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/*
  Mise à jour de réferentiels NULL ou vides pour les observations orphelines (sans nom_ret_nn)
  2722 observations trouvées au 2013/07/19
*/

DROP PROCEDURE IF EXISTS getNomSci;
DROP PROCEDURE IF EXISTS getNomSciCount;
DROP PROCEDURE IF EXISTS getNomSciAuteur;
DROP PROCEDURE IF EXISTS getNomSciAuteurCount;
DROP PROCEDURE IF EXISTS cur;

delimiter |

-- obtient le nombre de matches sur nom_sel = nom_sci
CREATE PROCEDURE getNomSciCount(IN _nom varchar(500), OUT param1 INT)
BEGIN
 SELECT sum(c) INTO param1 FROM (SELECT count(1) as c FROM tb_eflore.bdtfx_v1_02 b WHERE nom_sci = _nom UNION ALL SELECT count(1) FROM tb_eflore.bdtxa_v1_00 a WHERE nom_sci = _nom) AS req;
END
|
-- retourne les paramètres d'une match
CREATE PROCEDURE getNomSci(IN _nom varchar(500), OUT param1 char(5), OUT param2 varchar(601), OUT param3 INT, OUT param4 INT, OUT param5 varchar(255))
BEGIN
           SELECT * INTO param1, param2, param3, param4, param5 FROM
           (SELECT "bdtfx", CONCAT(b.nom_sci, ' ', b.auteur), b.num_nom, b.num_taxonomique, b.famille FROM tb_eflore.bdtfx_v1_02 b WHERE nom_sci = _nom
           UNION ALL
           SELECT "bdtxa", CONCAT(a.nom_sci, ' ', a.auteur), a.num_nom, a.num_tax, a.famille FROM tb_eflore.bdtxa_v1_00 a WHERE nom_sci = _nom) AS req;
END
|

-- obtient le nombre de matches sur nom_sel = CONCAT(nom_sci, " ", auteur)
-- quasiment identique à ci-dessus, sauf que nous excluons de la recherche de bdtfx et bdtxa les nom dont le nom d'auteur est ''
CREATE PROCEDURE getNomSciAuteurCount(IN _nom varchar(500), OUT param1 INT)
BEGIN
 SELECT sum(c) INTO param1 FROM (SELECT count(1) as c FROM tb_eflore.bdtfx_v1_02 b WHERE CONCAT(nom_sci, ' ', auteur) = _nom UNION ALL SELECT count(1) FROM tb_eflore.bdtxa_v1_00 a WHERE CONCAT(nom_sci, ' ', auteur) = _nom) AS req;
END
|
-- retourne les paramètres d'une match
CREATE PROCEDURE getNomSciAuteur(IN _nom varchar(500), OUT param1 char(5), OUT param2 varchar(601), OUT param3 INT, OUT param4 INT, OUT param5 varchar(255))
BEGIN
           SELECT * INTO param1, param2, param3, param4, param5 FROM
           (SELECT "bdtfx", CONCAT(b.nom_sci, ' ', b.auteur), b.num_nom, b.num_taxonomique, b.famille FROM tb_eflore.bdtfx_v1_02 b WHERE CONCAT(nom_sci, ' ', auteur) = _nom AND auteur != ''
           UNION ALL
           SELECT "bdtxa", CONCAT(a.nom_sci, ' ', a.auteur), a.num_nom, a.num_tax, a.famille FROM tb_eflore.bdtxa_v1_00 a WHERE CONCAT(nom_sci, ' ', auteur) = _nom AND auteur != '') AS req;
END
|

CREATE PROCEDURE cur()
BEGIN
DECLARE done INT DEFAULT 0;
DECLARE subst INT DEFAULT 0;
DECLARE _id_observation bigint(20) DEFAULT 0;
DECLARE _nom varchar(255) DEFAULT NULL;

-- la requête principale de sélection des observations à mettre à jour
DECLARE cur1 CURSOR FOR SELECT id_observation, nom_sel FROM cel_obs WHERE (nom_referentiel IS NULL OR nom_referentiel = '') AND nom_sel != '' AND nom_sel IS NOT NULL AND nom_ret_nn IS NULL; -- 78149
-- DECLARE CONTINUE HANDLER FOR NOT FOUND SET done = TRUE;
DECLARE CONTINUE HANDLER FOR SQLSTATE '02000' SET done = 1;

OPEN cur1;

REPEAT
        FETCH cur1 INTO _id_observation, _nom;
        CALL getNomSciCount(_nom, @a);
        -- SELECT _id_observation, _nom, @a;
        IF @a = 1 THEN
           CALL getNomSci(_nom, @_ref, @_nom, @_num_nom, @_num_tax, @_famille);
           SELECT "updb: getNomSci", _id_observation, _nom, '=', @_ref, @_nom, @_num_nom, @_num_tax, @_famille;
           UPDATE tb_cel.cel_obs c SET
                  c.nom_referentiel = @_ref,
                  c.nom_ret = @_nom, 
                  c.nom_ret_nn = @_num_nom,
                  c.nt = @_num_tax,
                  c.famille = @_famille
           WHERE id_observation = _id_observation;
           SET subst = subst + 1;
/*        ELSE
                CALL getNomSciAuteurCount(_nom, @a);
                IF @a = 1 THEN
                   CALL getNomSciAuteur(_nom, @_ref, @_nom, @_num_nom, @_num_tax, @_famille);
                   SELECT "updb: getNomSciAuteur", _id_observation, _nom, '=', @_ref, @_nom, @_num_nom, @_num_tax, @_famille;
                   UPDATE tb_cel.cel_obs c SET
                            c.nom_referentiel = @_ref,
                            c.nom_ret = @_nom, 
                            c.nom_ret_nn = @_num_nom,
                            c.nt = @_num_tax,
                            c.famille = @_famille
                            WHERE id_observation = _id_observation;
                   SET subst = subst + 1;
                END IF;*/
        END IF;
UNTIL done END REPEAT;
select subst AS 'nombre de mises à jour effectuées';
CLOSE cur1;
END



|

delimiter ;