WebSVN – eFlore/Projets.eflore-projets – //trunk/services/modules/0.1/bdtfx/Taxons.php

<?php

// declare(encoding='UTF-8');// ou ISO-8859-15
/**
* Description :
* Classe Taxons.php permettant de fournir des informations sur les noms scientifiques retenu.
* Si l'url finit par /taxons on retourne une liste de noms latin et leurs identifiants (seulement les 100 premeiers noms par défaut).
* L'url peut contenir des paramètres optionnels passés après le ? : /taxons?param1=val1&param2=val2&...
* 
* Les paramètres de requête disponibles sont : masque, recherche, rang, distinct, retour.format, nl.format, 
* nl.structure, navigation.depart et navigation.limite.
* 
* Encodage en entrée : utf8
* Encodage en sortie : utf8
* @package framework-v3
* @author Jennifer Dhé <jennifer.dhe@tela-botanica.org>
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
* @version 1.0
* @copyright 1999-${year} Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
*/


class Taxons extends CommunNomsTaxons {
        
        /** Permet de stocker la requete formulée taxons | taxons/#id | taxons/#id/#champ+#champ ...*/
        protected $format_reponse        = 'taxons';
        protected $service                       = 'taxons';
        protected $requete_champ         = 'num_nom, nom_sci, num_nom_retenu, num_taxonomique ';
        protected $requete_condition = null; 
        protected $requete_group_by  = ' ';
        /** Permet de stocker les limite de la requete SQL (par défaut seul les 100 premiers résultats seront retournés).*/
        protected $limite_requete        = array('depart' => 0, 'limite' => 100);
        protected $num_nom_taxon; //Stocke le num_nom du nom retenu du num_nom recherché 
        protected $presence_num_tax = true;
        
        
        public function consulter($ressources, $parametres) {
                return parent::consulter($ressources, $parametres);
        }
        
        public function traiterParametresSpecifiques() {
                $this->requete_condition[] = 'num_nom = num_nom_retenu';
                
                foreach ($this->parametres as $param => $val) {
                        switch ($param) {
                                case 'masque' :
                                        $this->ajouterFiltreMasque('nom_sci', $val);                                                                             
                                        break;
                                case 'masque.nt' :
                                        $this->requete_condition[] = "num_taxonomique IN ($val)";               
                                        $this->masque[] = "num_tax=$val";                                                
                                        break;
                                case 'masque.rg':
                                        $this->requete_condition[] = 'rang = '.$this->getBdd()->proteger($val); 
                                        $this->masque[] = "rang=$val";                                  
                                        break;
                        }
                }
        }
        
//------------------------------------------Fonction ressources---------------------------------------------------------------------
        
        public function gererNumTax() {
                if (!in_array('num_taxonomique', $this->champs_table)) {
                        $this->presence_num_tax = false;
                        $this->requete_champ = str_replace(', num_taxonomique ', '', $this->requete_champ);
                } else {
                        $this->presence_num_tax = true;
                }
        }
                
        public function traiterRessourcesIdentifiant() {
                $this->format_reponse = 'taxons/id';
                $this->traiterRessourceNtId();
                $this->num_nom_taxon =  $this->recupererNumNomTaxon(); //on recupere le taxon correspondant au num_nom recherché
                if ($this->entete_http == '') {
                        $this->requete_condition[0] = 'num_nom = '.$this->getBdd()->proteger($this->num_nom_taxon);
                        if (isset($this->ressources[1]) && !empty($this->ressources[1])) {
                                //---------------- requete de type taxons/#id/#champ+#champ--------------------------------------
                                if ($this->ressources[1] != 'relations') { // SELECT *, nom_sci FROM bftfx_v2_00 WHERE num_nom = X;
                                        $this->requete_champ = ' *, nom_sci ';
                                        $this->format_reponse .= '/champ';
                                //---------------- requete de type taxons/#id/relations/#relation--------------------------------
                                } elseif ($this->ressources[1] == 'relations') { 
                                        $this->traiterRessourceIdRelations();
                                } else {
                                        $e = 'Erreur dans votre requête </br> Ressources disponibles : <br/>
                                                 <li> #id/relations </li>  <li> #id/#champ+#champ </li> <li> #id/relations </li>  
                                                 <li> #id/relations/inferieurs </li> <li> #id/relations/superieurs </li>';
                                        $this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);             
                                }               
                        } else { //--------------- requete de type taxons/#id-----------------------------------------------------
                                $this->requete_champ = ' *, nom_sci ';
                        }
                }
        }
        
        public function traiterRessourceNtId() {
                if (strrpos($this->ressources[0], 'nt:') !== false) {
                        if ($this->presence_num_tax) {
                                // SELECT num_nom FROM bdtfx_v2_00 WHERE num_nom = num_nom_retenu AND num_taxonomique = X;
                                $this->requete_condition[0] = 'num_nom = num_nom_retenu AND num_taxonomique = '
                                        .str_replace('nt:', '', $this->ressources[0]).' ';
                        } else {
                                $e = 'Erreur dans votre requête : </br> Le numéro taxonomique n\'existe pas dans ce projet';
                                $this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
                        }
                } else {
                        // SELECT num_nom FROM bdtfx_v2_00 WHERE num_nom = (SELECT num_nom_retenu FROM bdtfx_v2_00 WHERE num_nom = X);
                        $this->requete_condition[0] = 'num_nom = (SELECT num_nom_retenu FROM '
                                .$this->table.' WHERE num_nom = '.$this->ressources[0].')';
                }
        }
        
        
        /** Permet de récupérer le num_nom du taxon recherché. Soit le numéro taxonomique est demandé (avec nt: ) 
         * soit un num_nom dont on recherche le num_nom_retenu */
        public function recupererNumNomTaxon() {
                $identifiant = '';
                if ($this->entete_http == '') {
                        //on récupere l'identifiant du taxon correspondant au num_nom ou num_taxonomique demandé pour pouvoir l'afficher
                        $req_tax = 'SELECT num_nom FROM '.$this->table.' WHERE '.$this->requete_condition[0]; 
                        $res_tax = $this->getBdd()->recuperer($req_tax);
                        //on recherche ensuite les identifiants des taxons supérieurs ou inférieurs
                        if ($res_tax && $res_tax != '') {
                                $identifiant = $res_tax['num_nom'];
                        } else {
                                $e = 'Le numéro de taxon ou l\'identifiant de nom correspondant au num_nom '
                                        .$this->ressources[0].' n\'existe pas dans la base.';
                                $this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE, $e);
                                Debug::printr($req_tax);
                        }
                }
                return $identifiant;
        }
        
        public function traiterRessourceIdRelations() {
                //----------------- requete de type taxons/#id/relations-------------------------------------------
                // SELECT *, nom_sci FROM bftfx_v2_00 WHERE num_nom = X;
                $this->format_reponse .= '/relations';
                if (isset($this->ressources[2]) && !empty($this->ressources[2])) {                      
                        //------------- requete de type taxons/#id/relations/#relation--------------------------------
                        switch ($this->ressources[2]) {
                                case 'superieurs' : 
                                        $rel = 'recupererIdSup';
                                        $this->format_reponse .= '/superieurs';         
                                        $this->traiterRessourceIdRelationInfSup($rel);                          
                                        break;
                                case 'inferieurs' : 
                                        $rel = 'recupererIdInf';
                                        $this->format_reponse .= '/inferieurs';         
                                        $this->traiterRessourceIdRelationInfSup($rel);                          
                                        break;
                                default : 
                                        $e = 'Erreur dans votre requête </br> Ressources disponibles : <br/>
                                                 <li> taxons/#id/relations </li><li> #id/relations/inferieurs </li>
                                                 <li> #id/relations/superieurs </li>';
                                        $this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e); 
                                        break;
                        }
                } 
        }
                
        public function traiterRessourceIdRelationInfSup($rel) {
                //Appel de la fct récupérerIdSup ou recupererIdInf : retourne les num_nom des noms inferieurs ou superieurs
                $res_relation = $this->$rel(); 
                //analyse du résultat retourné par la requete de recherche des identifiants correspondant aux taxons inf|sup :
                if ($res_relation == '') {      //dans le cas ou la requete comporte des erreurs
                        $e = 'Fct traiterRessourceIdHomonymie : La requête forme comporte une erreur!';
                        $this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE, $e);
                } elseif ($res_relation) {
                        //dans le cas ou une ou plusieurs relations est retournée, on récupère les identifiants ss la forme (id, id, id)
                        foreach ($res_relation as $ligne) $res[] = $ligne['num_nom'];
                        $res = implode(',',$res);
                        $this->requete_condition[0] = "num_nom IN ($res)";
                        $this->requete_champ     .=  ', rang, num_tax_sup ';
                } else { //dans le cas ou aucune relation n'existe
                        $res = array($this->num_nom_taxon => null);
                        $this->corps_http = json_encode($res);
                        $this->entete_http = RestServeur::HTTP_CODE_OK;
                }
        }
        
        public function recupererIdInf() {
                //SELECT num_nom FROM bfdtx_v2_00 WHERE num_tax_sup = (SELECT num_nom FROM bdtfx_v2_00 WHERE num_nom = X);
                $req_relation = 'SELECT num_nom FROM '.$this->table
                                                        .' WHERE num_tax_sup = (SELECT num_nom FROM '
                                                        .$this->table
                                                        .' WHERE '.implode(' AND ', $this->requete_condition).')';
                $res_relation = $this->getBdd()->recupererTous($req_relation);
                return $res_relation;
        }
        
        
        public function recupererIdSup() {
                //SELECT num_nom FROM bfdtx_v2_00 WHERE num_nom = (SELECT num_tax_sup FROM bdtfx_v2_00 WHERE num_nom = X);
                $req_relation = 'SELECT num_nom FROM '.$this->table
                                                        .' WHERE num_nom = (SELECT num_tax_sup FROM '
                                                        .$this->table
                                                        .' WHERE '.implode(' AND ', $this->requete_condition).')';
                $res_relation = $this->getBdd()->recupererTous($req_relation);
                return $res_relation;
        }

        
        public function traiterRessourceStatsInitiales() {
                // SELECT count(nom_sci) as nb, rang, left(nom_sci, 2) as lettre FROM bdtfx_v2_00  GROUP BY rang, left(nom_sci, 2);
                $this->format_reponse   = 'taxons/stats/initiales';
                $this->requete_champ     = 'count(nom_sci) as nb, rang, left(nom_sci, 2) as lettre ';  
                $this->requete_group_by  = ' GROUP BY rang, left(nom_sci, 2) ';
        }
                        
        public function traiterRessourceStatsRangs() {
                // SELECT count(*) as nombre, rang FROM bdtfx_v2_00 [WHERE rang = 290] GROUP BY rang ORDER BY rang;
                $this->format_reponse   = 'taxons/stats/rangs';
                $this->requete_champ     = 'count(*) as nombre, rang ';
                $this->requete_group_by  = ' GROUP BY rang ORDER BY rang ';
        }
                        
        public function traiterRessourceStatsAnnees() {
                // SELECT count(*) as nombre, annee FROM bdtfx_v2_00 GROUP BY annee ORDER BY annee;
                $this->format_reponse   = 'taxons/stats/annees';
                $this->requete_champ     = 'count(*) as nombre, annee ';
                $this->requete_group_by  = ' GROUP BY annee ORDER BY annee ';  
        }
        
        
//-----------------------------FONCTIONS DASSEMBLAGE DE LA REQUETE-----------------------------------------------------
        
        public function assemblerLaRequete() {  
                if ($this->format_reponse != 'taxons/stats/initiales') {
                        $this->mettreAuFormat(); //on remplace les nom_sci par les nom_sci_html
                }
                $requete =      ' SELECT '.$this->requete_champ.
                                                ' FROM '.$this->table
                                                        .$this->retournerRequeteCondition()
                                                        .$this->requete_group_by
                                                        .$this->formerRequeteLimite(); 
                return $requete; 
        }
        
        public function formerRequeteLimite() {
                if ($this->format_reponse != 'taxons' && $this->format_reponse != 'taxons/id/relations/homonymie') {
                        $this->requete_limite = '';
                } elseif (($depart = $this->limite_requete['depart']) > ($this->total_resultat = $this->recupererTotalResultat())) {
                        $this->limite_requete['depart'] = (($this->total_resultat - $this->limite_requete['limite']) < 0) ? 0 : ($this->total_resultat - $this->limite_requete['limite']);
                        $this->requete_limite = ' LIMIT '.$this->limite_requete['depart'].', '.$this->limite_requete['limite']; 
                } else {
                        $this->requete_limite = ' LIMIT '.$this->limite_requete['depart'].', '.$this->limite_requete['limite']; 
                }
                return $this->requete_limite;
        }
        
        public function retournerRequeteCondition() {
                $condition = '';
                if ($this->requete_condition) { 
                        $condition = ' WHERE '.implode(' AND ', $this->requete_condition);
                } 
                return $condition;
        }
        
        public function recupererTotalResultat() {
                $requete = 'SELECT count(*) as nombre FROM '.$this->table.$this->retournerRequeteCondition().$this->requete_group_by;
                $res = $this->getBdd()->recuperer($requete);
                if ($res) {
                        $total = $res['nombre'];
                } 
                return $total;
        }

//-------------------------FONCTIONS DE FORMATION DU RESULTAT-----------------------------------------------------------
        
        /** Permet de récupérer le résultat à retourner propre à chaque requete et de l'encoder en json*/
        public function retournerResultatFormate($resultat, $version) {
                switch ($this->format_reponse) {
                        case 'taxons/id' ://ds CommunNomsTaxons
                                $reponse = $this->formaterId($resultat[0]);
                                break;
                        case 'taxons/id/champ' ://ds CommunNomsTaxons
                                $reponse = $this->formaterIdChamp($resultat[0]);
                                break;
                        case 'taxons/id/relations' :
                                $reponse = $this->formaterIdRelations($resultat[0],$version);
                                break; 
                        case 'taxons/id/relations/superieurs' :
                                $reponse = $this->formaterIdSuperieur($resultat, $version);
                                break;
                        case 'taxons/id/relations/inferieurs' :
                                $reponse = $this->formaterIdInferieur($resultat);
                                break;
                        case 'taxons/stats/annees' :  //ds CommunNomsTaxons
                                $reponse = $this->formaterStatsAnnee($resultat);
                                break;
                        case 'taxons/stats/rangs' ://ds CommunNomsTaxons
                                $reponse = $this->formaterStatsRang($resultat);
                                break;
                        case 'taxons/stats/initiales' ://ds CommunNomsTaxons
                                $reponse = $this->formaterStatsInitiales($resultat);
                                break;
                        case 'taxons' :
                                $reponse = $this->formatertaxons($resultat);
                                break;                                                                                  
                }
                return $reponse;
        }
        
                
//----------------------concerne les resultats pour des requetes de type /noms avec ou sans paramètres--------------
        
        public function formaterTaxons($resultat) {
                if ($this->parametres['retour.format'] == 'oss') {
                        $reponse = $this->formaterEnOss($resultat);     
                } else {
                        $reponse = $this->formaterEnJsonMax($resultat);
                }
                return $reponse;
        }
        
        public function formaterEnJsonMax($resultat) {
                //print_r($resultat);
                $this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
                $masque = $this->recupererMasquePrincipal();
                if (isset($masque)) $resultat = $this->trierRechercheFloue($this->parametres[$masque[0]], $resultat, $masque[1]);
                if (isset($this->masque)) $this->table_retour['masque'] = implode('&', $this->masque); 
                $this->afficherEnteteResultat('/'.$this->service);
                $table_retour_json['entete'] = $this->table_retour;
                $this->table_retour = array();
                //on remplit la table $table_retour_json['resultat']
                $tab_tax_inf = $this->recupererListeTaxonInf($resultat);
                foreach ($resultat as $tab) {
                        $num = $tab['num_nom'];
                        if (isset($this->parametres['masque_nt'])) $this->afficherDonnees('num_taxonomique', $tab['num_taxonomique']);
                        $this->afficherNomHrefRetenu($tab, $num);
                        $this->afficherTaxonInfNb($num, $tab_tax_inf); 
                        $resultat_json[$num] = $this->table_retour;
                        $this->table_retour = array(); //on vide le tableau table_retour
                }
                $table_retour_json['resultat'] = $resultat_json; 
                return $table_retour_json;
        }
        
        
//--------------------concerne les resultats pour des requetes de type noms/id----------------------------------------

        public function formaterIdRelations($resultat, $version) {
                $this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
                $this->resultat_req = $resultat;
                $retour_id_rel = array ('entete' => array()); //on initialise pr que l'entete apparaisse en premier

                $superieurs = $this->ajouterRelations('superieurs'); //, $version);
                if (isset($superieurs)) $retour_id_rel['resultat']['superieurs'] = $superieurs;
                $inferieurs = $this->ajouterRelations('inferieurs', $version);
                if (isset($inferieurs)) $retour_id_rel['resultat']['inferieurs'] = $inferieurs;
                
                if (!isset($retour_id_rel['resultat'])) { //on renvoit un tableau null si il n'existe aucune relations
                        $retour_id_rel = 'null';
                } else { //on rajoute l'entete si des relations existent
                        $this->afficherDonnees('num_nom', $this->num_nom_taxon); //$this->afficherEnteteResultat($resultat, '/'.$this->service.'/'.$this->ressources[0].'/relations/synonymie');
                        $retour_id_rel['entete'] = $this->table_retour;
                        $this->table_retour = array();
                }
                return $retour_id_rel;
        }
                
        public function ajouterRelations($relation, $version) {
                $version = str_replace(Config::get('bdd_table').'_', '', $version);
                $res = null;
                $taxon = $this->num_nom_taxon;
                $parametres_url = '';
                if ($this->parametres != array()) $parametres_url = '?'.http_build_query($this->parametres, '', '&');
                $url = Config::get('url_service').'/'
                                .$this->service.'/'.$version.'/'
                                .$this->ressources[0].'/relations/'
                                .$relation.$parametres_url;
                $relation = $this->consulterHref($url);
                if (isset($relation->resultat)) {
                        $res = $relation->resultat;
                } elseif (isset($relation->$taxon)) { //pour les relations inf et sup
                        $res = $relation->$taxon;
                }
                return $res;
        }
        
        public function formaterIdSuperieur($resultat, $version) {
                $this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
                $tab_relation = null; //si il n'existe aucune relation
                if (($resultat) != '' ) { 
                        //on recupere d'abord les rangs supérieurs
                        $sup = $resultat[0];
                        do {
                                $sup = $this->recupererIdSuperieur($sup['num_tax_sup'], $version); 
                                if ($sup['rang'] == '0') $sup['rang'] = '10'; //erreur dans la base
                                if (isset($sup)) $resultat[] = $sup;
                        } while ($sup != null);
                        krsort($resultat);
                        //on les affiche ensuite
                        foreach ($resultat as $tab) {
                                $this->resultat_req = $tab;
                                $num = $tab['num_nom'];
                                $this->afficherNomHrefRetenu($tab, $num);
                                $this->afficherDonnees('rang', $tab['rang']);   
                                $tab_inf[$num] = $this->table_retour;
                                $this->table_retour = array();
                        }
                        $tab_relation[$this->num_nom_taxon] = $tab_inf;
                } 
                return $tab_relation;
        }
        
        
        public function recupererIdSuperieur($id, $version) {
                $req = 'SELECT num_nom, num_nom_retenu, num_tax_sup, rang FROM '
                                .$version.' WHERE num_nom = '.$this->getBdd()->proteger($id);   
                $res = $this->getBdd()->recupererTous($req);
                if ($res) {
                        $resultat = $res[0];
                } else {
                        $resultat = 'null'; //on return null si il n'y a pas de taxon superieur
                }
                return $resultat;
        }
        
        public function formaterIdInferieur($resultat) {
                $this->recupererTableSignification('champs_api,champs_comp,correspondance_champs');
                $tab_tax_inf = $this->recupererListeTaxonInf($resultat); 
                $tab_relation = null;
                //on commence le formatage
                if (($resultat) != '' ) { 
                        foreach ($resultat as $tab) {
                                $this->resultat_req = $tab;
                                $this->afficherNomHrefRetenu($tab, $num_nom);
                                $tab_inf[$num] = $this->table_retour;
                                $this->table_retour = array(); //on vide le tableau table_retour
                        }
                        $tab_relation[$this->num_nom_taxon] = $tab_inf;
                }
                return $tab_relation;
        }
        
        public function afficherTaxonInfNb($num, $tab_tax_inf) {
                foreach ($tab_tax_inf as $taxNb) {
                        if ($taxNb['num_tax_sup'] == $num) {
                                $this->table_retour['taxon_inferieur_nbre'] = $taxNb['nb'];
                        }
                } 
                if (!isset($this->table_retour['taxon_inferieur_nbre'])) {
                        $this->table_retour['taxon_inferieur_nbre'] = '0';
                }
        }
        
        public function recupererListeTaxonInf($resultat) {
                // SELECT num_tax_sup, count(*) as nb FROM bdtfx_v2_00 WHERE num_tax_sup IN (id, id, id) AND num_nom = num_nom_retenu GROUP BY num_tax_sup';
                foreach ($resultat as $tab) {
                        $tab_num[] = $tab['num_nom']; //on regroupe ici les id des taxons dont on cherche le nb de taxon inf
                }
                $req = 'SELECT num_tax_sup, count(*) as nb FROM '.$this->table
                                .' WHERE num_tax_sup IN ('.implode(',',$tab_num)
                                .') AND num_nom = num_nom_retenu GROUP BY num_tax_sup';
                $res = $this->getBdd()->recupererTous($req);
                if ($res) {
                        $resultat = $res;
                } else {
                        $resultat = array(); //on return un tableau vide s'il n'y a pas de taxon inférieurs
                }
                return $resultat;
        }
}

?>
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(root)//trunk/services/modules/0.1/bdtfx/Taxons.php – Rev 43
