Subversion Repositories eFlore/Applications.cel

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Rev 1914 Rev 1936
Line 1... Line 1...
1
<?php
1
<?php
2
/**
2
/**
3
* PHP Version 5
3
 * PHP Version 5
4
*
4
 *
5
* @category  PHP
5
 * @category  PHP
6
* @package   jrest
6
 * @package	  jrest
7
* @author    David Delon <david@tela-botania.org>
7
 * @author	  David Delon <david@tela-botania.org>
8
* @author    Aurélien Peronnet <aurelien@tela-botania.org>
8
 * @author	  Aurélien Peronnet <aurelien@tela-botania.org>
9
* @copyright 2010 Tela-Botanica
9
 * @copyright 2010 Tela-Botanica
10
* @license   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-fr.txt Licence CECILL
10
 * @license	  http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-fr.txt Licence CECILL
11
* @version   SVN: <svn_id>
11
 * @version	  SVN: <svn_id>
12
* @link      /doc/jrest/
12
 * @link	  /doc/jrest/
13
*/
13
 */
Line 14... Line 14...
14
 
14
 
15
/**
15
/**
16
 * 
16
 * 
17
 * La classe appelle les web service d'eflore pour éviter que le code client 
17
 * La classe appelle les web service d'eflore pour éviter que le code client 
18
 * ne soit dépendant de la version d'eflore
18
 * ne soit dépendant de la version d'eflore
19
 */
19
 */
20
class RechercheInfosTaxonBeta extends Cel {
20
class RechercheInfosTaxonBeta extends Cel {
-
 
21
 
-
 
22
	const DEBUG = FALSE;
21
	
23
 
22
	private $url_service_nom = null;
24
	private $url_service_nom = null;
23
	private $url_service_taxon = null;
25
	private $url_service_taxon = null;
Line 24... Line 26...
24
	private $url_service_chorologie = null;
26
	private $url_service_chorologie = null;
Line 28... Line 30...
28
 
30
 
29
	// initialisé à TRUE par rechercherInfosSurTexteCodeOuNumTax()
31
	// initialisé à TRUE par rechercherInfosSurTexteCodeOuNumTax()
30
	// si l'espèce passée a le motif <ref>:(nt|nn):<num>, eg: isfan:nt:1591
32
	// si l'espèce passée a le motif <ref>:(nt|nn):<num>, eg: isfan:nt:1591
Line -... Line 33...
-
 
33
	public $is_notation_spe = FALSE;
-
 
34
 
-
 
35
    // un cache utilisé pour les requêtes effectuées sur /service:eflore:0.1/bdtfx/noms?masque=
-
 
36
    // qui sont lourdes, et parfois identiques (cf cas de l'import XLS)
31
	public $is_notation_spe = FALSE;
37
    static $cache = array();
32
 
38
 
-
 
39
	public function RechercheInfosTaxonBeta($config, $code_referentiel = 'bdtfx') {
-
 
40
		parent::__construct($config);
-
 
41
        $this->setReferentiel($code_referentiel);
-
 
42
    }
33
	public function RechercheInfosTaxonBeta($config, $code_referentiel = 'bdtfx') {
43
 
34
		parent::__construct($config);
44
    public function setReferentiel($code_referentiel = 'bdtfx') {
35
		$this->code_referentiel = $code_referentiel;
45
		$this->code_referentiel = $code_referentiel;
Line 36... Line 46...
36
		$this->formaterUrlsServices($config);
46
		$this->formaterUrlsServices($this->config);
37
	}
47
	}
38
	
48
	
Line 46... Line 56...
46
	public function rechercherGenreEspeceSurPrefixe($genre = null, $espece = null) {
56
	public function rechercherGenreEspeceSurPrefixe($genre = null, $espece = null) {
Line 47... Line 57...
47
		
57
		
48
		$liste_genre_espece = array();	
58
		$liste_genre_espece = array();	
49
		$this->masque_recherche = trim(trim($genre).' '.trim($espece,' *'));
59
		$this->masque_recherche = trim(trim($genre).' '.trim($espece,' *'));
-
 
60
		$masque = urlencode($this->masque_recherche);
50
		$masque = urlencode($this->masque_recherche);
61
		if(self::DEBUG) error_log("CEL fetch: " . $this->url_service_nom.'?masque='.$masque.'&recherche=etendue&retour.format=min&navigation.limite=50&ns.structure=au');
51
		$requete = @file_get_contents($this->url_service_nom.'?masque='.$masque.'&recherche=etendue&retour.format=min&navigation.limite=50&ns.structure=au');
62
		$requete = @file_get_contents($this->url_service_nom.'?masque='.$masque.'&recherche=etendue&retour.format=min&navigation.limite=50&ns.structure=au');
52
		if($requete != '') {
63
		if($requete != '') {
53
			$requete = json_decode($requete);		
64
			$requete = json_decode($requete);		
54
			if(is_object($requete) && isset($requete->resultat)) {
65
			if(is_object($requete) && isset($requete->resultat)) {
Line 74... Line 85...
74
	
85
	
75
	public function effectuerRequeteInfosComplementairesEtFormaterNom($numNom) {
86
	public function effectuerRequeteInfosComplementairesEtFormaterNom($numNom) {
76
		$resultat_infos_complementaires = (array)$this->effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($numNom);
87
		$resultat_infos_complementaires = (array)$this->effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($numNom);
77
		$retour_infos_complementaires = array();
88
		$retour_infos_complementaires = array();
78
		if (isset($resultat_infos_complementaires['nom_retenu_complet']) && $resultat_infos_complementaires['nom_retenu_complet']) {
89
		if (isset($resultat_infos_complementaires['nom_retenu_complet']) && $resultat_infos_complementaires['nom_retenu_complet']) {
79
           	$retour_infos_complementaires=array((self::supprimerBiblio($resultat_infos_complementaires['nom_retenu_complet'])));
90
			$retour_infos_complementaires=array((self::supprimerBiblio($resultat_infos_complementaires['nom_retenu_complet'])));
Line 80... Line 91...
80
	    }
91
		}
81
		
92
		
Line 82... Line 93...
82
		return $retour_infos_complementaires;
93
		return $retour_infos_complementaires;
Line 103... Line 114...
103
		
114
		
104
		return $liste_genre_espece;
115
		return $liste_genre_espece;
Line 105... Line 116...
105
	}
116
	}
-
 
117
	
106
	
118
	private function effectuerRequeteUrlRecherche($nom_saisi, $mode = 'stricte') {
107
	private function effectuerRequeteUrlRecherche($nom_saisi, $mode = 'stricte') {
119
        $url = sprintf(
108
		$res = @json_decode(file_get_contents(sprintf('%1$s?masque=%2$s&recherche=%3$s&ns.format=txt&retour.champs=%4$s&navigation.limite=1',
120
            '%1$s?masque=%2$s&recherche=%3$s&ns.format=txt&retour.champs=%4$s&navigation.limite=1',
109
													  $this->url_service_nom,
121
            $this->url_service_nom,
110
													  urlencode($nom_saisi),
122
            urlencode($nom_saisi),
-
 
123
            $mode,
-
 
124
            implode(',', array("id","nom_sci","auteur","nom_retenu.id","famille","num_taxonomique","nom_retenu_complet")));
-
 
125
 
-
 
126
		if(! array_key_exists($url, self::$cache)) {
-
 
127
            if(self::DEBUG) error_log("CEL fetch: " . $url);
-
 
128
            $res = @json_decode(file_get_contents($url));
-
 
129
            self::$cache[$url] = $res;
-
 
130
        } else {
111
													  $mode,
131
            $res = self::$cache[$url];
112
													  implode(',', array("id","nom_sci","auteur","nom_retenu.id","famille","num_taxonomique","nom_retenu_complet")))));
132
        }
113
		if(!$res) return NULL;
133
		if(!$res) return NULL;
114
		$resultat = (array)$res->resultat;
134
		$resultat = (array)$res->resultat;
Line 115... Line 135...
115
		return array_pop($resultat);
135
		return array_pop($resultat);
116
	}
136
	}
117
	
137
	
118
	static function supprimerAuteur($nom_saisi) {
138
	static function supprimerAuteur($nom_saisi) {
119
		// TODO: gérer les hybrides
139
		// TODO: gérer les hybrides
120
		if(self::estUnHybride($nom_saisi) || self::estUneFormuleHybridite($nom_saisi)) {
140
		if(self::estUnHybride($nom_saisi) || self::estUneFormuleHybridite($nom_saisi)) {
121
			$nom_decoupe = explode(' ', $nom_saisi);
141
			$nom_decoupe = explode(' ', $nom_saisi);
122
			$derniere_position_hybride = end(array_keys($nom_decoupe, 'x'));
142
			$derniere_position_hybride = array_keys($nom_decoupe, 'x');
123
			$nom_saisi_sans_auteur = implode(' ',array_slice($nom_decoupe, 0, $derniere_position_hybride + 2));
143
			$nom_saisi_sans_auteur = implode(' ',array_slice($nom_decoupe, 0, end($derniere_position_hybride) + 2));
124
		} else {
144
		} else {
125
			/* Attention le parseur de nom n'est pas fiable à 100%
145
			/* Attention le parseur de nom n'est pas fiable à 100%
Line 141... Line 161...
141
		return strpos($nom_saisi,'x ') === 0;
161
		return strpos($nom_saisi,'x ') === 0;
142
	}
162
	}
Line 143... Line 163...
143
	
163
	
144
	public function effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($num_nom, $ref = NULL) {
164
	public function effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($num_nom, $ref = NULL) {
-
 
165
		if($ref && isset($this->config['eflore']['api_host'])) {
145
		if($ref && isset($this->config['eflore']['api_host'])) {
166
			if(self::DEBUG) error_log("CEL fetch: " .$this->config['eflore']['api_host'] . '/');
146
			return @json_decode(file_get_contents($this->config['eflore']['api_host'] . '/' .
167
			return @json_decode(file_get_contents($this->config['eflore']['api_host'] . '/' .
147
												  $ref . '/' .
168
			$ref . '/' .
148
												  'noms' . '/' .
169
			'noms' . '/' .
149
												  $num_nom .
170
			$num_nom .
150
												  '?retour.champs=' . implode(',', array('nom_sci,auteur',
171
			'?retour.champs=' . implode(',', array('nom_sci,auteur',
151
																								  'id',
172
			'id',
152
																								  'nom_retenu_complet',
173
			'nom_retenu_complet',
153
																								  'nom_retenu.id',
174
			'nom_retenu.id',
154
																								  'num_taxonomique',
175
			'num_taxonomique',
155
																								  'famille'))));
176
			'famille'))));
156
		}
177
		}
-
 
178
		// XXX: compat
157
		// XXX: compat
179
		if(self::DEBUG) error_log("CEL fetch: " . $this->url_service_nom.'/'.$num_nom.'?retour.champs=nom_sci,auteur,id,nom_retenu_complet,nom_retenu.id,num_taxonomique,famille');
158
		return @json_decode(file_get_contents($this->url_service_nom.'/'.$num_nom.'?retour.champs=nom_sci,auteur,id,nom_retenu_complet,nom_retenu.id,num_taxonomique,famille'));
180
		return @json_decode(file_get_contents($this->url_service_nom.'/'.$num_nom.'?retour.champs=nom_sci,auteur,id,nom_retenu_complet,nom_retenu.id,num_taxonomique,famille'));
Line 159... Line 181...
159
	}
181
	}
160
 
182
 
161
	static function supprimerBiblio($nom) {
183
	static function supprimerBiblio($nom) {
Line 162... Line 184...
162
		return trim(preg_replace('/ \[.*\]/','',$nom));
184
		return trim(preg_replace('/ \[.*\]/','',$nom));
163
	}
185
	}
164
	
186
	
-
 
187
	public function rechercherNumTaxSurNumNom($num_nom) {
165
	public function rechercherNumTaxSurNumNom($num_nom) {
188
		$nt = null;
166
		$nt = null;
189
		$url = $this->url_service_nom."/".$num_nom.'?retour.champs=num_taxonomique';
167
		$url = $this->url_service_nom."/".$num_nom.'?retour.champs=num_taxonomique';
190
		if(self::DEBUG) error_log("CEL fetch: $url");
168
		$resultat = @file_get_contents($url);
191
		$resultat = @file_get_contents($url);
169
		if($resultat != '') {
192
		if($resultat != '') {
Line 175... Line 198...
175
	}
198
	}
Line 176... Line 199...
176
	
199
	
177
	public function taxonEstPresentDansDepartement($num_taxon,$code_departement) {
200
	public function taxonEstPresentDansDepartement($num_taxon,$code_departement) {
178
		$presence_taxon = false;
201
		$presence_taxon = false;
-
 
202
		$url = $this->url_service_chorologie_obs.'?masque.departement='.$code_departement.'&masque.determination.nt='.$num_taxon.'&navigation.limite=1';
179
		$url = $this->url_service_chorologie_obs.'?masque.departement='.$code_departement.'&masque.determination.nt='.$num_taxon.'&navigation.limite=1';
203
		if(self::DEBUG) error_log("CEL fetch: $url");
180
		$resultat = @file_get_contents($url);
204
		$resultat = @file_get_contents($url);
181
		if($resultat != '') {
205
		if($resultat != '') {
182
			$resultat = json_decode($resultat);
206
			$resultat = json_decode($resultat);
183
			if(is_object($resultat) && isset($resultat->resultat) && count($resultat->resultat) > 0) {
207
			if(is_object($resultat) && isset($resultat->resultat) && count($resultat->resultat) > 0) {
Line 209... Line 233...
209
				$obj = $this->effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($num, $ref);
233
				$obj = $this->effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($num, $ref);
210
			}
234
			}
211
			// Numero taxonomique
235
			// Numero taxonomique
212
			else {
236
			else {
213
				//TODO: retourner moins de champs grâce au paramètre retour.champs
237
				//TODO: retourner moins de champs grâce au paramètre retour.champs
-
 
238
				if(self::DEBUG) error_log("CEL fetch: " . $this->url_service_taxon."/nt:".$num);
214
				$obj = @json_decode(file_get_contents($this->url_service_taxon."/nt:".$num));
239
				$obj = @json_decode(file_get_contents($this->url_service_taxon."/nt:".$num));
215
			}
240
			}
216
			if($obj) $obj->ref = $ref;
241
			if($obj) $obj->ref = $ref;
217
			return $obj;
242
			return $obj;
218
		}
243
		}
Line 221... Line 246...
221
		return $this->rechercherInformationsComplementairesSurNom($identifiant_espece);
246
		return $this->rechercherInformationsComplementairesSurNom($identifiant_espece);
222
	}
247
	}
Line 223... Line 248...
223
	
248
	
224
	public function rechercherSynonymesSurNumNom($num_nom) {
249
	public function rechercherSynonymesSurNumNom($num_nom) {
-
 
250
		$retour = array();
225
		$retour = array();
251
		if(self::DEBUG) error_log("CEL fetch: " . $this->url_service_nom.'/'.$num_nom.'/relations/synonymie/?retour.format=min');
226
		$resultat = @file_get_contents($this->url_service_nom.'/'.$num_nom.'/relations/synonymie/?retour.format=min');
252
		$resultat = @file_get_contents($this->url_service_nom.'/'.$num_nom.'/relations/synonymie/?retour.format=min');
227
		if($resultat != '') {
253
		if($resultat != '') {
228
			$resultat = json_decode($resultat);
254
			$resultat = json_decode($resultat);
229
			if(is_object($resultat) && isset($resultat->resultat) && count($resultat->resultat) > 0) {
255
			if(is_object($resultat) && isset($resultat->resultat) && count($resultat->resultat) > 0) {
230
				$retour = $resultat->resultat;
256
				$retour = $resultat->resultat;
231
			}
257
			}
232
		}
258
		}
233
		return $retour;
259
		return $retour;
234
	}
260
	}
235
}
-
 
236
?>
261
}