WebSVN – eFlore/Projets.eflore-projets – Diff – /trunk/scripts/modules/coste/Index.php


<?php
class Index {
 
	const DOSSIER_V0 = '../../../donnees/coste/0.00/';
	const DOSSIER_V2 = '../../../donnees/coste/2.00/';
 
	private $conteneur = null;
	private $outils = null;
	private $messages = null;
	private $generateur = null;
	private $dossierBase = '';
	private $spIndex = array();
	private $supraSpIndex = array();
	private $imgIndex = array();
	private $indexFinal = array();
	private $tableauParDefaut = array();
	private $nbreTaxonInf = array();
	private $enteteFinal = array(
		'num_nom',
		'num_nom_retenu',
		'num_tax_sup',
		'rang',
		'nom_sci',
		'nom_supra_generique',
		'genre',
		'epithete_infra_generique',
		'epithete_sp',
		'type_epithete',
		'epithete_infra_sp',
		'cultivar_groupe',
		'cultivar',
		'nom_commercial',
		'auteur',
		'annee',
		'biblio_origine',
		'notes',
		'nom_addendum',
		'nom_francais',
		'nom_coste',
		'auteur_coste',
		'biblio_coste',
		'num_nom_coste',
		'num_nom_retenu_coste',
		'num_tax_sup_coste',
		'synonymie_coste',
		'tome',
		'page',
		'nbre_taxons',
		'flore_bdtfx_nn',
		'flore_bdtfx_nt',
		'image',
		'image_auteur',
		'page_wiki_dsc',
		'page_wiki_cle',
		'nom_sci_html');
 
	public function __construct(Conteneur $conteneur) {
		mb_internal_encoding('UTF-8');
		setlocale(LC_ALL, 'fr_FR.UTF-8');
		$this->conteneur = $conteneur;
		$this->outils = $conteneur->getOutils();
		$this->messages = $conteneur->getMessages();
		$this->generateur = $conteneur->getGenerateurNomSciHtml();
		$this->dossierBase = dirname(__FILE__).'/';
	}
 
	public function fusionnerIndex() {
		$this->chargerIndexSp();
		$this->chargerIndexSupraSp();
		$this->initialiserTableauLigneIndexFinal();
		$this->creerIndexFinal();
		$this->ajouterChampsDansIndexFinal();
		$this->ajouteurAuteurImage();
		$this->decomposerNomSci();
		$this->ajouteurNomSciHtml();
		$this->ajouterCorrections();
		$this->creerFichierCsvIndexFinal();
	}
 
	private function chargerIndexSp() {
		$spIndexFichier = $this->dossierBase.self::DOSSIER_V0.'index_general_sp.tsv';
		$index = $this->outils->transformerTxtTsvEnTableau($spIndexFichier);
		$index = $this->reindexerParNumNomCoste($index);
		foreach ($index as $numNomCoste => $infos) {
			$numTaxSup = '';
			if ($infos['num_nom_coste'] == $infos['num_nom_retenu_coste']) {
				$numTaxSup = $infos['num_tax_sup_coste'];
			} else {
				$infosNomRetenu = $index[$infos['num_nom_retenu_coste']];
				$numTaxSup = $infosNomRetenu['num_tax_sup_coste'];
			}
			$this->spIndex[$numTaxSup][] = $infos;
		}
	}
 
	private function reindexerParNumNomCoste($index) {
		$nouvelIndex = array();
		foreach ($index as $infos) {
			$nouvelIndex[$infos['num_nom_coste']] = $infos;
		}
		return $nouvelIndex;
	}
 
	private function chargerIndexSupraSp() {
		$infraSpIndexFichier = $this->dossierBase.self::DOSSIER_V0.'index_general.tsv';
		$this->supraSpIndex = $this->outils->transformerTxtTsvEnTableau($infraSpIndexFichier);
		foreach ($this->supraSpIndex as $cle => $infos) {
			$this->supraSpIndex[$cle]['num_nom_retenu_coste'] = $infos['num_nom_coste'];
		}
	}
 
	private function initialiserTableauLigneIndexFinal() {
		$this->tableauParDefaut = array();
		foreach ($this->enteteFinal as $cle) {
			$this->tableauParDefaut[$cle] = '';
		}
	}
 
	private function creerIndexFinal() {
		foreach ($this->supraSpIndex as $infos) {
			$this->ajouterDansIndexFinal($infos);
			if (preg_match('/^G[0-9]+$/', $infos['num_nom_coste'])) {
				foreach ($this->spIndex[$infos['num_nom_coste']] as $infosSp) {
					$this->ajouterDansIndexFinal($infosSp);
				}
			}
		}
	}
 
	private function ajouterDansIndexFinal($infos) {
		$infos = array_merge($this->tableauParDefaut, $infos);
		$infos['num_nom'] = (count($this->indexFinal) + 1);
		$this->indexFinal[$infos['num_nom_coste']] = $infos;
	}
 
	private function ajouterChampsDansIndexFinal() {
		$this->genererNbreTaxons();
		foreach ($this->indexFinal as $nnc => $infos) {
			if ($infos['num_nom_coste'] == $infos['num_nom_retenu_coste']) {
				$infos['num_nom_retenu'] = $infos['num_nom'];
				if ($nnc != 'R') {
					$nomSuperieur = $this->indexFinal[$infos['num_tax_sup_coste']];
					$infos['num_tax_sup'] = $nomSuperieur['num_nom'];
				}
				$nomRetenu = $infos;
			} else {
				$nomRetenu = $this->indexFinal[$infos['num_nom_retenu_coste']];
				$infos['num_nom_retenu'] = $nomRetenu['num_nom'];
			}
			$infos['image'] = $this->obtenirNomFichierImg($nomRetenu);
			$infos['nbre_taxons'] = $this->obtenirNbreTaxon($infos);
			$nomRetenu['nbre_taxons'] = $infos['nbre_taxons'];
			$infos['page_wiki_dsc'] = $this->genererPageWikiDsc($nomRetenu);
			$infos['page_wiki_cle'] = $this->genererPageWikiCle($nomRetenu);
 
			$this->indexFinal[$nnc] = $infos;
		}
	}
 
	private function genererNbreTaxons() {
		foreach ($this->indexFinal as $infos) {
			if ($infos['num_tax_sup_coste'] != '') {
				if (isset($this->nbreTaxonInf[$infos['num_tax_sup_coste']])) {
					$this->nbreTaxonInf[$infos['num_tax_sup_coste']] += 1;
				} else {
					$this->nbreTaxonInf[$infos['num_tax_sup_coste']] = 1;
				}
			}
		}
	}
 
	private function genererPageWikiDsc($infos) {
		$prefixe = $this->genererPrefixePage($infos);
		if ($infos['rang'] == '180') {
			$nomSci = str_replace(' ', '', ucwords(strtolower($infos['nom_coste'])));
		} else {
			$nomSci = str_replace(' ', '', ucwords(strtolower($infos['nom_sci'])));
		}
		$pageWiki = $prefixe.$nomSci;
		return $pageWiki;
	}
 
	private function genererPageWikiCle($infos) {
		$pageWiki = '';
		if ($infos['nbre_taxons'] > 1) {
			$prefixe = $this->genererPrefixePage($infos);
			if ($infos['rang'] == '20') {
				$pageWiki = $prefixe.'TabClaEtEmb';
			} elseif ($infos['rang'] == '40' && ($infos['num_nom_coste'] == 'E2' || $infos['num_nom_coste'] == 'E3')) {
				$pageWiki = $prefixe.'TabFam';
			} else if ($infos['rang'] == '80') {
				$pageWiki = $prefixe.'TabFam';
			} else if ($infos['rang'] == '180') {
				$pageWiki = $prefixe.'TabGen';
			} else if ($infos['rang'] == '220') {
				$pageWiki = $prefixe.'TabSp';
			}
		}
		return $pageWiki;
	}
 
	private function genererPrefixePage($infos) {
		$prefixe = '';
		$num = preg_replace('/^[a-z]*([0-9.]+)$/i', '$1', $infos['num_nom_coste']);
		if (preg_match('/^([0-9]+)[.][0-9]+$/i', $infos['num_nom_coste'], $match)) {
			$num = sprintf('%04s', $match[1]);
		} else if ($infos['rang'] == 20 ) {
			$num = '';
		} else if ($infos['rang'] < 80 ) {
			$num = sprintf('%02s', $num);
		} else if ($infos['rang'] < 290 ) {
			$num = sprintf('%03s', $num);
		} else {
			$num = sprintf('%04s', $num);
		}
		$rangsTxt = array('20' => 'Reg', '40' => 'Emb', '80' => 'Cla', '180' => 'Fam', '220' => 'Gen', '290' => 'Esp', '340' => 'Var');
		$rang = $rangsTxt[$infos['rang']];
 
		$prefixe = $rang.$num;
		return $prefixe;
	}
 
	private function obtenirNbreTaxon($infos) {
		$nbre = '';
		if (isset($this->nbreTaxonInf[$infos['num_nom_coste']])) {
			$nbre = $this->nbreTaxonInf[$infos['num_nom_coste']];
		}
		return $nbre;
	}
 
	private function obtenirNomFichierImg($infos) {
		$img = '';
		if ($infos['rang'] == '290' && ($infos['num_nom'] == $infos['num_nom_retenu'])) {
			$img = $infos['num_nom_coste'].'.png';
		}
		return $img;
	}
 
	private function ajouteurAuteurImage() {
		$this->chargerAuteurImg();
		foreach ($this->indexFinal as $nnc => $infos) {
			$infos['image_auteur'] = $this->imgIndex[$infos['image']];
			$this->indexFinal[$nnc] = $infos;
		}
	}
 
	private function chargerAuteurImg() {
		$imgIndexFichier = $this->dossierBase.self::DOSSIER_V0.'coste_images_auteur_correspondance_bdnff.tsv';
		$index = $this->outils->transformerTxtTsvEnTableau($imgIndexFichier);
		foreach ($index as $infos) {
			$id = $infos['id_image'];
			$this->imgIndex[$id] = $infos['auteur'];
		}
	}
 
	private function decomposerNomSci() {
		$majuscule = "[ÆŒA-Z]";
		$epithete = "[æœïa-z-]+";
		foreach ($this->indexFinal as $nnc => $infos) {
			$id = $infos['num_nom_coste'];
			$nomSci = $infos['nom_sci'];
			$rang = $infos['rang'];
			if ($rang < 220) {
				$infos['nom_supra_generique'] = $nomSci;
			} else if ($rang == 220) {
				$infos['genre'] = $nomSci;
			} else if ($rang == 290) {
				if (preg_match("/^($majuscule$epithete) ($epithete)$/", $nomSci, $match)) {
					$infos['genre'] = $match[1];
					$infos['epithete_sp'] = $match[2];
				} else {
					$this->messages->traiterErreur("Le nom $nomSci ($id) de rang $rang n'est pas standard.");
				}
			} else if ($rang == 340) {
				if (preg_match("/^($majuscule$epithete) ($epithete) (var[.]) ($epithete)$/", $nomSci, $match)) {
					$infos['genre'] = $match[1];
					$infos['epithete_sp'] = $match[2];
					$infos['type_epithete'] = $match[3];
					$infos['epithete_infra_sp'] = $match[4];
				} else {
					$this->messages->traiterErreur("Le nom $nomSci ($id) de rang $rang n'est pas standard.");
				}
			}
 
			$this->indexFinal[$nnc] = $infos;
			$this->messages->afficherAvancement("Décomposition des noms scientifiques en cours");
		}
		echo "\n";
	}
 
	private function ajouteurNomSciHtml() {
		foreach ($this->indexFinal as $nnc => $infos) {
			$this->indexFinal[$nnc]['nom_sci_html'] = $this->generateur->genererNomSciHtml($infos);
			$this->messages->afficherAvancement("Création des noms scientifiques HTML en cours");
		}
		echo "\n";
	}
 
	private function ajouterCorrections() {
		$correctionsFichier = $this->dossierBase.self::DOSSIER_V2.'coste_v2_00_corrections.tsv';
		$corrections = $this->outils->transformerTxtTsvEnTableau($correctionsFichier);
		foreach ($corrections as $infos) {
			$nnc = $infos['num_nom_coste'];
			$infosACorriger = $this->indexFinal[$nnc];
			foreach ($corrections as $champ => $valeur) {
				$infosACorriger[$champ] = $valeur;
			}
			$this->indexFinal[$nnc] = $infosACorriger;
		}
	}
 
	private function creerFichierCsvIndexFinal() {
		$lignes = array();
		array_unshift($this->indexFinal, $this->enteteFinal);
		foreach ($this->indexFinal as $infos) {
			$lignes[] = implode("\t", $infos);
		}
 
		$txt = '';
		$txt = implode("\n", $lignes);
 
		$fichierTsvIndexFinal = $this->dossierBase.self::DOSSIER_V2.'coste_v2_00.tsv';
		file_put_contents($fichierTsvIndexFinal, $txt);
	}
}
?>

Subversion Repositories eFlore/Projets.eflore-projets

(root)/trunk/scripts/modules/coste/Index.php – Rev 487 → 493

Rev 487		Rev 493
1	`<?php`	1	`<?php`
2	`class Index {`	2	`class Index {`
3		3
4	`const DOSSIER_V0 = '../../../donnees/coste/0.00/';`	4	`const DOSSIER_V0 = '../../../donnees/coste/0.00/';`
5	`const DOSSIER_V2 = '../../../donnees/coste/2.00/';`	5	`const DOSSIER_V2 = '../../../donnees/coste/2.00/';`
6		6
7	`private $conteneur = null;`	7	`private $conteneur = null;`
8	`private $outils = null;`	8	`private $outils = null;`
9	`private $messages = null;`	9	`private $messages = null;`
10	`private $generateur = null;`	10	`private $generateur = null;`
11	`private $dossierBase = '';`	11	`private $dossierBase = '';`
12	`private $spIndex = array();`	12	`private $spIndex = array();`
13	`private $supraSpIndex = array();`	13	`private $supraSpIndex = array();`
14	`private $imgIndex = array();`	14	`private $imgIndex = array();`
15	`private $indexFinal = array();`	15	`private $indexFinal = array();`
16	`private $tableauParDefaut = array();`	16	`private $tableauParDefaut = array();`
17	`private $nbreTaxonInf = array();`	17	`private $nbreTaxonInf = array();`
18	`private $enteteFinal = array(`	18	`private $enteteFinal = array(`
19	`'num_nom',`	19	`'num_nom',`
20	`'num_nom_retenu',`	20	`'num_nom_retenu',`
21	`'num_tax_sup',`	21	`'num_tax_sup',`
22	`'rang',`	22	`'rang',`
23	`'nom_sci',`	23	`'nom_sci',`
24	`'nom_supra_generique',`	24	`'nom_supra_generique',`
25	`'genre',`	25	`'genre',`
26	`'epithete_infra_generique',`	26	`'epithete_infra_generique',`
27	`'epithete_sp',`	27	`'epithete_sp',`
28	`'type_epithete',`	28	`'type_epithete',`
29	`'epithete_infra_sp',`	29	`'epithete_infra_sp',`
30	`'cultivar_groupe',`	30	`'cultivar_groupe',`
31	`'cultivar',`	31	`'cultivar',`
32	`'nom_commercial',`	32	`'nom_commercial',`
33	`'auteur',`	33	`'auteur',`
34	`'annee',`	34	`'annee',`
35	`'biblio_origine',`	35	`'biblio_origine',`
36	`'notes',`	36	`'notes',`
37	`'nom_addendum',`	37	`'nom_addendum',`
38	`'nom_francais',`	38	`'nom_francais',`
39	`'nom_coste',`	39	`'nom_coste',`
40	`'auteur_coste',`	40	`'auteur_coste',`