WebSVN – eFlore/Projets.eflore-projets – Diff – /branches/acheb/scripts/modules/cel/cel_references.sql


/*
TODO:
* fix référentiel: suppression n° de version et uniformisation
SELECT DISTINCT nom_referentiel, COUNT(id_observation) AS count FROM `BASEEDIT`.`cel_obs` GROUP BY nom_referentiel ORDER BY count DESC;
* ajout INDEX nom_referentiel(5) sur `BASEEDIT`.`cel_obs`
* ajout INDEX catminat_code sur baseflor_v2012_12_31
* ajout INDEX num_taxon sur nva_v2013_06
* fix date: set NULL pour les dates dans le futur
SELECT courriel_utilisateur, id_observation, date_observation FROM `BASEEDIT`.`cel_obs` WHERE date_observation > NOW();
* intégrer les noms non-associés à un taxon (bdtfx where num_taxonomique = '')
* intégrer les noms non-associés à un taxon (bdtxa where num_tax = '' || num_tax IS NULL)
 
CREATE INDEX i_nom_referentiel ON `BASEEDIT`.`cel_obs` (`nom_referentiel`(5));
CREATE INDEX i_catminat_code ON baseflor_v2012_12_31 (`catminat_code`);
CREATE INDEX i_num_taxon ON nva_v2013_06 (`num_taxon`);
*/
 
-- malheureusement ceci est impossible en SQL d'où l'utilisation du shell-script
-- SET @destdb = 'tb_cel';
-- SET @desttable = 'cel_references';
-- -- SET BASEEDIT = `tb_cel`;
-- SET @dst = CONCAT('`',@destdb,'`','.`',@desttable,'`');
 
DROP TABLE IF EXISTS `BASEEDIT`.`cel_references`;
CREATE TABLE IF NOT EXISTS `BASEEDIT`.`cel_references` (
       `referentiel` CHAR(5) NOT NULL COMMENT 'eg: "bdtfx", "bdtfx", "bdtxa", ... No ENUM!',
 
       -- bdtfx
       `num_nom` INT(9) NOT NULL DEFAULT '0' COMMENT 'depuis bdtfx',
       `num_nom_retenu` VARCHAR(9) DEFAULT NULL COMMENT 'depuis bdtfx',
 
       -- bdtfx + nvjfl_v2007 + nva_v2013_06
       `num_taxon` int(9) NOT NULL COMMENT "depuis bdtfx, nvjfl_v2007 et nva_v2013_06 (commun), les noms non-associés ne sont pas intégrés pour l'instant", -- 'relax emacs
 
       -- bdtfx
       `nom_sci` VARCHAR(500) NOT NULL COMMENT 'depuis bdtfx',
       `auteur` VARCHAR(100) DEFAULT NULL COMMENT 'depuis bdtfx',
 
 
       -- `BASEEDIT`.`cel_obs`
       --       `nom_ret_nn` DECIMAL(9,0) DEFAULT NULL COMMENT 'Numéro du nom retenu.',
       --       `nom_ret` VARCHAR(255) DEFAULT NULL,
 
       -- nvjfl_v2007 (`nom_vernaculaire` text NOT NULL)
       -- mais NULL à cause de nva
       `nom_commun` VARCHAR(60) NULL COMMENT 'nom_vernaculaire pour nvjfl_v2007 et nva_v2013_06',
 
       -- baseflor_v2012_12_31
       `catminat_code` varchar(18) DEFAULT 'inconnu' COMMENT 'depuis baseflor_v2012_12_31',
       `ve_lumiere` int(1) DEFAULT NULL COMMENT 'depuis baseflor_v2012_12_31',
       `ve_temperature` int(1) DEFAULT NULL COMMENT 'depuis baseflor_v2012_12_31',
       `ve_continentalite` int(1) DEFAULT NULL COMMENT 'depuis baseflor_v2012_12_31',
       `ve_humidite_atmos` int(1) DEFAULT NULL COMMENT 'depuis baseflor_v2012_12_31',
       `ve_humidite_edaph` int(2) DEFAULT NULL COMMENT 'depuis baseflor_v2012_12_31',
       `ve_reaction_sol` int(1) DEFAULT NULL COMMENT 'depuis baseflor_v2012_12_31',
       `ve_nutriments_sol` int(1) DEFAULT NULL COMMENT 'depuis baseflor_v2012_12_31',
       `ve_salinite` int(1) DEFAULT NULL COMMENT 'depuis baseflor_v2012_12_31',
       `ve_texture_sol` int(1) DEFAULT NULL COMMENT 'depuis baseflor_v2012_12_31',
       `ve_mat_org_sol` int(1) DEFAULT NULL COMMENT 'depuis baseflor_v2012_12_31',
 
       -- baseveg_v2013_01_09
       `syntaxon` varchar(255) NULL COMMENT 'depuis baseveg_v2013_01_09',
PRIMARY KEY (`referentiel`, `num_nom`),
INDEX (`referentiel`(5)),
INDEX (`num_nom`),
INDEX (`num_taxon`)
) ENGINE=MyISAM \
  DEFAULT CHARSET=utf8 \
  COMMENT 'table générée par eflore/projets/scripts/modules/cel/cel_references.sql à partir de `TABLEBDTFX`, `TABLEBDTXA` et `TABLEISFAN`';
 
-- tables temporaires
DROP TEMPORARY TABLE IF EXISTS `T_nvjfl_v2007`, `T_nva_v2013_06`, `T_basevegflor`;
 
-- pour nvjfl_v2007, le nom recommandé ou typique est celui pour lequel num_statut = 1 (mais plusieurs sont possibles, d'où le GROUP BY num_taxon)
CREATE TEMPORARY TABLE T_nvjfl_v2007 ( INDEX(`num_taxon`) ) AS \
       -- ( SELECT n.num_taxon, n.nom_vernaculaire FROM `BASESOURCE`.`nvjfl_v2007` n WHERE n.code_langue = 'fra' GROUP BY n.num_taxon, n.num_statut HAVING n.num_statut = MAX(n.num_statut) );
       -- ( SELECT n.num_taxon, n.nom_vernaculaire, n.num_statut as void, MAX(n.num_statut) as void2 FROM `BASESOURCE`.`nvjfl_v2007` n WHERE n.code_langue = 'fra' GROUP BY n.num_taxon HAVING n.num_statut = MAX(n.num_statut) );
       ( SELECT n.num_taxon, n.nom_vernaculaire FROM `BASESOURCE`.`nvjfl_v2007` n WHERE n.code_langue = 'fra' AND n.num_statut = 1 GROUP BY n.num_taxon );
 
-- table temporaire uniquement parce qu'il manque un index-key, autrement le LEFT JOIN ci-dessous est bien trop long
CREATE TEMPORARY TABLE T_nva_v2013_06 ( INDEX(`num_taxon`) ) AS \
       -- ( SELECT n.num_taxon, n.nom_vernaculaire FROM `BASESOURCE`.`nva_v2013_06` n WHERE n.code_langue = 'fra' /* DB pb */ AND n.num_taxon IS NOT NULL /* /DB pb */ GROUP BY n.num_nom); -- aggrégat arbitraire car pas de num_statut
       -- pour nva_index, le nom recommandé ou typique est celui pour lequel num_statut = 0 (mais il n'y en a aucun à l'heure actuelle) (mais plusieurs sont possibles, d'où le GROUP BY num_nom)
       ( SELECT n.num_taxon, n.nom_vernaculaire FROM `BASESOURCE`.`nva_index_v2_03` n WHERE n.code_langue = 'fra' /* AND n.num_statut = 0 */ GROUP BY n.num_taxon);
 
 
-- JOIN ON num_taxon_originel car INDEX
-- cf: eflore/projets/donnees/baseflor/2012-12-31/baseflor.sql
CREATE TEMPORARY TABLE T_basevegflor ( INDEX(`num_nomen`), INDEX(`num_taxon`) ) AS \
SELECT f.num_nomen, f.num_taxon, f.catminat_code, f.ve_lumiere, f.ve_temperature, f.ve_continentalite, f.ve_humidite_atmos, f.ve_humidite_edaph, f.ve_reaction_sol, f.ve_nutriments_sol, f.ve_salinite, f.ve_texture_sol, f.ve_mat_org_sol, \
v.syntaxon \
FROM `BASESOURCE`.`baseflor_v2012_12_31` f LEFT JOIN `BASESOURCE`.`baseveg_v2013_01_09` v ON (f.catminat_code = v.code_catminat AND v.niveau = 'ALL' AND v.syntaxon IS NOT NULL) WHERE f.BDNT = "BDTFX" \
GROUP BY f.num_nomen, f.num_taxon; -- group by car plusieurs couple (f.num_nomen, f.num_taxon) peuvent exister dans baseveg_v2013_01_09 or num_nom est PRIMARY dans cel_references
 
 
-- INSERTIONS
-- pour le futur: attention au numéro taxonomique à 0 (WHERE b.num_taxonomique != '')
INSERT INTO `BASEEDIT`.`cel_references` (`referentiel`, `num_nom`, `num_nom_retenu`, `num_taxon`, `nom_sci`, `auteur`, `nom_commun`, \
      `catminat_code`, `ve_lumiere`, `ve_temperature`, `ve_continentalite`, `ve_humidite_atmos`, `ve_humidite_edaph`, \
      `ve_reaction_sol`, `ve_nutriments_sol`, `ve_salinite`, `ve_texture_sol`, `ve_mat_org_sol`, `syntaxon`) \
 
       SELECT "bdtfx", b.num_nom, b.num_nom_retenu, b.num_taxonomique, b.nom_sci, b.auteur, n.nom_vernaculaire, \
     bf.catminat_code, bf.ve_lumiere, bf.ve_temperature, bf.ve_continentalite, bf.ve_humidite_atmos, bf.ve_humidite_edaph, \
     bf.ve_reaction_sol, bf.ve_nutriments_sol, bf.ve_salinite, bf.ve_texture_sol, bf.ve_mat_org_sol, bf.syntaxon
  FROM `BASESOURCE`.`TABLEBDTFX` b LEFT JOIN T_nvjfl_v2007 n ON (b.num_taxonomique = n.num_taxon ) \
  LEFT JOIN T_basevegflor bf ON (b.num_taxonomique = bf.num_taxon AND b.num_nom = bf.num_nomen);
 
 
-- pour le futur: attention au numéro taxonomique à 0 (WHERE b.num_tax IS NOT NULL AND b.num_tax != '')
INSERT INTO `BASEEDIT`.`cel_references` (`referentiel`, `num_nom`, `num_nom_retenu`, `num_taxon`, `nom_sci`, `auteur`, `nom_commun`) \
       SELECT "bdtxa", b.num_nom, b.num_nom_retenu, b.num_tax, b.nom_sci, b.auteur, n.nom_vernaculaire FROM `BASESOURCE`.`TABLEBDTXA` b LEFT JOIN T_nva_v2013_06 n ON (b.num_tax = n.num_taxon);
 
 
INSERT INTO `BASEEDIT`.`cel_references` (`referentiel`, `num_nom`, `num_nom_retenu`, `num_taxon`, `nom_sci`, `auteur`) \
       SELECT "isfan", b.num_nom, b.num_nom_retenu, b.num_taxonomique, b.nom_sci, b.auteur FROM `BASESOURCE`.`TABLEISFAN` b;
 
 
 
 
DROP TEMPORARY TABLE IF EXISTS `T_nvjfl_v2007`, `T_nva_v2013_06`, `T_basevegflor`;
 
SELECT SUM(theorie.a) AS théorie, pratique.a AS total FROM \
	(SELECT COUNT(1) AS a FROM `BASESOURCE`.`TABLEBDTFX` UNION ALL \
	 SELECT COUNT(1) AS a FROM `BASESOURCE`.`TABLEBDTXA` UNION ALL \
	 SELECT COUNT(1) AS a FROM `BASESOURCE`.`TABLEISFAN` \
	) AS theorie, \
	(SELECT COUNT(1) AS a FROM tb_cel.cel_references) AS pratique;
-- bdtfx+bdtxa+isfan: 141181 (2013/07/23)

Subversion Repositories eFlore/Projets.eflore-projets

(root)/branches/acheb/scripts/modules/cel/cel_references.sql – Rev 880 → 890

Rev 880		Rev 890
1	`/*`	1	`/*`
2	`TODO:`	2	`TODO:`
3	`* fix référentiel: suppression n° de version et uniformisation`	3	`* fix référentiel: suppression n° de version et uniformisation`
4	SELECT DISTINCT nom_referentiel, COUNT(id_observation) AS count FROM `BASEEDIT`.`cel_obs` GROUP BY nom_referentiel ORDER BY count DESC;	4	SELECT DISTINCT nom_referentiel, COUNT(id_observation) AS count FROM `BASEEDIT`.`cel_obs` GROUP BY nom_referentiel ORDER BY count DESC;
5	* ajout INDEX nom_referentiel(5) sur `BASEEDIT`.`cel_obs`	5	* ajout INDEX nom_referentiel(5) sur `BASEEDIT`.`cel_obs`
6	`* ajout INDEX catminat_code sur baseflor_v2012_12_31`	6	`* ajout INDEX catminat_code sur baseflor_v2012_12_31`
7	`* ajout INDEX num_taxon sur nva_v2013_06`	7	`* ajout INDEX num_taxon sur nva_v2013_06`
8	`* fix date: set NULL pour les dates dans le futur`	8	`* fix date: set NULL pour les dates dans le futur`
9	SELECT courriel_utilisateur, id_observation, date_observation FROM `BASEEDIT`.`cel_obs` WHERE date_observation > NOW();	9	SELECT courriel_utilisateur, id_observation, date_observation FROM `BASEEDIT`.`cel_obs` WHERE date_observation > NOW();
10	`* intégrer les noms non-associés à un taxon (bdtfx where num_taxonomique = '')`	10	`* intégrer les noms non-associés à un taxon (bdtfx where num_taxonomique = '')`
11	`* intégrer les noms non-associés à un taxon (bdtxa where num_tax = '' \|\| num_tax IS NULL)`	11	`* intégrer les noms non-associés à un taxon (bdtxa where num_tax = '' \|\| num_tax IS NULL)`
12		12
13	CREATE INDEX i_nom_referentiel ON `BASEEDIT`.`cel_obs` (`nom_referentiel`(5));	13	CREATE INDEX i_nom_referentiel ON `BASEEDIT`.`cel_obs` (`nom_referentiel`(5));
14	CREATE INDEX i_catminat_code ON baseflor_v2012_12_31 (`catminat_code`);	14	CREATE INDEX i_catminat_code ON baseflor_v2012_12_31 (`catminat_code`);
15	CREATE INDEX i_num_taxon ON nva_v2013_06 (`num_taxon`);	15	CREATE INDEX i_num_taxon ON nva_v2013_06 (`num_taxon`);
16	`*/`	16	`*/`
17		17
18	`-- malheureusement ceci est impossible en SQL d'où l'utilisation du shell-script`	18	`-- malheureusement ceci est impossible en SQL d'où l'utilisation du shell-script`
19	`-- SET @destdb = 'tb_cel';`	19	`-- SET @destdb = 'tb_cel';`
20	`-- SET @desttable = 'cel_references';`	20	`-- SET @desttable = 'cel_references';`
21	-- -- SET BASEEDIT = `tb_cel`;	21	-- -- SET BASEEDIT = `tb_cel`;
22	-- SET @dst = CONCAT('`',@destdb,'`','.`',@desttable,'`');	22	-- SET @dst = CONCAT('`',@destdb,'`','.`',@desttable,'`');
23		23
24	DROP TABLE IF EXISTS `BASEEDIT`.`cel_references`;	24	DROP TABLE IF EXISTS `BASEEDIT`.`cel_references`;
25	CREATE TABLE IF NOT EXISTS `BASEEDIT`.`cel_references` (	25	CREATE TABLE IF NOT EXISTS `BASEEDIT`.`cel_references` (
26	`referentiel` CHAR(5) NOT NULL COMMENT 'eg: "bdtfx", "bdtfx", "bdtxa", ... No ENUM!',	26	`referentiel` CHAR(5) NOT NULL COMMENT 'eg: "bdtfx", "bdtfx", "bdtxa", ... No ENUM!',
27		27
28	`-- bdtfx`	28	`-- bdtfx`
29	`num_nom` INT(9) NOT NULL DEFAULT '0' COMMENT 'depuis bdtfx',	29	`num_nom` INT(9) NOT NULL DEFAULT '0' COMMENT 'depuis bdtfx',
30	`num_nom_retenu` VARCHAR(9) DEFAULT NULL COMMENT 'depuis bdtfx',	30	`num_nom_retenu` VARCHAR(9) DEFAULT NULL COMMENT 'depuis bdtfx',
31		31
32	`-- bdtfx + nvjfl_v2007 + nva_v2013_06`	32	`-- bdtfx + nvjfl_v2007 + nva_v2013_06`
33	`num_taxon` int(9) NOT NULL COMMENT "depuis bdtfx, nvjfl_v2007 et nva_v2013_06 (commun), les noms non-associés ne sont pas intégrés pour l\'instant",	33	`num_taxon` int(9) NOT NULL COMMENT "depuis bdtfx, nvjfl_v2007 et nva_v2013_06 (commun), les noms non-associés ne sont pas intégrés pour l'instant", -- 'relax emacs
34		34
35	`-- bdtfx`	35	`-- bdtfx`
36	`nom_sci` VARCHAR(500) NOT NULL COMMENT 'depuis bdtfx',	36	`nom_sci` VARCHAR(500) NOT NULL COMMENT 'depuis bdtfx',
37	`auteur` VARCHAR(100) DEFAULT NULL COMMENT 'depuis bdtfx',	37	`auteur` VARCHAR(100) DEFAULT NULL COMMENT 'depuis bdtfx',
38		38
39		39
40	-- `BASEEDIT`.`cel_obs`	40	-- `BASEEDIT`.`cel_obs`
41	-- `nom_ret_nn` DECIMAL(9,0) DEFAULT NULL COMMENT 'Numéro du nom retenu.',	41	-- `nom_ret_nn` DECIMAL(9,0) DEFAULT NULL COMMENT 'Numéro du nom retenu.',
42	-- `nom_ret` VARCHAR(255) DEFAULT NULL,	42	-- `nom_ret` VARCHAR(255) DEFAULT NULL,
43		43
44	-- nvjfl_v2007 (`nom_vernaculaire` text NOT NULL)	44	-- nvjfl_v2007 (`nom_vernaculaire` text NOT NULL)
45	`-- mais NULL à cause de nva`	45	`-- mais NULL à cause de nva`
46	`nom_commun` VARCHAR(60) NULL COMMENT 'nom_vernaculaire pour nvjfl_v2007 et nva_v2013_06',	46	`nom_commun` VARCHAR(60) NULL COMMENT 'nom_vernaculaire pour nvjfl_v2007 et nva_v2013_06',
47		47
48	`-- baseflor_v2012_12_31`	48	`-- baseflor_v2012_12_31`
49	`catminat_code` varchar(18) DEFAULT 'inconnu' COMMENT 'depuis baseflor_v2012_12_31',	49	`catminat_code` varchar(18) DEFAULT 'inconnu' COMMENT 'depuis baseflor_v2012_12_31',
50	`ve_lumiere` int(1) DEFAULT NULL COMMENT 'depuis baseflor_v2012_12_31',	50	`ve_lumiere` int(1) DEFAULT NULL COMMENT 'depuis baseflor_v2012_12_31',
51	`ve_temperature` int(1) DEFAULT NULL COMMENT 'depuis baseflor_v2012_12_31',	51	`ve_temperature` int(1) DEFAULT NULL COMMENT 'depuis baseflor_v2012_12_31',
52	`ve_continentalite` int(1) DEFAULT NULL COMMENT 'depuis baseflor_v2012_12_31',	52	`ve_continentalite` int(1) DEFAULT NULL COMMENT 'depuis baseflor_v2012_12_31',
53	`ve_humidite_atmos` int(1) DEFAULT NULL COMMENT 'depuis baseflor_v2012_12_31',	53	`ve_humidite_atmos` int(1) DEFAULT NULL COMMENT 'depuis baseflor_v2012_12_31',
54	`ve_humidite_edaph` int(2) DEFAULT NULL COMMENT 'depuis baseflor_v2012_12_31',	54	`ve_humidite_edaph` int(2) DEFAULT NULL COMMENT 'depuis baseflor_v2012_12_31',
55	`ve_reaction_sol` int(1) DEFAULT NULL COMMENT 'depuis baseflor_v2012_12_31',	55	`ve_reaction_sol` int(1) DEFAULT NULL COMMENT 'depuis baseflor_v2012_12_31',
56	`ve_nutriments_sol` int(1) DEFAULT NULL COMMENT 'depuis baseflor_v2012_12_31',	56	`ve_nutriments_sol` int(1) DEFAULT NULL COMMENT 'depuis baseflor_v2012_12_31',
57	`ve_salinite` int(1) DEFAULT NULL COMMENT 'depuis baseflor_v2012_12_31',	57	`ve_salinite` int(1) DEFAULT NULL COMMENT 'depuis baseflor_v2012_12_31',
58	`ve_texture_sol` int(1) DEFAULT NULL COMMENT 'depuis baseflor_v2012_12_31',	58	`ve_texture_sol` int(1) DEFAULT NULL COMMENT 'depuis baseflor_v2012_12_31',
59	`ve_mat_org_sol` int(1) DEFAULT NULL COMMENT 'depuis baseflor_v2012_12_31',	59	`ve_mat_org_sol` int(1) DEFAULT NULL COMMENT 'depuis baseflor_v2012_12_31',
60		60
61	`-- baseveg_v2013_01_09`	61	`-- baseveg_v2013_01_09`
62	`syntaxon` varchar(255) NULL COMMENT 'depuis baseveg_v2013_01_09',	62	`syntaxon` varchar(255) NULL COMMENT 'depuis baseveg_v2013_01_09',
63	PRIMARY KEY (`referentiel`, `num_nom`),	63	PRIMARY KEY (`referentiel`, `num_nom`),
64	INDEX (`referentiel`(5)),	64	INDEX (`referentiel`(5)),
65	INDEX (`num_nom`),	65	INDEX (`num_nom`),
66	INDEX (`num_taxon`)	66	INDEX (`num_taxon`)
67	`) ENGINE=MyISAM \`	67	`) ENGINE=MyISAM \`
68	`DEFAULT CHARSET=utf8 \`	68	`DEFAULT CHARSET=utf8 \`
69	`COMMENT 'table générée par eflore/projets/scripts/modules/cel/cel_references.sql à partir de TABLEBDTFX, TABLEBDTXA et nvjfl_v2007';`	69	COMMENT 'table générée par eflore/projets/scripts/modules/cel/cel_references.sql à partir de `TABLEBDTFX`, `TABLEBDTXA` et `TABLEISFAN`';
70		70
71	`-- tables temporaires`	71	`-- tables temporaires`
72	DROP TEMPORARY TABLE IF EXISTS `T_nvjfl_v2007`, `T_nva_v2013_06`, `T_basevegflor`;	72	DROP TEMPORARY TABLE IF EXISTS `T_nvjfl_v2007`, `T_nva_v2013_06`, `T_basevegflor`;
-		73
73		74	`-- pour nvjfl_v2007, le nom recommandé ou typique est celui pour lequel num_statut = 1 (mais plusieurs sont possibles, d'où le GROUP BY num_taxon)`
74	CREATE TEMPORARY TABLE T_nvjfl_v2007 ( INDEX(`num_taxon`) ) AS \	75	CREATE TEMPORARY TABLE T_nvjfl_v2007 ( INDEX(`num_taxon`) ) AS \
75	-- ( SELECT n.num_taxon, n.nom_vernaculaire FROM `BASESOURCE`.`nvjfl_v2007` n WHERE n.code_langue = 'fra' GROUP BY n.num_taxon, n.num_statut HAVING n.num_statut = MAX(n.num_statut) );	76	-- ( SELECT n.num_taxon, n.nom_vernaculaire FROM `BASESOURCE`.`nvjfl_v2007` n WHERE n.code_langue = 'fra' GROUP BY n.num_taxon, n.num_statut HAVING n.num_statut = MAX(n.num_statut) );
-		77	-- ( SELECT n.num_taxon, n.nom_vernaculaire, n.num_statut as void, MAX(n.num_statut) as void2 FROM `BASESOURCE`.`nvjfl_v2007` n WHERE n.code_langue = 'fra' GROUP BY n.num_taxon HAVING n.num_statut = MAX(n.num_statut) );
76	( SELECT n.num_taxon, n.nom_vernaculaire, n.num_statut as void, MAX(n.num_statut) as void2 FROM `BASESOURCE`.`nvjfl_v2007` n WHERE n.code_langue = 'fra' GROUP BY n.num_taxon HAVING n.num_statut = MAX(n.num_statut) );	78	( SELECT n.num_taxon, n.nom_vernaculaire FROM `BASESOURCE`.`nvjfl_v2007` n WHERE n.code_langue = 'fra' AND n.num_statut = 1 GROUP BY n.num_taxon );
77		79
78	`-- table temporaire uniquement parce qu'il manque un index-key, autrement le LEFT JOIN ci-dessous est bien trop long`	80	`-- table temporaire uniquement parce qu'il manque un index-key, autrement le LEFT JOIN ci-dessous est bien trop long`
79	CREATE TEMPORARY TABLE T_nva_v2013_06 ( INDEX(`num_taxon`) ) AS \	81	CREATE TEMPORARY TABLE T_nva_v2013_06 ( INDEX(`num_taxon`) ) AS \
80	( SELECT n.num_taxon, n.nom_vernaculaire FROM `BASESOURCE`.`nva_v2013_06` n WHERE n.code_langue = 'fra' /* DB pb / AND n.num_taxon IS NOT NULL / /DB pb */ GROUP BY n.num_nom); -- aggrégat arbitraire car pas de num_statut	82	-- ( SELECT n.num_taxon, n.nom_vernaculaire FROM `BASESOURCE`.`nva_v2013_06` n WHERE n.code_langue = 'fra' /* DB pb / AND n.num_taxon IS NOT NULL / /DB pb */ GROUP BY n.num_nom); -- aggrégat arbitraire car pas de num_statut
-		83	`-- pour nva_index, le nom recommandé ou typique est celui pour lequel num_statut = 0 (mais il n'y en a aucun à l'heure actuelle) (mais plusieurs sont possibles, d'où le GROUP BY num_nom)`
-		84	( SELECT n.num_taxon, n.nom_vernaculaire FROM `BASESOURCE`.`nva_index_v2_03` n WHERE n.code_langue = 'fra' /* AND n.num_statut = 0 */ GROUP BY n.num_taxon);
81		85
82		86
83	`-- JOIN ON num_taxon_originel car INDEX`	87	`-- JOIN ON num_taxon_originel car INDEX`
84	`-- cf: eflore/projets/donnees/baseflor/2012-12-31/baseflor.sql`	88	`-- cf: eflore/projets/donnees/baseflor/2012-12-31/baseflor.sql`
85	CREATE TEMPORARY TABLE T_basevegflor ( INDEX(`num_nomen`), INDEX(`num_taxon`) ) AS \	89	CREATE TEMPORARY TABLE T_basevegflor ( INDEX(`num_nomen`), INDEX(`num_taxon`) ) AS \
86	`SELECT f.num_nomen, f.num_taxon, f.catminat_code, f.ve_lumiere, f.ve_temperature, f.ve_continentalite, f.ve_humidite_atmos, f.ve_humidite_edaph, f.ve_reaction_sol, f.ve_nutriments_sol, f.ve_salinite, f.ve_texture_sol, f.ve_mat_org_sol, \`	90	`SELECT f.num_nomen, f.num_taxon, f.catminat_code, f.ve_lumiere, f.ve_temperature, f.ve_continentalite, f.ve_humidite_atmos, f.ve_humidite_edaph, f.ve_reaction_sol, f.ve_nutriments_sol, f.ve_salinite, f.ve_texture_sol, f.ve_mat_org_sol, \`
87	`v.syntaxon \`	91	`v.syntaxon \`
88	FROM `BASESOURCE`.`baseflor_v2012_12_31` f LEFT JOIN `BASESOURCE`.`baseveg_v2013_01_09` v ON (f.catminat_code = v.code_catminat AND v.niveau = 'ALL' AND v.syntaxon IS NOT NULL) WHERE f.BDNT = "BDTFX" \	92	FROM `BASESOURCE`.`baseflor_v2012_12_31` f LEFT JOIN `BASESOURCE`.`baseveg_v2013_01_09` v ON (f.catminat_code = v.code_catminat AND v.niveau = 'ALL' AND v.syntaxon IS NOT NULL) WHERE f.BDNT = "BDTFX" \
89	`GROUP BY f.num_nomen, f.num_taxon; -- group by car plusieurs couple (f.num_nomen, f.num_taxon) peuvent exister dans baseveg_v2013_01_09 or num_nom est PRIMARY dans cel_references`	93	`GROUP BY f.num_nomen, f.num_taxon; -- group by car plusieurs couple (f.num_nomen, f.num_taxon) peuvent exister dans baseveg_v2013_01_09 or num_nom est PRIMARY dans cel_references`
90		94
91		95
92	`-- INSERTIONS`	96	`-- INSERTIONS`
93	`-- pour le futur: attention au numéro taxonomique à 0 (WHERE b.num_taxonomique != '')`	97	`-- pour le futur: attention au numéro taxonomique à 0 (WHERE b.num_taxonomique != '')`
94	INSERT INTO `BASEEDIT`.`cel_references` (`referentiel`, `num_nom`, `num_nom_retenu`, `num_taxon`, `nom_sci`, `auteur`, `nom_commun`, \	98	INSERT INTO `BASEEDIT`.`cel_references` (`referentiel`, `num_nom`, `num_nom_retenu`, `num_taxon`, `nom_sci`, `auteur`, `nom_commun`, \
95	`catminat_code`, `ve_lumiere`, `ve_temperature`, `ve_continentalite`, `ve_humidite_atmos`, `ve_humidite_edaph`, \	99	`catminat_code`, `ve_lumiere`, `ve_temperature`, `ve_continentalite`, `ve_humidite_atmos`, `ve_humidite_edaph`, \
96	`ve_reaction_sol`, `ve_nutriments_sol`, `ve_salinite`, `ve_texture_sol`, `ve_mat_org_sol`, `syntaxon`) \	100	`ve_reaction_sol`, `ve_nutriments_sol`, `ve_salinite`, `ve_texture_sol`, `ve_mat_org_sol`, `syntaxon`) \
97		101
98	`SELECT "bdtfx", b.num_nom, b.num_nom_retenu, b.num_taxonomique, b.nom_sci, b.auteur, n.nom_vernaculaire, \`	102	`SELECT "bdtfx", b.num_nom, b.num_nom_retenu, b.num_taxonomique, b.nom_sci, b.auteur, n.nom_vernaculaire, \`
99	`bf.catminat_code, bf.ve_lumiere, bf.ve_temperature, bf.ve_continentalite, bf.ve_humidite_atmos, bf.ve_humidite_edaph, \`	103	`bf.catminat_code, bf.ve_lumiere, bf.ve_temperature, bf.ve_continentalite, bf.ve_humidite_atmos, bf.ve_humidite_edaph, \`
100	`bf.ve_reaction_sol, bf.ve_nutriments_sol, bf.ve_salinite, bf.ve_texture_sol, bf.ve_mat_org_sol, bf.syntaxon`	104	`bf.ve_reaction_sol, bf.ve_nutriments_sol, bf.ve_salinite, bf.ve_texture_sol, bf.ve_mat_org_sol, bf.syntaxon`
101	FROM `BASESOURCE`.`TABLEBDTFX` b LEFT JOIN T_nvjfl_v2007 n ON (b.num_taxonomique = n.num_taxon ) \	105	FROM `BASESOURCE`.`TABLEBDTFX` b LEFT JOIN T_nvjfl_v2007 n ON (b.num_taxonomique = n.num_taxon ) \
102	`LEFT JOIN T_basevegflor bf ON (b.num_taxonomique = bf.num_taxon AND b.num_nom = bf.num_nomen);`	106	`LEFT JOIN T_basevegflor bf ON (b.num_taxonomique = bf.num_taxon AND b.num_nom = bf.num_nomen);`
103		107
104		108
105	`-- pour le futur: attention au numéro taxonomique à 0 (WHERE b.num_tax IS NOT NULL AND b.num_tax != '')`	109	`-- pour le futur: attention au numéro taxonomique à 0 (WHERE b.num_tax IS NOT NULL AND b.num_tax != '')`
106	INSERT INTO `BASEEDIT`.`cel_references` (`referentiel`, `num_nom`, `num_nom_retenu`, `num_taxon`, `nom_sci`, `auteur`, `nom_commun`) \	110	INSERT INTO `BASEEDIT`.`cel_references` (`referentiel`, `num_nom`, `num_nom_retenu`, `num_taxon`, `nom_sci`, `auteur`, `nom_commun`) \
107	SELECT "bdtxa", b.num_nom, b.num_nom_retenu, b.num_tax, b.nom_sci, b.auteur, n.nom_vernaculaire FROM `BASESOURCE`.`TABLEBDTXA` b LEFT JOIN T_nva_v2013_06 n ON (b.num_tax = n.num_taxon);	111	SELECT "bdtxa", b.num_nom, b.num_nom_retenu, b.num_tax, b.nom_sci, b.auteur, n.nom_vernaculaire FROM `BASESOURCE`.`TABLEBDTXA` b LEFT JOIN T_nva_v2013_06 n ON (b.num_tax = n.num_taxon);
108		112
109		113
110	INSERT INTO `BASEEDIT`.`cel_references` (`referentiel`, `num_nom`, `num_nom_retenu`, `num_taxon`, `nom_sci`, `auteur`) \	114	INSERT INTO `BASEEDIT`.`cel_references` (`referentiel`, `num_nom`, `num_nom_retenu`, `num_taxon`, `nom_sci`, `auteur`) \
111	SELECT "isfan", b.num_nom, b.num_nom_retenu, b.num_taxonomique, b.nom_sci, b.auteur FROM `BASESOURCE`.`isfan_v2013` b;	115	SELECT "isfan", b.num_nom, b.num_nom_retenu, b.num_taxonomique, b.nom_sci, b.auteur FROM `BASESOURCE`.`TABLEISFAN` b;
112		116
113		117
114		118
115		119
116	DROP TEMPORARY TABLE IF EXISTS `T_nvjfl_v2007`, `T_nva_v2013_06`, `T_basevegflor`;	120	DROP TEMPORARY TABLE IF EXISTS `T_nvjfl_v2007`, `T_nva_v2013_06`, `T_basevegflor`;
117		121
118	`SELECT SUM(theorie.a) AS théorie, pratique.a AS total FROM \`	122	`SELECT SUM(theorie.a) AS théorie, pratique.a AS total FROM \`
119	(SELECT COUNT(1) AS a FROM `BASESOURCE`.`TABLEBDTFX` UNION ALL \	123	(SELECT COUNT(1) AS a FROM `BASESOURCE`.`TABLEBDTFX` UNION ALL \
120	SELECT COUNT(1) AS a FROM `BASESOURCE`.`TABLEBDTXA` UNION ALL \	124	SELECT COUNT(1) AS a FROM `BASESOURCE`.`TABLEBDTXA` UNION ALL \
121	SELECT COUNT(1) AS a FROM `BASESOURCE`.`isfan_v2013` \	125	SELECT COUNT(1) AS a FROM `BASESOURCE`.`TABLEISFAN` \
122	`) AS theorie, \`	126	`) AS theorie, \`
123	`(SELECT COUNT(1) AS a FROM tb_cel.cel_references) AS pratique;`	127	`(SELECT COUNT(1) AS a FROM tb_cel.cel_references) AS pratique;`
124	`-- bdtfx+bdtxa+isfan: 141181 (2013/07/23)`	128	`-- bdtfx+bdtxa+isfan: 141181 (2013/07/23)`