| New file |
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| 0,0 → 1,114 |
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| /* |
| À l'origine les observations nécessiteuses sont celles n'ayant pas de données génénées, |
| Soit: nom_ret, nom_ret_nn, nt ou famille à NULL|0|'' |
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| Eg: |
| SELECT id_observation, nom_sel |
| FROM tb_cel.cel_obs |
| WHERE ( |
| nom_ret IS NULL or nom_ret = '' |
| OR nom_ret_nn IS NULL or nom_ret_nn = 0 |
| OR nt IS NULL or nt = 0 |
| OR famille IS NULL or famille = '' |
| ) |
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| Sauf que: |
| 1) on exclue celles sans nom_sel (elles sont sans espoir): |
| nom_sel IS NOT NULL AND nom_sel != '' |
| 2) on exclue celles qui on un nom_ret_nn à 0, car cela peut-être légal, cf maj-201307.sql à ce propos |
| # donc pas de `nom_ret_nn = 0` dans la requête |
| 3) on exclue, dans un premier temps, celles dont le référentiel n'est pas défini |
| AND (nom_referentiel IS NULL AND nom_referentiel = '') |
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| D'où, les 3621 observations suivantes (2206 nom_sel distincts) |
| SELECT id_observation, nom_sel |
| FROM tb_cel.cel_obs |
| WHERE ( |
| nom_sel IS NOT NULL AND nom_sel != '' |
| AND ( |
| nom_ret IS NULL OR nom_ret = '' |
| OR nom_ret_nn IS NULL |
| OR nt IS NULL or nt = 0 |
| OR famille IS NULL or famille = '' |
| ) |
| AND (nom_referentiel IS NOT NULL AND nom_referentiel != '') |
| ) |
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| Dans un premier temps nous travaillons avec le bdtfx, c'est à dire que |
| AND (nom_referentiel IS NOT NULL AND nom_referentiel != '') |
| devient |
| AND (nom_referentiel like 'bdtfx%') |
| soit 3597/3621 observations: |
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| Et effectuons une jointure sur bdtfx: |
| SELECT id_observation, nom_sel, b.num_nom, b.famille |
| FROM tb_cel.cel_obs c INNER JOIN tb_eflore.bdtfx_v1_02 b ON (b.nom_sci = c.nom_sel) |
| WHERE ( |
| nom_sel IS NOT NULL AND nom_sel != '' |
| AND ( |
| nom_ret IS NULL OR nom_ret = '' |
| OR nom_ret_nn IS NULL |
| OR nt IS NULL OR nt = 0 |
| OR c.famille IS NULL OR c.famille = '' |
| ) |
| AND (nom_referentiel like 'bdtfx%') |
| ) |
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| * Or nous observons que la famille est parfois légitimement NULL ! Ce n'est pas pertinent de l'utiliser |
| comme critère de caractérisation d'une observation buggée, contentons-nous donc de empty ('') |
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| * Or nous observons que le numéro taxonomique est parfois légitimement 0 ! Ce n'est pas pertinent de l'utiliser |
| comme critère de caractérisation d'une observation buggée, contentons-nous donc de NULL |
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| Soit 84 lignes, cependant, un nom_sel peut correspondre à plusieurs num_nom_retenu dans bdtfx ! (et oui, les suffixes latins et d'auteur). |
| Il s'agit donc de ne pas traiter ceux qui risquerait d'être mal-corrigé (sans les 100% de certitude). |
| Ainsi un ` GROUP BY id_observation HAVING count(id_observation) = 1 ` sera du meilleur effet. |
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| Nous obtenons donc ainsi les 69 observations à mettre à jour: |
| SELECT id_observation, nom_sel, nom_ret, nom_ret_nn, nt, c.famille, b.num_nom, b.nom_sci, b.num_taxonomique, b.famille |
| FROM tb_cel.cel_obs c INNER JOIN tb_eflore.bdtfx_v1_02 b ON (b.nom_sci = c.nom_sel) |
| WHERE ( |
| nom_sel IS NOT NULL AND nom_sel != '' |
| AND ( |
| nom_ret IS NULL OR nom_ret = '' |
| OR nom_ret_nn IS NULL |
| OR nt IS NULL |
| OR c.famille = '' |
| ) |
| AND (nom_referentiel like 'bdtfx%') |
| ) |
| GROUP BY id_observation HAVING count(id_observation) = 1 |
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| === la mise à jour === |
| Comme nous voulons utiliser UPDATE, nous devons remplacer le JOIN par des conditions du WHERE, mais le GROUP BY bloque de |
| toute manière, un SUB-SELECT (table temporaire) est donc nécessaire: |
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| === finale === |
| */ |
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| CREATE TEMPORARY TABLE T_bis ( INDEX(`id_observation`)) AS |
| SELECT id_observation, b.num_nom, CONCAT(b.nom_sci, ' ', b.auteur), b.num_taxonomique, b.famille |
| FROM tb_cel.cel_obs c, tb_eflore.bdtfx_v1_02 b |
| WHERE ( |
| b.nom_sci = c.nom_sel |
| AND nom_sel IS NOT NULL AND nom_sel != '' |
| AND ( |
| nom_ret IS NULL OR nom_ret = '' |
| OR nom_ret_nn IS NULL |
| OR nt IS NULL OR nt = 0 |
| OR c.famille = '' |
| ) |
| AND (nom_referentiel like 'bdtfx%') |
| ) |
| GROUP BY id_observation HAVING count(id_observation) = 1 |
| |
| UPDATE tb_cel.cel_obs c, T_bis t SET |
| c.nom_ret = t.nom_sci, |
| c.nom_ret_nn = t.num_nom, |
| c.nt = t.num_taxonomique, |
| c.famille = t.famille |
| WHERE (c.id_observation = t.id_observation); |
| DROP TEMPORARY TABLE T_bis; |