WebSVN – eFlore/Projets.eflore-projets – Diff – /trunk/services/modules/0.1/bdtfx/Noms.php


<?php
// declare(encoding='UTF-8');
/**
* Classe permettant de fournir des informations sur les noms scientifiques.
* Si l'url finit par /noms on retourne une liste de noms latin et leurs identifiants (seulement les 100 premeiers noms par défaut).
* L'url peut contenir des paramètres optionnels passés après le ? : /noms?param1=val1&param2=val2&...
*
* Les paramètres de requête disponibles sont : masque, masque.gen (nom de genre), masque.sp (épithète d'espèce), masque.ssp (épithète infra-spécifique),
* masque.au (auteur du nom), masque.an (année de publication du nom), masque.bib (réf biblio de la publi d'origine du nom), masque.ad (nomen addendum),
* masque.nn (identifiant du nom), recherche, rang, distinct, retour.format, nl.format, nl.structure, navigation.depart et navigation.limite.
* Les différentes requetes :
*   - noms | noms/relations/#projet/#id_projet | noms/#id | noms/#id/#champ+#champ
*   - noms/#id/relations | noms/#id/relations/synonymie | noms/#id/relations/homonymie | noms/#id/relations/flores
*   - noms/stats/rangs | noms/stats/annees | noms/stats/initiales
*
* @package bdtfx
* @author Jennifer Dhé <jennifer.dhe@tela-botanica.org>
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
* @version $Id$
* @copyright 1999-2011 Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
* @see http://www.tela-botanica.org/wikini/eflore/wakka.php?wiki=EfloreApi01Noms
*/
 
class Noms extends CommunNomsTaxons {
 
	protected $format_reponse	 = 'noms'; // Permet de stocker la requete formulée
	protected $service 			 = 'noms';
	protected $serviceNom		 = 'noms';
	protected $requete_champ 	 = 'num_nom, nom_sci, num_nom_retenu';
	protected $requete_condition = null;
	protected $requete_group_by  = '';
	/** Permet de stocker les limite de la requete SQL (par défaut seul les 100 premiers résultats seront retournés).*/
	protected $limite_requete 	 = array('depart' => 0, 'limite' => 100);
	protected $distinct		 	 = null; // Valeur du paramètre de requete distinct (=0|1)
 
	public function consulter($ressources, $parametres) {
		return parent::consulter($ressources, $parametres);
	}
 
//+----------------FONCTION D'ANALYSE DES PARAMETRES---------------------------------------------------------+
 
	public function traiterParametresSpecifiques() {
		foreach ($this->parametres as $param => $val) {
			switch ($param) {
				case 'masque' :
					$champ = isset($this->parametres['recherche']) && ($this->parametres['recherche'] == 'etendue') ? 
							'CONCAT(nom_sci," ",auteur)' : 'nom_sci';
					$this->ajouterFiltreMasque($champ, $val);
					break;
				case 'masque.sg' :
					$this->ajouterFiltreMasque('nom_supra_generique', $val);
					break;
				case 'masque.gen' :
					$this->ajouterFiltreMasque('genre', $val);
					break;
				case 'masque.sp' :
					$this->ajouterFiltreMasque('epithete_sp', $val);
					break;
				case 'masque.ssp' :
					$this->ajouterFiltreMasque('epithete_infra_sp',$val);
					break;
				case 'masque.au' :
					$this->ajouterFiltreMasque('auteur', $val);
					break;
				case 'masque.an' :
					$this->ajouterFiltreMasque('annee', $val);
					break;
				case 'masque.bib' :
					$this->ajouterFiltreMasque('biblio_origine',$val);
					break;
				case 'masque.ad' :
					$this->ajouterFiltreMasque('nom_addendum', $val);
					break;
				case 'masque.nn' :
					$this->requete_condition []= 'num_nom IN ('.$val.')';
					$this->masque['num_nom'] = "num_nom=$val";
					break;
				case 'masque.nt' :
					$this->requete_condition []= 'num_taxonomique IN ('.$val.')';
					$this->masque['num_tax'] = "num_taxonomique=$val";
					break;
				case 'masque.rg' :
					$this->ajouterFiltreMasque('rang', $val);
					break;
				case 'retour.champs' :
					$this->verifierParamChamps($param, $val);
					break;
				case 'distinct' :
					$this->ajouterNomDistinct($val);
					break;
				case 'masque.fam' :
					$this->ajouterFiltreMasque('famille', $val);
					break;
				case 'masque.prga' :
					$this->ajouterFiltreMasque('presence_ga', $val);
					break;
				case 'masque.prco' :
					$this->ajouterFiltreMasque('presence_co', $val);
					break;
				case 'masque.sto' :
					$this->ajouterFiltreMasque('statut_origine', $val);
					break;
				case 'masque.sti' :
					$this->ajouterFiltreMasque('statut_introduction', $val);
					break;
				case 'masque.stc' :
					$this->ajouterFiltreMasque('statut_culture', $val);
					break;
				case 'masque.and' :
					$this->requete_condition []= " annee >= ".$this->getBdd()->proteger($val);
					break;
				case 'masque.anf' :
					$this->requete_condition []= " annee <= ".$this->getBdd()->proteger($val);
					break;
			}
 
		}
	}
 
	public function verifierParamChamps($param, $val) {
		$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
		$champs_demandes = explode(',', $val);
		$champs_verifies = array();
		$champs_api = array_flip($this->champs_api);
		$champs_supp = array('nom_retenu_complet'=>'num_nom_retenu', 'num_basionyme_complet'=>'num_basionyme');
		$champs_api = array_merge($champs_api, $champs_supp);
		foreach ($champs_demandes as $champ) {
			if (array_key_exists($champ, $champs_api)) {
				$champs_verifies[] = $champs_api[$champ];
			}
		}
		if (count($champs_verifies) > 0) {
			$this->requete_champ .= ', '.implode(',', $champs_verifies);
		}
	}
 
	/** Permet de rajouter à la requete sql le parametre distinct. N'est utilisé qu'avec le format oss */
	public function ajouterNomDistinct($distinct) {
		if (isset($distinct)) {
			if ($distinct == 1 && $this->parametres['retour.format'] == 'oss') {
				$this->distinct = ' distinct ';
			} elseif ($distinct == 1 && $this->parametres['retour.format'] != 'oss') {
				$e = 'Erreur dans votre requête </br> L\'utilisation du paramètre distinct ne se fait que sous
					le format oss';
				$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
			}
		}
	}
 
//-----------------FONCTION D'ANALYSE DES RESSOURCES--------------------------------------------------------------------
 
	public function traiterRessourcesIdentifiant() {
		//on initialise la condition de la requete sql et le format de réponse
		$this->requete_condition = array(); //on vide la table dans le cas de plusieurs version
		$this->requete_condition[] = 'num_nom = '.$this->getBdd()->proteger($this->ressources[0]);
		$this->format_reponse = $this->service.'/id';
		if (isset($this->ressources[1]) && !empty($this->ressources[1])) {
			if ($this->ressources[1] == 'relations') {
				$this->traiterRessourceIdRelations();
			} else {
				$e = 'Erreur dans votre requête </br> Ressources disponibles : <br/>
					 <li> noms/#id/relations </li> <li> noms/#id/#champ+#champ </li>
					 <li> noms/#id/relations/synonymie </li> <li> noms/#id/relations/flores </li>
					 <li> noms/#id/relations/homonymie </li>';
				$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
			}
		} else { // requete de type noms/#id : rajout du nom_sci pour récupérer le format html par la fct mettreAuFormat()
			$this->requete_champ = ' *, nom_sci ';
		}
	}
 
	public function traiterRessourceRelations() {
		$this->format_reponse .= '/relations';
		$projet = $this->ressources[1];
		$num_nom = $this->ressources[2];
		if (strrpos($num_nom, 'nn.coste') !== false) {
			list($p, $nn) = explode('=', $num_nom);
			$num_nom = $nn;
		}
		$champ = "flore_$projet"."_num";
		if (isset($this->ressources[3])) {
			$type = $this->ressources[3];
			if (!in_array($type, array('homonymie', 'synonymie', 'flores'))) {
				$e = "Les types disponibles pour les noms sont homonymie, synonymie et flores";
				$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
			}
		}
		$this->requete_champ = ' num_nom ';
		$this->requete_condition = array();
		$this->requete_condition[] = "$champ = ".$this->getBdd()->proteger($num_nom);
	}
 
	public function traiterRessourceIdRelations() {
		$this->format_reponse .= '/relations';
		if (isset($this->ressources[2]) && !empty($this->ressources[2])) {
			// requete de type noms/#id/relations/#relation
			switch ($this->ressources[2]) {
				case 'synonymie' :
					$this->traiterRessourceIdSynonymie();
					break;
				case 'flores' :
					$this->traiterRessourceIdFlores();
					break;
				case 'homonymie' :
					$this->traiterRessourceIdHomonymie();
					break;
				default :
					$e = 'Erreur dans votre requête </br> Ressources disponibles : <br/>
					 <li> noms/#id/relations </li>  <li> noms/#id/relations/synonymie </li>
					 <li> noms/#id/relations/flores </li> <li> noms/#id/relations/homonymie </li>';
					$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
					break;
			}
		}
	}
 
	public function traiterRessourceIdSynonymie() {
		// SELECT num_nom, nom_sci, num_nom_retenu, num_basionyme FROM bdtfx_v2_00 WHERE num_nom = X LIMIT 0,100;
		$this->format_reponse .= '/synonymie';
		if (strrpos($this->requete_champ, ', num_basionyme') === false) {
			$this->requete_champ .= ', num_basionyme ';
		}
		if (strrpos($this->requete_champ, ', num_type') === false) {
			$this->requete_champ .= ', num_type ';
		}
		$this->requete_champ .= ', source_biblio ';
		$this->requete_condition[0] = 'num_nom_retenu = '.
			'(SELECT num_nom_retenu FROM '.$this->table.' WHERE '.$this->requete_condition[0].')';
	}
 
	public function traiterRessourceIdHomonymie() {
		// SELECT num_nom, nom_sci, num_nom_retenu FROM bdtfx_v2_00 WHERE nom_sci = (SELECT nom_sci FROM bdtfx_v2_00 WHERE num_nom = X);
		$this->format_reponse 	 .=  '/homonymie';
		$this->requete_condition[0] =  'nom_sci = (SELECT nom_sci FROM '.$this->table
									.' WHERE '.$this->requete_condition[0].')';
	}
 
	public function traiterRessourceIdFlores() {
		$champ_flores = '';
		foreach ($this->champs_table as $champ) {
			if (preg_match('/^flore_.*$/', $champ)) {
				$champ_flores .= ', '.$champ;
			}
		}
		$this->format_reponse .=  '/flores';
		$this->requete_champ   = 'num_nom,num_nom_retenu,nom_sci,flores'.$champ_flores;
		$this->requete_condition = null;
		$this->requete_condition[] = "num_nom_retenu = ".$this->ressources[0]." OR num_nom = ".$this->ressources[0]; 
	}
 
	public function traiterRessourceStatsRangs() {
		// SELECT count(*) as nombre, rang FROM bdtfx_v2_00 [WHERE rang = 290] GROUP BY rang ORDER BY rang;
		$this->format_reponse   .= '/rangs';
		$this->requete_champ 	 = 'count(*) as nombre, rang ';
		$this->requete_group_by  = ' GROUP BY rang ORDER BY rang ';
	}
 
	public function traiterRessourceStatsAnnees() {
		// SELECT count(*) as nombre, annee FROM bdtfx_v2_00 GROUP BY annee ORDER BY annee;
		$this->format_reponse   .= '/annees';
		$this->requete_champ   	 = 'count(*) as nombre, annee ';
		$this->requete_condition = null;
		$this->requete_group_by  = ' GROUP BY annee ORDER BY annee ';
	}
 
	public function traiterRessourceStatsInitiales() {
		// SELECT count(left( nom_sci, 2 )) as nb, rang, left(nom_sci, 2) as lettre GROUP BY rang, left(nom_sci, 2);
		$this->format_reponse .= '/initiales';
		$this->requete_champ   = 'count(left( nom_sci, 2 )) as nb, rang, left(nom_sci, 2) as lettre ';
		$this->requete_group_by  = ' GROUP BY rang, left(nom_sci, 2)';
	}
 
 
 
//-----------------------------FONCTIONS DASSEMBLAGE DE LA REQUETE-----------------------------------------------------
 
	public function assemblerLaRequete() {
		if ( strrpos($this->format_reponse, 'noms/stats/') === false ) {
			$this->mettreAuFormat(); //Ds CommunNomsTaxons.php
		}
		$requete = 'SELECT '.$this->retournerChamps().' '.
			"FROM {$this->table} ".
			$this->retournerRequeteCondition().' '.
			$this->requete_group_by.' '.
			$this->retournerOrderBy().' '.
			$this->formerRequeteLimite() .
			' -- ' . __FILE__ . ':' . __LINE__ ;
		return $requete;
	}
 
	public function retournerChamps() {
		$sql = '';
		if ($this->distinct) {
			$sql .= $this->distinct.' ';
		}
		if ($this->requete_champ) {
			$sql .= $this->requete_champ.' ';
		}
 
		// Champs "virtuels" pour tier sur l'ensemble des résultats
		if (isset($this->parametres['retour.tri'])) {
			list($champ, $ordre) = $this->decouperParametreRetourTri();
			if ($champ == 'retenu') {
				$sql .= ", IF(num_nom = num_nom_retenu, '0', '1') AS nom_retenu_tri ";
			}
		}
 
		return $sql;
	}
 
	public function decouperParametreRetourTri() {
		$tri = array('', '');
		if (isset($this->parametres['retour.tri'])) {
			if (preg_match('/^(retenu)(?:,(ASC|DESC)|)$/', $this->parametres['retour.tri'], $match))
			$tri[0] = $match[1];
			$tri[1] = isset($match[2]) ? $match[2] : '';
		}
		return $tri;
	}
 
	public function retournerRequeteCondition() {
		$condition = '';
		if ($this->requete_condition) {
			$condition = ' WHERE '.implode(' AND ', $this->requete_condition);
		}
		return $condition;
	}
 
	public function retournerOrderBy() {
		$orderBy = array();
 
		// Tri sur l'ensemble des résultats
		if (isset($this->parametres['retour.tri'])) {
			list($champ, $ordre) = $this->decouperParametreRetourTri();
			if ($champ == 'retenu') {
				$orderBy[] = "nom_retenu_tri $ordre";
			}
		}
		// Tri par défaut
		if ($this->format_reponse == 'noms') {
			$orderBy[] = 'nom_sci ASC';
		}
 
		$sql = '';
		if (count($orderBy) > 0) {
			$sql = 'ORDER BY '.implode(', ', $orderBy).' ';
		}
		return $sql;
	}
 
	public function formerRequeteLimite() {
		if ($this->format_reponse != 'noms' && $this->format_reponse != 'noms/id/relations/synonymie'
				&& $this->format_reponse != 'noms/id/relations/homonymie') {
			$this->requete_limite = '';
		} elseif (($depart = $this->limite_requete['depart']) > ($this->total_resultat = $this->recupererTotalResultat())) {
			$this->limite_requete['depart'] =
			(($this->total_resultat - $this->limite_requete['limite']) < 0) ? 0 : ($this->total_resultat - $this->limite_requete['limite']);
			$this->requete_limite = ' LIMIT '.$this->limite_requete['depart'].', '.$this->limite_requete['limite'];
		} else {
			$this->requete_limite = ' LIMIT '.$this->limite_requete['depart'].', '.$this->limite_requete['limite'];
		}
		return $this->requete_limite;
	}
 
	/** Recupere le nombre total de résultat d'une requete lancée. */
	public function recupererTotalResultat() {
		$total = null;
		$requete = 'SELECT count(*) as nombre FROM '.$this->table.$this->retournerRequeteCondition().$this->requete_group_by;
		$res = $this->getBdd()->recuperer($requete);
		if ($res) {
			$total = $res['nombre'];
		} else {
			$e = 'Fct recupererTotalResultat() : <br/>Données introuvables dans la base';
			$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE, $e);
		}
		return $total;
	}
 
 
//-------------------FONCTIONS POUR LE FORMATAGE EN JSON----------------------------------------------------------------
 
	public function retournerResultatFormate($resultat) {
 
		switch ($this->format_reponse) {
			case 'noms/relations' :
				$reponse = $this->formaterRelations($resultat[0]);
				break;
			case 'noms/id' : //ds CommunNomsTaxons
				$reponse = $this->formaterId($resultat[0]);
				break;
			case 'noms/id/relations' :
				$reponse = $this->formaterIdRelations($resultat[0]);
				break;
			case 'noms/id/relations/synonymie' :
				$reponse = $this->formaterIdSynonymie($resultat);
				break;
			case 'noms/id/relations/homonymie' :
				$reponse = $this->formaterIdHomonymie($resultat);
				break;
			case 'noms/id/relations/flores' : //ds CommunsNomsTaxons
				$reponse = $this->formaterIdFlores($resultat);
				break;
			case 'noms/stats/annees' : //ds CommunNomsTaxons
				$reponse = $this->formaterStatsAnnee($resultat);
				break;
			case 'noms/stats/rangs' : //ds CommunNomsTaxons
				$reponse = $this->formaterStatsRang($resultat);
				break;
			case 'noms/stats/initiales' : //ds CommunNomsTaxons
				$reponse = $this->formaterStatsInitiales($resultat);
				break;
			case 'noms' :
				$reponse = $this->formaterNoms($resultat);
				break;
		}
		return $reponse;
	}
 
//+---------------------concerne les resultats pour des requetes de type noms/id-----------------------------+
 
	public function formaterRelations($resultat) {
		$num_nom = $resultat['num_nom'];
		if (isset($this->ressources[3])) {
			$url = Config::get('url_service').$this->service."/$num_nom/relations";
		} else {
			$type = $this->ressources[3];
			$url = Config::get('url_service')."/$this->service/$num_nom/relations/$type";
		}
		$res = $this->consulterHref($url);
		return $res;
	}
 
	public function formaterIdRelations($resultat) {
		$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
		$this->resultat_req = $resultat;
		$retour_id_rel = array ('entete' => array()); //on initialise pr que l'entete apparaisse en premier lors de l'affichage
 
		//on recupère le resultat de chaque relation (appel du WS correspondant)
		$flores = $this->ajouterRelations('flores');
		if (isset($flores)) $retour_id_rel['resultat']['flores'] = $flores;
		$homonymes = $this->ajouterRelations('homonymie');
		if (isset($homonymes)) $retour_id_rel['resultat']['homonymes'] = $homonymes;
		$synonymes = $this->ajouterRelations('synonymie');
		if (isset($synonymes)) $retour_id_rel['resultat']['synonymes'] = $synonymes;
 
		//on renvoit null si il n'existe aucune relations (on efface l'entete en premier lieu)
		if (!isset($retour_id_rel['resultat']))	{
			$retour_id_rel = null;
		} else { //on rajoute l'entete si des relations existent
			$this->afficherDonnees('num_nom', $this->ressources[0]);
			$retour_id_rel['entete'] = $this->table_retour;
			$this->table_retour = array();
		}
		return $retour_id_rel;
	}
 
	/**
	 * Recupere les relations (type de la relation passée en paramètres :[type_relation] = synonymie, homonymie ou
	 * flores) par l'appel du web service [version]/noms/#id/relations/[type_relation]
	 */
	public function ajouterRelations($relation) {
		$version = str_replace(Config::get('bdd_table').'_', '', $this->table);
		$res = null;
		$parametres_url = '';
		if ($this->parametres != array()) $parametres_url = '?'.http_build_query($this->parametres, '', '&');
		$url = Config::get('url_service').'/'.$this->service.'/'
									.$this->ressources[0].'/relations/'
									.$relation.$parametres_url;	Debug::printr($url);
 
		$relation = $this->consulterHref($url);
 
		$res = $relation->resultat;
		return $res;
	}
 
 
	public function formaterIdSynonymie($resultat) {
		$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
		$retour_id_syn = array();
		if ($resultat[0]['num_nom_retenu'] == '') return array('nom_retenu N.D.');
 
        // 1 ou + résultat(s)
        $retour_id_syn['entete'] = $this->afficherEnteteResultat('/'.$this->service.'/'.$this->ressources[0].'/relations/synonymie');
        $retour_id_syn['entete']['id'] = $this->ressources[0];
        $retour_id_syn['resultat'] = array();
 
        // résultat contient aussi l'original
        if(count($resultat) > 1) {
			//on remplit d'abord l'entete du resultat
			$this->table_retour['id'] = $this->ressources[0];
			$this->afficherEnteteResultat('/'.$this->service.'/'.$this->ressources[0].'/relations/synonymie');
			$retour_id_syn['entete'] = $this->table_retour;
			$this->table_retour = array();
			foreach ($resultat as $tab) {
				//pour chaque basionyme, on recupère le résultat : num_nom, nom_sci, num_basionyme et num_nom_retenu :
				$this->resultat_req = $tab;
				$num = $tab['num_nom'];
				$this->afficherNomHrefRetenu($tab, $num);
				$this->afficherDonnees('num_basionyme', $tab['num_basionyme']);
				$this->afficherDonnees('num_type', $tab['num_type']);
				$this->afficherDonnees('source_biblio', $tab['source_biblio']);
				$retour_id_syn['resultat'][$num] = $this->table_retour;
				$this->table_retour = array();
			}
			if (!isset($retour_id_syn['resultat']) && !in_array('nom_retenu N.D.', $retour_id_syn)) {
				$retour_id_syn = null; //on initialise le resultat à null
			}
		}
		return $retour_id_syn;
	}
 
	public function formaterIdHomonymie($resultat) {
		$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
		if (count($resultat) != 1) {
			$this->table_retour['id'] = $this->ressources[0];
			$this->afficherEnteteResultat($resultat, '/'.$this->service.'/'.$this->ressources[0].'/relations/homonymie');
			$retour_id_hom['entete'] = $this->table_retour;
			$this->table_retour = array();
			foreach ($resultat as $homonyme) {
				$this->resultat_req = $homonyme;
				$id = $homonyme['num_nom'];
				$this->afficherDonnees('num_nom', $id);
				if ($homonyme['num_nom_retenu'] != '') {
					$retenu = ($id == $homonyme['num_nom_retenu']) ? 'true' : 'false';
				} else {
					$retenu = 'absent';
				}
				$this->table_retour['retenu'] = $retenu;
				$retour_id_hom['resultat'][$id] = $this->table_retour;
				unset($retour_id_hom['resultat'][$id]['id']);
				$this->table_retour = array();
			}
		} else {
			$retour_id_hom = null;
		}
		return $retour_id_hom;
	}
 
 
	public function formaterIdFlores($synonymes_flores) {//print_r($resultat);
		$this->recupererTableSignification('noms_projets');
		if (is_array($synonymes_flores)) {//print_r($synonymes_flores);
			foreach ($synonymes_flores as $synonyme) {
				if ($synonyme['num_nom'] === $synonyme['num_nom_retenu']) {
					$reponse['entete']['id'] = $synonyme['num_nom'];
				}
				foreach ($this->noms_projets as $flore => $valeur) {
					if (isset($synonyme[$flore.'_num']) && $synonyme[$flore.'_num'] != '') {
						$presence[$valeur] = $flore;
						$this->table_retour[$flore]['type'] = "code";
						$this->afficherInfosFlore($synonyme, $flore, $valeur, '_num');
					} else if (isset($synonyme[$flore.'_page']) && $synonyme[$flore.'_page'] != '') {
						$this->table_retour[$flore]['type'] = "page";
						$this->afficherInfosFlore($synonyme, $flore, $valeur, '_page');						
					} else if (isset($synonyme[$flore]) && $synonyme[$flore] != '') {
						$this->table_retour[$flore]['type'] = "page";
						$this->afficherInfosFlore($synonyme, $flore, $valeur, 'page');
					}
				}
				if ($synonyme['flores'] != "") {
					$this->recupererTableSignification('correspondance_flores');
					$flores = explode(',', $synonyme['flores']);
					$projet = array_flip($this->noms_projets);
					foreach ($flores as $b =>$code) {
						$code = trim($code);
						if (isset($this->correspondance_flores[$code]) && !isset($presence[$this->correspondance_flores[$code]])) {
							$this->table_retour[$projet[$this->correspondance_flores[$code]]]['nom_flore'] = $this->correspondance_flores[$code];
						}
						
					}
				}
			}
		}
 
		if ($this->table_retour != array()) {
			$reponse['resultat'] = $this->table_retour;
			$this->table_retour = array();
		} else {
			$reponse = null;
		}
		return $reponse;
	}
 
 
	public function afficherInfosFlore($synonyme, $flore, $nom_flore, $type) {
 
				preg_match('/^([0-9]+)(.*)?$/', $synonyme[$flore.$type], $match);
		$this->table_retour[$flore]['nom_flore'] = $nom_flore;
		$this->table_retour[$flore]['num'][$synonyme[$flore.$type]]['id'] = $match['1'];
		$this->table_retour[$flore]['num'][$synonyme[$flore.$type]]['num_nom'] = $synonyme['num_nom'];
		$this->table_retour[$flore]['num'][$synonyme[$flore.$type]]['nom_sci'] = $synonyme['nom_sci'];
		if (isset($synonyme[$flore.'_rem']) && $synonyme[$flore.'_rem'] != '') {
			$this->table_retour[$flore]['num'][$synonyme[$flore.$type]]['remarques'] = $synonyme[$flore.'_rem'];
		}
		if ($flore == "flore_coste") {
			$this->table_retour[$flore]['num'][$synonyme[$flore.$type]]['href'] = $this->ajouterHrefAutreProjet('textes', 'coste.nn:', $match[1], 'coste');
		}
		switch ($flore) {
			case "flore_coste" : $statuts = array('syn' => 'synonyme', 'incl'=> 'taxons inclus dans', 'x' => 'correspond aux compléments en fin de tome 3',
				'hyb' => 'hybride', 'sub' => 'nom apparaissant dans la clé sous');break ;
			case "flore_bonnier" : break ; // champ vide
			case "flore_cnrs" : $statuts = array('syn' => 'synonyme', 'incl'=> 'taxons inclus dans');break ;
			case "flore_fe" : break ; // champ vide
			case "flore_coste" : $statuts = array('syn' => 'synonyme', 'inc'=> 'taxons inclus dans', 'x' => 'compléments en fin de tome 3');break ;
			case "flore_fh" : $statuts = array('syn' => 'synonyme', 'inc'=> 'taxons inclus dans'); break;
			case "flore_fournier" : $statuts = array('syn' => 'synonyme', 'hyb'=> 'hybride', 'sub' => 'nom apparaissant dans la clé sous'); break;
			case "flore_belge_ed5" : $statuts = array('R'=> 'nom retenu', 'S' => 'synonyme');break ;
			case "flore_fg" : $statuts = array('r' => 'nom retenu', 'c' => 'cité hors clé',
				 's' => 'synonyme d’un nom retenu', 'cs' => 'synonyme d’un nom cité hors clé', 
				'i' => 'nom d’un taxon inclus dans un autre', 'is' => 'syn d’un nom d’un taxon inclus dans un autre');break ;
		}
		/*
		 * Pour CNRS : 
a, b, c, d = le taxon est inclus dans un autre taxon, mentionné en note
 
 
Pour Coste :
a, b,… aux taxons inclus dans
		 */
		if (isset($statuts[trim($match[2])])) {
			$this->table_retour[$flore]['num'][$synonyme[$flore.$type]]['statut'] = $statuts[trim($match[2])];
		} else if(trim($match[2]) != "") {
			$suf = preg_split('/[\.|-|\s]/', $match[2]);
			$statut = "";
			foreach ($suf as $s) {
				if (isset($statuts[trim($s)])) {
					$statut .= $statuts[trim($s)]." ";
				} else if (preg_match('/^[a-z]$/', trim($s)) === 1) {
					$statut .= "taxon '".trim($s)."' inclus dans un autre taxon ";
				} else {
					$statut .= trim($s)." ";
				}
			}
			$this->table_retour[$flore]['num'][$synonyme[$flore.$type]]['statut'] = trim($statut);
		}
	}
 
//+---------------------concerne les resultats pour des requetes de type /noms avec ou sans paramètres-------+
 
	public function formaterNoms($resultat) {
		if ($this->parametres['retour.format'] == 'oss') {
			$reponse = $this->formaterEnOss($resultat);	 //Ds CommunNomsTaxons.php
		} else {
			$reponse = $this->formaterEnJsonMax($resultat);
		}
		return $reponse;
	}
 
	public function formaterEnJsonMax($resultat) {
		$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
 
		// TODO : améliorer le tri des résultats
		// ATTENTION : ce comportement est étrange
		$masque = $this->recupererMasquePrincipal();
		if ($masque && isset($this->parametres[$masque[0]] /* à éclaircir */ ) && !isset($this->parametres['retour.tri'])) {
			$resultat = $this->trierRechercheFloue($this->parametres[$masque[0]], $resultat, $masque[1]);
		}
 
		// Tri à la mode du CeL : lexicographique puis noms retenus (retour.tri = "alpharet")
		if (isset($this->parametres['retour.tri']) && ($this->parametres['retour.tri'] == "alpharet")) {
			usort($resultat, array($this, 'genrePuisNomsRetenusEnTete'));
		}
 
		$table_retour_json['entete'] = $this->afficherEnteteResultat('/'.$this->service);
		$table_retour_json['resultat'] = $this->remplirJsonResultat($resultat);
		return $table_retour_json;
	}
 
	// Trie les éléments du tableau de résultats : le genre en tête, puis les noms retenus, puis le reste
	// mais à partir du jeu de données retourné par SQL (indépendents du statut "retenu") 
	private function genrePuisNomsRetenusEnTete($a, $b) {
		// On pourrait utiliser l'indice ['retenu'] mais il contient parfois "absent", qui est dur à traiter
		$aEstRetenu = ($a['num_nom'] == $a['num_nom_retenu']);
		$bEstRetenu = ($b['num_nom'] == $b['num_nom_retenu']);
		$retour = 0;
 
		// les noms retenus en premier ("inférieurs")
		if ($aEstRetenu) {
			if (! $bEstRetenu) {
				$retour = -1;
			}
		}  else {
			if ($bEstRetenu) {
				$retour = 1;
			}
		}
 
		// en cas d'égalité on conserve le tri lexicographique - devrait faire sortir le genre en première position
		// car il ne contient pas le nom d'auteur
		if ($retour == 0) {
			$retour = strcasecmp($a['nom_sci'], $b['nom_sci']);
		}
 
		return $retour;
	}
 
	public function remplirJsonResultat($resultat) {
		$champs = null;
		if (array_key_exists('retour.champs', $this->parametres)) {
			$champs = explode(',', $this->parametres['retour.champs']);
		}
 
		// Structure des données: objet ou liste ?
		$modeListe = false;
		if (array_key_exists('retour.structure', $this->parametres)) {
			$modeListe = ($this->parametres['retour.structure'] === "liste");
		}
 
		$noms = array();
		foreach ($resultat as $tab) {
			$this->table_retour = array();
			$num = $tab['num_nom'];
			$this->afficherNomHrefRetenu($tab, $num); // ajoute le nom_sci, href et si le nom est retenu dans $this->table_retour
			$retour = $this->table_retour;
			$this->table_retour = array();
			if ($champs != null) {
				$reponse_id = $this->formaterId($tab);
				$this->table_retour = array();
				$this->ajouterChampsPersonnalises($champs, $reponse_id);
				$retour = array_merge($retour, $this->table_retour);
			}
			if ($modeListe) {
				$retour['num_nom'] = intval($num);
				$noms[] = $retour;
			} else {
				$noms[$num] = $retour;
			}
		}
 
		return  $noms;
	}
}
?>

Subversion Repositories eFlore/Projets.eflore-projets

(root)/trunk/services/modules/0.1/bdtfx/Noms.php – Rev 1166 → 1172

Rev 1166		Rev 1172
1	`<?php`	1	`<?php`
2	`// declare(encoding='UTF-8');`	2	`// declare(encoding='UTF-8');`
3	`/**`	3	`/**`
4	`* Classe permettant de fournir des informations sur les noms scientifiques.`	4	`* Classe permettant de fournir des informations sur les noms scientifiques.`
5	`* Si l'url finit par /noms on retourne une liste de noms latin et leurs identifiants (seulement les 100 premeiers noms par défaut).`	5	`* Si l'url finit par /noms on retourne une liste de noms latin et leurs identifiants (seulement les 100 premeiers noms par défaut).`
6	`* L'url peut contenir des paramètres optionnels passés après le ? : /noms?param1=val1&param2=val2&...`	6	`* L'url peut contenir des paramètres optionnels passés après le ? : /noms?param1=val1&param2=val2&...`
7	`*`	7	`*`
8	`* Les paramètres de requête disponibles sont : masque, masque.gen (nom de genre), masque.sp (épithète d'espèce), masque.ssp (épithète infra-spécifique),`	8	`* Les paramètres de requête disponibles sont : masque, masque.gen (nom de genre), masque.sp (épithète d'espèce), masque.ssp (épithète infra-spécifique),`
9	`* masque.au (auteur du nom), masque.an (année de publication du nom), masque.bib (réf biblio de la publi d'origine du nom), masque.ad (nomen addendum),`	9	`* masque.au (auteur du nom), masque.an (année de publication du nom), masque.bib (réf biblio de la publi d'origine du nom), masque.ad (nomen addendum),`
10	`* masque.nn (identifiant du nom), recherche, rang, distinct, retour.format, nl.format, nl.structure, navigation.depart et navigation.limite.`	10	`* masque.nn (identifiant du nom), recherche, rang, distinct, retour.format, nl.format, nl.structure, navigation.depart et navigation.limite.`
11	`* Les différentes requetes :`	11	`* Les différentes requetes :`
12	`* - noms \| noms/relations/#projet/#id_projet \| noms/#id \| noms/#id/#champ+#champ`	12	`* - noms \| noms/relations/#projet/#id_projet \| noms/#id \| noms/#id/#champ+#champ`
13	`* - noms/#id/relations \| noms/#id/relations/synonymie \| noms/#id/relations/homonymie \| noms/#id/relations/flores`	13	`* - noms/#id/relations \| noms/#id/relations/synonymie \| noms/#id/relations/homonymie \| noms/#id/relations/flores`
14	`* - noms/stats/rangs \| noms/stats/annees \| noms/stats/initiales`	14	`* - noms/stats/rangs \| noms/stats/annees \| noms/stats/initiales`
15	`*`	15	`*`
16	`* @package bdtfx`	16	`* @package bdtfx`
17	`* @author Jennifer Dhé <jennifer.dhe@tela-botanica.org>`	17	`* @author Jennifer Dhé <jennifer.dhe@tela-botanica.org>`
18	`* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>`	18	`* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>`
19	`* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>`	19	`* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>`
20	`* @version $Id$`	20	`* @version $Id$`
21	`* @copyright 1999-2011 Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)`	21	`* @copyright 1999-2011 Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)`
22	`* @see http://www.tela-botanica.org/wikini/eflore/wakka.php?wiki=EfloreApi01Noms`	22	`* @see http://www.tela-botanica.org/wikini/eflore/wakka.php?wiki=EfloreApi01Noms`
23	`*/`	23	`*/`
24		24
25	`class Noms extends CommunNomsTaxons {`	25	`class Noms extends CommunNomsTaxons {`
26		26
27	`protected $format_reponse = 'noms'; // Permet de stocker la requete formulée`	27	`protected $format_reponse = 'noms'; // Permet de stocker la requete formulée`
28	`protected $service = 'noms';`	28	`protected $service = 'noms';`
29	`protected $serviceNom = 'noms';`	29	`protected $serviceNom = 'noms';`
30	`protected $requete_champ = 'num_nom, nom_sci, num_nom_retenu';`	30	`protected $requete_champ = 'num_nom, nom_sci, num_nom_retenu';`
31	`protected $requete_condition = null;`	31	`protected $requete_condition = null;`
32	`protected $requete_group_by = '';`	32	`protected $requete_group_by = '';`
33	`/** Permet de stocker les limite de la requete SQL (par défaut seul les 100 premiers résultats seront retournés).*/`	33	`/** Permet de stocker les limite de la requete SQL (par défaut seul les 100 premiers résultats seront retournés).*/`
34	`protected $limite_requete = array('depart' => 0, 'limite' => 100);`	34	`protected $limite_requete = array('depart' => 0, 'limite' => 100);`
35	`protected $distinct = null; // Valeur du paramètre de requete distinct (=0\|1)`	35	`protected $distinct = null; // Valeur du paramètre de requete distinct (=0\|1)`
36		36
37	`public function consulter($ressources, $parametres) {`	37	`public function consulter($ressources, $parametres) {`
38	`return parent::consulter($ressources, $parametres);`	38	`return parent::consulter($ressources, $parametres);`
39	`}`	39	`}`
40		40