Line 2... |
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2 |
Mise à jour de réferentiels NULL ou vides pour les observations dotées d'un nom_sel_nn
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2 |
Mise à jour de réferentiels NULL ou vides pour les observations dotées d'un nom_sel_nn
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3 |
75427 observations trouvées au 2013/07/19
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3 |
75427 observations trouvées au 2013/07/19
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4 |
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4 |
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5 |
Les observations problématiques sont les suivantes:
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5 |
Les observations problématiques sont les suivantes:
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6 |
SELECT id_observation, nom_referentiel, nom_sel, nom_sel_nn, nom_ret, nom_ret_nn, nt, famille
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6 |
SELECT id_observation, nom_referentiel, nom_sel, nom_sel_nn, nom_ret, nom_ret_nn, nt, famille
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7 |
FROM `tb_cel_test`.`cel_obs`
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7 |
FROM `BASEEDIT`.`cel_obs`
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Line 8... |
Line 8... |
8 |
WHERE nom_referentiel IS NULL AND nom_sel != '' AND nom_sel IS NOT NULL AND nom_ret_nn IS NOT NULL;
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8 |
WHERE nom_referentiel IS NULL AND nom_sel != '' AND nom_sel IS NOT NULL AND nom_ret_nn IS NOT NULL;
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9 |
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9 |
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10 |
Or maj-cleanup-201307.sql reset les valeurs des observations ayant un nom_sel NULL ou '', de plus la préférence de sélection est
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10 |
Or maj-cleanup-201307.sql reset les valeurs des observations ayant un nom_sel NULL ou '', de plus la préférence de sélection est
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11 |
donné au nom_sel (incluant les synonymes) plutôt que nom_ret_nn.
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11 |
donné au nom_sel (incluant les synonymes) plutôt que nom_ret_nn.
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12 |
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12 |
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13 |
La requête est donc:
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13 |
La requête est donc:
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14 |
SELECT id_observation, nom_referentiel, nom_sel, nom_sel_nn, nom_ret, nom_ret_nn, nt, famille
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14 |
SELECT id_observation, nom_referentiel, nom_sel, nom_sel_nn, nom_ret, nom_ret_nn, nt, famille
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Line 15... |
Line 15... |
15 |
FROM `tb_cel_test`.`cel_obs` WHERE nom_referentiel IS NULL AND nom_sel_nn IS NOT NULL;
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15 |
FROM `BASEEDIT`.`cel_obs` WHERE nom_referentiel IS NULL AND nom_sel_nn IS NOT NULL;
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16 |
=> 76486
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16 |
=> 76486
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Line 17... |
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17 |
*/
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17 |
*/
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18 |
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18 |
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19 |
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19 |
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Line 20... |
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20 |
DROP TEMPORARY TABLE IF EXISTS T_bis;
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20 |
DROP TEMPORARY TABLE IF EXISTS T_bis;
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21 |
DROP PROCEDURE IF EXISTS majreferentiel;
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21 |
DROP PROCEDURE IF EXISTS majreferentiel;
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22 |
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22 |
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23 |
CREATE TEMPORARY TABLE IF NOT EXISTS T_bis ( INDEX(`nom`(30))) AS \
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23 |
CREATE TEMPORARY TABLE IF NOT EXISTS T_bis ( INDEX(`nom`(30))) AS \
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24 |
SELECT "bdtfx" AS valid_ref, CONCAT(b.nom_sci, ' ', b.auteur) AS nom, b.num_nom, b.num_taxonomique, b.famille FROM `tb_eflore`.`bdtfx_v1_01` b UNION ALL \
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24 |
SELECT "bdtfx" AS valid_ref, CONCAT(b.nom_sci, ' ', b.auteur) AS nom, b.num_nom, b.num_taxonomique, b.famille FROM `BASESOURCE`.`bdtfx_v1_01` b UNION ALL \
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25 |
SELECT "bdtxa" AS valid_ref, CONCAT(a.nom_sci, ' ', a.auteur) AS nom, a.num_nom, a.num_tax, a.famille FROM `tb_eflore`.`bdtxa_v1_00` a;
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25 |
SELECT "bdtxa" AS valid_ref, CONCAT(a.nom_sci, ' ', a.auteur) AS nom, a.num_nom, a.num_tax, a.famille FROM `BASESOURCE`.`bdtxa_v1_00` a;
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Line 26... |
Line 26... |
26 |
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26 |
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27 |
/* Donc nous JOINons:
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27 |
/* Donc nous JOINons:
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28 |
-- INNER JOIN sur bdtfx: 69719
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28 |
-- INNER JOIN sur bdtfx: 69719
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29 |
SELECT id_observation, nom_referentiel, nom_sel, nom_sel_nn, nom_ret, nom_ret_nn, nt, c.famille FROM `tb_cel_test`.`cel_obs` c INNER JOIN `tb_eflore`.`bdtfx_v1_01` b ON (b.num_nom = c.nom_sel_nn) WHERE nom_referentiel IS NULL AND nom_sel_nn IS NOT NULL;
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29 |
SELECT id_observation, nom_referentiel, nom_sel, nom_sel_nn, nom_ret, nom_ret_nn, nt, c.famille FROM `BASEEDIT`.`cel_obs` c INNER JOIN `BASESOURCE`.`bdtfx_v1_01` b ON (b.num_nom = c.nom_sel_nn) WHERE nom_referentiel IS NULL AND nom_sel_nn IS NOT NULL;
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30 |
-- INNER JOIN sur bdtxa: 79471 dont 9752 en dup (bdtxa + bdtfx), eg: 1005047
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30 |
-- INNER JOIN sur bdtxa: 79471 dont 9752 en dup (bdtxa + bdtfx), eg: 1005047
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31 |
SELECT id_observation, nom_referentiel, nom_sel, nom_sel_nn, nom_ret, nom_ret_nn, nt, c.famille FROM `tb_cel_test`.`cel_obs` c INNER JOIN T_bis b ON (b.num_nom = c.nom_sel_nn) WHERE nom_referentiel AND nom_sel_nn IS NOT NULL;
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31 |
SELECT id_observation, nom_referentiel, nom_sel, nom_sel_nn, nom_ret, nom_ret_nn, nt, c.famille FROM `BASEEDIT`.`cel_obs` c INNER JOIN T_bis b ON (b.num_nom = c.nom_sel_nn) WHERE nom_referentiel AND nom_sel_nn IS NOT NULL;
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32 |
*/
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32 |
*/
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33 |
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33 |
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34 |
/* d'où GROUP BY id_observation HAVING count(id_observation) = 1 */
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34 |
/* d'où GROUP BY id_observation HAVING count(id_observation) = 1 */
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Line 48... |
Line 48... |
48 |
BEGIN
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48 |
BEGIN
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49 |
DECLARE done INT DEFAULT 0;
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49 |
DECLARE done INT DEFAULT 0;
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50 |
DECLARE subst INT DEFAULT 0;
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50 |
DECLARE subst INT DEFAULT 0;
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51 |
DECLARE _id_observation bigint(20) DEFAULT 0;
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51 |
DECLARE _id_observation bigint(20) DEFAULT 0;
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52 |
DECLARE _valid_ref varchar(20) DEFAULT NULL;
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52 |
DECLARE _valid_ref varchar(20) DEFAULT NULL;
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53 |
DECLARE cur1 CURSOR FOR SELECT id_observation, valid_ref FROM `tb_cel_test`.`cel_obs` c INNER JOIN T_bis b ON (b.num_nom = c.nom_sel_nn)
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53 |
DECLARE cur1 CURSOR FOR SELECT id_observation, valid_ref FROM `BASEEDIT`.`cel_obs` c INNER JOIN T_bis b ON (b.num_nom = c.nom_sel_nn)
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54 |
WHERE nom_referentiel IS NULL AND nom_sel_nn IS NOT NULL group by id_observation HAVING count(id_observation) = 1;
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54 |
WHERE nom_referentiel IS NULL AND nom_sel_nn IS NOT NULL group by id_observation HAVING count(id_observation) = 1;
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55 |
-- DECLARE CONTINUE HANDLER FOR NOT FOUND SET done = TRUE;
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55 |
-- DECLARE CONTINUE HANDLER FOR NOT FOUND SET done = TRUE;
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56 |
DECLARE CONTINUE HANDLER FOR SQLSTATE '02000' SET done = 1;
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56 |
DECLARE CONTINUE HANDLER FOR SQLSTATE '02000' SET done = 1;
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Line 57... |
Line 57... |
57 |
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57 |
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58 |
OPEN cur1;
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58 |
OPEN cur1;
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59 |
REPEAT
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59 |
REPEAT
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60 |
FETCH cur1 INTO _id_observation, _valid_ref;
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60 |
FETCH cur1 INTO _id_observation, _valid_ref;
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61 |
UPDATE `tb_cel_test`.`cel_obs` c SET nom_referentiel = _valid_ref WHERE id_observation = _id_observation;
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61 |
UPDATE `BASEEDIT`.`cel_obs` c SET nom_referentiel = _valid_ref WHERE id_observation = _id_observation;
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62 |
SET subst = subst + 1;
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62 |
SET subst = subst + 1;
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63 |
UNTIL done END REPEAT;
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63 |
UNTIL done END REPEAT;
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64 |
select subst AS 'nombre de mises à jour de référentiel effectuées';
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64 |
select subst AS 'nombre de mises à jour de référentiel effectuées';
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65 |
CLOSE cur1;
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65 |
CLOSE cur1;
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