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Rev 637 Rev 661
Line 61... Line 61...
61 
			$this->traiterErreur($e->getMessage());
 61 
			$this->traiterErreur($e->getMessage());
62 
		}
 62 
		}
63 
	}
 63 
	}
Line 64... Line 64...
64 
 
 64 
 
65 
	private function chargerBdtxa() {
 65 
	private function chargerBdtxa() {
66 
		$chemin = Config::get('chemins.bdtxa');
 66 
		$chemin = Config::get('chemins.bdt');
67 
		$table = Config::get('tables.bdtxa');
 67 
		$table = Config::get('tables.bdtxa');
68 
		$requete = "LOAD DATA INFILE '$chemin' ".
 68 
		$requete = "LOAD DATA INFILE '$chemin' ".
69 
				"REPLACE INTO TABLE $table ".
 69 
				"REPLACE INTO TABLE $table ".
70 
				'CHARACTER SET utf8 '.
 70 
				'CHARACTER SET utf8 '.
Line 78... Line 78...
78 
 
 78 
 
79 
	private function genererChpNomSciHtml() {
 79 
	private function genererChpNomSciHtml() {
80 
		$this->initialiserGenerationChamps();
 80 
		$this->initialiserGenerationChamps();
81 
		$this->preparerTablePrChpNomSciHtml();
 81 
		$this->preparerTablePrChpNomSciHtml();
82 
		$generateur = new GenerateurNomSciHtml();
 82 
		$generateur = new GenerateurNomSciHtml();
- 
 
 83 
		$nbreTotal = $this->recupererNbTotalTuples();
83 
		$nbreTotal = $this->recupererNbTotalTuples();
 84 
		$erreurs = array();
84 
		$this->departInsertion = 0;
 85 
		$this->departInsertion = 0;
85 
		while ($this->departInsertion < $nbreTotal) {
 86 
		while ($this->departInsertion < $nbreTotal) {
- 
 
 87 
			$resultat = $this->recupererTuplesPrChpNomSciHtml();
- 
 
 88 
 
86 
			$resultat = $this->recupererTuplesPrChpNomSciHtml();
 89 
			try {
- 
 
 90 
				$nomsSciEnHtml = $generateur->generer($resultat);
- 
 
 91 
			} catch (Exception $e) {
- 
 
 92 
				$erreurs[] = $e->getMessage();
- 
 
 93 
			}
87 
			$nomsSciEnHtml = $generateur->generer($resultat);
 94 
 
88 
			$this->remplirChpNomSciHtm($nomsSciEnHtml);
 95 
			$this->remplirChpNomSciHtm($nomsSciEnHtml);
89 
			$this->departInsertion += $this->pasInsertion;
 96 
			$this->departInsertion += $this->pasInsertion;
90 
			$this->afficherAvancement("Insertion des noms scientifique au format HTML dans la base par paquet de {$this->pasInsertion} en cours");
 97 
			$this->afficherAvancement("Insertion des noms scientifique au format HTML dans la base par paquet de {$this->pasInsertion} en cours");
91 
			if ($this->stopperLaBoucle($this->getParametre('t'))) break;
 98 
			if ($this->stopperLaBoucle($this->getParametre('t'))) break;
92 
		}
 99 
		}
- 
 
 100 
		echo "\n";
- 
 
 101 
 
93 
		echo "\n";
 102 
		$this->creerFichierLog('Erreurs lors de la génération HTML des noms scientifiques', $erreurs, 'erreurs_noms_sci_html');
Line 94... Line 103...
94 
	}
 103 
	}
95 
 
 104 
 
96 
	private function initialiserGenerationChamps() {
 105 
	private function initialiserGenerationChamps() {
Line 132... Line 141...
132 
			if ($resultat === false) {
 141 
			if ($resultat === false) {
133 
				throw new Exception("Erreur d'insertion pour le tuple $id");
 142 
				throw new Exception("Erreur d'insertion pour le tuple $id");
134 
			}
 143 
			}
135 
		}
 144 
		}
136 
	}
 145 
	}
137
146 
 
138 
	private function genererChpNomComplet() {
 147 
	private function genererChpNomComplet() {
139 
		$this->preparerTablePrChpNomComplet();
 148 
		$this->preparerTablePrChpNomComplet();
140 
		$this->remplirChpNomComplet();
 149 
		$this->remplirChpNomComplet();
141 
	}
 150 
	}
142
151 
 
143 
	private function preparerTablePrChpNomComplet() {
 152 
	private function preparerTablePrChpNomComplet() {
144 
		$requete = "SHOW COLUMNS FROM {$this->table} LIKE 'nom_complet' ";
 153 
		$requete = "SHOW COLUMNS FROM {$this->table} LIKE 'nom_complet' ";
145 
		$resultat = $this->getBdd()->recuperer($requete);
 154 
		$resultat = $this->getBdd()->recuperer($requete);
146 
		if ($resultat === false) {
 155 
		if ($resultat === false) {
147 
			$requete = 	"ALTER TABLE {$this->table} ".
 156 
			$requete = 	"ALTER TABLE {$this->table} ".
148 
						'ADD nom_complet VARCHAR( 500 ) '.
 157 
						'ADD nom_complet VARCHAR( 500 ) '.
149 
						'CHARACTER SET utf8 COLLATE utf8_general_ci NULL DEFAULT NULL ';
 158 
						'CHARACTER SET utf8 COLLATE utf8_general_ci NULL DEFAULT NULL ';
150 
			$this->getBdd()->requeter($requete);
 159 
			$this->getBdd()->requeter($requete);
151 
		}
 160 
		}
152 
	}
 161 
	}
153
162 
 
154 
	private function remplirChpNomComplet() {
 163 
	private function remplirChpNomComplet() {
155 
		$this->afficherAvancement("Attribution du champ nom complet au taxons");
 164 
		echo "Attribution du champ nom complet au taxons : ";
156 
		$requete = "UPDATE {$this->table} SET nom_complet = CONCAT(nom_sci,' ',auteur)";
 165 
		$requete = "UPDATE {$this->table} SET nom_complet = CONCAT(nom_sci,' ',auteur)";
157 
		$resultat = $this->getBdd()->requeter($requete);
 166 
		$resultat = $this->getBdd()->requeter($requete);
158 
		if ($resultat === false) {
 167 
		if ($resultat === false) {
- 
 
 168 
			echo "KO\n";
159 
			throw new Exception("Erreur de génération du champ nom complet");
 169 
			throw new Exception("Erreur de génération du champ nom complet");
- 
 
 170 
		} else {
- 
 
 171 
			echo "OK\n";
160 
		}
 172 
		}
161 
	}
 173 
	}
Line 162... Line 174...
162 
 
 174 
 
163 
	private function genererChpFamille() {
 175 
	private function genererChpFamille() {
Line 207... Line 219...
207 
			}
 219 
			}
208 
			unset($introuvablesSyno[$id]);
 220 
			unset($introuvablesSyno[$id]);
209 
			$this->afficherAvancement("Attribution de leur famille aux synonymes en cours");
 221 
			$this->afficherAvancement("Attribution de leur famille aux synonymes en cours");
210 
		}
 222 
		}
211 
		echo "\n";
 223 
		echo "\n";
- 
 
 224 
 
- 
 
 225 
		$msg = 'Plusieurs familles sont introuvables';
- 
 
 226 
		$this->creerFichierLog($msg, $introuvables, 'famille_introuvable');
Line 212... Line -...
212 
 
 - 
 
213 
		if (count($introuvables) != 0) {
 - 
 
214 
			$introuvablesNbre = count($introuvables);
 - 
 
215 
			echo "Famille introuvable pour $introuvablesNbre noms ! Voir le log.\n";
 - 
 
216 
 
 - 
 
217 
			$logContenu = implode(", \n", $introuvables);
 - 
 
218 
			$logFichier = realpath(dirname(__FILE__)).'/log/famille_introuvable.log';
 - 
 
219 
			echo $logFichier."\n";
 - 
 
220 
			file_put_contents($logFichier, $logContenu);
 - 
 
221 
		}
 227 
 
222 
		$this->remplirChpFamille($noms);
 228 
		$this->remplirChpFamille($noms);
Line 223... Line 229...
223 
	}
 229 
	}
224 
 
 230 
 
Line 255... Line 261...
255 
		echo "\n";
 261 
		echo "\n";
256 
	}
 262 
	}
257 
	private function genererDonneesTestMultiVersion() {
 263 
	private function genererDonneesTestMultiVersion() {
258 
		$contenuSql = $this->recupererContenu(Config::get('chemins.structureSqlTest'));
 264 
		$contenuSql = $this->recupererContenu(Config::get('chemins.structureSqlTest'));
259 
		$this->executerScripSql($contenuSql);
 265 
		$this->executerScripSql($contenuSql);
260
266 
 
261 
		$table = Config::get('tables.bdtxa');
 267 
		$table = Config::get('tables.bdtxa');
262 
		$tableTest = Config::get('tables.bdtxaTest');
 268 
		$tableTest = Config::get('tables.bdtxaTest');
263 
		$requete = "INSERT INTO $tableTest SELECT * FROM $table";
 269 
		$requete = "INSERT INTO $tableTest SELECT * FROM $table";
264 
		$this->getBdd()->requeter($requete);
 270 
		$this->getBdd()->requeter($requete);
265 
	}
 271 
	}
266
272 
 
267 
	private function supprimerDonneesTestMultiVersion() {
 273 
	private function supprimerDonneesTestMultiVersion() {
268 
		$tableMeta = Config::get('tables.bdtxaMeta');
 274 
		$tableMeta = Config::get('tables.bdtxaMeta');
269 
		$requete = "DELETE FROM $tableMeta WHERE guid = 'urn:lsid:tela-botanica.org:bdtfx:1.02'";
 275 
		$requete = "DELETE FROM $tableMeta WHERE guid = 'urn:lsid:tela-botanica.org:bdtxa:1.00'";
270 
		$this->getBdd()->requeter($requete);
 276 
		$this->getBdd()->requeter($requete);
271
277 
 
272 
		$tableTest = Config::get('tables.bdtxaTest');
 278 
		$tableTest = Config::get('tables.bdtxaTest');
273 
		$requete = "DROP TABLE IF EXISTS $tableTest";
 279 
		$requete = "DROP TABLE IF EXISTS $tableTest";
274 
		$this->getBdd()->requeter($requete);
 280 
		$this->getBdd()->requeter($requete);
275 
	}
 281 
	}
276 
	private function supprimerTous() {
 282 
	private function supprimerTous() {
277 
		$requete = "DROP TABLE IF EXISTS bdtxa_meta, bdtxa_v0_01";
 283 
		$requete = "DROP TABLE IF EXISTS bdtxa_meta, bdtxa_v0_01, bdtxa_v1_00";
278 
		$this->getBdd()->requeter($requete);
 284 
		$this->getBdd()->requeter($requete);
279 
	}
 285 
	}
- 
 
 286 
 
- 
 
 287 
	private function creerFichierLog($message, $lignes, $nomFichier) {
- 
 
 288 
		$lignesNbre = count($lignes);
- 
 
 289 
		if ($lignesNbre != 0) {
- 
 
 290 
			echo "$message. Voir le log de $lignesNbre lignes :\n";
- 
 
 291 
 
- 
 
 292 
			$logContenu = implode(", \n", $lignes);
- 
 
 293 
			$logFichier = realpath(dirname(__FILE__))."/log/$nomFichier.log";
- 
 
 294 
			echo $logFichier."\n";
- 
 
 295 
			file_put_contents($logFichier, $logContenu);
- 
 
 296 
		}
- 
 
 297 
	}
280 
}
 298 
}
281 
?>
 299 
?>
282 

            300