WebSVN – eFlore/Projets.eflore-projets – Diff – /branches/v5.9-aulnaie/scripts/modules/chorodep/Chorodep.php


<?php
// /opt/lampp/bin/php cli.php chorodep -a chargerVersions
class Chorodep extends EfloreScript {
	protected $nbre_dep = 0;
	private $type_donnee = '';
	protected $aso_num_nomenc = array();
	protected $nbre_ligne = 0;
	protected $nbre_plte_presente = 0;
	protected $nbre_plte_a_confirmer = 0;
	protected $nbre_plte_douteux = 0;
	protected $nbre_plte_erreur = 0;
	protected $nbre_plte_disparue = 0;
	protected $nbre_plte_erreur_a_confirmer = 0;
	protected $nc_autres_valeur_champ = 0;
	protected $nc_nbre_plte_presente = 0;
	protected $nc_nbre_plte_a_confirmer = 0;
	protected $nc_nbre_plte_douteux = 0;
	protected $nc_nbre_plte_disparue = 0;
	protected $nc_nbre_plte_erreur = 0;
	protected $nc_nbre_plte_erreur_a_confirmer = 0;
 
	protected $aso_totaux_dep = array();
	private $fichier_verif = './chorodep_verif.html';
 
	public function executer() {
		try {
			$this->initialiserProjet('chorodep');
 
			// Lancement de l'action demandée
			$cmd = $this->getParametre('a');
			switch ($cmd) {
 
				case 'chargerTous' :
					$this->chargerStructureSql();
					$this->chargerVersions();
					$this->chargerChorodepContributeurs();
					$this->chargerChorodepSources();
					$this->chargerChorodepOntologies();
					break;
				case 'chargerStructureSql' :
					$this->chargerStructureSql();
					break;
				case 'chargerVersions' :
					$this->chargerVersions();
					break;
				case 'chargerChorodep' :
					$this->chargerChorodepContributeurs();
					$this->chargerChorodepSources();
					$this->chargerChorodepOntologies();
					break;
				case 'verifierDonnees' :
					$this->initialiserTraitement();
					$this->verifierDonnees();
					break;
				case 'supprimerTous' :
					$this->supprimerTous();
					break;
				// noms vernaculaires et statuts de protection
				case 'NVSP' :
					$this->nettoyageNVSP();
					$this->chargerStructureNVSP();
					$this->rabouterNomsVernaculaires();
					$this->rabouterStatutsProtection();
					break;
				case 'nettoyageNVSP' :
					$this->nettoyageNVSP();
					break;
				case 'chargerStructureNVSP' :
					$this->chargerStructureNVSP();
					break;
				case 'nomsVernaculaires' :
					$this->rabouterNomsVernaculaires();
					break;
				case 'statutsProtection' :
					$this->rabouterStatutsProtection();
					break;
				default :
					throw new Exception("Erreur : la commande '$cmd' n'existe pas!");
			}
		} catch (Exception $e) {
			$this->traiterErreur($e->getMessage());
		}
	}
 
	private function chargerChorodepContributeurs() {
		$chemin = Config::get('chemins.chorodepContributeurs');
		$table = Config::get('tables.chorodepContributeurs');
		$requete = "LOAD DATA INFILE '$chemin' ".
						"REPLACE INTO TABLE $table ".
						'CHARACTER SET utf8 '.
						'FIELDS '.
						"	TERMINATED BY '\t' ".
						"	ENCLOSED BY '' ".
						"	ESCAPED BY '\\\' ".
						'IGNORE 2 LINES';
		$this->getBdd()->requeter($requete);
	}
 
	private function chargerChorodepSources() {
		$chemin = Config::get('chemins.chorodepSources');
		$table = Config::get('tables.chorodepSources');
		$requete = "LOAD DATA INFILE '$chemin' ".
							"REPLACE INTO TABLE $table ".
							'CHARACTER SET utf8 '.
							'FIELDS '.
							"	TERMINATED BY '\t' ".
							"	ENCLOSED BY '' ".
							"	ESCAPED BY '\\\' ".
							'IGNORE 2 LINES';
		$this->getBdd()->requeter($requete);
	}
 
	private function chargerChorodepOntologies() {
		$chemin = Config::get('chemins.chorodepOntologies');
		$table = Config::get('tables.chorodepOntologies');
		$requete = "LOAD DATA INFILE '$chemin' ".
								"REPLACE INTO TABLE $table ".
								'CHARACTER SET utf8 '.
								'FIELDS '.
								"	TERMINATED BY '\t' ".
								"	ENCLOSED BY '' ".
								"	ESCAPED BY '\\\' ".
								'IGNORE 1 LINES';
		$this->getBdd()->requeter($requete);
	}
 
	private function chargerVersions() {
		$versions = explode(',', Config::get('versions'));
		$versionsDonnees = explode(',', Config::get('versionsDonnees'));
		foreach ($versions as $id => $version) {
			$versionDonnees = $versionsDonnees[$id];
			$this->chargerStructureSqlVersion($versionDonnees);
			$this->chargerDonneesVersion($versionDonnees, $version);
		}
	}
 
	private function chargerStructureSqlVersion($versionDonnees) {
		$fichierSqlTpl = Config::get('chemins.structureSqlVersionTpl');
		$fichierSql = sprintf($fichierSqlTpl, $versionDonnees, $versionDonnees);
		$contenuSql = $this->recupererContenu($fichierSql);
		$this->executerScripSql($contenuSql);
	}
 
	private function chargerDonneesVersion($versionDonnees, $version) {
		$fichierTsvTpl = Config::get('chemins.chorodepTpl');
		$fichierTsv = sprintf($fichierTsvTpl, $versionDonnees, $versionDonnees);
		$tableTpl = Config::get('tables.chorodepTpl');
		$table = sprintf($tableTpl, $version);
		$champs = Config::get('chorodepChamps'.$version);
		$requete = "LOAD DATA INFILE '$fichierTsv' ".
						"REPLACE INTO TABLE $table ".
						'CHARACTER SET utf8 '.
						'FIELDS '.
						"	TERMINATED BY '\t' ".
						"	ENCLOSED BY '' ".
						"	ESCAPED BY '\\\' ".
						"($champs) ";
		$this->getBdd()->requeter($requete);
	}
 
	private function initialiserTraitement() {
		//------------------------------------------------------------------------------------------------------------//
		// Récupération des informations à vérifier
		$table = $this->getNomTableDerniereVersion();
		$requete = 	'SELECT * '.
					"FROM $table ";
		$taxons = $this->getBdd()->recupererTous($requete);
		$tax_col = $taxons[1];
		$col = array_keys($tax_col);
		$this->initialiserTableaux($col);
		//------------------------------------------------------------------------------------------------------------//
		// Analyse des données
		echo 'Traitement de la ligne n° :';
		$i = 0;
		$j = 0;
		$aso_departements_analyses = array();
		$this->nbre_ligne_avec_guillemet = 0;
		foreach ($taxons as $aso_champs) {
			$nom = $aso_champs['nom_sci'];
			$num_taxo = $aso_champs['num_tax'];
			$num_nomenc = $aso_champs['num_nom'];
			if ($num_nomenc == 'nc') {
				$this->nc_nbre_nom++;
			} else if ($num_nomenc != 'nc') {
				$this->nbre_nom++;
				// Vérification de la nom duplication des numéros nomenclaturaux
				if ( !array_key_exists($num_nomenc, (array) $this->aso_num_nomenc) ) {
					$this->aso_num_nomenc[$num_nomenc]['compteur'] = 1;
					$this->aso_num_nomenc[$num_nomenc]['ligne'] = ($this->nbre_ligne+1);
				} else {
					$this->aso_num_nomenc[$num_nomenc]['compteur']++;
					$this->aso_num_nomenc[$num_nomenc]['ligne'] .= ' - '.($this->nbre_ligne+1);
				}
			}
			foreach ($aso_champs as $cle => $val ) {# Pour chaque département du taxon, on regarde la valeur
				$this->nbre_ligne_avec_guillemet += preg_match('/"/', $val);
				if ( preg_match('/^\d{2}$/', $cle) ) {# Nous vérifions que le nom du champs comprend bien le numéro du département entre ()
					$nd = $cle;# Numéro du département
					// Nous comptons le nombre de département en base de données
					if (!isset($aso_departements_analyses[$nd])) {
						$this->nbre_dep_analyse++;
						$aso_departements_analyses[$nd] = $nd;
					}
					if ( $num_nomenc != 'nc' && isset($val) && $val != '') {# Si le taxon n'est pas abscent du département
						if ($val == '1') {# Présent
							// Calcul du nombre de plante ayant un statut "Présent"
							$this->nbre_plte_presente++;
							// Stockage par département du nombre de plante ayant un statut "Présent"
							$this->aso_totaux_dep[$nd]['plte_presente']++;
							// Stockage des informations
							$this->tab_choro_dep[$j] = array(ZgFrDepartements::getIdChaine($nd), $num_taxo, $num_nomenc, 3, $this->id_donnee_choro++);
						} else if ($val == '1?') {# Présence à confirmer
							// Calcul du nombre de plante ayant un statut "Présence à confirmer"
							$this->nbre_plte_a_confirmer++;
							// Stockage par département du nombre de plante ayant un statut "Présence à confirmer"
							$this->aso_totaux_dep[$nd]['plte_a_confirmer']++;
							// Stockage des informations
							$this->tab_choro_dep[$j] = array(ZgFrDepartements::getIdChaine($nd), $num_taxo, $num_nomenc, 4, $this->id_donnee_choro++);
						} else if (preg_match('/^\s*(?:\?)\s*$/', $val)) {# Douteux
							// Calcul du nombre de plante ayant un statut "Disparu ou douteux"
							$this->nbre_plte_douteux++;
							// Stockage par département du nombre de plante ayant un statut "Douteux"
							$this->aso_totaux_dep[$nd]['plte_douteux']++;
							// Stockage des informations
							$this->tab_choro_dep[$j] = array(ZgFrDepartements::getIdChaine($nd), $num_taxo, $num_nomenc, 5, $this->id_donnee_choro++);
							if (preg_match('/(?: \?|\? | \? )/', $val)) {# Douteux
								// Ajout de la valeur dans une variable car elle n'est pas tout à fait conforme à "?".
								$this->autres_valeur_champ .= '<'.$val.'> '.'(Ligne n°: '.($this->nbre_ligne+2).
														' - N° nomenclatural: '.$num_nomenc.' - N° département: '.$nd.')<br />';
							}
						} elseif (preg_match('/^\s*(?:#)\s*$/', $val)) {# Erreur
	                        # Calcul du nombre de plante ayant un statut "Erreur"
	                        $this->nbre_plte_erreur++;
	                        # Stockage par département du nombre de plante ayant un statut "Erreur"
	                        $this->aso_totaux_dep[$nd]['plte_erreur']++;
	                        # Stockage des informations
	                        $this->tab_choro_dep[$j] = array(ZgFrDepartements::getIdChaine($nd), $num_taxo, $num_nomenc, 6, $this->id_donnee_choro++);
	                        if (preg_match('/(?: #|# | # )/', $val)) {# Erreur avec espace
	                            # Ajout de la valeur dans une variable car elle n'est pas tout à fait conforme à "#".
	                            $autres_valeur_champ .= '<'.$val.'> '.'(Ligne n°: '.($this->nbre_ligne+2).
	                                                    ' - N° nomenclatural: '.$num_nomenc.' - N° département: '.$nd.')<br />';
	                        }
                    	} elseif (preg_match('/^\s*(?:-\|-)\s*$/', $val)) {# Disparu
	                        # Calcul du nombre de plante ayant un statut "Disparu"
	                        $this->nbre_plte_disparue++;
	                        # Stockage par département du nombre de plante ayant un statut "Disparu"
	                        $this->aso_totaux_dep[$nd]['plte_disparue']++;
	                        # Stockage des informations
	                        $this->tab_choro_dep[$j] = array(ZgFrDepartements::getIdChaine($nd), $num_taxo, $num_nomenc, 6, $this->id_donnee_choro++);
	                        if (preg_match('/(?: -\|-|-\|- | -\|- )/', $val)) {# Disparu avec espace
	                            # Ajout de la valeur dans une variable car elle n'est pas tout à fait conforme à "-|-".
	                            $autres_valeur_champ .= '<'.$val.'> '.'(Ligne n°: '.($this->nbre_ligne+2).
	                                                    ' - N° nomenclatural: '.$num_nomenc.' - N° département: '.$nd.')<br />';
	                        }
                    	} elseif (preg_match('/^\s*(?:#\?)\s*$/', $val)) {# Erreur à confirmer
	                        # Calcul du nombre de plante ayant un statut "Erreur à confirmer"
	                        $this->nbre_plte_erreur_a_confirmer++;
	                        # Stockage par département du nombre de plante ayant un statut "Erreur à confirmer"
	                        $this->aso_totaux_dep[$nd]['plte_erreur_a_confirmer']++;
	                        # Stockage des informations
	                        $this->tab_choro_dep[$j] = array(ZgFrDepartements::getIdChaine($nd), $num_taxo, $num_nomenc, 6, $this->id_donnee_choro++);
                    		if (preg_match('/^(?:\s+#\?|#\?\s+|\s+#\?\s+)$/', $val)) {# Erreur à confirmer avec espace
	                            # Ajout de la valeur dans une variable car elle n'est pas tout à fait conforme à "#?".
	                            $autres_valeur_champ .= '<'.$val.'> '.'(Ligne n°: '.($this->nbre_ligne+2).
	                                                    ' - N° nomenclatural: '.$num_nomenc.' - N° département: '.$nd.')<br />';
	                        }
                    	} else {
							// Ajout de la valeur dans une variable car elle n'est pas conforme.
							$this->autres_valeur_champ .= '<'.$val.'> '.'(Ligne n°: '.($this->nbre_ligne+2).
													' - N° nomenclatural: '.$num_nomenc.' - N° département: '.$nd.')<br />';
						}
						$j++;
					} else if (isset($val) && $val != '') {
						if ($val == '1') {# Présent
							// Calcul du nombre de plante 'nc' ayant un statut "Présent"
							$this->nc_nbre_plte_presente++;
							// Stockage par département du nombre de plante 'nc' ayant un statut "Présent"
							$this->aso_totaux_dep[$nd]['nc_plte_presente']++;
						} elseif ($val == '1?') {# Présence à confirmer
							// Calcul du nombre de plante 'nc' ayant un statut "Présence à confirmer"
							$this->nc_nbre_plte_a_confirmer++;
							// Stockage par département du nombre de plante 'nc' ayant un statut "Présence à confirmer"
							$this->aso_totaux_dep[$nd]['nc_plte_a_confirmer']++;
						} elseif (preg_match('/^(?:\?| \?|\? | \?)$/', $val)) {# Douteux
							// Calcul du nombre de plante 'nc' ayant un statut "Douteux"
							$this->nc_nbre_plte_douteux++;
							// Stockage par département du nombre de plante 'nc' ayant un statut "Douteux"
							$this->aso_totaux_dep[$nd]['nc_plte_douteux']++;
							if (preg_match('/(?: \?|\? | \? )/', $val)) {# Douteux
								// Ajout de la valeur dans une variable car elle n'est pas tout à fait conforme à "?".
								$this->nc_autres_valeur_champ .= '<'.$val.'> '.'(Ligne n°: '.($this->nbre_ligne+2).
														' - N° nomenclatural: '.$num_nomenc.' - N° département: '.$nd.')<br />';
							}
						} elseif (preg_match('/^(?:#| #|# | # )$/', $val)) {# Erreur
	                        # Calcul du nombre de plante 'nc' ayant un statut "Erreur"
	                        $this->nc_nbre_plte_erreur++;
	                        # Stockage par département du nombre de plante 'nc' ayant un statut "Erreur"
	                        $this->aso_totaux_dep[$nd]['nc_plte_erreur']++;
	                        if (preg_match('/(?: #|# | # )/', $val)) {# Erreur avec espace
	                            # Ajout de la valeur dans une variable car elle n'est pas tout à fait conforme à "#".
	                            $nc_autres_valeur_champ .= '<'.$val.'> '.'(Ligne n°: '.($this->nbre_ligne+2).
	                                                    ' - N° nomenclatural: '.$num_nomenc.' - N° département: '.$nd.')<br />';
	                        }
                    	} elseif (preg_match('/^\s*(?:-\|-)\s*$/', $val)) {# Disparu
	                        # Calcul du nombre de plante 'nc' ayant un statut "Disparu"
	                        $this->nc_nbre_plte_disparue++;
	                        # Stockage par département du nombre de plante 'nc' ayant un statut "Disparu"
	                        $this->aso_totaux_dep[$nd]['nc_plte_disparue']++;
	                        if (preg_match('/(?: -\|-|-\|- | -\|- )/', $val)) {# Disparu avec espace
	                            # Ajout de la valeur dans une variable car elle n'est pas tout à fait conforme à "-|-".
	                            $nc_autres_valeur_champ .= '<'.$val.'> '.'(Ligne n°: '.($this->nbre_ligne+2).
	                                                    ' - N° nomenclatural: '.$num_nomenc.' - N° département: '.$nd.')<br />';
	                        }
                    	} elseif (preg_match('/^\s*(?:#\?)\s*$/', $val)) {# Erreur à confirmer
	                        # Calcul du nombre de plante 'nc' ayant un statut "Erreur à confirmer"
	                        $this->nc_nbre_plte_erreur_a_confirmer++;
	                        # Stockage par département du nombre de plante 'nc' ayant un statut "Erreur à confirmer"
	                        $this->aso_totaux_dep[$nd]['nc_plte_erreur_a_confirmer']++;
	                        if (preg_match('/^(?:\s+#\?|#\?\s+|\s+#\?\s+)$/', $val)) {# Erreur à confirmer avec espace
	                            # Ajout de la valeur dans une variable car elle n'est pas tout à fait conforme à "#?".
	                            $nc_autres_valeur_champ .= '<'.$val.'> '.'(Ligne n°: '.($this->nbre_ligne+2).
	                                                    ' - N° nomenclatural: '.$num_nomenc.' - N° département: '.$nd.')<br />';
	                        }
                    	} else {
							// Ajout de la valeur dans une variable car elle n'est pas conforme.
							$this->nc_autres_valeur_champ .= '<'.$val.'> '.'(Ligne n°: '.($this->nbre_ligne+2).
													' - N° nomenclatural: '.$num_nomenc.' - N° département: '.$nd.')<br />';
						}
					}
					// Affichage dans la console du numéro de l'enregistrement analysé.
					//echo str_repeat(chr(8), ( strlen( $i ) + 1 ))."\t".$i++;
				}
			}// fin du foreach
			// Affichage dans la console du numéro de l'enregistrement analysé.
			echo str_repeat(chr(8), ( strlen( $this->nbre_ligne ) + 1 ))."\t".$this->nbre_ligne++;
		}
		echo "\n";
	}
 
	private function initialiserTableaux($dep) {
		foreach ($dep as $code_dep) {
			if ( preg_match('/^\d{2}$/', $code_dep) ) {
				$this->aso_totaux_dep[$code_dep]['plte_presente'] = 0;
				$this->aso_totaux_dep[$code_dep]['plte_a_confirmer'] = 0;
				$this->aso_totaux_dep[$code_dep]['plte_douteux'] = 0;
				$this->aso_totaux_dep[$code_dep]['plte_erreur'] = 0;
				$this->aso_totaux_dep[$code_dep]['plte_disparue'] = 0;
				$this->aso_totaux_dep[$code_dep]['plte_erreur_a_confirmer'] = 0;
				$this->aso_totaux_dep[$code_dep]['autres_valeur_champ'] = 0;
				$this->aso_totaux_dep[$code_dep]['nc_plte_presente'] = 0;
				$this->aso_totaux_dep[$code_dep]['nc_plte_a_confirmer'] = 0;
				$this->aso_totaux_dep[$code_dep]['nc_plte_douteux'] = 0;
				$this->aso_totaux_dep[$code_dep]['nc_plte_erreur'] = 0;
				$this->aso_totaux_dep[$code_dep]['nc_plte_disparue'] = 0;
				$this->aso_totaux_dep[$code_dep]['nc_plte_erreur_a_confirmer'] = 0;
				$this->aso_totaux_dep[$code_dep]['nc_autres_valeur_champ'] = 0;
			}
		}
	}
 
	private function verifierDonnees() {
		// Ouverture du fichier contenant les résultats (sortie)
		if (!$handle = fopen($this->fichier_verif, 'w')) {
			echo "Impossible d'ouvrir le fichier ($this->fichier_verif)";
			exit;
		}
 
		// Création de la page
		$page = '<html>'."\n";
		$page .= '<head>'."\n";
		$page .= '<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8" />'."\n";
		$page .= '<title>RESULTAT DE LA VERIFICATION DU FICHIER TABULE DE LA CHOROLOGIE</title>'."\n";
		$page .= '</head>'."\n";
		$page .= '<body>'."\n";
		$page .= '<h1>RESULTAT DE LA VERIFICATION DU FICHIER TABULE DE LA CHOROLOGIE</h1>'."\n";
		$page .= '<hr/>'."\n";
		$page .= 	'<p>'.
						'Adresse fichier analysé : '.'<br />'."\n".
						'</p>'."\n";
		$page .= '<hr/>'."\n";
		$page .= '<h2>RESULTATS PROGRAMME DE VERIFICATION</h2>'."\n";
		$page .= 	'<p>'.
						'Nom du programme générant ce fichier : '.__FILE__.'<br />'."\n".
						'Nombre de lignes analysées : '.$this->nbre_ligne.'<br />'."\n".
						'Nbre de départements analysés : '.$this->nbre_dep_analyse.'<br />'."\n".
						'Date d\'exécution du programme : '.date('d.m.Y').'<br />'."\n".
						'</p>'."\n";
		$page .= '<hr/>'."\n";
		$page .= '<h2>RESULTATS ANALYSE CHOROLOGIE</h2>'."\n";
		$page .= 	'<p>'.
						'Nombre de nom "nc" : '.$this->nc_nbre_nom.'<br />'."\n".
						'Nombre de nom : '.$this->nbre_nom.'<br />'."\n".
						'Valeurs autres que 1, 1?, ?, #, #? et -|- : '.$this->autres_valeur_champ.'<br />'."\n".
						'Valeurs autres que 1, 1?, ?, #, #? et -|- pour les plantes nc : <br />'."\n".$this->nc_autres_valeur_champ.'</br>'."\n".
						'</p>'."\n";
		$page .= '<hr/>'."\n";
		$page .= '<h2>RESULTATS ANALYSE des CHAMPS</h2>'."\n";
		$page .= 	'<p>'.
						'Nombre de guillemets antislashés: '.$this->nbre_ligne_avec_guillemet.'<br />'."\n".
						'</p>'."\n";
		$page .= '<hr/>'."\n";
		$page .= '<h2>TABLEAUX</h2>'."\n";
 
		// Tableau des numéros nomenclaturaux dupliqués
		$table = '<table><thead><tr><th colspan="3">Tableau des numéros nomenclaturaux dupliqués </th></tr>';
		$table .= '<tr><th>Numéro nomenclatural</th><th>Nbre d\'itération</th><th>Lignes</th></tr></thead>';
		$afficher_tab_num_duplique = 0;
		ksort($this->aso_num_nomenc);
		$table .= '<tbody style="text-align: center;">';
		foreach ($this->aso_num_nomenc as $cle_nomenc => $val ) {
			$ligne = '<tr><td>'.$cle_nomenc.'</td><td>'.$val['compteur'].'</td><td>'.$val['ligne'].'</td></tr>';
			if ($val['compteur'] > 1) {
				$table .= $ligne;
				$afficher_tab_num_duplique = 1;
			}
		}
		if ( $afficher_tab_num_duplique == 1 ) {
			$page .= $table.'</tbody></table>';
		}
 
		// Tableau des résultats par départements
		$table = '<table><thead><tr><th colspan="14">Tableau des résulats par départements</th></tr>';
		$table .= '<tr><th>Département</th><th>Nbre pltes présentes</th><th>Nbre pltes à confirmer</th>'.
			'<th>Nbre pltes douteuses</th><th>Nbre pltes disparues</th><th>Nbre pltes erreur</th><th>Nbre pltes erreur à confirmer</th>'.
			'<th>Total</th><th>Nbre pltes nc présentes</th><th>Nbre pltes nc à confirmer</th>'.
			'<th>Nbre nc pltes douteuses</th><th>Nbre nc pltes disparues</th><th>Nbre nc pltes erreur</th><th>Nbre nc pltes erreur à confirmer</th></tr></thead>';
		$table .= '<tbody style="text-align: center;">';
		ksort($this->aso_totaux_dep);
		foreach ($this->aso_totaux_dep as $cle_dep => $val ) {
			$plt_total = $val{'plte_presente'} + $val{'plte_a_confirmer'} + $val{'plte_douteux'} + $val{'plte_disparue'} + $val{'plte_erreur'} + $val{'plte_erreur_a_confirmer'};
			$table .= '<tr><td>'.ZgFrDepartements::getNom($cle_dep).' ('.ZgFrDepartements::getIdChaine($cle_dep).') </td>'.
				'<td>'.$val{'plte_presente'}.'</td><td>'.$val{'plte_a_confirmer'}.'</td><td>'.$val{'plte_douteux'}.'</td>'.
				'<td>'.$val{'plte_disparue'}.'</td><td>'.$val{'plte_erreur'}.'</td><td>'.$val{'plte_erreur_a_confirmer'}.'</td><td>'.$plt_total.'</td>'.
				'<td>'.$val{'nc_plte_presente'}.'</td><td>'.$val{'nc_plte_a_confirmer'}.'</td><td>'.$val{'nc_plte_douteux'}.'</td>'.
				'<td>'.$val{'nc_plte_disparue'}.'</td><td>'.$val{'nc_plte_erreur'}.'</td><td>'.$val{'nc_plte_erreur_a_confirmer'}.'</td></tr>';
		}
 
		$table .= '<tr><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td>'.
				'<td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td></tr>';
		$plt_total = $this->nbre_plte_presente + $this->nbre_plte_a_confirmer + $this->nbre_plte_douteux + $this->nbre_plte_disparue + $this->nbre_plte_erreur + $this->nbre_plte_erreur_a_confirmer;
		$table .= '<tr><td>Totaux : '.$this->nbre_dep_analyse.' départements</td><td>'.$this->nbre_plte_presente.'</td>'.
			'<td>'.$this->nbre_plte_a_confirmer.'</td><td>'.$this->nbre_plte_douteux.'</td><td>'.$this->nbre_plte_disparue.'</td>'.
			'<td>'.$this->nbre_plte_erreur.'</td><td>'.$this->nbre_plte_erreur_a_confirmer.'</td><td>'.$plt_total.'</td>'.
			'<td>'.$this->nc_nbre_plte_presente.'</td>'.'<td>'.$this->nc_nbre_plte_a_confirmer.'</td>'.
			'<td>'.$this->nc_nbre_plte_douteux.'</td><td>'.$this->nc_nbre_plte_disparue.'</td><td>'.$this->nc_nbre_plte_erreur.'</td><td>'.$this->nc_nbre_plte_erreur_a_confirmer.'</td></tr>';
 
		$table .= '<tr><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td>'.
				'<td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td></tr>';
		$total_nbre_plte = ($this->nbre_plte_presente + $this->nbre_plte_a_confirmer + $this->nbre_plte_douteux + $this->nbre_plte_disparue + $this->nbre_plte_erreur + $this->nbre_plte_erreur_a_confirmer);
		$total_nbre_plte_nc = ($this->nc_nbre_plte_presente + $this->nc_nbre_plte_a_confirmer + $this->nc_nbre_plte_douteux + $this->nc_nbre_plte_disparue + $this->nc_nbre_plte_erreur + $this->nc_nbre_plte_erreur_a_confirmer);
		$table .= '<tr><td>Totaux plante / plante nc</td><td colspan="7">'.$total_nbre_plte.'</td>'.
			'<td colspan="6">'.$total_nbre_plte_nc.'</td></tr>';
 
		$table .= '<tr><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td>'.
				'<td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td></tr>';
		$plt_total = $this->nbre_plte_presente + $this->nc_nbre_plte_presente + $this->nc_nbre_plte_a_confirmer + $this->nbre_plte_a_confirmer;
		$table .= '<tr><td>Total plantes présentes et à confirmer</td><td colspan="13">'.$plt_total.'</td></tr>';
 
		$table .= '<tr><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td>'.
				'<td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td></tr>';
		$plt_total = $this->nbre_plte_presente + $this->nc_nbre_plte_presente;
		$table .= '<tr><td>Total plantes présentes</td><td colspan="13">'.$plt_total.'</td></tr>';
 
		$table .= '<tr><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td>'.
				'<td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td><td>&nbsp;</td></tr>';
		$plt_total = $total_nbre_plte + $total_nbre_plte_nc;
		$table .= '<tr><td>Total données chorologiques</td><td colspan="13">'.$plt_total.'</td></tr>';
 
		$table .= '</tbody></table>';
		$page .= $table;
 
		$page .= '<hr/>'."\n";
		$page .= '<h2>NOTES</h2>'."\n";
		$page .= 	'<p>'.
						'1.- Chaque champ précédé par "ATTENTION" doit être vide.'."\n".
						'S\'il ne l\'est pas, il y a une erreur'."\n".
						'</p>'."\n";
		$page .= '</body>'."\n";
		$page .= '</html>'."\n";
		// Fermeture de la poignée sur le fichier de sortie
		if (fwrite($handle, $page) === FALSE) {
			echo "Impossible d'écrire dans le fichier ($this->fichier_verif)";
			exit;
		}
		echo 'Ecriture du fichier de vérification de la chorologie réalisée!'."\n";
		fclose($handle);
	}
 
	private function supprimerTous() {
		$tablesChorodep = implode(',', $this->getNomsTablesChorodep());
		$tableContributeurs = Config::get('tables.chorodepContributeurs');
		$tableSources = Config::get('tables.chorodepSources');
		$tableOntologies = Config::get('tables.chorodepOntologies');
		$requete = "DROP TABLE IF EXISTS chorodep_meta, $tablesChorodep, $tableContributeurs, $tableSources, $tableOntologies ";
		$this->getBdd()->requeter($requete);
	}
 
	private function getNomsTablesChorodep() {
		$versions = explode(',', Config::get('versions'));
		$tableTpl = Config::get('tables.chorodepTpl');
		$tablesChorodep = array();
		foreach ($versions as $version) {
			$tablesChorodep[] = sprintf($tableTpl, $version);
		}
		return $tablesChorodep;
	}
 
	private function getNomTableDerniereVersion() {
		$version = $this->getDerniereVersion();
		$table = sprintf(Config::get('tables.chorodepTpl'), $version);
		return $table;
	}
 
	private function getDerniereVersion() {
		$version = array_pop(explode(',', Config::get('versions')));
		return $version;
	}
 
	// ----------
	// intégration des noms vernaculaires et statuts de protection (NVSP) dans
	// une table dédiée, pour permettre le service intégratif de l'applciation "chorologie"
	// (basé sur les scripts de "gentiana-services")
	// ----------
 
	/**
	 * Dézingue tout le bousin
	 * @TODO chaque méthode devrait s'autonettoyer au début afin d'être répétable
	 * sans avoir à tout reprendre depuis le début (principe du dump)
	 */
	protected function nettoyageNVSP() {
		echo "---- suppression des tables\n";
		$tableStatutsProtection = Config::get('tables.statuts_protection');
		$tableNomsVernaculaires = Config::get('tables.noms_vernaculaires');
		$req = "DROP TABLE IF EXISTS `" . $tableStatutsProtection . "`";
		$this->getBdd()->requeter($req);
		$req = "DROP TABLE IF EXISTS `" . $tableNomsVernaculaires . "`;";
		$this->getBdd()->requeter($req);
	}
 
	/**
	 * Crée les tables vides
	 */
	protected function chargerStructureNVSP() {
		echo "---- création des tables\n";
		$contenuSql = $this->recupererContenu(Config::get('chemins.structureNVSP'));
		$this->executerScripSql($contenuSql);
	}
 
	/**
	 * Va chercher les noms vernaculaires pour chaque espèce, et les rajoute
	 * dans la table dédiée
	 */
	protected function rabouterNomsVernaculaires() {
		$tableNomsVernaculaires = Config::get('tables.noms_vernaculaires');
		restore_error_handler();
		restore_exception_handler();
		ini_set("display_errors", true);
		error_reporting(E_ALL);
		$squeletteUrlNvjfl = Config::get("url_nvjfl");
		echo "---- récupération des noms vernaculaires depuis eFlore\n";
		$depart = 0;
		$nbInsertions = 0;
		$yenaencore = true;
		$tailleTranche = 1000;
		while ($yenaencore) {
			$url = sprintf($squeletteUrlNvjfl, $depart, $tailleTranche);
			$noms = $this->chargerDonnees($url);
			// Si quelqu'un parvient à dédoublonner les $valeurs, on enlève le IGNORE
			$req = "INSERT IGNORE INTO " . $tableNomsVernaculaires . " VALUES ";
			$valeurs = array();
			// insertion des données
			foreach ($noms['resultat'] as $res) {
				$numTaxons = explode(',', $res['num_taxon']);
				$nvP = $this->getBdd()->proteger($res['nom']);
				foreach ($numTaxons as $numTaxon) {
					$valeurs[] = "(" . $numTaxon . ", " . $nvP  . ")";
				}
			}
			$req .= implode(",", $valeurs);
			$this->getBdd()->executer($req);
			// prochain tour
			$nbInsertions += count($valeurs); // Faux car INSERT IGNORE - dédoublonner ou compter les insertions réelles
			$depart += $tailleTranche;
			$total = $noms['entete']['total'];
			$yenaencore = $depart <= $total;
			echo "insérés: " . min($depart, $total) . " noms, " . $nbInsertions . " attributions\n";
		}
	}
 
	 /**
	  * Va chercher les statuts de protection pour chaque espèce et les rajoute
	  * à la table; importe un fichier dump SQL des lois
	  */
	 protected function rabouterStatutsProtection() {
	 	$tableChorologie = $this->getNomTableDerniereVersion();
	 	$tableStatutsProtection = Config::get('tables.statuts_protection');
	 	echo "---- récupération des statuts de protection depuis eFlore\n";
	 	$req = "SELECT distinct num_nom FROM " . $tableChorologie;
	 	$resultat = $this->getBdd()->recupererTous($req);
	 	// pour chaque taxon mentionné (inefficace mais évite d'implémenter un
	 	// mode liste sur le service eflore/sptb
	 	$squeletteUrlSptb = Config::get("url_sptb");
	 	$statuts != array();
	 	
	 	foreach ($resultat as $res) {
	 		$nn = $res['num_nom'];
	 		//echo "NN: $nn\n";
	 		if ($nn != 0) {
	 			$url = sprintf($squeletteUrlSptb, $nn);
	 			//echo "URL: $url\n";
	 			$statuts = $this->chargerDonnees($url);
	 			//echo "STATUTS: " . print_r($statuts, true) . "\n";
	 			if ($statuts != array() && array_count_values($statuts) > 0) {
	 				$json = array();
	 				foreach ($statuts as $statut) {
 						$nouveauStatut = array();
 						$nouveauStatut['zone'] = $statut['code_zone_application'];
 
 						$json[] =  $nouveauStatut;
	 				}
	 				// Si au moins un statut
	 				if (count($json) > 0) {
	 					$json = json_encode($json);
	 					//echo "JSON: " . print_r($json, true) . "\n";
	 					// Insertion d'un bout de JSON
	 					$jsonP = $this->getBdd()->proteger($json);
	 					$nnP = $this->getBdd()->proteger($nn);
	 					$reqIns = "INSERT INTO " . $tableStatutsProtection
	 					. " values($nnP, $jsonP)";
	 					//echo "ReqIns: $reqIns\n";
	 					$this->getBdd()->executer($reqIns);
	 				}
	 			}
	 		}
	 	}
	 }
}
 
class ZgFrDepartements {
	static private $departements =
        array(
        "01" => array("Ain", "01", 1),
        "02" => array("Aisne", "02", 2),
        "03" => array("Allier", "03", 3),
        "04" => array("Alpes-de-Haute-Provence", "04", 4),
        "05" => array("Hautes-Alpes", "05", 5),
        "06" => array("Alpes-Maritimes", "06", 6),
        "07" => array("Ardèche", "07", 7),
        "08" => array("Ardennes", "08", 8),
        "09" => array("Ariège", "09", 9),
        "10" => array("Aube", "10", 10),
        "11" => array("Aude", "11", 11),
        "12" => array("Aveyron", "12", 12),
        "13" => array("Bouches-du-Rhône", "13", 13),
        "14" => array("Calvados", "14", 14),
        "15" => array("Cantal", "15", 15),
        "16" => array("Charente", "16", 16),
        "17" => array("Charente-Maritime", "17", 17),
        "18" => array("Cher", "18", 18),
        "19" => array("Corrèze", "19", 19),
        "20" => array("Corse", "20", 20),
        "2A" => array("Haute-Corse", "2A", 20),
        "2B" => array("Corse-du-Sud", "2B", 20),
        "21" => array("Côte-d'Or", "21", 21),
        "22" => array("Côtes-d'Armor", "22", 22),
        "23" => array("Creuse", "23", 23),
        "24" => array("Dordogne", "24", 24),
        "25" => array("Doubs","25", 25),
        "26" => array("Drôme", "26", 26),
        "27" => array("Eure", "27", 27),
        "28" => array("Eure-et-Loir", "28", 28),
        "29" => array("Finistère", "29", 29),
        "30" => array("Gard", "30", 30),
        "31" => array("Haute-Garonne", "31", 31),
        "32" => array("Gers", "32", 32),
        "33" => array("Gironde", "33", 33),
        "34" => array("Hérault", "34", 34),
        "35" => array("Ille-et-Vilaine", "35", 35),
        "36" => array("Indre", "36", 36),
        "37" => array("Indre-et-Loire", "37", 37),
        "38" => array("Isère", "38", 38),
        "39" => array("Jura", "39", 39),
        "40" => array("Landes", "40", 40),
        "41" => array("Loir-et-Cher", "41", 41),
        "42" => array("Loire", "42", 42),
        "43" => array("Haute-Loire", "43", 43),
        "44" => array("Loire-Atlantique", "44", 44),
        "45" => array("Loiret", "45", 45),
        "46" => array("Lot", "46", 46),
        "47" => array("Lot-et-Garonne", "47", 47),
        "48" => array("Lozére ", "48", 48),
        "49" => array("Maine-et-Loire", "49", 49),
        "50" => array("Manche", "50", 50),
        "51" => array("Marne", "51", 51),
        "52" => array("Haute-Marne", "52", 52),
        "53" => array("Mayenne", "53", 53),
        "54" => array("Meurthe-et-Moselle", "54", 54),
        "55" => array("Meuse", "55", 55),
        "56" => array("Morbihan", "56", 56),
        "57" => array("Moselle", "57", 57),
        "58" => array("Nièvre", "58", 58),
        "59" => array("Nord", "59", 59),
        "60" => array("Oise", "60", 60),
        "61" => array("Orne", "61", 61),
        "62" => array("Pas-de-Calais", "62", 62),
        "63" => array("Puy-de-Dôme", "63", 63),
        "64" => array("Pyrénées-Atlantiques", "64", 64),
        "65" => array("Hautes-Pyrénées", "65", 65),
        "66" => array("Pyrénées-Orientales", "66", 66),
        "67" => array("Bas-Rhin", "67", 67),
        "68" => array("Haut-Rhin", "68", 68),
        "69" => array("Rhône", "69", 69),
        "70" => array("Haute-Saône", "70", 70),
        "71" => array("Saône-et-Loire", "71", 71),
        "72" => array("Sarthe", "72", 72),
        "73" => array("Savoie", "73", 73),
        "74" => array("Haute-Savoie", "74", 74),
        "75" => array("Paris", "75", 75),
        "76" => array("Seine-Maritime", "76", 76),
        "77" => array("Seine-et-Marne", "77", 77),
        "78" => array("Yvelines", "78", 78),
        "79" => array("Deux-Sèvres", "79", 79),
        "80" => array("Somme", "80", 80),
        "81" => array("Tarn", "81", 81),
        "82" => array("Tarn-et-Garonne", "82", 82),
        "83" => array("Var", "83", 83),
        "84" => array("Vaucluse", "84", 84),
        "85" => array("Vendée", "85", 85),
        "86" => array("Vienne", "86", 86),
        "87" => array("Haute-Vienne", "87", 87),
        "88" => array("Vosges", "88", 88),
        "89" => array("Yonne", "89", 89),
        "90" => array("Territoire-de-Belfort", "90", 90),
        "91" => array("Essonne", "91", 91),
        "92" => array("Hauts-de-Seine", "92", 92),
        "93" => array("Seine-Saint-Denis", "93", 93),
        "94" => array("Val-de-Marne", "94", 94),
        "95" => array("Val-d'Oise", "95", 95),
        "96" => array("aaa", "96", 96),
        "971" => array("Guadeloupe", "971", 971),
        "972" => array("Martinique", "972", 972),
        "973" => array("Guyane", "973", 973),
        "974" => array("Réunion", "974", 974),
        "99" => array("Etranger", "99", 99),
        );
 
	static public function get() {
		return self::$departements;
	}
 
    static public function getNom($n) {
		return self::$departements[$n][0];
	}
 
	static public function getIdChaine($n) {
		return self::$departements[$n][1];
	}
 
	static public function getIdNumerique($n) {
		return (int)self::$departements[$n][2];
	}
 
	static public function getIdEflore($n) {
		return (int)self::$departements[$n][3];
	}
}
?>
Subversion Repositories eFlore/Projets.eflore-projets

(root)/branches/v5.9-aulnaie/scripts/modules/chorodep/Chorodep.php – Rev 1125 → 1198

Rev 1125		Rev 1198
1	`<?php`	1	`<?php`
2	`// /opt/lampp/bin/php cli.php chorodep -a chargerVersions`	2	`// /opt/lampp/bin/php cli.php chorodep -a chargerVersions`
3	`class Chorodep extends EfloreScript {`	3	`class Chorodep extends EfloreScript {`
4	`protected $nbre_dep = 0;`	4	`protected $nbre_dep = 0;`
5	`private $type_donnee = '';`	5	`private $type_donnee = '';`
6	`protected $aso_num_nomenc = array();`	6	`protected $aso_num_nomenc = array();`
7	`protected $nbre_ligne = 0;`	7	`protected $nbre_ligne = 0;`
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21		21
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23	`private $fichier_verif = './chorodep_verif.html';`	23	`private $fichier_verif = './chorodep_verif.html';`
24		24
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28		28
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32		32
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40	`case 'chargerStructureSql' :`	40	`case 'chargerStructureSql' :`