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<?php
// Encodage : UTF-8
// +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------+
/**
* Tests de référentiels de nomenclature et taxonomie
*
* Description : classe permettant de tester les référentiels selon le manuel technique
* Utilisation : php script.php tests -p bdnff -a tout
*
//Auteur original :
* @author Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org>
* @copyright Tela-Botanica 1999-2010
* @link http://www.tela-botanica.org/wikini/RTaxMethodo/wakka.php?wiki=MaNuel
* @licence GPL v3 & CeCILL v2
* @version $Id$
*/
// +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------+
// TODO : supprimer l'utilisation du paramêtres 'p' et chercher les infos depuis la bdd
class Tests extends ScriptCommande {
const SCRIPT_NOM = 'tests';
const MANUEL_VERSION = '4.4';
private $projet = null;
private $traitement = null;
private $manuel = null;
private $manuel_nom = null;
private $manuel_chemin = null;
private $tests = null;
private $colonnes = null;
private $analyses = null;
private $noms = null;
private $erreurs = array();
private $resultatDao = null;
private $traitementDao = null;
private $tableStructureDao = null;
private $referentielDao = null;
public function executer() {
$this->manuel_nom = 'mtpr_v'.str_replace('.', '_', self::MANUEL_VERSION).'.pdf';
$this->manuel_chemin = Config::get('chemin_appli').DS.'..'.DS.'configurations'.DS;
$manuel_config_nom = 'referentiel_v'.self::MANUEL_VERSION.'.ini';
$this->manuel = parse_ini_file($this->manuel_chemin.$manuel_config_nom);
$this->definirConstantes();
$this->tests = parse_ini_file($this->getModuleChemin().DS.'configurations'.DS.'tests.ini', true);
$this->resultatDao = new ResultatDao();
$this->traitementDao = new TraitementDao();
Debug::printr('Dans le script test');
// Récupération du dernier traitement demandé
$this->traitement = $this->traitementDao->getDernierTraitement('tout', self::SCRIPT_NOM);
if (isset($this->traitement)) {
$this->projet = $this->traitement['referentiel_code']; // Récupération du nom de projet
Debug::printr($this->traitement);
// Écriture de la date de début du traitement
Debug::printr('Debute:'.$this->traitementDao->debuterTraitement($this->traitement['id_traitement']));
// Nettoyage des traitements obsolètes
$traitements_obsoletes = $this->traitementDao->getTraitementsObsoletes($this->projet, self::SCRIPT_NOM);
if (isset($traitements_obsoletes)) {
Debug::printr('Supp. obsoletes:'.$this->traitementDao->supprimer($traitements_obsoletes));
}
$this->tableStructureDao = new TableStructureDao();
$this->referentielDao = new ReferentielDao();
// Lancement du test demandé
$cmd = $this->getParam('a');
switch ($cmd) {
case 'tout' :
Debug::printr('Départ lancement test:');
$this->recupererDonnees();
$this->lancerTestsAuto();
break;
case 'test14' :
$this->recupererDonnees();
Debug::printr('Départ lancement test 14 :');
$this->testerClassificationRang();
break;
default :
$this->traiterErreur('Erreur : la commande "%s" n\'existe pas!', array($cmd));
}
// Écriture de la date de fin du traitement
Debug::printr('Termine:'.$this->traitementDao->terminerTraitement($this->traitement['id_traitement']));
} else {
Debug::printr("Aucun dernier traitement trouvé pour le script '".self::SCRIPT_NOM."' !");
}
}
/**
* Cette méthode définie des constantes qui peuvent ensuite être utilisée dans les fichier ini.
* Surtout utile pour le fichier tests.ini
*/
private function definirConstantes() {
define('RANG_GENRE', $this->manuel['rang_genre']);
define('RANG_SP', $this->manuel['rang_sp']);
date_default_timezone_set('Europe/Berlin');
define('ANNEE_EN_COURS', date('Y'));
define('ANNEE_MINIMUM', 1753);
}
public function recupererDonnees() {
// Récupération des données à tester
$this->colonnes = $this->tableStructureDao->getColonnes($this->projet);
$this->analyses = $this->tableStructureDao->getAnalyse($this->projet);
$this->noms = $this->referentielDao->getTout($this->projet);
Debug::printr('Nbre noms :'.count($this->noms));
}
public function lancerTestsAuto() {
$resultats = array();
// Lancement des tests unitaires
Debug::printr('Lancement des tests unitaires');
$tests_numeros = array_keys($this->tests);
Debug::printr($tests_numeros);
foreach ($tests_numeros as &$numero) {
$info = $this->getInfosTest($numero);
if ($numero < 5) {
// Tests spéciaux vérifiant la structure de la table
$resultats[] = $this->lancerTestUnitaire($info);
} else if ($numero >= 5 && $this->verifierResultats($resultats)) {
// Si la structure est bonne nous lançons les autres tests
$this->lancerTestUnitaire($info);
}
}
$info = $this->construireTotalErreur();
$this->traiterResultatTest($info);
}
private function getInfosTest($numero) {
$info = $this->tests[$numero];
$info['methode'] = 'tester'.implode('', explode(' ', ucwords($info['abr'])));
$info['numero'] = $numero;
$info['nom'] = '#'.$numero.' - '.$info['nom'];
$info['resultat'] = false;
return $info;
}
public function lancerTestUnitaire($info) {
Debug::printr($info['numero'].'::'.$info['methode']);
$methodeDeTest = $info['methode'];
$erreurs = $this->$methodeDeTest();
// Analyse des résultats
if (isset($erreurs['special'])) {
$info = $erreurs;
} else {
$info = $this->construireResultatErreur($erreurs, $info);
}
$this->traiterResultatTest($info);
if ($info['numero'] < 5) {
return ($info['resultat'] ? '1' : '0');
}
}
private function ajouterNumNomErreursTest($num_nom) {
if (count($this->erreurs) < 1000) {
if (isset($this->erreurs[$num_nom])) {
$this->erreurs[$num_nom] += 1;
} else {
$this->erreurs[$num_nom] = 1;
}
}
}
private function construireResultatErreur($erreurs, $info) {
if (count($erreurs) > 0) {
$info['message']['entete'] = explode(',', $info['entete']);
if (isset($info['title'])) {
$info['message']['title'] = explode(';', $info['title']);
}
$info['message']['lignes'] = $erreurs;
unset($erreurs);
} else {
$info['resultat'] = true;
}
return $info;
}
private function construireTotalErreur() {
if (count($this->erreurs) > 0) {
arsort($this->erreurs);
$info['abr'] = "erreurs par num_nom";
$info['nom'] = "erreurs -> num_nom";
$info['description'] = "nombre d'erreurs détecté par num_nom";
$info['numero'] = "0";
$info['message']['entete'] = array('num_nom', "nombre d'erreurs");
foreach ($this->erreurs as $num_nom=>$nombre) {
$erreurs[] = array(0 => $num_nom, 1 => $nombre);
}
$info['message']['lignes'] = $erreurs;
unset($this->erreurs);
} else {
$info['resultat'] = true;
}
return $info;
}
private function verifierResultats(&$resultats) {
$ok = true;
foreach ($resultats as $resultat) {
if ($resultat == '0') {
$ok = false;
break;
}
}
return $ok;
}
private function traiterResultatTest($info) {
if (isset($info['message'])) {
if (is_array($info['message'])) {
$erreurs_nbre = count($info['message']['lignes']);
$erreurs_max = 1000;
if ($erreurs_nbre > $erreurs_max) {
$info['message']['lignes'] = array_slice($info['message']['lignes'], 0, $erreurs_max);
$info['erreur'] = "$erreurs_nbre erreurs ont été détectées seules les $erreurs_max premières sont affichées";
}
$info['message'] = $this->getVue('tests/squelettes/message_table', $info);
} else {
$info['message'] = $this->getVue('tests/squelettes/message_p', $info);
}
}
Debug::printr($this->resultatDao->ajouter($this->traitement['id_traitement'], $info));
$info = null;
}
//+--------------------------------------------------------------------------------------------------------------+//
// TESTS
/**
* Test #01
*/
private function testerNombreDeChamps() {
$info = $this->getInfosTest(1);
$info['special'] = true;
$nbre_colonnes = count($this->colonnes);
$info['message'] = $nbre_colonnes;
if ($nbre_colonnes >= 37) {
$info['resultat'] = true;
}
return $info;
}
/**
* Test #02
*/
private function testerNomDesChamps() {
$info = $this->getInfosTest(2);
$info['special'] = true;
$champs_attendus = explode(',', $this->manuel['champs']);
$champs_presents = array();
foreach ($this->colonnes as &$colonne) {
$champs_presents[$colonne['Field']] = $colonne;
}
$ok = true;
$champs_manquant = array();
foreach ($champs_attendus as &$champ_attendu) {
if (!isset($champs_presents[$champ_attendu])) {
$champs_manquant[] = $champ_attendu;
$ok = false;
}
}
$info['resultat'] = $ok;
if (!$ok) {
$info['message'] = sprintf($info['message'], implode(', ', $champs_manquant));
}
return $info;
}
/**
* Test #03
*/
private function testerTypeDesChamps() {
$champs_attendus = explode(',', $this->manuel['champs_type']);
$champs_presents = array();
foreach ($this->colonnes as &$colonne) {
$champs_presents[$colonne['Field']] = $colonne['Type'];
}
// Recercherche des erreurs
$champs_erreur = array();
foreach ($champs_attendus as &$champ_attendu) {
list($champ_attendu_nom, $champ_attendu_type_taille) = explode('=', trim($champ_attendu));
list($champ_attendu_type, $champ_attendu_taille) = explode('|', trim($champ_attendu_type_taille));
if (isset($champs_presents[$champ_attendu_nom])) {
$champs_present_type = $champs_presents[$champ_attendu_nom];
if (($champ_attendu_type == 'VARCHAR' && strstr($champs_present_type, 'varchar') === false)
|| ($champ_attendu_type == 'TEXT' && strstr($champs_present_type, 'text') === false)
|| ($champ_attendu_type == 'INT' && strstr($champs_present_type, 'int') === false)
|| ($champ_attendu_type == 'BOOL' && preg_match('/(?:bool|boolean|tinyint\(1\))/i', $champs_present_type) === false)) {
$champs_erreur[] = array($champ_attendu, $champ_attendu_type, $champs_present_type);
}
}
}
return $champs_erreur;
}
/**
* Test #04
*/
private function testerNumNomClePrimaire() {
$info = $this->getInfosTest(4);
$info['special'] = true;
foreach ($this->colonnes as &$colonne) {
if ($colonne['Field'] == 'num_nom' && $colonne['Key'] == 'PRI') {
$info['resultat'] = true;
break;
}
}
return $info;
}
/**
* Test #05
*/
private function testerTailleDesChamps() {
$tailles_champs_maxi = array();
foreach ($this->colonnes as &$colonne) {
if (preg_match('/^varchar\(([0-9]+)\)$/', $colonne['Type'], $match)) {
$tailles_champs_maxi[$colonne['Field']] = $match[1];
}
}
$tailles_trouvees = array();
foreach ($this->analyses as &$analyse) {
if (preg_match('/\.([^.]+)$/', $analyse['Field_name'], $match)) {
$tailles_trouvees[$match[1]] = $analyse['Max_length'];
}
}
$champs_erreur = array();
$champs_attendus = explode(',', $this->manuel['champs']);
foreach ($champs_attendus as &$champ_attendu) {
if (isset($tailles_champs_maxi[$champ_attendu]) && isset($tailles_trouvees[$champ_attendu])) {
if ($tailles_champs_maxi[$champ_attendu] == $tailles_trouvees[$champ_attendu]) {
$champs_erreur[] = array($champ_attendu, $tailles_champs_maxi[$champ_attendu], $tailles_trouvees[$champ_attendu]);
}
}
}
return $champs_erreur;
}
/**
* Test #06
*/
private function testerNumNomSuperieurAZero() {
$noms_erreur = array();
foreach ($this->noms as &$nom) {
if ($nom['num_nom'] <= 0) {
$noms_erreur[] = array($nom['num_nom']);
$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);
}
}
return $noms_erreur;
}
/**
* Test #07
*/
private function testerNumNomRetenuSuperieurAZero() {
$noms_erreur = array();
foreach ($this->noms as &$nom) {
if ($nom['num_nom_retenu'] != '' && $nom['num_nom_retenu'] <= 0) {
$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['num_nom_retenu']);
$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);
}
}
return $noms_erreur;
}
/**
* Test #08
*/
private function testerExistenceNumNomRetenu() {
$noms_erreur = array();
foreach ($this->noms as &$nom) {
if ($nom['num_nom_retenu'] != '' && $nom['num_nom_retenu'] != $nom['num_nom']) {
if ($nom['num_nom_retenu'] != 0 && !isset($this->noms[$nom['num_nom_retenu']])) {
$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['num_nom_retenu'], $nom['exclure_taxref']);
$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);
}
}
}
return $noms_erreur;
}
/**
* Test #09
*/
private function testerTransmissionNumNomRetenu() {
$noms_erreur = array();
foreach ($this->noms as &$nom) {
if ($nom['num_nom_retenu'] != $nom['num_nom'] && $nom['exclure_taxref'] == 0) {
if ($nom['num_nom_retenu'] != 0 && isset($this->noms[$nom['num_nom_retenu']])) {
if ($this->noms[$nom['num_nom_retenu']]['exclure_taxref'] != 0) {
$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['num_nom_retenu'], $this->noms[$nom['num_nom_retenu']]['exclure_taxref']);
$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);
}
}
}
}
return $noms_erreur;
}
/**
* Test #10
*/
private function testerSynonymeNumNomRetenu() {
$noms_erreur = array();
foreach ($this->noms as &$nom) {
if ($nom['num_nom_retenu'] != $nom['num_nom']) {
if ($nom['num_nom_retenu'] != 0 && isset($this->noms[$nom['num_nom_retenu']])) {
if ($this->noms[$nom['num_nom_retenu']]['num_nom'] != $this->noms[$nom['num_nom_retenu']]['num_nom_retenu']) {
$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['num_nom_retenu'], $this->noms[$nom['num_nom_retenu']]['num_nom_retenu']);
$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);
}
}
}
}
return $noms_erreur;
}
/**
* Test #11
*/
private function testerDoublonsNomSci() {
$noms_erreur = array();
$noms_complets = array();
foreach ($this->noms as &$nom) {
$a = $nom['nom_sci']." ".$nom['auteur']." ".$nom['nom_addendum']." ".$nom['biblio_origine'];
if (isset($noms_complets[$a])) {
$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $a, $noms_complets[$a], $nom['exclure_taxref'], $nom['homonyme']);
$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);
} else {
$noms_complets[$a] = $nom['num_nom'];
}
}
return $noms_erreur;
}
/**
* Test #12
*/
private function testerNumTaxSupEgalZeroUnique() {
$noms_erreur = array();
foreach ($this->noms as &$nom) {
if (preg_match('/^0$/', $nom['num_tax_sup'])) {
$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['num_tax_sup']);
$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);
}
}
// Ce test est spécial car le nombre de noms en erreurs doit être supérieur à 1 et non à 0 pour être KO.
if (count($noms_erreur) == 1) {
$noms_erreur = array();
}
return $noms_erreur;
}
/**
* Test #13
*/
private function testerTaxSupPourTaxon() {
$noms_erreur = array();
foreach ($this->noms as &$nom) {
if ($nom['num_nom_retenu'] != $nom['num_nom'] && $nom['num_tax_sup'] != '') {
$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['num_tax_sup'], $nom['exclure_taxref']);
$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);
}
}
return $noms_erreur;
}
/**
* Test #14
*/
private function testerExistenceTaxonSuperieur() {
$noms_erreur = array();
foreach ($this->noms as &$nom) {
if ($nom['num_nom_retenu'] == $nom['num_nom']) {
if ($nom['num_tax_sup'] != 0 && !isset($this->noms[$nom['num_tax_sup']])) {
$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['num_tax_sup'], $nom['exclure_taxref']);
$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);
}
}
}
return $noms_erreur;
}
/**
* Test #15
*/
private function testerClassificationEspece() {
$noms_erreur = array();
foreach ($this->noms as &$nom) {
if ($nom['num_nom_retenu'] == $nom['num_nom'] && $nom['rang'] == 290) {
if (isset($this->noms[$nom['num_tax_sup']])) {
$nom_sup = $this->noms[$nom['num_tax_sup']];
if ($nom_sup['rang'] != 220 ) {
$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['rang'], $nom_sup['num_nom'], $nom_sup['rang'], $nom['exclure_taxref']);
$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);
}
}
}
}
return $noms_erreur;
}
/**
* Test #16
*/
private function testerTransmissionTaxonSuperieur() {
$noms_erreur = array();
foreach ($this->noms as &$nom) {
if ($nom['num_nom_retenu'] == $nom['num_nom'] && $nom['exclure_taxref'] == 0) {
if ($nom['num_tax_sup'] != 0 && isset($this->noms[$nom['num_tax_sup']])) {
if ($this->noms[$nom['num_tax_sup']]['exclure_taxref'] != 0) {
$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['num_tax_sup'], $this->noms[$nom['num_tax_sup']]['exclure_taxref']);
$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);
}
}
}
}
return $noms_erreur;
}
/**
* Test #17
*/
private function testerClassificationRang() {
$noms_erreur = array();
//$rangs = explode(',', $this->manuel['rangs']);
foreach ($this->noms as &$nom) {
if ($nom['num_nom_retenu'] == $nom['num_nom']) {
if (isset($this->noms[$nom['num_tax_sup']])) {
$nom_sup = $this->noms[$nom['num_tax_sup']];
//$num_rang = array_search($nom['rang'], $rangs);
if ($nom_sup['rang'] >= $nom['rang']) {
//if ($nom_sup['rang'] != $rangs[$num_rang-1] ) {
// Prise en compte de l'exception des clades
if (! ($nom_sup['rang'] == 70 && $nom['rang'] == 70)) {
$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['rang'], $nom_sup['num_nom'], $nom_sup['rang'], $nom['exclure_taxref']);
$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);
}
}
}
}
}
return $noms_erreur;
}
/**
* Test #18
*/
private function testerClassification() {
$noms_erreur = array();
$this->noms_ok = array();
foreach ($this->noms as &$nom) {
if ($nom['num_nom_retenu'] == $nom['num_nom']) {
if (isset($this->noms_ok[$nom['num_tax_sup']])) {
$this->noms_ok[$nom['num_nom']] = true;
} else {
$this->detection_boucle_infini = array();
$classif_ok = $this->remonterClassif($nom);
unset($this->detection_boucle_infini);
if ($classif_ok === true) {
$this->noms_ok[$nom['num_nom']] = $classif_ok;
} else {
$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $classif_ok, $nom['exclure_taxref']);
$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);
}
}
}
}
unset($this->noms_ok);
return $noms_erreur;
}
private function remonterClassif(&$nom) {
$this->detection_boucle_infini[$nom['num_nom']] = true;
if (preg_match('/^[0-9]*$/', $nom['num_tax_sup'])) {
if (isset($this->noms_ok[$nom['num_tax_sup']])) {
$this->noms_ok[$nom['num_nom']] = true;
return true;
} else if (!isset($this->noms[$nom['num_tax_sup']]) && $nom['num_tax_sup'] == '0') {
$this->noms_ok[$nom['num_nom']] = true;
return true;
} else if (!isset($this->noms[$nom['num_tax_sup']]) && $nom['num_tax_sup'] != '0') {
return 'Hiérarchie avec le taxon #'.$nom['num_nom'].' ayant un taxon superieur #'.$nom['num_tax_sup'].' inexistant';
} else if (isset($this->detection_boucle_infini[$nom['num_tax_sup']])) {
return 'Boucle infinie pour le taxon #'.$nom['num_tax_sup'];
} else {
$retour = $this->remonterClassif($this->noms[$nom['num_tax_sup']]);
if ($retour === true) {
$this->noms_ok[$nom['num_tax_sup']] = true;
$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);
}
return $retour;
}
} else {
return 'Valeur num_tax_sup incorrecte : '.$nom['num_tax_sup'];
}
}
/**
* Test #19
*/
private function testerRang() {
$rangs = array_flip(explode(',', $this->manuel['rangs']));
// Réalisation du test
$noms_erreur = array();
foreach ($this->noms as &$nom) {
if (!isset($rangs[$nom['rang']])) {
$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['rang'], $nom['exclure_taxref']);
$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);
}
}
return $noms_erreur;
}
/**
* Test #20
*/
private function testerNomCompletSupraGenerique() {
$noms_erreur = array();
foreach ($this->noms as &$nom) {
if ($nom['rang'] < $this->manuel['rang_genre']) {
$suffixe_plte_cultivee = $this->construireSuffixeNomPltCultivee($nom);
$nom_sci_ideal = $this->formaterStyleNomGenre($nom['nom_supra_generique']);
$nom_sci_ideal .= ($suffixe_plte_cultivee != '' ? ' '.$suffixe_plte_cultivee : '');
if ($nom['nom_sci'] != $nom_sci_ideal) {
$nom_sci_traite = $this->repererEspace($nom['nom_sci']);
$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom_sci_traite, $nom_sci_ideal, $nom['exclure_taxref']);
$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);
}
}
}
return $noms_erreur;
}
/**
* Test #21
*/
private function testerNomCompletGenre() {
$noms_erreur = array();
foreach ($this->noms as &$nom) {
if ($nom['rang'] == $this->manuel['rang_genre']) {
$suffixe_plte_cultivee = $this->construireSuffixeNomPltCultivee($nom);
$nom_sci_ideal = $this->formaterStyleNomGenre($nom['genre']);
$nom_sci_ideal .= ($suffixe_plte_cultivee != '' ? ' '.$suffixe_plte_cultivee : '');
if ($nom['nom_sci'] != $nom_sci_ideal) {
$nom_sci_traite = $this->repererEspace($nom['nom_sci']);
$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom_sci_traite, $nom_sci_ideal, $nom['exclure_taxref']);
$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);
}
}
}
return $noms_erreur;
}
/**
* Test #22
*/
private function testerNomCompletInfraGenre() {
$noms_erreur = array();
foreach ($this->noms as &$nom) {
if ($nom['rang'] > $this->manuel['rang_genre'] && $nom['rang'] < $this->manuel['rang_sp']) {
$suffixe_plte_cultivee = $this->construireSuffixeNomPltCultivee($nom);
$nom_sci_ideal = '';
if ($nom['type_epithete'] == 'agg.') {
$nom_sci_ideal = $this->formaterStyleNomGenre($nom['genre']).' '.
$this->formaterStyleNomGenre($nom['epithete_infra_generique']).' '.
$nom['type_epithete'];
} else {
$nom_sci_ideal = $this->formaterStyleNomGenre($nom['genre']).' '.
$nom['type_epithete'].' '.
$this->formaterStyleNomGenre($nom['epithete_infra_generique']);
}
$nom_sci_ideal .= ($suffixe_plte_cultivee != '' ? ' '.$suffixe_plte_cultivee : '');
if ($nom['nom_sci'] != $nom_sci_ideal) {
$nom_sci_traite = $this->repererEspace($nom['nom_sci']);
$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom_sci_traite, $nom_sci_ideal, $nom['exclure_taxref']);
$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);
}
}
}
return $noms_erreur;
}
/**
* Test #23
*/
private function testerNomCompletEspece() {
$noms_erreur = array();
$erreur = '';
foreach ($this->noms as &$nom) {
if ($nom['rang'] == $this->manuel['rang_sp']) {
$suffixe_plte_cultivee = $this->construireSuffixeNomPltCultivee($nom);
$nom_sci_ideal = $this->formaterStyleNomGenre($nom['genre']).' ';
if (strstr($nom['nom_sci'] , ' x ') != false) {
list($nom_sci_ideal, $erreur) = $this->formaterStyleEpitheteSpHybride($nom_sci_ideal, $nom['epithete_sp']);
} else {
$nom_sci_ideal .= utf8_encode(strtolower(utf8_decode($nom['epithete_sp'])));
}
$nom_sci_ideal .= ($suffixe_plte_cultivee != '' ? ' '.$suffixe_plte_cultivee : '');
$nom_sci_ideal = trim($nom_sci_ideal);
if ($nom['nom_sci'] != $nom_sci_ideal) {
$nom_sci_traite = $this->repererEspace($nom['nom_sci']);
$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom_sci_traite, $nom_sci_ideal, $erreur, $nom['exclure_taxref']);
$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);
}
}
}
return $noms_erreur;
}
/**
* Test #24
*/
private function testerNomCompletInfraSpecifique() {
$noms_erreur = array();
$erreur = null;
foreach ($this->noms as &$nom) {
if ($nom['rang'] > $this->manuel['rang_sp']) {
$nom_sci_ideal = $this->formaterStyleNomGenre($nom['genre']).' '.
utf8_encode(strtolower(utf8_decode($nom['epithete_sp']))).' '.
utf8_encode(strtolower(utf8_decode($nom['type_epithete']))).' ';
$suffixe_plte_cultivee = $this->construireSuffixeNomPltCultivee($nom);
if (strstr($nom['nom_sci'] , ' x ') != false) {
list($nom_sci_ideal, $erreur) = $this->formaterStyleEpitheteInfraSpHybride($nom_sci_ideal, $nom['epithete_infra_sp'], $nom['genre']);
} else {
$nom_sci_ideal .= utf8_encode(strtolower(utf8_decode($nom['epithete_infra_sp'])));
}
$nom_sci_ideal = trim($nom_sci_ideal);
$nom_sci_ideal .= ($suffixe_plte_cultivee != '' ? ' '.$suffixe_plte_cultivee : '');
if ($nom['nom_sci'] != $nom_sci_ideal) {
$nom_sci_traite = $this->repererEspace($nom['nom_sci']);
$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom_sci_traite, $nom_sci_ideal, $erreur, $nom['exclure_taxref']);
$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);
}
}
}
return $noms_erreur;
}
/**
* Test #25
*/
private function testerNomSupraGeneriqueEspaces() {
$noms_erreur = array();
foreach ($this->noms as &$nom) {
if ($nom['nom_supra_generique'] != '') {
if (preg_match('/(?:^\s+(?!:\s+)|(?!:\s+)\s+$)/', $nom['nom_supra_generique'])) {
$nom_supra_generique_traite = $this->repererEspace($nom['nom_supra_generique']);
$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom_supra_generique_traite, $nom['exclure_taxref']);
$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);
}
}
}
return $noms_erreur;
}
/**
* Test #26
*/
private function testerNomSupraGeneriqueSyntaxe() {
$noms_erreur = array();
foreach ($this->noms as &$nom) {
if ($nom['nom_supra_generique'] != '') {
if (!preg_match('/^[A-ZÄËḦÏÖÜẄẌŸ][-a-zäëḧïöẗüẅẍÿ]+$/', $nom['nom_supra_generique'])) {
$nom_supra_generique_traite = $this->repererEspace($nom['nom_supra_generique']);
$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom_supra_generique_traite, $nom['exclure_taxref']);
$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);
}
}
}
return $noms_erreur;
}
/**
* Test #27
*/
private function testerNomSupraGeneriqueRang() {
$noms_erreur = array();
foreach ($this->noms as &$nom) {
if ($nom['nom_supra_generique'] != '') {
if ($nom['rang'] >= $this->manuel['rang_genre']) {
$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['nom_sci'], $nom['rang'], $nom['exclure_taxref']);
$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);
}
}
}
return $noms_erreur;
}
/**
* Test #28
*/
private function testerGenreEspaces() {
$noms_erreur = array();
foreach ($this->noms as &$nom) {
if ($nom['genre'] != '') {
if (preg_match('/(?:^\s+(?!:\s+)|(?!:\s+)\s{2,}(?!:\s+)|(?!:\s+)\s+$)/', $nom['genre'])) {
$nom_traite = $this->repererEspace($nom['genre']);
$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom_traite, $nom['exclure_taxref']);
$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);
}
}
}
return $noms_erreur;
}
/**
* Test #29
*/
private function testerGenreSyntaxe() {
$noms_erreur = array();
foreach ($this->noms as &$nom) {
if ($nom['genre'] != '') {
$mots = explode(' ', $nom['genre']);
foreach ($mots as $mot) {
if (!(preg_match('/^[+x]$/', $mot) || $this->verifierEpitheteGenre($mot))) {
$nom_traite = $this->repererEspace($nom['genre']);
$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom_traite, $nom['exclure_taxref']);
$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);
break;
}
}
}
}
return $noms_erreur;
}
/**
* Test #30
*/
private function testerGenreRang() {
$noms_erreur = array();
foreach ($this->noms as &$nom) {
if ($nom['genre'] != '') {
if ($nom['rang'] < $this->manuel['rang_genre']) {
$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['nom_sci'], $nom['rang'], $nom['exclure_taxref']);
$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);
}
}
}
return $noms_erreur;
}
/**
* Test #31
*/
private function testerEpitheteInfraGeneriqueSyntaxe() {
$noms_erreur = array();
foreach ($this->noms as &$nom) {
if ($nom['epithete_infra_generique'] != '') {
if (!preg_match('/^[A-ZÄËḦÏÖÜẄẌŸ][-a-zäëḧïöẗüẅẍÿ]+/', $nom['epithete_infra_generique'])) {
$epithete_traite = $this->repererEspace($nom['epithete_infra_generique']);
$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $epithete_traite, $nom['exclure_taxref']);
$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);
}
}
}
return $noms_erreur;
}
/**
* Test #32
*/
private function testerEpitheteInfraGeneriqueRang() {
$noms_erreur = array();
foreach ($this->noms as &$nom) {
if ($nom['epithete_infra_generique'] != '') {
if ($nom['rang'] <= $this->manuel['rang_genre'] || $nom['rang'] >= $this->manuel['rang_sp']) {
$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['nom_sci'], $nom['rang'], $nom['exclure_taxref']);
$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);
}
}
}
return $noms_erreur;
}
/**
* Test #33
*/
private function testerEpitheteInfraGeneriqueEspaces() {
$noms_erreur = array();
foreach ($this->noms as &$nom) {
if ($nom['epithete_infra_generique'] != '') {
if (preg_match('/(?:^\s+(?!:\s+)|(?!:\s+)\s{2,}(?!:\s+)|(?!:\s+)\s+$)/', $nom['epithete_infra_generique'])) {
$epithete_traite = $this->repererEspace($nom['epithete_infra_generique']);
$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $epithete_traite, $nom['exclure_taxref']);
$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);
}
}
}
return $noms_erreur;
}
/**
* Test #34
*/
private function testerEpitheteSpEspaces() {
$noms_erreur = array();
foreach ($this->noms as &$nom) {
if ($nom['epithete_sp'] != '') {
if (preg_match('/(?:^\s+(?!:\s+)|(?!:\s+)\s{2,}(?!:\s+)|(?!:\s+)\s+$)/', $nom['epithete_sp'])) {
$epithete_traite = $this->repererEspace($nom['epithete_sp']);
$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $epithete_traite, $nom['exclure_taxref']);
$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);
}
}
}
return $noms_erreur;
}
/**
* Test #35
*/
private function testerEpitheteSpSyntaxe() {
$noms_erreur = array();
foreach ($this->noms as &$nom) {
if ($nom['epithete_sp'] != '') {
$formule_hybridite = (strpos($nom['epithete_sp'], ' x ') !== false);
$mots = explode(' ', $nom['epithete_sp']);
foreach ($mots as $mot) {
// TODO: créer un test qui vérifie la formule d'hybridité en la reconstruisant à partir des parents
// afin que seuls des formules valides parviennent à la fonction
if (!(preg_match('/^[+x]$/', $mot) || $this->verifierEpitheteSp($mot) ||
($formule_hybridite && $this->verifierEpitheteGenre($mot) && !$this->verifierEstAbbreviationInfraSp($mot)))) {
$epithete_traite = $this->repererEspace($nom['epithete_sp']);
$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $epithete_traite, $nom['exclure_taxref']);
$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);
break;
}
}
}
}
return $noms_erreur;
}
/**
* Test #36
*/
private function testerEpitheteSpRang() {
$noms_erreur = array();
foreach ($this->noms as &$nom) {
if ($nom['epithete_sp'] != '') {
if ($nom['rang'] < $this->manuel['rang_sp']) {
$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['nom_sci'], $nom['rang'], $nom['exclure_taxref']);
$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);
}
}
}
return $noms_erreur;
}
/**
* Test #37
*/
private function testerTypeEpitheteEspaces() {
$noms_erreur = array();
foreach ($this->noms as &$nom) {
if ($nom['type_epithete'] != '') {
if (preg_match('/\s+/', $nom['type_epithete'])) {
$valeur_traitee = $this->repererEspace($nom['epithete_sp']);
$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $valeur_traitee, $nom['exclure_taxref']);
$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);
}
}
}
return $noms_erreur;
}
/**
* Test #38
*/
private function testerTypeEpitheteSyntaxe() {
$noms_erreur = array();
foreach ($this->noms as &$nom) {
if ($nom['type_epithete'] != '') {
if (!$this->verifierTypeEpithete($nom['type_epithete'])) {
$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['type_epithete'], $nom['exclure_taxref']);
$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);
}
}
}
return $noms_erreur;
}
/**
* Test #39
*/
private function testerTypeEpitheteHybridite() {
$noms_erreur = array();
foreach ($this->noms as &$nom) {
if ($nom['type_epithete'] != '') {
if (preg_match('/^(?:n-|notho-)/', $nom['type_epithete'])) {
$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['type_epithete'], $nom['exclure_taxref']);
$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);
}
}
}
return $noms_erreur;
}
/**
* Test #40
*/
private function testerEpitheteInfraSpEspaces() {
$noms_erreur = array();
foreach ($this->noms as &$nom) {
if ($nom['epithete_infra_sp'] != '') {
if (preg_match('/(?:^\s+(?!:\s+)|(?!:\s+)\s{2,}(?!:\s+)|(?!:\s+)\s+$)/', $nom['epithete_infra_sp'])) {
$epithete_traite = $this->repererEspace($nom['epithete_infra_sp']);
$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $epithete_traite, $nom['exclure_taxref']);
$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);
}
}
}
return $noms_erreur;
}
/**
* Test #41
*/
private function testerEpitheteInfraSpSyntaxe() {
$noms_erreur = array();
foreach ($this->noms as &$nom) {
if ($nom['epithete_infra_sp'] != '') {
$mots = explode(' ', $nom['epithete_infra_sp']);
$hybride_contient_abbreviation_infra_sp = false;
$formule_hybridite = (strpos($nom['epithete_infra_sp'], ' x ') !== false);
foreach ($mots as $mot) {
if($formule_hybridite && $this->verifierEstAbbreviationInfraSp($mot)) {
$hybride_contient_abbreviation_infra_sp = true;
}
$formule_hybridite_valide = $this->verifierEpitheteGenre($mot) || $this->verifierEpitheteSp($mot) || $hybride_contient_abbreviation_infra_sp;
if (!(preg_match('/^[+x]$/', $mot) || $this->verifierTypeEpithete($mot) || $this->verifierEpitheteSp($mot) ||
$formule_hybridite_valide)) {
$epithete_traite = $this->repererEspace($nom['epithete_infra_sp']);
$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $epithete_traite, $nom['exclure_taxref']);
$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);
break;
}
}
if($formule_hybridite && !$hybride_contient_abbreviation_infra_sp) {
$epithete_traite = $this->repererEspace($nom['epithete_infra_sp']);
$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $epithete_traite, $nom['exclure_taxref']);
$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);
}
}
}
return $noms_erreur;
}
/**
* Test #42
*/
private function testerEpitheteInfraSpRang() {
$noms_erreur = array();
foreach ($this->noms as &$nom) {
if ($nom['epithete_infra_sp'] != '') {
if ($nom['rang'] < $this->manuel['rang_sp']) {
$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['nom_sci'], $nom['rang'], $nom['exclure_taxref']);
$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);
}
}
}
return $noms_erreur;
}
/**
* Test #43
*/
private function testerGroupeCultivarSyntaxe() {
$noms_erreur = array();
foreach ($this->noms as &$nom) {
if ($nom['cultivar_groupe'] != '') {
if (!$this->verifierEpitheteGroupeCultivar($nom['cultivar_groupe'])) {
$epithete_traite = $this->repererEspace($nom['cultivar_groupe']);
$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $epithete_traite, $nom['exclure_taxref']);
$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);
}
}
}
return $noms_erreur;
}
/**
* Test #44
*/
private function testerGroupeCultivarRang() {
$noms_erreur = array();
foreach ($this->noms as &$nom) {
if ($nom['cultivar_groupe'] != '') {
if ($nom['rang'] < $this->manuel['rang_genre']) {
$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['nom_sci'], $nom['rang'], $nom['exclure_taxref']);
$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);
}
}
}
return $noms_erreur;
}
/**
* Test #45
*/
private function testerCultivarSyntaxe() {
$noms_erreur = array();
foreach ($this->noms as &$nom) {
if ($nom['cultivar'] != '') {
if (!$this->verifierEpitheteCultivar($nom['cultivar'])) {
$epithete_traite = $this->repererEspace($nom['cultivar']);
$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $epithete_traite, $nom['exclure_taxref']);
$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);
}
}
}
return $noms_erreur;
}
/**
* Test #46
*/
private function testerCultivarRang() {
$noms_erreur = array();
foreach ($this->noms as &$nom) {
if ($nom['cultivar'] != '') {
if ($nom['rang'] < $this->manuel['rang_genre']) {
$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['nom_sci'], $nom['rang'], $nom['exclure_taxref']);
$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);
}
}
}
return $noms_erreur;
}
/**
* Test #47
*/
private function testerNomCommercialSyntaxe() {
$noms_erreur = array();
foreach ($this->noms as &$nom) {
if ($nom['nom_commercial'] != '') {
if (!$this->verifierNomCommercial($nom['nom_commercial'])) {
$epithete_traite = $this->repererEspace($nom['nom_commercial']);
$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $epithete_traite, $nom['exclure_taxref']);
$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);
}
}
}
return $noms_erreur;
}
/**
* Test #48
*/
private function testerNomCommercialPresenceCultivar() {
$noms_erreur = array();
foreach ($this->noms as &$nom) {
if ((isset($nom['nom_commercial']) && $nom['nom_commercial'] != '') && ($nom['cultivar'] == '' && $nom['cultivar_groupe'] == '')) {
$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['nom_sci'], $nom['exclure_taxref']);
$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);
}
}
return $noms_erreur;
}
/**
* Test #49
*/
private function testerAuteurSyntaxe() {
$noms_erreur = array();
foreach ($this->noms as &$nom) {
if ($nom['auteur'] != '') {
if (!$this->verifierAuteur($nom['auteur'])) {
$intitule_traite = $this->repererEspace($nom['auteur']);
$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $intitule_traite, $nom['exclure_taxref']);
$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);
}
}
}
return $noms_erreur;
}
/**
* Test #50
*/
private function testerAnneeSyntaxe() {
$noms_erreur = array();
foreach ($this->noms as &$nom) {
if ($nom['annee'] != '') {
if (!$this->verifierAnnee($nom['annee'])) {
$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['annee'], $nom['exclure_taxref']);
$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);
}
}
}
return $noms_erreur;
}
/**
* Test #51
*/
private function testerBiblioOrigineSyntaxe() {
$noms_erreur = array();
foreach ($this->noms as &$nom) {
if ($nom['biblio_origine'] != '') {
if (!$this->verifierBiblioOrigine($nom['biblio_origine'])) {
$biblio_traite = $this->repererEspace($nom['biblio_origine']);
$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $biblio_traite, $nom['exclure_taxref']);
$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);
}
}
}
return $noms_erreur;
}
/**
* Test #52
*/
private function testerHomonymieSyntaxe() {
$noms_erreur = array();
foreach ($this->noms as &$nom) {
if ($nom['homonyme'] != '') {
if (!$this->verifierBooleen($nom['homonyme'])) {
$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['homonyme'], $nom['exclure_taxref']);
$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);
}
}
}
return $noms_erreur;
}
/**
* Test #53
*/
private function testerHomonymieExistence() {
$noms_homonymie = $this->classerNomsParNomComplet();
$noms_erreur = array();
foreach ($this->noms as &$nom) {
if ($nom['homonyme'] != '0' && $nom['homonyme'] != '') {
if ($noms_homonymie[$nom['nom_sci']] <= 1) {
$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['nom_sci'], $nom['exclure_taxref']);
$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);
}
}
}
$noms_homonymie = null;
return $noms_erreur;
}
/**
* Test #54
*/
private function testerBasionymeSyntaxe() {
$noms_erreur = array();
foreach ($this->noms as &$nom) {
if ($nom['num_basionyme'] != '') {
if (!$this->verifierNombre($nom['num_basionyme'])) {
$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['num_basionyme'], $nom['exclure_taxref']);
$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);
}
}
}
return $noms_erreur;
}
/**
* Test #55
*/
private function testerBasionymeExistence() {
$noms_erreur = array();
foreach ($this->noms as &$nom) {
if ($nom['num_basionyme'] != '') {
if (!isset($this->noms[$nom['num_basionyme']])) {
$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['num_basionyme'], $nom['exclure_taxref']);
$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);
}
}
}
return $noms_erreur;
}
/**
* Test #56
*/
private function testerSynonymeProparteSyntaxe() {
$noms_erreur = array();
foreach ($this->noms as &$nom) {
if ($nom['synonyme_proparte'] != '') {
if (!$this->verifierNombreSuite($nom['synonyme_proparte'])) {
$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['synonyme_proparte'], $nom['exclure_taxref']);
$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);
}
}
}
return $noms_erreur;
}
/**
* Test #57
*/
private function testerSynonymeProparteExistence() {
$noms_erreur = array();
foreach ($this->noms as &$nom) {
if ($nom['synonyme_proparte'] != '') {
$num_nom_a_verifier = explode(',', $nom['synonyme_proparte']);
$num_nom_en_erreur = array();
foreach ($num_nom_a_verifier as $num_nom) {
if (!isset($this->noms[$num_nom])) {
$num_nom_en_erreur[] = $num_nom;
}
}
if (count($num_nom_en_erreur) > 0) {
$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], implode(',', $num_nom_en_erreur), $nom['exclure_taxref']);
$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);
}
}
}
return $noms_erreur;
}
/**
* Test #58
*/
private function testerSynonymeDouteuxSyntaxe() {
$noms_erreur = array();
foreach ($this->noms as &$nom) {
if ($nom['synonyme_douteux'] != '') {
if (!$this->verifierBooleen($nom['synonyme_douteux'])) {
$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['synonyme_douteux'], $nom['exclure_taxref']);
$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);
}
}
}
return $noms_erreur;
}
/**
* Test #59
*/
private function testerSynonymeDouteuxNumNomRetenu() {
$noms_erreur = array();
foreach ($this->noms as &$nom) {
if ($nom['synonyme_douteux'] == 1 && !$this->verifierNombre($nom['num_nom_retenu'])) {
$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['synonyme_douteux'], $nom['exclure_taxref']);
$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);
}
}
return $noms_erreur;
}
/**
* Test #60
*/
private function testerSynonymeMalAppliqueSyntaxe() {
$noms_erreur = array();
foreach ($this->noms as &$nom) {
if ($nom['synonyme_mal_applique'] != '') {
if (!$this->verifierBooleen($nom['synonyme_mal_applique'])) {
$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['synonyme_mal_applique'], $nom['exclure_taxref']);
$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);
}
}
}
return $noms_erreur;
}
/**
* Test #61
*/
private function testerSynonymeOrthographiqueSyntaxe() {
$noms_erreur = array();
foreach ($this->noms as $nom) {
if ($nom['synonyme_orthographique'] != '') {
if (!$this->verifierNombre($nom['synonyme_orthographique'])) {
$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['synonyme_orthographique'], $nom['exclure_taxref']);
$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);
}
}
}
return $noms_erreur;
}
/**
* Test #62
*/
private function testerSynonymeOrthographiqueExistence() {
$noms_erreur = array();
foreach ($this->noms as &$nom) {
if ($nom['synonyme_orthographique'] != '') {
if (!isset($this->noms[$nom['synonyme_orthographique']])) {
$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['synonyme_orthographique'], $nom['exclure_taxref']);
$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);
}
}
}
return $noms_erreur;
}
/**
* Test #63
*/
private function testerHybrideParent01Syntaxe() {
$noms_erreur = array();
foreach ($this->noms as &$nom) {
if ($nom['hybride_parent_01'] != '') {
if (!$this->verifierNombre($nom['hybride_parent_01'])) {
$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $this->repererEspace($nom['hybride_parent_01']), $nom['exclure_taxref']);
$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);
}
}
}
return $noms_erreur;
}
/**
* Test #64
*/
private function testerHybrideParent01Existence() {
$noms_erreur = array();
foreach ($this->noms as &$nom) {
if ($nom['hybride_parent_01'] != '' && $nom['hybride_parent_01'] != '0') {
if (!isset($this->noms[$nom['hybride_parent_01']])) {
$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $this->repererEspace($nom['hybride_parent_01']), $nom['exclure_taxref']);
$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);
}
}
}
return $noms_erreur;
}
/**
* Test #65
*/
private function testerHybrideParent02Syntaxe() {
$noms_erreur = array();
foreach ($this->noms as &$nom) {
if ($nom['hybride_parent_02'] != '') {
if (!$this->verifierNombre($nom['hybride_parent_02'])) {
$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $this->repererEspace($nom['hybride_parent_02']), $nom['exclure_taxref']);
$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);
}
}
}
return $noms_erreur;
}
/**
* Test #66
*/
private function testerHybrideParent02Existence() {
$noms_erreur = array();
foreach ($this->noms as &$nom) {
if ($nom['hybride_parent_02'] != '') {
if (!isset($this->noms[$nom['hybride_parent_02']]) && $nom['hybride_parent_02'] != '0') {
$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $this->repererEspace($nom['hybride_parent_02']), $nom['exclure_taxref']);
$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);
}
}
}
return $noms_erreur;
}
/**
* Test #67
*/
private function testerNumTypeSyntaxe() {
$noms_erreur = array();
foreach ($this->noms as &$nom) {
if ($nom['num_type'] != '') {
if (!$this->verifierNombre($nom['num_type'])) {
$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['num_type'], $nom['exclure_taxref']);
$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);
}
}
}
return $noms_erreur;
}
/**
* Test #68
*/
private function testerNumTypeExistence() {
$noms_erreur = array();
foreach ($this->noms as &$nom) {
if ($nom['num_type'] != '') {
if (!isset($this->noms[$nom['num_type']])) {
$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['num_type'], $nom['exclure_taxref']);
$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);
}
}
}
return $noms_erreur;
}
/**
* Test #69
*/
private function testerPresenceSyntaxe() {
$noms_erreur = array();
foreach ($this->noms as &$nom) {
if ($nom['presence'] != '') {
if (!$this->verifierPresence($nom['presence'])) {
$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['presence'], $nom['exclure_taxref']);
$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);
}
}
}
return $noms_erreur;
}
/**
* Test #70
*/
private function testerPresenceExistence() {
$noms_erreur = array();
foreach ($this->noms as &$nom) {
if ($nom['num_nom_retenu'] == $nom['num_nom'] && $nom['exclure_taxref'] == 0) {
if ($nom['presence'] == "") {
$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'],$nom['num_nom_retenu'], $nom['presence'], $nom['exclure_taxref']);
$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);
}
}
}
return $noms_erreur;
}
/**
* Test #71
*/
private function testerStatutOrigineSyntaxe() {
$noms_erreur = array();
foreach ($this->noms as &$nom) {
if ($nom['statut_origine'] != '') {
if (!$this->verifierStatutOrigine($nom['statut_origine'])) {
$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['statut_origine'], $nom['exclure_taxref']);
$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);
}
}
}
return $noms_erreur;
}
/**
* Test #72
*/
private function testerStatutIntroductionSyntaxe() {
$noms_erreur = array();
foreach ($this->noms as &$nom) {
if ($nom['statut_introduction'] != '') {
if (!$this->verifierStatutIntroduction($nom['statut_introduction'])) {
$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['statut_introduction'], $nom['exclure_taxref']);
$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);
}
}
}
return $noms_erreur;
}
/**
* Test #73
*/
private function testerStatutCultureSyntaxe() {
$noms_erreur = array();
foreach ($this->noms as &$nom) {
if ($nom['statut_culture'] != '') {
if (!$this->verifierStatutCulture($nom['statut_culture'])) {
$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['statut_culture'], $nom['exclure_taxref']);
$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);
}
}
}
return $noms_erreur;
}
/**
* Test #74
*/
private function testerExclureTaxRefSyntaxe() {
$noms_erreur = array();
foreach ($this->noms as &$nom) {
if ($nom['exclure_taxref'] != '' && $nom['exclure_taxref'] != null) {
if (!preg_match('/^(?:0|1|9)$/', $nom['exclure_taxref'])) {
$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['exclure_taxref']);
$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);
}
}
}
return $noms_erreur;
}
/**
* Test #75
*/
private function testerNomFrancaisUnique() {
$noms_erreur = array();
foreach ($this->noms as &$nom) {
if ($nom['nom_francais'] != '' && $nom['nom_francais'] != null) {
if (strpbrk($nom['nom_francais'],',;')) {
$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $this->repererCaracteresInvalidesNomFrancais($nom['nom_francais']));
$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);
}
}
}
return $noms_erreur;
}
/**
* Test #76
*/
private function testerExclureTaxRefPresence() {
$noms_erreur = array();
foreach ($this->noms as &$nom) {
// On vérifie tous les noms retenu nom exclus de taxref de rang inférieur ou égal à l'espèce
if ($nom['num_nom_retenu'] == $nom['num_nom'] && $nom['exclure_taxref'] == 0 && $nom['rang'] >= 240) {
if($nom['presence'] == '' || !$this->verifierPresence($nom['presence'])) {
if(($nom['statut_origine'] == '' || !$this->verifierStatutOrigine($nom['statut_origine'])) &&
($nom['statut_introduction'] == '' || !$this->verifierStatutIntroduction($nom['statut_introduction'])) &&
($nom['statut_culture'] == '' || !$this->verifierStatutCulture($nom['statut_culture'])))
{
$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['nom_sci'],
$this->mettreEnValeurAvertissement($nom['presence']),
$this->mettreEnValeurAvertissement($nom['statut_origine']),
$this->mettreEnValeurAvertissement($nom['statut_introduction']),
$this->mettreEnValeurAvertissement($nom['statut_culture'])
);
$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);
} else {
//TODO: le comportement est identique mais il faudrait pouvoir afficher un avertissement
// si le champ présence n'est pas rempli mais que l'une des colonne de statut l'est
$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['nom_sci'],
$nom['presence'],
$this->mettreEnValeurAvertissement($nom['statut_origine']),
$this->mettreEnValeurAvertissement($nom['statut_introduction']),
$this->mettreEnValeurAvertissement($nom['statut_culture'])
);
$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);
}
}
}
}
return $noms_erreur;
}
//+--------------------------------------------------------------------------------------------------------------+//
// MÉTHODES COMMUNES aux TESTS
private function verifierPresence(&$valeur) {
$codes = $this->manuel['codes_presence'];
$ok = $this->verifierStatuts($valeur, $codes);
return $ok;
}
private function verifierStatutOrigine(&$valeur) {
$codes = $this->manuel['codes_statuts_origine'];
$ok = $this->verifierStatuts($valeur, $codes);
return $ok;
}
private function verifierStatutIntroduction(&$valeur) {
$codes = $this->manuel['codes_statuts_introduction'];
$ok = $this->verifierStatuts($valeur, $codes);
return $ok;
}
private function verifierStatutCulture(&$valeur) {
$codes = $this->manuel['codes_statuts_culture'];
$ok = $this->verifierStatuts($valeur, $codes);
return $ok;
}
private function verifierStatuts(&$valeur, &$codes) {
$ok = true;
if (!preg_match("/^(?:|-|[$codes](?:-[A-Z])?)$/", $valeur)) {
$ok = false;
}
return $ok;
}
private function verifierBooleen(&$valeur) {
$ok = true;
if (!preg_match('/^1$/', $valeur)) {
$ok = false;
}
return $ok;
}
private function verifierNombre(&$valeur) {
$ok = true;
if (!preg_match('/^[0-9]+$/', $valeur)) {
$ok = false;
}
return $ok;
}
private function verifierNombreSuite(&$valeur) {
$ok = true;
if (!preg_match('/^(?:[0-9]+, ?)*[0-9]+$/', $valeur)) {
$ok = false;
}
return $ok;
}
private function verifierTypeEpithete(&$type) {
$ok = false;
$rejetes = $this->manuel['type_epithete_rejetes'];
if (preg_replace("/^(?:$rejetes)$/", '', $type) == '') {
$ok = false;
} else if (preg_match('/^[a-z][-a-z]*[.]?$/', $type)) {
$ok = true;
}
return $ok;
}
private function verifierBiblioOrigine(&$intitule) {
$ok = true;
if (preg_match('/(?:^\s+|\s{2,}|\s+$)/', $intitule)) {
$ok = false;// Contient des espaces en trop
} else if (!preg_match('/^(?:in [^;]+[;]|)[^,]+?(?:[,][^:]+|)(?:[:].+|)$/', $intitule)) {
$ok = false;
} else if (preg_match('/(?:(?:^|[,:])\s*(?:[:,]|$))/', $intitule)) {
$ok = false;// Contient une mauvaise suite de caractères
}
return $ok;
}
private function verifierAnnee(&$annee) {
$ok = true;
if (!preg_match('/^[0-9]{4}$/', $annee)) {
$ok = false;
} else if ($annee < ANNEE_MINIMUM) {
$ok = false;
} else if ($annee > ANNEE_EN_COURS) {
$ok = false;
}
return $ok;
}
private function verifierAuteur(&$intitule) {
$ok = true;
$acceptes = $this->manuel['auteur_acceptes'];
if (!preg_match("/^(?:$acceptes)$/", $intitule)) {
if (preg_match('/(?:^\s+|\s{2,}|\s+$)/', $intitule)) {
$ok = false;// Contient des espaces en trop
} else {
$mots_rejetes = $this->manuel['auteur_mots_rejetes'];
$mots = explode(' ', $intitule);
foreach ($mots as $position => $mot) {
if (preg_match("/^(?:$mots_rejetes)$/i", $mot)) {
$ok = false;// Mot rejeté
} else if (preg_match("/^(?:(?:\p{L}|[.'\(\),-])+|[&])$/u", $mot)) {
continue;// Mot de l'intitulé auteur
} else {
$ok = false;
}
}
}
}
return $ok;
}
private function verifierNomCommercial(&$epithete) {
$ok = false;
if (preg_match("/^[[:upper:][:punct:][:digit:][:space:]]+$/", $epithete)) {
$ok = true;
}
return $ok;
}
private function verifierEpitheteCultivar(&$epithete) {
$ok = true;
$acceptes = $this->manuel['cultivar_acceptes'];
if (!preg_match("/^(?:$acceptes)$/", $epithete)) {
if (preg_match('/(?:^\s+|\s{2,}|\s+$)/', $epithete)) {
$ok = false;// Contient des espaces en trop
} else {
$mots_rejetes = $this->manuel['cultivar_mots_rejetes'];
$mots_mineurs = $this->manuel['mots_mineurs'];
$mots = explode(' ', $epithete);
foreach ($mots as $position => $mot) {
if (preg_match("/^(?:$mots_rejetes)$/i", $mot)) {
$ok = false;// Mot rejeté
} else if ($position > 0 && preg_match("/^(?:$mots_mineurs)$/", $mot)) {
continue;// Mot mineur en minuscule qui n'est pas en 1ère position
} else {
$mots_tiret = explode('-', $mot);
foreach ($mots_tiret as $position_tiret => $mot_tiret) {
if ($position_tiret > 0 && preg_match("/^(?:$mots_mineurs)$/", $mot_tiret)) {
continue;// Mot-tiret mineur en minuscule qui n'est pas en 1ère position
} else if (preg_match('/^[[:upper:]][[:lower:]]+$/', $mot_tiret)) {
continue;//Mot (ou 'mot-tiret') avec lettre initiale majuscule
} else if ($position_tiret == count($mots_tiret) && preg_match('/^[:upper:][:lower:]+[:punct:]?$/', $mot_tiret)) {
continue;//Dernier mot (ou 'mot-tiret') avec lettre initiale majuscule, suivi d'un éventuel signe de ponctuation
} else {
$ok = false;
}
}
}
}
}
}
return $ok;
}
private function verifierEpitheteGroupeCultivar(&$epithete) {
$ok = true;
$acceptes = $this->manuel['cultivar_gp_acceptes'];
if (!preg_match("/^(?:$acceptes)$/", $epithete)) {
if (preg_match('/(?:^\s+|\s{2,}|\s+$)/', $epithete)) {
$ok = false;// Contient des espaces en trop
} else {
$mots_acceptes = $this->manuel['cultivar_gp_mots_acceptes'];
$mots_rejetes = $this->manuel['cultivar_gp_mots_rejetes'];
$mots_mineurs = $this->manuel['mots_mineurs'];
$mots = explode(' ', $epithete);
foreach ($mots as $position => $mot) {
if (preg_match("/^(?:$mots_acceptes)$/i", $mot)) {
continue;// Mot accepté
} else if (preg_match("/^(?:$mots_rejetes)$/i", $mot)) {
$ok = false;// Mot rejeté
} else if ($position > 0 && preg_match("/^(?:$mots_mineurs)$/", $mot)) {
continue;// Mot mineur en minuscule qui n'est pas en 1ère position
} else {
$mots_tiret = explode('-', $mot);
foreach ($mots_tiret as $position_tiret => $mot_tiret) {
if ($position_tiret > 0 && preg_match("/^(?:$mots_mineurs)$/", $mot_tiret)) {
continue;// Mot-tiret mineur en minuscule qui n'est pas en 1ère position dans le mot
} else if (preg_match('/^[[:upper:]][[:lower:]]+$/', $mot_tiret)) {
continue;// Mot (ou 'mot-tiret') avec lettre initiale majuscule
} else if ($position_tiret == count($mots_tiret) && preg_match('/^[:upper:][:lower:]+[:punct:]?$/', $mot_tiret)) {
continue;// Dernier mot (ou 'mot-tiret') avec lettre initiale majuscule, suivi d'un éventuel signe de ponctuation
} else {
$ok = false;
}
}
}
}
}
}
return $ok;
}
private function verifierEpitheteSp(&$epithete) {
$ok = false;
if (preg_match('/^[a-zäëḧïöẗüẅẍÿ][-a-zäëḧïöẗüẅẍÿ]+$/', $epithete)) {
$ok = true;
} else if (preg_match('/^sp\.(?:[A-Z]|[1-9][0-9]*)$/', $epithete)) {
$ok = true;
}
return $ok;
}
private function verifierEpitheteGenre(&$epithete) {
$ok = false;
if (preg_match('/^[A-ZÄËḦÏÖÜẄẌŸ](?:[-a-zäëḧïöẗüẅẍÿ]+|[a-zäëḧïöẗüẅẍÿ]+-[A-ZÄËḦÏÖÜẄẌŸ][a-zäëḧïöẗüẅẍÿ]+)$/', $epithete)) {
$ok = true;
}
return $ok;
}
private function verifierEstAbbreviationInfraSp($mot) {
$ok = false;
if(preg_match($this->manuel['abbr_rangs_infra_specifique'], $mot)) {
$ok = true;
}
return $ok;
}
private function formaterStyleNomGenre(&$genre) {
$genre_fmt = '';
if (preg_match('/^\s*([x+])\s+(.+)$/i', $genre, $match)) {
$genre_fmt = utf8_encode(strtolower(utf8_decode($match[1]))).' '.utf8_encode(ucfirst(strtolower(utf8_decode($match[2]))));
} elseif (preg_match('/^(.+)\s+([x+])\s+(.+)$/i', $genre, $match)) {
$genre_fmt = utf8_encode(ucfirst(strtolower(utf8_decode($match[1])))).' '.
utf8_encode(strtolower(utf8_decode($match[2]))).' '.utf8_encode(ucfirst(strtolower(utf8_decode($match[3]))));
} else {
$genre_fmt = utf8_encode(ucfirst(strtolower(utf8_decode($genre))));
}
return $genre_fmt;
}
private function formaterStyleEpitheteSpHybride(&$genre, &$epithete) {
$nom_fmt = '';
$erreur = '';
if (trim($genre) == '') {
if ($epithete != '') {
$nom_fmt = $this->formaterFormuleHybridite($epithete);
} else {
$erreur = "Formule d'hybridité sans épithéte spécifique";
}
} else {
$nom_fmt = $this->formaterNomHybride($genre, $epithete);
}
return array($nom_fmt, $erreur);
}
private function formaterStyleEpitheteInfraSpHybride(&$nom_sci, &$infra, &$genre = null) {
$nom_fmt = '';
$erreur = '';
if (trim($genre) == '') {
if (trim($nom_sci) == '') {
if (trim($infra) != '') {
$nom_fmt = $this->formaterFormuleHybridite($infra);
} else {
$erreur = "Formule d'hybridité sans épithéte infraspécifique";
}
} else {
$erreur = "Formule d'hybridité avec épithéte spécifique";
}
} else {
$nom_fmt = $this->formaterNomHybride($nom_sci, $infra);
}
return array($nom_fmt, $erreur);
}
private function formaterNomHybride(&$nom_sci, &$epithete) {
if (preg_match('/^(.+)\s+([x+])\s+(.+)$/i', $epithete, $match) != '') {
$nom_fmt = $nom_sci.utf8_encode(ucfirst(strtolower(utf8_decode($match[1])))).' '.
utf8_encode(strtolower(utf8_decode($match[2]))).' '.
utf8_encode(ucfirst(strtolower(utf8_decode($match[3]))));
} elseif (preg_match('/^([x+])\s+(.+)$/i', $epithete, $match) != '') {
$nom_fmt = $nom_sci.utf8_encode(strtolower(utf8_decode($match[1]))).' '.
utf8_encode(strtolower(utf8_decode($match[2])));
} else {
$nom_fmt = $nom_sci.utf8_encode(strtolower(utf8_decode($epithete)));
}
return $nom_fmt;
}
private function formaterFormuleHybridite(&$epithete) {
$liste_parents = explode(' x ', $epithete);
if (count($liste_parents) == 2) {
$nom_fmt = utf8_encode(ucfirst(strtolower(utf8_decode($liste_parents[0])))).' x '.
utf8_encode(ucfirst(strtolower(utf8_decode($liste_parents[1]))));
} else {
for ($i=0; $i<count($liste_parents); $i++) {
if (strstr(trim($liste_parents[$i]), ' ') == false) {
$nom[] = utf8_encode(ucfirst(strtolower(utf8_decode(trim($liste_parents[$i]))))).' x '.
utf8_encode(strtolower(utf8_decode(trim($liste_parents[$i+1]))));
$i++;
} else {
$nom[] = utf8_encode(ucfirst(strtolower(utf8_decode($liste_parents[$i]))));
}
}
$nom_fmt = implode(' x ', $nom);
}
return $nom_fmt;
}
private function repererEspace($nom_sci) {
$nom_sci = str_replace(' ', '<span class="espace"> </span>', $nom_sci);
return $nom_sci;
}
private function repererCaracteresInvalidesNomFrancais($nom_verna) {
$nom_verna = str_replace(',', '<span class="espace">,</span>', $nom_verna);
$nom_verna = str_replace(';', '<span class="espace">;</span>', $nom_verna);
return $nom_verna;
}
private function mettreEnValeurAvertissement($chaine) {
$chaine = '<span class="espace">'.$chaine.'</span>';
return $chaine;
}
private function construireSuffixeNomPltCultivee(&$nom) {
$suffixe = array();
$suffixe[] = $this->construireNomCultivarGroupe($nom);
$suffixe[] = $this->construireNomCommercial($nom);
$suffixe[] = $this->construireNomCultivar($nom);
$suffixe = array_filter($suffixe);
return implode(' ', $suffixe);
}
private function construireNomCultivarGroupe(&$nom) {
$nom_groupe_cultivar = '';
if ($nom['cultivar_groupe'] != '') {
if (preg_match('/ gx$/', $nom['cultivar_groupe'])) {
$nom_groupe_cultivar = '('.$nom['cultivar_groupe'].')';
} else {
$nom_groupe_cultivar = '('.$nom['cultivar_groupe'].' Gp)';
}
}
return $nom_groupe_cultivar;
}
private function construireNomCommercial(&$nom) {
$nom_commercial = '';
if ($nom['nom_commercial'] != '') {
$nom_commercial = strtoupper($nom['nom_commercial']);
}
return $nom_commercial;
}
private function construireNomCultivar(&$nom) {
$nom_cultivar = '';
if ($nom['cultivar'] != '') {
$nom_cultivar = "'".$nom['cultivar']."'";
}
return $nom_cultivar;
}
private function classerNomsParNomComplet() {
$noms_classes = array();
foreach ($this->noms as &$nom) {
if (!isset($noms_classes[$nom['nom_sci']])) {
$noms_classes[$nom['nom_sci']] = 1;
} else {
$noms_classes[$nom['nom_sci']]++;
}
}
return $noms_classes;
}
}
?>