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Rev 356 Rev 377
1 
<?php
 1 
<?php
2 
/**
 2 
/**
3 
 * Service fournissant des données de la table contenant le référentiel de travail.
 3 
 * Service fournissant des données de la table contenant le référentiel de travail.
4 
 * Encodage en entrée : utf8
 4 
 * Encodage en entrée : utf8
5 
 * Encodage en sortie : utf8
 5 
 * Encodage en sortie : utf8
6 
 *
 6 
 *
7 
 * @category	Php 5.2
 7 
 * @category	Php 5.2
8 
 * @package		Referentiel
 8 
 * @package		Referentiel
9 
 * @author		Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org>
 9 
 * @author		Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org>
10 
 * @license		GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
 10 
 * @license		GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
11 
 * @license		CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
 11 
 * @license		CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
12 
 * @copyright	2010 Tela-Botanica
 12 
 * @copyright	2010 Tela-Botanica
13 
 * @version		$Id$
 13 
 * @version		$Id$
14 
 */
 14 
 */
15 
class Referentiel extends Ref {
 15 
class Referentiel extends Ref {
16
16
17 
	/**
 17 
	/**
18 
	 * Méthode principale appelée avec une requête de type GET.
 18 
	 * Méthode principale appelée avec une requête de type GET.
19 
	 */
 19 
	 */
20 
	public function getElement($params_url = array()) {
 20 
	public function getElement($params_url = array()) {
21 
		// Initialisation des variables
 21 
		// Initialisation des variables
22 
		$info = array();
 22 
		$info = array();
23
23
24 
		// Nour recherchons le type de requête demandé
 24 
		// Nour recherchons le type de requête demandé
25 
		$p = $this->traiterParametresUrl(array('type'), $params_url, false);
 25 
		$p = $this->traiterParametresUrl(array('type'), $params_url, false);
26 
		extract($p);
 26 
		extract($p);
27
27
28 
		if (!is_null($type)) {
 28 
		if (!is_null($type)) {
29 
			$methode = 'getElement'.$type;
 29 
			$methode = 'getElement'.$type;
30 
			if (method_exists($this, $methode)) {
 30 
			if (method_exists($this, $methode)) {
31 
				array_shift($params_url);
 31 
				array_shift($params_url);
32 
				$info = $this->$methode($params_url);
 32 
				$info = $this->$methode($params_url);
33 
			} else {
 33 
			} else {
34 
				$this->messages[] = "Le type d'information demandé '$type' n'est pas disponible.";
 34 
				$this->messages[] = "Le type d'information demandé '$type' n'est pas disponible.";
35 
			}
 35 
			}
36 
		} else {
 36 
		} else {
37 
			$this->messages[] = "Veuillez préciser le type de requête.";
 37 
			$this->messages[] = "Veuillez préciser le type de requête.";
38 
		}
 38 
		}
39
39
40 
		// Envoie sur la sortie standard
 40 
		// Envoie sur la sortie standard
41 
		$this->envoyer($info);
 41 
		$this->envoyer($info);
42 
	}
 42 
	}
43
43
44 
	/* Méthode pour récupérer les infos sur les référentiels disponibles
 44 
	/* Méthode pour récupérer les infos sur les référentiels disponibles
45 
	* Appelée avec les paramêtres d'url suivant :
 45 
	* Appelée avec les paramêtres d'url suivant :
46 
	* /RefReferentiel/tout/code_du_referentiel
 46 
	* /RefReferentiel/tout/code_du_referentiel
47 
	*/
 47 
	*/
48 
	public function getElementDispo($params_url) {
 48 
	public function getElementDispo($params_url) {
49 
		$requete =	'SHOW TABLES ';
 49 
		$requete =	'SHOW TABLES ';
50 
		$donnees = false;
 50 
		$donnees = false;
51
51
52 
		// Récupération des résultats
 52 
		// Récupération des résultats
53 
		try {
 53 
		try {
54 
			$tables = $this->bdd->query($requete)->fetchAll(PDO::FETCH_COLUMN, 0);
 54 
			$tables = $this->bdd->query($requete)->fetchAll(PDO::FETCH_COLUMN, 0);
55 
			if ($tables !== false) {
 55 
			if ($tables !== false) {
56 
				foreach ($tables as $table) {
 56 
				foreach ($tables as $table) {
57 
					if (preg_match('/^([a-z]+)_meta$/', $table, $match)) {
 57 
					if (preg_match('/^([a-z]+)_meta$/', $table, $match)) {
58 
						$donnees[] = $match[1];
 58 
						$donnees[] = $match[1];
59 
					}
 59 
					}
60 
				}
 60 
				}
61 
			} else {
 61 
			} else {
62 
				$this->messages[] = "La requête a retourné aucun résultat.";
 62 
				$this->messages[] = "La requête a retourné aucun résultat.";
63 
			}
 63 
			}
64 
		} catch (PDOException $e) {
 64 
		} catch (PDOException $e) {
65 
			$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage());
 65 
			$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage());
66 
		}
 66 
		}
67 
		return $donnees;
 67 
		return $donnees;
68 
	}
 68 
	}
69
69
70
70
71
71
72 
	/* Méthode pour récupérer les noms d'un référentiel.
 72 
	/* Méthode pour récupérer les noms d'un référentiel.
73 
	* Appelée avec les paramêtres d'url suivant :
 73 
	* Appelée avec les paramêtres d'url suivant :
74 
	* /Referentiel/tout/code_du_referentiel?start=0&limit=1000
 74 
	* /Referentiel/tout/code_du_referentiel?start=0&limit=1000
75 
	*/
 75 
	*/
76 
	public function getElementTout($params_url) {
 76 
	public function getElementTout($params_url) {
77 
		$p = $this->traiterParametresUrl(array('projet'), $params_url, false);
 77 
		$p = $this->traiterParametresUrl(array('projet'), $params_url, false);
78 
		extract($p);
 78 
		extract($p);
79
79
80 
		$donnees = false;
 80 
		$donnees = false;
81 
		if (!is_null($projet)) {
 81 
		if (!is_null($projet)) {
82 
			$requete =	($this->distinct ? 'SELECT DISTINCT' : 'SELECT').' * '.
 82 
			$requete =	($this->distinct ? 'SELECT DISTINCT' : 'SELECT').' * '.
83 
						"FROM $projet ".
 83 
						"FROM $projet ".
84 
						'ORDER BY '.((!is_null($this->orderby)) ? $this->orderby  : 'num_nom ASC').' '.
 84 
						'ORDER BY '.((!is_null($this->orderby)) ? $this->orderby  : 'num_nom ASC').' '.
85 
						"LIMIT $this->start, $this->limit ";
 85 
						"LIMIT $this->start, $this->limit ";
86 
			$this->debug[] = $requete;
 86 
			$this->debug[] = $requete;
87 
			// Récupération des résultats
 87 
			// Récupération des résultats
88 
			try {
 88 
			try {
89 
				$donnees = $this->bdd->query($requete)->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC);
 89 
				$donnees = $this->bdd->query($requete)->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC);
90 
				if ($donnees === false) {
 90 
				if ($donnees === false) {
91 
					$this->messages[] = "La requête a retourné aucun résultat.";
 91 
					$this->messages[] = "La requête a retourné aucun résultat.";
92 
				} else {
 92 
				} else {
93 
					$donnees_tmp = $donnees;
 93 
					$donnees_tmp = $donnees;
94 
					$donnees = array();
 94 
					$donnees = array();
95 
					foreach ($donnees_tmp as &$nom) {
 95 
					foreach ($donnees_tmp as &$nom) {
96 
						$donnees[$nom['num_nom']] = $nom;
 96 
						$donnees[$nom['num_nom']] = $nom;
97 
						unset($nom);
 97 
						unset($nom);
98 
					}
 98 
					}
99 
				}
 99 
				}
100 
			} catch (PDOException $e) {
 100 
			} catch (PDOException $e) {
101 
				$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage());
 101 
				$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage());
102 
			}
 102 
			}
103 
		} else {
 103 
		} else {
104 
			$this->messages[] = "Veuillez préciser le nom de code du projet comme second paramêtre (ex. : bdnff).";
 104 
			$this->messages[] = "Veuillez préciser le nom de code du projet comme second paramêtre (ex. : bdnff).";
105 
		}
 105 
		}
106 
		return $donnees;
 106 
		return $donnees;
107 
	}
 107 
	}
108
108
109 
	/* Méthode pour récupérer le nombre de noms présents dans un référentiel.
 109 
	/* Méthode pour récupérer le nombre de noms présents dans un référentiel.
110 
	* Appelée avec les paramêtres d'url suivant :
 110 
	* Appelée avec les paramêtres d'url suivant :
111 
	* /RefReferentiel/nombre/code_du_referentiel
 111 
	* /RefReferentiel/nombre/code_du_referentiel
112 
	*/
 112 
	*/
113 
	public function getElementNombre($params_url) {
 113 
	public function getElementNombre($params_url) {
114 
		$p = $this->traiterParametresUrl(array('projet'), $params_url, false);
 114 
		$p = $this->traiterParametresUrl(array('projet'), $params_url, false);
115 
		extract($p);
 115 
		extract($p);
116
116
117 
		$nbre = false;
 117 
		$nbre = false;
118 
		if (!is_null($projet)) {
 118 
		if (!is_null($projet)) {
119 
			$requete =	'SELECT COUNT(*) AS nbre '.
 119 
			$requete =	'SELECT COUNT(*) AS nbre '.
120 
						"FROM $projet ";
 120 
						"FROM $projet ";
121 
			// Récupération des résultats
 121 
			// Récupération des résultats
122 
			try {
 122 
			try {
123 
				$nbre = $this->bdd->query($requete)->fetchColumn();
 123 
				$nbre = $this->bdd->query($requete)->fetchColumn();
124 
				if ($nbre === false) {
 124 
				if ($nbre === false) {
125 
					$this->messages[] = "La requête a retourné aucun résultat.";
 125 
					$this->messages[] = "La requête a retourné aucun résultat.";
126 
				}
 126 
				}
127 
			} catch (PDOException $e) {
 127 
			} catch (PDOException $e) {
128 
				$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage());
 128 
				$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage());
129 
			}
 129 
			}
130 
		} else {
 130 
		} else {
131 
			$this->messages[] = "Veuillez préciser le nom de code du projet comme second paramêtre (ex. : bdnff).";
 131 
			$this->messages[] = "Veuillez préciser le nom de code du projet comme second paramêtre (ex. : bdnff).";
132 
		}
 132 
		}
133 
		return $nbre;
 133 
		return $nbre;
134 
	}
 134 
	}
135
135
136 
	/* Méthode pour récupérer le titre d'un référentiel.
 136 
	/* Méthode pour récupérer le titre d'un référentiel.
137 
	* Appelée avec les paramêtres d'url suivant :
 137 
	* Appelée avec les paramêtres d'url suivant :
138 
	* /RefReferentiel/nom/code_du_referentiel
 138 
	* /RefReferentiel/nom/code_du_referentiel
139 
	*/
 139 
	*/
140 
	public function getElementNom($params_url) {
 140 
	public function getElementNom($params_url) {
141 
		$p = $this->traiterParametresUrl(array('projet'), $params_url, false);
 141 
		$p = $this->traiterParametresUrl(array('projet'), $params_url, false);
142 
		extract($p);
 142 
		extract($p);
143
143
144 
		$nom = false;
 144 
		$nom = false;
145 
		if (!is_null($projet)) {
 145 
		if (!is_null($projet)) {
146 
			$requete =	"SELECT titre FROM {$projet}_meta WHERE id_meta = (SELECT MAX(id_meta) FROM {$projet}_meta);";
 146 
			$requete =	"SELECT titre FROM {$projet}_meta WHERE id_meta = (SELECT MAX(id_meta) FROM {$projet}_meta);";
147 
			// Récupération des résultats
 147 
			// Récupération des résultats
148 
			try {
 148 
			try {
149 
				$nom = $this->bdd->query($requete)->fetchColumn();
 149 
				$nom = $this->bdd->query($requete)->fetchColumn();
150 
				if ($nom === false) {
 150 
				if ($nom === false) {
151 
					$this->messages[] = "La requête a retourné aucun résultat.";
 151 
					$this->messages[] = "La requête a retourné aucun résultat.";
152 
				}
 152 
				}
153 
			} catch (PDOException $e) {
 153 
			} catch (PDOException $e) {
154 
				$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage());
 154 
				$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage());
155 
			}
 155 
			}
156 
		} else {
 156 
		} else {
157 
			$this->messages[] = "Veuillez préciser le nom de code du projet comme second paramêtre (ex. : bdnff).";
 157 
			$this->messages[] = "Veuillez préciser le nom de code du projet comme second paramêtre (ex. : bdnff).";
158 
		}
 158 
		}
159 
		return $nom;
 159 
		return $nom;
160 
	}
 160 
	}
161
161
162
162
163 
	/* Méthode pour récupérer le titre d'un référentiel.
 163 
	/* Méthode pour récupérer le titre d'un référentiel.
164 
	 * Appelée avec les paramêtres d'url suivant :
 164 
	 * Appelée avec les paramêtres d'url suivant :
165 
	* /RefReferentiel/nom/code_du_referentiel
 165 
	* /RefReferentiel/nom/code_du_referentiel
166 
	*/
 166 
	*/
167 
	public function getElementDateMiseAJour($params_url) {
 167 
	public function getElementDateMiseAJour($params_url) {
168 
		$p = $this->traiterParametresUrl(array('projet'), $params_url, false);
 168 
		$p = $this->traiterParametresUrl(array('projet'), $params_url, false);
169 
		extract($p);
 169 
		extract($p);
170
170
171 
		$nom = false;
 171 
		$nom = false;
172 
		if (!is_null($projet)) {
 172 
		if (!is_null($projet)) {
173 
			$requete =	'SELECT UPDATE_TIME '.
 173 
			$requete =	'SELECT UPDATE_TIME '.
174 
						'FROM   information_schema.tables '.
 174 
						'FROM   information_schema.tables '.
175 
						'WHERE  TABLE_SCHEMA = \'referentiels\' '.
 175 
						'WHERE  TABLE_SCHEMA = \'referentiels\' '.
176 
   						'AND TABLE_NAME = \''.$projet.'\'';
 176 
   						'AND TABLE_NAME = \''.$projet.'\'';
177 
			// Récupération des résultats
 177 
			// Récupération des résultats
178 
			try {
 178 
			try {
179 
				$nom = $this->bdd->query($requete)->fetchColumn();
 179 
				$nom = $this->bdd->query($requete)->fetchColumn();
180 
				if ($nom === false) {
 180 
				if ($nom === false) {
181 
					$this->messages[] = "La requête a retourné aucun résultat.";
 181 
					$this->messages[] = "La requête a retourné aucun résultat.";
182 
				}
 182 
				}
183 
			} catch (PDOException $e) {
 183 
			} catch (PDOException $e) {
184 
				$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage());
 184 
				$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage());
185 
			}
 185 
			}
186 
		} else {
 186 
		} else {
187 
			$this->messages[] = "Veuillez préciser le nom de code du projet comme second paramêtre (ex. : bdnff).";
 187 
			$this->messages[] = "Veuillez préciser le nom de code du projet comme second paramêtre (ex. : bdnff).";
188 
		}
 188 
		}
189 
		return $nom;
 189 
		return $nom;
190 
	}
 190 
	}
191
191
192
192
193 
	/* Méthode pour récupérer certains champs et noms pour l'export
 193 
	/* Méthode pour récupérer certains champs et noms pour l'export
194 
	* Appelée avec les paramètres d'url suivant :
 194 
	* Appelée avec les paramètres d'url suivant :
195 
	* /Recherche/Export/_
 195 
	* /Recherche/Export/_
196 
	* ou les _ représentent dans l'ordre : référentiel, version, champs, filtre
 196 
	* ou les _ représentent dans l'ordre : référentiel, version, champs, filtre
197 
	* Si un des paramètres est absent, il prendre la valeur *
 197 
	* Si un des paramètres est absent, il prendre la valeur *
198 
	*/
 198 
	*/
199 
	public function getElementExport($param) {
 199 
	public function getElementExport($param) {
200 
		// Initialisation des variables
 200 
		// Initialisation des variables
201 
		$info = array();
 201 
		$info = array();
202 
		$p = $this->traiterParametresUrl(array("ref","version","champs","filtre", "encodage"), $param, false);
 202 
		$p = $this->traiterParametresUrl(array("ref","version","champs","filtre", "encodage"), $param, false);
203 
		$ref = $p['ref'].'_v'.$p['version'];
 203 
		$ref = $p['ref'].'_v'.$p['version'];
204 
		$racine_tmp = $this->config['chemins']['chemin_tmp'];
 204 
		$racine_tmp = $this->config['chemins']['chemin_tmp'];
205 
		$dossier = $racine_tmp.date('Y_m_d').'/';
 205 
		$dossier = $racine_tmp.date('Y_m_d').'/';
206 
		if(!is_dir($dossier)){
 206 
		if(!is_dir($dossier)){
207 
			mkdir($dossier);
 207 
			mkdir($dossier);
208 
			chmod($dossier, 0777);
 208 
			chmod($dossier, 0777);
209 
		}
 209 
		}
210 
		$fichier = $dossier.$ref."_".time().'.csv';
210 
		$fichier = $dossier.$ref."_".time().'.csv';
211 
		if (isset($p['champs'])) {
 211 
		if (isset($p['champs'])) {
212 
			$champs = $this->formaterColonnes($p['champs'], $ref);
212 
			$champs = $this->formaterColonnes($p['champs'], $ref);
213 
			$requete = 'SELECT "'.implode('","', $champs['titre']).'" UNION (SELECT '.implode(', ',$champs['select']).
 213 
			$requete = 'SELECT "'.implode('","', $champs['titre']).'" UNION ALL (SELECT '.implode(', ',$champs['select']).
214 
				" INTO OUTFILE '".$fichier."' CHARACTER SET utf8 FIELDS TERMINATED BY '\t' OPTIONALLY ENCLOSED BY '' LINES TERMINATED BY '\n' ".
214 
				" INTO OUTFILE '".$fichier."' CHARACTER SET utf8 FIELDS TERMINATED BY '\t' OPTIONALLY ENCLOSED BY '' LINES TERMINATED BY '\n' ".
215 
			" FROM $ref a left join $ref b on b.num_nom=a.num_nom_retenu";
 215 
			" FROM $ref a left join $ref b on b.num_nom=a.num_nom_retenu";
216
- 
 
217
216
218 
			if (isset($p['filtre']) && $p['filtre'] != "*") {
 217 
			if (isset($p['filtre']) && $p['filtre'] != "*") {
219 
				$param_filtres = explode(",",$p["filtre"]);
 218 
				$param_filtres = explode(",",$p["filtre"]);
220 
				$dernier_filtre = array_pop($param_filtres);
 219 
				$dernier_filtre = array_pop($param_filtres);
221 
				$filtres = array("nnr"=>"a.num_nom = a.num_nom_retenu", "pre" => "a.presence = 'P'");
 220 
				$filtres = array("nnr"=>"a.num_nom = a.num_nom_retenu", "pre" => "a.presence = 'P'");
222 
				if ($dernier_filtre != '' && $dernier_filtre != '*')  {
221 
				if ($dernier_filtre != '' && $dernier_filtre != '*')  {
223 
					if (!isset($filtres[$dernier_filtre])) {// si il s'agit du filtre famille
 222 
					if (!isset($filtres[$dernier_filtre])) {// si il s'agit du filtre famille
224 
						$filtres["fam"] = "a.famille = '".$dernier_filtre."'";
 223 
						$filtres["fam"] = "a.famille = '".$dernier_filtre."'";
225 
						$dernier_filtre = "fam";
 224 
						$dernier_filtre = "fam";
226 
					}
 225 
					}
227 
					array_push($param_filtres, $dernier_filtre);
 226 
					array_push($param_filtres, $dernier_filtre);
228 
				}
 227 
				}
229
228
230 
				$requete .= " WHERE ".implode(" AND ",array_intersect_key($filtres, array_flip($param_filtres)));
 229 
				$requete .= " WHERE ".implode(" AND ",array_intersect_key($filtres, array_flip($param_filtres)));
231 
			}
 230 
			}
232 
			$requete .= ")";
 231 
			$requete .= ")";
233 
			// Récupération des résultats
 232 
			// Récupération des résultats
234 
			try {
 233 
			try {
235 
				$donnees = $this->bdd->query($requete);
 234 
				$donnees = $this->bdd->query($requete);
236 
				if ($donnees === false) {
 235 
				if ($donnees === false) {
237 
					$this->messages[] = "La requête a retourné aucun résultat : $requete";
 236 
					$this->messages[] = "La requête a retourné aucun résultat : $requete";
238 
				} else {
 237 
				} else {
239 
					$info = $donnees;
 238 
					$info = $donnees;
240 
				}
 239 
				}
241 
			} catch (PDOException $e) {
 240 
			} catch (PDOException $e) {
242 
				$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage()).$requete;
 241 
				$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage()).$requete;
243 
			}
 242 
			}
244 
		}
 243 
		}
245
244
246
245
247 
		return $fichier;
 246 
		return $fichier;
248 
	}
 247 
	}
249
248
250
249
251 
	private function formaterColonnes($colonnes, $ref) {
 250 
	private function formaterColonnes($colonnes, $ref) {
252 
		$colonnesOrdonnees = array("nn" => array("a.num_nom", "num_nom", "Numéro nomenclatural"),
 251 
		$colonnesOrdonnees = array("nn" => array("a.num_nom", "num_nom", "Numéro nomenclatural"),
253 
								"nr" => array("a.num_nom_retenu", "num_nom_retenu", "Numéro nomenclatural du nom retenu"),
 252 
								"nr" => array("a.num_nom_retenu", "num_nom_retenu", "Numéro nomenclatural du nom retenu"),
254 
								"nt" => array("a.num_taxonomique", "num_taxonomique", "Numéro taxonomique"),
 253 
								"nt" => array("a.num_taxonomique", "num_taxonomique", "Numéro taxonomique"),
255 
								"cd" => array("a.cd_nom", "cd_nom", "Numéro INPN"),
 254 
								"cd" => array("a.cd_nom", "cd_nom", "Numéro INPN"),
256 
								"rg" => array("a.rang", "rang", "Code rang"),
 255 
								"rg" => array("a.rang", "rang", "Code rang"),
257 
								"fam" => array("a.famille", "famille", "Famille (APG III)"),
 256 
								"fam" => array("a.famille", "famille", "Famille (APG III)"),
258 
								"nsc" => array("concat(a.nom_sci,' ',a.auteur)", "nom_sci", "Nom avec auteur"),
 257 
								"nsc" => array("concat(a.nom_sci,' ',a.auteur)", "nom_sci", "Nom avec auteur"),
259 
								"bibc" => array("concat(a.annee,' ',a.biblio_origine)", "annee", "Année et bibliographie"),
 258 
								"bibc" => array("concat(a.annee,' ',a.biblio_origine)", "annee", "Année et bibliographie"),
260 
								"nsrc" => array("concat(b.nom_sci,' ',b.auteur) as nom_sci_retenu_complet", "auteur", "Nom retenu avec auteur"),
 259 
								"nsrc" => array("a.nom_complet", "nom_complet", "Nom retenu avec auteur"),
261 
								"nf" => array("a.nom_francais", "nom_francais", "Nom français normalisé"),
 260 
								"nf" => array("a.nom_francais", "nom_francais", "Nom français normalisé"),
262 
								"extax" => array("if (a.exclure_taxref = 1, 0, 1)", "exclure_taxref", "Présent dans Taxref"),
 261 
								"extax" => array("if (a.exclure_taxref = 1, 0, 1)", "exclure_taxref", "Présent dans Taxref"),
263 
								"lien" => array("concat('http://www.tela-botanica.org/bdtfx-nn-',a.num_nom)", "num_nom", "Permalien"),
 262 
								"lien" => array("concat('http://www.tela-botanica.org/bdtfx-nn-',a.num_nom)", "num_nom", "Permalien"),
264 
								"ntsup" => array("a.num_tax_sup", "num_tax_sup", "Numéro nomenclatural rang supérieur"),
 263 
								"ntsup" => array("a.num_tax_sup", "num_tax_sup", "Numéro nomenclatural rang supérieur"),
265 
								"pre" => array("a.presence", "presence", "Répartition géographique"),
 264 
								"pre" => array("a.presence", "presence", "Répartition géographique"),
266 
								"ns" => array("a.nom_sci", "nom_sci", "Nom sans auteur"),
 265 
								"ns" => array("a.nom_sci", "nom_sci", "Nom sans auteur"),
267 
								"aut" => array("a.auteur", "auteur", "Auteur"),
 266 
								"aut" => array("a.auteur", "auteur", "Auteur"),
268 
								"ann" => array("a.annee", "annee", "Année publication"),
 267 
								"ann" => array("a.annee", "annee", "Année publication"),
269 
								"bib" => array("a.biblio_origine", "biblio_origine", "Bibliographie"),
 268 
								"bib" => array("a.biblio_origine", "biblio_origine", "Bibliographie"),
270 
								"ntype" => array("a.num_type", "num_type", "Numéro du type"),
 269 
								"ntype" => array("a.num_type", "num_type", "Numéro du type"),
271 
								"nbas" => array("a.num_basionyme", "num_basionyme", "Numéro du basionyme"),
 270 
								"nbas" => array("a.num_basionyme", "num_basionyme", "Numéro du basionyme"),
272 
								"genre" => array("a.genre", "genre", "Genre"),
 271 
								"genre" => array("a.genre", "genre", "Genre"),
273 
								"esp" => array("a.epithete_sp", "epithete_sp", "Epithète espèce"),
 272 
								"esp" => array("a.epithete_sp", "epithete_sp", "Epithète espèce"),
274 
								"eing" => array("a.epithete_infra_generique", "epithete_infra_generique", "Epithète infragénérique"),
 273 
								"eing" => array("a.epithete_infra_generique", "epithete_infra_generique", "Epithète infragénérique"),
275 
								"te" => array("a.type_epithete", "type_epithete", "Type d'épithète infraspécifique"),
 274 
								"te" => array("a.type_epithete", "type_epithete", "Type d'épithète infraspécifique"),
276 
								"einsp" => array("a.epithete_infra_sp", "epithete_infra_sp", "Epithète infraspécifique"),
 275 
								"einsp" => array("a.epithete_infra_sp", "epithete_infra_sp", "Epithète infraspécifique"),
277 
								"hybp01" => array("a.hybride_parent_01", "hybride_parent_01", "Hybride parent 1"),
 276 
								"hybp01" => array("a.hybride_parent_01", "hybride_parent_01", "Hybride parent 1"),
278 
								"nomsupgen" => array("a.nom_supra_generique", "nom_supra_generique", "Nom supra générique"),
 277 
								"nomsupgen" => array("a.nom_supra_generique", "nom_supra_generique", "Nom supra générique"),
279 
								"hybp02" => array("a.hybride_parent_02", "hybride_parent_02", "Hybride parent 2"),
 278 
								"hybp02" => array("a.hybride_parent_02", "hybride_parent_02", "Hybride parent 2"),
280 
								"stori" => array("a.statut_origine", "statut_origine", "Statut d'origine"),
 279 
								"stori" => array("a.statut_origine", "statut_origine", "Statut d'origine"),
281 
								"stint" => array("a.statut_introduction", "statut_introduction", "Statut d'introduction"),
 280 
								"stint" => array("a.statut_introduction", "statut_introduction", "Statut d'introduction"),
282 
								"stcult" => array("a.statut_culture", "statut_culture", "Statut de culture"),
 281 
								"stcult" => array("a.statut_culture", "statut_culture", "Statut de culture"),
283 
								"notes" => array("a.notes", "notes", "Remarques"),
 282 
								"notes" => array("a.notes", "notes", "Remarques"),
284 
								"nomadd" => array("a.nom_addendum", "nom_addendum", "Commentaires nomenclaturaux"),
 283 
								"nomadd" => array("a.nom_addendum", "nom_addendum", "Commentaires nomenclaturaux"),
285 
								"nsr" => array("b.nom_sci as nom_sci_retenu", "nom_sci", "Nom retenu sans auteur"),
 284 
								"nsr" => array("b.nom_sci as nom_sci_retenu", "nom_sci", "Nom retenu sans auteur"),
286 
								"hom" => array("a.homonyme", "homonyme", "Homonymie"),
 285 
								"hom" => array("a.homonyme", "homonyme", "Homonymie"),
287 
								"syn" => array("CASE a.num_nom_retenu WHEN a.num_nom THEN 'retenu'
286 
								"syn" => array("CASE a.num_nom_retenu WHEN a.num_nom THEN 'retenu'
288 
																	WHEN '' THEN 'ambigu'
287 
																	WHEN '' THEN 'ambigu'
289 
																	ELSE 'synonyme' END AS synonymie", "num_nom_retenu", "Statut du nom" ),
 288 
																	ELSE 'synonyme' END AS synonymie", "num_nom_retenu", "Statut du nom" ),
290 
								"synprop" => array("a.synonyme_proparte", "synonyme_proparte", "Synonyme proprate"),
 289 
								"synprop" => array("a.synonyme_proparte", "synonyme_proparte", "Synonyme proprate"),
291 
								"syndout" => array("a.synonyme_douteux", "synonyme_douteux", "Synonyme douteux"),
 290 
								"syndout" => array("a.synonyme_douteux", "synonyme_douteux", "Synonyme douteux"),
292 
								"synmapp" => array("a.synonyme_mal_applique", "synonyme_mal_applique", "Synonyme mal appliqué"),
 291 
								"synmapp" => array("a.synonyme_mal_applique", "synonyme_mal_applique", "Synonyme mal appliqué"),
293 
								"synorth" => array("a.synonyme_orthographique", "synonyme_orthographique", "Synonyme orthographique"),
 292 
								"synorth" => array("a.synonyme_orthographique", "synonyme_orthographique", "Synonyme orthographique"),
294 
								"orthori" => array("a.orthographe_originelle", "orthographe_originelle", "Orthographe originelle"),
 293 
								"orthori" => array("a.orthographe_originelle", "orthographe_originelle", "Orthographe originelle"),
295 
								"hybp01n" => array("a.hybride_parent_01_notes", "hybride_parent_01_notes", "Hybride parent 1 notes"),
 294 
								"hybp01n" => array("a.hybride_parent_01_notes", "hybride_parent_01_notes", "Hybride parent 1 notes"),
296 
								"hybp02n" => array("a.hybride_parent_02_notes", "hybride_parent_02_notes", "Hybride parent 2 notes"),
 295 
								"hybp02n" => array("a.hybride_parent_02_notes", "hybride_parent_02_notes", "Hybride parent 2 notes"),
297 
								"cultgp" => array("a.cultivar_groupe", "cultivar_groupe", "Groupe de cultivar"),
 296 
								"cultgp" => array("a.cultivar_groupe", "cultivar_groupe", "Groupe de cultivar"),
298 
								"cult" => array("a.cultivar", "cultivar", "Nom cultivar"),
 297 
								"cult" => array("a.cultivar", "cultivar", "Nom cultivar"),
299 
								"nomcomm" => array("a.nom_commercial", "nom_commercial", "Nom commercial"),
 298 
								"nomcomm" => array("a.nom_commercial", "nom_commercial", "Nom commercial"),
300 
								"autres" => array("a.*", "*", "Autres"));
 299 
								"autres" => array("a.*", "*", "Autres"));
301 
		$colonnes = explode(",", $colonnes);
 300 
		$colonnes = explode(",", $colonnes);
302 
		$requete = "SHOW COLUMNS FROM $ref";
 301 
		$requete = "SHOW COLUMNS FROM $ref";
303 
		$colonnesTable = $this->bdd->query($requete)->fetchAll(PDO::FETCH_COLUMN, "Field");
 302 
		$colonnesTable = $this->bdd->query($requete)->fetchAll(PDO::FETCH_COLUMN, "Field");
304 
		foreach ($colonnes as $colonne) {
 303 
		foreach ($colonnes as $colonne) {
305 
			if ($colonne == "autres") {
 304 
			if ($colonne == "autres") {
306 
				foreach ($colonnesOrdonnees as $colOrd) {
 305 
				foreach ($colonnesOrdonnees as $colOrd) {
307 
					$test[] = $colOrd[1];
 306 
					$test[] = $colOrd[1];
308 
				}
 307 
				}
309 
				$colonneAutres = array_diff($colonnesTable, $test);
 308 
				$colonneAutres = array_diff($colonnesTable, $test);
310 
				$champs['select'] = array_merge($champs['select'], array_map(array($this, 'ajouterIndexTable'), $colonneAutres));
 309 
				$champs['select'] = array_merge($champs['select'], array_map(array($this, 'ajouterIndexTable'), $colonneAutres));
311 
				$champs['titre'] = array_merge($champs['titre'], array_map(array($this, 'ajouterAutresTable'), $colonneAutres));
 310 
				$champs['titre'] = array_merge($champs['titre'], array_map(array($this, 'ajouterAutresTable'), $colonneAutres));
312 
			} else {
 311 
			} else {
313 
				if (array_search($colonnesOrdonnees[$colonne][1], $colonnesTable) !== false) {
 312 
				if (array_search($colonnesOrdonnees[$colonne][1], $colonnesTable) !== false) {
314 
					$champs['select'][] = $colonnesOrdonnees[$colonne][0];
 313 
					$champs['select'][] = $colonnesOrdonnees[$colonne][0];
315 
					$champs['titre'][] = $colonnesOrdonnees[$colonne][2];
 314 
					$champs['titre'][] = $colonnesOrdonnees[$colonne][2];
316 
				}
 315 
				}
317 
			}
 316 
			}
318 
		}
 317 
		}
319 
		return $champs;
 318 
		return $champs;
320 
	}
 319 
	}
321
320
322 
	private function ajouterIndexTable($valeur) {
 321 
	private function ajouterIndexTable($valeur) {
323 
		return 'a.'.$valeur;
 322 
		return 'a.'.$valeur;
324 
	}
 323 
	}
325 
	private function ajouterAutresTable($valeur) {
 324 
	private function ajouterAutresTable($valeur) {
326 
		return 'Autres : '.$valeur;
 325 
		return 'Autres : '.$valeur;
327 
	}
 326 
	}
328
327
329 
	/**
 328 
	/**
330 
	* Méthode principale appelée avec une requête de type POST.
 329 
	* Méthode principale appelée avec une requête de type POST.
331 
	*/
 330 
	*/
332 
	public function updateElement($params_url, $params_post) {
 331 
	public function updateElement($params_url, $params_post) {
333 
		// Initialisation des variables
 332 
		// Initialisation des variables
334 
		$info = array();
 333 
		$info = array();
335 
		// Nour recherchons le type de requête demandé
 334 
		// Nour recherchons le type de requête demandé
336 
		extract($this->traiterParametresUrl(array('action'), $params_url, true));
 335 
		extract($this->traiterParametresUrl(array('action'), $params_url, true));
337 
		extract($this->traiterParametresPost(array('referentiel'), $params_post, true));
 336 
		extract($this->traiterParametresPost(array('referentiel'), $params_post, true));
338 
		extract($this->traiterParametresPost(array('noms'), $params_post, false));
 337 
		extract($this->traiterParametresPost(array('noms'), $params_post, false));
339 
		$referentiel =trim($referentiel, "'");
 338 
		$referentiel =trim($referentiel, "'");
340
339
341 
		if (!is_null($referentiel)) {$action =trim($action, "'");
 340 
		if (!is_null($referentiel)) {$action =trim($action, "'");
342 
			if (!is_null($action)) {
 341 
			if (!is_null($action)) {
343 
				$methode = 'updateElement'.$action;
 342 
				$methode = 'updateElement'.$action;
344 
				if (method_exists($this, $methode)) {
 343 
				if (method_exists($this, $methode)) {
345 
					//array_shift($param);
 344 
					//array_shift($param);
346 
					$info = $this->$methode($referentiel, $noms);
 345 
					$info = $this->$methode($referentiel, $noms);
347 
				} else {
 346 
				} else {
348 
					$this->messages[] = "Le type de mise à jour demandé '$action' n'est pas disponible.";
 347 
					$this->messages[] = "Le type de mise à jour demandé '$action' n'est pas disponible.";
349 
				}
 348 
				}
350 
			} else {
 349 
			} else {
351 
				$this->messages[] = "Veuillez préciser le type de mise à jour à faire.";
 350 
				$this->messages[] = "Veuillez préciser le type de mise à jour à faire.";
352 
				// TODO : coder une mise à jour générique dans une méthode updateElementDefaut($id, $params_post);
 351 
				// TODO : coder une mise à jour générique dans une méthode updateElementDefaut($id, $params_post);
353 
			}
 352 
			}
354 
		} else {
 353 
		} else {
355 
			$this->messages[] = "Veuillez préciser l'id du traitement comme premier paramêtre dans l'url.";
 354 
			$this->messages[] = "Veuillez préciser l'id du traitement comme premier paramêtre dans l'url.";
356 
		}
 355 
		}
357
356
358 
		// Envoie sur la sortie standard
 357 
		// Envoie sur la sortie standard
359 
		$this->envoyer($info);
 358 
		$this->envoyer($info);
360 
	}
 359 
	}
361
360
362 
	private function getElementTablePrChpFamille($referentiel) {
 361 
	private function getElementTablePrChpFamille($referentiel) {
363 
		$infos = "";$referentiel = $referentiel[0];
 362 
		$infos = "";$referentiel = $referentiel[0];
364 
		$requete = "SHOW COLUMNS FROM {$referentiel} LIKE 'famille' ";
 363 
		$requete = "SHOW COLUMNS FROM {$referentiel} LIKE 'famille' ";
365 
		$resultat = $this->bdd->query($requete)->fetch();
364 
		$resultat = $this->bdd->query($requete)->fetch();
366 
		if ($resultat === false) {
 365 
		if ($resultat === false) {
367 
			$requete = 	"ALTER TABLE {$referentiel} ".
 366 
			$requete = 	"ALTER TABLE {$referentiel} ".
368 
						'ADD famille VARCHAR(50) '.
 367 
						'ADD famille VARCHAR(50) '.
369 
						'CHARACTER SET utf8 COLLATE utf8_general_ci NULL DEFAULT "" ';
 368 
						'CHARACTER SET utf8 COLLATE utf8_general_ci NULL DEFAULT "" ';
370 
			$this->bdd->exec($requete);
 369 
			$this->bdd->exec($requete);
371 
		}
 370 
		}
372 
		$requeteInfos = 'SELECT num_nom, num_nom_retenu, num_tax_sup, rang, nom_sci '.
 371 
		$requeteInfos = 'SELECT num_nom, num_nom_retenu, num_tax_sup, rang, nom_sci '.
373 
								"FROM {$referentiel} ".
 372 
								"FROM {$referentiel} ".
374 
								"WHERE rang >= 180 ".
 373 
								"WHERE rang >= 180 ".
375 
								"ORDER BY rang ASC, num_tax_sup ASC, num_nom_retenu DESC ";
 374 
								"ORDER BY rang ASC, num_tax_sup ASC, num_nom_retenu DESC ";
376 
		$infos = $this->bdd->query($requeteInfos)->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC);
 375 
		$infos = $this->bdd->query($requeteInfos)->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC);
377 
		return $infos;
 376 
		return $infos;
378
377
379 
	}
 378 
	}
380
379
381
380
382 
	private function updateElementChpFamille($referentiel, $noms) {
 381 
	private function updateElementChpFamille($referentiel, $noms) {
383 
		foreach ($noms as $id => $famille) {
 382 
		foreach ($noms as $id => $famille) {
384 
			$requete = "UPDATE {$referentiel} SET famille = '$famille' WHERE num_nom = $id ";
 383 
			$requete = "UPDATE {$referentiel} SET famille = '$famille' WHERE num_nom = $id ";
385 
			$resultat = $this->bdd->query($requete);
 384 
			$resultat = $this->bdd->query($requete);
386 
			if ($resultat === false) {
 385 
			if ($resultat === false) {
387 
				$this->messages[] = "Erreur d'insertion pour le tuple $id";
 386 
				$this->messages[] = "Erreur d'insertion pour le tuple $id";
388 
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391
390
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 391 
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 392 
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