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961 3878 d 1 h raphael /trunk/services/ cartes: fixes temporaires (anti-notices) en attendant la story sur l'uniformisation du caractères de séparation des "compléments" dans les ontologies  
/trunk/services/modules/0.1/commun/Commun.php
/trunk/services/modules/0.1/eflore/cartes/LegendeCartes.php
/trunk/services/tests/0.1/baseveg/SyntaxonsTest.php
/trunk/services/tests/0.1/eflore/EfloreCartesTest.php
952 3881 d 2 h raphael /trunk/services/modules/0.1/ tests: quelques bugfixes cf php bug #42197  
/trunk/services/modules/0.1/bdtfx/Noms.php
/trunk/services/modules/0.1/commun/Aide.php
951 3881 d 4 h raphael /trunk/services/modules/0.1/ ontologies: mutualisation de la fonction éclatant des valeurs multiples de "complements", basé sur le séparateur ","  
/trunk/services/modules/0.1/bdtxa/cartes/LegendeCartes.php
/trunk/services/modules/0.1/bdtxa/cartes/TaxonsCartes.php
/trunk/services/modules/0.1/chorodep/cartes/LegendeCartes.php
/trunk/services/modules/0.1/chorodep/cartes/TaxonsCartes.php
/trunk/services/modules/0.1/commun/Commun.php
/trunk/services/modules/0.1/eflore/cartes/LegendeCartes.php
946 3881 d 7 h raphael /trunk/services/ tests: retour plus adéquat en cas d'absence de la version de la table de projet demandée et correction des tests en conséquence  
/trunk/services/modules/0.1/commun/Commun.php
/trunk/services/tests/0.1/baseveg/SyntaxonsTest.php
/trunk/services/tests/0.1/bdtfx/BdtfxNomsTest.php
/trunk/services/tests/0.1/bdtfx/BdtfxTaxonsTest.php
941 3886 d 2 h aurelien /trunk/services/modules/0.1/ Ajout d'un paramètre référentiel à la méthode de récupération des taxons parents (au lieu de l'extraire de la config)  
/trunk/services/modules/0.1/commun/Commun.php
/trunk/services/modules/0.1/liste-rouge/Categorie.php
/trunk/services/modules/0.1/sptb/Statuts.php
/trunk/services/modules/0.1/sptba/Statuts.php
940 3886 d 2 h aurelien /trunk/services/ Ajout ébauche service liste rouge + factorisation de la methode de récupération de hierarchie des taxons dans commun.php  
/trunk/services/configurations/config_liste-rouge.ini
/trunk/services/modules/0.1/liste-rouge
/trunk/services/modules/0.1/liste-rouge/Categorie.php
/trunk/services/modules/0.1/commun/Commun.php
/trunk/services/modules/0.1/sptb/Statuts.php
/trunk/services/modules/0.1/sptba/Statuts.php
937 3887 d 6 h raphael /trunk/services/modules/0.1/ tentative interrompue, de créer une alternative à CommunNomsTaxons pour:
- en faire un *toolkit* *véritablement* réutilisable (cf classes éponymes dans bdtfx et isfan)
- faire remonter les boucles effectuant des requêtes MySQL des niveaux d'imbrications les plus
enfouis vers les niveaux supérieurs où ils pourraient potentiellement être factorisés.

NB: une réécriture totale s'avèrerait finalement de loin la meilleure option mais du code réutilisable
passe par la statification des functions/outils présentes dans Commun qui ne dépendent en aucun cas
(ou presque) de l'instanciation d'une classe.
 
/trunk/services/modules/0.1/bdtfx/CommunNomsTaxons2.php
/trunk/services/modules/0.1/commun/Commun.php
899 3909 d 8 h raphael /trunk/services/modules/0.1/commun/ api/aide: correction de "service.wikini" (suppression du "." dans le nom de page)
afin de pointer vers une page wikini valide.
 
/trunk/services/modules/0.1/commun/Aide.php
847 3933 d 5 h aurelien /trunk/services/modules/0.1/commun/ Correction des noms trop longs par troncage (temporaire normalement)  
/trunk/services/modules/0.1/commun/Commun.php
837 3934 d 2 h raphael /trunk/services/modules/0.1/commun/ meta-données: ajout d'un cache pour les ontologies redondantes  
/trunk/services/modules/0.1/commun/MetaDonnees.php
830 3935 d 6 h raphael /trunk/services/modules/0.1/commun/ aide: en cas d'erreur, ne pas générer d'E_NOTICE de variable non-existente ce qui ne pourrait qu'amplifier le problème  
/trunk/services/modules/0.1/commun/Aide.php
807 3940 d 4 h raphael /trunk/services/modules/0.1/ chorodep|bdtxa/cartes: factorisation du code de génération du fichier de carte PNG, dans Commun  
/trunk/services/modules/0.1/bdtxa/cartes/TaxonsCartes.php
/trunk/services/modules/0.1/chorodep/cartes/TaxonsCartes.php
/trunk/services/modules/0.1/commun/Commun.php
801 3941 d 4 h raphael /trunk/services/ cache: fix de l'obtention de la durée du cache auprès de Commun  
/trunk/services/bibliotheque/CacheEflore.php
/trunk/services/modules/0.1/commun/Commun.php
768 3964 d 5 h raphael /trunk/services/modules/0.1/ ontologies/sptb: correction de notices + traçage des requête mysql + compat PHP-5.2  
/trunk/services/modules/0.1/commun/Ontologies.php
/trunk/services/modules/0.1/sptb/Statuts.php
767 3964 d 7 h raphael /trunk/services/modules/0.1/ services: ajout de debug aux requêtes SQL + correction d'un masque pour le service de noms bdtxa  
/trunk/services/modules/0.1/bdtxa/Noms.php
/trunk/services/modules/0.1/cel/Images.php
/trunk/services/modules/0.1/commun/Commun.php
758 3972 d 2 h raphael /trunk/services/modules/0.1/commun/ ontologies communes: correction de 2 notices PHP dans le cas de l'absence de passage de
masque et de retour_champs.
Ex: /service:eflore:0.1/bdnt/ontologies/rangTaxo:220/nom
 
/trunk/services/modules/0.1/commun/Ontologies.php
733 3996 d 5 h raphael /trunk/services/modules/0.1/commun/ ontologies: support de requêtes multi-critères pour les ontologies (partie 2/2).
Lorsque des ontologies sont demandées, celles-ci peuvent désormais être regroupées
au sein d'une même requête.
La modification, portée à Commun/Ontologie.php affecte donc les web-services n'ayant *pas*
redéfini leur classe d'accès aux ontologies, c'est à dire (au 28/06/2013):
* nvjfl
* bdnt

Exemple:
Avant, 3 requêtes:
/service:eflore:0.1/nvjfl/ontologies/numStatut:1
/service:eflore:0.1/nvjfl/ontologies/numStatut:2
/service:eflore:0.1/nvjfl/ontologies/genreNombre:10

Après, 1 requête:
/service:eflore:0.1/nvjfl/ontologies/numStatus:1,numStatus:2,genreNombre:10

Dans le seul cas d'une requête multi-critères le format de retour du web-service
a été modifié: Un ensemble de clef-valeurs est retourné dans lequel chaque clef
représente le nom d'un des critères demandés.
Si un critère ne correspond à rien dans la BDD, celui-ci est absent de l'ensemble retourné.


$ ddiff \
<(GET "http://eflore/$i"|json_pp) \
<(GET "http://www.tela-botanica.org/$i"|json_pp)

# service:eflore:0.1/nvjfl/noms-vernaculaires/attributions?masque.nt=1382&masque.lg=fra&retour.champs=conseil_emploi
# 2 appels d'ontologies nvjfl, résultat identique

# service:eflore:0.1/bdtxa/taxons/13517/relations/inferieurs
# 1 appel d'ontologie bdnt/nom, résultat identique

$ diff \
<(GET http://eflore/service:eflore:0.1/bdnt/ontologies/rangTaxo:70|json_pp) \
<(GET http://eflore/service:eflore:0.1/bdnt/ontologies/rangTaxo:70,rangTaxo:-1|json_pp) \
|grep -v rangTaxo:70
# même résultat (-1 n'existe pas)

Le comparatif suivant provient de l'étude de la requête suivante,
représentative d'une recherche de nom commun (cf: Cel/export XLS):
"/service:eflore:0.1/nvjfl/noms-vernaculaires/attributions?masque.nt=1382&masque.lg=fra&retour.champs=conseil_emploi"

Avant Après
Requêtes HTTP 3 2
Connexions SQL 4 3
SELECT 15 10
Temps sur 300 (*) 1m36 1m30

(*) $ time \
mysql -N tb_eflore<<<"SELECT num_taxonomique FROM bdtfx_v1_01 WHERE num_nom = num_nom_retenu ORDER BY ORD(SUBSTRING(nom_sci, 4, 1)) LIMIT 300;" | \
xargs -i -t -n 1 curl -so /dev/null "http://eflore/service:eflore:0.1/nvjfl/noms-vernaculaires/attributions?masque.nt={}&masque.lg=fra&retour.champs=conseil_emploi";

Le faible différentiel de temps observable s'explique partiellement par le fait que toutes les recherches de nom vernaculaire
n'aboutissent pas systématiquement à l'émission de plusieurs requêtes d'ontologie.
Le différentiel n'en reste pas moins décevant.
 
/trunk/services/modules/0.1/commun/Ontologies.php
732 3996 d 5 h raphael /trunk/services/modules/0.1/commun/ ontologies communes: fix cosmétiques.
1° usage du paramètre retour.champs qui n'était pas utilisé jusqu'ici et n'aurait
pas pu être utilisé dans le cas d'un retour.format différent de "max".

2° ajout d'un commentaire relatif aux SELECT imbriqués actuellement utilisés et
auxquel une série de JOIN serait à préférer.

3° clarification de formaterOntologiesId()

4° réécriture et renommage afficherDonnees() en calculerClassID().
Une variable est passée par référence en paramètre de la fonction et
les conditions imbriquées sont remplacées par des return rapides.
La gestion des champs demandés est améliorée.
 
/trunk/services/modules/0.1/commun/Ontologies.php
654 4088 d 1 h jpm /trunk/services/modules/0.1/commun/ Mise en formet et commentaires.  
/trunk/services/modules/0.1/commun/Commun.php
609 4308 d 8 h mathilde /trunk/services/modules/0.1/commun/ correction commentaire  
/trunk/services/modules/0.1/commun/Commun.php
597 4321 d 8 h mathilde /trunk/services/modules/0.1/commun/  
/trunk/services/modules/0.1/commun/Commun.php
593 4327 d 5 h mathilde /trunk/services/modules/0.1/commun/ ajout de nouvelles valeurs possibles pour navigation.limite  
/trunk/services/modules/0.1/commun/Commun.php
563 4354 d 4 h aurelien /trunk/services/modules/0.1/ correction d'un constructeur appelé sans paramètres qui causait une erreur  
/trunk/services/modules/0.1/commun/Commun.php
/trunk/services/modules/0.1/coste/Textes.php
/trunk/services/modules/0.1/nvjfl/NomsVernaculaires.php
536 4370 d 6 h gduche /trunk/services/ cache des webservices  
/trunk/services/bibliotheque/CacheEflore.php
/trunk/services/configurations/config_bdtfx.ini
/trunk/services/configurations/config_bibliobota.ini
/trunk/services/configurations/config_coste.ini
/trunk/services/configurations/config_eflore.ini
/trunk/services/configurations/config_nvjfl.ini
/trunk/services/modules/0.1/Projets.php
/trunk/services/modules/0.1/bdtfx/Noms.php
/trunk/services/modules/0.1/bibliobota/Publications.php
/trunk/services/modules/0.1/cel/Images.php
/trunk/services/modules/0.1/commun/Commun.php
/trunk/services/modules/0.1/commun/MetaDonnees.php
/trunk/services/modules/0.1/coste/Textes.php
/trunk/services/modules/0.1/nvjfl/NomsVernaculaires.php
/trunk/services/modules/0.1/wikipedia/Textes.php
535 4371 d 4 h mathilde /trunk/services/modules/0.1/commun/  
/trunk/services/modules/0.1/commun/Commun.php
457 4409 d 3 h mathilde /trunk/services/modules/0.1/commun/  
/trunk/services/modules/0.1/commun/Commun.php
291 4511 d 3 h aurelien /trunk/services/modules/0.1/commun/ Remplacement d'un égal par un in dans une sous requete qui peut parfois rendre plusieurs valeurs  
/trunk/services/modules/0.1/commun/Ontologies.php
278 4516 d 1 h jpm /trunk/services/modules/0.1/commun/ Correction service meta-donnes couverture temporelle start et end.  
/trunk/services/modules/0.1/commun/MetaDonnees.php
265 4522 d 7 h jpm /trunk/services/ Suppression du projet commun remplacé par eFLore.  
/trunk/services/configurations/config_commun.ini
/trunk/services/modules/0.1/commun/Commun.php
239 4532 d 5 h delphine /trunk/services/modules/0.1/commun/ debug de version.projet et retour.langue  
/trunk/services/modules/0.1/commun/MetaDonnees.php
236 4535 d 3 h delphine /trunk/services/ debuggage pour que les services fonctionnent avec la classe Projets  
/trunk/services/configurations/config_commun.ini
/trunk/services/modules/0.1/chorodep/Observations.php
/trunk/services/modules/0.1/commun/Aide.php
/trunk/services/modules/0.1/commun/Commun.php
/trunk/services/modules/0.1/commun/MetaDonnees.php
151 4580 d 2 h delphine /trunk/services/modules/0.1/commun/ suppression du _v dans la version  
/trunk/services/modules/0.1/commun/Commun.php
92 4595 d 2 h jpm /trunk/services/modules/0.1/commun/ Correction de la gestion des versions de projet demandées.  
/trunk/services/modules/0.1/commun/Commun.php
88 4595 d 4 h delphine /trunk/services/modules/0.1/commun/ traiter version projet envoie de la version dans les url  
/trunk/services/modules/0.1/commun/Commun.php
/trunk/services/modules/0.1/commun/Ontologies.php
81 4598 d 2 h delphine /trunk/services/modules/0.1/ traiter version projet envoie de la version dans les url  
/trunk/services/modules/0.1/bdtfx/CommunNomsTaxons.php
/trunk/services/modules/0.1/commun/Commun.php
8 4605 d 9 h jpm /trunk/services/modules/0.1/commun/ Utilisation des paramètres GET bruts.  
/trunk/services/modules/0.1/commun/MetaDonnees.php
/trunk/services/modules/0.1/commun/Ontologies.php
3 4606 d 2 h jpm /trunk/  
/trunk/docs
/trunk/scripts
/trunk/services
/trunk/services/.htaccess
/trunk/services/bibliotheque
/trunk/services/bibliotheque/Outils.php
/trunk/services/configurations
/trunk/services/configurations/config.defaut.ini
/trunk/services/configurations/config_bdnt.ini
/trunk/services/configurations/config_bdtfx.ini
/trunk/services/framework.defaut.php
/trunk/services/index.php
/trunk/services/modules
/trunk/services/modules/0.1
/trunk/services/modules/0.1/Projets.php
/trunk/services/modules/0.1/bdtfx
/trunk/services/modules/0.1/bdtfx/CommunNomsTaxons.php
/trunk/services/modules/0.1/bdtfx/Noms.php
/trunk/services/modules/0.1/bdtfx/Taxons.php
/trunk/services/modules/0.1/commun
/trunk/services/modules/0.1/commun/Aide.php
/trunk/services/modules/0.1/commun/Commun.php
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/trunk/services/tests/BdtfxNomsTest.php
/trunk/services/tests/BdtfxTaxonsTest.php
/trunk/services/tests/prepare.php