Line 195... |
Line 195... |
195 |
* /Recherche/Export/_
|
195 |
* /Recherche/Export/_
|
196 |
* ou les _ représentent dans l'ordre : référentiel, version, champs, filtre
|
196 |
* ou les _ représentent dans l'ordre : référentiel, version, champs, filtre
|
197 |
* Si un des paramètres est absent, il prendre la valeur *
|
197 |
* Si un des paramètres est absent, il prendre la valeur *
|
198 |
*/
|
198 |
*/
|
199 |
public function getElementExport($param) {
|
199 |
public function getElementExport($param) {
|
200 |
$colonnesOrdonnees = array("nn" => array("a.num_nom", "Numéro nomenclatural"),
|
- |
|
201 |
"nr" => array("a.num_nom_retenu", "Numéro nomenclatural du nom retenu"),
|
- |
|
202 |
"nt" => array("a.num_taxonomique", "Numéro taxonomique"),
|
- |
|
203 |
"cd" => array("a.cd_ref", "Numéro INPN"),
|
- |
|
204 |
"rg" => array("a.rang", "Code rang"),
|
- |
|
205 |
"fam" => array("a.famille", "Famille (APG III)"),
|
- |
|
206 |
"nsc" => array("concat(a.nom_sci,' ',a.auteur)", "Nom avec auteur"),
|
- |
|
207 |
"bibc" => array("concat(a.annee,' ',a.biblio_origine)", "Année et bibliographie"),
|
- |
|
208 |
"nsrc" => array("concat(b.nom_sci,' ',b.auteur) as nom_sci_retenu_complet", "Nom retenu avec auteur"),
|
- |
|
209 |
"nf" => array("a.nom_francais", "Nom français normalisé"),
|
- |
|
210 |
"extax" => array("if (a.exclure_taxref = 1, 0, 1)", "Présent dans Taxref"),
|
- |
|
211 |
"lien" => array("concat('http://www.tela-botanica.org/bdtfx-nn-',a.num_nom)", "Permalien"),
|
- |
|
212 |
"ntsup" => array("a.num_tax_sup", "Numéro nomenclatural rang supérieur"),
|
- |
|
213 |
"pre" => array("a.presence", "Répartition géographique"),
|
- |
|
214 |
"ns" => array("a.nom_sci", "Nom sans auteur"),
|
- |
|
215 |
"aut" => array("a.auteur", "Auteur"),
|
- |
|
216 |
"ann" => array("a.annee", "Année publication"),
|
- |
|
217 |
"bib" => array("a.biblio_origine", "Bibliographie"),
|
- |
|
218 |
"ntype" => array("a.num_type", "Numéro du type"),
|
- |
|
219 |
"nbas" => array("a.num_basionyme", "Numéro du basionyme"),
|
- |
|
220 |
"genre" => array("a.genre", "Genre"),
|
- |
|
221 |
"esp" => array("a.epithete_sp", "Epithète espèce"),
|
- |
|
222 |
"eing" => array("a.epithete_infra_generique", "Epithète infragénérique"),
|
- |
|
223 |
"te" => array("a.type_epithete", "Type d'épithète infraspécifique"),
|
- |
|
224 |
"einsp" => array("a.epithete_infra_sp", "Epithète infraspécifique"),
|
- |
|
225 |
"hybp01" => array("a.hybride_parent_01", "Hybride parent 1"),
|
- |
|
226 |
"nomsupgen" => array("a.nom_supra_generique", "Nom supra générique"),
|
- |
|
227 |
"hybp02" => array("a.hybride_parent_02", "Hybride parent 2"),
|
- |
|
228 |
"stori" => array("a.statut_origine", "Statut d'origine"),
|
- |
|
229 |
"stint" => array("a.statut_introduction", "Statut d'introduction"),
|
- |
|
230 |
"stcult" => array("a.statut_culture", "Statut de culture"),
|
- |
|
231 |
"notes" => array("a.notes", "Remarques"),
|
- |
|
232 |
"nomadd" => array("a.nom_addendum", "Commentaires nomenclaturaux"),
|
- |
|
233 |
"nsr" => array("b.nom_sci as nom_sci_retenu", "Nom retenu sans auteur"),
|
- |
|
234 |
"hom" => array("a.homonyme", "Homonymie"),
|
- |
|
235 |
"synprop" => array("a.synonyme_proparte", "Synonyme proprate"),
|
- |
|
236 |
"syndout" => array("a.synonyme_douteux", "Synonyme douteux"),
|
- |
|
237 |
"synmapp" => array("a.synonyme_mal_applique", "Synonyme mal appliqué"),
|
- |
|
238 |
"synorth" => array("a.synonyme_orthographique", "Synonyme orthographique"),
|
- |
|
239 |
"orthori" => array("a.orthographe_originelle", "Orthographe originelle"),
|
- |
|
240 |
"hybp01n" => array("a.hybride_parent_01_notes", "Hybride parent 1 notes"),
|
- |
|
241 |
"hybp02n" => array("a.hybride_parent_02_notes", "Hybride parent 2 notes"),
|
- |
|
242 |
"cultgp" => array("a.cultivar_groupe", "Groupe de cultivar"),
|
- |
|
243 |
"cult" => array("a.cultivar", "Nom cultivar"),
|
- |
|
244 |
"nomcomm" => array("a.nom_commercial", "Nom commercial"),
|
- |
|
245 |
"autres" => array("a.*", "Autres"));
|
- |
|
246 |
// Initialisation des variables
|
200 |
// Initialisation des variables
|
247 |
$info = array();
|
201 |
$info = array();
|
248 |
$p = $this->traiterParametresUrl(array("ref","version","champs","filtre"), $param, false);
|
202 |
$p = $this->traiterParametresUrl(array("ref","version","champs","filtre"), $param, false);
|
249 |
$ref = $p['ref'].'_v'.$p['version'];
|
203 |
$ref = $p['ref'].'_v'.$p['version'];
|
250 |
$racine_tmp = $this->config['chemins']['chemin_tmp'];
|
204 |
$racine_tmp = $this->config['chemins']['chemin_tmp'];
|
251 |
$dossier = $racine_tmp.date('Y_m_d').'/';
|
205 |
$dossier = $racine_tmp.date('Y_m_d').'/';
|
252 |
if(!is_dir($dossier)){
|
206 |
if(!is_dir($dossier)){
|
253 |
mkdir($dossier);
|
207 |
mkdir($dossier);
|
254 |
}
|
208 |
}
|
255 |
$fichier = $dossier.$ref."_".time().'.csv'; // à mettre en config
|
209 |
$fichier = $dossier.$ref."_".time().'.csv';
|
256 |
$colonnes = explode(",", $p['champs']);
|
- |
|
257 |
|
- |
|
258 |
// recuperer colonne du ref pour vérifier que ces colonnes soient présentes + comptait nb colonnes pr autres
|
- |
|
259 |
foreach ($colonnes as $colonne) {
|
- |
|
260 |
$champs[] = $colonnesOrdonnees[$colonne][0];
|
210 |
$champs = $this->formaterColonnes($p['champs'], $ref);
|
261 |
$nom_champs[] = $colonnesOrdonnees[$colonne][1];
|
- |
|
262 |
}
|
- |
|
263 |
$requete = 'SELECT "'.implode('","', $nom_champs).'" UNION (SELECT '.implode(', ',$champs).
|
211 |
$requete = 'SELECT "'.implode('","', $champs['titre']).'" UNION (SELECT '.implode(', ',$champs['select']).
|
264 |
" INTO OUTFILE '".$fichier."' CHARACTER SET utf8 FIELDS TERMINATED BY '\t' OPTIONALLY ENCLOSED BY '' LINES TERMINATED BY '\n' ".
|
212 |
" INTO OUTFILE '".$fichier."' CHARACTER SET utf8 FIELDS TERMINATED BY '\t' OPTIONALLY ENCLOSED BY '' LINES TERMINATED BY '\n' ".
|
265 |
" FROM $ref a left join $ref b on b.num_nom=a.num_nom_retenu";
|
213 |
" FROM $ref a left join $ref b on b.num_nom=a.num_nom_retenu";
|
266 |
|
214 |
|
267 |
if (isset($p['filtre']) && $p['filtre'] != "*") {
|
215 |
if (isset($p['filtre']) && $p['filtre'] != "*") {
|
268 |
$param_filtres = explode(",",$p["filtre"]);
|
216 |
$param_filtres = explode(",",$p["filtre"]);
|
269 |
$dernier_filtre = array_pop($param_filtres);
|
217 |
$dernier_filtre = array_pop($param_filtres);
|
270 |
$filtres = array("nnr"=>"a.num_nom = a.num_nom_retenu", "pre" => "a.presence = 'P'");
|
218 |
$filtres = array("nnr"=>"a.num_nom = a.num_nom_retenu", "pre" => "a.presence = 'P'");
|
271 |
if (!isset($filtres[$dernier_filtre])) { // si il s'agit du filtre famille
|
219 |
if (!isset($filtres[$dernier_filtre])) { // si il s'agit du filtre famille
|
Line 289... |
Line 237... |
289 |
}
|
237 |
}
|
Line 290... |
Line 238... |
290 |
|
238 |
|
291 |
return $fichier;
|
239 |
return $fichier;
|
Line -... |
Line 240... |
- |
|
240 |
}
|
- |
|
241 |
|
- |
|
242 |
private function formaterColonnes($colonnes, $ref) {
|
- |
|
243 |
$colonnesOrdonnees = array("nn" => array("a.num_nom", "num_nom", "Numéro nomenclatural"),
|
- |
|
244 |
"nr" => array("a.num_nom_retenu", "num_nom_retenu", "Numéro nomenclatural du nom retenu"),
|
- |
|
245 |
"nt" => array("a.num_taxonomique", "num_taxonomique", "Numéro taxonomique"),
|
- |
|
246 |
"cd" => array("a.cd_nom", "cd_nom", "Numéro INPN"),
|
- |
|
247 |
"rg" => array("a.rang", "rang", "Code rang"),
|
- |
|
248 |
"fam" => array("a.famille", "famille", "Famille (APG III)"),
|
- |
|
249 |
"nsc" => array("concat(a.nom_sci,' ',a.auteur)", "nom_sci", "Nom avec auteur"),
|
- |
|
250 |
"bibc" => array("concat(a.annee,' ',a.biblio_origine)", "annee", "Année et bibliographie"),
|
- |
|
251 |
"nsrc" => array("concat(b.nom_sci,' ',b.auteur) as nom_sci_retenu_complet", "auteur", "Nom retenu avec auteur"),
|
- |
|
252 |
"nf" => array("a.nom_francais", "nom_francais", "Nom français normalisé"),
|
- |
|
253 |
"extax" => array("if (a.exclure_taxref = 1, 0, 1)", "exclure_taxref", "Présent dans Taxref"),
|
- |
|
254 |
"lien" => array("concat('http://www.tela-botanica.org/bdtfx-nn-',a.num_nom)", "num_nom", "Permalien"),
|
- |
|
255 |
"ntsup" => array("a.num_tax_sup", "num_tax_sup", "Numéro nomenclatural rang supérieur"),
|
- |
|
256 |
"pre" => array("a.presence", "presence", "Répartition géographique"),
|
- |
|
257 |
"ns" => array("a.nom_sci", "nom_sci", "Nom sans auteur"),
|
- |
|
258 |
"aut" => array("a.auteur", "auteur", "Auteur"),
|
- |
|
259 |
"ann" => array("a.annee", "annee", "Année publication"),
|
- |
|
260 |
"bib" => array("a.biblio_origine", "biblio_origine", "Bibliographie"),
|
- |
|
261 |
"ntype" => array("a.num_type", "num_type", "Numéro du type"),
|
- |
|
262 |
"nbas" => array("a.num_basionyme", "num_basionyme", "Numéro du basionyme"),
|
- |
|
263 |
"genre" => array("a.genre", "genre", "Genre"),
|
- |
|
264 |
"esp" => array("a.epithete_sp", "epithete_sp", "Epithète espèce"),
|
- |
|
265 |
"eing" => array("a.epithete_infra_generique", "epithete_infra_generique", "Epithète infragénérique"),
|
- |
|
266 |
"te" => array("a.type_epithete", "type_epithete", "Type d'épithète infraspécifique"),
|
- |
|
267 |
"einsp" => array("a.epithete_infra_sp", "epithete_infra_sp", "Epithète infraspécifique"),
|
- |
|
268 |
"hybp01" => array("a.hybride_parent_01", "hybride_parent_01", "Hybride parent 1"),
|
- |
|
269 |
"nomsupgen" => array("a.nom_supra_generique", "nom_supra_generique", "Nom supra générique"),
|
- |
|
270 |
"hybp02" => array("a.hybride_parent_02", "hybride_parent_02", "Hybride parent 2"),
|
- |
|
271 |
"stori" => array("a.statut_origine", "statut_origine", "Statut d'origine"),
|
- |
|
272 |
"stint" => array("a.statut_introduction", "statut_introduction", "Statut d'introduction"),
|
- |
|
273 |
"stcult" => array("a.statut_culture", "statut_culture", "Statut de culture"),
|
- |
|
274 |
"notes" => array("a.notes", "notes", "Remarques"),
|
- |
|
275 |
"nomadd" => array("a.nom_addendum", "nom_addendum", "Commentaires nomenclaturaux"),
|
- |
|
276 |
"nsr" => array("b.nom_sci as nom_sci_retenu", "nom_sci", "Nom retenu sans auteur"),
|
- |
|
277 |
"hom" => array("a.homonyme", "homonyme", "Homonymie"),
|
- |
|
278 |
"synprop" => array("a.synonyme_proparte", "synonyme_proparte", "Synonyme proprate"),
|
- |
|
279 |
"syndout" => array("a.synonyme_douteux", "synonyme_douteux", "Synonyme douteux"),
|
- |
|
280 |
"synmapp" => array("a.synonyme_mal_applique", "synonyme_mal_applique", "Synonyme mal appliqué"),
|
- |
|
281 |
"synorth" => array("a.synonyme_orthographique", "synonyme_orthographique", "Synonyme orthographique"),
|
- |
|
282 |
"orthori" => array("a.orthographe_originelle", "orthographe_originelle", "Orthographe originelle"),
|
- |
|
283 |
"hybp01n" => array("a.hybride_parent_01_notes", "hybride_parent_01_notes", "Hybride parent 1 notes"),
|
- |
|
284 |
"hybp02n" => array("a.hybride_parent_02_notes", "hybride_parent_02_notes", "Hybride parent 2 notes"),
|
- |
|
285 |
"cultgp" => array("a.cultivar_groupe", "cultivar_groupe", "Groupe de cultivar"),
|
- |
|
286 |
"cult" => array("a.cultivar", "cultivar", "Nom cultivar"),
|
- |
|
287 |
"nomcomm" => array("a.nom_commercial", "nom_commercial", "Nom commercial"),
|
- |
|
288 |
"autres" => array("a.*", "*", "Autres"));
|
- |
|
289 |
$colonnes = explode(",", $colonnes);
|
- |
|
290 |
$requete = "SHOW COLUMNS FROM $ref";
|
- |
|
291 |
$colonnesTable = $this->bdd->query($requete)->fetchAll(PDO::FETCH_COLUMN, "Field");
|
- |
|
292 |
foreach ($colonnes as $colonne) {
|
- |
|
293 |
if ($colonne == "autres") {
|
- |
|
294 |
foreach ($colonnesOrdonnees as $colOrd) {
|
- |
|
295 |
$test[] = $colOrd[1];
|
- |
|
296 |
}
|
- |
|
297 |
$index = function($valeur) { return 'a.'.$valeur; };
|
- |
|
298 |
$titre = function($valeur) { return 'Autres : '.$valeur; };
|
- |
|
299 |
$colonneAutres = array_diff($colonnesTable, $test);
|
- |
|
300 |
$champs['select'] = array_merge($champs['select'], array_map($index, $colonneAutres));
|
- |
|
301 |
$champs['titre'] = array_merge($champs['titre'], array_map($titre, $colonneAutres));
|
- |
|
302 |
} else {
|
- |
|
303 |
if (array_search($colonnesOrdonnees[$colonne][1], $colonnesTable) != false) {
|
- |
|
304 |
$champs['select'][] = $colonnesOrdonnees[$colonne][0];
|
- |
|
305 |
$champs['titre'][] = $colonnesOrdonnees[$colonne][2];
|
- |
|
306 |
}
|
- |
|
307 |
}
|
- |
|
308 |
}
|
- |
|
309 |
return $champs;
|
- |
|
310 |
}
|
- |
|
311 |
|
- |
|
312 |
private function ajouterIndexTable($valeur) {
|
- |
|
313 |
return 'a.'.$valeur;
|
292 |
}
|
314 |
}
|
293 |
|
315 |
|
294 |
/**
|
316 |
/**
|
295 |
* Méthode principale appelée avec une requête de type POST.
|
317 |
* Méthode principale appelée avec une requête de type POST.
|
296 |
*/
|
318 |
*/
|