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Rev 291 Rev 293
1
<?php
1
<?php
2
/**
2
/**
3
 * Service fournissant des informations sur les référentiels répondant aux critères de recherche
3
 * Service fournissant des informations sur les référentiels répondant aux critères de recherche
4
 * fournis en paramètre.
4
 * fournis en paramètre.
5
 * Encodage en entrée : utf8
5
 * Encodage en entrée : utf8
6
 * Encodage en sortie : utf8
6
 * Encodage en sortie : utf8
7
 * @author		Delphine CAUQUIL <delphine@tela-botanica.org>
7
 * @author		Delphine CAUQUIL <delphine@tela-botanica.org>
8
 * @author 		Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org>
8
 * @author 		Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org>
9
 * @license		http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-fr.txt Licence CECILL
9
 * @license		http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-fr.txt Licence CECILL
10
 * @license		http://www.gnu.org/licenses/gpl.html Licence GNU-GPL
10
 * @license		http://www.gnu.org/licenses/gpl.html Licence GNU-GPL
11
 * @version		$Id$
11
 * @version		$Id$
12
 * @copyright	2010 Tela-Botanica
12
 * @copyright	2010 Tela-Botanica
13
 */
13
 */
14
 
14
 
15
class Recherche extends Ref {
15
class Recherche extends Ref {
16
 
16
 
17
	/**
17
	/**
18
	 * Méthode principale appelée avec une requête de type GET.
18
	 * Méthode principale appelée avec une requête de type GET.
19
	 * Elle sert d'aiguilleur pour appeller la méthode correspondant au type de recherche passé en paramêtre.
19
	 * Elle sert d'aiguilleur pour appeller la méthode correspondant au type de recherche passé en paramêtre.
20
	 */
20
	 */
21
	public function getElement($param = array()) {
21
	public function getElement($param = array()) {
22
		// Initialisation des variables
22
		// Initialisation des variables
23
		$info = array();
23
		$info = array();
24
				
24
				
25
		// Nous recherchons le type de requête demandé
25
		// Nous recherchons le type de requête demandé
26
		$type = $param[0];
26
		$type = $param[0];
27
				 
27
				 
28
		$methode = 'getElement'.$type;
28
		$methode = 'getElement'.$type;
29
		if (method_exists($this, $methode)) {
29
		if (method_exists($this, $methode)) {
30
			array_shift($param);
30
			array_shift($param);
31
			$info = $this->$methode($param);
31
			$info = $this->$methode($param);
32
		} else {
32
		} else {
33
			$this->messages[] = "Le type de recherche demandé '$type' n'est pas disponible.";
33
			$this->messages[] = "Le type de recherche demandé '$type' n'est pas disponible.";
34
		}
34
		}
35
		
35
		
36
		// Envoie sur la sortie standard
36
		// Envoie sur la sortie standard
37
		$this->envoyer($info);
37
		$this->envoyer($info);
38
	}
38
	}
39
	
39
	
40
/* Méthode pour récupérer le nombre de taxons répondant à la requête
40
/* Méthode pour récupérer le nombre de taxons répondant à la requête
41
	 * Appelée avec les paramètres d'url suivant :
41
	 * Appelée avec les paramètres d'url suivant :
42
	 * /Recherche/Nombre/_
42
	 * /Recherche/Nombre/_
43
	 * ou les _ représentent dans l'ordre : référentiel, mots, paramétres avancés
43
	 * ou les _ représentent dans l'ordre : référentiel, mots, paramétres avancés
44
	 * Si un des paramètres est absent, il prendre la valeur *
44
	 * Si un des paramètres est absent, il prendre la valeur *
45
	 */
45
	 */
46
	public function getElementNombre($param) {
46
	public function getElementNombre($param) {
47
		// Initialisation des variables
47
		// Initialisation des variables
48
		$info = array();
48
		$info = array();
49
				
49
				
50
		// Pré traitement des paramètres
50
		// Pré traitement des paramètres
51
		$p = $this->pretraiterParametresUrl($param);
51
		$p = $this->pretraiterParametresUrl($param);
52
		$referentiel = substr($p['ref'], 2, -2); 
52
		$referentiel = substr($p['ref'], 2, -2); 
53
 
53
 
54
		// Construction de la requête
54
		// Construction de la requête
55
		// Il est important de compter le nombre de taxons pour l'affichage
55
		// Il est important de compter le nombre de taxons pour l'affichage
56
		$requete = 	(($this->distinct) ? 'SELECT DISTINCT' : 'SELECT').' COUNT(num_nom) AS nbre FROM '.$referentiel.
56
		$requete = 	(($this->distinct) ? 'SELECT DISTINCT' : 'SELECT').' COUNT(num_nom) AS nbre FROM '.$referentiel.
57
					$this->construireWhere($p).' ';
57
					$this->construireWhere($p).' ';
58
 
58
 
59
		// Récupération des résultats
59
		// Récupération des résultats
60
		try {
60
		try {
61
			$donnees = $this->bdd->query($requete)->fetch(PDO::FETCH_ASSOC);
61
			$donnees = $this->bdd->query($requete)->fetch(PDO::FETCH_ASSOC);
62
			if ($donnees === false) {
62
			if ($donnees === false) {
63
				$this->messages[] = "La requête a retourné aucun résultat : $requete";
63
				$this->messages[] = "La requête a retourné aucun résultat : $requete";
64
			} else {
64
			} else {
65
				$info = $donnees['nbre'];
65
				$info = $donnees['nbre'];
66
			}
66
			}
67
		} catch (PDOException $e) {
67
		} catch (PDOException $e) {
68
			$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage()).$requete;
68
			$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage()).$requete;
69
		}
69
		}
70
 
70
 
71
		return $info;
71
		return $info;
72
	}
72
	}
73
	
73
	
74
 	/* Méthode pour récupérer une liste de taxons
74
 	/* Méthode pour récupérer une liste de taxons
75
	 * Appelée avec les paramêtres d'url suivant :
75
	 * Appelée avec les paramêtres d'url suivant :
76
	 * /Recherche/ParDefaut/_
76
	 * /Recherche/ParDefaut/_
77
	 * ou les _ représentent dans l'ordre : référentiel, mots, paramétres avancés
77
	 * ou les _ représentent dans l'ordre : référentiel, mots, paramétres avancés
78
	 * Si un des paramètres est absent, il prendre la valeur *
78
	 * Si un des paramètres est absent, il prendre la valeur *
79
	 */
79
	 */
80
	public function getElementParDefaut($param) {
80
	public function getElementParDefaut($param) {
81
		// Initialisation des variables
81
		// Initialisation des variables
82
		$info = array();
82
		$info = array();
83
				
83
				
84
		// Pré traitement des paramètres
84
		// Pré traitement des paramètres
85
		$p = $this->pretraiterParametresUrl($param);
85
		$p = $this->pretraiterParametresUrl($param);
86
		$referentiel = substr($p['ref'], 2, -2); 
86
		$referentiel = substr($p['ref'], 2, -2); 
87
		
87
		
88
		// Construction de la requête		
88
		// Construction de la requête		
89
		$requete = 	(($this->distinct) ? 'SELECT DISTINCT' : 'SELECT').' num_nom, nom_sci, auteur, annee, '.
89
		$requete = 	(($this->distinct) ? 'SELECT DISTINCT' : 'SELECT').' num_nom, nom_sci, auteur, annee, '.
90
				'biblio_origine, nom_addendum, num_nom_retenu, presence, exclure_taxref'.
90
				'biblio_origine, nom_addendum, num_nom_retenu, presence, exclure_taxref'.
91
				' FROM '.$referentiel.$this->construireWhere($p).
91
				' FROM '.$referentiel.$this->construireWhere($p).
92
				'ORDER BY '.((!is_null($this->orderby)) ? $this->orderby  : 'nom_sci ASC').' '.
92
				'ORDER BY '.((!is_null($this->orderby)) ? $this->orderby  : 'nom_sci ASC').' '.
93
				"LIMIT $this->start, $this->limit "; 
93
				"LIMIT $this->start, $this->limit "; 
94
					
94
					
95
		// Récupération des résultats
95
		// Récupération des résultats
96
		try {
96
		try {
97
			$donnees = $this->bdd->query($requete)->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC);
97
			$donnees = $this->bdd->query($requete)->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC);
98
			if ($donnees === false) {
98
			if ($donnees === false) {
99
				$this->messages[] = "La requête a retourné aucun résultat : $requete";
99
				$this->messages[] = "La requête a retourné aucun résultat : $requete";
100
			} else {
100
			} else {
101
				$info = $donnees;
101
				$info = $donnees;
102
			}
102
			}
103
		} catch (PDOException $e) {
103
		} catch (PDOException $e) {
104
			$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage()).$requete;
104
			$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage()).$requete;
105
		}
105
		}
106
		return $info;
106
		return $info;
107
	}
107
	}
108
	
108
	
109
	
109
	
110
	/* Méthode pour récupérer le nombre de taxons répondant à une requête sur la synonymie
110
	/* Méthode pour récupérer le nombre de taxons répondant à une requête sur la synonymie
111
	 * Appelée avec les paramètres d'url suivant :
111
	 * Appelée avec les paramètres d'url suivant :
112
	 * /Recherche/Nombre/_
112
	 * /Recherche/Nombre/_
113
	 * ou les _ représentent dans l'ordre : référentiel, mots, paramétres avancés
113
	 * ou les _ représentent dans l'ordre : référentiel, mots, paramétres avancés
114
	 * Si un des paramètres est absent, il prendre la valeur *
114
	 * Si un des paramètres est absent, il prendre la valeur *
115
	 */
115
	 */
116
	public function getElementNombreTaxon($param) {
116
	public function getElementNombreTaxon($param) {
117
		// Initialisation des variables
117
		// Initialisation des variables
118
		$info = array();
118
		$info = array();
119
				
119
				
120
		// Pré traitement des paramètres
120
		// Pré traitement des paramètres
121
		$p = $this->pretraiterParametresUrl($param);
121
		$p = $this->pretraiterParametresUrl($param);
122
		$referentiel = substr($p['ref'], 2, -2); 
122
		$referentiel = substr($p['ref'], 2, -2); 
123
 
123
 
124
		
124
		
125
		// Construction de la requête
125
		// Construction de la requête
126
		// Il est important de compter le nombre de taxons pour l'affichage
126
		// Il est important de compter le nombre de taxons pour l'affichage
127
		$requete = 	'SELECT count(DISTINCT num_nom_retenu) as nbr FROM '.$referentiel.$this->construireWhere($p).';';
127
		$requete = 	'SELECT count(DISTINCT num_nom_retenu) as nbr FROM '.$referentiel.$this->construireWhere($p).';';
128
 
128
 
129
		// Récupération des résultats
129
		// Récupération des résultats
130
		try {
130
		try {
131
			$donnees = $this->bdd->query($requete)->fetch(PDO::FETCH_ASSOC);
131
			$donnees = $this->bdd->query($requete)->fetch(PDO::FETCH_ASSOC);
132
			if ($donnees === false) {
132
			if ($donnees === false) {
133
				$this->messages[] = "La requête a retourné aucun résultat.";
133
				$this->messages[] = "La requête a retourné aucun résultat.";
134
			} else {
134
			} else {
135
				$info = $donnees['nbr'];
135
				$info = $donnees['nbr'];
136
			}
136
			}
137
		} catch (PDOException $e) {
137
		} catch (PDOException $e) {
138
			$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage());
138
			$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage());
139
		}
139
		}
140
 
140
 
141
		return $info;
141
		return $info;
142
	}
142
	}
143
	
143
	
144
 	/* Méthode pour récupérer une liste de taxons
144
 	/* Méthode pour récupérer une liste de taxons
145
	 * Appelée avec les paramêtres d'url suivant :
145
	 * Appelée avec les paramêtres d'url suivant :
146
	 * /Recherche/ParDefaut/_
146
	 * /Recherche/ParDefaut/_
147
	 * ou les _ représentent dans l'ordre : référentiel, mots, paramétres avancés
147
	 * ou les _ représentent dans l'ordre : référentiel, mots, paramétres avancés
148
	 * Si un des paramètres est absent, il prendre la valeur *
148
	 * Si un des paramètres est absent, il prendre la valeur *
149
	 */
149
	 */
150
	public function getElementParTaxon($param) {
150
	public function getElementParTaxon($param) {
151
		// Initialisation des variables
151
		// Initialisation des variables
152
		$info = '';
152
		$info = '';
153
				
153
				
154
		// Pré traitement des paramètres
154
		// Pré traitement des paramètres
155
		$p = $this->pretraiterParametresUrl($param);
155
		$p = $this->pretraiterParametresUrl($param);
156
		$referentiel = substr($p['ref'], 2, -2); 
156
		$referentiel = substr($p['ref'], 2, -2); 
157
		
157
		
158
		$liste_nom = $this->getNomRetenu($param);
158
		$liste_nom = $this->getNomRetenu($param);
159
		if ($liste_nom != '') {
159
		if ($liste_nom != '') {
160
			// Construction de la requête
160
			// Construction de la requête
161
			// si recherche des synonymes
161
			// si recherche des synonymes
162
			$requete = (($this->distinct) ? 'SELECT DISTINCT' : 'SELECT').' num_nom, nom_sci, auteur, annee, '.
162
			$requete = (($this->distinct) ? 'SELECT DISTINCT' : 'SELECT').' num_nom, nom_sci, auteur, annee, '.
163
						'biblio_origine, nom_addendum, num_nom_retenu, basionyme, synonyme_mal_applique, presence, exclure_taxref '.
163
						'biblio_origine, nom_addendum, num_nom_retenu, basionyme, synonyme_mal_applique, presence, exclure_taxref '.
164
							' FROM '.$referentiel.' WHERE num_nom_retenu IN ('.$liste_nom.') '.
164
							' FROM '.$referentiel.' WHERE num_nom_retenu IN ('.$liste_nom.') '.
165
							'ORDER BY nom_sci ASC '; 
165
							'ORDER BY nom_sci ASC '; 
166
			try {
166
			try {
167
				$donnees = $this->bdd->query($requete)->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC);
167
				$donnees = $this->bdd->query($requete)->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC);
168
				$info = $donnees;
168
				$info = $donnees;
169
			} catch (PDOException $e) {
169
			} catch (PDOException $e) {
170
				$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage());
170
				$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage());
171
			}
171
			}
172
		}
172
		}
173
		return $info;
173
		return $info;
174
		
174
		
175
	}
175
	}
176
	
176
	
177
	/**
177
	/**
178
	 *  Récupérer le nombre de taxons d'une classifiation (infra ou supra)
178
	 *  Récupérer le nombre de taxons d'une classifiation (infra ou supra)
179
	 * Appelée avec les paramètres d'url suivant :
179
	 * Appelée avec les paramètres d'url suivant :
180
	* /Recherche/NombreClassif/_
180
	* /Recherche/NombreClassif/_
181
	* ou les _ représentent dans l'ordre : référentiel, mots, paramétres avancés
181
	* ou les _ représentent dans l'ordre : référentiel, mots, paramétres avancés
182
	* Si un des paramètres est absent, il prendre la valeur *
182
	* Si un des paramètres est absent, il prendre la valeur *
183
	*/
183
	*/
184
	public function getElementNombreClassif($param) {
184
	public function getElementNombreClassif($param) {
185
		// Initialisation des variables
185
		// Initialisation des variables
186
		$info = array();
186
		$info = array();
187
	
187
	
188
		// Pré traitement des paramètres
188
		// Pré traitement des paramètres
189
		$p = $this->pretraiterParametresUrl($param);
189
		$p = $this->pretraiterParametresUrl($param);
190
		$referentiel = substr($p['ref'], 2, -2);
190
		$referentiel = substr($p['ref'], 2, -2);
191
	
191
	
192
		$requete = '';
192
		$requete = '';
193
		if (isset($p['classif'])) {
193
		if (isset($p['classif'])) {
194
			if (!isset($p['nn'])) {
194
			if (!isset($p['nn'])) {
195
				$p['rg'] = 180;	
195
				$p['rg'] = 180;	
196
			}
196
			}
197
			
197
			
198
			if ($p['classif'] == 'infra') {
198
			if ($p['classif'] == 'infra') {
199
				$requete = 'SELECT COUNT(num_nom) as nbr '.
199
				$requete = 'SELECT COUNT(num_nom) as nbr '.
200
						   'FROM '.$referentiel.' '.
200
						   'FROM '.$referentiel.' '.
201
						   'WHERE num_tax_sup IN '.
201
						   'WHERE num_tax_sup IN '.
202
				           '(SELECT num_nom '.
202
				           '(SELECT num_nom '.
203
						   'FROM '.$referentiel.$this->construireWhere($p).') ';
203
						   'FROM '.$referentiel.$this->construireWhere($p).') ';
204
			} else {
204
			} else {
205
				$requete = 'SELECT count(distinct num_tax_sup) as nbr '.
205
				$requete = 'SELECT count(distinct num_tax_sup) as nbr '.
206
						'FROM '.$referentiel.$this->construireWhere($p).' ';
206
						'FROM '.$referentiel.$this->construireWhere($p).' ';
207
				
207
				
208
			}
208
			}
209
				
209
				
210
		} else {
210
		} else {
211
			// Construction de la requête
211
			// Construction de la requête
212
			// Il est important de compter le nombre de taxons pour l'affichage
212
			// Il est important de compter le nombre de taxons pour l'affichage
213
			$requete = 	'SELECT count(DISTINCT num_nom_retenu) as nbr FROM '.$referentiel.$this->construireWhere($p).';';
213
			$requete = 	'SELECT count(DISTINCT num_nom_retenu) as nbr FROM '.$referentiel.$this->construireWhere($p).';';
214
		}
214
		}
215
	
215
	
216
		// Récupération des résultats
216
		// Récupération des résultats
217
		try {
217
		try {
218
			$donnees = $this->bdd->query($requete)->fetch(PDO::FETCH_ASSOC);
218
			$donnees = $this->bdd->query($requete)->fetch(PDO::FETCH_ASSOC);
219
		if ($donnees === false) {
219
		if ($donnees === false) {
220
			$this->messages[] = "La requête a retourné aucun résultat.";
220
			$this->messages[] = "La requête a retourné aucun résultat.";
221
			} else {
221
			} else {
222
			$info = $donnees['nbr'];
222
			$info = $donnees['nbr'];
223
			
223
			
224
		}
224
		}
225
		} catch (PDOException $e) {
225
		} catch (PDOException $e) {
226
		$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage());
226
		$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage());
227
		}
227
		}
228
	
228
	
229
		return $info;
229
		return $info;
230
		}
230
		}
231
	
231
	
232
	/** 
232
	/** 
233
	 * Récupérer la classification d'un taxon donné (ses enfants ou parents)
233
	 * Récupérer la classification d'un taxon donné (ses enfants ou parents)
234
	 * Appelée avec les paramêtres d'url suivant :
234
	 * Appelée avec les paramêtres d'url suivant :
235
	* /Recherche/Hierarchie/_
235
	* /Recherche/Hierarchie/_
236
	* ou les _ représentent dans l'ordre : référentiel, mots, paramétres avancés (dont classif est le sens de la requête infra ou supra)
236
	* ou les _ représentent dans l'ordre : référentiel, mots, paramétres avancés (dont classif est le sens de la requête infra ou supra)
237
	* Si un des paramètres est absent, il prendre la valeur *
237
	* Si un des paramètres est absent, il prendre la valeur *
238
	*/
238
	*/
239
	public function getElementClassification($param) {
239
	public function getElementClassification($param) {
240
		
240
		
241
		$resultats = array();
241
		$resultats = array();
242
		
242
		
243
		try {
243
		try {
244
			$p = $this->pretraiterParametresUrl($param);
244
			$p = $this->pretraiterParametresUrl($param);
245
			$referentiel = substr($p['ref'], 2, -2);
245
			$referentiel = substr($p['ref'], 2, -2);
246
			$classif = $p['classif'];
246
			$classif = $p['classif'];
247
			
247
			
248
			//Si on ne recherche pas sur un numéro taxonomique, on veut ne trouver que les familles
248
			//Si on ne recherche pas sur un numéro taxonomique, on veut ne trouver que les familles
249
			if (!isset($p['nn'])) {
249
			if (!isset($p['nn'])) {
250
				$p['rg'] = 180;
250
				$p['rg'] = 180;
251
			}
251
			}
252
			
252
			
253
			// Récupérer les informations du nom sélectionné
253
			// Récupérer les informations du nom sélectionné
254
			$requete = 	(($this->distinct) ? 'SELECT DISTINCT' : 'SELECT').
254
			$requete = 	(($this->distinct) ? 'SELECT DISTINCT' : 'SELECT').
255
						' num_nom, nom_sci, auteur, annee, biblio_origine, nom_addendum,'.
255
						' num_nom, nom_sci, auteur, annee, biblio_origine, nom_addendum,'.
256
						' num_nom_retenu, presence, exclure_taxref, num_tax_sup'.
256
						' num_nom_retenu, presence, exclure_taxref, num_tax_sup'.
257
						' FROM '.$referentiel.$this->construireWhere($p).
257
						' FROM '.$referentiel.$this->construireWhere($p).
258
						' ORDER BY '.((!is_null($this->orderby)) ? $this->orderby  : 'nom_sci ASC');
258
						' ORDER BY '.((!is_null($this->orderby)) ? $this->orderby  : 'nom_sci ASC');
259
						
259
						
260
			$donnees = $this->bdd->query($requete)->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC);
260
			$donnees = $this->bdd->query($requete)->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC);
261
			
261
			
262
			if ($donnees === false) {
262
			if ($donnees === false) {
263
				$this->messages[] = "La requête a retourné aucun résultat : $requete";
263
				$this->messages[] = "La requête a retourné aucun résultat : $requete";
264
			} else {
264
			} else {
265
					
265
					
266
				if ($classif == 'infra') {
266
				if ($classif == 'infra') {
267
					$resultats = $this->trouverInfra($referentiel, $donnees);
267
					$resultats = $this->trouverInfra($referentiel, $donnees);
268
				} else {
268
				} else {
269
					$resultats = $this->trouverSupra($referentiel, $donnees);
269
					$resultats = $this->trouverSupra($referentiel, $donnees);
270
				}
270
				}
271
			}
271
			}
272
		} catch (PDOException $e) {
272
		} catch (PDOException $e) {
273
			$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage()).$requete;
273
			$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage()).$requete;
274
		}
274
		}
275
		return $resultats;
275
		return $resultats;
276
	}
276
	}
277
	
277
	
278
	/**
278
	/**
279
	 * Parcourir les données passées en paramètre pour trouver les taxons inférieurs
279
	 * Parcourir les données passées en paramètre pour trouver les taxons inférieurs
280
	 * @param $referentiel String le référentiel pour la requête
280
	 * @param $referentiel String le référentiel pour la requête
281
	 * @param $donnees Array un tableau de résultats contenant des lignes taxons
281
	 * @param $donnees Array un tableau de résultats contenant des lignes taxons
282
	 * @return un tableau de résultats contenant les taxons inférieurs
282
	 * @return un tableau de résultats contenant les taxons inférieurs
283
	 * */
283
	 * */
284
	public function trouverInfra($referentiel, $donnees) {
284
	public function trouverInfra($referentiel, $donnees) {
285
		$donneesInfras = array();
285
		$donneesInfras = array();
286
		foreach ($donnees as $taxon) {
286
		foreach ($donnees as $taxon) {
287
			
287
			
288
			$resultats = array();
288
			$resultats = array();
289
			$requete =  'SELECT DISTINCT '.
289
			$requete =  'SELECT DISTINCT '.
290
					' num_nom, nom_sci, auteur, annee, biblio_origine, nom_addendum,'.
290
					' num_nom, nom_sci, auteur, annee, biblio_origine, nom_addendum,'.
291
					' num_nom_retenu, presence, exclure_taxref'.
291
					' num_nom_retenu, presence, exclure_taxref'.
292
					' FROM '.$referentiel.
292
					' FROM '.$referentiel.
293
					' WHERE num_tax_sup = '.$taxon['num_nom'].' '.
293
					' WHERE num_tax_sup = '.$taxon['num_nom'].' '.
294
					' ORDER BY '.((!is_null($this->orderby)) ? $this->orderby  : 'nom_sci ASC').' '.
294
					' ORDER BY '.((!is_null($this->orderby)) ? $this->orderby  : 'nom_sci ASC').' '.
295
					"LIMIT $this->start, $this->limit ";
295
					"LIMIT $this->start, $this->limit ";
296
				
296
				
297
			$donneesInfras = $this->bdd->query($requete)->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC);
297
			$donneesInfras = $this->bdd->query($requete)->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC);
298
			
298
			
299
			if ($donneesInfras !== false) {
299
			if ($donneesInfras !== false) {
300
				$resultats = array_merge($resultats, $donneesInfras);
300
				$resultats = array_merge($resultats, $donneesInfras);
301
			}
301
			}
302
		}
302
		}
303
		
303
		
304
		return $donneesInfras;
304
		return $donneesInfras;
305
	}
305
	}
306
	
306
	
307
	/**
307
	/**
308
	 * Parcourir les données passées en paramètre pour trouver les taxons supérieurs
308
	 * Parcourir les données passées en paramètre pour trouver les taxons supérieurs
309
	 * @param $referentiel String le référentiel pour la requête
309
	 * @param $referentiel String le référentiel pour la requête
310
	 * @param $donnees Array un tableau de résultats contenant des lignes taxons
310
	 * @param $donnees Array un tableau de résultats contenant des lignes taxons
311
	 * @return un tableau de résultats contenant les taxons supérieurs
311
	 * @return un tableau de résultats contenant les taxons supérieurs
312
	 * */
312
	 * */
313
	public function trouverSupra($referentiel, $donnees) {
313
	public function trouverSupra($referentiel, $donnees) {
314
			$resultats = array();
314
			$resultats = array();
315
			$numNomSup = array();
315
			$numNomSup = array();
316
					
316
					
317
			foreach ($donnees as $taxon) {
317
			foreach ($donnees as $taxon) {
318
				$numNomSup[] = $taxon['num_tax_sup'];
318
				$numNomSup[] = $taxon['num_tax_sup'];
319
			}
319
			}
320
			
320
			
321
			// Récupérer les taxons supérieurs :
321
			// Récupérer les taxons supérieurs :
322
			$requete = 'SELECT DISTINCT '.
322
			$requete = 'SELECT DISTINCT '.
323
					' num_nom, nom_sci, auteur, annee, biblio_origine, nom_addendum,'.
323
					' num_nom, nom_sci, auteur, annee, biblio_origine, nom_addendum,'.
324
					' num_nom_retenu, presence, exclure_taxref, num_tax_sup'.
324
					' num_nom_retenu, presence, exclure_taxref, num_tax_sup'.
325
					' FROM '.$referentiel.
325
					' FROM '.$referentiel.
326
					' WHERE num_nom IN ('.implode(',', $numNomSup).') '.
326
					' WHERE num_nom IN ('.implode(',', $numNomSup).') '.
327
					' ORDER BY '.((!is_null($this->orderby)) ? $this->orderby  : 'nom_sci ASC').' '.
327
					' ORDER BY '.((!is_null($this->orderby)) ? $this->orderby  : 'nom_sci ASC').' '.
328
					"LIMIT $this->start, $this->limit ";
328
					"LIMIT $this->start, $this->limit ";
329
			
329
			
330
			$donneesSupras = $this->bdd->query($requete)->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC);
330
			$donneesSupras = $this->bdd->query($requete)->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC);
331
				
331
				
332
			if ($donneesSupras !== false) {
332
			if ($donneesSupras !== false) {
333
				$resultats = $donneesSupras;
333
				$resultats = $donneesSupras;
334
			}
334
			}
335
			
335
			
336
			return $resultats;
336
			return $resultats;
337
	}
337
	}
338
	
338
	
339
	/* Méthode pour récupérer une liste de noms retenus
339
	/* Méthode pour récupérer une liste de noms retenus
340
	 */
340
	 */
341
	public function getNomRetenu($param) {
341
	public function getNomRetenu($param) {
342
		// Initialisation des variables
342
		// Initialisation des variables
343
		$info = array();
343
		$info = array();
344
				
344
				
345
		// Pré traitement des paramètres
345
		// Pré traitement des paramètres
346
		$p = $this->pretraiterParametresUrl($param);
346
		$p = $this->pretraiterParametresUrl($param);
347
		$referentiel = substr($p['ref'], 2, -2); 
347
		$referentiel = substr($p['ref'], 2, -2); 
348
		
348
		
349
		// Construction de la requête
349
		// Construction de la requête
350
		// si recherche des synonymes
350
		// si recherche des synonymes
351
		$requete_nom_retenu =	'SELECT DISTINCT num_nom_retenu FROM '.$referentiel.$this->construireWhere($p)
351
		$requete_nom_retenu =	'SELECT DISTINCT num_nom_retenu FROM '.$referentiel.$this->construireWhere($p)
352
			."AND num_nom=num_nom_retenu ORDER BY nom_sci ASC LIMIT $this->start, $this->limit ".';';
352
			." ORDER BY nom_sci ASC LIMIT $this->start, $this->limit ".';';
353
		try {
353
		try {
354
			$info = '';
354
			$info = '';
355
			$donnees_nom_retenu = $this->bdd->query($requete_nom_retenu)->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC);
355
			$donnees_nom_retenu = $this->bdd->query($requete_nom_retenu)->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC);
356
 
356
 
357
			if ($donnees_nom_retenu === false) {
357
			if ($donnees_nom_retenu === false) {
358
				$this->messages[] = "La requête n'a retourné aucun résultat.";
358
				$this->messages[] = "La requête n'a retourné aucun résultat.";
359
			} else {
359
			} else {
360
				$liste_nom = '';
360
				$liste_nom = '';
361
				foreach ($donnees_nom_retenu as $donnees_nom) {
361
				foreach ($donnees_nom_retenu as $donnees_nom) {
362
					if ($donnees_nom['num_nom_retenu'] != '') {
362
					if ($donnees_nom['num_nom_retenu'] != '') {
363
						$liste_nom .= (!empty($liste_nom) ? ', ' : '').'"'.$donnees_nom['num_nom_retenu'].'"';
363
						$liste_nom .= (!empty($liste_nom) ? ', ' : '').'"'.$donnees_nom['num_nom_retenu'].'"';
364
					}
364
					}
365
				}
365
				}
366
				$info = $liste_nom;
366
				$info = $liste_nom;
367
			}
367
			}
368
		} catch (PDOException $e) {
368
		} catch (PDOException $e) {
369
			$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage());
369
			$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage());
370
		}
370
		}
371
		return $info;
371
		return $info;
372
	}
372
	}
373
	
373
	
374
	private function pretraiterParametresUrl($param) {
374
	private function pretraiterParametresUrl($param) {
375
		// Tableau des paramètres qui peuvent être passés dans l'url
375
		// Tableau des paramètres qui peuvent être passés dans l'url
376
		$params_passes = array('ref' => 'str',
376
		$params_passes = array('ref' => 'str',
377
			'mots' => 'str',
377
			'mots' => 'str',
378
			'sg' => 'str_exact', 
378
			'sg' => 'str_exact', 
379
			'gen' => 'str_exact', 
379
			'gen' => 'str_exact', 
380
			'sp' => 'str_exact',
380
			'sp' => 'str_exact',
381
			'ssp' => 'str_exact',
381
			'ssp' => 'str_exact',
382
			'au' => 'str',
382
			'au' => 'str',
383
			'an' => 'str',
383
			'an' => 'str',
384
			'nn' => 'int',
384
			'nn' => 'int',
385
			'bib' => 'str',
385
			'bib' => 'str',
386
			'nr' => 'bool',
386
			'nr' => 'bool',
387
			'tax' => 'bool',
387
			'tax' => 'bool',
388
			'pre' => 'bool',
388
			'pre' => 'bool',
389
			'taxref' => 'bool',
389
			'taxref' => 'bool',
390
			'classif' => '',
390
			'classif' => '',
391
			'rg' => 'int');
391
			'rg' => 'int');
392
		
392
		
393
		$p = $this->traiterParametresUrl(array_keys($params_passes), $param, false);
393
		$p = $this->traiterParametresUrl(array_keys($params_passes), $param, false);
394
		//$this->debug[] = $param;
394
		//$this->debug[] = $param;
395
		foreach ($params_passes as $param_passe => $type) {
395
		foreach ($params_passes as $param_passe => $type) {
396
			if (isset($p[$param_passe])) {
396
			if (isset($p[$param_passe])) {
397
				// Suppression des éventuels espaces en début et fin de chaine
397
				// Suppression des éventuels espaces en début et fin de chaine
398
				$valeur = trim($p[$param_passe]);
398
				$valeur = trim($p[$param_passe]);
399
				
399
				
400
				// Type de paramètre chaine
400
				// Type de paramètre chaine
401
				if ($type == 'str') {
401
				if ($type == 'str') {
402
					// Suppression des slash
402
					// Suppression des slash
403
					$valeur = stripslashes($valeur);
403
					$valeur = stripslashes($valeur);
404
					
404
					
405
					// Utilisation d'une recherche de chaîne
405
					// Utilisation d'une recherche de chaîne
406
					if (preg_match('/^"(.*)"$/', $valeur, $match)) {
406
					if (preg_match('/^"(.*)"$/', $valeur, $match)) {
407
						$valeur = '%'.$match[1].'%';
407
						$valeur = '%'.$match[1].'%';
408
					} elseif ($valeur == "#") {
408
					} elseif ($valeur == "#") {
409
					}else{
409
					}else{
410
						// Recherche de mots non liés
410
						// Recherche de mots non liés
411
						$mots = explode(' ', $valeur);
411
						$mots = explode(' ', $valeur);
412
						$valeur = '%'.implode ('%', $mots).'%';
412
						$valeur = '%'.implode ('%', $mots).'%';
413
					}
413
					}
414
					// Mise en place des quotes pour l'interrogation dans la bdd
414
					// Mise en place des quotes pour l'interrogation dans la bdd
415
					$valeur = $this->bdd->quote($valeur);
415
					$valeur = $this->bdd->quote($valeur);
416
				}
416
				}
417
				// Type de paramètre chaine exacte
417
				// Type de paramètre chaine exacte
418
				if ($type == 'str_exact') {
418
				if ($type == 'str_exact') {
419
					// Suppression des slash
419
					// Suppression des slash
420
					$valeur = stripslashes($valeur);
420
					$valeur = stripslashes($valeur);
421
					
421
					
422
					// Utilisation d'une recherche de chaîne exacte
422
					// Utilisation d'une recherche de chaîne exacte
423
					if (preg_match('/^"(.*)"$/', $valeur, $match)) {
423
					if (preg_match('/^"(.*)"$/', $valeur, $match)) {
424
						$valeur = $match[1];
424
						$valeur = $match[1];
425
					} else {
425
					} else {
426
						// Recherche de mots non liés
426
						// Recherche de mots non liés
427
						$mots = explode(' ', $valeur);
427
						$mots = explode(' ', $valeur);
428
						$valeur = implode (' ', $mots);
428
						$valeur = implode (' ', $mots);
429
					}
429
					}
430
					// Mise en place des quotes pour l'interrogation dans la bdd
430
					// Mise en place des quotes pour l'interrogation dans la bdd
431
					$valeur = $this->bdd->quote($valeur);
431
					$valeur = $this->bdd->quote($valeur);
432
				}
432
				}
433
				// Type de paramètre booléen
433
				// Type de paramètre booléen
434
				if ($type == 'bool') {
434
				if ($type == 'bool') {
435
					if (preg_match('/^[0]$/', $valeur)) {
435
					if (preg_match('/^[0]$/', $valeur)) {
436
						$valeur = false;
436
						$valeur = false;
437
					} else if (preg_match('/^[1]$/', $valeur)) {
437
					} else if (preg_match('/^[1]$/', $valeur)) {
438
						$valeur = true;
438
						$valeur = true;
439
					} else {
439
					} else {
440
						$this->messages[] = "Le paramètre '$param_passe' attend une valeur de type 0 ou 1 et non '$valeur'.";
440
						$this->messages[] = "Le paramètre '$param_passe' attend une valeur de type 0 ou 1 et non '$valeur'.";
441
						$valeur = null;
441
						$valeur = null;
442
					}
442
					}
443
					
443
					
444
				}
444
				}
445
				// Type de paramètre entier
445
				// Type de paramètre entier
446
				if ($type == 'int') {
446
				if ($type == 'int') {
447
					if (!preg_match('/^(?:[0-9]+,\s*)*[0-9]+$/', $valeur)) {
447
					if (!preg_match('/^(?:[0-9]+,\s*)*[0-9]+$/', $valeur)) {
448
						$this->messages[] = "Le paramètre '$param_passe' attend une ou plusieurs valeurs de type entiers ".
448
						$this->messages[] = "Le paramètre '$param_passe' attend une ou plusieurs valeurs de type entiers ".
449
							"séparés par des virgules et non '$valeur'.";
449
							"séparés par des virgules et non '$valeur'.";
450
						$valeur = null;
450
						$valeur = null;
451
					}
451
					}
452
				}
452
				}
453
				
453
				
454
				$p[$param_passe] = $valeur;
454
				$p[$param_passe] = $valeur;
455
			}
455
			}
456
		}
456
		}
457
		
457
		
458
		return $p;
458
		return $p;
459
	}
459
	}
460
	
460
	
461
	private function construireWhere($p) {
461
	private function construireWhere($p) {
462
		// Initialisation de variables
462
		// Initialisation de variables
463
		$where = ' WHERE ';
463
		$where = ' WHERE ';
464
		
464
		
465
		// Construire where en fonction des paramêtres 
465
		// Construire where en fonction des paramêtres 
466
		if (isset($p['mots'])) {
466
		if (isset($p['mots'])) {
467
			if (stripos($p['mots'], "#") == 1) {
467
			if (stripos($p['mots'], "#") == 1) {
468
				$where .= " 1 ";
468
				$where .= " 1 ";
469
			} else {
469
			} else {
470
			$where .= 'AND ('.	
470
			$where .= 'AND ('.	
471
				" num_nom LIKE {$p['mots']} ".
471
				" num_nom LIKE {$p['mots']} ".
472
				" OR num_nom_retenu LIKE {$p['mots']} ".
472
				" OR num_nom_retenu LIKE {$p['mots']} ".
473
				" OR num_tax_sup LIKE {$p['mots']} ".
473
				" OR num_tax_sup LIKE {$p['mots']} ".
474
				" OR rang LIKE {$p['mots']} ".
474
				" OR rang LIKE {$p['mots']} ".
475
				" OR nom_sci LIKE {$p['mots']} ".
475
				" OR nom_sci LIKE {$p['mots']} ".
476
				" OR nom_supra_generique LIKE {$p['mots']} ".
476
				" OR nom_supra_generique LIKE {$p['mots']} ".
477
				" OR genre LIKE {$p['mots']} ".
477
				" OR genre LIKE {$p['mots']} ".
478
				" OR epithete_infra_generique LIKE {$p['mots']} ".
478
				" OR epithete_infra_generique LIKE {$p['mots']} ".
479
				" OR epithete_sp LIKE {$p['mots']} ".
479
				" OR epithete_sp LIKE {$p['mots']} ".
480
				" OR type_epithete LIKE {$p['mots']} ".
480
				" OR type_epithete LIKE {$p['mots']} ".
481
				" OR epithete_infra_sp LIKE {$p['mots']} ".
481
				" OR epithete_infra_sp LIKE {$p['mots']} ".
482
				" OR cultivar_groupe LIKE {$p['mots']} ".
482
				" OR cultivar_groupe LIKE {$p['mots']} ".
483
				" OR cultivar LIKE {$p['mots']} ".
483
				" OR cultivar LIKE {$p['mots']} ".
484
				" OR nom_commercial LIKE {$p['mots']} ".
484
				" OR nom_commercial LIKE {$p['mots']} ".
485
				" OR auteur LIKE {$p['mots']} ".
485
				" OR auteur LIKE {$p['mots']} ".
486
				" OR annee LIKE {$p['mots']} ".
486
				" OR annee LIKE {$p['mots']} ".
487
				" OR biblio_origine LIKE {$p['mots']} ".
487
				" OR biblio_origine LIKE {$p['mots']} ".
488
				" OR notes LIKE {$p['mots']} ".
488
				" OR notes LIKE {$p['mots']} ".
489
				" OR nom_addendum LIKE {$p['mots']} ".
489
				" OR nom_addendum LIKE {$p['mots']} ".
490
				" OR homonyme LIKE {$p['mots']} ".
490
				" OR homonyme LIKE {$p['mots']} ".
491
				" OR basionyme LIKE {$p['mots']} ".
491
				" OR basionyme LIKE {$p['mots']} ".
492
				" OR synonyme_proparte LIKE {$p['mots']} ".
492
				" OR synonyme_proparte LIKE {$p['mots']} ".
493
				" OR synonyme_douteux LIKE {$p['mots']} ".
493
				" OR synonyme_douteux LIKE {$p['mots']} ".
494
				" OR synonyme_mal_applique LIKE {$p['mots']} ".
494
				" OR synonyme_mal_applique LIKE {$p['mots']} ".
495
				" OR synonyme_orthographique LIKE {$p['mots']} ".
495
				" OR synonyme_orthographique LIKE {$p['mots']} ".
496
				" OR hybride_parent_01 LIKE {$p['mots']} ".
496
				" OR hybride_parent_01 LIKE {$p['mots']} ".
497
				" OR hybride_parent_01_notes LIKE {$p['mots']} ".
497
				" OR hybride_parent_01_notes LIKE {$p['mots']} ".
498
				" OR hybride_parent_02 LIKE {$p['mots']} ".
498
				" OR hybride_parent_02 LIKE {$p['mots']} ".
499
				" OR hybride_parent_02_notes LIKE {$p['mots']} ".
499
				" OR hybride_parent_02_notes LIKE {$p['mots']} ".
500
				" OR nom_francais LIKE {$p['mots']} ".
500
				" OR nom_francais LIKE {$p['mots']} ".
501
				" OR presence LIKE {$p['mots']} ".
501
				" OR presence LIKE {$p['mots']} ".
502
				" OR statut_origine LIKE {$p['mots']} ".
502
				" OR statut_origine LIKE {$p['mots']} ".
503
				" OR statut_introduction LIKE {$p['mots']} ".
503
				" OR statut_introduction LIKE {$p['mots']} ".
504
				" OR statut_culture LIKE {$p['mots']} ".
504
				" OR statut_culture LIKE {$p['mots']} ".
505
				') ';
505
				') ';
506
			}
506
			}
507
		}
507
		}
508
		if (isset($p['sg'])) {
508
		if (isset($p['sg'])) {
509
			$where .= "AND nom_supra_generique LIKE {$p['sg']} ";
509
			$where .= "AND nom_supra_generique LIKE {$p['sg']} ";
510
		}
510
		}
511
		if (isset($p['gen'])) {
511
		if (isset($p['gen'])) {
512
			$where .= "AND genre LIKE ({$p['gen']}) ";
512
			$where .= "AND genre LIKE ({$p['gen']}) ";
513
		}
513
		}
514
		if (isset($p['sp'])) {
514
		if (isset($p['sp'])) {
515
			$where .= "AND epithete_sp LIKE {$p['sp']} ";
515
			$where .= "AND epithete_sp LIKE {$p['sp']} ";
516
		}
516
		}
517
		if (isset($p['ssp'])) {
517
		if (isset($p['ssp'])) {
518
			$where .= "AND epithete_infra_sp LIKE {$p['ssp']} ";
518
			$where .= "AND epithete_infra_sp LIKE {$p['ssp']} ";
519
		}
519
		}
520
		if (isset($p['au'])) {
520
		if (isset($p['au'])) {
521
			$where .= "AND auteur LIKE {$p['au']} ";
521
			$where .= "AND auteur LIKE {$p['au']} ";
522
		}
522
		}
523
		if (isset($p['an'])) {
523
		if (isset($p['an'])) {
524
			$where .= "AND annee LIKE ({$p['an']}) ";
524
			$where .= "AND annee LIKE ({$p['an']}) ";
525
		}
525
		}
526
		if (isset($p['nn'])) {
526
		if (isset($p['nn'])) {
527
			$where .= "AND num_nom IN ({$p['nn']}) ";
527
			$where .= "AND num_nom IN ({$p['nn']}) ";
528
		}	
528
		}	
529
		if (isset($p['bib'])) {
529
		if (isset($p['bib'])) {
530
			$where .= "AND biblio_origine LIKE ({$p['bib']}) ";
530
			$where .= "AND biblio_origine LIKE ({$p['bib']}) ";
531
		}
531
		}
532
		if (isset($p['nr']) && $p['nr'] == true) {
532
		if (isset($p['nr']) && $p['nr'] == true) {
533
			$where .= "AND num_nom_retenu = num_nom ";
533
			$where .= "AND num_nom_retenu = num_nom ";
534
		}
534
		}
535
		if (isset($p['pre']) && $p['pre'] == true) {
535
		if (isset($p['pre']) && $p['pre'] == true) {
536
			$where .= "AND presence NOT IN ('A', '') ";
536
			$where .= "AND presence NOT IN ('A', '') ";
537
		} elseif(isset($p['pre']) && $p['pre'] != true) {
537
		} elseif(isset($p['pre']) && $p['pre'] != true) {
538
			$where .= "AND presence IN ('A', '') ";
538
			$where .= "AND presence IN ('A', '') ";
539
			
539
			
540
		}
540
		}
541
		if (isset($p['taxref'])) {
541
		if (isset($p['taxref'])) {
542
			$where .= "AND exclure_taxref =";
542
			$where .= "AND exclure_taxref =";
543
			$where .= ($p['taxref'] == true) ? " 0 " : " 1 ";
543
			$where .= ($p['taxref'] == true) ? " 0 " : " 1 ";
544
		}
544
		}
545
		
545
		
546
		if (isset($p['rg'])) {
546
		if (isset($p['rg'])) {
547
			$where .= "AND rang = $p[rg] ";
547
			$where .= "AND rang = $p[rg] ";
548
		}
548
		}
549
		
549
		
550
		
550
		
551
		$where = str_replace('WHERE AND', ' WHERE ', $where);
551
		$where = str_replace('WHERE AND', ' WHERE ', $where);
552
		
552
		
553
		
553
		
554
		// Retour du Where associé
554
		// Retour du Where associé
555
		if (count($p) == 0) {
555
		if (count($p) == 0) {
556
			$where = "";
556
			$where = "";
557
		}
557
		}
558
		return $where;
558
		return $where;
559
	}
559
	}
560
}
560
}
561
?>
561
?>