WebSVN – Applications.referentiel – Diff – /trunk/scripts/modules/algolia/Algolia.php


<?php
/**
 * Indexation dans Algolia des référentiels
 *
 * Description : formate les données des référentiels choisis et envoie tout ça
 * dans Algolia
 * 
 * Utilisation : php script.php algolia [-ref "ref1,ref2,..."]
 *   -ref (optionnel): liste de codes de référentiels séparés par des virgules;
 *                     par défaut: "apd,bdtfx,bdtxa,isfan"
 * 
 * Exemples:
 *   php script.php algolia
 *   php script.php algolia -ref "bdtfx,isfan"
 * 
 * @note: ignorer le paramètre fasciste -a : on ne s'en sert pas
 *
 * @author       Tela Botanica <equipe-dev@tela-botanica.org>
 * @licence		GPL v3 & CeCILL v2
 */
restore_error_handler();
restore_exception_handler();
ini_set("display_errors","1");
error_reporting(E_ALL);
 
// composer autoload
require dirname(__FILE__) . '/../../../vendor/autoload.php';
 
class Algolia extends ScriptCommande {
 
	const SCRIPT_NOM = 'algolia';
 
	public $parametres = array(
		'-ref' => array(false, false, 'Celui qui lit ça est un con')
	);
 
	/** connexion PDO à la BDD "referentiels" */
	protected $bdd;
 
	/** client API Algolia */
	protected $algolia;
	protected $indexAlgolia;
	
	public function executer() {
		echo "Indexation des référentiels dans Algolia" . PHP_EOL;
 
		// Bibliothèque Algolia PHP pour appeler l'API
		Config::charger(dirname(__FILE__) . '/algolia.ini');
		$this->algolia = new \AlgoliaSearch\Client(Config::get('algolia_application_id'), Config::get('algolia_api_key'));
		$this->indexAlgolia = $this->algolia->initIndex(Config::get('algolia_index'));
 
		/*$settings = $this->indexAlgolia->getSettings();
		var_dump(json_encode($settings));
		exit;*/
 
		// Réglages de l'index @TODO tenir à jour
		if ($this->confirmer("Charger les réglages par défaut (index_settings.json) dans la configuration de l'index Algolia ?")) {
			// Chargement des réglages par défaut
			$reglagesJson = file_get_contents(dirname(__FILE__) . '/index_settings.json');
			$reglages = json_decode($reglagesJson, true);
			$this->indexAlgolia->setSettings($reglages);
			echo "Réglages chargés dans Algolia" . PHP_EOL;
		}
 
		// Connexion à la base
		$this->connecterPDO();
 
		// Liste des référentiels à fusionner
		$refsTexte = Config::get('algolia_referentiels');
		$refs = explode(",", $refsTexte);
 
		// Liste des référentiels à mettre à jour
		$refsMajTexte = $this->getParam("ref");
		if ($refsMajTexte === false) {
			// si le paramètre est vide, on met tout à jour
			$refsMaj = $refs;
		} else {
			$refsMaj = explode(",", $refsMajTexte);
		}
 
		// Déniaisage 1
		foreach ($refs as $k => $r) {
			$fichierRequete = dirname(__FILE__) . "/algolia_" . $r . ".sql";
			if (! file_exists($fichierRequete)) {
				echo "- fichier [$fichierRequete] non trouvé, fusion de [$r] ignorée" . PHP_EOL;
				unset($refs[$k]);
			}
		}
		if (empty($refs)) {
			echo "Aucun référentiel à fusionner" . PHP_EOL;
			exit;
		}
 
		// Déniaisage 2
		foreach ($refsMaj as $k => $r) {
			if (! in_array($r, $refs)) {
				echo "- le référentiel à mettre à jour [$r] n'est pas présent dans la liste à fusionner, il sera ignoré" . PHP_EOL;
				unset($refsMaj[$k]);
			}
		}
		if (empty($refsMaj)) {
			echo "Aucun référentiel à mettre à jour" . PHP_EOL;
			exit;
		}
 
		// Confirmation
		if (! $this->confirmer("Fusion des référentiels [" . implode(',', $refs) . "] et mise à jour de [" . implode(',', $refsMaj) . "]. Continuer ?")) {
			exit;
		}
 
		//var_dump($refs);
		$donneesBrutes = array();
		// Exécution des requêtes pour chaque référentiel
		foreach ($refs as $ref) {
			$fichierRequete = dirname(__FILE__) . "/algolia_" . $ref . ".sql";
			// Exécution de la requête
			$requete = file_get_contents($fichierRequete);
			$resultat = $this->requete($requete);
			/*while ($ligne = $resultat->fetch()) {
				var_dump($ligne);
				break;
			}*/
			$donneesBrutes[$ref] = $resultat->fetchAll();
 
			// Info utilisation mémoire
			$mem = memory_get_usage(true);
			$memMio = round($mem / (1024 * 1024));
			echo "Mémoire utilisée : $memMio Mio" . PHP_EOL;
		}
 
		// Fusion !
		$index = $this->fusionnerReferentiels($donneesBrutes);
		//$this->extrait($index, array('Acacia dealbata Link','Acacia Mill.','Fabaceae'));
 
		// Mise en forme
		$index = $this->mettreEnForme($index);
		//$this->extrait($index, 3);
 
		// Stats
		$taille = count($index);
		echo "Taille de l'index: [$taille] lignes !" . PHP_EOL;
		//file_put_contents("couscous.json", json_encode($index));
 
		// Calcul des différences ?
		// Insertion ?
		$this->insererDansAlgolia($index);
 
		// Info utilisation mémoire totale
		$mem = memory_get_peak_usage(true);
		$memMio = round($mem / (1024 * 1024));
		echo "Mémoire maximale utilisée : $memMio Mio" . PHP_EOL;
	}
 
	/**
	 * Génère un index unique pour Algolia à partir des données de n référentiels
	 */
	protected function fusionnerReferentiels(&$donneesRefs) {
		$index = array();
		foreach ($donneesRefs as $ref => &$d) {
			$nbTaxons = count($d);
			echo "-- fusion du référentiel [$ref] : $nbTaxons taxons --" . PHP_EOL;
 
			$fusions = 0;
			foreach ($d as $taxon) {
				$nomSci = $taxon[$ref . '_nom_sci'];
				//$nn = $taxon[$ref . '_num_nom'];
				// Ajout du nom d'auteur pour éviter les collisions dans un même référentiel
				if (! empty ($taxon[$ref . '_auteur'])) {
					$nomSci .= ' ' . $taxon[$ref . '_auteur'];
				}
 
				// -- ÉLIMINATION DES NOMS SANS CORRESPONDANCE
				if (empty($taxon[$ref . '_num_nom_retenu'])) {
					//echo "XX élimination du nom sans correspondance : [$nomSci] (nn $nn)" . PHP_EOL;
					continue;
				}
 
				if (! isset($index[$nomSci])) {
					$index[$nomSci] = array(
						'objectID' => $nomSci,
						'referentiels' => array()
					);
				} else {
					//echo "> fusion sur [$nomSci] (nn $nn)" . PHP_EOL;
					$fusions++;
				}
				$index[$nomSci] = array_merge($index[$nomSci], $taxon);
				$index[$nomSci]['referentiels'][] = $ref;
				//break;
			}
			$taille = count($index);
			echo "- taille de l'index après ajout de [$ref]: [$taille] lignes ($fusions fusions)" . PHP_EOL;
		}
		return $index;
	}
 
	/**
	 * Organise les données de chaque objet conformément à la structure de
	 * l'index Algolia
	 * 
	 * Voir commentaires sur cette page :
	 * http://taiga.tela-botanica.net/project/mathias-site-web/task/75
	 * 
	 * L'objectID est le MD5 de la "clef" (nom scientifique avec auteur)
	 */
	protected function mettreEnForme($index) {
		$nouvelIndex = array();
		foreach ($index as $nomSci => $taxon) {
			$nouveauTaxon = array(
				'objectID' => md5($nomSci),
				'referentiels' => $taxon['referentiels']
			);
			foreach ($taxon['referentiels'] as $ref) {
				// ingrédients
				$nn = $taxon[$ref . '_num_nom'];
				$ns = $taxon[$ref . '_nom_sci'];
				$nts = $taxon[$ref . '_num_tax_sup'];
				$rang = $taxon[$ref . '_rang'];
				$auteur = $taxon[$ref . '_auteur'];
				$annee = $taxon[$ref . '_annee'];
				$biblio = $taxon[$ref . '_biblio'];
				$nom_supra_generique = $taxon[$ref . '_nom_supra_generique'];
				$genre = $taxon[$ref . '_genre'];
				$epithete_sp = $taxon[$ref . '_epithete_sp'];
				$type_epithete = $taxon[$ref . '_type_epithete'];
				$epithete_infra_sp = $taxon[$ref . '_epithete_infra_sp'];
				$cultivar = $taxon[$ref . '_cultivar'];
				$cultivar_groupe = $taxon[$ref . '_cultivar_groupe'];
				$nomCommun = (isset($taxon[$ref . '_nom_francais']) ? $taxon[$ref . '_nom_francais'] : '');
				$url = $taxon[$ref . '_url'];
				$synonymes = json_decode($taxon[$ref . '_synonymes'], true);
				$raccourcis = json_decode($taxon[$ref . '_shortcuts'], true);
				$raccourcis = ($raccourcis != null ? array_values(array_unique($raccourcis)) : null); // array_values réindexe pour obtenir une liste en JSON et non un objet
				// garniture
				$donneesRef = array(
					'nomenclatural_number' => intval($nn),
					'scientific_name' => $ns,
					'common_name' => $nomCommun,
					'synonyms' => $synonymes,
					'url' => $url,
					'parent_taxon_number' => intval($nts),
					'rank' => intval($rang),
					'author' => $auteur,
					'year' => intval($annee),
					'biblio' => $biblio,
					'supra_genus_name' => $nom_supra_generique,
					'genus' => $genre,
					'species_attribute' => $epithete_sp,
					'attribute_type' => $type_epithete,
					'infra_species_attribute' => $epithete_infra_sp,
					'cultivar' => $cultivar,
					'cultivar_groupe' => $cultivar_groupe
				);
				$nouveauTaxon[$ref] = $donneesRef;
				$nouveauTaxon['shortcuts'] = $raccourcis;
			}
			$nouvelIndex[] = $nouveauTaxon;
		}
		return $nouvelIndex;
	}
 
	protected function insererDansAlgolia($index) {
		$tailleTranche = 30000;
		echo "++++ Insertion dans Algolia ($tailleTranche) !! ++++" . PHP_EOL;
		$tranche = array_slice($index, 0, $tailleTranche);
		//var_dump($tranche);
		//$trancheJSON = json_encode($tranche);
		$this->indexAlgolia->addObjects($tranche);
		//$this->algolia->
	}
 
	// ---------------- utilitaires --------------------------------------------
 
	protected function extrait($index, $clefsOuNombre) {
		// Debug
		echo PHP_EOL . "---- extrait des données --" . PHP_EOL;
		if (is_array($clefsOuNombre)) {
			foreach ($clefsOuNombre as $k) {
				var_dump($index[$k]);
			}
		} else {
			for ($i=0; $i < $clefsOuNombre; $i++) {
				var_dump($index[$i]);
			}
		}
	}
 
	protected function connecterPDO() {
		Config::charger(dirname(__FILE__) . '/../../configurations/bdd.ini');
		try {
			$dsn = Config::get('bdd_type').':dbname='.Config::get('bdd_nom').';host='.
				Config::get('bdd_hote');
			$this->bdd = new PDO($dsn, Config::get('bdd_utilisateur'), Config::get('bdd_mot_de_passe'));
			// Passe en UTF-8 la connexion à la BDD
			$this->bdd->exec("SET NAMES 'utf8'");
			// Affiche les erreurs détectées par PDO (sinon mode silencieux => aucune erreur affiché)
			$this->bdd->setAttribute(PDO::ATTR_ERRMODE, PDO::ERRMODE_EXCEPTION);
		} catch (PDOException $e) {
			//print_r($e);
			echo 'La connexion à la base de données via PDO a échoué : ' . $e->getMessage() . PHP_EOL;
			exit;
		}
	}
 
	protected function requete($requete) {
		$infos = null;
		try {
			$infos = $this->bdd->query($requete, PDO::FETCH_ASSOC);
			/*if ($infos === false) {
				echo $requete;
			}*/
		} catch (PDOException $e) {
			echo sprintf($e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage(), $e->getCode(), $requete);
		}
		return $infos;
	}
 
	/**
	 * Demande confirmation, et sort du script à moins qu'on tape ce qui est
	 * indiqué (par défaut "o" pour "oui")
	 */
	protected function confirmer($question='Continuer ?', $codeAcceptation='o', $messageAnnulation='annulation') {
		echo $question . ' ("' . $codeAcceptation . '" pour confirmer, autre chose pour annuler)' . PHP_EOL;
		$handle = fopen ("php://stdin","r");
		$line = fgets($handle);
		if(strtolower(trim($line)) != strtolower($codeAcceptation)) {
			echo $messageAnnulation . PHP_EOL;
			return false;
		}
		fclose($handle);
		return true;
	}
}
?>

Rev 380	Rev 382
1	`<?php`	1	`<?php`
2	`/**`	2	`/**`
3	`* Indexation dans Algolia des référentiels`	3	`* Indexation dans Algolia des référentiels`
4	`*`	4	`*`
5	`* Description : formate les données des référentiels choisis et envoie tout ça`	5	`* Description : formate les données des référentiels choisis et envoie tout ça`
6	`* dans Algolia`	6	`* dans Algolia`
7	`*`	7	`*`
8	`* Utilisation : php script.php algolia [-ref "ref1,ref2,..."]`	8	`* Utilisation : php script.php algolia [-ref "ref1,ref2,..."]`
9	`* -ref (optionnel): liste de codes de référentiels séparés par des virgules;`	9	`* -ref (optionnel): liste de codes de référentiels séparés par des virgules;`
10	`* par défaut: "apd,bdtfx,bdtxa,isfan"`	10	`* par défaut: "apd,bdtfx,bdtxa,isfan"`
11	`*`	11	`*`
12	`* Exemples:`	12	`* Exemples:`
13	`* php script.php algolia`	13	`* php script.php algolia`
14	`* php script.php algolia -ref "bdtfx,isfan"`	14	`* php script.php algolia -ref "bdtfx,isfan"`
15	`*`	15	`*`
16	`* @note: ignorer le paramètre fasciste -a : on ne s'en sert pas`	16	`* @note: ignorer le paramètre fasciste -a : on ne s'en sert pas`
17	`*`	17	`*`
18	`* @author Tela Botanica <equipe-dev@tela-botanica.org>`	18	`* @author Tela Botanica <equipe-dev@tela-botanica.org>`
19	`* @licence GPL v3 & CeCILL v2`	19	`* @licence GPL v3 & CeCILL v2`
20	`*/`	20	`*/`
21	`restore_error_handler();`	21	`restore_error_handler();`
22	`restore_exception_handler();`	22	`restore_exception_handler();`
23	`ini_set("display_errors","1");`	23	`ini_set("display_errors","1");`
24	`error_reporting(E_ALL);`	24	`error_reporting(E_ALL);`
25		25
26	`// composer autoload`	26	`// composer autoload`
27	`require dirname(__FILE__) . '/../../../vendor/autoload.php';`	27	`require dirname(__FILE__) . '/../../../vendor/autoload.php';`
28		28
29	`class Algolia extends ScriptCommande {`	29	`class Algolia extends ScriptCommande {`
30		30
31	`const SCRIPT_NOM = 'algolia';`	31	`const SCRIPT_NOM = 'algolia';`
32		32
33	`public $parametres = array(`	33	`public $parametres = array(`
34	`'-ref' => array(false, false, 'Celui qui lit ça est un con')`	34	`'-ref' => array(false, false, 'Celui qui lit ça est un con')`
35	`);`	35	`);`
36		36
37	`/** connexion PDO à la BDD "referentiels" */`	37	`/** connexion PDO à la BDD "referentiels" */`
38	`protected $bdd;`	38	`protected $bdd;`
39		39
40	`/** client API Algolia */`	40	`/** client API Algolia */`
41	`protected $algolia;`	41	`protected $algolia;`
42	`protected $indexAlgolia;`	42	`protected $indexAlgolia;`
43		43
44	`public function executer() {`	44	`public function executer() {`
45	`echo "Indexation des référentiels dans Algolia" . PHP_EOL;`	45	`echo "Indexation des référentiels dans Algolia" . PHP_EOL;`
46		46
47	`// Bibliothèque Algolia PHP pour appeler l'API`	47	`// Bibliothèque Algolia PHP pour appeler l'API`
48	`Config::charger(dirname(__FILE__) . '/algolia.ini');`	48	`Config::charger(dirname(__FILE__) . '/algolia.ini');`
49	`$this->algolia = new \AlgoliaSearch\Client(Config::get('algolia_application_id'), Config::get('algolia_api_key'));`	49	`$this->algolia = new \AlgoliaSearch\Client(Config::get('algolia_application_id'), Config::get('algolia_api_key'));`
50	`$this->indexAlgolia = $this->algolia->initIndex(Config::get('algolia_index'));`	50	`$this->indexAlgolia = $this->algolia->initIndex(Config::get('algolia_index'));`
-		51
-		52	`/*$settings = $this->indexAlgolia->getSettings();`
-		53	`var_dump(json_encode($settings));`
-		54	`exit;*/`
-		55
-		56	`// Réglages de l'index @TODO tenir à jour`
-		57	`if ($this->confirmer("Charger les réglages par défaut (index_settings.json) dans la configuration de l'index Algolia ?")) {`
-		58	`// Chargement des réglages par défaut`
-		59	`$reglagesJson = file_get_contents(dirname(__FILE__) . '/index_settings.json');`
-		60	`$reglages = json_decode($reglagesJson, true);`
-		61	`$this->indexAlgolia->setSettings($reglages);`
-		62	`echo "Réglages chargés dans Algolia" . PHP_EOL;`
-		63	`}`
51		64
52	`// Connexion à la base`	65	`// Connexion à la base`
53	`$this->connecterPDO();`	66	`$this->connecterPDO();`
54		67
55	`// Liste des référentiels à fusionner`	68	`// Liste des référentiels à fusionner`
56	`$refsTexte = Config::get('algolia_referentiels');`	69	`$refsTexte = Config::get('algolia_referentiels');`
57	`$refs = explode(",", $refsTexte);`	70	`$refs = explode(",", $refsTexte);`
58		71
59	`// Liste des référentiels à mettre à jour`	72	`// Liste des référentiels à mettre à jour`
60	`$refsMajTexte = $this->getParam("ref");`	73	`$refsMajTexte = $this->getParam("ref");`
61	`if ($refsMajTexte === false) {`	74	`if ($refsMajTexte === false) {`
62	`// si le paramètre est vide, on met tout à jour`	75	`// si le paramètre est vide, on met tout à jour`
63	`$refsMaj = $refs;`	76	`$refsMaj = $refs;`
64	`} else {`	77	`} else {`
65	`$refsMaj = explode(",", $refsMajTexte);`	78	`$refsMaj = explode(",", $refsMajTexte);`
66	`}`	79	`}`
67		80
68	`// Déniaisage 1`	81	`// Déniaisage 1`
69	`foreach ($refs as $k => $r) {`	82	`foreach ($refs as $k => $r) {`
70	`$fichierRequete = dirname(__FILE__) . "/algolia_" . $r . ".sql";`	83	`$fichierRequete = dirname(__FILE__) . "/algolia_" . $r . ".sql";`
71	`if (! file_exists($fichierRequete)) {`	84	`if (! file_exists($fichierRequete)) {`
72	`echo "- fichier [$fichierRequete] non trouvé, fusion de [$r] ignorée" . PHP_EOL;`	85	`echo "- fichier [$fichierRequete] non trouvé, fusion de [$r] ignorée" . PHP_EOL;`
73	`unset($refs[$k]);`	86	`unset($refs[$k]);`
74	`}`	87	`}`
75	`}`	88	`}`
76	`if (empty($refs)) {`	89	`if (empty($refs)) {`
77	`echo "Aucun référentiel à fusionner" . PHP_EOL;`	90	`echo "Aucun référentiel à fusionner" . PHP_EOL;`
78	`exit;`	91	`exit;`
79	`}`	92	`}`
80		93
81	`// Déniaisage 2`	94	`// Déniaisage 2`
82	`foreach ($refsMaj as $k => $r) {`	95	`foreach ($refsMaj as $k => $r) {`
83	`if (! in_array($r, $refs)) {`	96	`if (! in_array($r, $refs)) {`
84	`echo "- le référentiel à mettre à jour [$r] n'est pas présent dans la liste à fusionner, il sera ignoré" . PHP_EOL;`	97	`echo "- le référentiel à mettre à jour [$r] n'est pas présent dans la liste à fusionner, il sera ignoré" . PHP_EOL;`
85	`unset($refsMaj[$k]);`	98	`unset($refsMaj[$k]);`
86	`}`	99	`}`
87	`}`	100	`}`
88	`if (empty($refsMaj)) {`	101	`if (empty($refsMaj)) {`
89	`echo "Aucun référentiel à mettre à jour" . PHP_EOL;`	102	`echo "Aucun référentiel à mettre à jour" . PHP_EOL;`
90	`exit;`	103	`exit;`
91	`}`	104	`}`
92		105
93	`// Confirmation`	106	`// Confirmation`
94	`//$this->confirmer("Fusion des référentiels [" . implode(',', $refs) . "] et mise à jour de [" . implode(',', $refsMaj) . "]. Continuer ?");`	107	`if (! $this->confirmer("Fusion des référentiels [" . implode(',', $refs) . "] et mise à jour de [" . implode(',', $refsMaj) . "]. Continuer ?")) {`
-		108	`exit;`
-		109	`}`
95		110
96	`//var_dump($refs);`	111	`//var_dump($refs);`
97	`$donneesBrutes = array();`	112	`$donneesBrutes = array();`
98	`// Exécution des requêtes pour chaque référentiel`	113	`// Exécution des requêtes pour chaque référentiel`
99	`foreach ($refs as $ref) {`	114	`foreach ($refs as $ref) {`
100	`$fichierRequete = dirname(__FILE__) . "/algolia_" . $ref . ".sql";`	115	`$fichierRequete = dirname(__FILE__) . "/algolia_" . $ref . ".sql";`
101	`// Exécution de la requête`	116	`// Exécution de la requête`
102	`$requete = file_get_contents($fichierRequete);`	117	`$requete = file_get_contents($fichierRequete);`
103	`$resultat = $this->requete($requete);`	118	`$resultat = $this->requete($requete);`
104	`/*while ($ligne = $resultat->fetch()) {`	119	`/*while ($ligne = $resultat->fetch()) {`
105	`var_dump($ligne);`	120	`var_dump($ligne);`
106	`break;`	121	`break;`
107	`}*/`	122	`}*/`
108	`$donneesBrutes[$ref] = $resultat->fetchAll();`	123	`$donneesBrutes[$ref] = $resultat->fetchAll();`
109		124
110	`// Info utilisation mémoire`	125	`// Info utilisation mémoire`
111	`$mem = memory_get_usage(true);`	126	`$mem = memory_get_usage(true);`
112	`$memMio = round($mem / (1024 * 1024));`	127	`$memMio = round($mem / (1024 * 1024));`
113	`echo "Mémoire utilisée : $memMio Mio" . PHP_EOL;`	128	`echo "Mémoire utilisée : $memMio Mio" . PHP_EOL;`
114	`}`	129	`}`
115		130
116	`// Fusion !`	131	`// Fusion !`
117	`$index = $this->fusionnerReferentiels($donneesBrutes);`	132	`$index = $this->fusionnerReferentiels($donneesBrutes);`
118	`//$this->extrait($index, array('Acacia dealbata Link','Acacia Mill.','Fabaceae'));`	133	`//$this->extrait($index, array('Acacia dealbata Link','Acacia Mill.','Fabaceae'));`
119		134
120	`// Mise en forme`	135	`// Mise en forme`
121	`$index = $this->mettreEnForme($index);`	136	`$index = $this->mettreEnForme($index);`
122	`$this->extrait($index, 3);`	137	`//$this->extrait($index, 3);`
123		138
124	`// Stats`	139	`// Stats`
125	`$taille = count($index);`	140	`$taille = count($index);`
126	`echo "Taille de l'index: [$taille] lignes !" . PHP_EOL;`	141	`echo "Taille de l'index: [$taille] lignes !" . PHP_EOL;`
127	`//file_put_contents("couscous.json", json_encode($index));`	142	`//file_put_contents("couscous.json", json_encode($index));`
128		143
129	`// Calcul des différences ?`	144	`// Calcul des différences ?`
130	`// Insertion ?`	145	`// Insertion ?`
131	`$this->insererDansAlgolia($index);`	146	`$this->insererDansAlgolia($index);`
132		147
133	`// Info utilisation mémoire totale`	148	`// Info utilisation mémoire totale`
134	`$mem = memory_get_peak_usage(true);`	149	`$mem = memory_get_peak_usage(true);`
135	`$memMio = round($mem / (1024 * 1024));`	150	`$memMio = round($mem / (1024 * 1024));`
136	`echo "Mémoire maximale utilisée : $memMio Mio" . PHP_EOL;`	151	`echo "Mémoire maximale utilisée : $memMio Mio" . PHP_EOL;`
137	`}`	152	`}`
138		153
139	`/**`	154	`/**`
140	`* Génère un index unique pour Algolia à partir des données de n référentiels`	155	`* Génère un index unique pour Algolia à partir des données de n référentiels`
141	`*/`	156	`*/`
142	`protected function fusionnerReferentiels(&$donneesRefs) {`	157	`protected function fusionnerReferentiels(&$donneesRefs) {`
143	`$index = array();`	158	`$index = array();`
144	`foreach ($donneesRefs as $ref => &$d) {`	159	`foreach ($donneesRefs as $ref => &$d) {`
145	`$nbTaxons = count($d);`	160	`$nbTaxons = count($d);`
146	`echo "-- fusion du référentiel [$ref] : $nbTaxons taxons --" . PHP_EOL;`	161	`echo "-- fusion du référentiel [$ref] : $nbTaxons taxons --" . PHP_EOL;`
147		162
148	`$fusions = 0;`	163	`$fusions = 0;`
149	`foreach ($d as $taxon) {`	164	`foreach ($d as $taxon) {`
150	`$nomSci = $taxon[$ref . '_nom_sci'];`	165	`$nomSci = $taxon[$ref . '_nom_sci'];`
151	`//$nn = $taxon[$ref . '_num_nom'];`	166	`//$nn = $taxon[$ref . '_num_nom'];`
152	`// Ajout du nom d'auteur pour éviter les collisions dans un même référentiel`	167	`// Ajout du nom d'auteur pour éviter les collisions dans un même référentiel`
153	`if (! empty ($taxon[$ref . '_auteur'])) {`	168	`if (! empty ($taxon[$ref . '_auteur'])) {`
154	`$nomSci .= ' ' . $taxon[$ref . '_auteur'];`	169	`$nomSci .= ' ' . $taxon[$ref . '_auteur'];`
155	`}`	170	`}`
156		171
157	`// -- ÉLIMINATION DES NOMS SANS CORRESPONDANCE`	172	`// -- ÉLIMINATION DES NOMS SANS CORRESPONDANCE`
158	`if (empty($taxon[$ref . '_num_nom_retenu'])) {`	173	`if (empty($taxon[$ref . '_num_nom_retenu'])) {`
159	`//echo "XX élimination du nom sans correspondance : [$nomSci] (nn $nn)" . PHP_EOL;`	174	`//echo "XX élimination du nom sans correspondance : [$nomSci] (nn $nn)" . PHP_EOL;`
160	`continue;`	175	`continue;`
161	`}`	176	`}`
162		177
163	`if (! isset($index[$nomSci])) {`	178	`if (! isset($index[$nomSci])) {`
164	`$index[$nomSci] = array(`	179	`$index[$nomSci] = array(`
165	`'objectID' => $nomSci,`	180	`'objectID' => $nomSci,`
166	`'referentiels' => array()`	181	`'referentiels' => array()`
167	`);`	182	`);`
168	`} else {`	183	`} else {`
169	`//echo "> fusion sur [$nomSci] (nn $nn)" . PHP_EOL;`	184	`//echo "> fusion sur [$nomSci] (nn $nn)" . PHP_EOL;`
170	`$fusions++;`	185	`$fusions++;`
171	`}`	186	`}`
172	`$index[$nomSci] = array_merge($index[$nomSci], $taxon);`	187	`$index[$nomSci] = array_merge($index[$nomSci], $taxon);`
173	`$index[$nomSci]['referentiels'][] = $ref;`	188	`$index[$nomSci]['referentiels'][] = $ref;`
174	`//break;`	189	`//break;`
175	`}`	190	`}`
176	`$taille = count($index);`	191	`$taille = count($index);`
177	`echo "- taille de l'index après ajout de [$ref]: [$taille] lignes ($fusions fusions)" . PHP_EOL;`	192	`echo "- taille de l'index après ajout de [$ref]: [$taille] lignes ($fusions fusions)" . PHP_EOL;`
178	`}`	193	`}`
179	`return $index;`	194	`return $index;`
180	`}`	195	`}`
181		196
182	`/**`	197	`/**`
183	`* Organise les données de chaque objet conformément à la structure de`	198	`* Organise les données de chaque objet conformément à la structure de`
184	`* l'index Algolia`	199	`* l'index Algolia`
185	`*`	200	`*`
186	`* Voir commentaires sur cette page :`	201	`* Voir commentaires sur cette page :`
187	`* http://taiga.tela-botanica.net/project/mathias-site-web/task/75`	202	`* http://taiga.tela-botanica.net/project/mathias-site-web/task/75`
188	`*`	203	`*`
189	`* L'objectID est le MD5 de la "clef" (nom scientifique avec auteur)`	204	`* L'objectID est le MD5 de la "clef" (nom scientifique avec auteur)`
190	`*/`	205	`*/`
191	`protected function mettreEnForme($index) {`	206	`protected function mettreEnForme($index) {`
192	`$nouvelIndex = array();`	207	`$nouvelIndex = array();`
193	`foreach ($index as $nomSci => $taxon) {`	208	`foreach ($index as $nomSci => $taxon) {`
194	`$nouveauTaxon = array(`	209	`$nouveauTaxon = array(`
195	`'objectID' => md5($nomSci),`	210	`'objectID' => md5($nomSci),`
196	`'referentiels' => $taxon['referentiels']`	211	`'referentiels' => $taxon['referentiels']`
197	`);`	212	`);`
198	`foreach ($taxon['referentiels'] as $ref) {`	213	`foreach ($taxon['referentiels'] as $ref) {`
199	`// ingrédients`	214	`// ingrédients`
200	`$nn = $taxon[$ref . '_num_nom'];`	215	`$nn = $taxon[$ref . '_num_nom'];`
201	`$ns = $taxon[$ref . '_nom_sci'];`	216	`$ns = $taxon[$ref . '_nom_sci'];`
202	`$nts = $taxon[$ref . '_num_tax_sup'];`	217	`$nts = $taxon[$ref . '_num_tax_sup'];`
203	`$rang = $taxon[$ref . '_rang'];`	218	`$rang = $taxon[$ref . '_rang'];`
204	`$auteur = $taxon[$ref . '_auteur'];`	219	`$auteur = $taxon[$ref . '_auteur'];`
205	`$annee = $taxon[$ref . '_annee'];`	220	`$annee = $taxon[$ref . '_annee'];`
206	`$biblio = $taxon[$ref . '_biblio'];`	221	`$biblio = $taxon[$ref . '_biblio'];`
207	`$nom_supra_generique = $taxon[$ref . '_nom_supra_generique'];`	222	`$nom_supra_generique = $taxon[$ref . '_nom_supra_generique'];`
208	`$genre = $taxon[$ref . '_genre'];`	223	`$genre = $taxon[$ref . '_genre'];`
209	`$epithete_sp = $taxon[$ref . '_epithete_sp'];`	224	`$epithete_sp = $taxon[$ref . '_epithete_sp'];`
210	`$type_epithete = $taxon[$ref . '_type_epithete'];`	225	`$type_epithete = $taxon[$ref . '_type_epithete'];`
211	`$epithete_infra_sp = $taxon[$ref . '_epithete_infra_sp'];`	226	`$epithete_infra_sp = $taxon[$ref . '_epithete_infra_sp'];`
212	`$cultivar = $taxon[$ref . '_cultivar'];`	227	`$cultivar = $taxon[$ref . '_cultivar'];`
213	`$cultivar_groupe = $taxon[$ref . '_cultivar_groupe'];`	228	`$cultivar_groupe = $taxon[$ref . '_cultivar_groupe'];`
214	`$nomCommun = (isset($taxon[$ref . '_nom_francais']) ? $taxon[$ref . '_nom_francais'] : '');`	229	`$nomCommun = (isset($taxon[$ref . '_nom_francais']) ? $taxon[$ref . '_nom_francais'] : '');`
215	`$url = $taxon[$ref . '_url'];`	230	`$url = $taxon[$ref . '_url'];`
216	`$synonymes = json_decode($taxon[$ref . '_synonymes'], true);`	231	`$synonymes = json_decode($taxon[$ref . '_synonymes'], true);`
217	`$raccourcis = json_decode($taxon[$ref . '_shortcuts'], true);`	232	`$raccourcis = json_decode($taxon[$ref . '_shortcuts'], true);`
218	`$raccourcis = array_values(array_unique($raccourcis)); // array_values réindexe pour obtenir une liste en JSON et non un objet`	233	`$raccourcis = ($raccourcis != null ? array_values(array_unique($raccourcis)) : null); // array_values réindexe pour obtenir une liste en JSON et non un objet`
219	`// garniture`	234	`// garniture`
220	`$donneesRef = array(`	235	`$donneesRef = array(`
221	`'nomenclatural_number' => intval($nn),`	236	`'nomenclatural_number' => intval($nn),`
222	`'scientific_name' => $ns,`	237	`'scientific_name' => $ns,`
223	`'common_name' => $nomCommun,`	238	`'common_name' => $nomCommun,`
224	`'synonyms' => $synonymes,`	239	`'synonyms' => $synonymes,`
225	`'url' => $url,`	240	`'url' => $url,`
226	`'parent_taxon_number' => intval($nts),`	241	`'parent_taxon_number' => intval($nts),`
227	`'rank' => intval($rang),`	242	`'rank' => intval($rang),`
228	`'author' => $auteur,`	243	`'author' => $auteur,`
229	`'year' => intval($annee),`	244	`'year' => intval($annee),`
230	`'biblio' => $biblio,`	245	`'biblio' => $biblio,`
231	`'supra_genus_name' => $nom_supra_generique,`	246	`'supra_genus_name' => $nom_supra_generique,`
232	`'genus' => $genre,`	247	`'genus' => $genre,`
233	`'species_attribute' => $epithete_sp,`	248	`'species_attribute' => $epithete_sp,`
234	`'attribute_type' => $type_epithete,`	249	`'attribute_type' => $type_epithete,`
235	`'infra_species_attribute' => $epithete_infra_sp,`	250	`'infra_species_attribute' => $epithete_infra_sp,`
236	`'cultivar' => $cultivar,`	251	`'cultivar' => $cultivar,`
237	`'cultivar_groupe' => $cultivar_groupe`	252	`'cultivar_groupe' => $cultivar_groupe`
238	`);`	253	`);`
239	`$nouveauTaxon[$ref] = $donneesRef;`	254	`$nouveauTaxon[$ref] = $donneesRef;`
240	`$nouveauTaxon['shortcuts'] = $raccourcis;`	255	`$nouveauTaxon['shortcuts'] = $raccourcis;`
241	`}`	256	`}`
242	`$nouvelIndex[] = $nouveauTaxon;`	257	`$nouvelIndex[] = $nouveauTaxon;`
243	`}`	258	`}`
244	`return $nouvelIndex;`	259	`return $nouvelIndex;`
245	`}`	260	`}`
246		261
247	`protected function insererDansAlgolia($index) {`	262	`protected function insererDansAlgolia($index) {`
-		263	`$tailleTranche = 30000;`
248	`echo "++++ Insertion dans Algolia !! ++++" . PHP_EOL;`	264	`echo "++++ Insertion dans Algolia ($tailleTranche) !! ++++" . PHP_EOL;`
249	`$tranche = array_slice($index, 0, 500);`	265	`$tranche = array_slice($index, 0, $tailleTranche);`
250	`//var_dump($tranche);`	266	`//var_dump($tranche);`
251	`//$trancheJSON = json_encode($tranche);`	267	`//$trancheJSON = json_encode($tranche);`
252	`$this->indexAlgolia->addObjects($tranche);`	268	`$this->indexAlgolia->addObjects($tranche);`
253	`//$this->algolia->`	269	`//$this->algolia->`
254	`}`	270	`}`
255		271
256	`// ---------------- utilitaires --------------------------------------------`	272	`// ---------------- utilitaires --------------------------------------------`
257		273
258	`protected function extrait($index, $clefsOuNombre) {`	274	`protected function extrait($index, $clefsOuNombre) {`
259	`// Debug`	275	`// Debug`
260	`echo PHP_EOL . "---- extrait des données --" . PHP_EOL;`	276	`echo PHP_EOL . "---- extrait des données --" . PHP_EOL;`
261	`if (is_array($clefsOuNombre)) {`	277	`if (is_array($clefsOuNombre)) {`
262	`foreach ($clefsOuNombre as $k) {`	278	`foreach ($clefsOuNombre as $k) {`
263	`var_dump($index[$k]);`	279	`var_dump($index[$k]);`
264	`}`	280	`}`
265	`} else {`	281	`} else {`
266	`for ($i=0; $i < $clefsOuNombre; $i++) {`	282	`for ($i=0; $i < $clefsOuNombre; $i++) {`
267	`var_dump($index[$i]);`	283	`var_dump($index[$i]);`
268	`}`	284	`}`
269	`}`	285	`}`
270	`}`	286	`}`
271		287
272	`protected function connecterPDO() {`	288	`protected function connecterPDO() {`
273	`Config::charger(dirname(__FILE__) . '/../../configurations/bdd.ini');`	289	`Config::charger(dirname(__FILE__) . '/../../configurations/bdd.ini');`
274	`try {`	290	`try {`
275	`$dsn = Config::get('bdd_type').':dbname='.Config::get('bdd_nom').';host='.`	291	`$dsn = Config::get('bdd_type').':dbname='.Config::get('bdd_nom').';host='.`
276	`Config::get('bdd_hote');`	292	`Config::get('bdd_hote');`
277	`$this->bdd = new PDO($dsn, Config::get('bdd_utilisateur'), Config::get('bdd_mot_de_passe'));`	293	`$this->bdd = new PDO($dsn, Config::get('bdd_utilisateur'), Config::get('bdd_mot_de_passe'));`
278	`// Passe en UTF-8 la connexion à la BDD`	294	`// Passe en UTF-8 la connexion à la BDD`
279	`$this->bdd->exec("SET NAMES 'utf8'");`	295	`$this->bdd->exec("SET NAMES 'utf8'");`
280	`// Affiche les erreurs détectées par PDO (sinon mode silencieux => aucune erreur affiché)`	296	`// Affiche les erreurs détectées par PDO (sinon mode silencieux => aucune erreur affiché)`
281	`$this->bdd->setAttribute(PDO::ATTR_ERRMODE, PDO::ERRMODE_EXCEPTION);`	297	`$this->bdd->setAttribute(PDO::ATTR_ERRMODE, PDO::ERRMODE_EXCEPTION);`
282	`} catch (PDOException $e) {`	298	`} catch (PDOException $e) {`
283	`//print_r($e);`	299	`//print_r($e);`
284	`echo 'La connexion à la base de données via PDO a échoué : ' . $e->getMessage() . PHP_EOL;`	300	`echo 'La connexion à la base de données via PDO a échoué : ' . $e->getMessage() . PHP_EOL;`
285	`exit;`	301	`exit;`
286	`}`	302	`}`
287	`}`	303	`}`
288		304
289	`protected function requete($requete) {`	305	`protected function requete($requete) {`
290	`$infos = null;`	306	`$infos = null;`
291	`try {`	307	`try {`
292	`$infos = $this->bdd->query($requete, PDO::FETCH_ASSOC);`	308	`$infos = $this->bdd->query($requete, PDO::FETCH_ASSOC);`
293	`/*if ($infos === false) {`	309	`/*if ($infos === false) {`
294	`echo $requete;`	310	`echo $requete;`
295	`}*/`	311	`}*/`
296	`} catch (PDOException $e) {`	312	`} catch (PDOException $e) {`
297	`echo sprintf($e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage(), $e->getCode(), $requete);`	313	`echo sprintf($e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage(), $e->getCode(), $requete);`
298	`}`	314	`}`
299	`return $infos;`	315	`return $infos;`
300	`}`	316	`}`
301		317
302	`/**`	318	`/**`
303	`* Demande confirmation, et sort du script à moins qu'on tape ce qui est`	319	`* Demande confirmation, et sort du script à moins qu'on tape ce qui est`
304	`* indiqué (par défaut "o" pour "oui")`	320	`* indiqué (par défaut "o" pour "oui")`
305	`*/`	321	`*/`
306	`protected function confirmer($question='Continuer ?', $codeAcceptation='o', $messageAnnulation='annulation') {`	322	`protected function confirmer($question='Continuer ?', $codeAcceptation='o', $messageAnnulation='annulation') {`
307	`echo $question . ' ("' . $codeAcceptation . '" pour confirmer, autre chose pour annuler)' . PHP_EOL;`	323	`echo $question . ' ("' . $codeAcceptation . '" pour confirmer, autre chose pour annuler)' . PHP_EOL;`
308	`$handle = fopen ("php://stdin","r");`	324	`$handle = fopen ("php://stdin","r");`
309	`$line = fgets($handle);`	325	`$line = fgets($handle);`
310	`if(strtolower(trim($line)) != strtolower($codeAcceptation)) {`	326	`if(strtolower(trim($line)) != strtolower($codeAcceptation)) {`
311	`echo $messageAnnulation . PHP_EOL;`	327	`echo $messageAnnulation . PHP_EOL;`
312	`exit;`	328	`return false;`
313	`}`	329	`}`
314	`fclose($handle);`	330	`fclose($handle);`
-		331	`return true;`
315	`}`	332	`}`
316	`}`	333	`}`
317	`?>`	334	`?>`

Subversion Repositories Applications.referentiel

(root)/trunk/scripts/modules/algolia/Algolia.php – Rev 380 → 382