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<?php
// declare(encoding='UTF-8');
/**
 * Classe de nettoyage de la base de données du CEL.
 * Suppression des antislash
 * Remplacement des chaines vides par des NULL
 * Unifier les référentiels : pas de nom de version, majuscule...
 * Unifier les certitudes
 * Supprimer les INSEE-C: non rempli, les dates 0000-00 
 *
 * Utilisation :
 * - <code>/opt/lamp/bin/php cli.php nettoyage -a (voir méthode executer)</code>
 *
 * @category   CEL
 * @package    Scripts
 * @subpackage Nettoyage
 * @author     Delphine CAUQUIL <delphine@tela-botanica.org>
 * @license    GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
 * @license    CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
 * @copyright  1999-2016 Tela Botanica <accueil@tela-botanica.org>
 */
class Nettoyage extends Script {

        protected $bdd;
        protected $colonnes;
        protected $bd_cel = "tb_nettoye_cel";
        protected $bd_del = "tb_del";


        public function __construct($script_nom, $parametres_cli) {
                parent::__construct($script_nom, $parametres_cli);
                $this->bdd = new Bdd();
                $this->bd_cel = Config::get('nettoyage.cel_nettoye');
                $this->bd_del = Config::get('nettoyage.del');
        }

        public function executer() {
                $cmd = $this->getParametre('a');
                $requete_colonnes = "SELECT column_name FROM information_schema.columns WHERE table_name = 'cel_obs' AND table_schema='".$this->bd_cel."';";
                $this->colonnes = $this->bdd->recupererTous($requete_colonnes);
                try {
                        switch ($cmd) {
                                case 'tout' :
                                        $this->supprimerRetourLigne();
                                        $this->supprimerAntislash();
                                        $this->supprimerGuillemet();
                                        $this->unifierNull();
                                        $this->unifierNomReferentiel();
                                        $this->unifierCertitude();
                                        $this->supprimerCertitudeAutre();
                                        $this->unifierUtilisateur();
                                        $this->unifierPhenologie();
                                        $this->verifierCodeInsee();
                                        $this->verifierGeodatum();
                                        $this->supprimerInfosLiesObsInexistante();
                                        $this->supprimerImagesetTagAnonymes();
                                        $this->analyserMotsCles();
                                        $this->changerSensible();
                                        $this->unifierNull();
                                        break;
                                case 'supprimerRetourLigne' :
                                    $this->supprimerRetourLigne();
                                    break;
                                case 'supprimerAntislash' :
                                        $this->supprimerAntislash();
                                        break;
                                case 'supprimerGuillemet' :
                                    $this->supprimerGuillemet();
                                    break;
                                case 'unifierNomReferentiel' :
                                        $this->unifierNomReferentiel();
                                        break;
                                case 'unifierCertitude' :
                                        $this->unifierCertitude();
                                        break;
                                case 'supprimerCertitudeAutre' : // après unifier certitude si les autres valeurs sont bien à supprimer
                                    $this->supprimerCertitudeAutre();
                                    break;
                                case 'analyserMotsCles' : // après unifier certitude si les autres valeurs sont bien à supprimer
                                    $this->analyserMotsCles();
                                    break;
                                case 'verifierGeodatum' :
                                        $this->verifierGeodatum();
                                        break;
                                case 'verifierCodeInsee' :
                                    $this->verifierCodeInsee();
                                    break;
                                case 'sensible' :
                                    $this->changerSensible();
                                    break;
                                case 'unifierNull' : // lancer en dernier pour bien réussir
                                        $this->unifierNull();
                                        break;
                                case 'supprimerImagesetTagAnonymes' :
                                    $this->supprimerImagesetTagAnonymes();
                                    break;
                                case 'supprimerInfosLiesObsInexistante' :
                                    $this->supprimerInfosLiesObsInexistante();
                                    break;
                                case 'unifierUtilisateur' : 
                                    $this->unifierUtilisateur();
                                    break;
                                case 'unifierInfosEspece' :
                                    $this->unifierUtilisateur();
                                    break;
                                case 'unifierPhenologie' :
                                    $this->unifierPhenologie();
                                    break;
                                default :
                                        $msg = "Erreur : la commande '$cmd' n'existe pas!\n".
                                                "Commandes existantes : regenererMotsClesTexteObs, regenererMotsClesTexteImages"
                                                        . ", regenererMotsClesTexteObsTout, regenererMotsClesTexteImagesTout"
                                                        . ", viderMotsClesTexteImagesSansMotsCles, viderMotsClesTexteObsSansMotsCles"
                                                        . ", regenererChampsTailleImage, reparerLiaisonsOublieesObs, reparerLiaisonsOublieesImages"
                                                        . ", reparerLiaisonsObsParMotsClesTexte, reductionMotsClesImages, reductionMotsClesImagesUtil"
                                                        . ", reduireEtNormaliserMotsClesImagesUtil, reduireEtNormaliserMotsClesImages"
                                                        . ", reductionMotsClesObs, reductionMotsClesObsUtil, reduireEtNormaliserMotsClesObsUtil"
                                                        . ", reduireEtNormaliserMotsClesObs";
                                        throw new Exception($msg);
                        }
                } catch (Exception $e) {
                        $this->traiterErreur($e->getMessage());
                }
        }
        

        private function supprimerRetourLigne() {               
                foreach ($this->colonnes as $id=>$colonne) {
                        echo "Suppression des retour ligne dans la colonne ".$colonne['column_name']." ...";
                        $requete = "UPDATE ".$this->bd_cel.".cel_obs SET ".$colonne['column_name']." = REPLACE(".$colonne['column_name'].', "\n", "")';
                        $this->bdd->requeter($requete);
                        echo "effectuée \n";
                }
        }
        
        private function supprimerAntislash() {
                foreach ($this->colonnes as $id=>$colonne) {
                        echo "Suppression des antislash dans la colonne ".$colonne['column_name']." ...";
                        $requete = "UPDATE ".$this->bd_cel.".cel_obs SET ".$colonne['column_name']." = REPLACE(".$colonne['column_name'].', "\\\", "")';
                        $this->bdd->requeter($requete);
                        echo "effectuée \n";
                }
        }
        
        private function supprimerGuillemet() {
                foreach ($this->colonnes as $id=>$colonne) {
                        echo "Suppression des guillements dans la colonne ".$colonne['column_name']." ...";
                        $requete = "UPDATE ".$this->bd_cel.".cel_obs SET ".$colonne['column_name']." = REPLACE(".$colonne['column_name'].',"\"", "")';
                        $this->bdd->requeter($requete);
                        echo "effectuée \n";
                }
        }
        
        private function unifierNull() {
            foreach ($this->colonnes as $id=>$colonne) {
                        echo "Suppression des vides dans la colonne ".$colonne['column_name']." ...";
                        $dsl = array( 'transmission', 'altitude');
                        if (isset($dsl[$colonne['column_name']])) {
                                $requete = "UPDATE ".$this->bd_cel.".cel_obs SET ".$colonne['column_name']." = NULL WHERE trim(".$colonne['column_name'].") = '' and ".$colonne['column_name']." != '0'";
                        } else {
                                $requete = "UPDATE ".$this->bd_cel.".cel_obs SET ".$colonne['column_name']." = NULL WHERE trim(".$colonne['column_name'].") = '' OR ".$colonne['column_name']." IN ('INSEE-C:', '0000-00-00 00:00:00', '0.00000')";
                        }
                        $this->bdd->requeter($requete);
                        echo "effectuée \n";
                }
        }
        
        private function unifierCertitude() {
                echo "Uniformisation du champ certitude/identification";
                $certitude = array("A déterminer" => "à déterminer",
                    "À déterminer, voir photo" => "à déterminer",
                    "A déterminer" => "à déterminer",
                    "aDeterminer" => "à déterminer",
                    "déterminer" => "à déterminer",
                    "Inconnue" => "à déterminer",
                    "Ceraine" => "certain",
                    "certain" => "certain",
                    "Certainaaua" => "certain",
                    "Certaine" => "certain",
                    "Certaine K- rhizines blanche" => "certain",
                    "Certaine ( mais voir notes)" => "certain",
                    "Certaine (à 99%)" => "certain",
                    "Certaine Anett" => "certain",
                    "Certaine Anette" => "certain",
                    "Certaine Valériane officinale" => "certain",
                    "Certaine, Faite et confirmée par JM BERAUD" => "certain",
                    "Certaine, par Jean Lebail" => "certain",
                    "Certaine, subsp. minus" => "certain",
                    "Certainea" => "certain",
                    "Certaineanno" => "certain",
                    "Certainearia n" => "certain",
                    "Certainee" => "certain",
                    "Certainej" => "certain",
                    "Certainel" => "certain",
                    "CertaineNom de travai" => "certain",
                    "CertaineNom de travail" => "certain",
                    "Certainesites" => "certain",
                    "Certainesous-bois de feuillus en versant sud à sud-ouest" => "certain",
                    "Certaineu" => "certain",
                    "sure" => "certain",
                    "validée sur forum Naturalistes de l'ouest" => "certain",
                    "à confirmer" => "douteux",
                    "à approfondir" => "douteux",
                    "à cofirmer" => "douteux",
                    "À confiermer" => "douteux",
                    "A confirlmer" => "douteux",
                    "A confirmer" => "douteux",
                    "à confirmer vs. pumilum" => "douteux",
                    "à conirmer" => "douteux",
                    "à vérifier" => "douteux",
                    "douteuse" => "douteux",
                    "Douteuse (canadensis ?)" => "douteux",
                    "Douteuse ?" => "douteux",
                    "Douteuse à confirmer" => "douteux",
                    "Douteuse peut-être cordata" => "douteux",
                    "Douteuse, fleurs rouges" => "douteux",
                    "douteux" => "douteux",
                    "espèce bisannuelle mais non bien déterminée" => "douteux",
                    "Incertaine" => "douteux",
                    "Pavot douteux" => "douteux",
                    "Potentille ansérine, supposé" => "douteux",
                    "presque certaine" => "douteux",
                    "Quasi Certaine" => "douteux",
                    "ssp déterminer" => "douteux",
                    "subsp à vérifier" => "douteux",
                    "subsp. microphyllum ?" => "douteux",
                    "très douteuse" => "douteux",
                    "Très probable" => "douteux");
                foreach ($certitude as $valeur=>$saisie) {
                        $requete = 'UPDATE '.$this->bd_cel.'.cel_obs SET commentaire = concat(commentaire, " Certitude : ", certitude), certitude = "'.$saisie.'" WHERE certitude ="'.$valeur.'"';
                        $this->bdd->requeter($requete);
                        echo "effectuée \n";
                }
                $requete_verif = "SELECT certitude FROM ".$this->bd_cel.".cel_obs WHERE certitude NOT IN ('douteux', 'certain', 'à déterminer', '') and certitude is not NULL";
                $verif = $this->bdd->recupererTous($requete_verif);
                if ($verif != array()) print_r($verif);
        }
        
        private function supprimerCertitudeAutre() {
            echo "suppression des valeurs non compréhensible du champ certitude/identification";
            $requete = "UPDATE ".$this->bd_cel.".cel_obs 
                SET commentaire = case isnull(commentaire) when 1 THEN certitude ELSE concat(commentaire, ' Certitude : ', certitude) END, 
                certitude = '' WHERE `certitude` NOT IN ('douteux', 'certain', 'à déterminer', '') and certitude is not NULL";
            $this->bdd->requeter($requete);
                echo "effectuée \n";
            $requete_verif = "SELECT certitude FROM ".$this->bd_cel.".cel_obs WHERE certitude NOT IN ('douteux', 'certain', 'à déterminer', '') and certitude is not NULL";
            $verif = $this->bdd->recupererTous($requete_verif);
            if ($verif != array()) print_r($verif);
        }
        
        private function unifierPhenologie() {
            echo "Uniformisation du champ phenologie";
            $phenologie = array("2" => "00-09: germination, développement des bourgeons",
                "5" => "00-09: germination, développement des bourgeons",
                "5" => "00-09: germination, développement des bourgeons",
                "8" => "00-09: germination, développement des bourgeons",
                "8" => "00-09: germination, développement des bourgeons",
                "9" => "00-09: germination, développement des bourgeons",
                "00-09" => "00-09: germination, développement des bourgeons",
                "Germination, développement des bourgeons" => "00-09: germination, développement des bourgeons",
                "10" => "10-19: développement des feuilles",
                "11" => "10-19: développement des feuilles",
                "12" => "10-19: développement des feuilles",
                "14" => "10-19: développement des feuilles",
                "15" => "10-19: développement des feuilles",
                "16" => "10-19: développement des feuilles",
                "17" => "10-19: développement des feuilles",
                "18" => "10-19: développement des feuilles",
                "19" => "10-19: développement des feuilles",
                "10-19" => "10-19: développement des feuilles",
                "10-19: développement des feui" => "10-19: développement des feuilles",
                "10-19: développement des feuilles" => "10-19: développement des feuilles",
                "15: environ % des feuilles épanouies" => "10-19: développement des feuilles",
                "19   environ 50% des feuilles épanouies" => "10-19: développement des feuilles",
                "en feuilles" => "10-19: développement des feuilles",
                "Feuille" => "10-19: développement des feuilles",
                "feuille peu dvt, a confirmer" => "10-19: développement des feuilles",
                "feuilles seulement" => "10-19: développement des feuilles",
                "20" => "20-29: formation de pousses latérales, tallage",
                "Formation de pousses latérales, tallage" => "20-29: formation de pousses latérales, tallage",
                "30" => "30-39: développement des tiges, croissance des rosettes",
                "35" => "30-39: développement des tiges, croissance des rosettes",
                "36" => "30-39: développement des tiges, croissance des rosettes",
                "38" => "30-39: développement des tiges, croissance des rosettes",
                "39" => "30-39: développement des tiges, croissance des rosettes",
                "3: développement des tiges, croissance des rosettes" => "30-39: développement des tiges, croissance des rosettes",
                "Développement des tiges, croissance des rosettes" => "30-39: développement des tiges, croissance des rosettes",
                "40" => "40-49: développement des organes de propagation végétative",
                "43" => "40-49: développement des organes de propagation végétative",
                "45" => "40-49: développement des organes de propagation végétative",
                "46" => "40-49: développement des organes de propagation végétative",
                "48" => "40-49: développement des organes de propagation végétative",
                "49" => "40-49: développement des organes de propagation végétative",
                "40-49" => "40-49: développement des organes de propagation végétative",
                "40-49: développement des organes de propagation végétative" => "40-49: développement des organes de propagation végétative",
                "40-49: développement des organes de propagation végétativegt" => "40-49: développement des organes de propagation végétative",
                "40-49: développement des organes de propagation végétativepas d'inflorescence" => "40-49: développement des organes de propagation végétative",
                "50" => "50-59 : apparition de l’inflorescence",
                "56" => "50-59 : apparition de l’inflorescence",
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                "58" => "50-59 : apparition de l’inflorescence",
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                "10x En bouton" => "50-59 : apparition de l’inflorescence",
                "14x En bouton" => "50-59 : apparition de l’inflorescence",
                "20x En bouton" => "50-59 : apparition de l’inflorescence",
                "30-39" => "50-59 : apparition de l’inflorescence",
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                "50-59: apparition de l'inflorescence, épiaison" => "50-59 : apparition de l’inflorescence",
                "59: apparition de l'inflorescence, épiaison" => "50-59 : apparition de l’inflorescence",
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                "69" => "60-69 : floraison",
                " floraison " => "60-69 : floraison",
                "-69: floraison" => "60-69 : floraison",
                "10x Fin de floraison" => "60-69 : floraison",
                "12x Pleine floraison" => "60-69 : floraison",
                "14x Début de floraison" => "60-69 : floraison",
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                "17x Fin de floraison" => "60-69 : floraison",
                "1x Début de floraison" => "60-69 : floraison",
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                "1x Fin de floraison" => "60-69 : floraison",
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                "27x En fleur" => "60-69 : floraison",
                "30x Fin de floraison" => "60-69 : floraison",
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                "environ 30% des fleurs épanouies" => "60-69 : floraison",
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                "fin de floraison" => "60-69 : floraison",
                "fin floraison" => "60-69 : floraison",
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                "61 :" => "61: environ 10% des fleurs épanouies",
                "61 :  environ 10% des fleurs épanouies" => "61: environ 10% des fleurs épanouies",
                "61: début defloraison" => "61: environ 10% des fleurs épanouies",
                "61: floraison" => "61: environ 10% des fleurs épanouies",
                "61: environ 10% des fleurs épanouie" => "61: environ 10% des fleurs épanouies",
                "61: environ 10% des fleurs épanouies" => "61: environ 10% des fleurs épanouies",
                "61: environ 10% des fleurs épanouies63" => "61: environ 10% des fleurs épanouies",
                "61: environ 10% des fleurs épanouies68" => "61: environ 10% des fleurs épanouies",
                "61: environ 2% des fleurs épanouies" => "61: environ 10% des fleurs épanouies",
                "61: environ20% des fleurs épanouies" => "61: environ 10% des fleurs épanouies",
                "Fleurs (environ 10% des fleurs épanouies)" => "61: environ 10% des fleurs épanouies",
                "65" => "65: environ 50% des fleurs épanouies",
                "65" => "65: environ 50% des fleurs épanouies",
                "6: environ 50% des fleurs épanouies" => "65: environ 50% des fleurs épanouies",
                "65 , avec quelques fruits" => "65: environ 50% des fleurs épanouies",
                "65 : environ 80% des fleurs épanouies" => "65: environ 50% des fleurs épanouies",
                "65 : environ 10% des fleurs ép" => "65: environ 50% des fleurs épanouies",
                "65 : environ 50% des fleurs épa" => "65: environ 50% des fleurs épanouies",
                "65 : environ 50% des fleurs épanouies" => "65: environ 50% des fleurs épanouies",
                "65 : environ 50% des fleurs épanouies-75" => "65: environ 50% des fleurs épanouies",
                "65-6: floraison" => "65: environ 50% des fleurs épanouies",
                "65-69: floraison" => "65: environ 50% des fleurs épanouies",
                "65-7: floraison" => "65: environ 50% des fleurs épanouies",
                "65-72" => "65: environ 50% des fleurs épanouies",
                "65:" => "65: environ 50% des fleurs épanouies",
                "65: floraison" => "65: environ 50% des fleurs épanouies",
                "65: environ 10% des fleurs épanouies" => "65: environ 50% des fleurs épanouies",
                "65: environ 50% des fleurs épanoui" => "65: environ 50% des fleurs épanouies",
                "65: environ 50% des fleurs épanouie6" => "65: environ 50% des fleurs épanouies",
                "65: environ 50% des fleurs épanouies" => "65: environ 50% des fleurs épanouies",
                "65: environ 50% des fleurs épanouies et fructification" => "65: environ 50% des fleurs épanouies",
                "65: environ 50% des fleurs épanouies75" => "65: environ 50% des fleurs épanouies",
                "65: environ 50% des fleurs épanouies78" => "65: environ 50% des fleurs épanouies",
                "65:-70" => "65: environ 50% des fleurs épanouies",
                "65:-75" => "65: environ 50% des fleurs épanouies",
                "avec quelques fruits, 65" => "65: environ 50% des fleurs épanouies",
                "nviron 50% des fleurs épanouies" => "65: environ 50% des fleurs épanouies",
                "70" => "70-79: fructification",
                "71" => "70-79: fructification",
                "72" => "70-79: fructification",
                "73" => "70-79: fructification",
                "74" => "70-79: fructification",
                "75" => "70-79: fructification",
                "76" => "70-79: fructification",
                "77" => "70-79: fructification",
                "78" => "70-79: fructification",
                "79" => "70-79: fructification",
                "7: fructification" => "70-79: fructification",
                "70-: fructification" => "70-79: fructification",
                "70-71" => "70-79: fructification",
                "70-79" => "70-79: fructification",
                "70-79: floraison" => "70-79: fructification",
                "70-79: fructification" => "70-79: fructification",
                "70-79: fructification ?" => "70-79: fructification",
                "70-79: fructification +floraison" => "70-79: fructification",
                "70-79: fructification Entre autre" => "70-79: fructification",
                "70-79: fructification, mais fruits verts" => "70-79: fructification",
                "70-79: fructificationfleurs et fruit" => "70-79: fructification",
                "70-79:fin floraison fructification" => "70-79: fructification",
                "709: fructification" => "70-79: fructification",
                "75: fructification" => "70-79: fructification",
                "Début de ruits" => "70-79: fructification",
                "fin floraison et fructification" => "70-79: fructification",
                "fleur, fruit" => "70-79: fructification",
                "fleurs e fructification" => "70-79: fructification",
                "Fleurs et début fruits" => "70-79: fructification",
                "Fleurs et début ruits" => "70-79: fructification",
                "Fleurs et fructification" => "70-79: fructification",
                "floraison - fructification" => "70-79: fructification",
                "floraison zet fructification" => "70-79: fructification",
                "Floraison, fructification" => "70-79: fructification",
                "floraison(fin) fructification" => "70-79: fructification",
                "floraison+ ou - finie" => "70-79: fructification",
                "fr1" => "70-79: fructification",
                "quelques fruits rares" => "70-79: fructification",
                "stérile70-79: fructification" => "70-79: fructification",
                "toutes les fleurs épanouies et début fructification" => "70-79: fructification",
                "fleurs et fruits" => "70-79: fructification",
                "Fleurs et jeunes fruits" => "70-79: fructification",
                "floraison + fructification" => "70-79: fructification",
                "Fructificaiton" => "70-79: fructification",
                "fleurs et quelques fruits" => "70-79: fructification",
                "Fleurs et surtout début defruits" => "70-79: fructification",
                "floraison et fructification" => "70-79: fructification",
                "fructification" => "70-79: fructification",
                "Fleurs/fruits" => "70-79: fructification",
                "fructification ?" => "70-79: fructification",
                "80" => "80-89: maturité des fruits et des graines",
                "81" => "80-89: maturité des fruits et des graines",
                "82" => "80-89: maturité des fruits et des graines",
                "83" => "80-89: maturité des fruits et des graines",
                "84" => "80-89: maturité des fruits et des graines",
                "86" => "80-89: maturité des fruits et des graines",
                "87" => "80-89: maturité des fruits et des graines",
                "88" => "80-89: maturité des fruits et des graines",
                "89" => "80-89: maturité des fruits et des graines",
                "-89: maturité des fruits et des graines" => "80-89: maturité des fruits et des graines",
                "80-89" => "80-89: maturité des fruits et des graines",
                "80-89: maturité des fruits et des graines" => "80-89: maturité des fruits et des graines",
                "80-89: maturité des fruits et des graines,début sénescence" => "80-89: maturité des fruits et des graines",
                "80-95" => "80-89: maturité des fruits et des graines",
                "88  maturité des fruits et des graines" => "80-89: maturité des fruits et des graines",
                "89: maturité des fruits et des graines" => "80-89: maturité des fruits et des graines",
                "floraison et fructification, graines mûres" => "80-89: maturité des fruits et des graines",
                "floraison et maturation des graines" => "80-89: maturité des fruits et des graines",
                "fructification passée" => "80-89: maturité des fruits et des graines",
                "Fruit" => "80-89: maturité des fruits et des graines",
                "Fruits" => "80-89: maturité des fruits et des graines",
                "85" => "85: 50% des fruits matures",
                "50% des fruits matures (fructification d'Août)î" => "85: 50% des fruits matures",
                "85, mais avec encore des fleurs" => "85: 50% des fruits matures",
                "85:" => "85: 50% des fruits matures",
                "85:   fruits matures 20" => "85: 50% des fruits matures",
                "85: 50% des fruits mature8" => "85: 50% des fruits matures",
                "85: 50% des fruits matures" => "85: 50% des fruits matures",
                "85: 50% des fruits matures0" => "85: 50% des fruits matures",
                "85: 50% des fruits matures56" => "85: 50% des fruits matures",
                "85: 50% des fruits matures88" => "85: 50% des fruits matures",
                "88: 50% des fruits matures" => "85: 50% des fruits matures",
                "90" => "90-99: sénescence et dormance",
                "91" => "90-99: sénescence et dormance",
                "92" => "90-99: sénescence et dormance",
                "94" => "90-99: sénescence et dormance",
                "95" => "90-99: sénescence et dormance",
                "97" => "90-99: sénescence et dormance",
                "98" => "90-99: sénescence et dormance",
                "99" => "90-99: sénescence et dormance",
                "100% de feuilles jaunes" => "90-99: sénescence et dormance",
                "80% feuillage d'automne" => "90-99: sénescence et dormance",
                "90-99" => "90-99: sénescence et dormance",
                "90-99: sénescence et dormance" => "90-99: sénescence et dormance",
                "95: environ 9% des feuilles jaunes" => "90-99: sénescence et dormance"
            );
            foreach ($phenologie as $valeur=>$saisie) {
                $requete = 'UPDATE '.$this->bd_cel.'.cel_obs SET commentaire = concat(commentaire, " Certitude : ", certitude), phenologie = "'.$saisie.'" WHERE phenologie ="'.$valeur.'"';
                $this->bdd->requeter($requete);
                echo "effectuée \n";
            }
            $requete_verif = "SELECT certitude FROM ".$this->bd_cel.".cel_obs WHERE certitude NOT IN ('douteux', 'certain', 'à déterminer', '') and certitude is not NULL";
            $verif = $this->bdd->recupererTous($requete_verif);
            if ($verif != array()) print_r($verif);
        }
        
        private function unifierUtilisateur() {
            echo "vérification de la présence de l'annuaire \n";
            $requete = "SELECT * FROM ".$this->bd_cel.".`users`;";
            $result = $this->bdd->requeter($requete); 
            if ($result === NULL) {echo $requete;
                echo "Il manque la table annuaire (à recopier de telaorg users\n";
                exit;
            }
            
            echo "suppression de le colonne ordre \n";
            $requete = "ALTER TABLE ".$this->bd_cel.".cel_obs DROP INDEX id_obs;";
            $this->bdd->requeter($requete);
            $requete = "ALTER TABLE ".$this->bd_cel.".cel_obs DROP INDEX ordre;";
            $this->bdd->requeter($requete);
            $requete = "ALTER TABLE ".$this->bd_cel.".`cel_obs` DROP IF EXISTS `ordre`;";
            $this->bdd->requeter($requete);
            $requete = "ALTER TABLE ".$this->bd_cel.".`cel_obs` ADD IF NOT EXISTS pseudo  varchar(250);";
            $this->bdd->requeter($requete);
            
            echo "modification des observations ayant une adresse mail en identifiant";
            $requete_annu_mail = "UPDATE ".$this->bd_cel.".`cel_obs` right join ".$this->bd_cel.".`users` ON `user_email` = ce_utilisateur SET `ce_utilisateur` = `ID`, pseudo = user_nicename, 
                `courriel_utilisateur` =  `user_email`  WHERE ce_utilisateur like '%@%'";
            $utilisateur_mail = $this->bdd->recupererTous($requete_annu_mail);
            
            echo "modification des observations ayant une adresse mail mais pas d'identifiant";
            $requete_annu_mail = "UPDATE ".$this->bd_cel.".`cel_obs` join ".$this->bd_cel.".`users` ON `user_email` = courriel_utilisateur SET `ce_utilisateur` = `ID`, pseudo = user_nicename,
                `courriel_utilisateur` =  `user_email`  WHERE (ce_utilisateur IS NULL OR CHAR_LENGTH(ce_utilisateur) > 6
                OR ce_utilisateur = 0) and courriel_utilisateur like '%@%'";
            $utilisateur_mail = $this->bdd->recupererTous($requete_annu_mail);
            
            echo "modification des observations ayant un identifiant";
            $requete_annu_mail = "UPDATE ".$this->bd_cel.".`cel_obs` join ".$this->bd_cel.".`users` ON ID = ce_utilisateur SET pseudo = user_nicename,
                `courriel_utilisateur` =  `user_email` WHERE (ce_utilisateur IS NULL OR char_length(ce_utilisateur) > 6) and (courriel_utilisateur is null or courriel_utilisateur='')";
            $utilisateur_mail = $this->bdd->recupererTous($requete_annu_mail);
            
            echo "suppression des autres valeurs ce_utilisateur";
            $requete_annu_mail = "UPDATE ".$this->bd_cel.".`cel_obs` SET ce_utilisateur = NULL, courriel_utilisateur = if (ce_utilisateur like '%@%'and (courriel_utilisateur is null or courriel_utilisateur='') , ce_utilisateur, courriel_utilisateur) WHERE ce_utilisateur IS NOT NULL AND char_length(ce_utilisateur) > 6";
            $utilisateur_mail = $this->bdd->recupererTous($requete_annu_mail);
            
            echo "suppression des obs anonymes";
            $requete_anonyme = "DELETE FROM ".$this->bd_cel.".`cel_obs` WHERE (ce_utilisateur IS NULL OR char_length(ce_utilisateur) > 6
                OR ce_utilisateur = 0) and (`courriel_utilisateur` is null or `courriel_utilisateur` not like '%@%')";
            $this->bdd->requeter($requete_anonyme);        
            
            $requete_verif = "SELECT `ce_utilisateur`, `prenom_utilisateur`, `nom_utilisateur`, `courriel_utilisateur`  FROM ".$this->bd_cel.".cel_obs 
                    WHERE ce_utilisateur IS NOT NULL OR char_length(ce_utilisateur) > 6";
            $verif = $this->bdd->recupererTous($requete_verif);
            if ($verif != array()) print_r($verif);
            echo "effectuée \n";
            $this->unifierUtilisateurTag("cel_arbre_mots_cles_obs");
            $this->unifierUtilisateurTag("cel_arbre_mots_cles_images");
        }
        
        private function unifierUtilisateurTag($table) {
            echo "séparation des identifiants en ce_utilisateur et courriel";
            $requete = "ALTER TABLE ".$this->bd_cel.".".$table." ADD courriel varchar(255);";
            $this->bdd->requeter($requete);
            $requete = "UPDATE ".$this->bd_cel.".".$table." SET courriel = id_utilisateur, 
                id_utilisateur = NULL WHERE id_utilisateur like '%@%';";
            $this->bdd->requeter($requete);
            echo "recherche des identifiants pour les tags ayant que des courriels dans users";
            $requete = "UPDATE ".$this->bd_cel.".".$table." join ".$this->bd_cel.".`users` ON `user_email` = courriel SET `id_utilisateur` = `ID`
                WHERE courriel like '%@%';";
            $this->bdd->requeter($requete);
            echo "recherche des identifiants pour les tags ayant que des courriels dans obs";
            $requete = "UPDATE ".$this->bd_cel.".".$table." t join ".$this->bd_cel.".`cel_obs` o ON 
                `courriel` = courriel_utilisateur SET t.`id_utilisateur` = o.`ce_utilisateur`
                WHERE courriel_utilisateur like '%@%';";
            $this->bdd->requeter($requete);
            echo "suppression des tags sans identifiant";
            $requete_anonyme = "DELETE FROM ".$this->bd_cel.".".$table." WHERE 
                (id_utilisateur IS NULL OR trim(id_utilisateur) = '') OR char_length(id_utilisateur) > 6";
            $this->bdd->requeter($requete_anonyme);
            if ($table == "cel_arbre_mots_cles_obs") {
            $requete_anonyme = "DELETE FROM ".$this->bd_cel.".`cel_mots_cles_obs_liaison` 
                WHERE `id_element_lie` not in (SELECT `id_observation` FROM ".$this->bd_cel.".`cel_obs`) 
                    OR `id_mot_cle` NOT IN (SELECT `id_mot_cle` FROM ".$this->bd_cel.".`cel_arbre_mots_cles_obs`);";
            $this->bdd->requeter($requete_anonyme);
            } else {
                $requete_anonyme = "DELETE FROM ".$this->bd_cel.".`cel_mots_cles_images_liaison` 
                    WHERE `id_element_lie` not in (SELECT `id_image` FROM ".$this->bd_cel.".`cel_images`) 
                        OR `id_mot_cle` NOT IN (SELECT `id_mot_cle` FROM ".$this->bd_cel.".`cel_arbre_mots_cles_images`);";
                $this->bdd->requeter($requete_anonyme);
            }
        }
        
        private function supprimerImagesetTagAnonymes() {
            echo "vérification de la présence de l'annuaire \n";
            $requete = "SELECT * FROM ".$this->bd_cel.".`users`;";
            $result = $this->bdd->requeter($requete);
            if ($result === NULL) {echo $requete;
            echo "Il manque la table annuaire (à recopier de telaorg users\n";
            exit;
            }
            
            echo "suppression de le colonne ordre \n";
            $requete = "ALTER TABLE ".$this->bd_cel.".cel_images DROP INDEX id_img;";
            $this->bdd->requeter($requete);
            $requete = "ALTER TABLE ".$this->bd_cel.".`cel_images` DROP IF EXISTS `ordre`;";
            $this->bdd->requeter($requete);
            $requete = "ALTER TABLE ".$this->bd_cel.".`cel_images` ADD IF NOT EXISTS pseudo  varchar(250);";
            $this->bdd->requeter($requete);
            
            echo "modification des images ayant une adresse mail en identifiant";
            $requete_annu_mail = "UPDATE ".$this->bd_cel.".`cel_images` right join ".$this->bd_cel.".`users` ON `user_email` = ce_utilisateur SET `ce_utilisateur` = `ID`, pseudo = user_nicename,
                `courriel_utilisateur` =  `user_email`  WHERE ce_utilisateur like '%@%'";
            $utilisateur_mail = $this->bdd->recupererTous($requete_annu_mail);
            
            echo "modification des images ayant une adresse mail mais pas d'identifiant";
            $requete_annu_mail = "UPDATE ".$this->bd_cel.".`cel_images` join ".$this->bd_cel.".`users` ON `user_email` = courriel_utilisateur SET `ce_utilisateur` = `ID`, pseudo = user_nicename,
                `courriel_utilisateur` =  `user_email`  WHERE (ce_utilisateur IS NULL OR char_length(ce_utilisateur) > 6
                OR ce_utilisateur = 0) and courriel_utilisateur like '%@%'";
            $utilisateur_mail = $this->bdd->recupererTous($requete_annu_mail);
            
            echo "modification des images ayant un identifiant";
            $requete_annu_mail = "UPDATE ".$this->bd_cel.".`cel_images` join ".$this->bd_cel.".`users` ON ID = ce_utilisateur SET pseudo = user_nicename,
                `courriel_utilisateur` =  `user_email` WHERE (ce_utilisateur IS NULL OR char_length(ce_utilisateur) > 6) and (courriel_utilisateur is null or courriel_utilisateur='')";
            $utilisateur_mail = $this->bdd->recupererTous($requete_annu_mail);
            
            echo "suppression des autres valeurs ce_utilisateur";
            $requete_annu_mail = "UPDATE ".$this->bd_cel.".`cel_images` SET ce_utilisateur = NULL, courriel_utilisateur = if (ce_utilisateur like '%@%'and (courriel_utilisateur is null or courriel_utilisateur='') , ce_utilisateur, courriel_utilisateur) 
                WHERE ce_utilisateur IS NOT NULL AND (LENGTH(ce_utilisateur) > 6 OR trim(ce_utilisateur) = '')";
            $utilisateur_mail = $this->bdd->recupererTous($requete_annu_mail);
            
            
            echo "suppression des images\n";
            $requete_anonyme = "DELETE FROM ".$this->bd_cel.".`cel_images` WHERE (ce_utilisateur IS NULL OR char_length(ce_utilisateur) > 6
                OR ce_utilisateur = 0) and (`courriel_utilisateur` is null or `courriel_utilisateur` not like '%@%')";
            $this->bdd->requeter($requete_anonyme);
            

          /*  echo "suppression des tags obs anonymes";
            $requete_create = "CREATE TABLE ".$this->bd_cel.".user_mot_cle_absent AS SELECT distinct id_utilisateur FROM ".$this->bd_cel.".cel_arbre_mots_cles_obs WHERE id_utilisateur not in
                    (SELECT distinct id_utilisateur FROM ".$this->bd_cel.".cel_arbre_mots_cles_obs WHERE id_utilisateur in
                    (select distinct ce_utilisateur from ".$this->bd_cel.".cel_obs) or
                    id_utilisateur in (SELECT distinct courriel_utilisateur FROM ".$this->bd_cel.".cel_obs))";
            $this->bdd->requeter($requete_create);
            $requete_index = "ALTER TABLE ".$this->bd_cel.".`user_mot_cle_absent` ADD PRIMARY KEY(`id_utilisateur`);";
            $this->bdd->requeter($requete_index);
            $requete_anonyme = "DELETE FROM ".$this->bd_cel.".`cel_arbre_mots_cles_obs` WHERE `id_utilisateur` in (SELECT * FROM ".$this->bd_cel.".`user_mot_cle_absent`);";
            $this->bdd->requeter($requete_anonyme);
            $requete_anonyme = "DROP TABLE ".$this->bd_cel.".user_mot_cle_absent;";
            $this->bdd->requeter($requete_anonyme);
            $requete_anonyme = "UPDATE ".$this->bd_cel.".`cel_arbre_mots_cles_obs` a join ".$this->bd_cel.".cel_obs b on a.`id_utilisateur` = b.courriel_utilisateur SET a.`id_utilisateur` = b.ce_utilisateur
                WHERE b.ce_utilisateur IS NOT NULL AND b.ce_utilisateur != ''";
            $this->bdd->requeter($requete_anonyme);*/
            
        }
        
        private function unifierNomReferentiel() {
                echo "Uniformisation du nom de référentiel";
                $referentiels = array("bdtfx", "bdtre", "bdtxa", "apd", "lbf", "isfan");
                foreach ($referentiels as $referentiel) {
                        $requete = "UPDATE ".$this->bd_cel.".cel_obs SET nom_referentiel = '".$referentiel."' WHERE nom_referentiel like '".$referentiel."%'";
                        $this->bdd->requeter($requete);
                        $requete = "UPDATE ".$this->bd_cel.".cel_obs SET nom_referentiel = 'Autre/inconnu' WHERE nom_sel_nn IS NULL or nom_sel_nn = '0'";
                        $this->bdd->requeter($requete);
                        $requete = "UPDATE ".$this->bd_cel.".cel_obs SET nom_referentiel = 'apd' WHERE nom_referentiel like 'bdtao%'";
                        $this->bdd->requeter($requete);
                        $requete = "UPDATE ".$this->bd_cel.".cel_obs SET nom_referentiel = 'bdtfx' WHERE nom_referentiel like 'bdnff%'";
                        $this->bdd->requeter($requete);
                        echo "effectuée \n";
                        $requete = "UPDATE ".$this->bd_cel.".cel_obs SET nom_referentiel = 'Autre/inconnu' WHERE nom_referentiel IS NULL or nom_referentiel = ''";
                        $this->bdd->requeter($requete);
                        echo "effectuée \n";
                }
                $requete_verif = "SELECT nom_referentiel FROM ".$this->bd_cel.".cel_obs WHERE nom_referentiel NOT IN ('".implode("', '", $referentiels)."', 'Autre/inconnu')";
                $verif = $this->bdd->recupererTous($requete_verif);
                if ($verif != array()) print_r($verif);
        }
        
        private function supprimerInfosLiesObsInexistante() {
            echo "Supprimer infos liés à obs inexistante";
            $requete = "DELETE FROM ".$this->bd_cel.".`cel_obs_etendues` WHERE `id_observation` not in (select `id_observation` from ".$this->bd_cel.".cel_obs);";
            $this->bdd->requeter($requete);
            $requete = "DELETE FROM ".$this->bd_cel.".`cel_mots_cles_obs_liaison` WHERE `id_element_lie` not in (select `id_observation` from ".$this->bd_cel.".cel_obs);";
            $this->bdd->requeter($requete);
            $requete = "DELETE FROM ".$this->bd_cel.".`cel_mots_cles_obs_liaison` WHERE `id_mot_cle` not in (SELECT `id_mot_cle` FROM ".$this->bd_cel.".`cel_arbre_mots_cles_obs`);";
            $this->bdd->requeter($requete);
            $requete = "DELETE FROM ".$this->bd_cel.".`cel_images`  WHERE `ce_observation` is not null and `ce_observation` not in (select id_observation from ".$this->bd_cel.".cel_obs)";
            $this->bdd->requeter($requete);
            $requete = "DELETE FROM ".$this->bd_cel.".`cel_mots_cles_images_liaison` WHERE `id_element_lie` not in (select `id_image` from ".$this->bd_cel.".cel_images);";
            $this->bdd->requeter($requete);
            $requete = "DELETE FROM ".$this->bd_cel.".`cel_mots_cles_images_liaison` WHERE `id_mot_cle` not in (SELECT `id_mot_cle` FROM ".$this->bd_cel.".`cel_arbre_mots_cles_images`);";
            $this->bdd->requeter($requete);
            echo "effectuée \n";
        }
        
        private function verifierGeodatum() {
                echo "Uniformisation du geodatum";
                $requete = "UPDATE ".$this->bd_cel.".cel_obs SET geodatum = 'WGS84' WHERE (latitude IS NOT NULL or latitude != '0.00000') AND geodatum IS NULL";
                $this->bdd->requeter($requete);
                $requete = "UPDATE ".$this->bd_cel.".cel_obs SET geodatum = NULL WHERE (latitude IS NULL or latitude = '0.00000')";
                $this->bdd->requeter($requete);
                echo "effectuée \n";
                echo "Suppression des coordonnées fausses : ";
                $requete = "UPDATE ".$this->bd_cel.".cel_obs SET latitude = NULL, longitude = NULL WHERE latitude < -90 OR latitude > 90 OR longitude < -180 OR longitude > 180";
                $this->bdd->requeter($requete);
                echo "effectuée \n";
        }
        
        private function verifierCodeInsee() {
            echo "Mise à jour des valeurs code_insee";
            $requete = 'UPDATE `cel_obs` SET `ce_zone_geo` = NULL, 
                commentaire = concat(if(commentaire is null, "", concat(commentaire, ", ")), if(ce_zone_geo is null, "", concat("Zone geo : ",ce_zone_geo))) where `ce_zone_geo` not like "insee-c%"';
            $this->bdd->requeter($requete);
            $requete = 'UPDATE `cel_obs` SET `ce_zone_geo` = substr(`ce_zone_geo`, 9, 5) where `ce_zone_geo` like "insee-c:%"';
            $this->bdd->requeter($requete);
            $requete = 'UPDATE `cel_obs` SET `ce_zone_geo` = NULL where trim(`ce_zone_geo`) = ""';
            $this->bdd->requeter($requete);
            echo "effectuée \n";
            
            
            echo "Vérification du code insee";
            $requete = "ALTER TABLE ".$this->bd_cel.".`cel_obs` ADD IF NOT EXISTS `locality_consistency` INT(1) ;";
            $this->bdd->requeter($requete);
            
            $requete = "UPDATE ".$this->bd_cel.".cel_obs SET locality_consistency = '0' WHERE 
                ((ce_zone_geo != 'INSEE-C:' and ce_zone_geo like 'INSEE-C:%') and code_insee_calcule != '') and 
                replace(`ce_zone_geo`, 'INSEE-C:', '') != `code_insee_calcule`";
            $this->bdd->requeter($requete);
            $requete = "UPDATE ".$this->bd_cel.".cel_obs SET locality_consistency = '1' WHERE
                ((ce_zone_geo != 'INSEE-C:' and ce_zone_geo like 'INSEE-C:%') and code_insee_calcule != '') and
                replace(`ce_zone_geo`, 'INSEE-C:', '') = `code_insee_calcule`";
            $this->bdd->requeter($requete);
            
            $requete_verif = "SELECT `ce_zone_geo`, `code_insee_calcule`, `locality_consistency` FROM `cel_obs` WHERE `locality_consistency` IS NOT NULL";
            $verif = $this->bdd->recupererTous($requete_verif);
            if ($verif != array()) print_r($verif);
            echo "effectuée \n";
        }
        
        private function analyserMotsCles(){
            echo "Input source \n";
            $requete = "ALTER TABLE ".$this->bd_cel.".`cel_obs` ADD IF NOT EXISTS `input_source` VARCHAR(15)";
            $this->bdd->requeter($requete);
            
            $requete = "UPDATE ".$this->bd_cel.".cel_obs SET input_source = 'PlantNet' WHERE `mots_cles_texte` like '%plantnet%'";
            $this->bdd->requeter($requete);
            
            $requete = "UPDATE ".$this->bd_cel.".cel_obs SET input_source = 'autre' WHERE `mots_cles_texte` like '%MobileSauvages%'";
            $this->bdd->requeter($requete);
            
            $requete = "UPDATE ".$this->bd_cel.".cel_obs SET input_source = 'widget' WHERE `mots_cles_texte` like '%Projets coopératifs%' and (input_source = '' OR input_source IS NULL)";
            $this->bdd->requeter($requete);
            
            $requete = "UPDATE ".$this->bd_cel.".cel_obs SET input_source = 'widget' WHERE `mots_cles_texte` like '%widget%' and (input_source = '' OR input_source IS NULL)";
            $this->bdd->requeter($requete);
            
            $requete = "UPDATE ".$this->bd_cel.".cel_obs SET input_source = 'CEL' WHERE input_source = '' OR input_source IS NULL";
            $this->bdd->requeter($requete);
            
            echo "Suppression motcle du chemin \n";
            $requete = "UPDATE ".$this->bd_cel.".`cel_arbre_mots_cles_obs` SET chemin = 
                if(CHAR_LENGTH(chemin)-CHAR_LENGTH(`mot_cle`) = 2, '\/', substr(`chemin`, 1, CHAR_LENGTH(chemin)-CHAR_LENGTH(`mot_cle`)-2))";
            $this->bdd->requeter($requete);
            
            $requete = "UPDATE ".$this->bd_cel.".`cel_arbre_mots_cles_images` SET chemin = 
                substr(`chemin`, 1, CHAR_LENGTH(chemin)-CHAR_LENGTH(`mot_cle`)-1)";
            $this->bdd->requeter($requete);
            
            echo "Certitude à certaine quand obs validée sur ip \n";
            $requete = "UPDATE ".$this->bd_cel.".`cel_obs` c left join 
                (SELECT distinct `ce_observation`, `nom_sel_nn` 
                FROM ".$this->bd_del.".`del_commentaire` WHERE `proposition_retenue` = 1) d on 
                `ce_observation` = `id_observation` SET `certitude` = 'certain' 
                WHERE (c.`mots_cles_texte` LIKE '%adeterminer%' 
                or c.`certitude` = 'à déterminer') and c.`nom_sel_nn` = d.`nom_sel_nn`";
            $this->bdd->requeter($requete);
            
            echo "Certitude à douteux quand obs validée sur ip mais num_nom diff entre ip et cel \n";
            $requete = "UPDATE ".$this->bd_cel.".`cel_obs` c left join
                (SELECT distinct `ce_observation`, `nom_sel_nn`
                FROM ".$this->bd_del.".`del_commentaire`  WHERE `proposition_retenue` = 1 ) d on
                `ce_observation` = `id_observation` SET `certitude` = 'douteux'
                WHERE (c.`mots_cles_texte` LIKE '%adeterminer%'
                or c.`certitude` = 'à déterminer') and c.`nom_sel_nn` != d.`nom_sel_nn`";
            $this->bdd->requeter($requete);
            
            echo "Certitude à aDeterminer quand obs non validée sur ip \n";
            $requete = "UPDATE ".$this->bd_cel.".`cel_obs` c SET `certitude` = 'à déterminer'
                WHERE c.`mots_cles_texte` LIKE '%adeterminer%' AND 
                (c.`certitude` = '' or c.certitude IS NULL)";
            $this->bdd->requeter($requete);
            
            $requete = "UPDATE ".$this->bd_cel.".`cel_obs` SET 
                `mots_cles_texte` = REPLACE(`mots_cles_texte`, 'aDeterminer,', '')
                WHERE `mots_cles_texte` LIKE '%adeterminer,%'";
            $this->bdd->requeter($requete);
            

        }
        

        
        private function changerSensible(){
            echo "Sensible \n";
            $requete = "ALTER TABLE ".$this->bd_cel.".`cel_obs` ADD IF NOT EXISTS `published_location` varchar(50)";
            $this->bdd->requeter($requete);
            
            $requete = "UPDATE ".$this->bd_cel.".cel_obs SET published_location = 'localité' WHERE `mots_cles_texte` like '%sensible%'";
            $this->bdd->requeter($requete);
        }
}