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/tags/v5.6-arganeraie/initialiserBdd.sh
New file
0,0 → 1,91
#!/bin/bash
##############################################################################################################
# But : Script permettant d'initialiser en une seule commande l'ensemble de la base de données eFlore.
# Auteur : Jean-Pascal Milcent <jpm@tela-botanica.org> (translate bat file to shell script)
# Exemple : /opt/lampp/bin/php -d memory_limit=3500M ./cli.php bdtxa -a supprimerTous
# License : GPL v3
# Création : 07 decembre 2011
# Version: 0.1
# 2011-12-07 - Création
# $Id$
##############################################################################################################
# Constante
APPDIR_ABSOLU=`pwd`;
#
CHEMIN_PHP="/opt/lampp/bin"
CHEMIN_TBF_CLI="$APPDIR_ABSOLU/scripts"
MEMORY_LIMIT="3500M"
echo -e "\033[31m`tput blink`ATTENTION :`tput sgr0` Nécessite la création préalable de la base de données \033[31mtb_eflore\033[00m"
echo "Nettoyage et chargement en cours...";
# BASEFLORE : doit être placé apèrs BDTFX (dépendance !)
echo "BASEVEG :";
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php baseveg -a supprimerTous
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php baseveg -a chargerTous
echo "BDNT :";
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php bdnt -a supprimerTous
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php bdnt -a chargerTous
echo "BDTFX :";
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php bdtfx -a supprimerTous
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php bdtfx -a chargerTous
echo "BASEFLOR :";
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php baseflor -a supprimerTous
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php baseflor -a chargerTous
echo "BDTXA :";
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php bdtxa -a supprimerTous
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php bdtxa -a chargerTous
echo "BIBLIO_BOTA :";
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php biblio_bota -a supprimerTous
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php biblio_bota -a chargerTous
# echo "BONNIER :";
# Pas encore utilisé !
echo "CHORODEP :";
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php chorodep -a supprimerTous
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php chorodep -a chargerTous
echo "COSTE :";
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php coste -a supprimerTous
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php coste -a chargerTous
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php coste -a chargerTxt
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php coste -a chargerIndex
echo "EFLORE :";
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php eflore -a supprimerTous
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php eflore -a chargerTous
# echo "FOURNIER :";
# Pas encore utilisé !
echo "INSEE-D :";
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php insee_d -a supprimerTous
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php insee_d -a chargerTous
echo "ISO-3166-1 :";
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php iso_3166_1 -a supprimerTous
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php iso_3166_1 -a chargerTous
echo "ISO-639-1 :";
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php iso_639_1 -a supprimerTous
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php iso_639_1 -a chargerTous
echo "NVJFL :";
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php nvjfl -a supprimerTous
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php nvjfl -a chargerTous
echo "NVPS :";
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php nvps -a supprimerTous
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php nvps -a chargerTous
echo "NVA :";
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php nva -a supprimerTous
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php nva -a chargerTous
echo "PHOTOFLORA :";
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php photoflora -a supprimerTous
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php photoflora -a chargerTous
# echo "PROMETHEUS :";
# Ontologie botanique.
# Pas encore utilisé !
echo "SPTB :";
# Statut de protection Tela Botanica
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php sptb -a supprimerTous
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php sptb -a chargerTous
echo "CEL :";
echo -e "\033[31m`tput blink`ATTENTION :`tput sgr0` Nécessite la création préalable de la base de données \033[31mtb_cel\033[00m"
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php cel -a supprimerTous
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php cel -a chargerTous
echo "TAPIRLINK :";
echo -e "\033[31m`tput blink`ATTENTION :`tput sgr0` Nécessite la création préalable de la base de données \033[31mtb_hit_indexation\033[00m"
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php tapirlink -a supprimerTous
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php tapirlink -a chargerTous
 
 
Property changes:
Added: svn:eol-style
+native
\ No newline at end of property
Added: svn:executable
+*
\ No newline at end of property
/tags/v5.6-arganeraie/livraison.sh
New file
0,0 → 1,21
#!/bin/bash
##############################################################################################################
# But : Script permettant d'initialiser en une seule commande l'ensemble de la base de données eFlore.
# Auteur : Jean-Pascal Milcent <jpm@tela-botanica.org> (translate bat file to shell script)
# License : GPL v3
# Création : 07 decembre 2011
# Version: 0.1
# 2011-12-07 - Création
# $Id$
##############################################################################################################
 
# ATTENTION NE PAS UTILISER !!!
 
# compresser les services en excluant les fichiers svn et les fichiers de config et framework
#tar cvzf services.tar.gz services/ --exclude=".svn" --exclude="*.ini" --exclude="framework.php" --exclude="*.sh"
# envoyer sur tela
#scp services.tar.gz root@tela-botanica.org:/home/telabotap/www/eflore-test/.
 
# se connecter sur tela botanica en ssh et effectuer le déploiement
#ssh root@tela-botanica.org "cd /home/telabotap/www/eflore-test/; cd services; tar cvzf ../backup/services.tar.gz .; cd ../; rm -Rf services; tar xvzf services.tar.gz; cd services; cp ../configurations/services/* . -R; chown #telabotap:users /home/telabotap/www/eflore-test/services -R; chmod 755 /home/telabotap/www/eflore-test/services -R; exit";
#echo "Done !"
Property changes:
Added: svn:eol-style
+native
\ No newline at end of property
Added: svn:executable
+*
\ No newline at end of property
/tags/v5.6-arganeraie/chargerDonnees.sh
New file
0,0 → 1,50
#!/bin/bash
##############################################################################################################
# But : téléchargement automatique en local des données des projets depuis le serveur de Tela Botanica par ftp
# Auteur : Jean-Pascal Milcent <jpm@tela-botanica.org> (translate bat file to shell script)
# License : GPL v3
# Création : 07 decembre 2011
# Version: 0.1
# 2014-03-20 : changement dossier distant suite à passage sur Agathis.
# 2011-12-07 : Création.
##############################################################################################################
# Constante
NBREPARAM=$#
APPDIR_ABSOLU=`pwd`;
DOSSIER_LOCAL="$APPDIR_ABSOLU/donnees/"
DOSSIER_DISTANT="/"
# Aide
E_OPTERR=65
if [ "$1" = '--help' ]
then # Le script a besoin d'au moins un argument sur la ligne de commande
echo "Usage $0 -[parameters -u, -p ]"
echo "Paramétres : "
echo " -h: indiquer l'hote ftp"
echo " -u: indiquer le nom de l'utilisateur ftp"
echo " -p: indiquer le mot de passe de l'utilisateur ftp"
exit $E_OPTERR
fi
 
# Récupération des paramètres et des options de la ligne de commande
TEMP=`getopt -o u:p:h: -l help: -- "$@"`
if [ $? != 0 ] ; then echo "Terminating..." >&2 ; exit 1 ; fi
eval set -- "$TEMP"
while [ ! -z "$1" ] ; do
#echo $1" # "$2
case "$1" in
-h) HOST=$2;;
-u) FTP_USER=$2;;
-p) FTP_PASSWD=$2;;
--) shift ; break ;;
*) echo "Internal error!" ; exit 1 ;;
esac
shift 2
done
 
# Transfert sur le serveur par FTP
if [ $NBREPARAM -eq 0 ]; then
echo "Pas de transfert sur le serveur. Utiliser --help pour voir les options de transfert."
else
echo "Téléchargement en cours :";
lftp ftp://$FTP_USER:$FTP_PASSWD@$HOST -e "set ftp:passive off; mirror -e --no-symlinks -x '.*cel\/images\/.*' -x '.*osm\/.*' -x '.*plantscan\/.*' -x '.*coste\/cles\/.*' -x '.*coste\/descriptions\/.*' -x '.*coste\/images\/.*' -x '.*coste\/ressources\/.*' $DOSSIER_DISTANT $DOSSIER_LOCAL ; quit"
fi;
Property changes:
Added: svn:eol-style
+native
\ No newline at end of property
Added: svn:executable
+*
\ No newline at end of property
/tags/v5.6-arganeraie/services/modules/0.1/moissonnage/cartes/FormateurSVG.php
New file
0,0 → 1,322
<?php
 
/**
* Classe qui genere la carte SVG pour les parametres de la requete qui a ete utilisee pour appeler
* le web service
*
* @package framework-0.4
* @author Alexandre GALIBERT <alexandre.galibert@tela-botanica.org>
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
* @version $Id$
* @copyright 2013 Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
*
*/
 
 
class FormateurSVG {
private $documentXML;
private $coordonnees = array();
private $grille = null;
private $largeur = 0;
private $hauteur = 0;
private $typeMime = '';
private $format = 0;
private $sources = array();
private $image = null;
const ORIGINE = 20037508.342789244;
const MIME_MAP = 'text/html';
public function __construct($nomFichierSVG, $sources, $typeMime, $format) {
$this->chargerSVG($nomFichierSVG);
$this->chargerCoordonnees();
$this->construireParametresRetour($typeMime, $format);
$this->creerStyleSources();
$this->sources = $sources;
}
private function chargerSVG($nomFichierSVG) {
$this->documentXML = new DOMDocument("1.0", "UTF-8");
$this->documentXML->load($nomFichierSVG);
}
private function chargerCoordonnees() {
$viewbox = $this->recupererNoeuds('qgisviewbox');
$this->coordonnees = array(
'xMin' => $viewbox->attributes->getNamedItem('xMin')->value,
'xMax' => $viewbox->attributes->getNamedItem('xMax')->value,
'yMin' => $viewbox->attributes->getNamedItem('yMin')->value,
'yMax' => $viewbox->attributes->getNamedItem('yMax')->value
);
}
private function recupererNoeuds($nomCouche) {
$contenuSVG = $this->documentXML->documentElement->childNodes;
$noeudCouche = null;
$index = 0;
while ($index < $contenuSVG->length && is_null($noeudCouche)) {
$id = $contenuSVG->item($index)->attributes->getNamedItem('id');
if ($id->value == $nomCouche) {
$noeudCouche = $contenuSVG->item($index);
}
$index ++;
}
$noeuds = null;
if (!is_null($noeudCouche)) {
$noeuds = $noeudCouche->firstChild;
}
return $noeuds;
}
private function construireParametresRetour($typeMime, $format) {
$viewBox = $this->documentXML->documentElement->attributes->getNamedItem('viewBox');
$limitesPixels = explode(' ',$viewBox->value);
$this->largeur = intval($limitesPixels[2]);
$this->hauteur = intval($limitesPixels[3]);
$this->typeMime = $typeMime;
$this->format = intval($format);
}
private function creerStyleSources() {
$couleurs = $this->recupererCouleursSources();
$reglesCss = array();
foreach ($couleurs as $codeSource => $codeCouleur) {
$reglesCss[] = ".{$codeSource} {\nfill:{$codeCouleur}\n}\n";
}
$texteCss = $this->documentXML->createCDATASection(implode(' ', $reglesCss));
$noeudStyle = new DomElement('style', '');
$this->documentXML->documentElement->appendChild($noeudStyle);
$noeudStyle->appendChild($texteCss);
}
private function recupererCouleursSources() {
$sourcesDonnees = Config::get('sourcesDonnees');
$codesSources = str_replace('floradata', 'cel', $sourcesDonnees).',tout';
$codes = explode(',', $codesSources);
for ($index = 0; $index < count($codes); $index ++) {
$codes[$index] = "'".$codes[$index]."'";
}
$codesSources = implode(',', $codes);
$bdd = new Bdd();
$requete = "SELECT code, SUBSTR(complements,9) AS couleur FROM ".Config::get('bdd_table_ontologies')." WHERE code IN ({$codesSources})";
$couleurs = $bdd->recupererTous($requete);
$listeCouleurs = array();
foreach ($couleurs as $couleur) {
$couleur['code'] = $couleur['code'] == 'cel' ? 'floradata' : $couleur['code'];
$listeCouleurs[$couleur['code']] = $couleur['couleur'];
}
return $listeCouleurs;
}
 
public function formaterCarte($taxon) {
$limitesCarte = $this->renvoyerLimitesCarte();
$sourceDonnees = new SourceDonnees($limitesCarte, $taxon);
// modification temporaire pour lors de la selection d'un rang au dessus de famille on ne prenne que floradata
// (probleme de performance, qui sera réglé en reremplissant la table de moissonnage)
if($taxon['rang'] >= 180) {
foreach ($this->sources as $source) {
$nomMethode = "recupererStations".($source == 'floradata' ? 'Floradata' : 'Moissonnage');
$stations = $sourceDonnees->$nomMethode($source);
$this->ajouterStations($stations, $source);
}
} else {
$stations = $sourceDonnees->recupererStationsFloradata($source);
$this->ajouterStations($stations, $source);
}
$this->supprimerMaillesVides();
}
public function renvoyerLimitesCarte() {
$limites = array();
list($limites['ouest'], $limites['sud']) = $this->convertirMetresEnPixels(
$this->coordonnees['xMin'], $this->coordonnees['yMin']);
list($limites['est'], $limites['nord']) = $this->convertirMetresEnPixels(
$this->coordonnees['xMax'], $this->coordonnees['yMax']);
return $limites;
}
private function convertirMetresEnPixels($x, $y) {
$longitude = ($x / self::ORIGINE) * 180;
$latitude = ($y / self::ORIGINE) * 180;
$latitude = 180 / M_PI * (2 * atan(exp($latitude * M_PI / 180.0)) - M_PI / 2.0);
return array(round($longitude, 6), round($latitude, 6));
}
private function ajouterStations($stations, $source) {
$grille = $this->recupererNoeuds('grille')->childNodes;
$index = 0;
$maille = $grille->item($index);
foreach ($stations as $station) {
if (!isset($station['lat']) || !isset($station['lng']) || !isset($station['commune'])) {
continue;
}
$idMaille = $maille->attributes->getNamedItem('id')->value;
$bbox = explode('_', substr($idMaille, 5));
$bbox[0] = floatval($bbox[0]);
$bbox[1] = floatval($bbox[1]);
while ($index < $grille->length && (
$bbox[1] > $station['lat'] || ($bbox[1] == $station['lat'] && $bbox[0] < $station['lng'])
)) {
$maille = $grille->item($index ++);
$idMaille = $maille->attributes->getNamedItem('id')->value;
$bbox = explode('_', substr($idMaille, 5));
$bbox[0] = floatval($bbox[0]);
$bbox[1] = floatval($bbox[1]);
}
if ($bbox[1] == $station['lat'] && $bbox[0] == $station['lng']) {
$this->ajouterCommentaire($station, $source, $maille);
$this->appliquerStyleMaille($source, $maille);
}
if ($index == $grille->length) {
break;
}
}
}
private function supprimerMaillesVides() {
$grille = $this->recupererNoeuds('grille')->childNodes;
$index = 0;
while ($index < $grille->length) {
if (!$grille->item($index)->hasAttribute('title')) {
$grille->item($index)->parentNode->removeChild($grille->item($index));
} else {
$index ++;
}
}
}
private function appliquerStyleMaille($source, & $maille) {
if ($maille->hasAttribute('class') && $maille->attributes->getNamedItem('class')->value != $source) {
$maille->setAttribute('class', 'tout');
} elseif (!$maille->hasAttribute('class')) {
$maille->setAttribute('class', $source);
}
}
private function ajouterCommentaire($station, $source, & $maille) {
$commentaires = array();
if ($maille->hasAttribute('title')) {
$commentaires = explode("; ", $maille->attributes->getNamedItem('title')->value);
}
$commentaire = ucfirst($source)." : {$station['commune']}, ";
if (strlen($station['date']) == 4) {
$commentaire .= "en {$station['date']} par {$station['auteur']}";
} else {
$date = preg_replace("/(\d{4})-(\d{2})-(\d{2})/", "$3/$2/$1", $station['date']);
$commentaire .= "le {$date} par {$station['auteur']}";
}
$commentaires[] = trim($commentaire);
$maille->setAttribute('title', implode('; ', $commentaires));
}
public function renvoyerCarte() {
$this->documentXML->documentElement->setAttribute("width", $this->format);
$this->documentXML->documentElement->setAttribute("height", $this->hauteur * $this->format / $this->largeur);
$retour = '';
if ($this->typeMime == self::MIME_MAP) {
$retour = $this->documentXML->saveHTML();
} else {
$retour = $this->convertirEnPng();
}
return $retour;
}
private function convertirEnPng() {
$this->image = imagecreatetruecolor($this->format, $this->hauteur * $this->format / $this->largeur);
imagefill($this->image, 0, 0, imagecolorallocate($this->image, 255, 255, 255));
$this->transformerLignesEnPng('departements');
$this->transformerPolygonesEnPng('grille');
// stocker le contenu encode de l'image generee dans une chaine de caracteres
ob_start();
imagepng($this->image);
$png = ob_get_contents();
ob_end_clean();
return $png;
}
private function transformerLignesEnPng($nomCouche) {
$facteur = floatval($this->format) / floatval($this->largeur);
$noeudCouche = $this->recupererNoeuds($nomCouche);
$couleurContour = $noeudCouche->attributes->getNamedItem('stroke')->value;
$couleurContour = ($this->format >= 300 ? $couleurContour : "rgb(192,192,192)");
for ($index = 0; $index < $noeudCouche->childNodes->length; $index ++) {
$noeudLigne = $noeudCouche->childNodes->item($index);
for ($indexPath = 0; $indexPath < $noeudLigne->childNodes->length; $indexPath ++) {
$coordonneesSvg = $noeudLigne->childNodes->item($indexPath)->attributes->getNamedItem('points')->value;
preg_match_all('/\d+.\d/', $coordonneesSvg, $coordonnees);
$coordonnees = current($coordonnees);
foreach ($coordonnees as $indexCoord => $valeur) {
$coordonnees[$indexCoord] = intval(floatval($valeur) * $facteur);
}
if ($couleurContour != 'none') {
for ($i = 0; $i < count($coordonnees) - 2; $i += 2) {
imageline($this->image, $coordonnees[$i], $coordonnees[$i+1], $coordonnees[$i+2],
$coordonnees[$i+3], $this->allouerCouleur($couleurContour));
}
}
}
}
}
private function transformerPolygonesEnPng($nomCouche) {
$couleurs = $this->recupererCouleursSources();
$facteur = floatval($this->format) / floatval($this->largeur);
$noeudCouche = $this->recupererNoeuds($nomCouche);
$couleurRemplissage = $noeudCouche->attributes->getNamedItem('fill')->value;
$couleurContour = $noeudCouche->attributes->getNamedItem('stroke')->value;
for ($index = 0; $index < $noeudCouche->childNodes->length; $index ++) {
$noeudPolygone = $noeudCouche->childNodes->item($index);
$couleurPolygone = 'none';
if ($noeudPolygone->hasAttribute('class')) {
$couleurPolygone = $couleurs[$noeudPolygone->attributes->getNamedItem('class')->value];
}
for ($indexPath = 0; $indexPath < $noeudPolygone->childNodes->length; $indexPath ++) {
$coordonneesSvg = $noeudPolygone->childNodes->item($indexPath)->attributes->getNamedItem('points')->value;
preg_match_all('/\d+.\d/', $coordonneesSvg, $coordonnees);
$coordonnees = current($coordonnees);
foreach ($coordonnees as $indexCoord => $valeur) {
$coordonnees[$indexCoord] = intval(floatval($valeur) * $facteur);
}
if ($couleurRemplissage != 'none') {
imagefilledpolygon($this->image, $coordonnees, count($coordonnees) / 2, $this->allouerCouleur($couleurRemplissage));
}
if ($couleurContour != 'none') {
imagepolygon($this->image, $coordonnees, count($coordonnees) / 2, $this->allouerCouleur($couleurContour));
}
if ($couleurPolygone != 'none') {
$contourGrille = "rgba(255,255,255,".($this->format >= 300 ? 0.4 : 0).")";
imagefilledrectangle($this->image, $coordonnees[0], $coordonnees[1], $coordonnees[4], $coordonnees[5],
$this->allouerCouleur($couleurPolygone));
imagerectangle($this->image, $coordonnees[0], $coordonnees[1], $coordonnees[4], $coordonnees[5],
$this->allouerCouleur($contourGrille));
}
}
}
}
private function allouerCouleur($couleurTexte) {
preg_match_all('/\d+/', $couleurTexte, $valeurs);
$rouge = $valeurs[0][0];
$vert = $valeurs[0][1];
$bleu = $valeurs[0][2];
$alpha = 0;
if (count($valeurs[0]) > 3) {
$valeurAlpha = floatval($valeurs[0][3].".".$valeurs[0][4]);
$alpha = intval((1.0 - $valeurAlpha) * 127.0);
}
return imagecolorallocatealpha($this->image, $rouge, $vert, $bleu, $alpha);
}
}
 
?>
/tags/v5.6-arganeraie/services/modules/0.1/moissonnage/cartes/LegendeCartes.php
New file
0,0 → 1,76
<?php
 
/**
* Classe qui fournit une legende recuperee dans une table d'ontologies pour la renvoyer au client
*
* @package framework-0.4
* @author Alexandre GALIBERT <alexandre.galibert@tela-botanica.org>
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
* @version $Id$
* @copyright 2013 Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
*
*/
 
class LegendeCartes {
const TYPE_MIME = 'application/json';
const ID_CLASSE = '10';
private $tableOntologies = '';
private $ontologies = array();
private $legende = array();
public function __construct() {
$this->tableOntologies = Config::get('bdd_table_ontologies');
}
public function obtenirLegende() {
$this->chargerOntologies();
$this->chargerLegende();
$resultat = new ResultatService();
$resultat->corps = $this->legende;
$resultat->mime = self::TYPE_MIME;
return $resultat;
}
private function chargerOntologies() {
$bdd = new Bdd();
$requete = "SELECT * FROM {$this->tableOntologies}";
$resultats = $bdd->recupererTous($requete);
if (!is_array($resultats) || count($resultats) <= 0) {
$message = "Les données d'ontologies n'ont pu être chargées pour la ressource demandée";
$code = RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE;
throw new Exception($message, $code);
}
foreach ($resultats as $ontologie) {
$this->ontologies[$ontologie['id']] = $this->extraireComplementsOntologies($ontologie);
}
}
private function extraireComplementsOntologies($ontologie) {
if (strlen(trim($ontologie['complements'])) > 0) {
list($cle, $valeur) = explode('=', trim($ontologie['complements']));
$ontologie[trim($cle)] = trim($valeur);
}
return $ontologie;
}
private function chargerLegende() {
foreach ($this->ontologies as $ontologie) {
if ($ontologie['classe_id'] == self::ID_CLASSE && isset($ontologie['legende'])) {
$this->legende[] = array(
'code' => $ontologie['code'],
'couleur' => $ontologie['legende'],
'nom' => $ontologie['nom'],
'description' => $ontologie['description']
);
}
}
}
}
 
?>
/tags/v5.6-arganeraie/services/modules/0.1/moissonnage/cartes/SourceDonnees.php
New file
0,0 → 1,187
<?php
 
class SourceDonnees {
private $bdd = null;
private $limitesCarte = '';
private $taxon = array();
private $nomRang = '';
private $taxons = array();
private $genres = array();
private $utilisateurs = null;
public function __construct($limitesCarte, $taxon) {
$this->limitesCarte = $limitesCarte;
foreach ($this->limitesCarte as $bord => $valeur) {
$this->limitesCarte[$bord] = str_replace(",", ".", round($valeur, 6));
}
$this->bdd = new Bdd();
$this->taxon = $taxon;
$this->nomRang = $this->obtenirNomRang();
if ($this->nomRang == 'espece' || $this->nomRang == 'sous_espece') {
$this->taxons = $this->recupererSynonymesEtSousEspeces();
} elseif ($this->nomRang == 'famille') {
$this->genres = $this->recupererGenres();
}
$this->utilisateurs = new Utilisateurs();
}
private function obtenirNomRang() {
$nomsRangs = array('famille', 'genre', 'espece', 'sous_espece');
$rangs = explode(',', Config::get('rangs'));
for ($index = 0; $index < count($nomsRangs) && $rangs[$index] != $this->taxon['rang']; $index ++);
$position = $index == count($nomsRangs) ? count($nomsRangs)-1 : $index;
return $nomsRangs[$position];
}
protected function recupererSynonymesEtSousEspeces() {
$requete =
"SELECT num_nom, nom_sci, nom_complet, num_taxonomique FROM ".Config::get('bdd_table_referentiel').
" WHERE hierarchie LIKE '%-{$this->taxon['num_nom']}-%' ".
"OR num_nom_retenu = {$this->taxon['num_nom_retenu']}";
return $this->bdd->recupererTous($requete);
}
protected function recupererGenres() {
$this->bdd->requeter("USE ".Config::get('bdd_nom'));
$requete =
"SELECT num_nom, nom_sci, num_taxonomique FROM ".Config::get('bdd_table_referentiel').
" WHERE rang=220 AND num_tax_sup={$this->taxon['num_nom']}";
return $this->bdd->recupererTous($requete);
}
public function recupererStationsFloradata() {
$this->bdd->requeter("USE ".Config::get('bdd_nom_floradata'));
$requete =
"SELECT DISTINCTROW zone_geo AS commune, Date(date_observation) AS date, Floor(wgs84_latitude*10)/10 AS lat, ".
"Floor(wgs84_longitude*10)/10 AS lng, courriel_utilisateur AS auteur ".
"FROM cel_obs LEFT JOIN cel_zones_geo cz ON ce_zone_geo=id_zone_geo ".
"WHERE ".$this->construireWhereTaxonFloradata()." AND transmission=1 AND nom_referentiel = '".Config::get('referentielsDispo')."' AND ".
"wgs84_longitude BETWEEN ".$this->limitesCarte['ouest']." AND ".$this->limitesCarte['est']." ".
"AND wgs84_latitude BETWEEN ".$this->limitesCarte['sud']." AND ".$this->limitesCarte['nord']." ".
"AND date_observation<>'0000-00-00 00-00-00' ORDER BY lat DESC, lng ASC, commune, date";
$stations = $this->bdd->recupererTous($requete);
$this->extraireIdentitesAuteurs($stations);
foreach($stations as &$station) {
$station['auteur'] = $this->utilisateurs->getIntitule($station['auteur']);
}
return $stations;
}
private function extraireIdentitesAuteurs($stations) {
$courriels = array();
foreach ($stations as &$station) {
$courriels[] = $station['auteur'];
}
$this->utilisateurs->setCourriels($courriels);
$this->utilisateurs->chargerIdentites();
}
private function construireWhereTaxonFloradata() {
$criteres = array();
$nomRang = $this->obtenirNomRang($this->taxon);
if ($this->nomRang == 'famille') {
$criteres[] = "famille=".$this->bdd->proteger($this->taxon['nom_sci']);
} elseif ($this->nomRang == 'genre') {
$criteres[] = "nom_sel LIKE ".$this->bdd->proteger($this->taxon['nom_sci'].'%');
} else {
$taxons = array($this->taxon['num_nom']);
foreach ($this->taxons as $sousTaxon) {
$taxons[] = $sousTaxon['num_nom'];
}
$criteres[] = "nom_sel_nn IN (".implode(',', array_unique($taxons)) .")";
}
return "(".implode(' OR ',array_unique($criteres)).")";
}
public function recupererStationsMoissonnage($source) {
$this->bdd->requeter("USE ".Config::get('bdd_nom'));
$requete =
"SELECT DISTINCTROW lieu_commune_code_insee, observation_date AS date, observateur_nom_complet AS auteur ".
"FROM {$source}_tapir WHERE ".$this->construireWhereTaxonMoissonnage($source)." ".
"AND lieu_station_longitude BETWEEN ".$this->limitesCarte['ouest']." AND ".$this->limitesCarte['est']." ".
"AND lieu_station_latitude BETWEEN ".$this->limitesCarte['sud']." AND ".$this->limitesCarte['nord']." ".
"AND Length(lieu_commune_code_insee)=5 ORDER BY lieu_commune_code_insee, date"." -- " . __FILE__ . ":" . __LINE__." ". @$_SERVER['REQUEST_URI'];
$stations = $this->bdd->recupererTous($requete);
$this->rechercherInfosCommune($stations);
return $stations;
}
private function construireWhereTaxonMoissonnage($source) {
$nomRang = $this->obtenirNomRang();
$criteres = array();
$criteres[] = ($source == "baznat" || $source == "ifn") ?
"num_nom = ".$this->taxon['num_nom'] :
"nom_scientifique_complet LIKE ".$this->bdd->proteger($this->taxon['nom_sci']) ;
if ($this->nomRang == 'espece' || $this->nomRang == 'sous_espece') {
foreach ($this->taxons as $sousTaxon) {
$criteres[] = ($source == "baznat" || $source == "ifn") ?
"num_nom = ".$sousTaxon['num_nom'] :
"nom_scientifique_complet LIKE ".$this->bdd->proteger($sousTaxon['nom_sci']) ;
}
} elseif ($this->nomRang == 'famille') {
foreach ($this->genres as $genre) {
$criteres[] = "nom_scientifique_complet LIKE ".$this->bdd->proteger($genre['nom_sci']."%");
}
}
return "(".implode(' OR ',array_unique($criteres)).")";
}
private function rechercherInfosCommune(& $stations) {
$codesInsee = array();
foreach ($stations as $station) {
$codeInsee = $station['lieu_commune_code_insee'];
if (substr($codeInsee, 0, 2) == '20') {
$codeInsee = '2A'.substr($codeInsee, 2);
$codeInsee2 = '2B'.substr($codeInsee, 2);
}
if (!in_array($codeInsee, $codesInsee)) {
if (substr($codeInsee, 0, 2) == '20') {
$codesInsee[] = "'$codeInsee2'";
}
$codesInsee[] = "'$codeInsee'";
}
}
$nomTableCommunes = Config::get('bdd_table_communes');
$communes = array();
if(count($codesInsee) > 0) {
$requete =
"SELECT insee, nom AS commune, Floor(latitude_degre*10)/10 AS lat, Floor(longitude_degre*10)/10 AS lng ".
"FROM $nomTableCommunes WHERE insee IN (".implode(',', array_unique($codesInsee)).") ORDER BY insee";
$communes = $this->bdd->recupererTous($requete);
}
$indexStation = 0;
foreach ($communes as $commune) {
$codeInsee = $commune['insee'];
if (substr($codeInsee, 0, 2) == '2A' || substr($codeInsee, 0, 2) == '2B') {
$codeInsee = '20'.substr($codeInsee, 2);
}
while ($stations[$indexStation]['lieu_commune_code_insee'] < $codeInsee) {
$indexStation ++;
}
if ($stations[$indexStation]['lieu_commune_code_insee'] == $codeInsee) {
$stations[$indexStation]['lat'] = $commune['lat'];
$stations[$indexStation]['lng'] = $commune['lng'];
$stations[$indexStation]['commune'] = $commune['commune'];
}
}
$lat = array();
$lng = array();
foreach ($stations as $index => $station) {
if (!isset($station['lat'])) {
$station['lat'] = -100;
$station['lng'] = -100;
}
$lat[$index] = $station['lat'];
$lng[$index] = $station['lng'];
}
array_multisort($lat, SORT_DESC, $lng, SORT_ASC, $stations);
}
}
 
?>
/tags/v5.6-arganeraie/services/modules/0.1/moissonnage/Cartes.php
New file
0,0 → 1,276
<?php
 
/**
* Classe qui remplit un fond cartographique SVG a partir des observations en base de donnees
* pour un taxon de plante. Elle verifie dans un premier temps la validite des parametres saisis,
* puis charge le fond cartographique depuis le fichier, recupere dans la base de donnees
* les observations sur la France metropolitaine pour le taxon donne et remplit la carte
* en changeant le style CSS des mailles en fonction des coordonnees des points d'observation.
* Le format et la taille de la carte renvoyee au client est parametrable.
*
* Parametres :
* - referentiel : le referentiel taxonomique a interroger pour verifier le taxon. Pour l'instant,
* seul bdtfx (Tracheophytes de France metropolirtaine) est utilise par le web service
* - num_taxon : le numero taxonomique de la plante dont on veut obtenir la carte de repartition.
* Le rang des taxons traites par le web service sont la famille, le genre, l'espece et la sous-espece.
* La recherche des observations s'etend en pus sur les sous taxons et les synonymes.
* - source : une ou plusieurs sources de donnees a interroger. Si le parametre n'est pas indique,
* le web service ira rechercher les observatipons dans toutes les sources de donnees.
* - format : la largeur de la carte, exprimee dans une valeur entiere en pixels.
* Le ratio largeur:hauteur est conserve lors du redimensionnement de la carte pour le retour
* - retour : le type MIME (ou format de fichier) de retour. Sont acceptes par le web service
* le PNG (image/png) et le XML (text/html) pour renvoyer le web service
*
* @package framework-0.4
* @author Alexandre GALIBERT <alexandre.galibert@tela-botanica.org>
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
* @version $Id$
* @copyright 2013 Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
*
*/
 
class MoissonnageCartes {
 
const MIME_MAP = "text/html";
const MIME_PNG = "image/png";
const METHODE_TELECHARGEMENT = "telecharger";
const METHODE_AFFICHAGE = "afficher";
private $ressources;
private $parametres;
private $referentiel = '';
private $taxon = null;
private $sources = array();
private $format = 0;
private $retour = self::MIME_MAP;
private $methode_livraison = self::METHODE_AFFICHAGE;
private $erreurs = array();
public function consulter($ressources, $parametres) {
$this->parametres = $parametres;
$this->ressources = $ressources;
$resultat = null;
$this->chargerClassesSousDossier();
if ($this->analyserRessources() == true) {
$resultat = $this->formerLegende();
} else {
$this->traiterParametres();
$resultat = $this->formerCarte();
if($this->methode_livraison == self::METHODE_TELECHARGEMENT) {
$this->telechargerCarte($resultat->corps);
}
}
return $resultat;
}
private function analyserRessources() {
$ok = false;
if (isset($this->ressources[0]) && $this->ressources[0] == 'legende') {
$ok = true;
}
return $ok;
}
private function formerLegende() {
$legende = new LegendeCartes();
$resultat = $legende->obtenirLegende();
return $resultat;
}
private function chargerClassesSousDossier() {
$this->verifierExistenceDossier("cartes");
$nomDossier = dirname(__FILE__).DS."cartes";
$dossier = opendir($nomDossier);
$fichiersAInclure = array();
while ($fichier = readdir($dossier)) {
if (filetype($nomDossier.DS.$fichier) == 'file') {
$fichiersAInclure[] = $nomDossier.DS.$fichier;
}
}
$fichiersAInclure = array_reverse($fichiersAInclure);
foreach ($fichiersAInclure as $fichier) {
include_once($fichier);
}
}
private function verifierExistenceDossier($nomDossier) {
$dossier = dirname(__FILE__).DS.$nomDossier;
if (!file_exists($dossier) || !is_dir($dossier)) {
$message = "Problème rencontré lors de la génération de la carte : des ressources ".
"nécessaires au fonctionnement du service n'ont pas été localisées sur le serveur.\n";
throw new Exception($message);
}
}
private function verifierExistenceFichier($nomFichier) {
if (!file_exists($nomFichier)) {
$message = "Problème rencontré lors de la génération de la carte : des ressources ".
"nécessaires au fonctionnement du service n'ont pas été localisées sur le serveur.\n";
throw new Exception($message);
}
}
private function traiterParametres() {
$this->verifierReferentielEtTaxon();
$this->verifierParametreSource();
$this->verifierParametreFormat();
$this->verifierParametreRetour();
$this->verifierParametreMethodeLivraison();
if (count($this->erreurs) > 0) {
$this->renvoyerErreurs();
}
}
private function verifierParametreFormat() {
if (!isset($this->parametres['format'])) {
$this->erreurs[] = "Le paramètre format (dimensions) de l'image n'a pas été indiqué dans l'URL du service.";
} elseif (preg_match('/^[1-9]\d{2}$/', $this->parametres['format']) != 1) {
$this->erreurs[] = "La valeur du paramètre format n'est pas acceptée par le service. ".
"Une largeur valide doit être un nombre entier compris entre 100 et 999.";
} else {
$this->format = $this->parametres['format'];
}
}
private function verifierParametreRetour() {
$typesMime = array(self::MIME_MAP, self::MIME_PNG);
if (!isset($this->parametres['retour'])) {
$this->erreurs[] = "Le paramètre type de retour de l'image n'a pas été indiqué dans l'URL du service.";
} elseif (!in_array($this->parametres['retour'], $typesMime)) {
$this->erreurs[] = "Le format de retour ".$this->parametres['retour']." n'est pas acceptée par le service. ".
" Seuls les types MIME suivants sont gérés : ".implode(',', $typesMime);
} else {
$this->retour = $this->parametres['retour'];
}
}
private function verifierParametreMethodeLivraison() {
$typesMethodeLivraison = array(self::METHODE_AFFICHAGE, self::METHODE_TELECHARGEMENT);
if (isset($this->parametres['methode']) && !in_array($this->parametres['methode'], $typesMethodeLivraison)) {
$this->erreurs[] = "Le format de methode de livraison ".$this->parametres['methode']." n'est pas acceptée par le service. ".
" Seuls les methodes suivantes sont gérés : ".implode(',', $typesMethodeLivraison);
} elseif(isset($this->parametres['methode']) && in_array($this->parametres['methode'], $typesMethodeLivraison)) {
$this->methode_livraison = $this->parametres['methode'];
}
}
private function verifierParametreSource() {
$sourcesDisponibles = explode(',', trim(Config::get('sourcesDonnees')));
if (isset($this->parametres['source'])) {
$sourcesParametre = explode(',', trim($this->parametres['source']));
foreach ($sourcesParametre as $source) {
if (!in_array($source, $sourcesDisponibles)) {
$this->erreurs[] = "La source de données $source n'est pas disponible pour ce service. ".
"Les sources suivantes sont utilisables : ".implode(',', $sourcesDisponibles).".";
} else {
$this->sources[] = $source;
}
}
} else {
$this->sources = $sourcesDisponibles;
}
}
private function verifierReferentielEtTaxon() {
if (!$this->estReferentielDisponible()) {
$this->erreurs[] = "Le référentiel ".$this->parametres['referentiel']." n'a pas été trouvé. ".
"La liste des référentiels disponibles pour ce service sont : ".Config::get('referentielsDispo');
} else {
$this->referentiel = $this->parametres['referentiel'];
$taxon = $this->recupererInformationsTaxon();
if (is_null($taxon)) {
$this->erreurs[] = "Le taxon d'espèce que vous avez demandé n'a pas été trouvé dans le référentiel.";
} else {
$this->taxon = $taxon;
}
}
}
private function renvoyerErreurs() {
$message = "Les erreurs suivantes ont été rencontrées : \n".implode('\n', $this->erreurs);
throw new Exception($message, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE);
}
private function estReferentielDisponible() {
$referentielsDispo = explode(',', Config::get('referentielsDispo'));
$estDisponible = (isset($this->parametres['referentiel'])
&& in_array($this->parametres['referentiel'], $referentielsDispo));
return $estDisponible;
}
private function recupererInformationsTaxon() {
$taxon = null;
if (isset($this->parametres['num_taxon'])) {
$numTaxon = $this->parametres['num_taxon'];
$nomTable = $this->recupererNomTableReferentiel();
$bdd = new Bdd();
$requete = "SELECT num_nom, num_nom_retenu, nom_sci, nom_complet, rang, num_taxonomique FROM {$nomTable} ".
"WHERE num_taxonomique={$numTaxon} ORDER BY If(num_nom=num_nom_retenu,0,1) LIMIT 0,1";
$taxon = $bdd->recuperer($requete);
if ($taxon === false) {
$taxon = null;
}
}
return $taxon;
}
private function recupererNomTableReferentiel() {
$tablesReferentiel = explode(',', Config::get('bdd_table_referentiel'));
$nomTable = '';
foreach ($tablesReferentiel as $table) {
if (strstr($table, $this->referentiel) !== false) {
$nomTable = $table;
}
}
return $nomTable;
}
private function formerCarte() {
$suffixe = 'france_moissonnage';
// le fichier png avec les départements est illisible en petit format
// dans ce cas là un template plus simple est utilisé (sans les départements)
if($this->format < 300 && $this->retour == self::MIME_PNG) {
$suffixe = $suffixe."_sans_departements";
}
$nomFichierSVG = Config::get('chemin')."{$suffixe}.svg";
$this->verifierExistenceFichier($nomFichierSVG);
$formateur = new FormateurSVG($nomFichierSVG, $this->sources, $this->retour, $this->format);
$formateur->formaterCarte($this->taxon);
$resultat = new ResultatService();
$resultat->corps = $formateur->renvoyerCarte();
$resultat->mime = $this->retour;
 
return $resultat;
}
private function telechargerCarte($fichier) {
if (function_exists('mb_strlen')) {
$taille = mb_strlen($fichier, '8bit');
} else {
$taille = strlen($fichier);
}
$extension = ($this->retour == "text/html") ? 'html' : 'png';
header('Content-Description: File Transfer');
header('Content-Type: application/octet-stream');
header('Content-Disposition: attachment; filename="carte.'.$extension.'"');
header('Content-Transfer-Encoding: binary');
header('Connection: Keep-Alive');
header('Expires: 0');
header('Cache-Control: must-revalidate, post-check=0, pre-check=0');
header('Pragma: public');
header('Content-Length: '.$taille);
}
}
 
?>
/tags/v5.6-arganeraie/services/modules/0.1/moissonnage/Ontologies.php
New file
0,0 → 1,366
<?php
/**
* Description :
* Classe Ontologies.php fournit des informations sur ensemble structuré des termes et concepts représentant les éléments
* d'un domaine de connaissances .
* Le but étant de fournir un ensemble minimal d'information comprenant :
* un identifiant (numérique ou alphanumérique sous forme de ChatMot si possible), un nom, une description et
* éventuellement une relation hiérarchique avec un autre terme (=classe).
* Si l'url finit par /ontologies on retourne une liste de termes (seulement les 100 premières par défaut).
* L'url peut contenir des paramètres optionnels passés après le ? : /ontologies?param1=val1&param2=val2&...
*
* Les paramètres de requête disponibles sont : masque, masque.code, masque.nom, masque.description , recherche,
* distinct, retour.format, navigation.depart et navigation.limite.
*
* Encodage en entrée : utf8
* Encodage en sortie : utf8
* @package eflore-projets
* @author Jennifer DHÉ <jennifer.dhe@tela-botanica.org>
* @author Delphine CAUQUIL <delphine@tela-botanica.org>
* @author Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org>
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
* @version 0.1
* @copyright 1999-2011 Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
*/
class MoissonnageOntologies extends Commun {
 
protected $requete_condition = null; //Représente la partie de la requete SQL ajoutant une condition (WHERE ...)
/** Permet de stocker la requete formulée: /ontologies | /ontologies/#id | /ontologies/#id/champ | /ontologies/#id/relations */
protected $format_reponse = 'ontologies';
/** Permet de stocker les limite de la requete SQL (par défaut seul les 100 premiers résultats seront retournés).
* Stocke également les valeurs des paramètres navigation.depart et navigation.limite passés dans la requete*/
protected $limite_requete = array( 'depart' => 0, 'limite' => 100);
/** Stocke le nombre total de résultats de la requete principale. Est calculée lors de l'assemblage de la requete */
protected $total_resultat;
protected $retour_format = 'max';
 
public function consulter($ressources, $parametres) {
$this->ressources = $ressources;
$this->parametres = $parametres;
$this->service = 'ontologies';
$this->traiterParametres();
$resultats = '';
$this->table = 'eflore_ontologies'; //on stocke le nom de la table correspondant à la version du projet en cours
$this->recupererNomChamp($this->table); //on récupère les noms des champs disponibles (Ds Commun.php)
$this->traiterRessources(); //dans CommunNomsTaxons.php
$requete = $this->assemblerLaRequete();
$resultat = $this->getBdd()->recupererTous($requete);
$versionResultat = $this->traiterResultat($resultat, '', $requete);
$resultats = $versionResultat;
return $resultats;
}
public function traiterParametres() {
if (isset($this->parametres) && !empty($this->parametres)) {
foreach ($this->parametres as $param => $valeur) {
switch ($param) {
case 'masque' : $this->ajouterLeFiltreMasque('masque', $valeur); break;
case 'masque.code' : $this->ajouterLeFiltreMasque('code', $valeur); break;
case 'masque.nom' : $this->ajouterLeFiltreMasque('nom', $valeur); break;
case 'masque.description' : $this->ajouterLeFiltreMasque('description', $valeur); break;
case 'retour.format' : $this->retour_format = $valeur; break;
case 'retour.champs' : break;
case 'navigation.depart' : $this->limite_requete['depart'] = $valeur; break;
case 'navigation.limite' : $this->limite_requete['limite'] = $valeur; break;
case 'recherche' : break;
case 'version.projet' : break;
default :
$e = 'Erreur dans les parametres de recherche de votre requête : </br> Le paramètre " '
.$param.' " n\'existe pas.';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e); break;
}
}
}
}
 
public function ajouterLeFiltreMasque($nom_champ, $valeur) {
if ($nom_champ == 'code') {
$this->requete_condition[] = $nom_champ.' = '.$this->getBdd()->proteger($valeur);
} else {
if (isset($this->parametres['recherche']) && $this->parametres['recherche'] == 'floue') {
if ($nom_champ == 'masque') {
$this->requete_condition[] = '( code = '.$this->getBdd()->proteger($valeur)
.' OR ( SOUNDEX(nom) = SOUNDEX(\''.$valeur.'\')'
.' OR SOUNDEX(REVERSE(nom)) = SOUNDEX(REVERSE(\''.$valeur.'\')) '
.') OR ( SOUNDEX(description) = SOUNDEX(\''.$valeur.'\')'
.' OR SOUNDEX(REVERSE(description)) = SOUNDEX(REVERSE(\''.$valeur.'\')) ))';
} else {
$this->requete_condition[] = '(SOUNDEX('.$nom_champ.') = SOUNDEX(\''.$valeur.'\')'
.' OR SOUNDEX(REVERSE('.$nom_champ.')) = SOUNDEX(REVERSE(\''.$valeur.'\')))';
}
} else {
if (isset($this->parametres['recherche']) && $this->parametres['recherche'] == 'etendue') {
$valeur = str_replace(' ','%', $valeur);
$valeur .= '%';
}
if ($nom_champ == 'masque') {
$this->requete_condition[] = '(code = '.$this->getBdd()->proteger($valeur)
.' OR nom LIKE '.$this->getBdd()->proteger($valeur)
.' OR description LIKE '.$this->getBdd()->proteger($valeur).')';
} else {
$this->requete_condition[] = $nom_champ.' LIKE '.$this->getBdd()->proteger($valeur);
}
}
}
}
 
 
public function traiterRessources() {
if (isset($this->ressources) && !empty($this->ressources)) {
if (isset($this->ressources[0]) && !empty($this->ressources[0])) {
//requete = /ontologies/#id
$this->traiterRessourceId();
if (isset($this->ressources[1]) && !empty($this->ressources[1])) {
//requete = /ontologies/#id/relations
$this->traiterRessourceRelations();
}
}
}
}
 
 
public function traiterRessourceId() {
$this->requete_condition = array();
//requete : /ontologies/#id (ex : /ontologies/7)
if (is_numeric($this->ressources[0])) {
$this->requete_condition[] = ' id = '.$this->getBdd()->proteger($this->ressources[0]);
$this->format_reponse .= '/id';
//requete : /ontologies/#classe:#code (ex : /ontologies/rangTaxo:290)
} elseif (strrpos($this->ressources[0], ':') !== false) {
$this->format_reponse .= '/id';
preg_match('/^([^:]+):([^:]+)$/', $this->ressources[0], $match);
$this->requete_condition[] =
' id = (SELECT id FROM '.$this->table.' WHERE code = '.$this->getBdd()->proteger($match[2])
.' AND classe_id = (SELECT id FROM '.$this->table.' WHERE code = '.$this->getBdd()->proteger($match[1]).'))';
} else {
$e = 'Erreur dans les paramètres de recherche de votre requête : </br> Le paramètre " '
.$this->ressources[0].' " n\'existe pas.';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
}
}
 
 
public function traiterRessourceRelations() {
//requete = /ontologies/#id/relations :
if ($this->ressources[1] == 'relations') {
$this->format_reponse .= '/relations';
$this->requete_condition = array('classe_id = (SELECT classe_id FROM '.$this->table.' WHERE '
.implode(' AND ', $this->requete_condition).')');
}
}
 
//+--------------------------FONCTION ASSEMBLAGE DE LA REQUETE-------------------------------------------+
 
public function assemblerLaRequete() {
$requete = ' SELECT '.$this->formerRequeteChamp().
' FROM '.$this->table
.$this->retournerRequeteCondition()
.$this->formerRequeteLimite(); //print_r($requete);
return $requete;
}
 
public function formerRequeteChamp() {
$champ[] = 'id';
if ($this->format_reponse == 'ontologies') {
$champ[] = 'nom, code ';
}
if (isset($this->parametres['retour_champs']) || $this->format_reponse == 'ontologies/id/champs') {
$champs_recherches = explode(',', $this->parametres['retour_champs']);
$champs_possibles = $this->rechercherChampsPossibles();
foreach ($champs_recherches as $champ_recherche) {
if ($this->verifierValiditeChamp($champ_recherche)) {
$champ[] = (preg_match('/classe/', $champ_recherche)) ? 'classe_id' : $champ_recherche;
}
}
}
if (count($champ) == 1) {
$champ = array(' * ');
}
return implode(', ', $champ);
}
 
public function rechercherChampsPossibles() {
$this->recupererNomChamp($this->table);
$champs_possibles = $this->champs_table;
$champs_possibles[] = 'classe.id';
$champs_possibles[] = 'classe';
$champs_possibles[] = 'classe.href';
return $champs_possibles;
}
 
public function verifierValiditeChamp($champ, $champs_possibles) {
$validite = false;
preg_match('/^([^.]+)(:?\.([^.]+))?$/', $champ, $match);
if (in_array($match[1], $champs_possibles)) {
$validite = true;
} else {
$champs = implode('</li><li>', $champs_possibles);
$e = 'Erreur dans votre requête : </br> Le champ "'.$champ
.'" n\'existe pas. Les champs disponibles sont : <li>'.$champs.'</li>';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
}
return $validite;
}
 
public function retournerRequeteCondition() {
$condition = '';
if ($this->requete_condition !== null) {
$condition = ' WHERE '.implode(' AND ', $this->requete_condition);
}
return $condition;
}
 
public function formerRequeteLimite() {
$this->total_resultat = $this->recupererTotalResultat();
if (in_array($this->format_reponse , array('textes/id', 'textes/id/relations'))) {
$this->requete_limite = '';
} elseif (($depart = $this->limite_requete['depart']) > ($this->total_resultat)) {
$this->limite_requete['depart'] =
(($this->total_resultat - $this->limite_requete['limite']) < 0) ? 0 : ($this->total_resultat - $this->limite_requete['limite']);
$this->requete_limite = ' LIMIT '.$this->limite_requete['depart'].', '.$this->limite_requete['limite'];
} else {
$this->requete_limite = ' LIMIT '.$this->limite_requete['depart'].', '.$this->limite_requete['limite'];
}
return $this->requete_limite;
}
 
 
public function recupererTotalResultat() {
//on récupère le nombre total de résultats de la requete (ex : le nombre d'id contenu dans la liste /ontologies)
$requete = 'SELECT count(*) as nombre FROM '.$this->table.' '
.$this->retournerRequeteCondition();
$res = $this->getBdd()->recuperer($requete);
if ($res) {
$total = $res['nombre'];
} else {
$e = 'Données introuvables dans la base';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE, $e);
Debug::printr($requete);
}
return $total;
}
 
//+------------------------------------------------------------------------------------------------------+
public function retournerResultatFormate($resultat) {
// determine en fct du service appelé (/ontologies | /ontologies/#id | /ontologies/#id/champ |
// /ontologies/#id/relations) le format du tableau à retourner. Encode en json
switch ($this->format_reponse) {
case 'ontologies' : $reponse = $this->formaterOntologies($resultat); break;
case 'ontologies/id' : $reponse = $this->formaterOntologiesId($resultat[0]); break;
case 'ontologies/id/relations' : $reponse = $this->formaterOntologiesIdRelations($resultat); break;
default : break;
}
return $reponse;
}
 
 
public function formaterOntologies($resultat) {
$this->ajouterEnteteResultat($resultat);
$table_retour_json['entete'] = $this->ajouterEnteteResultat($resultat);
if (isset($this->parametres['masque_code']) || isset($this->parametres['masque'])) {
$resultat = $this->trierRechercheFloue($this->parametres['masque_code'], $resultat, 'code');
} elseif (isset($this->parametres['masque_nom'])) {
$resultat = $this->trierRechercheFloue($this->parametres['masque_nom'], $resultat, 'nom');
} elseif (isset($this->parametres['masque_description'])) {
$resultat = $this->trierRechercheFloue($this->parametres['masque_description'], $resultat, 'description');
}
//on remplit la table $table_retour_json['resultat']
foreach ($resultat as $tab) {
$num = $tab['id'];
unset($tab['id']);
foreach ($tab as $param => $valeur) {
$resultat_json[$num][$param] = $valeur;
}
if ($this->retour_format == 'max') $resultat_json[$num]['href'] = $this->ajouterHref('ontologies', $num);
}
$table_retour_json['resultat'] = $resultat_json;
return $table_retour_json;
}
 
public function ajouterEnteteResultat($resultat) {
//on remplit la table $table_retour_json['entete']
$entete['depart'] = $this->limite_requete['depart'];
$entete['limite'] = $this->limite_requete['limite'];
$entete['total'] = $this->total_resultat;
//formuler les urls
$url = $this->formulerUrl($this->total_resultat, '/ontologies');
if (isset($url['precedent']) && $url['precedent'] != '') { $entete['href.precedent'] = $url['precedent']; }
if (isset($url['suivant']) && $url['suivant'] != '') { $entete['href.suivant'] = $url['suivant']; }
return $entete;
}
 
 
public function formaterOntologiesId($resultat) {
$table_retour = array();
foreach ($resultat as $key => $valeur) {
if ($valeur != '') {
$table_retour = array_merge($table_retour, $this->afficherDonnees($key, $valeur));
}
}
return $table_retour;
}
 
public function afficherDonnees($champ, $valeur) {
$retour[$champ] = $valeur;
if ($this->retour_format == 'max') {
if ($champ == 'classe_id') {
unset($retour[$champ]); // remplacer par classe.id
if ($valeur != "0") { // pas de parent
if (isset($this->parametres['retour_champs'])) {
switch ($this->parametres['retour_champs']) {
case 'classe' : $retour['classe'] = $this->ajouterClasseCorrespondante($valeur); break;
case 'classe.id' : $retour['classe.id'] = $valeur; break;
case 'classe.href' : $retour['classe.href'] = $this->ajouterHref('ontologies', $valeur); break;
case 'classe.*' : $retour['classe.id'] = $valeur; $retour['classe.href'] = $this->ajouterHref('ontologies', $valeur); break;
}
} else {
$nom_classe = $this->ajouterClasseCorrespondante($valeur);
if (isset($nom_classe)) $retour['classe'] = $nom_classe;
$retour['classe.id'] = $valeur;
$retour['classe.href'] = $this->ajouterHref('ontologies', $valeur);
}
}
}
}
return $retour;
}
 
/** Recherche par interrogation de la base, le nom de la classe à partir de son identifiant (classe.id) */
public function ajouterClasseCorrespondante($classe_id) {
$nom = null;
if ($classe_id != 0) {
$nom = '';
$req = 'SELECT nom FROM '.$this->table.' WHERE id = '.$this->getBdd()->proteger($classe_id);
$res = $this->getBdd()->recuperer($req);
if ($res) {
$nom = $res['nom'];
} else {
$e = "Données introuvables dans la table $this->table";
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE, $e);
Debug::printr($req);
}
}
return $nom;
}
 
public function formaterOntologiesIdRelations($resultat) {
$retour = null;
if ($resultat != '') {
$retour['entete'] = $this->ajouterEnteteResultat($resultat);
//on remplit la table $table_retour_json['resultat']
foreach ($resultat as $tab) {
$num = $tab['id'];
$retour['resultat'][$num]['nom'] = $tab['nom'];
if ($this->retour_format == 'max') {
$retour['resultat'][$num]['href'] = $this->ajouterHref('ontologies', $num);
}
}
}
return $retour;
}
}
?>
/tags/v5.6-arganeraie/services/modules/0.1/insee-d/ZoneGeo.php
New file
0,0 → 1,405
<?php
/**
* Description :
* Classe ZoneGeo.php fournit des informations sur ensemble structuré des termes et concepts représentant les éléments
* d'un domaine de connaissances .
* Le but étant de fournir un ensemble minimal d'information comprenant :
* un identifiant (numérique ou alphanumérique sous forme de ChatMot si possible), un nom, une region et
* éventuellement une relation hiérarchique avec un autre terme (=classe).
* Si l'url finit par /zone-geo on retourne une liste de termes (seulement les 100 premières par défaut).
* L'url peut contenir des paramètres optionnels passés après le ? : /observations?param1=val1&param2=val2&...
*
* Les paramètres de requête disponibles sont : masque, masque.code, masque.nom, masque.region , recherche,
* distinct, retour.format, navigation.depart et navigation.limite.
*
* Encodage en entrée : utf8
* Encodage en sortie : utf8
* @package framework-v3
* @author Delphine Cauquil <delphine@tela-botanica.org>
* @author Jennifer Dhé <jennifer.dhe@tela-botanica.org>
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
* @version 1.0
* @copyright 1999-${year} Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
*/
 
class ZoneGeo extends Commun {
 
protected $service = 'zone-geo';
 
/**
* Permet de stocker la requete formulée : /zone-geo | /zone-geo/#id | /zone-geo/#id/champ | /zone-geo/#id/relations
* Est remplit au cours de l'analyse des ressources (traiterRessources()), par défaut, a la valeur du service.
* Est utilisée principalement pr déterminer le format du tableau à retourner. */
protected $format_reponse = 'zone-geo';
 
/** Variables constituant les parametres de la requete SQL (champ, condition, group by, limit) remplie
* selon ressources et paramètres */
protected $requete_champ = ' * ';
protected $requete_condition = '';
protected $limite_requete = array(
'depart' => 0,
'limite' => 100
);
 
/** Stockage des ressources et paramétres */
protected $table_ressources = array();
protected $table_param = array();
/**
* Precise la contenance plus ou moins précise du tableau à retourner :
* - min = les données présentes dans la table
* - max = les données de la table + les informations complémentaires (pour les identifiants et les codes)
* - oss = la liste des nom_sci (uniquement pour noms et taxons)
*/
protected $retour_format = 'max';
/** Valeur du paramètre de requete recherche :
* - stricte : le masque est passé tel quel à l'opérateur LIKE.
* - etendue : ajout automatique du signe % à la place des espaces et en fin de masque avec utilisation de LIKE.
* - floue : recherche tolérante vis-à-vis d'approximations ou d'erreurs (fautes d'orthographe par exemple) */
protected $recherche;
 
/** Permet de stocker le tableau de résultat (non encodé en json) */
protected $table_retour = array();
/** Stocke le nombre total de résultats de la requete principale. Est calculée lors de l'assemblage de la requete */
protected $total_resultat;
 
// +-----------------------------------------------------------------------------------------------------+
public function traiterParametres() {
if (isset($this->parametres) && !empty($this->parametres)) {
$this->table_param = $this->parametres;
 
// masque : filtre la liste en fonction d'un masque de recherche portant sur le code, le nom ou la region.
// masque.code : filtre uniquement sur le code. masque.nom : filtre uniquement sur le nom.
// masque.region : filtre uniquement sur la region.
if (isset($this->parametres['recherche']) && $this->parametres['recherche'] != '') {
$this->recherche = $this->parametres['recherche'];
}
 
foreach ($this->parametres as $param => $valeur) {
switch ($param) {
case 'masque' :
$this->ajouterLeFiltreMasque('masque', $valeur);
break;
case 'masque.code' :
$this->ajouterLeFiltreMasque('dep', $valeur);
break;
case 'masque.nom' :
$this->ajouterLeFiltreMasque('nccenr', $valeur);
break;
case 'masque.region' :
$this->ajouterLeFiltreMasque('region', $valeur);
break;
case 'retour.format' :
$this->retour_format = $valeur;
break;
case 'navigation.depart' :
$this->limite_requete['depart'] = $valeur;
break;
case 'navigation.limite' :
$this->limite_requete['limite'] = $valeur;
break;
case 'recherche' :
break;
default :
$p = 'Erreur dans les paramètres de recherche de votre requête : '.
'</br> Le paramètre " '.$param.' " n\'existe pas.';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $p);
}
}
}
}
 
public function ajouterLeFiltreMasque($nom_champ, $valeur) {
if ($nom_champ == 'dep' || $nom_champ == 'region') {
$this->requete_condition[] = $nom_champ.' = '.$this->getBdd()->proteger($valeur);
} else {
if ($this->recherche == 'floue') {
if ($nom_champ == 'masque') {
$this->requete_condition[] = '( dep = '.$this->getBdd()->proteger($valeur)
.' OR region = '.$this->getBdd()->proteger($valeur)
.' OR ( SOUNDEX(nccenr) = SOUNDEX(\''.$valeur.'\')'
.' OR SOUNDEX(REVERSE(nccenr)) = SOUNDEX(REVERSE(\''.$valeur.'\')) '
.')) ';
} else {
$this->requete_condition[] = '(SOUNDEX('.$nom_champ.') = SOUNDEX(\''.$valeur.'\')'
.' OR SOUNDEX(REVERSE('.$nom_champ.')) = SOUNDEX(REVERSE(\''.$valeur.'\'))) ';
}
} else {
if ($this->recherche == 'etendue') {
$valeur = str_replace(' ','%', $valeur);
$valeur .= '%';
}
 
if ($nom_champ == 'masque') {
$this->requete_condition[] = ' (dep = '.$this->getBdd()->proteger($valeur)
.' OR nccenr LIKE '.$this->getBdd()->proteger($valeur)
.' OR region = '.$this->getBdd()->proteger($valeur).')';
} else {
$this->requete_condition[] = $nom_champ.' LIKE '.$this->getBdd()->proteger($valeur);
}
}
}
}
 
 
//+------------------------------------------------------------------------------------------------------+
public function traiterRessources() {
if (isset($this->ressources) && !empty($this->ressources)) {
$this->table_ressources = $this->ressources;
if (isset($this->table_ressources[0]) && !empty($this->table_ressources[0])) {
//requete = /zone-geo/#id
$this->traiterRessourceId();
if (isset($this->table_ressources[1]) && !empty($this->table_ressources[1])) {
//dans le cas /zone-geo/#id/#champ ou /zone-geo/#id/relations
$this->traiterRessourceChampOuRelations();
}
}
}
}
 
//requete : /zone-geo/#id (ex : /zone-geo/7)
public function traiterRessourceId() {
if (is_numeric($this->table_ressources[0])) {
$this->requete_condition[] = ' dep = '.$this->getBdd()->proteger($this->table_ressources[0]);
$this->format_reponse .= '/id';
} else {
$r = 'Erreur dans les ressources de votre requête : </br> La ressource " '.$this->table_ressources[0].
' " n\'existe pas.';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $r);
}
}
 
 
public function traiterRessourceChampOuRelations() {
//requete = /zone-geo/#id/relations :
if ($this->table_ressources[1] == 'relations') {
$this->format_reponse .= '/relations';
$this->requete_condition[] = 'region = (SELECT region FROM '.$this->table.' WHERE '
.implode(' AND ', $this->requete_condition).')';
//requete = /zone-geo/#id/#champ :
} else {
$this->format_reponse .= '/champ';
}
}
 
//+------------------------------------------------------------------------------------------------------+
public function assemblerLaRequete() {
//assemblage de la requete :
$requete = ' SELECT '.$this->requete_champ.
' FROM '.$this->table
.$this->formerRequeteCondition()
.$this->formerRequeteLimite();
return $requete;
}
 
public function formerRequeteCondition() {
$condition = '';
if ($this->requete_condition != null) {
$condition = ' WHERE '.implode(' AND ', $this->requete_condition);
}
return $condition;
}
 
 
//ajout d'une limite seulement pour les listes (pas plus de 100 resultats retournés pr les requetes
// suivantes : /zone-geo et /zone-geo/#id/relations)
public function formerRequeteLimite() {
if ($this->format_reponse != 'zone-geo' && $this->format_reponse != 'zone-geo/id/relations') {
$this->requete_limite = '';
} elseif (($depart = $this->limite_requete['depart']) > ($this->total_resultat = $this->recupererTotalResultat())) {
//cas où la requete presente un navigation.depart supérieur au nb total de resultats.
$this->limite_requete['depart'] =
(($nb - $this->limite_requete['limite']) < 0) ? 0 : ($nb - $this->limite_requete['limite']);
$this->requete_limite = ' LIMIT '.$this->limite_requete['depart'].', '.$this->limite_requete['limite'];
} else {
$this->requete_limite = ' LIMIT '.$this->limite_requete['depart'].', '.$this->limite_requete['limite'];
}
return $this->requete_limite;
}
 
public function recupererTotalResultat() {
//on récupère le nombre total de résultats de la requete (ex : le nombre d'id contenu dans la liste /zone-geo)
$requete = 'SELECT count(*) as nombre FROM '
.$this->table
.$this->formerRequeteCondition();
$res = $this->getBdd()->recuperer($requete);
 
if ($res) {
$total = $res['nombre'];
} else {
$t = 'Fonction recupererTotalResultat() : <br/>Données introuvables dans la base';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE, $t);
}
return $total;
}
 
//+------------------------------------------------------------------------------------------------------+
// determine en fct du service appelé (/zone-geo | /zone-geo/#id | /zone-geo/#id/champ |
// /zone-geo/#id/relations) le format du tableau à retourner.
public function retournerResultatFormate($resultat) {
$this->recupererTableConfig('correspondance_champs');
switch ($this->format_reponse) {
case 'zone-geo' : $reponse = $this->formaterZoneGeo($resultat); break;
case 'zone-geo/id' : $reponse = $this->formaterZoneGeoId($resultat[0]); break;
case 'zone-geo/id/champ' : $reponse = $this->formaterZoneGeoIdChamp($resultat[0]); break;
case 'zone-geo/id/relations' : $reponse = $this->formaterZoneGeoIdRelations($resultat); break;
default : break;
}
return $reponse;
}
 
public function formaterZoneGeo($resultat) {
//on remplit la table $table_retour_json['entete']
$this->table_retour['depart'] = $this->limite_requete['depart'];
$this->table_retour['limite'] = $this->limite_requete['limite'];
$this->table_retour['total'] = $this->total_resultat;
$url = $this->formulerUrl($this->total_resultat, '/zone-geo');
if (isset($url['precedent']) && $url['precedent'] != '') { $this->table_retour['href.precedent'] = $url['precedent']; }
if (isset($url['suivant']) && $url['suivant'] != '') { $this->table_retour['href.suivant'] = $url['suivant']; }
$table_retour_json['entete'] = $this->table_retour;
 
//on remplit la table $table_retour_json['resultat']
$this->table_retour = array();
if (isset($this->table_param['masque_nom'])) $resultat = $this->trierRechercheFloue($this->table_param['masque_nom'], $resultat, 'nccenr');
foreach ($resultat as $tab) {
foreach ($tab as $key => $valeur) {
if ($valeur != '') {
switch ($key) {
case 'dep' : $num = $valeur; $this->table_retour['code'] = $valeur; break;
case 'nccenr' : $this->table_retour['nom'] = $valeur; break;
default : break;
}
}
}
if ($this->retour_format == 'max') {
$this->table_retour['href'] = $this->ajouterHref('zone-geo', $num);
}
$resultat_json[$num] = $this->table_retour;
$this->table_retour = array();
}
$table_retour_json['resultat'] = $resultat_json;
return $table_retour_json;
}
 
public function formaterZoneGeoId($resultat) {
foreach ($resultat as $key => $valeur) {
if ($valeur != '') {
$this->afficherDonnees($key, $valeur);
}
}
unset($this->table_retour['href']);
return $this->table_retour;
}
 
public function formaterZoneGeoIdRelations($resultat) {
if ($resultat == '') {
$retour = null;
} else {
//on remplit la table $table_retour_json['entete']
$this->table_retour['depart'] = $this->limite_requete['depart'];
$this->table_retour['limite'] = $this->limite_requete['limite'];
$this->table_retour['total'] = $this->total_resultat;
//formuler les urls
$url = $this->formulerUrl(count($resultat), '/zone-geo');
if ($url['precedent'] != '') { $this->table_retour['href.precedent'] = $url['precedent']; }
if ($url['suivant'] != '') { $this->table_retour['href.suivant'] = $url['suivant']; }
$retour['entete'] = $this->table_retour;
$this->table_retour = array();
 
//on remplit la table $table_retour_json['resultat']
foreach ($resultat as $tab) {
foreach ($tab as $key => $valeur) {
switch ($key) {
case 'dep' : $num = $valeur; $this->table_retour['code'] = $valeur; break;
case 'nccenr' : $this->table_retour['nom'] = $valeur; break;
default : break;
}
}
if ($this->retour_format == 'max') $this->table_retour['href'] = $this->ajouterHref('zone-geo', $num);
$resultat_json[$num] = $this->table_retour;
$this->table_retour = array();
}
$retour['resultat'] = $resultat_json;
}
return $retour;
}
 
public function formaterZoneGeoIdChamp($resultat) {
//on recupère tous les resultats possibles
$reponse = $this->formaterZoneGeoId($resultat);
$this->table_retour = array();
//on recupère les résultats demandés à partir du tableau de résultat complet
$this->table_retour['id'] = $reponse['code'];
$champs = explode(' ', $this->table_ressources[1]);
 
foreach ($champs as $champ) {
if ($this->verifierValiditeChamp($champ)) {
if (strrpos($champ, '.*') !== false) {
$this->afficherPointEtoile($champ, $reponse);
 
} else {
if (isset($reponse[$champ])) {
$this->table_retour[$champ] = $reponse[$champ];
} else {
$this->table_retour[$champ] = null;
}
}
}
}
return $this->table_retour;
}
 
public function verifierValiditeChamp($champ) {
preg_match('/^([^.]+)(\.([^.]+))?$/', $champ, $match);
$champs_possibles = $this->correspondance_champs;
$champs_possibles[] = 'nom.*';
 
if (in_array($match[1], $champs_possibles)) {
$validite = true;
} elseif (in_array($match[0], $champs_possibles)) {
$validite = true;
} else {
$champs_possibles = implode('</li><li>', $champs_possibles);
$c = 'Erreur dans votre requête : </br> Le champ "'.$champ_possibles.'" n\'existe pas. '.
'Les champs disponibles sont : <li>'.$champs_possibles.'</li>';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $c);
}
return $validite;
}
 
public function afficherPointEtoile($champ, $reponse) {
preg_match('/^([^.]+\.)\*$/', $champ, $match);
foreach ($reponse as $chp => $valeur) {
if (strrpos($chp, $match[1]) !== false) {
if ($valeur != '') {
$this->table_retour[$chp] = $valeur;
} else {
$this->table_retour[$chp] = null;
}
}
}
}
 
public function afficherDonnees($champ, $valeur) {
if ($this->retour_format == 'max') {
if ($champ == 'region' || $champ == 'chef_lieu') {
$projet = 'insee-'.substr($champ, 0, 1);
$this->table_retour[$champ.'.code'] = $valeur;
$this->table_retour[$champ.'.href'] = $this->ajouterHrefAutreProjet('zone-geo', '', $valeur, $projet);
} elseif ($champ == 'tncc') {
$url = $this->ajouterHref('ontologies', $valeur);
$res = $this->consulterHref($url);
$this->table_retour['type_nom'] = $res->nom;
$this->table_retour['type_nom.code'] = $valeur;
$this->table_retour['type_nom.href'] = $url;
} else {
$this->table_retour[$this->correspondance_champs[$champ]] = $valeur;
}
} else {
$this->table_retour[$this->correspondance_champs[$champ]] = $valeur;
}
}
 
}
 
?>
/tags/v5.6-arganeraie/services/modules/0.1/nva/NomsVernaculaires.php
New file
0,0 → 1,653
<?php
/**
* Description :
* Classe NomsVernaculaires.php fournit une liste de noms vernaculaires et leur liaison à la bdtxa
* Le but étant de fournir un ensemble minimal d'information comprenant :
* un identifiant (numérique ou alphanumérique sous forme de ChatMot si possible), un nom, une langue et
* une relation avec un taxon de la bdtxa.
* Si l'url finit par /noms-vernaculaires on retourne une liste de noms (seulement les 100 premières par défaut).
* L'url peut contenir des paramètres optionnels passés après le ? : /observations?param1=val1&param2=val2&...
*
* Les paramètres de requête disponibles sont : masque, masque.code, masque.nom, masque.region , recherche,
* distinct, retour.format, navigation.depart et navigation.limite.
*
* Encodage en entrée : utf8
* Encodage en sortie : utf8
* @package framework-v3
* @author Delphine Cauquil <delphine@tela-botanica.org>
* @author Jennifer Dhé <jennifer.dhe@tela-botanica.org>
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
* @version 1.0
* @copyright 1999-${year} Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
*/
class NomsVernaculaires extends Commun {
protected $champ_infos = array(
'taxon' => array('service' => 'taxons', 'ressource' => 'nt:', 'projet' => 'bdtxa', 'nom' => 'nom_sci'));
 
protected $service = 'noms-vernaculaires';
 
/**
* Permet de stocker la requete formulée : /noms-vernaculaires | /noms-vernaculaires/#id |
* /noms-vernaculaires/#id/champ | /noms-vernaculaires/#id/relations
* Est remplit au cours de l'analyse des ressources (traiterRessources()), par défaut, a la valeur du service.
* Est utilisée principalement pr déterminer le format du tableau à retourner. */
protected $format_reponse = 'noms-vernaculaires';
 
/** Variables constituant les parametres de la requete SQL (champ, condition, limit) remplie
* selon ressources et paramètres */
protected $requete_champ = array(' * ');
protected $requete_condition = '';
protected $limite_requete = array(
'depart' => 0,
'limite' => 100
);
protected $champ_tri = 'code_langue';
protected $direction_tri = 'asc';
/**
* Indique les champs supplémentaires à retourner
* - conseil_emploi = conseil d'emploi du nom vernaculaire
* - genre = genre et nombre du nom
* - taxon = nom retenu associé à ce nom
*/
protected $champs_supp = array();
 
/**
* Precise la contenance plus ou moins précise du tableau à retourner :
* - min = les données présentes dans la table
* - max = les données de la table + les informations complémentaires (pour les identifiants et les codes)
* - oss = la liste des nom_sci (uniquement pour noms et taxons) */
protected $retour_format = 'max';
/** Valeur du paramètre de requete recherche :
* - stricte : le masque est passé tel quel à l'opérateur LIKE.
* - etendue : ajout automatique du signe % à la place des espaces et en fin de masque avec utilisation de LIKE.
* - floue : recherche tolérante vis-à-vis d'approximations ou d'erreurs (fautes d'orthographe par exemple) */
protected $recherche;
/** Permet de stocker le tableau de résultat (non encodé en json) */
protected $table_retour = array();
/** Stocke le nombre total de résultats de la requete principale. Est calculée lors de l'assemblage de la requete */
protected $total_resultat;
private $config;
public function __construct($config) {
$this->config = is_null($config) ? Config::get('NomsVernaculaires') : $config;
}
 
//+------------------------------------------------------------------------------------------------------+
// créer une condition en fonction du paramétre
public function traiterParametres() {
if (isset($this->parametres) && !empty($this->parametres)) {
 
if (isset($this->parametres['recherche']) && $this->parametres['recherche'] != '') {
$this->recherche = $this->parametres['recherche'];
}
foreach ($this->parametres as $param => $valeur) {
switch ($param) {
case 'masque' :
$this->ajouterFiltreMasque('nom_vernaculaire', $valeur);
break;
case 'masque.nt' :
$this->ajouterFiltreMasque('num_taxon', $valeur);
break;
case 'masque.nv' :
$this->ajouterFiltreMasque('nom_vernaculaire', $valeur);
break;
case 'masque.lg' :
$this->ajouterFiltreMasque('code_langue', $valeur);
break;
case 'retour.format' :
$this->retour_format = $valeur;
break;
case 'navigation.depart' :
$this->limite_requete['depart'] = $valeur;
break;
case 'navigation.limite' :
$this->limite_requete['limite'] = $valeur;
break;
case 'retour.champs' :
$this->champs_supp = explode(',',$valeur);
break;
case 'recherche' :
break;
case 'version.projet' :
break;
default :
$p = 'Erreur dans les paramètres de recherche de votre requête : '.
'</br> Le paramètre " '.$param.' " n\'existe pas.';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $p);
}
}
}
}
 
public function ajouterFiltreMasque($nom_champ, $valeur) {
if ($nom_champ == 'num_taxon') { // si il s'agit d'un chiffre
$this->requete_condition[] = $nom_champ.' = '.$this->getBdd()->proteger($valeur);
} else {
if ($this->recherche == 'floue') {
$this->requete_condition[] = '(SOUNDEX('.$nom_champ.') = SOUNDEX(\''.$valeur.'\')'
.' OR SOUNDEX(REVERSE('.$nom_champ.')) = SOUNDEX(REVERSE(\''.$valeur.'\'))) ';
} else {
if ($this->recherche == 'etendue') {
$valeur = '%'.str_replace(' ','% ', $valeur);
$valeur .= '%';
}
$this->requete_condition[] = 'nva.'.$nom_champ.' LIKE '.$this->getBdd()->proteger($valeur);
}
}
}
 
//+------------------------------------------------------------------------------------------------------+
// en fonction de la présence des ressources modifie requete_champ et requete_condition
public function traiterRessources() {
if (isset($this->ressources) && !empty($this->ressources)) {
if (isset($this->ressources[0]) && !empty($this->ressources[0])) {
$this->traiterRessourceId(); // ajoute condition id=#valeur
if (isset($this->ressources[1]) && !empty($this->ressources[1])) {
$this->traiterRessourceChamp(); //modifie requete_champ ou requete_condition
}
}
} else { //rajoute distinct pour ne pas avoir plusieurs fois le même nom
$this->requete_champ = array('distinct(nva.num_nom_vernaculaire)', 'nva.nom_vernaculaire ');
}
}
 
//requete : /noms-vernaculaires/#id (ex : /noms-vernaculaires/7)
public function traiterRessourceId() {
if (is_numeric($this->ressources[0])) {
$this->requete_condition[] = ' nva.num_nom_vernaculaire = '.$this->getBdd()->proteger($this->ressources[0]);
$this->format_reponse .= '/id';
} elseif ($this->ressources[0] == 'attributions') {
$this->format_reponse .= '/attributions';
} else {
$r = 'Erreur dans les ressources de votre requête : </br> La ressource " '.$this->ressources[0].
' " n\'existe pas.';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $r);
}
}
 
 
public function traiterRessourceChamp() {
$this->format_reponse .= '/champ';
$this->analyserChamp();
}
 
public function analyserChamp() {
$this->requete_champ = array();
$this->recupererTableConfig('champs_possibles');// s'il y a plusieurs champs correspondant au champ demandé ils sont séparé par des |
$champs = explode(' ', $this->ressources[1]);
foreach ($champs as $champ) {
preg_match('/^([^.]+)(\.([^.]+))?$/', $champ, $match);
if (isset($this->champs_possibles[$match[1]])) {
$this->requete_champ[] = str_replace('|', ', ', $this->champs_possibles[$match[1]]);
} elseif (isset($this->champs_possibles[$match[0]])) {
$this->requete_champ[] = str_replace('|', ', ', $this->champs_possibles[$match[0]]);
} else {
$champs_possibles = implode('</li><li>', array_keys($this->champs_possibles));
$c = 'Erreur dans votre requête : </br> Le champ "'.$champ_possibles.'" n\'existe pas. '.
'Les champs disponibles sont : <li>'.$champs_possibles.'</li> et leurs déclinaisons (ex. ".code").';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $c);
}
}
}
 
//+------------------------------------------------------------------------------------------------------+
public function assemblerLaRequete() {
$requete = ' SELECT '.$this->formerRequeteChamp().
', CASE nva.code_langue WHEN "fra" THEN 1 ELSE 0 END AS tri '.
' FROM '.str_replace('nva', 'nva_index', $this->table).' inva'.
' LEFT JOIN '.$this->table.' nva ON nva.num_nom_vernaculaire = inva.num_nom_vernaculaire '
.$this->formerRequeteCondition().
' ORDER BY tri DESC, nva.nom_vernaculaire ASC '
.$this->formerRequeteLimite();
return $requete;
}
 
public function formerRequeteChamp() {
if (in_array('*', $this->requete_champ)) {
$champ = ' * ';
} else {
$champ = implode(', ', $this->requete_champ);
}
return $champ;
}
 
public function formerRequeteCondition() {
$condition = '';
if ($this->requete_condition != null) {
$condition = ' WHERE '.implode(' AND ', $this->requete_condition);
}
return $condition;
}
 
//ajout d'une limite seulement pour les listes (pas plus de 100 resultats retournés pr les requetes
// suivantes : /noms-vernaculaires et /noms-vernaculaires/#id/relations)
public function formerRequeteLimite() {
if (in_array($this->format_reponse , array($this->service.'/id', $this->service.'/id/champs'))) {
$this->requete_limite = '';
} elseif (($depart = $this->limite_requete['depart']) > ($this->total_resultat = $this->recupererTotalResultat())) {
$this->limite_requete['depart'] =
(($this->total_resultat - $this->limite_requete['limite']) < 0) ? 0 : ($this->total_resultat - $this->limite_requete['limite']);
$this->requete_limite = ' LIMIT '.$this->limite_requete['depart'].', '.$this->limite_requete['limite'];
} else {
$this->requete_limite = ' LIMIT '.$this->limite_requete['depart'].', '.$this->limite_requete['limite'];
}
return $this->requete_limite;
}
 
//on récupère le nombre total de résultats de la requete (ex : le nombre d'id contenu dans la liste /noms-vernaculaires)
public function recupererTotalResultat() {
$distinct = ($this->format_reponse == 'noms-vernaculaires/attributions') ? '*' : 'distinct nva.num_nom_vernaculaire';
$requete = 'SELECT count('.$distinct.') as nombre FROM '
.str_replace('nva', 'nva_index', $this->table).' inva '
.'INNER JOIN '.$this->table.' nva ON nva.num_nom_vernaculaire = '
.'inva.num_nom_vernaculaire '
.$this->formerRequeteCondition();
 
$res = $this->getBdd()->recuperer($requete);
 
if ($res) {
$total = $res['nombre'];
} else {
$t = 'Fonction recupererTotalResultat() : <br/>Données introuvables dans la base '.$requete;
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE, $t);
}
return $total;
}
 
//+------------------------------------------------------------------------------------------------------+
// determine en fct du service appelé (/noms-vernaculaires | /noms-vernaculaires/#id | /noms-vernaculaires/#id/champ |
// /noms-vernaculaires/#id/relations) le format du tableau à retourner.
public function retournerResultatFormate($resultat) {
$this->recupererTableConfig('correspondance_champs');
switch ($this->format_reponse) {
case 'noms-vernaculaires' :
$reponse = ($this->retour_format == 'oss') ? $this->formaterEnOss($resultat) : $this->formaterNomsVernaculaires($resultat); break;
case 'noms-vernaculaires/attributions' : $reponse = $this->formaterNomsVernaculairesAttributions($resultat); break;
case 'noms-vernaculaires/id' : $reponse = $this->formaterNomsVernaculairesId($resultat); break;
case 'noms-vernaculaires/id/champ' : $reponse = $this->formaterNomsVernaculairesIdChamp($resultat); break;
default : break;
}
return $reponse;
}
public function ajouterJsonEnTeteNV() {
$table_retour_json['masque'] = $this->recupererMasque();
$table_retour_json['depart'] = $this->limite_requete['depart'];
$table_retour_json['limite'] = $this->limite_requete['limite'];
$table_retour_json['total'] = $this->total_resultat;
$url = $this->formulerUrl($this->total_resultat, '/noms-vernaculaires');
if (isset($url['precedent']) && $url['precedent'] != '') {
$table_retour_json['href.precedent'] = $url['precedent'];
}
if (isset($url['suivant']) && $url['suivant'] != '') {
$table_retour_json['href.suivant'] = $url['suivant'];
}
return $table_retour_json;
}
public function ajouterJsonResultatNV($resultat) {
foreach ($resultat as $tab) {
foreach ($tab as $key => $valeur) {
if ($valeur != '') {
switch ($key) {
case 'num_nom_vernaculaire' : $num = $valeur; break;
case 'nom_vernaculaire' : $this->table_retour['nom'] = $valeur; break;
default : break;
}
}
}
if ($this->retour_format == 'max') $this->table_retour['href'] = $this->ajouterHref('noms-vernaculaires', $num);
$resultat_json[$num] = $this->table_retour;
$this->table_retour = array();
}
return $resultat_json;
}
 
public function formaterNomsVernaculaires($resultat) {
$table_retour_json['entete'] = $this->ajouterJsonEnTeteNV();
$resultat = $this->hierarchiserResultat($resultat);
$table_retour_json['resultat'] = $this->ajouterJsonResultatNV($resultat);
return $table_retour_json;
}
public function hierarchiserResultat($resultat) {
//tri recherche floue
if (isset($this->parametres['masque.nv'])) {
$resultat = $this->trierRechercheFloue($this->parametres['masque.nv'], $resultat, 'nom_vernaculaire');
}
if (isset($this->parametres['masque'])) {
$resultat = $this->trierRechercheFloue($this->parametres['masque'], $resultat, 'nom_vernaculaire');
}
return $resultat;
}
public function recupererMasque() {
$tab_masque = array();
foreach ($this->parametres as $param=>$valeur) {
if (strstr($param, 'masque') != false) {
$tab_masque[] = $param.'='.$valeur;
}
}
$masque = implode('&', $tab_masque);
return $masque;
}
public function formaterEnOss($resultat) {
$table_nom = array();
$oss = '';
foreach ($resultat as $tab) {
if (isset($tab['nom_vernaculaire']) ) {
if (!in_array($tab['nom_vernaculaire'], $table_nom)) {
$table_nom[] = $tab['nom_vernaculaire'];
$oss [] = $tab['nom_vernaculaire'];
}
}
}
$masque = $this->recupererMasque();
if($masque == "") {
$masque = "Pas de masque";
}
$table_retour_oss = array($masque, $oss);
return $table_retour_oss;
}
public function formaterNomsVernaculairesAttributions($resultat) {
$table_retour_json['entete']['masque'] = $this->recupererMasque();
$table_retour_json['entete']['depart'] = $this->limite_requete['depart'];
$table_retour_json['entete']['limite'] = $this->limite_requete['limite'];
$table_retour_json['entete']['total'] = $this->total_resultat;
$url = $this->formulerUrl($this->total_resultat, '/noms-vernaculaires/attributions');
if (isset($url['precedent']) && $url['precedent'] != '') {
$table_retour_json['entete']['href.precedent'] = $url['precedent'];
}
if (isset($url['suivant']) && $url['suivant'] != '') {
$table_retour_json['entete']['href.suivant'] = $url['suivant'];
}
foreach ($resultat as &$tab) {
unset($tab['tri']);
$id_nom = $tab['num_nom_vernaculaire'];
$resultat_json[$id_nom]['id'] = $id_nom;
$resultat_json[$id_nom]['nom_vernaculaire'] = $tab['nom_vernaculaire'];
$resultat_json[$id_nom]['code_langue'] = $tab['code_langue'];
$resultat_json[$id_nom]['taxon.code'] = 'bdtxa.nt:'.$tab['num_taxon'];
if ($this->retour_format == 'max') {
$resultat_json[$id_nom]['num_taxon'] = $tab['num_taxon'];
$resultat_json[$id_nom]['nom_retenu.code'] = $tab['num_taxon'];
$resultat_json[$id_nom]['taxon'] = $tab['num_taxon'];
$this->taxons[] = $tab['num_taxon']; // utilisé pour chercher les noms latins plus bas
$resultat_json[$id_nom]['href'] = $this->ajouterHref('noms-vernaculaires', $id_nom);
if($this->champs_supp != array()) {
$resultat_json[$id_nom] = $this->ajouterChampsOntologieLigneResultat($tab);
}
}
}
if ($this->retour_format == 'max') {
// On est obligé de faire un deuxième boucle pour demander tous les taxons présents en une
// fois et les attribuer aux noms car c'est beaucoup plus rapide
$noms_sci = $this->recupererNomTaxons();
foreach ($resultat_json as $num_nom => &$tab) {
$tab = $this->ajouterTaxonsAttributionsLigneResultat($tab, $noms_sci);
if($tab == null) {
unset($resultat_json[$num_nom]);
}
}
}
$table_retour_json['resultat'] = $resultat_json;
return $table_retour_json;
}
/**
* Ajoute les champs d'ontologie supplémentaires si necéssaire
* en faisant appels aux web services associés
* @param array $ligne_resultat
*
* @return array la ligne modifiée
*/
public function ajouterChampsOntologieLigneResultat($ligne_resultat) {
$intitule = '';
foreach($this->champ_infos as $cle => $champs_supplementaires) {
if(in_array($cle, $this->champs_supp)) {
extract($champs_supplementaires);
$valeur_recherche = '';
switch($cle) {
case 'taxon':
$valeur_recherche = $ligne_resultat['num_taxon'];
$intitule = 'taxon.code';
break;
}
$code_valeur = '';
if(trim($valeur_recherche) != '') {
$url = $this->ajouterHrefAutreProjet($service, $ressource, $valeur_recherche, $projet);
$code_valeur = $this->chercherSignificationCode($url, $nom);
}
$ligne_resultat[$intitule] = $code_valeur;
}
}
return $ligne_resultat;
}
/**
* Fonction qui ajoute les attributions à une ligne de résultats
*
* @param array $ligne_tableau_resultat
* @param array $nom_sci
*/
public function ajouterTaxonsAttributionsLigneResultat(&$ligne_tableau_resultat, &$noms_sci) {
if (isset($noms_sci[$ligne_tableau_resultat['num_taxon']])) {
$ligne_tableau_resultat['nom_retenu.code'] = $noms_sci[$ligne_tableau_resultat['num_taxon']]['id'];
$ligne_tableau_resultat['taxon'] = $noms_sci[$ligne_tableau_resultat['num_taxon']]['nom_sci'];
} else {
$ligne_tableau_resultat = null;
}
return $ligne_tableau_resultat;
}
private function trierLigneTableau($a, $b) {
$retour = 0;
if ($a[$this->champ_tri] == $b[$this->champ_tri]) {
$retour = 0;
}
if($this->champ_tri == 'code_langue') {
if ($a[$this->champ_tri] == 'fra' && $b[$this->champ_tri] != 'fra') {
$retour = ($this->direction_tri == 'asc') ? -1 : 1;
} else if ($a[$this->champ_tri] != 'fra' && $b[$this->champ_tri] == 'fra') {
$retour = ($this->direction_tri == 'asc') ? 1 : -1;
} else {
$retour = $this->comparerChaineSelonDirectionTri($a[$this->champ_tri], $b[$this->champ_tri]);
}
} else {
$retour = $this->comparerChaineSelonDirectionTri($a[$this->champ_tri], $b[$this->champ_tri]);
}
return $retour;
}
private function comparerChaineSelonDirectionTri($a, $b) {
if($this->direction_tri == 'asc') {
return ($a < $b) ? -1 : 1;
} else {
return ($a > $b) ? -1 : 1;
}
}
// formatage de la reponse /id ss la forme
// id, nom_vernaculaire, attributions
// langue
// num_nom (correspond à un taxon bdtxa)
public function formaterNomsVernaculairesId($resultat) {
foreach ($resultat as $taxon) { // pour chaque attribution à un taxon bdtxa
// on crée les variables qui serviront de clés et on les enléves du tableau
$num_nom = $taxon['num_nom_vernaculaire']; // unique pour un trinôme id, langue, taxon
unset($taxon['num_nom_vernaculaire']);
$langue = $taxon['code_langue'];
unset($taxon['code_langue']);
 
foreach ($this->correspondance_champs as $key => $correspondance) { // ordonne les infos pour affichage
if (isset($taxon[$key]) && $taxon[$key] != "") {
$this->afficherDonnees($correspondance, $taxon[$key], $langue, $num_nom);
}
}
foreach ($taxon as $key => $valeur) { // rajoute les champs non prévus dans l'api
if (!isset($this->correspondance_champs[$key]) && $valeur != "") {
$this->afficherDonnees($key, $valeur, $langue, $num_nom);
}
}
}
if ($this->retour_format == 'max') $this->afficherTaxons(); // va chercher les noms de tous les taxons
unset($this->table_retour['href']);
return $this->table_retour;
}
 
public function afficherDonnees($champ, $valeur, $langue = '', $num_nom = '') {
if ($champ == 'num_nom_vernaculaire' || $champ == 'nom_vernaculaire') {
$this->table_retour[$champ] = $valeur;
} elseif (preg_match('/^(.*)\.code$/', $champ, $match)) {
switch ($match[1]) {
case 'taxon' : if ($this->retour_format == 'max') {$this->taxons[$num_nom] = $valeur;}
$this->afficherPointCode($match[1], $langue, $num_nom, $valeur); break;
case 'langue' : //$this->afficherPointCode($match[1], 'iso-639-3', 'langues', $valeur);
break;
default : break;
}
 
} elseif ($langue != '') {
$this->table_retour['attributions'][$langue][$num_nom][$champ] = $valeur;
} else {
$this->table_retour[$champ] = $valeur;
}
}
 
public function afficherPointCode($nomChamp, $langue, $num_nom, $valeur) {
if (isset($this->champ_infos[$nomChamp])) {
extract($this->champ_infos[$nomChamp]);
}
 
if ($this->retour_format == 'max') {
$url = $this->ajouterHrefAutreProjet($service, $ressource, $valeur, $projet);
if ($service == 'taxons') {
$code_valeur = '';
$this->table_retour['attributions'][$langue][$num_nom]['nom_retenu.code'] = $code_valeur;
} else {
$code_valeur = $this->chercherSignificationCode($url, $nom);
}
if ($projet != '') $projet .= '.';
$this->table_retour['attributions'][$langue][$num_nom][$nomChamp] = $code_valeur;
$this->table_retour['attributions'][$langue][$num_nom][$nomChamp.'.code'] = $projet.$ressource.$valeur;
$this->table_retour['attributions'][$langue][$num_nom][$nomChamp.'.href'] = $url;
} else {
if ($projet != '') $projet .= '.';
$this->table_retour['attributions'][$langue][$num_nom][$nomChamp.'.code'] = $projet.$ressource.$valeur;
}
}
 
public function chercherSignificationCode($url, $nom) {
if (isset($this->signification_code[$url])) {
$valeur = $this->signification_code[$url];
} else {
$res = $this->consulterHref($url);
$valeur = $res->$nom;
$this->signification_code[$url] = $valeur;
}
return $valeur;
}
 
public function afficherTaxons() {
$resultat = $this->recupererNomTaxons();
foreach ($this->table_retour['attributions'] as $code_langue=>$langue) {
foreach ($langue as $num_nom=>$taxon) {
$num_tax = ltrim($taxon['taxon.code'], 'bdtxa.nt:');
if (isset($resultat[$num_tax])) {
$this->table_retour['attributions'][$code_langue][$num_nom]['nom_retenu.code'] = $resultat[$num_tax]['id'];
$this->table_retour['attributions'][$code_langue][$num_nom]['taxon'] = $resultat[$num_tax]['nom_sci'];
}
}
}
}
public function recupererNomTaxons() {
$taxons = array_unique($this->taxons);
$url = Config::get('url_service_base').'bdtxa/taxons?navigation.limite=500&ns.structure=au&masque.nt='.implode(',', $taxons);
$res = $this->consulterHref($url);
foreach ($res->resultat as $id=>$taxon) {
$resultat[$taxon->num_taxonomique]['id'] = 'bdtxa.nn:'.$id;
$resultat[$taxon->num_taxonomique]['nom_sci'] = $taxon->nom_sci_complet;
}
return $resultat;
}
 
public function formaterNomsVernaculairesIdChamp($resultat) {
$this->table_retour['id'] = $this->ressources[0];
$champs = explode(' ', $this->ressources[1]);
if (in_array('attributions', $champs) != false) {
$this->formaterNomsVernaculairesId($resultat);
unset($this->table_retour['nom_vernaculaire']);
} else {
$champ_attributions = array('num_taxon', 'zone_usage', 'num_statut', 'num_genre', 'notes');
foreach ($resultat as $taxon) {
foreach ($taxon as $key=>$valeur) {
if ($key == 'code_langue' && in_array('langue', $champs) != false) {
$this->table_retour['attributions']['langue'][] = $valeur;
} elseif (in_array($key, $champ_attributions) != false) {
$this->afficherPoint($this->correspondance_champs[$key] , $valeur, $taxon['code_langue'], $taxon['num_nom_vernaculaire']);
} elseif (in_array($key, $champs) != false) {
$this->table_retour[$key] = $valeur;
}
}
if (in_array('biblio', $champs) != false) $this->chargerBiblio($taxon['num_nom_vernaculaire'], $taxon['code_langue']);
}
if (in_array('biblio', $champs) != false && array_search('biblio.num_ref', $this->table_retour) != false) $this->table_retour['biblio'] = null;
}
return $this->table_retour;
}
 
public function afficherPoint($champ, $valeur, $langue, $num_nom) {
preg_match('/^(.*)\.code$/', $champ, $match);
$champ = $match[1];
if (isset($this->champ_infos[$champ])) {
extract($this->champ_infos[$champ]);
$url = $this->ajouterHrefAutreProjet($service, $ressource, $valeur, $projet);
$projet .= '.';
}
 
$champs = explode(' ', $this->ressources[1]);
if (in_array($champ.'.*', $champs) !== false && isset($projet)) {
$this->table_retour['attributions'][$langue][$num_nom][$champ.'.code'] = $projet.$ressource.$valeur;
$this->table_retour['attributions'][$langue][$num_nom][$champ.'.href'] = $url;
}
if (in_array($champ.'.code', $champs) !== false && isset($projet)) {
$this->table_retour['attributions'][$langue][$num_nom][$champ.'.code'] = $projet.$ressource.$valeur;
}
if (in_array($champ.'.href', $champs) !== false && isset($projet)) {
$this->table_retour['attributions'][$langue][$num_nom][$champ.'.href'] = $url;
}
if (in_array($champ, $champs) !== false) {
if (isset($url)) {
$this->table_retour['attributions'][$langue][$num_nom][$champ] = $this->chercherSignificationCode($url, $nom);
} else {
$this->table_retour['attributions'][$langue][$champ] = $valeur;
}
}
}
 
public function afficherLangue($nomChamp, $projet, $service, $valeur, $ressource = '', $nom = 'nom') {
if ($this->retour_format == 'max') {
$this->table_retour['attributions'][$nomChamp] = $nom;
$this->table_retour['attributions'][$nomChamp.'.code'] = $projet.$ressource.$valeur;
$this->table_retour['attributions'][$nomChamp.'.href'] = $url;
} else {
$this->table_retour['attributions'][$nomChamp.'.code'] = $projet.$ressource.$valeur;
}
}
}
?>
/tags/v5.6-arganeraie/services/modules/0.1/iso-3166-1/ZoneGeo.php
New file
0,0 → 1,401
<?php
/**
* Description :
* Classe ZoneGeo.php fournit des informations sur un ensemble de lieux à une échelle donnée.
* Le but étant de fournir un ensemble minimal d'information comprenant :
* un identifiant (numérique ou alphanumérique sous forme de ChatMot si possible), un nom, une region et
* éventuellement une relation hiérarchique avec un autre terme (=classe).
* Si l'url finit par /zone-geo on retourne une liste de zones (seulement les 100 premières par défaut).
* L'url peut contenir des paramètres optionnels passés après le ? : /zone-geo?param1=val1&param2=val2&...
*
* Les paramètres de requête disponibles sont : masque, masque.code, masque.nom, masque.region , recherche,
* distinct, retour.format, navigation.depart et navigation.limite.
*
* Encodage en entrée : utf8
* Encodage en sortie : utf8
* @package framework-v3
* @author Delphine Cauquil <delphine@tela-botanica.org>
* @author Jennifer Dhé <jennifer.dhe@tela-botanica.org>
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
* @version 1.0
* @copyright 1999-${year} Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
*/
 
class ZoneGeo extends Commun {
 
protected $service = 'zone-geo';
 
/**
* Permet de stocker la requete formulée : /zone-geo | /zone-geo/#id | /zone-geo/#id/champ | /zone-geo/#id/relations
* Est remplit au cours de l'analyse des ressources (traiterRessources()), par défaut, a la valeur du service.
* Est utilisée principalement pr déterminer le format du tableau à retourner. */
protected $format_reponse = 'zone-geo';
 
/** Variables constituant les parametres de la requete SQL (champ, condition, group by, limit) remplie
* selon ressources et paramètres */
protected $requete_champ = ' * ';
protected $requete_condition = '';
protected $limite_requete = array(
'depart' => 0,
'limite' => 100
);
 
/** Stockage des ressources et paramétres */
protected $table_ressources = array();
protected $table_param = array();
/**
* Precise la contenance plus ou moins précise du tableau à retourner :
* - min = les données présentes dans la table
* - max = les données de la table + les informations complémentaires (pour les identifiants et les codes)
* - oss = la liste des nom_sci (uniquement pour noms et taxons)
*/
protected $retour_format = 'max';
/** Valeur du paramètre de requete recherche :
* - stricte : le masque est passé tel quel à l'opérateur LIKE.
* - etendue : ajout automatique du signe % à la place des espaces et en fin de masque avec utilisation de LIKE.
* - floue : recherche tolérante vis-à-vis d'approximations ou d'erreurs (fautes d'orthographe par exemple) */
protected $recherche;
 
/** Permet de stocker le tableau de résultat (non encodé en json) */
protected $table_retour = array();
/** Stocke le nombre total de résultats de la requete principale. Est calculée lors de l'assemblage de la requete */
protected $total_resultat;
 
// +-----------------------------------------------------------------------------------------------------+
public function traiterParametres() {
if (isset($this->parametres) && !empty($this->parametres)) {
$this->table_param = $this->parametres;
 
// masque : filtre la liste en fonction d'un masque de recherche portant sur le code, le nom ou la region.
// masque.code : filtre uniquement sur le code. masque.nom : filtre uniquement sur le nom.
// masque.region : filtre uniquement sur la region.
if (isset($this->parametres['recherche']) && $this->parametres['recherche'] != '') {
$this->recherche = $this->parametres['recherche'];
}
 
foreach ($this->parametres as $param => $valeur) {
switch ($param) {
case 'masque' :
$this->ajouterLeFiltreMasque('masque', $valeur);
break;
case 'masque.code' :
$this->ajouterLeFiltreMasque('codet', $valeur);
break;
case 'masque.nom' :
$this->ajouterLeFiltreMasque('nom', $valeur);
break;
case 'masque.statut' :
$this->ajouterLeFiltreMasque('codet_statut', $valeur);
break;
case 'retour.format' :
$this->retour_format = $valeur;
break;
case 'navigation.depart' :
$this->limite_requete['depart'] = $valeur;
break;
case 'navigation.limite' :
$this->limite_requete['limite'] = $valeur;
break;
case 'recherche' :
break;
default :
$p = 'Erreur dans les paramètres de recherche de votre requête : '.
'</br> Le paramètre " '.$param.' " n\'existe pas.';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $p); break;
}
}
}
}
 
public function ajouterLeFiltreMasque($nom_champ, $valeur) {
if ($nom_champ == 'codet') {
$this->requete_condition[] .= $nom_champ.' = '.$this->getBdd()->proteger($valeur);
} else {
if ($this->recherche == 'floue') {
if ($nom_champ == 'masque') {
$this->requete_condition[] = ' ( codet = '.$this->getBdd()->proteger($valeur)
.' OR (SOUNDEX(nom_francais) = SOUNDEX(\''.$valeur.'\')'
.' OR SOUNDEX(REVERSE(nom_francais)) = SOUNDEX(REVERSE(\''.$valeur.'\')) OR '
.'SOUNDEX(nom_anglais) = SOUNDEX(\''.$valeur.'\')'
.' OR SOUNDEX(REVERSE(nom_anglais)) = SOUNDEX(REVERSE(\''.$valeur.'\'))) '
.' OR ( SOUNDEX(codet_statut) = SOUNDEX(\''.$valeur.'\')'
.' OR SOUNDEX(REVERSE(codet_statut)) = SOUNDEX(REVERSE(\''.$valeur.'\')) '
.')) ';
} elseif ($nom_champ == 'nom') {
$this->requete_condition[] = '(SOUNDEX(nom_francais) = SOUNDEX(\''.$valeur.'\')'
.' OR SOUNDEX(REVERSE(nom_francais)) = SOUNDEX(REVERSE(\''.$valeur.'\'))) OR
(SOUNDEX(nom_anglais) = SOUNDEX(\''.$valeur.'\')'
.' OR SOUNDEX(REVERSE(nom_anglais)) = SOUNDEX(REVERSE(\''.$valeur.'\'))) ';
} else {
$this->requete_condition[] = '(SOUNDEX('.$nom_champ.') = SOUNDEX(\''.$valeur.'\')'
.' OR SOUNDEX(REVERSE('.$nom_champ.')) = SOUNDEX(REVERSE(\''.$valeur.'\'))) ';
}
} else {
if ($this->recherche == 'etendue') {
$valeur = str_replace(' ','%', $valeur);
$valeur .= '%';
}
 
if ($nom_champ == 'masque') {
$this->requete_condition[] = '(codet = '.$this->getBdd()->proteger($valeur)
.' OR nom_francais LIKE '.$this->getBdd()->proteger($valeur)
.' OR nom_anglais LIKE '.$this->getBdd()->proteger($valeur)
.' OR codet_statut LIKE '.$this->getBdd()->proteger($valeur).')';
} elseif ($nom_champ == 'nom') {
$this->requete_condition[] = '(nom_francais LIKE '.$this->getBdd()->proteger($valeur).' OR '
.'nom_anglais LIKE '.$this->getBdd()->proteger($valeur).') ';
} else {
$this->requete_condition[] = $nom_champ.' LIKE '.$this->getBdd()->proteger($valeur);
}
}
}
}
 
// +-----------------------------------------------------------------------------------------------------+
public function traiterRessources() {
if (isset($this->ressources) && !empty($this->ressources)) {
$this->table_ressources = $this->ressources;
if (isset($this->table_ressources[0]) && !empty($this->table_ressources[0])) {
//requete = /zone-geo/#id
$this->traiterRessourceId();
if (isset($this->table_ressources[1]) && !empty($this->table_ressources[1])) {
//requete = /zone-geo/#id/#champ ou /zone-geo/#id/relations
$this->traiterRessourceChampOuRelations();
}
}
}
}
 
public function traiterRessourceId() {
//requete : /zone-geo/#id (ex : /zone-geo/7)
if ($this->table_ressources[0]) {
$this->requete_condition[] = ' codet = '.$this->getBdd()->proteger($this->table_ressources[0]);
$this->format_reponse .= '/id';
} else {
$r = 'Erreur dans les ressources de votre requête : </br> La ressource " '.$this->table_ressources[0].
' " n\'existe pas.';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $r);
}
}
 
 
public function traiterRessourceChampOuRelations() {
if ($this->table_ressources[1] == 'relations') {
$r = 'Erreur dans les ressources de votre requête : </br> La ressource " '.$this->table_ressources[1].
' " n\'existe pas.';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $r);
} else {
$this->format_reponse .= '/champ';
}
}
 
// +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------+
public function assemblerLaRequete() {
//assemblage de la requete :
$requete = ' SELECT '.$this->requete_champ.
' FROM '.$this->table
.$this->formerRequeteCondition()
.$this->formerRequeteLimite();
return $requete;
}
 
//ajout d'une limite seulement pour les listes (pas plus de 100 resultats retournés pr les requetes
// suivantes : /zone-geo et /zone-geo/#id/relations)
public function formerRequeteLimite() {
if ($this->format_reponse != 'zone-geo') {
$this->requete_limite = '';
} elseif (($depart = $this->limite_requete['depart']) > ($this->total_resultat = $this->recupererTotalResultat())) {
//cas ou la requete presente un navigation.depart supérieur au nb total de resultats.
$this->limite_requete['depart'] =
(($nb - $this->limite_requete['limite']) < 0) ? 0 : ($nb - $this->limite_requete['limite']);
$this->requete_limite = ' LIMIT '.$this->limite_requete['depart'].', '.$this->limite_requete['limite'];
} else {
$this->requete_limite = ' LIMIT '.$this->limite_requete['depart'].', '.$this->limite_requete['limite'];
}
return $this->requete_limite;
}
 
public function formerRequeteCondition() {
$condition = '';
if ($this->requete_condition != null) {
$condition = ' WHERE '.implode(' AND ', $this->requete_condition);
}
return $condition;
}
 
public function recupererTotalResultat() {
//on récupère le nombre total de résultats de la requete (ex : le nombre d'id contenu dans la liste /zone-geo)
$requete = 'SELECT count(*) as nombre FROM '
.$this->table
.$this->formerRequeteCondition();
$res = $this->getBdd()->recuperer($requete);
 
if ($res) {
$total = $res['nombre'];
} else {
$t = 'Fonction recupererTotalResultat() : <br/>Données introuvables dans la base';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE, $t);
}
return $total;
}
 
// +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------+
// determine en fct du service appelé (/zone-geo | /zone-geo/#id | /zone-geo/#id/champ |
// /zone-geo/#id/relations) le format du tableau à retourner. Encode en json
public function retournerResultatFormate($resultat) {
$this->recupererTableConfig('correspondance_champs');
switch ($this->format_reponse) {
case 'zone-geo' : $reponse = $this->formaterZoneGeo($resultat); break;
case 'zone-geo/id' : $reponse = $this->formaterZoneGeoId($resultat[0]); break;
case 'zone-geo/id/champ' : $reponse = $this->formaterZoneGeoIdChamp($resultat[0]); break;
default : break;
}
return $reponse;
}
 
public function formaterZoneGeo($resultat) {
//on remplit la table $table_retour_json['entete']
$this->table_retour['depart'] = $this->limite_requete['depart'];
$this->table_retour['limite'] = $this->limite_requete['limite'];
$this->table_retour['total'] = $this->total_resultat;
$url = $this->formulerUrl($this->total_resultat, '/zone-geo');
if (isset($url['precedent']) && $url['precedent'] != '') {
$this->table_retour['href.precedent'] = $url['precedent'];
}
if (isset($url['suivant']) && $url['suivant'] != '') {
$this->table_retour['href.suivant'] = $url['suivant'];
}
$table_retour_json['entete'] = $this->table_retour;
 
//on remplit la table $table_retour_json['resultat']
$this->table_retour = array();
if (isset($this->table_param['masque_nom'])) $resultat = $this->trierRechercheFloue($this->table_param['masque_nom'], $resultat, 'nom_francais');
foreach ($resultat as $tab) {
foreach ($tab as $key => $valeur) {
$valeur = rtrim($valeur);
if ($valeur != '') {
switch ($key) {
case 'codet' : $num = $valeur; $this->table_retour['code'] = $valeur; break;
case 'nom_francais' : $this->table_retour['nom'] = $valeur; break;
case 'nom_anglais' : if ($tab['nom_francais'] == '') $this->table_retour['nom'] = $valeur; break;
case 'codet_statut' : $this->table_retour['statut'] = $valeur; break;
default : break;
}
}
}
if ($this->retour_format == 'max') {
$this->table_retour['href'] = $this->ajouterHref('zone-geo', $num);
}
$resultat_json[$num] = $this->table_retour;
$this->table_retour = array();
}
$table_retour_json['resultat'] = $resultat_json;
return $table_retour_json;
}
 
public function formaterZoneGeoId($resultat) {
foreach ($resultat as $key => $valeur) {
if ($valeur != '') {
$this->afficherDonnees($key, $valeur);
}
}
unset($this->table_retour['href']);
return $this->table_retour;
}
 
public function formaterZoneGeoIdChamp($resultat) {
//on recupère tous les resultats possibles
$reponse = $this->formaterZoneGeoId($resultat);
$this->table_retour = array();
//on recupère les résultats demandés à partir du tableau de résultat complet
$this->table_retour['id'] = $reponse['code'];
 
$champs = explode(' ', $this->table_ressources[1]);
foreach ($champs as $champ) {
if ($champ == 'nom') $champ = 'nom.fr';
if ($this->verifierValiditeChamp($champ)) {
if (strrpos($champ, '.*') !== false) {
$this->afficherPointEtoile($champ, $reponse);
} else {
if (isset($reponse[$champ])) {
$this->table_retour[$champ] = $reponse[$champ];
} else {
$this->table_retour[$champ] = null;
}
}
}
}
return $this->table_retour;
}
 
public function verifierValiditeChamp($champ) {
preg_match('/^([^.]+)(\.([^.]+))?$/', $champ, $match);
$champs_possibles = $this->correspondance_champs;
$champs_possibles[] = 'nom.*';
 
if (in_array($match[1], $champs_possibles)) {
$validite = true;
} elseif (in_array($match[0], $champs_possibles)) {
$validite = true;
} else {
$champs_possibles = implode('</li><li>', $champs_possibles);
$c = 'Erreur dans votre requête : </br> Le champ "'.$champ_possibles.'" n\'existe pas. '.
'Les champs disponibles sont : <li>'.$champs_possibles.'</li>';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $c);
}
return $validite;
}
 
public function afficherPointEtoile($champ, $reponse) {
preg_match('/^([^.]+\.)\*$/', $champ, $match);
foreach ($reponse as $chp => $valeur) {
if (strrpos($chp, $match[1]) !== false) {
if ($valeur != '') {
$this->table_retour[$chp] = $valeur;
} else {
$this->table_retour[$chp] = null;
}
}
}
}
 
public function afficherDonnees($champ, $valeur) {
if ($this->retour_format == 'max') {
if ($champ == 'codet_statut') {
$this->table_retour[$this->correspondance_champs[$champ]] = $valeur;
$this->table_retour[$this->correspondance_champs[$champ].'.href'] =
$this->ajouterHref('ontologies', 'masque.nom=Codet '.$valeur, '?');
} else {
$this->table_retour[$this->correspondance_champs[$champ]] = $valeur;
}
} else {
$this->table_retour[$this->correspondance_champs[$champ]] = $valeur;
}
}
 
// +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------+
/** Permet de retourner l'url http://tela-botanica.org/service:eflore:0.1/[projet]/[version_projet]/[service]/[ressource]:[valeur]
* @param $service : correspond au nom de la ressource à laquelle on souhaite acceder
* @param $val : correspond au paramètre de la ressource (ex :
* @param $projet : est remplit dans les cas suivants :
* - si le projet dans lequel se trouve l'information est différent de celui du service appelé
* - si on souhaite rappeler le meme projet avec la meme ressource mais un parametre de ressource différent
*/
public function ajouterHref($service, $val, $separation = '/') {
$val = $this->encoderUrl($val);
if ($this->version_projet == '+') {
$url = Config::get('url_service_base').Config::get('nom_projet').'/'.$service.$separation.$val;
} else {
$url = Config::get('url_service_base').Config::get('nom_projet').'/'.$this->version_projet.'/'.$service.$separation.$val;
}
return $url;
}
 
public function encoderUrl($url) {
$url = str_replace(' ', '%20', $url);
$url = str_replace('?', urlencode('?'), $url);
return $url;
}
}
?>
/tags/v5.6-arganeraie/services/modules/0.1/nvps/NomsVernaculaires.php
New file
0,0 → 1,652
<?php
/**
* Description :
* Classe NomsVernaculaires.php fournit une liste de noms vernaculaires et leur liaison à la bdtfx
* Le but étant de fournir un ensemble minimal d'information comprenant :
* un identifiant (numérique ou alphanumérique sous forme de ChatMot si possible), un nom, une langue et
* une relation avec un taxon de la bdtfx.
* Si l'url finit par /noms-vernaculaires on retourne une liste de noms (seulement les 100 premières par défaut).
* L'url peut contenir des paramètres optionnels passés après le ? : /observations?param1=val1&param2=val2&...
*
* Les paramètres de requête disponibles sont : masque, masque.code, masque.nom, masque.region , recherche,
* distinct, retour.format, navigation.depart et navigation.limite.
*
* Encodage en entrée : utf8
* Encodage en sortie : utf8
* @package framework-v3
* @author Delphine Cauquil <delphine@tela-botanica.org>
* @author Jennifer Dhé <jennifer.dhe@tela-botanica.org>
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
* @version 1.0
* @copyright 1999-${year} Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
*/
class NomsVernaculaires extends Commun {
protected $champ_infos = array(
'taxon' => array('service' => 'taxons', 'ressource' => 'nt:', 'projet' => 'bdtfx', 'nom' => 'nom_sci'));
 
protected $service = 'noms-vernaculaires';
 
/**
* Permet de stocker la requete formulée : /noms-vernaculaires | /noms-vernaculaires/#id |
* /noms-vernaculaires/#id/champ | /noms-vernaculaires/#id/relations
* Est remplit au cours de l'analyse des ressources (traiterRessources()), par défaut, a la valeur du service.
* Est utilisée principalement pr déterminer le format du tableau à retourner. */
protected $format_reponse = 'noms-vernaculaires';
 
/** Variables constituant les parametres de la requete SQL (champ, condition, limit) remplie
* selon ressources et paramètres */
protected $requete_champ = array(' * ');
protected $requete_condition = '';
protected $limite_requete = array(
'depart' => 0,
'limite' => 100
);
protected $champ_tri = 'code_langue';
protected $direction_tri = 'asc';
/**
* Indique les champs supplémentaires à retourner
* - conseil_emploi = conseil d'emploi du nom vernaculaire
* - genre = genre et nombre du nom
* - taxon = nom retenu associé à ce nom
*/
protected $champs_supp = array();
 
/**
* Precise la contenance plus ou moins précise du tableau à retourner :
* - min = les données présentes dans la table
* - max = les données de la table + les informations complémentaires (pour les identifiants et les codes)
* - oss = la liste des nom_sci (uniquement pour noms et taxons) */
protected $retour_format = 'max';
/** Valeur du paramètre de requete recherche :
* - stricte : le masque est passé tel quel à l'opérateur LIKE.
* - etendue : ajout automatique du signe % à la place des espaces et en fin de masque avec utilisation de LIKE.
* - floue : recherche tolérante vis-à-vis d'approximations ou d'erreurs (fautes d'orthographe par exemple) */
protected $recherche;
/** Permet de stocker le tableau de résultat (non encodé en json) */
protected $table_retour = array();
/** Stocke le nombre total de résultats de la requete principale. Est calculée lors de l'assemblage de la requete */
protected $total_resultat;
private $config;
public function __construct($config) {
$this->config = is_null($config) ? Config::get('NomsVernaculaires') : $config;
}
 
//+------------------------------------------------------------------------------------------------------+
// créer une condition en fonction du paramétre
public function traiterParametres() {
if (isset($this->parametres) && !empty($this->parametres)) {
 
if (isset($this->parametres['recherche']) && $this->parametres['recherche'] != '') {
$this->recherche = $this->parametres['recherche'];
}
foreach ($this->parametres as $param => $valeur) {
switch ($param) {
case 'masque' :
$this->ajouterFiltreMasque('nom_vernaculaire', $valeur);
break;
case 'masque.nt' :
$this->ajouterFiltreMasque('num_taxon', $valeur);
break;
case 'masque.nv' :
$this->ajouterFiltreMasque('nom_vernaculaire', $valeur);
break;
case 'masque.lg' :
$this->ajouterFiltreMasque('code_langue', $valeur);
break;
case 'masque.cce' :
$this->ajouterFiltreMasque('num_statut', $valeur);
break;
case 'retour.format' :
$this->retour_format = $valeur;
break;
case 'navigation.depart' :
$this->limite_requete['depart'] = $valeur;
break;
case 'navigation.limite' :
$this->limite_requete['limite'] = $valeur;
break;
case 'retour.champs' :
$this->champs_supp = explode(',',$valeur);
break;
case 'recherche' :
break;
case 'version.projet' :
break;
default :
$p = 'Erreur dans les paramètres de recherche de votre requête : '.
'</br> Le paramètre " '.$param.' " n\'existe pas.';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $p);
}
}
}
}
 
public function ajouterFiltreMasque($nom_champ, $valeur) {
if ($nom_champ == 'num_taxon') { // si il s'agit d'un chiffre
$this->requete_condition[] = $nom_champ.' = '.$this->getBdd()->proteger($valeur);
} else {
if ($this->recherche == 'floue') {
$this->requete_condition[] = '(SOUNDEX('.$nom_champ.') = SOUNDEX(\''.$valeur.'\')'
.' OR SOUNDEX(REVERSE('.$nom_champ.')) = SOUNDEX(REVERSE(\''.$valeur.'\'))) ';
} else {
if ($this->recherche == 'etendue') {
$valeur = '%'.str_replace(' ','% ', $valeur);
$valeur .= '%';
}
$this->requete_condition[] = $nom_champ.' LIKE '.$this->getBdd()->proteger($valeur);
}
}
}
 
//+------------------------------------------------------------------------------------------------------+
// en fonction de la présence des ressources modifie requete_champ et requete_condition
public function traiterRessources() {
if (isset($this->ressources) && !empty($this->ressources)) {
if (isset($this->ressources[0]) && !empty($this->ressources[0])) {
$this->traiterRessourceId(); // ajoute condition id=#valeur
if (isset($this->ressources[1]) && !empty($this->ressources[1])) {
$this->traiterRessourceChamp(); //modifie requete_champ ou requete_condition
}
}
} else { //rajoute distinct pour ne pas avoir plusieurs fois le même nom
$this->requete_champ = array('distinct(id)', 'nom_vernaculaire ');
}
}
 
//requete : /noms-vernaculaires/#id (ex : /noms-vernaculaires/7)
public function traiterRessourceId() {
if (is_numeric($this->ressources[0])) {
$this->requete_condition[] = ' id = '.$this->getBdd()->proteger($this->ressources[0]);
$this->format_reponse .= '/id';
} elseif ($this->ressources[0] == 'attributions') {
$this->format_reponse .= '/attributions';
} else {
$r = 'Erreur dans les ressources de votre requête : </br> La ressource " '.$this->ressources[0].
' " n\'existe pas.';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $r);
}
}
 
 
public function traiterRessourceChamp() {
$this->format_reponse .= '/champ';
$this->analyserChamp();
}
 
public function analyserChamp() {
$this->requete_champ = array();
$this->recupererTableConfig('champs_possibles');// s'il y a plusieurs champs correspondant au champ demandé ils sont séparé par des |
$champs = explode(' ', $this->ressources[1]);
foreach ($champs as $champ) {
preg_match('/^([^.]+)(\.([^.]+))?$/', $champ, $match);
if (isset($this->champs_possibles[$match[1]])) {
$this->requete_champ[] = str_replace('|', ', ', $this->champs_possibles[$match[1]]);
} elseif (isset($this->champs_possibles[$match[0]])) {
$this->requete_champ[] = str_replace('|', ', ', $this->champs_possibles[$match[0]]);
} else {
$champs_possibles = implode('</li><li>', array_keys($this->champs_possibles));
$c = 'Erreur dans votre requête : </br> Le champ "'.$champ_possibles.'" n\'existe pas. '.
'Les champs disponibles sont : <li>'.$champs_possibles.'</li> et leurs déclinaisons (ex. ".code").';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $c);
}
}
}
 
//+------------------------------------------------------------------------------------------------------+
public function assemblerLaRequete() {
$requete = ' SELECT '.$this->formerRequeteChamp().
' FROM '.$this->table
.$this->formerRequeteCondition()
.$this->formerRequeteLimite();
return $requete;
}
 
public function formerRequeteChamp() {
if (in_array('*', $this->requete_champ)) {
$champ = ' * ';
} else {
$champ = implode(', ', $this->requete_champ);
}
return $champ;
}
 
public function formerRequeteCondition() {
$condition = '';
if ($this->requete_condition != null) {
$condition = ' WHERE '.implode(' AND ', $this->requete_condition);
}
return $condition;
}
 
//ajout d'une limite seulement pour les listes (pas plus de 100 resultats retournés pr les requetes
// suivantes : /noms-vernaculaires et /noms-vernaculaires/#id/relations)
public function formerRequeteLimite() {
if (in_array($this->format_reponse , array($this->service.'/id', $this->service.'/id/champs'))) {
$this->requete_limite = '';
} elseif (($depart = $this->limite_requete['depart']) > ($this->total_resultat = $this->recupererTotalResultat())) {
$this->limite_requete['depart'] =
(($this->total_resultat - $this->limite_requete['limite']) < 0) ? 0 : ($this->total_resultat - $this->limite_requete['limite']);
$this->requete_limite = ' LIMIT '.$this->limite_requete['depart'].', '.$this->limite_requete['limite'];
} else {
$this->requete_limite = ' LIMIT '.$this->limite_requete['depart'].', '.$this->limite_requete['limite'];
}
return $this->requete_limite;
}
 
//on récupère le nombre total de résultats de la requete (ex : le nombre d'id contenu dans la liste /noms-vernaculaires)
public function recupererTotalResultat() {
$distinct = ($this->format_reponse == 'noms-vernaculaires/attributions') ? 'id' : 'distinct(id)';
$requete = 'SELECT count('.$distinct.') as nombre FROM '
.$this->table
.$this->formerRequeteCondition();
$res = $this->getBdd()->recuperer($requete);
 
if ($res) {
$total = $res['nombre'];
} else {
$t = 'Fonction recupererTotalResultat() : <br/>Données introuvables dans la base '.$requete;
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE, $t);
}
return $total;
}
 
//+------------------------------------------------------------------------------------------------------+
// determine en fct du service appelé (/noms-vernaculaires | /noms-vernaculaires/#id | /noms-vernaculaires/#id/champ |
// /noms-vernaculaires/#id/relations) le format du tableau à retourner.
public function retournerResultatFormate($resultat) {
$this->recupererTableConfig('correspondance_champs');
switch ($this->format_reponse) {
case 'noms-vernaculaires' :
$reponse = ($this->retour_format == 'oss') ? $this->formaterEnOss($resultat) : $this->formaterNomsVernaculaires($resultat); break;
case 'noms-vernaculaires/attributions' : $reponse = $this->formaterNomsVernaculairesAttributions($resultat); break;
case 'noms-vernaculaires/id' : $reponse = $this->formaterNomsVernaculairesId($resultat); break;
case 'noms-vernaculaires/id/champ' : $reponse = $this->formaterNomsVernaculairesIdChamp($resultat); break;
default : break;
}
return $reponse;
}
public function ajouterJsonEnTeteNV() {
$table_retour_json['masque'] = $this->recupererMasque();
$table_retour_json['depart'] = $this->limite_requete['depart'];
$table_retour_json['limite'] = $this->limite_requete['limite'];
$table_retour_json['total'] = $this->total_resultat;
$url = $this->formulerUrl($this->total_resultat, '/noms-vernaculaires');
if (isset($url['precedent']) && $url['precedent'] != '') {
$table_retour_json['href.precedent'] = $url['precedent'];
}
if (isset($url['suivant']) && $url['suivant'] != '') {
$table_retour_json['href.suivant'] = $url['suivant'];
}
return $table_retour_json;
}
public function ajouterJsonResultatNV($resultat) {
foreach ($resultat as $tab) {
foreach ($tab as $key => $valeur) {
if ($valeur != '') {
switch ($key) {
case 'id' : $num = $valeur; break;
case 'nom_vernaculaire' : $this->table_retour['nom'] = $valeur; break;
default : break;
}
}
}
if ($this->retour_format == 'max') $this->table_retour['href'] = $this->ajouterHref('noms-vernaculaires', $num);
$resultat_json[$num] = $this->table_retour;
$this->table_retour = array();
}
return $resultat_json;
}
 
public function formaterNomsVernaculaires($resultat) {
$table_retour_json['entete'] = $this->ajouterJsonEnTeteNV();
$resultat = $this->hierarchiserResultat($resultat);
$table_retour_json['resultat'] = $this->ajouterJsonResultatNV($resultat);
return $table_retour_json;
}
public function hierarchiserResultat($resultat) {
//tri recherche floue
if (isset($this->parametres['masque.nv'])) {
$resultat = $this->trierRechercheFloue($this->parametres['masque.nv'], $resultat, 'nom_vernaculaire');
}
if (isset($this->parametres['masque'])) {
$resultat = $this->trierRechercheFloue($this->parametres['masque'], $resultat, 'nom_vernaculaire');
}
return $resultat;
}
public function recupererMasque() {
$tab_masque = array();
foreach ($this->parametres as $param=>$valeur) {
if (strstr($param, 'masque') != false) {
$tab_masque[] = $param.'='.$valeur;
}
}
$masque = implode('&', $tab_masque);
return $masque;
}
public function formaterEnOss($resultat) {
$table_nom = array();
$oss = '';
foreach ($resultat as $tab) {
if (isset($tab['nom_vernaculaire']) ) {
if (!in_array($tab['nom_vernaculaire'], $table_nom)) {
$table_nom[] = $tab['nom_vernaculaire'];
$oss [] = $tab['nom_vernaculaire'];
}
}
}
if (isset($this->masque)) $masque = implode('&', $this->masque);
else $masque = 'Pas de masque';
$table_retour_oss = array($masque, $oss);
return $table_retour_oss;
}
public function formaterNomsVernaculairesAttributions($resultat) {
//on remplie la table $table_retour_json['entete']
$table_retour_json['entete']['masque'] = $this->recupererMasque();
$table_retour_json['entete']['depart'] = $this->limite_requete['depart'];
$table_retour_json['entete']['limite'] = $this->limite_requete['limite'];
$table_retour_json['entete']['total'] = $this->total_resultat;
$url = $this->formulerUrl($this->total_resultat, '/noms-vernaculaires/attributions');
if (isset($url['precedent']) && $url['precedent'] != '') {
$table_retour_json['entete']['href.precedent'] = $url['precedent'];
}
if (isset($url['suivant']) && $url['suivant'] != '') {
$table_retour_json['entete']['href.suivant'] = $url['suivant'];
}
foreach ($resultat as &$tab) {
$resultat_json[$tab['id']]['id'] = $tab['id'];
$resultat_json[$tab['id']]['nom_vernaculaire'] = $tab['nom_vernaculaire'];
$resultat_json[$tab['id']]['code_langue'] = $tab['code_langue'];
$resultat_json[$tab['id']]['taxon.code'] = 'bdtfx.nt:'.$tab['num_taxon'];
if ($this->retour_format == 'max') {
$resultat_json[$tab['id']]['num_taxon'] = $tab['num_taxon'];
$resultat_json[$tab['id']]['nom_retenu.code'] = $tab['num_taxon'];
$resultat_json[$tab['id']]['taxon'] = $tab['num_taxon'];
$this->taxons[] = $tab['num_taxon']; // utilisé pour chercher les noms latins plus bas
$resultat_json[$tab['id']]['href'] = $this->ajouterHref('noms-vernaculaires', $tab['id']);
if($this->champs_supp != array()) {
$resultat_json[$tab['id']] = $this->ajouterChampsOntologieLigneResultat($tab);
}
}
}
if ($this->retour_format == 'max') {
// On est obligé de faire un deuxième boucle pour demander tous les taxons présents en une
// fois et les attribuer aux noms car c'est beaucoup plus rapide
$noms_sci = $this->recupererNomTaxons();
foreach ($resultat_json as $num_nom => &$tab) {
$tab = $this->ajouterTaxonsAttributionsLigneResultat($tab, $noms_sci);
if($tab == null) {
unset($resultat_json[$num_nom]);
}
}
}
uasort($resultat_json, array($this,'trierLigneTableau'));
$table_retour_json['resultat'] = $resultat_json;
return $table_retour_json;
}
/**
* Ajoute les champs d'ontologie supplémentaires si necéssaire
* en faisant appels aux web services associés
* @param array $ligne_resultat
*
* @return array la ligne modifiée
*/
public function ajouterChampsOntologieLigneResultat($ligne_resultat) {
$intitule = '';
foreach($this->champ_infos as $cle => $champs_supplementaires) {
if(in_array($cle, $this->champs_supp)) {
extract($champs_supplementaires);
$valeur_recherche = '';
switch($cle) {
case 'taxon':
$valeur_recherche = $ligne_resultat['num_taxon'];
$intitule = 'taxon.code';
break;
}
$code_valeur = '';
if(trim($valeur_recherche) != '') {
$url = $this->ajouterHrefAutreProjet($service, $ressource, $valeur_recherche, $projet);
$code_valeur = $this->chercherSignificationCode($url, $nom);
}
$ligne_resultat[$intitule] = $code_valeur;
}
}
return $ligne_resultat;
}
/**
* Fonction qui ajoute les attributions à une ligne de résultats
*
* @param array $ligne_tableau_resultat
* @param array $nom_sci
*/
public function ajouterTaxonsAttributionsLigneResultat(&$ligne_tableau_resultat, &$noms_sci) {
if (isset($noms_sci[$ligne_tableau_resultat['num_taxon']])) {
$ligne_tableau_resultat['nom_retenu.code'] = $noms_sci[$ligne_tableau_resultat['num_taxon']]['id'];
$ligne_tableau_resultat['taxon'] = $noms_sci[$ligne_tableau_resultat['num_taxon']]['nom_sci'];
} else {
$ligne_tableau_resultat = null;
}
return $ligne_tableau_resultat;
}
private function trierLigneTableau($a, $b) {
$retour = 0;
if ($a[$this->champ_tri] == $b[$this->champ_tri]) {
$retour = 0;
}
if($this->champ_tri == 'code_langue') {
if ($a[$this->champ_tri] == 'fra' && $b[$this->champ_tri] != 'fra') {
$retour = ($this->direction_tri == 'asc') ? -1 : 1;
} else if ($a[$this->champ_tri] != 'fra' && $b[$this->champ_tri] == 'fra') {
$retour = ($this->direction_tri == 'asc') ? 1 : -1;
} else {
$retour = $this->comparerChaineSelonDirectionTri($a[$this->champ_tri], $b[$this->champ_tri]);
}
} else {
$retour = $this->comparerChaineSelonDirectionTri($a[$this->champ_tri], $b[$this->champ_tri]);
}
return $retour;
}
private function comparerChaineSelonDirectionTri($a, $b) {
if($this->direction_tri == 'asc') {
return ($a < $b) ? -1 : 1;
} else {
return ($a > $b) ? -1 : 1;
}
}
// formatage de la reponse /id ss la forme
// id, nom_vernaculaire, attributions
// langue
// num_nom (correspond à un taxon bdtfx)
public function formaterNomsVernaculairesId($resultat) {
foreach ($resultat as $taxon) { // pour chaque attribution à un taxon bdtfx
// on crée les variables qui serviront de clés et on les enléves du tableau
$num_nom = $taxon['id']; // unique pour un trinôme id, langue, taxon
$langue = $taxon['code_langue'];
unset($taxon['code_langue']);
 
foreach ($this->correspondance_champs as $key => $correspondance) { // ordonne les infos pour affichage
if (isset($taxon[$key]) && $taxon[$key] != "") {
$this->afficherDonnees($correspondance, $taxon[$key], $langue, $num_nom);
}
}
foreach ($taxon as $key => $valeur) { // rajoute les champs non prévus dans l'api
if (!isset($this->correspondance_champs[$key]) && $valeur != "") {
$this->afficherDonnees($key, $valeur, $langue, $num_nom);
}
}
}
if ($this->retour_format == 'max') $this->afficherTaxons(); // va chercher les noms de tous les taxons
unset($this->table_retour['href']);
return $this->table_retour;
}
 
public function afficherDonnees($champ, $valeur, $langue = '', $num_nom = '') {
if ($champ == 'id' || $champ == 'nom_vernaculaire') {
$this->table_retour[$champ] = $valeur;
} elseif (preg_match('/^(.*)\.code$/', $champ, $match)) {
switch ($match[1]) {
case 'taxon' : if ($this->retour_format == 'max') {$this->taxons[$num_nom] = $valeur;}
$this->afficherPointCode($match[1], $langue, $num_nom, $valeur); break;
case 'langue' : //$this->afficherPointCode($match[1], 'iso-639-3', 'langues', $valeur);
break;
default : break;
}
 
} elseif ($langue != '') {
$this->table_retour['attributions'][$langue][$num_nom][$champ] = $valeur;
} else {
$this->table_retour[$champ] = $valeur;
}
}
 
public function afficherPointCode($nomChamp, $langue, $num_nom, $valeur) {
if (isset($this->champ_infos[$nomChamp])) {
extract($this->champ_infos[$nomChamp]);
}
 
if ($this->retour_format == 'max') {
$url = $this->ajouterHrefAutreProjet($service, $ressource, $valeur, $projet);
if ($service == 'taxons') {
$code_valeur = '';
$this->table_retour['attributions'][$langue][$num_nom]['nom_retenu.code'] = $code_valeur;
} else {
$code_valeur = $this->chercherSignificationCode($url, $nom);
}
if ($projet != '') $projet .= '.';
$this->table_retour['attributions'][$langue][$num_nom][$nomChamp] = $code_valeur;
$this->table_retour['attributions'][$langue][$num_nom][$nomChamp.'.code'] = $projet.$ressource.$valeur;
$this->table_retour['attributions'][$langue][$num_nom][$nomChamp.'.href'] = $url;
} else {
if ($projet != '') $projet .= '.';
$this->table_retour['attributions'][$langue][$num_nom][$nomChamp.'.code'] = $projet.$ressource.$valeur;
}
}
 
public function chercherSignificationCode($url, $nom) {
if (isset($this->signification_code[$url])) {
$valeur = $this->signification_code[$url];
} else {
$res = $this->consulterHref($url);
$valeur = $res->$nom;
$this->signification_code[$url] = $valeur;
}
return $valeur;
}
 
public function afficherTaxons() {
$resultat = $this->recupererNomTaxons();
foreach ($this->table_retour['attributions'] as $code_langue=>$langue) {
foreach ($langue as $num_nom=>$taxon) {
$num_tax = ltrim($taxon['taxon.code'], 'bdtfx.nt:');
if (isset($resultat[$num_tax])) {
$this->table_retour['attributions'][$code_langue][$num_nom]['nom_retenu.code'] = $resultat[$num_tax]['id'];
$this->table_retour['attributions'][$code_langue][$num_nom]['taxon'] = $resultat[$num_tax]['nom_sci'];
}
}
}
}
public function recupererNomTaxons() {
$taxons = array_unique($this->taxons);
$url = Config::get('url_service_base').'bdtfx/taxons?navigation.limite=500&ns.structure=au&masque.nt='.implode(',', $taxons);
$res = $this->consulterHref($url);
foreach ($res->resultat as $id=>$taxon) {
$resultat[$taxon->num_taxonomique]['id'] = 'bdtfx.nn:'.$id;
$resultat[$taxon->num_taxonomique]['nom_sci'] = $taxon->nom_sci_complet;
}
return $resultat;
}
 
public function formaterNomsVernaculairesIdChamp($resultat) {
$this->table_retour['id'] = $this->ressources[0];
$champs = explode(' ', $this->ressources[1]);
if (in_array('attributions', $champs) != false) {
$this->formaterNomsVernaculairesId($resultat);
unset($this->table_retour['nom_vernaculaire']);
} else {
$champ_attributions = array('num_taxon', 'genre', 'notes');
foreach ($resultat as $taxon) {
foreach ($taxon as $key=>$valeur) {
if ($key == 'code_langue' && in_array('langue', $champs) != false) {
$this->table_retour['attributions']['langue'][] = $valeur;
} elseif (in_array($key, $champ_attributions) != false) {
$this->afficherPoint($this->correspondance_champs[$key] , $valeur, $taxon['code_langue'], $taxon['id']);
} elseif (in_array($key, $champs) != false) {
$this->table_retour[$key] = $valeur;
}
}
}
}
return $this->table_retour;
}
 
public function afficherPoint($champ, $valeur, $langue, $num_nom) {
preg_match('/^(.*)\.code$/', $champ, $match);
$champ = $match[1];
if (isset($this->champ_infos[$champ])) {
extract($this->champ_infos[$champ]);
$url = $this->ajouterHrefAutreProjet($service, $ressource, $valeur, $projet);
$projet .= '.';
}
 
$champs = explode(' ', $this->ressources[1]);
if (in_array($champ.'.*', $champs) !== false && isset($projet)) {
$this->table_retour['attributions'][$langue][$num_nom][$champ.'.code'] = $projet.$ressource.$valeur;
$this->table_retour['attributions'][$langue][$num_nom][$champ.'.href'] = $url;
}
if (in_array($champ.'.code', $champs) !== false && isset($projet)) {
$this->table_retour['attributions'][$langue][$num_nom][$champ.'.code'] = $projet.$ressource.$valeur;
}
if (in_array($champ.'.href', $champs) !== false && isset($projet)) {
$this->table_retour['attributions'][$langue][$num_nom][$champ.'.href'] = $url;
}
if (in_array($champ, $champs) !== false) {
if (isset($url)) {
$this->table_retour['attributions'][$langue][$num_nom][$champ] = $this->chercherSignificationCode($url, $nom);
} else {
$this->table_retour['attributions'][$langue][$champ] = $valeur;
}
}
}
 
public function afficherLangue($nomChamp, $projet, $service, $valeur, $ressource = '', $nom = 'nom') {
if ($this->retour_format == 'max') {
$this->table_retour['attributions'][$nomChamp] = $nom;
$this->table_retour['attributions'][$nomChamp.'.code'] = $projet.$ressource.$valeur;
$this->table_retour['attributions'][$nomChamp.'.href'] = $url;
} else {
$this->table_retour['attributions'][$nomChamp.'.code'] = $projet.$ressource.$valeur;
}
}
 
 
}
?>
/tags/v5.6-arganeraie/services/modules/0.1/baseflor/Ontologies.php
New file
0,0 → 1,436
<?php
/**
Classe Ontologies.php fournit des informations sur ensemble structuré des termes et concepts représentant les éléments
* d'un domaine de connaissances pour le projet baseflor.
*/
 
class BaseFloreOntologies extends Commun {
 
protected $requete_condition = null;
/** Permet de stocker la requete formulée: /ontologies | /ontologies/#id | /ontologies/#id/champ | /ontologies/#id/relations */
protected $format_reponse = 'ontologies';
/** Permet de stocker les limite de la requete SQL (par défaut seul les 100 premiers résultats seront retournés).
* Stocke également les valeurs des paramètres navigation.depart et navigation.limite passés dans la requete*/
protected $limite_requete = array( 'depart' => 0, 'limite' => 100);
/** Stocke le nombre total de résultats de la requete principale. Est calculée lors de l'assemblage de la requete */
protected $total_resultat;
protected $retour_format = 'max';
 
// beaucoup plus flexible dans le cas de requêtes SQL complexes
protected $mesChamps = '';
protected $mesJoinsEtConditions = '';
 
public function consulter($ressources, $parametres) {
$this->ressources = $ressources;
$this->parametres = $parametres;
$this->service = 'ontologies';
$this->traiterParametres();
$resultats = '';
$this->table = 'baseflor_ontologies';
$this->recupererNomChamp($this->table);
$this->traiterRessources();
$requete = $this->assemblerLaRequete();
$resultat = $this->getBdd()->recupererTous($requete);
return $this->traiterResultat($resultat, '');
}
public function traiterParametres() {
if (isset($this->parametres) && !empty($this->parametres)) {
foreach ($this->parametres as $param => $valeur) {
switch ($param) {
case 'masque' : $this->ajouterLeFiltreMasque('masque', $valeur); break;
case 'masque.code' : $this->ajouterLeFiltreMasque('code', $valeur); break;
case 'masque.nom' : $this->ajouterLeFiltreMasque('nom', $valeur); break;
case 'masque.description' : $this->ajouterLeFiltreMasque('description', $valeur); break;
case 'retour.format' : $this->retour_format = $valeur; break;
case 'navigation.depart' : $this->limite_requete['depart'] = $valeur; break;
case 'navigation.limite' : $this->limite_requete['limite'] = $valeur; break;
default :
$e = 'Erreur dans les parametres de recherche de votre requête : </br> Le paramètre " '
.$param.' " n\'existe pas.';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e); break;
}
}
}
}
 
public function ajouterLeFiltreMasque($nom_champ, $valeur) {
if ($nom_champ == 'code') {
$this->requete_condition[] = $nom_champ.' = '.$this->getBdd()->proteger($valeur);
} else {
if (isset($this->parametres['recherche']) && $this->parametres['recherche'] == 'floue') {
if ($nom_champ == 'masque') {
$this->requete_condition[] = '( code = '.$this->getBdd()->proteger($valeur)
.' OR ( SOUNDEX(nom) = SOUNDEX(\''.$valeur.'\')'
.' OR SOUNDEX(REVERSE(nom)) = SOUNDEX(REVERSE(\''.$valeur.'\')) '
.') OR ( SOUNDEX(description) = SOUNDEX(\''.$valeur.'\')'
.' OR SOUNDEX(REVERSE(description)) = SOUNDEX(REVERSE(\''.$valeur.'\')) ))';
} else {
$this->requete_condition[] = '(SOUNDEX('.$nom_champ.') = SOUNDEX(\''.$valeur.'\')'
.' OR SOUNDEX(REVERSE('.$nom_champ.')) = SOUNDEX(REVERSE(\''.$valeur.'\')))';
}
} else {
if (isset($this->parametres['recherche']) && $this->parametres['recherche'] == 'etendue') {
$valeur = str_replace(' ','%', $valeur);
$valeur .= '%';
}
if ($nom_champ == 'masque') {
$this->requete_condition[] = '(code = '.$this->getBdd()->proteger($valeur)
.' OR nom LIKE '.$this->getBdd()->proteger($valeur)
.' OR description LIKE '.$this->getBdd()->proteger($valeur).')';
} else {
$this->requete_condition[] = $nom_champ.' LIKE '.$this->getBdd()->proteger($valeur);
}
}
}
}
 
 
public function traiterRessources() {
if (isset($this->ressources) && !empty($this->ressources)) {
if (isset($this->ressources[0]) && !empty($this->ressources[0])) {
//requete = /ontologies/#id
$this->traiterRessourceId();
if (isset($this->ressources[1]) && !empty($this->ressources[1])) {
//requete = /ontologies/#id/relations
$this->traiterRessourceRelations();
}
}
}
}
 
 
public function traiterRessourceId() {
$this->requete_condition = array();
//requete : /ontologies/#id (ex : /ontologies/7)
if (is_numeric($this->ressources[0])) {
$this->requete_condition[] = ' id = '.$this->getBdd()->proteger($this->ressources[0]);
$this->format_reponse .= '/id';
//requete : /ontologies/#classe:#code (ex : /ontologies/rangTaxo:290)
} elseif (strrpos($this->ressources[0], ':') !== false) {
// plusieurs couples #classe:#code séparés par des virgules
if(strrpos($this->ressources[0], ',') !== false) {
$this->traiterMultipleRessourceId();
return;
}
 
// ou un unique couple #classe:#code
$this->format_reponse .= '/id';
preg_match('/^([^:]+):([^:]+)$/', $this->ressources[0], $match);
$this->requete_condition[] =
' id = (SELECT id FROM '.$this->table.' WHERE code = BINARY '.$this->getBdd()->proteger($match[2])
.' AND classe_id = (SELECT id FROM '.$this->table.' WHERE code = BINARY '.$this->getBdd()->proteger($match[1]).'))';
// TODO: optimiser, à voir: traiterMultipleRessourceId() ci-dessous
// SELECT a.*
// FROM $this->table a
// LEFT JOIN $this->table b ON a.id = b.id LEFT JOIN $this->table c ON b.classe_id = c.id
// WHERE b.code = $this->getBdd()->proteger($match[2])
// AND c.code = $this->getBdd()->proteger($match[1]);
} else {
$e = 'Erreur dans les paramètres de recherche de votre requête : </br> Le paramètre " '
.$this->ressources[0].' " n\'existe pas.';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
}
}
 
// Requète : /ontologies/#classe:#code,[...] (ex : /ontologies/numStatus:2,numStatus:3,genreNombre:10)
public function traiterMultipleRessourceId() {
$this->format_reponse .= '/ids'; // noter le "s"
$this->mesChamps = Array(
// 'a.*' // pourquoi pas, mais alors des unset() seront nécessaire
'a.id',
'a.classe_id AS `classe.id`',
'a.nom',
'a.description',
'a.code',
'a.complements',
'c.nom AS classe', // évite très simplement (un très couteux) ajouterClasseCorrespondante()
'concat(c.code,":", b.code) AS requete'); // permet aux appelants de récupérer la valeur qu'ils recherchent
$this->mesChamps = implode(', ', $this->mesChamps);
 
$this->mesJoinsEtConditions =
// alias de la table première
" a "
. " LEFT JOIN {$this->table} b ON a.id = b.id LEFT JOIN {$this->table} c ON b.classe_id = c.id"
. " WHERE ";
 
$or_stack = false;
$tab = explode(',', $this->ressources[0]);
foreach($tab as $couple) {
preg_match('/^([^:]+):([^:]+)$/', $couple, $match);
if($or_stack) {
// une fois qu'un set de condition et présent,
// les autres sont `OR`-ed.
$this->mesJoinsEtConditions .= " OR ";
}
$this->mesJoinsEtConditions .=
sprintf("(b.code = %s AND c.code = %s)",
$this->getBdd()->proteger($match[2]),
$this->getBdd()->proteger($match[1]));
$or_stack = true;
}
}
 
public function traiterRessourceRelations() {
//requete = /ontologies/#id/relations :
if ($this->ressources[1] == 'relations') {
$this->format_reponse .= '/relations';
$this->requete_condition = array('classe_id = (SELECT classe_id FROM '.$this->table.' WHERE '
.implode(' AND ', $this->requete_condition).')');
}
}
 
//+--------------------------FONCTION ASSEMBLAGE DE LA REQUETE-------------------------------------------+
 
public function assemblerLaRequete() {
$requete = ' SELECT '.$this->formerRequeteChamp().
' FROM '.$this->table
.$this->retournerRequeteCondition()
.$this->formerRequeteLimite(); //print_r($requete);
return $requete;
}
 
public function formerRequeteChamp() {
if($this->mesChamps) return $this->mesChamps;
 
$champ[] = 'id';
if ($this->format_reponse == 'ontologies') {
$champ[] = 'nom, code ';
}
if (isset($this->parametres['retour_champs']) || $this->format_reponse == 'ontologies/id/champs') {
$champs_recherches = explode(',', $this->parametres['retour_champs']);
$champs_possibles = $this->rechercherChampsPossibles();
foreach ($champs_recherches as $champ_recherche) {
if ($this->verifierValiditeChamp($champ_recherche, $champs_possibles)) {
$champ[] = (preg_match('/classe/', $champ_recherche)) ? 'classe_id' : $champ_recherche;
}
}
}
if (count($champ) == 1) {
$champ = array(' * ');
}
return implode(', ', $champ);
}
 
public function rechercherChampsPossibles() {
$this->recupererNomChamp($this->table);
$champs_possibles = $this->champs_table;
$champs_possibles[] = 'classe.id';
$champs_possibles[] = 'classe';
$champs_possibles[] = 'classe.href';
return $champs_possibles;
}
 
public function verifierValiditeChamp($champ, $champs_possibles) {
$validite = false;
preg_match('/^([^.]+)(:?\.([^.]+))?$/', $champ, $match);
if (in_array($match[1], $champs_possibles)) {
$validite = true;
} else {
$champs = implode('</li><li>', $champs_possibles);
$e = 'Erreur dans votre requête : </br> Le champ "'.$champ
.'" n\'existe pas. Les champs disponibles sont : <li>'.$champs.'</li>';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
}
return $validite;
}
 
public function retournerRequeteCondition() {
if($this->mesJoinsEtConditions) return $this->mesJoinsEtConditions;
 
$condition = '';
if ($this->requete_condition !== null) {
$condition = ' WHERE '.implode(' AND ', $this->requete_condition);
}
return $condition;
}
 
public function formerRequeteLimite() {
$this->total_resultat = $this->recupererTotalResultat();
if (in_array($this->format_reponse , array('textes/id', 'textes/id/relations'))) {
$this->requete_limite = '';
} elseif (($depart = $this->limite_requete['depart']) > ($this->total_resultat)) {
$this->limite_requete['depart'] =
(($this->total_resultat - $this->limite_requete['limite']) < 0) ? 0 : ($this->total_resultat - $this->limite_requete['limite']);
$this->requete_limite = ' LIMIT '.$this->limite_requete['depart'].', '.$this->limite_requete['limite'];
} else {
$this->requete_limite = ' LIMIT '.$this->limite_requete['depart'].', '.$this->limite_requete['limite'];
}
return $this->requete_limite;
}
 
 
public function recupererTotalResultat() {
//on récupère le nombre total de résultats de la requete (ex : le nombre d'id contenu dans la liste /ontologies)
$requete = 'SELECT count(*) as nombre FROM '.$this->table.' '
.$this->retournerRequeteCondition();
$res = $this->getBdd()->recuperer($requete . ' -- ' . __FILE__ . ':' . __LINE__);
if ($res) {
$total = $res['nombre'];
} else {
$e = 'Données introuvables dans la base';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE, $e);
Debug::printr($requete);
}
return $total;
}
 
//+------------------------------------------------------------------------------------------------------+
public function retournerResultatFormate($resultat) {
// determine en fct du service appelé (/ontologies | /ontologies/#id | /ontologies/#id/champ |
// /ontologies/#id/relations) le format du tableau à retourner. Encode en json
switch ($this->format_reponse) {
case 'ontologies' : $reponse = $this->formaterOntologies($resultat); break;
case 'ontologies/id' : $reponse = $this->formaterOntologiesId($resultat[0]); break;
case 'ontologies/ids' : $reponse = $this->formaterMultipleOntologiesId($resultat); break;
case 'ontologies/id/relations' : $reponse = $this->formaterOntologiesIdRelations($resultat); break;
default : break;
}
return $reponse;
}
 
 
public function formaterOntologies($resultat) {
$this->ajouterEnteteResultat($resultat);
$table_retour_json['entete'] = $this->ajouterEnteteResultat($resultat);
if (isset($this->parametres['masque_code']) || isset($this->parametres['masque'])) {
$resultat = $this->trierRechercheFloue($this->parametres['masque_code'], $resultat, 'code');
} elseif (isset($this->parametres['masque_nom'])) {
$resultat = $this->trierRechercheFloue($this->parametres['masque_nom'], $resultat, 'nom');
} elseif (isset($this->parametres['masque_description'])) {
$resultat = $this->trierRechercheFloue($this->parametres['masque_description'], $resultat, 'description');
}
//on remplit la table $table_retour_json['resultat']
foreach ($resultat as $tab) {
$num = $tab['id'];
unset($tab['id']);
foreach ($tab as $param => $valeur) {
$resultat_json[$num][$param] = $valeur;
}
if ($this->retour_format == 'max') $resultat_json[$num]['href'] = $this->ajouterHref('ontologies', $num);
}
$table_retour_json['resultat'] = $resultat_json;
return $table_retour_json;
}
 
public function ajouterEnteteResultat($resultat) {
//on remplit la table $table_retour_json['entete']
$entete['depart'] = $this->limite_requete['depart'];
$entete['limite'] = $this->limite_requete['limite'];
$entete['total'] = $this->total_resultat;
//formuler les urls
$url = $this->formulerUrl($this->total_resultat, '/ontologies');
if (isset($url['precedent']) && $url['precedent'] != '') { $entete['href.precedent'] = $url['precedent']; }
if (isset($url['suivant']) && $url['suivant'] != '') { $entete['href.suivant'] = $url['suivant']; }
return $entete;
}
 
public function __anonyme1($val) { return $val != ''; }
 
public function formaterOntologiesId($resultat) {
$table_retour = array_filter($resultat, array($this, '__anonyme1'));
$this->calculerClassID($table_retour);
return $table_retour;
}
 
public function formaterMultipleOntologiesId($resultats) {
$result = Array();
foreach($resultats as $k => $resultat) {
$id = $resultat['requete'];
$result[$id] = array_filter($resultat, array($this, '__anonyme1'));
unset($result[$id]['requete']);
$this->calculerClassID($result[$id]);
}
return $result;
}
 
public function calculerClassID(&$resultat) {
// commenté: pourquoi restreindre le choix des champs au format "max",
// ça ne semble pas logique...
// if ($this->retour_format != 'max') return;
 
// question: pourquoi ne pas passer les infos relatives aux ontologies 0 ?
// et que signifie ce commentaire: "pas de parent"
if (@$resultat['classe_id'] == '0') return;
 
$valeur = isset($resultat['classe_id']) ? $resultat['classe_id'] : $resultat['classe.id'];
if(! isset($resultat['classe.id'])) {
$resultat['classe.id'] = $resultat['classe_id'];
unset($resultat['classe_id']);
}
 
// max-format et pas de champs spécifiques demandés ?
// Alors on rempli "classe" et "classe.href"
// Mais ne pas recalculer (surtout la classe) si ce n'est pas nécessaire
// (c'est le cas si l'on a demandé plusieurs critère [provenons de formaterMultipleOntologiesId()])
if (! isset($this->parametres['retour_champs'])) {
if(! isset($resultat['classe'])) {
$nom_classe = $this->ajouterClasseCorrespondante($valeur);
if (isset($nom_classe)) $resultat['classe'] = $nom_classe;
}
if(! isset($resultat['classe.href'])) {
$resultat['classe.href'] = $this->ajouterHref('ontologies', $valeur);
}
return;
}
 
// cas où des champs sont demandés
$champs = explode(',', $this->parametres['retour_champs']);
if(in_array('classe', $champs) && ! isset($resultat['classe'])) {
$this->ajouterClasseCorrespondante($valeur);
}
 
if(in_array('classe.id', $champs) && ! isset($resultat['classe.id'])) {
$resultat['classe.id'] = $valeur;
}
 
if(in_array('classe.href', $champs) && ! isset($resultat['classe.href'])) {
$resultat['classe.href'] = $this->ajouterHref('ontologies', $valeur);
}
 
if(in_array('classe.*', $champs) && (! isset($resultat['classe.href']) || ! isset($resultat['classe.id']))) {
$resultat['classe.id'] = $valeur;
$resultat['classe.href'] = $this->ajouterHref('ontologies', $valeur);
}
}
 
/** Recherche par interrogation de la base, le nom de la classe à partir de son identifiant (classe.id) */
public function ajouterClasseCorrespondante($classe_id) {
$nom = null;
if ($classe_id != 0) {
$nom = '';
$req = 'SELECT nom FROM '.$this->table.' WHERE id = '.$this->getBdd()->proteger($classe_id);
$res = $this->getBdd()->recuperer($req);
if ($res) {
$nom = $res['nom'];
} else {
$e = "Données introuvables dans la table $this->table";
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE, $e);
Debug::printr($req);
}
}
return $nom;
}
 
public function formaterOntologiesIdRelations($resultat) {
$retour = null;
if ($resultat != '') {
$retour['entete'] = $this->ajouterEnteteResultat($resultat);
//on remplit la table $table_retour_json['resultat']
foreach ($resultat as $tab) {
$num = $tab['id'];
$retour['resultat'][$num]['nom'] = $tab['nom'];
if ($this->retour_format == 'max') {
$retour['resultat'][$num]['href'] = $this->ajouterHref('ontologies', $num);
}
}
}
return $retour;
}
}
?>
/tags/v5.6-arganeraie/services/modules/0.1/baseflor/GraphiquesBaseflor.php
New file
0,0 → 1,125
<?php
/**
* Classe GraphiquesBaseflor.php transforme les données écologiques de la table baseflor
* en graphique svg
* graphiques/#typegraphique/#bdnt.nn:#num_nomen --> renvoie un graphique avec les données connues
*
*
* @package eflore-projets
* @author Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org>
* @author Mathilde SALTHUN-LASSALLE <mathilde@tela-botanica.org>
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
* @version 1.0
* @copyright 1999-2011 Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
*/
 
class GraphiquesBaseflor extends CommunGraphiques{
 
public function definirTable($version){
$this->table = Config::get('bdd_table')."_v".$version;
}
 
//+--------------------------traitement ressources ou paramètres -------------------------------------------+
 
public function traiterReferentieletNum(){
if (!empty($this->ressources[1])) {
if(preg_match('/^(.+)\.nn:([0-9|,]+)$/', $this->ressources[1], $retour) == 1){
switch ($retour[1]) {
case 'bdtfx' :
$this->requete_condition[]= "num_nomen = ".$retour[2]." AND bdnt = 'bdtfx' ";
break;
case 'bdafx' :
$this->requete_condition[] = "num_nomen = ".$retour[2]." AND bdnt = 'bdafx' ";
break;
case 'bdbfx' :
$this->requete_condition[] = "num_nomen = ".$retour[2]." AND bdnt = 'bdbfx' ";
break;
default :
$e = "Le référentiel {$retour[1]} n'existe pas.";
throw new Exception( $e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE);
break;
}
}else {
$e = "Erreur dans l'url de votre requête :".
" précisez le référentiel et le numéro nomenclatural sous la forme {bdnt}.nn:{nn}.";
throw new Exception( $e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE);
}
} else {
throw new Exception( "Erreur dans l'url de votre requête :".
" précisez le référentiel et le numéro nomenclatural sous la forme {bdnt}.nn:{nn}.",
RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE);
}
}
public function traiterTypeGraphique(){
if (!empty($this->ressources[0])) {
switch ($this->ressources[0]) {
case 'climat' :
$this->requete_champs = ' ve_lumiere , ve_temperature, ve_continentalite, ve_humidite_atmos' ;
$this->nomGraphique= 'climat';
break;
case 'sol' :
$this->requete_champs = ' ve_humidite_edaph , ve_reaction_sol, ve_nutriments_sol, ve_salinite,'
.'ve_texture_sol, ve_mat_org_sol' ;
$this->nomGraphique = 'sol';
break;
default :
$e = "Erreur dans l'url de votre requête :".
"</br> precisez le graphique -> \"sol\" ou \"climat\".";
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE);
break;
}
}else {
throw new Exception("Erreur dans l'url de votre requête :".
"</br> precisez le graphique -> \"sol\" ou \"climat\".", RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE);
}
}
 
//+-------------------------- formatage du résultat -------------------------------------------+
/// ++++ svg +++++ ///
public function changerValeursSVG(){
$Dompath = new DOMXPath($this->dom);
foreach ($this->valeurs_en_pourcentage as $cle => $val) {
if ($val !== null) { // sinon valeur inconnue donc pas de point rouge
$val = preg_replace('/,/','.', $val);
$grad_id = array_search($val,$this->graduations_id);
$element = $Dompath->query("//*[@id='".$grad_id."']")->item(0);
if($element != null) {
$pos_x = $element->getAttribute('x1');
$curseur = $Dompath->query("//*[@id='".$cle."']")->item(0);
$curseur->setAttribute('cx', $pos_x);
$curseur->setAttribute('class', 'curseur');
$this->ajouterInfoAuSurvol($curseur);
$changement = true;
}
}
}
$this->ajusterFormatSVG();
}
public function ajouterInfoAuSurvol($curseur){
$champs = $curseur->getAttribute('id');
$valeurTexte = $this->recupererOntologies($this->valeurs_champs[$champs], $champs );
if ($valeurTexte !== false) {
$valeurTexte = $this->traiterIntermediaires($valeurTexte->nom, $champs, $champs);
$curseur->setAttribute('title',$this->valeurs_champs[$champs].": ".$valeurTexte );
}
}
 
}
?>
/tags/v5.6-arganeraie/services/modules/0.1/baseflor/InformationsBaseflor.php
New file
0,0 → 1,507
<?php
 
/**
* Classe InformationsBaseflor.php permet de faire des requetes de baseflor en fonction d'un référentiel
*( BDTFX, BDAFX, BDBFX ) et d'un numéro nomenclatural ( différent de 0 ).
* fin d'url possibles :
* /informations/#bdnt.nn:#num_nomen --> retourne tous les champs pour un BDNT et un num_nomen
* /informations/#bdnt.nn:#num_nomen?champs=description --> retourne champs description pour un BDNT et un num_nomen
* /informations/#bdnt.nn:#num_nomen?champs=ecologie --> retourne champs ecologiques pour un BDNT et un num_nomen
* /informations/#bdnt.nn:#num_nomen/relations/catminat --> donne les num nomen et les bdnt pour tous
* les taxons qui ont le même code catminat ( code milieu ) que celui entré
*
* Encodage en entrée : utf8
* Encodage en sortie : utf8
* @package eflore-projets
* @author Mathilde SALTHUN-LASSALLE <mathilde@tela-botanica.org>
* @author Delphine CAUQUIL <delphine@tela-botanica.org>
* @author Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org>
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
* @version 1.0
* @copyright 1999-2012 Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
*/
 
class InformationsBaseflor extends Commun{
 
protected $table = "";
private $format_reponse = 'informations';
private $retour_format = 'max';
private $champs_ontologiques = array();
protected $serviceNom = 'informations';
private $Bdd;
private $requete_condition = "";
private $champs_recherches = '*';
private $resultat_json;
private $nb_ressources;
protected $limite_requete = array( 'depart' => 0, 'limite' => 10);
 
public function consulter($ressources, $parametres) {
$this->ressources = $ressources;
$this->parametres = $parametres;
$this->nb_ressources = count($ressources);
 
$this->traiterParametres();
$this->definirTables();
$this->traiterRessources();
$resultats = null;
foreach ($this->table_version as $version) {
$this->table = $version;
$requete = $this->assemblerLaRequete();
$resultat = $this->Bdd->recupererTous($requete);
$versionResultat = $this->analyserResultat($resultat);
if (count($this->table_version) > 1) {
$resultats[$version] = $versionResultat;
} else {
$resultats = $versionResultat;
}
}
return $resultats;
}
 
public function __construct(Conteneur $Conteneur) {
$this->Bdd = $Conteneur->getBdd();
}
public function analyserResultat($resultat) {
$versionResultat = null;
if ($resultat == '') {
$message = 'La requête SQL formée comporte une erreur!';
$code = RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE;
throw new Exception($message, $code);
} elseif ($resultat) {
$versionResultat = $this->retournerResultatFormate($resultat);
}
return $versionResultat;
}
 
//+--------------------------traitement ressources ou paramètres -------------------------------------------+
public function traiterParametres() {
if (isset($this->parametres) && !empty($this->parametres)) {
foreach ($this->parametres as $param => $valeur) {
switch ($param) {
case 'categorie' :
if($this->nb_ressources != 1 ) {
$e = "Nombre de ressource != 1 pour informations/#id/relations/catminat";
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE);
}
 
if ($valeur == "description") {
$this->champs_recherches = "num_nomen, BDNT, chorologie, inflorescence,"
." sexualite, ordre_maturation, "
."pollinisation, fruit, dissemination, couleur_fleur, macule, floraison, type_bio, "
."form_vegetale ";
$this->requete_condition[] = "( chorologie != '' OR inflorescence != '' ".
"OR sexualite != '' OR ordre_maturation != '' OR pollinisation != '' ".
"OR fruit != '' OR dissemination != '' OR couleur_fleur != '' OR macule != '' ".
"OR floraison != '' OR type_bio != '' OR form_vegetale != '' )";
} elseif ($valeur == "ecologie") {
$this->champs_recherches = " num_nomen, BDNT, ve_lumiere , ve_temperature,"
." ve_continentalite, ve_humidite_atmos, ve_humidite_edaph, ve_reaction_sol,"
." ve_nutriments_sol, ve_salinite, ve_texture_sol, ve_mat_org_sol, "
." vi_lumiere, vi_temperature, vi_continentalite, vi_humidite_edaph,"
." vi_reaction_sol, vi_nutriments_sol, vi_salinite ";
$this->requete_condition[] = "( ve_lumiere != '' OR ve_temperature != '' ".
"OR ve_continentalite != '' OR ve_humidite_atmos != '' ".
"OR ve_humidite_edaph != '' OR ve_reaction_sol != '' ".
"OR ve_nutriments_sol != '' OR ve_salinite != '' ".
"OR ve_texture_sol != '' OR ve_mat_org_sol != '' )";
} else {
$e = "Valeur de paramètre inconnue pour 'categorie'. Ce paramètre n'est pas autorisé pour informations/#id/relations/catminat";
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE);
}
break;
case 'retour.format' :
if ($valeur == 'min' || $valeur == 'max' && $this->nb_ressources == 1) {
$this->retour_format = $valeur;
} else {
$e = "Valeur de paramètre inconnue pour 'retour.format'. Ce paramètre n'est pas autorisé pour informations/#id/relations/catminat";
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE);
}
break;
case 'navigation.depart' :
$this->definirNavigationDepart($valeur);
break;
case 'navigation.limite' :
$this->definirNavigationLimite($valeur);
break;
case 'version.projet' :
$this->traiterVersion($valeur);
break;
default :
$e = 'Erreur dans les parametres de votre requête : </br> Le paramètre " '
.$param.' " n\'existe pas.';
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE);
break;
}
}
}
}
 
public function traiterRessources() {
if(preg_match('/^(.+)\.nn:([0-9]+)$/', $this->ressources[0], $retour)){
$id = $retour[2];
$ref = $retour[1];
if ($ref == 'bdtfx' || $ref == 'bdafx' || $ref == 'bdbfx') {
if($this->nb_ressources == 1) {
$this->requete_condition[] = "num_nomen = ".$id." AND BDNT = '".strtoupper($ref)."' ";
} else {
$this->definirParametresRequeteRelations($ref, $id);
}
} else {
$e = 'Erreur dans l\'url de votre requête : </br> Le référentiel " '
.$ref.' " n\'existe pas.';
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE);
}
 
} else {
$e = 'Erreur dans l\'url de votre requête : </br> La ressource demandée n\'existe pas.';
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE);
}
}
function definirParametresRequeteRelations($ref, $id){
if ($this->ressources[1] == 'relations'){
switch ($this->ressources[2]) {
case 'catminat' :
$this->requete_condition[] = "catminat_code = ( SELECT catminat_code from ".$this->table_version[0]." WHERE "
." num_nomen = ".$id." AND BDNT = '".$ref. "' ) AND num_nomen != ".$id." ";
$this->champs_recherches = " catminat_code, num_nomen, BDNT, nom_sci ";
break;
default :
$e = 'Erreur dans l\'url de votre requête : </br> Le type de relation " '
.$this->ressources[2].' " n\'existe pas.';
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE);
break;
}
} else {
$e = 'Erreur dans l\'url de votre requête : </br> Le type de ressources " '
.$this->ressources[1].' " n\'existe pas.';
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE);
}
}
//+++------------------------------traitement des versions----------------------------------------++
public function traiterVersion($valeur) {
if (preg_match('/^[0-9]+(?:[._][0-9]+)*$/', $valeur) || $valeur == '+') {
$this->version_projet = $valeur;
} elseif ($valeur == '*') {
$this->version_projet = ($this->nb_ressources == 1) ? $valeur : '+' ;
} else {
$e = "Erreur : La version est inconnue.";
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE);
}
}
public function definirTables() {
$table_num_version = $this->recupererVersionDisponible();
$prefixe_table = config::get('bdd_table');
if ( in_array($this->version_projet,$table_num_version) ) {
$this->table_version[] = $prefixe_table.'_v'.$this->version_projet;
} elseif ($this->version_projet == '+') {
$derniere_version = $table_num_version[count($table_num_version) - 1];
$this->table_version[] = $prefixe_table.'_v'.str_replace('.', '_', $derniere_version);
} elseif ($this->version_projet == '*') {
foreach ($table_num_version as $num_version) {
$this->table_version[] = $prefixe_table.'_v'.str_replace('.', '_', $num_version);
}
} else {
$e = "Erreur : La version est inconnue.";
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE);
}
}
//+--------------------------formatages de resultats -------------------------------------------+
public function retournerResultatFormate($resultat) {
$resultat_json = $resultat[0];
if ($this->retour_format == 'max'){
if ($this->nb_ressources == 1) {
if (@$this->parametres['categorie'] == 'ecologie') {
$this->formaterResultatsChampsEcologie($resultat_json);
} elseif (@$this->parametres['categorie'] == 'description') {
$this->formaterResultatsChampsDescription($resultat_json);
}else {
$this->formaterResultatsTousChamps($resultat_json);
}
} else {
$this->formaterResultatsRelations($resultat);
}
} else {
$this->resultat_json = $resultat_json;
}
return $this->resultat_json;
}
public function formaterResultatsRelations($resultat) {
$this->resultat_json['entete'] = $this->ajouterEnteteResultat();
$resultat_json = array();
foreach ($resultat as $cle => $res){
$resultat_json[$cle] = $res ;
$resultat_json[$cle]['href'] = $this->ajouterHref('informations',strtolower($res['BDNT']).".nn:".$res['num_nomen']);
}
$this->resultat_json['resultat'] = $resultat_json;
}
public function ajouterEnteteResultat() {
$entete['depart'] = $this->limite_requete['depart'];
$entete['limite'] = $this->limite_requete['limite'];
$entete['total'] = $this->total_resultat;
$entete['version'] = $this->version_projet;
if ($this->limite_requete['limite'] != '*') {
$url = $this->formulerUrl($this->total_resultat, '/informations/'.$this->ressources[0].'/relations/catminat');
if (isset($url['precedent']) && $url['precedent'] != '') {
$entete['href.precedent'] = $url['precedent'];
}
if (isset($url['suivant']) && $url['suivant'] != '') {
$entete['href.suivant'] = $url['suivant'];
}
}
return $entete;
}
 
public function formaterResultatsTousChamps($resultat) {
$this->resultat_json = $resultat;
$this->traiterTypeBio();
$graphique_presence = $this->traiterEcologie() ;
if ($graphique_presence) {
$graphique = $this->ajouterLiensGraphique($graphique_presence);
}
}
public function formaterResultatsChampsEcologie($resultat) {
$this->resultat_json = $resultat;
$graphique_presence = $this->traiterEcologie() ;
if ($graphique_presence) {
$graphique = $this->ajouterLiensGraphique($graphique_presence);
}
}
public function formaterResultatsChampsDescription($resultat) {
$this->resultat_json = $resultat;
$this->traiterTypeBio();
}
//vérifie la présence de données écologiques pour les graphiques et récupère leur ontologie
public function traiterEcologie() {
$donnees_presence = false;
$this->champs_ontologiques = Commun::s_recupererTableauConfig('Paramètres.champs_ontologiques');
foreach ($this->champs_ontologiques as $cle => $valeur){
if ($this->resultat_json[$cle] != ""){
$donnees_presence[$this->getNomGraphique($valeur)] = true;
$this->recupererOntologies($this->resultat_json[$cle], $cle);
unset($this->resultat_json[$cle]);
}
}
return $donnees_presence;
}
//donne le nom du graphique correspondant à un champ écologique
public function getNomGraphique($code_ecolo) {
$graphique = null;
if (in_array($code_ecolo, explode(',',Config::get('Paramètres.climat')))) {
$graphique = 'climat';
} elseif (in_array($code_ecolo, explode(',', Config::get('Paramètres.sol')) )) {
$graphique = 'sol';
}
return $graphique;
}
public function traiterTypeBio() {
if ($this->resultat_json['type_bio'] != ""){
$tab_ontologie = $this->recupererOntologiePrTypeBio($this->resultat_json['type_bio']);
unset($this->resultat_json['type_bio']);
$this->resultat_json= array_merge($this->resultat_json,$tab_ontologie);
}
}
 
public function ajouterLiensGraphique($graphique_presence) {
if ($graphique_presence['climat']) {
$this->resultat_json['graphique_climat']['libelle'] = 'climat';
$this->resultat_json['graphique_climat']['href'] =
$this->ajouterHref('graphiques/climat', strtolower($this->resultat_json['BDNT']).'.nn:'.$this->resultat_json['num_nomen']);
}
if ($graphique_presence['sol']) {
$this->resultat_json['graphique_sol']['libelle'] = 'sol';
$this->resultat_json['graphique_sol']['href'] =
$this->ajouterHref('graphiques/sol', strtolower($this->resultat_json['BDNT']).'.nn:'.$this->resultat_json['num_nomen']);
}
}
//+--------------------------traitement ontologies -------------------------------------------+
 
public function recupererOntologies($valeur, $champs){
$url = Config::get('url_service_base').Config::get('nom_projet').
'/ontologies/'.$this->champs_ontologiques[$champs].':'.urlencode(urlencode($valeur));
$val = $this->getBdd()->recuperer(sprintf(
"SELECT a.nom FROM baseflor_ontologies a LEFT JOIN baseflor_ontologies b ON a.id = b.id LEFT JOIN baseflor_ontologies c ON b.classe_id = c.id WHERE".
" b.code = BINARY '%s' AND c.code = BINARY '%s' LIMIT 0, 100",
$valeur,
$this->champs_ontologiques[$champs]),
Bdd::MODE_OBJET);
 
$this->resultat_json[$champs.'.libelle'] = isset($val->nom) ? $val->nom : NULL; // eg: VEMO:0
$this->resultat_json[$champs.'.code'] = $valeur;
$this->resultat_json[$champs.'.href'] = $url;
}
//+-------------ontologie pour le champs type biologique (lire le .txt)---+
 
public function recupererOntologiePrTypeBio($type_a_traiter){
$resultat_typeBio = "";
if ($type_a_traiter != "") {
$types_prim_sec = $this->separerTypesPrimairesSecondaires($type_a_traiter);
$types_sstypes = $this->classerPrimSecEnTypesSsTypes($types_prim_sec);
$resultat_typeBio = $this->formaterJsonTypeBio($types_sstypes, $type_a_traiter );
}
return $resultat_typeBio;
}
public function classerPrimSecEnTypesSsTypes($types_prim_sec) {
$types_sstypes = '';
foreach ($types_prim_sec as $cle => $tb) {
$types_sstypes[$cle]= $this->separerTypes_SousTypes($tb, $cle);
}
switch (count($types_sstypes)) {
case 1 :
$types_sstypes = $types_sstypes['principal'];
break;
case 2 :
$types_sstypes = array_merge($types_sstypes['principal'],$types_sstypes['secondaire']);
break;
}
return $types_sstypes;
}
 
public function formaterJsonTypeBio( $types_sstypes, $type_a_traiter) {
$resultat_typeBio['type_bio.code'] = $type_a_traiter;
foreach ($types_sstypes as $cle => $tb) {
if (($cle == 'type.principal') || ($cle == 'type.secondaire')) {
$i = 0;
foreach ($tb as $types) {
$url = Config::get('url_service_base').Config::get('nom_projet').
'/ontologies/TB:'.urlencode(urlencode($types));
$val = $this->consulterHref($url);
$libelle[$cle][$i]= $val->nom;
$detail[$cle][$i]['libelle'] = $val->nom;
$detail[$cle][$i]['code'] = $val->code;
$detail[$cle][$i]['href'] = $url;
$i++;
}
}
if ($cle == 'sous_type.principal' || $cle == 'sous_type.secondaire' ) {
$i = 0;
foreach ($tb as $sstypes) {
$url = Config::get('url_service_base').Config::get('nom_projet').
'/ontologies/ssTT:'.urlencode(urlencode($sstypes));
$val = $this->consulterHref($url);
$libelle[$cle][$i]=$val->nom;
$detail[$cle][$i]['libelle'] = $val->nom;
$detail[$cle][$i]['code'] = $val->code;
$detail[$cle][$i]['href'] = $url;
$i++;
}
}
}
//var_dump($libelle); exit;
$resultat_typeBio['type_bio.libelle']= $this->formaterTypeBioPrLibelle($libelle);
$resultat_typeBio['type_bio.detail'] = $detail;
return $resultat_typeBio;
}
public function formaterTypeBioPrLibelle($info) {
$libelle = implode(', ',$info['type.principal'])." ";
$libelle .= isset($info['sous_type.principal']) ? " (".implode(', ',$info['sous_type.principal']).") " : "";
$libelle .= isset($info['type.secondaire']) ? ", ".implode(', ',$info['type.secondaire'])." " : "";
$libelle .= isset($info['sous_type.secondaire']) ? "(".implode(', ',$info['sous_type.secondaire']).") " : "";
return $libelle;
}
 
//séparation des principaux et des secondaires
public function separerTypesPrimairesSecondaires($type) {
$types = array();
if (preg_match("/(.+)\((.+)\)\-{0,1}(.+){0,1}/", $type,$retour)) {
$types['principal'] = isset($retour[3]) ? $retour[1].'-'. $retour[3] : $retour[1] ;
$types['secondaire'] = $retour[2];
} else {
$types['principal'] = $type;
}
return $types;
}
 
public function separerTypes_SousTypes($type_a_traiter, $typePrimOuSec) {
$types = array();
if (preg_match("/^([a-zA-Zé]+)\-(.+)$|^([a-zA-Zé,]+[^\-])$/", $type_a_traiter, $retour)) {
//type
$type = array();
$type[0] = (isset($retour[3])) ? $retour[3] : $retour[1] ;
$type = explode(",", $type[0]);
for ($i = 0 ; $i < count($type); $i++) {
$types['type.'.$typePrimOuSec][$i] = $type[$i];
}
//sous types
$ss_types = array();
if (isset($retour[2]) && $retour[2] != '') {
$ss_types[0] = $retour[2] ;
$ss_types = explode("-", $ss_types[0]);
for ($i = 0 ; $i < count($ss_types); $i++) {
$types['sous_type.'.$typePrimOuSec][$i] = $ss_types[$i];
}
}
}
return $types;
}
 
//+--------------------------FONCTIONS D'ASSEMBLAGE DE LA REQUETE-------------------------------------------+
public function assemblerLaRequete() {
$requete = ' SELECT '.$this->champs_recherches.' FROM '.$this->table.' '
.Informations::retournerRequeteCondition($this->requete_condition).' ';
if ($this->nb_ressources != 1 ) {
$requete .= $this->delimiterResultatsRequete();
}
return $requete;
}
public function delimiterResultatsRequete() {
$this->total_resultat = Informations::calculerTotalResultat(
$this->getBdd(),
$this->table,
Array(),
$this->requete_condition);
if ($this->limite_requete['limite'] == '*') return '';
 
if ( ($this->limite_requete['depart'] > $this->total_resultat)) {
throw new Exception(
"Erreur : la valeur pour le paramètre navigation.départ est supérieure au nombre total de résultats.",
RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE);
}
 
if (($this->limite_requete['limite'] + $this->limite_requete['depart'] ) < $this->total_resultat) {
return 'LIMIT '.$this->limite_requete['depart'].', ' .$this->limite_requete['limite'];
}
// ?
return '';
}
}
/tags/v5.6-arganeraie/services/modules/0.1/baseflor/CommunGraphiques.php
New file
0,0 → 1,402
<?php
 
/**
* Classe CommunGraphiques.php regroupement de fonctions pour les graphiques
* graphiques/#typegraphique/#bdnt.nn:#num_nomen --> renvoie un graphique avec les données connues
*
*
* @package eflore-projets
* @author Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org>
* @author Mathilde SALTHUN-LASSALLE <mathilde@tela-botanica.org>
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
* @version 1.0
* @copyright 1999-2011 Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
*/
 
abstract class CommunGraphiques extends Commun{
 
protected $parametres = array();
protected $ressources = array();
 
protected $Bdd;
protected $config;
protected $cache;
protected $metadonnees;
protected $version;
protected $serviceNom = 'Graphiques';
 
protected $graduations_id = array();
protected $champs_ontologiques = array();
protected $nomGraphique = array();
 
protected $table = '';
protected $requete_condition = "";
protected $requete_champs;
 
protected $convertisseur;
protected $cheminGraphBase;
protected $valeurs_en_pourcentage = array();
protected $dom;
protected $largeurSVG = "500";
protected $hauteurSVG;
protected $valeurs_champs;
 
 
 
public function consulter($ressources, $parametres) {
$this->ressources = $ressources;
$this->parametres = $parametres;
$this->verifierParametres();
$this->initialiserConfiguration();
$resultats = '';
$this->traiterRessources();
 
$req = $this->assemblerLaRequete();
$resultat = $this->resultat = $this->Bdd->recupererTous($req);
$versionResultat = $this->obtenirResultat($resultat);
return $versionResultat;
}
 
 
//+--------------------------initialisation de paramètres -------------------------------------------+
 
private function initialiserConfiguration() {
$conteneur = new Conteneur();
$this->Bdd = $conteneur->getBdd();
$this->config = $conteneur->getParametre('Graphiques');
$this->convertisseur = $this->config['convertisseur'];
$this->graduations_id = $this->getParametreTableau('Paramètres.graduations_id');
$this->champs_ontologiques = $this->getParametreTableau('Paramètres.champs_ontologiques');
$this->cheminGraphBase = $this->config['chemin'];
$cacheOptions = array('mise_en_cache' => $this->config['cache_miseEnCache'],
'stockage_chemin' => $this->config['cache_stockageChemin'],
'duree_de_vie' => $this->config['cache_dureeDeVie']);
$this->cache = $conteneur->getCacheSimple($cacheOptions);
$this->definirVersion();
$this->definirFormat();
$this->definirTable($this->version);
}
 
 
 
abstract function definirTable($version);
 
 
private function getParametreTableau($cle) {
$tableau = array();
$parametre = Config::get($cle);
if (empty($parametre) === false) {
$tableauPartiel = explode(',', $parametre);
$tableauPartiel = array_map('trim', $tableauPartiel);
foreach ($tableauPartiel as $champ) {
if (strpos($champ, '=') !== false && strlen($champ) >= 3) {
list($cle, $val) = explode('=', $champ);
$tableau[trim($cle)] = trim($val);
} else {
$tableau[] = trim($champ);
}
}
}
return $tableau;
}
 
//+--------------------------traitement ressources ou paramètres -------------------------------------------+
 
//+---- paramètres ----+
 
private function verifierParametres() {
if (isset($this->parametres)) {
$parametres_dispo = array('retour', 'retour.format', 'version.projet');
$parametres = array_keys($this->parametres);
foreach ($parametres as $param) {
if (!in_array($param, $parametres_dispo)) {
$erreur = "Erreur : Le paramètre $param est inconnu.";
$code = RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE;
throw new Exception($erreur, $code);
}
}
}
 
}
 
//on n'affiche qu'une version de graphique à la fois ( la dernière ou celle demandée )
private function definirVersion() {
$this->chargerVersions();
if (!isset($this->parametres['version.projet']) ) {
$this->version = $this->metadonnees[0]['version'];
} elseif ($this->parametres['version.projet'] == '+') {
$this->version = $this->metadonnees[0]['version'];
} else {
if($this->verifierVersion($this->parametres['version.projet'])) {
$this->version = $this->parametres['version.projet'];
}else {
$erreur = "Erreur : La version est inconnue.";
$code = RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE;
throw new Exception($erreur, $code);
}
}
}
 
private function verifierVersion($version){
$retour = false;
foreach ($this->metadonnees as $vers) {
if ($vers['version'] == $version ) {
$retour = true;
}
}
return $retour;
}
private function definirFormat() {
if (isset($this->parametres['retour.format']) ){
if (preg_match("/^[0-9]+$/", $this->parametres['retour.format'])){
if ($this->parametres['retour.format'] > 0) {
$this->largeurSVG = $this->parametres['retour.format'];
} else {
$erreur = "Erreur : valeur pour retour.format négative ou égale à 0.";
$code = RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE;
throw new Exception($erreur, $code);
}
}else {
$erreur = "Erreur : valeur inconnue. Entrez la largeur voulue (en pixels) pour le paramètre retour.format.";
$code = RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE;
throw new Exception($erreur, $code);
}
}
if (!isset($this->parametres['retour']) ){
$this->parametres['retour'] = 'image/svg+xml';
 
}else {
if (( $this->parametres['retour'] != 'image/svg+xml')&& ( $this->parametres['retour'] != 'image/png')){
$erreur = "Erreur : valeur inconnue. Choisissez le format de retour pour le paramètre retour : image/svg%2Bxml ou image/png.";
$code = RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE;
throw new Exception($erreur, $code);
}
}
}
 
 
 
private function chargerVersions() {
$requete = "SELECT version ".
"FROM ".Config::get('bdd_table_meta')." ".
"ORDER BY date_creation DESC ";
$resultats = $this->Bdd->recupererTous($requete);
if (!is_array($resultats) || count($resultats) <= 0) {
$message = "Les méta-données n'ont pu être chargée pour la ressource demandée";
$code = RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE;
throw new Exception($message, $code);
}
 
$this->metadonnees = $resultats;
}
 
//+----- ressources -----+
 
 
public function traiterRessources() {
if(isset($this->ressources)) {
$this->traiterTypeGraphique();
$this->traiterReferentielEtNum();
} else {
$e = 'Erreur dans l\'url de votre requête : </br> ressources insuffisantes.';
throw new Exception( $e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE);
}
}
 
abstract function traiterReferentielEtNum();
abstract function traiterTypeGraphique();
 
//+--------------------------FONCTIONS D'ASSEMBLAGE DE LA REQUETE-------------------------------------------+
 
public function assemblerLaRequete() {
return ' SELECT '.$this->requete_champs.' FROM '.$this->table.' '.Informations::retournerRequeteCondition($this->requete_condition);
}
 
public function retournerRequeteCondition() {
$condition = '';
if ($this->requete_condition !== "") {
$condition = ' WHERE '.implode(' AND ', $this->requete_condition);
}
return $condition;
}
 
//+-------------------------- formatage du résultat -------------------------------------------+
 
public function obtenirResultat($resultat) {
if ($resultat == '') {
throw new Exception(
'La requête SQL formée comporte une erreur!',
RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE);
} elseif ($resultat) {
if ((count($this->ressources)) != 0) {
//$Atraiter = array_filter($resultat[0],function($var){return ($var != '');});
foreach ($resultat[0] as $champs => $valeur) {
if ($valeur !== null && $valeur !== '') {
$Atraiter[$champs] = $valeur;
}
}
if (!empty($Atraiter)) {
$this->traiterValeursEcologiques($Atraiter);
$svg = $this->genererSVG($this->cheminGraphBase.$this->nomGraphique.".svg");
$resultat = new ResultatService();
$resultat->corps = ($this->parametres['retour'] == 'image/png') ? $this->convertirEnPNG($svg) : $svg;
$resultat->mime = $this->parametres['retour'];
} else {
$resultat = null;
}
}
} else {
$resultat = null;
}
return $resultat;
}
 
 
 
 
//+----- modification svg -----+
 
 
 
public function traiterValeursEcologiques($valeur) {
$this->valeurs_champs = $valeur;
 
foreach($this->valeurs_champs as $cle => $val){
if ($val === null) {
$this->valeurs_en_pourcentage[$cle] = null;
} else {
if (preg_match("/ve_humidite_edaph/", $cle)) {
$this->valeurs_en_pourcentage[$cle] = round($val/13,1);
} elseif (preg_match("/ve_salinite/", $cle)) {
$this->valeurs_en_pourcentage[$cle] = round(($val+1)/11,1);
} else {
$this->valeurs_en_pourcentage[$cle] = round($val/10,1);
}
}
}
}
 
public function donnerHauteur($ancienne_largeur, $ancienne_hauteur) {
$nouvelle_largeur = $this->largeurSVG;
$ancienne_largeur = str_replace('px','',$ancienne_largeur);
$ancienne_hauteur = str_replace('px','',$ancienne_hauteur);
$rapport = $nouvelle_largeur / $ancienne_largeur ;
$nouvelle_hauteur = $ancienne_hauteur * $rapport;
$this->hauteurSVG = $nouvelle_hauteur;
}
 
public function ajusterFormatSVG(){
$svg = $this->dom->getElementsByTagName("svg")->item(0);
$largeur = $svg->getAttribute('width');
$hauteur = $svg->getAttribute('height');
$this->donnerHauteur($largeur , $hauteur);
$svg->setAttribute('width',round($this->largeurSVG).'px');
$svg->setAttribute('height',round($this->hauteurSVG).'px');
 
}
 
public function genererSVG($fichierSvg){
$svg = null;
$this->dom = new DOMDocument('1.0', 'UTF-8');
$this->dom->validateOnParse = true;
$this->dom->load($fichierSvg);
$this->changerValeursSVG();
return $this->dom->saveXML();
}
 
abstract function changerValeursSVG();
 
public function recupererOntologies($valeur, $champs){
$url = $this->ajouterHref('ontologies',$this->champs_ontologiques[$champs].':'.urlencode(urlencode($valeur)));
try {
$val = $this->getBdd()->recuperer(sprintf(
"SELECT a.nom FROM baseflor_ontologies a LEFT JOIN baseflor_ontologies b ON a.id = b.id LEFT JOIN baseflor_ontologies c ON b.classe_id = c.id WHERE".
" b.code = BINARY '%s' AND c.code = BINARY '%s' LIMIT 0, 100",
$valeur,
$this->champs_ontologiques[$champs]),
Bdd::MODE_OBJET);
} catch (Exception $e) {
$val = false;
}
return $val;
}
 
public function traiterIntermediaires($valeurTexte,$champsOntologie, $champsTable){
if (preg_match("/(?:I|i)nterm(?:é|e)diaire(?:s)*/", $valeurTexte )) {
$prec = $this->recupererOntologies(($this->valeurs_champs[$champsTable]-1), $champsOntologie );
$suiv = $this->recupererOntologies(($this->valeurs_champs[$champsTable]+1), $champsOntologie );
$valeurTexte = "Intermédiaires entre $prec->nom et $suiv->nom ";
}
return $valeurTexte;
}
 
/// +---- convertir png ----+
 
public function convertirEnPNG($svg) {
$png = null;
 
if (isset($this->convertisseur)) {
if ($this->convertisseur == 'imagick') {
if (extension_loaded('imagick')) {
$png = $this->convertirEnPNGAvecImageMagick($svg);
} else {
$message = "Impossible de générer l'image sur le serveur. Extension ImageMagick absente.";
$code = RestServeur::HTTP_CODE_ERREUR;
throw new Exception($message, $code);
}
} else if ($this->convertisseur == 'rsvg') {
$png = $this->convertirGraphiqueEnPNGAvecRsvg($svg);
} else {
$message = "Le convertisseur indiqué '{$this->convertisseur}' ne fait pas partie de la liste ".
"des convertisseurs disponibles : imagick, rsvg.";
$code = RestServeur::HTTP_CODE_ERREUR;
throw new Exception($message, $code);
}
} else {
$message = "Veuillez indiquer le convertisseur de svg à utiliser pour le service.";
$code = RestServeur::HTTP_CODE_ERREUR;
throw new Exception($message, $code);
}
return $png;
}
 
public function convertirEnPNGAvecImageMagick($svg) {
$convertisseur = new Imagick();
$convertisseur->setBackgroundColor(new ImagickPixel('#F8F8F8'));
$convertisseur->readImageBlob($svg);
$convertisseur->setImageFormat('png32');
$convertisseur->resizeImage($this->largeurSVG,$this->hauteurSVG, imagick::FILTER_LANCZOS, 0, true);
$png = $convertisseur->getImageBlob();
$convertisseur->clear();
$convertisseur->destroy();
return $png;
}
 
public function convertirGraphiqueEnPNGAvecRsvg($svg) {
$idFichier = $this->getIdFichier();
$fichierPng = $this->config['cache_stockageChemin'].$idFichier.'.png';
$fichierSvg = $this->config['cache_stockageChemin'].$idFichier.'.svg';
file_put_contents($fichierSvg, $svg);
$commande = "rsvg-convert $fichierSvg -w ".$this->largeurSVG ." -h ".$this->hauteurSVG ." -o $fichierPng";
//echo $commande; exit;
$rsvg = exec($commande);
$this->indexerGraphiqueFichierPng($fichierPng);
$png = file_get_contents($fichierPng);
return $png;
}
 
public function indexerGraphiqueFichierPng($fichierPng) {
$img = imagecreatefrompng($fichierPng);
imagetruecolortopalette($img, false, 32);
imagepng($img, $fichierPng, 9, PNG_ALL_FILTERS);
}
 
public function getIdFichier(){
$idfichier = str_replace(".","-",$this->ressources[1]);
$idfichier = str_replace(':','-',$idfichier);
$idfichier .= "-".$this->ressources[0];
return $idfichier;
}
}
?>
/tags/v5.6-arganeraie/services/modules/0.1/baseflor/Graphiques.php
New file
0,0 → 1,42
<?php
/**
* Classe Graphiques.php détermine le type de graphiques à afficher en fonction des données des tables
* baseflor et baseflor_rang_sup_ecologie
* fin d'url possibles :
* graphiques/#typegraphique/#bdnt.nn:#num_nomen --> renvoie une graphique avec les données connues
*
*
* @package eflore-projets
* @author Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org>
* @author Mathilde SALTHUN-LASSALLE <mathilde@tela-botanica.org>
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
* @version 1.0
* @copyright 1999-2011 Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
*/
 
class Graphiques extends Commun{
 
 
private $Graph_tables = array('GraphiquesBaseflor', 'GraphiquesTaxonsSup');
public function consulter($ressources, $parametres) {
$versionResultat = null;
foreach ($this->Graph_tables as $graph_tab) {
$Graph = new $graph_tab();
$versionResultat = $Graph->consulter($ressources, $parametres);
if($versionResultat != null) {break;}
}
if ($versionResultat == null) {
$message = 'Les données recherchées sont introuvables.';
$code = RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE;
throw new Exception($message, $code);
}
return $versionResultat;
}
 
}
?>
/tags/v5.6-arganeraie/services/modules/0.1/baseflor/Informations.php
New file
0,0 → 1,287
<?php
 
/**
* Classe Informations.php interroge la table Index
* et redirige vers une autre classe si besoin
* d'interroger une autre table (comme baseflor ou baseflor_rang_sup)
* elle traite également le retour du web service : /informations
*
* Encodage en entrée : utf8
* Encodage en sortie : utf8
* @package eflore-projets
* @author Mathilde SALTHUN-LASSALLE <mathilde@tela-botanica.org>
* @author Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org>
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
* @version 1.0
* @copyright 1999-2012 Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
*
*
*/
 
class Informations extends Commun {
protected $limite_requete = array( 'depart' => 0, 'limite' => 10);
private $tables;
private $champs_recherches = '*';
private $requete_jointure = array();
private $requete_condition = array();
private $total_resultat;
protected $serviceNom = 'informations';
private $masque;
public function consulter($ressources, $parametres) {
$this->ressources = $ressources;
$this->parametres = $parametres;
$versionResultat = null;
if (empty($this->ressources)){
$this->traiterParametres();
}
$this->definirTables(array ('index' => config::get('bdd_table_index'),
'baseflor' => config::get('bdd_table'),
'rangSup' => config::get('bdd_table_rang_sup')
)
);
$this->traiterRessources();
$requete = $this->assemblerLaRequete();
// exemple:
// SELECT * FROM baseflor_index_v2012_12_31 WHERE `bdnt.nn` = 'bdtfx.nn:XXXXX';
$resultat = $this->Bdd->recupererTous($requete . ' -- ' . __FILE__ . ':' .__LINE__);
$versionResultat = $this->renvoyerResultat($resultat);
if ($versionResultat === null) {
throw new Exception('Les données recherchées sont introuvables.', RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE);
}
return $versionResultat;
}
 
public function __construct() {
$Conteneur = new Conteneur();
$this->Bdd = $Conteneur ->getBdd();
}
public function renvoyerResultat($resultat) {
if (empty($this->ressources)) return $this->retournerResultatFormate($resultat);
if(empty($resultat[0]['baseflor'])) {
if(@$this->parametres['categorie'] == 'description') {
// non-supporté par InformationsTaxonsSup.php...
return array();
}
$info = new InformationsTaxonsSup(new Conteneur());
return $info->consulter($this->ressources, $this->parametres);
}
 
$info = new InformationsBaseflor(new Conteneur());
return $info->consulter($this->ressources, $this->parametres);
}
//+--------------------------traitement ressources ou paramètres -------------------------------------+
 
public function traiterRessources() {
if (empty($this->ressources)) {
$this->requete_jointure = array(
'LEFT JOIN '. $this->tables['baseflor'].' ON '
.$this->tables['baseflor'].".cle =".$this->tables['index'].".baseflor",
'LEFT JOIN '. $this->tables['rangSup'].' ON '
.$this->tables['rangSup'].".cle = ".$this->tables['index'].".RangSup");
$this->champs_recherches = " {$this->tables['baseflor']}.num_nomen as 'baseflor.nn',
{$this->tables['baseflor']}.BDNT as 'baseflor.bdnt',
{$this->tables['baseflor']}.catminat_code,
{$this->tables['baseflor']}.num_taxon ,
{$this->tables['baseflor']}.nom_sci ,
{$this->tables['rangSup']}.num_nomen as 'rangSup.nn',
{$this->tables['rangSup']}.bdnt as 'rangSup.bdnt',
{$this->tables['index']}.cle as 'index.cle' ";
} else {
if(preg_match('/^(.+)\.nn:([0-9]+)$/', $this->ressources[0], $retour)){
$this->champs_recherches = " baseflor, rangSup ";
$this->requete_condition[] = " `bdnt.nn` = '{$retour[0]}' ";
} else {
$e = 'Erreur dans l\'url de votre requête : </br> La ressource demandée n\'existe pas.';
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE);
break;
}
}
}
public function traiterParametres() {
if (isset($this->parametres) && !empty($this->parametres) ) {
foreach ($this->parametres as $param => $valeur) {
switch ($param) {
case 'navigation.depart' :
if(!isset($this->parametres['navigation.limite']))
throw new Exception("indiquez également la valeur pour le paramètre navigation.limite.",
RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE);
$this->definirNavigationDepart($valeur);
break;
case 'navigation.limite' :
if(!isset($this->parametres['navigation.depart']))
throw new Exception("indiquez également la valeur pour le paramètre navigation.depart.",
RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE);
$this->definirNavigationLimite($valeur);
break;
case 'version.projet' :
$this->traiterVersion($valeur);
break;
case 'masque.cat' :
$this->masque = 'catminat='.str_replace('-','/',$valeur);
$this->requete_condition[] = " catminat_code = '".str_replace('-','/',$valeur)."' ";
break;
default :
$e = 'Erreur dans les parametres de votre requête : </br> Le paramètre " '
.$param.' " n\'existe pas.';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e); break;
}
}
}
}
//+++------------------------------traitement des versions----------------------------------------++
public function traiterVersion($valeur) {
if (preg_match('/^[0-9]+(?:[._][0-9]+)*$/', $valeur) || $valeur == '*' || $valeur == '+') {
$this->version_projet = $valeur;
} else {
$e = "Erreur : La version est inconnue.";
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE);
}
if ($this->version_projet == '*' && empty($this->ressources)) {
$message = "L'affichage de plusieurs versions ne fonctionne que pour les ressources de type /ressources/#id";
$code = RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE;
throw new Exception($message, $code);
}
}
public function definirTables($prefixe_table) {
$table_num_version = $this->recupererVersionDisponible();
foreach ($prefixe_table as $nom => $prefixe ) {
if ( in_array($this->version_projet,$table_num_version) ) {
$tables[$nom] = $prefixe.'_v'.$this->version_projet;
} elseif ($this->version_projet == '+') {
$derniere_version = $table_num_version[count($table_num_version) - 1];
$tables[$nom] = $prefixe.'_v'.str_replace('.', '_', $derniere_version);
} else {
$e = "Erreur : La version est inconnue.";
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE);
}
}
$this->tables = $tables;
}
 
//+--------------------------formatages de resultats -------------------------------------------+
 
public function retournerResultatFormate($resultat) {
$resultat_json = array();
$resultat_json['entete'] = $this->ajouterEnteteResultat();
$resultat_json['resultats'] = array();
foreach ($resultat as $ligne => $tab) {
$num = $tab['index.cle'];
$resultat_json['resultats'][$num]['num_nomen'] =
(empty ($tab['baseflor.nn'])) ? $tab['rangSup.nn'] : $tab['baseflor.nn'];
$resultat_json['resultats'][$num]['bdnt'] =
(empty ($tab['baseflor.bdnt'])) ? $tab['rangSup.bdnt'] : $tab['baseflor.bdnt'];
$resultat_json['resultats'][$num]['catminat_code'] =
(empty ($tab['catminat_code'])) ? '' : $tab['catminat_code'];
$resultat_json['resultats'][$num]['nom_sci'] =
(empty ($tab['nom_sci'])) ? '' : $tab['nom_sci'];
$resultat_json['resultats'][$num]['num_taxon'] =
(empty ($tab['num_taxon'])) ? '' : $tab['num_taxon'];
if ($resultat_json['resultats'][$num]['num_nomen'] != 0) {
$bdnt = strtolower($resultat_json['resultats'][$num]['bdnt']);
$nn = $resultat_json['resultats'][$num]['num_nomen'];
$resultat_json['resultats'][$num]['href'] =
$this->ajouterHref('informations',$bdnt.".nn:".$nn);
}
}
return $resultat_json;
}
public function ajouterEnteteResultat() {
$entete['depart'] = $this->limite_requete['depart'];
$entete['limite'] = $this->limite_requete['limite'];
$entete['total'] = $this->total_resultat;
if ($this->masque) {
$entete['masque'] = $this->masque;
}
$entete['version'] = $this->version_projet;
$url = $this->formulerUrl($this->total_resultat, '/informations');
if (isset($url['precedent']) && $url['precedent'] != '') {
$entete['href.precedent'] = $url['precedent'];
}
if (isset($url['suivant']) && $url['suivant'] != '') {
$entete['href.suivant'] = $url['suivant'];
}
return $entete;
}
//+-------------------------------------assemblage de requête------------------------------------//
public function assemblerLaRequete() {
$requete = ' SELECT '.$this->champs_recherches.
' FROM '.$this->tables['index'].' '
.self::retournerRequeteJointure($this->requete_jointure).' '
.self::retournerRequeteCondition($this->requete_condition).' '
.$this->delimiterResultatsRequete();
return $requete;
}
 
static function retournerRequeteCondition($cond) {
return $cond ? (' WHERE '.implode(' AND ', $cond)) : '';
}
static function calculerTotalResultat($db, $table, Array $join, Array $cond) {
$requete = sprintf(
'SELECT count(*) as nombre FROM %s %s %s -- %s:%d',
$table,
$join ? implode(' ', $join) : '',
$cond ? (' WHERE '.implode(' AND ', $cond)) : '',
__FILE__,
__LINE__);
$res = $db->recuperer($requete);
if ($res && $res['nombre']) return $res['nombre'];
throw new Exception('Données introuvables dans la base', RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE);
}
public function delimiterResultatsRequete() {
$this->total_resultat = self::calculerTotalResultat(
$this->getBdd(),
$this->tables['index'],
$this->requete_jointure,
$this->requete_condition);
$requete_limite = '';
if (($this->limite_requete['depart'] <= $this->total_resultat) ){
if ( $this->limite_requete['depart'] < $this->total_resultat ){
$requete_limite = 'LIMIT '.$this->limite_requete['depart'].', '
.$this->limite_requete['limite'];
}
} else {
$e = "Erreur : la valeur pour le paramètre navigation.départ est supérieure".
" au nombre total de résultats.";
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE);
}
return $requete_limite;
}
static function retournerRequeteJointure($join) {
return $join ? implode(' ', $join) : '';
}
}
/tags/v5.6-arganeraie/services/modules/0.1/baseflor/GraphiquesTaxonsSup.php
New file
0,0 → 1,146
<?php
/**
* Classe GraphiquesTaxonsSup.php transforme les données écologiques de la table baseflor_rang_sup_ecologie
* en graphique svg
* graphiques/#typegraphique/#bdnt.nn:#num_nomen --> renvoie un graphique avec les données connues
*
*
* @package eflore-projets
* @author Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org>
* @author Mathilde SALTHUN-LASSALLE <mathilde@tela-botanica.org>
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
* @version 1.0
* @copyright 1999-2011 Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
*/
 
class GraphiquesTaxonsSup extends CommunGraphiques{
 
 
public function definirTable($version){
$this->table = Config::get('bdd_table_rang_sup')."_v".$version;
}
//+---- ressources ----+
public function traiterReferentieletNum(){
if (!empty($this->ressources[1])) {
if(preg_match('/^(.+)\.nn:([0-9]+)$/', $this->ressources[1], $retour) == 1){
switch ($retour[1]) {
case 'bdtfx' : // pour le moment un seul referentiel disponible
$this->requete_condition[]= "num_nomen = ".$retour[2]." AND bdnt = 'bdtfx' ";
break;
default :
$e = "Le référentiel {$retour[1]} n'existe pas.";
throw new Exception( $e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE);
break;
}
}else {
$e = "Erreur dans l'url de votre requête :".
" précisez le référentiel et le numéro nomenclatural sous la forme {bdnt}.nn:{nn}.";
throw new Exception( $e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE);
}
} else {
throw new Exception( "Erreur dans l'url de votre requête :".
" précisez le référentiel et le numéro nomenclatural sous la forme {bdnt}.nn:{nn}.",
RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE);
}
}
public function traiterTypeGraphique(){
if (!empty($this->ressources[0])) {
switch ($this->ressources[0]) {
case 'climat' :
$this->requete_champs = ' ve_lumiere_min, ve_lumiere_max, ve_temperature_min,'.
' ve_temperature_max, ve_continentalite_min,'.
' ve_continentalite_max, ve_humidite_atmos_min,'.
' ve_humidite_atmos_max' ;
$this->nomGraphique= 'climat_min_max';
break;
case 'sol' :
$this->requete_champs = ' ve_humidite_edaph_min , ve_humidite_edaph_max,'.
' ve_reaction_sol_min, ve_reaction_sol_max, '.
' ve_nutriments_sol_min, ve_nutriments_sol_max,'.
' ve_salinite_min, ve_salinite_max,'.
' ve_texture_sol_min, ve_texture_sol_max,'.
've_mat_org_sol_min,ve_mat_org_sol_max ' ;
$this->nomGraphique = 'sol_min_max';
break;
default :
$e = "Erreur dans l'url de votre requête :".
"</br> précisez le graphique -> \"sol\" ou \"climat\".";
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE);
break;
}
}else {
throw new Exception("Erreur dans l'url de votre requête :".
"</br> precisez le graphique -> \"sol\" ou \"climat\".", RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE);
}
}
//+-------------------------- formatage du résultat -------------------------------------------+
public function changerValeursSVG(){
$this->ajouterValeursIntermediaires();
$Dompath = new DOMXPath($this->dom);
foreach ($this->valeurs_en_pourcentage as $cle => $val){
$val = preg_replace('/,/','.', $val);
$grad_id = array_search($val,$this->graduations_id);
$champs = preg_replace('/_min|_max|_[0-9]/','', $cle);
// dans le cas de mauvaises données, pour ne pas que tout le graphique
$case = $Dompath->query("//*[@id='".$grad_id."_".$champs."']")->item(0);
if($case != null) {
$case->setAttribute('fill','#EA6624');
$case->setAttribute('stroke','#EA6624');
$this->ajouterInfoAuSurvol($champs,$case);
}
$changement = true;
}
$this->ajusterFormatSVG();
}
public function ajouterValeursIntermediaires(){
$champs_ecolo = array_keys($this->champs_ontologiques);
foreach ($champs_ecolo as $chps ){
$min = !empty($this->valeurs_en_pourcentage[$chps.'_min']) ? $this->valeurs_en_pourcentage[$chps.'_min'] : -1;
$max = !empty($this->valeurs_en_pourcentage[$chps.'_max']) ? $this->valeurs_en_pourcentage[$chps.'_max'] : -1;
if ($min < ($max-0.1) ){
$i = $min + 0.1;
$num = 1;
for ($i ; $i < $max; $i += 0.1) {
$this->valeurs_en_pourcentage[$chps.'_'.$num] = $i;
$num++;
}
}
}
}
public function ajouterInfoAuSurvol($champs, $case){
$min = $this->valeurs_champs[$champs."_min"];
$max = $this->valeurs_champs[$champs."_max"];
if ($min != $max){
$valeurMin = $this->recupererOntologies($min, $champs );
$valeurMax = $this->recupererOntologies($max, $champs );
$valeurMin = $this->traiterIntermediaires($valeurMin->nom, $champs, $champs.'_min');
$valeurMax = $this->traiterIntermediaires($valeurMax->nom, $champs, $champs.'_max');
$case->setAttribute('title',"de $min: $valeurMin à $max: $valeurMax " );
} else {
$valeurMin = $this->recupererOntologies($min, $champs );
$valeurMin = $this->traiterIntermediaires($valeurMin->nom, $champs, $champs.'_min');
$case->setAttribute('title',"$min: $valeurMin" );
}
}
}
?>
/tags/v5.6-arganeraie/services/modules/0.1/baseflor/InformationsTaxonsSup.php
New file
0,0 → 1,274
<?php
 
/**
* Classe InformationsTaxonsSup.php permet de faire des requetes pour les rangs superieurs de baseflor
* du référentiel BDTFX et avec un numéro nomenclatural ( différent de 0 ).
* fin d'url possibles :
*
* /informations/#bdnt.nn:#num_nomen?champs=ecologie --> retourne champs ecologiques pour un BDNT et un num_nomen
*
*
* Encodage en entrée : utf8
* Encodage en sortie : utf8
* @package eflore-projets
* @author Mathilde SALTHUN-LASSALLE <mathilde@tela-botanica.org>
* @author Delphine CAUQUIL <delphine@tela-botanica.org>
* @author Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org>
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
* @version 1.0
* @copyright 1999-2011 Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
*/
 
class InformationsTaxonsSup extends Commun{
protected $table = "";
private $champs_ontologiques = array();
private $format_reponse = 'informations';
protected $serviceNom = 'informations';
private $retour_format = 'max';
private $Bdd;
private $requete_condition = "";
private $champs_recherches = '*';
public function consulter($ressources, $parametres) {
$this->ressources = $ressources;
$this->parametres = $parametres;
$this->traiterParametres();
$this->definirTables();
$this->traiterRessources();
$resultats = '';
foreach ($this->table_version as $version) {
$this->table = $version;
$requete = $this->assemblerLaRequete();
$resultat = $this->Bdd->recupererTous($requete);
$versionResultat = $this->analyserResultat($resultat);
if (count($this->table_version) > 1) {
$resultats[$version] = $versionResultat;
} else {
$resultats = $versionResultat;
}
}
return $resultats;
}
public function analyserResultat($resultat) {
$versionResultat = null;
if ($resultat == '') {
$message = 'La requête SQL formée comporte une erreur!';
$code = RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE;
throw new Exception($message, $code);
} elseif ($resultat) {
$versionResultat = $this->retournerResultatFormate($resultat);
}
return $versionResultat;
}
public function __construct(Conteneur $Conteneur) {
$this->Bdd = $Conteneur->getBdd();
}
//+--------------------------traitement ressources ou paramètres -------------------------------------------+
public function traiterRessources() {
if(preg_match('/^(.+)\.nn:([0-9]+)$/', $this->ressources[0], $retour)==1){
switch ($retour[1]) {
case 'bdtfx' :
$this->requete_condition[] = "num_nomen = ".$retour[2]." AND bdnt = 'bdtfx' ";
break;
default :
$e = 'Erreur dans l\'url de votre requête : </br> Le référentiel " '
.$retour[1].' " n\'existe pas.';
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE);
break;
}
}
}
//+---- paramètres ----+
public function traiterParametres() {
if (isset($this->parametres) && !empty($this->parametres) ) {
foreach ($this->parametres as $param => $valeur) {
switch ($param) {
case 'categorie' :
if ($valeur == "ecologie"){
$this->champs_recherches = ' num_nomen, bdnt, ve_lumiere_min , ve_lumiere_max,'
.' ve_temperature_min, ve_temperature_max, ve_continentalite_min,'
.' ve_continentalite_max, ve_humidite_atmos_min, ve_humidite_atmos_max,'
.' ve_humidite_edaph_min, ve_humidite_edaph_max, ve_reaction_sol_min,'
.' ve_reaction_sol_max, ve_nutriments_sol_min, ve_nutriments_sol_max,'
.' ve_salinite_min, ve_salinite_max, ve_texture_sol_min,ve_texture_sol_max,'
.' ve_mat_org_sol_min, ve_mat_org_sol_max ';
} else {
$e = "Valeur de paramètre inconnue pour 'categorie'. Ce paramètre n'est pas autorisé pour informations/#id";
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE);
}
break;
case 'retour.format' :
if ($valeur == 'min' || $valeur == 'max') {
$this->retour_format = $valeur;
break;
} else {
$e = "Valeur de paramètre inconnue pour 'retour.format'. Ce paramètre n'est pas autorisé pour informations/#id";
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE);
}
case 'navigation.depart' :
$this->definirNavigationDepart($valeur);
break;
case 'navigation.limite' :
$this->definirNavigationLimite($valeur);
break;
case 'version.projet' :
$this->traiterVersion($valeur);
break;
default :
$e = 'Erreur dans les parametres de votre requête : </br> Le paramètre " '
.$param.' " n\'existe pas.';
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); break;
}
}
}
}
 
//+++------------------------------traitement des versions----------------------------------------++
public function traiterVersion($valeur) {
if (preg_match('/^[0-9]+(?:[._][0-9]+)*$/', $valeur) || $valeur == '*' || $valeur == '+') {
$this->version_projet = $valeur;
} else {
$e = "Erreur : La version est inconnue.";
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE);
}
if ($this->version_projet == '*' && $this->ressources == array()) {
$message = "L'affichage de plusieurs versions ne fonctionne que pour les ressources de type /ressources/#id";
$code = RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE;
throw new Exception($message, $code);
}
}
 
public function definirTables() {
$table_num_version = $this->recupererVersionDisponible();
$prefixe_table = config::get('bdd_table_rang_sup');
if ( in_array($this->version_projet,$table_num_version) ) {
$this->table_version[] = $prefixe_table.'_v'.$this->version_projet;
} elseif ($this->version_projet == '+') {
$derniere_version = $table_num_version[count($table_num_version) - 1];
$this->table_version[] = $prefixe_table.'_v'.str_replace('.', '_', $derniere_version);
} elseif ($this->version_projet == '*') {
foreach ($table_num_version as $num_version) {
$this->table_version[] = $prefixe_table.'_v'.str_replace('.', '_', $num_version);
}
} else {
$e = "Erreur : La version est inconnue.";
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE);
}
}
//+--------------------------formatages de resultats -------------------------------------------+
public function retournerResultatFormate($resultat) {
$this->resultat_json = $resultat[0];
if ($this->retour_format == 'max') {
$graphique_presence = $this->traiterEcologie() ;
if ($graphique_presence) {
$this->ajouterLiensGraphique($graphique_presence);
}
}
return $this->resultat_json ;
}
public function traiterEcologie() {
$donnees_presence = false;
$this->champs_ontologiques = Commun::s_recupererTableauConfig('Paramètres.champs_ontologiques');
foreach ($this->champs_ontologiques as $cle => $valeur){
/* Les deux tests commentés ci-dessous étaient présents dans eflore-test (uniquement) jusqu'à juin 2013.
La valeur 0 pose question.
cf baseflor_v2012_12_31
cf services/modules/0.1/baseflor/CommunGraphiques.php traiterValeursEcologiques() */
if ($this->resultat_json[$cle.'_min'] != "") { // && $this->resultat_json[$cle.'_min'] != 0) {
$donnees_presence[$this->getNomGraphique($valeur)] = true;
$tab_ontologie = $this->recupererOntologies($this->resultat_json[$cle.'_min'], $cle.'_min');
unset($this->resultat_json[$cle.'_min']);
}
if ($this->resultat_json[$cle.'_max'] != "") { // && $this->resultat_json[$cle.'_max'] != 0) {
$this->recupererOntologies($this->resultat_json[$cle.'_max'], $cle.'_max');
unset($this->resultat_json[$cle.'_max']);
}
}
return $donnees_presence;
}
//donne le nom du graphique correspondant à un champ écologique
public function getNomGraphique($code_ecolo) {
$graphique = null;
if (in_array($code_ecolo, explode(',',Config::get('Paramètres.climat')))) {
$graphique = 'climat';
} elseif (in_array($code_ecolo, explode(',', Config::get('Paramètres.sol')) )) {
$graphique = 'sol';
}
return $graphique;
}
public function ajouterLiensGraphique($graphique_presence) {
if ($graphique_presence['climat']) {
$this->resultat_json['graphique_climat']['libelle'] = 'climat';
$this->resultat_json['graphique_climat']['href'] = $this->ajouterHref('graphiques/climat',
strtolower($this->resultat_json['bdnt']).'.nn:'.$this->resultat_json['num_nomen']);
}
if ($graphique_presence['sol']) {
$this->resultat_json['graphique_sol']['libelle'] = 'sol';
$this->resultat_json['graphique_sol']['href'] = $this->ajouterHref('graphiques/sol',
strtolower($this->resultat_json['bdnt']).'.nn:'.$this->resultat_json['num_nomen']);
}
}
//+--------------------------traitement ontologies -------------------------------------------+
public function recupererOntologies($valeur, $champs){
$chps_sans = preg_replace("/_min|_max/", '', $champs);
$url = Config::get('url_service_base').Config::get('nom_projet').
'/ontologies/'.$this->champs_ontologiques[$chps_sans].':'.urlencode(urlencode($valeur));
try {
$val = $this->getBdd()->recuperer(sprintf(
"SELECT a.nom FROM baseflor_ontologies a LEFT JOIN baseflor_ontologies b ON a.id = b.id LEFT JOIN baseflor_ontologies c ON b.classe_id = c.id WHERE".
" b.code = BINARY '%s' AND c.code = BINARY '%s' LIMIT 0, 100",
$valeur,
$this->champs_ontologiques[$chps_sans]),
Bdd::MODE_OBJET);
$this->resultat_json[$champs.'.libelle'] = $val->nom;
$this->resultat_json[$champs.'.code'] = $valeur;
$this->resultat_json[$champs.'.href'] = $url;
} catch (Exception $e) {
$this->resultat_json[$champs.'.libelle'] = '';
$this->resultat_json[$champs.'.code'] = '';
$this->resultat_json[$champs.'.href'] = '';
}
}
//+--------------------------FONCTIONS D'ASSEMBLAGE DE LA REQUETE-------------------------------------------+
public function assemblerLaRequete() {
$requete = ' SELECT '.$this->champs_recherches.' FROM '.$this->table.' '
.$this->retournerRequeteCondition();
return $requete;
}
public function retournerRequeteCondition() {
$condition = '';
if (empty($this->requete_condition) == false) {
$condition = ' WHERE '.implode(' AND ', $this->requete_condition);
}
return $condition;
}
}
?>