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/trunk/scripts/modules/cel/cel_references.sql
8,8 → 8,7
 
 
DROP TABLE IF EXISTS `cel_references`;
 
CREATE TABLE `cel_references` (
CREATE TABLE IF NOT EXISTS `cel_references` (
`referentiel` CHAR(5) NOT NULL, -- ENUM ("bdtfx", "bdtfx", "bdtxa", ...),
 
-- bdtfx
16,44 → 15,70
`num_nom` INT(9) NOT NULL DEFAULT '0',
`num_nom_retenu` VARCHAR(9) DEFAULT NULL,
 
-- bdtfx + nvjfl_v2007
`num_taxon` int(9) NOT NULL,
 
-- bdtfx
`nom_sci` VARCHAR(500) NOT NULL,
`auteur` VARCHAR(100) DEFAULT NULL,
 
 
-- cel_obs
-- `nom_ret_nn` DECIMAL(9,0) DEFAULT NULL COMMENT 'Numéro du nom retenu.',
-- `nom_ret` VARCHAR(255) DEFAULT NULL,
 
-- nvjfl_v2007 (`nom_vernaculaire` text NOT NULL)
`nom_commun` VARCHAR(60) NOT NULL,
-- mais NULL à cause de nva
`nom_commun` VARCHAR(60) NULL,
PRIMARY KEY (`referentiel`, `num_nom`)
) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=utf8;
 
 
/*
way 1: theory
INSERT INTO `cel_references` (`referentiel`, `num_nom`, `num_nom_retenu`, `nom_sci`, `auteur`, `nom_commun`) \
SELECT "bdtfx", b.num_nom, b.num_nom_retenu, b.nom_sci, b.auteur, n.nom_vernaculaire, MAX(n.num_statut) FROM bdtfx_v1_01 b LEFT JOIN nvjfl_v2007 n ON (b.num_taxonomique = n.num_taxon AND n.code_langue = 'fra' ) GROUP BY b.num_nom \
UNION \
SELECT "bdtxa", b.num_nom, b.num_nom_retenu, b.nom_sci, b.auteur, n.nom_vernaculaire, NULL FROM bdtxa_v1_00 b LEFT JOIN nva_v2013_06 n ON (b.num_tax = n.num_taxon AND n.code_langue = 'fra' ) GROUP BY b.num_nom;
SELECT "isfan", b.num_nom, b.num_nom_retenu, b.nom_sci, b.auteur, NULL FROM isfan_v2013 b;
*/
 
-- INSERT INTO `cel_references` (`referentiel`, `num_nom`, `num_nom_retenu`, `nom_sci`, `auteur`, `nom_commun`) \
-- SELECT "bdtfx", b.num_nom, b.num_nom_retenu, b.nom_sci, b.auteur, n.nom_vernaculaire, MAX(n.num_statut) FROM bdtfx_v1_01 b LEFT JOIN nvjfl_v2007 n ON (b.num_taxonomique = n.num_taxon AND n.code_langue = 'fra' ) GROUP BY b.num_nom \
-- UNION \
-- SELECT "bdtxa", b.num_nom, b.num_nom_retenu, b.nom_sci, b.auteur, n.nom_vernaculaire, NULL FROM bdtxa_v1_00 b LEFT JOIN nva_v2013_06 n ON (b.num_tax = n.num_taxon AND n.code_langue = 'fra' ) GROUP BY b.num_nom;
-- SELECT "isfan", b.num_nom, b.num_nom_retenu, b.nom_sci, b.auteur, NULL FROM isfan_v2013 b;
 
/*
Détermination des nom vernaculaires meilleurs et uniques:
 
way 1:
-- SELECT n.num_taxon, n.nom_vernaculaire, n.num_statut, n2.num_statut FROM nvjfl_v2007 n LEFT JOIN nvjfl_v2007 n2 ON (n.num_taxon = n2.num_taxon) WHERE n.num_taxon < 32 AND n.code_langue = 'fra' GROUP BY n.num_taxon, n.num_statut HAVING n.num_statut = MAX(n2.num_statut) LIMIT 100;
-- 12311
-- # distinct=
 
way 2:
-- SELECT n.num_taxon, n.nom_vernaculaire FROM nvjfl_v2007 n INNER JOIN nvjfl_v2007 n2 ON (n.num_taxon = n2.num_taxon AND n.code_langue = n2.code_langue AND n.num_statut > n2.num_statut) WHERE n.code_langue = 'fra' GROUP BY n.num_taxon;
-- 2680
 
-- déterminé à partir de
-- SELECT n.num_taxon, n.nom_vernaculaire, n.num_statut, n2.num_statut FROM nvjfl_v2007 n LEFT JOIN nvjfl_v2007 n2 ON (n.num_taxon = n2.num_taxon) WHERE n.num_taxon < 32 AND n.code_langue = 'fra' GROUP BY n.num_taxon, n.num_statut; -- HAVING n.num_statut = MAX(n2.num_statut) LIMIT 100;
DROP TEMPORARY TABLE IF EXISTS `T_nvjfl_v2007`;
way 2":
-- SELECT n.num_taxon, n.nom_vernaculaire FROM nvjfl_v2007 n LEFT JOIN nvjfl_v2007 n2 ON (n.num_taxon = n2.num_taxon AND n.code_langue = n2.code_langue AND n.num_statut > n2.num_statut) WHERE n.code_langue = 'fra' AND n2.num_statut IS NOT NULL GROUP BY num_taxon;
-- 2680, Mais problème ensuite: SELECT n.* from cel_references NATURAL JOIN nvjfl_v2007 n WHERE `nom_commun` = '' AND n.code_langue = 'fra';
 
 
Note: 16146 nom communs français distincts, 12312 num_taxon fr, aucun num_statut NULL en français
*/
 
 
DROP TEMPORARY TABLE IF EXISTS `T_nvjfl_v2007`, `T_nva_v2013_06`;
 
CREATE TEMPORARY TABLE T_nvjfl_v2007 ( INDEX(`num_taxon`) ) AS \
( SELECT n.num_taxon, n.nom_vernaculaire FROM nvjfl_v2007 n WHERE n.code_langue = 'fra' GROUP BY n.num_taxon, n.num_statut HAVING n.num_statut = MAX(n.num_statut) );
-- ( SELECT n.num_taxon, n.nom_vernaculaire FROM nvjfl_v2007 n WHERE n.code_langue = 'fra' GROUP BY n.num_taxon, n.num_statut HAVING n.num_statut = MAX(n.num_statut) );
( SELECT n.num_taxon, n.nom_vernaculaire, n.num_statut as void, MAX(n.num_statut) as void2 FROM nvjfl_v2007 n WHERE n.code_langue = 'fra' GROUP BY n.num_taxon HAVING n.num_statut = MAX(n.num_statut) );
 
 
-- uniquement pour la primary key, autrement le LEFT JOIN suivant est trop long
DROP TEMPORARY TABLE IF EXISTS `T_nva_v2013_06`;
-- table temporaire uniquement parce qu'il manque un index-key, autrement le LEFT JOIN ci-dessous est bien trop long
CREATE TEMPORARY TABLE T_nva_v2013_06 ( INDEX(`num_taxon`) ) AS \
( SELECT n.num_taxon, n.nom_vernaculaire FROM nva_v2013_06 n WHERE n.code_langue = 'fra' GROUP BY n.num_nom); -- aggrégat arbitraire car pas de num_statut
( SELECT n.num_taxon, n.nom_vernaculaire FROM nva_v2013_06 n WHERE n.code_langue = 'fra' /* DB pb */ AND n.num_taxon IS NOT NULL /* /DB pb */ GROUP BY n.num_nom); -- aggrégat arbitraire car pas de num_statut
 
 
INSERT INTO `cel_references` (`referentiel`, `num_nom`, `num_nom_retenu`, `nom_sci`, `auteur`, `nom_commun`) \
SELECT "bdtfx", b.num_nom, b.num_nom_retenu, b.nom_sci, b.auteur, n.nom_vernaculaire FROM bdtfx_v1_01 b LEFT JOIN T_nvjfl_v2007 n ON (b.num_taxonomique = n.num_taxon ) \
INSERT INTO `cel_references` (`referentiel`, `num_nom`, `num_nom_retenu`, `num_taxon`, `nom_sci`, `auteur`, `nom_commun`) \
SELECT "bdtfx", b.num_nom, b.num_nom_retenu, b.num_taxonomique, b.nom_sci, b.auteur, n.nom_vernaculaire FROM bdtfx_v1_01 b LEFT JOIN T_nvjfl_v2007 n ON (b.num_taxonomique = n.num_taxon ) \
UNION \
SELECT "bdtxa", b.num_nom, b.num_nom_retenu, b.nom_sci, b.auteur, n.nom_vernaculaire FROM bdtxa_v1_00 b LEFT JOIN T_nva_v2013_06 n ON (b.num_tax = n.num_taxon);
DROP TEMPORARY TABLE T_nvjfl_v2007;
SELECT "bdtxa", b.num_nom, b.num_nom_retenu, b.num_tax, b.nom_sci, b.auteur, n.nom_vernaculaire FROM bdtxa_v1_00 b LEFT JOIN T_nva_v2013_06 n ON (b.num_tax = n.num_taxon);
 
DROP TEMPORARY TABLE IF EXISTS `T_nvjfl_v2007`, `T_nva_v2013_06`;