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<?php// declare(encoding='UTF-8');/*** Classe de découpage des noms latins.** @internal Mininum PHP version : 5.2* @category CEL* @package Services* @subpackage Bibliothèques* @version 0.1* @author Mathias CHOUET <mathias@tela-botanica.org>* @author Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org>* @author Aurelien PERONNET <aurelien@tela-botanica.org>* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>* @copyright 1999-2014 Tela Botanica <accueil@tela-botanica.org>*/class DecoupageNomLatin extends Decoupage {private $expression_principale = array();private $expression_complement = array();public function __construct() {parent::__construct();// Genre et nom supragénérique$this->expression_principale[1] = "/^((?:$this->hyb |)$this->Gen)(?:( $this->Inf)|)$/u";// Sp$this->expression_principale[2] = "/^((?:$this->hyb |)$this->Gen) ((?:($this->hyb) |$this->Dou|)(?:$this->Epi|$this->Dou))(?:((?:,| $this->Ran) $this->Inf)| agg\.|)$/u";// Rang infragénérique et supraspécifique$this->expression_principale[3] = '/^('.$this->Gen.') ('.$this->Ran.') ('.$this->Gen.'|.'.$this->Epi.')(?:(, '.$this->Inf.')|)$/u';// Hybride interspécifique$this->expression_principale[4] = "/^((?:$this->Gen) $this->Epi (?:($this->Ran) $this->Epi )?x $this->Epi(?: ($this->Ran) $this->Epi)?)$/u";// Aggrégat$this->expression_principale[5] = "/^($this->Gen) ($this->Epi) (agg\.)(?:( $this->Inf)|)$/u";//// Epithète infra-spécifique$this->expression_complement[1] = "/^ ($this->Ran) ((?:($this->hyb) |$this->Dou|)(?:$this->Epi|$this->Dou))(?:((?:,| $this->Ran) $this->Inf)|)$/Uu";// Cultivar$this->expression_complement[5] = "/^ ($this->Ran_ht) ((?:(?:$this->Epi_cv) ?)+)$/u";}public function decouper($nom_latin) {$aso_nom_decompo = array('nom_genre' => '', 'nom_sp' => '', 'auteur_sp' => '', 'nom_complement' => '','type_infrasp' => '', 'nom_infrasp' => '','num_nomenc' => '', 'num_taxo' => '', 'rang_taxonomique' => '','nom_courant' => '', 'nom_superieur' => '', 'agg' => '');$aso_nom_decompo['nom_complet'] = $nom_latin;while ($nom_latin != '') {$morceau = array();if (preg_match($this->expression_principale[4], $nom_latin, $morceau)) {// Formule d'hybridation// Nous tentons de déterminer le rang de l'hybrideif (isset($morceau[2]) && isset($morceau[3]) && $morceau[2] == $morceau[3]) {$aso_nom_decompo['rang_taxonomique'] = $this->attribuerCodeRang('n-'.$morceau[2]);} else {$aso_nom_decompo['rang_taxonomique'] = 260;// Hybride instersp.}$aso_nom_decompo['mark_hybride_interspecifique'] = 'x';$aso_nom_decompo['formule_hybridation'] = $morceau[0];$nom_latin = '';} else if (preg_match($this->expression_principale[5], $nom_latin, $morceau)) {// agg.$aso_nom_decompo['rang_taxonomique'] = 240;// agg.$aso_nom_decompo['nom_genre'] = $morceau[1];$aso_nom_decompo['nom_sp'] = $morceau[2];$aso_nom_decompo['agg'] = $morceau[3];$nom_latin = $morceau[4];$aso_nom_decompo['nom_superieur'] = $morceau[1];$aso_nom_decompo['nom_courant'] = $morceau[2];} else if (preg_match($this->expression_principale[2], $nom_latin, $morceau)) {// Nom d'sp.// Nous regardons si nous avons à faire à un hybrideif (preg_match('/^'.$this->hyb.'$/', $morceau[3])) {$aso_nom_decompo['rang_taxonomique'] = 260;// hybride intersp.$aso_nom_decompo['mark_hybride_interspecifique'] = strtolower($morceau[3]);} else if (preg_match('/^'.$this->Epi_nn_hy.'$/', $morceau[2])) {$aso_nom_decompo['rang_taxonomique'] = 260;// hybride intersp.$aso_nom_decompo['mark_hybride_interspecifique'] = 'x';} else {$aso_nom_decompo['rang_taxonomique'] = 250;// sp.}// Nous atribuons le genre$aso_nom_decompo['nom_genre'] = $morceau[1];// Nous regardons si nous avons à faire à une phrase non nommé (ex : sp.1, spp., nsp.)if (preg_match('/^'.$this->Epi_nn.'$/', $morceau[2])) {$aso_nom_decompo['phrase_nom_non_nomme'] = $morceau[2];// hybride intersp.$aso_nom_decompo['nom_sp'] = '';} else {$aso_nom_decompo['nom_sp'] = $morceau[2];}$nom_latin = $morceau[4];$aso_nom_decompo['nom_superieur'] = $morceau[1];$aso_nom_decompo['nom_courant'] = $morceau[2];} else if (preg_match($this->expression_principale[3], $nom_latin, $morceau)) {// Nom infragénérique et supraspécifique$aso_nom_decompo['nom_genre'] = $morceau[1];$aso_nom_decompo['rang_taxonomique'] = $this->attribuerCodeRang($morceau[2]);// Nous regardons si nous avons à faire à un groupeif (preg_match('/^'.$this->Ran_ig_gr.'$/', $morceau[2])) {$aso_nom_decompo['nom_sp'] = $morceau[3];} else {$aso_nom_decompo['nom_infra_genre'] = $morceau[3];}$nom_latin = $morceau[4];$aso_nom_decompo['nom_superieur'] = $morceau[1];$aso_nom_decompo['nom_courant'] = $morceau[3];} else if (preg_match($this->expression_principale[1], $nom_latin, $morceau)) {// Nom de genre et supragénérique$aso_nom_decompo['rang_taxonomique'] = $this->verifierTerminaisonLatine($nom_latin);$aso_nom_decompo['nom_suprasp'] = $morceau[1];$nom_latin = $morceau[2];$aso_nom_decompo['nom_superieur'] = null;$aso_nom_decompo['nom_courant'] = $morceau[1];} else if (preg_match($this->expression_complement[5], $nom_latin, $morceau)) {// Cultivar$aso_nom_decompo['rang_cultivar'] = $this->attribuerCodeRang($morceau[1]);// Nous vérifions si nous avons à faire à un cultivar d'hybrideif ($aso_nom_decompo['mark_hybride_interspecifique'] == 'x' && $aso_nom_decompo['rang_cultivar'] == 460) {$aso_nom_decompo['rang_cultivar'] = 470;}$aso_nom_decompo['cultivar'] = $morceau[2];$nom_latin = '';} else if (preg_match($this->expression_complement[1], $nom_latin, $morceau)) {// Nom infrasp.if (preg_match('/^'.$this->hyb.'$/', $morceau[3])) {$aso_nom_decompo['mark_hybride_interspecifique'] = strtolower($morceau[3]);}$aso_nom_decompo['rang_taxonomique'] = $this->attribuerCodeRang($morceau[1]);$aso_nom_decompo['type_infrasp'] = $morceau[1];$aso_nom_decompo['nom_infrasp'] = $morceau[2];$nom_latin = $morceau[4];$aso_nom_decompo['nom_superieur'] = $aso_nom_decompo['nom_courant'];$aso_nom_decompo['nom_courant'] = $morceau[2];} else {// Erreurs$aso_nom_decompo['erreur_mark'] = 'erreur';$aso_nom_decompo['erreur_notes'] = $nom_latin;$nom_latin = '';}}return $aso_nom_decompo;}public function verifierTerminaisonLatine($nom_latin) {if (preg_match('/^Plantae$/', $nom_latin)) {// Règnereturn 10;} else if (preg_match('/phyta$/', $nom_latin)) {// Embranchement ou Divisionreturn 30;} else if (preg_match('/phytina$/', $nom_latin)) {// Sous-Embranchement ou Sous-Divisionreturn 40;} if (preg_match('/opsida$/', $nom_latin)) {// Classereturn 70;} else if (preg_match('/idae$/', $nom_latin)) {// Sous-Classereturn 80;} else if (preg_match('/ales$/', $nom_latin)) {// Ordrereturn 100;} else if (preg_match('/ineae$/', $nom_latin)) {// Sous-Ordrereturn 110;} else if (preg_match('/aceae$/', $nom_latin)) {// Famillereturn 120;} else if (preg_match('/oideae$/', $nom_latin)) {// Sous-Famillereturn 130;} else if (preg_match('/eae$/', $nom_latin)) {// Tribureturn 140;} else if (preg_match('/inae$/', $nom_latin)) {// Sous-Tribureturn 150;} else if (preg_match('/^[A-Z]/', $nom_latin)) {// Genrereturn 160;} else {return 1;}}static function fournirTableauAbreviationRang($type = 'tout') {$rang_supra_sp = array('subgen.', 'subg.', 'sect.');// l'abréviation du rang est suivi par un nom supra spécifique commençant par une majuscule$rang_supra_gr = array('gr.');// l'abréviation du rang est suivi par un nom ne commençant pas par une majuscule$rang_supra_agg = array('agg.');// le nom latin est terminé par l'abréviation du rang$rang_infra_sp = array('subsp.', 'n-subsp.', '[subsp.]', '[n-subsp.]','var.', 'nvar.', '[var.]','prol.', 'proles', 'n-proles.','f.', 'fa', 'fa.', 'forma','subvar.', 'convar.','cv.', 'Cv.','n-f.', 'n-fa', 'n-fa.','subf.', 'subfa', 'subfa.');if ($type == 'supra') {return $rang_supra_sp;} else if ($type == 'supra-gr') {return $rang_supra_gr;} else if ($type == 'supra-agg') {return $rang_supra_agg;} else if ($type == 'infra') {return $rang_infra_sp;} else if ($type == 'tout') {return array_merge($rang_supra_sp, $rang_supra_gr, $rang_supra_agg, $rang_infra_sp);}}static function actualiserCodeRang($code_rang) {$aso_rang = array('1' => '10', // Règne'3' => '20', // Sous-Règne'5' => '30', // Phylum'7' => '40', // Sub-Phylum'9' => '50', // division'15' => '60', // sous-division'20' => '70', // classe'25' => '80', // sous-classe'30' => '100', // ordre'35' => '110', // sous-ordre'40' => '120', // famille'45' => '130', // sous-famille'50' => '140', // tribu'55' => '150', // sous-tribu'60' => '160', // genre'62' => '170', // genre hybride (nouveau compatibilité flore Réunion)'65' => '180', // sous-genre'65' => '190', // section'75' => '200', // sous-section'80' => '210', // série'85' => '220', // sous-série'90' => '230', // groupe'95' => '240', // aggrégat'100' => '250', // espèce'102' => '260', // espèce hybride intragénérique'104' => '260', // espèce hybride intergénérique'110' => '280', // sous-espèce'112' => '300', // sous-espèce hybride : hybride entre deux sous-espèces d'une espèce non hybride ; exemple : Polypodium vulgare L. nsubsp. mantoniae (Rothm.) Schidlay (Polypodium vulgare L. subsp. vulgare x Polypodium vulgare L. subsp. prionodes (Aschers.) Rothm.).'113' => '310', // sous-espèce hybride : sous-espèce d'espèce hybride sans spécification du rang parental (subspecies) (voir ICBN, art. H.12.1).'114' => '300', // sous-espèce hybride : sous-espèce hybride d'espèce hybride (nothosubspecies) (voir ICBN, art. H.12.1) ; exemple : Mentha x piperita L. nsubsp. piperita (Mentha aquatica L. x Mentha spicata L. subsp. glabrata (Lej. et Court.) Lebeau).'115' => '300', // sous-espèce hybride'120' => '1', // infra2'122' => '330', // prole, race : peu employé souvent issu de nom ancien (antérieur au code).'124' => '340', // prole, race hybride : peu employé souvent issu de nom ancien (antérieur au code).'132' => '350', // convarietas : si on le conscidère comme un rang intermédiaire entre la sous-espèce et la variété. Voir aussi n°200.'130' => '1', // infra3 : niveau infra-spécifique de troisième niveau, sans plus de précision.'140' => '360', // variété'142' => '380', // variété : hybride entre deux variétés d'une espèce non hybride.'143' => '390', // variété : variété d'espèce hybride sans spécification du rang parental (varietas) (voir ICBN, art. H.12.1); exemple : Populus x canadensis Moench var. marilandica (Poir.) Rehder.'144' => '380', // variété : variété hybride d'espèce hybride (nothovarietas) ; exemple : Salix x sepulcralis Simonk. nvar. chrysocoma (Dode) Meikle.'145' => '380', // variété hybride'150' => '410', // sous-variété'160' => '420', // forme'162' => '430', // forme : hybride entre deux formes d'une espèce non hybride.'163' => '430', // forme : forme d'espèce hybride sans spécification du rang parental (forma) (voir ICBN, art. H.12.1); exemple : Mentha x piperita L. f. hirsuta Sole.'164' => '430', // forme : forme hybride d'espèce hybride (nothoforma).'170' => '440', // sous-forme'200' => '450', // groupe de cultivar'210' => '460', // cultivar'220' => '470', // cultivar d'hybride'0' => '480' // clade);return $aso_rang[$code_rang];}public function attribuerCodeInfra($str_abreviation_type_infra) {$aso_code_infra = array('type' => '', 'code' => 0, 'rang' => 2 );switch ($str_abreviation_type_infra) {case 'subgen.' :case 'subg.' :$aso_code_infra['rang'] = 180;break;case 'sect.' :$aso_code_infra['rang'] = 190;break;case 'gr.' :$aso_code_infra['rang'] = 230;break;case 'subsp.' :$aso_code_infra['type'] = 'infra1';$aso_code_infra['code'] = 1;$aso_code_infra['rang'] = 280;break;case 'n-subsp.' :$aso_code_infra['type'] = 'infra1';$aso_code_infra['code'] = 2;$aso_code_infra['rang'] = 300;break;case '[subsp.]' :$aso_code_infra['type'] = 'infra1';$aso_code_infra['code'] = 3;$aso_code_infra['rang'] = 290;break;case '[n-subsp.]' :$aso_code_infra['type'] = 'infra1';$aso_code_infra['code'] = 4;$aso_code_infra['rang'] = 310;break;case 'var.' :$aso_code_infra['type'] = 'infra2';$aso_code_infra['code'] = 1;$aso_code_infra['rang'] = 360;break;case '[var.]' :$aso_code_infra['type'] = 'infra2';$aso_code_infra['code'] = 2;$aso_code_infra['rang'] = 370;break;case 'n-var.' :$aso_code_infra['type'] = 'infra2';$aso_code_infra['code'] = 3;$aso_code_infra['rang'] = 380;break;case 'nvar.' :$aso_code_infra['type'] = 'infra2';$aso_code_infra['code'] = 3;$aso_code_infra['rang'] = 384;break;case '[n-var.]' :$aso_code_infra['type'] = 'infra2';$aso_code_infra['code'] = 5;$aso_code_infra['rang'] = 390;break;case 'prol.' :case 'proles' :$aso_code_infra['type'] = 'infra3';$aso_code_infra['code'] = 2;$aso_code_infra['rang'] = 330;break;case 'n-proles' :case 'n-proles.' :$aso_code_infra['type'] = 'infra3';$aso_code_infra['code'] = 1;$aso_code_infra['rang'] = 340;break;case 'f.':case 'fa':case 'fa.':case 'forma':$aso_code_infra['type'] = 'infra3';$aso_code_infra['code'] = 3;$aso_code_infra['rang'] = 420;break;case 'subvar.' :$aso_code_infra['type'] = 'infra3';$aso_code_infra['code'] = 4;$aso_code_infra['rang'] = 410;break;case 'convar.' :$aso_code_infra['type'] = 'infra3';$aso_code_infra['code'] = 5;$aso_code_infra['rang'] = 350;break;case 'cv.':case 'Cv.':$aso_code_infra['type'] = 'infra3';$aso_code_infra['code'] = 6;$aso_code_infra['rang'] = 460;break;case 'n-f.':case 'n-fa':case 'n-fa.':$aso_code_infra['type'] = 'infra3';$aso_code_infra['code'] = 7;$aso_code_infra['rang'] = 430;break;case 'subf.':case 'subfa':case 'subfa.':$aso_code_infra['type'] = 'infra3';$aso_code_infra['code'] = 8;$aso_code_infra['rang'] = 440;break;default:$aso_code_infra['erreur_mark'] = 'erreur';$aso_code_infra['erreur_notes'] = $str_abreviation_type_infra;$aso_code_infra['rang'] = 2;}return $aso_code_infra;}public function attribuerCodeRang($str_abreviation_type_infra) {$aso_code_infra = $this->attribuerCodeInfra($str_abreviation_type_infra);return $aso_code_infra['rang'];}}