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<?php
// declare(encoding='UTF-8');
/**
* Classe Controleur du module Accueil.
* Affichage les infos sur l'ensemble des référentiels disponibles.
*
* @package Referentiel
* @category Php5.2
* @author Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org>
* @copyright 2010 Tela-Botanica
* @license http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-fr.txt Licence CECILL
* @license http://www.gnu.org/licenses/gpl.html Licence GNU-GPL
* @version SVN: $Id$
*/
class Informations extends AppliControleur {
private $referentiel = null;
private $referentielDao = null;
private $rechercheDao = null;
private $traitementDao = null;
private $resultatDao = null;
private $metaDao = null;
private $colonnesOrdonnees = array();
public function __construct() {
parent::__construct();
// Récupération de paramêtres
if (isset($_GET['ref'])) { // code du projet courrant
$this->referentiel = strtolower(strip_tags($_GET['ref']));
}
// Chargement des DAO nécessaires
$this->resultatDao = new ResultatDao();
$this->traitementDao = new TraitementDao();
$this->referentielDao = new ReferentielDao();
$this->rechercheDao = new RechercheDao();
$this->metaDao = new MetaDao();
// tableau colonnesOrdonnees à modifier aussi dans service/Recherche.php
$this->colonnesOrdonnees = array("nn" => array("Numéro nomenclatural","checked","Identifiant numérique du nom scientifique"),
"nr" => array("Numéro nomenclatural du nom retenu","checked","Identifiant numérique du nom scientifique (num_nom) retenu pour désigner le taxon"),
"nt" => array("Numéro taxonomique","checked","Identifiant numérique du taxon auquel est rattaché le nom"),
"cd" => array("Numéro INPN","checked","Identifiant numérique unique du nom scientifique attribué par l’INPN"),
"rg" => array("Code rang","checked","Code numérique indiquant le rang du nom scientifique (voir tableau 7 du manuel technique)"),
"fam" => array("Famille (APG III)","checked","Nom de la famille dans APG III"),
"nsc" => array("Nom avec auteur","checked","Nom scientifique avec auteur(s)"),
"bibc" => array("Année et bibliographie","checked","Format à étudier celui de Tela : 1868, Brev. Pl. Nov., 2 : 70 ou celui de Kew : Brev. Pl. Nov., 2 : 70 (1868)"),
"nsrc" => array("Nom retenu avec auteur","checked","Nom retenu pour tous les taxons (identique si le nom est édjà le nom retenu)"),
"extax" => array("Présent dans Taxref","checked",""),
"lien" => array("Permalien","checked","Lien http vers la fiche nomenclaturale"),
"ntsup" => array("Numéro nomenclatural rang supérieur","","Identifiant numérique du nom (num_nom) de rang supérieur dans la classification par défaut de l'index"),
"pre" => array("Répartition géographique","","Code indiquant si le taxon est présent dans la zone géographique définie par le référentiel (tableau 9)"),
"ns" => array("Nom sans auteur","","Nom scientifique sans auteur"),
"aut" => array("Auteur","","Intitulé de(s) l'auteur(s) du nom (abréviations standards de Brummitt et Powell)"),
"ann" => array("Année publication","","Année de la publication effective du support papier"),
"bib" => array("Bibliographie","","Référence bibliographique de la publication d'origine du nom"),
"ntype" => array("Numéro du type","","Identifiant numérique (num_nom) du 1er basionyme appliqué à la planche d'herbier"),
"nbas" => array("Numéro du basionyme","","Identifiant numérique (num_nom) du basionyme du nom"),
"genre" => array("Genre","","Nom d'un genre dans le cas d'un monôme du rang genre ou d'une combinaison"),
"esp" => array("Epithète espèce","","Épithète de l'espèce"),
"eing" => array("Epithète infragénérique","","Épithète infra-générique d'une combinaison dont le rang est situé entre le genre et l'espèce"),
"te" => array("Type d'épithète infraspécifique","","Abréviation indiquant le type de l'épithète infra-spécifique"),
"einsp" => array("Epithète infraspécifique","","Épithète infra-spécifique d'une combinaison"),
"hybp01" => array("Hybride parent 1","","Identifiant du nom (num_nom) du parent numéro 1 (dans le cas d'un hybride)"),
"nomsupgen" => array("Nom supra générique","","Monôme dont le rang est supérieur au genre"),
"hybp02" => array("Hybride parent 2","","Identifiant du nom (num_nom) du parent numéro 2 (dans le cas d'un hybride)"),
"stori" => array("Statut d'origine","","Code indiquant le statut d'origine du taxon dans la zone géographique définie par le référentiel (tableau 10)"),
"stint" => array("Statut d'introduction","","Code indiquant le statut d'introduction du taxon dans la zone géographique définie par le référentiel (tableau 11)"),
"stcult" => array("Statut de culture","","Code indiquant le statut de culture du taxon dans la zone géographique définie par le référentiel (tableau 12)"),
"notes" => array("Remarques","","Notes complémentaires"),
"nomadd" => array("Commentaires nomenclaturaux","","Commentaires nomenclaturaux pouvant être associés à un nom (voir tableau 8 du manuel technique)"),
"nsr" => array("Nom retenu sans auteur","","Nom scientifique du nom retenu sans auteur"),
"hom" => array("Homonymie","","Contient la valeur 1 si le nom possède un homonyme ou si le nom est un homonyme. Dans le cas contraire"),
"syn" => array("Statut du nom", "", "retenu, synonyme, ambigü, calculé à partir des num_nom et num_nom_retenu"),
"synprop" => array("Synonyme proprate","","Contient plusieurs identifiants numériques (num_nom) dans le cas d'un nom obtenu suite à la division d'un taxon. Contient un seul identifiant numérique (num_nom) dans le cas d'un nom obtenu suite à la fusion de plusieurs taxons."),
"syndout" => array("Synonyme douteux","","Contient la valeur 1 si le nom est un synonyme douteux. Dans le cas contraire"),
"synmapp" => array("Synonyme mal appliqué","","Contient la valeur 1 si le nom est un synonyme mal appliqué (cas des sensu). Dans le cas contraire"),
"synorth" => array("Synonyme orthographique","","Contient l'identifiant numérique du nom (num_nom) correctement orthographié"),
"orthori" => array("Orthographe originelle","","Contient la graphie originelle d'un nom non-conforme faisant l'objet d'une correction orthographique obligatoire"),
"hybp01n" => array("Hybride parent 1 notes","","Notes éventuelles sur l'hybridité et le parent numéro 1"),
"hybp02n" => array("Hybride parent 2 notes","","Notes éventuelles sur l'hybridité et le parent numéro 2"),
"cultgp" => array("Groupe de cultivar","","Nom d'un groupe de cultivar (sansl'abréviation « Gp »)"),
"cult" => array("Nom cultivar","","Nom d'un cultivar (sans les guillemets simple ou abréviation « cv. »)"),
"nomcomm" => array("Nom commercial","","Nom commercial d'une plante (en majuscule"),
"autres" => array("Autres","","colonnes spécifiques au référentiel"));
}
//+----------------------------------------------------------------------------------------------------------------+
// Méthodes
/**
* Fonction d'affichage par défaut
*/
public function executerActionParDefaut() {
return $this->afficherDetail();
}
/**
* Affiche le détail d'un référentiel et la liste des actions possibles
*/
public function afficherDetail() {
$this->definirCommeModulePrincipal('Informations');
$donnees = $this->preparerPagePourDetailReferentielEtTelechargement();
$donnees['messages'] = $this->getMessages();
$this->traiterEsperluette($donnees);
$this->setSortie(self::RENDU_CORPS, $this->getVue('detail_referentiel', $donnees), false);
}
public function telecharger() {
$dossier = Config::get('chemin_tmp');
$parametres['ref'] = $this->referentiel;
$parametres['version'] = $_POST["version"];
$parametres['version'] = str_replace(".", "_", $parametres['version']);
if (isset($_POST["champs"])) $parametres['champs'] = implode(",",$_POST["champs"]);
if (isset($_POST["filtres"])) $parametres['filtres'] = implode(",",$_POST["filtres"]);
if (isset($_POST["encodage"])) $parametres['encodage'] = $_POST["encodage"];
$_POST['usage'] = empty($_POST['usage']) ? 'inconnu' : $_POST['usage'];
$this->loggerExport($_SERVER['REMOTE_ADDR'], $_POST['usage'], $parametres['ref'], $parametres['version']);
$this->supprimerAncienExport($dossier);
$ref = $this->referentielDao->exporter($parametres);
$meta = $this->metaDao->exporter($parametres);
$dossierDateEtNomDeFichier = date('Y_m_d').'/'.$this->referentiel.time().'.zip';
$cheminZip = $dossier.$dossierDateEtNomDeFichier;
$zip = new ZipArchive();
if($zip->open($cheminZip, ZipArchive::CREATE) === true) {
// Ajout des fichiers métadonnées, référentiel et manuel technique
$meta = str_replace("\\/", "/", $meta);
if (file_exists($meta)) {
$metazip = $zip->addFile($meta, "informations.csv");
}
if (file_exists($ref)) {
$refzip = $zip->addFile($ref, "referentiel.csv");
}
if (file_exists($dossier.'mtpr_V4_4.pdf')) {
$zip->addFile($dossier.'mtpr_V4_4.pdf', 'manuel_technique.pdf');
}
// Et on referme l'archive
$zip->close();
} else {
echo "Erreur : impossible d'ouvrir le fichier [$cheminZip]<br/>";
}
// on revient à la page de détail, avec un lien de téléchargement en prime
$donnees = $this->preparerPagePourDetailReferentielEtTelechargement();
if (file_exists($cheminZip)) {
$urlLien = Config::get("base_url_telechargements") . $dossierDateEtNomDeFichier;
$donnees['url_telechargement_zip'] = $urlLien;
}
//$this->transformerEnXls($ref, $dossier);
$this->setSortie(self::RENDU_CORPS, $this->getVue('detail_referentiel', $donnees), false);
}
private function loggerExport($ip, $usage, $referentiel, $version) {
$separateur = "\t";
$ligne = date('Y-m-d H:i:s').$separateur.$ip.$separateur.$usage.$separateur.$referentiel.$separateur.$version."\n";
file_put_contents(Config::get('base_chemin_log').'telechargements.log', $ligne, FILE_APPEND);
}
public function transformerEnXls($fichier, $dossier) {
include '../bibliotheque/utilitaires/PHPExcel/IOFactory.php';
$dossier .= date('Y_m_d').'/';
$objReader = PHPExcel_IOFactory::createReader('CSV');
// If the files uses a delimiter other than a comma (e.g. a tab), then tell the reader
$objReader->setDelimiter("\t");
// If the files uses an encoding other than UTF-8 or ASCII, then tell the reader
$objReader->setInputEncoding('UTF-8');
$objPHPExcel = $objReader->load($fichier);
$objWriter = PHPExcel_IOFactory::createWriter($objPHPExcel, 'Excel5');
$objWriter->save($dossier.'MyExcelFile.xls');
}
// exécute la partie commune entre l'action "detail" et l'action "telecharger"
protected function preparerPagePourDetailReferentielEtTelechargement() {
$donnees = array();
// Traitement de l'info sur le code du référentiel
if (isset($this->referentiel)) {
$this->construireMenu($this->referentiel);
$this->construireFilAriane($this->referentiel);
$donnees['referentiel'] = $this->referentiel;
$donnees['nom_referentiel'] = $this->referentielDao->getNom($this->referentiel);
$donnees['url_menu_test'] = $this->obtenirUrlMenuTest($this->referentiel);
$donnees['url_menu_versionnage'] = $this->obtenirUrlMenuVersionnage($this->referentiel);
$donnees['url_menu_consultation'] = $this->obtenirUrlMenuConsultation($this->referentiel);
$donnees['url_form_telech'] = $this->obtenirUrlDetailReferentielTelechargement($this->referentiel);
// suppression du téléchargement pour bdbfx
if ($this->referentiel != 'bdbfx') {
$donnees['versions'] = $this->afficherFormulaireTelechargementsReferentiels();
$donnees['infos_telechargements'] = $this->afficherTelechargementsReferentiels();
$donnees['colonnesOrdonnees'] = $this->colonnesOrdonnees;
$parametres['ref'] = $this->referentiel;
$parametres['rg'] = '180';
$donnees['familles'] = $this->rechercheDao->chercher('ParDefaut', $parametres, 250);
}
} else {
$this->addMessage("Aucun code de projet de référentiel n'est indiqué (Ex. bdtfx).");
}
return $donnees;
}
private function supprimerAncienExport($dossier) {
$pointeur = opendir($dossier);
// si pas d'erreur d'ouverture du dossier on lance le scan
if( $pointeur != false ) {
// Parcours du repertoire
while( $ss_dossier = readdir($pointeur)) {
if($ss_dossier != "." && $ss_dossier != "..") {
$chemin_complet = $dossier . $ss_dossier;
if (is_dir($chemin_complet) && $ss_dossier < date('Y_m_d')) {
$fichiers = scandir($chemin_complet);
foreach ($fichiers as $fichier) {
if($fichier != "." && $fichier != "..") {
unlink($chemin_complet."/".$fichier);
}
}
rmdir($chemin_complet);
}
}
}
closedir($pointeur);
}
}
private function afficherFormulaireTelechargementsReferentiels() {
$versions = $this->traitementDao->getTraitementsTermines($this->referentiel, 'versionnage');
if ($versions != null) {
foreach ($versions as $id => $version) {
$versions[$id] = (unserialize($versions[$id]["script_parametres"]));
}
}
return $versions;
}
private function afficherTelechargementsReferentiels() {
$infos_telechargements = array();
// Recherche des traitements déjà effectué
$resultat = $this->traitementDao->getTraitementsTermines($this->referentiel, 'versionnage');
if (is_array($resultat)) {
foreach ($resultat as &$traitement) {
$infos_traitement = $this->traitementDao->getInfos($traitement['id_traitement']);
if ($infos_traitement != false) {
// Recherche des fichiers disponibles
$infos_zip = $this->obtenirUrlsZipPourTraitement($infos_traitement);
$infos_telechargements[] = array(
'infos_traitement' => $traitement,
'description' => $this->creerDescriptionTelechargement($traitement),
'urls_zip' => $infos_zip);
}
}
}
return $infos_telechargements;
}
private function creerDescriptionTelechargement($traitement) {
return strftime('%e %B %Y', strtotime($traitement['meta_date_creation'])).' ('.$this->referentielDao->getNom($this->referentiel).') ';
}
}
?>