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Rev 295 Rev 327
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<?php
1
<?php
2
 
2
 
3
// declare(encoding='UTF-8');// ou ISO-8859-15
3
// declare(encoding='UTF-8');// ou ISO-8859-15
4
/**
4
/**
5
* Description :
5
* Description :
6
* Classe Taxons.php permettant de fournir des informations sur les noms scientifiques retenu.
6
* Classe Taxons.php permettant de fournir des informations sur les noms scientifiques retenu.
7
* Si l'url finit par /taxons on retourne une liste de noms latin et leurs identifiants (seulement les 100 premeiers noms par défaut).
7
* Si l'url finit par /taxons on retourne une liste de noms latin et leurs identifiants (seulement les 100 premeiers noms par défaut).
8
* L'url peut contenir des paramètres optionnels passés après le ? : /taxons?param1=val1&param2=val2&...
8
* L'url peut contenir des paramètres optionnels passés après le ? : /taxons?param1=val1&param2=val2&...
9
* 
9
* 
10
* Les paramètres de requête disponibles sont : masque, recherche, rang, distinct, retour.format, nl.format, 
10
* Les paramètres de requête disponibles sont : masque, recherche, rang, distinct, retour.format, nl.format, 
11
* nl.structure, navigation.depart et navigation.limite.
11
* nl.structure, navigation.depart et navigation.limite.
12
* 
12
* 
13
* Encodage en entrée : utf8
13
* Encodage en entrée : utf8
14
* Encodage en sortie : utf8
14
* Encodage en sortie : utf8
15
* @package framework-v3
15
* @package framework-v3
16
* @author Jennifer Dhé <jennifer.dhe@tela-botanica.org>
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* @author Jennifer Dhé <jennifer.dhe@tela-botanica.org>
17
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
17
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
18
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
18
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
19
* @version 1.0
19
* @version 1.0
20
* @copyright 1999-${year} Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
20
* @copyright 1999-${year} Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
21
*/
21
*/
22
 
22
 
23
 
23
 
24
class Taxons extends CommunNomsTaxons {
24
class Taxons extends CommunNomsTaxons {
25
	
25
	
26
	/** Permet de stocker la requete formulée taxons | taxons/#id | taxons/#id/#champ+#champ ...*/
26
	/** Permet de stocker la requete formulée taxons | taxons/#id | taxons/#id/#champ+#champ ...*/
27
	protected $format_reponse	 = 'taxons';
27
	protected $format_reponse	 = 'taxons';
28
	protected $service 			 = 'taxons';
28
	protected $service 			 = 'taxons';
29
	protected $requete_champ 	 = 'num_nom, nom_sci, num_nom_retenu, num_taxonomique ';
29
	protected $requete_champ 	 = 'num_nom, nom_sci, num_nom_retenu, num_taxonomique ';
30
	protected $requete_condition = null; 
30
	protected $requete_condition = null; 
31
	protected $requete_group_by  = ' ';
31
	protected $requete_group_by  = ' ';
32
	/** Permet de stocker les limite de la requete SQL (par défaut seul les 100 premiers résultats seront retournés).*/
32
	/** Permet de stocker les limite de la requete SQL (par défaut seul les 100 premiers résultats seront retournés).*/
33
	protected $limite_requete 	 = array('depart' => 0, 'limite' => 100);
33
	protected $limite_requete 	 = array('depart' => 0, 'limite' => 100);
34
	protected $num_nom_taxon; //Stocke le num_nom du nom retenu du num_nom recherché 
34
	protected $num_nom_taxon; //Stocke le num_nom du nom retenu du num_nom recherché 
35
	protected $presence_num_tax = true;
35
	protected $presence_num_tax = true;
36
	
36
	
37
	
37
	
38
	public function consulter($ressources, $parametres) {
38
	public function consulter($ressources, $parametres) {
39
		return parent::consulter($ressources, $parametres);
39
		return parent::consulter($ressources, $parametres);
40
	}
40
	}
41
	
41
	
42
	public function traiterParametresSpecifiques() {
42
	public function traiterParametresSpecifiques() {
43
		$this->requete_condition[] = 'num_nom = num_nom_retenu';
43
		$this->requete_condition[] = 'num_nom = num_nom_retenu';
44
		
44
		
45
		foreach ($this->parametres as $param => $val) {
45
		foreach ($this->parametres as $param => $val) {
46
			switch ($param) {
46
			switch ($param) {
47
				case 'masque' :
47
				case 'masque' :
48
					$this->ajouterFiltreMasque('nom_sci', $val);										 
48
					$this->ajouterFiltreMasque('nom_sci', $val);										 
49
					break;
49
					break;
50
				case 'masque.nt' :
50
				case 'masque.nt' :
51
					$this->requete_condition[] = "num_taxonomique IN ($val)";		
51
					$this->requete_condition[] = "num_taxonomique IN ($val)";		
52
					$this->masque[] = "num_tax=$val";						 
52
					$this->masque[] = "num_tax=$val";						 
53
					break;
53
					break;
54
				case 'masque.rg':
54
				case 'masque.rg':
55
					$this->requete_condition[] = 'rang = '.$this->getBdd()->proteger($val); 
55
					$this->requete_condition[] = 'rang = '.$this->getBdd()->proteger($val); 
56
					$this->masque[] = "rang=$val";					
56
					$this->masque[] = "rang=$val";					
57
					break;
57
					break;
58
			}
58
			}
59
		}
59
		}
60
	}
60
	}
61
	
61
	
62
//------------------------------------------Fonction ressources---------------------------------------------------------------------
62
//------------------------------------------Fonction ressources---------------------------------------------------------------------
63
	
63
	
64
	public function gererNumTax() {
64
	public function gererNumTax() {
65
		if (!in_array('num_taxonomique', $this->champs_table)) {
65
		if (!in_array('num_taxonomique', $this->champs_table)) {
66
			$this->presence_num_tax = false;
66
			$this->presence_num_tax = false;
67
			$this->requete_champ = str_replace(', num_taxonomique ', '', $this->requete_champ);
67
			$this->requete_champ = str_replace(', num_taxonomique ', '', $this->requete_champ);
68
		} else {
68
		} else {
69
			$this->presence_num_tax = true;
69
			$this->presence_num_tax = true;
70
		}
70
		}
71
	}
71
	}
72
		
72
		
73
	public function traiterRessourcesIdentifiant() {
73
	public function traiterRessourcesIdentifiant() {
74
		$this->format_reponse = 'taxons/id';
74
		$this->format_reponse = 'taxons/id';
75
		$this->traiterRessourceNtId();
75
		$this->traiterRessourceNtId();
76
		$this->num_nom_taxon =  $this->recupererNumNomTaxon(); //on recupere le taxon correspondant au num_nom recherché
76
		$this->num_nom_taxon =  $this->recupererNumNomTaxon(); //on recupere le taxon correspondant au num_nom recherché
77
		if ($this->entete_http == '') {
77
		if ($this->entete_http == '') {
78
			$this->requete_condition[0] = 'num_nom = '.$this->getBdd()->proteger($this->num_nom_taxon);
78
			$this->requete_condition[0] = 'num_nom = '.$this->getBdd()->proteger($this->num_nom_taxon);
79
			if (isset($this->ressources[1]) && !empty($this->ressources[1])) {
79
			if (isset($this->ressources[1]) && !empty($this->ressources[1])) {
80
				//---------------- requete de type taxons/#id/#champ+#champ--------------------------------------
80
				//---------------- requete de type taxons/#id/#champ+#champ--------------------------------------
81
				if ($this->ressources[1] != 'relations') { // SELECT *, nom_sci FROM bftfx_v2_00 WHERE num_nom = X;
81
				if ($this->ressources[1] != 'relations') { // SELECT *, nom_sci FROM bftfx_v2_00 WHERE num_nom = X;
82
					$this->requete_champ = ' *, nom_sci ';
82
					$this->requete_champ = ' *, nom_sci ';
83
					$this->format_reponse .= '/champ';
83
					$this->format_reponse .= '/champ';
84
				//---------------- requete de type taxons/#id/relations/#relation--------------------------------
84
				//---------------- requete de type taxons/#id/relations/#relation--------------------------------
85
				} elseif ($this->ressources[1] == 'relations') { 
85
				} elseif ($this->ressources[1] == 'relations') { 
86
					$this->traiterRessourceIdRelations();
86
					$this->traiterRessourceIdRelations();
87
				} else {
87
				} else {
88
					$e = 'Erreur dans votre requête </br> Ressources disponibles : <br/>
88
					$e = 'Erreur dans votre requête </br> Ressources disponibles : <br/>
89
						 <li> #id/relations </li>  <li> #id/#champ+#champ </li> <li> #id/relations </li>  
89
						 <li> #id/relations </li>  <li> #id/#champ+#champ </li> <li> #id/relations </li>  
90
						 <li> #id/relations/inferieurs </li> <li> #id/relations/superieurs </li>';
90
						 <li> #id/relations/inferieurs </li> <li> #id/relations/superieurs </li>';
91
					$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);		
91
					$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);		
92
				}		
92
				}		
93
			} else { //--------------- requete de type taxons/#id-----------------------------------------------------
93
			} else { //--------------- requete de type taxons/#id-----------------------------------------------------
94
				$this->requete_champ = ' *, nom_sci ';
94
				$this->requete_champ = ' *, nom_sci ';
95
			}
95
			}
96
		}
96
		}
97
	}
97
	}
98
	
98
	
99
	public function traiterRessourceNtId() {
99
	public function traiterRessourceNtId() {
100
		if (strrpos($this->ressources[0], 'nt:') !== false) {
100
		if (strrpos($this->ressources[0], 'nt:') !== false) {
101
			if ($this->presence_num_tax) {
101
			if ($this->presence_num_tax) {
102
				// SELECT num_nom FROM bdtfx_v2_00 WHERE num_nom = num_nom_retenu AND num_taxonomique = X;
102
				// SELECT num_nom FROM bdtfx_v2_00 WHERE num_nom = num_nom_retenu AND num_taxonomique = X;
103
				$this->requete_condition[0] = 'num_nom = num_nom_retenu AND num_taxonomique = '
103
				$this->requete_condition[0] = ' num_taxonomique = '
104
					.str_replace('nt:', '', $this->ressources[0]).' ';
104
					.str_replace('nt:', '', $this->ressources[0]).' ';
105
			} else {
105
			} else {
106
				$e = 'Erreur dans votre requête : </br> Le numéro taxonomique n\'existe pas dans ce projet';
106
				$e = 'Erreur dans votre requête : </br> Le numéro taxonomique n\'existe pas dans ce projet';
107
				$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
107
				$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
108
			}
108
			}
109
		} else {
109
		} else {
110
			// SELECT num_nom FROM bdtfx_v2_00 WHERE num_nom = (SELECT num_nom_retenu FROM bdtfx_v2_00 WHERE num_nom = X);
110
			// SELECT num_nom FROM bdtfx_v2_00 WHERE num_nom = (SELECT num_nom_retenu FROM bdtfx_v2_00 WHERE num_nom = X);
111
			$this->requete_condition[0] = 'num_nom = (SELECT num_nom_retenu FROM '
111
			$this->requete_condition[0] = 'num_nom = '.$this->ressources[0];
112
				.$this->table.' WHERE num_nom = '.$this->ressources[0].')';
-
 
113
		}
112
		}
114
	}
113
	}
115
	
114
	
116
	
115
	
117
	/** Permet de récupérer le num_nom du taxon recherché. Soit le numéro taxonomique est demandé (avec nt: ) 
116
	/** Permet de récupérer le num_nom du taxon recherché. Soit le numéro taxonomique est demandé (avec nt: ) 
118
	 * soit un num_nom dont on recherche le num_nom_retenu */
117
	 * soit un num_nom dont on recherche le num_nom_retenu */
119
	public function recupererNumNomTaxon() {
118
	public function recupererNumNomTaxon() {
120
		$identifiant = '';
119
		$identifiant = '';
121
		if ($this->entete_http == '') {
120
		if ($this->entete_http == '') {
122
			//on récupere l'identifiant du taxon correspondant au num_nom ou num_taxonomique demandé pour pouvoir l'afficher
121
			//on récupere l'identifiant du taxon correspondant au num_nom ou num_taxonomique demandé pour pouvoir l'afficher
123
			$req_tax = 'SELECT num_nom FROM '.$this->table.' WHERE '.$this->requete_condition[0]; 
122
			$req_tax = 'SELECT num_nom_retenu FROM '.$this->table.' WHERE '.$this->requete_condition[0]; 
124
			$res_tax = $this->getBdd()->recuperer($req_tax);
123
			$res_tax = $this->getBdd()->recuperer($req_tax);
125
			//on recherche ensuite les identifiants des taxons supérieurs ou inférieurs
124
			//on recherche ensuite les identifiants des taxons supérieurs ou inférieurs
126
			if ($res_tax && $res_tax != '') {
125
			if ($res_tax && $res_tax != '') {
127
				$identifiant = $res_tax['num_nom'];
126
				$identifiant = $res_tax['num_nom_retenu'];
128
			} else {
127
			} else {
129
				$e = 'Le numéro de taxon ou l\'identifiant de nom correspondant au num_nom '
128
				$e = 'Le numéro de taxon ou l\'identifiant de nom correspondant au num_nom '
130
					.$this->ressources[0].' n\'existe pas dans la base.';
129
					.$this->ressources[0].' n\'existe pas dans la base.';
131
				$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE, $e);
130
				$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE, $e);
132
				Debug::printr($req_tax);
131
				Debug::printr($req_tax);
133
			}
132
			}
134
		}
133
		}
135
		return $identifiant;
134
		return $identifiant;
136
	}
135
	}
137
	
136
	
138
	public function traiterRessourceIdRelations() {
137
	public function traiterRessourceIdRelations() {
139
		//----------------- requete de type taxons/#id/relations-------------------------------------------
138
		//----------------- requete de type taxons/#id/relations-------------------------------------------
140
		// SELECT *, nom_sci FROM bftfx_v2_00 WHERE num_nom = X;
139
		// SELECT *, nom_sci FROM bftfx_v2_00 WHERE num_nom = X;
141
		$this->format_reponse .= '/relations';
140
		$this->format_reponse .= '/relations';
142
		if (isset($this->ressources[2]) && !empty($this->ressources[2])) {			
141
		if (isset($this->ressources[2]) && !empty($this->ressources[2])) {			
143
			//------------- requete de type taxons/#id/relations/#relation--------------------------------
142
			//------------- requete de type taxons/#id/relations/#relation--------------------------------
144
			switch ($this->ressources[2]) {
143
			switch ($this->ressources[2]) {
145
				case 'superieurs' : 
144
				case 'superieurs' : 
146
					$rel = 'recupererIdSup';
145
					$rel = 'recupererIdSup';
147
					$this->format_reponse .= '/superieurs'; 	
146
					$this->format_reponse .= '/superieurs'; 	
148
					$this->traiterRessourceIdRelationInfSup($rel);	 			
147
					$this->traiterRessourceIdRelationInfSup($rel);	 			
149
					break;
148
					break;
150
				case 'inferieurs' : 
149
				case 'inferieurs' : 
151
					$rel = 'recupererIdInf';
150
					$rel = 'recupererIdInf';
152
					$this->format_reponse .= '/inferieurs'; 	
151
					$this->format_reponse .= '/inferieurs'; 	
153
					$this->traiterRessourceIdRelationInfSup($rel); 				
152
					$this->traiterRessourceIdRelationInfSup($rel); 				
154
					break;
153
					break;
155
				default : 
154
				default : 
156
					$e = 'Erreur dans votre requête </br> Ressources disponibles : <br/>
155
					$e = 'Erreur dans votre requête </br> Ressources disponibles : <br/>
157
						 <li> taxons/#id/relations </li><li> #id/relations/inferieurs </li>
156
						 <li> taxons/#id/relations </li><li> #id/relations/inferieurs </li>
158
						 <li> #id/relations/superieurs </li>';
157
						 <li> #id/relations/superieurs </li>';
159
					$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e); 
158
					$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e); 
160
					break;
159
					break;
161
			}
160
			}
162
		} 
161
		} 
163
	}
162
	}
164
		
163
		
165
	public function traiterRessourceIdRelationInfSup($rel) {
164
	public function traiterRessourceIdRelationInfSup($rel) {
166
		//Appel de la fct récupérerIdSup ou recupererIdInf : retourne les num_nom des noms inferieurs ou superieurs
165
		//Appel de la fct récupérerIdSup ou recupererIdInf : retourne les num_nom des noms inferieurs ou superieurs
167
		$res_relation = $this->$rel(); 
166
		$res_relation = $this->$rel(); 
168
		//analyse du résultat retourné par la requete de recherche des identifiants correspondant aux taxons inf|sup :
167
		//analyse du résultat retourné par la requete de recherche des identifiants correspondant aux taxons inf|sup :
169
		if ($res_relation == '') { 	//dans le cas ou la requete comporte des erreurs
168
		if ($res_relation == '') { 	//dans le cas ou la requete comporte des erreurs
170
			$e = 'Fct traiterRessourceIdHomonymie : La requête forme comporte une erreur!';
169
			$e = 'Fct traiterRessourceIdHomonymie : La requête forme comporte une erreur!';
171
			$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE, $e);
170
			$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE, $e);
172
		} elseif ($res_relation) {
171
		} elseif ($res_relation) {
173
			//dans le cas ou une ou plusieurs relations est retournée, on récupère les identifiants ss la forme (id, id, id)
172
			//dans le cas ou une ou plusieurs relations est retournée, on récupère les identifiants ss la forme (id, id, id)
174
			foreach ($res_relation as $ligne) $res[] = $ligne['num_nom'];
173
			foreach ($res_relation as $ligne) $res[] = $ligne['num_nom'];
175
			$res = implode(',',$res);
174
			$res = implode(',',$res);
176
			$this->requete_condition[0] = "num_nom IN ($res)";
175
			$this->requete_condition[0] = "num_nom IN ($res)";
177
			$this->requete_champ 	 .=  ', rang, num_tax_sup ';
176
			$this->requete_champ 	 .=  ', rang, num_tax_sup ';
178
		} else { //dans le cas ou aucune relation n'existe
177
		} else { //dans le cas ou aucune relation n'existe
179
			$res = array($this->num_nom_taxon => null);
178
			$res = array($this->num_nom_taxon => null);
180
			$this->corps_http = json_encode($res);
179
			$this->corps_http = json_encode($res);
181
			$this->entete_http = RestServeur::HTTP_CODE_OK;
180
			$this->entete_http = RestServeur::HTTP_CODE_OK;
182
		}
181
		}
183
	}
182
	}
184
	
183
	
185
	public function recupererIdInf() {
184
	public function recupererIdInf() {
186
		//SELECT num_nom FROM bfdtx_v2_00 WHERE num_tax_sup = (SELECT num_nom FROM bdtfx_v2_00 WHERE num_nom = X);
185
		//SELECT num_nom FROM bfdtx_v2_00 WHERE num_tax_sup = (SELECT num_nom FROM bdtfx_v2_00 WHERE num_nom = X);
187
		$req_relation = 'SELECT num_nom FROM '.$this->table
186
		$req_relation = 'SELECT num_nom FROM '.$this->table
188
							.' WHERE num_tax_sup = (SELECT num_nom FROM '
187
							.' WHERE num_tax_sup = (SELECT num_nom FROM '
189
							.$this->table
188
							.$this->table
190
							.' WHERE '.implode(' AND ', $this->requete_condition).')';
189
							.' WHERE '.implode(' AND ', $this->requete_condition).')';
191
		$res_relation = $this->getBdd()->recupererTous($req_relation);
190
		$res_relation = $this->getBdd()->recupererTous($req_relation);
192
		return $res_relation;
191
		return $res_relation;
193
	}
192
	}
194
	
193
	
195
	
194
	
196
	public function recupererIdSup() {
195
	public function recupererIdSup() {
197
		//SELECT num_nom FROM bfdtx_v2_00 WHERE num_nom = (SELECT num_tax_sup FROM bdtfx_v2_00 WHERE num_nom = X);
196
		//SELECT num_nom FROM bfdtx_v2_00 WHERE num_nom = (SELECT num_tax_sup FROM bdtfx_v2_00 WHERE num_nom = X);
198
		$req_relation = 'SELECT num_nom FROM '.$this->table
197
		$req_relation = 'SELECT num_tax_sup as num_nom FROM '.$this->table
199
							.' WHERE num_nom = (SELECT num_tax_sup FROM '
-
 
200
							.$this->table
-
 
201
							.' WHERE '.implode(' AND ', $this->requete_condition).')';
198
							.' WHERE '.implode(' AND ', $this->requete_condition);
202
		$res_relation = $this->getBdd()->recupererTous($req_relation);
199
		$res_relation = $this->getBdd()->recupererTous($req_relation);
203
		return $res_relation;
200
		return $res_relation;
204
	}
201
	}
205
 
202
 
206
	
203
	
207
	public function traiterRessourceStatsInitiales() {
204
	public function traiterRessourceStatsInitiales() {
208
		// SELECT count(nom_sci) as nb, rang, left(nom_sci, 2) as lettre FROM bdtfx_v2_00  GROUP BY rang, left(nom_sci, 2);
205
		// SELECT count(nom_sci) as nb, rang, left(nom_sci, 2) as lettre FROM bdtfx_v2_00  GROUP BY rang, left(nom_sci, 2);
209
		$this->format_reponse	= 'taxons/stats/initiales';
206
		$this->format_reponse	= 'taxons/stats/initiales';
210
		$this->requete_champ	 = 'count(nom_sci) as nb, rang, left(nom_sci, 2) as lettre ';  
207
		$this->requete_champ	 = 'count(nom_sci) as nb, rang, left(nom_sci, 2) as lettre ';  
211
		$this->requete_group_by  = ' GROUP BY rang, left(nom_sci, 2) ';
208
		$this->requete_group_by  = ' GROUP BY rang, left(nom_sci, 2) ';
212
	}
209
	}
213
			
210
			
214
	public function traiterRessourceStatsRangs() {
211
	public function traiterRessourceStatsRangs() {
215
		// SELECT count(*) as nombre, rang FROM bdtfx_v2_00 [WHERE rang = 290] GROUP BY rang ORDER BY rang;
212
		// SELECT count(*) as nombre, rang FROM bdtfx_v2_00 [WHERE rang = 290] GROUP BY rang ORDER BY rang;
216
		$this->format_reponse	= 'taxons/stats/rangs';
213
		$this->format_reponse	= 'taxons/stats/rangs';
217
		$this->requete_champ	 = 'count(*) as nombre, rang ';
214
		$this->requete_champ	 = 'count(*) as nombre, rang ';
218
		$this->requete_group_by  = ' GROUP BY rang ORDER BY rang ';
215
		$this->requete_group_by  = ' GROUP BY rang ORDER BY rang ';
219
	}
216
	}
220
			
217
			
221
	public function traiterRessourceStatsAnnees() {
218
	public function traiterRessourceStatsAnnees() {
222
		// SELECT count(*) as nombre, annee FROM bdtfx_v2_00 GROUP BY annee ORDER BY annee;
219
		// SELECT count(*) as nombre, annee FROM bdtfx_v2_00 GROUP BY annee ORDER BY annee;
223
		$this->format_reponse	= 'taxons/stats/annees';
220
		$this->format_reponse	= 'taxons/stats/annees';
224
		$this->requete_champ	 = 'count(*) as nombre, annee ';
221
		$this->requete_champ	 = 'count(*) as nombre, annee ';
225
		$this->requete_group_by  = ' GROUP BY annee ORDER BY annee ';  
222
		$this->requete_group_by  = ' GROUP BY annee ORDER BY annee ';  
226
	}
223
	}
227
	
224
	
228
	
225
	
229
//-----------------------------FONCTIONS DASSEMBLAGE DE LA REQUETE-----------------------------------------------------
226
//-----------------------------FONCTIONS DASSEMBLAGE DE LA REQUETE-----------------------------------------------------
230
	
227
	
231
	public function assemblerLaRequete() {	
228
	public function assemblerLaRequete() {	
232
		if ($this->format_reponse != 'taxons/stats/initiales') {
229
		if ($this->format_reponse != 'taxons/stats/initiales') {
233
			$this->mettreAuFormat(); //on remplace les nom_sci par les nom_sci_html
230
			$this->mettreAuFormat(); //on remplace les nom_sci par les nom_sci_html
234
		}
231
		}
235
		$requete = 	' SELECT '.$this->requete_champ.
232
		$requete = 	' SELECT '.$this->requete_champ.
236
						' FROM '.$this->table
233
						' FROM '.$this->table
237
							.$this->retournerRequeteCondition()
234
							.$this->retournerRequeteCondition()
238
							.$this->requete_group_by
235
							.$this->requete_group_by
239
							.$this->formerRequeteLimite(); 
236
							.$this->formerRequeteLimite(); 
240
		return $requete; 
237
		return $requete; 
241
	}
238
	}
242
	
239
	
243
	public function formerRequeteLimite() {
240
	public function formerRequeteLimite() {
244
		if ($this->format_reponse != 'taxons' && $this->format_reponse != 'taxons/id/relations/homonymie') {
241
		if ($this->format_reponse != 'taxons' && $this->format_reponse != 'taxons/id/relations/homonymie') {
245
			$this->requete_limite = '';
242
			$this->requete_limite = '';
246
		} elseif (($depart = $this->limite_requete['depart']) > ($this->total_resultat = $this->recupererTotalResultat())) {
243
		} elseif (($depart = $this->limite_requete['depart']) > ($this->total_resultat = $this->recupererTotalResultat())) {
247
			$this->limite_requete['depart'] = (($this->total_resultat - $this->limite_requete['limite']) < 0) ? 0 : ($this->total_resultat - $this->limite_requete['limite']);
244
			$this->limite_requete['depart'] = (($this->total_resultat - $this->limite_requete['limite']) < 0) ? 0 : ($this->total_resultat - $this->limite_requete['limite']);
248
			$this->requete_limite = ' LIMIT '.$this->limite_requete['depart'].', '.$this->limite_requete['limite']; 
245
			$this->requete_limite = ' LIMIT '.$this->limite_requete['depart'].', '.$this->limite_requete['limite']; 
249
		} else {
246
		} else {
250
			$this->requete_limite = ' LIMIT '.$this->limite_requete['depart'].', '.$this->limite_requete['limite']; 
247
			$this->requete_limite = ' LIMIT '.$this->limite_requete['depart'].', '.$this->limite_requete['limite']; 
251
		}
248
		}
252
		return $this->requete_limite;
249
		return $this->requete_limite;
253
	}
250
	}
254
	
251
	
255
	public function retournerRequeteCondition() {
252
	public function retournerRequeteCondition() {
256
		$condition = '';
253
		$condition = '';
257
		if ($this->requete_condition) { 
254
		if ($this->requete_condition) { 
258
			$condition = ' WHERE '.implode(' AND ', $this->requete_condition);
255
			$condition = ' WHERE '.implode(' AND ', $this->requete_condition);
259
		} 
256
		} 
260
		return $condition;
257
		return $condition;
261
	}
258
	}
262
	
259
	
263
	public function recupererTotalResultat() {
260
	public function recupererTotalResultat() {
264
		$requete = 'SELECT count(*) as nombre FROM '.$this->table.$this->retournerRequeteCondition().$this->requete_group_by;
261
		$requete = 'SELECT count(*) as nombre FROM '.$this->table.$this->retournerRequeteCondition().$this->requete_group_by;
265
		$res = $this->getBdd()->recuperer($requete);
262
		$res = $this->getBdd()->recuperer($requete);
266
		if ($res) {
263
		if ($res) {
267
			$total = $res['nombre'];
264
			$total = $res['nombre'];
268
		} 
265
		} 
269
		return $total;
266
		return $total;
270
	}
267
	}
271
 
268
 
272
//-------------------------FONCTIONS DE FORMATION DU RESULTAT-----------------------------------------------------------
269
//-------------------------FONCTIONS DE FORMATION DU RESULTAT-----------------------------------------------------------
273
	
270
	
274
	/** Permet de récupérer le résultat à retourner propre à chaque requete et de l'encoder en json*/
271
	/** Permet de récupérer le résultat à retourner propre à chaque requete et de l'encoder en json*/
275
	public function retournerResultatFormate($resultat, $version) {
272
	public function retournerResultatFormate($resultat, $version) {
276
		switch ($this->format_reponse) {
273
		switch ($this->format_reponse) {
277
			case 'taxons/id' ://ds CommunNomsTaxons
274
			case 'taxons/id' ://ds CommunNomsTaxons
278
				$reponse = $this->formaterId($resultat[0]);
275
				$reponse = $this->formaterId($resultat[0]);
279
				break;
276
				break;
280
			case 'taxons/id/champ' ://ds CommunNomsTaxons
277
			case 'taxons/id/champ' ://ds CommunNomsTaxons
281
				$reponse = $this->formaterIdChamp($resultat[0]);
278
				$reponse = $this->formaterIdChamp($resultat[0]);
282
				break;
279
				break;
283
			case 'taxons/id/relations' :
280
			case 'taxons/id/relations' :
284
				$reponse = $this->formaterIdRelations($resultat[0],$version);
281
				$reponse = $this->formaterIdRelations($resultat[0],$version);
285
				break; 
282
				break; 
286
			case 'taxons/id/relations/superieurs' :
283
			case 'taxons/id/relations/superieurs' :
287
				$reponse = $this->formaterIdSuperieur($resultat, $version);
284
				$reponse = $this->formaterIdSuperieur($resultat, $version);
288
				break;
285
				break;
289
			case 'taxons/id/relations/inferieurs' :
286
			case 'taxons/id/relations/inferieurs' :
290
				$reponse = $this->formaterIdInferieur($resultat);
287
				$reponse = $this->formaterIdInferieur($resultat);
291
				break;
288
				break;
292
			case 'taxons/stats/annees' :  //ds CommunNomsTaxons
289
			case 'taxons/stats/annees' :  //ds CommunNomsTaxons
293
				$reponse = $this->formaterStatsAnnee($resultat);
290
				$reponse = $this->formaterStatsAnnee($resultat);
294
				break;
291
				break;
295
			case 'taxons/stats/rangs' ://ds CommunNomsTaxons
292
			case 'taxons/stats/rangs' ://ds CommunNomsTaxons
296
				$reponse = $this->formaterStatsRang($resultat);
293
				$reponse = $this->formaterStatsRang($resultat);
297
				break;
294
				break;
298
			case 'taxons/stats/initiales' ://ds CommunNomsTaxons
295
			case 'taxons/stats/initiales' ://ds CommunNomsTaxons
299
				$reponse = $this->formaterStatsInitiales($resultat);
296
				$reponse = $this->formaterStatsInitiales($resultat);
300
				break;
297
				break;
301
			case 'taxons' :
298
			case 'taxons' :
302
				$reponse = $this->formatertaxons($resultat);
299
				$reponse = $this->formatertaxons($resultat);
303
				break;											
300
				break;											
304
		}
301
		}
305
		return $reponse;
302
		return $reponse;
306
	}
303
	}
307
	
304
	
308
		
305
		
309
//----------------------concerne les resultats pour des requetes de type /noms avec ou sans paramètres--------------
306
//----------------------concerne les resultats pour des requetes de type /noms avec ou sans paramètres--------------
310
	
307
	
311
	public function formaterTaxons($resultat) {
308
	public function formaterTaxons($resultat) {
312
		if ($this->parametres['retour.format'] == 'oss') {
309
		if ($this->parametres['retour.format'] == 'oss') {
313
			$reponse = $this->formaterEnOss($resultat);	
310
			$reponse = $this->formaterEnOss($resultat);	
314
		} else {
311
		} else {
315
			$reponse = $this->formaterEnJsonMax($resultat);
312
			$reponse = $this->formaterEnJsonMax($resultat);
316
		}
313
		}
317
		return $reponse;
314
		return $reponse;
318
	}
315
	}
319
	
316
	
320
	public function formaterEnJsonMax($resultat) {
317
	public function formaterEnJsonMax($resultat) {
321
		//print_r($resultat);
318
		//print_r($resultat);
322
		$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
319
		$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
323
		$masque = $this->recupererMasquePrincipal();
320
		$masque = $this->recupererMasquePrincipal();
324
		if (isset($masque)) $resultat = $this->trierRechercheFloue($this->parametres[$masque[0]], $resultat, $masque[1]);
321
		if (isset($masque)) $resultat = $this->trierRechercheFloue($this->parametres[$masque[0]], $resultat, $masque[1]);
325
		if (isset($this->masque)) $this->table_retour['masque'] = implode('&', $this->masque); 
322
		if (isset($this->masque)) $this->table_retour['masque'] = implode('&', $this->masque); 
326
		$this->afficherEnteteResultat('/'.$this->service);
323
		$this->afficherEnteteResultat('/'.$this->service);
327
		$table_retour_json['entete'] = $this->table_retour;
324
		$table_retour_json['entete'] = $this->table_retour;
328
		$this->table_retour = array();
325
		$this->table_retour = array();
329
		//on remplit la table $table_retour_json['resultat']
326
		//on remplit la table $table_retour_json['resultat']
330
		$tab_tax_inf = $this->recupererListeTaxonInf($resultat);
327
		$tab_tax_inf = $this->recupererListeTaxonInf($resultat);
331
		foreach ($resultat as $tab) {
328
		foreach ($resultat as $tab) {
332
			$num = $tab['num_nom'];
329
			$num = $tab['num_nom'];
333
			if (isset($this->parametres['masque.nt'])) $this->afficherDonnees('num_taxonomique', $tab['num_taxonomique']);
330
			if (isset($this->parametres['masque.nt'])) $this->afficherDonnees('num_taxonomique', $tab['num_taxonomique']);
334
			$this->afficherNomHrefRetenu($tab, $num);
331
			$this->afficherNomHrefRetenu($tab, $num);
335
			$this->afficherTaxonInfNb($num, $tab_tax_inf); 
332
			$this->afficherTaxonInfNb($num, $tab_tax_inf); 
336
			$resultat_json[$num] = $this->table_retour;
333
			$resultat_json[$num] = $this->table_retour;
337
			$this->table_retour = array(); //on vide le tableau table_retour
334
			$this->table_retour = array(); //on vide le tableau table_retour
338
		}
335
		}
339
		$table_retour_json['resultat'] = $resultat_json; 
336
		$table_retour_json['resultat'] = $resultat_json; 
340
		return $table_retour_json;
337
		return $table_retour_json;
341
	}
338
	}
342
	
339
	
343
	
340
	
344
//--------------------concerne les resultats pour des requetes de type noms/id----------------------------------------
341
//--------------------concerne les resultats pour des requetes de type noms/id----------------------------------------
345
 
342
 
346
	public function formaterIdRelations($resultat, $version) {
343
	public function formaterIdRelations($resultat, $version) {
347
		$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
344
		$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
348
		$this->resultat_req = $resultat;
345
		$this->resultat_req = $resultat;
349
		$retour_id_rel = array ('entete' => array()); //on initialise pr que l'entete apparaisse en premier
346
		$retour_id_rel = array ('entete' => array()); //on initialise pr que l'entete apparaisse en premier
350
 
347
 
351
		$superieurs = $this->ajouterRelations('superieurs'); //, $version);
348
		$superieurs = $this->ajouterRelations('superieurs'); //, $version);
352
		if (isset($superieurs)) $retour_id_rel['resultat']['superieurs'] = $superieurs;
349
		if (isset($superieurs)) $retour_id_rel['resultat']['superieurs'] = $superieurs;
353
		$inferieurs = $this->ajouterRelations('inferieurs', $version);
350
		$inferieurs = $this->ajouterRelations('inferieurs', $version);
354
		if (isset($inferieurs)) $retour_id_rel['resultat']['inferieurs'] = $inferieurs;
351
		if (isset($inferieurs)) $retour_id_rel['resultat']['inferieurs'] = $inferieurs;
355
		
352
		
356
		if (!isset($retour_id_rel['resultat']))	{ //on renvoit un tableau null si il n'existe aucune relations
353
		if (!isset($retour_id_rel['resultat']))	{ //on renvoit un tableau null si il n'existe aucune relations
357
			$retour_id_rel = 'null';
354
			$retour_id_rel = 'null';
358
		} else { //on rajoute l'entete si des relations existent
355
		} else { //on rajoute l'entete si des relations existent
359
			$this->afficherDonnees('num_nom', $this->num_nom_taxon); //$this->afficherEnteteResultat($resultat, '/'.$this->service.'/'.$this->ressources[0].'/relations/synonymie');
356
			$this->afficherDonnees('num_nom', $this->num_nom_taxon); //$this->afficherEnteteResultat($resultat, '/'.$this->service.'/'.$this->ressources[0].'/relations/synonymie');
360
			$retour_id_rel['entete'] = $this->table_retour;
357
			$retour_id_rel['entete'] = $this->table_retour;
361
			$this->table_retour = array();
358
			$this->table_retour = array();
362
		}
359
		}
363
		return $retour_id_rel;
360
		return $retour_id_rel;
364
	}
361
	}
365
		
362
		
366
	public function ajouterRelations($relation, $version) {
363
	public function ajouterRelations($relation, $version) {
367
		$version = str_replace(Config::get('bdd_table').'_', '', $version);
364
		$version = str_replace(Config::get('bdd_table').'_', '', $version);
368
		$res = null;
365
		$res = null;
369
		$taxon = $this->num_nom_taxon;
366
		$taxon = $this->num_nom_taxon;
370
		$parametres_url = '';
367
		$parametres_url = '';
371
		if ($this->parametres != array()) $parametres_url = '?'.http_build_query($this->parametres, '', '&');
368
		if ($this->parametres != array()) $parametres_url = '?'.http_build_query($this->parametres, '', '&');
372
		$url = Config::get('url_service').'/'
369
		$url = Config::get('url_service').'/'
373
				.$this->service.'/'.$version.'/'
370
				.$this->service.'/'.$version.'/'
374
				.$this->ressources[0].'/relations/'
371
				.$this->ressources[0].'/relations/'
375
				.$relation.$parametres_url;
372
				.$relation.$parametres_url;
376
		$relation = $this->consulterHref($url);
373
		$relation = $this->consulterHref($url);
377
		if (isset($relation->resultat)) {
374
		if (isset($relation->resultat)) {
378
			$res = $relation->resultat;
375
			$res = $relation->resultat;
379
		} elseif (isset($relation->$taxon)) { //pour les relations inf et sup
376
		} elseif (isset($relation->$taxon)) { //pour les relations inf et sup
380
			$res = $relation->$taxon;
377
			$res = $relation->$taxon;
381
		}
378
		}
382
		return $res;
379
		return $res;
383
	}
380
	}
384
	
381
	
385
	public function formaterIdSuperieur($resultat, $version) {
382
	public function formaterIdSuperieur($resultat, $version) {
386
		$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
383
		$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
387
		$tab_relation = null; //si il n'existe aucune relation
384
		$tab_relation = null; //si il n'existe aucune relation
388
		$taxon_sup_traites = array();
385
		$taxon_sup_traites = array();
389
		if (($resultat) != '' ) { 
386
		if (($resultat) != '' ) { 
390
			//on recupere d'abord les rangs supérieurs
387
			//on recupere d'abord les rangs supérieurs
391
			$sup = $resultat[0];
388
			$sup = $resultat[0];
392
			do {
389
			do {
393
				$sup = $this->recupererIdSuperieur($sup['num_tax_sup'], $version); 
390
				$sup = $this->recupererIdSuperieur($sup['num_tax_sup'], $version); 
394
				if(!in_array($sup['num_nom'], $taxon_sup_traites)) {
391
				if(!in_array($sup['num_nom'], $taxon_sup_traites)) {
395
					$taxon_sup_traites[] = $sup['num_nom'];
392
					$taxon_sup_traites[] = $sup['num_nom'];
396
				} else {
393
				} else {
397
					$sup = null;
394
					$sup = null;
398
				}
395
				}
399
				if ($sup['rang'] == '0') $sup['rang'] = '10'; //erreur dans la base
396
				if ($sup['rang'] == '0') $sup['rang'] = '10'; //erreur dans la base
400
				if (isset($sup)) $resultat[] = $sup;
397
				if (isset($sup)) $resultat[] = $sup;
401
			} while ($sup != null);
398
			} while ($sup != null);
402
			krsort($resultat);
399
			krsort($resultat);
403
			//on les affiche ensuite
400
			//on les affiche ensuite
404
			foreach ($resultat as $tab) {
401
			foreach ($resultat as $tab) {
405
				$this->resultat_req = $tab;
402
				$this->resultat_req = $tab;
406
				$num = $tab['num_nom'];
403
				$num = $tab['num_nom'];
407
				$this->afficherNomHrefRetenu($tab, $num);
404
				$this->afficherNomHrefRetenu($tab, $num);
408
				$this->afficherDonnees('rang', $tab['rang']);	
405
				$this->afficherDonnees('rang', $tab['rang']);	
409
				$tab_inf[$num] = $this->table_retour;
406
				$tab_inf[$num] = $this->table_retour;
410
				$tab_inf[$num]['num_nom'] = $tab['num_nom'];
407
				$tab_inf[$num]['num_nom'] = $tab['num_nom'];
411
				$this->table_retour = array();
408
				$this->table_retour = array();
412
			}
409
			}
413
			
410
			
414
			$tab_relation[$this->num_nom_taxon] = $tab_inf;
411
			$tab_relation[$this->num_nom_taxon] = $tab_inf;
415
		}
412
		}
416
		return $tab_relation;
413
		return $tab_relation;
417
	}
414
	}
418
	
415
	
419
	
416
	
420
	public function recupererIdSuperieur($id, $version) {
417
	public function recupererIdSuperieur($id, $version) {
421
		$req = 'SELECT num_nom, num_nom_retenu, num_tax_sup, rang, nom_sci FROM '
418
		$req = 'SELECT num_nom, num_nom_retenu, num_tax_sup, rang, nom_sci FROM '
422
				.$version.' WHERE num_nom = '.$this->getBdd()->proteger($id); 	
419
				.$version.' WHERE num_nom = '.$this->getBdd()->proteger($id); 	
423
		$res = $this->getBdd()->recupererTous($req);
420
		$res = $this->getBdd()->recupererTous($req);
424
		if ($res) {
421
		if ($res) {
425
			$resultat = $res[0];
422
			$resultat = $res[0];
426
		} else {
423
		} else {
427
			$resultat = null; //on return null si il n'y a pas de taxon superieur
424
			$resultat = null; //on return null si il n'y a pas de taxon superieur
428
		}
425
		}
429
		return $resultat;
426
		return $resultat;
430
	}
427
	}
431
	
428
	
432
	public function formaterIdInferieur($resultat) {
429
	public function formaterIdInferieur($resultat) {
433
		// Attention à l'ordre, on doit d'abord récupérer correpondance_champs avant champs_api
430
		// Attention à l'ordre, on doit d'abord récupérer correpondance_champs avant champs_api
434
		$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
431
		$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
435
		$tab_relation = null;
432
		$tab_relation = null;
436
		if (($resultat) != array()) { 
433
		if (($resultat) != array()) { 
437
			foreach ($resultat as $tab) {
434
			foreach ($resultat as $tab) {
438
				$this->resultat_req = $tab;
435
				$this->resultat_req = $tab;
439
				$num = $tab['num_nom'];
436
				$num = $tab['num_nom'];
440
				$this->afficherNomHrefRetenu($tab, $num);
437
				$this->afficherNomHrefRetenu($tab, $num);
441
				$this->afficherDonnees('rang', $tab['rang']);
438
				$this->afficherDonnees('rang', $tab['rang']);
442
				$tab_inf[$num] = $this->table_retour;
439
				$tab_inf[$num] = $this->table_retour;
443
				$tab_inf[$num]['nom_sci'] = $tab['nom_sci'];
440
				$tab_inf[$num]['nom_sci'] = $tab['nom_sci'];
444
				$tab_inf[$num]['num_nom'] = $tab['num_nom'];
441
				$tab_inf[$num]['num_nom'] = $tab['num_nom'];
445
				$this->table_retour = array();
442
				$this->table_retour = array();
446
			}
443
			}
447
			$tab_relation[$this->num_nom_taxon] = $tab_inf;
444
			$tab_relation[$this->num_nom_taxon] = $tab_inf;
448
		}
445
		}
449
		return $tab_relation;
446
		return $tab_relation;
450
	}
447
	}
451
	
448
	
452
	public function afficherTaxonInfNb($num, $tab_tax_inf) {
449
	public function afficherTaxonInfNb($num, $tab_tax_inf) {
453
		foreach ($tab_tax_inf as $taxNb) {
450
		foreach ($tab_tax_inf as $taxNb) {
454
			if ($taxNb['num_tax_sup'] == $num) {
451
			if ($taxNb['num_tax_sup'] == $num) {
455
				$this->table_retour['taxon_inferieur_nbre'] = $taxNb['nb'];
452
				$this->table_retour['taxon_inferieur_nbre'] = $taxNb['nb'];
456
			}
453
			}
457
		} 
454
		} 
458
		if (!isset($this->table_retour['taxon_inferieur_nbre'])) {
455
		if (!isset($this->table_retour['taxon_inferieur_nbre'])) {
459
			$this->table_retour['taxon_inferieur_nbre'] = '0';
456
			$this->table_retour['taxon_inferieur_nbre'] = '0';
460
		}
457
		}
461
	}
458
	}
462
	
459
	
463
	public function recupererListeTaxonInf($resultat) {
460
	public function recupererListeTaxonInf($resultat) {
464
		// SELECT num_tax_sup, count(*) as nb FROM bdtfx_v2_00 WHERE num_tax_sup IN (id, id, id) AND num_nom = num_nom_retenu GROUP BY num_tax_sup';
461
		// SELECT num_tax_sup, count(*) as nb FROM bdtfx_v2_00 WHERE num_tax_sup IN (id, id, id) AND num_nom = num_nom_retenu GROUP BY num_tax_sup';
465
		foreach ($resultat as $tab) {
462
		foreach ($resultat as $tab) {
466
			$tab_num[] = $tab['num_nom']; //on regroupe ici les id des taxons dont on cherche le nb de taxon inf
463
			$tab_num[] = $tab['num_nom']; //on regroupe ici les id des taxons dont on cherche le nb de taxon inf
467
		}
464
		}
468
		$req = 'SELECT num_tax_sup, count(*) as nb FROM '.$this->table
465
		$req = 'SELECT num_tax_sup, count(*) as nb FROM '.$this->table
469
				.' WHERE num_tax_sup IN ('.implode(',',$tab_num)
466
				.' WHERE num_tax_sup IN ('.implode(',',$tab_num)
470
				.') AND num_nom = num_nom_retenu GROUP BY num_tax_sup';
467
				.') AND num_nom = num_nom_retenu GROUP BY num_tax_sup';
471
		$res = $this->getBdd()->recupererTous($req);
468
		$res = $this->getBdd()->recupererTous($req);
472
		if ($res) {
469
		if ($res) {
473
			$resultat = $res;
470
			$resultat = $res;
474
		} else {
471
		} else {
475
			$resultat = array(); //on retourne un tableau vide s'il n'y a pas de taxon inférieurs
472
			$resultat = array(); //on retourne un tableau vide s'il n'y a pas de taxon inférieurs
476
		}
473
		}
477
		return $resultat;
474
		return $resultat;
478
	}
475
	}
479
}
476
}
480
 
477
 
481
?>
478
?>