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Rev 737 Rev 738
1 
-- TODO:
 1 
-- TODO:
2 
-- fix référentiel: suppression n° de version et uniformisation
 2 
-- fix référentiel: suppression n° de version et uniformisation
3 
-- SELECT DISTINCT nom_referentiel, COUNT(id_observation) AS count FROM cel_obs GROUP BY nom_referentiel ORDER BY count DESC;
 3 
-- SELECT DISTINCT nom_referentiel, COUNT(id_observation) AS count FROM cel_obs GROUP BY nom_referentiel ORDER BY count DESC;
4 
 
 4 
 
5 
-- fix date: NULL pour les dates dans le futur
 5 
-- fix date: NULL pour les dates dans le futur
6 
-- SELECT courriel_utilisateur, id_observation, date_observation FROM cel_obs WHERE date_observation > NOW();
 6 
-- SELECT courriel_utilisateur, id_observation, date_observation FROM cel_obs WHERE date_observation > NOW();
7 
 
 7 
 
8 
 
 8 
 
9 
 
 9 
 
10 
DROP TABLE IF EXISTS `cel_references`;
 10 
DROP TABLE IF EXISTS `cel_references`;
11 
 
 - 
 
12 
CREATE TABLE `cel_references` (
 11 
CREATE TABLE IF NOT EXISTS `cel_references` (
13 
       `referentiel` CHAR(5) NOT NULL, -- ENUM ("bdtfx", "bdtfx", "bdtxa", ...),
 12 
       `referentiel` CHAR(5) NOT NULL, -- ENUM ("bdtfx", "bdtfx", "bdtxa", ...),
14 
 
 13 
 
15 
       -- bdtfx
 14 
       -- bdtfx
16 
       `num_nom` INT(9) NOT NULL DEFAULT '0',
 15 
       `num_nom` INT(9) NOT NULL DEFAULT '0',
17 
       `num_nom_retenu` VARCHAR(9) DEFAULT NULL,
 16 
       `num_nom_retenu` VARCHAR(9) DEFAULT NULL,
- 
 
 17 
 
- 
 
 18 
       -- bdtfx + nvjfl_v2007
- 
 
 19 
       `num_taxon` int(9) NOT NULL,
- 
 
 20 
 
18 
 
 21 
       -- bdtfx
19 
       `nom_sci` VARCHAR(500) NOT NULL,
 22 
       `nom_sci` VARCHAR(500) NOT NULL,
20 
       `auteur` VARCHAR(100) DEFAULT NULL,
 23 
       `auteur` VARCHAR(100) DEFAULT NULL,
- 
 
 24 
 
21 
 
 25 
 
22 
       -- cel_obs
 26 
       -- cel_obs
23 
       --       `nom_ret_nn` DECIMAL(9,0) DEFAULT NULL COMMENT 'Numéro du nom retenu.',
 27 
       --       `nom_ret_nn` DECIMAL(9,0) DEFAULT NULL COMMENT 'Numéro du nom retenu.',
24 
       --       `nom_ret` VARCHAR(255) DEFAULT NULL,
 28 
       --       `nom_ret` VARCHAR(255) DEFAULT NULL,
25 
 
 29 
 
26 
       -- nvjfl_v2007 (`nom_vernaculaire` text NOT NULL)
 30 
       -- nvjfl_v2007 (`nom_vernaculaire` text NOT NULL)
- 
 
 31 
       -- mais NULL à cause de nva
27 
       `nom_commun` VARCHAR(60) NOT NULL,
 32 
       `nom_commun` VARCHAR(60) NULL,
28 
PRIMARY KEY (`referentiel`, `num_nom`)
 33 
PRIMARY KEY (`referentiel`, `num_nom`)
29 
) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=utf8;
 34 
) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=utf8;
30 
 
 35 
 
- 
 
 36 
 
- 
 
 37 
/*
- 
 
 38 
way 1: theory
- 
 
 39 
INSERT INTO `cel_references` (`referentiel`, `num_nom`, `num_nom_retenu`, `nom_sci`, `auteur`, `nom_commun`) \
- 
 
 40 
       SELECT "bdtfx", b.num_nom, b.num_nom_retenu, b.nom_sci, b.auteur, n.nom_vernaculaire, MAX(n.num_statut)	FROM bdtfx_v1_01 b LEFT JOIN nvjfl_v2007 n	ON (b.num_taxonomique = n.num_taxon AND n.code_langue = 'fra' )	GROUP BY b.num_nom \
- 
 
 41 
       UNION \
- 
 
 42 
       SELECT "bdtxa", b.num_nom, b.num_nom_retenu, b.nom_sci, b.auteur, n.nom_vernaculaire, NULL				FROM bdtxa_v1_00 b LEFT JOIN nva_v2013_06 n	ON (b.num_tax = n.num_taxon AND n.code_langue = 'fra' )			GROUP BY b.num_nom;
- 
 
 43 
SELECT "isfan", b.num_nom, b.num_nom_retenu, b.nom_sci, b.auteur, NULL FROM isfan_v2013 b;
31 
 
 - 
 
32 
 
 - 
 
33 
-- INSERT INTO `cel_references` (`referentiel`, `num_nom`, `num_nom_retenu`, `nom_sci`, `auteur`, `nom_commun`) \
 - 
 
34 
--        SELECT "bdtfx", b.num_nom, b.num_nom_retenu, b.nom_sci, b.auteur, n.nom_vernaculaire, MAX(n.num_statut)	FROM bdtfx_v1_01 b LEFT JOIN nvjfl_v2007 n	ON (b.num_taxonomique = n.num_taxon AND n.code_langue = 'fra' )	GROUP BY b.num_nom \
 - 
 
35 
--        UNION \
 - 
 
- 
 
 44 
*/
- 
 
 45 
 
- 
 
 46 
 
- 
 
 47 
/*
- 
 
 48 
Détermination des nom vernaculaires meilleurs et uniques:
- 
 
 49 
 
- 
 
 50 
way 1:
- 
 
 51 
-- SELECT n.num_taxon, n.nom_vernaculaire, n.num_statut, n2.num_statut FROM nvjfl_v2007 n LEFT JOIN nvjfl_v2007 n2 ON (n.num_taxon = n2.num_taxon) WHERE n.num_taxon < 32 AND n.code_langue = 'fra' GROUP BY n.num_taxon, n.num_statut HAVING n.num_statut = MAX(n2.num_statut) LIMIT 100;
- 
 
 52 
-- 12311
36 
--        SELECT "bdtxa", b.num_nom, b.num_nom_retenu, b.nom_sci, b.auteur, n.nom_vernaculaire, NULL				FROM bdtxa_v1_00 b LEFT JOIN nva_v2013_06 n	ON (b.num_tax = n.num_taxon AND n.code_langue = 'fra' )			GROUP BY b.num_nom;
 - 
 
37 
-- SELECT "isfan", b.num_nom, b.num_nom_retenu, b.nom_sci, b.auteur, NULL FROM isfan_v2013 b;
 53 
-- # distinct=
38 
 
 54 
 
39 
 
 - 
 
40 
 
 55 
way 2:
41 
 
 56 
-- SELECT n.num_taxon, n.nom_vernaculaire FROM nvjfl_v2007 n INNER JOIN nvjfl_v2007 n2 ON (n.num_taxon = n2.num_taxon AND n.code_langue = n2.code_langue AND n.num_statut > n2.num_statut) WHERE n.code_langue = 'fra' GROUP BY n.num_taxon;
- 
 
 57 
-- 2680
- 
 
 58 
 
- 
 
 59 
way 2":
42 
-- déterminé à partir de
 60 
-- SELECT n.num_taxon, n.nom_vernaculaire FROM nvjfl_v2007 n LEFT JOIN nvjfl_v2007 n2 ON (n.num_taxon = n2.num_taxon AND n.code_langue = n2.code_langue AND n.num_statut > n2.num_statut) WHERE n.code_langue = 'fra' AND n2.num_statut IS NOT NULL GROUP BY num_taxon;
- 
 
 61 
-- 2680, Mais problème ensuite: SELECT n.* from cel_references NATURAL JOIN nvjfl_v2007 n WHERE `nom_commun` = '' AND n.code_langue = 'fra';
- 
 
 62 
 
- 
 
 63 
 
- 
 
 64 
Note: 16146 nom communs français distincts, 12312 num_taxon fr, aucun num_statut NULL en français
- 
 
 65 
*/
- 
 
 66 
 
43 
-- SELECT n.num_taxon, n.nom_vernaculaire, n.num_statut, n2.num_statut FROM nvjfl_v2007 n LEFT JOIN nvjfl_v2007 n2 ON (n.num_taxon = n2.num_taxon) WHERE n.num_taxon < 32 AND n.code_langue = 'fra' GROUP BY n.num_taxon, n.num_statut; -- HAVING n.num_statut = MAX(n2.num_statut) LIMIT 100;
 67 
 
44 
DROP TEMPORARY TABLE IF EXISTS `T_nvjfl_v2007`;
 68 
DROP TEMPORARY TABLE IF EXISTS `T_nvjfl_v2007`, `T_nva_v2013_06`;
45 
CREATE TEMPORARY TABLE T_nvjfl_v2007 ( INDEX(`num_taxon`) ) AS \
 69 
 
46 
       ( SELECT n.num_taxon, n.nom_vernaculaire FROM nvjfl_v2007 n WHERE n.code_langue = 'fra' GROUP BY n.num_taxon, n.num_statut HAVING n.num_statut = MAX(n.num_statut) );
 70 
CREATE TEMPORARY TABLE T_nvjfl_v2007 ( INDEX(`num_taxon`) ) AS \
47 
 
 71 
       -- ( SELECT n.num_taxon, n.nom_vernaculaire FROM nvjfl_v2007 n WHERE n.code_langue = 'fra' GROUP BY n.num_taxon, n.num_statut HAVING n.num_statut = MAX(n.num_statut) );
48 
 
 72 
       ( SELECT n.num_taxon, n.nom_vernaculaire, n.num_statut as void, MAX(n.num_statut) as void2 FROM nvjfl_v2007 n WHERE n.code_langue = 'fra' GROUP BY n.num_taxon HAVING n.num_statut = MAX(n.num_statut) );
- 
 
 73 
 
49 
-- uniquement pour la primary key, autrement le LEFT JOIN suivant est trop long
 74 
-- table temporaire uniquement parce qu'il manque un index-key, autrement le LEFT JOIN ci-dessous est bien trop long
50 
DROP TEMPORARY TABLE IF EXISTS `T_nva_v2013_06`;
 75 
CREATE TEMPORARY TABLE T_nva_v2013_06 ( INDEX(`num_taxon`) ) AS \
51 
CREATE TEMPORARY TABLE T_nva_v2013_06 ( INDEX(`num_taxon`) ) AS \
 76 
       ( SELECT n.num_taxon, n.nom_vernaculaire FROM nva_v2013_06 n WHERE n.code_langue = 'fra' /* DB pb */ AND n.num_taxon IS NOT NULL /* /DB pb */ GROUP BY n.num_nom); -- aggrégat arbitraire car pas de num_statut
52 
       ( SELECT n.num_taxon, n.nom_vernaculaire FROM nva_v2013_06 n WHERE n.code_langue = 'fra' GROUP BY n.num_nom); -- aggrégat arbitraire car pas de num_statut
 77 
 
53 
 
 78 
 
54 
 
 79 
INSERT INTO `cel_references` (`referentiel`, `num_nom`, `num_nom_retenu`, `num_taxon`, `nom_sci`, `auteur`, `nom_commun`) \
55 
INSERT INTO `cel_references` (`referentiel`, `num_nom`, `num_nom_retenu`, `nom_sci`, `auteur`, `nom_commun`) \
 80 
       SELECT "bdtfx", b.num_nom, b.num_nom_retenu, b.num_taxonomique, b.nom_sci, b.auteur, n.nom_vernaculaire	FROM bdtfx_v1_01 b LEFT JOIN T_nvjfl_v2007 n ON (b.num_taxonomique = n.num_taxon ) \
56 
       SELECT "bdtfx", b.num_nom, b.num_nom_retenu, b.nom_sci, b.auteur, n.nom_vernaculaire	FROM bdtfx_v1_01 b LEFT JOIN T_nvjfl_v2007 n ON (b.num_taxonomique = n.num_taxon ) \
 81 
       UNION \
57 
       UNION \
 82 
       SELECT "bdtxa", b.num_nom, b.num_nom_retenu, b.num_tax, b.nom_sci, b.auteur, n.nom_vernaculaire FROM bdtxa_v1_00 b LEFT JOIN T_nva_v2013_06 n ON (b.num_tax = n.num_taxon);
58 
       SELECT "bdtxa", b.num_nom, b.num_nom_retenu, b.nom_sci, b.auteur, n.nom_vernaculaire FROM bdtxa_v1_00 b LEFT JOIN T_nva_v2013_06 n ON (b.num_tax = n.num_taxon);
 83 
 
59 
DROP TEMPORARY TABLE T_nvjfl_v2007;
 84 
DROP TEMPORARY TABLE IF EXISTS `T_nvjfl_v2007`, `T_nva_v2013_06`;