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<?php
// declare(encoding='UTF-8');
/**
* Classe Controleur du module Fiche Taxon.
*
* @category Php 5.2
* @package Taxon
* @author Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org>
* @copyright 2010 Tela-Botanica
* @license http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-fr.txt Licence CECILL
* @license http://www.gnu.org/licenses/gpl.html Licence GNU-GPL
* @version SVN: $Id: Fiche.php 96 2010-06-21 16:46:31Z jpm $
*/
class FicheTaxon extends AppliControleur {
private $donnees = array();
protected $taxonDao = null;
private $tableau_manuel = null;
private $num_taxon = array(0=>0,1=>0,2=>0);
private $type_synonymie = array(
'n' => 'Synonymie nomenclaturale',
't' => 'Synonymie taxonomique',
'i' => 'Synonymie indéterminée (pas de basionyme)',
'd' => 'Synonymie douteuse',
'o' => 'Synonymie orthographique',
'ma' => 'Synonymie mal appliquée',
'pp' => 'Synonymie pro parte',
'h' => 'Homonymie (sensu)',
'b' => 'Basionyme commun');
//+----------------------------------------------------------------------------------------------------------------+
// Méthodes
/**
* Fonction d'affichage par défaut
*/
public function executerActionParDefaut() {
return $this->afficherTaxon();
}
// +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------+
// FICHE CONSULTATION TAXON
public function afficherTaxon() {
// Récupération du référentiel
if (isset($_GET['ref'])) {
$this->referentiel = strtolower($_GET['ref']);
}
// Gestion des actions par défaut
$this->taxonDao = new TaxonDao();
$this->definirCommeModulePrincipal(get_class($this));
$this->construireMenu($this->referentiel);
$this->construireFilAriane($this->referentiel);
$this->executerActionReferentiel('Recherche', 'chargerMoteurRecherche', $this->referentiel);
// Gestion des données de la requête
if (!isset($_GET['num_nom'])) {
} else {
// Récupération des données
$this->donnees['referentiel'] = $this->referentiel;
$this->donnees['num_nom'] = $_GET['num_nom'];
$this->donnees['info'] = $this->taxonDao->getTaxon($this->referentiel, $this->donnees['num_nom']);
$this->donnees['num_nom_retenu'] = $this->donnees['info']['num_nom_retenu'];
$this->donnees['nom'] = $this->donnees['info']['nom_complet'];
if ($this->donnees['info'] != '') {
// Chargement des données des onglets
$this->chargerNomenclature();
$this->chargerSynonymie();
$this->chargerClassification();
$this->chargerChorologie();
$this->chargerComplements();
}
$this->setSortie(self::RENDU_CORPS, $this->getVue('fiche_taxon', $this->donnees));
}
}
private function chargerNomenclature() {
$this->donnees['selectionne'] = $this->taxonDao->getNomenclature($this->referentiel, $this->donnees['num_nom']);
if (strpos($this->donnees['nom'], ' x ') ) {
if ($this->donnees['num_nom'] != $this->donnees['num_nom_retenu'] && $this->donnees['num_nom_retenu'] != '') {
$this->donnees['retenu'] = $this->taxonDao->getNomenclature($this->referentiel, $this->donnees['num_nom_retenu']);
$this->donnees['parents'] = $this->taxonDao->getParentsHybride($this->referentiel, $this->donnees['num_nom_retenu']);
} else {
$this->donnees['parents'] = $this->taxonDao->getParentsHybride($this->referentiel, $this->donnees['num_nom']);
}
} else {
if ($this->donnees['num_nom'] != $this->donnees['num_nom_retenu'] && $this->donnees['num_nom_retenu'] != '') {
$this->donnees['retenu'] = $this->taxonDao->getNomenclature($this->referentiel, $this->donnees['num_nom_retenu']);
}
}
}
// recherche les synonymes (à compléter)
private function chargerSynonymie() {
$rechercheDao = new RechercheDao();
$this->donnees['type_synonymie'] = $this->type_synonymie;
// recherche des synonymes nomenclaturaux et taxonomiques
$parametres = $this->parserChaineDeRecherche('nn:'.$this->donnees['num_nom'].' tax:1');
$parametres['ref']= $this->referentiel;
$synonymes = $rechercheDao->chercher('ParTaxon', $parametres);
if ($synonymes != '') {
foreach ($synonymes as $synonyme) {
$this->trierSynonymesNomenclaturauxTaxonomiques($synonyme);
$this->trierSynonymesMalAppliques($synonyme);
$this->trierSynonymesOrthographiques($synonyme);
}
}
// synonyme douteux
if ($this->donnees['info']['synonyme_douteux'] == 1) {
$this->donnees['fiche_synonymie']['d']['num_nom'] = $this->donnees['info'];
}
// synonyme proparte
if ($this->donnees['info']['synonyme_proparte'] != ''){
$propartes = preg_split('/;/', $this->donnees['info']['synonyme_proparte']);
foreach ($propartes as $protarte) {
$this->donnees['fiche_synonymie']['pp'] =
$this->taxonDao->getTaxonAffichage($this->referentiel, $proparte);
}
}
// homonymie
$nom = $this->encodeChaine($this->donnees['info']['nom_complet']);
$homonymes = $this->taxonDao->getHomonyme($this->referentiel, $nom);
if (count($homonymes) > 1) {
foreach ($homonymes as $id => &$homonyme) {
$homonyme['statut'] = $homonyme['homonyme'];
}
$this->donnees['fiche_synonymie']['h'] = $homonymes;
}
// Même basionyme
if ($this->donnees['info']['basionyme'] != '') {
$basionyme_commun = $this->taxonDao->getNomsBasionymeCommun($this->referentiel, $this->donnees['info']['basionyme']);
foreach ($basionyme_commun as $nom) {
if ($nom['num_nom_retenu'] != $this->donnees['num_nom_retenu']) {
$this->donnees['fiche_synonymie']['b'][] = $nom;
}
}
}
}
private function trierSynonymesNomenclaturauxTaxonomiques($synonyme) {
if ($this->donnees['num_nom'] != $synonyme['num_nom'] && $synonyme['basionyme'] != null) {
if (($this->donnees['num_nom'] != $synonyme['num_nom']) && ($synonyme['basionyme'] ==
$this->donnees['num_nom'] || $this->donnees['info']['basionyme'] == $synonyme['num_nom'] ||
$this->donnees['info']['basionyme'] == $synonyme['basionyme'])) {
$this->donnees['fiche_synonymie']['n'][] = $synonyme;
} elseif ($this->donnees['num_nom'] != $synonyme['num_nom'] && $synonyme['basionyme'] != null &&
$this->donnees['info']['basionyme'] != null) {
$this->donnees['fiche_synonymie']['t'][] = $synonyme;
}
} elseif ($this->donnees['num_nom'] != $synonyme['num_nom']) {
$this->donnees['fiche_synonymie']['i'][] = $synonyme;
}
}
private function trierSynonymesMalAppliques($synonyme) {
if ($synonyme['synonyme_mal_applique'] == 1) {
if ($synonyme['num_nom'] == $synonyme['num_nom_retenu']) {
$synonyme['statut'] = 'posséde des synonymes mal appliqués';
} else {
$synonyme['statut'] = 'est synonyme mal appliqué du num_nom '.$synonyme['num_nom_retenu'];
}
$this->donnees['fiche_synonymie']['ma'][] = $synonyme;
}
}
private function trierSynonymesOrthographiques($synonyme) {
if (isset($synonyme['synonyme_orthographique']) && $synonyme['synonyme_orthographique'] != '') {
if ($synonyme['synonyme_orthographique'] == $synonyme['num_nom']) {
$synonyme['statut'] = 'posséde des synonymes orthographiques';
} else {
$synonyme['statut'] = 'est synonyme orthographique du num_nom '.$synonyme['synonyme_orthographique'];
}
$this->donnees['fiche_synonymie']['o'][] = $synonyme;
}
}
private function chargerChorologie() {
$this->chargerTableauManuel('presence');
$this->chargerTableauManuel('statuts_origine');
$this->chargerTableauManuel('statuts_introduction');
$this->chargerTableauManuel('statuts_culture');
foreach ($this->donnees['info'] as $param => $valeur) {
if ($param == 'presence') {
$this->donnees['chorologie']['Présence']['France']['code'] = $valeur;
$this->donnees['chorologie']['Présence']['France']['valeur'] = $this->tableau_manuel['presence'][$valeur];
} elseif (preg_match('/presence_(.*)/', $param, $lieu)) {
$this->donnees['chorologie']['Présence'][$lieu['1']]['code'] = $valeur;
$this->donnees['chorologie']['Présence'][$lieu['1']]['valeur'] = $this->tableau_manuel['presence'][$valeur];
} elseif ($param == 'statut_origine') {
$this->donnees['chorologie']['Statut d\'origine']['France']['code'] = $valeur;
$this->donnees['chorologie']['Statut d\'origine']['France']['valeur'] =
$this->tableau_manuel['statuts_origine'][$valeur];
} elseif (preg_match('/statut_origine_(.*)/', $param, $lieu)) {
$this->donnees['chorologie']['Statut d\'origine'][$lieu['1']]['code'] = $valeur;
$this->donnees['chorologie']['Statut d\'origine'][$lieu['1']]['valeur'] =
$this->tableau_manuel['statuts_origine'][$valeur];
} elseif ($param == 'statut_introduction') {
$this->donnees['chorologie']['Statut d\'introduction']['France']['code'] = $valeur;
$this->donnees['chorologie']['Statut d\'introduction']['France']['valeur'] =
$this->tableau_manuel['statuts_introduction'][$valeur];
} elseif (preg_match('/statut_introduction_(.*)/', $param, $lieu)) {
$this->donnees['chorologie']['Statut d\'introduction'][$lieu['1']]['code'] = $valeur;
$this->donnees['chorologie']['Statut d\'introduction'][$lieu['1']]['valeur'] =
$this->tableau_manuel['statuts_introduction'][$valeur];
} elseif ($param == 'statut_culture') {
$this->donnees['chorologie']['Statut de culture']['France']['code'] = $valeur;
$this->donnees['chorologie']['Statut de culture']['France']['valeur'] =
$this->tableau_manuel['statuts_culture'][$valeur];
} elseif (preg_match('/statut_culture_(.*)/', $param, $lieu)) {
$this->donnees['chorologie']['Statut de culture'][$lieu['1']]['code'] = $valeur;
$this->donnees['chorologie']['Statut de culture'][$lieu['1']]['valeur'] =
$this->tableau_manuel['statuts_culture'][$valeur];
}
}
foreach ($this->donnees['chorologie']['Présence'] as $lieu => $valeur) {
if (!isset($this->donnees['chorologie']['Statut d\'origine'][$lieu])) {
$this->donnees['chorologie']['Statut d\'origine'][$lieu]['code'] = '';
}
if (!isset($this->donnees['chorologie']['Statut d\'introduction'][$lieu])) {
$this->donnees['chorologie']['Statut d\'introduction'][$lieu]['code'] = '';
}
if (!isset($this->donnees['chorologie']['Statut de culture'][$lieu])) {
$this->donnees['chorologie']['Statut de culture'][$lieu]['code'] = '';
}
}
}
private function chargerClassification() {
$this->chargerTableauManuel('signification_rang');
$this->donnees['valeur_rang'] = $this->tableau_manuel['signification_rang'];
if ($this->donnees['info']['num_tax_sup'] != '' || isset($this->donnees['retenu']['num_tax_sup'])) {
if ($this->donnees['num_nom'] == $this->donnees['num_nom_retenu']) {
$this->donnees['classification']['supérieurs'] = array_reverse($this->taxonDao->getClassification
('Superieur', $this->referentiel, $this->donnees['info']['num_tax_sup']));
} else {
$this->donnees['classification']['supérieurs'] = array_reverse($this->taxonDao->getClassification
('Superieur', $this->referentiel, $this->donnees['retenu']['num_tax_sup']));
}
}
if ($this->donnees['num_nom_retenu'] != '') {
$class_inf = $this->taxonDao->getClassification
('Inferieur', $this->referentiel, $this->donnees['num_nom_retenu']);
if ($class_inf != '') {
$this->donnees['classification']['inférieurs'] = $class_inf['inf'];
$this->donnees['niveau'] = $class_inf['niveau'];
}
}
}
private function chargerComplements() {
$champs_manuel_technique = explode(',', $this->manuel['champs']);
$champs_base_donnees = key($this->donnees['info']);
$champs_supp_base = array_diff_key($this->donnees['info'], array_flip($champs_manuel_technique));
foreach ($champs_supp_base as $champ=>$valeur) {
if (!(preg_match('/presence_(.*)/',$champ) || preg_match('/statut_origine_(.*)/', $champ) ||
preg_match('/statut_introduction_(.*)/', $champ) || preg_match('/statut_culture_(.*)/', $champ))) {
$this->donnees['complement'][$champ] = $valeur;
}
}
}
private function parserChaineDeRecherche($chaine) {
$mots = preg_split('/ /i', $chaine, -1, PREG_SPLIT_NO_EMPTY);
$parametres = array('mots' => '');
$cle_precedente = null;
foreach ($mots as $mot) {
if (preg_match('/^(sg|gen|sp|ssp|au|an|nn|bib|nr|tax):(.*)$/', $mot, $match)) {
$cle = $match[1];
$cle_precedente = $cle;
$valeur = $match[2];
$parametres[$cle] = $valeur;
} else if (!is_null($cle_precedente)) {
$parametres[$cle_precedente] .= ' '.$mot;
} else if (is_null($cle_precedente)) {
if (empty($parametres['mots'])) {
$parametres['mots'] = $mot;
} else {
$parametres['mots'] .= ' '.$mot;
}
}
}
return $parametres;
}
public function encodeChaine($chaine) {
if (Config::get('sortie_encodage') != Config::get('appli_encodage')) {
$chaine = mb_convert_encoding($chaine, Config::get('sortie_encodage'), Config::get('appli_encodage'));
}
$chaine = urlencode($chaine);
return $chaine;
}
// retourne l'url de la fiche taxon pour les liens
public static function getUrlFicheTaxon($params, $type) {
$taxon = null;
switch ($type) {
case 'bas' :
$taxon['num_nom'] = $params['bas_num'];
break;
case 'p1' :
$taxon['num_nom'] = $params['p1_num'];
break;
case 'p2' :
$taxon['num_nom'] = $params['p2_num'];
break;
default :
break;
}
return Recherche::getUrlFicheTaxon($taxon);
}
// charger tableau de $this->manuel
private function chargerTableauManuel($titreTableau) {
$champs = explode(',', $this->manuel[$titreTableau]);
foreach ($champs as $champ) {
list($champ_nom, $type) = explode('=', trim($champ));
$this->tableau_manuel[$titreTableau][$champ_nom] = $type;
}
}
}