WebSVN – eFlore/Applications.cel – Diff – /branches/v3.00-serfouette/jrest/bibliotheque/RechercheInfosTaxonBeta.php

 <?php
 /**
 * PHP Version 5
+*
 * @category  PHP
 * @package   jrest
 * @author    David Delon <david@tela-botania.org>
 * @author    Aurélien Peronnet <aurelien@tela-botania.org>
 * @copyright 2010 Tela-Botanica
 * @license   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-fr.txt Licence CECILL
 * @version   SVN: <svn_id>
 * @link      /doc/jrest/
 */
 /**
+ *
  * La classe appelle les web service d'eflore pour éviter que le code client
  * ne soit dépendant de la version d'eflore
  */
 class RechercheInfosTaxonBeta extends Cel {
+	private $url_service_nom = null;
+	private $url_service_taxon = null;
+	private $url_service_chorologie = null;
 	public function RechercheInfosTaxonBeta($config) {
+		parent::__construct($config);
+		$this->url_service_nom = $config['eflore']['url_service_nom'];
+		$this->url_service_taxon = $config['eflore']['url_service_taxon'];
-		parent::__construct($config);
+		$this->url_service_chorologie_obs = $config['eflore']['url_service_chorologie_obs'];
+	}
 	public function rechercherGenreEspeceSurPrefixe($genre = null, $espece = null) {
 		$liste_genre_espece = array();
 		$masque = urlencode(trim(trim($genre).' '.trim($espece,' *')));
-		$requete = @file_get_contents('http://localhost/service:eflore:0.1/bdtfx/noms?masque='.$masque.'&recherche=etendue&retour.format=min&navigation.limite=50&ns.structure=au');
+		$requete = @file_get_contents($this->url_service_nom.'?masque='.$masque.'&recherche=etendue&retour.format=min&navigation.limite=50&ns.structure=au');
 		if($requete != '') {
 			$requete = json_decode($requete);
 			if(is_object($requete) && isset($requete->resultat)) {
 				foreach ($requete->resultat as $id => $res) {
-					$retenu = $res->retenu == true ? '3' : '';
+					$retenu = ($res->retenu == "true") ? '3' : '4';
 					$liste_genre_espece[] = array($res->nom_sci_complet, $id, $retenu);
+				}
+			}
-			usort($liste_genre_espece, array($this, 'comparerParNom'));
+			usort($liste_genre_espece, array($this, 'comparerParRetenuPuisNom'));
+		}
 		return $liste_genre_espece;
+	}
+	function comparerParRetenuPuisNom($a, $b) {
+		if($a[2] == 3 && $b[2] != 3) {
+			return -1;
+		} elseif($a[2] != 3 && $b[2] == 3) {
+			return 1;
-	function comparerParNom($a, $b) {
+		} else {
+			return strnatcmp($a[0], $b[0]);
 		return strnatcmp($a[0], $b[0]);
+	}
 	public function effectuerRequeteInfosComplementairesEtFormaterNom($numNom) {
 		$resultat_infos_complementaires = (array)$this->effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($numNom);
 		$retour_infos_complementaires = array();
 		if (isset($resultat_infos_complementaires['nom_retenu_complet']) && $resultat_infos_complementaires['nom_retenu_complet'] != '') {
            	$retour_infos_complementaires=array(($this->supprimerBiblio($resultat_infos_complementaires['nom_retenu_complet'])));
+	    }
 		return $retour_infos_complementaires;
+	}
 	public function rechercherInformationsComplementairesSurNom($nom_saisi) {
 		$nameparser = new NameParser();
 		$nom_decoupe = $nameparser->parse($nom_saisi);
 		$masque = ((isset($nom_decoupe['genus']) && $nom_decoupe['genus']!= '') &&
 				  (isset($nom_decoupe['species']) && $nom_decoupe['species']!= ''))
 				  ? $nom_decoupe['genus'].' '.$nom_decoupe['species'] : $nom_saisi;
 		$liste_genre_espece = array();
-		$url = 'http://www.tela-botanica.org/service:eflore:0.1/bdtfx/noms?masque='.urlencode($nom_decoupe['genus'].' '.$nom_decoupe['species']).'&recherche=etendue&ns.format=txt&retour.champs=nom_retenu,nom_retenu.*,num_taxonomique,auteur&navigation.limite=1';
+		$url = $this->url_service_nom.'?masque='.urlencode($nom_decoupe['genus'].' '.$nom_decoupe['species']).'&recherche=etendue&ns.format=txt&retour.champs=nom_retenu,nom_retenu.*,num_taxonomique,auteur&navigation.limite=1';
 		$resultat = @file_get_contents($url);
 		if($resultat != '') {
 			$resultat = json_decode($resultat);
 			if(is_object($resultat) && isset($resultat->resultat)) {
 				foreach ($resultat->resultat as $id => $res) {
 					$nom_complet = $res->{'nom_sci'}.' '.$res->auteur;
 					$liste_genre_espece[] = array($res->{'nom_retenu.id'},$nom_complet);
+				}
+			}
+		}
 		return $liste_genre_espece;
+	}
 	public function rechercherInformationsComplementairesSurNumNom($num_nom) {
 		$infos_formatees = array();
 		$infos = $this->effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($num_nom);
 		if(is_object($infos)) {
 			$infos_formatees = $this->formaterInfosComplementairesSurNumNom($infos);
+		}
 		return $infos_formatees;
+	}
 	public function effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($num_nom) {
 		$infos = array();
 		//TODO: retourner moins de champs grâce au paramètre retour.champs
-		$url = "http://www.tela-botanica.org/service:eflore:0.1/bdtfx/noms/".$num_nom;
+		$url = $this->url_service_nom.'/'.$num_nom;
 		$resultat = @file_get_contents($url);
 		if($resultat != '') {
 			$infos = json_decode($resultat);
+		}
 		return $infos;
+	}
 	private function formaterInfosComplementairesSurNumNom($infos) {
 		$infos = (array)$infos;
 		return $infos_formatees = array(
 			'Nom_Retenu' => $this->supprimerBiblio($infos['nom_retenu_complet']),
 			'Num_Nom_Retenu' => $infos['nom_retenu.id'],
 			'Num_Taxon' => $infos['num_taxonomique'],
 			'Famille' => $infos['famille']
 		);
+	}
 	private function supprimerBiblio($nom) {
 		return preg_replace('/ \[.*\]/','',$nom);
+	}
 	public function rechercherNumTaxSurNumNom($num_nom) {
 		$nt = null;
-		$url = "http://www.tela-botanica.org/service:eflore:0.1/bdtfx/noms/".$num_nom.'?retour.champs=num_taxonomique';
+		$url = $this->url_service_nom."/".$num_nom.'?retour.champs=num_taxonomique';
 		$resultat = @file_get_contents($url);
 		if($resultat != '') {
 			$infos = json_decode($resultat);
 			$nt = $infos->num_taxonomique;
+		}
 		return $nt;
+	}
 	public function taxonEstPresentDansDepartement($num_taxon,$code_departement) {
 		$presence_taxon = false;
-		$url = 'http://localhost/service:eflore:0.1/chorodep/observations/?masque.departement='.$code_departement.'&masque.determination.nt='.$num_taxon.'&navigation.limite=1';
+		$url = $this->url_service_chorologie_obs.'?masque.departement='.$code_departement.'&masque.determination.nt='.$num_taxon.'&navigation.limite=1';
 		$resultat = @file_get_contents($url);
 		if($resultat != '') {
 			$resultat = json_decode($resultat);
 			if(is_object($resultat) && isset($resultat->resultat) && count($resultat->resultat) > 0) {
 				$presence_taxon = true;
+			}
+		}
 		return $presence_taxon;
+	}
 	public function effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumTax($numTax) {
 		$infos = array();
 		//TODO: retourner moins de champs grâce au paramètre retour.champs
-		$url = "http://www.tela-botanica.org/service:eflore:0.1/bdtfx/taxons/nt:".$numTax;
+		$url = $this->url_service_taxon."/nt:".$numTax;
 		$resultat = @file_get_contents($url);
 		if($resultat != '') {
 			$infos = json_decode($resultat);
+		}
 		return $infos;
+	}
-	private function decouperNomEtRechercheEspeceOuSousEspece($identifiant_espece) {
-		$nameparser=new NameParser();
-		$nom_latin_decoupe=$nameparser->parse($identifiant_espece);
-		// requete sous espece (on privilegie les noms retenu cf tri par esn_ce_statut)
-		if (isset($nom_latin_decoupe['infra']) && $nom_latin_decoupe['infra']!="") {
-			$requete="SELECT DISTINCT en_id_nom, esn_ce_statut" .
-            	" FROM eflore_nom, eflore_nom_rang, eflore_selection_nom " .
-            	" WHERE en_id_version_projet_nom = '25' AND en_nom_genre = ".$this->proteger($nom_latin_decoupe['genus'])." " .
-                " AND enrg_abreviation_rang = ".$this->proteger($nom_latin_decoupe['infra_type'])." " .
-                " AND en_epithete_infra_specifique = ".$this->proteger($nom_latin_decoupe['infra'])." " .
-                " AND esn_id_nom= en_id_nom ".
-                " AND esn_id_version_projet_taxon=en_id_version_projet_nom " .
-                " AND en_epithete_espece =  ".$this->proteger($nom_latin_decoupe['species'])." AND en_ce_rang = enrg_id_rang " .
-                " ORDER BY esn_ce_statut ".
-                " LIMIT 1";
-		}
-		else { // espece  (on privilegie les noms retenu cf tri par esn_ce_statut)
-			$requete="SELECT DISTINCT en_id_nom, esn_ce_statut" .
-				" FROM eflore_nom, eflore_nom_rang, eflore_selection_nom " .
-				" WHERE en_id_version_projet_nom = '25' AND en_nom_genre = ".$this->proteger($nom_latin_decoupe['genus'])." " .
-				" AND enrg_abreviation_rang = 'sp.' " .
-				" AND esn_id_nom= en_id_nom ".
-				" AND esn_id_version_projet_taxon=en_id_version_projet_nom " .
-				" AND en_epithete_espece =  ".$this->proteger($nom_latin_decoupe['species'])." AND en_ce_rang = enrg_id_rang " .
-				" ORDER BY esn_ce_statut ".
-				" LIMIT 1";
-		}
-		$resultat = $this->executerRequete($requete);
-		$retour = array();
-		if (is_array($resultat) && count($resultat) > 0) {
-			$retour = $resultat[0];
-		}
-		return $retour;
-	}
 	function rechercherInfosSurTexteCodeOuNumTax($identifiant_espece) {
 		// texte libre, nom scientifique,
 		// ou code nomenclatural (format BDNFFnn999999)
 		// ou code taxonomique (format BDNFFnt999999)
 		$identifiant_espece=trim($identifiant_espece);
 		$identifiant_espece=utf8_encode($identifiant_espece);
 		$retour = array();
 		preg_match('/BDNFFnn([0-9][0-9]*)/',$identifiant_espece, $elements);
 		if (isset($elements[1])) {
 			// Numero nomenclatural
 			$infos_taxon = $this->rechercherInformationsComplementairesSurNumNom($elements[1]);
 			$retour = array("nom_sel" => $infos_taxon['Nom_Retenu'], "en_id_nom" => $elements[1]);
 		} else {
 			//  Numero taxonomique ou nom scientifique
 			preg_match('/BDNFFnt([0-9][0-9]*)/', $identifiant_espece, $elements);
 			if (isset($elements[1])) {
 				// Numero taxonomique
 				$infos_taxon = (array)$this->effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumTax($elements[1]);
 				if(isset($infos_taxon['nom_retenu.libelle']) && isset($infos_taxon['id'])) {
 					$nom = $infos_taxon['nom_retenu.libelle'];
 					$nom .= (isset($infos_taxon['auteur'])) ? ' '.$infos_taxon['auteur'] : '';
 					$retour = array("nom_sel" => $nom,
 									"en_id_nom" => $infos_taxon['id']);
+				}
 			} else {
 				// Nom scientifique
 				$id_nom = $this->rechercherInformationsComplementairesSurNom($identifiant_espece);
 				// Recherche du nom associe
 				$retour = array("nom_sel" => $identifiant_espece);
 				if(is_array($id_nom) && count($id_nom) > 0 && isset($id_nom[0][0])) {
 					$nn = $id_nom[0][0];
 					$infos_nom = (array)$this->effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($nn);
 					if (is_array($infos_nom) && !empty($infos_nom)) {
 						$retour = array("nom_sel" => $infos_nom['nom_sci'].' '.$infos_nom['auteur'], "en_id_nom" => $infos_nom['id']);
+					}
+				}
+			}
+		}
 		return $retour;
+	}
+}
 ?>

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