WebSVN – eFlore/Projets.eflore-projets – Diff – /trunk/scripts/modules/coste/Index.php

 <?php
 class Index {
 	const DOSSIER_V0 = '../../../donnees/coste/0.00/';
 	const DOSSIER_V2 = '../../../donnees/coste/2.00/';
 	private $conteneur = null;
 	private $outils = null;
 	private $messages = null;
+	private $generateur = null;
 	private $dossierBase = '';
 	private $spIndex = array();
 	private $supraSpIndex = array();
+	private $imgIndex = array();
 	private $indexFinal = array();
 	private $tableauParDefaut = array();
 	private $nbreTaxonInf = array();
 	private $enteteFinal = array(
 		'num_nom',
 		'num_nom_retenu',
 		'num_tax_sup',
 		'rang',
 		'nom_sci',
+		'nom_supra_generique',
+		'genre',
+		'epithete_infra_generique',
+		'epithete_sp',
+		'type_epithete',
+		'epithete_infra_sp',
+		'cultivar_groupe',
+		'cultivar',
+		'nom_commercial',
 		'auteur',
-		'nom_addendum',
 		'annee',
 		'biblio_origine',
+		'notes',
+		'nom_addendum',
 		'nom_francais',
 		'nom_coste',
 		'auteur_coste',
 		'biblio_coste',
 		'num_nom_coste',
 		'num_nom_retenu_coste',
 		'num_tax_sup_coste',
 		'synonymie_coste',
 		'tome',
 		'page',
 		'nbre_taxons',
-		'bdnff_nn',
+		'flore_bdtfx_nn',
-		'bdnff_nt',
+		'flore_bdtfx_nt',
 		'image',
+		'image_auteur',
 		'page_wiki_dsc',
-		'page_wiki_cle');
+		'page_wiki_cle',
+		'nom_sci_html');
 	public function __construct(Conteneur $conteneur) {
 		mb_internal_encoding('UTF-8');
 		setlocale(LC_ALL, 'fr_FR.UTF-8');
 		$this->conteneur = $conteneur;
 		$this->outils = $conteneur->getOutils();
 		$this->messages = $conteneur->getMessages();
+		$this->generateur = $conteneur->getGenerateurNomSciHtml();
 		$this->dossierBase = dirname(__FILE__).'/';
+	}
 	public function fusionnerIndex() {
 		$this->chargerIndexSp();
 		$this->chargerIndexSupraSp();
 		$this->initialiserTableauLigneIndexFinal();
 		$this->creerIndexFinal();
 		$this->ajouterChampsDansIndexFinal();
+		$this->ajouteurAuteurImage();
+		$this->decomposerNomSci();
+		$this->ajouteurNomSciHtml();
 		$this->creerFichierCsvIndexFinal();
+	}
 	private function chargerIndexSp() {
 		$spIndexFichier = $this->dossierBase.self::DOSSIER_V0.'index_general_sp.tsv';
 		$index = $this->outils->transformerTxtTsvEnTableau($spIndexFichier);
 		$index = $this->reindexerParNumNomCoste($index);
 		foreach ($index as $numNomCoste => $infos) {
 			$numTaxSup = '';
 			if ($infos['num_nom_coste'] == $infos['num_nom_retenu_coste']) {
 				$numTaxSup = $infos['num_tax_sup_coste'];
 			} else {
 				$infosNomRetenu = $index[$infos['num_nom_retenu_coste']];
 				$numTaxSup = $infosNomRetenu['num_tax_sup_coste'];
+			}
 			$this->spIndex[$numTaxSup][] = $infos;
+		}
+	}
 	private function reindexerParNumNomCoste($index) {
 		$nouvelIndex = array();
 		foreach ($index as $infos) {
 			$nouvelIndex[$infos['num_nom_coste']] = $infos;
+		}
 		return $nouvelIndex;
+	}
 	private function chargerIndexSupraSp() {
 		$infraSpIndexFichier = $this->dossierBase.self::DOSSIER_V0.'index_general.tsv';
 		$this->supraSpIndex = $this->outils->transformerTxtTsvEnTableau($infraSpIndexFichier);
 		foreach ($this->supraSpIndex as $cle => $infos) {
 			$this->supraSpIndex[$cle]['num_nom_retenu_coste'] = $infos['num_nom_coste'];
+		}
+	}
 	private function initialiserTableauLigneIndexFinal() {
 		$this->tableauParDefaut = array();
 		foreach ($this->enteteFinal as $cle) {
 			$this->tableauParDefaut[$cle] = '';
+		}
+	}
 	private function creerIndexFinal() {
 		foreach ($this->supraSpIndex as $infos) {
 			$this->ajouterDansIndexFinal($infos);
 			if (preg_match('/^G[0-9]+$/', $infos['num_nom_coste'])) {
 				foreach ($this->spIndex[$infos['num_nom_coste']] as $infosSp) {
 					$this->ajouterDansIndexFinal($infosSp);
+				}
+			}
+		}
+	}
 	private function ajouterDansIndexFinal($infos) {
 		$infos = array_merge($this->tableauParDefaut, $infos);
 		$infos['num_nom'] = (count($this->indexFinal) + 1);
 		$this->indexFinal[$infos['num_nom_coste']] = $infos;
+	}
 	private function ajouterChampsDansIndexFinal() {
 		$this->genererNbreTaxons();
 		foreach ($this->indexFinal as $nnc => $infos) {
 			if ($infos['num_nom_coste'] == $infos['num_nom_retenu_coste']) {
 				$infos['num_nom_retenu'] = $infos['num_nom'];
 				if ($nnc != 'R') {
 					$nomSuperieur = $this->indexFinal[$infos['num_tax_sup_coste']];
 					$infos['num_tax_sup'] = $nomSuperieur['num_nom'];
+				}
 				$nomRetenu = $infos;
 			} else {
 				$nomRetenu = $this->indexFinal[$infos['num_nom_retenu_coste']];
 				$infos['num_nom_retenu'] = $nomRetenu['num_nom'];
+			}
 			$infos['image'] = $this->obtenirNomFichierImg($nomRetenu);
 			$infos['nbre_taxons'] = $this->obtenirNbreTaxon($infos);
 			$nomRetenu['nbre_taxons'] = $infos['nbre_taxons'];
 			$infos['page_wiki_dsc'] = $this->genererPageWikiDsc($nomRetenu);
 			$infos['page_wiki_cle'] = $this->genererPageWikiCle($nomRetenu);
 			$this->indexFinal[$nnc] = $infos;
+		}
+	}
 	private function genererNbreTaxons() {
 		foreach ($this->indexFinal as $infos) {
 			if ($infos['num_tax_sup_coste'] != '') {
 				if (isset($this->nbreTaxonInf[$infos['num_tax_sup_coste']])) {
 					$this->nbreTaxonInf[$infos['num_tax_sup_coste']] += 1;
 				} else {
 					$this->nbreTaxonInf[$infos['num_tax_sup_coste']] = 1;
+				}
+			}
+		}
+	}
 	private function genererPageWikiDsc($infos) {
 		$prefixe = $this->genererPrefixePage($infos);
+		if ($infos['rang'] == '180') {
+			$nomSci = str_replace(' ', '', ucwords(strtolower($infos['nom_coste'])));
+		} else {
-		$nomSci = str_replace(' ', '', ucwords(strtolower($infos['nom_sci'])));
+			$nomSci = str_replace(' ', '', ucwords(strtolower($infos['nom_sci'])));
+		}
 		$pageWiki = $prefixe.$nomSci;
 		return $pageWiki;
+	}
 	private function genererPageWikiCle($infos) {
 		$pageWiki = '';
 		if ($infos['nbre_taxons'] > 1) {
 			$prefixe = $this->genererPrefixePage($infos);
-			if ($infos['rang'] == '180') {
+			if ($infos['rang'] == '20') {
+				$pageWiki = $prefixe.'TabClaEtEmb';
+			} elseif ($infos['rang'] == '40' && ($infos['num_nom_coste'] == 'E2' || $infos['num_nom_coste'] == 'E3')) {
+				$pageWiki = $prefixe.'TabFam';
+			} else if ($infos['rang'] == '80') {
+				$pageWiki = $prefixe.'TabFam';
+			} else if ($infos['rang'] == '180') {
 				$pageWiki = $prefixe.'TabGen';
 			} else if ($infos['rang'] == '220') {
 				$pageWiki = $prefixe.'TabSp';
+			}
+		}
 		return $pageWiki;
+	}
 	private function genererPrefixePage($infos) {
 		$prefixe = '';
 		$num = preg_replace('/^[a-z]*([0-9.]+)$/i', '$1', $infos['num_nom_coste']);
 		if (preg_match('/^([0-9]+)[.][0-9]+$/i', $infos['num_nom_coste'], $match)) {
 			$num = sprintf('%04s', $match[1]);
+		} else if ($infos['rang'] == 20 ) {
+			$num = '';
 		} else if ($infos['rang'] < 80 ) {
 			$num = sprintf('%02s', $num);
 		} else if ($infos['rang'] < 290 ) {
 			$num = sprintf('%03s', $num);
 		} else {
 			$num = sprintf('%04s', $num);
+		}
 		$rangsTxt = array('20' => 'Reg', '40' => 'Emb', '80' => 'Cla', '180' => 'Fam', '220' => 'Gen', '290' => 'Esp', '340' => 'Var');
 		$rang = $rangsTxt[$infos['rang']];
 		$prefixe = $rang.$num;
 		return $prefixe;
+	}
 	private function obtenirNbreTaxon($infos) {
 		$nbre = '';
-		if ($infos['rang'] == 180 || $infos['rang'] == 220) {
-			if (isset($this->nbreTaxonInf[$infos['num_nom_coste']])) {
+		if (isset($this->nbreTaxonInf[$infos['num_nom_coste']])) {
-				$nbre = $this->nbreTaxonInf[$infos['num_nom_coste']];
+			$nbre = $this->nbreTaxonInf[$infos['num_nom_coste']];
-			}
+		}
 		return $nbre;
+	}
 	private function obtenirNomFichierImg($infos) {
 		$img = '';
 		if ($infos['rang'] == '290' && ($infos['num_nom'] == $infos['num_nom_retenu'])) {
 			$img = $infos['num_nom_coste'].'.png';
+		}
 		return $img;
+	}
+	private function ajouteurAuteurImage() {
+		$this->chargerAuteurImg();
+		foreach ($this->indexFinal as $nnc => $infos) {
+			$infos['image_auteur'] = $this->imgIndex[$infos['image']];
+			$this->indexFinal[$nnc] = $infos;
+		}
+	}
+	private function chargerAuteurImg() {
+		$imgIndexFichier = $this->dossierBase.self::DOSSIER_V0.'coste_images_auteur_correspondance_bdnff.tsv';
+		$index = $this->outils->transformerTxtTsvEnTableau($imgIndexFichier);
+		foreach ($index as $infos) {
+			$id = $infos['id_image'];
+			$this->imgIndex[$id] = $infos['auteur'];
+		}
+	}
+	private function decomposerNomSci() {
+		$majuscule = "[ÆŒA-Z]";
+		$epithete = "[æœïa-z-]+";
+		foreach ($this->indexFinal as $nnc => $infos) {
+			$id = $infos['num_nom_coste'];
+			$nomSci = $infos['nom_sci'];
+			$rang = $infos['rang'];
+			if ($rang < 220) {
+				$infos['nom_supra_generique'] = $nomSci;
+			} else if ($rang == 220) {
+				$infos['genre'] = $nomSci;
+			} else if ($rang == 290) {
+				if (preg_match("/^($majuscule$epithete) ($epithete)$/", $nomSci, $match)) {
+					$infos['genre'] = $match[1];
+					$infos['epithete_sp'] = $match[2];
+				} else {
+					$this->messages->traiterErreur("Le nom $nomSci ($id) de rang $rang n'est pas standard.");
+				}
+			} else if ($rang == 340) {
+				if (preg_match("/^($majuscule$epithete) ($epithete) (var[.]) ($epithete)$/", $nomSci, $match)) {
+					$infos['genre'] = $match[1];
+					$infos['epithete_sp'] = $match[2];
+					$infos['type_epithete'] = $match[3];
+					$infos['epithete_infra_sp'] = $match[4];
+				} else {
+					$this->messages->traiterErreur("Le nom $nomSci ($id) de rang $rang n'est pas standard.");
+				}
+			}
+			$this->indexFinal[$nnc] = $infos;
+			$this->messages->afficherAvancement("Décomposition des noms scientifiques en cours");
+		}
+		echo "\n";
+	}
+	private function ajouteurNomSciHtml() {
+		foreach ($this->indexFinal as $nnc => $infos) {
+			$this->indexFinal[$nnc]['nom_sci_html'] = $this->generateur->genererNomSciHtml($infos);
+			$this->messages->afficherAvancement("Création des noms scientifiques HTML en cours");
+		}
+		echo "\n";
+	}
 	private function creerFichierCsvIndexFinal() {
 		$lignes = array();
 		array_unshift($this->indexFinal, $this->enteteFinal);
 		foreach ($this->indexFinal as $infos) {
 			$lignes[] = implode("\t", $infos);
+		}
 		$txt = '';
 		$txt = implode("\n", $lignes);
 		$fichierTsvIndexFinal = $this->dossierBase.self::DOSSIER_V2.'coste_v2_00.tsv';
 		file_put_contents($fichierTsvIndexFinal, $txt);
+	}
+}
 ?>

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(root)/trunk/scripts/modules/coste/Index.php @ 478 – Rev 478 → 487