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<?php/** @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>* @copyright 2013 Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)*/abstract class CommunNomsTaxons extends Commun {/** Tableau de correspondance entre les noms des champs et les codes de l'ontologie.*/private $relationsChampsCodesOntologie = null;protected $table_retour; //Permet de stocker le tableau de résultat (non encodé en json)protected $resultat_req; // Permet de stocker le résultat de la requete principale.protected $table;// Nom de la table dans laquelle on récupèrera les données dans les requetes SQLprotected $total_resultat = null;/** Stocke le service appelé correspondant. Est utilisé principalement lors de l'affichage du href d'un synonyme(ex id=12, basionyme num 25 est un synonyme) dans le service taxon */protected $service_href = null;protected $erreursParametres = null;protected $sans_nom_sci = array('gen','sp','ssp','fam','au_ss','bib_ss');private $bib_traitees = array();static $correspondance_champs = array();static $champs_api = array();static $compo_nom = null; //Stocke sous forme de tableau les composant du nom à ajouter au nom scientifiquestatic $cache_ontologies = array(); // cache des ontologies//+------------------------------- PARAMÈTRES ---------------------------------------------------------------+public function traiterParametres() {$this->definirParametresParDefaut();$this->verifierParametres();if (isset($this->parametres) && count($this->parametres) > 0) {foreach ($this->parametres as $param => $val) {switch ($param) {case 'ns.structure' :self::remplirTableCompositionNom($val);if (in_array($val,$this->sans_nom_sci)){$this->requete_champ = implode(', ',self::$compo_nom);}else {$this->requete_champ .= ' ,'.implode(', ',self::$compo_nom);}break;case 'navigation.depart' :$this->limite_requete['depart'] = $val;break;case 'navigation.limite' :$this->limite_requete['limite'] = $val;break;}}$this->traiterParametresSpecifiques();}}protected function definirParametresParDefaut() {if (empty($this->parametres['recherche'])) {$this->parametres['recherche'] = 'stricte';}if (empty($this->parametres['ns.format'])) {$this->parametres['ns.format'] = 'txt';}if (empty($this->parametres['retour.format'])) {$this->parametres['retour.format'] = 'max';}if (empty($this->parametres['ns.structure']) &&$this->parametres['retour.format'] != 'oss') {$this->parametres['ns.structure'] = 'au,an,bib';}}public function verifierParametres() {//$this->verifierParametresAPI();$this->verifierParametre('recherche', 'stricte|floue|etendue|complete');$this->verifierParametre('ns.format', 'htm|txt');$this->verifierParametre('retour.format', 'min|max|oss|perso');$this->verifierParametreAvecValeurMultipe('ns.structure', 'an|au|bib|ad|gen|sp|ssp|fam|au_ss|bib_ss');/*if (count($this->erreursParametres) > 0) {$m = 'Erreur dans votre requête : '.implode('<br/>', $this->erreursParametres);throw new Exception(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $m);}*/}public function verifierParametresAPI() {$parametresApi = Commun::recupererTableauConfig('parametresAPI');while (!is_null($parametre = key($this->parametres))) {if (!in_array($parametre, $parametresApi)) {$this->erreursParametres[] = "Le paramètre '$parametre' n'est pas pris en compte par cette version de l'API.";}next($this->parametres);}}public function verifierParametre($parametre, $valeursPermises) {if (isset($this->parametres[$parametre]) && !empty($this->parametres[$parametre])) {$valeur = $this->parametres[$parametre];$this->verifierValeursPermises($parametre, $valeur, $valeursPermises);}}public function verifierParametreAvecValeurMultipe($parametre, $valeursPermises) {if (isset($this->parametres[$parametre]) && !empty($this->parametres[$parametre])) {$valeursConcatenees = $this->parametres[$parametre];$valeurs = explode(',', $valeursConcatenees);foreach ($valeurs as $valeur) {$this->verifierValeursPermises($parametre, $valeur, $valeursPermises);}}}private function verifierValeursPermises($parametre, $valeur, $valeursPermises) {if (!in_array($valeur, explode('|', $valeursPermises))) {$this->erreursParametres[] = "Le paramètre '$parametre' ne peut pas prendre la valeur '$valeur'. Valeurs permises : $valeursPermises";}}public function ajouterFiltreMasque($nom_champ, $valeur) {$orig_val = $valeur;$valeur = explode(',',$valeur);$conditions = array();if ($nom_champ == 'annee' || $nom_champ == 'rang') {foreach ($valeur as $val) {$conditions[] = "$nom_champ = ".$this->getBdd()->proteger($val);}} else {if ($this->parametres['recherche'] == 'etendue') {foreach ($valeur as $val) {$val = self::preparerChainePourRechercheEtendue(self::remplacerCaractereHybrideEtChimere($val));$conditions[] = "$nom_champ LIKE ".$this->getBdd()->proteger($val);}} elseif ($this->parametres['recherche'] == 'floue') {foreach ($valeur as $val) {$val = $this->getBdd()->proteger($val);$conditions[] = "( SOUNDEX($nom_champ) = SOUNDEX($val))"." OR ( SOUNDEX(REVERSE($nom_champ)) = SOUNDEX(REVERSE($val)))";}// utile pour la détermination à partir d'un nom retenu (concat(nom_sci,auteur)) lors// d'un import depuis le CEL} elseif ($this->parametres['recherche'] == 'concat' && $nom_champ == 'nom_sci') {$conditions[] = "CONCAT(nom_sci, ' ', auteur) = " . $this->getBdd()->proteger($orig_val);} else {foreach ($valeur as $val) {$conditions[] = "$nom_champ LIKE ".$this->getBdd()->proteger($val);}}}$this->requete_condition[]= '('.implode(' OR ', $conditions ).')';$this->masque[$nom_champ] = $nom_champ.'='.implode(',',$valeur);}static function remplacerCaractereHybrideEtChimere($valeur) {return str_replace(array('×', '%D7', '+', '%2B'),array('x ','x ', '+', '+'),$valeur);}static function preparerChainePourRechercheEtendue($valeur) {return str_replace(' ', '% ', trim($valeur)) . '%';}//+-------------------------------Fonctions d'analyse des ressources-------------------------------------+public function traiterRessources() {if (isset($this->ressources) && count($this->ressources) > 0) {if ($this->ressources[0] == 'relations') {$this->traiterRessourceRelations();} elseif ($this->estUnIdentifiant($this->ressources[0])) { //l'identifiant peut etre de type /#id ou /nt:#id$this->traiterRessourcesIdentifiant(); // dans le service noms ou taxons} elseif ($this->ressources[0] == 'stats') { //ressource = noms/stats$this->traiterRessourcesStats();} else {$e = 'Erreur dans votre requete </br> Ressources disponibles : <br/><li> /'.$this->service.'/#id (id : L\'identifiant du nom rechercher)</li><li> /'.$this->service.'/nt:#id (id : Numero du taxon recherche)</li><li> /'.$this->service.'/stats </li>';throw new Exception(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);}}}public function traiterRessourcesStats() {$this->format_reponse = $this->service.'/stats';$e = "Erreur dans votre requête </br> Ressources disponibles : $this->service/stats/[annees|rangs|initiales]";if (isset($this->ressources[1]) && !empty($this->ressources[1])) {switch ($this->ressources[1]) {case 'annees' :$this->traiterRessourceStatsAnnees();break;case 'rangs' :$this->traiterRessourceStatsRangs();break;case 'initiales' :$this->traiterRessourceStatsInitiales();break;default :throw new Exception(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);break;}} else {throw new Exception(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);}}/** Vérifie si la première valeur de la table de ressource est un identifiant :* un numerique ou un numéro taxonomique sous la forme nt:xx */static function estUnIdentifiant($uripart) {return (is_numeric($uripart) || (strrpos($uripart,'nt:') !== false&& is_numeric(str_replace('nt:','',$uripart))));}//+------------------------------------------------------------------------------------------------------+// Fonction d'analyse des parametres/** Permet de remplir le tableau compo_nom. Il comprendra en fct du paramètre ns.structure les éléments à rajouter* au nom_sci (annee, auteur, biblio ou addendum). */static function remplirTableCompositionNom($valeur) {$structure_nom = explode(',', $valeur);foreach ($structure_nom as $structure) {$structure = trim($structure);$patterns = array('/^an$/', '/^au$/', '/^bib$/', '/^ad$/', '/^sp$/', '/^gen$/', '/^ssp$/','/^fam$/','/^au_ss$/','/^bib_ss$/');$champs = array('annee', 'auteur', 'biblio_origine', 'nom_addendum', 'epithete_sp', 'genre','epithete_infra_sp','famille','auteur', 'biblio_origine');// avec str_replace() 'sp' est inclu dans 'ssp', et la conversion pour 'ssp' est mauvaiseself::$compo_nom[$structure] = preg_replace($patterns, $champs, $structure);}}public function mettreAuFormat() {if ($this->parametres['ns.format'] == 'htm') {if (strrpos($this->requete_champ, 'nom_sci_html as nom_sci') === false) {$this->requete_champ = str_replace('nom_sci', 'nom_sci_html as nom_sci', $this->requete_champ);}}}//+------------------------------------------------------------------------------------------------------+// Fonctions de formatagepublic function formaterEnOss($resultat) {$table_nom = array();$oss = '';foreach ($resultat as $tab) {if (isset($tab['nom_sci']) ) {if (!in_array($tab['nom_sci'], $table_nom)) {$table_nom[] = $tab['nom_sci'];$oss[] = $tab['nom_sci'].' '.self::ajouterCompositionNom($tab, $this->parametres['ns.format'], $this->bib_traitees);}}else {$res = self::ajouterCompositionNom($tab, $this->parametres['ns.format'], $this->bib_traitees);if($res) {$oss[] = $res;}}}if (isset($this->masque)) $masque = implode('&', $this->masque);else $masque = 'Pas de masque';$table_retour_oss = array($masque, $oss);return $table_retour_oss;}public function afficherEnteteResultat($url_service) {$this->table_retour['depart'] = $this->limite_requete['depart'];$this->table_retour['limite'] = $this->limite_requete['limite'];$this->table_retour['total'] = $this->total_resultat;$url = $this->formulerUrl($this->total_resultat, $url_service);if (isset($url['precedent']) && $url['precedent'] != '') {$this->table_retour['href.precedent'] = $url['precedent'];}if (isset($url['suivant']) && $url['suivant'] != '') {$this->table_retour['href.suivant'] = $url['suivant'];}}public function afficherNomHrefRetenu($tab, $num) {$this->resultat_req = $tab;$this->afficherDonnees('num_nom', $num);if ($this->parametres['retour.format'] == 'min') { // sinon est affiché ds afficherDonnees(num_nom, $val) ci-dessus$this->table_retour['nom_sci'] = $tab['nom_sci'];$this->table_retour['nom_sci_complet'] = $tab['nom_sci'].' '.self::ajouterCompositionNom($tab, $this->parametres['ns.format'], $this->bib_traitees);}if ($tab['num_nom_retenu'] != '') {$retenu = ($tab['num_nom_retenu'] == $num) ? 'true' : 'false';} else {$retenu = 'absent';}$this->table_retour['retenu'] = $retenu;// Pourquoi ce unset ? JPM - 28-03-2013unset($this->table_retour['id']);}//+------------------------------------------------------------------------------------------------------+// Fonction de formatage pour les services /#id/public function formaterId($resultat) {self::$correspondance_champs = Commun::recupererTableauConfig('correspondance_champs');foreach (self::$correspondance_champs as $key => $val) {preg_match('/(hybride[.]parent_0[12](?:[.]notes)?|nom_sci[.][^.]+|[^.]+)(?:[.](id|code))?/', $val, $match);self::$champs_api[$key] = $match[1];}$this->resultat_req = $resultat;foreach ($resultat as $cle => $valeur) {if ($valeur != '') {$this->afficherDonnees($cle, $valeur);}}if (isset($this->parametres['retour.champs']) && $this->format_reponse == 'noms/id') {$retour = $this->table_retour;$this->table_retour = array();$champs = explode(',', $this->parametres['retour.champs']);self::ajouterChampsPersonnalises($champs, $retour, $this->champs_table, $this->table_retour, $this->resultat_req);}unset($this->table_retour['href']);return $this->table_retour;}public function formaterIdChamp($resultat) {self::$correspondance_champs = Commun::recupererTableauConfig('correspondance_champs');foreach (self::$correspondance_champs as $key => $val) {preg_match('/(hybride[.]parent_0[12](?:[.]notes)?|nom_sci[.][^.]+|[^.]+)(?:[.](id|code))?/', $val, $match);self::$champs_api[$key] = $match[1];}$reponse_id = $this->formaterId($resultat);$this->table_retour = array();$champs = explode(' ', $this->ressources[1]);self::ajouterChampsPersonnalises($champs, $reponse_id, $this->champs_table, $this->table_retour, $this->resultat_req);return $this->table_retour;}static function ajouterChampsPersonnalises($champs, $reponse_id, $champs_table, &$retour, $resultat_req) {$champs_a_libeller = array('nom_retenu', 'rang', 'basionyme', 'hybride', 'hybride.parent_01','hybride.parent_02', 'presence', 'tax_sup', 'statut_origine', 'statut_culture', 'statut_introduction');if (! is_null($champs) && is_array($champs) && count($champs) > 0) {foreach ($champs as $champ) {if (! self::verifierValiditeChamp($champ, $champs_table)) continue;if (strrpos($champ, '.*') !== false) {self::afficherPointEtoile($champ, $reponse_id, $retour, $resultat_req);} elseif (in_array($champ, $champs_a_libeller)) {$retour[$champ.'.libelle'] =(isset($reponse_id[$champ.'.libelle'])) ? $reponse_id[$champ.'.libelle'] : null;} else {$champ_bdd = self::trouverChampBddCorrespondant($champ);$retour[$champ_bdd] = isset($reponse_id[$champ_bdd]) ? $reponse_id[$champ_bdd] : null;}}}}static function afficherPointEtoile($champ, $reponse, &$retour, $resultat_req) {preg_match('/^([^.]+\.)\*$/', $champ, $match);if ($match[1] == 'nom_sci') {self::afficherNomSciPointEpithete($resultat_req, $retour);} else {foreach ($reponse as $chp => $valeur) {if (strrpos($chp, $match[1]) !== false) {if ($valeur != '') {$retour[$chp] = $valeur;} else {$retour[$chp] = null;}}}}}static function verifierValiditeChamp($champ, $champs_table) {if (! preg_match('/^(?:([^.]+\.parent_0[12]|[^.]+))(?:\.(.+))?$/', $champ, $match)) {return true;}// decomposerNomChamp()$radical = $match[1];$suffixe = isset($match[2]) ? $match[2] : "";$champs_complementaire = array('nom_retenu_complet', 'basionyme_complet');// on verifie si le nom du champ existe bien$champs_complementaire2 = array_diff($champs_table, array_keys(self::$champs_api)); // XXXif (! self::estChampApi($radical) && ! in_array($radical_champ, $champs_complementaire2)) {if (!in_array($radical, $champs_complementaire)) {throw new Exception(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, 'Le champ "'.$radical.'" n\'existe pas dans la base. <br/><br/>');return FALSE;}} elseif (self::estUnPoint($champ)) {return self::verifierValiditeSuffixe($suffixe, $radical);}return TRUE;}static function estChampApi($radical_champ) {$champ_api_ok = false;if (in_array($radical_champ, self::$champs_api) || in_array($radical_champ, self::$correspondance_champs)) {$champ_api_ok = true;}return $champ_api_ok;}static function verifierValiditeSuffixe($suffixe, $radical_champ) {$validite_ressource = true;if (self::correspondAUnId($radical_champ) || $radical_champ == 'id') {self::verificationSuffixesIdentifiant($suffixe, $radical_champ, $validite_ressource);} elseif (self::correspondAUnCode($radical_champ)) {if (!in_array($suffixe, array('*', 'code', 'href', 'details'))) {throw new Exception(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, 'Erreur : Le suffixe demandé n\'existe pas pour le champ "'.$radical_champ.'.<br/> Les suffixes possibles sont les suivants : <li> .* </li><li> .code </li><li> .href </li><li> .details </li>');}} elseif ($radical_champ == 'nom_sci') {if ($suffixe != '*') {$validite_ressource = false;$m = 'Erreur : Le suffixe demandé n\'existe pas pour le champ "'.$radical_champ.'".<br/>Les suffixes possibles sont les suivants : <li> * </li>';throw new Exception( RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $m);}} else {$validite_ressource = false;$m = 'Erreur : Le paramètre "'.$radical_champ.'" ne peut pas présenter de suffixe. <br/><br/>';throw new Exception( RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $m);}return $validite_ressource;}static function verificationSuffixesIdentifiant(&$suffixe, &$radical_champ, &$validite_ressource) {if ((strrpos($radical_champ, 'parent') !== false && !in_array($suffixe, array('*', 'id', 'href', 'details', 'notes')))|| !in_array($suffixe, array('*', 'id', 'href', 'details')) && strrpos($radical_champ, 'parent') === false) {$validite_ressource = false;$e = 'Erreur : Le suffixe demandé n\'existe pas pour le champ "'.$radical_champ.'".<br/> Les suffixes '.'possibles sont les suivants : <li> .* </li><li> .id </li><li> .href </li><li> .details </li>'.'<li> .notes (seulement pour les hybride.parent)';throw new Exception( RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);}}//------------------------------fonction de formatage pour les services /stats/-----------------------------------------public function formaterStatsInitiales($resultat) {$rang = null;$table_rang = array();foreach ($resultat as $tuple) {if ($tuple['rang'] != 0) {$this->memoriserRang($table_rang, $tuple, $rang);if ($tuple['lettre'] == 'x ') {self::ajouterHybrideChimere('hybride', $this->retour[$rang], $tuple);} elseif ($tuple['lettre'] == '+ ') {self::ajouterHybrideChimere('chimere', $this->retour[$rang], $tuple);} else {$l = substr($tuple['lettre'], 0, 1);if (isset($this->table_retour[$rang][$l])) {$this->table_retour[$rang][substr($tuple['lettre'], 0, 1)] += floatval($tuple['nb']);} else {$this->table_retour[$rang][substr($tuple['lettre'], 0, 1)] = floatval($tuple['nb']);}}}}return $this->table_retour;}public function memoriserRang(&$table_rang, $tuple, &$rang) {if (is_array($table_rang)) {if (!in_array($tuple['rang'], $table_rang)) {$rang = $tuple['rang'];$table_rang[] = $rang;if ($this->parametres['retour.format'] == 'max') {$rang = self::ajouterSignificationCode('rang', $rang, $this->getBdd());}}}}static function ajouterHybrideChimere($groupe, &$tab, &$tuple) {if (isset($tab[str_replace('hybride', 'hyb', $groupe)])) {$tab[$groupe] += floatval($tuple['nb']);} else {$tab[$groupe] = floatval($tuple['nb']);}}//-----------------------------Fonctions d'affichage utiliser dans les fonctions de formatage---------------------------public function afficherDonnees($champApi, $valeur) {$champBdd = self::trouverChampBddCorrespondant($champApi);if ($this->parametres['retour.format'] == 'min') {if ($champApi == 'nom_sci') {$valeur = $valeur.' '.self::ajouterCompositionNom($this->resultat_req, $this->parametres['ns.format'], $this->bib_traitees);}if ($champApi == 'nom_sci_html') {$valeur = $valeur.' '.self::ajouterCompositionNom($this->resultat_req, 'htm', $this->bib_traitees);}$this->table_retour[$champBdd] = $valeur;// on essaye de permettre l'obtention du nom_sci_complet, y compris en retour.format == 'min',// tout en évitant les appels aux ontologies/*if ($this->correspondAUnId($champBdd) || $champBdd == 'id' && $valeur != '0') {preg_match('/^([^.]+\.parent_0[12]|[^.]+)(?:\.id)?$/', $champBdd, $match);if(strpos($this->parametres['retour.format'], $match[1]) !== false) $this->afficherSignification($match[1], $valeur);}*/} else {$this->afficherToutesLesInfos($champBdd, $valeur);}}static function trouverChampBddCorrespondant($champApi) {if (array_key_exists($champApi, self::$champs_api)) {$champBdd = self::$correspondance_champs[$champApi];} else {$champBdd = $champApi;}return $champBdd;}public function afficherToutesLesInfos($nom_champ_api, $valeur) {if ($this->presentePlusieursId($nom_champ_api, $valeur)) {preg_match('/^([^.]+\.parent_0[12]|[^.]+)(?:\.id)?$/', $nom_champ_api, $match);$this->afficherInfosPrecises($match[1], 'details', $valeur, $this->table_retour);$this->table_retour[$nom_champ_api] = $valeur;} elseif (strrpos($nom_champ_api, 'parent') !== false && strrpos($nom_champ_api, 'notes') !== false) {$this->table_retour[$nom_champ_api] = $valeur;} elseif ((self::correspondAUnId($nom_champ_api) || $nom_champ_api == 'id' && $valeur != '0')) {preg_match('/^([^.]+\.parent_0[12]|[^.]+)(?:\.id)?$/', $nom_champ_api, $match);$this->afficherInfosPrecises($match[1], 'id,href', $valeur, $this->table_retour);self::afficherSignification($match[1], $valeur, $obj->resultat_req, $this->table_retour, $this->getBdd(), $this);} elseif (self::correspondAUnCode($nom_champ_api)) {preg_match('/^([^.]+)(?:\.code)?$/', $nom_champ_api, $match);$this->afficherInfosPrecises($match[1], 'code,href', $valeur, $this->table_retour);self::afficherSignification($match[1], $valeur, $obj->resultat_req, $this->table_retour, $this->getBdd(), $this);} elseif ($nom_champ_api == 'nom_sci_html') {$this->table_retour['nom_sci_html'] = $valeur;$this->table_retour['nom_sci_html_complet'] = $valeur.' '.self::ajouterCompositionNom($this->resultat_req, 'htm', $this->bib_traitees);} elseif ($nom_champ_api != 'nom_sci') {$this->table_retour[$nom_champ_api] = $valeur;}}public function presentePlusieursId($ressource, $valeur = null) {if ($valeur) {$presente = strrpos($ressource, 'proparte') !== false && strrpos($valeur, ',') !== false;} else { //pour la vérification du champ, on ignore alors la valeur de la ressource$presente = strrpos($ressource, 'proparte') !== false;}return $presente;}public function afficherInfosPrecises($champ, $suffixe, $valeur, &$retour) {$suffixes = explode(',', $suffixe);//on initialise au service appelé. Sera potentiellement modifié dans la fonction afficherSignification()$this->service_href = $this->service;foreach ($suffixes as $suffixe) {switch ($suffixe) {case 'id' :$retour[str_replace('id.id', 'id', $champ.'.id')] = $valeur;break;case 'details' :$tab_id = explode(',', $valeur);$tab_res = $retour;$retour = array();foreach ($tab_id as $id) {$this->afficherInfosPrecises($champ, 'id,signification,href', $id, $retour);$tab_res[$champ.'.details'][] = $retour;$retour = array();}$retour = $tab_res;break;case 'href' :$retour[str_replace('id.href', 'href', $champ.'.href')] = self::creerUrl($champ, $valeur, $this->version_projet);break;case 'code' :$retour[$champ.'.code'] = "bdnt." . self::transformerChampEnCode($champ) . ":$valeur";break;case 'notes' :$retour[$champ.'.notes'] = $this->resultat_req[str_replace('.', '_', $champ).'_notes'];break;default : break;}}}static function transformerChampEnCode($champ) {static $tab;$tab = Outils::recupererTableauConfig('ChampsCodesOntologie');if (!array_key_exists($champ, $tab)) return $champ;return $tab[$champ];}static function creerUrl($champ, $valeur, $version_projet) {if (self::correspondAUnId($champ) || $champ == 'id') {$service = $this->service_href;$url = self::s_ajouterHref($service, $valeur, $version_projet);} else {$code = self::transformerChampEnCode($champ);$url = self::ajouterHrefAutreProjet('ontologies', "$code:", $valeur, 'bdnt');}return $url;}static function afficherSignification($champ, $valeur, $resreq, &$retour, $db, $obj) {$fmt = $obj->parametres['ns.format'];if ($champ == 'id' && isset($resreq['nom_sci']) && $resreq['num_nom'] == $valeur) {//si le nom_sci du num_nom que l'on veut afficher est déjà dans la table de résultat :$retour['nom_sci'] = $resreq['nom_sci'];$retour['nom_sci_complet'] = $resreq['nom_sci'] . (($suff = self::ajouterCompositionNom($resreq, $fmt, $obj->bib_traitees)) ? ' ' . $suff : '');return ;}if (self::correspondAUnCode($champ)) {$retour[$champ.'.libelle'] = self::ajouterSignificationCode($champ, $valeur, $db);return ;}if (self::correspondAUnId($champ) || $champ == 'id') {// $nom = $obj->recupererNomSci($valeur);$id = $valeur;$nom = array();if ($id != 0) {if (self::$compo_nom == null) {$req = 'SELECT nom_sci, num_nom_retenu, nom_sci_html FROM '.$obj->table.' WHERE num_nom = '.$id;} else { //on ajoute à la requete sql, les champs de ns.structure//print_r(self::$compo_nom);$req = 'SELECT nom_sci, num_nom_retenu, nom_sci_html, '.implode(', ', self::$compo_nom).' FROM '.$obj->table.' WHERE num_nom = '.$id;}if ($fmt == 'htm') {$req = str_replace('nom_sci', 'nom_sci_html as nom_sci', $req);}$res = $db->recuperer($req . ' -- ' . __FILE__ . ':' . __LINE__);if ($res) {$nom['nom_sci'] = $res['nom_sci'];$nom['nom_sci_html'] = $res['nom_sci_html'];$nom['nom_sci_complet'] = $res['nom_sci'].' '.self::ajouterCompositionNom($res, $fmt, $obj->bib_traitees);$nom['nom_sci_complet_html'] = $res['nom_sci_html'].' '.self::ajouterCompositionNom($res, 'htm', $obj->bib_traitees);$nom['service'] = ($res['num_nom_retenu'] == $id && $obj->service == 'taxons') ? 'taxons' : 'noms';}}if ($nom != array()) {$retour[$champ.'.libelle'] = $nom['nom_sci'];$retour[$champ.'_html'] = $nom['nom_sci_html'];$retour[$champ.'_complet'] = $nom['nom_sci_complet'];$retour[$champ.'_html_complet'] = $nom['nom_sci_complet_html'];$obj->service_href = $nom['service'];}}}/** Permet d'afficher les élements nomenclatural du nom_sci lors de l'appel dans le service noms/id/champ du champ^nom_sci.*/static function afficherNomSciPointEpithete($resultat, &$retour) {$tab_nom_sci = array('nom_supra_generique', 'genre', 'epithete_infra_generique', 'epithete_sp','type_epithete', 'epithete_infra_sp', 'cultivar_groupe', 'cultivar', 'nom_commercial');foreach ($tab_nom_sci as $compo_nom) {if (isset($resultat[$compo_nom]) && !empty($resultat[$compo_nom])) {$table_retour['nom_sci.'.$compo_nom] = $resultat[$compo_nom];}}}static function ajouterSignificationCode($champ, $valeur, $db) {// ontologie/cacheif(array_key_exists($champ, self::$cache_ontologies) && array_key_exists($valeur, self::$cache_ontologies[$champ])) {$nom_code = self::$cache_ontologies[$champ][$valeur];} else {$code = self::transformerChampEnCode($champ);if (preg_match('/^([^_-]+)(?:_|-)([^_-]+)$/', $code, $match)) {$code = $match[1].ucfirst($match[2]);}$requete = sprintf('SELECT * FROM %1$s WHERE id IN (SELECT id FROM %1$s WHERE code = "%2$s" AND classe_id = (SELECT id FROM %1$s WHERE code = "%3$s")) LIMIT 0, 100 -- %4$s:%5$s',Config::get('bdd_table_ontologies'), $valeur, $code, __FILE__, __LINE__);$res = $db->recuperer($requete);$nom_code = $valeur;if (is_array($res)) {$nom_code = $res['nom'];}// cacheself::$cache_ontologies[$champ][$valeur] = $correspondance;}return $nom_code;}/** Permet de retourner une chaine de caractère composée des parametres du nom (ns.structure : annnée, auteur,* bibilio et addendum). A ajouter au nom scientifique */static function ajouterCompositionNom($tab_res, $format, &$bib_traitees) {if(!self::$compo_nom) return '';if ($format == 'htm') {$format = array('au' => '<span class="auteur">%s</span>','an' => '[<span class="annee">%s</span>]','an_bib' => '[<span class="annee">%s</span>, <span class="biblio">%s</span>]','bib' => '[<span class="biblio">%s</span>]','ad' => '[<span class="adendum">%s</span>]');} else {$format = array('au' => '%s','an' => '[%s]','an_bib' => '[%s, %s]','bib' => '[%s]','ad' => '[%s]','gen' => '%s','sp' => '%s','ssp' => '%s','fam' => '%s','au_ss' => '%s','bib_ss' => '%s');}$compo_nom_arr = array();foreach (self::$compo_nom as $key => $champ) {if (isset($tab_res[$champ]) && !empty($tab_res[$champ])) {$compo_nom_arr[$key] = $tab_res[$champ];}}return rtrim(implode(' ', self::formerNomComplet($compo_nom_arr, $format, $bib_traitees)), ' ');}static function formerNomComplet($compo_nom_arr, $format, &$bib_traitees) {$nom_complet = array();extract($compo_nom_arr);if (isset($au)) $nom_complet[] = sprintf($format['au'], $au);if (isset($an)) {if (isset($bib)) {$nom_complet[] = sprintf($format['an_bib'], $an, $bib);} else {$nom_complet[] = sprintf($format['an'], $an);}} elseif (isset($bib)) {$nom_complet[] = sprintf($format['bib'], $bib);}if (isset($ad)) $nom_complet[] = sprintf($format['ad'], $ad);if (isset($gen)) $nom_complet[] = sprintf($format['gen'], $gen);if (isset($ssp)) $nom_complet[] = sprintf($format['ssp'], $ssp);if (isset($sp)) $nom_complet[] = sprintf($format['sp'], $sp);if (isset($fam)) $nom_complet[] = sprintf($format['fam'], $fam);if (isset($au_ss)) $nom_complet[] = sprintf($format['au_ss'], $au_ss);if (isset($bib_ss)) {$bibl = self::tronquerBiblio($bib_ss);//simule un 'select distinct' sur les biblio tronquéesif (!isset($bib_traitees[$bibl])) {$nom_complet[] = sprintf($format['bib_ss'],$bibl );$bib_traitees[$bibl] = 1;}}return $nom_complet;}static function tronquerBiblio($valeur){$bib = '';if(strpos($valeur,',') !== false) {$bib = explode(',',$valeur);}if(strpos($bib[0],';') !== false) {$bib[0] = strstr($bib[0],';');$bib[0] = str_replace('; ','',$bib[0]);}return $bib[0];}static function correspondAUnCode($key) {return strrpos($key, '.code') !== false || in_array($key.'.code', self::$correspondance_champs);}static function correspondAUnId($key) {return strrpos($key, '.id') !== false || in_array($key.'.id', self::$correspondance_champs);}static function estUnPoint($key) {if (strrpos($key, 'hybride.parent') !== false) {$key = str_replace('hybride.parent', 'hybride_parent', $key);}return (strrpos($key, '.') !== false);}public function recupererMasquePrincipal() {$masque = null;$tab_masque = array('masque' => 'nom_sci','masque_sg' => 'nom_supra_generique','masque_gen' => 'genre','masque_sp' => 'epithete_sp','masque_ssp' => 'epithete_infra_sp','masque_au' => 'auteur','masque_an' => 'annee','masque_bib' => 'biblio_origine','masque_ad' => 'addendum','masque_rg' => 'rang');$liste_masque = array();if (isset($this->masque['num_nom'])) {$liste_masque[] = $this->masque['num_nom'];}foreach ($tab_masque as $key => $filtre) {if (isset($this->masque[$filtre])) {if (!isset($masque) && !in_array($filtre, array('rang', 'annee'))) {$masque = array($key, $filtre);}$liste_masque[] = $this->masque[$filtre];}}$this->masque = $liste_masque;return $masque;}}