Subversion Repositories eFlore/Applications.cel

<?php
/**
* PHP Version 5
*
* @category  PHP
* @package   jrest
* @author    David Delon <david@tela-botania.org>
* @author    Aurélien Peronnet <aurelien@tela-botania.org>
* @copyright 2010 Tela-Botanica
* @license   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-fr.txt Licence CECILL
* @version   SVN: <svn_id>
* @link      /doc/jrest/
*/

/**
 * 
 * La classe appelle les web service d'eflore pour éviter que le code client 
 * ne soit dépendant de la version d'eflore
 */
class RechercheInfosTaxonBeta extends Cel {
        
        public function RechercheInfosTaxonBeta($config) {              
                parent::__construct($config);
        }
        
        public function rechercherGenreEspeceSurPrefixe($genre = null, $espece = null) {
                
                $liste_genre_espece = array();  
                $masque = urlencode(trim(trim($genre).' '.trim($espece,' *')));
                $requete = @file_get_contents('http://localhost/service:eflore:0.1/bdtfx/noms?masque='.$masque.'&recherche=etendue&retour.format=min&navigation.limite=50&ns.structure=au');
                
                if($requete != '') {
                        $requete = json_decode($requete);               
                        if(is_object($requete) && isset($requete->resultat)) {
                                foreach ($requete->resultat as $id => $res) {
                                        $retenu = $res->retenu == true ? '3' : '';
                                        $liste_genre_espece[] = array($res->nom_sci_complet, $id, $retenu);
                                }
                        }
                        usort($liste_genre_espece, array($this, 'comparerParNom'));  
                }
                return $liste_genre_espece;
        }
        
        function comparerParNom($a, $b) {
                return strnatcmp($a[0], $b[0]); 
        }
        
        public function effectuerRequeteInfosComplementairesEtFormaterNom($numNom) {
                
                $resultat_infos_complementaires = (array)$this->effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($numNom);
                $retour_infos_complementaires = array();
                if (isset($resultat_infos_complementaires['nom_retenu_complet']) && $resultat_infos_complementaires['nom_retenu_complet'] != '') {
                $retour_infos_complementaires=array(($this->supprimerBiblio($resultat_infos_complementaires['nom_retenu_complet'])));
            }
                
                return $retour_infos_complementaires;
        }
        
        public function rechercherInformationsComplementairesSurNom($nom_saisi) {
                
                $nameparser = new NameParser();
                $nom_decoupe = $nameparser->parse($nom_saisi);
                
                $masque = ((isset($nom_decoupe['genus']) && $nom_decoupe['genus']!= '') && 
                                  (isset($nom_decoupe['species']) && $nom_decoupe['species']!= ''))
                                  ? $nom_decoupe['genus'].' '.$nom_decoupe['species'] : $nom_saisi;
                
                $liste_genre_espece = array();
                $url = 'http://www.tela-botanica.org/service:eflore:0.1/bdtfx/noms?masque='.urlencode($nom_decoupe['genus'].' '.$nom_decoupe['species']).'&recherche=etendue&ns.format=txt&retour.champs=nom_retenu,nom_retenu.*,num_taxonomique,auteur&navigation.limite=1';

                $resultat = @file_get_contents($url);
                if($resultat != '') {
                        $resultat = json_decode($resultat);
                        if(is_object($resultat) && isset($resultat->resultat)) {
                                foreach ($resultat->resultat as $id => $res) {
                                        $nom_complet = $res->{'nom_sci'}.' '.$res->auteur;
                                        $liste_genre_espece[] = array($res->{'nom_retenu.id'},$nom_complet);
                                }
                        }
                }
                return $liste_genre_espece;
        }
        
        public function rechercherInformationsComplementairesSurNumNom($num_nom) {
                $infos_formatees = array();
                $infos = $this->effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($num_nom);
                if(is_object($infos)) {
                        $infos_formatees = $this->formaterInfosComplementairesSurNumNom($infos);
                }
                return $infos_formatees;
        }
        
        public function effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($num_nom) {
                $infos = array();
                //TODO: retourner moins de champs grâce au paramètre retour.champs
                $url = "http://www.tela-botanica.org/service:eflore:0.1/bdtfx/noms/".$num_nom;
                $resultat = @file_get_contents($url);
                if($resultat != '') {
                        $infos = json_decode($resultat);
                }
                return $infos;
        }
        
        private function formaterInfosComplementairesSurNumNom($infos) {
                $infos = (array)$infos;
                return $infos_formatees = array(
                        'Nom_Retenu' => $this->supprimerBiblio($infos['nom_retenu_complet']),
                        'Num_Nom_Retenu' => $infos['nom_retenu.id'],
                        'Num_Taxon' => $infos['num_taxonomique'],
                        'Famille' => $infos['famille']
                );
        }
        
        private function supprimerBiblio($nom) {
                return preg_replace('/ \[.*\]/','',$nom);
        }
        
        public function rechercherNumTaxSurNumNom($num_nom) {
        
                $nt = null;
                $url = "http://www.tela-botanica.org/service:eflore:0.1/bdtfx/noms/".$num_nom.'?retour.champs=num_taxonomique';
                $resultat = @file_get_contents($url);
                if($resultat != '') {
                        $infos = json_decode($resultat);
                        $nt = $infos->num_taxonomique;
                }
        
                return $nt;
        }
        
        public function taxonEstPresentDansDepartement($num_taxon,$code_departement) {
                $presence_taxon = false;
                $url = 'http://localhost/service:eflore:0.1/chorodep/observations/?masque.departement='.$code_departement.'&masque.determination.nt='.$num_taxon.'&navigation.limite=1';
                $resultat = @file_get_contents($url);
                if($resultat != '') {
                        $resultat = json_decode($resultat);
                        if(is_object($resultat) && isset($resultat->resultat) && count($resultat->resultat) > 0) {
                                $presence_taxon = true;
                        }
                }
                return $presence_taxon;
        }
        
        public function effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumTax($numTax) {
                
                $infos = array();
                //TODO: retourner moins de champs grâce au paramètre retour.champs
                $url = "http://www.tela-botanica.org/service:eflore:0.1/bdtfx/taxons/nt:".$numTax;
                $resultat = @file_get_contents($url);
                if($resultat != '') {
                        $infos = json_decode($resultat);
                }

                return $infos;
        }
        
        private function decouperNomEtRechercheEspeceOuSousEspece($identifiant_espece) {
                $nameparser=new NameParser();
                $nom_latin_decoupe=$nameparser->parse($identifiant_espece);
                // requete sous espece (on privilegie les noms retenu cf tri par esn_ce_statut)
                if (isset($nom_latin_decoupe['infra']) && $nom_latin_decoupe['infra']!="") {
                        $requete="SELECT DISTINCT en_id_nom, esn_ce_statut" .
                " FROM eflore_nom, eflore_nom_rang, eflore_selection_nom " .
                " WHERE en_id_version_projet_nom = '25' AND en_nom_genre = ".$this->proteger($nom_latin_decoupe['genus'])." " .
                " AND enrg_abreviation_rang = ".$this->proteger($nom_latin_decoupe['infra_type'])." " .
                " AND en_epithete_infra_specifique = ".$this->proteger($nom_latin_decoupe['infra'])." " .
                " AND esn_id_nom= en_id_nom ".
                " AND esn_id_version_projet_taxon=en_id_version_projet_nom " .
                " AND en_epithete_espece =  ".$this->proteger($nom_latin_decoupe['species'])." AND en_ce_rang = enrg_id_rang " .
                " ORDER BY esn_ce_statut ".
                " LIMIT 1";
                }
                else { // espece  (on privilegie les noms retenu cf tri par esn_ce_statut)
                        $requete="SELECT DISTINCT en_id_nom, esn_ce_statut" .
                                " FROM eflore_nom, eflore_nom_rang, eflore_selection_nom " .
                                " WHERE en_id_version_projet_nom = '25' AND en_nom_genre = ".$this->proteger($nom_latin_decoupe['genus'])." " .
                                " AND enrg_abreviation_rang = 'sp.' " .
                                " AND esn_id_nom= en_id_nom ".
                                " AND esn_id_version_projet_taxon=en_id_version_projet_nom " .
                                " AND en_epithete_espece =  ".$this->proteger($nom_latin_decoupe['species'])." AND en_ce_rang = enrg_id_rang " .
                                " ORDER BY esn_ce_statut ".
                                " LIMIT 1";
                
                }
                
                $resultat = $this->executerRequete($requete);
                
                $retour = array();
                if (is_array($resultat) && count($resultat) > 0) {
                        $retour = $resultat[0];
                }
                
                return $retour;
        }
        
        function rechercherInfosSurTexteCodeOuNumTax($identifiant_espece) {
                // texte libre, nom scientifique, 
                // ou code nomenclatural (format BDNFFnn999999) 
                // ou code taxonomique (format BDNFFnt999999)
                $identifiant_espece=trim($identifiant_espece);
                $identifiant_espece=utf8_encode($identifiant_espece);
                
                $retour = array();
                
                preg_match('/BDNFFnn([0-9][0-9]*)/',$identifiant_espece, $elements);
                if (isset($elements[1])) {
                        // Numero nomenclatural
                        $infos_taxon = $this->rechercherInformationsComplementairesSurNumNom($elements[1]);
                        $retour = array("nom_sel" => $infos_taxon['Nom_Retenu'], "en_id_nom" => $elements[1]);
                } else { 
                        //  Numero taxonomique ou nom scientifique
                        preg_match('/BDNFFnt([0-9][0-9]*)/', $identifiant_espece, $elements);
                        if (isset($elements[1])) {
                                // Numero taxonomique
                                $infos_taxon = (array)$this->effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumTax($elements[1]);
                                if(isset($infos_taxon['nom_retenu.libelle']) && isset($infos_taxon['id'])) {
                                        $nom = $infos_taxon['nom_retenu.libelle'];
                                        $nom .= (isset($infos_taxon['auteur'])) ? ' '.$infos_taxon['auteur'] : '';
                                        $retour = array("nom_sel" => $nom, 
                                                                        "en_id_nom" => $infos_taxon['id']);
                                }
                        } else { 
                                // Nom scientifique
                                $id_nom = $this->rechercherInformationsComplementairesSurNom($identifiant_espece);
                                // Recherche du nom associe
                                $retour = array("nom_sel" => $identifiant_espece);
                                if(is_array($id_nom) && count($id_nom) > 0 && isset($id_nom[0][0])) {
                                        $nn = $id_nom[0][0];
                                        $infos_nom = (array)$this->effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($nn);
                                        if (is_array($infos_nom) && !empty($infos_nom)) {
                                                $retour = array("nom_sel" => $infos_nom['nom_sci'].' '.$infos_nom['auteur'], "en_id_nom" => $infos_nom['id']);
                                        }
                                }
                        }
                }
                
                return $retour;
        }
}
?>