Subversion Repositories Applications.referentiel

Rev

Rev 288 | Rev 326 | Go to most recent revision | Show entire file | Ignore whitespace | Details | Blame | Last modification | View Log | RSS feed

Rev 288 Rev 322
Line 187... Line 187...
187
			$this->messages[] = "Veuillez préciser le nom de code du projet comme second paramêtre (ex. : bdnff).";
187
			$this->messages[] = "Veuillez préciser le nom de code du projet comme second paramêtre (ex. : bdnff).";
188
		}
188
		}
189
		return $nom;
189
		return $nom;
190
	}
190
	}
Line -... Line 191...
-
 
191
	
-
 
192
	
-
 
193
	/* Méthode pour récupérer certains champs et noms pour l'export
-
 
194
	* Appelée avec les paramètres d'url suivant :
-
 
195
	* /Recherche/Export/_
-
 
196
	* ou les _ représentent dans l'ordre : référentiel, version, champs, filtre
-
 
197
	* Si un des paramètres est absent, il prendre la valeur *
-
 
198
	*/
-
 
199
	public function getElementExport($param) {
-
 
200
		$colonnesOrdonnees = array("nn" => array("a.num_nom", "Numéro nomenclatural"),
-
 
201
						"nr" => array("a.num_nom_retenu", "Numéro nomenclatural du nom retenu"),
-
 
202
						"nt" => array("a.num_taxonomique", "Numéro taxonomique"),
-
 
203
						"cd" => array("a.cd_ref", "Numéro INPN"),
-
 
204
						"rg" => array("a.rang", "Code rang"),
-
 
205
						"fam" => array("a.famille", "Famille (APG III)"),
-
 
206
						"nsc" => array("concat(a.nom_sci,' ',a.auteur)", "Nom avec auteur"),
-
 
207
						"bibc" => array("concat(a.annee,' ',a.biblio_origine)", "Année et bibliographie"),
-
 
208
						"nsrc" => array("concat(b.nom_sci,' ',b.auteur) as nom_sci_retenu_complet", "Nom retenu avec auteur"),
-
 
209
						"nf" => array("a.nom_francais", "Nom français normalisé"),
-
 
210
						"extax" => array("if (a.exclure_taxref = 1, 0, 1)", "Présent dans Taxref"),
-
 
211
						"lien" => array("concat('http://www.tela-botanica.org/bdtfx-nn-',a.num_nom)", "Permalien"),
-
 
212
						"ntsup" => array("a.num_tax_sup", "Numéro nomenclatural rang supérieur"),
-
 
213
						"pre" => array("a.presence", "Répartition géographique"),
-
 
214
						"ns" => array("a.nom_sci", "Nom sans auteur"),
-
 
215
						"aut" => array("a.auteur", "Auteur"),
-
 
216
						"ann" => array("a.annee", "Année publication"),
-
 
217
						"bib" => array("a.biblio_origine", "Bibliographie"),
-
 
218
						"ntype" => array("a.num_type", "Numéro du type"),
-
 
219
						"nbas" => array("a.num_basionyme", "Numéro du basionyme"),
-
 
220
						"genre" => array("a.genre", "Genre"),
-
 
221
						"esp" => array("a.epithete_sp", "Epithète espèce"),
-
 
222
						"eing" => array("a.epithete_infra_generique", "Epithète infragénérique"),
-
 
223
						"te" => array("a.type_epithete", "Type d'épithète infraspécifique"),
-
 
224
						"einsp" => array("a.epithete_infra_sp", "Epithète infraspécifique"),
-
 
225
						"hybp01" => array("a.hybride_parent_01", "Hybride parent 1"),
-
 
226
						"nomsupgen" => array("a.nom_supra_generique", "Nom supra générique"),
-
 
227
						"hybp02" => array("a.hybride_parent_02", "Hybride parent 2"),
-
 
228
						"stori" => array("a.statut_origine", "Statut d'origine"),
-
 
229
						"stint" => array("a.statut_introduction", "Statut d'introduction"),
-
 
230
						"stcult" => array("a.statut_culture", "Statut de culture"),
-
 
231
						"notes" => array("a.notes", "Remarques"),
-
 
232
						"nomadd" => array("a.nom_addendum", "Commentaires nomenclaturaux"),
-
 
233
						"nsr" => array("b.nom_sci as nom_sci_retenu", "Nom retenu sans auteur"),
-
 
234
						"hom" => array("a.homonyme", "Homonymie"),
-
 
235
						"synprop" => array("a.synonyme_proparte", "Synonyme proprate"),
-
 
236
						"syndout" => array("a.synonyme_douteux", "Synonyme douteux"),
-
 
237
						"synmapp" => array("a.synonyme_mal_applique", "Synonyme mal appliqué"),
-
 
238
						"synorth" => array("a.synonyme_orthographique", "Synonyme orthographique"),
-
 
239
						"orthori" => array("a.orthographe_originelle", "Orthographe originelle"),
-
 
240
						"hybp01n" => array("a.hybride_parent_01_notes", "Hybride parent 1 notes"),
-
 
241
						"hybp02n" => array("a.hybride_parent_02_notes", "Hybride parent 2 notes"),
-
 
242
						"cultgp" => array("a.cultivar_groupe", "Groupe de cultivar"),
-
 
243
						"cult" => array("a.cultivar", "Nom cultivar"),
-
 
244
						"nomcomm" => array("a.nom_commercial", "Nom commercial"),
-
 
245
						"autres" => array("a.*", "Autres"));
-
 
246
		// Initialisation des variables
-
 
247
		$info = array();
-
 
248
		$p = $this->traiterParametresUrl(array("ref","version","champs","filtre"), $param, false);
-
 
249
		$ref = $p['ref'].'_v'.$p['version'];
-
 
250
		$dossier = '/home/delphine/tmp/'.date('Y_m_d').'/';
-
 
251
		if(!is_dir($dossier)){
-
 
252
			mkdir($dossier);
-
 
253
		}
-
 
254
		$fichier = $dossier.$ref."_".time().'.csv'; // à mettre en config
-
 
255
		$colonnes = explode(",", $p['champs']);
-
 
256
		
-
 
257
		// recuperer colonne du ref pour vérifier que ces colonnes soient présentes + comptait nb colonnes pr autres
-
 
258
		foreach ($colonnes as $colonne) {
-
 
259
			$champs[] = $colonnesOrdonnees[$colonne][0];
-
 
260
			$nom_champs[] = $colonnesOrdonnees[$colonne][1];
-
 
261
		}
-
 
262
		$requete = 'SELECT "'.implode('","', $nom_champs).'" UNION (SELECT '.implode(', ',$champs).
-
 
263
			" INTO OUTFILE '".$fichier."' CHARACTER SET utf8 FIELDS TERMINATED BY '\t' OPTIONALLY ENCLOSED BY '' LINES TERMINATED BY '\n' ". 
-
 
264
		" FROM $ref a left join $ref b on b.num_nom=a.num_nom_retenu";
-
 
265
		
-
 
266
		if (isset($p['filtre']) && $p['filtre'] != "*") {
-
 
267
			$param_filtres = explode(",",$p["filtre"]);
-
 
268
			$dernier_filtre = array_pop($param_filtres);
-
 
269
			$filtres = array("nnr"=>"a.num_nom = a.num_nom_retenu", "pre" => "a.presence = 'P'");
-
 
270
			if (!isset($filtres[$dernier_filtre])) { // si il s'agit du filtre famille
-
 
271
				$filtres["fam"] = "a.famille = '".$dernier_filtre."'";
-
 
272
				$dernier_filtre = "fam";
-
 
273
			}
-
 
274
			array_push($param_filtres, $dernier_filtre);
-
 
275
			$requete .= " WHERE ".implode(" AND ",array_intersect_key($filtres, array_flip($param_filtres)));
-
 
276
		}
-
 
277
		$requete .= ")";
-
 
278
		// Récupération des résultats
-
 
279
		try {
-
 
280
			$donnees = $this->bdd->query($requete);
-
 
281
			if ($donnees === false) {
-
 
282
				$this->messages[] = "La requête a retourné aucun résultat : $requete";
-
 
283
			} else {
-
 
284
				$info = $donnees;
-
 
285
			}
-
 
286
		} catch (PDOException $e) {
-
 
287
			$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage()).$requete;
-
 
288
		}
-
 
289
	
-
 
290
		return $fichier;
-
 
291
	}
-
 
292
	
-
 
293
	/**
-
 
294
	* Méthode principale appelée avec une requête de type POST.
-
 
295
	*/
-
 
296
	public function updateElement($params_url, $params_post) {
-
 
297
		// Initialisation des variables
-
 
298
		$info = array();
-
 
299
		// Nour recherchons le type de requête demandé
-
 
300
		extract($this->traiterParametresUrl(array('action'), $params_url, true));
-
 
301
		extract($this->traiterParametresPost(array('referentiel'), $params_post, true));
-
 
302
		extract($this->traiterParametresPost(array('noms'), $params_post, false));
-
 
303
		$referentiel =trim($referentiel, "'");
-
 
304
		
-
 
305
		if (!is_null($referentiel)) {$action =trim($action, "'");
-
 
306
			if (!is_null($action)) {
-
 
307
				$methode = 'updateElement'.$action;
-
 
308
				if (method_exists($this, $methode)) {
-
 
309
					//array_shift($param);
-
 
310
					$info = $this->$methode($referentiel, $noms);
-
 
311
				} else {
-
 
312
					$this->messages[] = "Le type de mise à jour demandé '$action' n'est pas disponible.";
-
 
313
				}
-
 
314
			} else {
-
 
315
				$this->messages[] = "Veuillez préciser le type de mise à jour à faire.";
-
 
316
				// TODO : coder une mise à jour générique dans une méthode updateElementDefaut($id, $params_post);
-
 
317
			}
-
 
318
		} else {
-
 
319
			$this->messages[] = "Veuillez préciser l'id du traitement comme premier paramêtre dans l'url.";
-
 
320
		}
-
 
321
	
-
 
322
		// Envoie sur la sortie standard
-
 
323
		$this->envoyer($info);
-
 
324
	}
-
 
325
	
-
 
326
	private function getElementTablePrChpFamille($referentiel) {
-
 
327
		$infos = "";$referentiel = $referentiel[0];
-
 
328
		$requete = "SHOW COLUMNS FROM {$referentiel} LIKE 'famille' ";
-
 
329
		$resultat = $this->bdd->query($requete)->fetch(); 
-
 
330
		if ($resultat === false) {
-
 
331
			$requete = 	"ALTER TABLE {$referentiel} ".
-
 
332
						'ADD famille VARCHAR(50) '.
-
 
333
						'CHARACTER SET utf8 COLLATE utf8_general_ci NULL DEFAULT "" ';
-
 
334
			$this->bdd->exec($requete);
-
 
335
		}
-
 
336
		$requeteInfos = 'SELECT num_nom, num_nom_retenu, num_tax_sup, rang, nom_sci '.
-
 
337
								"FROM {$referentiel} ".
-
 
338
								"WHERE rang >= 180 ".
-
 
339
								"ORDER BY rang ASC, num_tax_sup ASC, num_nom_retenu DESC ";
-
 
340
		$infos = $this->bdd->query($requeteInfos)->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC);
-
 
341
		return $infos;
-
 
342
		
-
 
343
	}
-
 
344
	
-
 
345
	
-
 
346
	private function updateElementChpFamille($referentiel, $noms) {
-
 
347
		foreach ($noms as $id => $famille) {
-
 
348
			$requete = "UPDATE {$referentiel} SET famille = '$famille' WHERE num_nom = $id ";
-
 
349
			$resultat = $this->bdd->query($requete);
-
 
350
			if ($resultat === false) {
-
 
351
				$this->messages[] = "Erreur d'insertion pour le tuple $id";
-
 
352
			}
-
 
353
		}
-
 
354
	}
191
	
355
	
192
}
356
}
193
?>
357
?>