| New file |
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| 0,0 → 1,69 |
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| /* |
| Mise à jour de réferentiels NULL ou vides pour les observations dotées d'un nom_sel_nn |
| 75427 observations trouvées au 2013/07/19 |
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| Les observations problématiques sont les suivantes: |
| SELECT id_observation, nom_referentiel, nom_sel, nom_sel_nn, nom_ret, nom_ret_nn, nt, famille |
| FROM `BASEEDIT`.`cel_obs` |
| WHERE nom_referentiel IS NULL AND nom_sel != '' AND nom_sel IS NOT NULL AND nom_ret_nn IS NOT NULL; |
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| Or maj-cleanup-201307.sql reset les valeurs des observations ayant un nom_sel NULL ou '', de plus la préférence de sélection est |
| donné au nom_sel (incluant les synonymes) plutôt que nom_ret_nn. |
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| La requête est donc: |
| SELECT id_observation, nom_referentiel, nom_sel, nom_sel_nn, nom_ret, nom_ret_nn, nt, famille |
| FROM `BASEEDIT`.`cel_obs` WHERE nom_referentiel IS NULL AND nom_sel_nn IS NOT NULL; |
| => 76486 |
| */ |
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| DROP TEMPORARY TABLE IF EXISTS T_bis; |
| DROP PROCEDURE IF EXISTS majreferentiel; |
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| CREATE TEMPORARY TABLE IF NOT EXISTS T_bis ( INDEX(`nom`(30))) AS \ |
| SELECT "bdtfx" AS valid_ref, CONCAT(b.nom_sci, ' ', b.auteur) AS nom, b.num_nom, b.num_taxonomique, b.famille FROM `BASESOURCE`.`TABLEBDTFX` b UNION ALL \ |
| SELECT "bdtxa" AS valid_ref, CONCAT(a.nom_sci, ' ', a.auteur) AS nom, a.num_nom, a.num_tax, a.famille FROM `BASESOURCE`.`TABLEBDTXA` a; |
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| /* Donc nous JOINons: |
| -- INNER JOIN sur bdtfx: 69719 |
| SELECT id_observation, nom_referentiel, nom_sel, nom_sel_nn, nom_ret, nom_ret_nn, nt, c.famille FROM `BASEEDIT`.`cel_obs` c INNER JOIN `BASESOURCE`.`TABLEBDTFX` b ON (b.num_nom = c.nom_sel_nn) WHERE nom_referentiel IS NULL AND nom_sel_nn IS NOT NULL; |
| -- INNER JOIN sur bdtxa: 79471 dont 9752 en dup (bdtxa + bdtfx), eg: 1005047 |
| SELECT id_observation, nom_referentiel, nom_sel, nom_sel_nn, nom_ret, nom_ret_nn, nt, c.famille FROM `BASEEDIT`.`cel_obs` c INNER JOIN T_bis b ON (b.num_nom = c.nom_sel_nn) WHERE nom_referentiel AND nom_sel_nn IS NOT NULL; |
| */ |
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| /* d'où GROUP BY id_observation HAVING count(id_observation) = 1 */ |
| /* |
| SELECT id_observation, nom_referentiel, nom_sel, nom_sel_nn, nom_ret, nom_ret_nn, nt, c.famille |
| FROM `BASEEDIT`.`cel_obs` c |
| INNER JOIN T_bis b |
| ON (b.num_nom = c.nom_sel_nn) |
| WHERE nom_referentiel IS NULL AND nom_sel_nn IS NOT NULL GROUP BY id_observation HAVING count(id_observation) = 1; |
| -- 59967, tous bdtfx... |
| */ |
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| delimiter | |
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| CREATE PROCEDURE majreferentiel() |
| BEGIN |
| DECLARE done INT DEFAULT 0; |
| DECLARE subst INT DEFAULT 0; |
| DECLARE _id_observation bigint(20) DEFAULT 0; |
| DECLARE _valid_ref varchar(20) DEFAULT NULL; |
| DECLARE cur1 CURSOR FOR SELECT id_observation, valid_ref FROM `BASEEDIT`.`cel_obs` c INNER JOIN T_bis b ON (b.num_nom = c.nom_sel_nn) |
| WHERE nom_referentiel IS NULL AND nom_sel_nn IS NOT NULL GROUP BY id_observation HAVING count(id_observation) = 1; |
| -- DECLARE CONTINUE HANDLER FOR NOT FOUND SET done = TRUE; |
| DECLARE CONTINUE HANDLER FOR SQLSTATE '02000' SET done = 1; |
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| OPEN cur1; |
| REPEAT |
| FETCH cur1 INTO _id_observation, _valid_ref; |
| UPDATE `BASEEDIT`.`cel_obs` c SET nom_referentiel = _valid_ref WHERE id_observation = _id_observation; |
| SET subst = subst + 1; |
| UNTIL done END REPEAT; |
| select subst AS 'nombre de mises à jour de référentiel effectuées'; |
| CLOSE cur1; |
| END |
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| delimiter ; |