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187 |
$this->messages[] = "Veuillez préciser le nom de code du projet comme second paramêtre (ex. : bdnff).";
|
187 |
$this->messages[] = "Veuillez préciser le nom de code du projet comme second paramêtre (ex. : bdnff).";
|
188 |
}
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188 |
}
|
189 |
return $nom;
|
189 |
return $nom;
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190 |
}
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190 |
}
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Line 191... |
- |
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191 |
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- |
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192 |
|
- |
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193 |
/* Méthode pour récupérer certains champs et noms pour l'export
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194 |
* Appelée avec les paramètres d'url suivant :
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- |
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195 |
* /Recherche/Export/_
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- |
|
196 |
* ou les _ représentent dans l'ordre : référentiel, version, champs, filtre
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- |
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197 |
* Si un des paramètres est absent, il prendre la valeur *
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- |
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198 |
*/
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- |
|
199 |
public function getElementExport($param) {
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- |
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200 |
$colonnesOrdonnees = array("nn" => array("a.num_nom", "Numéro nomenclatural"),
|
- |
|
201 |
"nr" => array("a.num_nom_retenu", "Numéro nomenclatural du nom retenu"),
|
- |
|
202 |
"nt" => array("a.num_taxonomique", "Numéro taxonomique"),
|
- |
|
203 |
"cd" => array("a.cd_ref", "Numéro INPN"),
|
- |
|
204 |
"rg" => array("a.rang", "Code rang"),
|
- |
|
205 |
"fam" => array("a.famille", "Famille (APG III)"),
|
- |
|
206 |
"nsc" => array("concat(a.nom_sci,' ',a.auteur)", "Nom avec auteur"),
|
- |
|
207 |
"bibc" => array("concat(a.annee,' ',a.biblio_origine)", "Année et bibliographie"),
|
- |
|
208 |
"nsrc" => array("concat(b.nom_sci,' ',b.auteur) as nom_sci_retenu_complet", "Nom retenu avec auteur"),
|
- |
|
209 |
"nf" => array("a.nom_francais", "Nom français normalisé"),
|
- |
|
210 |
"extax" => array("if (a.exclure_taxref = 1, 0, 1)", "Présent dans Taxref"),
|
- |
|
211 |
"lien" => array("concat('http://www.tela-botanica.org/bdtfx-nn-',a.num_nom)", "Permalien"),
|
- |
|
212 |
"ntsup" => array("a.num_tax_sup", "Numéro nomenclatural rang supérieur"),
|
- |
|
213 |
"pre" => array("a.presence", "Répartition géographique"),
|
- |
|
214 |
"ns" => array("a.nom_sci", "Nom sans auteur"),
|
- |
|
215 |
"aut" => array("a.auteur", "Auteur"),
|
- |
|
216 |
"ann" => array("a.annee", "Année publication"),
|
- |
|
217 |
"bib" => array("a.biblio_origine", "Bibliographie"),
|
- |
|
218 |
"ntype" => array("a.num_type", "Numéro du type"),
|
- |
|
219 |
"nbas" => array("a.num_basionyme", "Numéro du basionyme"),
|
- |
|
220 |
"genre" => array("a.genre", "Genre"),
|
- |
|
221 |
"esp" => array("a.epithete_sp", "Epithète espèce"),
|
- |
|
222 |
"eing" => array("a.epithete_infra_generique", "Epithète infragénérique"),
|
- |
|
223 |
"te" => array("a.type_epithete", "Type d'épithète infraspécifique"),
|
- |
|
224 |
"einsp" => array("a.epithete_infra_sp", "Epithète infraspécifique"),
|
- |
|
225 |
"hybp01" => array("a.hybride_parent_01", "Hybride parent 1"),
|
- |
|
226 |
"nomsupgen" => array("a.nom_supra_generique", "Nom supra générique"),
|
- |
|
227 |
"hybp02" => array("a.hybride_parent_02", "Hybride parent 2"),
|
- |
|
228 |
"stori" => array("a.statut_origine", "Statut d'origine"),
|
- |
|
229 |
"stint" => array("a.statut_introduction", "Statut d'introduction"),
|
- |
|
230 |
"stcult" => array("a.statut_culture", "Statut de culture"),
|
- |
|
231 |
"notes" => array("a.notes", "Remarques"),
|
- |
|
232 |
"nomadd" => array("a.nom_addendum", "Commentaires nomenclaturaux"),
|
- |
|
233 |
"nsr" => array("b.nom_sci as nom_sci_retenu", "Nom retenu sans auteur"),
|
- |
|
234 |
"hom" => array("a.homonyme", "Homonymie"),
|
- |
|
235 |
"synprop" => array("a.synonyme_proparte", "Synonyme proprate"),
|
- |
|
236 |
"syndout" => array("a.synonyme_douteux", "Synonyme douteux"),
|
- |
|
237 |
"synmapp" => array("a.synonyme_mal_applique", "Synonyme mal appliqué"),
|
- |
|
238 |
"synorth" => array("a.synonyme_orthographique", "Synonyme orthographique"),
|
- |
|
239 |
"orthori" => array("a.orthographe_originelle", "Orthographe originelle"),
|
- |
|
240 |
"hybp01n" => array("a.hybride_parent_01_notes", "Hybride parent 1 notes"),
|
- |
|
241 |
"hybp02n" => array("a.hybride_parent_02_notes", "Hybride parent 2 notes"),
|
- |
|
242 |
"cultgp" => array("a.cultivar_groupe", "Groupe de cultivar"),
|
- |
|
243 |
"cult" => array("a.cultivar", "Nom cultivar"),
|
- |
|
244 |
"nomcomm" => array("a.nom_commercial", "Nom commercial"),
|
- |
|
245 |
"autres" => array("a.*", "Autres"));
|
- |
|
246 |
// Initialisation des variables
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- |
|
247 |
$info = array();
|
- |
|
248 |
$p = $this->traiterParametresUrl(array("ref","version","champs","filtre"), $param, false);
|
- |
|
249 |
$ref = $p['ref'].'_v'.$p['version'];
|
- |
|
250 |
$dossier = '/home/delphine/tmp/'.date('Y_m_d').'/';
|
- |
|
251 |
if(!is_dir($dossier)){
|
- |
|
252 |
mkdir($dossier);
|
- |
|
253 |
}
|
- |
|
254 |
$fichier = $dossier.$ref."_".time().'.csv'; // à mettre en config
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- |
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255 |
$colonnes = explode(",", $p['champs']);
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- |
|
256 |
|
- |
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257 |
// recuperer colonne du ref pour vérifier que ces colonnes soient présentes + comptait nb colonnes pr autres
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- |
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258 |
foreach ($colonnes as $colonne) {
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- |
|
259 |
$champs[] = $colonnesOrdonnees[$colonne][0];
|
- |
|
260 |
$nom_champs[] = $colonnesOrdonnees[$colonne][1];
|
- |
|
261 |
}
|
- |
|
262 |
$requete = 'SELECT "'.implode('","', $nom_champs).'" UNION (SELECT '.implode(', ',$champs).
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- |
|
263 |
" INTO OUTFILE '".$fichier."' CHARACTER SET utf8 FIELDS TERMINATED BY '\t' OPTIONALLY ENCLOSED BY '' LINES TERMINATED BY '\n' ".
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- |
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264 |
" FROM $ref a left join $ref b on b.num_nom=a.num_nom_retenu";
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- |
|
265 |
|
- |
|
266 |
if (isset($p['filtre']) && $p['filtre'] != "*") {
|
- |
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267 |
$param_filtres = explode(",",$p["filtre"]);
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- |
|
268 |
$dernier_filtre = array_pop($param_filtres);
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- |
|
269 |
$filtres = array("nnr"=>"a.num_nom = a.num_nom_retenu", "pre" => "a.presence = 'P'");
|
- |
|
270 |
if (!isset($filtres[$dernier_filtre])) { // si il s'agit du filtre famille
|
- |
|
271 |
$filtres["fam"] = "a.famille = '".$dernier_filtre."'";
|
- |
|
272 |
$dernier_filtre = "fam";
|
- |
|
273 |
}
|
- |
|
274 |
array_push($param_filtres, $dernier_filtre);
|
- |
|
275 |
$requete .= " WHERE ".implode(" AND ",array_intersect_key($filtres, array_flip($param_filtres)));
|
- |
|
276 |
}
|
- |
|
277 |
$requete .= ")";
|
- |
|
278 |
// Récupération des résultats
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- |
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279 |
try {
|
- |
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280 |
$donnees = $this->bdd->query($requete);
|
- |
|
281 |
if ($donnees === false) {
|
- |
|
282 |
$this->messages[] = "La requête a retourné aucun résultat : $requete";
|
- |
|
283 |
} else {
|
- |
|
284 |
$info = $donnees;
|
- |
|
285 |
}
|
- |
|
286 |
} catch (PDOException $e) {
|
- |
|
287 |
$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage()).$requete;
|
- |
|
288 |
}
|
- |
|
289 |
|
- |
|
290 |
return $fichier;
|
- |
|
291 |
}
|
- |
|
292 |
|
- |
|
293 |
/**
|
- |
|
294 |
* Méthode principale appelée avec une requête de type POST.
|
- |
|
295 |
*/
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- |
|
296 |
public function updateElement($params_url, $params_post) {
|
- |
|
297 |
// Initialisation des variables
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- |
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298 |
$info = array();
|
- |
|
299 |
// Nour recherchons le type de requête demandé
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- |
|
300 |
extract($this->traiterParametresUrl(array('action'), $params_url, true));
|
- |
|
301 |
extract($this->traiterParametresPost(array('referentiel'), $params_post, true));
|
- |
|
302 |
extract($this->traiterParametresPost(array('noms'), $params_post, false));
|
- |
|
303 |
$referentiel =trim($referentiel, "'");
|
- |
|
304 |
|
- |
|
305 |
if (!is_null($referentiel)) {$action =trim($action, "'");
|
- |
|
306 |
if (!is_null($action)) {
|
- |
|
307 |
$methode = 'updateElement'.$action;
|
- |
|
308 |
if (method_exists($this, $methode)) {
|
- |
|
309 |
//array_shift($param);
|
- |
|
310 |
$info = $this->$methode($referentiel, $noms);
|
- |
|
311 |
} else {
|
- |
|
312 |
$this->messages[] = "Le type de mise à jour demandé '$action' n'est pas disponible.";
|
- |
|
313 |
}
|
- |
|
314 |
} else {
|
- |
|
315 |
$this->messages[] = "Veuillez préciser le type de mise à jour à faire.";
|
- |
|
316 |
// TODO : coder une mise à jour générique dans une méthode updateElementDefaut($id, $params_post);
|
- |
|
317 |
}
|
- |
|
318 |
} else {
|
- |
|
319 |
$this->messages[] = "Veuillez préciser l'id du traitement comme premier paramêtre dans l'url.";
|
- |
|
320 |
}
|
- |
|
321 |
|
- |
|
322 |
// Envoie sur la sortie standard
|
- |
|
323 |
$this->envoyer($info);
|
- |
|
324 |
}
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- |
|
325 |
|
- |
|
326 |
private function getElementTablePrChpFamille($referentiel) {
|
- |
|
327 |
$infos = "";$referentiel = $referentiel[0];
|
- |
|
328 |
$requete = "SHOW COLUMNS FROM {$referentiel} LIKE 'famille' ";
|
- |
|
329 |
$resultat = $this->bdd->query($requete)->fetch();
|
- |
|
330 |
if ($resultat === false) {
|
- |
|
331 |
$requete = "ALTER TABLE {$referentiel} ".
|
- |
|
332 |
'ADD famille VARCHAR(50) '.
|
- |
|
333 |
'CHARACTER SET utf8 COLLATE utf8_general_ci NULL DEFAULT "" ';
|
- |
|
334 |
$this->bdd->exec($requete);
|
- |
|
335 |
}
|
- |
|
336 |
$requeteInfos = 'SELECT num_nom, num_nom_retenu, num_tax_sup, rang, nom_sci '.
|
- |
|
337 |
"FROM {$referentiel} ".
|
- |
|
338 |
"WHERE rang >= 180 ".
|
- |
|
339 |
"ORDER BY rang ASC, num_tax_sup ASC, num_nom_retenu DESC ";
|
- |
|
340 |
$infos = $this->bdd->query($requeteInfos)->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC);
|
- |
|
341 |
return $infos;
|
- |
|
342 |
|
- |
|
343 |
}
|
- |
|
344 |
|
- |
|
345 |
|
- |
|
346 |
private function updateElementChpFamille($referentiel, $noms) {
|
- |
|
347 |
foreach ($noms as $id => $famille) {
|
- |
|
348 |
$requete = "UPDATE {$referentiel} SET famille = '$famille' WHERE num_nom = $id ";
|
- |
|
349 |
$resultat = $this->bdd->query($requete);
|
- |
|
350 |
if ($resultat === false) {
|
- |
|
351 |
$this->messages[] = "Erreur d'insertion pour le tuple $id";
|
- |
|
352 |
}
|
- |
|
353 |
}
|
- |
|
354 |
}
|
191 |
|
355 |
|
192 |
}
|
356 |
}
|
193 |
?>
|
357 |
?>
|