Rev 494 | Blame | Last modification | View Log | RSS feed
<?php
class Index {
const DOSSIER_V0 = '../../../donnees/coste/0.00/';
const DOSSIER_V2 = '../../../donnees/coste/2.00/';
private $conteneur = null;
private $outils = null;
private $messages = null;
private $generateur = null;
private $dossierBase = '';
private $spIndex = array();
private $supraSpIndex = array();
private $imgIndex = array();
private $indexFinal = array();
private $tableauParDefaut = array();
private $nbreTaxonInf = array();
private $enteteFinal = array(
'num_nom',
'num_nom_retenu',
'num_tax_sup',
'rang',
'nom_sci',
'nom_supra_generique',
'genre',
'epithete_infra_generique',
'epithete_sp',
'type_epithete',
'epithete_infra_sp',
'cultivar_groupe',
'cultivar',
'nom_commercial',
'auteur',
'annee',
'biblio_origine',
'notes',
'nom_addendum',
'nom_francais',
'nom_coste',
'auteur_coste',
'biblio_coste',
'num_nom_coste',
'num_nom_retenu_coste',
'num_tax_sup_coste',
'synonymie_coste',
'tome',
'page',
'nbre_taxons',
'flore_bdtfx_nn',
'flore_bdtfx_nt',
'image',
'image_auteur',
'page_wiki_dsc',
'page_wiki_cle',
'nom_sci_html');
public function __construct(Conteneur $conteneur) {
mb_internal_encoding('UTF-8');
setlocale(LC_ALL, 'fr_FR.UTF-8');
$this->conteneur = $conteneur;
$this->outils = $conteneur->getOutils();
$this->messages = $conteneur->getMessages();
$this->generateur = $conteneur->getGenerateurNomSciHtml();
$this->dossierBase = dirname(__FILE__).'/';
}
public function fusionnerIndex() {
$this->chargerIndexSp();
$this->chargerIndexSupraSp();
$this->initialiserTableauLigneIndexFinal();
$this->creerIndexFinal();
$this->insererCorrections();
$this->ajouterChampsDansIndexFinal();
$this->ajouteurAuteurImage();
$this->decomposerNomSci();
$this->ajouteurNomSciHtml();
$this->creerFichierCsvIndexFinal();
}
private function chargerIndexSp() {
$spIndexFichier = $this->dossierBase.self::DOSSIER_V0.'index_general_sp.tsv';
$index = $this->outils->transformerTxtTsvEnTableau($spIndexFichier);
$index = $this->reindexerParNumNomCoste($index);
foreach ($index as $numNomCoste => $infos) {
$numTaxSup = '';
if ($infos['num_nom_coste'] == $infos['num_nom_retenu_coste']) {
$numTaxSup = $infos['num_tax_sup_coste'];
} else {
$infosNomRetenu = $index[$infos['num_nom_retenu_coste']];
$numTaxSup = $infosNomRetenu['num_tax_sup_coste'];
}
$this->spIndex[$numTaxSup][] = $infos;
}
}
private function reindexerParNumNomCoste($index) {
$nouvelIndex = array();
foreach ($index as $infos) {
$nouvelIndex[$infos['num_nom_coste']] = $infos;
}
return $nouvelIndex;
}
private function chargerIndexSupraSp() {
$infraSpIndexFichier = $this->dossierBase.self::DOSSIER_V0.'index_general.tsv';
$this->supraSpIndex = $this->outils->transformerTxtTsvEnTableau($infraSpIndexFichier);
foreach ($this->supraSpIndex as $cle => $infos) {
$this->supraSpIndex[$cle]['num_nom_retenu_coste'] = $infos['num_nom_coste'];
}
}
private function initialiserTableauLigneIndexFinal() {
$this->tableauParDefaut = array();
foreach ($this->enteteFinal as $cle) {
$this->tableauParDefaut[$cle] = '';
}
}
private function creerIndexFinal() {
foreach ($this->supraSpIndex as $infos) {
$this->ajouterDansIndexFinal($infos);
if (preg_match('/^G[0-9]+$/', $infos['num_nom_coste'])) {
foreach ($this->spIndex[$infos['num_nom_coste']] as $infosSp) {
$this->ajouterDansIndexFinal($infosSp);
}
}
}
}
private function ajouterDansIndexFinal($infos) {
$infos = array_merge($this->tableauParDefaut, $infos);
$infos['num_nom'] = (count($this->indexFinal) + 1);
$this->indexFinal[$infos['num_nom_coste']] = $infos;
}
private function ajouterChampsDansIndexFinal() {
$this->genererNbreTaxons();
foreach ($this->indexFinal as $nnc => $infos) {
if ($infos['num_nom_coste'] == $infos['num_nom_retenu_coste']) {
$infos['num_nom_retenu'] = $infos['num_nom'];
if ($nnc != 'R') {
$nomSuperieur = $this->indexFinal[$infos['num_tax_sup_coste']];
$infos['num_tax_sup'] = $nomSuperieur['num_nom'];
}
$nomRetenu = $infos;
} else {
$nomRetenu = $this->indexFinal[$infos['num_nom_retenu_coste']];
$infos['num_nom_retenu'] = $nomRetenu['num_nom'];
$infos['page'] = $nomRetenu['page'];
$infos['tome'] = $nomRetenu['tome'];
}
$infos['image'] = $this->obtenirNomFichierImg($nomRetenu);
$infos['nbre_taxons'] = $this->obtenirNbreTaxon($infos);
$nomRetenu['nbre_taxons'] = $infos['nbre_taxons'];
$infos['page_wiki_dsc'] = $this->genererPageWikiDsc($nomRetenu);
$infos['page_wiki_cle'] = $this->genererPageWikiCle($nomRetenu);
$this->indexFinal[$nnc] = $infos;
}
}
private function genererNbreTaxons() {
foreach ($this->indexFinal as $infos) {
if ($infos['num_tax_sup_coste'] != '') {
if (isset($this->nbreTaxonInf[$infos['num_tax_sup_coste']])) {
$this->nbreTaxonInf[$infos['num_tax_sup_coste']] += 1;
} else {
$this->nbreTaxonInf[$infos['num_tax_sup_coste']] = 1;
}
}
}
}
private function genererPageWikiDsc($infos) {
$prefixe = $this->genererPrefixePage($infos);
if ($infos['rang'] == '180') {
$nomSci = str_replace(' ', '', ucwords(strtolower($infos['nom_coste'])));
} else {
$nomSci = str_replace(' ', '', ucwords(strtolower($infos['nom_sci'])));
}
$pageWiki = $prefixe.$nomSci;
return $pageWiki;
}
private function genererPageWikiCle($infos) {
$pageWiki = '';
if ($infos['nbre_taxons'] > 1) {
$prefixe = $this->genererPrefixePage($infos);
if ($infos['rang'] == '20') {
$pageWiki = $prefixe.'TabClaEtEmb';
} elseif ($infos['rang'] == '40' && ($infos['num_nom_coste'] == 'E2' || $infos['num_nom_coste'] == 'E3')) {
$pageWiki = $prefixe.'TabFam';
} else if ($infos['rang'] == '80') {
$pageWiki = $prefixe.'TabFam';
} else if ($infos['rang'] == '180') {
$pageWiki = $prefixe.'TabGen';
} else if ($infos['rang'] == '220') {
$pageWiki = $prefixe.'TabSp';
}
}
return $pageWiki;
}
private function genererPrefixePage($infos) {
$prefixe = '';
$num = preg_replace('/^[a-z]*([0-9]+)(?:[.][0-9a-z]|)$/i', '$1', $infos['num_nom_coste']);
if (preg_match('/^([0-9]+)[.][0-9a-z]$/i', $infos['num_nom_coste'], $match)) {
$num = sprintf('%04s', $match[1]);
} else if ($infos['rang'] == 20 ) {
$num = '';
} else if ($infos['rang'] < 80 ) {
$num = sprintf('%02s', $num);
} else if ($infos['rang'] < 290 ) {
$num = sprintf('%03s', $num);
} else {
$num = sprintf('%04s', $num);
}
$rangsTxt = array('20' => 'Reg', '40' => 'Emb', '80' => 'Cla', '180' => 'Fam', '220' => 'Gen', '290' => 'Esp', '340' => 'Var');
$rang = $rangsTxt[$infos['rang']];
$prefixe = $rang.$num;
return $prefixe;
}
private function obtenirNbreTaxon($infos) {
$nbre = '';
if (isset($this->nbreTaxonInf[$infos['num_nom_coste']])) {
$nbre = $this->nbreTaxonInf[$infos['num_nom_coste']];
}
return $nbre;
}
private function obtenirNomFichierImg($infos) {
$img = '';
if ($infos['rang'] == '290') {
$prefixe = preg_replace('/[.][a-z]$/', '', $infos['num_nom_retenu']);
$img = $prefixe.'.png';
}
return $img;
}
private function ajouteurAuteurImage() {
$this->chargerAuteurImg();
foreach ($this->indexFinal as $nnc => $infos) {
$infos['image_auteur'] = $this->imgIndex[$infos['image']];
$this->indexFinal[$nnc] = $infos;
}
}
private function chargerAuteurImg() {
$imgIndexFichier = $this->dossierBase.self::DOSSIER_V0.'coste_images_auteur_correspondance_bdnff.tsv';
$index = $this->outils->transformerTxtTsvEnTableau($imgIndexFichier);
foreach ($index as $infos) {
$id = $infos['id_image'];
$this->imgIndex[$id] = $infos['auteur'];
}
}
private function decomposerNomSci() {
$majuscule = "[ÆŒA-Z]";
$epithete = "[æœïa-z-]+";
foreach ($this->indexFinal as $nnc => $infos) {
$id = $infos['num_nom_coste'];
$nomSci = $infos['nom_sci'];
$rang = $infos['rang'];
if ($rang < 220) {
$infos['nom_supra_generique'] = $nomSci;
} else if ($rang == 220) {
$infos['genre'] = $nomSci;
} else if ($rang == 290) {
if (preg_match("/^($majuscule$epithete) ($epithete)$/", $nomSci, $match)) {
$infos['genre'] = $match[1];
$infos['epithete_sp'] = $match[2];
} else {
$this->messages->traiterErreur("Le nom $nomSci ($id) de rang $rang n'est pas standard.");
}
} else if ($rang == 340) {
if (preg_match("/^($majuscule$epithete) ($epithete) (var[.]) ($epithete)$/", $nomSci, $match)) {
$infos['genre'] = $match[1];
$infos['epithete_sp'] = $match[2];
$infos['type_epithete'] = $match[3];
$infos['epithete_infra_sp'] = $match[4];
} else {
$this->messages->traiterErreur("Le nom $nomSci ($id) de rang $rang n'est pas standard.");
}
}
$this->indexFinal[$nnc] = $infos;
$this->messages->afficherAvancement("Décomposition des noms scientifiques en cours");
}
echo "\n";
}
private function ajouteurNomSciHtml() {
foreach ($this->indexFinal as $nnc => $infos) {
$this->indexFinal[$nnc]['nom_sci_html'] = $this->generateur->genererNomSciHtml($infos);
$this->messages->afficherAvancement("Création des noms scientifiques HTML en cours");
}
echo "\n";
}
private function insererCorrections() {
$correctionsFichier = $this->dossierBase.self::DOSSIER_V2.'coste_v2_00_corrections.tsv';
$corrections = $this->outils->transformerTxtTsvEnTableau($correctionsFichier);
foreach ($corrections as $infos) {
$nnc = $infos['num_nom_coste'];
$infosACorriger = isset($this->indexFinal[$nnc]) ? $this->indexFinal[$nnc] : array();
foreach ($corrections as $champ => $valeur) {
$infosACorriger[$champ] = $valeur;
}
$this->indexFinal[$nnc] = $infosACorriger;
}
}
private function creerFichierCsvIndexFinal() {
$lignes = array();
array_unshift($this->indexFinal, $this->enteteFinal);
foreach ($this->indexFinal as $infos) {
$lignes[] = implode("\t", $infos);
}
$txt = '';
$txt = implode("\n", $lignes);
$fichierTsvIndexFinal = $this->dossierBase.self::DOSSIER_V2.'coste_v2_00.tsv';
file_put_contents($fichierTsvIndexFinal, $txt);
}
}
?>