Subversion Repositories eFlore/Applications.cel

Rev

Rev 1527 | Blame | Last modification | View Log | RSS feed

<?php
/**
* PHP Version 5
*
* @category  PHP
* @package   jrest
* @author    David Delon <david@tela-botania.org>
* @author    Aurélien Peronnet <aurelien@tela-botania.org>
* @copyright 2010 Tela-Botanica
* @license   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-fr.txt Licence CECILL
* @version   SVN: <svn_id>
* @link      /doc/jrest/
*/

/**
 * 
 * La classe appelle les web service d'eflore pour éviter que le code client 
 * ne soit dépendant de la version d'eflore
 */
class RechercheInfosTaxonBeta extends Cel {
        
        private $url_service_nom = null;
        private $url_service_taxon = null;
        private $url_service_chorologie = null;
        
        private $masque_recherche = null;
        private $code_referentiel = 'bdtfx';
                
        public function RechercheInfosTaxonBeta($config, $code_referentiel = 'bdtfx') {
                parent::__construct($config);
                $this->code_referentiel = $code_referentiel;
                $this->formaterUrlsServices($config);
        }
        
        private function formaterUrlsServices($config) {
                $this->url_service_nom = str_replace('{referentiel}', $this->code_referentiel ,$config['eflore']['url_service_nom']);
                $this->url_service_taxon = str_replace('{referentiel}', $this->code_referentiel ,$config['eflore']['url_service_taxon']);
                $this->url_service_chorologie_obs = $config['eflore']['url_service_chorologie_obs'];
        }
        
        public function rechercherGenreEspeceSurPrefixe($genre = null, $espece = null) {
                
                $liste_genre_espece = array();  
                $this->masque_recherche = trim(trim($genre).' '.trim($espece,' *'));
                $masque = urlencode($this->masque_recherche);
                $requete = @file_get_contents($this->url_service_nom.'?masque='.$masque.'&recherche=etendue&retour.format=min&navigation.limite=50&ns.structure=au');
                if($requete != '') {
                        $requete = json_decode($requete);               
                        if(is_object($requete) && isset($requete->resultat)) {
                                foreach ($requete->resultat as $id => $res) {
                                        $retenu = ($res->retenu == "true") ? '3' : '4';
                                        $liste_genre_espece[] = array($res->nom_sci_complet, $id, $retenu);
                                }
                        }
                        usort($liste_genre_espece, array($this, 'comparerParRetenuPuisNom'));  
                }
                return $liste_genre_espece;
        }
        
        function comparerParRetenuPuisNom($a, $b) {
                if($a[2] == 3 && $b[2] != 3) {
                        return -1;
                } elseif($a[2] != 3 && $b[2] == 3) {
                        return 1;
                } else {
                        return levenshtein($this->masque_recherche, $a[0]) >= levenshtein($this->masque_recherche, $b[0]);
                }
        }
        
        public function effectuerRequeteInfosComplementairesEtFormaterNom($numNom) {
                
                $resultat_infos_complementaires = (array)$this->effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($numNom);
                $retour_infos_complementaires = array();
                if (isset($resultat_infos_complementaires['nom_retenu_complet']) && $resultat_infos_complementaires['nom_retenu_complet'] != '') {
                $retour_infos_complementaires=array(($this->supprimerBiblio($resultat_infos_complementaires['nom_retenu_complet'])));
            }
                
                return $retour_infos_complementaires;
        }
        
        public function rechercherInformationsComplementairesSurNom($nom_saisi) {
                $nom_saisi = trim($nom_saisi);
                // Essai de recherche sur le nom saisi tel quel
                $liste_genre_espece = $this->effectuerRequeteUrlRecherche($nom_saisi, true);
                if(empty($liste_genre_espece)) {
                        // Essai de recherche stricte en tentant de supprimer le nom d'auteur
                        $nom_saisi_sans_auteur = $this->supprimerAuteur($nom_saisi);
                        $liste_genre_espece = $this->effectuerRequeteUrlRecherche($nom_saisi_sans_auteur, true);
                        if(empty($liste_genre_espece)) {
                                // Dernière tentative : essai de recherche étendue
                                $liste_genre_espece = $this->effectuerRequeteUrlRecherche($nom_saisi, false);
                        }
                }
                return $liste_genre_espece;
        }
        
        private function effectuerRequeteUrlRecherche($nom_saisi, $stricte = true) {
                $url_recherche = $this->getUrlRechercheInfosComplementaires($nom_saisi, $stricte);
                $resultat = @file_get_contents($url_recherche);
                $liste_genre_espece = array();
                if($resultat != '') {
                        $liste_genre_espece = $this->parserResultatRechercheTaxon($resultat);
                }
                return $liste_genre_espece;
        }
        
        private function getUrlRechercheInfosComplementaires($nom_saisi, $stricte = true) {
                $type_recherche = $stricte ? 'stricte' : 'etendue';
                return $url_recherche_etendue = $this->url_service_nom.'?masque='.urlencode($nom_saisi).'&recherche='.$type_recherche.'&ns.format=txt&retour.champs=nom_sci,auteur,nom_retenu.id&navigation.limite=1';
        }
        
        private function supprimerAuteur($nom_saisi) {
                // Attention le parseur de nom n'est pas fiable à 100%
                // mais ça marche dans la plupart des cas      
                // à part les formules d'hybridité saisies avec un auteur
                // TODO: gérer les hybrides
                $nameparser = new NameParser();
                if($this->estUnHybride($nom_saisi) || $this->estUneFormuleHybridite($nom_saisi)) {
                        $nom_decoupe = explode(' ', $nom_saisi);
                        $derniere_position_hybride = end(array_keys($nom_decoupe, 'x'));
                        $nom_saisi_sans_auteur = implode(' ',array_slice($nom_decoupe, 0, $derniere_position_hybride + 2));
                } else {
                        $auteur = $nameparser->parse_auth($nom_saisi);
                        $nom_saisi_sans_auteur = str_replace($auteur, '', $nom_saisi);
                }

                $nom_saisi_sans_auteur = trim($nom_saisi_sans_auteur);
                return $nom_saisi_sans_auteur;
        }
        
        private function estUneFormuleHybridite($nom_saisi) {
                return strpos($nom_saisi,' x ') !== false;
        }
        
        private function estUnHybride($nom_saisi) {
                return strpos($nom_saisi,'x ') === 0;
        }
        
        private function parserResultatRechercheTaxon($resultat) {
                $liste_genre_espece = array();
                $resultat = json_decode($resultat);
                if(is_object($resultat) && isset($resultat->resultat)) {
                        foreach ($resultat->resultat as $id => $res) {
                                $nom_complet = $res->{'nom_sci'}.' '.$res->auteur;
                                $liste_genre_espece[] = array($id,$nom_complet);
                        }
                }
                return $liste_genre_espece;
        }
        
        public function rechercherInformationsComplementairesSurNumNom($num_nom) {
                $infos_formatees = array();
                $infos = $this->effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($num_nom);
                if(is_object($infos)) {
                        $infos_formatees = $this->formaterInfosComplementairesSurNumNom($infos);
                }
                return $infos_formatees;
        }
        
        public function effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($num_nom) {
                $infos = array();               
                $url = $this->url_service_nom.'/'.$num_nom.'?retour.champs=nom_sci,auteur,id,nom_retenu_complet,nom_retenu.id,num_taxonomique,famille';
                $resultat = @file_get_contents($url);
                if($resultat != '') {
                        $infos = json_decode($resultat);
                }
                return $infos;
        }
        
        private function formaterInfosComplementairesSurNumNom($infos) {
                $infos = (array)$infos;
                return $infos_formatees = array(
                        'Nom_Retenu' => $this->supprimerBiblio($infos['nom_retenu_complet']),
                        'Num_Nom_Retenu' => $infos['nom_retenu.id'],
                        'Num_Taxon' => $infos['num_taxonomique'],
                        'Famille' => $infos['famille']
                );
                return $infos_formatees;
        }
        
        private function supprimerBiblio($nom) {
                return preg_replace('/ \[.*\]/','',$nom);
        }
        
        public function rechercherNumTaxSurNumNom($num_nom) {
                $nt = null;
                $url = $this->url_service_nom."/".$num_nom.'?retour.champs=num_taxonomique';
                $resultat = @file_get_contents($url);
                if($resultat != '') {
                        $infos = json_decode($resultat);
                        $nt = $infos->num_taxonomique;
                }
        
                return $nt;
        }
        
        public function taxonEstPresentDansDepartement($num_taxon,$code_departement) {
                $presence_taxon = false;
                $url = $this->url_service_chorologie_obs.'?masque.departement='.$code_departement.'&masque.determination.nt='.$num_taxon.'&navigation.limite=1';
                $resultat = @file_get_contents($url);
                if($resultat != '') {
                        $resultat = json_decode($resultat);
                        if(is_object($resultat) && isset($resultat->resultat) && count($resultat->resultat) > 0) {
                                $presence_taxon = true;
                        }
                }
                return $presence_taxon;
        }
        
        public function effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumTax($numTax) {
                
                $infos = array();
                //TODO: retourner moins de champs grâce au paramètre retour.champs
                $url = $this->url_service_taxon."/nt:".$numTax;
                $resultat = @file_get_contents($url);
                if($resultat != '') {
                        $infos = json_decode($resultat);
                }

                return $infos;
        }
        
        function rechercherInfosSurTexteCodeOuNumTax($identifiant_espece) {
                // texte libre, nom scientifique, 
                // ou code nomenclatural (format BDNFFnn999999) 
                // ou code taxonomique (format BDNFFnt999999)
                $identifiant_espece=trim($identifiant_espece);
                $identifiant_espece=utf8_encode($identifiant_espece);
                
                $retour = array();
                //TODO: voir ce qu'on fait pour l'import de différent référentiels
                preg_match('/BDNFFnn([0-9][0-9]*)/',$identifiant_espece, $elements);
                if (isset($elements[1])) {
                        // Numero nomenclatural
                        $infos_taxon = $this->rechercherInformationsComplementairesSurNumNom($elements[1]);
                        $retour = array("nom_sel" => $infos_taxon['Nom_Retenu'], "en_id_nom" => $elements[1]);
                } else { 
                        //  Numero taxonomique ou nom scientifique
                        preg_match('/BDNFFnt([0-9][0-9]*)/', $identifiant_espece, $elements);
                        if (isset($elements[1])) {
                                // Numero taxonomique
                                $infos_taxon = (array)$this->effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumTax($elements[1]);
                                if(isset($infos_taxon['nom_retenu.libelle']) && isset($infos_taxon['id'])) {
                                        $nom = $infos_taxon['nom_retenu.libelle'];
                                        $nom .= (isset($infos_taxon['auteur'])) ? ' '.$infos_taxon['auteur'] : '';
                                        $retour = array("nom_sel" => $nom, 
                                                                        "en_id_nom" => $infos_taxon['id']);
                                }
                        } else { 
                                // Nom scientifique
                                $id_nom = $this->rechercherInformationsComplementairesSurNom($identifiant_espece);
                                // Recherche du nom associe
                                $retour = array("nom_sel" => $identifiant_espece);
                                if(is_array($id_nom) && count($id_nom) > 0 && isset($id_nom[0][0]) && isset($id_nom[0][1])) {
                                        $nn = $id_nom[0][0];
                                        $retour = array("nom_sel" => $id_nom[0][1], "en_id_nom" => $id_nom[0][0]);
                                }
                        }
                }
                
                return $retour;
        }
}
?>