| Line 49... |
Line 49... |
| 49 |
$traitements_obsoletes = $this->traitementDao->getTraitementsObsoletes($this->projet, self::SCRIPT_NOM);
|
49 |
$traitements_obsoletes = $this->traitementDao->getTraitementsObsoletes($this->projet, self::SCRIPT_NOM);
|
| 50 |
if (isset($traitements_obsoletes)) {
|
50 |
if (isset($traitements_obsoletes)) {
|
| 51 |
Debug::printr('Supp. obsoletes:'.$this->traitementDao->supprimer($traitements_obsoletes));
|
51 |
Debug::printr('Supp. obsoletes:'.$this->traitementDao->supprimer($traitements_obsoletes));
|
| 52 |
}
|
52 |
}
|
| Line -... |
Line 53... |
| - |
|
53 |
|
| - |
|
54 |
$this->tableStructureDao = new TableStructureDao();
|
| - |
|
55 |
$this->referentielDao = new ReferentielDao();
|
| 53 |
|
56 |
|
| 54 |
// Lancement du test demandé
|
57 |
// Lancement du test demandé
|
| 55 |
$cmd = $this->getParam('a');
|
58 |
$cmd = $this->getParam('a');
|
| 56 |
switch ($cmd) {
|
59 |
switch ($cmd) {
|
| 57 |
case 'tout' :
|
- |
|
| 58 |
$this->tableStructureDao = new TableStructureDao();
|
- |
|
| 59 |
$this->referentielDao = new ReferentielDao();
|
60 |
case 'tout' :
|
| - |
|
61 |
Debug::printr('Départ lancement test:');
|
| 60 |
Debug::printr('Départ lancement test:');
|
62 |
$this->recupererDonnees();
|
| 61 |
$this->lancerTests();
|
63 |
$this->lancerTests();
|
| - |
|
64 |
break;
|
| - |
|
65 |
case 'test11' :
|
| - |
|
66 |
$this->recupererDonnees();
|
| - |
|
67 |
Debug::printr('Départ lancement test 11 :');
|
| - |
|
68 |
$this->testerClassificationRang();
|
| 62 |
break;
|
69 |
break;
|
| 63 |
default :
|
70 |
default :
|
| 64 |
$this->traiterErreur('Erreur : la commande "%s" n\'existe pas!', array($cmd));
|
71 |
$this->traiterErreur('Erreur : la commande "%s" n\'existe pas!', array($cmd));
|
| 65 |
}
|
72 |
}
|
| 66 |
// Écriture de la date de fin du traitement
|
73 |
// Écriture de la date de fin du traitement
|
| 67 |
Debug::printr('Termine:'.$this->traitementDao->terminerTraitement($this->traitement['id_traitement']));
|
74 |
Debug::printr('Termine:'.$this->traitementDao->terminerTraitement($this->traitement['id_traitement']));
|
| 68 |
} else {
|
75 |
} else {
|
| 69 |
Debug::printr("Aucun dernier traitement trouvé pour le script '".self::SCRIPT_NOM."' !");
|
76 |
Debug::printr("Aucun dernier traitement trouvé pour le script '".self::SCRIPT_NOM."' !");
|
| 70 |
}
|
77 |
}
|
| 71 |
}
|
78 |
}
|
| 72 |
|
79 |
|
| 73 |
public function lancerTests() {
|
- |
|
| 74 |
$donnees = array();
|
- |
|
| 75 |
$donnees['tests'] = array();
|
- |
|
| 76 |
|
80 |
public function recupererDonnees() {
|
| 77 |
// Récupération des données à tester
|
81 |
// Récupération des données à tester
|
| 78 |
$colonnes = $this->tableStructureDao->getColonnes($this->projet);
|
82 |
$colonnes = $this->tableStructureDao->getColonnes($this->projet);
|
| 79 |
$analyses = $this->tableStructureDao->getAnalyse($this->projet);
|
83 |
$analyses = $this->tableStructureDao->getAnalyse($this->projet);
|
| 80 |
$this->noms = $this->referentielDao->getTout($this->projet);
|
84 |
$this->noms = $this->referentielDao->getTout($this->projet);
|
| - |
|
85 |
Debug::printr('Nbre noms :'.count($this->noms));
|
| 81 |
Debug::printr('Nbre noms :'.count($this->noms));
|
86 |
}
|
| - |
|
87 |
|
| 82 |
|
88 |
public function lancerTests() {
|
| 83 |
// Lancement des tests unitaires
|
89 |
// Lancement des tests unitaires
|
| 84 |
$resultats = array();
|
90 |
$resultats = array();
|
| 85 |
$resultats[] = $this->testerNombreDeChamps($colonnes);
|
91 |
$resultats[] = $this->testerNombreDeChamps($colonnes);
|
| 86 |
$resultats[] = $this->testerNomDesChamps($colonnes);
|
92 |
$resultats[] = $this->testerNomDesChamps($colonnes);
|
| Line 96... |
Line 102... |
| 96 |
|
102 |
|
| 97 |
$this->testerNumNomRetenuSuperieurAZero();
|
103 |
$this->testerNumNomRetenuSuperieurAZero();
|
| 98 |
$this->testerNumTaxSupEgalZeroUnique();
|
104 |
$this->testerNumTaxSupEgalZeroUnique();
|
| 99 |
$this->testerTaxSupPourTaxon();
|
105 |
$this->testerTaxSupPourTaxon();
|
| 100 |
$this->testerExitenceTaxonSuperieur();
|
106 |
$this->testerExitenceTaxonSuperieur();
|
| 101 |
$this->testerClassificationRang();
|
107 |
$this->testerClassificationRang();
|
| Line 102... |
Line 108... |
| 102 |
$this->testerClassification();
|
108 |
$this->testerClassification();
|
| Line 103... |
Line 109... |
| 103 |
|
109 |
|
| Line 1499... |
Line 1505... |
| 1499 |
}
|
1505 |
}
|
| Line 1500... |
Line 1506... |
| 1500 |
|
1506 |
|
| 1501 |
private function testerClassificationRang() {
|
1507 |
private function testerClassificationRang() {
|
| 1502 |
$info = array('nom' => 'Classification -> taxon supérieur avec rang inférieur',
|
1508 |
$info = array('nom' => 'Classification -> taxon supérieur avec rang inférieur',
|
| 1503 |
'description' => "Pour chaque enregistrement représentant un taxon, le taxon supérieur doit avoir ".
|
1509 |
'description' => "Pour chaque enregistrement représentant un taxon, le taxon supérieur doit avoir ".
|
| 1504 |
"un rang inférieur au taxon courant.",
|
1510 |
"un rang inférieur au taxon courant (à l'exception des noms ayant le rang de Clade).",
|
| Line 1505... |
Line 1511... |
| 1505 |
'resultat' => false);
|
1511 |
'resultat' => false);
|
| 1506 |
|
1512 |
|
| 1507 |
// Réalisation du test
|
1513 |
// Réalisation du test
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| 1508 |
$noms_erreur = array();
|
1514 |
$noms_erreur = array();
|
| 1509 |
foreach ($this->noms as &$nom) {
|
1515 |
foreach ($this->noms as &$nom) {
|
| 1510 |
if ($nom['num_nom_retenu'] == $nom['num_nom']) {
|
1516 |
if ($nom['num_nom_retenu'] == $nom['num_nom']) {
|
| 1511 |
if (isset($this->noms[$nom['num_tax_sup']])) {
|
1517 |
if (isset($this->noms[$nom['num_tax_sup']])) {
|
| - |
|
1518 |
$nom_sup = $this->noms[$nom['num_tax_sup']];
|
| - |
|
1519 |
if ($nom_sup['rang'] >= $nom['rang']) {
|
| 1512 |
$nom_sup = $this->noms[$nom['num_tax_sup']];
|
1520 |
// Prise en compte de l'exception des clades
|
| - |
|
1521 |
if (! ($nom_sup['rang'] == 70 && $nom['rang'] == 70)) {
|
| 1513 |
if ($nom_sup['rang'] > $nom['rang']) {
|
1522 |
$noms_erreur[] = $nom['num_nom'];
|
| 1514 |
$noms_erreur[] = $nom['num_nom'];
|
1523 |
}
|
| 1515 |
}
|
1524 |
}
|
| 1516 |
}
|
1525 |
}
|