| Line 16... |
Line 16... |
| 16 |
|
16 |
|
| 17 |
private $referentiel = null;
|
17 |
private $referentiel = null;
|
| 18 |
private $referentielDao = null;
|
18 |
private $referentielDao = null;
|
| 19 |
private $traitementDao = null;
|
19 |
private $traitementDao = null;
|
| - |
|
20 |
private $resultatDao = null;
|
| - |
|
21 |
private $metaDao = null;
|
| Line 20... |
Line 22... |
| 20 |
private $resultatDao = null;
|
22 |
private $colonnesOrdonnees = array();
|
| 21 |
|
23 |
|
| Line 22... |
Line 24... |
| 22 |
public function __construct() {
|
24 |
public function __construct() {
|
| Line 29... |
Line 31... |
| 29 |
|
31 |
|
| 30 |
// Chargement des DAO nécessaires
|
32 |
// Chargement des DAO nécessaires
|
| 31 |
$this->resultatDao = new ResultatDao();
|
33 |
$this->resultatDao = new ResultatDao();
|
| 32 |
$this->traitementDao = new TraitementDao();
|
34 |
$this->traitementDao = new TraitementDao();
|
| - |
|
35 |
$this->referentielDao = new ReferentielDao();
|
| - |
|
36 |
$this->metaDao = new MetaDao();
|
| - |
|
37 |
// tableau colonnesOrdonnees à modifier aussi dans service/Recherche.php
|
| - |
|
38 |
$this->colonnesOrdonnees = array("nn" => array("Numéro nomenclatural","checked","Identifiant numérique du nom scientifique"),
|
| - |
|
39 |
"nr" => array("Numéro nomenclatural du nom retenu","checked","Identifiant numérique du nom scientifique (num_nom) retenu pour désigner le taxon"),
|
| - |
|
40 |
"nt" => array("Numéro taxonomique","checked","Identifiant numérique du taxon auquel est rattaché le nom"),
|
| - |
|
41 |
"cd" => array("Numéro INPN","checked","Identifiant numérique unique du nom scientifique attribué par l’INPN"),
|
| - |
|
42 |
"rg" => array("Code rang","checked","Code numérique indiquant le rang du nom scientifique (voir tableau 7 du manuel technique)"),
|
| - |
|
43 |
"fam" => array("Famille (APG III)","checked","Nom de la famille dans APG III"),
|
| - |
|
44 |
"nsc" => array("Nom avec auteur","checked","Nom scientifique avec auteur(s)"),
|
| - |
|
45 |
"bibc" => array("Année et bibliographie","checked","Format à étudier celui de Tela : 1868, Brev. Pl. Nov., 2 : 70 ou celui de Kew : Brev. Pl. Nov., 2 : 70 (1868)"),
|
| - |
|
46 |
"nsrc" => array("Nom retenu avec auteur","checked","Nom retenu pour tous les taxons (identique si le nom est édjà le nom retenu)"),
|
| - |
|
47 |
"nf" => array("Nom français normalisé","checked","Nom français conseillé pour ce taxon (à venir)"),
|
| - |
|
48 |
"extax" => array("Présent dans Taxref","checked",""),
|
| - |
|
49 |
"lien" => array("Permalien","checked","Lien http vers la fiche nomenclaturale"),
|
| - |
|
50 |
"ntsup" => array("Numéro nomenclatural rang supérieur","","Identifiant numérique du nom (num_nom) de rang supérieur dans la classification par défaut de l'index"),
|
| - |
|
51 |
"pre" => array("Répartition géographique","","Code indiquant si le taxon est présent dans la zone géographique définie par le référentiel (tableau 9)"),
|
| - |
|
52 |
"ns" => array("Nom sans auteur","","Nom scientifique sans auteur"),
|
| - |
|
53 |
"aut" => array("Auteur","","Intitulé de(s) l'auteur(s) du nom (abréviations standards de Brummitt et Powell)"),
|
| - |
|
54 |
"ann" => array("Année publication","","Année de la publication effective du support papier"),
|
| - |
|
55 |
"bib" => array("Bibliographie","","Référence bibliographique de la publication d'origine du nom"),
|
| - |
|
56 |
"ntype" => array("Numéro du type","","Identifiant numérique (num_nom) du 1er basionyme appliqué à la planche d'herbier"),
|
| - |
|
57 |
"nbas" => array("Numéro du basionyme","","Identifiant numérique (num_nom) du basionyme du nom"),
|
| - |
|
58 |
"genre" => array("Genre","","Nom d'un genre dans le cas d'un monôme du rang genre ou d'une combinaison"),
|
| - |
|
59 |
"esp" => array("Epithète espèce","","Épithète de l'espèce"),
|
| - |
|
60 |
"eing" => array("Epithète infragénérique","","Épithète infra-générique d'une combinaison dont le rang est situé entre le genre et l'espèce"),
|
| - |
|
61 |
"te" => array("Type d'épithète infraspécifique","","Abréviation indiquant le type de l'épithète infra-spécifique"),
|
| - |
|
62 |
"einsp" => array("Epithète infraspécifique","","Épithète infra-spécifique d'une combinaison"),
|
| - |
|
63 |
"hybp01" => array("Hybride parent 1","","Identifiant du nom (num_nom) du parent numéro 1 (dans le cas d'un hybride)"),
|
| - |
|
64 |
"nomsupgen" => array("Nom supra générique","","Monôme dont le rang est supérieur au genre"),
|
| - |
|
65 |
"hybp02" => array("Hybride parent 2","","Identifiant du nom (num_nom) du parent numéro 2 (dans le cas d'un hybride)"),
|
| - |
|
66 |
"stori" => array("Statut d'origine","","Code indiquant le statut d'origine du taxon dans la zone géographique définie par le référentiel (tableau 10)"),
|
| - |
|
67 |
"stint" => array("Statut d'introduction","","Code indiquant le statut d'introduction du taxon dans la zone géographique définie par le référentiel (tableau 11)"),
|
| - |
|
68 |
"stcul" => array("Statut de culture","","Code indiquant le statut de culture du taxon dans la zone géographique définie par le référentiel (tableau 12)"),
|
| - |
|
69 |
"notes" => array("Remarques","","Notes complémentaires"),
|
| - |
|
70 |
"nomadd" => array("Commentaires nomenclaturaux","","Commentaires nomenclaturaux pouvant être associés à un nom (voir tableau 8 du manuel technique)"),
|
| - |
|
71 |
"nsr" => array("Nom retenu sans auteur","","Nom scientifique du nom retenu sans auteur"),
|
| - |
|
72 |
"hom" => array("Homonymie","","Contient la valeur 1 si le nom possède un homonyme ou si le nom est un homonyme. Dans le cas contraire"),
|
| - |
|
73 |
"synprop" => array("Synonyme proprate","","Contient plusieurs identifiants numériques (num_nom) dans le cas d'un nom obtenu suite à la division d'un taxon. Contient un seul identifiant numérique (num_nom) dans le cas d'un nom obtenu suite à la fusion de plusieurs taxons."),
|
| - |
|
74 |
"syndout" => array("Synonyme douteux","","Contient la valeur 1 si le nom est un synonyme douteux. Dans le cas contraire"),
|
| - |
|
75 |
"synmapp" => array("Synonyme mal appliqué","","Contient la valeur 1 si le nom est un synonyme mal appliqué (cas des sensu). Dans le cas contraire"),
|
| - |
|
76 |
"synorth" => array("Synonyme orthographique","","Contient l'identifiant numérique du nom (num_nom) correctement orthographié"),
|
| - |
|
77 |
"orthori" => array("Orthographe originelle","","Contient la graphie originelle d'un nom non-conforme faisant l'objet d'une correction orthographique obligatoire"),
|
| - |
|
78 |
"hybp01n" => array("Hybride parent 1 notes","","Notes éventuelles sur l'hybridité et le parent numéro 1"),
|
| - |
|
79 |
"hybp02n" => array("Hybride parent 2 notes","","Notes éventuelles sur l'hybridité et le parent numéro 2"),
|
| - |
|
80 |
"cultgp" => array("Groupe de cultivar","","Nom d'un groupe de cultivar (sansl'abréviation « Gp »)"),
|
| - |
|
81 |
"cult" => array("Nom cultivar","","Nom d'un cultivar (sans les guillemets simple ou abréviation « cv. »)"),
|
| - |
|
82 |
"nomcomm" => array("Nom commercial","","Nom commercial d'une plante (en majuscule"),
|
| 33 |
$this->referentielDao = new ReferentielDao();
|
83 |
"autres" => array("Autres","","colonnes spécifiques au référentiel"));
|
| Line 34... |
Line 84... |
| 34 |
}
|
84 |
}
|
| 35 |
|
85 |
|
| 36 |
//+----------------------------------------------------------------------------------------------------------------+
|
86 |
//+----------------------------------------------------------------------------------------------------------------+
|
| Line 56... |
Line 106... |
| 56 |
$donnees['referentiel'] = $this->referentiel;
|
106 |
$donnees['referentiel'] = $this->referentiel;
|
| 57 |
$donnees['nom_referentiel'] = $this->referentielDao->getNom($this->referentiel);
|
107 |
$donnees['nom_referentiel'] = $this->referentielDao->getNom($this->referentiel);
|
| 58 |
$donnees['url_menu_test'] = $this->obtenirUrlMenuTest($this->referentiel);
|
108 |
$donnees['url_menu_test'] = $this->obtenirUrlMenuTest($this->referentiel);
|
| 59 |
$donnees['url_menu_versionnage'] = $this->obtenirUrlMenuVersionnage($this->referentiel);
|
109 |
$donnees['url_menu_versionnage'] = $this->obtenirUrlMenuVersionnage($this->referentiel);
|
| 60 |
$donnees['url_menu_consultation'] = $this->obtenirUrlMenuConsultation($this->referentiel);
|
110 |
$donnees['url_menu_consultation'] = $this->obtenirUrlMenuConsultation($this->referentiel);
|
| - |
|
111 |
$donnees['url_form_telech'] = $this->obtenirUrlDetailReferentielTelechargement($this->referentiel);
|
| Line 61... |
Line 112... |
| 61 |
|
112 |
|
| 62 |
// suppression du téléchargement pour bdbfx
|
113 |
// suppression du téléchargement pour bdbfx
|
| - |
|
114 |
if ($this->referentiel != 'bdbfx') {
|
| 63 |
if ($this->referentiel != 'bdbfx') {
|
115 |
$donnees['versions'] = $this->afficherFormulaireTelechargementsReferentiels();
|
| - |
|
116 |
$donnees['infos_telechargements'] = $this->afficherTelechargementsReferentiels();
|
| 64 |
$donnees['infos_telechargements'] = $this->afficherTelechargementsReferentiels();
|
117 |
$donnees['colonnesOrdonnees'] = $this->colonnesOrdonnees;
|
| 65 |
}
|
118 |
}
|
| 66 |
} else {
|
119 |
} else {
|
| 67 |
$this->addMessage("Aucun code de projet de référentiel n'est indiqué (Ex. bdtfx).");
|
120 |
$this->addMessage("Aucun code de projet de référentiel n'est indiqué (Ex. bdtfx).");
|
| Line 68... |
Line 121... |
| 68 |
}
|
121 |
}
|
| 69 |
|
122 |
|
| 70 |
$donnees['messages'] = $this->getMessages();
|
123 |
$donnees['messages'] = $this->getMessages();
|
| 71 |
$this->traiterEsperluette($donnees);
|
124 |
$this->traiterEsperluette($donnees);
|
| Line -... |
Line 125... |
| - |
|
125 |
$this->setSortie(self::RENDU_CORPS, $this->getVue('detail_referentiel', $donnees), false);
|
| - |
|
126 |
}
|
| - |
|
127 |
|
| - |
|
128 |
public function telecharger() {
|
| - |
|
129 |
//$this->afficherDetail();
|
| - |
|
130 |
$dossier = '/home/delphine/tmp/';
|
| - |
|
131 |
$parametres['ref'] = $this->referentiel;
|
| - |
|
132 |
$parametres['version'] = $_POST["version"];
|
| - |
|
133 |
$parametres['version'] = str_replace(".", "_", $parametres['version']);
|
| - |
|
134 |
$parametres['champs'] = implode(",",$_POST["champs"]);
|
| - |
|
135 |
$parametres['filtres'] = implode(",",$_POST["filtres"]);
|
| - |
|
136 |
$this->supprimerAncienExport($dossier);
|
| - |
|
137 |
$ref = $this->referentielDao->exporter($parametres);
|
| - |
|
138 |
$meta = $this->metaDao->exporter($parametres);
|
| - |
|
139 |
$zip = new ZipArchive();
|
| - |
|
140 |
if($zip->open($dossier.date('Y_m_d').'/'.$this->referentiel.time().'.zip', ZipArchive::CREATE) === true){
|
| - |
|
141 |
// Ajout des fichiers métadonnées, référentiel et manuel technique
|
| - |
|
142 |
$meta = str_replace("\\/", "/", $meta);
|
| - |
|
143 |
if (file_exists($meta)) $metazip = $zip->addFile($meta, "informations.csv");
|
| - |
|
144 |
if (file_exists($ref)) $refzip = $zip->addFile($ref, "referentiel.csv");
|
| - |
|
145 |
if (file_exists($dossier.'mtpr_V4_4.pdf')) $zip->addFile($dossier.'mtpr_V4_4.pdf', 'manuel_technique.pdf');
|
| - |
|
146 |
// Et on referme l'archive
|
| - |
|
147 |
$zip->close();
|
| - |
|
148 |
} else {
|
| - |
|
149 |
print_r('Impossible d'ouvrir "Zip.zip<br/>');
|
| - |
|
150 |
}
|
| - |
|
151 |
|
| - |
|
152 |
if (file_exists($fichier)) {
|
| - |
|
153 |
print_r("<a href='".$zip."'>");
|
| - |
|
154 |
}
|
| - |
|
155 |
}
|
| - |
|
156 |
|
| - |
|
157 |
private function supprimerAncienExport($dossier) {
|
| - |
|
158 |
$pointeur = opendir($dossier);
|
| - |
|
159 |
// si pas d'erreur d'ouverture du dossier on lance le scan
|
| - |
|
160 |
if( $pointeur != false ) {
|
| - |
|
161 |
// Parcours du repertoire
|
| - |
|
162 |
while( $ss_dossier = readdir($pointeur)) {
|
| - |
|
163 |
if($ss_dossier != "." && $ss_dossier != "..") {
|
| - |
|
164 |
$chemin_complet = $dossier . $ss_dossier;
|
| - |
|
165 |
if (is_dir($chemin_complet) && $ss_dossier < date('Y_m_d')) {
|
| - |
|
166 |
$fichiers = scandir($chemin_complet);
|
| - |
|
167 |
foreach ($fichiers as $fichier) {
|
| - |
|
168 |
if($fichier != "." && $fichier != "..") {
|
| - |
|
169 |
unlink($chemin_complet."/".$fichier);
|
| - |
|
170 |
}
|
| - |
|
171 |
}
|
| - |
|
172 |
rmdir($chemin_complet);
|
| - |
|
173 |
}
|
| - |
|
174 |
}
|
| - |
|
175 |
}
|
| - |
|
176 |
closedir($pointeur);
|
| - |
|
177 |
}
|
| - |
|
178 |
}
|
| - |
|
179 |
|
| - |
|
180 |
private function afficherFormulaireTelechargementsReferentiels() {
|
| - |
|
181 |
$versions = $this->traitementDao->getTraitementsTermines($this->referentiel, 'versionnage');
|
| - |
|
182 |
foreach ($versions as $id => $version) {
|
| 72 |
$this->setSortie(self::RENDU_CORPS, $this->getVue('detail_referentiel', $donnees), false);
|
183 |
$versions[$id] = (unserialize($versions[$id]["script_parametres"])); }
|
| 73 |
}
|
184 |
return $versions;
|
| 74 |
|
185 |
}
|
| 75 |
private function afficherTelechargementsReferentiels() {
|
186 |
private function afficherTelechargementsReferentiels() {
|
| 76 |
$infos_telechargements = array();
|
187 |
$infos_telechargements = array();
|