Rev 1541 | Blame | Last modification | View Log | RSS feed
<?php/*** PHP Version 5** @category PHP* @package jrest* @author David Delon <david@tela-botania.org>* @author Aurélien Peronnet <aurelien@tela-botania.org>* @copyright 2010 Tela-Botanica* @license http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-fr.txt Licence CECILL* @version SVN: <svn_id>* @link /doc/jrest/*//**** La classe appelle les web service d'eflore pour éviter que le code client* ne soit dépendant de la version d'eflore*/class RechercheInfosTaxonBeta extends Cel {private $url_service_nom = null;private $url_service_taxon = null;private $url_service_chorologie = null;private $masque_recherche = null;private $code_referentiel = 'bdtfx';public function RechercheInfosTaxonBeta($config, $code_referentiel = 'bdtfx') {parent::__construct($config);$this->code_referentiel = $code_referentiel;$this->formaterUrlsServices($config);}private function formaterUrlsServices($config) {$this->url_service_nom = str_replace('{referentiel}', $this->code_referentiel ,$config['eflore']['url_service_nom']);$this->url_service_taxon = str_replace('{referentiel}', $this->code_referentiel ,$config['eflore']['url_service_taxon']);$this->url_service_chorologie_obs = $config['eflore']['url_service_chorologie_obs'];}public function rechercherGenreEspeceSurPrefixe($genre = null, $espece = null) {$liste_genre_espece = array();$this->masque_recherche = trim(trim($genre).' '.trim($espece,' *'));$masque = urlencode($this->masque_recherche);$requete = @file_get_contents($this->url_service_nom.'?masque='.$masque.'&recherche=etendue&retour.format=min&navigation.limite=50&ns.structure=au');if($requete != '') {$requete = json_decode($requete);if(is_object($requete) && isset($requete->resultat)) {foreach ($requete->resultat as $id => $res) {$retenu = ($res->retenu == "true") ? '3' : '4';$liste_genre_espece[] = array($res->nom_sci_complet, $id, $retenu);}}usort($liste_genre_espece, array($this, 'comparerParRetenuPuisNom'));}return $liste_genre_espece;}function comparerParRetenuPuisNom($a, $b) {if($a[2] == 3 && $b[2] != 3) {return -1;} elseif($a[2] != 3 && $b[2] == 3) {return 1;} else {return levenshtein($this->masque_recherche, $a[0]) >= levenshtein($this->masque_recherche, $b[0]);}}public function effectuerRequeteInfosComplementairesEtFormaterNom($numNom) {$resultat_infos_complementaires = (array)$this->effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($numNom);$retour_infos_complementaires = array();if (isset($resultat_infos_complementaires['nom_retenu_complet']) && $resultat_infos_complementaires['nom_retenu_complet'] != '') {$retour_infos_complementaires=array(($this->supprimerBiblio($resultat_infos_complementaires['nom_retenu_complet'])));}return $retour_infos_complementaires;}public function rechercherInformationsComplementairesSurNom($nom_saisi) {$nom_saisi = trim($nom_saisi);// Essai de recherche sur le nom saisi tel quel$liste_genre_espece = $this->effectuerRequeteUrlRecherche($nom_saisi, true);if(empty($liste_genre_espece)) {// Essai de recherche stricte en tentant de supprimer le nom d'auteur$nom_saisi_sans_auteur = $this->supprimerAuteur($nom_saisi);$liste_genre_espece = $this->effectuerRequeteUrlRecherche($nom_saisi_sans_auteur, true);if(empty($liste_genre_espece)) {// Dernière tentative : essai de recherche étendue$liste_genre_espece = $this->effectuerRequeteUrlRecherche($nom_saisi, false);}}return $liste_genre_espece;}private function effectuerRequeteUrlRecherche($nom_saisi, $stricte = true) {$url_recherche = $this->getUrlRechercheInfosComplementaires($nom_saisi, $stricte);$resultat = @file_get_contents($url_recherche);$liste_genre_espece = array();if($resultat != '') {$liste_genre_espece = $this->parserResultatRechercheTaxon($resultat);}return $liste_genre_espece;}private function getUrlRechercheInfosComplementaires($nom_saisi, $stricte = true) {$type_recherche = $stricte ? 'stricte' : 'etendue';return $url_recherche_etendue = $this->url_service_nom.'?masque='.urlencode($nom_saisi).'&recherche='.$type_recherche.'&ns.format=txt&retour.champs=nom_sci,auteur,nom_retenu.id&navigation.limite=1';}private function supprimerAuteur($nom_saisi) {// Attention le parseur de nom n'est pas fiable à 100%// mais ça marche dans la plupart des cas// à part les formules d'hybridité saisies avec un auteur// TODO: gérer les hybrides$nameparser = new NameParser();if($this->estUnHybride($nom_saisi) || $this->estUneFormuleHybridite($nom_saisi)) {$nom_decoupe = explode(' ', $nom_saisi);$derniere_position_hybride = end(array_keys($nom_decoupe, 'x'));$nom_saisi_sans_auteur = implode(' ',array_slice($nom_decoupe, 0, $derniere_position_hybride + 2));} else {$auteur = $nameparser->parse_auth($nom_saisi);$nom_saisi_sans_auteur = str_replace($auteur, '', $nom_saisi);}$nom_saisi_sans_auteur = trim($nom_saisi_sans_auteur);return $nom_saisi_sans_auteur;}private function estUneFormuleHybridite($nom_saisi) {return strpos($nom_saisi,' x ') !== false;}private function estUnHybride($nom_saisi) {return strpos($nom_saisi,'x ') === 0;}private function parserResultatRechercheTaxon($resultat) {$liste_genre_espece = array();$resultat = json_decode($resultat);if(is_object($resultat) && isset($resultat->resultat)) {foreach ($resultat->resultat as $id => $res) {$nom_complet = $res->{'nom_sci'}.' '.$res->auteur;$liste_genre_espece[] = array($id,$nom_complet);}}return $liste_genre_espece;}public function rechercherInformationsComplementairesSurNumNom($num_nom) {$infos_formatees = array();$infos = $this->effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($num_nom);if(is_object($infos)) {$infos_formatees = $this->formaterInfosComplementairesSurNumNom($infos);}return $infos_formatees;}public function effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($num_nom) {$infos = array();$url = $this->url_service_nom.'/'.$num_nom.'?retour.champs=nom_sci,auteur,id,nom_retenu_complet,nom_retenu.id,num_taxonomique,famille';$resultat = @file_get_contents($url);if($resultat != '') {$infos = json_decode($resultat);}return $infos;}private function formaterInfosComplementairesSurNumNom($infos) {$infos = (array)$infos;return $infos_formatees = array('Nom_Retenu' => $this->supprimerBiblio($infos['nom_retenu_complet']),'Num_Nom_Retenu' => $infos['nom_retenu.id'],'Num_Taxon' => $infos['num_taxonomique'],'Famille' => $infos['famille']);return $infos_formatees;}private function supprimerBiblio($nom) {return preg_replace('/ \[.*\]/','',$nom);}public function rechercherNumTaxSurNumNom($num_nom) {$nt = null;$url = $this->url_service_nom."/".$num_nom.'?retour.champs=num_taxonomique';$resultat = @file_get_contents($url);if($resultat != '') {$infos = json_decode($resultat);$nt = $infos->num_taxonomique;}return $nt;}public function taxonEstPresentDansDepartement($num_taxon,$code_departement) {$presence_taxon = false;$url = $this->url_service_chorologie_obs.'?masque.departement='.$code_departement.'&masque.determination.nt='.$num_taxon.'&navigation.limite=1';$resultat = @file_get_contents($url);if($resultat != '') {$resultat = json_decode($resultat);if(is_object($resultat) && isset($resultat->resultat) && count($resultat->resultat) > 0) {$presence_taxon = true;}}return $presence_taxon;}public function effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumTax($numTax) {$infos = array();//TODO: retourner moins de champs grâce au paramètre retour.champs$url = $this->url_service_taxon."/nt:".$numTax;$resultat = @file_get_contents($url);if($resultat != '') {$infos = json_decode($resultat);}return $infos;}function rechercherInfosSurTexteCodeOuNumTax($identifiant_espece) {// texte libre, nom scientifique,// ou code nomenclatural (format BDNFFnn999999)// ou code taxonomique (format BDNFFnt999999)$identifiant_espece=trim($identifiant_espece);$identifiant_espece=utf8_encode($identifiant_espece);$retour = array();//TODO: voir ce qu'on fait pour l'import de différent référentielspreg_match('/BDNFFnn([0-9][0-9]*)/',$identifiant_espece, $elements);if (isset($elements[1])) {// Numero nomenclatural$infos_taxon = $this->rechercherInformationsComplementairesSurNumNom($elements[1]);$retour = array("nom_sel" => $infos_taxon['Nom_Retenu'], "en_id_nom" => $elements[1]);} else {// Numero taxonomique ou nom scientifiquepreg_match('/BDNFFnt([0-9][0-9]*)/', $identifiant_espece, $elements);if (isset($elements[1])) {// Numero taxonomique$infos_taxon = (array)$this->effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumTax($elements[1]);if(isset($infos_taxon['nom_retenu.libelle']) && isset($infos_taxon['id'])) {$nom = $infos_taxon['nom_retenu.libelle'];$nom .= (isset($infos_taxon['auteur'])) ? ' '.$infos_taxon['auteur'] : '';$retour = array("nom_sel" => $nom,"en_id_nom" => $infos_taxon['id']);}} else {// Nom scientifique$id_nom = $this->rechercherInformationsComplementairesSurNom($identifiant_espece);// Recherche du nom associe$retour = array("nom_sel" => $identifiant_espece);if(is_array($id_nom) && count($id_nom) > 0 && isset($id_nom[0][0]) && isset($id_nom[0][1])) {$nn = $id_nom[0][0];$retour = array("nom_sel" => $id_nom[0][1], "en_id_nom" => $id_nom[0][0]);}}}return $retour;}private function getUrlRechercheSynonymes($num_nom) {return $this->url_service_nom.'/'.$num_nom.'/relations/synonymie/?retour.format=min';}public function rechercherSynonymesSurNumNom($num_nom) {$retour = array();$resultat = @file_get_contents($this->getUrlRechercheSynonymes($num_nom));if($resultat != '') {$resultat = json_decode($resultat);if(is_object($resultat) && isset($resultat->resultat) && count($resultat->resultat) > 0) {$retour = $resultat->resultat;}}return $retour;}}?>