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Rev 2123 Rev 2152
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11
 * @version	  SVN: <svn_id>
11
 * @version	  SVN: <svn_id>
12
 * @link	  /doc/jrest/
12
 * @link	  /doc/jrest/
13
 */
13
 */
Line 14... Line 14...
14
 
14
 
15
/**
15
/**
16
 * 
16
 *
17
 * La classe appelle les web service d'eflore pour éviter que le code client 
17
 * La classe appelle les web service d'eflore pour éviter que le code client
18
 * ne soit dépendant de la version d'eflore
18
 * ne soit dépendant de la version d'eflore
19
 */
19
 */
Line 20... Line 20...
20
class RechercheInfosTaxonBeta extends Cel {
20
class RechercheInfosTaxonBeta extends Cel {
Line 21... Line 21...
21
 
21
 
22
	const DEBUG = FALSE;
22
	const DEBUG = FALSE;
23
 
23
 
24
	private $url_service_nom = null;
24
	private $url_service_nom = null;
25
	private $url_service_taxon = null;
25
	private $url_service_taxon = null;
26
	private $url_service_chorologie = null;
26
	private $url_service_chorologie = null;
Line 27... Line 27...
27
	
27
 
28
	private $masque_recherche = null;
28
	private $masque_recherche = null;
Line 43... Line 43...
43
 
43
 
44
    public function setReferentiel($code_referentiel = 'bdtfx') {
44
    public function setReferentiel($code_referentiel = 'bdtfx') {
45
		$this->code_referentiel = $code_referentiel;
45
		$this->code_referentiel = $code_referentiel;
46
		$this->formaterUrlsServices($this->config);
46
		$this->formaterUrlsServices($this->config);
47
	}
47
	}
48
	
48
 
49
	private function formaterUrlsServices($config) {
49
	private function formaterUrlsServices($config) {
50
		$this->url_service_nom = str_replace('{referentiel}', $this->code_referentiel ,$config['eflore']['url_service_nom']);
50
		$this->url_service_nom = str_replace('{referentiel}', $this->code_referentiel ,$config['eflore']['url_service_nom']);
51
		$this->url_service_taxon = str_replace('{referentiel}', $this->code_referentiel ,$config['eflore']['url_service_taxon']);
51
		$this->url_service_taxon = str_replace('{referentiel}', $this->code_referentiel ,$config['eflore']['url_service_taxon']);
52
		$this->url_service_chorologie_obs = $config['eflore']['url_service_chorologie_obs'];
52
		$this->url_service_chorologie_obs = $config['eflore']['url_service_chorologie_obs'];
53
		$this->config = $config;
53
		$this->config = $config;
54
	}
54
	}
55
	
55
 
56
	public function rechercherGenreEspeceSurPrefixe($genre = null, $espece = null) {
56
	public function rechercherGenreEspeceSurPrefixe($genre = null, $espece = null) {
57
		$liste_genre_espece = array();	
57
		$liste_genre_espece = array();
58
		$this->masque_recherche = trim(trim($genre).' '.trim($espece,' *'));
58
		$this->masque_recherche = trim(trim($genre).' '.trim($espece,' *'));
59
		$masque = urlencode($this->masque_recherche);
59
		$masque = urlencode($this->masque_recherche);
60
		if(self::DEBUG) error_log("CEL fetch: " . $this->url_service_nom.'?masque='.$masque.'&recherche=etendue&retour.format=min&navigation.limite=50&ns.structure=au');
60
		if(self::DEBUG) error_log("CEL fetch: " . $this->url_service_nom.'?masque='.$masque.'&recherche=etendue&retour.format=min&navigation.limite=50&ns.structure=au');
61
		$urlService = $this->url_service_nom.'?masque='.$masque.'&recherche=etendue&retour.format=min&navigation.limite=50&ns.structure=au';
61
		$urlService = $this->url_service_nom.'?masque='.$masque.'&recherche=etendue&retour.format=min&navigation.limite=50&ns.structure=au';
62
		$requete = @file_get_contents($urlService);
62
		$requete = @file_get_contents($urlService);
63
		if($requete != '') {
63
		if($requete != '') {
64
			$requete = json_decode($requete);		
64
			$requete = json_decode($requete);
65
			if(is_object($requete) && isset($requete->resultat)) {
65
			if(is_object($requete) && isset($requete->resultat)) {
66
				foreach ($requete->resultat as $id => $res) {
66
				foreach ($requete->resultat as $id => $res) {
67
					$retenu = ($res->retenu == "true") ? '3' : '4';
67
					$retenu = ($res->retenu == "true") ? '3' : '4';
68
					$liste_genre_espece[] = array($res->nom_sci_complet, $id, $retenu);
68
					$liste_genre_espece[] = array($res->nom_sci_complet, $id, $retenu);
69
				}
69
				}
70
			}
70
			}
71
			usort($liste_genre_espece, array($this, 'comparerParRetenuPuisNom'));  
71
			usort($liste_genre_espece, array($this, 'comparerParRetenuPuisNom'));
72
		}
72
		}
73
		return $liste_genre_espece;
73
		return $liste_genre_espece;
74
	}
74
	}
75
	
75
 
76
	function comparerParRetenuPuisNom($a, $b) {
76
	function comparerParRetenuPuisNom($a, $b) {
77
		if($a[2] == 3 && $b[2] != 3) {
77
		if($a[2] == 3 && $b[2] != 3) {
78
			return -1;
78
			return -1;
79
		} elseif($a[2] != 3 && $b[2] == 3) {
79
		} elseif($a[2] != 3 && $b[2] == 3) {
80
			return 1;
80
			return 1;
81
		} else {
81
		} else {
82
			return levenshtein($this->masque_recherche, $a[0]) >= levenshtein($this->masque_recherche, $b[0]);
82
			return levenshtein($this->masque_recherche, $a[0]) >= levenshtein($this->masque_recherche, $b[0]);
83
		}
83
		}
84
	}
84
	}
85
	
85
 
86
	public function effectuerRequeteInfosComplementairesEtFormaterNom($numNom) {
86
	public function effectuerRequeteInfosComplementairesEtFormaterNom($numNom) {
87
		$resultat_infos_complementaires = (array)$this->effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($numNom);
87
		$resultat_infos_complementaires = (array)$this->effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($numNom);
88
		$retour_infos_complementaires = array();
88
		$retour_infos_complementaires = array();
89
		if (isset($resultat_infos_complementaires['nom_retenu_complet']) && $resultat_infos_complementaires['nom_retenu_complet']) {
89
		if (isset($resultat_infos_complementaires['nom_retenu_complet']) && $resultat_infos_complementaires['nom_retenu_complet']) {
90
			$retour_infos_complementaires=array((self::supprimerBiblio($resultat_infos_complementaires['nom_retenu_complet'])));
90
			$retour_infos_complementaires=array((self::supprimerBiblio($resultat_infos_complementaires['nom_retenu_complet'])));
91
		}
91
		}
92
		
92
 
93
		return $retour_infos_complementaires;
93
		return $retour_infos_complementaires;
94
	}
94
	}
95
	
95
 
96
	public function rechercherInformationsComplementairesSurNom($nom_saisi) {
96
	public function rechercherInformationsComplementairesSurNom($nom_saisi) {
97
		$nom_saisi = trim($nom_saisi);
97
		$nom_saisi = trim($nom_saisi);
98
		// Essai de recherche sur le nom saisi tel quel
98
		// Essai de recherche sur le nom saisi tel quel
99
		$liste_genre_espece = $this->effectuerRequeteUrlRecherche($nom_saisi, 'stricte');
99
		$liste_genre_espece = $this->effectuerRequeteUrlRecherche($nom_saisi, 'stricte');
Line 109... Line 109...
109
		$liste_genre_espece = $this->effectuerRequeteUrlRecherche($nom_saisi, 'etendue');
109
		$liste_genre_espece = $this->effectuerRequeteUrlRecherche($nom_saisi, 'etendue');
110
		if($liste_genre_espece) return $liste_genre_espece;
110
		if($liste_genre_espece) return $liste_genre_espece;
Line 111... Line 111...
111
 
111
 
112
		// dernière tentative: concaténation (nom_sci,auteur) (= nom-retenu généré utilisé comme nom_sci)
112
		// dernière tentative: concaténation (nom_sci,auteur) (= nom-retenu généré utilisé comme nom_sci)
113
		$liste_genre_espece = $this->effectuerRequeteUrlRecherche($nom_saisi, 'concat');
113
		$liste_genre_espece = $this->effectuerRequeteUrlRecherche($nom_saisi, 'concat');
114
		
114
 
115
		return $liste_genre_espece;
115
		return $liste_genre_espece;
116
	}
116
	}
117
	
117
 
118
	private function effectuerRequeteUrlRecherche($nom_saisi, $mode = 'stricte') {
118
	private function effectuerRequeteUrlRecherche($nom_saisi, $mode = 'stricte') {
119
        $url = sprintf(
119
        $url = sprintf(
120
            '%1$s?masque=%2$s&recherche=%3$s&ns.format=txt&retour.champs=%4$s&navigation.limite=1',
120
            '%1$s?masque=%2$s&recherche=%3$s&ns.format=txt&retour.champs=%4$s&navigation.limite=1',
121
            $this->url_service_nom,
121
            $this->url_service_nom,
Line 132... Line 132...
132
        }
132
        }
133
		if(!$res) return NULL;
133
		if(!$res) return NULL;
134
		$resultat = (array)$res->resultat;
134
		$resultat = (array)$res->resultat;
135
		return array_pop($resultat);
135
		return array_pop($resultat);
136
	}
136
	}
137
	
137
 
138
	static function supprimerAuteur($nom_saisi) {
138
	static function supprimerAuteur($nom_saisi) {
139
		// TODO: gérer les hybrides
139
		// TODO: gérer les hybrides
140
		if(self::estUnHybride($nom_saisi) || self::estUneFormuleHybridite($nom_saisi)) {
140
		if(self::estUnHybride($nom_saisi) || self::estUneFormuleHybridite($nom_saisi)) {
141
			$nom_decoupe = explode(' ', $nom_saisi);
141
			$nom_decoupe = explode(' ', $nom_saisi);
142
			$derniere_position_hybride = array_keys($nom_decoupe, 'x');
142
			$derniere_position_hybride = array_keys($nom_decoupe, 'x');
143
			$nom_saisi_sans_auteur = implode(' ',array_slice($nom_decoupe, 0, end($derniere_position_hybride) + 2));
143
			$nom_saisi_sans_auteur = implode(' ',array_slice($nom_decoupe, 0, end($derniere_position_hybride) + 2));
144
		} else {
144
		} else {
145
			/* Attention le parseur de nom n'est pas fiable à 100%
145
			/* Attention le parseur de nom n'est pas fiable à 100%
146
			   mais ça marche dans la plupart des cas	
146
			   mais ça marche dans la plupart des cas
147
			   à part les formules d'hybridité saisies avec un auteur */
147
			   à part les formules d'hybridité saisies avec un auteur */
148
			$nameparser = new NameParser();
148
			$nameparser = new NameParser();
149
			$auteur = $nameparser->parse_auth($nom_saisi);
149
			$auteur = $nameparser->parse_auth($nom_saisi);
150
			$nom_saisi_sans_auteur = str_replace($auteur, '', $nom_saisi);
150
			$nom_saisi_sans_auteur = str_replace($auteur, '', $nom_saisi);
151
		}
151
		}
Line 152... Line 152...
152
 
152
 
153
		return trim($nom_saisi_sans_auteur);
153
		return trim($nom_saisi_sans_auteur);
154
	}
154
	}
155
	
155
 
156
	static function estUneFormuleHybridite($nom_saisi) {
156
	static function estUneFormuleHybridite($nom_saisi) {
157
		return strpos($nom_saisi,' x ') !== false;
157
		return strpos($nom_saisi,' x ') !== false;
158
	}
158
	}
159
	
159
 
160
	static function estUnHybride($nom_saisi) {
160
	static function estUnHybride($nom_saisi) {
161
		return strpos($nom_saisi,'x ') === 0;
161
		return strpos($nom_saisi,'x ') === 0;
162
	}
162
	}
163
	
163
 
164
	public function effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($num_nom, $ref = NULL) {
164
	public function effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($num_nom, $ref = NULL) {
165
		if($ref && isset($this->config['eflore']['api_host'])) {
165
		if($ref && isset($this->config['eflore']['api_host'])) {
166
			if(self::DEBUG) error_log("CEL fetch: " .$this->config['eflore']['api_host'] . '/');
166
			if(self::DEBUG) error_log("CEL fetch: " .$this->config['eflore']['api_host'] . '/');
167
			return @json_decode(file_get_contents($this->config['eflore']['api_host'] . '/' .
167
			return @json_decode(file_get_contents($this->config['eflore']['api_host'] . '/' .
Line 181... Line 181...
181
	}
181
	}
Line 182... Line 182...
182
 
182
 
183
	static function supprimerBiblio($nom) {
183
	static function supprimerBiblio($nom) {
184
		return trim(preg_replace('/ \[.*\]/','',$nom));
184
		return trim(preg_replace('/ \[.*\]/','',$nom));
185
	}
185
	}
186
	
186
 
187
	public function rechercherNumTaxSurNumNom($num_nom) {
187
	public function rechercherNumTaxSurNumNom($num_nom) {
188
		$nt = null;
188
		$nt = null;
189
		$url = $this->url_service_nom."/".$num_nom.'?retour.champs=num_taxonomique';
189
		$url = $this->url_service_nom."/".$num_nom.'?retour.champs=num_taxonomique';
190
		if(self::DEBUG) error_log("CEL fetch: $url");
190
		if(self::DEBUG) error_log("CEL fetch: $url");
191
		$resultat = @file_get_contents($url);
191
		$resultat = @file_get_contents($url);
192
		if($resultat != '') {
192
		if($resultat != '') {
193
			$infos = json_decode($resultat);
193
			$infos = json_decode($resultat);
194
			$nt = $infos->num_taxonomique;
194
			$nt = $infos->num_taxonomique;
195
		}
195
		}
196
	
196
 
197
		return $nt;
197
		return $nt;
198
	}
198
	}
199
	
199
 
200
	public function taxonEstPresentDansDepartement($num_taxon,$code_departement) {
200
	public function taxonEstPresentDansDepartement($num_taxon,$code_departement) {
201
		$presence_taxon = false;
201
		$presence_taxon = false;
202
		$url = $this->url_service_chorologie_obs.'?masque.departement='.$code_departement.'&masque.determination.nt='.$num_taxon.'&navigation.limite=1';
202
		$url = $this->url_service_chorologie_obs.'?masque.departement='.$code_departement.'&masque.determination.nt='.$num_taxon.'&navigation.limite=1';
203
		if(self::DEBUG) error_log("CEL fetch: $url");
203
		if(self::DEBUG) error_log("CEL fetch: $url");
Line 208... Line 208...
208
				$presence_taxon = true;
208
				$presence_taxon = true;
209
			}
209
			}
210
		}
210
		}
211
		return $presence_taxon;
211
		return $presence_taxon;
212
	}
212
	}
213
	
213
 
214
	/* texte libre, nom scientifique, 
214
	/* texte libre, nom scientifique,
215
	   ou code nomenclatural (format bdtfx:nn:999999) 
215
	   ou code nomenclatural (format bdtfx:nn:999999)
216
	   ou code taxonomique (format bdtfx:nt:999999)
216
	   ou code taxonomique (format bdtfx:nt:999999)
217
	   TODO: voir ce qu'on fait pour l'import de différent référentiels */
217
	   TODO: voir ce qu'on fait pour l'import de différent référentiels */
218
	function rechercherInfosSurTexteCodeOuNumTax($identifiant_espece) {
218
	function rechercherInfosSurTexteCodeOuNumTax($identifiant_espece) {
219
		preg_match('/(' . implode('|', Cel::$referentiels_valides) .'):(nn|nt):(\d+)/i', $identifiant_espece, $elements);
219
		preg_match('/(' . implode('|', Cel::$referentiels_valides) .'):(nn|nt):(\d+)/i', $identifiant_espece, $elements);
220
		if($elements) {
220
		if($elements) {
Line 243... Line 243...
243
		}
243
		}
Line 244... Line 244...
244
 
244
 
245
		// Nom scientifique
245
		// Nom scientifique
246
		return $this->rechercherInformationsComplementairesSurNom($identifiant_espece);
246
		return $this->rechercherInformationsComplementairesSurNom($identifiant_espece);
247
	}
247
	}
248
	
248
 
249
	public function rechercherSynonymesSurNumNom($num_nom) {
249
	public function rechercherSynonymesSurNumNom($num_nom) {
250
		$retour = array();
250
		$retour = array();
251
		if(self::DEBUG) error_log("CEL fetch: " . $this->url_service_nom.'/'.$num_nom.'/relations/synonymie/?retour.format=min');
251
		if(self::DEBUG) error_log("CEL fetch: " . $this->url_service_nom.'/'.$num_nom.'/relations/synonymie/?retour.format=min');
252
		$resultat = @file_get_contents($this->url_service_nom.'/'.$num_nom.'/relations/synonymie/?retour.format=min');
252
		$resultat = @file_get_contents($this->url_service_nom.'/'.$num_nom.'/relations/synonymie/?retour.format=min');
Line 256... Line 256...
256
				$retour = $resultat->resultat;
256
				$retour = $resultat->resultat;
257
			}
257
			}
258
		}
258
		}
259
		return $retour;
259
		return $retour;
260
	}
260
	}
261
}
261
}
262
262