WebSVN – Applications.referentiel – Diff – /trunk/services/modules/Referentiel.php

 <?php
 /**
  * Service fournissant des données de la table contenant le référentiel de travail.
  * Encodage en entrée : utf8
  * Encodage en sortie : utf8
+ *
  * @category	Php 5.2
  * @package		Referentiel
  * @author		Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org>
  * @license		GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
  * @license		CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
  * @copyright	2010 Tela-Botanica
  * @version		$Id$
  */
 class Referentiel extends Ref {
 	/**
 	 * Méthode principale appelée avec une requête de type GET.
 	 */
 	public function getElement($params_url = array()) {
 		// Initialisation des variables
 		$info = array();
 		// Nour recherchons le type de requête demandé
 		$p = $this->traiterParametresUrl(array('type'), $params_url, false);
 		extract($p);
 		if (!is_null($type)) {
 			$methode = 'getElement'.$type;
 			if (method_exists($this, $methode)) {
 				array_shift($params_url);
 				$info = $this->$methode($params_url);
 			} else {
 				$this->messages[] = "Le type d'information demandé '$type' n'est pas disponible.";
+			}
 		} else {
 			$this->messages[] = "Veuillez préciser le type de requête.";
+		}
 		// Envoie sur la sortie standard
 		$this->envoyer($info);
+	}
 	/* Méthode pour récupérer les infos sur les référentiels disponibles
 	* Appelée avec les paramêtres d'url suivant :
 	* /RefReferentiel/tout/code_du_referentiel
 	*/
 	public function getElementDispo($params_url) {
 		$requete =	'SHOW TABLES ';
 		$donnees = false;
 		// Récupération des résultats
 		try {
 			$tables = $this->bdd->query($requete)->fetchAll(PDO::FETCH_COLUMN, 0);
 			if ($tables !== false) {
 				foreach ($tables as $table) {
 					if (preg_match('/^([a-z]+)_meta$/', $table, $match)) {
 						$donnees[] = $match[1];
+					}
+				}
 			} else {
 				$this->messages[] = "La requête a retourné aucun résultat.";
+			}
 		} catch (PDOException $e) {
 			$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage());
+		}
 		return $donnees;
+	}
 	/* Méthode pour récupérer les noms d'un référentiel.
 	* Appelée avec les paramêtres d'url suivant :
 	* /Referentiel/tout/code_du_referentiel?start=0&limit=1000
 	*/
 	public function getElementTout($params_url) {
 		$p = $this->traiterParametresUrl(array('projet'), $params_url, false);
 		extract($p);
 		$donnees = false;
 		if (!is_null($projet)) {
 			$requete =	($this->distinct ? 'SELECT DISTINCT' : 'SELECT').' * '.
 						"FROM $projet ".
 						'ORDER BY '.((!is_null($this->orderby)) ? $this->orderby  : 'num_nom ASC').' '.
 						"LIMIT $this->start, $this->limit ";
 			$this->debug[] = $requete;
 			// Récupération des résultats
 			try {
 				$donnees = $this->bdd->query($requete)->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC);
 				if ($donnees === false) {
 					$this->messages[] = "La requête a retourné aucun résultat.";
 				} else {
 					$donnees_tmp = $donnees;
 					$donnees = array();
 					foreach ($donnees_tmp as &$nom) {
 						$donnees[$nom['num_nom']] = $nom;
 						unset($nom);
+					}
+				}
 			} catch (PDOException $e) {
 				$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage());
+			}
 		} else {
 			$this->messages[] = "Veuillez préciser le nom de code du projet comme second paramêtre (ex. : bdnff).";
+		}
 		return $donnees;
+	}
 	/* Méthode pour récupérer le nombre de noms présents dans un référentiel.
 	* Appelée avec les paramêtres d'url suivant :
 	* /RefReferentiel/nombre/code_du_referentiel
 	*/
 	public function getElementNombre($params_url) {
 		$p = $this->traiterParametresUrl(array('projet'), $params_url, false);
 		extract($p);
 		$nbre = false;
 		if (!is_null($projet)) {
 			$requete =	'SELECT COUNT(*) AS nbre '.
 						"FROM $projet ";
 			// Récupération des résultats
 			try {
 				$nbre = $this->bdd->query($requete)->fetchColumn();
 				if ($nbre === false) {
 					$this->messages[] = "La requête a retourné aucun résultat.";
+				}
 			} catch (PDOException $e) {
 				$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage());
+			}
 		} else {
 			$this->messages[] = "Veuillez préciser le nom de code du projet comme second paramêtre (ex. : bdnff).";
+		}
 		return $nbre;
+	}
 	/* Méthode pour récupérer le titre d'un référentiel.
 	* Appelée avec les paramêtres d'url suivant :
 	* /RefReferentiel/nom/code_du_referentiel
 	*/
 	public function getElementNom($params_url) {
 		$p = $this->traiterParametresUrl(array('projet'), $params_url, false);
 		extract($p);
 		$nom = false;
 		if (!is_null($projet)) {
 			$requete =	"SELECT titre FROM {$projet}_meta WHERE id_meta = (SELECT MAX(id_meta) FROM {$projet}_meta);";
 			// Récupération des résultats
 			try {
 				$nom = $this->bdd->query($requete)->fetchColumn();
 				if ($nom === false) {
 					$this->messages[] = "La requête a retourné aucun résultat.";
+				}
 			} catch (PDOException $e) {
 				$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage());
+			}
 		} else {
 			$this->messages[] = "Veuillez préciser le nom de code du projet comme second paramêtre (ex. : bdnff).";
+		}
 		return $nom;
+	}
 	/* Méthode pour récupérer le titre d'un référentiel.
 	 * Appelée avec les paramêtres d'url suivant :
 	* /RefReferentiel/nom/code_du_referentiel
 	*/
 	public function getElementDateMiseAJour($params_url) {
 		$p = $this->traiterParametresUrl(array('projet'), $params_url, false);
 		extract($p);
 		$nom = false;
 		if (!is_null($projet)) {
 			$requete =	'SELECT UPDATE_TIME '.
 						'FROM   information_schema.tables '.
 						'WHERE  TABLE_SCHEMA = \'referentiels\' '.
    						'AND TABLE_NAME = \''.$projet.'\'';
 			// Récupération des résultats
 			try {
 				$nom = $this->bdd->query($requete)->fetchColumn();
 				if ($nom === false) {
 					$this->messages[] = "La requête a retourné aucun résultat.";
+				}
 			} catch (PDOException $e) {
 				$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage());
+			}
 		} else {
 			$this->messages[] = "Veuillez préciser le nom de code du projet comme second paramêtre (ex. : bdnff).";
+		}
 		return $nom;
+	}
+	/* Méthode pour récupérer certains champs et noms pour l'export
+	* Appelée avec les paramètres d'url suivant :
+	* /Recherche/Export/_
+	* ou les _ représentent dans l'ordre : référentiel, version, champs, filtre
+	* Si un des paramètres est absent, il prendre la valeur *
+	*/
+	public function getElementExport($param) {
+		$colonnesOrdonnees = array("nn" => array("a.num_nom", "Numéro nomenclatural"),
+						"nr" => array("a.num_nom_retenu", "Numéro nomenclatural du nom retenu"),
+						"nt" => array("a.num_taxonomique", "Numéro taxonomique"),
+						"cd" => array("a.cd_ref", "Numéro INPN"),
+						"rg" => array("a.rang", "Code rang"),
+						"fam" => array("a.famille", "Famille (APG III)"),
+						"nsc" => array("concat(a.nom_sci,' ',a.auteur)", "Nom avec auteur"),
+						"bibc" => array("concat(a.annee,' ',a.biblio_origine)", "Année et bibliographie"),
+						"nsrc" => array("concat(b.nom_sci,' ',b.auteur) as nom_sci_retenu_complet", "Nom retenu avec auteur"),
+						"nf" => array("a.nom_francais", "Nom français normalisé"),
+						"extax" => array("if (a.exclure_taxref = 1, 0, 1)", "Présent dans Taxref"),
+						"lien" => array("concat('http://www.tela-botanica.org/bdtfx-nn-',a.num_nom)", "Permalien"),
+						"ntsup" => array("a.num_tax_sup", "Numéro nomenclatural rang supérieur"),
+						"pre" => array("a.presence", "Répartition géographique"),
+						"ns" => array("a.nom_sci", "Nom sans auteur"),
+						"aut" => array("a.auteur", "Auteur"),
+						"ann" => array("a.annee", "Année publication"),
+						"bib" => array("a.biblio_origine", "Bibliographie"),
+						"ntype" => array("a.num_type", "Numéro du type"),
+						"nbas" => array("a.num_basionyme", "Numéro du basionyme"),
+						"genre" => array("a.genre", "Genre"),
+						"esp" => array("a.epithete_sp", "Epithète espèce"),
+						"eing" => array("a.epithete_infra_generique", "Epithète infragénérique"),
+						"te" => array("a.type_epithete", "Type d'épithète infraspécifique"),
+						"einsp" => array("a.epithete_infra_sp", "Epithète infraspécifique"),
+						"hybp01" => array("a.hybride_parent_01", "Hybride parent 1"),
+						"nomsupgen" => array("a.nom_supra_generique", "Nom supra générique"),
+						"hybp02" => array("a.hybride_parent_02", "Hybride parent 2"),
+						"stori" => array("a.statut_origine", "Statut d'origine"),
+						"stint" => array("a.statut_introduction", "Statut d'introduction"),
+						"stcult" => array("a.statut_culture", "Statut de culture"),
+						"notes" => array("a.notes", "Remarques"),
+						"nomadd" => array("a.nom_addendum", "Commentaires nomenclaturaux"),
+						"nsr" => array("b.nom_sci as nom_sci_retenu", "Nom retenu sans auteur"),
+						"hom" => array("a.homonyme", "Homonymie"),
+						"synprop" => array("a.synonyme_proparte", "Synonyme proprate"),
+						"syndout" => array("a.synonyme_douteux", "Synonyme douteux"),
+						"synmapp" => array("a.synonyme_mal_applique", "Synonyme mal appliqué"),
+						"synorth" => array("a.synonyme_orthographique", "Synonyme orthographique"),
+						"orthori" => array("a.orthographe_originelle", "Orthographe originelle"),
+						"hybp01n" => array("a.hybride_parent_01_notes", "Hybride parent 1 notes"),
+						"hybp02n" => array("a.hybride_parent_02_notes", "Hybride parent 2 notes"),
+						"cultgp" => array("a.cultivar_groupe", "Groupe de cultivar"),
+						"cult" => array("a.cultivar", "Nom cultivar"),
+						"nomcomm" => array("a.nom_commercial", "Nom commercial"),
+						"autres" => array("a.*", "Autres"));
+		// Initialisation des variables
+		$info = array();
+		$p = $this->traiterParametresUrl(array("ref","version","champs","filtre"), $param, false);
+		$ref = $p['ref'].'_v'.$p['version'];
+		$dossier = '/home/delphine/tmp/'.date('Y_m_d').'/';
+		if(!is_dir($dossier)){
+			mkdir($dossier);
+		}
+		$fichier = $dossier.$ref."_".time().'.csv'; // à mettre en config
+		$colonnes = explode(",", $p['champs']);
+		// recuperer colonne du ref pour vérifier que ces colonnes soient présentes + comptait nb colonnes pr autres
+		foreach ($colonnes as $colonne) {
+			$champs[] = $colonnesOrdonnees[$colonne][0];
+			$nom_champs[] = $colonnesOrdonnees[$colonne][1];
+		}
+		$requete = 'SELECT "'.implode('","', $nom_champs).'" UNION (SELECT '.implode(', ',$champs).
+			" INTO OUTFILE '".$fichier."' CHARACTER SET utf8 FIELDS TERMINATED BY '\t' OPTIONALLY ENCLOSED BY '' LINES TERMINATED BY '\n' ".
+		" FROM $ref a left join $ref b on b.num_nom=a.num_nom_retenu";
+		if (isset($p['filtre']) && $p['filtre'] != "*") {
+			$param_filtres = explode(",",$p["filtre"]);
+			$dernier_filtre = array_pop($param_filtres);
+			$filtres = array("nnr"=>"a.num_nom = a.num_nom_retenu", "pre" => "a.presence = 'P'");
+			if (!isset($filtres[$dernier_filtre])) { // si il s'agit du filtre famille
+				$filtres["fam"] = "a.famille = '".$dernier_filtre."'";
+				$dernier_filtre = "fam";
+			}
+			array_push($param_filtres, $dernier_filtre);
+			$requete .= " WHERE ".implode(" AND ",array_intersect_key($filtres, array_flip($param_filtres)));
+		}
+		$requete .= ")";
+		// Récupération des résultats
+		try {
+			$donnees = $this->bdd->query($requete);
+			if ($donnees === false) {
+				$this->messages[] = "La requête a retourné aucun résultat : $requete";
+			} else {
+				$info = $donnees;
+			}
+		} catch (PDOException $e) {
+			$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage()).$requete;
+		}
+		return $fichier;
+	}
+	/**
+	* Méthode principale appelée avec une requête de type POST.
+	*/
+	public function updateElement($params_url, $params_post) {
+		// Initialisation des variables
+		$info = array();
+		// Nour recherchons le type de requête demandé
+		extract($this->traiterParametresUrl(array('action'), $params_url, true));
+		extract($this->traiterParametresPost(array('referentiel'), $params_post, true));
+		extract($this->traiterParametresPost(array('noms'), $params_post, false));
+		$referentiel =trim($referentiel, "'");
+		if (!is_null($referentiel)) {$action =trim($action, "'");
+			if (!is_null($action)) {
+				$methode = 'updateElement'.$action;
+				if (method_exists($this, $methode)) {
+					//array_shift($param);
+					$info = $this->$methode($referentiel, $noms);
+				} else {
+					$this->messages[] = "Le type de mise à jour demandé '$action' n'est pas disponible.";
+				}
+			} else {
+				$this->messages[] = "Veuillez préciser le type de mise à jour à faire.";
+				// TODO : coder une mise à jour générique dans une méthode updateElementDefaut($id, $params_post);
+			}
+		} else {
+			$this->messages[] = "Veuillez préciser l'id du traitement comme premier paramêtre dans l'url.";
+		}
+		// Envoie sur la sortie standard
+		$this->envoyer($info);
+	}
+	private function getElementTablePrChpFamille($referentiel) {
+		$infos = "";$referentiel = $referentiel[0];
+		$requete = "SHOW COLUMNS FROM {$referentiel} LIKE 'famille' ";
+		$resultat = $this->bdd->query($requete)->fetch();
+		if ($resultat === false) {
+			$requete = 	"ALTER TABLE {$referentiel} ".
+						'ADD famille VARCHAR(50) '.
+						'CHARACTER SET utf8 COLLATE utf8_general_ci NULL DEFAULT "" ';
+			$this->bdd->exec($requete);
+		}
+		$requeteInfos = 'SELECT num_nom, num_nom_retenu, num_tax_sup, rang, nom_sci '.
+								"FROM {$referentiel} ".
+								"WHERE rang >= 180 ".
+								"ORDER BY rang ASC, num_tax_sup ASC, num_nom_retenu DESC ";
+		$infos = $this->bdd->query($requeteInfos)->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC);
+		return $infos;
+	}
+	private function updateElementChpFamille($referentiel, $noms) {
+		foreach ($noms as $id => $famille) {
+			$requete = "UPDATE {$referentiel} SET famille = '$famille' WHERE num_nom = $id ";
+			$resultat = $this->bdd->query($requete);
+			if ($resultat === false) {
+				$this->messages[] = "Erreur d'insertion pour le tuple $id";
+			}
+		}
+	}
+}
 ?>

Subversion Repositories Applications.referentiel

(root)/trunk/services/modules/Referentiel.php – Rev 288 → 322