, `62`, `63`, `66`, `64`, `69`, `71`, `72`, `73`, `77`, `76`, `93`, `80`, `81`, `82`, `90`, `94`, `95`, `83`, `84`, `85`, `86`, `88`, `89`, `78`, freq_abs, freq_rel, rare_nat";
chorodepChamps2013_08 = "rang, catminat,indication_phytosocio_caracteristique, num_tax, num_nom, nom_sci, chorologie, `01`, `02`, `03`, `04`, `06`, `07`, `08`, `09`, `10`, `11`, `12`, `67`, `13`, `14`, `15`, `16`, `17`, `18`, `19`, `20`, `21`, `22`, `23`, `79`, `24`, `25`, `26`, `91`, `27`, `28`, `29`, `30`, `32`, `33`, `31`, `43`, `52`, `05`, `70`, `74`, `65`, `87`, `68`, `92`, `34`, `35`, `36`, `37`, `38`, `39`, `40`, `42`, `44`, `45`, `41`, `46`, `47`, `48`, `49`, `50`, `51`, `53`, `54`, `55`, `56`, `57`, `58`, `59`, `60`, `61`, `75`, `62`, `63`, `66`, `64`, `69`, `71`, `72`, `73`, `77`, `76`, `93`, `80`, `81`, `82`, `90`, `94`, `95`, `83`, `84`, `85`, `86`, `88`, `89`, `78`, freq_abs, freq_rel, rare_nat";
chorodepChamps2013_11 = "rang, catminat,indication_phytosocio_caracteristique, num_tax, num_nom, nom_sci, chorologie, `01`, `02`, `03`, `04`, `06`, `07`, `08`, `09`, `10`, `11`, `12`, `67`, `13`, `14`, `15`, `16`, `17`, `18`, `19`, `20`, `21`, `22`, `23`, `79`, `24`, `25`, `26`, `91`, `27`, `28`, `29`, `30`, `32`, `33`, `31`, `43`, `52`, `05`, `70`, `74`, `65`, `87`, `68`, `92`, `34`, `35`, `36`, `37`, `38`, `39`, `40`, `42`, `44`, `45`, `41`, `46`, `47`, `48`, `49`, `50`, `51`, `53`, `54`, `55`, `56`, `57`, `58`, `59`, `60`, `61`, `75`, `62`, `63`, `66`, `64`, `69`, `71`, `72`, `73`, `77`, `76`, `93`, `80`, `81`, `82`, `90`, `94`, `95`, `83`, `84`, `85`, `86`, `88`, `89`, `78`, freq_abs, freq_rel, rare_nat";
chorodepChamps2014_08 = "rang, catminat,indication_phytosocio_caracteristique, num_tax, num_nom, nom_sci, chorologie, `01`, `02`, `03`, `04`, `06`, `07`, `08`, `09`, `10`, `11`, `12`, `67`, `13`, `14`, `15`, `16`, `17`, `18`, `19`, `20`, `21`, `22`, `23`, `79`, `24`, `25`, `26`, `91`, `27`, `28`, `29`, `30`, `32`, `33`, `31`, `43`, `52`, `05`, `70`, `74`, `65`, `87`, `68`, `92`, `34`, `35`, `36`, `37`, `38`, `39`, `40`, `42`, `44`, `45`, `41`, `46`, `47`, `48`, `49`, `50`, `51`, `53`, `54`, `55`, `56`, `57`, `58`, `59`, `60`, `61`, `75`, `62`, `63`, `66`, `64`, `69`, `71`, `72`, `73`, `77`, `76`, `93`, `80`, `81`, `82`, `90`, `94`, `95`, `83`, `84`, `85`, `86`, `88`, `89`, `78`, freq_abs, freq_rel, rare_nat";
 
 
[tables]
chorodepMeta = "chorodep_meta"
chorodepContributeurs = "chorodep_contributeurs"
chorodepSources = "chorodep_sources"
chorodepOntologies = "chorodep_ontologies"
chorodep = "chorodep_v{ref:version}"
chorodepTpl = "chorodep_v%s"
; Noms vernaculaires et status de protection :
statuts_protection = "chorologie_sp"
noms_vernaculaires = "chorologie_nv"
 
[fichiers]
structureSql = "chorodep.sql"
structureSqlVersion = "chorodep_v{ref:versionDonnees}.sql"
structureSqlVersionTpl = "chorodep_v%s.sql"
chorodepContributeurs = "chorodep_contributeurs.tsv"
chorodepSources = "chorodep_sources.tsv"
chorodepOntologies = "chorodep_ontologies.tsv"
chorodep = "chorodep_v{ref:versionDonnees}.tsv"
chorodepTpl = "chorodep_v%s.tsv"
; Noms vernaculaires et status de protection :
structureNVSP = "nvsp.sql"
 
[chemins]
structureSql = "{ref:dossierSql}{ref:fichiers.structureSql}"
structureSqlVersion = "{ref:dossierTsv}{ref:fichiers.structureSqlVersion}"
structureSqlVersionTpl = "{ref:dossierTsvTpl}{ref:fichiers.structureSqlVersionTpl}"
chorodepContributeurs = "{ref:dossierSql}{ref:fichiers.chorodepContributeurs}"
chorodepSources = "{ref:dossierSql}{ref:fichiers.chorodepSources}"
chorodepOntologies = "{ref:dossierSql}{ref:fichiers.chorodepOntologies}"
chorodep = "{ref:dossierTsv}{ref:fichiers.chorodep}"
chorodepTpl = "{ref:dossierTsvTpl}{ref:fichiers.chorodepTpl}"
; Noms vernaculaires et status de protection :
structureNVSP = "{ref:dossierSql}{ref:fichiers.structureNVSP}"
 
[services]
;base_url_service_eflore = "http://api.tela-botanica.org/service:eflore:0.1/";
base_url_service_eflore = "http://localhost/service:eflore:0.1/";
url_nvjfl = "{ref:base_url_service_eflore}nvjfl/noms-vernaculaires?masque.lg=fra&retour.champs=num_taxon&retour.tri=num_taxon&navigation.depart=%s&navigation.limite=%s"
url_sptb = "{ref:base_url_service_eflore}sptb/statuts?masque.nn=%s"
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/lbf/Lbf.php
New file
0,0 → 1,337
<?php
//declare(encoding='UTF-8');
/**
* Exemple de lancement du script : :
* /opt/lampp/bin/php cli.php lbf -a chargerTous
*
* @category php 5.2
* @package eFlore/Scripts
* @author Delphine Cauquil <delphine@tela-botanica.org>
* @author Aurélien PERONNET <aurelien@tela-botanica.org>
* @copyright Copyright (c) 2014, Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
* @license http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-fr.txt Licence CECILL
* @license http://www.gnu.org/licenses/gpl.html Licence GNU-GPL
* @version $Id$
*/
class Lbf extends EfloreScript {
 
private $table = null;
private $pasInsertion = 1000;
private $departInsertion = 0;
 
protected $parametres_autorises = array(
'-t' => array(false, false, 'Permet de tester le script sur un jeu réduit de données (indiquer le nombre de lignes).'));
 
public function executer() {
try {
$this->initialiserProjet('lbf');
 
// Lancement de l'action demandée
$cmd = $this->getParametre('a');
switch ($cmd) {
case 'chargerTous' :
$this->chargerStructureSql();
$this->chargerlbf();
$this->genererChpNomSciHtml();
$this->genererChpFamille();
//$this->genererChpHierarchie();
break;
case 'chargerStructureSql' :
$this->chargerStructureSql();
break;
case 'chargerlbf' :
$this->chargerlbf();
break;
case 'genererNomSciHtml' :
$this->genererChpNomSciHtml();
break;
case 'genererChpFamille' :
$this->genererChpFamille();
break;
case 'supprimerTous' :
$this->supprimerTous();
break;
default :
throw new Exception("Erreur : la commande '$cmd' n'existe pas!");
}
} catch (Exception $e) {
$this->traiterErreur($e->getMessage());
}
}
 
private function chargerlbf() {
$chemin = Config::get('chemins.lbf');
$table = Config::get('tables.lbf');
$requete = "LOAD DATA INFILE '$chemin' ".
"REPLACE INTO TABLE $table ".
'CHARACTER SET utf8 '.
'FIELDS '.
" TERMINATED BY '\t' ".
" ENCLOSED BY '' ".
" ESCAPED BY '\\\' ".
'IGNORE 1 LINES';
$this->getBdd()->requeter($requete);
}
 
private function genererChpNomSciHtml() {
$this->initialiserGenerationChamps();
$this->preparerTablePrChpNomSciHtml();
$generateur = new GenerateurNomSciHtml();
$nbreTotal = $this->recupererNbTotalTuples();
$erreurs = array();
$this->departInsertion = 0;
while ($this->departInsertion < $nbreTotal) {
$resultat = $this->recupererTuplesPrChpNomSciHtml();
 
try {
$nomsSciEnHtml = $generateur->generer($resultat);
} catch (Exception $e) {
$erreurs[] = $e->getMessage();
}
 
$this->remplirChpNomSciHtm($nomsSciEnHtml);
$this->departInsertion += $this->pasInsertion;
$this->afficherAvancement("Insertion des noms scientifique au format HTML dans la base par paquet de {$this->pasInsertion} en cours");
if ($this->stopperLaBoucle($this->getParametre('t'))) break;
}
echo "\n";
 
$this->creerFichierLog('Erreurs lors de la génération HTML des noms scientifiques', $erreurs, 'erreurs_noms_sci_html');
}
 
private function initialiserGenerationChamps() {
$this->table = Config::get('tables.lbf');
}
 
private function preparerTablePrChpNomSciHtml() {
$requete = "SHOW COLUMNS FROM {$this->table} LIKE 'nom_sci_html' ";
$resultat = $this->getBdd()->recuperer($requete);
if ($resultat === false) {
$requete = "ALTER TABLE {$this->table} ".
'ADD nom_sci_html VARCHAR( 500 ) '.
'CHARACTER SET utf8 COLLATE utf8_general_ci NULL DEFAULT NULL ';
$this->getBdd()->requeter($requete);
}
}
 
private function recupererNbTotalTuples(){
$requete = "SELECT count(*) AS nb FROM {$this->table} ";
$resultat = $this->getBdd()->recuperer($requete);
return $resultat['nb'];
}
 
private function recupererTuplesPrChpNomSciHtml() {
$requete = 'SELECT num_nom, rang, nom_sci, nom_supra_generique, genre, epithete_infra_generique, '.
' epithete_sp, type_epithete, epithete_infra_sp,cultivar_groupe, '.
' nom_commercial, cultivar '.
"FROM {$this->table} ".
"LIMIT {$this->departInsertion},{$this->pasInsertion} ";
$resultat = $this->getBdd()->recupererTous($requete);
return $resultat;
}
 
private function remplirChpNomSciHtm($nomsSciHtm) {
foreach ($nomsSciHtm as $id => $html) {
$html = $this->getBdd()->proteger($html);
$requete = "UPDATE {$this->table} SET nom_sci_html = $html WHERE num_nom = $id ";
$resultat = $this->getBdd()->requeter($requete);
if ($resultat === false) {
throw new Exception("Erreur d'insertion pour le tuple $id");
}
}
}
 
private function traiterResultatsFamille(&$resultats, &$noms, &$introuvables, &$introuvablesSyno) {
foreach ($resultats as $id => $nom) {
$nn = $nom['num_nom'];
$nnr = $nom['num_nom_retenu'];
$nts = $nom['num_tax_sup'];
$rg = $nom['rang'];
if ($nnr != '') {
if ($rg == '180') {
$noms[$nn] = $nom['nom_sci'];
} else {
if ($nn == $nnr) {// nom retenu
if (isset($noms[$nts])) {
// signifie que recupererTuplesPrChpFamille() devrait
// récupérer ce record *avant*
$noms[$nn] = $noms[$nts];
} else {
$introuvables[] = $nn;
}
} else {// nom synonyme
if (isset($noms[$nnr])) {
// signifie que recupererTuplesPrChpFamille() devrait
// récupérer ce record *avant*
$noms[$nn] = $noms[$nnr];
} else {
$introuvablesSyno[] = $nom;
}
}
}
}
unset($resultats[$id]);
$this->afficherAvancement("Attribution de leur famille aux noms en cours");
if ($this->stopperLaBoucle($this->getParametre('t'))) break;
}
}
 
private function genererChpFamille() {
$this->initialiserGenerationChamps();
$this->preparerTablePrChpFamille();
$resultats = $this->recupererTuplesPrChpFamille();
$noms = array();
$introuvables = array();
$introuvablesSyno = array();
$i = 1;
 
while(true) {
printf("passe n°%d:\n", $i);
$this->traiterResultatsFamille($resultats, $noms, $introuvables, $introuvablesSyno);
echo "\n\n";
// printf("noms: %d, introuvables: %d, introuvablesSyno: %d\n", count($noms), count($introuvables), count($introuvablesSyno));
// XXX, au 22/07/2013, 3 passes sont suffisantes
// TODO: MySQL procédure stockée !
if($i++ == 3) break;
$resultats = array_merge($resultats, $introuvables, $introuvablesSyno);
$introuvables = $introuvablesSyno = array();
}
 
foreach ($introuvablesSyno as $id => $nom) {
$nn = $nom['num_nom'];
$nnr = $nom['num_nom_retenu'];
if (isset($noms[$nnr])) {
$noms[$nn] = $noms[$nnr];
} else {
$introuvables[] = $nn;
}
unset($introuvablesSyno[$id]);
$this->afficherAvancement("Attribution de leur famille aux synonymes en cours");
}
echo "\n";
 
$msg = 'Plusieurs familles sont introuvables';
$this->creerFichierLog($msg, $introuvables, 'famille_introuvable');
 
$this->remplirChpFamille($noms);
}
private function preparerTablePrChpFamille() {
$requete = "SHOW COLUMNS FROM {$this->table} LIKE 'famille' ";
$resultat = $this->getBdd()->recuperer($requete);
if ($resultat === false) {
$requete = "ALTER TABLE {$this->table} ".
'ADD famille VARCHAR(255) '.
'CHARACTER SET utf8 COLLATE utf8_general_ci NULL DEFAULT NULL ';
$this->getBdd()->requeter($requete);
}
}
 
private function recupererTuplesPrChpFamille() {
$requete = 'SELECT num_nom, num_nom_retenu, num_tax_sup, rang, nom_sci '.
"FROM {$this->table} ".
"WHERE rang >= 180 ".
"ORDER BY rang ASC, num_tax_sup ASC, num_nom_retenu DESC ";
$resultat = $this->getBdd()->recupererTous($requete);
return $resultat;
}
 
private function remplirChpFamille($noms) {
foreach ($noms as $id => $famille) {
$famille = $this->getBdd()->proteger($famille);
$requete = "UPDATE {$this->table} SET famille = $famille WHERE num_nom = $id ";
$resultat = $this->getBdd()->requeter($requete);
if ($resultat === false) {
throw new Exception("Erreur d'insertion pour le tuple $id");
}
$this->afficherAvancement("Insertion des noms de famille dans la base en cours");
}
echo "\n";
}
private function genererChpHierarchie() {
$this->initialiserGenerationChamps();
$this->preparerTablePrChpHierarchie();
$table = Config::get('tables.lbf');
$requete = "UPDATE $table SET hierarchie = NULL ";
$mise_a_jour = $this->getBdd()->requeter($requete);
$requete_hierarchie = "SELECT num_nom, num_nom_retenu, num_tax_sup FROM ".$table." ORDER BY rang DESC";
$resultat = $this->getBdd()->recupererTous($requete_hierarchie);
$num_nom_a_num_sup = array();
foreach($resultat as &$taxon) {
$num_nom_a_num_sup[$taxon['num_nom']] = $taxon['num_tax_sup'];
}
$chemin_taxo = "";
foreach($resultat as &$taxon) {
$chemin_taxo = $this->traiterHierarchieNumTaxSup($taxon['num_nom_retenu'], $num_nom_a_num_sup).'-';
$requete = "UPDATE $table SET hierarchie = ".$this->getBdd()->proteger($chemin_taxo)." WHERE num_nom = ".$taxon['num_nom']." ";
$mise_a_jour = $this->getBdd()->requeter($requete);
$this->afficherAvancement("Insertion de la hierarchie taxonomique en cours");
}
echo "\n";
}
private function traiterHierarchieNumTaxSup($num_nom_retenu, &$num_nom_a_num_sup) {
$chaine_hierarchie = "";
if(isset($num_nom_a_num_sup[$num_nom_retenu])) {
$num_tax_sup = $num_nom_a_num_sup[$num_nom_retenu];
$chaine_hierarchie = '-'.$num_tax_sup;
if($num_tax_sup != 0 && $num_tax_sup != '') {
$chaine_hierarchie = $this->traiterHierarchieNumTaxSup($num_tax_sup, $num_nom_a_num_sup).$chaine_hierarchie;
}
}
return $chaine_hierarchie;
}
private function preparerTablePrChpHierarchie() {
$requete = "SHOW COLUMNS FROM {$this->table} LIKE 'hierarchie' ";
$resultat = $this->getBdd()->recuperer($requete);
if ($resultat === false) {
$requete = "ALTER TABLE {$this->table} ".
'ADD hierarchie VARCHAR(1000) '.
'CHARACTER SET utf8 COLLATE utf8_general_ci NULL DEFAULT NULL ';
$this->getBdd()->requeter($requete);
}
}
 
private function genererDonneesTestMultiVersion() {
$contenuSql = $this->recupererContenu(Config::get('chemins.structureSqlTest'));
$this->executerScripSql($contenuSql);
 
$table = Config::get('tables.lbf');
$tableTest = Config::get('tables.lbfTest');
$requete = "INSERT INTO $tableTest SELECT * FROM $table";
$this->getBdd()->requeter($requete);
}
 
private function supprimerDonneesTestMultiVersion() {
$tableMeta = Config::get('tables.lbfMeta');
$requete = "DELETE FROM $tableMeta WHERE guid = 'urn:lsid:tela-botanica.org:lbf:1.02'";
$this->getBdd()->requeter($requete);
 
$tableTest = Config::get('tables.lbfTest');
$requete = "DROP TABLE IF EXISTS $tableTest";
$this->getBdd()->requeter($requete);
}
 
private function supprimerTous() {
$requete = "DROP TABLE IF EXISTS lbf_meta, lbf_v1_00";
$this->getBdd()->requeter($requete);
}
 
private function creerFichierLog($message, $lignes, $nomFichier) {
$lignesNbre = count($lignes);
if ($lignesNbre != 0) {
echo "$message. Voir le log de $lignesNbre lignes :\n";
 
$logContenu = implode(", \n", $lignes);
$logFichier = realpath(dirname(__FILE__))."/log/$nomFichier.log";
echo $logFichier."\n";
file_put_contents($logFichier, $logContenu);
}
}
}
?>
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/lbf/lbf.ini
New file
0,0 → 1,15
version="1_00"
dossierTsv = "{ref:dossierDonneesEflore}lbf/1.00/"
dossierSql = "{ref:dossierTsv}"
 
[tables]
lbfMeta = "lbf_meta"
lbf = "lbf_v{ref:version}"
 
[fichiers]
structureSql = "lbf_v{ref:version}.sql"
lbf = "lbf_v{ref:version}_ref.txt"
 
[chemins]
structureSql = "{ref:dossierSql}{ref:fichiers.structureSql}"
lbf = "{ref:dossierTsv}{ref:fichiers.lbf}"
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/apd/apd.ini
New file
0,0 → 1,18
version="3_4_0"
dossierapd = "{ref:dossierDonneesEflore}apd/{ref:version}/"
 
[tables]
apdMeta = "apd_meta"
apd = "apd_v{ref:version}"
 
[fichiers]
structureSql = "apd_v{ref:version}.sql"
csvCjbg = "apd_v{ref:version}.csv"
csvRtax = "apd_v{ref:version}_rtax.csv"
csvRtaxModifie = "apd_v{ref:version}_rtax_modifie.csv"
 
[chemins]
structureSql = "{ref:dossierapd}{ref:fichiers.structureSql}"
csvCjbg = "{ref:dossierapd}{ref:fichiers.csvCjbg}"
csvRtax = "{ref:dossierapd}{ref:fichiers.csvRtax}"
csvRtaxModifie = "{ref:dossierapd}{ref:fichiers.csvRtaxModifie}"
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/apd/Apd.php
New file
0,0 → 1,719
<?php
//declare(encoding='UTF-8');
/**
* Exemple de lancement du script : :
* /opt/lampp/bin/php cli.php apd -a chargerTous
*
* Base de données des Trachéophytes (trachéo...quoi ?? C'est le truc avec le stylo Bic ?)
* d'Afrique de l'Ouest (et Centrale mais faut pas le dire)
*
* @category php 5.2
* @package eFlore/Scripts
* @author Mathias CHOUET <mathias@tela-botanica.org>
* @copyright Copyright (c) 2014, Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
* @license http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-fr.txt Licence CECILL
* @license http://www.gnu.org/licenses/gpl.html Licence GNU-GPL
*/
class Apd extends EfloreScript {
 
private $table = null;
private $tableMeta = null;
private $pasInsertion = 1000;
private $departInsertion = 0;
 
protected $parametres_autorises = array();
 
// Entêtes du nouveau fichier Rtax à produire
protected $entetesRtax = array("num_nom","num_nom_retenu","num_tax_sup","rang","nom_sci",
"nom_supra_generique","genre","epithete_infra_generique","epithete_sp",
"type_epithete","epithete_infra_sp","cultivar_groupe","cultivar","nom_commercial",
"auteur","annee","biblio_origine","notes","nom_addendum","homonyme","num_type",
"num_basionyme","synonyme_proparte","synonyme_douteux","synonyme_mal_applique",
"synonyme_orthographique","orthographe_originelle","hybride_parent_01",
"hybride_parent_01_notes","hybride_parent_02","hybride_parent_02_notes",
"nom_francais","presence","statut_origine ","statut_introduction","statut_culture","exclure_taxref");
 
public function initialiserProjet($projetNom) {
parent::initialiserProjet($projetNom);
$this->table = Config::get("apd");
$this->tableMeta = Config::get("apdMeta");
}
 
public function executer() {
try {
$this->initialiserProjet('apd');
 
// Lancement de l'action demandée
$cmd = $this->getParametre('a');
switch ($cmd) {
case 'tout' :
$ok = $this->productionCsvPourReferentiels();
if ($ok === true) {
$this->integrationEFlore();
}
break;
case 'ref' : // partie 1 : "referentiels"
$this->productionCsvPourReferentiels();
break;
case 'eflore' : // partie 2 : "eFlore"
$this->integrationEFlore();
break;
case 'nettoyage' :
$this->nettoyage();
break;
case 'chargerStructureSql' :
//$this->creerStructure();
$this->chargerStructureSql();
break;
case 'verifierEtGenererCsvRtax' :
$this->verifierEtGenererCsvRtax();
break;
case 'chargerCsvRtax' :
$this->chargerCsvRtax();
break;
case 'changerRangs' :
$this->changerRangs();
break;
case 'completerNumNomRetenu' :
$this->completerNumNomRetenu();
break;
case 'supprimerNumTaxSupPourSynonymes' :
$this->supprimerNumTaxSupPourSynonymes();
break;
case 'subspAutonymes' :
$this->subspAutonymes();
break;
case 'genererNomSupraGenerique' :
$this->genererNomSupraGenerique();
break;
case 'genererEpitheteInfraGenerique' :
$this->genererEpitheteInfraGenerique();
break;
case 'exporterCSVModifie' :
$this->exporterCSVModifie();
break;
case 'genererChpNumTax' :
$this->genererChpNumTax();
break;
case 'genererNomSciHtml' :
$this->genererChpNomSciHtml();
break;
case 'genererChpNomComplet' :
$this->genererChpNomComplet();
break;
case 'genererChpFamille' :
$this->genererChpFamille();
break;
case 'genererChpHierarchie' :
$this->genererChpHierarchie();
break;
default :
throw new Exception("Erreur : la commande '$cmd' n'existe pas!");
}
} catch (Exception $e) {
$this->traiterErreur($e->getMessage());
}
}
 
// Lance la première moitié du boulot, et s'arrête lorsque le fichier CSV
// au format Rtax est rempli avec les données amendées - il est prêt à rentrer dans Rtxß.
// Retourne true si tout s'est bien passé, false sinon
protected function productionCsvPourReferentiels() {
$retour = false;
$this->nettoyage();
$this->chargerStructureSql();
$verifOk = $this->verifierEtGenererCsvRtax();
if ($verifOk === true) {
$chgtOk = $this->chargerCsvRtax();
if ($chgtOk) {
$this->changerRangs();
$this->completerNumNomRetenu();
$this->supprimerNumTaxSupPourSynonymes();
$this->subspAutonymes();
$this->genererNomSupraGenerique();
$this->genererEpitheteInfraGenerique();
$this->exporterCSVModifie();
$retour = true;
}
}
return $retour;
}
 
// Lance la seconde moitié du boulot, et s'arrête lorsque le référentiel
// est inséré dans la base eFlore.
// Retourne true si tout s'est bien passé, false sinon
protected function integrationEFlore() {
$retour = false;
$this->genererChpNumTax();
$this->genererChpNomSciHtml();
$this->genererChpFamille();
$this->genererChpNomComplet();
$this->genererChpHierarchie();
$retour = true;
return $retour;
}
 
// -------------- partie Rtax -------------
 
// Dézingue tout le bousin
protected function nettoyage() {
echo "---- suppression des tables\n";
$req = "DROP TABLE IF EXISTS `" . $this->table . "`";
$this->getBdd()->requeter($req);
$req = "DROP TABLE IF EXISTS `" . $this->tableMeta . "`;";
$this->getBdd()->requeter($req);
}
 
// Analyse le fichier CSV fourni par le CJBG, le vérifie et écrit un CSV minimal au format Rtax
function verifierEtGenererCsvRtax() {
$cheminCsvRtax = Config::get('chemins.csvRtax');
$cheminCsvCjbg = Config::get('chemins.csvCjbg');
$retour = false;
echo "---- vérification CSV CJBG [$cheminCsvCjbg] et génération CSV Rtax\n";
 
// Correspondances de colonnes pour le remplissage à minima du fichier CSV Rtax
// Clefs: CJBG
// Valeurs: Rtax
$entetesCjbgVersRtax = array(
"id_name" => "num_nom",
"presence" => "presence",
"statut_introduction" => "statut_introduction",
"statut_origine" => "statut_origine",
"nom_addendum" => "nom_addendum",
"BASIONYME" => "num_basyonyme",
"NO_RANG" => "rang",
"auteur" => "auteur",
"ANNEE" => "annee",
"type_epithete" => "type_epithete",
"SYN_mal_applique" => "synonyme_mal_applique",
"nom_sci" => "nom_sci",
"num_tax_sup" => "num_tax_sup",
"num_nom_retenu" => "num_nom_retenu",
"genre" => "genre",
"NOTES" => "notes",
"epithete_sp" => "epithete_sp",
"epithete_infra_sp" => "epithete_infra_sp",
// champs additionnels
"NOM_STANDARD2" => false,
"STATUT_SYN" => false, // @TODO convertir
"hybride_parents" => false, // toujours "x" => ??
"FAM APG3" => false,
"auth_genre" => false,
"auth_esp" => false
);
 
$analyseOK = true;
$numLigne = 1;
$idNames = array();
// lecture CSV d'origine
$csv = fopen($cheminCsvCjbg, "r");
$donneesTransformees = array();
if ($csv) {
$entetes = fgetcsv($csv);
//echo "Entetes: " . print_r($entetes, true) . "\n";
while(($ligne = fgetcsv($csv)) !== false) {
$numLigne++;
$nouvelleLigne = array();
if (isset($idNames[$ligne[0]])) {
echo "Entrée dupliquée pour id_name [" . $ligne[0] . "]\n";
$analyseOK = false;
} else if (! is_numeric($ligne[0])) {
echo "Ligne $numLigne : la clef [" . $ligne[0] . "] n'est pas un entier\n";
$analyseOK = false;
} else if ($ligne[0] == 0) {
echo "Ligne $numLigne : la clef [" . $ligne[0] . "] vaut zéro\n";
$analyseOK = false;
} else {
$idNames[$ligne[0]] = $ligne[13]; // stockage du nom retenu
foreach ($ligne as $idx => $col) {
$entete = $entetes[$idx];
$ert = $entetesCjbgVersRtax[$entete];
if (strpos($col, "\n") > -1) {
echo "Info: la colonne $ert de la ligne $numLigne contient des retours chariot. Conversion en espaces.\n";
$col = str_replace("\n", " ", $col);
}
$nouvelleLigne[$ert] = $col;
}
$donneesTransformees[] = $nouvelleLigne;
}
}
} else {
echo "Erreur lors de l'ouverture du fichier\n";
}
 
// Vérifications:
// - existence des num_nom_retenu et num_tax_sup mentionnés
// - réduction des chaînes de synonymie
$nnrManquants = array();
$ntsManquants = array();
$chaineSyn = array();
foreach ($donneesTransformees as $ligne) {
$taxSup = $ligne['num_tax_sup'];
$nomRet = $ligne['num_nom_retenu'];
$numNom = $ligne['num_nom'];
// Si un nom est retenu, son taxon supérieur doit être mentionné et exister
if (($numNom == $nomRet) && $taxSup && (! isset($idNames[$taxSup])) && (! isset($ntsManquants[$taxSup]))) {
$ntsManquants[$taxSup] = true;
}
// Si un nom retenu est mentionné, il doit exister et être un nom retenu
if ($nomRet) {
if (isset($idNames[$nomRet])) {
/*$nrnr = $idNames[$nomRet];
echo "Test pour nn $numNom, nr $nomRet, " . $nrnr . "\n";
if ($nomRet && $nrnr != $nomRet) {
if (! isset($chaineSyn[$nomRet])) {
$chaineSyn[$nomRet] = true;
}
}*/
} else {
if (! isset($nnrManquants[$nomRet])) {
$nnrManquants[$nomRet] = true;
}
}
}
}
if (count($nnrManquants) > 0) {
echo count($nnrManquants) . " Nom(s) retenu(s) absent(s):\n";
echo "(" . implode(",", array_keys($nnrManquants)) . ")\n";
}
if (count($ntsManquants) > 0) {
echo count($ntsManquants) . " Taxon(s) supérieur(s) absent(s):\n";
echo "(" . implode(",", array_keys($ntsManquants)) . ")\n";
}
/*if (count($chaineSyn) > 0) {
echo count($chaineSyn) . " Synonymes ne sont pas des noms retenus:\n";
//echo "(" . implode(",", array_keys($chaineSyn)) . ")\n";
}*/
 
if ($analyseOK === true) {
// Production CSV de destination
$csvDestination = '';
$csvDestination .= implode($this->entetesRtax, ',') . "\n";
$tailleLigne = count($this->entetesRtax);
foreach ($donneesTransformees as $dt) {
//$ligne = array();
$ligneCsv = '';
$i = 0;
foreach ($this->entetesRtax as $e) {
/*if (isset($dt[$e])) {
$ligne[] = $dt[$e];
} else {
$ligne[] = '';
}*/
if (isset($dt[$e]) && ($dt[$e] !== '')) {
$ligneCsv .= '"' . $dt[$e] . '"';
}
if ($i < $tailleLigne) {
$ligneCsv .= ',';
}
$i++;
}
$ligneCsv .= "\n";
//$ligneCsv = '"' . implode($ligne, '","') . '"' . "\n"; // met des double guillemets sur les champs vides et /i
$csvDestination .= $ligneCsv;
}
// @TODO créer le répertoire dans /tmp et donner les droits 777
file_put_contents($cheminCsvRtax, $csvDestination);
$retour = true;
} else {
echo "L'analyse a mis en évidence des erreurs. Interruption.\n";
}
 
return $retour;
}
 
// Charge le CSV minimal au format TexRaf
protected function chargerCsvRtax() {
$cheminCsvRtax = Config::get('chemins.csvRtax');
echo "---- chargement du fichier CSV Rtax [$cheminCsvRtax]\n";
$req = "LOAD DATA INFILE '" . $cheminCsvRtax . "' INTO TABLE " . $this->table
. " FIELDS TERMINATED BY ',' ENCLOSED BY '\"' LINES TERMINATED BY '\n' IGNORE 1 LINES";
$retour = $this->getBdd()->requeter($req);
return $retour;
}
 
// Convertit les rangs du format chaispasquoi au format RexTaf
protected function changerRangs() {
echo "---- conversion des rangs\n";
$rangs = array(
"0" => "10",
"1" => "20",
"2" => "50",
"3" => "53",
"4" => "80",
"5" => "140",
"6" => "180",
"7" => "190",
"8" => "200",
"9" => "220",
"10" => "230",
"11" => "240",
"12" => "250",
"13" => "260",
"14" => "280",
"15" => "290",
"16" => "320",
"17" => "340",
"18" => "350",
"19" => "360",
"20" => "370",
"26" => "440"
);
foreach ($rangs as $src => $dest) {
echo "rang $src => rang $dest\n";
$req = "UPDATE " . $this->table . " SET rang=$dest WHERE rang=$src;";
$this->getBdd()->requeter($req);
}
}
 
// Copie num_nom dans num_nom_retenu lorsque ce dernier est vide
protected function completerNumNomRetenu() {
echo "---- complétion des num_nom_retenu\n";
$req = "UPDATE " . $this->table . " SET num_nom_retenu = num_nom WHERE num_nom_retenu='';";
$this->getBdd()->requeter($req);
}
 
// Supprime le num_tax_sup pour les synonymes
// et le met à 1 s'il est égal au num_nom
protected function supprimerNumTaxSupPourSynonymes() {
echo "---- suppression de num_tax_sup pour les synonymes et mise à 1 si égal à num_nom\n";
$req = "UPDATE " . $this->table . " SET num_tax_sup = '' WHERE num_nom != num_nom_retenu;";
$this->getBdd()->requeter($req);
$req = "UPDATE " . $this->table . " SET num_tax_sup = 1 WHERE num_nom = num_tax_sup;";
$this->getBdd()->requeter($req);
}
 
// Pour chaque subsp. autonyme, inscrit l'epithete_infra_sp
protected function subspAutonymes() {
echo "---- inscription de l'épithète infraspécifique des subsp. autonymes\n";
$req = "SELECT num_nom, nom_sci, epithete_infra_sp FROM " . $this->table . " WHERE nom_sci LIKE '%subsp.%'";
$res = $this->getBdd()->recupererTous($req);
 
$nbres = count($res);
$cpt = 0;
$ok = 0;
$ids = array();
foreach ($res as $subsp) {
$ns = $subsp['nom_sci'];
$pos = strpos($ns, 'subsp.');
$gsp = substr($ns, 0, $pos - 1);
$sp = substr($gsp, strrpos($gsp, ' ') + 1);
$sub = substr($ns, $pos + 8);
if ($sub == $sp) {
$cpt++;
// @TODO
// 1) récupérer l'auteur
// 2) intégrer l'auteur avant "subsp." dans le nom_sci
//echo "[$sp] || [$sub] || [" . $subsp['epithete_infra_sp'] . "]\n";
if ($sub == $subsp['epithete_infra_sp']) {
$ok++;
} else {
$reqMod = "UPDATE " . $this->table . " SET epithete_infra_sp='"
. $sub . "' WHERE num_nom=" . $subsp['num_nom'];
$this->getBdd()->requeter($reqMod);
}
}
}
echo "subsp.: $nbres\n";
echo "Autonymes: $cpt dont $ok déjà inscrites\n";
}
 
// Copie le nom scientifique dans le nom supra générique pour les taxons de rang
// supérieur au genre
protected function genererNomSupraGenerique() {
echo "---- complétion des noms supragénériques\n";
$req = "UPDATE " . $this->table . " SET nom_supra_generique = nom_sci WHERE rang < 220";
$res = $this->getBdd()->requeter($req);
}
 
// Copie le nom scientifique dans l'épithète infra générique pour les taxons de rang
// entre genre et espèce
protected function genererEpitheteInfraGenerique() {
echo "---- complétion des épithètes infragénériques\n";
$req = "UPDATE " . $this->table . " SET epithete_infra_generique = nom_sci WHERE rang > 220 AND rang < 290";
$res = $this->getBdd()->requeter($req);
}
 
protected function exporterCSVModifie() {
$cheminFichierCsvRtaxModifie = Config::get('chemins.csvRtaxModifie');
echo "---- export du CSV Rtax modifié [$cheminFichierCsvRtaxModifie]\n";
if (file_exists($cheminFichierCsvRtaxModifie)) {
unlink($cheminFichierCsvRtaxModifie);
}
$req = "SELECT '" . implode("','", $this->entetesRtax) . "'"
. " UNION ALL "
. " SELECT * FROM " . $this->table . " INTO OUTFILE '" . $cheminFichierCsvRtaxModifie . "'"
. " FIELDS TERMINATED BY ',' ENCLOSED BY '\"' LINES TERMINATED BY '\n'";
$res = $this->getBdd()->requeter($req);
// Remplacement des cases vides par '' aulieu de '""' (peut faire foirer l'import par la suite)
exec("sed -i 's/\"\"//g' " . $cheminFichierCsvRtaxModifie);
}
 
// -------------- partie eFlore ------------- copiée depuis le script Bdtfx
 
private function genererChpNomSciHtml() {
echo "---- génération des noms scientifiques en HTML \n";
$this->preparerTablePrChpNomSciHtml();
$generateur = new GenerateurNomSciHtml();
$nbreTotal = $this->recupererNbTotalTuples();
$erreurs = array();
$this->departInsertion = 0;
while ($this->departInsertion < $nbreTotal) {
$resultat = $this->recupererTuplesPrChpNomSciHtml();
try {
$nomsSciEnHtml = $generateur->generer($resultat);
} catch (Exception $e) {
$erreurs[] = $e->getMessage();
}
$this->remplirChpNomSciHtm($nomsSciEnHtml);
$this->departInsertion += $this->pasInsertion;
$this->afficherAvancement("Insertion des noms scientifique au format HTML dans la base par paquet de {$this->pasInsertion} en cours");
}
echo "\n";
 
if (count($erreurs) > 0) {
echo 'Erreurs lors de la génération HTML des noms scientifiques:\n' . print_r($erreurs, true) . "\n";
}
}
 
private function preparerTablePrChpNomSciHtml() {
echo "---- ajout de la colonne nom_sci_html \n";
$requete = "SHOW COLUMNS FROM {$this->table} LIKE 'nom_sci_html' ";
$resultat = $this->getBdd()->recuperer($requete);
if ($resultat === false) {
$requete = "ALTER TABLE {$this->table} ".
'ADD nom_sci_html VARCHAR( 500 ) '.
'CHARACTER SET utf8 COLLATE utf8_general_ci NULL DEFAULT NULL ';
$this->getBdd()->requeter($requete);
}
}
 
private function recupererNbTotalTuples(){
$requete = "SELECT count(*) AS nb FROM {$this->table} ";
$resultat = $this->getBdd()->recuperer($requete);
return $resultat['nb'];
}
 
private function recupererTuplesPrChpNomSciHtml() {
$requete = 'SELECT num_nom, rang, nom_sci, nom_supra_generique, genre, epithete_infra_generique, '.
' epithete_sp, type_epithete, epithete_infra_sp,cultivar_groupe, '.
' nom_commercial, cultivar '.
"FROM {$this->table} ".
"LIMIT {$this->departInsertion},{$this->pasInsertion} ";
$resultat = $this->getBdd()->recupererTous($requete);
return $resultat;
}
 
private function remplirChpNomSciHtm($nomsSciHtm) {
foreach ($nomsSciHtm as $id => $html) {
$html = $this->getBdd()->proteger($html);
$requete = "UPDATE {$this->table} SET nom_sci_html = $html WHERE num_nom = $id ";
$resultat = $this->getBdd()->requeter($requete);
if ($resultat === false) {
throw new Exception("Erreur d'insertion pour le tuple $id");
}
}
}
 
// Attention c'est over-lent !
private function genererChpNumTax() {
$this->preparerTablePrChpNumTax();
$erreurs = array();
$this->departInsertion = 0;
$dernier_num_tax = 0;
$requete = 'SELECT num_nom '.
'FROM '.$this->table.' '.
'WHERE num_nom = num_nom_retenu AND num_nom_retenu != 0 '.
'ORDER by num_nom_retenu ASC ';
 
$resultat = $this->getBdd()->recupererTous($requete);
foreach ($resultat as $taxon) {
$dernier_num_tax++;
$requete_maj = 'UPDATE '.$this->table.' '.
'SET num_taxonomique = '.$dernier_num_tax.' '.
'WHERE num_nom_retenu = '.$taxon['num_nom'];
$this->getBdd()->requeter($requete_maj);
$this->pasInsertion++;
$this->afficherAvancement("Insertion des num tax, ".count($resultat)." num tax a traiter");
}
echo "\n";
if (count($erreurs) > 0) {
echo 'Erreurs lors de la génération des numéros taxonomiques' . print_r($erreurs, true) . "\n";
}
}
private function preparerTablePrChpNumTax() {
$requete = "SHOW COLUMNS FROM {$this->table} LIKE 'num_taxonomique' ";
$resultat = $this->getBdd()->recuperer($requete);
if ($resultat === false) {
$requete = "ALTER TABLE {$this->table} ".
'ADD num_taxonomique INT( 9 ) ';
$this->getBdd()->requeter($requete);
}
}
 
private function genererChpNomComplet() {
$this->preparerTablePrChpNomComplet();
$this->remplirChpNomComplet();
}
private function preparerTablePrChpNomComplet() {
$requete = "SHOW COLUMNS FROM {$this->table} LIKE 'nom_complet' ";
$resultat = $this->getBdd()->recuperer($requete);
if ($resultat === false) {
$requete = "ALTER TABLE {$this->table} ".
'ADD nom_complet VARCHAR( 500 ) '.
'CHARACTER SET utf8 COLLATE utf8_general_ci NULL DEFAULT NULL ';
$this->getBdd()->requeter($requete);
}
}
private function remplirChpNomComplet() {
echo "---- Attribution du champ nom complet au taxons :\n";
$requete = "UPDATE {$this->table} SET nom_complet = CONCAT(nom_sci,' ',auteur)";
$resultat = $this->getBdd()->requeter($requete);
if ($resultat === false) {
echo "Erreur de génération du champ nom complet\n";
} else {
echo "OK\n";
}
}
 
private function genererChpFamille() {
$this->preparerTablePrChpFamille();
$resultats = $this->recupererTuplesPrChpFamille();
$noms = array();
$introuvables = array();
$introuvablesSyno = array();
foreach ($resultats as $id => $nom) {
$nn = $nom['num_nom'];
$nnr = $nom['num_nom_retenu'];
$nts = $nom['num_tax_sup'];
$rg = $nom['rang'];
if ($nnr != '') {
if ($rg == '180') {
$noms[$nn] = $nom['nom_sci'];
} else {
if ($nn == $nnr) {// nom retenu
if (isset($noms[$nts])) {
$noms[$nn] = $noms[$nts];
} else {
$introuvables[] = $nn;
}
} else {// nom synonyme
if (isset($noms[$nnr])) {
$noms[$nn] = $noms[$nnr];
} else {
$introuvablesSyno[] = $nom;
}
}
}
}
unset($resultats[$id]);
$this->afficherAvancement("Attribution de leur famille aux noms en cours");
}
echo "\n";
 
foreach ($introuvablesSyno as $id => $nom) {
$nn = $nom['num_nom'];
$nnr = $nom['num_nom_retenu'];
if (isset($noms[$nnr])) {
$noms[$nn] = $noms[$nnr];
} else {
$introuvables[] = $nn;
}
unset($introuvablesSyno[$id]);
$this->afficherAvancement("Attribution de leur famille aux synonymes en cours");
}
echo "\n";
 
if (count($introuvables) > 0) {
echo count($introuvables) . ' familles sont introuvables : ' . implode(',', $introuvables) . "\n";
}
$this->remplirChpFamille($noms);
}
 
private function preparerTablePrChpFamille() {
$requete = "SHOW COLUMNS FROM {$this->table} LIKE 'famille' ";
$resultat = $this->getBdd()->recuperer($requete);
if ($resultat === false) {
$requete = "ALTER TABLE {$this->table} ".
'ADD famille VARCHAR(255) '.
'CHARACTER SET utf8 COLLATE utf8_general_ci NULL DEFAULT NULL ';
$this->getBdd()->requeter($requete);
}
}
 
private function recupererTuplesPrChpFamille() {
$requete = 'SELECT num_nom, num_nom_retenu, num_tax_sup, rang, nom_sci '.
"FROM {$this->table} ".
"WHERE rang >= 180 ".
"ORDER BY rang ASC, num_tax_sup ASC, num_nom_retenu DESC ";
$resultat = $this->getBdd()->recupererTous($requete);
return $resultat;
}
 
private function remplirChpFamille($noms) {
foreach ($noms as $id => $famille) {
$famille = $this->getBdd()->proteger($famille);
$requete = "UPDATE {$this->table} SET famille = $famille WHERE num_nom = $id ";
$resultat = $this->getBdd()->requeter($requete);
if ($resultat === false) {
throw new Exception("Erreur d'insertion pour le tuple $id");
}
$this->afficherAvancement("Insertion des noms de famille dans la base en cours");
}
echo "\n";
}
private function genererChpHierarchie() {
$this->preparerTablePrChpHierarchie();
$table = Config::get('tables.isfan');
$requete = "UPDATE {$this->table} SET hierarchie = NULL ";
$mise_a_jour = $this->getBdd()->requeter($requete);
$requete_hierarchie = "SELECT num_nom, num_nom_retenu, num_tax_sup FROM " . $this->table . " ORDER BY rang DESC";
$resultat = $this->getBdd()->recupererTous($requete_hierarchie);
$num_nom_a_num_sup = array();
foreach($resultat as &$taxon) {
$num_nom_a_num_sup[$taxon['num_nom']] = $taxon['num_tax_sup'];
}
$chemin_taxo = "";
foreach($resultat as &$taxon) {
$chemin_taxo = $this->traiterHierarchieNumTaxSup($taxon['num_nom_retenu'], $num_nom_a_num_sup).'-';
$requete = "UPDATE {$this->table} SET hierarchie = ".$this->getBdd()->proteger($chemin_taxo)." WHERE num_nom = ".$taxon['num_nom']." ";
$mise_a_jour = $this->getBdd()->requeter($requete);
$this->afficherAvancement("Insertion de la hierarchie taxonomique en cours");
}
echo "\n";
}
private function traiterHierarchieNumTaxSup($num_nom_retenu, &$num_nom_a_num_sup) {
$chaine_hierarchie = "";
if(isset($num_nom_a_num_sup[$num_nom_retenu])) {
$num_tax_sup = $num_nom_a_num_sup[$num_nom_retenu];
$chaine_hierarchie = '-'.$num_tax_sup;
if($num_tax_sup != 0 && $num_tax_sup != '') {
$chaine_hierarchie = $this->traiterHierarchieNumTaxSup($num_tax_sup, $num_nom_a_num_sup).$chaine_hierarchie;
}
}
return $chaine_hierarchie;
}
private function preparerTablePrChpHierarchie() {
$requete = "SHOW COLUMNS FROM {$this->table} LIKE 'hierarchie' ";
$resultat = $this->getBdd()->recuperer($requete);
if ($resultat === false) {
$requete = "ALTER TABLE {$this->table} ".
'ADD hierarchie VARCHAR(1000) '.
'CHARACTER SET utf8 COLLATE utf8_general_ci NULL DEFAULT NULL ';
$this->getBdd()->requeter($requete);
}
}
}
?>
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/biblio_bota/biblio_bota.ini
New file
0,0 → 1,84
version="2009-10-05"
dossierTsv = "{ref:dossierDonneesEflore}biblio_bota/{ref:version}/"
dossierSql = "{ref:dossierTsv}"
prefixe = "biblio_"
 
[tables]
article = "{ref:prefixe}article"
article_sauv = "{ref:prefixe}article_sauv"
aut_saisie = "{ref:prefixe}aut_saisie"
collection = "{ref:prefixe}collection"
domaine = "{ref:prefixe}domaine"
domaine_lier = "{ref:prefixe}domaine_lier"
domaine_lier_sauv = "{ref:prefixe}domaine_lier_sauv"
fasc = "{ref:prefixe}fasc"
fasc_sauv = "{ref:prefixe}fasc_sauv"
item = "{ref:prefixe}item"
item_sauv = "{ref:prefixe}item_sauv"
item_typlog = "{ref:prefixe}item_typlog"
item_typphy = "{ref:prefixe}item_typphy"
link = "{ref:prefixe}link"
link_categ = "{ref:prefixe}link_categ"
link_categoriser = "{ref:prefixe}link_categoriser"
link_sauv = "{ref:prefixe}link_sauv"
media = "{ref:prefixe}media"
modif = "{ref:prefixe}modif"
serie = "{ref:prefixe}serie"
spy = "{ref:prefixe}spy"
str = "{ref:prefixe}str"
str_sauve = "{ref:prefixe}str_sauve"
str_type = "{ref:prefixe}str_type"
 
[fichiers]
structureSql = "biblio_bota.sql"
article = "{ref:prefixe}article.tsv"
article_sauv = "{ref:prefixe}article_sauv.tsv"
aut_saisie = "{ref:prefixe}aut_saisie.tsv"
collection = "{ref:prefixe}collection.tsv"
domaine = "{ref:prefixe}domaine.tsv"
domaine_lier = "{ref:prefixe}domaine_lier.tsv"
domaine_lier_sauv = "{ref:prefixe}domaine_lier_sauv.tsv"
fasc = "{ref:prefixe}fasc.tsv"
fasc_sauv = "{ref:prefixe}fasc_sauv.tsv"
item = "{ref:prefixe}item.tsv"
item_sauv = "{ref:prefixe}item_sauv.tsv"
item_typlog = "{ref:prefixe}item_typlog.tsv"
item_typphy = "{ref:prefixe}item_typphy.tsv"
link = "{ref:prefixe}link.tsv"
link_categ = "{ref:prefixe}link_categ.tsv"
link_categoriser = "{ref:prefixe}link_categoriser.tsv"
link_sauv = "{ref:prefixe}link_sauv.tsv"
media = "{ref:prefixe}media.tsv"
modif = "{ref:prefixe}modif.tsv"
serie = "{ref:prefixe}serie.tsv"
spy = "{ref:prefixe}spy.tsv"
str = "{ref:prefixe}str.tsv"
str_sauve = "{ref:prefixe}str_sauve.tsv"
str_type = "{ref:prefixe}str_type.tsv"
 
[chemins]
structureSql = "{ref:dossierSql}{ref:fichiers.structureSql}"
article = "{ref:dossierSql}{ref:fichiers.article}"
article_sauv = "{ref:dossierSql}{ref:fichiers.article_sauv}"
aut_saisie = "{ref:dossierSql}{ref:fichiers.aut_saisie}"
collection = "{ref:dossierSql}{ref:fichiers.collection}"
domaine = "{ref:dossierSql}{ref:fichiers.domaine}"
domaine_lier = "{ref:dossierSql}{ref:fichiers.domaine_lier}"
domaine_lier_sauv = "{ref:dossierSql}{ref:fichiers.domaine_lier_sauv}"
fasc = "{ref:dossierSql}{ref:fichiers.fasc}"
fasc_sauv = "{ref:dossierSql}{ref:fichiers.fasc_sauv}"
item = "{ref:dossierSql}{ref:fichiers.item}"
item_sauv = "{ref:dossierSql}{ref:fichiers.item_sauv}"
item_typlog = "{ref:dossierSql}{ref:fichiers.item_typlog}"
item_typphy = "{ref:dossierSql}{ref:fichiers.item_typphy}"
link = "{ref:dossierSql}{ref:fichiers.link}"
link_categ = "{ref:dossierSql}{ref:fichiers.link_categ}"
link_categoriser = "{ref:dossierSql}{ref:fichiers.link_categoriser}"
link_sauv = "{ref:dossierSql}{ref:fichiers.link_sauv}"
media = "{ref:dossierSql}{ref:fichiers.media}"
modif = "{ref:dossierSql}{ref:fichiers.modif}"
serie = "{ref:dossierSql}{ref:fichiers.serie}"
spy = "{ref:dossierSql}{ref:fichiers.spy}"
str = "{ref:dossierSql}{ref:fichiers.str}"
str_sauve = "{ref:dossierSql}{ref:fichiers.str_sauve}"
str_type = "{ref:dossierSql}{ref:fichiers.str_type}"
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/biblio_bota/BiblioBota.php
New file
0,0 → 1,70
<?php
//declare(encoding='UTF-8');
/**
* Exemple de lancement du script : :
* /opt/lampp/bin/php cli.php cel -a chargerTous
*
* @category php 5.2
* @package eFlore/Scripts
* @author Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org>
* @copyright Copyright (c) 2011, Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
* @license http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-fr.txt Licence CECILL
* @license http://www.gnu.org/licenses/gpl.html Licence GNU-GPL
* @version $Id$
*/
class BiblioBota extends EfloreScript {
 
public function executer() {
try {
$this->initialiserProjet('biblio_bota');
 
// Lancement de l'action demandée
$cmd = $this->getParametre('a');
switch ($cmd) {
case 'chargerTous' :
$this->chargerStructureSql();
$this->chargerBiblioBota();
break;
case 'supprimerTous' :
$this->supprimerTous();
break;
default :
throw new Exception("Erreur : la commande '$cmd' n'existe pas!");
}
} catch (Exception $e) {
$this->traiterErreur($e->getMessage());
}
}
 
public function chargerBiblioBota() {
$tablesCodes = array_keys(Config::get('tables'));
foreach ($tablesCodes as $code) {
echo "Chargement de la table : $code\n";
$this->chargerFichierTsvDansTable($code);
}
}
 
private function chargerFichierTsvDansTable($code) {
$chemin = Config::get('chemins.'.$code);
$table = Config::get('tables.'.$code);
$requete = "LOAD DATA INFILE '$chemin' ".
"REPLACE INTO TABLE $table ".
'CHARACTER SET utf8 '.
'FIELDS '.
" TERMINATED BY '\t' ".
" ENCLOSED BY '\"' ".
" ESCAPED BY '\\\' ";
$this->getBdd()->requeter($requete);
}
 
private function supprimerTous() {
$requete = "DROP TABLE IF EXISTS biblio_article, biblio_article_sauv, biblio_aut_saisie, ".
"biblio_collection, biblio_domaine, biblio_domaine_lier, biblio_domaine_lier_sauv, biblio_fasc, ".
"biblio_fasc_sauv, biblio_item, biblio_item_sauv, biblio_item_typlog, biblio_item_typphy, ".
"biblio_link, biblio_link_categ, biblio_link_categoriser, biblio_link_sauv, biblio_media, ".
"biblio_modif, biblio_serie, biblio_spy, biblio_str, biblio_str_sauve, biblio_str_type, ".
"biblio_meta";
$this->getBdd()->requeter($requete);
}
}
?>
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/wikipedia/wikipedia.ini
New file
0,0 → 1,21
version="2011"
dossierDonnees = "{ref:dossierDonneesEflore}wikipedia/"
 
[dossiers]
structure = "{ref:dossierDonnees}"
meta = "{ref:dossierDonnees}"
communes = "{ref:dossierDonnees}communes/2011-05-13/"
[tables]
wikipediaMeta = "wikipedia_meta"
wikipediaCommunes = "wikipedia_communes_v{ref:version}"
 
[fichiers]
structureSql = "wikipedia.sql"
wikipediaMeta = "wikipedia_meta.sql"
wikipediaCommunes = "communes_tom_com_v2011.csv"
 
[chemins]
structureSql = "{ref:dossiers.structure}{ref:fichiers.structureSql}"
wikipediaMeta = "{ref:dossiers.meta}{ref:fichiers.wikipediaMeta}"
wikipediaCommunes = "{ref:dossiers.communes}{ref:fichiers.wikipediaCommunes}"
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/wikipedia/Wikipedia.php
New file
0,0 → 1,115
<?php
//declare(encoding='UTF-8');
/**
* Classe permettant de :
* - rajouter l'objet point centroide de la commune.
* - charger la bdd
* Exemple de lancement du script : :
* /opt/lampp/bin/php cli.php wikipedia -a chargerTous
*
* @category php 5.2
* @package eFlore/Scripts
* @author Mohcen BENMOUNAH <mohcen@tela-botanica.org>
* @author Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org>
* @copyright Copyright (c) 2011, Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
* @license http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-fr.txt Licence CECILL
* @license http://www.gnu.org/licenses/gpl.html Licence GNU-GPL
* @version $Id$
*/
class Wikipedia extends EfloreScript {
private $tableMeta = '';
private $cheminFichierMeta = '';
private $tableCommunes = '';
private $cheminFichierCommunes = '';
 
public function executer() {
try {
$this->initialiserProjet('wikipedia');
$this->tableMeta = Config::get('tables.wikipediaMeta');
$this->cheminFichierMeta = Config::get('chemins.wikipediaMeta');
$this->tableCommunes = Config::get('tables.wikipediaCommunes');
$this->cheminFichierCommunes = Config::get('chemins.wikipediaCommunes');
 
// Lancement de l'action demandée
$cmd = $this->getParametre('a');
switch ($cmd) {
case 'chargerTous' :
$this->chargerStructureSql();
$this->chargerMetaDonnees();
$this->chargerWikipediaCommunes();
$this->preparerTable();
$this->recupererPoints();
case 'points' :
$this->preparerTable();
$this->recupererPoints();
break;
case 'supprimerTous' :
$this->supprimerTous();
break;
default :
throw new Exception("Erreur : la commande '$cmd' n'existe pas!");
}
} catch (Exception $e) {
$this->traiterErreur($e->getMessage());
}
}
 
protected function chargerMetaDonnees() {
$contenuSql = $this->recupererContenu($this->cheminFichierMeta);
$this->executerScripSql($contenuSql);
}
 
private function chargerWikipediaCommunes() {
$requete = "LOAD DATA INFILE '{$this->cheminFichierCommunes}' ".
"REPLACE INTO TABLE {$this->tableCommunes} ".
'CHARACTER SET utf8 '.
'FIELDS '.
" TERMINATED BY ',' ".
" ENCLOSED BY '\"' ".
" ESCAPED BY '\\\' ".
'IGNORE 1 LINES';
$this->getBdd()->requeter($requete);
}
 
private function preparerTable() {
$requete = "ALTER TABLE {$this->tableCommunes} ".
'DROP centroide ';
$this->getBdd()->requeter($requete);
 
$requete = "ALTER TABLE {$this->tableCommunes} ".
' ADD centroide point NOT NULL ';
$this->getBdd()->requeter($requete);
 
$requete = "ALTER TABLE {$this->tableCommunes} ".
' ADD INDEX (centroide) ';
$this->getBdd()->requeter($requete);
}
 
private function recupererPoints() {
$requete = 'SELECT * '.
"FROM {$this->tableCommunes} ";
$LatLons = $this->getBdd()->recupererTous($requete);
 
foreach ($LatLons as $LatLon) {
$latitude_degre = $LatLon['latitude'];
$longitude_degre = $LatLon['longitude'];
$insee = $LatLon['code_insee'];
$this->formerPointCentre($latitude_degre, $longitude_degre, $insee);
$this->afficherAvancement('Analyse des communes Wikipedia');
}
}
 
private function formerPointCentre($latitude_degre, $longitude_degre, $insee) {
$centre = "$latitude_degre $longitude_degre";
$requete = "UPDATE {$this->tableCommunes} ".
"SET centroide = POINTFROMTEXT('POINT($centre)') ".
"WHERE code_insee = $insee ";
$this->getBdd()->requeter($requete);
}
 
private function supprimerTous() {
$requete = "DROP TABLE IF EXISTS {$this->tableMeta}, {$this->tableCommunes}";
$this->getBdd()->requeter($requete);
}
}
?>
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/sptb/Sptb.php
New file
0,0 → 1,90
<?php
/** Exemple lancement:
* /opt/lampp/bin/php -d memory_limit=3500M cli.php sptb -a chargerTous
*/
class Sptb extends EfloreScript {
 
public function executer() {
// Lancement de l'action demandée
try {
$this->initialiserProjet('sptb');
 
$cmd = $this->getParametre('a');
switch ($cmd) {
case 'chargerTous' :
$this->chargerStructureSql();
$this->chargerDonnees('especes');
$this->chargerDonnees('lois');
$this->genererChampNumNomRetenu();
break;
case 'chargerStructureSql' :
$this->chargerStructureSql();
break;
case 'chargerDonnees' :
$this->chargerDonnees('especes');
$this->chargerDonnees('lois');
$this->genererChampNumNomRetenu();
break;
case 'genererChampNumNomRetenu' :
$this->genererChampNumNomRetenu();
break;
case 'supprimerTous' :
$this->supprimerTous();
break;
default :
throw new Exception("Erreur : la commande '$cmd' n'existe pas!");
}
} catch (Exception $e) {
$this->traiterErreur($e->getMessage());
}
}
 
private function chargerDonnees($type) {
$chemin = Config::get('chemins.'.$type);
$table = Config::get('tables.'.$type);
$requete = "LOAD DATA INFILE '$chemin' ".
"REPLACE INTO TABLE $table ".
'CHARACTER SET utf8 '.
'FIELDS '.
" TERMINATED BY '\t' ".
" ENCLOSED BY '' ".
" ESCAPED BY '\\\' ".
'IGNORE 1 LINES';
$this->getBdd()->requeter($requete);
}
private function genererChampNumNomRetenu() {
$this->preparerTablePrChpNumNomRetenu();
$this->genererNumNomRetenu();
}
private function preparerTablePrChpNumNomRetenu() {
$table = Config::get('tables.especes');
$requete = "SHOW COLUMNS FROM $table LIKE 'num_nom_retenu' ";
$resultat = $this->getBdd()->recuperer($requete);
if ($resultat === false) {
$requete = "ALTER TABLE $table ".
'ADD num_nom_retenu INT(10) '.
'NULL DEFAULT NULL AFTER num_nom';
$this->getBdd()->requeter($requete);
}
}
private function genererNumNomRetenu() {
$table = Config::get('tables.especes');
$table_referentiel = Config::get('tables.referentielTaxo');
$requete = 'UPDATE '.$table.' s, '.$table_referentiel.' r '.
'SET s.num_nom_retenu = r.num_nom_retenu '.
' WHERE s.num_nom = r.num_nom ';
$this->getBdd()->requeter($requete);
}
 
private function supprimerTous() {
$requete = "DROP TABLE IF EXISTS sptb_meta, sptb_especes_v2012, sptb_lois_v2012";
$this->getBdd()->requeter($requete);
Debug::printr('suppression');
}
}
?>
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/sptb/sptb.ini
New file
0,0 → 1,19
version="2012"
dossierTsv = "{ref:dossierDonneesEflore}sptb/{ref:version}/"
dossierSql = "{ref:dossierTsv}"
 
[tables]
especes = "sptb_especes_v2012"
lois = "sptb_lois_v2012"
referentielTaxo = "bdtfx_v1_02"
 
[fichiers]
structureSql = "sptb_v2012.sql"
especes = "sptb_especes_v2012.tsv"
lois = "sptb_lois_v2012.tsv"
 
[chemins]
structureSql = "{ref:dossierSql}{ref:fichiers.structureSql}"
especes = "{ref:dossierTsv}{ref:fichiers.especes}"
lois = "{ref:dossierTsv}{ref:fichiers.lois}"
numNomRetenus = "{ref:dossierTsv}{ref:fichiers.numNomRetenus}"
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/ifn/Ifn.php
New file
0,0 → 1,243
<?php
/** Exemple lancement:
* /opt/lampp/bin/php -d memory_limit=3500M cli.php ifn -a chargerTous
* Options :
* -t : Permet de tester le script sur un jeux réduit de données (indiquer le nombre de lignes).
*/
class Ifn extends EfloreScript {
 
public function executer() {
// Lancement de l'action demandée
try {
$this->initialiserProjet('ifn');
 
$cmd = $this->getParametre('a');
switch ($cmd) {
case 'chargerTous' :
$this->chargerStructureSql();
$this->chargerDonnees("documentationFlore");
$this->chargerDonneesAnnuelles();
include_once dirname(__FILE__)."/bibliotheque/proj4php/proj4php.php";
$this->genererCoordonneesWgs('placettesForet');
$this->genererCoordonneesWgs('placettesPeupleraie');
$this->genererCodeInsee('placettesForet');
$this->genererCodeInsee('placettesPeupleraie');
$this->creerVueTapir();
$this->ajouterTupleEfloreOntologies();
break;
case 'chargerStructure' :
$this->chargerStructureSql();
break;
case 'chargerDonnees' :
$this->chargerDonnees("documentationFlore");
$this->chargerDonneesAnnuelles();
break;
case 'genererCoordWgs' :
include_once dirname(__FILE__)."/bibliotheque/proj4php/proj4php.php";
$this->genererCoordonneesWgs('placettesForet');
$this->genererCoordonneesWgs('placettesPeupleraie');
break;
case 'genererCodeInsee' :
$this->genererCodeInsee('placettesForet');
$this->genererCodeInsee('placettesPeupleraie');
break;
case 'creerVueTapir' :
$this->creerVueTapir();
$this->ajouterTupleEfloreOntologies();
break;
case 'supprimerTous' :
$this->supprimerTous();
break;
default :
throw new Exception("Erreur : la commande '$cmd' n'existe pas!");
}
} catch (Exception $e) {
$this->traiterErreur($e->getMessage());
}
}
 
private function chargerDonneesAnnuelles() {
$categories = explode(",",Config::get('categories'));
$annees = explode(",",Config::get('versions'));
foreach ($categories as $categorie) {
foreach ($annees as $annee) {
$this->chargerDonnees($categorie, $annee."/");
Debug::printr($categorie." ".$annee."\n");
}
}
}
private function chargerDonnees($categorie, $annee = '') {
$chemin = Config::get('dossierTsv').$annee.Config::get('fichiers.'.$categorie);
$table = Config::get('tables.'.$categorie);
$requete = "LOAD DATA INFILE '$chemin' ".
"REPLACE INTO TABLE $table ".
'CHARACTER SET utf8 '.
'FIELDS '.
" TERMINATED BY ';' ".
" ENCLOSED BY '' ".
" ESCAPED BY '\\\' ".
'IGNORE 1 LINES';
$this->getBdd()->requeter($requete);
}
private function genererNumNomBdtfx() {
$table = Config::get('tables.flore');
$placettes = $this->recupererTuplesPrChpCoordonnees($table);
$this->preparerTablePrCoordWgs($table);
foreach ($placettes as $placette) {
$placette = $this->transformerCoordL93enWgs84($placette);
$this->remplirChpCoordonnees($table, $placette);
}
}
private function creerVueTapir() {
$requete = "DROP VIEW IF EXISTS ifn_tapir; CREATE VIEW ifn_tapir AS ".
"SELECT f.idp as observation_id, b.nom_sci as nom_scientifique_complet, b.num_nom, ".
" fo.lieu_commune_code_insee, fo.lieu_station_latitude, fo.lieu_station_longitude,".
" 'WGS84' AS geodeticDatum, e.dateeco as observation_date, '' AS observateur_nom_complet".
" FROM `bdtfx_v2_01` b, ifn_flore f, ifn_ecologie e, ifn_placettes_foret fo".
" WHERE f.idp = e.idp".
" AND e.idp = fo.idp".
" AND b.cd_nom = f.cd_ref;";
$this->getBdd()->requeter($requete);
}
private function ajouterTupleEfloreOntologies(){ // pour la légende
$requete = "INSERT INTO `eflore_ontologies`(id,`classe_id`, `nom`, `description`, `code`, `complements`) VALUES ".
"(24,10,'IFN',".
"'données issues des données brutes mises en ligne de l\'Inventaire Forestier National',".
"'ifn','legende=#F2B148')";
$this->getBdd()->requeter($requete);
}
private function genererCoordonneesWgs($categorie) {
$table = Config::get('tables.'.$categorie);
$placettes = $this->recupererTuplesPrChpCoordonnees($table);
$this->preparerTablePrCoordWgs($table);
foreach ($placettes as $placette) {
$placette = $this->transformerCoordL93enWgs84($placette);
$this->remplirChpCoordonnees($table, $placette);
}
}
private function transformerCoordL93enWgs84($coord) {
$proj4 = new Proj4php();
$projL93 = new Proj4phpProj('EPSG:2154',$proj4);
$projWGS84 = new Proj4phpProj('EPSG:4326',$proj4);
$projLI = new Proj4phpProj('EPSG:27571',$proj4);
$projLSud = new Proj4phpProj('EPSG:27563',$proj4);
$projL72 = new Proj4phpProj('EPSG:31370',$proj4);
$pointSrc = new proj4phpPoint($coord['xl93'],$coord['yl93']);
$pointDest = $proj4->transform($projL93,$projWGS84,$pointSrc);
$coord['longitude_wgs'] = '"'.number_format($pointDest->x, 6).'"';
$coord['latitude_wgs'] = '"'.number_format($pointDest->y, 6).'"';
return $coord;
}
private function recupererTuplesPrChpCoordonnees($table) {
$requete = 'SELECT idp, xl93, yl93 '.
"FROM {$table} ";
$resultat = $this->getBdd()->recupererTous($requete);
return $resultat;
}
private function remplirChpCoordonnees($table, $placette) {
$requete = "UPDATE {$table} ".
" SET lieu_station_longitude = {$placette['longitude_wgs']} , lieu_station_latitude = {$placette['latitude_wgs']} ".
" WHERE idp = {$placette['idp']} ";
$resultat = $this->getBdd()->requeter($requete);
if ($resultat === false) {
throw new Exception("Erreur d'insertion pour le tuple $idp");
}
}
 
private function preparerTablePrCoordWgs($table) {
$requete = "SHOW COLUMNS FROM {$table} LIKE 'lieu_station_latitude' ";
$resultat = $this->getBdd()->recuperer($requete);
if ($resultat === false) {
$requete = "ALTER TABLE {$table} ".
' ADD `lieu_station_latitude` DECIMAL( 9, 6 ),'.
' ADD `lieu_station_longitude` DECIMAL( 9, 6 )';
$this->getBdd()->requeter($requete);
}
}
 
private function genererCodeInsee($categorie) {
$table = Config::get('tables.'.$categorie);
$this->preparerTablePrChpCodeInsee($table);
$liste_coordonnees = $this->recupererTuplesPrChpCodeInsee($table);
foreach ($liste_coordonnees as $coordonnees) {
$code_insee = $this->chercherCodeCommune($coordonnees['latitude'], $coordonnees['longitude']);
if ($code_insee != "") {
$this->remplirChpCodeInsee($table, $coordonnees['latitude'], $coordonnees['longitude'], $code_insee);
}
}
}
private function preparerTablePrChpCodeInsee($table) {
$requete = "SHOW COLUMNS FROM {$table} LIKE 'lieu_commune_code_insee' ";
$resultat = $this->getBdd()->recuperer($requete);
if ($resultat === false) {
$requete = "ALTER TABLE {$table} ".
' ADD `lieu_commune_code_insee` VARCHAR(5);';
$this->getBdd()->requeter($requete);
}
}
private function recupererTuplesPrChpCodeInsee($table) {
$requete = 'SELECT distinct lieu_station_latitude as latitude, lieu_station_longitude as longitude '.
"FROM {$table} WHERE lieu_commune_code_insee IS NULL ";
$resultat = $this->getBdd()->recupererTous($requete);
return $resultat;
}
private function remplirChpCodeInsee($table, $latitude, $longitude, $code_insee) {
$requete = "UPDATE {$table} ".
" SET lieu_commune_code_insee = '{$code_insee}'".
" WHERE lieu_station_longitude = {$longitude} AND lieu_station_latitude = {$latitude} ";
$resultat = $this->getBdd()->requeter($requete);
if ($resultat === false) {
throw new Exception("Erreur d'insertion pour le tuple $idp");
}
}
private function chercherCodeCommune($latitude, $longitude) {
$code_insee = '';
if ($this->testerCoordonneesWgsFrance($latitude, $longitude)) {
$url_service = "api.tela-botanica.org/service:eflore:0.1/osm/nom-commune".
"?lat={$latitude}&lon={$longitude}";
$url_service = str_replace(',', '.', $url_service);
$ch = curl_init($url_service);
curl_setopt($ch, CURLOPT_RETURNTRANSFER, true);
$reponse = curl_exec($ch);
$reponse = json_decode($reponse);
if (isset($reponse->codeINSEE)) {
$code_insee = $reponse->codeINSEE;
}
curl_close($ch);
}
return $code_insee;
}
private function testerCoordonneesWgsFrance($latitude, $longitude) {
$coord_france = false;
if ($latitude != '' && $longitude != '') {
if ($latitude < 51.071667 && $latitude > 41.316667) {
if ($longitude < 9.513333 && $longitude > -5.140278) {
$coord_france = true;
}
}
}
return $coord_france;
}
 
private function supprimerTous() {
$requete = "DROP TABLE IF EXISTS `ifn_arbres_forets`, `ifn_arbres_peupleraie`, `ifn_couverts_foret`,
`ifn_documentation`, `ifn_documentation_flore`, `ifn_ecologie`, `ifn_flore`, `ifn_placettes_foret`,
`ifn_placettes_peupleraie`;
";
$this->getBdd()->requeter($requete);
}
}
?>
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/ifn/ifn.ini
New file
0,0 → 1,35
code = "ifn"
versions = "2005,2006,2007,2008,2009,2010,2011,2012"
categories = "arbresForet,arbresPeupleraie,couvertsForet,documentation,ecologie,flore,placettesForet,placettesPeupleraie"
dossierTsv = "{ref:dossierDonneesEflore}{ref:code}/"
dossierSql = "{ref:dossierTsv}"
 
[tables]
ifnMeta = "if_meta"
documentationFlore = "ifn_documentation_flore"
arbresForet = "ifn_arbres_foret"
arbresPeupleraie = "ifn_arbres_peupleraie"
couvertsForet = "ifn_couverts_foret"
documentation = "ifn_documentation"
ecologie = "ifn_ecologie"
flore = "ifn_flore"
placettesForet = "ifn_placettes_foret"
placettesPeupleraie = "ifn_placettes_peupleraie"
ifnTest = "ifn"
 
 
[fichiers]
structureSql = "{ref:code}.sql"
arbresForet = "arbres_foret.csv"
arbresPeupleraie = "arbres_peupleraie.csv"
couvertsForet = "couverts_foret.csv"
documentation = "documentation.csv"
ecologie = "ecologie.csv"
flore = "flore.csv"
placettesForet = "placettes_foret.csv"
placettesPeupleraie = "placettes_peupleraie.csv"
documentationFlore = "documentation_flore.csv"
 
[chemins]
structureSql = "{ref:dossierSql}{ref:fichiers.structureSql}"
documentation_flore = "{ref:dossierTsv}{ref:documentation_flore}"
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/ifn/bibliotheque/proj4php/proj4php.php
New file
0,0 → 1,437
<?php
/**
* Author : Julien Moquet
*
* Simple conversion from javascript to PHP of Proj4php by Mike Adair madairATdmsolutions.ca and Richard Greenwood rich@greenwoodmap.com
*
* License: LGPL as per: http://www.gnu.org/copyleft/lesser.html
*/
$dir = dirname( __FILE__ );
 
require_once($dir . "/proj4phpProj.php");
require_once($dir . "/proj4phpCommon.php");
require_once($dir . "/proj4phpDatum.php");
require_once($dir . "/proj4phpLongLat.php");
require_once($dir . "/proj4phpPoint.php");
 
class Proj4php {
 
protected $defaultDatum = 'WGS84';
public static $ellipsoid = array( );
public static $common = null;
public static $datum = array( );
public static $defs = array( );
public static $wktProjections = array( );
public static $WGS84 = null;
public static $primeMeridian = array( );
public static $proj = array( );
/**
* Property: defsLookupService
* service to retreive projection definition parameters from
*/
public static $defsLookupService = 'http://spatialreference.org/ref';
/**
Proj4php.defs is a collection of coordinate system definition objects in the
PROJ.4 command line format.
Generally a def is added by means of a separate .js file for example:
 
<SCRIPT type="text/javascript" src="defs/EPSG26912.js"></SCRIPT>
 
def is a CS definition in PROJ.4 WKT format, for example:
+proj="tmerc" //longlat, etc.
+a=majorRadius
+b=minorRadius
+lat0=somenumber
+long=somenumber
*/
protected function initDefs() {
// These are so widely used, we'll go ahead and throw them in
// without requiring a separate .js file
self::$defs['WGS84'] = "+title=long/lat:WGS84 +proj=longlat +ellps=WGS84 +datum=WGS84 +units=degrees";
self::$defs['EPSG:4326'] = "+title=long/lat:WGS84 +proj=longlat +a=6378137.0 +b=6356752.31424518 +ellps=WGS84 +datum=WGS84 +units=degrees";
self::$defs['EPSG:4269'] = "+title=long/lat:NAD83 +proj=longlat +a=6378137.0 +b=6356752.31414036 +ellps=GRS80 +datum=NAD83 +units=degrees";
self::$defs['EPSG:3875'] = "+title= Google Mercator +proj=merc +a=6378137 +b=6378137 +lat_ts=0.0 +lon_0=0.0 +x_0=0.0 +y_0=0 +k=1.0 +units=m +nadgrids=@null +no_defs";
self::$defs['EPSG:3785'] = self::$defs['EPSG:3875'];
self::$defs['GOOGLE'] = self::$defs['EPSG:3875'];
self::$defs['EPSG:900913'] = self::$defs['EPSG:3875'];
self::$defs['EPSG:102113'] = self::$defs['EPSG:3875'];
}
 
//lookup table to go from the projection name in WKT to the Proj4php projection name
//build this out as required
protected function initWKTProjections() {
self::$wktProjections["Lambert Tangential Conformal Conic Projection"] = "lcc";
self::$wktProjections["Mercator"] = "merc";
self::$wktProjections["Mercator_1SP"] = "merc";
self::$wktProjections["Transverse_Mercator"] = "tmerc";
self::$wktProjections["Transverse Mercator"] = "tmerc";
self::$wktProjections["Lambert Azimuthal Equal Area"] = "laea";
self::$wktProjections["Universal Transverse Mercator System"] = "utm";
}
 
protected function initDatum() {
self::$datum["WGS84"] = array( 'towgs84' => "0,0,0", 'ellipse' => "WGS84", 'datumName' => "WGS84" );
self::$datum["GGRS87"] = array( 'towgs84' => "-199.87,74.79,246.62", 'ellipse' => "GRS80", 'datumName' => "Greek_Geodetic_Reference_System_1987" );
self::$datum["NAD83"] = array( 'towgs84' => "0,0,0", 'ellipse' => "GRS80", 'datumName' => "North_American_Datum_1983" );
self::$datum["NAD27"] = array( 'nadgrids' => "@conus,@alaska,@ntv2_0.gsb,@ntv1_can.dat", 'ellipse' => "clrk66", 'datumName' => "North_American_Datum_1927" );
self::$datum["potsdam"] = array( 'towgs84' => "606.0,23.0,413.0", 'ellipse' => "bessel", 'datumName' => "Potsdam Rauenberg 1950 DHDN" );
self::$datum["carthage"] = array( 'towgs84' => "-263.0,6.0,431.0", 'ellipse' => "clark80", 'datumName' => "Carthage 1934 Tunisia" );
self::$datum["hermannskogel"] = array( 'towgs84' => "653.0,-212.0,449.0", 'ellipse' => "bessel", 'datumName' => "Hermannskogel" );
self::$datum["ire65"] = array( 'towgs84' => "482.530,-130.596,564.557,-1.042,-0.214,-0.631,8.15", 'ellipse' => "mod_airy", 'datumName' => "Ireland 1965" );
self::$datum["nzgd49"] = array( 'towgs84' => "59.47,-5.04,187.44,0.47,-0.1,1.024,-4.5993", 'ellipse' => "intl", 'datumName' => "New Zealand Geodetic Datum 1949" );
self::$datum["OSGB36"] = array( 'towgs84' => "446.448,-125.157,542.060,0.1502,0.2470,0.8421,-20.4894", 'ellipse' => "airy", 'datumName' => "Airy 1830" );
}
 
protected function initEllipsoid() {
self::$ellipsoid["MERIT"] = array( 'a' => 6378137.0, 'rf' => 298.257, 'ellipseName' => "MERIT 1983" );
self::$ellipsoid["SGS85"] = array( 'a' => 6378136.0, 'rf' => 298.257, 'ellipseName' => "Soviet Geodetic System 85" );
self::$ellipsoid["GRS80"] = array( 'a' => 6378137.0, 'rf' => 298.257222101, 'ellipseName' => "GRS 1980(IUGG, 1980)" );
self::$ellipsoid["IAU76"] = array( 'a' => 6378140.0, 'rf' => 298.257, 'ellipseName' => "IAU 1976" );
self::$ellipsoid["airy"] = array( 'a' => 6377563.396, 'b' => 6356256.910, 'ellipseName' => "Airy 1830" );
self::$ellipsoid["APL4."] = array( 'a' => 6378137, 'rf' => 298.25, 'ellipseName' => "Appl. Physics. 1965" );
self::$ellipsoid["NWL9D"] = array( 'a' => 6378145.0, 'rf' => 298.25, 'ellipseName' => "Naval Weapons Lab., 1965" );
self::$ellipsoid["mod_airy"] = array( 'a' => 6377340.189, 'b' => 6356034.446, 'ellipseName' => "Modified Airy" );
self::$ellipsoid["andrae"] = array( 'a' => 6377104.43, 'rf' => 300.0, 'ellipseName' => "Andrae 1876 (Den., Iclnd.)" );
self::$ellipsoid["aust_SA"] = array( 'a' => 6378160.0, 'rf' => 298.25, 'ellipseName' => "Australian Natl & S. Amer. 1969" );
self::$ellipsoid["GRS67"] = array( 'a' => 6378160.0, 'rf' => 298.2471674270, 'ellipseName' => "GRS 67(IUGG 1967)" );
self::$ellipsoid["bessel"] = array( 'a' => 6377397.155, 'rf' => 299.1528128, 'ellipseName' => "Bessel 1841" );
self::$ellipsoid["bess_nam"] = array( 'a' => 6377483.865, 'rf' => 299.1528128, 'ellipseName' => "Bessel 1841 (Namibia)" );
self::$ellipsoid["clrk66"] = array( 'a' => 6378206.4, 'b' => 6356583.8, 'ellipseName' => "Clarke 1866" );
self::$ellipsoid["clrk80"] = array( 'a' => 6378249.145, 'rf' => 293.4663, 'ellipseName' => "Clarke 1880 mod." );
self::$ellipsoid["CPM"] = array( 'a' => 6375738.7, 'rf' => 334.29, 'ellipseName' => "Comm. des Poids et Mesures 1799" );
self::$ellipsoid["delmbr"] = array( 'a' => 6376428.0, 'rf' => 311.5, 'ellipseName' => "Delambre 1810 (Belgium)" );
self::$ellipsoid["engelis"] = array( 'a' => 6378136.05, 'rf' => 298.2566, 'ellipseName' => "Engelis 1985" );
self::$ellipsoid["evrst30"] = array( 'a' => 6377276.345, 'rf' => 300.8017, 'ellipseName' => "Everest 1830" );
self::$ellipsoid["evrst48"] = array( 'a' => 6377304.063, 'rf' => 300.8017, 'ellipseName' => "Everest 1948" );
self::$ellipsoid["evrst56"] = array( 'a' => 6377301.243, 'rf' => 300.8017, 'ellipseName' => "Everest 1956" );
self::$ellipsoid["evrst69"] = array( 'a' => 6377295.664, 'rf' => 300.8017, 'ellipseName' => "Everest 1969" );
self::$ellipsoid["evrstSS"] = array( 'a' => 6377298.556, 'rf' => 300.8017, 'ellipseName' => "Everest (Sabah & Sarawak)" );
self::$ellipsoid["fschr60"] = array( 'a' => 6378166.0, 'rf' => 298.3, 'ellipseName' => "Fischer (Mercury Datum) 1960" );
self::$ellipsoid["fschr60m"] = array( 'a' => 6378155.0, 'rf' => 298.3, 'ellipseName' => "Fischer 1960" );
self::$ellipsoid["fschr68"] = array( 'a' => 6378150.0, 'rf' => 298.3, 'ellipseName' => "Fischer 1968" );
self::$ellipsoid["helmert"] = array( 'a' => 6378200.0, 'rf' => 298.3, 'ellipseName' => "Helmert 1906" );
self::$ellipsoid["hough"] = array( 'a' => 6378270.0, 'rf' => 297.0, 'ellipseName' => "Hough" );
self::$ellipsoid["intl"] = array( 'a' => 6378388.0, 'rf' => 297.0, 'ellipseName' => "International 1909 (Hayford)" );
self::$ellipsoid["kaula"] = array( 'a' => 6378163.0, 'rf' => 298.24, 'ellipseName' => "Kaula 1961" );
self::$ellipsoid["lerch"] = array( 'a' => 6378139.0, 'rf' => 298.257, 'ellipseName' => "Lerch 1979" );
self::$ellipsoid["mprts"] = array( 'a' => 6397300.0, 'rf' => 191.0, 'ellipseName' => "Maupertius 1738" );
self::$ellipsoid["new_intl"] = array( 'a' => 6378157.5, 'b' => 6356772.2, 'ellipseName' => "New International 1967" );
self::$ellipsoid["plessis"] = array( 'a' => 6376523.0, 'rf' => 6355863.0, 'ellipseName' => "Plessis 1817 (France)" );
self::$ellipsoid["krass"] = array( 'a' => 6378245.0, 'rf' => 298.3, 'ellipseName' => "Krassovsky, 1942" );
self::$ellipsoid["SEasia"] = array( 'a' => 6378155.0, 'b' => 6356773.3205, 'ellipseName' => "Southeast Asia" );
self::$ellipsoid["walbeck"] = array( 'a' => 6376896.0, 'b' => 6355834.8467, 'ellipseName' => "Walbeck" );
self::$ellipsoid["WGS60"] = array( 'a' => 6378165.0, 'rf' => 298.3, 'ellipseName' => "WGS 60" );
self::$ellipsoid["WGS66"] = array( 'a' => 6378145.0, 'rf' => 298.25, 'ellipseName' => "WGS 66" );
self::$ellipsoid["WGS72"] = array( 'a' => 6378135.0, 'rf' => 298.26, 'ellipseName' => "WGS 72" );
self::$ellipsoid["WGS84"] = array( 'a' => 6378137.0, 'rf' => 298.257223563, 'ellipseName' => "WGS 84" );
self::$ellipsoid["sphere"] = array( 'a' => 6370997.0, 'b' => 6370997.0, 'ellipseName' => "Normal Sphere (r=6370997)" );
}
 
protected function initPrimeMeridian() {
self::$primeMeridian["greenwich"] = '0.0'; //"0dE",
self::$primeMeridian["lisbon"] = -9.131906111111; //"9d07'54.862\"W",
self::$primeMeridian["paris"] = 2.337229166667; //"2d20'14.025\"E",
self::$primeMeridian["bogota"] = -74.080916666667; //"74d04'51.3\"W",
self::$primeMeridian["madrid"] = -3.687938888889; //"3d41'16.58\"W",
self::$primeMeridian["rome"] = 12.452333333333; //"12d27'8.4\"E",
self::$primeMeridian["bern"] = 7.439583333333; //"7d26'22.5\"E",
self::$primeMeridian["jakarta"] = 106.807719444444; //"106d48'27.79\"E",
self::$primeMeridian["ferro"] = -17.666666666667; //"17d40'W",
self::$primeMeridian["brussels"] = 4.367975; //"4d22'4.71\"E",
self::$primeMeridian["stockholm"] = 18.058277777778; //"18d3'29.8\"E",
self::$primeMeridian["athens"] = 23.7163375; //"23d42'58.815\"E",
self::$primeMeridian["oslo"] = 10.722916666667; //"10d43'22.5\"E"
}
/**
*
*/
public function __construct() {
$this->initWKTProjections();
$this->initDefs();
$this->initDatum();
$this->initEllipsoid();
$this->initPrimeMeridian();
self::$proj['longlat'] = new proj4phpLongLat();
self::$proj['identity'] = new proj4phpLongLat();
self::$common = new proj4phpCommon();
self::$WGS84 = new Proj4phpProj( 'WGS84' );
}
 
/**
* Method: transform(source, dest, point)
* Transform a point coordinate from one map projection to another. This is
* really the only public method you should need to use.
*
* Parameters:
* source - {Proj4phpProj} source map projection for the transformation
* dest - {Proj4phpProj} destination map projection for the transformation
* point - {Object} point to transform, may be geodetic (long, lat) or
* projected Cartesian (x,y), but should always have x,y properties.
*/
public function transform( $source, $dest, $point ) {
if( !$source->readyToUse ) {
self::reportError( "Proj4php initialization for:" . $source->srsCode . " not yet complete" );
return $point;
}
if( !$dest->readyToUse ) {
self::reportError( "Proj4php initialization for:" . $dest->srsCode . " not yet complete" );
return $point;
}
// Workaround for datum shifts towgs84, if either source or destination projection is not wgs84
if ( isset($source->datum) && isset($dest->datum) && (
(($source->datum->datum_type == Proj4php::$common->PJD_3PARAM || $source->datum->datum_type == Proj4php::$common->PJD_7PARAM) && (isset($dest->datumCode) && $dest->datumCode != "WGS84")) ||
(($dest->datum->datum_type == Proj4php::$common->PJD_3PARAM || $dest->datum->datum_type == Proj4php::$common->PJD_7PARAM) && (isset($source->datumCode) && $source->datumCode != "WGS84")))) {
$wgs84 = Proj4php::$WGS84;
$this->transform($source, $wgs84, $point);
$source = $wgs84;
}
 
// Workaround for Spherical Mercator => skipped in proj4js 1.1.0
/*
if( ($source->srsProjNumber == "900913" && $dest->datumCode != "WGS84") ||
($dest->srsProjNumber == "900913" && $source->datumCode != "WGS84") ) {
$wgs84 = Proj4php::$WGS84; // DONT KNOW WHAT YET
$this->transform( $source, $wgs84, $point );
$source = $wgs84;
}
*/
 
// DGR, 2010/11/12
if( $source->axis != "enu" ) {
$this->adjust_axis( $source, false, $point );
}
 
// Transform source points to long/lat, if they aren't already.
if( $source->projName == "longlat" ) {
$point->x *= Proj4php::$common->D2R; // convert degrees to radians
$point->y *= Proj4php::$common->D2R;
} else {
if( isset($source->to_meter) ) {
$point->x *= $source->to_meter;
$point->y *= $source->to_meter;
}
$source->inverse( $point ); // Convert Cartesian to longlat
}
 
// Adjust for the prime meridian if necessary
if( isset( $source->from_greenwich ) ) {
$point->x += $source->from_greenwich;
}
 
// Convert datums if needed, and if possible.
$point = $this->datum_transform( $source->datum, $dest->datum, $point );
// Adjust for the prime meridian if necessary
if( isset( $dest->from_greenwich ) ) {
$point->x -= $dest->from_greenwich;
}
 
if( $dest->projName == "longlat" ) {
// convert radians to decimal degrees
$point->x *= Proj4php::$common->R2D;
$point->y *= Proj4php::$common->R2D;
} else { // else project
$dest->forward( $point );
if( isset($dest->to_meter) ) {
$point->x /= $dest->to_meter;
$point->y /= $dest->to_meter;
}
}
 
// DGR, 2010/11/12
if( $dest->axis != "enu" ) {
$this->adjust_axis( $dest, true, $point );
}
 
return $point;
}
 
/** datum_transform()
source coordinate system definition,
destination coordinate system definition,
point to transform in geodetic coordinates (long, lat, height)
*/
public function datum_transform( $source, $dest, $point ) {
// Short cut if the datums are identical.
if( $source->compare_datums( $dest ) ) {
return $point; // in this case, zero is sucess,
// whereas cs_compare_datums returns 1 to indicate TRUE
// confusing, should fix this
}
 
// Explicitly skip datum transform by setting 'datum=none' as parameter for either source or dest
if( $source->datum_type == Proj4php::$common->PJD_NODATUM
|| $dest->datum_type == Proj4php::$common->PJD_NODATUM ) {
return $point;
}
 
/*
// If this datum requires grid shifts, then apply it to geodetic coordinates.
if( $source->datum_type == Proj4php::$common->PJD_GRIDSHIFT ) {
throw(new Exception( "ERROR: Grid shift transformations are not implemented yet." ));
}
 
if( $dest->datum_type == Proj4php::$common->PJD_GRIDSHIFT ) {
throw(new Exception( "ERROR: Grid shift transformations are not implemented yet." ));
}
*/
 
// Do we need to go through geocentric coordinates?
if( $source->es != $dest->es || $source->a != $dest->a
|| $source->datum_type == Proj4php::$common->PJD_3PARAM
|| $source->datum_type == Proj4php::$common->PJD_7PARAM
|| $dest->datum_type == Proj4php::$common->PJD_3PARAM
|| $dest->datum_type == Proj4php::$common->PJD_7PARAM ) {
 
// Convert to geocentric coordinates.
$source->geodetic_to_geocentric( $point );
// CHECK_RETURN;
// Convert between datums
if( $source->datum_type == Proj4php::$common->PJD_3PARAM || $source->datum_type == Proj4php::$common->PJD_7PARAM ) {
$source->geocentric_to_wgs84( $point );
// CHECK_RETURN;
}
 
if( $dest->datum_type == Proj4php::$common->PJD_3PARAM || $dest->datum_type == Proj4php::$common->PJD_7PARAM ) {
$dest->geocentric_from_wgs84( $point );
// CHECK_RETURN;
}
 
// Convert back to geodetic coordinates
$dest->geocentric_to_geodetic( $point );
// CHECK_RETURN;
}
 
// Apply grid shift to destination if required
/*
if( $dest->datum_type == Proj4php::$common->PJD_GRIDSHIFT ) {
throw(new Exception( "ERROR: Grid shift transformations are not implemented yet." ));
// pj_apply_gridshift( pj_param(dest.params,"snadgrids").s, 1, point);
// CHECK_RETURN;
}
*/
return $point;
}
/**
* Function: adjust_axis
* Normalize or de-normalized the x/y/z axes. The normal form is "enu"
* (easting, northing, up).
* Parameters:
* crs {Proj4php.Proj} the coordinate reference system
* denorm {Boolean} when false, normalize
* point {Object} the coordinates to adjust
*/
public function adjust_axis( $crs, $denorm, $point ) {
$xin = $point->x;
$yin = $point->y;
$zin = isset( $point->z ) ? $point->z : 0.0;
#$v;
#$t;
for( $i = 0; $i < 3; $i++ ) {
if( $denorm && $i == 2 && !isset( $point->z ) ) {
continue;
}
if( $i == 0 ) {
$v = $xin;
$t = 'x';
} else if( $i == 1 ) {
$v = $yin;
$t = 'y';
} else {
$v = $zin;
$t = 'z';
}
switch( $crs->axis[$i] ) {
case 'e':
$point[$t] = $v;
break;
case 'w':
$point[$t] = -$v;
break;
case 'n':
$point[$t] = $v;
break;
case 's':
$point[$t] = -$v;
break;
case 'u':
if( isset( $point[$t] ) ) {
$point->z = $v;
}
break;
case 'd':
if( isset( $point[$t] ) ) {
$point->z = -$v;
}
break;
default :
throw(new Exception( "ERROR: unknow axis (" . $crs->axis[$i] . ") - check definition of " . $crs->projName ));
return null;
}
}
return $point;
}
 
/**
* Function: reportError
* An internal method to report errors back to user.
* Override this in applications to report error messages or throw exceptions.
*/
public static function reportError( $msg ) {
//console.log(msg);
echo $msg . "<br />\n";
}
 
/**
* Function : loadScript
* adapted from original. PHP is simplier.
*/
public static function loadScript( $filename, $onload = null, $onfail = null, $loadCheck = null ) {
if( stripos($filename, 'http://') !== false ) {
return @file_get_contents($filename);
}
elseif( file_exists( $filename ) ) {
require_once($filename);
return true;
}
else {
throw(new Exception( "File $filename could not be found or was not able to be loaded." ));
return false;
}
}
 
/**
* Function: extend
* Copy all properties of a source object to a destination object. Modifies
* the passed in destination object. Any properties on the source object
* that are set to undefined will not be (re)set on the destination object.
*
* Parameters:
* destination - {Object} The object that will be modified
* source - {Object} The object with properties to be set on the destination
*
* Returns:
* {Object} The destination object.
*/
public static function extend( $destination, $source ) {
if( $source != null )
foreach( $source as $key => $value ) {
$destination->$key = $value;
}
return $destination;
}
 
}
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/ifn/bibliotheque/proj4php/proj4phpLongLat.php
New file
0,0 → 1,23
<?php
/**
* Author : Julien Moquet
*
* Inspired by Proj4js from Mike Adair madairATdmsolutions.ca
* and Richard Greenwood rich@greenwoodmap.com
* License: LGPL as per: http://www.gnu.org/copyleft/lesser.html
*/
class proj4phpLongLat {
 
public function init() {
}
 
public function forward( $pt ) {
return $pt;
}
 
public function inverse( $pt ) {
return $pt;
}
 
}
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/ifn/bibliotheque/proj4php/defs/EPSG27571.php
New file
0,0 → 1,2
<?php
Proj4php::$defs["EPSG:27571"] = "+proj=lcc +lat_1=49.50000000000001 +lat_0=49.50000000000001 +lon_0=0 +k_0=0.999877341 +x_0=600000 +y_0=1200000 +a=6378249.2 +b=6356515 +towgs84=-168,-60,320,0,0,0,0 +pm=paris +units=m +no_defs";
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/ifn/bibliotheque/proj4php/defs/EPSG31468.php
New file
0,0 → 1,2
<?php
Proj4php::$defs["EPSG:31468"] = "+proj=tmerc +lat_0=0 +lon_0=12 +k=1.000000 +x_0=4500000 +y_0=0 +ellps=bessel +datum=potsdam +units=m +no_defs";
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/ifn/bibliotheque/proj4php/defs/EPSG26591.php
New file
0,0 → 1,2
<?php
Proj4php::$defs["EPSG:26591"] = "+title= Monte Mario (Rome) / Italy zone 1 EPSG:26591 +proj=tmerc +lat_0=0 +lon_0=-3.45233333333333 +from_greenwich=12.45233333333333 +k=0.999600 +x_0=1500000 +y_0=0 +a=6378388.0, +b=6356911.94612795 +units=m";
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/ifn/bibliotheque/proj4php/defs/EPSG27563.php
New file
0,0 → 1,2
<?php
Proj4php::$defs["EPSG:27563"]="+title=NTF (Paris)/Lambert Sud France +proj=lcc +lat_1=44.10000000000001 +lat_0=44.10000000000001 +lon_0=0 +k_0=0.9998774990000001 +x_0=600000 +y_0=200000 +a=6378249.2 +b=6356515 +towgs84=-168,-60,320,0,0,0,0 +pm=paris +units=m +no_defs ";
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/ifn/bibliotheque/proj4php/defs/EPSG4302.php
New file
0,0 → 1,3
<?php
Proj4php::$defs["EPSG:4302"] = "+title=Trinidad 1903 EPSG:4302 (7 param datum shift) +proj=longlat +a=6378293.63683822 +b=6356617.979337744 +towgs84=-61.702,284.488,472.052,0,0,0,0";
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/ifn/bibliotheque/proj4php/defs/EPSG2154.php
New file
0,0 → 1,2
<?php
Proj4php::$defs["EPSG:2154"] = "+proj=lcc +lat_1=49 +lat_2=44 +lat_0=46.5 +lon_0=3 +x_0=700000 +y_0=6600000 +ellps=GRS80 +towgs84=0,0,0,0,0,0,0 +units=m +no_defs";
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/ifn/bibliotheque/proj4php/defs/EPSG900913.txt
New file
0,0 → 1,11
// Google Mercator projection
// Used in combination with GoogleMercator layer type in OpenLayers
//+proj=merc +a=6378137 +b=6378137 +lat_ts=0.0 +lon_0=0.0 +x_0=0.0 +y_0=0 +k=1.0 +units=m +nadgrids=@null +no_defs
 
csList.EPSG900913= "\
+title= Google Mercator EPSG:900913\
+proj=merc +a=6378137 +b=6378137 \
+lat_ts=0.0 +lon_0=0.0 \
+x_0=0.0 +y_0=0 +k=1.0 \
+units=m +nadgrids=@null +no_defs \
";
Property changes:
Added: svn:eol-style
+native
\ No newline at end of property
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/ifn/bibliotheque/proj4php/defs/EPSG4181.php
New file
0,0 → 1,2
<?php
Proj4php::$defs["EPSG:4181"] = "+title=Luxembourg 1930 EPSG:4181 (7 param datum shift) +proj=longlat +towgs84=-193,13.7,-39.3,-0.41,-2.933,2.688,0.43 +a=6378388.0, +b=6356911.94612795";
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/ifn/bibliotheque/proj4php/defs/GOOGLE.php
New file
0,0 → 1,3
<?php
Proj4php::$defs["GOOGLE"]="+proj=merc +a=6378137 +b=6378137 +lat_ts=0.0 +lon_0=0.0 +x_0=0.0 +y_0=0 +k=1.0 +units=m +nadgrids=@null +no_defs";
Proj4php::$defs["EPSG:900913"]=Proj4php::$defs["GOOGLE"];
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/ifn/bibliotheque/proj4php/defs/EPSG4272.php
New file
0,0 → 1,2
<?php
Proj4php::$defs["EPSG:4272"] = "+title=NZGD49 +proj=longlat +ellps=intl +datum=nzgd49 +no_defs ";
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/ifn/bibliotheque/proj4php/defs/EPSG4139.php
New file
0,0 → 1,2
<?php
Proj4php::$defs["EPSG:4139"] = "+title=Puerto Rico EPSG:4139 (3 param datum shift) +proj=longlat +towgs84 = 11,72,-101,0,0,0,0 +a=6378206.4 +b=6356583.8";
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/ifn/bibliotheque/proj4php/defs/EPSG41001.php
New file
0,0 → 1,2
<?php
Proj4php::$defs["EPSG:41001"] = "+title=simple mercator EPSG:41001 +proj=merc +lat_ts=0 +lon_0=0 +k=1.000000 +x_0=0 +y_0=0 +ellps=WGS84 +datum=WGS84 +units=m";
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/ifn/bibliotheque/proj4php/defs/EPSG102757.php
New file
0,0 → 1,2
<?php
Proj4php::$defs["EPSG:102757"] = "+title=NAD 1983 StatePlane Wyoming West Central FIPS 4903 Feet +proj=tmerc +lat_0=40.5 +lon_0=-108.75 +x_0=600000.0 +y_0=0 +k=0.999938 +a=6378137.0 +b=6356752.3141403 +to_meter=0.3048006096012192";
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/ifn/bibliotheque/proj4php/defs/EPSG900913.php
New file
0,0 → 1,6
<?php
// Google Mercator projection
// Used in combination with GoogleMercator layer type in OpenLayers
//+proj=merc +a=6378137 +b=6378137 +lat_ts=0.0 +lon_0=0.0 +x_0=0.0 +y_0=0 +k=1.0 +units=m +nadgrids=@null +no_defs
 
Proj4php::$defs["EPSG:900913"]= "+title= Google Mercator EPSG:900913 +proj=merc +a=6378137 +b=6378137 +lat_ts=0.0 +lon_0=0.0 +x_0=0.0 +y_0=0 +k=1.0 +units=m +nadgrids=@null +no_defs";
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/ifn/bibliotheque/proj4php/defs/EPSG102758.php
New file
0,0 → 1,2
<?php
Proj4php::$defs["EPSG:102758"] = "+title=NAD 1983 StatePlane Wyoming West FIPS 4904 Feet +proj=tmerc +lat_0=40.5 +lon_0=-110.0833333333333 +x_0=800000 +y_0=100000 +k=0.999938 +a=6378137.0 +b=6356752.3141403 +to_meter=0.3048006096012192";
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/ifn/bibliotheque/proj4php/defs/EPSG27200.php
New file
0,0 → 1,2
<?php
Proj4php::$defs["EPSG:27200"] = "+title=New Zealand Map Grid +proj=nzmg +lat_0=-41 +lon_0=173 +x_0=2510000 +y_0=6023150 +ellps=intl +datum=nzgd49 +units=m +no_defs";
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/ifn/bibliotheque/proj4php/defs/EPSG42304.php
New file
0,0 → 1,2
<?php
Proj4php::$defs["EPSG:42304"]="+title=Atlas of Canada, LCC +proj=lcc +lat_1=49 +lat_2=77 +lat_0=49 +lon_0=-95 +x_0=0 +y_0=0 +ellps=GRS80 +datum=NAD83 +units=m +no_defs";
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/ifn/bibliotheque/proj4php/defs/EPSG31370.php
New file
0,0 → 1,2
<?php
Proj4php::$defs["EPSG:31370"] = "+proj=lcc +lat_1=51.16666723333333 +lat_2=49.8333339 +lat_0=90 +lon_0=4.367486666666666 +x_0=150000.013 +y_0=5400088.438 +ellps=intl +towgs84=106.869,-52.2978,103.724,-0.33657,0.456955,-1.84218,1 +units=m +no_defs";
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/ifn/bibliotheque/proj4php/defs/EPSG21781.php
New file
0,0 → 1,2
<?php
Proj4php::$defs["EPSG:21781"] = "+title=CH1903 / LV03 +proj=somerc +lat_0=46.95240555555556 +lon_0=7.439583333333333 +x_0=600000 +y_0=200000 +ellps=bessel +towgs84=674.374,15.056,405.346,0,0,0,0 +units=m +no_defs";
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/ifn/bibliotheque/proj4php/defs/EPSG25832.php
New file
0,0 → 1,2
<?php
Proj4php::$defs["EPSG:25832"] = "+proj=utm +zone=32 +ellps=GRS80 +units=m +no_defs";
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/ifn/bibliotheque/proj4php/defs/EPSG26912.php
New file
0,0 → 1,2
<?php
Proj4php::$defs["EPSG26912"] = "+title=NAD83 / UTM zone 12N +proj=utm +zone=12 +a=6378137.0 +b=6356752.3141403";
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/ifn/bibliotheque/proj4php/defs/EPSG31467.php
New file
0,0 → 1,2
<?php
Proj4php::$defs["EPSG:31467"] = "+proj=tmerc +lat_0=0 +lon_0=9 +k=1.000000 +x_0=3500000 +y_0=0 +ellps=bessel +datum=potsdam +units=m +no_defs";
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/ifn/bibliotheque/proj4php/WSProj4PHP_1.0.php
New file
0,0 → 1,104
<?php
 
include_once("proj4php.php");
 
$error = false;
 
/**
* Geometry-Points
*/
if( isset( $_GET['GEOM'] ) ) {
list($x, $y) = explode( ' ', $_GET['GEOM'] );
} else {
if( isset( $_GET['x'] ) ) {
$x = $_GET['x'];
}
else
$error = true;
 
if( isset( $_GET['y'] ) ) {
$y = $_GET['y'];
}
else
$error = true;
}
 
/**
* Source-CRS
*/
if( isset( $_GET['SOURCECRS'] ) ) {
$srcProjection = str_replace( '::', ':', $_GET['SOURCECRS'] );
} else if( isset( $_GET['projectionxy'] ) ) {
$srcProjection = $_GET['projectionxy'];
$srcProjection = str_replace( '::', ':', $srcProjection );
}
else
$srcProjection = 'EPSG:2154';
 
/**
* Target-CRS
*/
if( isset( $_GET['TARGETCRS'] ) ) {
$tgtProjection = str_replace( '::', ':', $_GET['TARGETCRS'] );
} else if( isset( $_GET['projection'] ) ) {
$tgtProjection = $_GET['projection'];
$tgtProjection = str_replace( '::', ':', $tgtProjection );
}
else
$tgtProjection = 'EPSG:4326';
 
/**
* Format
*/
if( isset( $_GET['format'] ) ) {
$format = $_GET['format'];
if( !($format == 'xml' || $format == 'json') )
$error = true;
}
else
$format = 'xml';
 
 
$proj4 = new Proj4php();
$projsource = new Proj4phpProj( $srcProjection, $proj4 );
$projdest = new Proj4phpProj( $tgtProjection, $proj4 );
 
// check the projections
if( Proj4php::$defs[$srcProjection] == Proj4php::$defs['WGS84'] && $srcProjection != 'EPSG:4326' )
$error = true;
if( Proj4php::$defs[$tgtProjection] == Proj4php::$defs['WGS84'] && $tgtProjection != 'EPSG:4326' )
$error = true;
 
if( $error === true ) {
if( $format == 'json' ) {
echo "{\"status\":\"error\", \"erreur\": {\"code\": 2, \"message\": \"Wrong parameters.\"} }";
exit;
} else {
echo "<reponse>";
echo " <erreur>";
echo " <code>2</code>";
echo " <message>Wrong parameters</message>";
echo " </erreur>";
echo "</reponse>";
exit;
}
}
 
$pointSrc = new proj4phpPoint( $x, $y );
$pointDest = $proj4->transform( $projsource, $projdest, $pointSrc );
 
$tgtProjection = str_replace( ':', '::', $tgtProjection );
 
if( $format == 'json' ) {
echo "{\"status\" :\"success\", \"point\" : {\"x\":" . $pointDest->x . ", \"y\":" . $pointDest->y . ",\"projection\" :\"" . $tgtProjection . "\"}}";
exit;
} else {
header ("Content-Type:text/xml");
echo "<reponse>";
echo "<point>";
echo "<x>" . $pointDest->x . "</x>";
echo "<y>" . $pointDest->y . "</y>";
echo "<projection>" . $tgtProjection . "</projection>";
echo "</point>";
echo "</reponse>";
}
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/ifn/bibliotheque/proj4php/proj4phpCommon.php
New file
0,0 → 1,389
<?php
 
/**
* Author : Julien Moquet
*
* Inspired by Proj4js from Mike Adair madairATdmsolutions.ca
* and Richard Greenwood rich@greenwoodmap.com
* License: LGPL as per: http://www.gnu.org/copyleft/lesser.html
*/
class Proj4phpCommon {
 
public $PI = M_PI; #3.141592653589793238; //Math.PI,
public $HALF_PI = M_PI_2; #1.570796326794896619; //Math.PI*0.5,
public $TWO_PI = 6.283185307179586477; //Math.PI*2,
public $FORTPI = 0.78539816339744833;
public $R2D = 57.29577951308232088;
public $D2R = 0.01745329251994329577;
public $SEC_TO_RAD = 4.84813681109535993589914102357e-6; /* SEC_TO_RAD = Pi/180/3600 */
public $EPSLN = 1.0e-10;
public $MAX_ITER = 20;
// following constants from geocent.c
public $COS_67P5 = 0.38268343236508977; /* cosine of 67.5 degrees */
public $AD_C = 1.0026000; /* Toms region 1 constant */
 
/* datum_type values */
public $PJD_UNKNOWN = 0;
public $PJD_3PARAM = 1;
public $PJD_7PARAM = 2;
public $PJD_GRIDSHIFT = 3;
public $PJD_WGS84 = 4; // WGS84 or equivalent
public $PJD_NODATUM = 5; // WGS84 or equivalent
 
const SRS_WGS84_SEMIMAJOR = 6378137.0; // only used in grid shift transforms
 
// ellipoid pj_set_ell.c
 
public $SIXTH = .1666666666666666667; /* 1/6 */
public $RA4 = .04722222222222222222; /* 17/360 */
public $RA6 = .02215608465608465608; /* 67/3024 */
public $RV4 = .06944444444444444444; /* 5/72 */
public $RV6 = .04243827160493827160; /* 55/1296 */
 
 
/* meridinal distance for ellipsoid and inverse
* * 8th degree - accurate to < 1e-5 meters when used in conjuction
* * with typical major axis values.
* * Inverse determines phi to EPS (1e-11) radians, about 1e-6 seconds.
*/
protected $C00 = 1.0;
protected $C02 = .25;
protected $C04 = .046875;
protected $C06 = .01953125;
protected $C08 = .01068115234375;
protected $C22 = .75;
protected $C44 = .46875;
protected $C46 = .01302083333333333333;
protected $C48 = .00712076822916666666;
protected $C66 = .36458333333333333333;
protected $C68 = .00569661458333333333;
protected $C88 = .3076171875;
 
/**
* Function to compute the constant small m which is the radius of
* a parallel of latitude, phi, divided by the semimajor axis.
*
* @param type $eccent
* @param type $sinphi
* @param type $cosphi
* @return type
*/
public function msfnz( $eccent, $sinphi, $cosphi ) {
$con = $eccent * $sinphi;
return $cosphi / (sqrt( 1.0 - $con * $con ));
}
 
/**
* Function to compute the constant small t for use in the forward
* computations in the Lambert Conformal Conic and the Polar
* Stereographic projections.
*
* @param type $eccent
* @param type $phi
* @param type $sinphi
* @return type
*/
public function tsfnz( $eccent, $phi, $sinphi ) {
$con = $eccent * $sinphi;
$com = 0.5 * $eccent;
$con = pow( ((1.0 - $con) / (1.0 + $con) ), $com );
return (tan( .5 * (M_PI_2 - $phi) ) / $con);
}
 
/**
* Function to compute the latitude angle, phi2, for the inverse of the
* Lambert Conformal Conic and Polar Stereographic projections.
*
* rise up an assertion if there is no convergence.
*
* @param type $eccent
* @param type $ts
* @return type
*/
public function phi2z( $eccent, $ts ) {
$eccnth = .5 * $eccent;
$phi = M_PI_2 - 2 * atan( $ts );
for( $i = 0; $i <= 15; $i++ ) {
$con = $eccent * sin( $phi );
$dphi = M_PI_2 - 2 * atan( $ts * (pow( ((1.0 - $con) / (1.0 + $con) ), $eccnth )) ) - $phi;
$phi += $dphi;
if( abs( $dphi ) <= .0000000001 )
return $phi;
}
assert( "false; /* phi2z has NoConvergence */" );
return (-9999);
}
 
/**
* Function to compute constant small q which is the radius of a
* parallel of latitude, phi, divided by the semimajor axis.
*
* @param type $eccent
* @param type $sinphi
* @return type
*/
public function qsfnz( $eccent, $sinphi ) {
if( $eccent > 1.0e-7 ) {
$con = $eccent * $sinphi;
return (( 1.0 - $eccent * $eccent) * ($sinphi / (1.0 - $con * $con) - (.5 / $eccent) * log( (1.0 - $con) / (1.0 + $con) )));
}
return (2.0 * $sinphi);
}
 
/**
* Function to eliminate roundoff errors in asin
*
* @param type $x
* @return type
*/
public function asinz( $x ) {
return asin(
abs( $x ) > 1.0 ? ($x > 1.0 ? 1.0 : -1.0) : $x
);
#if( abs( $x ) > 1.0 ) {
# $x = ($x > 1.0) ? 1.0 : -1.0;
#}
#return asin( $x );
}
 
/**
* following functions from gctpc cproj.c for transverse mercator projections
*
* @param type $x
* @return type
*/
public function e0fn( $x ) {
return (1.0 - 0.25 * $x * (1.0 + $x / 16.0 * (3.0 + 1.25 * $x)));
}
 
/**
*
* @param type $x
* @return type
*/
public function e1fn( $x ) {
return (0.375 * $x * (1.0 + 0.25 * $x * (1.0 + 0.46875 * $x)));
}
 
/**
*
* @param type $x
* @return type
*/
public function e2fn( $x ) {
return (0.05859375 * $x * $x * (1.0 + 0.75 * $x));
}
 
/**
*
* @param type $x
* @return type
*/
public function e3fn( $x ) {
return ($x * $x * $x * (35.0 / 3072.0));
}
 
/**
*
* @param type $e0
* @param type $e1
* @param type $e2
* @param type $e3
* @param type $phi
* @return type
*/
public function mlfn( $e0, $e1, $e2, $e3, $phi ) {
return ($e0 * $phi - $e1 * sin( 2.0 * $phi ) + $e2 * sin( 4.0 * $phi ) - $e3 * sin( 6.0 * $phi ));
}
 
/**
*
* @param type $esinp
* @param type $exp
* @return type
*/
public function srat( $esinp, $exp ) {
return (pow( (1.0 - $esinp) / (1.0 + $esinp), $exp ));
}
 
/**
* Function to return the sign of an argument
*
* @param type $x
* @return type
*/
public function sign( $x ) {
return $x < 0.0 ? -1 : 1;
}
 
/**
* Function to adjust longitude to -180 to 180; input in radians
*
* @param type $x
* @return type
*/
public function adjust_lon( $x ) {
return (abs( $x ) < M_PI) ? $x : ($x - ($this->sign( $x ) * $this->TWO_PI) );
}
 
/**
* IGNF - DGR : algorithms used by IGN France
* Function to adjust latitude to -90 to 90; input in radians
*
* @param type $x
* @return type
*/
public function adjust_lat( $x ) {
$x = (abs( $x ) < M_PI_2) ? $x : ($x - ($this->sign( $x ) * M_PI) );
return $x;
}
 
/**
* Latitude Isometrique - close to tsfnz ...
*
* @param type $eccent
* @param float $phi
* @param type $sinphi
* @return string
*/
public function latiso( $eccent, $phi, $sinphi ) {
if( abs( $phi ) > M_PI_2 )
return +NaN;
if( $phi == M_PI_2 )
return INF;
if( $phi == -1.0 * M_PI_2 )
return -1.0 * INF;
 
$con = $eccent * $sinphi;
return log( tan( (M_PI_2 + $phi) / 2.0 ) ) + $eccent * log( (1.0 - $con) / (1.0 + $con) ) / 2.0;
}
 
/**
*
* @param type $x
* @param type $L
* @return type
*/
public function fL( $x, $L ) {
return 2.0 * atan( $x * exp( $L ) ) - M_PI_2;
}
 
/**
* Inverse Latitude Isometrique - close to ph2z
*
* @param type $eccent
* @param type $ts
* @return type
*/
public function invlatiso( $eccent, $ts ) {
$phi = $this->fL( 1.0, $ts );
$Iphi = 0.0;
$con = 0.0;
do {
$Iphi = $phi;
$con = $eccent * sin( $Iphi );
$phi = $this->fL( exp( $eccent * log( (1.0 + $con) / (1.0 - $con) ) / 2.0 ), $ts );
} while( abs( $phi - $Iphi ) > 1.0e-12 );
return $phi;
}
 
/**
* Grande Normale
*
* @param type $a
* @param type $e
* @param type $sinphi
* @return type
*/
public function gN( $a, $e, $sinphi ) {
$temp = $e * $sinphi;
return $a / sqrt( 1.0 - $temp * $temp );
}
 
/**
* code from the PROJ.4 pj_mlfn.c file; this may be useful for other projections
*
* @param type $es
* @return type
*/
public function pj_enfn( $es ) {
 
$en = array( );
$en[0] = $this->C00 - $es * ($this->C02 + $es * ($this->C04 + $es * ($this->C06 + $es * $this->C08)));
$en[1] = es * ($this->C22 - $es * ($this->C04 + $es * ($this->C06 + $es * $this->C08)));
$t = $es * $es;
$en[2] = $t * ($this->C44 - $es * ($this->C46 + $es * $this->C48));
$t *= $es;
$en[3] = $t * ($this->C66 - $es * $this->C68);
$en[4] = $t * $es * $this->C88;
return $en;
}
 
/**
*
* @param type $phi
* @param type $sphi
* @param type $cphi
* @param type $en
* @return type
*/
public function pj_mlfn( $phi, $sphi, $cphi, $en ) {
$cphi *= $sphi;
$sphi *= $sphi;
return ($en[0] * $phi - $cphi * ($en[1] + $sphi * ($en[2] + $sphi * ($en[3] + $sphi * $en[4]))));
}
 
/**
*
* @param type $arg
* @param type $es
* @param type $en
* @return type
*/
public function pj_inv_mlfn( $arg, $es, $en ) {
$k = (float) 1 / (1 - $es);
$phi = $arg;
for( $i = Proj4php::$common->MAX_ITER; $i; --$i ) { /* rarely goes over 2 iterations */
$s = sin( $phi );
$t = 1. - $es * $s * $s;
//$t = $this->pj_mlfn($phi, $s, cos($phi), $en) - $arg;
//$phi -= $t * ($t * sqrt($t)) * $k;
$t = ($this->pj_mlfn( $phi, $s, cos( $phi ), $en ) - $arg) * ($t * sqrt( $t )) * $k;
$phi -= $t;
if( abs( $t ) < Proj4php::$common->EPSLN )
return $phi;
}
 
Proj4php::reportError( "cass:pj_inv_mlfn: Convergence error" );
 
return $phi;
}
 
}
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/ifn/bibliotheque/proj4php/projCode/eqdc.php
New file
0,0 → 1,152
<?php
/**
* Author : Julien Moquet
*
* Inspired by Proj4php from Mike Adair madairATdmsolutions.ca
* and Richard Greenwood rich@greenwoodma$p->com
* License: LGPL as per: http://www.gnu.org/copyleft/lesser.html
*/
/*******************************************************************************
NAME EQUIDISTANT CONIC
 
PURPOSE: Transforms input longitude and latitude to Easting and Northing
for the Equidistant Conic projection. The longitude and
latitude must be in radians. The Easting and Northing values
will be returned in meters.
 
PROGRAMMER DATE
---------- ----
T. Mittan Mar, 1993
 
ALGORITHM REFERENCES
 
1. Snyder, John $p->, "Map Projections--A Working Manual", U.S. Geological
Survey Professional Paper 1395 (Supersedes USGS Bulletin 1532), United
State Government Printing Office, Washington D.C., 1987.
 
2. Snyder, John $p-> and Voxland, Philip M., "An Album of Map Projections",
U.S. Geological Survey Professional Paper 1453 , United State Government
Printing Office, Washington D.C., 1989.
*******************************************************************************/
 
/* Variables common to all subroutines in this code file
-----------------------------------------------------*/
 
class Proj4phpProjEqdc {
/* Initialize the Equidistant Conic projection
------------------------------------------ */
public function init() {
/* Place parameters in static storage for common use
------------------------------------------------- */
if( !$this->mode )
$this->mode = 0; //chosen default mode
$this->temp = $this->b / $this->a;
$this->es = 1.0 - pow( $this->temp, 2 );
$this->e = sqrt( $this->es );
$this->e0 = Proj4php::$common->e0fn( $this->es );
$this->e1 = Proj4php::$common->e1fn( $this->es );
$this->e2 = Proj4php::$common->e2fn( $this->es );
$this->e3 = Proj4php::$common->e3fn( $this->es );
 
$this->sinphi = sin( $this->lat1 );
$this->cosphi = cos( $this->lat1 );
 
$this->ms1 = Proj4php::$common->msfnz( $this->e, $this->sinphi, $this->cosphi );
$this->ml1 = Proj4php::$common->mlfn( $this->e0, $this->e1, $this->e2, $this->e3, $this->lat1 );
 
/* format B
--------- */
if( $this->mode != 0 ) {
if( abs( $this->lat1 + $this->lat2 ) < Proj4php::$common->EPSLN ) {
Proj4php::reportError( "eqdc:Init:EqualLatitudes" );
//return(81);
}
$this->sinphi = sin( $this->lat2 );
$this->cosphi = cos( $this->lat2 );
 
$this->ms2 = Proj4php::$common->msfnz( $this->e, $this->sinphi, $this->cosphi );
$this->ml2 = Proj4php::$common->mlfn( $this->e0, $this->e1, $this->e2, $this->e3, $this->lat2 );
if( abs( $this->lat1 - $this->lat2 ) >= Proj4php::$common->EPSLN ) {
$this->ns = ($this->ms1 - $this->ms2) / ($this->ml2 - $this->ml1);
} else {
$this->ns = $this->sinphi;
}
} else {
$this->ns = $this->sinphi;
}
$this->g = $this->ml1 + $this->ms1 / $this->ns;
$this->ml0 = Proj4php::$common->mlfn( $this->e0, $this->e1, $this->e2, $this->e3, $this->lat0 );
$this->rh = $this->a * ($this->g - $this->ml0);
}
 
/* Equidistant Conic forward equations--mapping lat,long to x,y
----------------------------------------------------------- */
public function forward( $p ) {
$lon = $p->x;
$lat = $p->y;
 
/* Forward equations
----------------- */
$ml = Proj4php::$common->mlfn( $this->e0, $this->e1, $this->e2, $this->e3, $lat );
$rh1 = $this->a * ($this->g - $ml);
$theta = $this->ns * Proj4php::$common->adjust_lon( $lon - $this->long0 );
 
$x = $this->x0 + $rh1 * sin( $theta );
$y = $this->y0 + $this->rh - $rh1 * cos( $theta );
$p->x = $x;
$p->y = $y;
return $p;
}
 
/* Inverse equations
----------------- */
public function inverse( $p ) {
$p->x -= $this->x0;
$p->y = $this->rh - $p->y + $this->y0;
if( $this->ns >= 0 ) {
$rh1 = sqrt( $p->x * $p->x + $p->y * $p->y );
$con = 1.0;
} else {
$rh1 = -sqrt( $p->x * $p->x + $p->y * $p->y );
$con = -1.0;
}
$theta = 0.0;
if( $rh1 != 0.0 )
$theta = atan2( $con * $p->x, $con * $p->y );
$ml = $this->g - $rh1 / $this->a;
$lat = $this->phi3z( $ml, $this->e0, $this->e1, $this->e2, $this->e3 );
$lon = Proj4php::$common->adjust_lon( $this->long0 + $theta / $this->ns );
 
$p->x = $lon;
$p->y = $lat;
return $p;
}
 
/* Function to compute latitude, phi3, for the inverse of the Equidistant
Conic projection.
----------------------------------------------------------------- */
 
public function phi3z( $ml, $e0, $e1, $e2, $e3 ) {
 
$phi = $ml;
for( $i = 0; $i < 15; $i++ ) {
$dphi = ($ml + $e1 * sin( 2.0 * $phi ) - $e2 * sin( 4.0 * $phi ) + $e3 * sin( 6.0 * $phi )) / $e0 - $phi;
$phi += $dphi;
if( abs( $dphi ) <= .0000000001 ) {
return $phi;
}
}
Proj4php::reportError( "PHI3Z-CONV:Latitude failed to converge after 15 iterations" );
return null;
}
}
 
Proj4php::$proj['eqdc'] = new Proj4phpProjEqdc();
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/ifn/bibliotheque/proj4php/projCode/sinu.php
New file
0,0 → 1,139
<?php
/**
* Author : Julien Moquet
*
* Inspired by Proj4php from Mike Adair madairATdmsolutions.ca
* and Richard Greenwood rich@greenwoodma$p->com
* License: LGPL as per: http://www.gnu.org/copyleft/lesser.html
*/
/*******************************************************************************
NAME SINUSOIDAL
 
PURPOSE: Transforms input longitude and latitude to Easting and
Northing for the Sinusoidal projection. The
longitude and latitude must be in radians. The Easting
and Northing values will be returned in meters.
 
PROGRAMMER DATE
---------- ----
D. Steinwand, EROS May, 1991
 
This function was adapted from the Sinusoidal projection code (FORTRAN) in the
General Cartographic Transformation Package software which is available from
the U.S. Geological Survey National Mapping Division.
 
ALGORITHM REFERENCES
 
1. Snyder, John P., "Map Projections--A Working Manual", U.S. Geological
Survey Professional Paper 1395 (Supersedes USGS Bulletin 1532), United
State Government Printing Office, Washington D.C., 1987.
 
2. "Software Documentation for GCTP General Cartographic Transformation
Package", U.S. Geological Survey National Mapping Division, May 1982.
* ***************************************************************************** */
 
class Proj4phpProjSinu {
/* Initialize the Sinusoidal projection
------------------------------------ */
public function init() {
/* Place parameters in static storage for common use
------------------------------------------------- */
#$this->R = 6370997.0; //Radius of earth
 
if( !$this->sphere ) {
$this->en = Proj4php::$common->pj_enfn( $this->es );
} else {
$this->n = 1.;
$this->m = 0.;
$this->es = 0;
$this->C_y = sqrt( ($this->m + 1.) / $this->n );
$this->C_x = $this->C_y / ($this->m + 1.);
}
}
 
/* Sinusoidal forward equations--mapping lat,long to x,y
----------------------------------------------------- */
public function forward( $p ) {
 
#$x,y,delta_lon;
$lon = $p->x;
$lat = $p->y;
 
/* Forward equations
----------------- */
$lon = Proj4php::$common->adjust_lon( $lon - $this->long0 );
if( isset($this->sphere) ) {
if( !$this->m ) {
$lat = $this->n != 1. ? asin( $this->n * sin( $lat ) ) : $lat;
} else {
$k = $this->n * sin( $lat );
for( $i = Proj4php::$common->MAX_ITER; $i; --$i ) {
$V = ($this->m * $lat + sin( $lat ) - $k) / ($this->m + cos( $lat ));
$lat -= $V;
if( abs( $V ) < Proj4php::$common->EPSLN )
break;
}
}
$x = $this->a * $this->C_x * $lon * ($this->m + cos( $lat ));
$y = $this->a * $this->C_y * $lat;
} else {
 
$s = sin( $lat );
$c = cos( $lat );
$y = $this->a * Proj4php::$common->pj_mlfn( $lat, $s, $c, $this->en );
$x = $this->a * $lon * $c / sqrt( 1. - $this->es * $s * $s );
}
 
$p->x = $x;
$p->y = $y;
 
return $p;
}
 
/**
*
* @param type $p
* @return type
*/
public function inverse( $p ) {
#$lat;
#$temp;
#$lon;
 
/* Inverse equations
----------------- */
$p->x -= $this->x0;
$p->y -= $this->y0;
$lat = $p->y / $this->a;
 
if( isset($this->sphere) ) {
 
$p->y /= $this->C_y;
$lat = $this->m ? asin( ($this->m * $p->y + sin( $p->y )) / $this->n ) : ( $this->n != 1. ? asin( sin( $p->y ) / $this->n ) : $p->y );
$lon = $p->x / ($this->C_x * ($this->m + cos( $p->y )));
}
else {
$lat = Proj4php::$common->pj_inv_mlfn( $p->y / $this->a, $this->es, $this->en );
$s = abs( $lat );
if( $s < Proj4php::$common->HALF_PI ) {
$s = sin( $lat );
$temp = $this->long0 + $p->x * sqrt( 1. - $this->es * $s * $s ) / ($this->a * cos( $lat ));
//temp = $this->long0 + $p->x / ($this->a * cos($lat));
$lon = Proj4php::$common->adjust_lon( $temp );
} else if( ($s - Proj4php::$common->EPSLN) < Proj4php::$common->HALF_PI ) {
$lon = $this->long0;
}
}
$p->x = $lon;
$p->y = $lat;
 
return $p;
}
 
}
 
Proj4php::$proj['sinu'] = new Proj4phpProjSinu();
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/ifn/bibliotheque/proj4php/projCode/gauss.php
New file
0,0 → 1,74
<?php
/**
* Author : Julien Moquet
*
* Inspired by Proj4php from Mike Adair madairATdmsolutions.ca
* and Richard Greenwood rich@greenwoodma$p->com
* License: LGPL as per: http://www.gnu.org/copyleft/lesser.html
*/
class Proj4phpProjGauss {
 
/**
*
*/
public function init() {
$sphi = sin( $this->lat0 );
$cphi = cos( $this->lat0 );
$cphi *= $cphi;
$this->rc = sqrt( 1.0 - $this->es ) / (1.0 - $this->es * $sphi * $sphi);
$this->C = sqrt( 1.0 + $this->es * $cphi * $cphi / (1.0 - $this->es) );
$this->phic0 = asin( $sphi / $this->C );
$this->ratexp = 0.5 * $this->C * $this->e;
$this->K = tan( 0.5 * $this->phic0 + Proj4php::$common->FORTPI ) / (pow( tan( 0.5 * $this->lat0 + Proj4php::$common->FORTPI ), $this->C ) * Proj4php::$common->srat( $this->e * $sphi, $this->ratexp ));
}
 
/**
*
* @param type $p
* @return type
*/
public function forward( $p ) {
$lon = $p->x;
$lat = $p->y;
 
$p->y = 2.0 * atan( $this->K * pow( tan( 0.5 * $lat + Proj4php::$common->FORTPI ), $this->C ) * Proj4php::$common->srat( $this->e * sin( $lat ), $this->ratexp ) ) - Proj4php::$common->HALF_PI;
$p->x = $this->C * $lon;
return $p;
}
 
/**
*
* @param type $p
* @return null
*/
public function inverse( $p ) {
$DEL_TOL = 1e-14;
$lon = $p->x / $this->C;
$lat = $p->y;
$num = pow( tan( 0.5 * $lat + Proj4php::$common . FORTPI ) / $this->K, 1. / $this->C );
for( $i = Proj4php::$common . MAX_ITER; $i > 0; --$i ) {
$lat = 2.0 * atan( $num * Proj4php::$common->srat( $this->e * sin( $p->y ), -0.5 * $this->e ) ) - Proj4php::$common->HALF_PI;
if( abs( $lat - $p->y ) < $DEL_TOL )
break;
$p->y = $lat;
}
/* convergence failed */
if( !$i ) {
Proj4php::reportError( "gauss:inverse:convergence failed" );
return null;
}
$p->x = $lon;
$p->y = $lat;
return $p;
}
 
}
 
Proj4php::$proj['gauss'] = new Proj4phpProjGauss();
/tags/v5.12-baouque/scripts/modules/ifn/bibliotheque/proj4php/projCode/stere.php
New file
0,0 → 1,303
<?php
/**
* Author : Julien Moquet
*
* Inspired by Proj4php from Mike Adair madairATdmsolutions.ca
* and Richard Greenwood rich@greenwoodma$p->com
* License: LGPL as per: http://www.gnu.org/copyleft/lesser.html
*/
 
// Initialize the Stereographic projection
class Proj4phpProjStere {
 
protected $TOL = 1.e-8;
protected $NITER = 8;
protected $CONV = 1.e-10;
protected $S_POLE = 0;
protected $N_POLE = 1;
protected $OBLIQ = 2;
protected $EQUIT = 3;
 
/**
*
* @param type $phit
* @param type $sinphi
* @param type $eccen
* @return type
*/
public function ssfn_( $phit, $sinphi, $eccen ) {
$sinphi *= $eccen;
return (tan( .5 * (Proj4php::$common->HALF_PI + $phit) ) * pow( (1. - $sinphi) / (1. + $sinphi), .5 * $eccen ));
}
/**
*
*/
public function init() {
$this->phits = $this->lat_ts ? $this->lat_ts : Proj4php::$common->HALF_PI;
$t = abs( $this->lat0 );
if( (abs( $t ) - Proj4php::$common->HALF_PI) < Proj4php::$common->EPSLN ) {
$this->mode = $this->lat0 < 0. ? $this->S_POLE : $this->N_POLE;
} else {
$this->mode = $t > Proj4php::$common->EPSLN ? $this->OBLIQ : $this->EQUIT;
}
$this->phits = abs( $this->phits );
if( $this->es ) {
#$X;
 
switch( $this->mode ) {
case $this->N_POLE:
case $this->S_POLE:
if( abs( $this->phits - Proj4php::$common->HALF_PI ) < Proj4php::$common->EPSLN ) {
$this->akm1 = 2. * $this->k0 / sqrt( pow( 1 + $this->e, 1 + $this->e ) * pow( 1 - $this->e, 1 - $this->e ) );
} else {
$t = sin( $this->phits );
$this->akm1 = cos( $this->phits ) / Proj4php::$common->tsfnz( $this->e, $this->phits, $t );
$t *= $this->e;
$this->akm1 /= sqrt( 1. - $t * $t );
}
break;
case $this->EQUIT:
$this->akm1 = 2. * $this->k0;
break;
case $this->OBLIQ:
$t = sin( $this->lat0 );
$X = 2. * atan( $this->ssfn_( $this->lat0, $t, $this->e ) ) - Proj4php::$common->HALF_PI;
$t *= $this->e;
$this->akm1 = 2. * $this->k0 * cos( $this->lat0 ) / sqrt( 1. - $t * $t );
$this->sinX1 = sin( $X );
$this->cosX1 = cos( $X );
break;
}
} else {
switch( $this->mode ) {
case $this->OBLIQ:
$this->sinph0 = sin( $this->lat0 );
$this->cosph0 = cos( $this->lat0 );
case $this->EQUIT:
$this->akm1 = 2. * $this->k0;
break;
case $this->S_POLE:
case $this->N_POLE:
$this->akm1 = abs( $this->phits - Proj4php::$common->HALF_PI ) >= Proj4php::$common->EPSLN ?
cos( $this->phits ) / tan( Proj4php::$common->FORTPI - .5 * $this->phits ) :
2. * $this->k0;
break;
}
}
}