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Rev 1425 Rev 1426
Line 65... Line 65...
65 
		$masque = ((isset($nom_decoupe['genus']) && $nom_decoupe['genus']!= '') &&
65 
		$masque = ((isset($nom_decoupe['genus']) && $nom_decoupe['genus']!= '') &&
66 
				  (isset($nom_decoupe['species']) && $nom_decoupe['species']!= ''))
 66 
				  (isset($nom_decoupe['species']) && $nom_decoupe['species']!= ''))
67 
				  ? $nom_decoupe['genus'].' '.$nom_decoupe['species'] : $nom_saisi;
 67 
				  ? $nom_decoupe['genus'].' '.$nom_decoupe['species'] : $nom_saisi;
Line 68... Line 68...
68
68
69 
		$liste_genre_espece = array();
 69 
		$liste_genre_espece = array();
- 
 
 70 
		$url = 'http://www.tela-botanica.org/service:eflore:0.1/bdtfx/noms?masque='.urlencode($nom_decoupe['genus'].' '.$nom_decoupe['species']).'&recherche=etendue&ns.format=txt&retour.champs=nom_retenu,nom_retenu.*,num_taxonomique,auteur&navigation.limite=1';
70 
		$url = 'http://www.tela-botanica.org/service:eflore:0.1/bdtfx/noms?masque='.urlencode($nom_decoupe['genus'].' '.$nom_decoupe['species']).'&recherche=etendue&ns.format=txt&retour.champs=nom_retenu,nom_retenu.*,num_taxonomique,auteur&navigation.limite=3000';
 71 
 
71 
		$resultat = @file_get_contents($url);
 72 
		$resultat = @file_get_contents($url);
72 
		if($resultat != '') {
 73 
		if($resultat != '') {
73 
			$resultat = json_decode($resultat);
 74 
			$resultat = json_decode($resultat);
74 
			if(is_object($resultat) && isset($resultat->resultat)) {
 75 
			if(is_object($resultat) && isset($resultat->resultat)) {
Line 141... Line 142...
141 
		return $presence_taxon;
 142 
		return $presence_taxon;
142 
	}
 143 
	}
Line 143... Line 144...
143
144
Line 144... Line -...
144 
	public function effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumTax($numTax) {
 - 
 
145
- 
 
146 
		$requete_infos_complementaires = "SELECT DISTINCT en_nom_genre, en_epithete_espece, en_nom_supra_generique, en_epithete_infra_generique,".
 - 
 
147 
                    "   auteur_bex.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_basio_ex ".
 - 
 
148 
                    " , auteur_b.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_basio ".
 - 
 
149 
                    " , auteur_mex.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_modif_ex ".
 - 
 
150 
                    " , auteur_m.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_modif ".
 - 
 
151 
                    " , en_epithete_espece, en_epithete_infra_specifique, enrg_abreviation_rang, en_id_nom" .
 - 
 
152 
                    " FROM eflore_nom, eflore_nom_rang," .
 - 
 
153 
                    "     eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_bex ".
 - 
 
154 
                    "   , eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_b ".
 - 
 
155 
                    "   , eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_mex ".
 - 
 
156 
                    "   , eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_m ".
 - 
 
157 
                    " , eflore_selection_nom ".
 - 
 
158 
                    " WHERE esn_id_taxon = '".$numTax. "'".
 - 
 
159 
                    " AND esn_id_version_projet_taxon = 25 ".
 - 
 
160 
                    " AND esn_ce_statut=3 ".
 - 
 
161 
                    " AND en_id_nom = esn_id_nom" .
 - 
 
162 
                    " AND en_ce_rang = enrg_id_rang" .
 - 
 
163 
                    " AND en_ce_auteur_basio_ex = auteur_bex.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege ".
 - 
 
164 
                    " AND en_ce_auteur_basio = auteur_b.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege  ".
 - 
 
165 
                    " AND en_ce_auteur_modif_ex = auteur_mex.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege ".
 - 
 
166 
                    " AND en_ce_auteur_modif = auteur_m.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege ".
 - 
 
167 
                    " AND esn_id_version_projet_taxon=en_id_version_projet_nom ";
 - 
 
168
- 
 
169 
		$resultat_infos_complementaires = $this->executerRequete($requete_infos_complementaires);
 - 
 
170
- 
 
171 
		return $resultat_infos_complementaires;
 - 
 
172 
	}
 - 
 
173
- 
 
174 
	public function rechercherFamille($taxon) {
 145 
	public function effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumTax($numTax) {
175
- 
 
176 
		$row = array();
 146
177
- 
 
178 
		$requete_famille = "SELECT DISTINCT en_ce_rang, etr_id_taxon_2, en_id_nom, en_nom_supra_generique ".
 - 
 
179 
		" FROM eflore_taxon_relation, ".
 - 
 
180 
		" eflore_selection_nom, ".
 - 
 
181 
		" eflore_nom ".
 147 
		$infos = array();
182 
		" WHERE etr_id_taxon_1 = ".$taxon.
 148 
		//TODO: retourner moins de champs grâce au paramètre retour.champs
183 
		" AND etr_id_version_projet_taxon_1 = 25 ".
 - 
 
184 
		" AND etr_id_categorie_taxon = 3 ".
 - 
 
185 
		" AND etr_id_valeur_taxon = 3 ".
 149 
		$url = "http://www.tela-botanica.org/service:eflore:0.1/bdtfx/taxons/nt:".$numTax;
186 
		" AND esn_id_taxon =  etr_id_taxon_2 ".
 - 
 
187 
		" AND esn_ce_statut = 3 ".
 150 
		$resultat = @file_get_contents($url);
188 
		" AND esn_id_version_projet_taxon = etr_id_version_projet_taxon_1 ".
 - 
 
189 
		" AND en_id_nom = esn_id_nom ".
 - 
 
190 
		" AND esn_id_version_projet_taxon=en_id_version_projet_nom  ";
 - 
 
191
- 
 
192 
		$resultat_recherche_famille = $this->executerRequete($requete_famille);
 - 
 
193
- 
 
194 
		if (!is_array($resultat_recherche_famille) || count($resultat_recherche_famille) == 0) {
- 
 
195 
	    	$resultat_recherche_famille = array('en_ce_rang' => 'fin');
 - 
 
196 
	    } else {
 151 
		if($resultat != '') {
197 
	    	$resultat_recherche_famille = $resultat_recherche_famille[0];
 152 
			$infos = json_decode($resultat);
198 
	    }
 153 
		}
199
154 
 
Line 200... Line 155...
200 
		return $resultat_recherche_famille;
 155 
		return $infos;
201 
	}
 156 
	}
202
157
Line 237... Line 192...
237 
		}
 192 
		}
Line 238... Line 193...
238
193
239 
		return $retour;
 194 
		return $retour;
Line 240... Line -...
240 
	}
 - 
 
241
- 
 
242 
	private function formaterNom($rawnom) {
 - 
 
243 
 
 - 
 
244 
        // Constitution du nom:
 - 
 
245 
        $nom = '';
 - 
 
246 
 
 - 
 
247 
        if (isset($rawnom['en_nom_supra_generique']) && $rawnom['en_nom_supra_generique'] != '') {
 - 
 
248 
            $nom .= $rawnom['en_nom_supra_generique'];
 - 
 
249 
        } else if (isset($rawnom['en_epithete_infra_generique']) && $rawnom['en_epithete_infra_generique'] != '') {
 - 
 
250 
            $nom .= $rawnom['en_epithete_infra_generique'];
 - 
 
251 
        } else {
 - 
 
252 
            if (isset($rawnom['en_nom_genre']) &&  $rawnom['en_nom_genre'] != '') {
 - 
 
253 
                $nom .=  $rawnom['en_nom_genre'];
 - 
 
254 
            }
 - 
 
255 
            if (isset($rawnom['en_epithete_espece']) &&  $rawnom['en_epithete_espece']!= '') {
 - 
 
256 
                $nom .= ' '.$rawnom['en_epithete_espece'];
 - 
 
257 
            }
 - 
 
258 
            if (isset($rawnom['en_epithete_infra_specifique']) &&  $rawnom['en_epithete_infra_specifique'] != '') {
 - 
 
259 
                if (!empty($rawnom['enrg_abreviation_rang'])) {
 - 
 
260 
                        $nom .= ' '.$rawnom['enrg_abreviation_rang'].'';
 - 
 
261 
                }
 - 
 
262 
                $nom .= ' '.$rawnom['en_epithete_infra_specifique'];
 - 
 
263 
            }
 - 
 
264 
        }
 - 
 
265 
 
 - 
 
266 
        return $nom.$this->retournerAuteur($rawnom) ;
 - 
 
267 
 	}
 - 
 
268 
 
 - 
 
269 
	private function retournerAuteur($rawnom) {
 - 
 
270 
		$auteurs = '';
 - 
 
271 
		$auteur_basio = '';
 - 
 
272 
		$auteur_modif = '';
 - 
 
273 
		if (!empty($rawnom['abreviation_auteur_basio_ex']) && $rawnom['abreviation_auteur_basio_ex']!='-' )  {
 - 
 
274 
		    $auteur_basio .= $rawnom['abreviation_auteur_basio_ex'];
 - 
 
275 
		    if (!empty($rawnom['abreviation_auteur_basio']) && $rawnom['abreviation_auteur_basio']!='-') {
 - 
 
276 
		        $auteur_basio .= ' ex '.$rawnom['abreviation_auteur_basio'];
 - 
 
277 
		    }
 - 
 
278 
		} else if (!empty($rawnom['abreviation_auteur_basio']) && $rawnom['abreviation_auteur_basio']!='-') {
 - 
 
279 
		    $auteur_basio .= $rawnom['abreviation_auteur_basio'];
 - 
 
280 
		}
 - 
 
281 
 
 - 
 
282 
		if (!empty($rawnom['abreviation_auteur_modif_ex']) && $rawnom['abreviation_auteur_modif_ex']!='-') {
 - 
 
283 
		    $auteur_modif .= $rawnom['abreviation_auteur_modif_ex'];
 - 
 
284 
		    if (!empty($rawnom['abreviation_auteur_modif']) && $rawnom['abreviation_auteur_modif']!='-') {
 - 
 
285 
		        $auteur_modif .= ' ex '.$rawnom['abreviation_auteur_modif'];
 - 
 
286 
		    }
 - 
 
287 
		} else if (!empty($rawnom['abreviation_auteur_modif']) && $rawnom['abreviation_auteur_modif']!='-')  {
 - 
 
288 
		    $auteur_modif .= $rawnom['abreviation_auteur_modif'];
 - 
 
289 
		}
 - 
 
290 
 
 - 
 
291 
		if (!empty($auteur_modif)) {
 - 
 
292 
		    $auteurs = ' ('.$auteur_basio.') '.$auteur_modif;
 - 
 
293 
		} elseif (!empty($auteur_basio)) {
 - 
 
294 
		    $auteurs = ' '.$auteur_basio;
 - 
 
295 
		}
 - 
 
296 
 
 - 
 
297 
		return $auteurs ;
 - 
 
298 
	}
 195 
	}
299
196
300 
	function rechercherInfosSurTexteCodeOuNumTax($identifiant_espece) {
 197 
	function rechercherInfosSurTexteCodeOuNumTax($identifiant_espece) {
301 
		// texte libre, nom scientifique,
198 
		// texte libre, nom scientifique,
302 
		// ou code nomenclatural (format BDNFFnn999999)
199 
		// ou code nomenclatural (format BDNFFnn999999)
303 
		// ou code taxonomique (format BDNFFnt999999)
 200 
		// ou code taxonomique (format BDNFFnt999999)
304 
		$identifiant_espece=trim($identifiant_espece);
 201 
		$identifiant_espece=trim($identifiant_espece);
305 
		$identifiant_espece=utf8_encode($identifiant_espece);
 202 
		$identifiant_espece=utf8_encode($identifiant_espece);
Line 306... Line 203...
306
203
307 
		$retour = array();
 204 
		$retour = array();
308
205
309 
		preg_match('/BDNFFnn([0-9][0-9]*)/',$identifiant_espece, $elements);
 206 
		preg_match('/BDNFFnn([0-9][0-9]*)/',$identifiant_espece, $elements);
310 
		if (isset($elements[1])) {
 207 
		if (isset($elements[1])) {
311 
			// Numero nomenclatural
 208 
			// Numero nomenclatural
312 
			$infos_taxon = $this->rechercherInformationsComplementairesSurNumNom($elements[1]);
 209 
			$infos_taxon = $this->rechercherInformationsComplementairesSurNumNom($elements[1]);
313 
			$retour = array("nom_sel" => $this->formaterNom($infos_taxon), "en_id_nom" => $elements[1]);
 210 
			$retour = array("nom_sel" => $infos_taxon['Nom_Retenu'], "en_id_nom" => $elements[1]);
314 
		} else {
- 
 
315 
			//  Numero taxonomique ou nom scientifique
 211 
		} else {
316 
			preg_match('/BDNFFnt([0-9][0-9]*)/', $identifiant_espece, $elements);
 212 
			//  Numero taxonomique ou nom scientifique
317
213 
			preg_match('/BDNFFnt([0-9][0-9]*)/', $identifiant_espece, $elements);
- 
 
 214 
			if (isset($elements[1])) {
318 
			if (isset($elements[1])) {
 215 
				// Numero taxonomique
319 
				// Numero taxonomique
 216 
				$infos_taxon = (array)$this->effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumTax($elements[1]);
- 
 
 217 
				if(isset($infos_taxon['nom_retenu.libelle']) && isset($infos_taxon['id'])) {
- 
 
 218 
					$nom = $infos_taxon['nom_retenu.libelle'];
- 
 
 219 
					$nom .= (isset($infos_taxon['auteur'])) ? ' '.$infos_taxon['auteur'] : '';
320 
				$infos_taxon = $this->effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumTax($elements[1]);
 220 
					$retour = array("nom_sel" => $nom,
321 
				$infos_taxon = $infos_taxon[0];
 221 
									"en_id_nom" => $infos_taxon['id']);
322 
				$retour = array("nom_sel" => $this->formaterNom($infos_taxon), "en_id_nom" => $infos_taxon['en_id_nom']);
 222 
				}
323 
			} else {
223 
			} else {
324 
				// Nom scientifique
 224 
				// Nom scientifique
325 
				$id_nom = $this->decouperNomEtRechercheEspeceOuSousEspece($identifiant_espece);
225 
				$id_nom = $this->rechercherInformationsComplementairesSurNom($identifiant_espece);
- 
 
 226 
				// Recherche du nom associe
326 
				// Recherche du nom associe
 227 
				$retour = array("nom_sel" => $identifiant_espece);
327 
				$retour = array("nom_sel" => $identifiant_espece);
 228 
				if(is_array($id_nom) && count($id_nom) > 0 && isset($id_nom[0][0])) {
328 
				if(is_array($id_nom) && isset($id_nom['en_id_nom'])) {
 - 
 
329 
					$infos_nom = $this->effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($id_nom['en_id_nom']);
 229 
					$nn = $id_nom[0][0];
330 
					if (is_array($infos_nom) && !empty($infos_nom)) {
 230 
					$infos_nom = (array)$this->effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($nn);
331 
						$infos_nom = $infos_nom[0];
 231 
					if (is_array($infos_nom) && !empty($infos_nom)) {
332 
						$retour = array("nom_sel" => $this->formaterNom($infos_nom), "en_id_nom" => $id_nom['en_id_nom']);
 232 
						$retour = array("nom_sel" => $infos_nom['nom_sci'].' '.$infos_nom['auteur'], "en_id_nom" => $infos_nom['id']);
333 
					}
 233 
					}