Blame | Last modification | View Log | RSS feed
<?php
/*
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
* @copyright 2013 Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
*/
abstract class CommunNomsTaxons extends Commun {
/** Tableau de correspondance entre les noms des champs et les codes de l'ontologie.*/
private $relationsChampsCodesOntologie = null;
protected $table_retour; //Permet de stocker le tableau de résultat (non encodé en json)
protected $resultat_req; // Permet de stocker le résultat de la requete principale.
protected $table;// Nom de la table dans laquelle on récupèrera les données dans les requetes SQL
protected $total_resultat = null;
/** Stocke le service appelé correspondant. Est utilisé principalement lors de l'affichage du href d'un synonyme
(ex id=12, basionyme num 25 est un synonyme) dans le service taxon */
protected $service_href = null;
protected $erreursParametres = null;
protected $sans_nom_sci = array('gen','sp','ssp','fam','au_ss','bib_ss');
private $bib_traitees = array();
static $correspondance_champs = array();
static $champs_api = array();
static $compo_nom = null; //Stocke sous forme de tableau les composant du nom à ajouter au nom scientifique
static $cache_ontologies = array(); // cache des ontologies
//+------------------------------- PARAMÈTRES ---------------------------------------------------------------+
public function traiterParametres() {
$this->definirParametresParDefaut();
$this->verifierParametres();
if (isset($this->parametres) && count($this->parametres) > 0) {
foreach ($this->parametres as $param => $val) {
switch ($param) {
case 'ns.structure' :
self::remplirTableCompositionNom($val);
if (in_array($val,$this->sans_nom_sci)){
$this->requete_champ = implode(', ',self::$compo_nom);
}else {
$this->requete_champ .= ' ,'.implode(', ',self::$compo_nom);
}
break;
case 'navigation.depart' :
$this->limite_requete['depart'] = $val;
break;
case 'navigation.limite' :
$this->limite_requete['limite'] = $val;
break;
}
}
$this->traiterParametresSpecifiques();
}
}
protected function definirParametresParDefaut() {
if (empty($this->parametres['recherche'])) {
$this->parametres['recherche'] = 'stricte';
}
if (empty($this->parametres['ns.format'])) {
$this->parametres['ns.format'] = 'txt';
}
if (empty($this->parametres['retour.format'])) {
$this->parametres['retour.format'] = 'max';
}
if (empty($this->parametres['ns.structure']) &&
$this->parametres['retour.format'] != 'oss') {
$this->parametres['ns.structure'] = 'au,an,bib';
}
}
public function verifierParametres() {
//$this->verifierParametresAPI();
$this->verifierParametre('recherche', 'stricte|floue|etendue|complete');
$this->verifierParametre('ns.format', 'htm|txt');
$this->verifierParametre('retour.format', 'min|max|oss|perso');
$this->verifierParametreAvecValeurMultipe('ns.structure', 'an|au|bib|ad|gen|sp|ssp|fam|au_ss|bib_ss');
/*if (count($this->erreursParametres) > 0) {
$m = 'Erreur dans votre requête : '.implode('<br/>', $this->erreursParametres);
throw new Exception(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $m);
}*/
}
public function verifierParametresAPI() {
$parametresApi = Commun::recupererTableauConfig('parametresAPI');
while (!is_null($parametre = key($this->parametres))) {
if (!in_array($parametre, $parametresApi)) {
$this->erreursParametres[] = "Le paramètre '$parametre' n'est pas pris en compte par cette version de l'API.";
}
next($this->parametres);
}
}
public function verifierParametre($parametre, $valeursPermises) {
if (isset($this->parametres[$parametre]) && !empty($this->parametres[$parametre])) {
$valeur = $this->parametres[$parametre];
$this->verifierValeursPermises($parametre, $valeur, $valeursPermises);
}
}
public function verifierParametreAvecValeurMultipe($parametre, $valeursPermises) {
if (isset($this->parametres[$parametre]) && !empty($this->parametres[$parametre])) {
$valeursConcatenees = $this->parametres[$parametre];
$valeurs = explode(',', $valeursConcatenees);
foreach ($valeurs as $valeur) {
$this->verifierValeursPermises($parametre, $valeur, $valeursPermises);
}
}
}
private function verifierValeursPermises($parametre, $valeur, $valeursPermises) {
if (!in_array($valeur, explode('|', $valeursPermises))) {
$this->erreursParametres[] = "Le paramètre '$parametre' ne peut pas prendre la valeur '$valeur'. Valeurs permises : $valeursPermises";
}
}
public function ajouterFiltreMasque($nom_champ, $valeur) {
$orig_val = $valeur;
$valeur = explode(',',$valeur);
$conditions = array();
if ($nom_champ == 'annee' || $nom_champ == 'rang') {
foreach ($valeur as $val) {
$conditions[] = "$nom_champ = ".$this->getBdd()->proteger($val);
}
} else {
if ($this->parametres['recherche'] == 'etendue') {
foreach ($valeur as $val) {
$val = self::preparerChainePourRechercheEtendue(self::remplacerCaractereHybrideEtChimere($val));
$conditions[] = "$nom_champ LIKE ".$this->getBdd()->proteger($val);
}
} elseif ($this->parametres['recherche'] == 'floue') {
foreach ($valeur as $val) {
$val = $this->getBdd()->proteger($val);
$conditions[] = "( SOUNDEX($nom_champ) = SOUNDEX($val))".
" OR ( SOUNDEX(REVERSE($nom_champ)) = SOUNDEX(REVERSE($val)))";
}
// utile pour la détermination à partir d'un nom retenu (concat(nom_sci,auteur)) lors
// d'un import depuis le CEL
} elseif ($this->parametres['recherche'] == 'concat' && $nom_champ == 'nom_sci') {
$conditions[] = "CONCAT(nom_sci, ' ', auteur) = " . $this->getBdd()->proteger($orig_val);
} else {
foreach ($valeur as $val) {
$conditions[] = "$nom_champ LIKE ".$this->getBdd()->proteger($val);
}
}
}
$this->requete_condition[]= '('.implode(' OR ', $conditions ).')';
$this->masque[$nom_champ] = $nom_champ.'='.implode(',',$valeur);
}
static function remplacerCaractereHybrideEtChimere($valeur) {
return str_replace(array('×', '%D7', '+', '%2B'),
array('x ','x ', '+', '+'),
$valeur);
}
static function preparerChainePourRechercheEtendue($valeur) {
return str_replace(' ', '% ', trim($valeur)) . '%';
}
//+-------------------------------Fonctions d'analyse des ressources-------------------------------------+
public function traiterRessources() {
if (isset($this->ressources) && count($this->ressources) > 0) {
if ($this->ressources[0] == 'relations') {
$this->traiterRessourceRelations();
} elseif ($this->estUnIdentifiant($this->ressources[0])) { //l'identifiant peut etre de type /#id ou /nt:#id
$this->traiterRessourcesIdentifiant(); // dans le service noms ou taxons
} elseif ($this->ressources[0] == 'stats') { //ressource = noms/stats
$this->traiterRessourcesStats();
} else {
$e = 'Erreur dans votre requete </br> Ressources disponibles : <br/>
<li> /'.$this->service.'/#id (id : L\'identifiant du nom rechercher)</li>
<li> /'.$this->service.'/nt:#id (id : Numero du taxon recherche)</li>
<li> /'.$this->service.'/stats </li>';
throw new Exception(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
}
}
}
public function traiterRessourcesStats() {
$this->format_reponse = $this->service.'/stats';
$e = "Erreur dans votre requête </br> Ressources disponibles : $this->service/stats/[annees|rangs|initiales]";
if (isset($this->ressources[1]) && !empty($this->ressources[1])) {
switch ($this->ressources[1]) {
case 'annees' :
$this->traiterRessourceStatsAnnees();
break;
case 'rangs' :
$this->traiterRessourceStatsRangs();
break;
case 'initiales' :
$this->traiterRessourceStatsInitiales();
break;
default :
throw new Exception(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
break;
}
} else {
throw new Exception(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
}
}
/** Vérifie si la première valeur de la table de ressource est un identifiant :
* un numerique ou un numéro taxonomique sous la forme nt:xx */
static function estUnIdentifiant($uripart) {
return (is_numeric($uripart) || (strrpos($uripart,'nt:') !== false
&& is_numeric(str_replace('nt:','',$uripart))));
}
//+------------------------------------------------------------------------------------------------------+
// Fonction d'analyse des parametres
/** Permet de remplir le tableau compo_nom. Il comprendra en fct du paramètre ns.structure les éléments à rajouter
* au nom_sci (annee, auteur, biblio ou addendum). */
static function remplirTableCompositionNom($valeur) {
$structure_nom = explode(',', $valeur);
foreach ($structure_nom as $structure) {
$structure = trim($structure);
$patterns = array('/^an$/', '/^au$/', '/^bib$/', '/^ad$/', '/^sp$/', '/^gen$/', '/^ssp$/','/^fam$/',
'/^au_ss$/','/^bib_ss$/');
$champs = array('annee', 'auteur', 'biblio_origine', 'nom_addendum', 'epithete_sp', 'genre',
'epithete_infra_sp','famille','auteur', 'biblio_origine');
// avec str_replace() 'sp' est inclu dans 'ssp', et la conversion pour 'ssp' est mauvaise
self::$compo_nom[$structure] = preg_replace($patterns, $champs, $structure);
}
}
public function mettreAuFormat() {
if ($this->parametres['ns.format'] == 'htm') {
if (strrpos($this->requete_champ, 'nom_sci_html as nom_sci') === false) {
$this->requete_champ = str_replace('nom_sci', 'nom_sci_html as nom_sci', $this->requete_champ);
}
}
}
//+------------------------------------------------------------------------------------------------------+
// Fonctions de formatage
public function formaterEnOss($resultat) {
$table_nom = array();
$oss = '';
foreach ($resultat as $tab) {
if (isset($tab['nom_sci']) ) {
if (!in_array($tab['nom_sci'], $table_nom)) {
$table_nom[] = $tab['nom_sci'];
$oss[] = $tab['nom_sci'].' '.self::ajouterCompositionNom($tab, $this->parametres['ns.format'], $this->bib_traitees);
}
}else {
$res = self::ajouterCompositionNom($tab, $this->parametres['ns.format'], $this->bib_traitees);
if($res) {
$oss[] = $res;
}
}
}
if (isset($this->masque)) $masque = implode('&', $this->masque);
else $masque = 'Pas de masque';
$table_retour_oss = array($masque, $oss);
return $table_retour_oss;
}
public function afficherEnteteResultat($url_service) {
$this->table_retour['depart'] = $this->limite_requete['depart'];
$this->table_retour['limite'] = $this->limite_requete['limite'];
$this->table_retour['total'] = $this->total_resultat;
$url = $this->formulerUrl($this->total_resultat, $url_service);
if (isset($url['precedent']) && $url['precedent'] != '') {
$this->table_retour['href.precedent'] = $url['precedent'];
}
if (isset($url['suivant']) && $url['suivant'] != '') {
$this->table_retour['href.suivant'] = $url['suivant'];
}
}
public function afficherNomHrefRetenu($tab, $num) {
$this->resultat_req = $tab;
$this->afficherDonnees('num_nom', $num);
if ($this->parametres['retour.format'] == 'min') { // sinon est affiché ds afficherDonnees(num_nom, $val) ci-dessus
$this->table_retour['nom_sci'] = $tab['nom_sci'];
$this->table_retour['nom_sci_complet'] = $tab['nom_sci'].' '.self::ajouterCompositionNom($tab, $this->parametres['ns.format'], $this->bib_traitees);
}
if ($tab['num_nom_retenu'] != '') {
$retenu = ($tab['num_nom_retenu'] == $num) ? 'true' : 'false';
} else {
$retenu = 'absent';
}
$this->table_retour['retenu'] = $retenu;
// Pourquoi ce unset ? JPM - 28-03-2013
unset($this->table_retour['id']);
}
//+------------------------------------------------------------------------------------------------------+
// Fonction de formatage pour les services /#id/
public function formaterId($resultat) {
self::$correspondance_champs = Commun::recupererTableauConfig('correspondance_champs');
foreach (self::$correspondance_champs as $key => $val) {
preg_match('/(hybride[.]parent_0[12](?:[.]notes)?|nom_sci[.][^.]+|[^.]+)(?:[.](id|code))?/', $val, $match);
self::$champs_api[$key] = $match[1];
}
$this->resultat_req = $resultat;
foreach ($resultat as $cle => $valeur) {
if ($valeur != '') {
$this->afficherDonnees($cle, $valeur);
}
}
if (isset($this->parametres['retour.champs']) && $this->format_reponse == 'noms/id') {
$retour = $this->table_retour;
$this->table_retour = array();
$champs = explode(',', $this->parametres['retour.champs']);
self::ajouterChampsPersonnalises($champs, $retour, $this->champs_table, $this->table_retour, $this->resultat_req);
}
unset($this->table_retour['href']);
return $this->table_retour;
}
public function formaterIdChamp($resultat) {
self::$correspondance_champs = Commun::recupererTableauConfig('correspondance_champs');
foreach (self::$correspondance_champs as $key => $val) {
preg_match('/(hybride[.]parent_0[12](?:[.]notes)?|nom_sci[.][^.]+|[^.]+)(?:[.](id|code))?/', $val, $match);
self::$champs_api[$key] = $match[1];
}
$reponse_id = $this->formaterId($resultat);
$this->table_retour = array();
$champs = explode(' ', $this->ressources[1]);
self::ajouterChampsPersonnalises($champs, $reponse_id, $this->champs_table, $this->table_retour, $this->resultat_req);
return $this->table_retour;
}
static function ajouterChampsPersonnalises($champs, $reponse_id, $champs_table, &$retour, $resultat_req) {
$champs_a_libeller = array('nom_retenu', 'rang', 'basionyme', 'hybride', 'hybride.parent_01',
'hybride.parent_02', 'presence', 'tax_sup', 'statut_origine', 'statut_culture', 'statut_introduction');
if (! is_null($champs) && is_array($champs) && count($champs) > 0) {
foreach ($champs as $champ) {
if (! self::verifierValiditeChamp($champ, $champs_table)) continue;
if (strrpos($champ, '.*') !== false) {
self::afficherPointEtoile($champ, $reponse_id, $retour, $resultat_req);
} elseif (in_array($champ, $champs_a_libeller)) {
$retour[$champ.'.libelle'] =
(isset($reponse_id[$champ.'.libelle'])) ? $reponse_id[$champ.'.libelle'] : null;
} else {
$champ_bdd = self::trouverChampBddCorrespondant($champ);
$retour[$champ_bdd] = isset($reponse_id[$champ_bdd]) ? $reponse_id[$champ_bdd] : null;
}
}
}
}
static function afficherPointEtoile($champ, $reponse, &$retour, $resultat_req) {
preg_match('/^([^.]+\.)\*$/', $champ, $match);
if ($match[1] == 'nom_sci') {
self::afficherNomSciPointEpithete($resultat_req, $retour);
} else {
foreach ($reponse as $chp => $valeur) {
if (strrpos($chp, $match[1]) !== false) {
if ($valeur != '') {
$retour[$chp] = $valeur;
} else {
$retour[$chp] = null;
}
}
}
}
}
static function verifierValiditeChamp($champ, $champs_table) {
if (! preg_match('/^(?:([^.]+\.parent_0[12]|[^.]+))(?:\.(.+))?$/', $champ, $match)) {
return true;
}
// decomposerNomChamp()
$radical = $match[1];
$suffixe = isset($match[2]) ? $match[2] : "";
$champs_complementaire = array('nom_retenu_complet', 'basionyme_complet');
// on verifie si le nom du champ existe bien
$champs_complementaire2 = array_diff($champs_table, array_keys(self::$champs_api)); // XXX
if (! self::estChampApi($radical) && ! in_array($radical_champ, $champs_complementaire2)) {
if (!in_array($radical, $champs_complementaire)) {
throw new Exception(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, 'Le champ "'.$radical.'" n\'existe pas dans la base. <br/><br/>');
return FALSE;
}
} elseif (self::estUnPoint($champ)) {
return self::verifierValiditeSuffixe($suffixe, $radical);
}
return TRUE;
}
static function estChampApi($radical_champ) {
$champ_api_ok = false;
if (in_array($radical_champ, self::$champs_api) || in_array($radical_champ, self::$correspondance_champs)) {
$champ_api_ok = true;
}
return $champ_api_ok;
}
static function verifierValiditeSuffixe($suffixe, $radical_champ) {
$validite_ressource = true;
if (self::correspondAUnId($radical_champ) || $radical_champ == 'id') {
self::verificationSuffixesIdentifiant($suffixe, $radical_champ, $validite_ressource);
} elseif (self::correspondAUnCode($radical_champ)) {
if (!in_array($suffixe, array('*', 'code', 'href', 'details'))) {
throw new Exception(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, 'Erreur : Le suffixe demandé n\'existe pas pour le champ "'.$radical_champ.'.<br/> Les suffixes possibles sont les suivants : <li> .* </li><li> .code </li><li> .href </li><li> .details </li>');
}
} elseif ($radical_champ == 'nom_sci') {
if ($suffixe != '*') {
$validite_ressource = false;
$m = 'Erreur : Le suffixe demandé n\'existe pas pour le champ "'.$radical_champ.'".<br/>
Les suffixes possibles sont les suivants : <li> * </li>';
throw new Exception( RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $m);
}
} else {
$validite_ressource = false;
$m = 'Erreur : Le paramètre "'.$radical_champ.'" ne peut pas présenter de suffixe. <br/><br/>';
throw new Exception( RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $m);
}
return $validite_ressource;
}
static function verificationSuffixesIdentifiant(&$suffixe, &$radical_champ, &$validite_ressource) {
if ((strrpos($radical_champ, 'parent') !== false && !in_array($suffixe, array('*', 'id', 'href', 'details', 'notes')))
|| !in_array($suffixe, array('*', 'id', 'href', 'details')) && strrpos($radical_champ, 'parent') === false) {
$validite_ressource = false;
$e = 'Erreur : Le suffixe demandé n\'existe pas pour le champ "'.$radical_champ.'".<br/> Les suffixes '
.'possibles sont les suivants : <li> .* </li><li> .id </li><li> .href </li><li> .details </li>'
.'<li> .notes (seulement pour les hybride.parent)';
throw new Exception( RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
}
}
//------------------------------fonction de formatage pour les services /stats/-----------------------------------------
public function formaterStatsInitiales($resultat) {
$rang = null;
$table_rang = array();
foreach ($resultat as $tuple) {
if ($tuple['rang'] != 0) {
$this->memoriserRang($table_rang, $tuple, $rang);
if ($tuple['lettre'] == 'x ') {
self::ajouterHybrideChimere('hybride', $this->retour[$rang], $tuple);
} elseif ($tuple['lettre'] == '+ ') {
self::ajouterHybrideChimere('chimere', $this->retour[$rang], $tuple);
} else {
$l = substr($tuple['lettre'], 0, 1);
if (isset($this->table_retour[$rang][$l])) {
$this->table_retour[$rang][substr($tuple['lettre'], 0, 1)] += floatval($tuple['nb']);
} else {
$this->table_retour[$rang][substr($tuple['lettre'], 0, 1)] = floatval($tuple['nb']);
}
}
}
}
return $this->table_retour;
}
public function memoriserRang(&$table_rang, $tuple, &$rang) {
if (is_array($table_rang)) {
if (!in_array($tuple['rang'], $table_rang)) {
$rang = $tuple['rang'];
$table_rang[] = $rang;
if ($this->parametres['retour.format'] == 'max') {
$rang = self::ajouterSignificationCode('rang', $rang, $this->getBdd());
}
}
}
}
static function ajouterHybrideChimere($groupe, &$tab, &$tuple) {
if (isset($tab[str_replace('hybride', 'hyb', $groupe)])) {
$tab[$groupe] += floatval($tuple['nb']);
} else {
$tab[$groupe] = floatval($tuple['nb']);
}
}
//-----------------------------Fonctions d'affichage utiliser dans les fonctions de formatage---------------------------
public function afficherDonnees($champApi, $valeur) {
$champBdd = self::trouverChampBddCorrespondant($champApi);
if ($this->parametres['retour.format'] == 'min') {
if ($champApi == 'nom_sci') {
$valeur = $valeur.' '.self::ajouterCompositionNom($this->resultat_req, $this->parametres['ns.format'], $this->bib_traitees);
}
if ($champApi == 'nom_sci_html') {
$valeur = $valeur.' '.self::ajouterCompositionNom($this->resultat_req, 'htm', $this->bib_traitees);
}
$this->table_retour[$champBdd] = $valeur;
// on essaye de permettre l'obtention du nom_sci_complet, y compris en retour.format == 'min',
// tout en évitant les appels aux ontologies
/*if ($this->correspondAUnId($champBdd) || $champBdd == 'id' && $valeur != '0') {
preg_match('/^([^.]+\.parent_0[12]|[^.]+)(?:\.id)?$/', $champBdd, $match);
if(strpos($this->parametres['retour.format'], $match[1]) !== false) $this->afficherSignification($match[1], $valeur);
}*/
} else {
$this->afficherToutesLesInfos($champBdd, $valeur);
}
}
static function trouverChampBddCorrespondant($champApi) {
if (array_key_exists($champApi, self::$champs_api)) {
$champBdd = self::$correspondance_champs[$champApi];
} else {
$champBdd = $champApi;
}
return $champBdd;
}
public function afficherToutesLesInfos($nom_champ_api, $valeur) {
if ($this->presentePlusieursId($nom_champ_api, $valeur)) {
preg_match('/^([^.]+\.parent_0[12]|[^.]+)(?:\.id)?$/', $nom_champ_api, $match);
$this->afficherInfosPrecises($match[1], 'details', $valeur, $this->table_retour);
$this->table_retour[$nom_champ_api] = $valeur;
} elseif (strrpos($nom_champ_api, 'parent') !== false && strrpos($nom_champ_api, 'notes') !== false) {
$this->table_retour[$nom_champ_api] = $valeur;
} elseif ((self::correspondAUnId($nom_champ_api) || $nom_champ_api == 'id' && $valeur != '0')) {
preg_match('/^([^.]+\.parent_0[12]|[^.]+)(?:\.id)?$/', $nom_champ_api, $match);
$this->afficherInfosPrecises($match[1], 'id,href', $valeur, $this->table_retour);
self::afficherSignification($match[1], $valeur, $obj->resultat_req, $this->table_retour, $this->getBdd(), $this);
} elseif (self::correspondAUnCode($nom_champ_api)) {
preg_match('/^([^.]+)(?:\.code)?$/', $nom_champ_api, $match);
$this->afficherInfosPrecises($match[1], 'code,href', $valeur, $this->table_retour);
self::afficherSignification($match[1], $valeur, $obj->resultat_req, $this->table_retour, $this->getBdd(), $this);
} elseif ($nom_champ_api == 'nom_sci_html') {
$this->table_retour['nom_sci_html'] = $valeur;
$this->table_retour['nom_sci_html_complet'] = $valeur.' '.self::ajouterCompositionNom($this->resultat_req, 'htm', $this->bib_traitees);
} elseif ($nom_champ_api != 'nom_sci') {
$this->table_retour[$nom_champ_api] = $valeur;
}
}
public function presentePlusieursId($ressource, $valeur = null) {
if ($valeur) {
$presente = strrpos($ressource, 'proparte') !== false && strrpos($valeur, ',') !== false;
} else { //pour la vérification du champ, on ignore alors la valeur de la ressource
$presente = strrpos($ressource, 'proparte') !== false;
}
return $presente;
}
public function afficherInfosPrecises($champ, $suffixe, $valeur, &$retour) {
$suffixes = explode(',', $suffixe);
//on initialise au service appelé. Sera potentiellement modifié dans la fonction afficherSignification()
$this->service_href = $this->service;
foreach ($suffixes as $suffixe) {
switch ($suffixe) {
case 'id' :
$retour[str_replace('id.id', 'id', $champ.'.id')] = $valeur;
break;
case 'details' :
$tab_id = explode(',', $valeur);
$tab_res = $retour;
$retour = array();
foreach ($tab_id as $id) {
$this->afficherInfosPrecises($champ, 'id,signification,href', $id, $retour);
$tab_res[$champ.'.details'][] = $retour;
$retour = array();
}
$retour = $tab_res;
break;
case 'href' :
$retour[str_replace('id.href', 'href', $champ.'.href')] = self::creerUrl($champ, $valeur, $this->version_projet);
break;
case 'code' :
$retour[$champ.'.code'] = "bdnt." . self::transformerChampEnCode($champ) . ":$valeur";
break;
case 'notes' :
$retour[$champ.'.notes'] = $this->resultat_req[str_replace('.', '_', $champ).'_notes'];
break;
default : break;
}
}
}
static function transformerChampEnCode($champ) {
static $tab;
$tab = Outils::recupererTableauConfig('ChampsCodesOntologie');
if (!array_key_exists($champ, $tab)) return $champ;
return $tab[$champ];
}
static function creerUrl($champ, $valeur, $version_projet) {
if (self::correspondAUnId($champ) || $champ == 'id') {
$service = $this->service_href;
$url = self::s_ajouterHref($service, $valeur, $version_projet);
} else {
$code = self::transformerChampEnCode($champ);
$url = self::ajouterHrefAutreProjet('ontologies', "$code:", $valeur, 'bdnt');
}
return $url;
}
static function afficherSignification($champ, $valeur, $resreq, &$retour, $db, $obj) {
$fmt = $obj->parametres['ns.format'];
if ($champ == 'id' && isset($resreq['nom_sci']) && $resreq['num_nom'] == $valeur) {
//si le nom_sci du num_nom que l'on veut afficher est déjà dans la table de résultat :
$retour['nom_sci'] = $resreq['nom_sci'];
$retour['nom_sci_complet'] = $resreq['nom_sci'] . (($suff = self::ajouterCompositionNom($resreq, $fmt, $obj->bib_traitees)) ? ' ' . $suff : '');
return ;
}
if (self::correspondAUnCode($champ)) {
$retour[$champ.'.libelle'] = self::ajouterSignificationCode($champ, $valeur, $db);
return ;
}
if (self::correspondAUnId($champ) || $champ == 'id') {
// $nom = $obj->recupererNomSci($valeur);
$id = $valeur;
$nom = array();
if ($id != 0) {
if (self::$compo_nom == null) {
$req = 'SELECT nom_sci, num_nom_retenu, nom_sci_html FROM '.$obj->table.' WHERE num_nom = '.$id;
} else { //on ajoute à la requete sql, les champs de ns.structure
//print_r(self::$compo_nom);
$req = 'SELECT nom_sci, num_nom_retenu, nom_sci_html, '.implode(', ', self::$compo_nom)
.' FROM '.$obj->table
.' WHERE num_nom = '.$id;
}
if ($fmt == 'htm') {
$req = str_replace('nom_sci', 'nom_sci_html as nom_sci', $req);
}
$res = $db->recuperer($req . ' -- ' . __FILE__ . ':' . __LINE__);
if ($res) {
$nom['nom_sci'] = $res['nom_sci'];
$nom['nom_sci_html'] = $res['nom_sci_html'];
$nom['nom_sci_complet'] = $res['nom_sci'].' '.self::ajouterCompositionNom($res, $fmt, $obj->bib_traitees);
$nom['nom_sci_complet_html'] = $res['nom_sci_html'].' '.self::ajouterCompositionNom($res, 'htm', $obj->bib_traitees);
$nom['service'] = ($res['num_nom_retenu'] == $id && $obj->service == 'taxons') ? 'taxons' : 'noms';
}
}
if ($nom != array()) {
$retour[$champ.'.libelle'] = $nom['nom_sci'];
$retour[$champ.'_html'] = $nom['nom_sci_html'];
$retour[$champ.'_complet'] = $nom['nom_sci_complet'];
$retour[$champ.'_html_complet'] = $nom['nom_sci_complet_html'];
$obj->service_href = $nom['service'];
}
}
}
/** Permet d'afficher les élements nomenclatural du nom_sci lors de l'appel dans le service noms/id/champ du champ^nom_sci.*/
static function afficherNomSciPointEpithete($resultat, &$retour) {
$tab_nom_sci = array('nom_supra_generique', 'genre', 'epithete_infra_generique', 'epithete_sp',
'type_epithete', 'epithete_infra_sp', 'cultivar_groupe', 'cultivar', 'nom_commercial');
foreach ($tab_nom_sci as $compo_nom) {
if (isset($resultat[$compo_nom]) && !empty($resultat[$compo_nom])) {
$table_retour['nom_sci.'.$compo_nom] = $resultat[$compo_nom];
}
}
}
static function ajouterSignificationCode($champ, $valeur, $db) {
// ontologie/cache
if(array_key_exists($champ, self::$cache_ontologies) && array_key_exists($valeur, self::$cache_ontologies[$champ])) {
$nom_code = self::$cache_ontologies[$champ][$valeur];
} else {
$code = self::transformerChampEnCode($champ);
if (preg_match('/^([^_-]+)(?:_|-)([^_-]+)$/', $code, $match)) {
$code = $match[1].ucfirst($match[2]);
}
$requete = sprintf('SELECT * FROM %1$s WHERE id IN (SELECT id FROM %1$s WHERE code = "%2$s" AND classe_id = (SELECT id FROM %1$s WHERE code = "%3$s")) LIMIT 0, 100 -- %4$s:%5$s',
Config::get('bdd_table_ontologies'), $valeur, $code, __FILE__, __LINE__);
$res = $db->recuperer($requete);
$nom_code = $valeur;
if (is_array($res)) {
$nom_code = $res['nom'];
}
// cache
self::$cache_ontologies[$champ][$valeur] = $correspondance;
}
return $nom_code;
}
/** Permet de retourner une chaine de caractère composée des parametres du nom (ns.structure : annnée, auteur,
* bibilio et addendum). A ajouter au nom scientifique */
static function ajouterCompositionNom($tab_res, $format, &$bib_traitees) {
if(!self::$compo_nom) return '';
if ($format == 'htm') {
$format = array(
'au' => '<span class="auteur">%s</span>',
'an' => '[<span class="annee">%s</span>]',
'an_bib' => '[<span class="annee">%s</span>, <span class="biblio">%s</span>]',
'bib' => '[<span class="biblio">%s</span>]',
'ad' => '[<span class="adendum">%s</span>]');
} else {
$format = array(
'au' => '%s',
'an' => '[%s]',
'an_bib' => '[%s, %s]',
'bib' => '[%s]',
'ad' => '[%s]',
'gen' => '%s',
'sp' => '%s',
'ssp' => '%s',
'fam' => '%s',
'au_ss' => '%s',
'bib_ss' => '%s');
}
$compo_nom_arr = array();
foreach (self::$compo_nom as $key => $champ) {
if (isset($tab_res[$champ]) && !empty($tab_res[$champ])) {
$compo_nom_arr[$key] = $tab_res[$champ];
}
}
return rtrim(implode(' ', self::formerNomComplet($compo_nom_arr, $format, $bib_traitees)), ' ');
}
static function formerNomComplet($compo_nom_arr, $format, &$bib_traitees) {
$nom_complet = array();
extract($compo_nom_arr);
if (isset($au)) $nom_complet[] = sprintf($format['au'], $au);
if (isset($an)) {
if (isset($bib)) {
$nom_complet[] = sprintf($format['an_bib'], $an, $bib);
} else {
$nom_complet[] = sprintf($format['an'], $an);
}
} elseif (isset($bib)) {
$nom_complet[] = sprintf($format['bib'], $bib);
}
if (isset($ad)) $nom_complet[] = sprintf($format['ad'], $ad);
if (isset($gen)) $nom_complet[] = sprintf($format['gen'], $gen);
if (isset($ssp)) $nom_complet[] = sprintf($format['ssp'], $ssp);
if (isset($sp)) $nom_complet[] = sprintf($format['sp'], $sp);
if (isset($fam)) $nom_complet[] = sprintf($format['fam'], $fam);
if (isset($au_ss)) $nom_complet[] = sprintf($format['au_ss'], $au_ss);
if (isset($bib_ss)) {
$bibl = self::tronquerBiblio($bib_ss);
//simule un 'select distinct' sur les biblio tronquées
if (!isset($bib_traitees[$bibl])) {
$nom_complet[] = sprintf($format['bib_ss'],$bibl );
$bib_traitees[$bibl] = 1;
}
}
return $nom_complet;
}
static function tronquerBiblio($valeur){
$bib = '';
if(strpos($valeur,',') !== false) {
$bib = explode(',',$valeur);
}
if(strpos($bib[0],';') !== false) {
$bib[0] = strstr($bib[0],';');
$bib[0] = str_replace('; ','',$bib[0]);
}
return $bib[0];
}
static function correspondAUnCode($key) {
return strrpos($key, '.code') !== false || in_array($key.'.code', self::$correspondance_champs);
}
static function correspondAUnId($key) {
return strrpos($key, '.id') !== false || in_array($key.'.id', self::$correspondance_champs);
}
static function estUnPoint($key) {
if (strrpos($key, 'hybride.parent') !== false) {
$key = str_replace('hybride.parent', 'hybride_parent', $key);
}
return (strrpos($key, '.') !== false);
}
public function recupererMasquePrincipal() {
$masque = null;
$tab_masque = array(
'masque' => 'nom_sci',
'masque_sg' => 'nom_supra_generique',
'masque_gen' => 'genre',
'masque_sp' => 'epithete_sp',
'masque_ssp' => 'epithete_infra_sp',
'masque_au' => 'auteur',
'masque_an' => 'annee',
'masque_bib' => 'biblio_origine',
'masque_ad' => 'addendum',
'masque_rg' => 'rang');
$liste_masque = array();
if (isset($this->masque['num_nom'])) {
$liste_masque[] = $this->masque['num_nom'];
}
foreach ($tab_masque as $key => $filtre) {
if (isset($this->masque[$filtre])) {
if (!isset($masque) && !in_array($filtre, array('rang', 'annee'))) {
$masque = array($key, $filtre);
}
$liste_masque[] = $this->masque[$filtre];
}
}
$this->masque = $liste_masque;
return $masque;
}
}