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Rev 478 Rev 487
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5 
	const DOSSIER_V2 = '../../../donnees/coste/2.00/';
 5 
	const DOSSIER_V2 = '../../../donnees/coste/2.00/';
Line 6... Line 6...
6 
 
 6 
 
7 
	private $conteneur = null;
 7 
	private $conteneur = null;
8 
	private $outils = null;
 8 
	private $outils = null;
- 
 
 9 
	private $messages = null;
9 
	private $messages = null;
 10 
	private $generateur = null;
10 
	private $dossierBase = '';
 11 
	private $dossierBase = '';
11 
	private $spIndex = array();
 12 
	private $spIndex = array();
- 
 
 13 
	private $supraSpIndex = array();
12 
	private $supraSpIndex = array();
 14 
	private $imgIndex = array();
13 
	private $indexFinal = array();
 15 
	private $indexFinal = array();
14 
	private $tableauParDefaut = array();
 16 
	private $tableauParDefaut = array();
15 
	private $nbreTaxonInf = array();
 17 
	private $nbreTaxonInf = array();
16 
	private $enteteFinal = array(
 18 
	private $enteteFinal = array(
17 
		'num_nom',
 19 
		'num_nom',
18 
		'num_nom_retenu',
 20 
		'num_nom_retenu',
19 
		'num_tax_sup',
 21 
		'num_tax_sup',
20 
		'rang',
 22 
		'rang',
- 
 
 23 
		'nom_sci',
- 
 
 24 
		'nom_supra_generique',
- 
 
 25 
		'genre',
- 
 
 26 
		'epithete_infra_generique',
- 
 
 27 
		'epithete_sp',
- 
 
 28 
		'type_epithete',
- 
 
 29 
		'epithete_infra_sp',
- 
 
 30 
		'cultivar_groupe',
- 
 
 31 
		'cultivar',
21 
		'nom_sci',
 32 
		'nom_commercial',
22 
		'auteur',
 - 
 
23 
		'nom_addendum',
 33 
		'auteur',
24 
		'annee',
 34 
		'annee',
- 
 
 35 
		'biblio_origine',
- 
 
 36 
		'notes',
25 
		'biblio_origine',
 37 
		'nom_addendum',
26 
		'nom_francais',
 38 
		'nom_francais',
27 
		'nom_coste',
 39 
		'nom_coste',
28 
		'auteur_coste',
 40 
		'auteur_coste',
29 
		'biblio_coste',
 41 
		'biblio_coste',
Line 32... Line 44...
32 
		'num_tax_sup_coste',
 44 
		'num_tax_sup_coste',
33 
		'synonymie_coste',
 45 
		'synonymie_coste',
34 
		'tome',
 46 
		'tome',
35 
		'page',
 47 
		'page',
36 
		'nbre_taxons',
 48 
		'nbre_taxons',
37 
		'bdnff_nn',
 49 
		'flore_bdtfx_nn',
38 
		'bdnff_nt',
 50 
		'flore_bdtfx_nt',
39 
		'image',
 51 
		'image',
- 
 
 52 
		'image_auteur',
40 
		'page_wiki_dsc',
 53 
		'page_wiki_dsc',
41 
		'page_wiki_cle');
 54 
		'page_wiki_cle',
- 
 
 55 
		'nom_sci_html');
Line 42... Line 56...
42 
 
 56 
 
43 
	public function __construct(Conteneur $conteneur) {
 57 
	public function __construct(Conteneur $conteneur) {
44 
		mb_internal_encoding('UTF-8');
 58 
		mb_internal_encoding('UTF-8');
45 
		setlocale(LC_ALL, 'fr_FR.UTF-8');
 59 
		setlocale(LC_ALL, 'fr_FR.UTF-8');
46 
		$this->conteneur = $conteneur;
 60 
		$this->conteneur = $conteneur;
47 
		$this->outils = $conteneur->getOutils();
 61 
		$this->outils = $conteneur->getOutils();
- 
 
 62 
		$this->messages = $conteneur->getMessages();
48 
		$this->messages = $conteneur->getMessages();
 63 
		$this->generateur = $conteneur->getGenerateurNomSciHtml();
49 
		$this->dossierBase = dirname(__FILE__).'/';
 64 
		$this->dossierBase = dirname(__FILE__).'/';
Line 50... Line 65...
50 
	}
 65 
	}
51 
 
 66 
 
52 
	public function fusionnerIndex() {
 67 
	public function fusionnerIndex() {
53 
		$this->chargerIndexSp();
 68 
		$this->chargerIndexSp();
54 
		$this->chargerIndexSupraSp();
 69 
		$this->chargerIndexSupraSp();
55 
		$this->initialiserTableauLigneIndexFinal();
 70 
		$this->initialiserTableauLigneIndexFinal();
- 
 
 71 
		$this->creerIndexFinal();
- 
 
 72 
		$this->ajouterChampsDansIndexFinal();
- 
 
 73 
		$this->ajouteurAuteurImage();
56 
		$this->creerIndexFinal();
 74 
		$this->decomposerNomSci();
57 
		$this->ajouterChampsDansIndexFinal();
 75 
		$this->ajouteurNomSciHtml();
Line 58... Line 76...
58 
		$this->creerFichierCsvIndexFinal();
 76 
		$this->creerFichierCsvIndexFinal();
59 
	}
 77 
	}
Line 150... Line 168...
150 
		}
 168 
		}
151 
	}
 169 
	}
Line 152... Line 170...
152 
 
 170 
 
153 
	private function genererPageWikiDsc($infos) {
 171 
	private function genererPageWikiDsc($infos) {
- 
 
 172 
		$prefixe = $this->genererPrefixePage($infos);
- 
 
 173 
		if ($infos['rang'] == '180') {
- 
 
 174 
			$nomSci = str_replace(' ', '', ucwords(strtolower($infos['nom_coste'])));
154 
		$prefixe = $this->genererPrefixePage($infos);
 175 
		} else {
- 
 
 176 
			$nomSci = str_replace(' ', '', ucwords(strtolower($infos['nom_sci'])));
155 
		$nomSci = str_replace(' ', '', ucwords(strtolower($infos['nom_sci'])));
 177 
		}
156 
		$pageWiki = $prefixe.$nomSci;
 178 
		$pageWiki = $prefixe.$nomSci;
157 
		return $pageWiki;
 179 
		return $pageWiki;
Line 158... Line 180...
158 
	}
 180 
	}
159 
 
 181 
 
160 
	private function genererPageWikiCle($infos) {
 182 
	private function genererPageWikiCle($infos) {
161 
		$pageWiki = '';
 183 
		$pageWiki = '';
162 
		if ($infos['nbre_taxons'] > 1) {
 184 
		if ($infos['nbre_taxons'] > 1) {
- 
 
 185 
			$prefixe = $this->genererPrefixePage($infos);
- 
 
 186 
			if ($infos['rang'] == '20') {
- 
 
 187 
				$pageWiki = $prefixe.'TabClaEtEmb';
- 
 
 188 
			} elseif ($infos['rang'] == '40' && ($infos['num_nom_coste'] == 'E2' || $infos['num_nom_coste'] == 'E3')) {
- 
 
 189 
				$pageWiki = $prefixe.'TabFam';
- 
 
 190 
			} else if ($infos['rang'] == '80') {
163 
			$prefixe = $this->genererPrefixePage($infos);
 191 
				$pageWiki = $prefixe.'TabFam';
164 
			if ($infos['rang'] == '180') {
 192 
			} else if ($infos['rang'] == '180') {
165 
				$pageWiki = $prefixe.'TabGen';
 193 
				$pageWiki = $prefixe.'TabGen';
166 
			} else if ($infos['rang'] == '220') {
 194 
			} else if ($infos['rang'] == '220') {
167 
				$pageWiki = $prefixe.'TabSp';
 195 
				$pageWiki = $prefixe.'TabSp';
Line 173... Line 201...
173 
	private function genererPrefixePage($infos) {
 201 
	private function genererPrefixePage($infos) {
174 
		$prefixe = '';
 202 
		$prefixe = '';
175 
		$num = preg_replace('/^[a-z]*([0-9.]+)$/i', '$1', $infos['num_nom_coste']);
 203 
		$num = preg_replace('/^[a-z]*([0-9.]+)$/i', '$1', $infos['num_nom_coste']);
176 
		if (preg_match('/^([0-9]+)[.][0-9]+$/i', $infos['num_nom_coste'], $match)) {
 204 
		if (preg_match('/^([0-9]+)[.][0-9]+$/i', $infos['num_nom_coste'], $match)) {
177 
			$num = sprintf('%04s', $match[1]);
 205 
			$num = sprintf('%04s', $match[1]);
- 
 
 206 
		} else if ($infos['rang'] == 20 ) {
- 
 
 207 
			$num = '';
178 
		} else if ($infos['rang'] < 80 ) {
 208 
		} else if ($infos['rang'] < 80 ) {
179 
			$num = sprintf('%02s', $num);
 209 
			$num = sprintf('%02s', $num);
180 
		} else if ($infos['rang'] < 290 ) {
 210 
		} else if ($infos['rang'] < 290 ) {
181 
			$num = sprintf('%03s', $num);
 211 
			$num = sprintf('%03s', $num);
182 
		} else {
 212 
		} else {
Line 189... Line 219...
189 
		return $prefixe;
 219 
		return $prefixe;
190 
	}
 220 
	}
Line 191... Line 221...
191 
 
 221 
 
192 
	private function obtenirNbreTaxon($infos) {
 222 
	private function obtenirNbreTaxon($infos) {
193 
		$nbre = '';
 - 
 
194 
		if ($infos['rang'] == 180 || $infos['rang'] == 220) {
 223 
		$nbre = '';
195 
			if (isset($this->nbreTaxonInf[$infos['num_nom_coste']])) {
 224 
		if (isset($this->nbreTaxonInf[$infos['num_nom_coste']])) {
196 
				$nbre = $this->nbreTaxonInf[$infos['num_nom_coste']];
 - 
 
197 
			}
 225 
			$nbre = $this->nbreTaxonInf[$infos['num_nom_coste']];
198 
		}
 226 
		}
199 
		return $nbre;
 227 
		return $nbre;
Line 200... Line 228...
200 
	}
 228 
	}
Line 205... Line 233...
205 
			$img = $infos['num_nom_coste'].'.png';
 233 
			$img = $infos['num_nom_coste'].'.png';
206 
		}
 234 
		}
207 
		return $img;
 235 
		return $img;
208 
	}
 236 
	}
Line -... Line 237...
- 
 
 237 
 
- 
 
 238 
	private function ajouteurAuteurImage() {
- 
 
 239 
		$this->chargerAuteurImg();
- 
 
 240 
		foreach ($this->indexFinal as $nnc => $infos) {
- 
 
 241 
			$infos['image_auteur'] = $this->imgIndex[$infos['image']];
- 
 
 242 
			$this->indexFinal[$nnc] = $infos;
- 
 
 243 
		}
- 
 
 244 
	}
- 
 
 245 
 
- 
 
 246 
	private function chargerAuteurImg() {
- 
 
 247 
		$imgIndexFichier = $this->dossierBase.self::DOSSIER_V0.'coste_images_auteur_correspondance_bdnff.tsv';
- 
 
 248 
		$index = $this->outils->transformerTxtTsvEnTableau($imgIndexFichier);
- 
 
 249 
		foreach ($index as $infos) {
- 
 
 250 
			$id = $infos['id_image'];
- 
 
 251 
			$this->imgIndex[$id] = $infos['auteur'];
- 
 
 252 
		}
- 
 
 253 
	}
- 
 
 254 
 
- 
 
 255 
	private function decomposerNomSci() {
- 
 
 256 
		$majuscule = "[ÆŒA-Z]";
- 
 
 257 
		$epithete = "[æœïa-z-]+";
- 
 
 258 
		foreach ($this->indexFinal as $nnc => $infos) {
- 
 
 259 
			$id = $infos['num_nom_coste'];
- 
 
 260 
			$nomSci = $infos['nom_sci'];
- 
 
 261 
			$rang = $infos['rang'];
- 
 
 262 
			if ($rang < 220) {
- 
 
 263 
				$infos['nom_supra_generique'] = $nomSci;
- 
 
 264 
			} else if ($rang == 220) {
- 
 
 265 
				$infos['genre'] = $nomSci;
- 
 
 266 
			} else if ($rang == 290) {
- 
 
 267 
				if (preg_match("/^($majuscule$epithete) ($epithete)$/", $nomSci, $match)) {
- 
 
 268 
					$infos['genre'] = $match[1];
- 
 
 269 
					$infos['epithete_sp'] = $match[2];
- 
 
 270 
				} else {
- 
 
 271 
					$this->messages->traiterErreur("Le nom $nomSci ($id) de rang $rang n'est pas standard.");
- 
 
 272 
				}
- 
 
 273 
			} else if ($rang == 340) {
- 
 
 274 
				if (preg_match("/^($majuscule$epithete) ($epithete) (var[.]) ($epithete)$/", $nomSci, $match)) {
- 
 
 275 
					$infos['genre'] = $match[1];
- 
 
 276 
					$infos['epithete_sp'] = $match[2];
- 
 
 277 
					$infos['type_epithete'] = $match[3];
- 
 
 278 
					$infos['epithete_infra_sp'] = $match[4];
- 
 
 279 
				} else {
- 
 
 280 
					$this->messages->traiterErreur("Le nom $nomSci ($id) de rang $rang n'est pas standard.");
- 
 
 281 
				}
- 
 
 282 
			}
- 
 
 283 
 
- 
 
 284 
			$this->indexFinal[$nnc] = $infos;
- 
 
 285 
			$this->messages->afficherAvancement("Décomposition des noms scientifiques en cours");
- 
 
 286 
		}
- 
 
 287 
		echo "\n";
- 
 
 288 
	}
- 
 
 289 
 
- 
 
 290 
	private function ajouteurNomSciHtml() {
- 
 
 291 
		foreach ($this->indexFinal as $nnc => $infos) {
- 
 
 292 
			$this->indexFinal[$nnc]['nom_sci_html'] = $this->generateur->genererNomSciHtml($infos);
- 
 
 293 
			$this->messages->afficherAvancement("Création des noms scientifiques HTML en cours");
- 
 
 294 
		}
- 
 
 295 
		echo "\n";
- 
 
 296 
	}
209 
 
 297 
 
210 
	private function creerFichierCsvIndexFinal() {
 298 
	private function creerFichierCsvIndexFinal() {
211 
		$lignes = array();
 299 
		$lignes = array();
212 
		array_unshift($this->indexFinal, $this->enteteFinal);
 300 
		array_unshift($this->indexFinal, $this->enteteFinal);
213 
		foreach ($this->indexFinal as $infos) {
 301 
		foreach ($this->indexFinal as $infos) {