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/*
Cleanup des observation ayant un nom_ret_nn à 0 (mais un nom_ret défini...):
En effet, on peut pour l'instant POSTer $nom_ret, d'où bien souvent nom_sel == nom_ret, cependant nom_ret_nn = 0
(pas d'autodétection).
Nous pourrions donc les nullifier sans remord, ... mais ...
nom_ret == 0 est VALIDE (car bdtfx.num_nom_retenu == 0 est valide) [ 3800 nom_retenu "orphelins" de taxon ]
1) créer un index pour les jointures:
CREATE INDEX i_nom_ret ON bdtfx_v1_01 (`nom_sci`(8))
2) regarder les num_nom_ret orphelins de taxon en BDTFX:
SELECT * FROM bdtfx_v1_01 WHERE num_nom_retenu = 0; # 3960
3) regarder les num_nom_ret orphelins de taxon en BDTXA:
SELECT * FROM bdtxa_v1_00 WHERE num_nom_retenu = 0; # 0
4) regarder les orphelins équivalents dans `BASEEDIT`.`cel_obs`:
SELECT date_observation, SUBSTRING(nom_sel, 1, 50), nom_ret_nn, nom_ret, b.nom_sci FROM `BASEEDIT`.`cel_obs` c LEFT JOIN `BASESOURCE`.`bdtfx_v1_01` b on (c.nom_ret = b.nom_sci) WHERE nom_ret_nn = 0; # 7740
Donc ceux dont le nom_ret à été POSTé manuellement et qui matchent le nom_sci de BDTFX : on les conserve.
Mais les autres, qui ont un nom_ret probablement erroné et un nom_ret_nn à 0, on NULLify les données censées être (correctement) autogénérées !
Cela concerne:
SELECT date_observation, SUBSTRING(nom_sel, 1, 50), nom_ret_nn, nom_ret, b.nom_sci FROM `BASEEDIT`.`cel_obs` c LEFT JOIN `BASESOURCE`.`bdtfx_v1_01` b on (c.nom_ret = b.nom_sci) WHERE nom_ret_nn = 0
AND c.nom_ret != '' AND id_observation NOT IN ( SELECT id_observation FROM `BASEEDIT`.`cel_obs` c, `BASESOURCE`.`bdtfx_v1_01` b WHERE c.nom_ret = b.nom_sci AND c.nom_ret_nn = 0 ); # 960
*/
-- D'où la requête :
UPDATE `BASEEDIT`.`cel_obs` SET nom_sel_nn = NULL, nom_ret = NULL, nom_ret_nn = NULL, nt = NULL, famille = NULL WHERE id_observation IN
( SELECT id_observation FROM `BASEEDIT`.`cel_obs` c LEFT JOIN `BASESOURCE`.`bdtfx_v1_01` b on (c.nom_ret = b.nom_sci) WHERE nom_ret_nn = 0
AND c.nom_ret != '' AND id_observation NOT IN ( SELECT id_observation FROM `BASEEDIT`.`cel_obs` c, `BASESOURCE`.`bdtfx_v1_01` b WHERE c.nom_ret = b.nom_sci AND c.nom_ret_nn = 0 ) );
-- TODO
-- UPDATE `BASEEDIT`.`cel_obs` SET nom_ret_nn = NULL WHERE nom_ret_nn = 0;
-- UPDATE `BASEEDIT`.`cel_obs` SET nom_sel_nn = NULL WHERE nom_sel_nn = 0;
/*
UPDATE `BASEEDIT`.`cel_obs` SET nom_sel = NULL, nom_sel_nn = NULL, nom_ret = NULL, nom_ret_nn = NULL, nt = NULL, famille = NULL,
FROM `BASEEDIT`.`cel_obs`
WHERE (nom_sel = '' OR nom_sel IS NULL) AND
(
(nom_ret IS NOT NULL AND nom_ret != '') OR
(nom_ret_nn IS NOT NULL AND nom_ret_nn != 0 AND nom_ret_nn != '') OR
(nt IS NOT NULL AND nt != 0 AND nt != '') OR
(famille IS NOT NULL AND famille != '')
)
*/