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<?php
// commande : /opt/lampp/bin/php cli.php description_sp -a tester -n /home/jennifer/Tela-botanica_projets/Coste/descriptions/html
class Description {
const DOSSIER_V0 = '../../../donnees/coste/0.00/';
const DOSSIER_DSC_HTML = '../../../donnees/coste/descriptions/html/';
const DOSSIER_DSC_TXT = '../../../donnees/coste/descriptions/txt/';
const DOSSIER_LOG = 'log/';
private $dossierBase = '';
private $conteneur = null;
private $outils = null;
private $messages = null;
private $action = '';
private $nomFichier = '';
private $nomDossier = '';
private $listeFichiers = array();
private $fichierNum = '';
private $fichier = '';
private $log = '';
private $correspondance = array();
private $infosCorrespondanceBase = array(
'nom_sci' => '',
'rang' => 290,
'auteur' => '',
'annee' => '',
'biblio_coste' => '',
'nom_francais' => '',
'nom_coste' => '',
'auteur_coste' => '',
'num_nom_coste' => '',
'num_nom_retenu_coste' => '',
'num_tax_sup_coste' => '',
'tome' => '',
'page' => '',
'synonymie_coste' => '',
'bdnff_nn' => '',
'bdnff_nt' => '');
public function __construct(Conteneur $conteneur) {
$this->conteneur = $conteneur;
$this->outils = $conteneur->getOutils();
$this->messages = $conteneur->getMessages();
$this->dossierBase = dirname(__FILE__).'/';
}
public function genererDescriptionTxt() {
$this->chargerFichiers();
foreach ($this->listeFichiers as $this->fichierNum => $this->fichier) {
$this->messages->afficherAvancement("Création des descriptions au format txt");
$this->genererFichier();
}
echo "\n";
}
public function verifierDescriptionTxt() {
$this->chargerFichiers();
foreach ($this->listeFichiers as $this->fichierNum => $this->fichier) {
$this->messages->afficherAvancement("Analyse des descriptions");
$this->verifierFichier();
}
echo "\n";
$fichierTxt = $this->dossierBase.self::DOSSIER_LOG.'analyse.log';
file_put_contents($fichierTxt, $this->log);
}
public function genererCorrespondance() {
$this->chargerFichiers();
foreach ($this->listeFichiers as $this->fichierNum => $this->fichier) {
$this->messages->afficherAvancement("Création du fichier de correspondance");
$this->extraireInfosCorrespondance();
}
echo "\n";
$fichierTxt = $this->dossierBase.self::DOSSIER_V0.'index_general_sp.tsv';
$txtCorrespondance = $this->creerFichierCsvCorrespondance();
file_put_contents($fichierTxt, $txtCorrespondance);
$fichierLog = $this->dossierBase.self::DOSSIER_LOG.'synonymes.log';
file_put_contents($fichierLog, $this->log);
}
private function chargerFichiers() {
$this->nomDossier = $this->dossierBase.self::DOSSIER_DSC_HTML;
if (file_exists($this->nomDossier) === true) {
if (is_dir($this->nomDossier)) {
if ($dossierOuvert = opendir($this->nomDossier)) {
while (($this->nomFichier = readdir($dossierOuvert)) !== false) {
if (! is_dir($this->nomFichier) && preg_match('/e([0-9]{4})\.htm/', $this->nomFichier, $match)) {
$this->listeFichiers[$match[1]] = $this->nomDossier.'/'.$this->nomFichier;
}
}
closedir($dossierOuvert);
} else {
$this->messages->traiterErreur("Le dossier {$this->nomDossier} n'a pas pu être ouvert.");
}
} else {
$this->messages->traiterErreur("{$this->nomDossier} n'est pas un dossier.");
}
} else {
$this->messages->traiterErreur("Le dossier {$this->nomDossier} est introuvable.");
}
arsort($this->listeFichiers);
}
private function verifierFichier() {
$donnees = $this->analyserFichier();
$txt = $donnees['texte'];
$this->verifierOuvertureFermetureBalise($txt);
$this->verifierAbscenceEgale($txt);
$this->verifierNumero($txt);
// TODO : vérifier les noms vernauclaire qui sont abrégés
}
private function verifierOuvertureFermetureBalise($txt) {
$b_ouvert = substr_count($txt, '<B>');
$b_ferme = substr_count($txt, '</B>');
if ($b_ouvert != $b_ferme) {
$this->log .= "{$this->fichierNum} contient $b_ouvert balises B ouvertes et $b_ferme fermées\n";
}
$i_ouvert = substr_count($txt, '<I>');
$i_ferme = substr_count($txt, '</I>');
if ($i_ouvert != $i_ferme) {
$this->log .= "{$this->fichierNum} contient $i_ouvert balises I ouvertes et $i_ferme fermées\n";
}
}
private function verifierAbscenceEgale($txt) {
if (strripos($txt, '=') === false) {
$this->log .= "{$this->fichierNum} ne contient pas le séparateur de phénologie (=)\n";
}
}
private function verifierNumero($txt) {
if (preg_match('/^<B>[0-9]{1,4}. – /', $txt) == 0) {
$this->log .= "{$this->fichierNum} ne contient pas un numéro bien formaté\n";
}
}
private function extraireInfosCorrespondance() {
$donnees = $this->analyserFichier();
$infos = $this->infosCorrespondanceBase;
$titre = $donnees['titre'];
if (preg_match('/^Coste ([0-9]+) - ((?:(?! - ).)+) - F[0-9]+, (?:(?! - ).)+ - (G[0-9]+), T([123])[.]p([0-9]+)$/', $titre, $match)) {
$infos['num_nom_coste'] = $match[1];
$infos['nom_sci'] = $match[2];
$infos['num_tax_sup_coste'] = $match[3];
$infos['tome'] = $match[4];
$infos['page'] = $match[5];
} else {
$this->messages->traiterErreur("Le titre du fichier {$this->fichierNum} est mal formaté.");
}
$corres = $donnees['correspondance'];
if (preg_match('/^Bdnff ([0-9]+) - (?:(?! - ).)+ - (?:(?! - ).)+ - Tax=([0-9]+)$/', $corres, $match)) {
$infos['bdnff_nn'] = $match[1];
$infos['bdnff_nt'] = $match[2];
} else {
$this->messages->traiterErreur("La correspondance du fichier {$this->fichierNum} est mal formatée.");
}
$txt = $donnees['texte'];
$txt = $this->corrigerDescription($txt);
if (preg_match('/^<B>[0-9]{1,4}[.] – ([^<]+)<\/B> ([^–]*)– (?:<I>([^<]+)<\/I>[.] – |<I>([^<]+)<\/I>( \([^)]+\))[.] – |[A-Z]|<I>(?:Sous-|Espèce|Turion|Souche|Plante|Feuille|Racine))/u', $txt, $match)) {
$infos['nom_coste'] = trim($match[1]);
$infos['auteur_coste'] = trim($match[2]);
$infos['nom_francais'] = isset($match[3]) ? $match[3] : '';
$infos['nom_francais'] = isset($match[4]) && isset($match[5]) ? $match[4].$match[5] : $infos['nom_francais'];
if (strpos($infos['auteur_coste'], '(' ) !== false) {
if (preg_match('/^([^(]*)\(([^)]+)\)(?:[.]?| ; ((?:(?! – ).)+))$/', $infos['auteur_coste'], $match)) {
$infos['auteur_coste'] = trim($match[1]);
$infos['auteur'] = $this->traiterAuteur($infos['auteur_coste']);
$parentheseContenu = trim($match[2]);
if (preg_match('/^[0-9]+$/', $parentheseContenu)) {
$infos['annee'] = $parentheseContenu;
} else {
$infos['synonymie_coste'] = $parentheseContenu;
$infos['biblio_coste'] = isset($match[3]) ? trim($match[3]) : '';
}
} else {
$this->messages->traiterErreur("L'auteur du nom sciencitifique du fichier {$this->fichierNum} est mal formaté.");
}
}
} else {
$this->messages->traiterErreur("La texte du fichier {$this->fichierNum} est mal formaté.");
}
$this->correspondance[] = $infos;
if ($infos['synonymie_coste'] != '') {
$this->traiterSynonymie($infos);
}
}
private function traiterAuteur($auteurCoste) {
$auteur = '';
if ($auteurCoste != '') {
$auteur = str_replace('et', '&', $auteurCoste);
}
return $auteur;
}
private function traiterSynonymie($infos) {
$synoCoste = $infos['synonymie_coste'];
$synoCoste = preg_replace('/^et /', '', $synoCoste);
$synoCoste = preg_replace('/ et ([A-Z]{2,}|[A-Z][.] [A-Z]{2,})/', ' ; $1', $synoCoste);
$synoCoste = preg_replace('/, ((?:(?!non |part[.]|an |G[.] G[.])[^,]+))/', ' ;$1', $synoCoste);
$synonymes = explode(';', $synoCoste);
foreach ($synonymes as $syno) {
$syno = trim($syno);
$syno = trim($syno, ' ');
$infosSyno = $this->infosCorrespondanceBase;
$this->log .= $infos['num_nom_coste']."\t$syno\n";
$this->correspondance[] = $infosSyno;
}
}
private function creerFichierCsvCorrespondance() {
$lignes[] = implode("\t", array_keys($this->infosCorrespondanceBase));
foreach ($this->correspondance as $infos) {
$lignes[] = implode("\t", $infos);
}
$txt = '';
$txt = implode("\n", $lignes);
return $txt;
}
private function genererFichier() {
$donnees = $this->analyserFichier();
$txt = $this->nettoyerDescription($donnees['texte']);
$txt = $this->corrigerDescription($txt);
$txt = $this->remplacerHtmlParSyntaxeWiki($txt);
$fichierTxt = $this->dossierBase.self::DOSSIER_DSC_TXT.$this->fichierNum.'.txt';
file_put_contents($fichierTxt, $txt);
unset($donnees['texte']);
$txt = implode("\n", $donnees);
$fichierTxt = $this->dossierBase.self::DOSSIER_DSC_TXT.$this->fichierNum.'.json';
file_put_contents($fichierTxt, $txt);
}
private function analyserFichier() {
$donnees = array('titre' => '', 'texte' => '', 'correspondance' => '');
if ($fichierOuvert = fopen($this->fichier, 'r')) {
$i = 1;
while ($ligne = fgets($fichierOuvert)) {
if ($i == 24) {
$donnees['titre'] = $this->supprimerHtml($ligne);
} elseif ($i >= 45 && $i <= 60) {
$donnees['texte'] .= $this->traiterLigneDescription($ligne);
} elseif ($i >= 61 && preg_match('/Bdnff /ui', $ligne)) {
$donnees['correspondance'] = $this->supprimerHtml($ligne);
}
$i++;
}
fclose($fichierOuvert);
} else {
$this->messages->traiterErreur("Le fichier {$this->fichier} n'a pas pu être ouvert.");
}
return $donnees;
}
private function supprimerHtml($txt) {
$txt = strip_tags($txt,'<b>,<i>');
$txt = str_replace('­', '', $txt);
$txt = str_ireplace(' ', ' ', $txt);
$txt = trim($txt);
$txt = preg_replace('/^<\/I>/', '', $txt);
$txt = html_entity_decode($txt, ENT_NOQUOTES, 'UTF-8');
return $txt;
}
private function traiterLigneDescription($txt) {
$txt = $this->supprimerHtml($txt);
$txt = $txt."\n";
return $txt;
}
private function nettoyerDescription($txt) {
$txt = preg_replace("/\n{2,}+/", "\n", $txt);
$txt = trim($txt);
return $txt;
}
private function corrigerDescription($txt) {
$txt = preg_replace("/– <I>([^.]+?)[.] – <\/I>/", "– <I>$1</I>. – ", $txt);
$txt = preg_replace("/– <I>([^.]+?)[.] – ([A-Z])<\/I>/", "– <I>$1</I>. – $2", $txt);
$txt = preg_replace("/– <I>([^.]+?) – <\/I>/", "– <I>$1</I>. – ", $txt);
return $txt;
}
private function remplacerHtmlParSyntaxeWiki($txt) {
$txt = str_replace(array('<B>', '</B>'), '**', $txt);
$txt = str_replace(array('<I>', '</I>'), '//', $txt);
return $txt;
}
}
?>