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Rev 78 Rev 82
Line 14... Line 14...
14 
class FicheTaxon extends AppliControleur {
 14 
class FicheTaxon extends AppliControleur {
Line 15... Line 15...
15
15
16 
	private $donnees = array();
 16 
	private $donnees = array();
Line -... Line 17...
- 
 
 17 
	protected $taxonDao = null;
- 
 
 18
- 
 
 19 
	// Codification de la présence d'un taxon
- 
 
 20 
	private $presence_taxon = array (
- 
 
 21 
		'P' => 'Présent',
- 
 
 22 
		'S' => 'Supposé présent (présence à confirmer)',
- 
 
 23 
		'D' => 'Présence douteuse',
- 
 
 24 
		'E' => 'Éteint',
- 
 
 25 
		'C' => 'Cité par erreur comme présent',
- 
 
 26 
		'A' => 'Absent',
- 
 
 27 
		'' => 'Pas d\'information',
- 
 
 28 
		'-' => 'Autre statut de présence',
- 
 
 29 
		'E-W' => 'Disparu',
- 
 
 30 
		'P-B' =>'Présence accidentelle (Taxon « visiteur »)',
- 
 
 31 
		'E-F' => 'Trouvé en fouille',
- 
 
 32 
		'-C' => 'Cryptogène');
- 
 
 33 
	// Codification du statut d'origine
- 
 
 34 
	private $statut_origine= array(
- 
 
 35 
		'N' => 'Natif',
- 
 
 36 
		'S' => 'Supposé natif',
- 
 
 37 
		'D' => 'Origine douteuse',
- 
 
 38 
		'E' => 'Anciennement natif (éteint)',
- 
 
 39 
		'C' => 'Cité par erreur comme natif',
- 
 
 40 
		'A' => 'Non natif',
- 
 
 41 
		'' => 'Pas d\'information',
- 
 
 42 
		'X' => 'Inapplicable','-' => 'Autre statut d\'origine',
- 
 
 43 
		'N-E' => 'Endémique',
- 
 
 44 
		'N-S' => 'Sub-Endémique',
- 
 
 45 
		'E-Z' => 'Endémique éteinte');
- 
 
 46 
	// Codification du statut d'introduction
- 
 
 47 
	private $statut_introduction = array(
- 
 
 48 
		'I' => 'Introduit',
- 
 
 49 
		'S' => 'Supposé introduit',
- 
 
 50 
		'D' => 'Introduction douteuse',
- 
 
 51 
		'E' => 'Anciennement introduit (éteint)',
- 
 
 52 
		'C' => 'Cité par erreur comme introduit',
- 
 
 53 
		'A' => 'Non introduit',
- 
 
 54 
		'' => 'Pas d\'information',
- 
 
 55 
		'X' => 'Inapplicable',
- 
 
 56 
		'-' => 'Autre notion d\'introduction',
- 
 
 57 
		'I-J' => 'Introduit envahissant',
- 
 
 58 
		'I-M' => 'Domestique / Introduit non établi'
- 
 
 59 
	);
- 
 
 60 
	// Codification du statut de culture
- 
 
 61 
	private $statut_culture = array(
- 
 
 62 
		'C' => 'Cultivé en extérieur',
- 
 
 63 
		'I' => 'Cultivé en intérieur',
- 
 
 64 
		'S' => 'Supposé cultivé',
- 
 
 65 
		'D' => 'Culture douteuse',
- 
 
 66 
		'E' => 'Anciennement cultivé (éteint)',
- 
 
 67 
		'C' => 'Cité par erreur comme cultivé',
- 
 
 68 
		'' => 'Pas d\'information',
- 
 
 69 
		'X' => 'Inapplicable',
17 
	protected $taxonDao = null;
 70 
		'-' => 'Autre notion de culture'
18
71 
	);
19 
	//+----------------------------------------------------------------------------------------------------------------+
 72 
	//+----------------------------------------------------------------------------------------------------------------+
20 
	// Méthodes
 73 
	// Méthodes
21 
	/**
 74 
	/**
22 
	 * Fonction d'affichage par défaut
 75 
	 * Fonction d'affichage par défaut
23 
	 */
 76 
	 */
24 
	public function executerActionParDefaut() {
 77 
	public function executerActionParDefaut() {
Line 25... Line 78...
25 
		return $this->afficherTaxon();
 78 
		return $this->afficherTaxon();
26 
	}
 79 
	}
27
80
28 
	// +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------+
 81 
	// +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------+
29 
	// FICHE COLLECTION
 82 
	// FICHE CONSULTATION TAXON
30 
	public function afficherTaxon() {
 83 
	public function afficherTaxon() {
31 
		// Récupération du référentiel
 84 
		// Récupération du référentiel
Line 46... Line 99...
46 
			// Récupération des données
 99 
			// Récupération des données
47 
			$this->donnees['referentiel'] = $this->referentiel;
 100 
			$this->donnees['referentiel'] = $this->referentiel;
48 
			$this->donnees['num_nom'] = $_GET['num_nom'];
 101 
			$this->donnees['num_nom'] = $_GET['num_nom'];
49 
			$this->donnees['num_nom_retenu'] = $_GET['num_nom_retenu'];
 102 
			$this->donnees['num_nom_retenu'] = $_GET['num_nom_retenu'];
50 
			$this->donnees['nom'] = $_GET['nom'];
 103 
			$this->donnees['nom'] = $_GET['nom'];
51 
			//$this->donnees['info'] = $this->taxonDao->getTaxon($this->referentiel, $this->donnees['num_nom']);
 104 
			$this->donnees['info'] = $this->taxonDao->getTaxon($this->referentiel, $this->donnees['num_nom']);
Line 52... Line 105...
52
105
53 
			// Chargement des données des onglets
 106 
			// Chargement des données des onglets
54 
			$this->chargerNomenclature();
 - 
 
55 
			//print_r($this->donnees);
 107 
			$this->chargerNomenclature();
56 
			/*$this->chargerSynonymie();
 108 
			$this->chargerSynonymie();
57 
			$this->chargerClassification();
 - 
 
58 
			$this->chargerNotes();
 109 
			//$this->chargerClassification();
59 
			$this->chargerChorologie();
 110 
			$this->chargerChorologie();
Line 60... Line 111...
60 
			$this->chargerComplements();*/
 111 
			//$this->chargerComplements();
61
- 
 
62 
			$this->setSortie(self::RENDU_CORPS, $this->getVue('fiche_taxon', $this->donnees));
 112
63 
			//$this->chargerPiedDePage();
 113 
			$this->setSortie(self::RENDU_CORPS, $this->getVue('fiche_taxon', $this->donnees));
Line -... Line 114...
- 
 
 114 
		}
- 
 
 115 
	}
- 
 
 116
- 
 
 117 
	private function chargerNomenclature() {
- 
 
 118 
		$this->donnees['selectionne'] = $this->taxonDao->getNomenclature($this->referentiel, $this->donnees['num_nom']);
- 
 
 119 
		if (strpos($this->donnees['nom'], ' x ') ) {
- 
 
 120 
			if ($this->donnees['num_nom'] != $this->donnees['num_nom_retenu']) {
- 
 
 121 
				$this->donnees['retenu'] = $this->taxonDao->getNomenclature($this->referentiel, $this->donnees['num_nom_retenu']);
- 
 
 122 
				$this->donnees['parents'] = $this->taxonDao->getParentsHybride($this->referentiel, $this->donnees['num_nom_retenu']);
- 
 
 123 
			} else {
- 
 
 124 
				$this->donnees['parents'] = $this->taxonDao->getParentsHybride($this->referentiel, $this->donnees['num_nom']);
- 
 
 125 
			}
- 
 
 126 
		} else {
- 
 
 127 
			if ($this->donnees['num_nom'] != $this->donnees['num_nom_retenu']) {
- 
 
 128 
				$this->donnees['retenu'] = $this->taxonDao->getNomenclature($this->referentiel, $this->donnees['num_nom_retenu']);
- 
 
 129 
			}
- 
 
 130 
		}
- 
 
 131 
	}
- 
 
 132
- 
 
 133 
	// recherche les synonymes (à compléter)
- 
 
 134 
	private function chargerSynonymie() {
- 
 
 135 
		$rechercheDao = new RechercheDao();
- 
 
 136 
		// recherche des synonymes nomenclaturaux et taxonomiques
- 
 
 137 
		$parametres = $this->parserChaineDeRecherche('nn:'.$this->donnees['num_nom'].' tax:1');
- 
 
 138 
		$parametres['ref']= $this->referentiel;
- 
 
 139 
		$synonymes = $rechercheDao->chercher('ParTaxon', $parametres);
- 
 
 140 
		foreach ($synonymes as $synonyme) {
- 
 
 141 
			if ($this->donnees['num_nom'] != $synonyme['num_nom'] && $synonyme['basionyme'] != null) {
- 
 
 142 
				if (($this->donnees['num_nom'] != $synonyme['num_nom']) && ($synonyme['basionyme'] == $this->donnees['num_nom'] ||
- 
 
 143 
						$this->donnees['info']['basionyme'] == $synonyme['num_nom'] || $this->donnees['info']['basionyme'] == $synonyme['basionyme'])) {
- 
 
 144 
					$this->donnees['fiche_synonymie']['nomenclaturale'][] = $synonyme;
- 
 
 145 
				} elseif ($this->donnees['num_nom'] != $synonyme['num_nom'] && $synonyme['basionyme'] != null &&
- 
 
 146 
					$this->donnees['info']['basionyme'] != null) {
- 
 
 147 
					$this->donnees['fiche_synonymie']['taxonomique'][] = $synonyme;
- 
 
 148 
				}
- 
 
 149 
			} elseif ($this->donnees['num_nom'] != $synonyme['num_nom']) {
- 
 
 150 
				///nom est synonyme mal applique de num_nom_retenu
- 
 
 151 
				if ($synonyme['synonyme_mal_applique'] == 1) {
- 
 
 152 
					$this->donnees['fiche_synonymie']['mal appliquée'][] = $synonyme;
- 
 
 153 
				} else {
- 
 
 154 
					$this->donnees['fiche_synonymie']['indéterminée (pas de basionyme)'][] = $synonyme;
- 
 
 155 
				}
- 
 
 156 
			}
- 
 
 157 
		}
- 
 
 158 
		// recherche synonyme proparte
- 
 
 159 
		if ($this->donnees['info']['synonyme_proparte'] != ''){
- 
 
 160 
			$this->donnees['fiche_synonymie']['pro parte']['num_nom'] = $this->donnees['info']['synonyme_proparte'];
- 
 
 161 
		}
- 
 
 162 
		// recherche si taxon est un synonyme douteux
- 
 
 163 
		if ($this->donnees['info']['synonyme_douteux'] == 1) {
- 
 
 164 
			$this->donnees['fiche_synonymie']['douteux']['num_nom'] = $this->donnees['info'];
- 
 
 165 
		}
- 
 
 166
- 
 
 167 
	}
- 
 
 168
- 
 
 169 
	private function chargerChorologie() {
- 
 
 170 
		foreach ($this->donnees['info'] as $param => $valeur) {
- 
 
 171 
			if ($param == 'presence') {
- 
 
 172 
				$this->donnees['chorologie']['Présence']['France']['code'] = $valeur;
- 
 
 173 
				$this->donnees['chorologie']['Présence']['France']['valeur'] = $this->presence_taxon[$valeur];
- 
 
 174 
			} elseif (preg_match('/presence_(.*)/', $param, $lieu)) {
- 
 
 175 
				$this->donnees['chorologie']['Présence'][$lieu['1']]['code'] = $valeur;
- 
 
 176 
				$this->donnees['chorologie']['Présence'][$lieu['1']]['valeur'] = $this->presence_taxon[$valeur];
- 
 
 177 
			} elseif ($param == 'statut_origine') {
- 
 
 178 
				$this->donnees['chorologie']['Statut d\'origine']['France']['code'] = $valeur;
- 
 
 179 
				$this->donnees['chorologie']['Statut d\'origine']['France']['valeur'] = $this->statut_origine[$valeur];
- 
 
 180 
			} elseif (preg_match('/statut_origine_(.*)/', $param, $lieu)) {
- 
 
 181 
				$this->donnees['chorologie']['Statut d\'origine'][$lieu['1']]['code'] = $valeur;
- 
 
 182 
				$this->donnees['chorologie']['Statut d\'origine'][$lieu['1']]['valeur'] = $this->statut_origine[$valeur];
- 
 
 183 
			} elseif ($param == 'statut_introduction') {
- 
 
 184 
				$this->donnees['chorologie']['Statut d\'introduction']['France']['code'] = $valeur;
- 
 
 185 
				$this->donnees['chorologie']['Statut d\'introduction']['France']['valeur'] = $this->statut_introduction[$valeur];
- 
 
 186 
			} elseif (preg_match('/statut_introduction_(.*)/', $param, $lieu)) {
- 
 
 187 
				$this->donnees['chorologie']['Statut d\'introduction'][$lieu['1']]['code'] = $valeur;
- 
 
 188 
				$this->donnees['chorologie']['Statut d\'introduction'][$lieu['1']]['valeur'] = $this->statut_introduction[$valeur];
- 
 
 189 
			} elseif ($param == 'statut_culture') {
- 
 
 190 
				$this->donnees['chorologie']['Statut de culture']['France']['code'] = $valeur;
- 
 
 191 
				$this->donnees['chorologie']['Statut de culture']['France']['valeur'] = $this->statut_culture[$valeur];
- 
 
 192 
			} elseif (preg_match('/statut_culture_(.*)/', $param, $lieu)) {
- 
 
 193 
				$this->donnees['chorologie']['Statut de culture'][$lieu['1']]['code'] = $valeur;
- 
 
 194 
				$this->donnees['chorologie']['Statut de culture'][$lieu['1']]['valeur'] = $this->statut_culture[$valeur];
- 
 
 195 
			}
- 
 
 196 
		}
- 
 
 197 
		foreach ($this->donnees['chorologie']['Présence'] as $lieu=>$valeur) {
- 
 
 198 
			if (!isset($this->donnees['chorologie']['Statut d\'origine'][$lieu])) {
- 
 
 199 
				$this->donnees['chorologie']['Statut d\'origine'][$lieu]['code'] = '';
- 
 
 200 
				$this->donnees['chorologie']['Statut d\'origine'][$lieu]['valeur'] = $this->statut_origine[''];
- 
 
 201 
			}
- 
 
 202 
			if (!isset($this->donnees['chorologie']['Statut d\'introduction'][$lieu])) {
- 
 
 203 
				$this->donnees['chorologie']['Statut d\'introduction'][$lieu]['code'] = '';
- 
 
 204 
				$this->donnees['chorologie']['Statut d\'introduction'][$lieu]['valeur'] = $this->statut_introduction[''];
- 
 
 205 
			}
- 
 
 206 
			if (!isset($this->donnees['chorologie']['Statut de culture'][$lieu])) {
- 
 
 207 
				$this->donnees['chorologie']['Statut de culture'][$lieu]['code'] = '';
- 
 
 208 
				$this->donnees['chorologie']['Statut de culture'][$lieu]['valeur'] = $this->statut_culture[''];
- 
 
 209 
			}
- 
 
 210 
		}
- 
 
 211 
	}
- 
 
 212
- 
 
 213 
	private function parserChaineDeRecherche($chaine) {
- 
 
 214 
		$mots = preg_split('/ /i', $chaine, -1, PREG_SPLIT_NO_EMPTY);
- 
 
 215 
		$parametres = array('mots' => '');
- 
 
 216 
		$cle_precedente = null;
- 
 
 217 
		foreach ($mots as $mot) {
- 
 
 218 
			if (preg_match('/^(sg|gen|sp|ssp|au|an|nn|bib|nr|tax):(.*)$/', $mot, $match)) {
- 
 
 219 
				$cle = $match[1];
- 
 
 220 
				$cle_precedente = $cle;
- 
 
 221 
				$valeur = $match[2];
- 
 
 222 
				$parametres[$cle] = $valeur;
- 
 
 223 
			} else if (!is_null($cle_precedente)) {
- 
 
 224 
				$parametres[$cle_precedente] .= ' '.$mot;
- 
 
 225 
			} else if (is_null($cle_precedente)) {
- 
 
 226 
				if (empty($parametres['mots'])) {
- 
 
 227 
					$parametres['mots'] = $mot;
- 
 
 228 
				} else {
- 
 
 229 
					$parametres['mots'] .= ' '.$mot;
- 
 
 230 
				}
- 
 
 231 
			}
- 
 
 232 
		}
- 
 
 233 
		return $parametres;
64 
		}
 234 
	}
65 
	}
 235
66
236 
	// retourne l'url de la fiche taxon pour les liens
67 
	public static function getUrlFicheTaxon($params, $type) {
 237 
	public static function getUrlFicheTaxon($params, $type) {
68 
		$taxon = null;
 238 
		$taxon = null;
Line 85... Line 255...
85 
			default : break;
 255 
			default : break;
86 
		}
 256 
		}
87 
		return Recherche::getUrlFicheTaxon($taxon);
 257 
		return Recherche::getUrlFicheTaxon($taxon);
88 
	}
 258 
	}
Line 89... Line -...
89
- 
 
90
- 
 
91 
	private function chargerNomenclature() {
 - 
 
92 
		$this->donnees['selectionne'] = $this->taxonDao->getNomenclature($this->referentiel, $this->donnees['num_nom']);
 - 
 
93 
		if (strpos($this->donnees['nom'], ' x ') ) {
 - 
 
94 
			if ($this->donnees['num_nom'] != $this->donnees['num_nom_retenu']) {
 - 
 
95 
				$this->donnees['retenu'] = $this->taxonDao->getNomenclature($this->referentiel, $this->donnees['num_nom_retenu']);
 - 
 
96 
				$this->donnees['parents'] = $this->taxonDao->getParentsHybride($this->referentiel, $this->donnees['num_nom_retenu']);
 - 
 
97 
			} else {
 - 
 
98 
				$this->donnees['parents'] = $this->taxonDao->getParentsHybride($this->referentiel, $this->donnees['num_nom']);
 - 
 
99 
			}
- 
 
100 
		} else {
 - 
 
101 
			if ($this->donnees['num_nom'] != $this->donnees['num_nom_retenu']) {
 - 
 
102 
				$this->donnees['retenu'] = $this->taxonDao->getNomenclature($this->referentiel, $this->donnees['num_nom_retenu']);
 - 
 
103 
			}
 - 
 
104 
		}
 - 
 
Line 105... Line 259...
105 
	}
 259
106 
 
 260