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/tags/v5.12-baouque/services/modules/0.1/baseveg/precisions_sur_niveaux.txt
New file
0,0 → 1,16
Précisions pour les ontologies : voir le fichier log dans le script de baseveg.
 
 
niveaux existants :
ORD,ALL,ASS,CLA,SUBCLA,SUBORD,SUBASS,SUBCLA,SUBALL,BC,DC,GRPT
A ce jour je ne connais pas le sens de BC et DC.
synonymes :
"syn" suivi de un ou plusieurs des termes suivants :
incl,=,= ?,illeg,pp,pmaxp,pminp,compl,ambig,non,inval,nn,ined
on rencontre parfois des textes entre [ ] comme dans : " syn incl illeg [pro race hyperatlantique] ".
catminat : certains codes comme 01/A6.0.1.0.1/01 comportent des lettres (probablement pour bdafx (algues)).
ces cas ont été ignorés.
Property changes:
Added: svn:eol-style
+native
\ No newline at end of property
/tags/v5.12-baouque/services/modules/0.1/baseveg/syntaxons/SyntaxonsRelationsToutes.php
New file
0,0 → 1,89
<?php
/**
*
* syntaxons/relations -> retourne toutes les relations d'un syntaxon en fonction du numéro catminat
*
* * @package eflore-projets
* @author mathilde Salthun-Lassalle
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
* @version 1.0
* @copyright 1999-2012 Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
*
*/
 
 
 
class SyntaxonsRelationsToutes extends SyntaxonsCommun {
 
public function consulter($ressources, $parametres) {
$this->ressources = $ressources;
$this->parametres = $parametres;
$this->traiterParametres();
$resultats = null;
$resultat = $this->retournerResultatRelations();
// puisque notre implémentation de retournerResultatFormate() n'utilise pas NULL
// et que le prototype de Commun::traiterResultat() doit être respecté, nous passons
// NULL comme second paramètre.
$versionResultat = $this->traiterResultat($resultat, NULL);
$resultats = $versionResultat;
return $resultats;
}
 
// si je ne réinstancie pas la classe entre les appels à la méthode consulter, çà ne marche pas !
private function retournerResultatRelations () {
$resultat_relation = array();
$classe = new SyntaxonsRelation(new Conteneur());
$ressources_syn = array_merge($this->ressources, array('synonymie') );
$synonymie = $classe->consulter($ressources_syn,$this->parametres);
if ($synonymie != 'Les données recherchées sont introuvables') {
$resultat_relation['synonymie'] = $synonymie['resultat'];
}
$ressources_niv = array_merge($this->ressources, array('niveaux-sup') );
$classe = new SyntaxonsRelation(new Conteneur());
$niveaux = $classe->consulter($ressources_niv,$this->parametres);
if ($niveaux != 'Les données recherchées sont introuvables') {
$resultat_relation['niveaux_superieurs'] = $niveaux['resultat'];
}
return $resultat_relation;
}
//+-------------------------------------traitement des ressources et des paramètres----------------------------------------+//
 
public function traiterParametres() {
if (isset($this->parametres) && !empty($this->parametres) ) {
foreach ($this->parametres as $param => $valeur) {
if ($param != 'version.projet' || $param != 'retour.champs' ) {
$e = 'Erreur dans les parametres de votre requête : </br> Le paramètre " '
.$param.' " n\'existe pas.';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
}
}
}
}
 
//+--------------------------formatages de resultats -------------------------------------------+
public function retournerResultatFormate($resultat) {
$resultat_json = array();
$resultat_json['entete']['catminat'] = str_replace('-','/',$this->ressources[0]);
$resultat_json['resultat'] = $resultat;
return $resultat_json;
}
 
}
?>
/tags/v5.12-baouque/services/modules/0.1/baseveg/syntaxons/SyntaxonsCode.php
New file
0,0 → 1,107
<?php
/**
*
* /syntaxons?masque.catminat=#catminat&masque.niveau=#niveau etc.--> retourne les syntaxons répondant à ces critères
* /syntaxons/cle:#cle --> retourne les informations de ce syntaxon ( peut être un synonyme )
*
* Remarque : le code fixe n'est pas tout à fait unique puisque certaines valeurs (ex. 1489)
* apparaissent 2 ou 3 fois avec des codes catminat ou des syntaxons sensiblement différents.
* C'est pourquoi il n'est pas utilisé.
*
*
* @package eflore-projets
* @author mathilde Salthun-Lassalle
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
* @version 1.0
* @copyright 1999-2012 Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
*
*/
 
class SyntaxonsCode extends SyntaxonsCommun {
public function consulter($ressources, $parametres) {
$this->ressources = $ressources;
$this->parametres = $parametres;
$this->traiterRessources();
$this->traiterParametres();
$this->definirTables();
$resultats = null;
$requete = '';
foreach ($this->table_version as $version) {
$this->table = $version;
$requete = $this->assemblerLaRequete();
$resultat = $this->Bdd->recupererTous($requete);
$versionResultat = $this->traiterResultat($resultat, $version);
if (count($this->table_version) > 1) {
$resultats[$version] = $versionResultat;
} else {
$resultats = $versionResultat;
}
}
return $resultats;
}
function __construct(Conteneur $conteneur) {
parent::__construct($conteneur);
}
 
//+-------------------------------------traitement des ressources et des paramètres----------------------------------------+//
public function traiterRessources() {
$catminat='';
if(preg_match("/catminat:(([0-9]{2}\-$)|([0-9]{2}\-[0-9]\.$)|([0-9]{2}\-(?:[0-9]\.){1,5}[0-9]$)|([0-9]{2}\-(?:[0-9]\.){4,5}[0-9]\-[0-9]+(?:bis|ter|quater){0,1}$))/",$this->ressources[0], $retour)) {
$this->catminat = str_replace('-', '/',$retour[1]);
$this->requete_condition[] = ' code_catminat = \''.$this->catminat.'\' ' ;
$this->requete_condition[] = ' niveau NOT LIKE \'syn%\' ';
} elseif (preg_match("/cle:([0-9]+)/",$this->ressources[0], $retour)) {
$this->champs_recherches = ' * ';
$this->requete_condition[] = ' cle = '.$retour[1].' ' ;
}elseif ($this->ressources[0]) {
$e = 'Erreur dans l\'url de votre requête : </br> La ressource demandée n\'existe pas.';
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE);
}
return $catminat;
}
public function traiterParametres() {
if (isset($this->parametres) && !empty($this->parametres) ) {
foreach ($this->parametres as $param => $valeur) {
switch ($param) {
case 'version.projet' :
$this->traiterVersion($valeur);
break;
default :
$e = 'Erreur dans les parametres de votre requête : </br> Le paramètre " '
.$param.' " n\'existe pas.';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e); break;
}
}
}
}
//+--------------------------formatages de resultats -------------------------------------------+
public function retournerResultatFormate($resultat) {
$resultat_json = array();
foreach ($resultat as $cle => $res) {
$resultat[$cle] = array_merge($resultat[$cle],$this->traiterOntologieNiveau($res['niveau']));
unset($resultat[$cle]['niveau']);
$resultat[$cle] = $this->enleverValeursVides($resultat[$cle]);
}
$resultat_json['resultat'] = $resultat;
return $resultat_json;
}
 
}
 
?>
/tags/v5.12-baouque/services/modules/0.1/baseveg/syntaxons/SyntaxonsTous.php
New file
0,0 → 1,152
<?php
/**
*
* /syntaxons --> retourne l'ensemble des tuples de la table
* /syntaxons?masque.catminat=#catminat&masque.niveau=#niveau etc.--> retourne les syntaxons répondant à ces critères
*
* * @package eflore-projets
* @author mathilde Salthun-Lassalle
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
* @version 1.0
* @copyright 1999-2012 Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
*
*/
 
class SyntaxonsTous extends SyntaxonsCommun {
 
function __construct(Conteneur $conteneur) {
parent::__construct($conteneur);
$this->champs_recherches = 'cle, code_catminat, syntaxon, code_fixe_nom, code_natura_2000, niveau ';
}
public function consulter($ressources, $parametres) {
$this->ressources = $ressources;
$this->parametres = $parametres;
$this->traiterParametres();
$this->definirTables();
$resultats = null;
foreach ($this->table_version as $version) {
$this->table = $version;
$requete = $this->assemblerLaRequete();
$resultat = $this->Bdd->recupererTous($requete);
// puisque notre implémentation de retournerResultatFormate() n'utilise pas NULL
// et que le prototype de Commun::traiterResultat() doit être respecté, nous passons
// NULL comme second paramètre.
$versionResultat = $this->traiterResultat($resultat, NULL);
if (count($this->table_version) > 1) {
$resultats[$version] = $versionResultat;
} else {
$resultats = $versionResultat;
}
}
return $resultats;
}
//+-------------------------------------traitement des ressources et des paramètres----------------------------------------+//
public function traiterParametres() {
if (isset($this->parametres) && !empty($this->parametres) ) {
foreach ($this->parametres as $param => $valeur) {
switch ($param) {
case 'navigation.depart' :
$this->definirNavigationDepart($valeur);
break;
case 'navigation.limite' :
$this->definirNavigationLimite($valeur);
break;
case 'version.projet' :
$this->traiterVersion($valeur);
break;
case 'masque.catminat' :
$this->traiterCatminat($valeur);
break;
case 'masque.niveau' :
$this->traiterNiveau($valeur);
break;
case 'masque.retenu' :
$this->traiterRetenu($valeur);
break;
case 'masque.fixe' :
$this->requete_condition[] = ' code_fixe_nom = \''.$valeur.'\' ';
break;
case 'retour.champs' :
$this->champs_recherches .= ','.$valeur.' ';
break;
default :
$e = 'Erreur dans les parametres de votre requête : </br> Le paramètre " '
.$param.' " n\'existe pas.';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e); break;
}
}
}
}
public function traiterRetenu($valeur) {
$valeur = trim($valeur);
if( $valeur == 'true') {
$this->requete_condition[] = ' niveau NOT LIKE \'syn%\' ';
} elseif ( $valeur == 'false') {
$this->requete_condition[] = ' niveau LIKE \'syn%\' ';
}
}
public function traiterCatminat($valeur) {
$valeur = trim($valeur);
$valeur = str_replace('-', '/', $valeur);
$this->requete_condition[] = ' code_catminat = '.$this->getBdd()->proteger($valeur).'';
}
public function traiterNiveau($valeur) {
$valeur = strtoupper(trim($valeur));
if (in_array($valeur,$this->niv)) {
$this->requete_condition[] = ' niveau = '.$this->getBdd()->proteger($valeur).'';
//$this->requete_condition[] = ' code_catminat = '.$this->catminat.'';
} else {
$e = "Erreur : valeur inconnue pour masque.niveau."
." valeurs possibles : ALL|ORD|CLA|SUBCLA|SUBORD|SUBALL|ASS|SUBASS|BC|DC|GRPT";
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE);
}
}
//+--------------------------formatages de resultats -------------------------------------------+
public function retournerResultatFormate($resultat) {
$resultat_json = array();
$resultat_json['entete'] = $this->ajouterEnteteResultat();
foreach ($resultat as $cle => $res) {
$resultat[$cle]['href'] = $this->ajouterHref('syntaxons','cle:'.$res['cle']);
$resultat[$cle] = array_merge($resultat[$cle],$this->traiterOntologieNiveau($res['niveau']));
unset($resultat[$cle]['niveau']);
}
$resultat_json['resultat'] = $resultat;
return $resultat_json;
}
public function ajouterEnteteResultat() {
$entete['depart'] = $this->limite_requete['depart'];
$entete['limite'] = $this->limite_requete['limite'];
$entete['total'] = $this->total_resultat;
$entete['version'] = $this->version_projet;
$ressources = (empty($this->ressources)) ? '/syntaxons' : '/syntaxons/' ;
$url = $this->formulerUrl($this->total_resultat, $ressources.implode('/',$this->ressources));
if (isset($url['precedent']) && $url['precedent'] != '') {
$entete['href.precedent'] = $url['precedent'];
}
if (isset($url['suivant']) && $url['suivant'] != '') {
$entete['href.suivant'] = $url['suivant'];
}
return $entete;
}
}
?>
/tags/v5.12-baouque/services/modules/0.1/baseveg/syntaxons/SyntaxonsRelation.php
New file
0,0 → 1,256
<?php
/**
*
* syntaxons/relations -> retourne toutes les relations d'un syntaxon en fonction du numéro catminat
*
* /syntaxons/catminat:#code_catminat/relations/niveaux_sup --> retourne les niveaux supérieurs d'un syntaxon
* /syntaxons/catminat:#code_catminat/relations/synonymie --> retourne tous les synonymes pour un code catminat
*
* @package eflore-projets
* @author mathilde Salthun-Lassalle
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
* @version 1.0
* @copyright 1999-2012 Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
*
*/
 
class SyntaxonsRelation extends SyntaxonsCommun{
public function consulter($ressources, $parametres) {
$this->ressources = $ressources;
$this->parametres = $parametres;
$this->traiterRessources();
$this->traiterParametres();
$this->definirTables();
$resultats = null;
$requete = '';
foreach ($this->table_version as $version) {
$this->table = $version;
$requete = $this->assemblerLaRequete();
$resultat = $this->Bdd->recupererTous($requete);
$versionResultat = $this->traiterResultat($resultat, $this->version_projet);
if (count($this->table_version) > 1) {
$resultats[$version] = $versionResultat;
} else {
$resultats = $versionResultat;
}
}
return $resultats;
}
 
 
function __construct(Conteneur $conteneur) {
parent::__construct($conteneur);
$this->champs_recherches = 'cle, code_catminat, syntaxon, code_fixe_nom, code_natura_2000, niveau ';
}
 
//surchargée car le web-service est appelé par SyntaxonsRelationsToutes.
//ne doit pas renvoyer une erreur mais un résultat vide.
public function traiterResultat($resultat, $version) {
$versionResultat = null;
if ($resultat == '') {
$message = 'La requête SQL formée comporte une erreur!';
$code = RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE;
throw new Exception($message, $code);
} elseif ($resultat) {
$versionResultat = $this->retournerResultatFormate($resultat);
} else {
$versionResultat = 'Les données recherchées sont introuvables';
}
return $versionResultat;
}
 
//+-------------------------------------traitement des ressources et des paramètres----------------------------------------+//
public function traiterRessources() {
$catminat='';
if(preg_match("/catminat:(([0-9]{2}\-$)|([0-9]{2}\-[0-9]\.$)|([0-9]{2}\-(?:[0-9]\.){1,5}[0-9]$)|([0-9]{2}\-(?:[0-9]\.){4,5}[0-9]\-[0-9]+(?:bis|ter|quater){0,1}$))/",$this->ressources[0], $retour)) {
$this->catminat = str_replace('-', '/',$retour[1]);
$this->traiterRessourcesRelations();
}elseif ($this->ressources[0]) {
$e = 'Erreur dans l\'url de votre requête : </br> La ressource demandée n\'existe pas.';
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE);
}
return $catminat;
}
public function traiterRessourcesRelations(){
if($this->ressources[1] == 'relations') {
switch($this->ressources[2]) {
case 'niveaux-sup':
$catminat_sup = $this->chercherCatminatSuperieurs();
if (!empty($catminat_sup)) {
if (count($catminat_sup)>1) {
$this->requete_condition[] = ' code_catminat in ('.implode(',',$catminat_sup).')';
} else {
$this->requete_condition[] = ' code_catminat = '.$catminat_sup[0].' ';
}
} else {
$e = 'Erreur dans l\'url de votre requête : le code catminat est trop court.';
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE);
}
break;
case 'synonymie' :
$this->requete_condition[] = " niveau LIKE 'syn%' and code_catminat = '".$this->catminat."' " ;
break;
default :
$e = 'Erreur dans l\'url de votre requête : </br> La ressource demandée n\'existe pas.';
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE);
}
} else {
$e = 'Erreur dans l\'url de votre requête : </br> La ressource demandée n\'existe pas.';
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE);
}
}
//ne renvoie que les supérieurs ( sans la valeur initiale )
public function chercherCatminatSuperieurs() {
$catminat_sup = array();
$catminat_slash = explode('/',$this->catminat);
$catminat_slash = $this->enleverValeursVides($catminat_slash);
$taille_slash = count($catminat_slash);
if ($taille_slash > 1) {
$catminat_sup[0] = "'".array_shift($catminat_slash)."/'";
$niveaux = array_shift($catminat_slash);
$unites = explode('.',trim($niveaux)); //attention explode peut renvoyer des cases vides (voir la doc php)
$unites = $this->enleverValeursVides($unites);
$taille = ($taille_slash == 3) ? count($unites) : count($unites)-1 ;
for ($i=0; $i< $taille ; $i++) {
$sup = "'".trim($catminat_sup[$i],"'");
if ($i == 0) {
$sup .= $unites[$i].".'";
} elseif ($i == 1) {
$sup .= $unites[$i]."'";
} else {
$sup .= ".".$unites[$i]."'";
}
$catminat_sup[] = $sup;
}
}
return $catminat_sup;
}
public function traiterParametres() {
if (isset($this->parametres) && !empty($this->parametres) ) {
foreach ($this->parametres as $param => $valeur) {
switch ($param) {
case 'navigation.depart' :
$this->definirNavigationDepart($valeur);
break;
case 'navigation.limite' :
$this->definirNavigationLimite($valeur);
break;
case 'version.projet' :
$this->traiterVersion($valeur);
break;
case 'masque.catminat' :
$this->traiterCatminat($valeur);
break;
case 'masque.niveau' :
$this->traiterNiveau($valeur);
break;
case 'masque.fixe':
$this->requete_condition[] = ' code_fixe_nom = \''.$valeur.'\' ';
break;
case 'retour.champs' :
$this->champs_recherches .= ','.$valeur.' ';
break;
case 'masque.retenu' :
$this->traiterRetenu($valeur);
break;
default :
$e = 'Erreur dans les parametres de votre requête : </br> Le paramètre " '
.$param.' " n\'existe pas.';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e); break;
}
}
}
}
public function traiterRetenu($valeur) {
if ($this->ressources[2] == 'niveaux-sup') {
$valeur = trim($valeur);
if( $valeur == 'true') {
$this->requete_condition[] = ' niveau NOT LIKE \'syn%\' ';
} elseif ( $valeur == 'false') {
$this->requete_condition[] = ' niveau LIKE \'syn%\' ';
}
} else {
$e = 'Erreur dans les parametres de votre requête : </br> Le paramètre " masque.retenu " n\'existe pas.';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
}
}
public function traiterCatminat($valeur) {
if ($this->ressources[2] == 'niveaux-sup') {
$valeur = trim($valeur);
$valeur = str_replace('-', '/', $valeur);
$this->requete_condition[] = ' code_catminat = '.$this->getBdd()->proteger($valeur).'';
} else {
$e = 'Erreur dans les parametres de votre requête : </br> Le paramètre " masque.catminat " n\'existe pas.';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e); break;
}
}
public function traiterNiveau($valeur) {
if ($this->ressources[2] == 'niveaux-sup') {
$valeur = strtoupper(trim($valeur));
if (in_array($valeur,$this->niv)) {
$this->requete_condition[] = ' niveau = '.$this->getBdd()->proteger($valeur).'';
} else {
$e = "Erreur : valeur inconnue pour masque.niveau."
." valeurs possibles : ALL|ORD|CLA|SUBCLA|SUBORD|SUBALL|ASS|SUBASS|BC|DC|GRPT";
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE);
}
} else {
$e = 'Erreur dans les parametres de votre requête : </br> Le paramètre " masque.niveau " n\'existe pas.';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
}
}
//+--------------------------formatages de resultats -------------------------------------------+//
public function retournerResultatFormate($resultat) {
$resultat_json = array();
$resultat_json['entete'] = $this->ajouterEnteteResultat();
foreach ($resultat as $cle => $res) {
$resultat[$cle]['href'] = $this->ajouterHref('syntaxons','cle:'.$res['cle']);
$resultat[$cle] = array_merge($resultat[$cle],$this->traiterOntologieNiveau($res['niveau']));
unset($resultat[$cle]['niveau']);
}
$resultat_json['resultat'] = $resultat;
return $resultat_json;
}
public function ajouterEnteteResultat() {
$entete['depart'] = $this->limite_requete['depart'];
$entete['limite'] = $this->limite_requete['limite'];
$entete['total'] = $this->total_resultat;
$entete['version'] = $this->version_projet;
$ressources = (empty($this->ressources)) ? '/syntaxons' : '/syntaxons/' ;
$url = $this->formulerUrl($this->total_resultat, $ressources.implode('/',$this->ressources));
if (isset($url['precedent']) && $url['precedent'] != '') {
$entete['href.precedent'] = $url['precedent'];
}
if (isset($url['suivant']) && $url['suivant'] != '') {
$entete['href.suivant'] = $url['suivant'];
}
return $entete;
}
 
}
 
?>
/tags/v5.12-baouque/services/modules/0.1/baseveg/syntaxons/SyntaxonsCommun.php
New file
0,0 → 1,195
<?php
/**
*
* fonctions et paramètres communs aux traitement des syntaxons
* - traitement de l'ontologie
* - fonction utiles pour les paramètres de configuration entre autres
* - traitement des tables et de leur version
* - traitement de la requête
*
* @package eflore-projets
* @author mathilde Salthun-Lassalle
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
* @version 1.0
* @copyright 1999-2012 Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
*/
 
require_once(dirname(__FILE__) . '/../../baseflor/Informations.php');
 
class SyntaxonsCommun extends Commun {
protected $table = "";
protected $format_reponse = 'syntaxons';
protected $serviceNom = 'syntaxons';
protected $Bdd;
protected $syn;
protected $niv;
protected $limite_requete = array('depart' => 0, 'limite' => 100);
protected $requete_condition = array();
protected $total_resultat;
protected $champs_recherches = ' * ';
protected $table_version;
protected $version_projet = '+' ;
static $cache = array();
public function __construct(Conteneur $conteneur) {
$this->Bdd = $conteneur->getBdd();
$this->syn = $this->getParametreTableauSpe('Paramètres.synonymes');
$this->niv = $this->getParametreTableauSpe('Paramètres.niveaux');
}
 
 
//+---------------------------------------------------outils------------------------------------------------//
protected function getParametreTableauSpe($cle) {
$tableau = array();
$parametre = Config::get($cle);
if (empty($parametre) === false) {
$tableauPartiel = explode(',', $parametre);
$tableauPartiel = array_map('trim', $tableauPartiel);
foreach ($tableauPartiel as $champ) {
$tableau[] = trim($champ,"'");// spécificité pour le = ? des synonymes
}
}
return $tableau;
}
//la fonction php array_filters ne marche pas sur le serveur
protected function enleverValeursVides($tableau) {
$tab = array();
foreach ($tableau as $cle => $valeur) {
if ($valeur != '' && is_int($cle)) {
$tab[] = $valeur;
} elseif ($valeur != '' && is_string($cle)) {
$tab[$cle] = $valeur;
}
}
return $tab;
}
//+++------------------------------traitement des versions----------------------------------------++
protected function traiterVersion($valeur) {
if (preg_match('/^[0-9]+(?:[._][0-9]+)*$/', $valeur) || $valeur == '+' || $valeur == '*') {
$this->version_projet = $valeur;
} else {
$e = "Erreur : La version est inconnue.";
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE);
}
}
protected function definirTables() {
$table_num_version = $this->recupererVersionDisponible();
$prefixe_table = config::get('bdd_table');
if ( in_array($this->version_projet,$table_num_version) ) {
$this->table_version[] = $prefixe_table.'_v'.$this->version_projet;
} elseif ($this->version_projet == '+') {
$derniere_version = $table_num_version[count($table_num_version) - 1];
$this->table_version[] = $prefixe_table.'_v'.str_replace('.', '_', $derniere_version);
} elseif ($this->version_projet == '*') {
foreach ($table_num_version as $num_version) {
$this->table_version[] = $prefixe_table.'_v'.str_replace('.', '_', $num_version);
}
} else {
$e = "Erreur : La version est inconnue.";
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE);
}
}
//+------------------------------------ontologies----------------------------------------------------+
protected function recupererOntologiesNiveau($valeur, $code){
$ontologie = array();
$url = Config::get('url_service_base').Config::get('nom_projet').
'/ontologies/'.$code.':'.urlencode(urlencode($valeur));
if(array_key_exists($url, self::$cache)) {
$val = self::$cache[$url];
} else {
$val = $this->consulterHref($url);
self::$cache[$url] = $val;
}
$ontologie['niveau.code'] = $valeur;
$ontologie['niveau.libelle'] = $val->nom;
$ontologie['niveau.href'] = $url;
return $ontologie;
}
protected function recupererOntologiesNiveauSyn($niveau){
$ontologie = array();
$synonymes = explode(' ',$niveau[1]);
$libelle = array();
$detail = array();
foreach ($synonymes as $syn) {
if ($syn == '=') {
$syn = 'equi';
} elseif ($syn == '= ?') {
$syn = 'prob';
}
if ($syn != '' && $syn != '?') {
$detail[] = $this->recupererOntologiesNiveau($syn, 'syn');
$dernier = end($detail);
$libelle[] = $dernier['niveau.libelle'].' ';
}
}
$ontologie['niveau.code'] = $niveau[0];
$ontologie['niveau.libelle'] = 'synonyme '.implode(' - ',$libelle);
if (isset($niveau[2])) {
$ontologie['niveau.libelle'] .= ' '.$niveau[2];
}
$ontologie['niveau.detail'] = $detail;
return $ontologie;
}
protected function traiterOntologieNiveau($niveau) {
$ontologie = array();
if ( preg_match('/syn {0,1}(['.implode($this->syn).']*)( *\[.+\])*/',$niveau,$retour)) {
$ontologie = $this->recupererOntologiesNiveauSyn($retour);
} else {
$ontologie = $this->recupererOntologiesNiveau($niveau, 'UP');
}
return $ontologie;
}
//+--------------------------FONCTIONS D'ASSEMBLAGE DE LA REQUETE-------------------------------------------+
protected function assemblerLaRequete() {
$requete = ' SELECT '.$this->champs_recherches.' FROM '.$this->table.' '
.Informations::retournerRequeteCondition($this->requete_condition).' '.$this->delimiterResultatsRequete();
return $requete;
}
protected function delimiterResultatsRequete() {
$this->total_resultat = Informations::calculerTotalResultat(
$this->getBdd(),
$this->table,
Array(),
$this->requete_condition);
 
$requete_limite = '';
if (($this->limite_requete['depart'] <= $this->total_resultat) ){
if (($this->limite_requete['limite'] + $this->limite_requete['depart'] )
< $this->total_resultat ){
$requete_limite = 'LIMIT '.$this->limite_requete['depart'].', '
.$this->limite_requete['limite'];
}
} else {
$e = "Erreur : la valeur pour le paramètre navigation.départ est supérieure".
" au nombre total de résultats.";
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE);
}
return $requete_limite;
}
 
}
?>
/tags/v5.12-baouque/services/modules/0.1/baseveg/Ontologies.php
New file
0,0 → 1,345
<?php
/**
Classe Ontologies.php fournit des informations sur ensemble structuré des termes et concepts représentant les éléments
* d'un domaine de connaissances pour le projet baseveg.
*/
 
class BasevegOntologies extends Commun {
 
protected $requete_condition = null;
/** Permet de stocker la requete formulée: /ontologies | /ontologies/#id | /ontologies/#id/champ | /ontologies/#id/relations */
protected $format_reponse = 'ontologies';
/** Permet de stocker les limite de la requete SQL (par défaut seul les 100 premiers résultats seront retournés).
* Stocke également les valeurs des paramètres navigation.depart et navigation.limite passés dans la requete*/
protected $limite_requete = array( 'depart' => 0, 'limite' => 100);
/** Stocke le nombre total de résultats de la requete principale. Est calculée lors de l'assemblage de la requete */
protected $total_resultat;
protected $retour_format = 'max';
 
public function consulter($ressources, $parametres) {
$this->ressources = $ressources;
$this->parametres = $parametres;
$this->service = 'ontologies';
$this->traiterParametres();
$resultats = '';
$this->table = 'baseveg_ontologies';
$this->recupererNomChamp($this->table);
$this->traiterRessources();
$requete = $this->assemblerLaRequete();
$resultat = $this->getBdd()->recupererTous($requete);
$versionResultat = $this->traiterResultat($resultat, '');
$resultats = $versionResultat;
return $resultats;
}
public function traiterParametres() {
if (isset($this->parametres) && !empty($this->parametres)) {
foreach ($this->parametres as $param => $valeur) {
switch ($param) {
case 'masque' : $this->ajouterLeFiltreMasque('masque', $valeur); break;
case 'masque.code' : $this->ajouterLeFiltreMasque('code', $valeur); break;
case 'masque.nom' : $this->ajouterLeFiltreMasque('nom', $valeur); break;
case 'masque.description' : $this->ajouterLeFiltreMasque('description', $valeur); break;
case 'retour.format' : $this->retour_format = $valeur; break;
case 'navigation.depart' : $this->limite_requete['depart'] = $valeur; break;
case 'navigation.limite' : $this->limite_requete['limite'] = $valeur; break;
default :
$e = 'Erreur dans les parametres de recherche de votre requête : </br> Le paramètre " '
.$param.' " n\'existe pas.';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e); break;
}
}
}
}
 
public function ajouterLeFiltreMasque($nom_champ, $valeur) {
if ($nom_champ == 'code') {
$this->requete_condition[] = $nom_champ.' = '.$this->getBdd()->proteger($valeur);
} else {
if (isset($this->parametres['recherche']) && $this->parametres['recherche'] == 'floue') {
if ($nom_champ == 'masque') {
$this->requete_condition[] = '( code = '.$this->getBdd()->proteger($valeur)
.' OR ( SOUNDEX(nom) = SOUNDEX(\''.$valeur.'\')'
.' OR SOUNDEX(REVERSE(nom)) = SOUNDEX(REVERSE(\''.$valeur.'\')) '
.') OR ( SOUNDEX(description) = SOUNDEX(\''.$valeur.'\')'
.' OR SOUNDEX(REVERSE(description)) = SOUNDEX(REVERSE(\''.$valeur.'\')) ))';
} else {
$this->requete_condition[] = '(SOUNDEX('.$nom_champ.') = SOUNDEX(\''.$valeur.'\')'
.' OR SOUNDEX(REVERSE('.$nom_champ.')) = SOUNDEX(REVERSE(\''.$valeur.'\')))';
}
} else {
if (isset($this->parametres['recherche']) && $this->parametres['recherche'] == 'etendue') {
$valeur = str_replace(' ','%', $valeur);
$valeur .= '%';
}
if ($nom_champ == 'masque') {
$this->requete_condition[] = '(code = '.$this->getBdd()->proteger($valeur)
.' OR nom LIKE '.$this->getBdd()->proteger($valeur)
.' OR description LIKE '.$this->getBdd()->proteger($valeur).')';
} else {
$this->requete_condition[] = $nom_champ.' LIKE '.$this->getBdd()->proteger($valeur);
}
}
}
}
 
 
public function traiterRessources() {
if (isset($this->ressources) && !empty($this->ressources)) {
if (isset($this->ressources[0]) && !empty($this->ressources[0])) {
//requete = /ontologies/#id
$this->traiterRessourceId();
if (isset($this->ressources[1]) && !empty($this->ressources[1])) {
//requete = /ontologies/#id/relations
$this->traiterRessourceRelations();
}
}
}
}
 
 
public function traiterRessourceId() {
$this->requete_condition = array();
//requete : /ontologies/#id (ex : /ontologies/7)
if (is_numeric($this->ressources[0])) {
$this->requete_condition[] = ' id = '.$this->getBdd()->proteger($this->ressources[0]);
$this->format_reponse .= '/id';
//requete : /ontologies/#classe:#code (ex : /ontologies/rangTaxo:290)
} elseif (strrpos($this->ressources[0], ':') !== false) {
$this->format_reponse .= '/id';
preg_match('/^([^:]+):([^:]+)$/', $this->ressources[0], $match);
$this->requete_condition[] =
' id = (SELECT id FROM '.$this->table.' WHERE code = BINARY '.$this->getBdd()->proteger($match[2])
.' AND classe_id = (SELECT id FROM '.$this->table.' WHERE code = BINARY '.$this->getBdd()->proteger($match[1]).'))';
} else {
$e = 'Erreur dans les paramètres de recherche de votre requête : </br> Le paramètre " '
.$this->ressources[0].' " n\'existe pas.';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
}
}
 
 
public function traiterRessourceRelations() {
//requete = /ontologies/#id/relations :
if ($this->ressources[1] == 'relations') {
$this->format_reponse .= '/relations';
$this->requete_condition = array('classe_id = (SELECT classe_id FROM '.$this->table.' WHERE '
.implode(' AND ', $this->requete_condition).')');
}
}
 
//+--------------------------FONCTION ASSEMBLAGE DE LA REQUETE-------------------------------------------+
 
public function assemblerLaRequete() {
$requete = ' SELECT '.$this->formerRequeteChamp().
' FROM '.$this->table
.$this->retournerRequeteCondition()
.$this->formerRequeteLimite(); //print_r($requete);
return $requete;
}
 
public function formerRequeteChamp() {
$champ[] = 'id';
if ($this->format_reponse == 'ontologies') {
$champ[] = 'nom, code ';
}
if (isset($this->parametres['retour_champs']) || $this->format_reponse == 'ontologies/id/champs') {
$champs_recherches = explode(',', $this->parametres['retour_champs']);
$champs_possibles = $this->rechercherChampsPossibles();
foreach ($champs_recherches as $champ_recherche) {
if ($this->verifierValiditeChamp($champ_recherche)) {
$champ[] = (preg_match('/classe/', $champ_recherche)) ? 'classe_id' : $champ_recherche;
}
}
}
if (count($champ) == 1) {
$champ = array(' * ');
}
return implode(', ', $champ);
}
 
public function rechercherChampsPossibles() {
$this->recupererNomChamp($this->table);
$champs_possibles = $this->champs_table;
$champs_possibles[] = 'classe.id';
$champs_possibles[] = 'classe';
$champs_possibles[] = 'classe.href';
return $champs_possibles;
}
 
public function verifierValiditeChamp($champ, $champs_possibles) {
$validite = false;
preg_match('/^([^.]+)(:?\.([^.]+))?$/', $champ, $match);
if (in_array($match[1], $champs_possibles)) {
$validite = true;
} else {
$champs = implode('</li><li>', $champs_possibles);
$e = 'Erreur dans votre requête : </br> Le champ "'.$champ
.'" n\'existe pas. Les champs disponibles sont : <li>'.$champs.'</li>';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
}
return $validite;
}
 
public function retournerRequeteCondition() {
$condition = '';
if ($this->requete_condition !== null) {
$condition = ' WHERE '.implode(' AND ', $this->requete_condition);
}
return $condition;
}
 
public function formerRequeteLimite() {
$this->total_resultat = $this->recupererTotalResultat();
if (in_array($this->format_reponse , array('textes/id', 'textes/id/relations'))) {
$this->requete_limite = '';
} elseif (($depart = $this->limite_requete['depart']) > ($this->total_resultat)) {
$this->limite_requete['depart'] =
(($this->total_resultat - $this->limite_requete['limite']) < 0) ? 0 : ($this->total_resultat - $this->limite_requete['limite']);
$this->requete_limite = ' LIMIT '.$this->limite_requete['depart'].', '.$this->limite_requete['limite'];
} else {
$this->requete_limite = ' LIMIT '.$this->limite_requete['depart'].', '.$this->limite_requete['limite'];
}
return $this->requete_limite;
}
 
 
public function recupererTotalResultat() {
//on récupère le nombre total de résultats de la requete (ex : le nombre d'id contenu dans la liste /ontologies)
$requete = 'SELECT count(*) as nombre FROM '.$this->table.' '
.$this->retournerRequeteCondition();
$res = $this->getBdd()->recuperer($requete);
if ($res) {
$total = $res['nombre'];
} else {
$e = 'Données introuvables dans la base';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE, $e);
Debug::printr($requete);
}
return $total;
}
 
//+------------------------------------------------------------------------------------------------------+
public function retournerResultatFormate($resultat) {
// determine en fct du service appelé (/ontologies | /ontologies/#id | /ontologies/#id/champ |
// /ontologies/#id/relations) le format du tableau à retourner. Encode en json
switch ($this->format_reponse) {
case 'ontologies' : $reponse = $this->formaterOntologies($resultat); break;
case 'ontologies/id' : $reponse = $this->formaterOntologiesId($resultat[0]); break;
case 'ontologies/id/relations' : $reponse = $this->formaterOntologiesIdRelations($resultat); break;
default : break;
}
return $reponse;
}
 
 
public function formaterOntologies($resultat) {
$this->ajouterEnteteResultat($resultat);
$table_retour_json['entete'] = $this->ajouterEnteteResultat($resultat);
if (isset($this->parametres['masque_code']) || isset($this->parametres['masque'])) {
$resultat = $this->trierRechercheFloue($this->parametres['masque_code'], $resultat, 'code');
} elseif (isset($this->parametres['masque_nom'])) {
$resultat = $this->trierRechercheFloue($this->parametres['masque_nom'], $resultat, 'nom');
} elseif (isset($this->parametres['masque_description'])) {
$resultat = $this->trierRechercheFloue($this->parametres['masque_description'], $resultat, 'description');
}
//on remplit la table $table_retour_json['resultat']
foreach ($resultat as $tab) {
$num = $tab['id'];
unset($tab['id']);
foreach ($tab as $param => $valeur) {
$resultat_json[$num][$param] = $valeur;
}
if ($this->retour_format == 'max') $resultat_json[$num]['href'] = $this->ajouterHref('ontologies', $num);
}
$table_retour_json['resultat'] = $resultat_json;
return $table_retour_json;
}
 
public function ajouterEnteteResultat($resultat) {
//on remplit la table $table_retour_json['entete']
$entete['depart'] = $this->limite_requete['depart'];
$entete['limite'] = $this->limite_requete['limite'];
$entete['total'] = $this->total_resultat;
//formuler les urls
$url = $this->formulerUrl($this->total_resultat, '/ontologies');
if (isset($url['precedent']) && $url['precedent'] != '') { $entete['href.precedent'] = $url['precedent']; }
if (isset($url['suivant']) && $url['suivant'] != '') { $entete['href.suivant'] = $url['suivant']; }
return $entete;
}
 
 
public function formaterOntologiesId($resultat) {
$table_retour = array();
foreach ($resultat as $key => $valeur) {
if ($valeur != '') {
$table_retour = array_merge($table_retour, $this->afficherDonnees($key, $valeur));
}
}
return $table_retour;
}
 
public function afficherDonnees($champ, $valeur) {
$retour[$champ] = $valeur;
if ($this->retour_format == 'max') {
if ($champ == 'classe_id') {
unset($retour[$champ]); // remplacer par classe.id
if ($valeur != "0") { // pas de parent
if (isset($this->parametres['retour_champs'])) {
switch ($this->parametres['retour_champs']) {
case 'classe' : $retour['classe'] = $this->ajouterClasseCorrespondante($valeur); break;
case 'classe.id' : $retour['classe.id'] = $valeur; break;
case 'classe.href' : $retour['classe.href'] = $this->ajouterHref('ontologies', $valeur); break;
case 'classe.*' : $retour['classe.id'] = $valeur; $retour['classe.href'] = $this->ajouterHref('ontologies', $valeur); break;
}
} else {
$nom_classe = $this->ajouterClasseCorrespondante($valeur);
if (isset($nom_classe)) $retour['classe'] = $nom_classe;
$retour['classe.id'] = $valeur;
$retour['classe.href'] = $this->ajouterHref('ontologies', $valeur);
}
}
}
}
return $retour;
}
 
/** Recherche par interrogation de la base, le nom de la classe à partir de son identifiant (classe.id) */
public function ajouterClasseCorrespondante($classe_id) {
if ($classe_id == 0) return NULL;
 
$nom = '';
$req = 'SELECT nom FROM '.$this->table.' WHERE id = '.$this->getBdd()->proteger($classe_id);
$res = $this->getBdd()->recuperer($req . ' -- ' . __FILE__ . ':' . __LINE__);
if ($res) {
$nom = $res['nom'];
} else {
$e = "Données introuvables dans la table $this->table";
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE, $e);
Debug::printr($req);
}
return $nom;
}
 
public function formaterOntologiesIdRelations($resultat) {
$retour = null;
if ($resultat != '') {
$retour['entete'] = $this->ajouterEnteteResultat($resultat);
//on remplit la table $table_retour_json['resultat']
foreach ($resultat as $tab) {
$num = $tab['id'];
$retour['resultat'][$num]['nom'] = $tab['nom'];
if ($this->retour_format == 'max') {
$retour['resultat'][$num]['href'] = $this->ajouterHref('ontologies', $num);
}
}
}
return $retour;
}
}
?>
/tags/v5.12-baouque/services/modules/0.1/baseveg/Syntaxons.php
New file
0,0 → 1,85
<?php
/**
* Classe Syntaxons.php permet de faire des requetes de baseveg autour du code CATMINAT ou des niveaux de syntaxons
* Un syntaxon est une unité de végétation ( groupement )
* Cette classe analyse les ressources pour rediriger vers la classe du web service correpondant
*
* @see http://www.tela-botanica.org/wikini/eflore/wakka.php?wiki=EfloreApi01Syntaxons
*
* Encodage en entrée : utf8
* Encodage en sortie : utf8
* @package eflore-projets
* @author Mathilde SALTHUN-LASSALLE <mathilde@tela-botanica.org>
* @author Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org>
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
* @version 1.0
* @copyright 1999-2012 Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
*/
 
class Syntaxons extends Commun {// héritage de commun à cause du cache !
private $sousService;
public function consulter($ressources, $parametres) {
spl_autoload_register(array($this, 'chargerSyntaxons'));
$this->parametres = $parametres;
$this->ressources = $ressources;
$this->analyserRessources();
$resultat = $this->executerSousService();
return $resultat;
}
private function analyserRessources() {
$nb_ressources = count($this->ressources);
switch ($nb_ressources) {
case 0 : // syntaxons/
$this->sousService = 'SyntaxonsTous';
break;
case 1 : // syntaxons/#type_code:#code
$this->sousService = 'SyntaxonsCode';
break;
case 2 : // syntaxons/code catminat/relations
$this->sousService = 'SyntaxonsRelationsToutes';
break;
case 3 : // syntaxons/code catminat/relations /#type_relation
$this->sousService = 'SyntaxonsRelation';
break;
default:
$message = 'Erreur dans l\'url de votre requête : </br> La ressource demandée n\'existe pas.';
$code = RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE;
throw new Exception($message, $code);
break;
}
}
private function executerSousService() {
if (isset($this->sousService)) {
$classe = $this->sousService;
//require_once dirname(__FILE__).DS.'syntaxons'.DS.$classe.'.php';
$sousService = new $classe(new Conteneur());
$resultat = $sousService->consulter($this->ressources, $this->parametres);
} else {
$message = "L'analyse des ressources n'a pu aboutir à déterminer le sous service à executer.";
$code = RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE;
throw new Exception($message, $code);
}
return $resultat;
}
 
private function chargerSyntaxons($classe) {
$base = dirname(__FILE__).DS;
$chemin = $base.DS.'syntaxons'.DS;
$fichierATester = $chemin.$classe.'.php';
if (file_exists($fichierATester)) {
include_once $fichierATester;
return null;
}
}
}
?>