| Line 17... |
Line 17... |
| 17 |
* La classe appelle les web service d'eflore pour éviter que le code client
|
17 |
* La classe appelle les web service d'eflore pour éviter que le code client
|
| 18 |
* ne soit dépendant de la version d'eflore
|
18 |
* ne soit dépendant de la version d'eflore
|
| 19 |
*/
|
19 |
*/
|
| 20 |
class RechercheInfosTaxonBeta extends Cel {
|
20 |
class RechercheInfosTaxonBeta extends Cel {
|
| Line -... |
Line 21... |
| - |
|
21 |
|
| - |
|
22 |
private $url_service_nom = null;
|
| - |
|
23 |
private $url_service_taxon = null;
|
| - |
|
24 |
private $url_service_chorologie = null;
|
| 21 |
|
25 |
|
| 22 |
public function RechercheInfosTaxonBeta($config) {
|
26 |
public function RechercheInfosTaxonBeta($config) {
|
| - |
|
27 |
parent::__construct($config);
|
| - |
|
28 |
$this->url_service_nom = $config['eflore']['url_service_nom'];
|
| - |
|
29 |
$this->url_service_taxon = $config['eflore']['url_service_taxon'];
|
| 23 |
parent::__construct($config);
|
30 |
$this->url_service_chorologie_obs = $config['eflore']['url_service_chorologie_obs'];
|
| Line 24... |
Line 31... |
| 24 |
}
|
31 |
}
|
| Line 25... |
Line 32... |
| 25 |
|
32 |
|
| 26 |
public function rechercherGenreEspeceSurPrefixe($genre = null, $espece = null) {
|
33 |
public function rechercherGenreEspeceSurPrefixe($genre = null, $espece = null) {
|
| 27 |
|
34 |
|
| Line 28... |
Line 35... |
| 28 |
$liste_genre_espece = array();
|
35 |
$liste_genre_espece = array();
|
| 29 |
$masque = urlencode(trim(trim($genre).' '.trim($espece,' *')));
|
36 |
$masque = urlencode(trim(trim($genre).' '.trim($espece,' *')));
|
| 30 |
$requete = @file_get_contents('http://localhost/service:eflore:0.1/bdtfx/noms?masque='.$masque.'&recherche=etendue&retour.format=min&navigation.limite=50&ns.structure=au');
|
37 |
$requete = @file_get_contents($this->url_service_nom.'?masque='.$masque.'&recherche=etendue&retour.format=min&navigation.limite=50&ns.structure=au');
|
| 31 |
|
38 |
|
| 32 |
if($requete != '') {
|
39 |
if($requete != '') {
|
| 33 |
$requete = json_decode($requete);
|
40 |
$requete = json_decode($requete);
|
| 34 |
if(is_object($requete) && isset($requete->resultat)) {
|
41 |
if(is_object($requete) && isset($requete->resultat)) {
|
| 35 |
foreach ($requete->resultat as $id => $res) {
|
42 |
foreach ($requete->resultat as $id => $res) {
|
| 36 |
$retenu = $res->retenu == true ? '3' : '';
|
43 |
$retenu = ($res->retenu == "true") ? '3' : '4';
|
| 37 |
$liste_genre_espece[] = array($res->nom_sci_complet, $id, $retenu);
|
44 |
$liste_genre_espece[] = array($res->nom_sci_complet, $id, $retenu);
|
| 38 |
}
|
45 |
}
|
| 39 |
}
|
46 |
}
|
| Line 40... |
Line 47... |
| 40 |
usort($liste_genre_espece, array($this, 'comparerParNom'));
|
47 |
usort($liste_genre_espece, array($this, 'comparerParRetenuPuisNom'));
|
| - |
|
48 |
}
|
| - |
|
49 |
return $liste_genre_espece;
|
| - |
|
50 |
}
|
| - |
|
51 |
|
| - |
|
52 |
function comparerParRetenuPuisNom($a, $b) {
|
| 41 |
}
|
53 |
if($a[2] == 3 && $b[2] != 3) {
|
| - |
|
54 |
return -1;
|
| 42 |
return $liste_genre_espece;
|
55 |
} elseif($a[2] != 3 && $b[2] == 3) {
|
| Line 43... |
Line 56... |
| 43 |
}
|
56 |
return 1;
|
| Line 44... |
Line 57... |
| 44 |
|
57 |
} else {
|
| Line 65... |
Line 78... |
| 65 |
$masque = ((isset($nom_decoupe['genus']) && $nom_decoupe['genus']!= '') &&
|
78 |
$masque = ((isset($nom_decoupe['genus']) && $nom_decoupe['genus']!= '') &&
|
| 66 |
(isset($nom_decoupe['species']) && $nom_decoupe['species']!= ''))
|
79 |
(isset($nom_decoupe['species']) && $nom_decoupe['species']!= ''))
|
| 67 |
? $nom_decoupe['genus'].' '.$nom_decoupe['species'] : $nom_saisi;
|
80 |
? $nom_decoupe['genus'].' '.$nom_decoupe['species'] : $nom_saisi;
|
| Line 68... |
Line 81... |
| 68 |
|
81 |
|
| 69 |
$liste_genre_espece = array();
|
82 |
$liste_genre_espece = array();
|
| Line 70... |
Line 83... |
| 70 |
$url = 'http://www.tela-botanica.org/service:eflore:0.1/bdtfx/noms?masque='.urlencode($nom_decoupe['genus'].' '.$nom_decoupe['species']).'&recherche=etendue&ns.format=txt&retour.champs=nom_retenu,nom_retenu.*,num_taxonomique,auteur&navigation.limite=1';
|
83 |
$url = $this->url_service_nom.'?masque='.urlencode($nom_decoupe['genus'].' '.$nom_decoupe['species']).'&recherche=etendue&ns.format=txt&retour.champs=nom_retenu,nom_retenu.*,num_taxonomique,auteur&navigation.limite=1';
|
| 71 |
|
84 |
|
| 72 |
$resultat = @file_get_contents($url);
|
85 |
$resultat = @file_get_contents($url);
|
| 73 |
if($resultat != '') {
|
86 |
if($resultat != '') {
|
| Line 92... |
Line 105... |
| 92 |
}
|
105 |
}
|
| Line 93... |
Line 106... |
| 93 |
|
106 |
|
| 94 |
public function effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($num_nom) {
|
107 |
public function effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($num_nom) {
|
| 95 |
$infos = array();
|
108 |
$infos = array();
|
| 96 |
//TODO: retourner moins de champs grâce au paramètre retour.champs
|
109 |
//TODO: retourner moins de champs grâce au paramètre retour.champs
|
| 97 |
$url = "http://www.tela-botanica.org/service:eflore:0.1/bdtfx/noms/".$num_nom;
|
110 |
$url = $this->url_service_nom.'/'.$num_nom;
|
| 98 |
$resultat = @file_get_contents($url);
|
111 |
$resultat = @file_get_contents($url);
|
| 99 |
if($resultat != '') {
|
112 |
if($resultat != '') {
|
| 100 |
$infos = json_decode($resultat);
|
113 |
$infos = json_decode($resultat);
|
| 101 |
}
|
114 |
}
|
| Line 117... |
Line 130... |
| 117 |
}
|
130 |
}
|
| Line 118... |
Line 131... |
| 118 |
|
131 |
|
| Line 119... |
Line 132... |
| 119 |
public function rechercherNumTaxSurNumNom($num_nom) {
|
132 |
public function rechercherNumTaxSurNumNom($num_nom) {
|
| 120 |
|
133 |
|
| 121 |
$nt = null;
|
134 |
$nt = null;
|
| 122 |
$url = "http://www.tela-botanica.org/service:eflore:0.1/bdtfx/noms/".$num_nom.'?retour.champs=num_taxonomique';
|
135 |
$url = $this->url_service_nom."/".$num_nom.'?retour.champs=num_taxonomique';
|
| 123 |
$resultat = @file_get_contents($url);
|
136 |
$resultat = @file_get_contents($url);
|
| 124 |
if($resultat != '') {
|
137 |
if($resultat != '') {
|
| 125 |
$infos = json_decode($resultat);
|
138 |
$infos = json_decode($resultat);
|
| Line 129... |
Line 142... |
| 129 |
return $nt;
|
142 |
return $nt;
|
| 130 |
}
|
143 |
}
|
| Line 131... |
Line 144... |
| 131 |
|
144 |
|
| 132 |
public function taxonEstPresentDansDepartement($num_taxon,$code_departement) {
|
145 |
public function taxonEstPresentDansDepartement($num_taxon,$code_departement) {
|
| 133 |
$presence_taxon = false;
|
146 |
$presence_taxon = false;
|
| 134 |
$url = 'http://localhost/service:eflore:0.1/chorodep/observations/?masque.departement='.$code_departement.'&masque.determination.nt='.$num_taxon.'&navigation.limite=1';
|
147 |
$url = $this->url_service_chorologie_obs.'?masque.departement='.$code_departement.'&masque.determination.nt='.$num_taxon.'&navigation.limite=1';
|
| 135 |
$resultat = @file_get_contents($url);
|
148 |
$resultat = @file_get_contents($url);
|
| 136 |
if($resultat != '') {
|
149 |
if($resultat != '') {
|
| 137 |
$resultat = json_decode($resultat);
|
150 |
$resultat = json_decode($resultat);
|
| 138 |
if(is_object($resultat) && isset($resultat->resultat) && count($resultat->resultat) > 0) {
|
151 |
if(is_object($resultat) && isset($resultat->resultat) && count($resultat->resultat) > 0) {
|
| Line 144... |
Line 157... |
| 144 |
|
157 |
|
| Line 145... |
Line 158... |
| 145 |
public function effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumTax($numTax) {
|
158 |
public function effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumTax($numTax) {
|
| 146 |
|
159 |
|
| 147 |
$infos = array();
|
160 |
$infos = array();
|
| 148 |
//TODO: retourner moins de champs grâce au paramètre retour.champs
|
161 |
//TODO: retourner moins de champs grâce au paramètre retour.champs
|
| 149 |
$url = "http://www.tela-botanica.org/service:eflore:0.1/bdtfx/taxons/nt:".$numTax;
|
162 |
$url = $this->url_service_taxon."/nt:".$numTax;
|
| 150 |
$resultat = @file_get_contents($url);
|
163 |
$resultat = @file_get_contents($url);
|
| 151 |
if($resultat != '') {
|
164 |
if($resultat != '') {
|
| Line 152... |
Line 165... |
| 152 |
$infos = json_decode($resultat);
|
165 |
$infos = json_decode($resultat);
|
| 153 |
}
|
166 |
}
|
| Line 154... |
Line -... |
| 154 |
|
- |
|
| 155 |
return $infos;
|
- |
|
| 156 |
}
|
- |
|
| 157 |
|
- |
|
| 158 |
private function decouperNomEtRechercheEspeceOuSousEspece($identifiant_espece) {
|
- |
|
| 159 |
$nameparser=new NameParser();
|
- |
|
| 160 |
$nom_latin_decoupe=$nameparser->parse($identifiant_espece);
|
- |
|
| 161 |
// requete sous espece (on privilegie les noms retenu cf tri par esn_ce_statut)
|
- |
|
| 162 |
if (isset($nom_latin_decoupe['infra']) && $nom_latin_decoupe['infra']!="") {
|
- |
|
| 163 |
$requete="SELECT DISTINCT en_id_nom, esn_ce_statut" .
|
- |
|
| 164 |
" FROM eflore_nom, eflore_nom_rang, eflore_selection_nom " .
|
- |
|
| 165 |
" WHERE en_id_version_projet_nom = '25' AND en_nom_genre = ".$this->proteger($nom_latin_decoupe['genus'])." " .
|
- |
|
| 166 |
" AND enrg_abreviation_rang = ".$this->proteger($nom_latin_decoupe['infra_type'])." " .
|
- |
|
| 167 |
" AND en_epithete_infra_specifique = ".$this->proteger($nom_latin_decoupe['infra'])." " .
|
- |
|
| 168 |
" AND esn_id_nom= en_id_nom ".
|
- |
|
| 169 |
" AND esn_id_version_projet_taxon=en_id_version_projet_nom " .
|
- |
|
| 170 |
" AND en_epithete_espece = ".$this->proteger($nom_latin_decoupe['species'])." AND en_ce_rang = enrg_id_rang " .
|
- |
|
| 171 |
" ORDER BY esn_ce_statut ".
|
- |
|
| 172 |
" LIMIT 1";
|
- |
|
| 173 |
}
|
- |
|
| 174 |
else { // espece (on privilegie les noms retenu cf tri par esn_ce_statut)
|
- |
|
| 175 |
$requete="SELECT DISTINCT en_id_nom, esn_ce_statut" .
|
- |
|
| 176 |
" FROM eflore_nom, eflore_nom_rang, eflore_selection_nom " .
|
- |
|
| 177 |
" WHERE en_id_version_projet_nom = '25' AND en_nom_genre = ".$this->proteger($nom_latin_decoupe['genus'])." " .
|
- |
|
| 178 |
" AND enrg_abreviation_rang = 'sp.' " .
|
- |
|
| 179 |
" AND esn_id_nom= en_id_nom ".
|
- |
|
| 180 |
" AND esn_id_version_projet_taxon=en_id_version_projet_nom " .
|
- |
|
| 181 |
" AND en_epithete_espece = ".$this->proteger($nom_latin_decoupe['species'])." AND en_ce_rang = enrg_id_rang " .
|
- |
|
| 182 |
" ORDER BY esn_ce_statut ".
|
- |
|
| 183 |
" LIMIT 1";
|
- |
|
| 184 |
|
- |
|
| 185 |
}
|
- |
|
| 186 |
|
- |
|
| 187 |
$resultat = $this->executerRequete($requete);
|
- |
|
| 188 |
|
- |
|
| 189 |
$retour = array();
|
- |
|
| 190 |
if (is_array($resultat) && count($resultat) > 0) {
|
- |
|
| 191 |
$retour = $resultat[0];
|
- |
|
| 192 |
}
|
- |
|
| 193 |
|
167 |
|
| 194 |
return $retour;
|
168 |
return $infos;
|
| 195 |
}
|
169 |
}
|
| 196 |
|
170 |
|
| 197 |
function rechercherInfosSurTexteCodeOuNumTax($identifiant_espece) {
|
171 |
function rechercherInfosSurTexteCodeOuNumTax($identifiant_espece) {
|