Rev 364 | Blame | Compare with Previous | Last modification | View Log | RSS feed
<?php// Encodage : UTF-8// +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------+/*** Tests de référentiels de nomenclature et taxonomie** Description : classe permettant de tester les référentiels selon le manuel technique* Utilisation : php script.php tests -p bdnff -a tout*//Auteur original :* @author Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org>* @copyright Tela-Botanica 1999-2010* @link http://www.tela-botanica.org/wikini/RTaxMethodo/wakka.php?wiki=MaNuel* @licence GPL v3 & CeCILL v2* @version $Id$*/// +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------+// TODO : supprimer l'utilisation du paramêtres 'p' et chercher les infos depuis la bddclass Tests extends ScriptCommande {const SCRIPT_NOM = 'tests';const MANUEL_VERSION = '4.4';private $projet = null;private $traitement = null;private $manuel = null;private $manuel_nom = null;private $manuel_chemin = null;private $tests = null;private $colonnes = null;private $analyses = null;private $noms = null;private $erreurs = array();private $resultatDao = null;private $traitementDao = null;private $tableStructureDao = null;private $referentielDao = null;public function executer() {$this->manuel_nom = 'mtpr_v'.str_replace('.', '_', self::MANUEL_VERSION).'.pdf';$this->manuel_chemin = Config::get('chemin_appli').DS.'..'.DS.'configurations'.DS;$manuel_config_nom = 'referentiel_v'.self::MANUEL_VERSION.'.ini';$this->manuel = parse_ini_file($this->manuel_chemin.$manuel_config_nom);$this->definirConstantes();$this->tests = parse_ini_file($this->getModuleChemin().DS.'configurations'.DS.'tests.ini', true);$this->resultatDao = new ResultatDao();$this->traitementDao = new TraitementDao();Debug::printr('Dans le script test');// Récupération du dernier traitement demandé$this->traitement = $this->traitementDao->getDernierTraitement('tout', self::SCRIPT_NOM);if (isset($this->traitement)) {$this->projet = $this->traitement['referentiel_code']; // Récupération du nom de projetDebug::printr($this->traitement);// Écriture de la date de début du traitementDebug::printr('Debute:'.$this->traitementDao->debuterTraitement($this->traitement['id_traitement']));// Nettoyage des traitements obsolètes$traitements_obsoletes = $this->traitementDao->getTraitementsObsoletes($this->projet, self::SCRIPT_NOM);if (isset($traitements_obsoletes)) {Debug::printr('Supp. obsoletes:'.$this->traitementDao->supprimer($traitements_obsoletes));}$this->tableStructureDao = new TableStructureDao();$this->referentielDao = new ReferentielDao();// Lancement du test demandé$cmd = $this->getParam('a');switch ($cmd) {case 'tout' :Debug::printr('Départ lancement test:');$this->recupererDonnees();$this->lancerTestsAuto();break;case 'test14' :$this->recupererDonnees();Debug::printr('Départ lancement test 14 :');$this->testerClassificationRang();break;default :$this->traiterErreur('Erreur : la commande "%s" n\'existe pas!', array($cmd));}// Écriture de la date de fin du traitementDebug::printr('Termine:'.$this->traitementDao->terminerTraitement($this->traitement['id_traitement']));} else {Debug::printr("Aucun dernier traitement trouvé pour le script '".self::SCRIPT_NOM."' !");}}/*** Cette méthode définie des constantes qui peuvent ensuite être utilisée dans les fichier ini.* Surtout utile pour le fichier tests.ini*/private function definirConstantes() {define('RANG_GENRE', $this->manuel['rang_genre']);define('RANG_SP', $this->manuel['rang_sp']);date_default_timezone_set('Europe/Berlin');define('ANNEE_EN_COURS', date('Y'));define('ANNEE_MINIMUM', 1753);}public function recupererDonnees() {// Récupération des données à tester$this->colonnes = $this->tableStructureDao->getColonnes($this->projet);$this->analyses = $this->tableStructureDao->getAnalyse($this->projet);$this->noms = $this->referentielDao->getTout($this->projet);Debug::printr('Nbre noms :'.count($this->noms));}public function lancerTestsAuto() {$resultats = array();// Lancement des tests unitairesDebug::printr('Lancement des tests unitaires');$tests_numeros = array_keys($this->tests);Debug::printr($tests_numeros);foreach ($tests_numeros as &$numero) {$info = $this->getInfosTest($numero);if ($numero < 5) {// Tests spéciaux vérifiant la structure de la table$resultats[] = $this->lancerTestUnitaire($info);} else if ($numero >= 5 && $this->verifierResultats($resultats)) {// Si la structure est bonne nous lançons les autres tests$this->lancerTestUnitaire($info);}}$info = $this->construireTotalErreur();$this->traiterResultatTest($info);}private function getInfosTest($numero) {$info = $this->tests[$numero];$info['methode'] = 'tester'.implode('', explode(' ', ucwords($info['abr'])));$info['numero'] = $numero;$info['nom'] = '#'.$numero.' - '.$info['nom'];$info['resultat'] = false;return $info;}public function lancerTestUnitaire($info) {Debug::printr($info['numero'].'::'.$info['methode']);$methodeDeTest = $info['methode'];$erreurs = $this->$methodeDeTest();// Analyse des résultatsif (isset($erreurs['special'])) {$info = $erreurs;} else {$info = $this->construireResultatErreur($erreurs, $info);}$this->traiterResultatTest($info);if ($info['numero'] < 5) {return ($info['resultat'] ? '1' : '0');}}private function ajouterNumNomErreursTest($num_nom) {if (count($this->erreurs) < 1000) {if (isset($this->erreurs[$num_nom])) {$this->erreurs[$num_nom] += 1;} else {$this->erreurs[$num_nom] = 1;}}}private function construireResultatErreur($erreurs, $info) {if (count($erreurs) > 0) {$info['message']['entete'] = explode(',', $info['entete']);if (isset($info['title'])) {$info['message']['title'] = explode(';', $info['title']);}$info['message']['lignes'] = $erreurs;unset($erreurs);} else {$info['resultat'] = true;}return $info;}private function construireTotalErreur() {if (count($this->erreurs) > 0) {arsort($this->erreurs);$info['abr'] = "erreurs par num_nom";$info['nom'] = "erreurs -> num_nom";$info['description'] = "nombre d'erreurs détecté par num_nom";$info['numero'] = "0";$info['message']['entete'] = array('num_nom', "nombre d'erreurs");foreach ($this->erreurs as $num_nom=>$nombre) {$erreurs[] = array(0 => $num_nom, 1 => $nombre);}$info['message']['lignes'] = $erreurs;unset($this->erreurs);} else {$info['resultat'] = true;}return $info;}private function verifierResultats(&$resultats) {$ok = true;foreach ($resultats as $resultat) {if ($resultat == '0') {$ok = false;break;}}return $ok;}private function traiterResultatTest($info) {if (isset($info['message'])) {if (is_array($info['message'])) {$erreurs_nbre = count($info['message']['lignes']);$erreurs_max = 1000;if ($erreurs_nbre > $erreurs_max) {$info['message']['lignes'] = array_slice($info['message']['lignes'], 0, $erreurs_max);$info['erreur'] = "$erreurs_nbre erreurs ont été détectées seules les $erreurs_max premières sont affichées";}$info['message'] = $this->getVue('tests/squelettes/message_table', $info);} else {$info['message'] = $this->getVue('tests/squelettes/message_p', $info);}}Debug::printr($this->resultatDao->ajouter($this->traitement['id_traitement'], $info));$info = null;}//+--------------------------------------------------------------------------------------------------------------+//// TESTS/*** Test #01*/private function testerNombreDeChamps() {$info = $this->getInfosTest(1);$info['special'] = true;$nbre_colonnes = count($this->colonnes);$info['message'] = $nbre_colonnes;if ($nbre_colonnes >= 37) {$info['resultat'] = true;}return $info;}/*** Test #02*/private function testerNomDesChamps() {$info = $this->getInfosTest(2);$info['special'] = true;$champs_attendus = explode(',', $this->manuel['champs']);$champs_presents = array();foreach ($this->colonnes as &$colonne) {$champs_presents[$colonne['Field']] = $colonne;}$ok = true;$champs_manquant = array();foreach ($champs_attendus as &$champ_attendu) {if (!isset($champs_presents[$champ_attendu])) {$champs_manquant[] = $champ_attendu;$ok = false;}}$info['resultat'] = $ok;if (!$ok) {$info['message'] = sprintf($info['message'], implode(', ', $champs_manquant));}return $info;}/*** Test #03*/private function testerTypeDesChamps() {$champs_attendus = explode(',', $this->manuel['champs_type']);$champs_presents = array();foreach ($this->colonnes as &$colonne) {$champs_presents[$colonne['Field']] = $colonne['Type'];}// Recercherche des erreurs$champs_erreur = array();foreach ($champs_attendus as &$champ_attendu) {list($champ_attendu_nom, $champ_attendu_type_taille) = explode('=', trim($champ_attendu));list($champ_attendu_type, $champ_attendu_taille) = explode('|', trim($champ_attendu_type_taille));if (isset($champs_presents[$champ_attendu_nom])) {$champs_present_type = $champs_presents[$champ_attendu_nom];if (($champ_attendu_type == 'VARCHAR' && strstr($champs_present_type, 'varchar') === false)|| ($champ_attendu_type == 'TEXT' && strstr($champs_present_type, 'text') === false)|| ($champ_attendu_type == 'INT' && strstr($champs_present_type, 'int') === false)|| ($champ_attendu_type == 'BOOL' && preg_match('/(?:bool|boolean|tinyint\(1\))/i', $champs_present_type) === false)) {$champs_erreur[] = array($champ_attendu, $champ_attendu_type, $champs_present_type);}}}return $champs_erreur;}/*** Test #04*/private function testerNumNomClePrimaire() {$info = $this->getInfosTest(4);$info['special'] = true;foreach ($this->colonnes as &$colonne) {if ($colonne['Field'] == 'num_nom' && $colonne['Key'] == 'PRI') {$info['resultat'] = true;break;}}return $info;}/*** Test #05*/private function testerTailleDesChamps() {$tailles_champs_maxi = array();foreach ($this->colonnes as &$colonne) {if (preg_match('/^varchar\(([0-9]+)\)$/', $colonne['Type'], $match)) {$tailles_champs_maxi[$colonne['Field']] = $match[1];}}$tailles_trouvees = array();foreach ($this->analyses as &$analyse) {if (preg_match('/\.([^.]+)$/', $analyse['Field_name'], $match)) {$tailles_trouvees[$match[1]] = $analyse['Max_length'];}}$champs_erreur = array();$champs_attendus = explode(',', $this->manuel['champs']);foreach ($champs_attendus as &$champ_attendu) {if (isset($tailles_champs_maxi[$champ_attendu]) && isset($tailles_trouvees[$champ_attendu])) {if ($tailles_champs_maxi[$champ_attendu] == $tailles_trouvees[$champ_attendu]) {$champs_erreur[] = array($champ_attendu, $tailles_champs_maxi[$champ_attendu], $tailles_trouvees[$champ_attendu]);}}}return $champs_erreur;}/*** Test #06*/private function testerNumNomSuperieurAZero() {$noms_erreur = array();foreach ($this->noms as &$nom) {if ($nom['num_nom'] <= 0) {$noms_erreur[] = array($nom['num_nom']);$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);}}return $noms_erreur;}/*** Test #07*/private function testerNumNomRetenuSuperieurAZero() {$noms_erreur = array();foreach ($this->noms as &$nom) {if ($nom['num_nom_retenu'] != '' && $nom['num_nom_retenu'] <= 0) {$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['num_nom_retenu']);$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);}}return $noms_erreur;}/*** Test #08*/private function testerExistenceNumNomRetenu() {$noms_erreur = array();foreach ($this->noms as &$nom) {if ($nom['num_nom_retenu'] != '' && $nom['num_nom_retenu'] != $nom['num_nom']) {if ($nom['num_nom_retenu'] != 0 && !isset($this->noms[$nom['num_nom_retenu']])) {$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['num_nom_retenu'], $nom['exclure_taxref']);$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);}}}return $noms_erreur;}/*** Test #09*/private function testerTransmissionNumNomRetenu() {$noms_erreur = array();foreach ($this->noms as &$nom) {if ($nom['num_nom_retenu'] != $nom['num_nom'] && $nom['exclure_taxref'] == 0) {if ($nom['num_nom_retenu'] != 0 && isset($this->noms[$nom['num_nom_retenu']])) {if ($this->noms[$nom['num_nom_retenu']]['exclure_taxref'] != 0) {$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['num_nom_retenu'], $this->noms[$nom['num_nom_retenu']]['exclure_taxref']);$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);}}}}return $noms_erreur;}/*** Test #10*/private function testerSynonymeNumNomRetenu() {$noms_erreur = array();foreach ($this->noms as &$nom) {if ($nom['num_nom_retenu'] != $nom['num_nom']) {if ($nom['num_nom_retenu'] != 0 && isset($this->noms[$nom['num_nom_retenu']])) {if ($this->noms[$nom['num_nom_retenu']]['num_nom'] != $this->noms[$nom['num_nom_retenu']]['num_nom_retenu']) {$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['num_nom_retenu'], $this->noms[$nom['num_nom_retenu']]['num_nom_retenu']);$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);}}}}return $noms_erreur;}/*** Test #11*/private function testerDoublonsNomSci() {$noms_erreur = array();$noms_complets = array();foreach ($this->noms as &$nom) {$a = $nom['nom_sci']." ".$nom['auteur']." ".$nom['nom_addendum']." ".$nom['biblio_origine'];if (isset($noms_complets[$a])) {$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $a, $noms_complets[$a], $nom['exclure_taxref'], $nom['homonyme']);$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);} else {$noms_complets[$a] = $nom['num_nom'];}}return $noms_erreur;}/*** Test #12*/private function testerNumTaxSupEgalZeroUnique() {$noms_erreur = array();foreach ($this->noms as &$nom) {if (preg_match('/^0$/', $nom['num_tax_sup'])) {$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['num_tax_sup']);$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);}}// Ce test est spécial car le nombre de noms en erreurs doit être supérieur à 1 et non à 0 pour être KO.if (count($noms_erreur) == 1) {$noms_erreur = array();}return $noms_erreur;}/*** Test #13*/private function testerTaxSupPourTaxon() {$noms_erreur = array();foreach ($this->noms as &$nom) {if ($nom['num_nom_retenu'] != $nom['num_nom'] && $nom['num_tax_sup'] != '') {$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['num_tax_sup'], $nom['exclure_taxref']);$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);}}return $noms_erreur;}/*** Test #14*/private function testerExistenceTaxonSuperieur() {$noms_erreur = array();foreach ($this->noms as &$nom) {if ($nom['num_nom_retenu'] == $nom['num_nom']) {if ($nom['num_tax_sup'] != 0 && !isset($this->noms[$nom['num_tax_sup']])) {$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['num_tax_sup'], $nom['exclure_taxref']);$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);}}}return $noms_erreur;}/*** Test #15*/private function testerClassificationEspece() {$noms_erreur = array();foreach ($this->noms as &$nom) {if ($nom['num_nom_retenu'] == $nom['num_nom'] && $nom['rang'] == 290) {if (isset($this->noms[$nom['num_tax_sup']])) {$nom_sup = $this->noms[$nom['num_tax_sup']];if ($nom_sup['rang'] != 220 ) {$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['rang'], $nom_sup['num_nom'], $nom_sup['rang'], $nom['exclure_taxref']);$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);}}}}return $noms_erreur;}/*** Test #16*/private function testerTransmissionTaxonSuperieur() {$noms_erreur = array();foreach ($this->noms as &$nom) {if ($nom['num_nom_retenu'] == $nom['num_nom'] && $nom['exclure_taxref'] == 0) {if ($nom['num_tax_sup'] != 0 && isset($this->noms[$nom['num_tax_sup']])) {if ($this->noms[$nom['num_tax_sup']]['exclure_taxref'] != 0) {$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['num_tax_sup'], $this->noms[$nom['num_tax_sup']]['exclure_taxref']);$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);}}}}return $noms_erreur;}/*** Test #17*/private function testerClassificationRang() {$noms_erreur = array();//$rangs = explode(',', $this->manuel['rangs']);foreach ($this->noms as &$nom) {if ($nom['num_nom_retenu'] == $nom['num_nom']) {if (isset($this->noms[$nom['num_tax_sup']])) {$nom_sup = $this->noms[$nom['num_tax_sup']];//$num_rang = array_search($nom['rang'], $rangs);if ($nom_sup['rang'] >= $nom['rang']) {//if ($nom_sup['rang'] != $rangs[$num_rang-1] ) {// Prise en compte de l'exception des cladesif (! ($nom_sup['rang'] == 70 && $nom['rang'] == 70)) {$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['rang'], $nom_sup['num_nom'], $nom_sup['rang'], $nom['exclure_taxref']);$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);}}}}}return $noms_erreur;}/*** Test #18*/private function testerClassification() {$noms_erreur = array();$this->noms_ok = array();foreach ($this->noms as &$nom) {if ($nom['num_nom_retenu'] == $nom['num_nom']) {if (isset($this->noms_ok[$nom['num_tax_sup']])) {$this->noms_ok[$nom['num_nom']] = true;} else {$this->detection_boucle_infini = array();$classif_ok = $this->remonterClassif($nom);unset($this->detection_boucle_infini);if ($classif_ok === true) {$this->noms_ok[$nom['num_nom']] = $classif_ok;} else {$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $classif_ok, $nom['exclure_taxref']);$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);}}}}unset($this->noms_ok);return $noms_erreur;}private function remonterClassif(&$nom) {$this->detection_boucle_infini[$nom['num_nom']] = true;if (preg_match('/^[0-9]*$/', $nom['num_tax_sup'])) {if (isset($this->noms_ok[$nom['num_tax_sup']])) {$this->noms_ok[$nom['num_nom']] = true;return true;} else if (!isset($this->noms[$nom['num_tax_sup']]) && $nom['num_tax_sup'] == '0') {$this->noms_ok[$nom['num_nom']] = true;return true;} else if (!isset($this->noms[$nom['num_tax_sup']]) && $nom['num_tax_sup'] != '0') {return 'Hiérarchie avec le taxon #'.$nom['num_nom'].' ayant un taxon superieur #'.$nom['num_tax_sup'].' inexistant';} else if (isset($this->detection_boucle_infini[$nom['num_tax_sup']])) {return 'Boucle infinie pour le taxon #'.$nom['num_tax_sup'];} else {$retour = $this->remonterClassif($this->noms[$nom['num_tax_sup']]);if ($retour === true) {$this->noms_ok[$nom['num_tax_sup']] = true;$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);}return $retour;}} else {return 'Valeur num_tax_sup incorrecte : '.$nom['num_tax_sup'];}}/*** Test #19*/private function testerRang() {$rangs = array_flip(explode(',', $this->manuel['rangs']));// Réalisation du test$noms_erreur = array();foreach ($this->noms as &$nom) {if (!isset($rangs[$nom['rang']])) {$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['rang'], $nom['exclure_taxref']);$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);}}return $noms_erreur;}/*** Test #20*/private function testerNomCompletSupraGenerique() {$noms_erreur = array();foreach ($this->noms as &$nom) {if ($nom['rang'] < $this->manuel['rang_genre']) {$suffixe_plte_cultivee = $this->construireSuffixeNomPltCultivee($nom);$nom_sci_ideal = $this->formaterStyleNomGenre($nom['nom_supra_generique']);$nom_sci_ideal .= ($suffixe_plte_cultivee != '' ? ' '.$suffixe_plte_cultivee : '');if ($nom['nom_sci'] != $nom_sci_ideal) {$nom_sci_traite = $this->repererEspace($nom['nom_sci']);$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom_sci_traite, $nom_sci_ideal, $nom['exclure_taxref']);$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);}}}return $noms_erreur;}/*** Test #21*/private function testerNomCompletGenre() {$noms_erreur = array();foreach ($this->noms as &$nom) {if ($nom['rang'] == $this->manuel['rang_genre']) {$suffixe_plte_cultivee = $this->construireSuffixeNomPltCultivee($nom);$nom_sci_ideal = $this->formaterStyleNomGenre($nom['genre']);$nom_sci_ideal .= ($suffixe_plte_cultivee != '' ? ' '.$suffixe_plte_cultivee : '');if ($nom['nom_sci'] != $nom_sci_ideal) {$nom_sci_traite = $this->repererEspace($nom['nom_sci']);$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom_sci_traite, $nom_sci_ideal, $nom['exclure_taxref']);$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);}}}return $noms_erreur;}/*** Test #22*/private function testerNomCompletInfraGenre() {$noms_erreur = array();foreach ($this->noms as &$nom) {if ($nom['rang'] > $this->manuel['rang_genre'] && $nom['rang'] < $this->manuel['rang_sp']) {$suffixe_plte_cultivee = $this->construireSuffixeNomPltCultivee($nom);$nom_sci_ideal = '';if ($nom['type_epithete'] == 'agg.') {$nom_sci_ideal = $this->formaterStyleNomGenre($nom['genre']).' '.$this->formaterStyleNomGenre($nom['epithete_infra_generique']).' '.$nom['type_epithete'];} else {$nom_sci_ideal = $this->formaterStyleNomGenre($nom['genre']).' '.$nom['type_epithete'].' '.$this->formaterStyleNomGenre($nom['epithete_infra_generique']);}$nom_sci_ideal .= ($suffixe_plte_cultivee != '' ? ' '.$suffixe_plte_cultivee : '');if ($nom['nom_sci'] != $nom_sci_ideal) {$nom_sci_traite = $this->repererEspace($nom['nom_sci']);$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom_sci_traite, $nom_sci_ideal, $nom['exclure_taxref']);$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);}}}return $noms_erreur;}/*** Test #23*/private function testerNomCompletEspece() {$noms_erreur = array();$erreur = '';foreach ($this->noms as &$nom) {if ($nom['rang'] == $this->manuel['rang_sp']) {$suffixe_plte_cultivee = $this->construireSuffixeNomPltCultivee($nom);$nom_sci_ideal = $this->formaterStyleNomGenre($nom['genre']).' ';if (strstr($nom['nom_sci'] , ' x ') != false) {list($nom_sci_ideal, $erreur) = $this->formaterStyleEpitheteSpHybride($nom_sci_ideal, $nom['epithete_sp']);} else {$nom_sci_ideal .= utf8_encode(strtolower(utf8_decode($nom['epithete_sp'])));}$nom_sci_ideal .= ($suffixe_plte_cultivee != '' ? ' '.$suffixe_plte_cultivee : '');$nom_sci_ideal = trim($nom_sci_ideal);if ($nom['nom_sci'] != $nom_sci_ideal) {$nom_sci_traite = $this->repererEspace($nom['nom_sci']);$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom_sci_traite, $nom_sci_ideal, $erreur, $nom['exclure_taxref']);$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);}}}return $noms_erreur;}/*** Test #24*/private function testerNomCompletInfraSpecifique() {$noms_erreur = array();$erreur = null;foreach ($this->noms as &$nom) {if ($nom['rang'] > $this->manuel['rang_sp']) {$nom_sci_ideal = $this->formaterStyleNomGenre($nom['genre']).' '.utf8_encode(strtolower(utf8_decode($nom['epithete_sp']))).' '.utf8_encode(strtolower(utf8_decode($nom['type_epithete']))).' ';$suffixe_plte_cultivee = $this->construireSuffixeNomPltCultivee($nom);if (strstr($nom['nom_sci'] , ' x ') != false) {list($nom_sci_ideal, $erreur) = $this->formaterStyleEpitheteInfraSpHybride($nom_sci_ideal, $nom['epithete_infra_sp'], $nom['genre']);} else {$nom_sci_ideal .= utf8_encode(strtolower(utf8_decode($nom['epithete_infra_sp'])));}$nom_sci_ideal = trim($nom_sci_ideal);$nom_sci_ideal .= ($suffixe_plte_cultivee != '' ? ' '.$suffixe_plte_cultivee : '');if ($nom['nom_sci'] != $nom_sci_ideal) {$nom_sci_traite = $this->repererEspace($nom['nom_sci']);$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom_sci_traite, $nom_sci_ideal, $erreur, $nom['exclure_taxref']);$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);}}}return $noms_erreur;}/*** Test #25*/private function testerNomSupraGeneriqueEspaces() {$noms_erreur = array();foreach ($this->noms as &$nom) {if ($nom['nom_supra_generique'] != '') {if (preg_match('/(?:^\s+(?!:\s+)|(?!:\s+)\s+$)/', $nom['nom_supra_generique'])) {$nom_supra_generique_traite = $this->repererEspace($nom['nom_supra_generique']);$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom_supra_generique_traite, $nom['exclure_taxref']);$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);}}}return $noms_erreur;}/*** Test #26*/private function testerNomSupraGeneriqueSyntaxe() {$noms_erreur = array();foreach ($this->noms as &$nom) {if ($nom['nom_supra_generique'] != '') {if (!preg_match('/^[A-ZÄËḦÏÖÜẄẌŸ][-a-zäëḧïöẗüẅẍÿ]+$/', $nom['nom_supra_generique'])) {$nom_supra_generique_traite = $this->repererEspace($nom['nom_supra_generique']);$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom_supra_generique_traite, $nom['exclure_taxref']);$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);}}}return $noms_erreur;}/*** Test #27*/private function testerNomSupraGeneriqueRang() {$noms_erreur = array();foreach ($this->noms as &$nom) {if ($nom['nom_supra_generique'] != '') {if ($nom['rang'] >= $this->manuel['rang_genre']) {$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['nom_sci'], $nom['rang'], $nom['exclure_taxref']);$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);}}}return $noms_erreur;}/*** Test #28*/private function testerGenreEspaces() {$noms_erreur = array();foreach ($this->noms as &$nom) {if ($nom['genre'] != '') {if (preg_match('/(?:^\s+(?!:\s+)|(?!:\s+)\s{2,}(?!:\s+)|(?!:\s+)\s+$)/', $nom['genre'])) {$nom_traite = $this->repererEspace($nom['genre']);$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom_traite, $nom['exclure_taxref']);$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);}}}return $noms_erreur;}/*** Test #29*/private function testerGenreSyntaxe() {$noms_erreur = array();foreach ($this->noms as &$nom) {if ($nom['genre'] != '') {$mots = explode(' ', $nom['genre']);foreach ($mots as $mot) {if (!(preg_match('/^[+x]$/', $mot) || $this->verifierEpitheteGenre($mot))) {$nom_traite = $this->repererEspace($nom['genre']);$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom_traite, $nom['exclure_taxref']);$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);break;}}}}return $noms_erreur;}/*** Test #30*/private function testerGenreRang() {$noms_erreur = array();foreach ($this->noms as &$nom) {if ($nom['genre'] != '') {if ($nom['rang'] < $this->manuel['rang_genre']) {$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['nom_sci'], $nom['rang'], $nom['exclure_taxref']);$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);}}}return $noms_erreur;}/*** Test #31*/private function testerEpitheteInfraGeneriqueSyntaxe() {$noms_erreur = array();foreach ($this->noms as &$nom) {if ($nom['epithete_infra_generique'] != '') {if (!preg_match('/^[A-ZÄËḦÏÖÜẄẌŸ][-a-zäëḧïöẗüẅẍÿ]+/', $nom['epithete_infra_generique'])) {$epithete_traite = $this->repererEspace($nom['epithete_infra_generique']);$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $epithete_traite, $nom['exclure_taxref']);$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);}}}return $noms_erreur;}/*** Test #32*/private function testerEpitheteInfraGeneriqueRang() {$noms_erreur = array();foreach ($this->noms as &$nom) {if ($nom['epithete_infra_generique'] != '') {if ($nom['rang'] <= $this->manuel['rang_genre'] || $nom['rang'] >= $this->manuel['rang_sp']) {$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['nom_sci'], $nom['rang'], $nom['exclure_taxref']);$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);}}}return $noms_erreur;}/*** Test #33*/private function testerEpitheteInfraGeneriqueEspaces() {$noms_erreur = array();foreach ($this->noms as &$nom) {if ($nom['epithete_infra_generique'] != '') {if (preg_match('/(?:^\s+(?!:\s+)|(?!:\s+)\s{2,}(?!:\s+)|(?!:\s+)\s+$)/', $nom['epithete_infra_generique'])) {$epithete_traite = $this->repererEspace($nom['epithete_infra_generique']);$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $epithete_traite, $nom['exclure_taxref']);$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);}}}return $noms_erreur;}/*** Test #34*/private function testerEpitheteSpEspaces() {$noms_erreur = array();foreach ($this->noms as &$nom) {if ($nom['epithete_sp'] != '') {if (preg_match('/(?:^\s+(?!:\s+)|(?!:\s+)\s{2,}(?!:\s+)|(?!:\s+)\s+$)/', $nom['epithete_sp'])) {$epithete_traite = $this->repererEspace($nom['epithete_sp']);$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $epithete_traite, $nom['exclure_taxref']);$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);}}}return $noms_erreur;}/*** Test #35*/private function testerEpitheteSpSyntaxe() {$noms_erreur = array();foreach ($this->noms as &$nom) {if ($nom['epithete_sp'] != '') {$formule_hybridite = (strpos($nom['epithete_sp'], ' x ') !== false);$mots = explode(' ', $nom['epithete_sp']);foreach ($mots as $mot) {// TODO: créer un test qui vérifie la formule d'hybridité en la reconstruisant à partir des parents// afin que seuls des formules valides parviennent à la fonctionif (!(preg_match('/^[+x]$/', $mot) || $this->verifierEpitheteSp($mot) ||($formule_hybridite && $this->verifierEpitheteGenre($mot) && !$this->verifierEstAbbreviationInfraSp($mot)))) {$epithete_traite = $this->repererEspace($nom['epithete_sp']);$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $epithete_traite, $nom['exclure_taxref']);$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);break;}}}}return $noms_erreur;}/*** Test #36*/private function testerEpitheteSpRang() {$noms_erreur = array();foreach ($this->noms as &$nom) {if ($nom['epithete_sp'] != '') {if ($nom['rang'] < $this->manuel['rang_sp']) {$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['nom_sci'], $nom['rang'], $nom['exclure_taxref']);$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);}}}return $noms_erreur;}/*** Test #37*/private function testerTypeEpitheteEspaces() {$noms_erreur = array();foreach ($this->noms as &$nom) {if ($nom['type_epithete'] != '') {if (preg_match('/\s+/', $nom['type_epithete'])) {$valeur_traitee = $this->repererEspace($nom['epithete_sp']);$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $valeur_traitee, $nom['exclure_taxref']);$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);}}}return $noms_erreur;}/*** Test #38*/private function testerTypeEpitheteSyntaxe() {$noms_erreur = array();foreach ($this->noms as &$nom) {if ($nom['type_epithete'] != '') {if (!$this->verifierTypeEpithete($nom['type_epithete'])) {$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['type_epithete'], $nom['exclure_taxref']);$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);}}}return $noms_erreur;}/*** Test #39*/private function testerTypeEpitheteHybridite() {$noms_erreur = array();foreach ($this->noms as &$nom) {if ($nom['type_epithete'] != '') {if (preg_match('/^(?:n-|notho-)/', $nom['type_epithete'])) {$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['type_epithete'], $nom['exclure_taxref']);$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);}}}return $noms_erreur;}/*** Test #40*/private function testerEpitheteInfraSpEspaces() {$noms_erreur = array();foreach ($this->noms as &$nom) {if ($nom['epithete_infra_sp'] != '') {if (preg_match('/(?:^\s+(?!:\s+)|(?!:\s+)\s{2,}(?!:\s+)|(?!:\s+)\s+$)/', $nom['epithete_infra_sp'])) {$epithete_traite = $this->repererEspace($nom['epithete_infra_sp']);$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $epithete_traite, $nom['exclure_taxref']);$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);}}}return $noms_erreur;}/*** Test #41*/private function testerEpitheteInfraSpSyntaxe() {$noms_erreur = array();foreach ($this->noms as &$nom) {if ($nom["rang"] != 450) {if ($nom['epithete_infra_sp'] != '') {$mots = explode(' ', $nom['epithete_infra_sp']);$hybride_contient_abbreviation_infra_sp = false;$formule_hybridite = (strpos($nom['epithete_infra_sp'], ' x ') !== false);foreach ($mots as $mot) {if($formule_hybridite && $this->verifierEstAbbreviationInfraSp($mot)) {$hybride_contient_abbreviation_infra_sp = true;}$formule_hybridite_valide = $this->verifierEpitheteGenre($mot) || $this->verifierEpitheteSp($mot) || $hybride_contient_abbreviation_infra_sp;if (!(preg_match('/^[+x]$/', $mot) || $this->verifierTypeEpithete($mot) || $this->verifierEpitheteSp($mot) ||$formule_hybridite_valide)) {$epithete_traite = $this->repererEspace($nom['epithete_infra_sp']);$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $epithete_traite, $nom['exclure_taxref']);$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);break;}}if($formule_hybridite && !$hybride_contient_abbreviation_infra_sp) {$epithete_traite = $this->repererEspace($nom['epithete_infra_sp']);$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $epithete_traite, $nom['exclure_taxref']);$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);}}}}return $noms_erreur;}/*** Test #42*/private function testerEpitheteInfraSpRang() {$noms_erreur = array();foreach ($this->noms as &$nom) {if ($nom['epithete_infra_sp'] != '') {if ($nom['rang'] < $this->manuel['rang_sp']) {$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['nom_sci'], $nom['rang'], $nom['exclure_taxref']);$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);}}}return $noms_erreur;}/*** Test #43*/private function testerGroupeCultivarSyntaxe() {$noms_erreur = array();foreach ($this->noms as &$nom) {if ($nom['cultivar_groupe'] != '') {if (!$this->verifierEpitheteGroupeCultivar($nom['cultivar_groupe'])) {$epithete_traite = $this->repererEspace($nom['cultivar_groupe']);$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $epithete_traite, $nom['exclure_taxref']);$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);}}}return $noms_erreur;}/*** Test #44*/private function testerGroupeCultivarRang() {$noms_erreur = array();foreach ($this->noms as &$nom) {if ($nom['cultivar_groupe'] != '') {if ($nom['rang'] < $this->manuel['rang_genre']) {$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['nom_sci'], $nom['rang'], $nom['exclure_taxref']);$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);}}}return $noms_erreur;}/*** Test #45*/private function testerCultivarSyntaxe() {$noms_erreur = array();foreach ($this->noms as &$nom) {if ($nom['cultivar'] != '') {if (!$this->verifierEpitheteCultivar($nom['cultivar'])) {$epithete_traite = $this->repererEspace($nom['cultivar']);$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $epithete_traite, $nom['exclure_taxref']);$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);}}}return $noms_erreur;}/*** Test #46*/private function testerCultivarRang() {$noms_erreur = array();foreach ($this->noms as &$nom) {if ($nom['cultivar'] != '') {if ($nom['rang'] < $this->manuel['rang_genre']) {$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['nom_sci'], $nom['rang'], $nom['exclure_taxref']);$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);}}}return $noms_erreur;}/*** Test #47*/private function testerNomCommercialSyntaxe() {$noms_erreur = array();foreach ($this->noms as &$nom) {if ($nom['nom_commercial'] != '') {if (!$this->verifierNomCommercial($nom['nom_commercial'])) {$epithete_traite = $this->repererEspace($nom['nom_commercial']);$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $epithete_traite, $nom['exclure_taxref']);$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);}}}return $noms_erreur;}/*** Test #48*/private function testerNomCommercialPresenceCultivar() {$noms_erreur = array();foreach ($this->noms as &$nom) {if ((isset($nom['nom_commercial']) && $nom['nom_commercial'] != '') && ($nom['cultivar'] == '' && $nom['cultivar_groupe'] == '')) {$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['nom_sci'], $nom['exclure_taxref']);$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);}}return $noms_erreur;}/*** Test #49*/private function testerAuteurSyntaxe() {$noms_erreur = array();foreach ($this->noms as &$nom) {if ($nom['auteur'] != '') {if (!$this->verifierAuteur($nom['auteur'])) {$intitule_traite = $this->repererEspace($nom['auteur']);$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $intitule_traite, $nom['exclure_taxref']);$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);}}}return $noms_erreur;}/*** Test #50*/private function testerAnneeSyntaxe() {$noms_erreur = array();foreach ($this->noms as &$nom) {if ($nom['annee'] != '') {if (!$this->verifierAnnee($nom['annee'])) {$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['annee'], $nom['exclure_taxref']);$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);}}}return $noms_erreur;}/*** Test #51*/private function testerBiblioOrigineSyntaxe() {$noms_erreur = array();foreach ($this->noms as &$nom) {if ($nom['biblio_origine'] != '') {if (!$this->verifierBiblioOrigine($nom['biblio_origine'])) {$biblio_traite = $this->repererEspace($nom['biblio_origine']);$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $biblio_traite, $nom['exclure_taxref']);$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);}}}return $noms_erreur;}/*** Test #52*/private function testerHomonymieSyntaxe() {$noms_erreur = array();foreach ($this->noms as &$nom) {if ($nom['homonyme'] != '') {if (!$this->verifierBooleen($nom['homonyme'])) {$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['homonyme'], $nom['exclure_taxref']);$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);}}}return $noms_erreur;}/*** Test #53*/private function testerHomonymieExistence() {$noms_homonymie = $this->classerNomsParNomComplet();$noms_erreur = array();foreach ($this->noms as &$nom) {if ($nom['homonyme'] != '0' && $nom['homonyme'] != '') {if ($noms_homonymie[$nom['nom_sci']] <= 1) {$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['nom_sci'], $nom['exclure_taxref']);$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);}}}$noms_homonymie = null;return $noms_erreur;}/*** Test #54*/private function testerBasionymeSyntaxe() {$noms_erreur = array();foreach ($this->noms as &$nom) {if ($nom['num_basionyme'] != '') {if (!$this->verifierNombre($nom['num_basionyme'])) {$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['num_basionyme'], $nom['exclure_taxref']);$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);}}}return $noms_erreur;}/*** Test #55*/private function testerBasionymeExistence() {$noms_erreur = array();foreach ($this->noms as &$nom) {if ($nom['num_basionyme'] != '') {if (!isset($this->noms[$nom['num_basionyme']])) {$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['num_basionyme'], $nom['exclure_taxref']);$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);}}}return $noms_erreur;}/*** Test #56*/private function testerSynonymeProparteSyntaxe() {$noms_erreur = array();foreach ($this->noms as &$nom) {if ($nom['synonyme_proparte'] != '') {if (!$this->verifierNombreSuite($nom['synonyme_proparte'])) {$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['synonyme_proparte'], $nom['exclure_taxref']);$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);}}}return $noms_erreur;}/*** Test #57*/private function testerSynonymeProparteExistence() {$noms_erreur = array();foreach ($this->noms as &$nom) {if ($nom['synonyme_proparte'] != '') {$num_nom_a_verifier = explode(',', $nom['synonyme_proparte']);$num_nom_en_erreur = array();foreach ($num_nom_a_verifier as $num_nom) {if (!isset($this->noms[$num_nom])) {$num_nom_en_erreur[] = $num_nom;}}if (count($num_nom_en_erreur) > 0) {$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], implode(',', $num_nom_en_erreur), $nom['exclure_taxref']);$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);}}}return $noms_erreur;}/*** Test #58*/private function testerSynonymeDouteuxSyntaxe() {$noms_erreur = array();foreach ($this->noms as &$nom) {if ($nom['synonyme_douteux'] != '') {if (!$this->verifierBooleen($nom['synonyme_douteux'])) {$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['synonyme_douteux'], $nom['exclure_taxref']);$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);}}}return $noms_erreur;}/*** Test #59*/private function testerSynonymeDouteuxNumNomRetenu() {$noms_erreur = array();foreach ($this->noms as &$nom) {if ($nom['synonyme_douteux'] == 1 && !$this->verifierNombre($nom['num_nom_retenu'])) {$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['synonyme_douteux'], $nom['exclure_taxref']);$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);}}return $noms_erreur;}/*** Test #60*/private function testerSynonymeDouteuxSynonyme() {$noms_erreur = array();foreach ($this->noms as &$nom) {if ($nom['synonyme_douteux'] == 1 && $nom['num_nom'] == $nom['num_nom_retenu']) {$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['num_nom_retenu'], $nom['synonyme_douteux'], $nom['exclure_taxref']);$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);}}return $noms_erreur;}/*** Test #61*/private function testerSynonymeMalAppliqueSyntaxe() {$noms_erreur = array();foreach ($this->noms as &$nom) {if ($nom['synonyme_mal_applique'] != '') {if (!$this->verifierBooleen($nom['synonyme_mal_applique'])) {$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['synonyme_mal_applique'], $nom['exclure_taxref']);$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);}}}return $noms_erreur;}/*** Test #62*/private function testerSynonymeMalAppliqueChampsAnnexe() {$noms_erreur = array();foreach ($this->noms as &$nom) {if ($nom['synonyme_mal_applique'] == 1) {$erreur = true;$erreur = ($nom['annee'] == "") ? false : $erreur;$erreur = ($nom['biblio_origine'] == "") ? false : $erreur;$erreur = (strpos($nom['auteur'], "sensu") === 0) ? $erreur : false;if ($erreur == false) {$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['auteur'], $nom['annee'], $nom['biblio_origine'], $nom['exclure_taxref']);$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);}}}return $noms_erreur;}/*** Test #63*/private function testerSynonymeMalAppliqueSynonyme() {$noms_erreur = array();foreach ($this->noms as &$nom) {if ($nom['synonyme_mal_applique'] == 1 && $nom['num_nom'] == $nom['num_nom_retenu']) {$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['num_nom_retenu'], $nom['synonyme_mal_applique'], $nom['exclure_taxref']);$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);}}return $noms_erreur;}/*** Test #64*/private function testerSynonymeOrthographiqueSyntaxe() {$noms_erreur = array();foreach ($this->noms as $nom) {if ($nom['synonyme_orthographique'] != '') {if (!$this->verifierNombre($nom['synonyme_orthographique'])) {$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['synonyme_orthographique'], $nom['exclure_taxref']);$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);}}}return $noms_erreur;}/*** Test #65*/private function testerSynonymeOrthographiqueExistence() {$noms_erreur = array();foreach ($this->noms as &$nom) {if ($nom['synonyme_orthographique'] != '') {if (!isset($this->noms[$nom['synonyme_orthographique']])) {$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['synonyme_orthographique'], $nom['exclure_taxref']);$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);}}}return $noms_erreur;}/*** Test #66*/private function testerHybrideParent01Syntaxe() {$noms_erreur = array();foreach ($this->noms as &$nom) {if ($nom['hybride_parent_01'] != '') {if (!$this->verifierNombre($nom['hybride_parent_01'])) {$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $this->repererEspace($nom['hybride_parent_01']), $nom['exclure_taxref']);$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);}}}return $noms_erreur;}/*** Test #67*/private function testerHybrideParent01Existence() {$noms_erreur = array();foreach ($this->noms as &$nom) {if ($nom['hybride_parent_01'] != '' && $nom['hybride_parent_01'] != '0') {if (!isset($this->noms[$nom['hybride_parent_01']])) {$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $this->repererEspace($nom['hybride_parent_01']), $nom['exclure_taxref']);$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);}}}return $noms_erreur;}/*** Test #68*/private function testerHybrideParent02Syntaxe() {$noms_erreur = array();foreach ($this->noms as &$nom) {if ($nom['hybride_parent_02'] != '') {if (!$this->verifierNombre($nom['hybride_parent_02'])) {$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $this->repererEspace($nom['hybride_parent_02']), $nom['exclure_taxref']);$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);}}}return $noms_erreur;}/*** Test #69*/private function testerHybrideParent02Existence() {$noms_erreur = array();foreach ($this->noms as &$nom) {if ($nom['hybride_parent_02'] != '') {if (!isset($this->noms[$nom['hybride_parent_02']]) && $nom['hybride_parent_02'] != '0') {$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $this->repererEspace($nom['hybride_parent_02']), $nom['exclure_taxref']);$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);}}}return $noms_erreur;}/*** Test #70*/private function testerNumTypeSyntaxe() {$noms_erreur = array();foreach ($this->noms as &$nom) {if ($nom['num_type'] != '') {if (!$this->verifierNombre($nom['num_type'])) {$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['num_type'], $nom['exclure_taxref']);$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);}}}return $noms_erreur;}/*** Test #71*/private function testerNumTypeExistence() {$noms_erreur = array();foreach ($this->noms as &$nom) {if ($nom['num_type'] != '') {if (!isset($this->noms[$nom['num_type']])) {$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['num_type'], $nom['exclure_taxref']);$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);}}}return $noms_erreur;}/*** Test #72*/private function testerPresenceSyntaxe() {$noms_erreur = array();foreach ($this->noms as &$nom) {if ($nom['presence'] != '') {if (!$this->verifierPresence($nom['presence'])) {$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['presence'], $nom['exclure_taxref']);$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);}}}return $noms_erreur;}/*** Test #73*/private function testerPresenceExistence() {$noms_erreur = array();foreach ($this->noms as &$nom) {if ($nom['num_nom_retenu'] == $nom['num_nom'] && $nom['exclure_taxref'] == 0) {if ($nom['presence'] == "") {$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'],$nom['num_nom_retenu'], $nom['presence'], $nom['exclure_taxref']);$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);}}}return $noms_erreur;}/*** Test #74*/private function testerStatutOrigineSyntaxe() {$noms_erreur = array();foreach ($this->noms as &$nom) {if ($nom['statut_origine'] != '') {if (!$this->verifierStatutOrigine($nom['statut_origine'])) {$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['statut_origine'], $nom['exclure_taxref']);$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);}}}return $noms_erreur;}/*** Test #75*/private function testerStatutIntroductionSyntaxe() {$noms_erreur = array();foreach ($this->noms as &$nom) {if ($nom['statut_introduction'] != '') {if (!$this->verifierStatutIntroduction($nom['statut_introduction'])) {$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['statut_introduction'], $nom['exclure_taxref']);$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);}}}return $noms_erreur;}/*** Test #76*/private function testerStatutCultureSyntaxe() {$noms_erreur = array();foreach ($this->noms as &$nom) {if ($nom['statut_culture'] != '') {if (!$this->verifierStatutCulture($nom['statut_culture'])) {$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['statut_culture'], $nom['exclure_taxref']);$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);}}}return $noms_erreur;}/*** Test #77*/private function testerExclureTaxRefSyntaxe() {$noms_erreur = array();foreach ($this->noms as &$nom) {if ($nom['exclure_taxref'] != '' && $nom['exclure_taxref'] != null) {if (!preg_match('/^(?:0|1|9)$/', $nom['exclure_taxref'])) {$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['exclure_taxref']);$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);}}}return $noms_erreur;}/*** Test #78*/private function testerNomFrancaisUnique() {$noms_erreur = array();foreach ($this->noms as &$nom) {if ($nom['nom_francais'] != '' && $nom['nom_francais'] != null) {if (strpbrk($nom['nom_francais'],',;')) {$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $this->repererCaracteresInvalidesNomFrancais($nom['nom_francais']));$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);}}}return $noms_erreur;}/*** Test #79*/private function testerExistenceNomSuperieur() {$noms_erreur = array();foreach ($this->noms as &$nom) {if ($nom['num_nom_sup'] != 0 && !isset($this->noms[$nom['num_nom_sup']])) {$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['num_nom_sup'], $nom['exclure_taxref']);$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);}}return $noms_erreur;}/*** Test #80*/private function testerExclureTaxRefPresence() {$noms_erreur = array();foreach ($this->noms as &$nom) {// On vérifie tous les noms retenu nom exclus de taxref de rang inférieur ou égal à l'espèceif ($nom['num_nom_retenu'] == $nom['num_nom'] && $nom['exclure_taxref'] == 0 && $nom['rang'] >= 240) {if($nom['presence'] == '' || !$this->verifierPresence($nom['presence'])) {if(($nom['statut_origine'] == '' || !$this->verifierStatutOrigine($nom['statut_origine'])) &&($nom['statut_introduction'] == '' || !$this->verifierStatutIntroduction($nom['statut_introduction'])) &&($nom['statut_culture'] == '' || !$this->verifierStatutCulture($nom['statut_culture']))){$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['nom_sci'],$this->mettreEnValeurAvertissement($nom['presence']),$this->mettreEnValeurAvertissement($nom['statut_origine']),$this->mettreEnValeurAvertissement($nom['statut_introduction']),$this->mettreEnValeurAvertissement($nom['statut_culture']));$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);} else {//TODO: le comportement est identique mais il faudrait pouvoir afficher un avertissement// si le champ présence n'est pas rempli mais que l'une des colonne de statut l'est$noms_erreur[] = array($nom['num_nom'], $nom['nom_sci'],$nom['presence'],$this->mettreEnValeurAvertissement($nom['statut_origine']),$this->mettreEnValeurAvertissement($nom['statut_introduction']),$this->mettreEnValeurAvertissement($nom['statut_culture']));$this->ajouterNumNomErreursTest($nom['num_nom']);}}}}return $noms_erreur;}//+--------------------------------------------------------------------------------------------------------------+//// MÉTHODES COMMUNES aux TESTSprivate function verifierPresence(&$valeur) {$codes = $this->manuel['codes_presence'];$ok = $this->verifierStatuts($valeur, $codes);return $ok;}private function verifierStatutOrigine(&$valeur) {$codes = $this->manuel['codes_statuts_origine'];$ok = $this->verifierStatuts($valeur, $codes);return $ok;}private function verifierStatutIntroduction(&$valeur) {$codes = $this->manuel['codes_statuts_introduction'];$ok = $this->verifierStatuts($valeur, $codes);return $ok;}private function verifierStatutCulture(&$valeur) {$codes = $this->manuel['codes_statuts_culture'];$ok = $this->verifierStatuts($valeur, $codes);return $ok;}private function verifierStatuts(&$valeur, &$codes) {$ok = true;if (!preg_match("/^(?:|-|[$codes](?:-[A-Z])?)$/", $valeur)) {$ok = false;}return $ok;}private function verifierBooleen(&$valeur) {$ok = true;if (!preg_match('/^1$/', $valeur)) {$ok = false;}return $ok;}private function verifierNombre(&$valeur) {$ok = true;if (!preg_match('/^[0-9]+$/', $valeur)) {$ok = false;}return $ok;}private function verifierNombreSuite(&$valeur) {$ok = true;if (!preg_match('/^(?:[0-9]+, ?)*[0-9]+$/', $valeur)) {$ok = false;}return $ok;}private function verifierTypeEpithete(&$type) {$ok = false;$rejetes = $this->manuel['type_epithete_rejetes'];if (preg_replace("/^(?:$rejetes)$/", '', $type) == '') {$ok = false;} else if (preg_match('/^[a-z][-a-z]*[.]?$/', $type)) {$ok = true;}return $ok;}private function verifierBiblioOrigine(&$intitule) {$ok = true;if (preg_match('/(?:^\s+|\s{2,}|\s+$)/', $intitule)) {$ok = false;// Contient des espaces en trop} else if (!preg_match('/^(?:in [^;]+[;]|)[^,]+?(?:[,][^:]+|)(?:[:].+|)$/', $intitule)) {$ok = false;} else if (preg_match('/(?:(?:^|[,:])\s*(?:[:,]|$))/', $intitule)) {$ok = false;// Contient une mauvaise suite de caractères}return $ok;}private function verifierAnnee(&$annee) {$ok = true;if (!preg_match('/^[0-9]{4}$/', $annee)) {$ok = false;} else if ($annee < ANNEE_MINIMUM) {$ok = false;} else if ($annee > ANNEE_EN_COURS) {$ok = false;}return $ok;}private function verifierAuteur(&$intitule) {$ok = true;$acceptes = $this->manuel['auteur_acceptes'];if (!preg_match("/^(?:$acceptes)$/", $intitule)) {if (preg_match('/(?:^\s+|\s{2,}|\s+$)/', $intitule)) {$ok = false;// Contient des espaces en trop} else {$mots_rejetes = $this->manuel['auteur_mots_rejetes'];$mots = explode(' ', $intitule);foreach ($mots as $position => $mot) {if (preg_match("/^(?:$mots_rejetes)$/i", $mot)) {$ok = false;// Mot rejeté} else if (preg_match("/^(?:(?:\p{L}|[.'\(\),-])+|[&])$/u", $mot)) {continue;// Mot de l'intitulé auteur} else {$ok = false;}}}}return $ok;}private function verifierNomCommercial(&$epithete) {$ok = false;if (preg_match("/^[[:upper:][:punct:][:digit:][:space:]]+$/", $epithete)) {$ok = true;}return $ok;}private function verifierEpitheteCultivar(&$epithete) {$ok = true;$acceptes = $this->manuel['cultivar_acceptes'];if (!preg_match("/^(?:$acceptes)$/", $epithete)) {if (preg_match('/(?:^\s+|\s{2,}|\s+$)/', $epithete)) {$ok = false;// Contient des espaces en trop} else {$mots_rejetes = $this->manuel['cultivar_mots_rejetes'];$mots_mineurs = $this->manuel['mots_mineurs'];$mots = explode(' ', $epithete);foreach ($mots as $position => $mot) {if (preg_match("/^(?:$mots_rejetes)$/i", $mot)) {$ok = false;// Mot rejeté} else if ($position > 0 && preg_match("/^(?:$mots_mineurs)$/", $mot)) {continue;// Mot mineur en minuscule qui n'est pas en 1ère position} else {$mots_tiret = explode('-', $mot);foreach ($mots_tiret as $position_tiret => $mot_tiret) {if ($position_tiret > 0 && preg_match("/^(?:$mots_mineurs)$/", $mot_tiret)) {continue;// Mot-tiret mineur en minuscule qui n'est pas en 1ère position} else if (preg_match('/^[[:upper:]][[:lower:]]+$/', $mot_tiret)) {continue;//Mot (ou 'mot-tiret') avec lettre initiale majuscule} else if ($position_tiret == count($mots_tiret) && preg_match('/^[:upper:][:lower:]+[:punct:]?$/', $mot_tiret)) {continue;//Dernier mot (ou 'mot-tiret') avec lettre initiale majuscule, suivi d'un éventuel signe de ponctuation} else {$ok = false;}}}}}}return $ok;}private function verifierEpitheteGroupeCultivar(&$epithete) {$ok = true;$acceptes = $this->manuel['cultivar_gp_acceptes'];if (!preg_match("/^(?:$acceptes)$/", $epithete)) {if (preg_match('/(?:^\s+|\s{2,}|\s+$)/', $epithete)) {$ok = false;// Contient des espaces en trop} else {$mots_acceptes = $this->manuel['cultivar_gp_mots_acceptes'];$mots_rejetes = $this->manuel['cultivar_gp_mots_rejetes'];$mots_mineurs = $this->manuel['mots_mineurs'];$mots = explode(' ', $epithete);foreach ($mots as $position => $mot) {if (preg_match("/^(?:$mots_acceptes)$/i", $mot)) {continue;// Mot accepté} else if (preg_match("/^(?:$mots_rejetes)$/i", $mot)) {$ok = false;// Mot rejeté} else if ($position > 0 && preg_match("/^(?:$mots_mineurs)$/", $mot)) {continue;// Mot mineur en minuscule qui n'est pas en 1ère position} else {$mots_tiret = explode('-', $mot);foreach ($mots_tiret as $position_tiret => $mot_tiret) {if ($position_tiret > 0 && preg_match("/^(?:$mots_mineurs)$/", $mot_tiret)) {continue;// Mot-tiret mineur en minuscule qui n'est pas en 1ère position dans le mot} else if (preg_match('/^[[:upper:]][[:lower:]]+$/', $mot_tiret)) {continue;// Mot (ou 'mot-tiret') avec lettre initiale majuscule} else if ($position_tiret == count($mots_tiret) && preg_match('/^[:upper:][:lower:]+[:punct:]?$/', $mot_tiret)) {continue;// Dernier mot (ou 'mot-tiret') avec lettre initiale majuscule, suivi d'un éventuel signe de ponctuation} else {$ok = false;}}}}}}return $ok;}private function verifierEpitheteSp(&$epithete) {$ok = false;if (preg_match('/^[a-zäëḧïöẗüẅẍÿ][-a-zäëḧïöẗüẅẍÿ]+$/', $epithete)) {$ok = true;} else if (preg_match('/^sp\.(?:[A-Z]|[1-9][0-9]*)$/', $epithete)) {$ok = true;}return $ok;}private function verifierEpitheteGenre(&$epithete) {$ok = false;if (preg_match('/^[A-ZÄËḦÏÖÜẄẌŸ](?:[-a-zäëḧïöẗüẅẍÿ]+|[a-zäëḧïöẗüẅẍÿ]+-[A-ZÄËḦÏÖÜẄẌŸ][a-zäëḧïöẗüẅẍÿ]+)$/', $epithete)) {$ok = true;}return $ok;}private function verifierEstAbbreviationInfraSp($mot) {$ok = false;if(preg_match($this->manuel['abbr_rangs_infra_specifique'], $mot)) {$ok = true;}return $ok;}private function formaterStyleNomGenre(&$genre) {$genre_fmt = '';if (preg_match('/^\s*([x+])\s+(.+)$/i', $genre, $match)) {$genre_fmt = utf8_encode(strtolower(utf8_decode($match[1]))).' '.utf8_encode(ucfirst(strtolower(utf8_decode($match[2]))));} elseif (preg_match('/^(.+)\s+([x+])\s+(.+)$/i', $genre, $match)) {$genre_fmt = utf8_encode(ucfirst(strtolower(utf8_decode($match[1])))).' '.utf8_encode(strtolower(utf8_decode($match[2]))).' '.utf8_encode(ucfirst(strtolower(utf8_decode($match[3]))));} else {$genre_fmt = utf8_encode(ucfirst(strtolower(utf8_decode($genre))));}return $genre_fmt;}private function formaterStyleEpitheteSpHybride(&$genre, &$epithete) {$nom_fmt = '';$erreur = '';if (trim($genre) == '') {if ($epithete != '') {$nom_fmt = $this->formaterFormuleHybridite($epithete);} else {$erreur = "Formule d'hybridité sans épithéte spécifique";}} else {$nom_fmt = $this->formaterNomHybride($genre, $epithete);}return array($nom_fmt, $erreur);}private function formaterStyleEpitheteInfraSpHybride(&$nom_sci, &$infra, &$genre = null) {$nom_fmt = '';$erreur = '';if (trim($genre) == '') {if (trim($nom_sci) == '') {if (trim($infra) != '') {$nom_fmt = $this->formaterFormuleHybridite($infra);} else {$erreur = "Formule d'hybridité sans épithéte infraspécifique";}} else {$erreur = "Formule d'hybridité avec épithéte spécifique";}} else {$nom_fmt = $this->formaterNomHybride($nom_sci, $infra);}return array($nom_fmt, $erreur);}private function formaterNomHybride(&$nom_sci, &$epithete) {if (preg_match('/^(.+)\s+([x+])\s+(.+)$/i', $epithete, $match) != '') {$nom_fmt = $nom_sci.utf8_encode(ucfirst(strtolower(utf8_decode($match[1])))).' '.utf8_encode(strtolower(utf8_decode($match[2]))).' '.utf8_encode(ucfirst(strtolower(utf8_decode($match[3]))));} elseif (preg_match('/^([x+])\s+(.+)$/i', $epithete, $match) != '') {$nom_fmt = $nom_sci.utf8_encode(strtolower(utf8_decode($match[1]))).' '.utf8_encode(strtolower(utf8_decode($match[2])));} else {$nom_fmt = $nom_sci.utf8_encode(strtolower(utf8_decode($epithete)));}return $nom_fmt;}private function formaterFormuleHybridite(&$epithete) {$liste_parents = explode(' x ', $epithete);if (count($liste_parents) == 2) {$nom_fmt = utf8_encode(ucfirst(strtolower(utf8_decode($liste_parents[0])))).' x '.utf8_encode(ucfirst(strtolower(utf8_decode($liste_parents[1]))));} else {for ($i=0; $i<count($liste_parents); $i++) {if (strstr(trim($liste_parents[$i]), ' ') == false) {$nom[] = utf8_encode(ucfirst(strtolower(utf8_decode(trim($liste_parents[$i]))))).' x '.utf8_encode(strtolower(utf8_decode(trim($liste_parents[$i+1]))));$i++;} else {$nom[] = utf8_encode(ucfirst(strtolower(utf8_decode($liste_parents[$i]))));}}$nom_fmt = implode(' x ', $nom);}return $nom_fmt;}private function repererEspace($nom_sci) {$nom_sci = str_replace(' ', '<span class="espace"> </span>', $nom_sci);return $nom_sci;}private function repererCaracteresInvalidesNomFrancais($nom_verna) {$nom_verna = str_replace(',', '<span class="espace">,</span>', $nom_verna);$nom_verna = str_replace(';', '<span class="espace">;</span>', $nom_verna);return $nom_verna;}private function mettreEnValeurAvertissement($chaine) {$chaine = '<span class="espace">'.$chaine.'</span>';return $chaine;}private function construireSuffixeNomPltCultivee(&$nom) {$suffixe = array();$suffixe[] = $this->construireNomCultivarGroupe($nom);$suffixe[] = $this->construireNomCommercial($nom);$suffixe[] = $this->construireNomCultivar($nom);$suffixe = array_filter($suffixe);return implode(' ', $suffixe);}private function construireNomCultivarGroupe(&$nom) {$nom_groupe_cultivar = '';if ($nom['cultivar_groupe'] != '') {if (preg_match('/ gx$/', $nom['cultivar_groupe'])) {$nom_groupe_cultivar = '('.$nom['cultivar_groupe'].')';} else {$nom_groupe_cultivar = '('.$nom['cultivar_groupe'].' Gp)';}}return $nom_groupe_cultivar;}private function construireNomCommercial(&$nom) {$nom_commercial = '';if ($nom['nom_commercial'] != '') {$nom_commercial = strtoupper($nom['nom_commercial']);}return $nom_commercial;}private function construireNomCultivar(&$nom) {$nom_cultivar = '';if ($nom['cultivar'] != '') {$nom_cultivar = "'".$nom['cultivar']."'";}return $nom_cultivar;}private function classerNomsParNomComplet() {$noms_classes = array();foreach ($this->noms as &$nom) {if (!isset($noms_classes[$nom['nom_sci']])) {$noms_classes[$nom['nom_sci']] = 1;} else {$noms_classes[$nom['nom_sci']]++;}}return $noms_classes;}}?>